Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 75 out of 11,481

دراسة انتاجية البكتريوسين من بكتريا Enterococcus faecium المعزولة من مصادر سريرية == Study of the Bacteriocin production from Enterococcus faecium isolated From clinical sources

Author name: هاله عباس جاسم
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | شروق ريس كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 290 عينة سريرية من المرضى الراقدين والمراجعين لمستشفيات بغداد وتوزعت هذه العينات الى 177عينة ادرارو113 عينة خروج ، اظهرت نتائج الزرع البكتريولوجي على وسط المكورات المعوية الانتخابي Ej media ووسط المكورات المعوية التاكيدي Bile esculin azide agar والتشخيص المظهري والكيميوحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API 20 strep تشخيص 27عزلة(%9.31) من بكتريا Enterococcus faecium من عدد العينات الكلي ،وكانت 11 عزلة ( 6.21%) منهامن الادرارو16 %14.15)) عزلة من الخروج . اختبرت حساسية عزلات E.faeciumل11 نوع من المضادات الحيوية واظهرت النتائج مقاومة عالية لل Naldixic acid(81%)و (63%) TetracyclineوAmpicilin (52%)بينما كانت المقاومة لل Ciprofloxacin(48%)و(41%) Erythromycin .ومن الناحية الاخرى اظهرت العزلات مقاومة واطئة لل Penicillin (26%) وNitrofurantion (22%)و وVancomycin (18%)وكانت (19%)لل Trimethprim و(15%)Chloramphenicol. كانت (7%)فقط من العزلات مقاومةللGentamycin.اجريت تجارب التحري عن البكتريوسين من بكتريا E.faecium وكانت جميع العزلات منتجة (100%)ولمدى واسع من التاثير على البكتريا الموجبة والسالبة مع اقطار تثبيط (8 - 15 )مليمتر و(9 - 27)مليمتر على العزلات العائدة لنفس النوع . اختيرت العزلة EH(1) كعزلة كفوءة الانتاج مع فعالية نوعية 1.28 وحدة/مايكروكرام بروتين بتركيز بروتين 250 مايكروكرام /مليمتر بعد ان قيست الفعالية في العزلات(EH1,EH6,EH13) التي كانت افضل العزلات انتاجية للبكتريوسين بطريقة الاقراص. ووجد ان وسط Mann Regusa Sharp السائل والصلب هو افضل وسط لانتاج البكتريوسين من بكتريا E.faecium وان هذه البكتريا تنتج البكتريوسين في درجات حرارية بين 16 - 45 م ، واختيرت العزلة E3 والبكتريا Staphylococcus aureus, Staphylococcs epidermidis,Escherichia coli, Sallmonella كعزلات دالة ، استخلص البكتريوسين من العزلةE1 بصورته الخام بعد تنمية هذه العزلة على وسط Mann Regusa sharp السائل وتم الحصول على بكتريوسين ذي فعالية نوعية )1,28 وحدة / مايكرو كرام) بروتين وبتركيز بروتين 250 (مايكروكرام /مليلتر) وهذا البكتريوسين مقاوم للدرجات الحرارية (80,100، 121)م لمدة (15 و30 )دقيقة ، كذلك مقاوم لمدى من الرقم الهيدروجيني (8 - 2) ،ومقاوم للخزن في درجات حرارة (0،4 ،37) م لمدة (يوم ,اسبوع) . اجريت التنقية الجزئية للبكتريوسين الخام المستخلص من العزلة E1 بالترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع ( 40% و75% )واظهرت النتائج ان الترسيب بـ40%كان الافضل الذي بلغت الفعالية النوعيةفيه 44.137 وحدة/مايكروكرام بروتين وبتركيز بروتين 290 مايكروكرام/مليمتر . وكانت فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا ثابتةعند 80م لمدة 30 دقيقة و100 م لمدة (15,5)دقيقة لكن انخفضت فعاليته لتصل الى 0.8 )وحدة /مايكروكرام بروتين( في 30 دقيقة , وفقدت الفعاليةعند121م لمدة 15 دقيقة ، كانت الفاعلية ثابتة عند مدى من الرقم الهيدروجيني (8.5 - 5.5) والخزن عند صفردرجة مئوية لمدة اسبوع. | The study has involved collecting (290) clinical samples collected from admitted and refeard patients of Baghdad hospitals .The samples distributed into (177) urine sample and (113) faeces samples . Results from bacteriological culture on selective Enterococcus medium EJ medium , Enterococcus medium (bile esculin azide agar) in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20 strep system showed that only27 isolates (9.31%) were identified as Enterococcus faecium ,11 (6.21% ) isolate from urine samples and 16isolate (14.15% ) from faeces samples . The Antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecium isolates was tested towards 11 types of antimicrobial agents .The isolate showed a high resistance to Naldixic acid (81%) ,Tetracycline (63%) and ampicilin (52%) ,while (48%) of the isolate were resistant to Ciprofloxocin and (41%)resistant to Erythromycin . From the other hand Enterococcus faecium isolates showed low resistance to otherantimicrobial agent : Pencilin(26%),Nitrofurantion (22%) , Vancomycin (18%) and Trimethprim (19%) and Chloramphenicol (15%). Only(7%) of the isolates were resistant to gentamycin . Bacteriocin detection experments were carried on Enterococcus faecium and the results that all isolates were produce bacteriocin (100%) with wide range effect on gram positive and negative bacteria bacterial growth , with diameter (8 - 15)millimeter and (9 - 27)millimeter on the same isolates species ,EH1 isolate chosen as the best producer isolate bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration(250) microgram/ millimeter after the activity detected in isolates EH1,EH6,EH13 were the best bacteriocin production isolates by using disk method on the Mann Regusa Sharp agar . And founded the solid and broth Man Ragusa sharp medium was the best medium for bacteriocin production from E.faecium and this bacteria produce bacteriocin in tempreture degree between )16 - 45(C, E3isolate and the bacteria Salmonella ,Escherichia coli ,Staphylococcus aureus ,staphylococcus epidermidis chosen as indicating isolates, the bacteriocin extracted from E1in the crude form after growth this isolate on Mann Regusa Sharp broth and obtained on bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration (250) microgram /millimeter and this bacteriocin resistant for tempreture degrees 80,100,121 C for (15 ,30) minute also resistant to PH range (2 - 8) and resistant the storage in tempreture degree 0C,4 Cfor (day ,week). Then partial purification applied for this crude bacteriocin by precipitation with Ammonium sulphate of (40%,75%) saturation percentage .Results showed the precipitation in percentage 40% was the best with a specific activity reached in it to 44,137unit /migrogram protein and protein concentration 290 microgram/millimeter . The partial purified bacteriocin activity was stable at 80C for 30 minutes ,100C for( 5 ,15) minute ,but its activity decrease to reach to 0.8 unit/mg protein in 30 minute and lost activity in 121 C for 15 minute. Its activity was stable in PH (5.5 - 8.5) and storage at 0C for week

دراسة التاثير الخلطي لبعض المضادات الحيوية على فعالية المكونات الخلوية لبكتريا البروسيل == Study the effect of some antibiotics combination on the cell component activity for Brucella Spp

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل نوعين من بكتريا البروسيلا وتحديد انماطها الحيوية وهي البروسيلا المجــــــــــهضة (Brucella abortus)والبروسيلا المالطية (Brucella melitensis)المعزولة من الانسان . وتحديد حساسيتها لمضادات الحيوية وتــــــــحديد التركيز المثبط الادنىMIC))لبعض المضادات الحيوية المستخدمة في علاج داء البروسيلوسز Brucellosis)). فضلا عن التحري عن التاثير الخلطي لمضادات الحيوية وعند التراكيز تحت المثبطة الدنيا (sub - MIC)في نموها وعلى المكونات الخلوية المتمثلة بفعاليات انزيماتها, ونفاذية غشائها الخلوي ومكونات عديد السكرايد الشحمي المستخلص منها وعوامل التصاقها (Colony factor), فضلا عن تاثيرها في طور المستعمرات والتصاق خلايا البروسيلا على سطح الخلايا الطلائية . حيث اظهرت النتائج الاتي : • ان النمطين الحيويين السابع من البروسلا المجهضة والثالث من البروسيلا المالطية هما الاكثر انتشارا .• حساسية عزلات البروسيلا المجهضة والمالطية لكل من مضادات,Gentamicin,Kanamycin,Tobramycin,Naldixic acid .فيما قاومت مضادات,Lincomycin Rifampicin , Cephalaxicin ( وعلى التوالي .• بلغ التركيز المثبط الادنى لمضادات Doxycyclin ,Tetracyclin,Streptomycin ,Erythromycin ,Rifampicin (5,10,10,40,40) مكغم/مل وعلى التوالي • وجود تاثير تازري في نمو بكتريا عند خلط كل من مضاديDoxycyclin+Rifampicin,Erythromycin+Doxycyclin ,Erythromycin+Rifampicin,Tetracyclin+Rifampicin ,Tetracyclin+Erythromycin• غير مضاد Doxycyclin طور المستعمرات الملساء للبروسيلا الى طورها المتوسط فيما لم يوثر مضاد Rifampicin في طور المستعمرات فبقيت ملساء, وغير خلط مضاديDoxycyclin+Rifampicin طور المستعمرات الى الطور الخشن الفاقد للامراضية . • ثبط مضاديDoxycyclin+Rifampicin انتاج انزيمات Catalase ,Urease ,Oxidase ,Nitrate reductaseمن قبل البروسيلا المالطية والمجهضة عند استخدامها بصورة مفردة وخلطية • جاء التاثير الخلطي لمضادات Doxycyclin+Rifampicin تازريا في مكونات عديد السكرايد الشحمي عندما خفض نسبة المكونات السكرية والدهنية في مستخلص عديد السكرايد الشحمي بطوره المائي والفينولي لتبلغ المكونات السكرية للمستخلص(147,144) مكغم/مل للبروسيلا المجهضة بطورها المائي والفينولي وعلى التوالي و(145,138)مكغم/مل للبروسيلا المالطية وبطوريها المائي والفينولي . ومقارنة مع معاملة السيطرة(172,189) مكغم/مل بطوريها المائي والفينولي . اما المكونات الدهنية فبلغت لمستخلص البروسيلا المجهضة (60.6,56.5 )مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي ولمستخلص البروسيلا المالطية (44.4,36.3 )مكغم/مل وعلى التوالي لطوريها الفينولي والمائي ومقارنة بمعاملة السيطرة للبروسيلا المجهضة (82.1,77.3) مكغم/مل وللبروسيلا المالطية(92.1,64.6) مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي .• تبين قدرة كل من البروسيلا المالطية والمجهضة على تكوين عوامل الالتصاق بانواعـــــــــــها الثلاثة (CAF/I, CAF/II ,CAF/III), فضلا عن تكوينها لانواع اخرى من عوامل الالتصاق تم الكشف عنها وبطرائق محورة . كما استطاعت المضادات الحيوية المستخدمة خــــــــــلطا (Doxycyclin+Rifampicin )من منع خلايا البروسيلا عن تكوين هذه العوامل كافة.• اثر استخدام مضادي Doxycyclin+Rifampicinخلطا على خفض عدد خلايا البروسيلا الملتصقة بسطوح الخلايا الطلائية مسببا خفض اعدادها لتبغ معدل عدد الخلايا للبروسيلا المجهضة 6, وللبروسيلا المالطية 3 مقارنة بمعاملة السيطرة 51 و55 وعلى التوالي .• تسبب معاملة البروسيلا بمضاديDoxycyclin+Rifampicin خلطا خللا في نفاذية غشائها الخلوي السايتوبلازمي ونضوحا لحامضها النووي عندما بلغ طيف الامتصاص حامضها النووي(2.21,2.33) لكل من البروسيلا المجهضة والمالطية وعلى التوالي ومقارنة بمعاملة السيطرة(0.72,0.73). | Two types of Brucella isolated from human included Br. abortus and Br. melitensis were determine there biotype, Antibiotic sensitivity and MIC for some antibiotic used for brucellosis treatment were applied.mixed affect of antibiotics at concentrations of sub MIC on the growth and on cellular containt of brucella represented by enzymatic activity, cellular membrane permeability lipopolysaccharide contents,colony phase,colony adhesion factor beside adhesion on epithelial cells to brucella.the results showed that biotype 7 from Br.abortus and biotype 3 from Br. melitensis were the dominant isolated. All isolated of Br . abortus , Br. melitensis sensitive completely to gentamycin, kanamycin ,tobramycin, naldixic acid while its resistantto lincomycin ,rifampicin ,cephlothin , doxycyline The MIC to doxycycline,tetracycline,streptomycine,erythromycine,rifampicin were ( 40 , 40 , 10 , 10 ,5 ) g/ml respeactivelly.There was a synergistic effect on bacterial growth when the following antibiotics mixed as follow : ( doxycyline - rifampicin , erythromycin - rifampicin , rifampicin - tetracycline , erthromycin - tetracycline )The doxycycline had changed the colony from smooth phase to intermediate phase while the rifampicin had not affect the smooth phase . The mixed affect of doxycylin _ rifampicin have changed the smooth colonies to rough colonies .Both doxycyline , rifampicine inhibited the activity of catalase , urease , oxidase , nitrate , reductase that produced by Br. abortus and Br.melitensisThe synergistic effect of doxycycline and Rifampicin on the content of lipopolysaccharide.The mixed effect of antibiotic caused a decrase in the polysaccharides in aqueous and phenolic phases .In this case it gave a values (144,147) g/ml for Br. abortus and (138,145) g/ml for Br. melitensis in comparison with contral with read to(172,180.1) g/ml to aqueous and phenolic extraction respeactivelly. While the lipid content showed value of (60.6,56.5) g/ml for Br. abortus and (44.4,36.3) for Br. melitensis in comparison with control that gave a values (82.1,77.3) g/ml for Br. abortus and (92.1,64.6) for Br. melitensis in aqueous and phenolic phases respeactivelly .Both Br.abortus and Br. melitensis had ability to from colony adhesion factor(CAF/I,CAF/II,CAF/III) in addition to another colony factors(i.e CAF/III) that had modified due to presence of tannic acid. The mixed effect of doxycycline - Rfampicin inhibit the formation of these factor.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin causesd a decrase of brucella adhesion on the epithelial cell surface.The average of Br. abortus (6) and Br. mlitensis(3) in comparison with control 51,55 cell/filed respectively.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin caused a defeact in cytoplasmic membrane permeability hance the absorbance of Naldaxic acid a values 2.21,2.33 for Br. abortus and Br.melitensis in comparison with acontrol that showed avalues 0.72,0.73 respectivelly.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

Author name: نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

ترافق بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض السكري النمط - 1 للانسان == Association of some human blood groups and antibodies with type - 1 diabetes

Author name: نور عبد الاله خليل حسين
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 126 نموذجا لمرضى السكري النمط ـ1 (T1D) Type - 1 Diabetes قورنت بـ 100 نموذجا لاصحاء مقاربة بالعمر والجنس مع المرضى. اهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم A وB وO وAB وLe(a+b - )وLe(a - b+) وLe(a - b - )و MMوMN وNNوSS وSsوss فضلا عن دراسة عيارية الاضداد للمرضى والاصحاء اذ استعملت طريقة تنميط مجموعة الدم ABO وLewis وMNSs واستعمل فحص تثبيط التراص لتحديد قابلية الافراز للنمط Le(a - b - ). جاءت النتائج لتشير الى زيادة ملحوظة في تردد مجموعة الدم O ، اذ كانت 39.68% في المرضى و28% في الاصحاء (مربع كاي 7.097 وباحتمالية P<0.01 ). فيما صاحب تردد مجموعة الدم A انخفاضا ملحوظا في المرضى فكان 20.63% اما في الاصحاء فكان 37% (مربع كاي 6.159 واحتمالية P<0.05) .اما مجموعة الدم B فظهرت بتردد 28.57% في المرضى و23% في الاصحاء (مربع كاي 3.615 واحتمالية P<0.05). وانخفض تردد مجموعة الدم AB انخفاضا طفيفا في المرضى عنه في الاصحاء ، اذ كان في المرضى 11.11% و12% في الاصحاء وبفرق غير معنوي (مربع كاي 0.804).ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض ، اذ بلغ ترددها في المرضى 30.95% فيما كان في الاصحاء 21% واشار التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية لهذا الفرق (مربع كاي 5.882 واحتمالية P<0.05). واظهرت المجموعة Le(a - b - ) دورا هاما في قابلية الاصابة بالمرض وبتردد بلغ 18.25% في المرضى و11% في الاصحاء (مربع كاي 4.604 واحتمالية P<0.05). في حين اظهرت المجموعة Le(a - b+) دورا مقاوما للمرض.وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 وذلك بارتفاع تردد الفارزين عن غير الفارزين ، فقد كان في المرضى 69.56% على حين كان في الاصحاء 45.45% وبمعنوية عالية (مربع كاي 11.601 واحتمالية P<0.01). اما مجموعة غير الفارزين فاظهرت مقاومة للاصابة بالمرض.لقد برز دور مجموعة الدم MNSs في المرض ، اذ بلغ تـردد المجمـوعة MN في المرضى 55.55% مقارنة بالاصحاء 41% (مربع كاي 6.377 واحتمالية P<0.05). وقد لعبت المجموعة Ss دورا في المرض وبتردد 23.80% في المرضى مقارنة بتردد 11% في الاصحاء (مربع كاي 7.067 واحتمالية P<0.01)، على حين كانت بعض مجاميع دم MNSs مقاومة للمرض. درست عيارية الاضداد للانماط الدموية تحت الدراسة وقد لوحظ من نتائج الدراسة وجود ارتباط بين بعض المجاميع الدموية وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب Anti - rabbit red blood corpuscles antibodies في مصول مرضى السكري النمط ـ1 مقارنة بالاصحاء اذ استعمل اختبار التحري عن عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب. كان النمطين A وAB اكثر الانماط اظهارا لعياريات عالية ، اذ بلغت في المجموعة A 1949.5 ± 938.7 . اما في المجموعة AB قد كانت 1940.6 ± 1331.3 مقارنة بالاصحاء والتي بلغت 1487.6 ± 1237.5 في المجموعة A و714.7 ± 510.4 في المجموعة AB وكان التحليل الاحصائي ذا شان (قيمة T 35.844 واحتمالية P<0.01) و(قيمة T 167.78 وباحتمالية P<0.01) على التوالي.ان المجموعة Le(a - b+) ارتفعت فيها عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب ، اذ بلغت 1852.9 ± 948.7 في المرضى و1387.3 ± 1192.1 في الاصحاء (قيمة T 51.802 واحتمالية P<0.01).اما عيارية النمط Le(a+b - ) اذ بلغت 1824.8 ± 979.6 في المرضى و1091.1 ± 1088.8 في الاصحاء (قيمة T 40.816 وباحتمالية P<0.01).على حين كانت العيارية للنمط Le(a - b - ) هي 1444 ± 1069.6 في المرضى و1198.6 ± 742.6 في الاصحاء (قيمة T 63.470 وباحتمالية P<0.01). درس مورث الافراز Secretory gene بالنسبة الى عيارية الاضداد، قد كان غير الفارزين ذو عيارية ضادة لكريات دم الارنب عالية مقارنة بالفارزين اذ بلغت في المرضى 2052.6 ± 1557.2 مقارنة بالاصحاء البالغة 1386.7 ± 794.9 (قيمة T 172.65 واحتمالية P<0.01).اما ما يخص مجموعة الدم MNSs ، فقد اظهر النمط MN عيارية مرتفعة والبالغة 1815.3 ± 962.9 وقد افترقت عن مثيلاتها في الاصحاء فكانت 1379.9 ± 1142.5 (قيمة T 162.09 واحتمالية P<0.01).كانت المجاميع O وLe(a - b - ) وLe(a+b - ) ومجموعة الفارزين والانماط MN وSsاكثر Relative risk للمرض اذ بلغت خطورتها النسبية 1.4 و1.7 و1.5 و1.5 و1.4 و2.2 على التوالي. | A total of 126 type - 1 diabetics and an age and sex comparable 100 healthy subjects were studied . The study dealt with finding the frequency of ABO , Lewis , MNSs blood groups in these subjects , besides the frequency of secretors and non - secretors were investigated.Further more , the anti - rabbit antibody immune response among diabetic and healthy subjects was investigated .The frequency distribution of ABO showed the followings :  A significant increase in O - blood group distribution was recorded : 39.68% in patients versus 28% in control (Chi2 7.097 , P< 0.01 ) . A significant decrease in patients A - blood group frequency was seen 20.63% in patients versus 37% in control (Chi2 6.159 , P<0.05 ) . A slight increase in B - blood group frequency in patients was observed (28.57%) compared to control (23%) (Chi2 3.615 , P< 0.05 ) . Likewise , AB - blood group showed a frequency of 11.11% in patients compared to 12% in the control .On the other hand , the frequency distribution of Lewis blood group showed : Le ( a+ b - ) Patients frequency was 30.95% versus 21% in control (Chi2 5.88 , P<0.05 ) . while Le ( a - b - ) gave a patients frequency of 18.25% versus 11% in control ( Chi2 4.6 , P<0,05 ) .Le ( a - b+ ) demonstrated a resistant distribution compared to control .The fraction of secretors among Le ( a - b - ) gave 69.56% versus 45.45% in healthy controls ( Chi2 = 11.6 , P<0.01 ) .The frequency distribution of MNSs blood group showed a role of MN , giving a frequency of 55.55% versus 41% in control (Chi2 = 6.37, P<0.05). Likewise , Ss gave a frequency of 23.80% versus 11% in control (Chi2 = 7.06 , P<0.01 ) .Nonetheless , some MNSs genetic types showed a decreased frequency in diabetics compared to controls .The immunological findings showed that there was an association between blood groups and anti - rabbit red blood cell antibody titers . A and AB were among the groups that gave an increase anti - rabbit red blood cell titers . The mean titer in A was 1949.5 ± 938.7 versus 1487.6 ± 1237.5 ( T 35.8 , P<0.01 ) , while the mean titer in AB was 1310.2 ± 646.3 in patients versus 714.7 ± 510.4 in controls (T 167.78 , P < 0.01).A statistically significant increase in anti - rabbit antibody titers was seen in Le ( a+b - ) and Le ( a - b - ) Lewis blood groups compared to controls .MNSs blood groups genetic types gave an increase in mean MN anti - rabbit antibody titers 1815.3 ± 962.9 versus 1379.9 ± 1142.5 ( T = 162.09 , P<0.01 ) .The relative risk in all blood groups was recorded O , Le ( a - b - ) , Le ( a+b - ) , secretors , MN and Ss showed a relatively increase risk giving a relative risks of 1.4 , 1.7 , 1.5 , 1.5 , 1.4 and 2.2 respectively .The novel findings were discussed based on the available data in the subject

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

Author name: نور شكيب محمد
Supervisor name: ضمياء محمود ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

دراسة مناعية عن علاقة فايروس الخلية العملاقة للمرضى المصابين بسرطان الفم == Immunological study of relation of Cytomegalovirus in patients with Oral Cancer

Author name: نور الهدى علي عبد الحسين سعيد
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعد حسن محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة كبحث باثر رجعي حيث تم اخذ (70) عينة من الانسجة الفموية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البرافين ، جمعت هذه النماذج من ارشيف الانسجة لمختبرات فرع الانسجة والامراض في كلية طب الاسنان / جامعة بغداد . حيث تعود هذه العينات للفترة بين 1998 - 2008.قسمت هذه العينات النسيجية الفموية الى مجموعتين : - مجموعة تضم (60) عينة اخذت من سرطانات الانسجة الطلائية الحرشفية للتجويف الفمي بينما ضمت المجموعة الاخرى (10) عينات نسيجية خالية من الامراض حسب الفحص النسيجي المرضي كنماذج سيطرة.تم تحليل هذه العينات، اخذين بنظر الاعتبار العمر، الجنس، موقع النسيج المصاب، والتمايز النسيجي، ثم صبغت جميعها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين للتشخيص النهائي.كما تم اجراء التشخيص الجزيئي لدنا فايروس الخلية العملاقة في الخزعات النسيجيه قد انجزت بواسطة جيل حساس ومتقدم من التقانة الاحيائية الجزيئية التي لها قابلية التحديد داخل الخلية للاحماض النووية.امتدت هذه الدراسة لتشمل دراسة نسيجية - مناعية بواسطة التصبيغ المناعي لتحديد انتشار البروتين المنتج من الجين المنشط للسرطان ( p53) ، كذلك لتحديد المستضد الموجود على سطح الخلية اللمفاوية نوع(T ) والمسمى (CD8 ) .مجمل النتائج المستحصلة من هذه الدراسة قد صنفت كالاتي : - كانت اعمار المرضى المصابين بسرطان الانسجة الحرشفية الفموية تتراوح بين (10 - 92) سنة وبمتوسط عمري (56،4) سنة . اعلى نسبة شخصت كانت بالفئة العمرية (45 - 75) سنة ، شكلت سرطانات اللسان النسبة الاعلى بين سرطانات الفم الحرشفية كما شكلت ايضا النسبة الاعلى من النتائج الموجبة لفيروس الخلية العملاقة البشري وانتشار بروتينp53 وكذلك للخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ). اكثر من 80% من حالات سرطانات الفم كانت جيدة التمايز، ضمن سرطانات الفم الحرشفية ، 26 عينة اظهرت نتائج موجبة لفايروس الخلية العملاقة البشري بواسطة التقنية الاحيائية عالية الحساسية ( التهجين بالموقع).مثلت هذه النتائج 43،3% من مجموع سرطانات الفم الحرشفية الخاضعة للتحري، في حين من بين المجموعة نفسها ، 55% (33 عينة من اصل 60) اظهرت نتائج موجبة لفحص انتشار بروتين p53 و18،3% (اي 11 عينة من اصل 60) اظهرت نتيجة موجبة لفحص الخلايا اللمفاوية التائية ( CD8).بينما لم يتم تسجيل اي نتيجة موجبة لفايروس الخلية العملاقة ، انتشار بروتينp53 والخلايا اللمفاوية التائية (CD8 ) ضمن مجموعة السيطرة. سجلت حالات ظهور مشترك لانتشار بروتينp53 الطافر مع دنا فايروس الخلية العملاقة في (18،3%) ومع الخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ) في (10%) بينما سجلت هذه الدراسة حالات ظهور مشترك للخلايا اللمفاوية التائية السامة مع فيروس الخلية العملاقة وطفرة الجينp53 في (1،7%) من سرطانات الفم الحرشفية | This study was designed as retrospective study . A total number of seventy (70) formalin - fixed paraffin - embedded oral tissues that were collected from archives of oral Histology and Histopathology department of Dentistry College/University of Baghdad, during the period from October 2008 till April 2009. All the samples are related to the period between 1998 - 2008.These oral tissue blocks were divided into two groups. A group included sixty (60) tissue blocks with histopathologic diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). And another group included ten (10) tissue specimens that were taken from histopathologically healthy oral tissues.All these tissues were analyzed according to age, sex, site and histological grading.Histopathological sections were made for those oral biopsies and stained by hematoxylin and eosin stain for definitive histologic diagnosis.Molecular detection of cytomegalovirus (CMV - DNA) in those tissue blocks were performed by using highly sensitive version of in situ hybridization (ISH) technique.This research work has further perform immunohistochemical study to demonstrate the prevalence of p53 overexpression. This study also was extended to determine the phenotype of cell surface antigen marker, namely CD8+ marker of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal anti bodies to this CD marker.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with oral SCC ranged from (10 - 92) years with mean of (56.4) years. The highest percentage was diagnosed in the age stratum of (45 - 75) years , the tongue was the most commonly affected site by OSCC. And also represents the major site for CMV infection , p53 gene mutation and CD8 positive - phenotyping results.More than 80% of the OSCC have well - differentiated grade , among oral SCC group, 26 archival tissue blocks showed positive - ISH reactions for CMV - DNA by sensitive version of ISH . This constituted 43.3% of the total screened oral SCC tissues.Thirty - three out of sixty oral SCC showed 55% positive IHC reaction indicating p53 overexpression, and 18.3% (11 out of 60) showed positive IHC reaction pointing for presence of CD8 +ve tumor infiltrating lymphocytes. While , none of those tissues in the histopathologically healthy control group showed reaction for CMV - DNA, p53, or CD8 marker.The co - occurrence of mutated - p53 overexpression with positive CMV infection was localized in (18.3%), whereas co - occurrence of p53 gene mutation and CMV infection along CD8 - positive tumor infiltrating lymphocytes in OSCC were documented in (1.7%) of these cancerous specime

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

دراسة كيمياوية وبايولوجية لبعض مركبات الايض الثانوي المستخلص من اوراق نبات البشملة L. Eroibotrya japonica المستزرع في العراق == Chemical and Biological Study of Some Secondary Metabolism Compounds Extracted from Bashmala Eriobotrya Japonica L. leaves Cultivated in Iraq

Author name: نعم حيدر جواد سعيد الجوهري
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study containes the extraction and detection some of active compounds in the leaves of Eriobotrya japonica L. and testing the activity of crude extract as an antibacterial and food preservation. Methnol was used in crude extraction and also CC , TLC ,HPLC techniques were used in qultitive and quantative amount of some flavonoid ,terprnoid and phenolic compound .The well in agar to study the effect of crude on Staphylococcus aurus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria in 200 ,100, 50 and 25 mg /ml concentrations , In addition to study of effect of the extraction on meat at 200 mg /ml concentration . The ruselts show that Alcholic crude extract contains flavonoid ,terprnoid and phenolic compounds and the chlororform was the best solvent in separating those compounds . Through the use TLC and HPLC , it was possible to separate terpenoids (Oleanolic acid , ursolic acid , maslinic acid) , flavonoids (Qurcetin, Kaempferol ,Rutine ) and phenolic compounds (Benzoic acid ,caffeic acid ,chlorogenic acid). The results show the high activity of leaves crude extract of Eriobotrya japonica L . in 200 mg /ml concentrationthat is used as a food preservation in minced beef meat. The results also show significant differences at (P<0.05) in Thiobarbutric acid ,Total violate nitrogen measurement ,total bacterial account , and psychrotrophic bacteria account ,AS for the value of PH was governor compared with standard control. The concentrations of cruds extract showed an Antibacterial activity where Staphylococcus aureus where 15 and 26 mm by using 100 and 200 mg/ ml concetrations respectively .furthermore,The crude extractshowed an efficiency as antibacterial agains Escherichia coli with 13and 15mm inhabition zone ; and also Salmonella typhmurium with 14 and 19mm inhabition zone by using 100 and 200 mg / ml concentration , respectively compared with standard control . The ruselts show that minimum inhibitory concentration of the cruds extract agains Staphylococcus aureus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria was 100 mg / ml compared with standard control .

مستويات الرصاص في الدم لسكان بغداد والعوامل المؤثرة على ذلك == Levels of Blood Lead in Baghdad Inhabitants and Factors Affecting Them

Author name: نضال ياس يعقوب
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الرصاص عنصرا" طبيعيا" يتواجد في القشرة الارضية ويستعمل على نطاق واسع في الطلاء والكازولين والبطاريات والعلب المعدنية وبعض الاواني الخزفية. ويتعرض الناس الى الرصاص عن طريق الغبار الملوث ورقائق الطلاء والاطعمة الملوثة..شملت الدراسة 80 شخصا من العاملين في الشركة العامة للبطاريات في الوزيرية والذين يتعرضون للرصاص اضافة الى 10 اشخاص غير متعرضين ( مجموعة السيطرة). تم تحديد مستوى الرصاص في دم الاشخاص المذكورين كما درست معايير الدم لديهم اذ شملت فحوصات الدم : مستوى خضاب الدم (Hb)،حجم الدم المضغوط(pcv)،عدد كريات الدم الحمر(RBCs)،متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا(MCHC) ومتوسط حجم الخلايا(MCV). تم اختيار عينة مؤلفة من (38) شخصا من المتعرضين الذين كان مستوى الرصاص لديهم عالي حيث يبلغ (41.4 مكغم/100 مل) مع انخفاض ملحوظ في مؤشرات الدم الاخرى فكان معدل تركيز هيموكلوبين الدم (12.75 غم / 100 مل) اما مدى النسبة المئوية لحجم الدم المضغوط فقد كان (39.4 غم/100 مل) ومعدل عدد كريات الدم الحمر (5 مليون / مم3) ومعدل متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا بلغ (30.9 غم/100 مل) ومعدل متوسط حجم الخلايا بلغ (77.1 فمتولتر) . تمت دراسة تاثير الرصاص على هذه المجموعة من خلال تدوين المعلومات الخاصة في الاستمارة الاستبيانية وكانت اهم هذة التاثيرات على جهاز الخصوبة في الذكور وتاثيرات على الجهاز البولي وظهور عدد من حالات فقر الدم وحالات من السعال والصداع والاجهاض لدى السيدات والم في المفاصل .و من جانب اخر فقد تم تقسيم عينة المتعرضين الى عدة مجاميع حسب : - 1) الجنس : اذ تم تقسيم العينة الى مجموعتي الذكور والاناث اذ كان معدل تركيز الرصاص في دم الذكور اعلى اذ بلغ(35.2 مكغم/100 مل) اما الاناث فقد بلغ (32.2 مكغم/100 مل) . وظهرت معدلات اقل بالنسبة لمؤشرات الدم الاخرى .2) حالة التدخين : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتي المدخنين وعددهم (36) شخصا والثانية غير المدخنين وعددهم (44) شخصا وكان هناك تقارب في نتائج مستوى الرصاص في الدم للمجموعتين.3) للفئات العمرية : فقد تم تقسيم العينة الى اربع مجاميع فقد ظهر اعلى مستوى لتركيز الرصاص للفئة العمرية (41 - 50) سنة مع انخفاض في مؤشرات الدم الاخرى.4) حسب المهنة : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتين وهما العاملين من داخل الشركة العامة للبطاريات (بابل 1، بابل 2) في الوزيرية والعاملين في المعامل الاهلية المنتشرة في مدينة بغداد .و من الملاحظ وجود علاقة عكسية بين تراكيز الرصاص ومعايير الدم مثل مستويات خضاب الدم والنسبة المئوية لحجم الدم المضغوط وعدد كريات الدم الحمر ومتوسط تركيزهيموكلوبين الخلايا ومتوسط حجم الخلايا. | Lead is one of the natural elements exist in the crust of the earth, and widely used in the coating , gasoline, batteries, tin cans and some ceramics. Usually people are exposed to lead through the polluted dust, coating pieces and polluted food.In 1987 using lead in gasoline has been denied in developed countries but it is still used in the developing countries. One of the causes of the mental retard in children and being behind their colleagues in behave and learn is sedimentation of lead in brain tissues because the children have more ability to absorb lead than adults.Also women and pregnant face increased hazard as a result of lead exposure which negatively affect the fetus and may lead to infertility. Lead absorption also results in many diseases and effects in human body such as : sever anemia, sever and chronic lung inflammation, increase kidney failure among children and adults, and immunity system breakdown. If the lead level was over (75 μg/dl) these people would have a failure in the reproductive system as a result of having atrophy in the testis with inability to product sperms.A study have been performed to estimate the lead level in the blood of Baghdad inhabitations in order to know its effect on the workers' health who exist in polluted places, and exposure effects on the hematological indications such as : total hemoglobin, percentage of Packed Cell Volume (PCV%), Red Blood Cell count, Mean Cell Hemoglobin Concentration (MCHC), and Mean Cell Volume (MCV). 80 workers who are exposed to lead working in the General Company for Battery in Al - Wazeria in addition to other workers from private companies in Baghdad and other 10 persons who are not exposed to lead as the control group, all have been chosen as samples for the study. a sample of 38 exposed persons have been chosen who have high lead level in their blood which was about (41.4 g/100ml) with a significant decrease in the other hematological indications; the Blood Hemoglobin Concentration average was (12.75 gm/100ml), the percentage of Packed Cell Volume average was (39.4%), the Red blood cell count average was (5 million/mml3), and the mean cell hemoglobin concentration average was (30.9 gm/100ml), mean cell volume average was (77.1 FL).Lead effects on this group had been studied through recording the data in questionnaire forms, and the most important effect was on the male fertility system, effects on urinary system, anemia, coughing, headache, miscarriage, and ache in the joints. In the other hand the sample of the exposed persons had been classified into groups according to : - 1 - Gender : - the sample had been classified into 2 groups : male and female, where the lead concentration was higher in the male blood which was about (35.2 mg/100ml) and about (32.2 mg/100ml) in the female blood, in addition to less hematological indications.2 - Smoking case : - the sample had been classified into 2 groups : smokers about (36)persons and nonsmokers about (44)person, the study showed similarity in the results on lead level in the blood of both groups.3 - Age : - the sample had been classified into 4 groups, the higher lead level appeared in age group (41 - 50), with decrease in the other hematological indications of the rest. It is clear that there is a slight relation between lead concentrations and hematological indications such as blood hemoglobin, mean packed cell volume, red blood cell count, mean cell hemoglobin volume and mean cell volume.

تاثير مستخلصات اوراق العنب والخروع والبصل في بعض عوامل استعمار انواع بكتريا التهاب الاذن الوسطى في الانسان == Effect of Grape leaves, Caster bean and Onion extracts in some colonization factors of bacterial species isolated from otitis media in human

Author name: نضال عبد الامير علي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 80 مسحة من المرضى المصابين بالتهابات الاذن الوسطى( Otitis media) المراجعين للعيادة الخارجية في مستشفى الصدر العام في بغداد وللفترة من تشرين الثاني 2007 وحتى كانون الثاني 2008. زرعت المسحات على الاوساط الزرعية (اكار الدم واكار الماكونكي) لعزل البكتريا وتشخيصها باستخدام الاختبارات المجهرية ،و الزرعية واالكيموحيوية . امكن الحصول على 69 عزلة بكتيرية من المجموع الكلي (83) وشخصت بكونها تابعة الى الانواع الاتية : (33) عزلة وبنسبة (39.75 %) Pseudomonas aeruginosa ، (11)عزلة (13.2 % ) aureus Staphylococcus ، و(8) عزلات (9.6 %) epidermidis Staphylococcus و(8) عزلات (9.6 %) Proteus mirabilis و( 5 ) عزلات(6.02 % ) تعود الى Klebsiella pneumoniae و(4) عزلات ( 4.8 %) Escherichia coli، في لم تظهر ( 14) مــسحة بنسبة ( 16.86 %) اي نمو بكتيري . اظهرت النتائج ان الاصابات المفردة هي السائدة عندما بلغت نسبتها( 96.2 %) ،بينما بلغت الاصابات المختلطة ( 3 ) اصابات فقط بنسبة (3.7%). كانت نسبة الاصابات في الاناث (57.2%) اكثر منها في الذكور (42.5 %) فيما سجلت اعلى نسبة للاصابة في الفئة العمرية (اقل من سنة - 10 سنوات) .كما تبين ان الاصابة المزمنة بالتهابات الاذن الوسطى هي اكثر شيوعا من الاصابة الحادة . لدى اختبار حساسية العزلات البكتيرية الى (18) مضادا حيويا ، اظهرت نتائج وجود مقاومة تامة (100%) لبكتريا Ps.aeruginosa ضد كل من Carbenicillin ، Doxycyclin وCeftizoxime في حين كانت حساسة جدا لمضادات Amikacin وImipenem وCiprofloxacin سوى عزلة واحدة ،اما الانواع العائدة للعائلة المعوية فكانت Pr.mirabilis وبكتريا E.coli مقاومة بنسبة (100%) لمضاد Doxycyclin دون غيره وعزلات K.pneumoniae مقاومة وبنسبة (100%) لكل من Doxycyclin وGentamycinو Pipracillin ، وكانت جميع عزلات Staphylococcus spp. مقاومة كليا Methicillin وبنسبة (100%) فيما قاومت مضادات Penicillin وAmpicillin وCloxacillin بنسب اقل . انتخبت العزلات البكتيرية وحسب شدة ضراوتها ومقاومتها للمضادات الحيوية التي شملت Ps.aeruginosa وaureus S.و Pr.mirabilisو K.pneumoniaeو E.coliلدراسة تاثير المستخلصات المائية الباردة لثمار البصل واوراق كل من الخروع والعنب في نمو العزلات ،فقد اظهر مستخلص البصل فعالـية ضد Ps.aeruginosaو aureus . Sو E.coliوعند التراكيز (750 , 1000 ,1250 ,1500 ) ملغم /مل ،عندما بلغ قطر منطقة التثبيط لكل من بكتريا aureus . Sو Ps.aeruginosa وE.coli عند تركيز 750 ملغم /مل (13 , 12 , 11) ملم وعلى التوالي . واظهر مـــستخلص اوراق الــخروع فـعاليــة ضـــد Ps.aeruginosa وaureus S. وE.coli وK.pneumoniae عند التراكيز (250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل حيث بلغت اقطار مناطق التثبيط عند التركيز 1000 ملغم /مل 15.66 , 16.33 , 16.33 , 15.33 ) ) ملم وعلى التوالي . في حين اظهر مستخلص اوراق العنب فعالية ضد جميع الانواع البكتيرية المختبرة وفي التراكيز(250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل ، عندما بلغت اقطار مناطق التثبـــــيط عند التركيز 1000ملغم/مل لكل من بكتريا aureus. S وPr.mirabilisو Ps.aeruginosaو E.coli وK.pneumoniae (32 ,21.3 , 20.6 , 18.6 , 14.3) ملم وعلى التوالي . وكان المستخلص المائي البارد لاوراق العنب هو الاكفا في تاثيره مقارنة بمستخلصات البصل واوراق الخروع . تم اختبار قابلية الانواع البكتيرية المنتخبة على الالتصاق على الخلايا الطلائية قبل وبعد المعاملة بالتركيز تحت المثبط الادنى للمستخلصات النباتية، فقد اظهر التركيز تحت المثبط الادنى للبصل تاثيرا مثبطا للالتصاق الانواع Ps.aeruginosa وaureus . Sو E.coli عندما قلل عدد الخلايا البكتيرية الملتصقة من ( 56.8 , 48.9 , 24.7 ) وعلى التوالي ليصبح (11.6 , 08 21 , 15.3)على التوالي. اظهر مستخلص اوراق العنب تاثيرا مثبطا لالتصاق الانواع المختبرة Ps.aeruginosaو aureus . Sو Pr.mirabilis وK.pneumoniaeوE.coli عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة بعد المعاملة بالمستخلص ( 12.8, 14.8, 8.3 , 16 ,12.8 ) وعلى التوالي ،اما مستخلص اوراق الخروع فقد قلل عدد الخلايا الملتصقة للانواع Ps.aeruginosa وaureus S. وK.pneumoniae وE.coliمن (56.8 , 48.9 ,46.8 ,24.7) لتصبح ( 7 , 13.6 ,4.2 ,4.5) وعلى التوالي ، كان هذا المستخلص الاكفا لتثبيط التصاق الخلايا البكتيرية بالخلايا الطلائية . | Eighty swabs were collected from patients suffering from otitis media who attended Al - sader hospital in Baghdad during November 2007 to January 2008. Swabs were cultured on blood agar and MacConkey agar media to isolate bacteria and to diagnose by microscopic cultural and biochemical testes. Ninety six isolates were isolated and identified to species as follows : (33) isolates (39.75)% were Pseudomonas aeruginosa, (11) were S.aureus with a ratio of (13.2)% and (8) isolates with a ratio of (9.6)% were S.epidermidis .(8) isolates with ratio (19.6)% were Proteus mirabilis, while (5) isolates were Klebsiella pneumoniae with a ratio of ( 6.02) % and (4) isolates with ratio (4.8)% Escherichia coli, However (14) swabs with a ratio of (16.86)% with no growth. Results showed that the infections by a single pathogen were the dominant was reached 96.2%, while the mixed infection was only (3.7)%. The infection in female were 57.2% , while in male were 42.5%. However ,the high percentage of infection were observed within the age range of less than year to ten years . Morever the chronic infection with otitis media were more dominant than the acute infection. Sensitivity of the isolates towards (18) antibiotics were performed. The results showed complete resistance (100%) of Pseudomonas aeruginosa to Carbenicillin, Doxycyclin and Ceftizoxime, while they were sensitive to Amikacin, Imipenem and Ciproflaxcin , except one isolate. Proteus mirabilis and Escherichia coli isolates were (100 )% resistant to Doxycyclin, while Klebsiella pneumoniae isolates were completely resistance (100%) to Doxycyclin , Gentamycin and Pipracillin. All Staphylococcus spp. isolates completely resisted Methicillin (100%) , but resisted Penicillin , Ampicillin , Cloxacillin at less ratios. Bacterial isolates which included Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae ,E.coli were chosen according to their virulence factors and resistant to the antibiotics , to be used for studying the effect of cold - water extracts of Allium cepa (Onion) ,Ricinus communis leaves(Caster bean) and Vitis vinifera leaves(Grape) on bacterial growth ,and adherence to epithelial cells of human . Allium cepa extracts showed activity against Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli at concentration of (750, 1000, 1250, 1500)mg/ml when the diameter of inhibition zones for S.aureus , Ps.aeruginosa, E.coli at (750)mg /ml were (13 ,12 ,11)mm, respectively . The Ricinus communis leaves extracts showed activity against Ps.aeruginosa , S.aureus , E.coli and K.pneumoniae at concentration of ( 250, 500, 750, 1000)mg /ml with diameters of inhibition zones at 1000mg/ml (15.33 ,16.33 ,16.33 ,15.66) mm , respectively. While Vitis vinifera leaves extracts showed activity against all tested bacterial species in concentrations of (250 ,500 ,750 ,1000)mg/ml with inhibition zones at 1000mg/ml concentration for S.aureus, Pr.mirabilis, Ps.aeruginosa, K.pneumoniae, E.coli (32 ,21.3 ,20.6 ,18.6 ,14.3) mm , respectively . Result showed that the cold - water extract of the Vitis vinifera leaves was the most efficient in its effects on bacterial species in comparison with Allium cepa and Ricinus communis extracts . The ability of chosen bacterial isolates for adherence before and after the treatment with sub - minimum inhibition concentration of plant extracts showed the sub - MIC for Allium cepa extract reduced the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli when the adhered bacterial cells decrease from (56.8 ,48.9 ,24.7) to be (11.6 , 21.08 ,15.3) , respectively. Vitis vinifera extract showed inhibition effect on the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae and E.coli when the average of adhered cells after the treatment with the extract were (12.8 , 14.8 , 8.3 , 16 , 12.8) , respectively . Ricinus communis leaves extracts decrease numbers of the adhered cells of Ps.aeruginosa , S.aureus , K.pneumoniae , E.coli to epithelial from ( 56.8 , 48.9 , 46.8 , 24.7) to be ( 7 , 13.6 , 4.2 , 4.5) , respectively

التحري وراثيا عن انتاج بعض انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية من بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Genetics Detection of Metallic and Extended spectrum Beta - Lactamase production from Klebsiella pneumoniae Isolated from different clinical sources

Author name: نبا علي جاسم
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 1600 عينة سريرية من مرضى يعانون من التهابات مختلفة ، توزعت ما بين 1500 عينة ادرار و100 عينة قشع, ومن خلال نتائج الفحوصات الزرعية والفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية ، شخصت 53 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella spp تضمنت 44 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و6 عزلات تعود للنوع K.oxytoca و3 عزلات تعود للنوع K.planticola .اختبرت حساسية عزلات بكتريا K.pneumoniae لـ 15 مضادا حيويا شملت على : Aztreonam وAmpicillinو Amikacinو Ceftriaxoneو Cefotaxime وCeftazidime[ Amoxicillin / Clavulanic acidو Meropenemو Imipenemو Ciprofloxacin Kanamycin وPipracillinو Cefepimeو CarbenicillinوStreptomycin,] . تم التحري عن انتاج هذه العزلات لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية ، اذ استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وثلاث طرائق للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية ،وتم الحصول على خمس عزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وعزلة واحدة منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية وكانت العزلات المنتجة لهذه الانزيمات تحمل مقاومة عالية للمضادات الحياتية AztreonamوCeftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وCarbenicillin وPipracillin وAmpicillinبنسبة 100%. تم تحديد التركيز المثبط الادنى(MIC) Minimum Inhibition Concentration باستخدام طريقة تخفيف الاكار القياسية،وقد اظهرت العزلات قيمة MIC عالية اتجاه المضادات قيد الدراسة (Ceftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وImipenem) اذ تراوحت القيم للعزلات المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميزالواســعة الطــيف(K22,K26,K28,K29,K36) من g/mlµ(0.1 - 0.05) لمضاد Imipenem وg/mlµ (256 - 32) لمضاد وg/mlµ (1024 - 256) لمضاد Ceftriaxone وg/mlµ (1024 - 128) لمضاد Cefotaxime. اما العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية K8 فقد كانت قيمة MIC لهg/ml µ ( 64 ,512,1024, ( 512 للمضادات (Imipenem , Ceftazidime , Ceftriaxone , ( Cefotaxime على التوالي.تــمـــت دراســــة المــحتــوى البلازمـيـــدي للــعــزلات الســـتة المنتخبة (K8, K22, K26, K28, K29, K36) واظهرت نتائج الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز امتلاك العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية (K8) حزمة بلازميدية في حين تباينت العزلات الخمسة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ، اذ احتوت العزلتين K22 وK26 على ثلاث حزم بلازميدية ، بينما العزلة K36 على حزمتين بلازميدية في حين احتوت العزلتين K28 وK29 على حزمة واحدة فقط. اظهرت نتائج معاملات الدنا البلازميدي باستخدام مادتي Ethidum Bromide وSDS عدم قدرة مادة SDSعلى تحييد الحزم البلازميدية، في حين كان Ethidum Bromide محيدا كفوءا عند التركيز g/mlµ (512 - 1024 ).تم استخدام تقنية (PCR) Polymerase Chain Reaction للتحري عن امتلاك العزلات قيد الدراسة على الجينات التي تشفرالى انتاج انزيمات ESL وML وباستخدام طريقة الاستخلاص السريعة (الغليان) وطريقة المستعمرة المباشرة كقالب الدنا وباستخدام بادئات متخصصة لاستهداف الجين shv - bla والجين bla imp - 1. اظهرت العزلات المنتجة لانزيمات ESLجميعها امتلاكها للجين shv - bla وبنسبة %100 ولكن العزلة المنتجة لانزيمات IMP اعطت نتيجة سالبة، كما اظهرت طريقة الاستخلاص بواسطة الغليان كفاءة عالية كقالب للدنا، مقارنتا بطريقة المستعمرة المباشرة. | The study included (1600) clinical samples from Patients suffering From different infections distrubated between (1500) urine and (100) sputum. Morphological ، biochemical tests and use Api 20 E system were employed to diagnose bacterial species and the result showed they were (53) isolates of Klebsiella spp.included(44) K. pneumoniae. (6) K. oxytoca and (3) isolates of K. planticola. Antibiotic susceptibility for K. pneumoniae isolate was performed against 15 antibiotic using disk diffusion method. Disc approximation method was used to detect production of ESLs , and three methods used to detect production of MLs.Results indicated that 5 isolates produced ESLs and only one isolate produced MLs, they isolates which produced ESLs were have highly resistant to antibiotic (100)%to [Aztreonam, Ceftriaxone, Cefotaxime, Ceftazidime, Ampicillin, Pipracillin, Carbenicillin]. Agar dilution method was used for the determination of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for the ESLs and MLs producing isolates. The result showed high resistance to Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem and Ceftazidime. The value of MIC of isolates producing ESLs(K22,K26,K28,K29,K36) were (0.05 - 0.1) µg/ml to Imipenem antibiotic, Ceftazidime (32 - 265) µg/ml, Ceftriaxone (256 - 1024) µg/ml and Cefotaxime (128 - 1024) µg/ml, while the isolate producing ML(K8) showed MIC value (64, 512, 1024, 1024) µg/ml respectively. The plasmid content of six isolates (K 8, K 22, K 26, K 28, K 29, K 36) were studies، the result of revealed electrophorsis in agar gel that the isolate K8 have one plasmid, while isolates produce ESLs differs on plasmid content,in our side K22, K26 have three plasmid, K36 have two plasmid and K28, K29 have one plasmid. Curing was conducted by the use of SDS and ethidum bromide ، and the results showed that the isolates lost the plasmids at concentration (512 - 1024) g/mL of ethidum bromide. Polymerase chain reaction technique was performed for the detection ESLs and ML, DNA template that used for PCR reaction was prepared by using boiling method and the Direct colony method, by using SHV to detect ESL and IMP - 1 to detect MLs. The results showed that all isolates were 100% harboring blashv while blaIMP - 1 gave negative result.also the extraction by use boiling method showed high efficiency compare with direct colony method.

تاثير بعض العوامل الفيزيائية والكيميائية في الشكل المظهري والامراضية لخميرة Candida albicans == Effect Of Some Physical And Chemical Factors In Morphology And Pathogenicity Of Candida albicans

Author name: ميس قيس علي
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | رباب قاسم صقر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included isolation and identification Candida albicans from different sources ,We obtained (26) isolates of Candida albicans of the total (115) samples which included (60) clinical samples of children who suffer from inflammatory in the Area of diapers in the children Protection Teaching - Hospital in The Medical City hospital and Alalweia hospital in Baghdad ؛(50) soil samples from Nurseries and gardens and corrals , )5) dried milk samples in the period between January2012to April2012 . We obtained (20) isolates C. albicans from the clinical samples; (5) isolates from soil samples and only one isolate from the dried milk samples.All isolates have been cultured on a differential mediums to diagnosis and identify C. albicans from the other species . Biggy agar, Candida medium, Candida BCG ,Corn meal agar involved in the isolation and identification of the C. albicans. Candida diagnosed based on the phenotypic characteristics of the developing colonies.All isolates was involved to microscopic examinations for the purpose of examining the phenotypic characteristics of C. albicans cells as well as to examine the germination tube formation, The diagnosis also includes the use of biochemical methods such as fermentation and assimilation behavior of Candida , API20cAUX System and ability of Candida to produce Proteinase in Skim milk agar and Blood agar.The second axis of the current study included investigating about white - opaque phenotypic switching, (20) clinical isolates (5) soil isolates (1) milk isolate showed ability to transition from white to opaque ,also we found the results of phenotypic transition ratios of the colonies grown on modified Lee’s mediums by adding Glucose or N - acetyl glucosamine in different incubation conditions involved the aerobic condition and presence of CO2, at (25)°c and (37)°c during (1,2,5,and 10) days. the results of transition ratios and the overlap between the factors compared statistically. the study found that the ratio reached a maximum at physiological temperature (37 o C) in the presence of N - acetylglucoseamine and 1% CO2 . in the aerobic condition at (37o)C with presence of N - acetylglucoseamine the results show a significantdifference at the duration between the 1st and 2nd day, and no significant difference on the dried milk isolate . The results of 5th and 10th days do not show significant difference in any isolates which due to the saturation condition when cell do not affect a change in the metabolic activity, so it dispense with N - acetylglucoseamine who induce the swathing only for a short duration.Further study the morphology of C. albicans with transmission electron microscope (TEM) and the virulence of the white and opaque colony of C. albicans. The histopathological study of the liver, the spleen and the kidneys of injected mice (Balb/c) showed several changes in the tissues, two concentration of yeast suspension (1.5 x 108) cells/ml and (3x 108) cells/ml prepared by McFarland method are used, the injection with the white the phenotypic (1.5 x 108) showed necrosis in the renal tubule and mononucleosis filtration in the tissue of the kidney, also simple filtration to the inflammatory cell in liver and a replication and necrosis in the lymphatic tissue of the spleen .The white the phenotypic (3x 108) showed a necrosis in the lymphatic tissue of the spleen and a filtrationto the Megakaryocytes, acute necrosis in liver cells and a filtration to the inflammation near the hepatic portal veins and a acute renal failure combined with mononucleosis filtration in the kidney ,On the other hand the opaque cells injection (3x108) cells/ml has caused a simple necrosis in tissues of the liver, spleen and the kidneys while the opaque cells (1.5 x108) cells/ml has no effective virulence and the tissue diagnosed as a normal.

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

Author name: ميس عماد احمد
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

دراسة بعض التاثيرات البيئية لملوثات الهواء في بغداد

Author name: نادية كامل بشار القريشي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت دراسة تلوث الهواء بدقائق الغبار ( العواصف الغبارية dust storm والغبار العالق في الهواء Suspended dust والغبار المتصاعد rising dust والغبار المترسب على اوراق نبات الدودونيا Dodonaea viscose L. جمع الغبار على الاوراق في كل شهر من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009 لثلاث مناطق : الكاظمية ، والمنصور ، وشارع فلسطين ، في مدينة بغداد/ العراق، واخذت معلومات عن عدد المرضى الشهري الذين زاروا مستشفى ابن النفيس خلال فترة الدراسة من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009. ربطت العلاقة بين عدد المرضى والظواهر اعلاه .وبينت النتائج ان العواصف الغبارية لم يكن فيها فرق معنوي بين معدلات الفترات الزمنية 1970 - 1980 و1980 - 1990 و1990 - 2000للاشهر الستة اعلاه . بينما يوجد فرق معنوي على مستوى 5% ( P - value = 0.022 ) لشهر اذار بين الفترات الزمنية الثلاث اعلاه . بالنسبة للغبار المتصاعد .المعدل الشهري لمجموع الغبار المترسب على اوراق نبات الدودونياكان معنويا لشهر اذار ( 0.70 غم / سم ²) ومايس (0.38 غم / سم ² ) وحزيران (0.38 غم / سم ²) للمناطق الثلاث تحت الدراسة .معدل عدد المرضى كان 8848.0 ، واقل قيمة هي 6902.00 وكانت في شهر كانون الثاني ، واعلى قيمة12940.0 في شهر حزيران .ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والغبار المترسب (r =0.9679) ، والمعادلة الاتية توضح العلاقة : Y=12684.505e - 86.3442X العلاقة بين عدد المرضى الشهري (Y) والغبار الجوي المتصاعد(X)Rising dust Y=11841.62 - 2211.404+220.69X2 ….. r = 0.8033ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والعواصف الغبارية (r = 0.6763) Y=480.00+20168.42X - 9993.53X2 ….. r=0.6763ولاتوجد علاقة معنوية بين عدد المرضى والغبار المعلق Y=11749.138 - 785.34X+39.21X2 ….. r=0.3772 وقد تبين من نتائج التحاليل الكيمياوية للغبار المترسب ان هناك فرقا معنويا في نسبة الكاربون العضوي للمناطق الثلاثة ونسبة المادة العضوية والكالسيوم والمغنيسيوم وملوحة التربة وتفاعلها ، بينما لا يوجد فرق معنوي بالنسبة لمحتوى الرصاص والكاربونات والبيكاربونات والكلورات .

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لاعلاف الدواجن والتحري عن مستوى التلوث بالافلاتوكسين == Isolation and identification of fungi associated with poultry feeds and detection of aflatoxin contamination level

Author name: هـبـة فـرحان دلــــي
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبـود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تحديد مدى تلوث بعض اعلاف الدواجن(خليط من بذور بعض المحاصيل) المعروضة في بعض الاسواق المحلية لبعض محافظات العراق بالفطريات ، وتحديد قابلية عزلات الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسينات فضلا عن تقييم كفاءة اربعة ممد صات كيميائية في ٳمدصاص سم الافلاتوكسين B1 من الاوساط السائلة . اظهرت نتائج عزل وتشخيص الفطريات المعزولة من 52 عينة من اعلاف الدواجن من محافظات بغداد ،ديالى ،بابل ،السماوة ،كربلاء ،القادسية وميسان تواجد الانواع الفطرية الاتية في الاعلاف : Alternaria alternaria وAspergillus candidus وAsp.clavatus وAsp.flavipesوAsp.flavus وAsp.fumigatus وAsp.niger وCephalosporium spp. وCladosporium cladosporioids وFusarium graminearum وF.moniliforme وF.oxysporum وGonatosbotrys simplex وMucor sp. وPenicillium citrinum وP.chrysogenum وP.cyclopium وP.expansumوP.griesofulvum وP.oxalicum وUlocladium sp. ومجموعة Mycelia sterila fungi. وفيما يخص نسبة التواجد فقد كان الجنس Aspergillus sp. هو الاعلى في معظم العينات المفحوصة اذ بلغت نسب تواجده 99.15 ،100 ،100 ،94.55 ،100 ،98.58 ،100 و95.24% في العينات B4 ،B11 ،B13 ،B16 ،B17 ،Kh6 ،M1 وM3. وسجل النوع Aspergillus flavus اعلى نسبة مئوية للتواجد بالنسبة لبقية انواع الجنسAspergillus sp. اذ بلغت نسب تواجده 88.03 ،85.71 ،71.43 و% 87.5 في العينات B4 ،B17 ،C2 وC3. في حين ظهر الفطر Cladosporium cladosporioids بشكل متوسط وبنسب مئوية 41.67 ،56.25 ،72.22 ،71.43 و50 % في العينات B¬1 ،B2 ،B6 ،B7 وC1 . اما الفطر Gonatobotrys simplex فقد سجل اقل نسبة مئوية للتواجد بلغت 0.5 % في العينة Di1. وفيما يـخـص تـكـرار العـزل قـد اظهر الجـنـس Aspergillus sp. اعـلـى تكرارات بـلـغت 19 : 18 ،7 : 7 ،3 : 3 ،3 : 3 ،6 : 5 ،6 : 6 و8 : 8 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل،السماوة ، كـربلاء ، القادسيـة ومـيـسان ومـن بـيـن انـواع الجـنـس Aspergillus sp. سجـل النـوع Aspergillus flavus اعـلـى تكرارات عـزل بـلـغت 19 : 15 ،7 : 5 ،3 : 3 و3 : 3 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل ، الســماوة على التوالي . اظهر الفـطـر Cladosporium cladosporioids تـكـرار عــزل بلغت متوسطاته 19 : 8 ،7 : 3،6 : 2 و8 : 4 % في عينات محفظات بـغـداد ، ديالـى ، كربلاء وميسان . اما اقل تكرار عزل فسجله الفطر Gonatobotrys simplex اذ بلغ 7 : 1 % في عينات محافظة ديالى . وبالنسبة لبقية الفطريات فقد اظهرت نسب تواجد وتكرارات عزل متباينة حسب مصدر العينات ومكوناتها . وفيما يخص الحمل الفطري فقد سجلت محافظة كربلاء اعلى معدل للحمل الفطري بلغ 253×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، وسجلت محافظة القادسية معدل حمل فطري متوسط بلغ 140×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، في حين كان اقل معدل حمل فطري لمحافظة السماوة اذ بلغ 3.4×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف . اظهرت نتائج قابلية 37 عزلة من الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسين ان 13 عزلة فقط اظهرت قابلية على انتاج الافلاتوكسين B1، وتفوقت العزلة 6B من محافظة بغداد على بقية العزلات في القابلية على الانتاج اذ سجلت قابلية فائقة في الانتاج (++++) . اظهرت نتائج الكشف بتقانة TLC كفاءة كل من قشور الرمان والفحم المنشط والكايتوسان كعوامل ممدصة ، وكانت قشور الرمان اكفا هذه العوامل اذ اظهرت اكبر مساحة بقعة واشد تالق مقارنة ببقية المعاملات الاخرى، في حين اظهر الفحم المنشط كفاءة جيدة في الامدصاص ولكن بمستوى اقل من الدباغ. اما فيما يخص الكايتوسان قد اظهر كفاءة قليلة كعامل مدمص بينما اظهر الطين عدم كفاءته كعامل مدمص الا انه اظهر كفاءة عالية في التحطيم حيث ادى الى اختفاء السم من الراشح والراسب. | This study was aimed to determine the fungal contamination levels of poultry feeds(grains mixture of agricultural crops) exhibited in local markets of some Iraqi governorates, the aflatoxin toxigenic activity of Aspergillus flavus isolated isolates and evaluation of four materials as detoxification agents. The results of fungal isolation and identification of 52 poultry feed samples collected from Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan governorates revealed presence of the following fungal species : Alternaria alternaria,Aspergillus candidus, Asp.clavatus, Asp.flavipes, Asp.flavus, Asp.fumigatus, Asp.niger, Cephalosporium ssp., Cladosporium cladosporioids, Fusarium graminearum, F.monilforme, F.oxysporum, Gonatobotrys simplex, Mucor sp., Penicillium citrinum, P.chrysogenum, P.cyclopium, P.expansum, P.griesofulvum, P.oxalicum , Ulocladium sp. and Mycelia sterile fungi group. Genus Aspergillus showed the highest percentage of occurence in most tested samples which recorded 99.15 ,100 ,100 ,94.55 ,100 ,98.58 ,100 and 95.24 % in samples B4 ,B11 ,B13 ,B16 ,B17 ,Kh6 ,M1 and M3, respectively. Species Asp.flavus recorded the highest percentage of occurence among other Aspergillus species which recorded 88.03 ,85.71 ,71.43 and 87.5% in samples B4 ,B17 ,C2 and C3, respectively, while the fungus Cladosporium cladosporioids appeared in moderate percentage when recorded 41.67 ,56.25 ,72.22 ,71.43 and 50 % in samples B1 ,B2 ,B6 ,B7 and C1, respectively. Fungus Gonatobotrys simplex showed the lowest percentage of occurence (5.0% in Di1). The genus Aspergillus also recorded highest isolation frequencies (18 : 19 ,7 : 7 ,3 : 3 ,3 : 3 ,5 : 6 ,6 : 6 and 8 : 8 %) in (samples Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan).However, among isolated species, Asp.flavus recorded highest frequencies 15 : 19 ,5 : 7 ,3 : 3 and 3 : 3 % in samples Baghdad, Deila, Babil and Seemawa respectively, while Cladosporium cladosporioids showed moderate isolation frequencies 8 : 19 ,3 : 7 ,2 : 6 and 4 : 8 % in samples Baghdad, Deila, Karbala and Maysan respectively and the Gonatobotrys simplex the lowest (1 : 7 %) in Deila samples. Other fungal isolates showed different percentages of occurence and isolation frequencies according to the source and components of the collected Samples. Karbala governorate recorded highest rate of fungal load (253×106 CFU / gm feed), moderate rate (140×106 CFU / gm feed) recorded by Kadisia samples, while the lowest (3.3×106 CFU / gm feed) by Seemawa samples. The results of toxigenic activity of 37 isolates of Asp.flavus showed that only 13 of them have toxigenic activity, and isolate B6 was the most toxigenic than other isolates. The results of TLC showed the efficiency of Pomegranate pericarp , activated carbon and chitosan as absorption agents. Pomegranate pericarp was the most efficient as manifested by area and severe fluorescence of it's sopt followed by activated carbon and chitosan which recorded the lowest efficiency, while clay had no efficiency as absorption agents but it showed high efficiency in toxin degradation as manifested by the disappearance of the toxin in both filterate and precipitate.

علاقة الحركيات الخلوية بالتهاب المعدة المزمن لدى عينة من المرضى العراقيين == Association of Cytokines with Chronic Gastritis in A sample of Iraqi Patients

Author name: نرجس عبد الرحمن عودة اللامي
Supervisor name: اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد التهاب المعدة المزمن من المشاكل الصحية الكبرى الواسعة الانتشار في العالم وتعتمد الاصابة به على نوع المسبب المرضي ومدى فعاليته اضافة الى قوة الاستجابة الالتهابية والمناعية (الخلوية والخلطية) للمضيف، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف تقييم بعض المعايير المصلية والنسيجية التي يمكن من خلالها تشخيص نوع المرض والاصابة ببكتريا H.pylori، ولتوضيح تاثير بعض العوامل المناعية والالتهابية على الحالة المرضية لدى مرضى التهاب المعدة المزمن. شملت الدراسة (100) مريض عراقي يعانون من اعراض عسر الهضم خضعوا للتنظير المعدي واستئصال الخزعات النسيجية (61 ذكر، 39انثى) تراوحت اعمارهم بين 10 الى 79 سنة، وقسمت مجموعة المرضى وفقا للتشخيص النسيجي الى ثلاثة مجاميع، الاولى تضم 66 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن الفعال Active Chronic Gastritis ، والثانية 21 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن السطحي Superficial Chronic Gastritis، اما الثالثة فشملت 13 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن غير الفعال Inactive Chronic Gastritis، فضلا عن ثلاثين متطوع من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة. اجريت الدراسة في المركز التعليمي لامراض الجهاز الهضمي والكبد في دائرة مدينة الطب في بغداد ومختبرات الصحة المركزية، واستمرت للمدة من تشرين الثاني 2007م الى نيسان 2008م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1 - ان الاصابة بالتهاب المعدة المزمن في الذكور اعلى منها في الاناث؛ اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 1.56 ومتوسط اعمارهم (40.03) سنة، لكن لم يشكل هذا الفرق دلالة معنوية (P> 0.05).2 - اظهرت الفحوصات النسيجية للمعده وجود بكتريا H.pylori بنسبة (66%) من المجموع الكلي لمرضى التهاب المعدة المزمن. 3 - تبين من خلال الفحوصات السيرولوجية للتحري عن اضداد IgG ضد H.pylori اصابة (70%) من مرضى التهاب المعدة المزمن ببكتريا H.pylori مقارنة بالمرضى غير المصابين بالبكتريا (30%) وقد اكتسب هذا الفرق دلالة معنوية جدا(P < 0.01)،كما ارتفع مستوى اضداد IgG ضد بكترياH.pylori لدى مجاميع المرضى الثلاثه ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P < 0.05).4 - اظهرت الاختبارات السيرولوجية لتقييم حالة الطبقة الظهارية لمخاطية المعدة - ارتفاع مستوى الكاسترين - 17 لدى مجاميع المرضى الثلاثة ICG وSCG وACG على التوالي بدلالة معنوية (P < 0.05) مقارنة مع مجموعة السيطرة. - وجد هناك فرق معنوي (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين I لدى مرضى ACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة لكن لا يعد ذلك ارتفاعا في مستوى PGI لكون قيمته كانت ضمن النسب الطبيعية لمستوى PGI في مصل الدم. - لوحظ وجود علاقة معنوية (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين II لدى مرضى ACG فقط مقارنة بمجموعة السيطرة، بينما لم تلاحظ اي فروقات معنوية (P > 0.05) في مستوى نسب PGI/II لدى مجاميع المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة. 5 - الحركيات الخلوية Cytokines - ارتفاع مستوى IL - 4 في مصل مجاميع المرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - اظهرت مجاميع المرضى ICG وSCG وACG على التوالي ارتفاع مستوى IL - 8 في المصل مقارنة بالسيطرة وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك ارتفاع في مستوى IL - 10 في مصل مجاميع المرضى ACG وICG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا لدى مرضى ACG فقط (P < 0.01). - ارتفع مستوى IFN - γ في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل الارتفاع فرقا معنويا (P < 0.05). - اظهرت مجاميع مرضىACG وSCG وICG على التوالي ارتفاع مستوى GM - CSF في المصل مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا ( P < 0.05). 6 - الكلوبيولينات المناعية Immunoglobulines - ارتفع مستوى IgG في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - لوحظ ارتفاع مستوى IgA في مصل مجاميع مرضى ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك اختلاف في مستوى IgM بين مجاميع المرضى والسيطرة وكان الاختلاف معنويا لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة. 7 - مكوني المتمم C3، C4 - ظهر فرق معنوي (P<0.05) في مستوى C3 لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة، فيما كان مستواه لدى مرضى التهاب المعدة المزمن عامة ومرضى SCG وICG مقاربا لمجموعة السيطرة ومن دون فروقات معنوية. - ارتفع مستوى C4 في مصل مجاميع مرضى ICG وSCG وACG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). 8 - اظهر التحليل الاحصائي وجود فروقات معنوية بين المرضى والحالة الاقتصادية والاجتماعية (P < 0.01) وكانت اعلى نسبة للتكرارات لدى المرضى ذوي الحالة الاقتصادية والاجتماعية الواطئة. فيما لوحظ انخفاض المستوى التعليمي لدى مرضى التهاب المعدة المزمن وقد شكل هذا الانخفاض دلالة معنوية (P<0.01). وعند المقارنة الاحصائية بين المرضى والاعراض السريرية وجد ارتفاع تكرارات المرضى لمجموعة من اعراض عسر الهضم واكتسب الارتفاع دلالة معنوية (P<0.01). 9 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقة طردية بين IL - 4 وكل من PGII وIL - 10 وIgG وكانت العلاقة طردية ايضا بين IL - 8 مع IgG وC4 وIgA وG - 17، فيما ارتبط مستوى IL - 10 بعلاقة طردية مع IFN - γ وPGII وC4، وظهر ايضا وجود علاقة طردية بين IFN - γ وكل من IL - 8 وIgA وC4 وIgG، وقد اكتسبت هذه العلاقات دلالة معنوية (P < 0.05). | The chronic gastritis is considered as one of the greatest health problem that is widely distributed throughout the world, and the disease depends on the type and the activity of the causes, furthermore the strength of immune & inflammatory response (cellular & humeral) of the host, The present study was conducted to estimate some of serological & histological parameters in order to diagnose both the type of disease, and infection with H.pylori, in addition to shed light on influence of some immunoinflammatory factors on pathogensis of thechronic gastritis. The study included (100)Iraqi patients (61 male & 39 female) are suffering from dyspepsia , and submitted for gastroendoscopy and biopsy. their age varied between 10 to 80 years. All patient groups were divided according to histological diagnosis into three groups , 66 with Active Chronic Gastritis (ACG), 21 with Superficial Chronic Gastritis (SCG) and 13 with Inactive Chronic Gastritis (ICG), with apparently health 30 individuals volunteers as control group, the study was carried out in the Gastroenterology and Hepatology Teaching Center in Medical City and Health Central Laboratories from November 2007 to April 2008. The study revealed the following results : 1 - The present study showed the frequency of chronic gastritis is higher among males than females; with ratio was 1.56 : 1 respectively; The mean age was (40.03) years, with non significant difference (P<0.05). 2 - Histological examinations revealed the incidence of H.pylori is (66%) among all patients. 3 - Serological examinations showed significance, that increasing number of patients with chronic gastritis infected with H.pylori (70%) compared with non infected (30%) Also highly significant increased (P<0.01) was observed in serum level of IgG antibody anti - H.pylori in the three patient groups : ACG, SCG, ICG respectively as compared with control group. 4 - Estimation of mucas epithelial layer state : - Significant increase (P<0.05) in serum level of Gastrin - 17 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively as compared with control group. - Significant difference (P<0.05) was found in serum level of pepsinogen I in patients groups : ACG, SCG respectively as compared with control group but that is not consider increase in the level of PGI because the values lies among the normal ratio of PGI level in serum. - There is significant relationship (P<0.05) was observed in serum level of pepsinogen II only in patients of ACG compared with control group, wherease non significant differences (P<0.05) was observed in the ratios of PGI / II in the patients groups compared with control group. 5 - Cytokines : - Significant increase (P<0.05) in the serum level of IL - 4 in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - All patients groups ICG, SCG, ACG respectively revealed highly significant increased (P< 0.01) in the serum level of IL - 8 compared with control group. - Highly significant increased (P<0.01) was observed of IL - 10 in all patients groups : ACG, ICG, SCG respectively compared with control group. - Highly level of IFN - γ in serum of all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively, This increament formed significant difference (P<0.05). - All patients groups ACG, SCG, ICG consequently revealed significant increased (P<0.05) in the concentration of GM - SCF as compared with control group. 6 - Immunoglobulines : - Highly significant increased (P<0.01) in the level of serum IgG in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - Highly significant increase was observed in the level of serum IgA in all patients groups : ACG, SCG, ICG consequently compared with control group (P<0.01). - Patients groups revealed difference in the level of serum IgM compared with control group, but this difference was significant only in ACG patients (P<0.05). 7 - Complement components C3 and C4 : - Appearing significant difference (P<0.05) in the serum level of C3 only in ACG patients compared with the control group, but non significant difference when compared general patients of chronic gastritis and SCG, ICG patients with control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the serum level of C4 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively compared with control group. 8 - Statistical analysis appeared significant difference (P<0.01) between patients with low socioeconomic state & educational level and inassociation with severity of clinical diagnosis & increased frequency of patient that’s are suffering from dyspepsia. 9 - The result of present study revealed direct correlation between IL - 4 with (PGII, IL - 10 & IgG), IL - 8 with (IgG, C4, IgA & G - 17), IL - 10 with (IFN - γ, PGII & C4) and IFN - γ with (IL - 8, IgA, C4 & IgG). This correlations request significant evidence (P<0.05).

التحري الجزيئي والتعبير الجيني لمضخات الدفق في بكتريا Pseudomonas aerugionsa متعددة المقاومة للمضادات الحيوية == The Role of Efflux Pumps in Multidrug - Resistance in Colistin - resistant Pseudomonas aeruginosa

Author name: نبراس رضا محمد العبيدي
Supervisor name: محمد فرج شذر المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 120 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa للمدة من /15 2014/9 لغاية /11/15 2014, من مصادر سريرية مختلفة شملت : (33عزلة ) من الادرار , و(25عزلة) من الحروق , و(25عزلة ) من القشع , و(17عزلة) من الجروح , و(12عزلة ) من الدم, و( 5عزلات ) من الاذن , و(3 عزلات) من ادوات قثطرة المجاري البولية. اختبرت حساسية العزلات قيد الدراسة تجاه مضاد الكولستين باستعمال طريقة الاقراص واظهرت النتائج وجود 27) ) عزلة مقاومة للكولستين وبنسبة (%22.5) , ثم اختبرت مقاومة60 عزلة (منها 27 عزلة مقاومة للكولستين ) تجاه اثناعشر مضادا من مجاميع مختلفة وتم تحديد حساسية العزلات ومقاومتها للمضادات المايكروبية باعتماد قياس قطر منطقة التثبيط بالمليمتر حول اقراص المضادات المستعملة , واظهرت النتائج ان جميع العزلات المختبرة كانت مقاومة بشكل تام لمضادات Amoxicillin وCarbencillin بينما ابدت العزلات مقاومة لمضاداتGentamycin بنسبة (%70) و(%56.6) Tobramycin وLomefloxacin (%58.3)وكانت المقاومة اقل لمضادات Aztreonam (%18.3) وPolymyxin B بنسبة (%18.3) وتليها المقاومة لمضادNorfloxacin (%13.3)و Levofloxacin (%11.6) وتجاه Ciprofloxacin الاقل مقاومة بنسبة (%8.3) .اختبرت قابلية (60) عزلة اعلاه على انتاج انزيم البروتييز وتكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج قابلية % 88.3 من العزلات 53) عزلة )على انتاج انزيم البروتييز, وكانت جميع العزلات المقاومة للكولستين منتجة لانزيم البروتييز وبنسبة %100 , من جانب اخر كانت 43 عزلة (%71.7) منتجة طبقة لزجة قوية محددة بوساطة تكوين مستعمرات سوداء دلالة على تكوينها الغشاء الحيوي .تم الكشف عن وجود مضخات الدفق بين 60 عزلة من عزلات الدراسة ( منها 27 عزلة مقاومة لمضاد كولستين و33 عزلة حساسة له) باعتماد طريقة العجلة الخشبية Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) باعتماد صبغة الاثيديوم برومايد كمؤشر للكشف عن مضخات الدفق , واظهرت النتائج ان 46 عزلة (76.7%) من العزلات المختارة اعطت نتيجة موجبة للفحص اعلاه , ومن جانب اخر كانت جميع العزلات المقاومة للكولستين موجبة للفحص مما يدل على امتلاكها لمضخات الدفق , اما بالنسبة للعزلات الحساسة للكولستين فكانت %33.3منها تملك مضخات دفق بالكشف المظهري . اخضعت 32 عزلة (27 منها كانت مقاومة للكولستين) للكشف الجيني عن مضخات الدفق باستعمال تقنية Conventional PCRللكشف عن مضخة الدفق MexAB - OprM (بالكشف عن جينات oprMو (mexAومضخة الدفق MexXY (بالكشف عن جين mexY) اظهرت النتائج ان20 عزلة (62.5%) تمتلك الجينoprM , وان 22عزلة (68.8%) تمتلك الجين mexA , و24 عزلة (75%) تمتلك الجينmexY , وبينت النتائج ايضا بخصوص الكشف الجيني عن مضخات الدفق لعزلات الدراسة ان جميع العزلات الموجبة لاختبار امتلاك الجين mexYهي مقاومة للكولستين وقد شكلت نسبة %88.9 من العزلات الكلية المقاومة للكولستين . وتم الكشف عن التعبير الجيني لمضخة الدفق OprM - MexAB (بدراسة الجين (mexB ومضخة الدفق MexXY ( بدراسة الجين mexX) في 9 من عزلات الدراسة والتي كانت مقاومة لمضاد الكولستين باستعمال تقنية q RT - PCR من خلال استخلاص RNA البكتيري , ومن ثم تحويله الى cDNA , واظهرت نتائج الكشف عن التعبير الجيني للجين mexB والجين mexXان العزلات كانت متباينة في قيم ct , وبحسب معادلة Livak تم استخراج قيم ct ومعرفة التعبير الجيني لمضخات الدفق , ولوحظ ان التعبير الجيني لمضخة الدفق MexXY اكثر من التعبير الجيني لمضخة الدفق MexAB - OprM . | A total of (120) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were collected from different sources , During the period between 15/9/2014 till 15/11/2014 . The source of these isolates were as follows : (33) isolates from urine , (25) isolates from Burns , (25) isolates from sputum , (17) isolates from Wounds , (12) isolates from Blood , (5) isolates from ears ,and the last (3) isolates from Catheters . All isolates were identified through morphological , cultural and some biochemical tests and using Vitek2 GN . The antibiotic susceptibility test Towrd Colistin was done using the agar diffusion method ; Results showed that 27 isolates (%22.5) were resistance to Colistin ,then Sixty isolates ( Ones 27 isolates resistance to Colistin ) were tested against twelve antibiotic by measuring inhibition zone around disk antibiotic , Result showed that All isolates were complete resistance to Amoxicillin and Carbencillin , While resistance to other antibiotic were Gentamycin (70%) , Tobramycin (56.6%) , Lomefloxacin (58.3%) , and less resistance was showed for Aztreonam(18.3%) , Polymyxin B (18.3%), Norfloxacin(13.3%) , Levofloxacin(11.6%) and Ciprofloxacin (8.3%) ,The most effective antibiotic against Colistin resistance isolates were Levofloxacin and Ciprofloxacin . Sixty of isolates were choosen to detect for ability to protease production and biofilm formation , The Results showed 53 isolates (%88.3) were protease production , and results showed all Colistin resistant isolates were protease production and 43 isolates (%71.7) were able to biofilm formation . Sixity isolates (Ones 27 Colistin resistance isolates ) were choosen for detect efflux pumps by using Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) , which include ethedium bromide dye as marker to detect efflux pumps , the result showed that 46 isolates (%76.7) give positive result . Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the mexA , mexY, oprM gene , The results showed that oprM found in 20 isolates (%62.5) , mexA found in 22 isolates (%68.8) , mexY found in 24 isolates (%75) , The results also showed that 88.9 % from Colistin resistant isolates had mexY gene . Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction of Colistin resistant isolates and c DNA synthesis , The results showed that gene expression were high in efflux pumps especially to MexXY efflux pumps , and the gene expression to MexXY efflux pumps higher than MexAB - OprM efflux pums

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية == Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

Author name: نشميل علي حسن الهواسي
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين == Study of some immunological aspects of Iraqi patients with ATOPIC DERMATITIS

Author name: ميادة نوري اقبال الدوسكي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف الحصول على المزيد من الايضاحات حول تاثير الاضطرابات المناعية على الحالة المرضية عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين ،لقد تم خلال هذه الدراسة اخضاع 124 مريضا من كلا الجنسين (55مريضاﹰمن الذكور و69من الاناث ) تتراوح اعمارهم ما بين(6 - 55 ) سنة من الذين شخصوا كمرضى التهاب جلدي متماحل ،حيث كان بينهم 48 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل البسيط و76 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل الشديد ، اضافةﹰالى(50) شخصاﹰمن الاصحاء ظاهرياﹰ كمجموعة سيطرة ، تم اخضاعهم الى مختلف الاختبارات بضمنها الفحوصات المختبرية المالوفة للحساسيةوقياس المعلمات المناعية حديثة الاكتشاف بالاضافة الى عزل وتشخيص بكتريا الـ Staphylococcus spp. .اظهرت النتائج اختلاف انتشار مرض التهاب الجلدي المتماحل بين مختلف الفئات العمرية وكذلك بين الجنسين حيث كان نسبة انتشار المرض عند الاناث اكثرمن الذكور. من خلال فحص الجلد وباستخدام (13) نوع من المستارجات، تم التوصل الى انه المستارجات داخل المباني indoor allergens اعلى نسبة للتفاعل الموجب لفحص الجلد ضمن كل مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ،ومن بينها كان حلم الغبار المنزل HDM هو اكثر الانواع تكرارا فى الظهور بنسبة =5‚68 في حين كان لثيل البرمودا Bermuda grass وخليط انواع المختلفة النسبة الاعلى بين حبوب اللقاح =7‚ 13 % و1‚ 12 % على التوالي ، وكذلك لخليط الفطريات نوع MMI النسبة الاعلى بين الفطريات =9‚12%. باستخدام اختبار الامتزاز المناعي للانظيم المرتبط ELISA تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي(E) الكلي والنوعي في مصل الدم ، وكانت قيمة المتوسط الحسابي للكلوبيولين المناعي(E) الكلي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد اعلى وذات فرق احصائي معنوي عنها في كل من مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط ومجموعة السيطرة الاصحاء.وكذلك تم احتساب مستوى الكلوبيولين المناعي (E)النوعي في مصل الدم وذلك لـ 19 نوع المستارجات اظهرت نتائج الدراسة ان الكلوبيولين المناعي (E)النوعي الاكثر تكرارا في كل مجاميع الدراسة من المرضى كان للمستارج D2 بنسبة =7‚ 63 % يتبعه للمستارج H2بنسبة = 7‚ 59 % ،ثم للعشب G2 وبنسبة = 9‚ 58 % تبعهم الكلوبيولين النوعي للفطر M1 = 5‚ 57 % ، F29 =8‚ 54 % ، = F23‚ 54 %، W6 =6‚ 51 % ، M4 = 50 % ، G1 = 50 % ، G15 =2‚ 49 % ، W1 =5‚ 43 % ، M6 =8‚ 46 % ، D1 =46 % ، M2 =5‚ 43 % ، بينما كانت نسبة الكلوبيولين (E ) النوعي للـ F73 مساوي لـ T9 = 1‚ 37 % ،و 9‚ 33 % للمستارج W9 . في حين كانت اقل نسب للكلوبيولين النوعي ضد كل من T3 ، T5 وكانت تساوي 4‚ 23 % ،1، 16 % على التوالي .ان نسبة التطابق الاجمالية بين فحص الجلد ومستوى الكلوبيولينات المناعية النوعية لـخمسة من المستارجات كانت بمقدار9‚ 83 % كما كانت حساسية الاختبار بنسبة 100% لاشجار Mediterranean و19% لاعشاب Mugwort في حين كانت نسبة خصوصية الاختبار 98 % مساوية لكل من Plantain ,Betula واعقبتها المستارجات Fagac ,Bermuda =5‚97% ، 7‚96% على التوالي .اما المستارج HD اظهر اقل نسبة خصوصية وكانت2‚74% لم يلاحظ اي اختلاف معنوي في مستوى الكلوبيولينات المناعية (M , A ) واحدى مكونات المتمم C3 في المصل بين المجاميع الثلاثة قيد الدراسة بينما لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الكلوبيولين المناعي G واحدى مكونات المتمم C4 عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاء. وجد ان عدد خلايا اليفة الايوسين في الدم اعلى معنويا عند كل من مجموعتي المرضى بالمقارنة مع الاصحاء. لم تظهر النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي CD3 اي فروقات معنوية ضمن مجاميع الدراسة ،بينما النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي .CDميادة نوري اقبال الدوسكيكانت اعلى معنويا عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عما هو عليه في كل من مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء. المعلم المناعي الـ CD8 اظهر انخفاض معنوي عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاءولوحظ فروقات معنوية في نسبة الخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 ضمن مجاميع الدراسة مما ادى الى ارتفاع نسبة ((CD4/CD8 ارتفاعا ملحوظا ضمن مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومقارنة بالاصحاء وخاصة عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.كذلك لوحظت اضطرابات في الاستجابة المناعية الخلوية تجاه المشطر اللانوعي PHA ومستخلص البروتيني عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.احد النتائج المهمة في هذه الدراسة هي ان متوسط مستوى الانترلوكين نوع IL - 4 يزداد بشكل معنوي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل عن الاصحاء ،ان مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط اظهرت زيادة معنوية مقارنة بمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد والاصحاء (1‚84، 9‚58،4 ‚15 بيكوغرام/مل ) في حين ان مستوى الانترلوكين نوع IL - 5 في المصل كان اعلى في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عن مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء(5‚95، 9‚75، 2 ‚23 بيكوغرام/مل ) ، بالاضافة الى ذلك ظهرت علاقة خطية موجبة بين IL - 5 واعداد خلايا اليفة الايوسين في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اما فيما يتعلق بمجاميع الدم فلم تظهر اية علاقة معنوية موجبة بين مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومجاميع فصائل الدم بالرغم من انتشار مرض الالتهاب الجلدي المتماحل ضمن الاشخاص ذوي فصائل الدم A, B .الجزء الاخير من الدراسة تضمن اخذ مسحات للجلد لكل من المرضى والاصحاء ، تم زرعها بشكل مناسب لعزل وتشخيص بكتريا المتواجدة فيه . لقد اوضحت النتائج ان بكتريا Staphylococcus aureus كانت الاكثر تكرارا لدى مرضى الالتهاب الجلد المتماحل بنسبة 7‚ 76 % وبالاخص مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد بينما Staphylococcus epidermidis كانت نسبتها3‚ 23 % .فيما يخص علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مع مختلف المعلمات المناعية ،فقد لوحظ وجود علاقة خطية موجبة معنوية مع عدد من الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) النوعي ،الى جانب ذلك فقد بينت النتائج وجود علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي مع عدد خلايا اليفة الايوسين عند كل مرضى الالتهاب الجلد المتماحل النسب المئوية للخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 وCD19ونسبة CD4/CD8 وIL - 4 ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اظهرت علاقة موجبة معنوية مع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي ،في حين علاقة الانترلوكين IL - 5 مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي هي علاقة سلبية واظهرت النتائج ايضا وجود الـ Staphylococcus aureus ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل هو مقترن مع زيادة او ارتفاع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مما ادى الى علاقة موجبة .فيما لم تظهر الكلوبيولينات المناعية ( M , A ) علاقة موجبة مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي عدا الكلوبيولين المناعي G حيث اظهر علاقة ضعيفة ،كذلك الحال بالنسبة لعلاقة شدة المرض مع مختلف المعلمات المناعية حيث اظهرت النتائج وجود علاقة موجبة ذات قيمة معنوية احصائيا مع كل من عدد الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) وعدد خلايا اليفة الايوسين ،ونسبة CD4/CD8 ، مستوى الانترلوكين IL - 5 في المصل ، اضافة الى ذلك كانت نسبة انتشار بكتريا Staphylococcus aureus مقترنة مع شدة المرض. | The favor of this work, is first at all, and above all, is all Allah's. I would like to express my profound thanks and sincere gratitude to my supervisor Dr. Rajwa H.AL - Rubai’e for her valuable scientific guidance, encouragement and support that made it possible for me to accomplish this study. I extend my deep gratitude also to my supervisor Dr. Jassem T. AL - Khafaji for his scientific advice, clinical instructions, in addition to his provision of laboratory materials and equipment. I should express my gratitude to the head and all the employees of the Department of Biology in the College of Science, AL - Mustansiriya University.Deepest gratitude goes to consultant center for Allergy and Asthma especially, Dr. Arij AL - Ani and Dr. Omar AL - Janabi for preparing the diagnostic cases and the chemist Mrs. Aysar F.AL - Aumari and Alaa’s father, Hamssa’s mother for their generous help and their kind assistance in presenting the possible facilities in the lab work.Thanks are also dedicated for Fransois Tron for his cooperation in help me to complete our research in laboratories of Rouen University France. My sincere gratitude presented to Dr. Abdul Alkhaliq AL - Naqeb for their efforts and help in statistical analysis.From my deep hearts, I would express my thanks and respect to my colleagues for their encouragement during my study. Finally, I would like to express my deepest and warmest gratitude and indebtedness to my family, for their kind, love and help in one way or another, and to all those who have contributed to the completion and success of this project. Mayada N. AL - DoskiResearcher SummaryA Prospective study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of atopic dermatitis (AD) among Iraqi patients. One hundred twenty four cases of AD (55 males and 69 females), ranging in age between (6 to 55) years, Patients were grouped as mild AD (48) and severe AD (76), according to severity, and (50) apparently healthy individuals used as a control group (24 males and 26 females). They were studied using different allergic, immunological and hematological tests; in addition to that Staphylococcus species were isolated and diagnosed, Atopic Dermatitis occurred in different ages and most frequently in females than males.Skin test analysis of 13 allergens revealed that AD patients had higher proportions of positive skin reactivity to indoor allergens, among them House dust mites HDM was the most frequent = 68.5%, Bermuda grass and grasses mixture had the highest frequency = 13.7%, and 12.1% respectively among pollens, whereas mould mixture I were the most frequent moulds = 12.9%. Enzyme linked immunosorbent assay ELISA was used to measure serum IgE levels. The mean total IgE was significantly higher in severe than in mild AD and healthy control groups. The quantitative of serum specific IgE was carried out for 19 allergens. Among all AD cases, the most frequent specific IgE was found to D2 = 63.7% followed by H2 = 59.7%, G2 = 58 .9%, M1=56.5%, F29= 54.8%, F2= 54.03%, W6= 51.6%, M4= 50%, G1=50%, G15= 49.2%, W1= 43.5%, M6 = 46.8%, D1 = 46%, M2 = 43.5% and F73 and T9 are equal = 37.1% and 33.9 % for W9. However the least rates were to T3 and T5=23.4% and 16.1% respectively, in contrast to that of healthy controls which showed negative results for most allergens with the exception of M1= 24% = followed by W9 = 16% . The relationship of skin test with serum specific IgE level for seven compatible allergens showed an overall agreement of (83.9%) sensitivity for Mediterranean trees=100%, Mugwort=99%, specificity for Plantain equal to Betula = 98%, followed by specificity for Bermuda and Fagac = 97.5%, 96.7% respectively while the least were to HD = 74.2%. No significant differences between all AD patients and healthy controls as well as between two types of AD patients could be detected in IgM, IgA and C3 serum levels, while serum IgG and C4 levels were significantly increased in both types of illness compared to healthy controls. Blood eosinophil counts were significantly higher in all AD patients than healthy controls. No significant differences between all AD patients and healthy subjects in CD3+ lymphocyte percentage while CD19+ lymphocyte percentage was significantly higher in severe AD group than mild and healthy control groups. CD8+ lymphocyte percentage was significantly lower in all AD patients than healthy control group . Statistically significant differences were observed between the study groups in CD4+ lymphocyte percentage, the mean CD4+ / CD8+ ratio was higher in severe AD group compared to mild AD and healthy control. On the other hand a disorder observed in cellular immunity response to PHA and proteins extract among patients with severe AD. One of the important findings of this study, was that the mean serum IL - 4 was significantly increasing among AD patients as compared to healthy controls, also it was significantly higher in mild AD than severe AD and healthy control groups = 84.1, 58.9 and 15.4 pg/ml respectively, whereas serum level of IL - 5 was obviously higher in cases with severe AD group than mild AD and healthy control groups= 95.5, 75.9 and 23.2 pg/ml respectively. More over a significant positive linear correlation was found between IL - 5 and peripheral eosinophil counts in atopic dermatitis. The relationship between AD and ABO system has shown no significant correlation in spite of the highest frequency of A and B blood groups among atopic dermatitis patients. The last part of this study included skin swabs which were taken from AD patients. Samples were cultured on suitable media for isolation then identification bacteria. The results showed that Staphylococcus aureus was the most common organism isolated from AD patients =76.7% while Staphylococcus epidermidis was =23.3%. In severe AD group; the incidence of Staphylococcus aureus was higher than in mild AD group =70 %, 60% respectively. Regarding the association between total serum IgE and different immunological markers, the mean serum total IgE concentration was significantly increased with number of positive skin tests as well as serum specific IgE scored by subjects with AD. Also, the eosinophil counts revealed a statistically significant positive linear correlation with total serum IgE level in all AD group.CD4+ and CD19+ lymphocyte percentage and CD4+/CD8+ ratio among all AD groups showed significant positive linear correlation with total serum IgE concentration.The relationship between total serum IgE levels and IL - 4 concentration gave positive linear correlation; whereas, between IL - 5 and total IgE levels the results showed negative correlation. The results revealed that persistence of Staphylococcus aureus colonization in AD patients was associated with higher levels of total serum IgE leading to positive correlations between serum total IgE and Staphylococcus aureus persistence. There were no significant differences in level concentration of IgM, IgA with the exception of the IgG which showed a weak correlation. In conclusion, the association between AD severity and different immunological markers were assessed. The severity of AD group was associated with higher total serum IgE levels and number of specific IgE scored by subjects, as well as, eosinophil counts, CD4+/CD8+ ratio, level of cytokine in serum (IL - 5), in addition, the persistence of Staphylococcus aureus were associated with severity of AD disease.

تقيم بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة وجين Mitochondrial Cytochrome C - 1 oxidase لدى الرجال المدخنين والمصابين بفرط الكريات الحمر الثانوي == Evaluation of Some Oxidant - Antioxidant Parameter and Mitochondrial Cytochrome C - 1 Oxidase Gene in Smokers' Secondary Polycythemic Men

Author name: ميادة عبود محمود فرحان
Supervisor name: داخل غاني عمران الوطيفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: ان الدراسة الجارية تضمنت بحث بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة oxidant - antioxidant parameters)) وعزل mt - DNA لغرض تعيين الجين المشفر للانزيم cytochrome - oxidase - C لدى الرجال المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمر polycythemia)). كان العدد الكلي لا شخاص الدراسة120 رجلا , كان منهم 60 رجلا مدخنا مصابا بفرط الكريات الحمر اما العدد الباقي 60) رجلا( فقد كانوا اصحاء وغير مدخنين وقد استخدموا كمجموعة سيطرة (control). تراوحت جميع اعمار اشخاص الدراسة بين30 سنه الى 60 سنه تم تقسيم جميع اشخاص الدراسة(اصحاء ومرضى) الى ثلاثة مجاميع عمرية وكالاتي؛ المجموع الاولى (30 - 39 سنه) ؛المجموعة الثانية (40 - 49سنه) المجموعة الثالثة(50 - 59سنه). تميز جميع المرضى في هده الدراسة بارتفاع معنوي (p<0.05 ) في قيم حجم الخلايا المضغوط pcv)) عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء وقد لوحظ حصول ارتباط ايجابي (r=0.8) بين قيم pcv ومعدل العمر. اما بخصوص بروكسيدات الدهون lipid peroxidation)) فقد سجل مركب malondialdehyde ( وهو دليل واضح لا كسدة الدهون) ارتفاع واضح (p<0.05 ) لدى كل مجاميع المرضى عند مطابقتهم مع الاشخاص الاصحاء . وقد سجلت قيمه ارتباطا ايجابيا مع كل من العمر (r=0.4) ومستوى ال .(r=0.4) PCV وبشان معايير مضادات الاكسدة(Anti - oxidants) فقد اشرت قيم الكلوتاثيون المختزل (GSH) وهو مضاد اكسده غير انزيمي ) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى المجاميع الثلاثة للاشخاص المدخنين عندما قورنوا مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيمة ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2 )و قيم ال PCV (r= - 0.9).اعطت قيم فعالية الكاتليز (catalase activity) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى جميع الفئات العمرية للاشخاص المدخنين بالمقارنة مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيم فعالياته ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2)و قيم ال PCV (r= - 0.9).وبشان قيم فعاليات انزيم superoxide dismutase فقد تبين كدلك حصول انخفاضا ملحوظ p<0.05) ) لكل الفئات العمرية للاشخاص المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمراء عندما مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء. وتبين حصول ارتباط عكسي بين فعاليات SOD وكل من العمر (r= - 0.5)و PCV (r= - 0.5).نتائج الدراسة الحالية اثبتت بان التدخين وفرط كريات الدم الحمراء ليس لها تاثيرات على الجين المشفر ل cytochrome oxidase c1و الموجودة على DNA المايتوكوندريا باستخدام تقنية الPCR ومن النتائج الموضحة في اعلاه؛ فان الايضاح المدون لهده التغيرات يمكن اعزاءه الى العدد الهائل من الكريات الدم الحمراء ونواتج التدخين السامة والتي يمكن ان تسبب انخفاض جميع فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون وعلاوة على دلك؛ يلعب العمر دورا كبيرا في خفض فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون. | The current study was involved to investigate some oxidant - antioxidants parameters and isolation of mt - DNA for cytochrome c - 1 oxidase gene of smoker men affected with polycythemia . One hundered twenty (120) men were recruited in this study ,of them, sixty (60) smoker men affected with polycythemia and the remaining number (60) men were healthy men and serves as control group in this study . all ages of the enrolled subjects were limited between 30 - 60 years old .According to their ages, they were classified into three groups, first group(30 - 39 years old),second group(40 - 49 years old), and third group(50 - 59 years old). All patients included in this study have packed cell volume (PCV) higher than of their healthy counter parts and showed significant increase (p<0.05) when compared with healthy control men. Moreover, levels of PCV have a positive correlation (r=0.8) with advanced ages. concerning lipid peroxidation, malondialdehyde (MDA)as markers of lipid peroxidation was used, an its results revealed a significant increase (p<0.05) in all groups of smokers' polycythemic men and also showed a positive correlation with age (r=0.4) and PCV(r=0.4) Regarding markers of antioxidants, results of reduced glutathione (GSH) non - enzymatic antioxidants, were significantly decreased (p<0.05) in all tested groups in compared with those control group. it was found that results of GSH proportionate inversely with age (r= - 0.2) and PCV(r= - 0.9). About catalase activity , results of its activity indicated a marked decrease (p<0.05) in three age groups of smokers' polycythemic men in a comparison with control groups . the activity of catalase pointed out a negative correlation with both age and PCV(r= - 0.3 ,r = - 0.6 respectively) Serum superoxide dismutase (SOD)activity were also significantly decrease (p<0.05) in all age groups of smokers' polycythemic men when compared with those control group .The SOD activities were inversely proportionated with age and PCV(r= - 0.5, r= - 0.5, respectively). results of the present study confirmed that the smoking and polycythemia have not effects on cytochrome oxidase C1 gene of mt - DNA by using PCR technique. Finally, according to correct study that mentioned above the possible explanation to these findings can be showed that high PCV and toxic materials produced by smoking can be implicated with drop of antioxidant activities with increase lipid peroxidation. Moreover, aging can be exert negative action on these anti - oxidants that associated with increase lipid peroxidation marker (MDA

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض ابيضاض الدم النخاعي الحاد لمرضى عراقيين == Association of Glutathione - S - Transferas (GSTP1) gene polymorphism with Acute Myeloid leukemia in Iraqi patients

Author name: ميادة خالد ابراهيم
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was carried out to investigate the relationships between acute myeloid leukemia (AML) patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1 class (GSTP1) by using Polymerase Chain Reaction (PCR) - Restriction Fragment Length Polymorphism (REFLP) and measurement of some clinical parameters of patients and control.This study included 120 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with AML were diagnosed by the consultant of The National Center of Hematology medical City, Center for Hematology AL - Mustanseria University, hematology clinic of Baghdad Hospital and Alkadhymian medical city teaching hospital during the period from October 2014 to May 2015. Those AML cases then have been diagnosed by a specialized hematologists depending on bone marrow aspiration, biopsies reports and other diagnostic criteria for AML according to the International Staging System (ISS).Sixty individuals healthy also included as control group, their age range were between 15 - 70 years. Blood were used as samples to found the correlation between genotyping of GSTP1 and all studied parameters.Molecular studies involved DNA extraction and PCR - RFLP was carried to detect the genetic polymorphism of GSTP1 for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department / College of Sciences for women. The results showed that in the age for patients and control group were no significant difference in group less than 30 years old, while showed significant difference (P˂0.05) between other groups 30 - 50 years and 50 - 70 years, were (30%) (38.30%) (33.3%) and (23.0%) respectively.The results showed that there were significant different between patients (10.40±2.97) and controls (6.25±0.37) in the mean of white blood cells count (WBCc) (P˂0.48), the mean of hemoglobin (Hb) in patients was (8.11±0.37) and in control was (12.81±1.31) and the different was highly significant between them.The results of genetics polymorphism of the GSTP1 showed the significant difference (P˂0.05) between patients were (56.67%) and controls were (65.00%) in wild genotype AA, while the heterozygous genotype AG and homozygous mutant genotype GG were in AML patients and in controls were no significant different.Distribution of GSTP1 polymorphism and age of patients groups showed that there were significant difference between all age groups and all types of gene polymorphism, were (38.24%), (32.35%), (29.41%) in AA genotype, in AG were (26.32%), (21.05%), (52.63%) and in GG were (57.14%), (42.86%) and (0.00%) respectively.The results of relationship between the sex and AML patients showed that mutant genotype GG genotype was more in male (85.71%) than female (14.29%) with highly significant increase and the risk of male to be effect was more 1,5 than female. The mutant allele G is more frequent in male (0.38) than female (0.17). The data also showed no significant difference between the GSTP1 polymorphism and the mean value of WBC, but the mean value of Hb was shown significant different (P˂0.05), the heterozygous genotype AG showed the highest value (11.35± 0.73).Distribution of GSTP1 polymorphism between control groups according to non - smoking and smoking in the genotype AA+AG, (93.33%), (90.00%) respectively, showed significant difference (P<0.05), while in genotype AG+GG (26.67%), (43.33%) showed high significant difference (P<0.01) and the mutant allele G was more frequency in smoker control (0.27) but in non - smoker was (0.17).Results of this study suggest that GSTP1 gene polymorphisms was not associated with AML disease and GSTP1 has no active role in the pathogenesis of AML, while the age and sex may have a risk factor for progression AML

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لتعفن الفواكه المستوردة وطرق مكافحتها == Isolation and Identification of fungi associated for rotting of imported fruits and methods of their control

Author name: مؤيد صالح حسين
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر الفطريات، قسم علوم الحياة، كلية العلوم - الجامعة المستنصرية ٬ ومختبرات دائرة البحوث الزراعية - وزارة العلوم والتكنولوجيا ؛ للكشف عن الفطريات المرافقة لثلاثة انواع من الفاكهة المستوردة (الليمون حامض ، التفاح والخوخ) . تم جمع (60) عينة عشـوائية (20 لكل نـوع) من اربع اسـواق محلية (باب المعظم ، الكاظمية ، علاوي الحلة، العطيفية ) في مدينة بغداد. للفترة من 15 - 5 ولغاية 15 - 8 لعام 2013 . وبعد تحديد نسبة حدوث المرض،عزلت الفطريات من الفواكه المتعفنة على الوسط الزرعي PDA المدعم ب 100 جزء بالمليون من الكلورامفينيكول. تمت تنقية الفطريات المعزولة٬ وتم حساب تردد كل عزلة لكل الفطريات. اظهرت النتائج عزل 141 عزلة فطرية تنتمي الى اربعة اجناس : Penicillium, Aspergillus ,Rhizopus Alternaria , توزعت على ستة انواع من الفطريات. اكثر الانواع ترددا Aspergillus niger بتردد 37.6% يليه Penicillium expansum بتردد 24.8% ثم Penicillum digitatum ٬ Aspergillusflavus ٬Rhizopus Stolonifer وAlternaria.citri التي سجلت 14.9% ٬ 9.2%٬ 7.8% و5.7% . اظهرت النتائج ايضا ان الفطريات الاكثر عزلا كانت من سوق باب المعظم وبنسبة 49.6% يليه سوق الكاظمية 24.8% ثم سوق العلاوي والعطيفية التي سجلت كل منهما 12.8% . استنادا الى تردد العزلات تم اختيار 36 عزلة لاختبار القدرة الٳمراضية باستخدام ثمار التفاح كعائل نباتي . انتخبت عشر عزلات عالية الضراوة : ٳثنان تعود الى جنس البنسليوم P.expansum, واحدة تعود الى P.digitatum , اربعة تعود الى A.niger عزلة واحدة تعود الى R. stolonifer , وعزلة واحدة تابعة ٳلى Alternaria citri وكذلك عزلة واحدة تنتمي الى A.flavus التي اعطيت الرموز الاتية (1 - 2) (1 - 6)، (1 - 7)، (2 - 1) (2 - 3)، (2 - 4) (2 - 5)، (3 - 1)، (4 - 1)، (5 - 1) على التوالي ٬ والتي استخدمت طوال مدة الدراسة. اظهرت نتائج التاثير السمي لحامض الساليسيلك (SA) في الفطريات ٬ ان (SA) في 400 جزء بالمليون ثبط بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلات (1 - 7) P.digitatum و(3 - 1) R. stolonifer ، في حين ان التركيز نفسه في الوسط السائل ثبط بالكامل الوزن الطري والجاف للكتلة الحية للعزلة (1 - 6) expansum P.. كذلك اظهرت النتائج ان الكايتوسان في 1.6 ملغم / مل ثبطʹ بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلة (3 - 1) R. stolonifer في حين ان التركيز نفسه احدث انخفاضا عاليا في الوزن الطري والجاف من الكتلة الحيوية الفطرية للعزلة (1 - 7) P.digitatum التي سجلت 0.15 غرام و0.01 غرام على التوالي. اظهرت النتائج ان توليفات من حامض السالسيلك والكايتوسان اثرت على النمو القطري، التبوغ والوزن الطري والجاف للعزلات (1 - 2) P.expansum و(2 - 5) A.niger وان التوليفة 75 - 25 % كانت الاكثر فعالية. كما اظهرت نتائج الاختبارات التطبيقية في رش كل من حامض السالسيلك بتركيز 400 جزء بالمليون والكايتوسان بتركيز 1.6 ملغم/مل والتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان بالتركيز 75 - 25 جزء بالمليون - ملغم/مل على ثمار التفاح الملقحة بالعزلة (1 - 2) التي تعود للفطر P.expansum ٬ ان الثمار كانت اكثر مقاومة لظهور العفن في جميع المعاملات قبل 24 ساعة من التلقيح وحتى نهاية اليوم الخامس للاختبار بالمقارنة مع الثمار المعاملة بعد 24 ساعة من التلقيح ٬ حيث وصل النمو ٳلى 2.33 سم2 في الثمار المعاملة بحامض السالسيلك ٬ في حين وصل النمو في الثمار المعاملة بالكايتوسان ٳلى 2.65 سم2 ٬اما الثمار المعاملة بالتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان فقد وصل النمو الى 3.57 سم2 ٬ في حين وصل معدل النمو لثمار السيطرة في اليوم الخامس ايضا الى 10.88 سم2 . واظهرت نتائج قدرة اربع عزلات فطرية هي (1 - 2) Penicillium expansum ٬ (1 - 11) P. digitatum ٬ (2 - 1) A. niger ٬ (2 - 19) A. niger في انتاج انزيمي البكتنيز Pectinase والسليليز Cellulase ان العزلات جميعها لها القابلية على ٳنتاج الانزيمين . وارتبطت الفعالية الانزيمية مباشرة بالقابلية الٳمراضية للعزلات ٬ فوجد ان العزلتين العاليتي الضراوة (1 - 2) (2 - 1) اظهرت فعالية انزيمية عالية بلغت 23.59 ٬ 22.55 و64.83 ٬ 62.36 وحدة/ مل . في حين اظهرت العزلات الواطئة الضراوة (1 - 11) (2 - 19) فعالية انزيمية بلغت 9.44 ٬ 15.87 و43.44 ٬ 47.89 وحدة/مل لانزيم Cellulase وPectinase على التوالي . | This study was conducted in laboratory of fungi , Biology Department , College of Sciences - University of El - Mustansiriya and laboratories of Directorate of agricultural research , Ministry of Science and Technology to detect the fungi associated with three kinds of imported fruit ( lemon , apple , peach). Sixty random samples (20 for each kind ) were collected from four local markets (Bab El muadium, Kadhmia, Alawi alhilla, Eletaphia) at Baghdad city After determination of the percentage of disease incidence , the rotted fruits subjected for fungal isolation on PDA medium supplemented with 100 ppm Chloramphenicol . Isolated fungi were purified then the frequency of each isolate was calculated for all fungi. The results showed the isolation of 141 fungal isolate belonged to four genera : Penicillium, Aspergillus, Rhizopus, Alternaria and distributed among six fungal species . The most frequent isolated species Aspergillus niger 37.6 %, followed by Penicillium expansum 24.8 % and P. digitatum, A.flavus, R. Stolonifer and A.citri which recorded 14.9 % , 9.2% , 7.8% and 5.7 % respectively. The results also showed that the most isolated fungi were from Bab El muadium 49.6 %, followed by Kadhmia 24.8 %, then Alawi alhilla and Eletaphia which each of them recorded 12.8 % . Based on the frequency of isolation 36 isolates were selected for pathogenicity test using apple fruits as host Plant . The high virulent ten isolates were selected : two belonged to Penicillium expansum , one belonged to Penicillium digitatum , four belonged to Aspergillus niger one isolate belonged to Rhizopus stolonifer , one isolate belonging to Alternaria citri and one isolate belonged to Aspergillus flavus which given the following codes (1 - 2) (1 - 6) , ( 1 - 7 ) , (2 - 1 ) (2 3) , ( 2 - 4 ) (2 - 5 ) , (3 - 1 ) , (4 - 1 ) , ( 5 - 1 ), respectively were used throughout the study . The results of Fungitoxic effect of Salicylic acid(SA) revealed that (SA) at 400 ppm completely inhibited the radial growth and sporulation of ( 1 - 7 ) P. digitatum and (3 - 1 ) R. stolonifer isolates , while the same concentration in broth medium completely inhibited fresh and dry weight of biomass for (1 - 6) P. expansum . The results showed that Chitosan at 1.6 mg / ml completely inhibited the radial growth and sporulation of isolate (3 - 1 ) R. stolonifer while the same concentration induced the high reduction in fresh and dry weight of fungal biomass for isolate ( 1 - 7 ) P. digitatum which recorded 0.15 g and 0.01 g respectively. The results of the combination effect of Salicylic acid and Chitosan mixture on radial growth , sporulation , fresh and dry weight of isolate (1 - 2 ) P.expansum and (2 - 5 ) A.niger showed that the 75 - 25 % mixture was the most effective one. The results of the tests applications in spraying of Salicylic acid concentration of 400 ppm and Chitosan concentration of 1.6 ml / mg and combination between Salicylic acid and Chitosan concentration 75 - 25 ppm - ml / mg on the apples vaccinated with isolate (1 - 2) P.expansum showed that fruits were more resistant to the appearance of mold in all Treatments befor 24 hours of vaccination until the end of the fifth day of the test, compared with fruits treatment after 24 hours of vaccination, Reached growth to 2.33 cm 2 in fruits treated with Salicylic acid ٬ while growth reached in fruits treated with Chitosan to 2.65 cm 2 , and the fruits which treated with combination between Salicylic acid and Chitosan the growth has reached to 3.57 cm 2 , while the growth rate of the fruits of control on the fifth day to 10.88 cm 2 . The results of the ability of four isolates (1 - 2) P. expansum, (1 - 11) P. digitatum, (2 - 1) A. niger and (2 - 19) A. niger in production of Cellulase and Pectinase enzymes showed that all tested isolates are capable of production both enzymes , but the ability was positively correlated with the isolate virulence . The virulent isolate (1 - 2 ) , (2 - 1) showed the highest enzymaric activity 23.59 , 22.55 , 64.83 and 62.36 Enzymatic units / ml . While the A virulent isolates ( 1 - 11) (2 - 19 ) showed the lowest enzymatic activity 9.44 , 15.87 and 43.44 , 47.89 unit / ml respectively.

دور بعض العوامل المناعية الالتهابية كعوامل خطورة لدى مرضى القلب == The Role of Some Immunoinflammatory Elements as Risk Factors in Patients with Heart Diseases

Author name: مهدي حيدر حمادي الناجي
Supervisor name: اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع امراض القلب خلال القرن الحادي والعشرين كمرض مزمن ومهيمن في العديد من انحاء العالم، ويتوقع ان يصبح السبب الرئيس للعجز والوفاة في العالم، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول تاثير العوامل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory Factors والكيموحيوية في الحالة المرضية لدى مرضى القلب العراقيين، وتوجيه المزيد من الفهم نحو عوامل الخطورة التقليدية والمزيد من العوامل الجديدة التي قد تعد عوامل خطورة يمكن استخدامها كعوامل تكهنية وتشخيصية للمرض. ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة 100 مريض عراقي من المصابين بامراض القلب (80 ذكر، 20 انثى) وقسمت مجموعة المرضى الى اربعة مجاميع، الاولى 17 مريضا مصابا بفشل القلب Heart Failure (H.F)، والثانية 26 مريضا مصابا باحتشاء عضلة القلب Myocardial Infarction (M.I)، والثالثة 12 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية المستقرة Stable Angina Pectoris (SAP)، والرابعة 45 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية غيرالمستقرة Unstable Angina Pectoris (UAP)، فضلا عن الى عشرين متطوعا من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة ، وتراوحت اعمار المرضى بين 20 الى 80 سنة. وقد شخصت مجاميع المرضى من اختصاصي امراض القلب في المركز العراقي لامراض القلب، ومستشفى بغداد التعليمي للمدة من كانون الاول 2006م والى اذار 2007م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : * المظاهر الديموغرافية Demographic featuresبالنسبة للتوزيع الجغرافي كان 77% من بغداد، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 4/1، ومتوسط اعمارهم 36.30 سنة. وكانت نسبة الاصابة في الذكور اعلى معنويا (P<0.05) عما عليه في الاناث. * عوامل الخطورة Risk factors - ارتفاع تكرارات مرضى القلب الذين يمتلكون تاريخا عائليا موجبا لامراض القلب (54.5%) مقارنة مع مرضى القلب الذين لا يمتلكون تاريخا عائليا موجبا (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - اظهرت المجاميع الاربعة للمرضى انخفاضا في تكرارات المرضى المتناولين للمشروبات الكحولية هذا الانخفاض لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المدخنين (54.5%) مقارنة بغير المدخنين (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المصابين ببكتريا Helicobacter pylori (90%)، مقارنة مع مرضى القلب غير المصابين (10%). وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). كما ارتفع مستوى الكلوبيولين المناعي IgG ضد بكتريا H.pylori لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وUA وSA وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب غير المتبعين لنظام غذائي (59.6%) مقارنة مع مرضى القلب المتبعين لنظام غذائي (40.4%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوي (P>0.05). - انخفاض دليل كتلة الجسم لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة (اعلى من 25 كغم/ملم2) عموما مقارنة بالسيطرة، ولكن هذا الانخفاض لم يشكل فرق معنوية (P>0.05). - ان مجموعة الدم O اكثر تكرارا لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وMI وUA وSA على التوالي، فيما كانت مجموعة الدم B اكثر تكرارا لدى مرضى SA وUA فقط مقارنة بالسيطرة وبشكل معنوي جدا (P<0.01)، وعكس ذلك بالنسبة لمجاميع الدم A وAB اذ كانت اقل تكرارا. * الدلائل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory markersتم استخدام ثلاث تقنيات للتحري عن العناصر المناعية الالتهابية، اولا تقنية الـ (EASIA) Enzyme Amplified Sensitivity Immunoassay للتحري عن مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IL - 4 وIL - 6 وIL - 8 وIFN - γ)، وتقنية الـ Enzyme Linked Immunosorbant Assay(ELISA) للتحري عن مستوى البروتين الفعال - C، والبحث عن وجود الاجسام المضادة نوع IgG ضد بكتريا Helicobactor pylori، وتقنية الانتشار الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion لتقدير مستوى مكوني المتمم C3 وC4. - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 4 في مصل مجاميع مرضى القلب HF وUA وMI وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وHF وUA وSA على التوالي ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 6 في المصل مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 8 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة UA وHF وMI وSA على التوالي ارتفاع مستوى الانترفيرون - كاما (IFN - γ) في المصل، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر (ESR) لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وMI وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع مستوى البروتين الفعال - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C3 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وUA وHF وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C4 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وHF وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). * الشحوم والبروتينات الشحمية Lipid & Lipoproteins - ارتفاع مستوى الكوليسترول لدى مرضى فشل القلب ومرضى احتشاء عضلة القلب ومرضى الذبحة الصدرية غير المستقرة، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01) فيما انخفض لدى مرضى الذبحة الصدرية المستقرة مقارنة بالسيطرة. - ارتفاع مستوى الكليسيريد الثلاثي لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة S.A وM.I وUA وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - انخفاض مستوى البروتين الشحمي عالي الكثافة المرتبط بالكوليسترول HDL - C لدى مرضى HF وSA وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05)، بينما كان مرتفعا قليلا لدى مرضى MI ولكن بدون فروقات معنوية. - ارتفاع مستوى البروتين الشحمي واطئ الكثافة المرتبط بالكوليسترول LDL - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة مقارنة بالسيطرة ولكن هذا الارتفاع البسيط لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05).* فحص خضاب الدم Haemoglobin test - انخفض معدل تركيز خضاب الدم (Hb) لدى مرضى U.A فقط مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05) فيما كان معدل تركيزه لدى مرضى HF وMI وSA مقاربا لمجموعة السيطرة وبدون فروقات معنوية.اكدت نتائج الدراسة الحالية ان العناصر المناعية الالتهابية تمثل دورا حيويا كعامل خطورة للاصابة بامراض القلب، وانعكس ذلك بارتفاع واضح في مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IFN - γ,IL - 8, IL - 6, IL - 4) بصورة عامة لدى مرضى القلب جميعهم فضلا عن ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر ESR ومستوى البروتين الفعال C - الذي يؤشر درجة الحالة الالتهابية لمرضى القلب، كما بينت ان نظام المتمم بمكونيه C3 وC4 يمثل دورا مهما في العمليات الالتهابية لامراض القلب من خلال المسلكين التقليدي والبديل، واكدت النتائج ان الاصابة ببكتريا H.pylori تعد عامل خطورة مهما في حدوث امراض القلب وقد تجلى بوضوح الدور الذي تمثله الشحوم والبروتينات الشحمية كعوامل خطورة للاصابة بامراض القلب، فضلا عن ذلك اكدت الدراسة ان مستضدات مجاميع الدم بامكانها ان تمثل دورا مهما في الاصابة بامراض القلب. | Heart Diseases become more common during 21st century as the dominant chronic diseases in many parts of the world and it is predicted to become the main causes of disability and death worldwide.Present study was conducted to obtain more clarification about the impact of immuno - inflammatory and biochemical factors on the clinical expression of heart disease among Iraqi patients, and proved further insights into the classical risk factors, and several new factors that could be consider as risk factors that could be used as predictive and diagnostic factors.In order to reach this purpose the study included 100 Iraqi patients with heart diseases (80male and 20 Female) patients are divided into four groups. 17 with Heart Failure (H.F); 26 with Myocardial Infarction (M.I); 12 with stable Angina Pectoris (SAP) and 45 with unstable Angina Pectoris (UAP), with apparently health 20 individuals are used as control group, the age varied between 20 to 80 years. All patients groups were diagnosed by consultant of heart diseases in Iraqi center for heart diseases and Baghdad Hospital from December 2006 to March 2007. The study revealed the following results : * Demographic featuresAbout the geographical distribution, 77% of patients were from Baghdad; male to female ratio was 4/1; Age mean was 36.30 years, with significant difference in male than female (P<0.05).* Risk Factors - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients with positive family history for heart diseases (54%) compared with patients with negative family history (45.5%). - Non significant decreased (P>0.05) was observed in the frequency of alcohol drinking patients in the four patients groups. - Higher frequency of smokers patients (54.5%) compared with non smokers (45.5%) but this difference is not significant (P>0.05). - High significant increased (P<0.01) in the frequency of infected patients with H.pylori (90%) compared with non infected patients (10%). Also clearly significant (P>0.01) elevated was observed in serum level of anti H.pyolri antibody in the four patients groups : H.F, U.A, S.A, M.I respectively as compared with control group. - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients undergo dietary system (59.6%) as compared with patients who were not undergo dietary system. - Non significant reduction (P>0.05) in the means of body mass index (BMI) in all patients groups (over 25 Kg/m2) compared with control group. - Blood group O was significantly (P<0.01) more frequent in all patients groups : H.F,M.I,U.A,S.A respectively, also highly significant increased in frequency of blood group B was observed only in the patients groups of S.A and U.A heart diseases (P<0.01), on contrast blood groups A & AB had the less frequency.* Immuno - inflammatory markers in this study three techniques were used to measure immuno - inflammatory elements, the first enzyme amplified sensitivity immunoassay (EASIA) technique to measure the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8, IFN - γ) and enzyme linked immunosorbant assay (ELISA) technique to measure the levels of C - RP and anti H.pylori antibody, moreover single radial immunodiffusion technique to measure the level of complement component C3 and C4. - Significant increase in the serum level of IL - 4 in all patients groups : HF, UA, MI, SA respectively compared with control group (P<0.05). - The present study revealed significant increased in the serum level of IL - 6 in all patients groups : MI, HF, UA, SA respectively compared with control group (P<0.05). - Significant increased (P<0.05) in the serum level of IL - 8 in all patients groups : SA,HF,MI,UA respectively compared with control group. - All patients groups UA, HF, MI, SA consequently revealed highly significant increased (P<0.01) in the concentration of IFN - γ compared wit control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the erythrocyte sedimentation rate (E.S.R) in all patients groups : SA, UA, MI, HF consequently compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the mean of C - reactive protein concentration in the serum of all patients groups : SA, HF, MI, UA respectively compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the concentration of serum C3 in all patients groups : MI, UA, HF, SA respectively compared with control group. - Significant increased in the concentration of serum C4 in all patients groups : SA, UA, HF, MI consequently compared with control group (P<0.05). * Lipids and lipoproteins - Significant increased (P<0.05) in the mean of cholesterol level in HF, MI and UA patients groups compared with the control group, on the other hand, decreased in the cholesterol level in SA patient group was observed compared with the control group. - Highly significant elevated (P<0.01) in the means of serum triglyceride level in all patient group; SA, MI, UA, HF respectively compared with control group. - Significant decreased (P<0.05) in the serum HDL - C level in the HF, SA, UA patents groups respectively compared with control group on the other hand, increased in the level of HDL - C in the MI patients group. - The means of serum LDL - C level illustrated no significant differences recorded among patients groups and control group (P>0.05).* Haemoglobin test - Significant decreased (P<0.05) in the mean of haemoglobin concentration in the UA patients group compared with healthy control group, with non significant increased in Hb. Level was observed in HF, MI, SA patients groups compared with healthy control group (P>0.05). Results of the present study showed that immuno - inflammatory elements play a crucial role in the susceptibility of heart diseases this reflected by markedly elevated in the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8 IFN - γ) in all patients of heart diseases in addition elevation of erythrocyte sedimentation rate and the level of C - RP this reflect the degree of the inflammatory status of heart diseases patients, also this revealed that complement component C3 & C4 play important role in inflammatory process of heart diseases through both pathway classical & Alternative, on the other hand, the results proved that infected by H.pylori consider as important microbial risk factor in heart diseases, furthermore, the results revealed that lipid & lipoproteins play important role as risk factor in the occurrency of heart disease, in addition, this study showed that blood groups antigens could play crucial role in the aetiopathogensis of heart diseases.

دراسة جزيئية لبكتريا Enterococcus spp. المقاومة لمضاد الفانكومايسين == Molecular Study of the Vancomycin - Resistant Enterococcus spp

Author name: مها مخلف كاظم الشمري
Supervisor name: محمد فرج شذر المرجاني | كفاح احمد جاسم الكرخي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (325) عينة شملت (268) عينة سريرية ، توزعت بين (151) عينة ادرار و(101) عينة دم و(16) عينة سائل النخاع الشوكي CSF)) ، من مستشفيات مختلفة من مدينة بغداد ،من جانب اخر جمعت (57)عينة براز من اصحاء وذلك للفترة من بداية تشرين الاول وحتى نهاية كانون الاول لعام 2010. تم الحصول على (33) عزلة تعود لجنس Enterococcus بواقع (30) عزلة من عينات الادرار و(3) عزلات من عينات الدم ، فيما لم يتم الحصول على اية عزلة من عينات سائل النخاع الشوكي، وبلغت عزلات براز الاصحاء (46) عزلة. اما على مستوى النوع فقد تم تشخيص (20) عزلة تعود للنوع E.faecalis ، شملت (17) عزلة من عينات الادرار بنسبة عزل (6.3)% و(3) عزلات من عينات الدم بنسبة عزل (1.11)% ، في حين شخصت (10) عزلات تعود للنوع E.faecium بنسبة عزل (3.73)% وقد عزلت جميعها من عينات الادرار. وفيما يخص عينات براز الاصحاء فقد كانت السيادة تعود للنوع E.faecium اذ شخصت (40) عزلة تعود لهذا النوع وبنسبة عزل (70.1)% في حين شخصت (3) عزلات فقط تعود للنوع E.faecalis بنسبة عزل (5.2)%. اختبرت حساسية العزلات تجاه (11) مضادا حيويا مختلفا باستعمال طريقة الاقراص وقد اظهرت النتائج فعالية كل من Imipeneme وAmpicillin تجاه عزلات بكتريا E.faecalis السريرية ، اما Ofloxacin فقد اظهر فعالية تجاه عزلات الاصحاء بالمقارنة مع العزلات السريرية ، في حين كانت عزلات هذه البكتريا مقاومة بنسبة (100)% Oxacillin وCefepime ، بينما اظهرت العزلات السريرية مقاومة بنسبة (55)% Azlocillin وبلغت نسبة مقاومة عزلات الاصحاء لهذا المضاد (66.7)% ، وكانت نسبة مقاومة عزلاتها من الاصحاء (100)% Erythromycin وRifampicin وTetracycline ، اما بالنسبة لبكتريا E.faecium فقد اظهرت عزلاتها حساسية عالية تجاه Imipeneme وكانت العزلات السريرية اكثر حساسية تجاه Ampicillin مقارنة بعزلات الاصحاء . فضلا عن ان العزلات جميعا كانت مقاومة Oxacillin ، بينما كانت العزلات السريرية مقاومة بنسبة (100)% Azlocillin ، في حين كانت عزلات الاصحاء مقاومة بنسبة (100)% Cefepime ، كما اظهرت عزلات الاصحاء مقاومة اعلى من العزلات السريرية تجاه Erythromycin ، كما كانت جميع العزلات السريرية مقاومة Rifampicin وStreptomycin. اوضحت نتائج الدراسة الحالية ان (25)% من العزلات السريرية و(66.7)% من عزلات الاصحاء لبكتريا E.faecalis كانت مقاومة Vancomycin ، بينما بلغت نسبة العزلات السريرية لبكتريا E.faecium المقاومة لهذا المضاد (40)% ، في حين كانت نسبتها بين عزلات الاصحاء (47.5)% . حددت التراكيز المثبطة الدنيا Vancomycin للعزلات المقاومة لهذا المضاد بطريقة التخفيف بالوسط السائل ، تراوحت قيم MIC للعزلات السريرية لبكتريا E.faecalis بين (4 - 512) مايكروغرام\مل ، بينما كانت عزلتا الاصحاء التابعة لهذه البكتريا ذات MIC (128و64) مايكروغرام\مل ،اما بالنسبة لبكتريا E.faecium فتراوحت قيم MIC لعزلاتها السريريــــة بين (4 - 64) مايكروغــرام\مـــل ولــــعزلاتها من الاصحاء) ≤4) مايكروغرام\مل . بينت نتائج التحري عن الدنا البلازميدي بالترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز لعدد من عزلات بكتريا المكورات المعوية المقاومة Vancomycin Vancomycin - Resistant Enterococcus) (VRE) ) احتواء بعض هذه العزلات على حزم بلازميدية مختلفة الاحجام. اجريت عمليات الاقتران البكتيري خارج الجسم الحي In vitro)) وداخل الجسم الحيvivo) In) ، اظهرت النتائج نجاح عمليات الاقتران اذ لوحظ انتقال صفة مقاومة Vancomycin بين الخلايا مما يدل على احتمال كون جينات هذه الصفة محمولة على بلازميدات اقترانية تسهل انتقالها عبر الانتقال الافقي من خلية لاخرى ضمن النوع نفسه او الانواع الاخرى . كما اظهرت نتائج التشخيص باستعمال تقنيةPCR لعزلات بكتريا المكورات المعوية نجاح ارتباط البوادئ بالتسلسلات المكملة لها ضمن جيناتsod A الموجودة بالدنا القالب لكلا النوعين الذي ادى الى الحصول على نواتج التضاعف وبالتالي التاكد من صحة الفحوصات التشخيصية التي اجريت على العزلات والتي اعتمدت الفحوصات البايوكيميائية ماعدا (4) عزلات لبكتريا E.faecalis و(6) عزلات لبكتريا E.faecium لم تعط اي ناتج . بينت نتائج التحري عن جينات مقاومة Vancomycin في بكترياVRE سواء كانت VRE.faecalis (VREF) او VRE.faecium (VREFm) ان جينات المقاومة vanA هي الاكثر انتشارا بين العزلات المحلية بالمقارنة مع جينات vanB اذ احتوت العزلات جميعها - سواء كانت السريرية او المعزولة من الاصحاء التابعة لكلا النوعين وذات (64)≤ MIC مايكروغرام\مل - على جين vanA عدا عزلتين كانت احداهما عزلة سريرية تعود لبكترياE. faecalis والاخرى عزلة اصحاء تعود لبكتريا E.faecium اللتان لهما MIC (32) مايكروغرام \مل اذ احتوت كل منهما على جين vanB . | This study involved collecting (325) samples distributed as two groups : The first group was including (268) clinical samples distributed as (151) urine, (101) blood and (16) CSF, the second group involved (57) stool specimens from healthy people, from different hospital in Baghdad, since October till December 2010. All (73) isolates had been identified by morphological, cultural and biochemical tests such API - 20 strep and API Rapid ID - 32 strep, as a result of these tests (6.3)% of urin isolates, (1.11)% of blood isolates and (5.2)% of stool isolates were identified as E.faecalis, at the same time (3.73)% of urine isolates and (70.1)% of stool isolates were identified as E.faecium. Blood agar medium used to detect bacterial ability to produce β - hemolysin, (58.82)% and (66.67)% of E.faecalis clinical and stool isolates were able to produce β - hemolysin, (20)% of clinical and (27.5)% of stool E.faecium isolates were able to produce β - hemolysin. The antibiotic susceptibility test to (11) types of antibiotics showed the high susceptibility of E.faecalis isolates to Imipeneme and Ampicillin and the high resistance (100)% to Oxacillin, and Cefepim, all isolates showed resistance to Azlocillin , stool isolates showed high resistance to Tetracyclin and Refampicin, all E.faecium isolates showed high sensitivity to Imipeneme, high sensitivity to Ampicillin (among clinical isolates more than stool isolates), high resistance among stool isolates to Erythromycin, all clinical isolates were resistant to Streptomycin and Rifampicin. The vancomycin susceptibility test for E.faecalis was done results showed that (25)% of clinical isolates and (66.7)% of stool isolates were resistant to this antibiotic. While (40,47.5)% of clinical and stool E.faecium isolates were resistant to vancomycin respectively. Minimum Inhibitory concentrations for vancomycin were determined, VRE.faecalis isolates that had concentrations between (4 - 512) μg/ml, and VRE.faecium clinical isolates had MICS (4 - 64) μg/ml and the MICS for stool isolates were ≥ 4 μg/ml. The detection of plasmid DNA in VRE isolates by gel electrophoresis showed that some of these isolates had plasmid bands with different sizes. The bacterial conjugation expriments between Enterococcus isolates had gained success in transfer of vancomycin resistance between the local isolates by in vitro and in vivo conjugation. Identifiicaion of Enterococcus isolates to the species level by using the sodA gene as a target in the PCR in this method (19) of E.faecalis isolates gave suspected products while (24) of E.faecium isolates gave suspected products. The detection of van genes by PCR showed the high dissemination of vanA gene which encoded to high resistance level to vancomycin between the local VRE isolates especially VREFm in comparison to vanB gene

الدور المحتمل للانترليوكين - 33 (33 - IL) في النساء ذوات مقدمة الارتعاج == The possible Role of IL - 33 in preeclamptic women

Author name: مها محمود شاكر
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية بهدف تقصي بعض المتغيرات المناعية وبالتحديد interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin IgG and antiphospholipid IgG عند الحوامل المصابات بمقدمة الارتعاج وقد امتدت الدراسة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر كانون الثاني 2014. اشتملت الدراسة على 90 امراة حامل تراوحت اعمارههن (16 - 42) منهن 60 مريضة بمقدمة الارتعاج من المراجعات لمستشفى بغداد التعليمي قسم النسائية والتوليد ومستشفى فاطمة الزهراء التعليمي و30 امراة ذات حمل طبيعي للمقارنة ممن ليس لديهن تاريخ سريري للاصابة بمقدمة الارتعاج, قسمت المريضات الستين وفقا لشدة المرض الى 23 حالة خفيفة و37 حالة شديدة .تضمنت العينات اخذ كل من الدم والادرار اضافة الى مليء استمارة استبيان اعدت بهدف الحصول على تفاصيل الحالة الصحية التي تضمنت العمر بالسنوات وعمر الحمل عدد مرات الولادة عند المشاركات في الدراسة. تم خلال الدراسة قياس مستويات interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid( IgG) بتقنية الاليزا بالاضافة الى قياس كل من Cholesterol and triglyceride وقد تم قياس الطول والوزن لحساب مؤشر كتلة الجسم وتم اخذ اوزان الاطفال لكل من المريضات وذوات الحمل الطبيعي وقد خلصت الدراسة الى نتائج مختلفة يمكن تلخيصها بما يلي : ارتفعت مستويات IL - 33عند مستوى معنوية (P<0.05) لتصلml) (163.78 ± 26.82 pg/ في امصال النساء المصابات بمقدمة الارتعاج وعند كلا من المريضات ذوات الحالة الخفيفة (164.30 ± 28.54 pg/ml) وذوات الحالة الشديدة من المرض (163.45 ±16.71 pg/ml) اذا ما قورنت بمستوياته بنظيراتهن من نساء السيطرة((92.27 ± 11.56 pg/ml يمكن ان تدل هذه التغيرات على دور هذا الانترليوكين في امراضية مقدمة الارتعاج. اما بشان IgE فقد سجل ارتفاعا في مستوياته في مريضات مقدمة الارتعاج ( (275.31 ± 28.89 IU/ml) سواء اكن من ذوات الحالة الخفيفة(30.5.31 ± 48.24 IU/ml) ام الحالات الشديدة( 256.67 ± 36.18 IU/ml) مقارنة بمستوياته التي ضلت ضمن حدودها الطبيعية في امصال النسوة في مجموعة السيطرة (138.26 ±20.17 IU/ml ) .وربما تنذر مثل هذه النتائج بالدور الضار لل IgE في مقدمة الارتعاج. لوحظت علاقة احصائية موجبة بين فرط انتاج IL - 33 مع الزيادة في مستويات IgE عند النساء المريضات. من ناحية اخرى لم تكن هنالك ثمة تغيرات في مستويات اضداد الكارديوليبين واضداد الفوسفوليبد في امصال المريضات بمقدمة الارتعاج(3.54 ± 0.22 pg/ml) ( 3.20 ± 0.19 pg/ml) على التوالي سواء ذوات الحالة المعتدلة(3.73 ± 0.43 pg/ml) ( 2.68 ± 0.28 pg/ml)على التوالي ام الشديدة منها(3.42±0.25 pg/ml) (3.52±0.24 pg/ml) على التوالي والتي ظلت عند مستوياتها الطبيعية(3.34± 0.12 pg/ml) (3.36 ± 0.29 pg/ml) على التوالي عند النساء ذوات الحمل الطبيعي .كما لوحظ ايضا ارتفاعا عند مستوى معنوية في الكولسترول عند المريضات251.4 ± 22 mg/dl),) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (187.3 ± 10.78 mg/dl) كذلك لوحظ مثل هذا الارتفاع في الدهون الثلاثية عند المريضات ذوات مقدمة الارتعاجmg/dl) 251.4 ± 22) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (223.7 ± 29.72 mg/dl وعندما تم احتساب قيمة الدهون منخفضة الكثافة جدا من الدهون الثلاثية فقد وجد انها ترتفع عند مستوى معنوية عند النساء من ذوات مقدمة الارتعاج (49.52 ± 1.12 mg/dl) مقارنة مع نظيراتهن من ذوات الحمل الطبيعي41.82 ± 5.18 mg/dl) ) وكذلك لوحظ ارتفاعا في مؤشر كتلة الجسم عند المريضات 33 ± 0.5 Kg/m2)) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (30 ± 0.6 Kg/m2) في حين لم يلاحظ اي اختلاف في معدل اوزان اطفال كل من المريضات بمقدمة الارتعاج او ذوات الحمل الطبيعي ( .(3.52 ± 0.36 Kg , 3.4 ± 0.31Kg | The present study was designed to focus on some immunological changes; namely interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) accompanied preeclampsia . The study was extended from October 2013 to February 2014. Ninety women whose ages ranged from 16 - 42 years, were enrolled in the study including 60 preeclamptic women, among those attending the Department of Obstetrics and Gynecology in Baghdad Teaching hospital and in Fatima AL - Zahra Teaching Hospital. In addition to, 30 women whose pregnancies were healthy with no history of preeclampsia. The preeclamptic women were divided according to the severity of the disease into 23 with mild preeclampsia and 37with severe preeclampsia. Samples were taken from the 90 participants including blood and urine, in addition to a questionnaire which was prepared for this purpose including patient age, gestational age, parity , weight, height, history of family. There was a significant (P < 0.05) increase in the mean systolic blood pressure (SBP) and diastolic blood pressure (DBP) in women with mild and severe PE (14.84 ± 0.93, 10.06 ± 0.81 mmHg & 17.36 ± 1.08, 11.29 ± 0.73 mmHg respectively) as compared to those of apparently healthy pregnant (control) group (10.59 ± 0.87, 7.38 ± 0.28 mm - Hg respectively). The elevation of albuminuria in preeclamptic women were recorded to be 3 grades (+1,+2,+3). The highest ratio (41.6 %) of preeclamptic were with grade +2, (30.1%) of them recorded to be with +3, grade while (28.3%) with +1 grade. Statistically there were significantly (p < 0.05) differ compare to their counterparts in those with healthy pregnancy (controls) in whom albuminuria wasn’t been detected Levels of interleukin - 33, Total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) were estimated using ELISA technique while lipid profile were estimated by using enzymatic method, results can be summarized as follows : Interleukin - 33 levels significantly elevated (P < 0.05) to reach (163.78±26.82 pg/ml) in preeclamptic women, including both groups of patients, those with mild (164.30 ± 28.54 pg/ml) and those with severe illness (163.45 ± 16.71 pg/ml) in comparison to their counterparts in control group (92.27 ±11pg/ml). Such changes may indicate the pivotal role of interleukin - 33 in the pathogenesis of preeclampsia. Regarding (IgE) also recorded to be significantly elevate (P<0.05) in preeclamptic patients (275.31 ± 28.89 IU/ml), both in those with mild (305.31 ± 48.24 IU/ml ) and those with severe illness (256.67 ± 36.18 IU/ml), also, which it remain within its normal range in control groups (138.26 ± 20.17 IU/ml). These results can be alarming for the noxious role of total IgE in the pathogenesis of preeclampsia. Statistically, a positive correlation was noticed between the overproduction of serum interleukin - 33 and increased levels of serum total IgE in preeclamptic women. On the other hand there were no significant changes in each of anticardiolipin (IgG) and antiphospholipid (IgG) levels which remain within the limits of their normal range in sera of preeclamptic patients (3.54 ± 0.22 pg/ml and 3.20 ± 0.19 pg/ml) respectively, whether those of mild (3.73 ± 0.43 pg/ml and 2.68 ± 0.28 pg/ml respectively) or sever conditions (3.42 ± 0.25 pg/ml and 3.52 ± 0.24 pg/ml) respectively in compareision to their levels in those women whose pregnancies were with no complications (3.34 ± 0.12 pg/ml and 3.36 ± 0.29 pg/ml) respectively. Cholesterol, triglyceride, and very low density lipoprotein recorded significantly elevated (P < 0.05) in preeclamptic patients (264.1 ± 34.54 mg/dl, 251.4 ± 22 mg/dl, 49.52 ± 1.12 mg/dl) respectively as compared to control group (187.3 ± 10.78 mg/dl, 223.7 ± 29.72 mg/dl, and 41.82 ± 5.18 mg/dl respectively).The body mass index also increased in its mean in preeclamptic patients (33 ± 0.5 Kg/m2) at(P < 0.05) as compared to control group (30 ± 0.6 Kg/m2), while there are no significant (P > 0.05) increase in mean of weight of babies of preeclamptic women (3.4 ± 0.31Kg) as compared to control group (3.52 ± 0.36 Kg).

تقييم كفاءة بعض المرشحات كبدائل في معالجة مياه الصرف الصحي واعادة استخدامها في ري نبات الذره الصفرا ء Zea mays L == Evaluation Efficiency For Some Alternatives Filters in Sewage Treatment and Reusing in Irrigation Plant Zea mays L

Author name: منى محمد نجیب
Supervisor name: حسين يوسف خلف الركابي
General topic: Biology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: recently Iraq where suffer from several crisis including diminished quantity and deteriorated quality of water resources, specially in southern provinces. This study was designed to show the extent of using non - traditional water resources such as sewage after its treatment with local alternative chemicals and using the resulting water in agriculture sector. Samples were collected from the terminal tank of waste water station in Al Nasiriyah ( Alhindia station) according to the criteria of United States Environment Protection Agency (USEPA, 1977) regarding the sewage properties including pH, EC, total dissolved solid(TDS), total suspended solids( TSS), CO2, Mg+2, Ca+2, Na+, CaCO3, Cl - , PO4 - , NO3 - , chemical oxygen demand ( COD), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, we easured three trace elements ( Pb, Ni, Cd) as well as sodium adsorption ratio( SAR) and biological properties and bacterial contamination with fecal coliform bacteria. Physicochemical analysis of both sewage and tab water was performed. It was found that pH values were 7.37 and 8 for sewage and tab water , respectively. While the electrical conductivity for tab water was 8.01 ds / m compared with that of sewage water which was only 1.76 ds / m . TDS, TSS and CO2 for both sewage and tab water were (3780, 723) and ( 800 , 320) and (5.41, 1.23) mg/ L respectively. Results also showed that sewage water contain high concentrations of cations and anions as compared to tab water. Magnesium concentration was 469.42mg/L in sewage water and 100.1mg/L in tab water while calcium was 581.2mg/L in tab water and 60.8 in sewage water. Sodium concentration was 662.86 mg/L in sewage water and 186.3mg/L in tab water. On the other hand, water hardness and alkalinity were (3300 , 280) mg/L for sewage water and ( 2.40, 66.49) mg/L for tab water respectively .Results of this study also showed an increase in the concentrations of some ions in crude sewage water with respect to tab water. Concentrations ofchloride,phosphate,sulphate and nitrate in sewage water sample were 2496.31 Mg/ L,1.6 Mg / L , 1976 Mg / L ,3.67 Mg / L and for tab water were 226.8,0.7,108.48,0.6 Mg/L, respectively. Fecal coliform number was 2600 cell/100 ml in sewage sample and only 6 cell/ 100 ml in tab water. BOD5 andCOD values were 18, 167 Mg/ L for sewage water and 2.0, 6.0 Mg/L for tab water respectively Heavy elements also found to be elevated in sewage with respect to tab water , where the concentrations of Pb,Ni& Cd in sewage sample were 2.8, 0.8 & 0.004 Mg / L , while they were 0.09, 0.001 &undetected in tab water, respectively. On the other hand, sodium adsorption ratio SAR in sewage samples was 7 and in tab water was only 0.48.Laboratory experiments dealt with the following : 1 - It was used sand filters as a primary processing for waste water to remove pollutants prior to pass it through used filter upon incubating it for 14 days . 2 - in this study , it was selected four types of filters to remove contaminants and improve the quality of water is (water plant Ceratophyllum demersum, wood sawyer , , coal and Cladophora glomerta ). As it was used as filters either aprimary step in processing waste water through passing these waters as aby - pass step these waters on sand filter was used in this studay .3 - chemical , physical and biological characteristics of waste waters were studied upon passing it on the under - studying filters and also estimated the efficiency of removal Removal efficiency (%) of the components. 4 - Used of Some international Standerds and Iraqi specifications to evaluate the quality of water befor and after to pass it on filters for irrigation purposes. Some of criteria Such as (Kloke, 1980; WHO, 1995; US EPA, 1996; European Society, 1996 and Awasthi, 2000. ) were used to in the evaluation of soil contamination with heavy metals.This study reached to the following results : .The study concluded accrediting wooden sawyer + sand and water plant in recycling and reforming waste water and its capacity to remove pollutants, evaluation of quality of waste water and the treated water after passing through the filters under studay results indicated that all types of water inclusive the class (C4S1 ) which means high salinity water with afew of sodium element according to the classification of Laboratory US salinity. and water to cause toxicity problem in the study, and showed It results that candidates contributed to the removal of pathogenic bacteria from the treated water, and irrigation with waters passed through ceratophyllum dermersum L and sand filter leading treatment gave the highest dry to plant maize and two shoot and root weight, Result of statistical analysis showed that soils characteristics had a significant effect on of dry weight, concentration and quantity absorbed heavy elements in sections shoot and root to plant maize, was not for irrigation with treated wastewater impact on soil pollution with heavy metals and the results showed that the soils environmentally safe after relying on the Organization standards (WHO) and the American Environmental Protection Agency (US EPA).

فصــل وتنقية وتوصيف انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي == Isolated, Purification and Characterization of Lipoxygenase from Local Chickens Meat

Author name: منى محمد زيدان
Supervisor name: اياد نافع يحيى
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة اختيار افضل طريقة لاستخلاص انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي, من بين ثمان طرائق, وكان كلوريد الصوديوم (10)% هو الافضل في استخلاص الانزيم بفعالية كلية بلغت (918810) وحدة, ركز المحتوى البروتيني باستخدام كبريتات الامونيوم (60)%من بين خمس طرائق للتركيز (التنقية الجزئية), واكملت مراحل التنقية باستخدام التبادل الايوني والترشيح الهلامي بعمود DEAE - Sephadex - A50 , ومن ثم استخدام الترشيح الهلامي بعمود السيفاكريل ( Sephacryl S - 300) اذ بلغت الفعالية النوعية (17.10) وحدة / مل والفعالية الكلية (393) وحدة والحصيلة الانزيمية مقدارها (42.9)% وعدد مرات التنقية (7.50) مرة. وثم التاكد من نقاوة الانزيم باجراء عملية الترحيل الكهربائي بغياب المواد الماسخة للبروتين اذ ظهرت حزمة بروتينية واحدة في هلام متعدد اكريل امايد, ثم تم توصيف الانزيم واشارت النتائج الى ما ياتي : 1. كان الوزن الجزيئي هو (85) كيلودالتون مقدرا بطريقة الترشيح الهلامي.2. بلغت نقطة التعادل الكهربائي pI للانزيم (6.2).3. اظهرت الدراسة ان الانزيم من البروتينات السكرية وان نسبة الجزء الكربوهيدراتي تشكل (9.42)% عند تقديرها بطريقة الفينول - حامض الكبريتيك.4. وجد ان الدالة الحمضية الامثل لفعالية الانزيم (7), واظهر الانزيم ثباتا في مدى من قيم دالة الحموضة تراوحت بين (5 - 9).5. اظهرت النتائج ان درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم كانت (40) م°, عند دالة الحموضة الامثل لفعالية الانزيم, وان درجة الثبات الحراري لهذا الانزيم بين (10 - 40) م°.6. احتفظ الانزيم بكامل فعاليته الانزيمية عند حضنه بدرجة حرارة (40) م° لمدة (40) دقيقة وفقد (6)% من فعاليته في الدقيقة (50) وفقد (10)% من فعاليته بعد (60) دقيقة.7. بلغت قيمة طاقة التنشيط لتحويل المادة الاساس الى ناتج (8.836) كيلو سعرة / مول, بينما بلغت قيمة طاقة التنشيط لمسخ الانزيم (18.239) كيلو سعرة / مول.8. اظهرت دراسة الثوابت الحركية ان معدلات قيم ثابت ميكالس منتن ( Km ) لتفاعل الانزيم تجاه حامض اللينولييك كانت ( 0.296) ملغم/مل , في حين بلغت قيمة السرعة القصوى ( Vmax ) للتفاعل الانزيمي (1.50) وحدة/مل.9. اظهرت الايونات الموجبة للكالسيوم والمنغنيز والمغنيسيوم والنيكل تاثيرا منشطا, بينما اظهرت ايونات النحاس والحديد والخارصين تاثيرا مثبطا.10. وجد ان جميع المثبطات المعدنية المستخدمة في الدراسة سببت تثبيطا بدرجة واضحة مما يعطي دليلا على اشتراك المعادن في تفاعل الانزيم, اي ان هذا الانزيم من الانزيمات المعدنية. 11. وجد ان المستخلص الانزيمي النقي , له القدرة على تبييض دقيق القمح الاسمر كذلك تحسن الصفات الحسية للخبز المصنوع من الدقيق الاسمر بعد اضافة انزيم الليبوكسيجينيز المستخلص من لحم الدجاج المحلي له. | The study included the selection of the best methods to extract the enzyme among eight methods. It appeared that have given the highest activity of the crude enzyme (total activity = 918810 unit). The protein content was concentrated and precipitated by ammonium sulfate (60) %, among other five methods of concentration (partial purification). The purification stages were achieved by using ion exchange column chromatography (DEAE - Sephadex A - 50 column). Followed by gel filtration chromatography using Sephacryl S - 300. This method extract pure enzyme at a yield of (42.9) %, (7.50) times of purification and specific activity of (17.1) unit / ml. The purity of enzyme was certified by poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing condition, the enzyme was characterized by the following : - 1 - Its molecular weight was (85) KD as estimated by gel filtration.2 - Its Iso electric point was at (6.2).3 - The result showed that it was a glycoprotein with a carbohydrate content of (9.42) % as determined by phenol - sulfuric acid method.4 - Its optimum activity pH was (7). The enzyme was stable at pH range between (5 - 9).5 - The optimum temperature for enzyme activity was (40) C°at the Optimum pH. The enzyme stability temperature range between (10 - 40) C°. 6 - The enzyme keep full effectiveness when his lap (40)C° for (40) minutes, and lost (6) % of its effectiveness after (50) minutes, and lost (10)% of its effectiveness after (60) minutes.7 - The activation energy to convert the substrate to product was (8.836) kilo calorie / mole. The inactivation energy for the denatured enzyme was (18.239) kilo calorie / mole.8 - The average Michael’s constant ( Km ) for the enzyme reactions towards linoleic acid were (0.296) mg/ml. and its Vmax was (1.50) unite / minutes. 9 - The positive ions such as Ca, Mn, Mg and Ni have shown activating effect of Lipoxygenase, while the Cu, Fe and Zn have on inhibitory effect on the enzyme.10 - Metal inhibitors in habited Lipoxygenase clearly meaning that it is metallic protein enzyme.11 - Purified enzyme was clearly bleached the tan color of flour, leading to improvement of properties quality of the produced loaf.

دراسة بعض المؤشرات المناعية لجروح ما بعد الحرق == Study of Some Immunological Aspects of Post Burn Injuries

Author name: مـــنى شكري محمود جواد
Supervisor name: زينب ثامر شويت الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التحري عن مستويات الحركيات الخلوية (IL - 10, IL - 17A, IFN - γ , MCP - 1,(TNF - α في مصل المصابين بجروح مابعد الحرق , كذلك تم تسليط الضوء على العلاقة بين المساحة السطحية الكلية للحرق مع تعداد خلايا Tregs ومستوى الحركيات الخلوية. شملت عينة الدراسة71 مصابا بجروح ما بعد الحرق, اذ تم سحب الدم الوريدي منهم بعد اليوم الاول واليوم الخامس من الاصابة بالحرق لغرض تقدير مستوى الحركيات الخلوية باستعمال تقنية الاليزا (ELISA) وحساب تعداد خلايا Tregs باستعمال تقنية التدفق الخلوي Flow Cytometry, كما شملت عينة الدراسة 60 شخصا من الاصحاء ليمثلوا مجموعة السيطرة. اظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي في مستويات كل من IL - 10, MCP - 1, TNF - α في مصل المصابين بالحروق مقارنة مع مستوياتها في مجموعة السيطرة , بينما كان هنالك ارتفاعا معنويا في مستوى IL - 17A في مصل المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق (28.70± 0.75, 0.86±27.28) بيكوغرام/مل مقارنة مع مستواه في مجموعة السيطرة (0.66±23.85) بيكوغرام/مل. كما بينت النتائج عدم وجود فرق معنوي في مستوى IFN - γ مابين المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق ومجموعة السيطرة (0.21±14.31, 0.17±13.97, (0.19±13.96 بيكوغرام/مل على التوالي, كما اظهرت نتائج الدراسة وجود انخفاض معنوي بعد اليوم الاول من الحرق في مستوى γ - IFN في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق %(70 - 46) و%(100 - 71)اذ بلغت مستوياته (0.41±13.03, (0.30±13.57 بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصل انخفاض معنوي في مستوى TNF - α في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق100 - 71) )% مقارنة مع المساحات الاقل اذ بلغ مستواه في هذه المجموعـــة 0.57±11.61)) بيكوغرام/مل، بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي بين فئات نسب الحرق المختلفة. كما بينت النتائج وجود ارتفاع معنوي في مستوى TNF - α بعد اليوم الخامس من الحرق مع زيادة المساحة السطحية للحرق اذ بلغ مستواه في الفئات %(45 - 31), %(70 - 46), %(100 - 71) 2.51±21.51), 4.20±29.59, (1.45±23.36بيكوغرام/مل على التوالي مقارنة مع مستواه ضمن مساحة سطحية للحرق%(30 - 10) (0.87±19.54) بيكوغرام/مل بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي مع زيادة مساحة الحرق. وقد حصل ارتفاع معنوي في مستوى كل من IL - 10, IL - 17A في مصل المصابين الذكور مقارنة بالاناث اذ بلغت مستوياتهما في الذكور (30.48±0.85, 29.36±0.83) بيكوغرام/مل على التــوالي في حين بلغت مستوياتهما في الاناث (0.65±28.38, 0.76±26.98) بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصــل ارتفاع في مستـــوى TNF - α 0.97±18.35) ) بيكوغرام/مل في مصل الاناث المصابات بجروح مابعد الحرق مقارنة بالذكور (15.11±0.70) بيكوغرام/مل, كما حصل ارتفاع معنوي في مستوى IL - 10 (34.25±1.77) بيكوغرام/مل في مصل المصابين بجروح الحرق الناتجة من التعرض الى الانفجار مقارنة مع المصابين بالحرق بوساطة مصادر اخرى. اما نتائج تعداد خلايا Tregs فقد حصل ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في الدم المحيطي للمصابين بنسب حرق اقل من %45 واكثر من %45 مقارنة مع اعدادها في الدم المحيطي للاشخاص الاصحاء وذلك بعد اليوم الاول وكذلك بعد اليوم الخامس من الاصابة بالحرق وكان اعلى ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في دم المصابين بنسبة حرق اكثر من %45 بعد اليوم الاول والخامس من الحرق حيث بلغت %(63.58) و57.95))% على التوالي. | The aim of this study was to investigate the levels of cytokines (IL - 10, IL - 17A , IFN - γ , MCP - 1,TNF - α ) in the serum of patients with post burn injuries and to evaluate the status of patients, and also to shed light on the relationship of the surface area of burn with the count of Tregs and levels of cytokines. Seventy one patients with post burn injuries were included in this research, the Venous blood was collected from the first day and fifth day after burn to evaluate cytokines levels by ELISA technique and to count Tregs by Flow Cytometry; the study also included 60 healthy persons represented control group. The results showed a significant decrease in the levels of IL - 10, MCP - 1 and TNF - α in the serum of patients comparing with control, while there is a significant increase in the level of IL - 17A in the serum of patients after first and fifth day of burn (28.70±0.75, 27.28±0.86) pg/ml comparing with control(23.85± 0.66) pg/ml; and there is no significant differences in the level of IFN - γ between patients and control (14.31±0.21, 13.97±0.17, 13.96±0.19) pg/ml respectively. moreover The results showed significant decrease in the level of IFN - γ in the first day after burn in patients with surface area of burn (46 - 70)% and (71 - 100)% and the levels were (13.03±0.41, 13.57±0.30) pg/ml respectively, while there was significant decrease in the level of TNF - α the in patients with surface area of burn (71 - 100)% comparing with less areas of burn, the levels of it in this group was (11.61±0.57) pg/ml and there is no significant differences were seen between other cytokines among different surface areas of burn. The results showed also significant increase in the level of TNF - α in the fifth day after burn in the higher surface areas of burn (31 - 45)%, (46 - 70)% and (71 - 100)% (21.51±2.51, 29.59±4.20, 23.36±1.45) pg/ml respectively comparing with its level in surface area (10 - 30)% (19.54±0.87) pg/ml and there is no significant differences between other cytokines. The results Revealed showed a significant elevation in the level of IL - 10 and IL - 17A in the serum of male patients comparing with female, and the levels in the serum of male were (30.48±0.85, 29.36±0.83) pg/ml respectively while the levels in female patients were (28.38±0.65 , 26.98±0.76) pg/ml respectively, and there was elevation in the level of TNF - α (18.35±0.97) pg/ml in the female patients comparing with male (15.11±0.70) pg/ml. There Additionally, was significant elevation in IL - 10 levels in the patients with post burn injuries by explosion comparing with another sources of burn. There was significant increase in the percentage of Tregs in the peripheral blood of patient with surface area less than 45% and more than 45% comparing with control group , in both first and fifth day after burn with the higher increase in the percentage of its count was in the patients with surface area more than 45% in the first and fifth day after burn (63.58% , 57.95%) respectively

تاثير نبات Carica papaya على طفيلي Giardia lamblia في الفئران وبعض التغيرات البايوكيميائية والنسيجية == Effect of Carica papaya on Giardia lamblia in mice, some biochemical and histological changes

Author name: مصطفى كاظم ملاخ عزيز
Supervisor name: شذى خضير
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة لمستخلص بذور نبات Carica papaya على 100 من الفئران السويدية التي تتراوح اعمارهم (6 - 10) اسابيع ومعدل اوزانهم (8 - 23) غم المصابة بطفيلي الجيارديا ثم ومعرفة بعض التغيرات المناعية والفسيولوجية المرضية والنسيجية والكيميائية الحياتية الحاصلة في تلك الفئران بعد استخدام مستخلص البذور كعلاج لتلك القئران من الجيارديا ثم مقارنتها مع الفلاجيل.بينت نتائج الدراسة المعطيات التالية : هناك انخفاض في مستوى البروتين الكلي في مصل مجموعة الفئران المصابة بطفيلي الجيارديا والمجموعة التي تم معالجتها بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2٪ و5٪ (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) في حين ارتفع مستواه في مجموعة الفئران التي تم معالجتها من قبل فلاجيل (4.35 ± 0.06) مقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة (4.10 ± 0.06).انخفض مستوى الكلكوز انخفاض طفيفا في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا (7.70 ± 0.04). في حين ارتفع مستوى الكلكوز في مصل الدم في المجموعة المعالجة بالفلاجيل وكذلك المجموعتين المصابة بالجيارديا والمعالجة بمستخلص بذور نبات ال Papaya 2% و5% (10.90 ± 0.04) (10.60 ± 0.05) (10.64 ± 0.07) على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (8.10 ± 0.06).مستوى انزيمات الكبد (GOT, GPT) ارتفعت في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة. انخفض مستوى الكوليسترول في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا وفي مجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 5% (1.50 ± 0.04) (1.64 ± 0.05) على التوالي, بينما ارتفع لدى مجموعة الفئران المعالجة بالفلاجيل (2.65 ± 0.03) ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 2% (2.65 ± 0.08) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (2.50 ± 0.00).ارتفع مستوى الكرياتين في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى البروتينات (A, C, D, E) انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري المغنيسيوم والصوديوم انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري الكالسيوم والبوتاسيوم انخفض في مجموعة الفئران المصابة بلجيارديا بينما ارتفع مستواه في مجموعة الفئران المعالجة بلفلاجيل ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2% و5% مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.اظهرت النتائج تغيرات فسلجية مرضية متنوعة في امعاء وكبد وكلية الحيوانات المصابة بطفيلي الجيارديا شملت قصر في الزغابات المعوية, ارتشاح خلوي التهابي, تنسج مع وجود التنخر واحتقان دموي مع تجمع للدهونافضل النتائج كانت بلنسبة للفلاجيل ومن ثم يليها المستخلص المائي لبذور بنات Carica papaya بتركيز 2%. | This study was conducted to determine the effect of different concentrations of seeds extract of Carica papaya plant on 100 Swedish mice aged (6 - 10) weeks and the rate of their weight (8 - 23) g infected with parasite of Giardia and then knowing some pathological physiological, histological and Biochemical changes that occurred in those mice after using the seed extract as a treatment for those mice from Giardia and then compare it with Flagyl. There is a decrease in the total protein level in serum of the group infected mice with Giardia, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) g/L respectivily while its level increased in the group which treated by Flagyl (4.35 ± 0.06 g/L) compared to the negative control group (4.10 ± 0.06 g/L). Level of glucose low slightly in serum in the group of infected mice with Giardia (7.70 ± 0.04 mmol/L), while its level high in the serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (10.90 ± 0.04, 10.60 ± 0.05, 10.64 ± 0.07) mmol/L respectively compared to the negative control group (8.10 ± 0.06 mmol/L). The level of the enzyme (GOT) and (GPT) high in all groups compared with a negative control. The cholesterol level in serum of the group infected mice with Giardia and the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 5% (1.50 ± 0.04 and 1.64 ± 0.05) mg/dl respectively, while its level high in the serum of the group that dosage with flagyl and the group that dosage with seeds extract of Carica Papaya concentration of 2% (2.65 ± 0.03, 2.65 ± 0.08) mg/dl respectively compared to the negative control group (2.50 ± 0.00 mg/dl). The level of Creatinine in the serum high in all groups compared to the negative control group. The level of vitamin A, C, D and E became low in the serum of all groups compared with negative control group. The level of Mg+2 and Na+ low in a serum of all groups compared with the negative control group. The level of Ca+2 and K+ low in a serum of the group of infected mice with Giardia while its level rise in a serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% compared to the negative control group. Results showed diverse histopathological changes in the intestines, liver and kidney of infected animals with Giardia included Palace in intestinal villi, inflammatory cellular infiltration, hyperplasia, necrosis, bloody vessels congestion and accumulation the fats. The best results were for Flagyl, and then for aqueous extract of Carica papaya in a concentration 2%.

مقارنة النشاط الانزيمي لبكتريا Escherichia coli المعزولة من مرضى التهاب المجاري البولية للمصابين وغير المصابين بالعجز الكلوي == Comparison of enzymatic activity of Escherichia coli isolated from urinary tract infection patients with renal failure and non - renal failure

Author name: مصطفى حسن زينل طلحة
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة خلال الفترة من 1/6/2007 لغاية 1/6/2008 . تظمنت جمع 55 عينة ادرار من مستشفى الكندي العام شعبة الكلية الصناعية من المرضى الذين يعانون من التهاب المجاري البولية والمصابين بالعجز الكلوي، ومن كلا الجنسين، وبالاعمار ما بين 30 و55 سنة مقارنة بغير المصابين بالعجز الكلوي الذين تم جمع العينات منهم من المستشفى المذكور، اضافة الى مختبرات حكومية واهلية اخرى وبواقع 143 عينة من هؤلاء المصابين بالتهابات المجاري البولية ضمن الاعمار 3 و75 سنة. تم عزل 51 عزلة بكتيريا من ادرار مرضى العجز الكلوي مع التهاب المجاري البولية منها (49 عزلة للذكور واثنتان للاناث) ، بالاضافة الى عزل 80 عزلة بكتيريا من مرضى غير مصابين بالعجز الكلوي مع التهاب المجاري البولية (33 ذكور و54 انثى).وتم تشخيص الجراثيم المسببة لالتهابات المجاري البولية من كلتا مجموعتي الدراسة بالاعتماد على الصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية القياسية . وكانت نسبة الجراثيم المعزولة من مرضى العجز الكلوي كالاتي 86.2% لـEscherichia coli و5.8% Pseudomonas aeruginosa و3.7% لكل من Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis . وان نسبة الجراثيم المعزولة من التهاب المجاري البولية لغير المصابين بالعجز الكلوي كانت 48.7% Escherichia coli و11.3% لكل من Staphyllococcus aureus وProteus mirabilis, و5.0% Pseudomonas aeruginosa و6.2% Klebsiella pneumoniae و6.2% Enterobacter sp. و7.5% Streptococcus sp.. اتبعت طريقة اليود السريعة لتحديد العزلات المنتجة لانظيمات البيتالاكتاميز، ووجد ان 95.4% من هذه العزلات منتجة للانظيم في مجموعة المصابين بالعجز الكلوي, ونسبة 97.4% للمرضى غير المصابين بالعجز الكلوي، كما تم معرفة نشاط انتاج انظيمات الهيمولايسين بطريقة زرع العزلات التي اظهرت نتيجة موجبة على وسط اكار الدم، وذلك باستعمال انماط مختلفة من الدم البشري بفصائله الاربعة A ,B ,AB ,O ، ووجد ان اعلى نسبة تحلل للدم كانت للصنف AB ولكل من المصابين وغير المصابين بالعجز الكلوي، كما ان نسبة النشاط الهيمولايسيني ولجميع العزلات مرتفعة اذ كانت 84.6% لدى غير المصابين بالعجز الكلوي ووصلت النسبة الى 86.6% لدى المصابين بالعجز الكلوي.اختبرت حساسية البكتريا لمضادات الحياة التي قيست بطريقة Kirby - Bauer على وسط Mueller - Hinton agar وان مضادات الفلوروكوينيلونات, والازيثرومايسين كانت الاكثر فعالية ضد الجراثيم المعزولة من مرضى العجز الكلوي، بينما كانت مضادات النورفلوكساسين وحامض النالدكسيك والبيفلوكساسين اكثر فعالية ضد الجراثيم المعزولة من غير المصابين بالعجز الكلوي.كما وجد ان مديات المقاومة المتعددة لمضادات الحياة في مرضى العجز الكلوي اقل من غير المصابين بالعجز الكلوي، اذ كانت مديات المقاومة لاكثر من خمسة مضادات بنسبة 17.6% ولجميع المضادات بنسبة 10.7% اما غير المصابين بالعجز الكلوي فقد وصلت مديات العزلات المقاومة لخمس مضادات 18.0%، والمقاومة لجميع المضادات الموضوعة بالبحث الى 17.9%. | This study was carried out between 1st of June 2007 to the 1st of June 2008. It comprised the collection of 55 urine samples from Al - Kindy general hospital /artificial kidney department from patients who suffered from urinary tract infections with renal failure of both sexes and of ages between 30 - 55 years and was compared with people not suffering from renal failure by sample collected from them in the above mentioned hospitals, these samples were studied in government and private laboratories amounting to 143 samples from those with urinary tract infection ages between 3 - 75 years.Fifty one bacterial isolates were isolated from renal failure urines with urinary tract infections of this 49 from males and 2 from females in addition to 80 bacterial isolates from non - renal failure patients with urinary tract infections (33 males & 54 females).Bacteria causing urinary tract infections from both groups which were studied were identified by morphological characters and biochemical standard testing. The percentage of germs isolated from renal failure patients was 86.2% for Escherichia coli, 5.8% for Pseudomonas aeruginosa, 3.7% for Klebsiella pneumoniae and 3.7% for Proteus mirabilis and the percentage of germs isolated from urinary tract infection patients with non - renal failure were 48.7% for Escherichia coli, 11.3% for Staphyllococcus aureus, 11.3% for Proteus mirabilis, 5.0% for Pseudomonas aeruginosa, 6.2% for Klebsiella pneumoniae, 6.2% for Enterobacter sp. and 7.5% Streptococcus spp.Quick iodine method was used to determine the isolates which produce β - lactamase enzyme, 95.4% of these isolates were found to produce this enzyme in the group of patients with renal failure and 97.4% in patients with non - renal failure. The activity of haemolysin enzyme production was determined by culturing the isolates on blood agar by using different sorts of human blood of all four groups A, B, AB & O and the highest proportion of blood haemolysis was found in the AB group in both renal failure 85.6% and non - renal failure patients 84.6%.Antibiotics sensitivity was tested by Kirby - Bauer method and measured on Mueller - Hinton agar medium however Floroquinilones & Azithromycin antibiotics were the most efficient against the isolates from renal failure patients, while Norfloxacin, Naldixic acid and Pefloxacin were efficient against isolates from non - renal failure patients. It was found that the extents of antibiotic resistant in renal failure patients was less than in non - renal failure patients where the resistance for more than 5 antibiotics was 17.6% and for all antibiotics 10.7%, while the resistance extent to 5 antibiotics in non - renal failure patients was 18.0% and to all antibiotics was 17.9%.

التاثير السمي لمستخلص نبات المديد وفايروس مرض النيوكاسل على بعض الخلايا السرطانية في المختبر == Cytotoxic Effect of Convolvulus arvensis Extract and Newcastle Disease Virus on Some Cancer Cell Lines in vitro

Author name: مصطفى اكــرم عثمان خليل
Supervisor name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني | احمـد مجيد حمزة الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

التحطم الحيوي لسم فطر Fusarium graminearum داخل جسم الكائن الحي

Author name: مشتاق طالب كريم
Supervisor name: شذى علي شفيق
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية بيان التاثيرات النسيجية والبايوكيميائية في نسيجي الكبد والكلى لذكور الفئران البيض تحت تاثير سم الزيرالينون المستخلص من عزلة فطرية منتجة لسم الزيرالينون Fusarium graminearum وبتركيز(2)ملغم/كغم بجرعة احادية وجرعات متكررة من السم وتجريعها فمويا , تقسيم الفئران الى ثلاث مجاميع (5 فئران لكل مجموعة) مع الاخذ بنظر الاعتبار وزن الجسم الحي واوزان الكبد والكلى,مجموعة عوملت بجرعة احادية من السم وتركت لمدة يومين (T1) ومجموعة اخرى عوملت بجرعتين اسبوعيا لمدة اسبوع (T2) ومجموعة عوملت بجرعـــتين كل اسبوع لمدة اســـبوعين (T3),وقد تم اخـــذ مجموعة السيطرة لكل معاملة وعـــوملت بالمحلول الذي اذيب فيه السم الفطري (1% ثنائي مثيل الكبريت) DMSO Dimethyl Suphxide.لقد لــــوحظ في نتائج هذه الدراسة تغيــــيرات نسيجية في الكـــبد عند المعاملتين T2وT3 تمـــثلت باحتقان في الاوعية الدموية مع تنخر وتنكس في الخلايا الكـــبدية وقلة حبيـــبات الكلايكوبروتين , بينما تضمنت التغيرات النسيجية في نسيج الكلى باحـــتقان دموي في الاوعية الدموية مع وجود تنكسات في الخلايا المبطنة الدانية والقاصـــية في المعاملــتين T2وT3 ولم تــظهر المــعاملة T1 اي تغيرات نسيجية في الكبد والكلى مقارنة مع معاملة السيطرة .اما نتائج الاختبارت البايوكيــــميائية لانزيـــمات الكبد والــــكلى فقد اظــهرت نتائج التحليل الاحصائي عـــــدم وجـــــود فروقات معـــــنوية فــــي قـــيــم انزيــــمي AST Aspartate Aminotransferase) ) وALT(Alanine Aminotransferase) عند المعاملتين T1وT2 , بينما اظهرت المعاملة T3 انخفاضا معنويا فــــي قيم كلا الانزيــمين وقد انـــخفضت الى (12.33,14.00) وحــدة دولية لكل لتر مقارنة مع معاملة السيطرة (22.00,20.00) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب , اما انــزيم (Alkaline Phosphatase) ALP اظــهرت المعاملتين T2وT3 ارتفاعا معنويا بلغت (23.00,18.66) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة(13.33)وحدة دولية لكل لتر, ولم تظهر المعاملة T1 اي اختلاف معنوي في قيم الانزيم ALP . اما تركيز اليوريا في مجانس نسيج الكلى فــــقد اظهر انخفاضا معنويا في المعاملتين T2وT3 اذ بلغت قيمته (23.66,24.83) ملغم / لتــــر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة (27.16) ملغم/لتر,اما المعامـــــلة T1 لم تظهر اي فروقات معنوية في قيم تركيز اليوريا، كما لم تظهر فروقات معنوية ولكافة المعاملات في تركيز الكرياتنين.تضمن الجزء الثاني من هذه الدراسة التحطيم الاحيائي لسم الزيرالينون بواسطة المعزز الحيوي العراقي بتركيز (2%) وزن/حجم وراشح خميرة Saccaromyces boulardii واللذان كان لهما الاثر الفــــعال والمعـــنوي , اذ لوحــــظ تحسن واضح في خلايا نسيج الكبد والكلى لمجموعة الفئران التي تم تغذيتـــها عــــــلى العـــليقة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح الخميرة مقارنة مع ما احــدثته السيطرة الموجبة والمتمثلة بمجموعة الفئران التي تغذت على العليقة الملوثة بفـــطر F.graminearum المنتج لسم الزيرالينون من تغيرات نسيجية في نسيجي الكبد والكلى.كما اظهرت نتائج التحليل الاحصائي لانزيمات الكبد في معاملة السيطرة الموجبة فروقات معنوية واضحة عند مستوى احتمالية (P˂0.01) بلغت قيــــم ا لانزيمات ASTو ALTوALP (25.66,14.66,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة السالبة (مجموعة الفئران التي تغذت على عليـــــقة غير ملوثة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لـــسم الزيرالينون ) اذ بلغت قيــــم الانزيمات الثلاثة (13.33,22.00,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب,و بينت نتائج تداخل تغذية ذكور الفئران لعـــليقة ملوثة بفطر F.graminearum المنتجة لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح خميرة S.boulardii زيادة معنوية في قيم الفـــعالية النوعية لانـــزيمات الكبد الثلاثة في مجانس نسيج الكبد وقـــــيمة تركـــيز اليــوريا في مجانس نسيج الكلى مقارنة مع معاملة السيطرة الموجبة. | The present study was conducted to evaluate the histological and biochemical toxic effects of Zearalenone on liver and kidney tissues of males white mice that extracted from fungal isolate Fusarium graminearum produced Zearalenone at concentration (2 mg / kg body weight) given single and repeated doses of toxin via oral administration. Mice were divided into three groups (five mice for each group), taking into consideration body weight, liver and kidney weights. T1 : receiving the toxin once and sacrificed after two days. T2 : given the toxin twice for one week. T3 : given the toxin twice a week for two weeks. Each treated group has its corresponding control which received 1% Dimethyl Sulphoxide (DMSO). The results showed the histological changes in liver tissue in T2 and T3 groups which represented by congestion vascular with necrosis and degeneration in hepatic cells in addition to reduction in glycoprotein granules. While, the histological changes in kidney tissue included congestion vascular and degeneration in distal and proximal tubules. No obvious histological changes were noticed in liver and kidney tissues in T1 group.The results of biochemical tests for kidney and liver enzymes AST (Aspartate Aminotransferase) , ALT (Alanine Aminotransferase) were shown no significant differences in means of the specific activity of these enzymes , AST and ALT in T1 and T2 groups .In contrast T3 group showed significant decreasing in values for both enzymes AST and ALT (14.00 , 12.33) IU/ L respectively . ALP (Alkaline Phosphatase) enzyme was increased significantly in T2 and T3 groups (23.00, 18.00) IU/L respectively compared with T1 and control groups . The results of Creatinine concentration in kidney tissue revealed no significant differences in all groups. In regard to Urea concentration in kidney tissue was decreased significantly in T2 and T3 groups (24.83,23.66) mg / L respectively compared with the rest of groups. The other part of the present study was to investigate the biological degradation of Zearalenone using by Iraqi probiotic 2% (w/v) and yeast filtrate of Saccharomyces boulardii which had an active influence . As observed a clear improvement in liver and kidney tissues for group of mice that fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate compared with positive control ( group of mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ) that caused the histological changes in liver and kidney tissues .The results of liver enzymes showed significant differences in positive group for three enzymes ALS , ALT and ALP reached ( 15.66, 14.66, 25.66 ) IU/ L respectively , compared with negative control (group of mice did not fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ). However , the results of the interaction between mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate were shown significant increasing for ALS , ALT , ALP enzymes in addition to urea concentrations in kidney tissue compared with positive control

توصيف جرثومة Enterobacter sakazakii المعزولة من مصادر مختلفة في محافظة ذي قار == Characterization of Enterobacter sakazakii Isolated from various sources at Thi - Qar Province

Author name: مروى حسن نصير الصافي
Supervisor name: يحيى عبد الرضا عباس | راجي طعمة ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى الكشف عن بكتريا Enterobacter sakazakii في بيئات مختلفة شملت عينات غذائية وبيئية وسريرية . اذ جمعت 310 عينة خلال الفترة من ايلول 2012 ولغاية تموز 2013.اظهرت نتائج الزرع الاولي على وسطVRBAواكار الماكونكي بعد التشخيص بالاعتماد على الصفات الزرعية والكيموحيوية وتوكيد التشخيص باستعمال العدة API 20E. ان 22 (7.09%) من اصل 310 عينة اعطت نموا لبكتريا Enterobacter كالاتي 9/80(11.2%) من بيئة المستشفيات ,12/180(6.6%) حليب اطفال,1/50(2%)من حالات الاسهال . توزعت العزلات بعد التشخيص المختبري على الانواع التالية (15/22) 68.1% Enterobacter cloacae,(4/22)18.1% Enterobacter sakazakii و3/22))13.6% للنوع Enterobacter aminogenus. اختبرت مقاومة عزلات Enterobacter sakazakii الاربع ضد 20 مضادا من اصناف مختلفة وقد اظهرت النتائج ا ن جميع العزلات كانت مقاومة على الاقل لست من المضادات قيد الاختبار.اختبرت قدرة بكتريا Enterobacter sakazakii على انتاج انزيمات البيتا لاكتيميز واسعة الطيف واظهرت العزلات عدم قدرتها على الانتاج واستخدمت طريقة القرص المصاحب لمعرفة قابلية العزلات على انتاج انزيمات الميتالو بيتا لاكتاميز.درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج ان 2/4(50%) من العزلات لها قدرة على انتاج الغشاء الحيوي.كما د رست قدرة البكتريا على مقاومة التاثير القاتل للمصل وظهرت العزلات كلها موجبة بينما درست قدرة البكتريا على تلازن كريات الدم الحمراء لوحظت تحت المجهر واظهرت النتائج ان 3/4(75%)من العزلات كانت موجبة.اختبرت قدرة البكتريا على انتاج السموم المعوية باستخدام الفئران الرضيعة وظهرت كل العزلات منتجة له وقد ظهرت على الفئران الرضيعة بالسموم المعوية اعراض سريريه حادة مثل انخفاض النشاط والحركة البطيئة وعلامات ضعف مع تغيرات في المعدة وخسارة التركيب النسيجي للغشاء المخاطي والغدد وظهور بؤر للخلايا المتحللة وزيادة في سمك الجدار مع تقرحات في النسيج اما التغيرات المرضية في الامعاء فهي تغيرات غير مخصصة تمثلت بتقطعات في النسيج الطلائي وتقرحه وفقدان لشكل النسيج والغدد. | This study was aimed for detection occurrence of Enterobacter sakazakii in stool specimens, infant formula and hospitals environments. A total of 310 samples (180 infant formula, 50 stool samples and 80 hospital environment swabs ), during the period from September 2012 to July 2013 were collected. Growth on Violet redbile agar and MacConkey agar was identified by cultural and biochemical tests and confermated by API 20 E system which revealed that : Only 22/310(7.09%)gave positive growth for Enterobacter spp. as following : 9/80 (11.2%) environmental swabs , 12/180(6.6%) infant formula and 1/50 (2%) stool samples. Diagnosis of the isolates appeared that E. cloacae was (15 ⁄ 22) while E . sakazakii (4 ⁄ 22) and E. aminogenus (3/22). Four E. sakazakii isolates were screened for their antibiotic resistance against 20 antibiotics of different classes using Kirby - Bauer disk diffusion method. The results showed that all the tested isolates were resistant to at least 6 antibiotics of which they were tested . In the present study four E. sakazakii isolates where screened for potential ESBLs production, they showed 3 (75%) isolates were potential ESBLs production ,but conformation of ESBLs production was detected by double disk synergism test and appeared that all the isolates were unproductive . Combined disk diffusion method was used for detection of metallo - β - lactamase - producing isolates, they were emplace each of imipenem and ceftazidame antibiotics with and without EDTA on Mueller - Hinton agar, because EDTA working to inhibit of metallo - β - lactamase. The results showed that the presence of EDTA does not affect the diameter of inhibition zone for the four isolates. Biofilm production was detected by spectrophotometric method .The four isolates were tested and appeared that 2(50%) were produced biofilm. The resistance of bacterial isolates to serum bactericidal activity was tested by the turbidmetric assay . All isolates were appeared able to resist to serum bactericidal activity, while Agglutination of erythrocytes was tested under the microscope and showed 3/4(75%) were positive. In the present study E. sakazakii were evaluated enterotoxin production. All the isolates showed positive for enterotoxin production. Results of treating suckling mice with enterotoxin showed acute clinical signs appeared depression, slow movement and signs of weakness. Significant macroscopic finding showed in mice treated with enterotoxin the stomach was distended and enlarged with thick corrugated mucosa but no significant changes in intestine. Pathological changes in the stomach appeared as loss of normal architecture of mucosa and glands, multiple foci of degenerative cells, reactive epithelial surface with thickening wall, pseudo - metaplasic changes and superficial epithelial injury. The intestinal changes showed nonspecific pattern of damage to surface of epithelium .Complete loss of architecture of glands and mucosal epithelial , superficial epithelial discontinuity , ulcer and non - specific reactive epithelial surface.

الممرضات الداخلية المسببة لحالات الاسهال لدى الاعمار من 1 - 15 سنة في مدينة بغداد

Author name: مروة محمد نصري التميمي
Supervisor name: سلوى صبر محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The diarrhea is Enteropathy characterized liquidity abnormal,because of the increases by the movement of colon in the general way, may be represent a good sign to the Enteropathy like the Entamoeba histolytica disease, viruses Enteropathogen and bacteria,The diarrhea and associated of droughts state remains the major problem to the job of medial health in the medial east especially in the age under 5 years old.This study design to study the reason of the diarrhea and diagnosis and the effect result of it in the children under 15 years old, theirs patient from (learn hospital of alemamenalkadoman) in the city of Baghdad from 25/4/2014 to 1/10/2014 period of time, the study represent 103 sample of Stool and blood from children between (>1 - 15)years wasSufferers from diarrhea state, this state diagnose with infection of parasite (E.histolytica, G.lamblia, and others), Rotaviruses and bacteria E.coli.It use the general stool examination direct (by eyes) and in direct (by microscope) to diagnose the antigen of rotaviruses in stool, Either the blood sample store in two tube one of it contain EDTA use to CBC, Pcv, Hb, w.b.c, ABO group measure, and the second one is empty from the EDTA use to ayanlsys serum to measure (CRP) and Interleukin in the patient diarrhea.From summation of 103 found that 50 (48.54%) infected by intestinal protozoa, 41 (39.80%) infected by Rotaviruses, 9 (8.73%) infected by mixed (Parasite + Rotavirus), 3 (2.91%) infected by bacteria E.coli.50 sample infected by intestinal protozoa (42 sample is infected with one Species of parasite and 8 sample of stool continue two type of the parasite), the highest ration of infection was E.histolytica 50%, G.lamblia 38.10%, Blastocystis hominis 7.14%, and the lowestBalantidium coli 4.76%, the study recode the highest ration of mixed infected (Parasite + Rotavirus) was between G.lamblia + Rotavirus 33.33%.In This study present we found highest deference between male and female in the infection of parasite and rotavirus, male record (62 - 60)% and female (38 - 40)% on series, mixed infected (parasite + Rotavirus) Reached to the female 55.56% and this is the highest ration infection from the male 44.44%, notice that there is high Significant difference in the ratio of infection between the Age groups of the groups studied at the probability of p<0.01, where recording rotavirus infection IIhigher ratio infection in the Age groups (1 - 5) year 66,67% and less ratio 11,11% where age groups less than year, but the parasite infection only was more age group infected liable (more than 5) year with ratio 56% and smallest ratio for age group (less than year) 18%. And in the result media use (L.E) to culture E.histolytica and discover from the study , this media don’t provide good environment to maintain the parasite and resolve it for a limited period without multiplication or increase in number is it, in the case of trophzoite stage culture it stay with out - increases in the number is for one day only and after bass 24 hour transfer to the cyst stage and remain bass 3 day only and despair in the fourth day, while in culture of cyst stage Found that Noway to transform to the trophzoite stage like it happen in the human body but stay in the case of cyst stage on states. With condition E.histolytica that the Stool samples continue blood and mucous only to contain a lot off mass from the trophzoite stage and this stage only can be increases causes increase in number.Noted that this culture never dedicated only to the cultivation E.histolytica but noted the trophzoite stage exist for parasite B.coli in this stage and when culture sample from Stool contain B.coli and remain this stage Governor of the trophozoite stage for a period of two days.Either for the blood type test has been shown by the study, the highest percentage recorded rotaviruses injury in people living with antigen type A 39.59%, 39% and 44.44% for parasitic and rotavirus infections and joint respectively.And gave a hemoglobin level of Hb and size precipitation of red blood cells PCV lowest level at co - infection (parasit + rotavirus), followed by rotaviral and parasitic infection compared with control group P <0.05. Showed parasitic infection and joint significant difference in the total number of white blood cells when the probability of P <0.05, either rotaviral infection did not give a significant difference with the control group.The results of the present study about differential count of white blood cells, showed no significant difference comparing with study groups, but showed significant difference within the three groups with control group that remain the value of the Moral difference p<0.05 When all of the (Neutrophil ،Basophile ،Eosenophil)However, it did not register significant difference when cells Lymphocyte.When statistical analysis when studying some immunological changes associated with injuries intestinal regarding the number of days that lasted the case of diarrhea, and by which they can determine if the injury was severe diarrhea or chronic, and that gave significant difference (1 - 2) day P <0.01 when (3 - 4) day and (more than 4) on the value of the differences P <0.05.log CRP level of rotavirus infections 31.70%, 0.52% for infections with parasite, 88.89% of the common injuries (parasitic + viral) gave at P <0.01 probability asignificant differences.The results of the study of some of the dynamics of cellular aggregates of the study and its relationship to the immune response. Observed statistically significant at the use of IL - 10 three of its study groups recorded a significant P <0.05 was higher at 1.22% viral infection compared to the control group. Parasitic infection and did not record any significant difference.And log IL - 17A highest percentage increase at the joint injury, and there is no significant difference between the incidence of parasitic and viral infection.For IL - 33 infection joint highest recorded percentage of injury followed by a parasitic infection and finally viral. and IL - 4 infection shared the highest rate, followed by injury viral recorded and finally parasitic and gave moral difference P <0.05 and finally INF - gama, which did not record any significant differences when comparing the groups study together but gave at P <0.01probability moral differences with group of control when compared recorded the highest common injury is also high.

دراسة التنوع الاحيائي للطحالب الملتصقة على نبات القصب والطين في نهر دجلة - الدورة, ضمن مدينة بغداد/العراق == Biodiversity Study of Epiphytic on Phragmites australis and Epipelic Algae in Tigris

Author name: مروة ثامر خالد هندي
Supervisor name: جنان شاوي الحساني
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الفصلية للطحالب الملتصقة على نبات القصب Phragmites australis ولطحالب الطين في نهر دجلة ضمن منطقة الدورة / بغداد, عدت كمحطة دراسة واحدة ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 لغاية شهر حزيران 2015. تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل البيئية الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ضمن الموقع المذكور مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء)، التوصيلية الكهربائية (E.C.), الملوحة, نفاذية الضوء (L.P)، الاس الهيدروجيني (pH)، المواد الذائبة الكلية (TDS)، المواد الصلبة العالقة الكلية (TSS)، القاعدية الكلية (TA)، الاوكسجين المذاب (DO)، الكدرة (Turbidity), العسرة الكلية (TH), الكالسيوم (Ca), المغنيسيوم (Mg), سرعة الجريان (W.F), الكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا , النتروجين الكلي (TN), الفسفور الكلي (TP) والسيليكا الفعالة (SiO3). تم حساب اربعة ادلة بيولوجية (دليل الغنى ودليل التنوع ودليل جاكارد للتشابه ودليل التكافؤ). تراوحت درجة حرارة الماء والهواء بين (10.5 - 27) م و(11 - 32) م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني (7.1 - 7.9) وقيمة الاس الهيدروجيني للرواسب (7.7 - 8.1). بينما كانت قابلية التوصيل الكهربائي بين (597.0 - 821.67) مايكروسمنز/سم. في حين سجلت قيم الملوحة (0.38 - 0.50) جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية بين (298.0 - 410.0) ملغم /لتر، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن (38.87 - 15.75) ملغم /لتر، والكدرة (24.63 - 42.03)NTU ، ونفاذية الضوء (5.17 - 20.5) سم، وسرعة الجريان (0.06 - 0.67) م/ثا والاوكسجـين المذاب بين ((11.5 - 10.15 ملغم/لتر، وقيم المتطلب الحيوي بين (5.33 - 3.03) ملغم \لتر، واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت بين (133.33 - 200.53) ملغمCaCO3/لتر, العسرة الكلية (413.33 - 636.67)ملغمCaCO3/لتر، الكالسيوم (111.14 - 196.0) ملغم/لتر، المغنسيوم (33.2 - 78.5) ملغم/لتر، النتروجين الكلي (4.54 - 6.99 ) مايكروغرام /لتر، في حين تراوح الفسفور الكلي (12.88 - 15.64) مايكروغرام/لتر والسيليكا الفعالة (371.14 - 506.10) مايكروغرام/لتر. سجلت في هذه الدراسة اعلى قيمة للكلوروفيل للطحالب الملتصقة على نبات القصبPhragmites australis في الخريف (19.71) مايكروغرام/سم2واقل قيمة في الربيع (13.35) مايكروغرام/سم2, اما بالنسبة للكلوروفيل الخاص بطحالب الطين فقد سجل اعلى نسبة في الصيف (5.84) مايكروغرام/سم2, واقل نسبة في الخريف (2.17) مايكروغرام/سم2, سجلت قيم الفيوفايتين في الدراسة الحالية,ففي الطحالب الملتصقة على نبات القصب سجلت اعلى قيمة في الصيف (6.57) مايكروغرام/سم2, واقل قيمة في الربيع (1.02) مايكروغرام/سم2 وقيم الفيوفايتين الخاصة بطحالب الطين سجلت اعلى قيمة لها في الربيع (1.00) مايكروغرام/سم2 واقل قيمة كانت في فصل الخريف (0.37) مايكروغرام/سم2. تم تشخيص (253)نوعا من الطحالب الملتصقة على كلا السطحين (القصب والطين) اذ بلغ عدد الانواع المشخصة على نبات القصب Phragmites australis في الدراسة 183 نوعا( 57 جنسا), وكان منها 115 نوعا (26 جنسا) تعود الى الطحالب العصوية (الدايتومات) Bacillariophyceae 37 نوعا (11 جنسا) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae, و25 نوعا (15 جنس) تعود الى الطحالب الخضر Chlorophyceae وقد شخص نوعان من الطحالب اليوغلينية Euglenophyceae ونوع واحد للطحالب البرواتية Dinophyceae ونوع واحد من الطحالب الكارية Charyophyceae ونوع واحد من الطحالب الحمرRhodophyceae ونوع واحد من الطحالب الصفر Xanthophyceae . وبلغ عدد الطحالب المشخصة على الطين 154 نوعا 38) جنسا), كان منها 130 نوعا(24 جنسا)تعود للطحالب العصوية (الدايتومات) و15 نوعا (سبعة اجناس) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae وثمانية انواع (ستة اجناس) تعود للطحالب الخضر ونوع واحد يعود للطحالب اليوغلينية Euglenophyceae.بينت نتائج الدراسة الحالية وجود تغايرات فصلية في العدد الكلي للطحالب الملتصقة على القصب وعلى الطين اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الشتاء اذ بلغ 772.05 x 104خلية/غم وزن رطب48.1) %) من المجموع الكلي لاعداد الطحالب المشخصة في هذه الدراسة , وقد سجل اقل عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الصيف x 161.13 104خلية/غم وزن رطب (10.04% ), اما في فصلي الربيع الخريف فكانت نتائج اعداد الطحالب المشخصة متقاربة فكانت x337.92 104خلية/غم وزن رطب ( 21.06% ) في الربيع وx 333.17 104 خلية/غم وزن رطب (20.07%) في الخريف. اما بالنسبة للاعداد الكلية الخاصة بطحالب الطين فبلغ اعلى تسجيل في الشتاء 104x20.07 خلية/ سم2 35.01)%) من المجموع الكلي للطحالب المشخصة, واقل عدد كلي سجل في الصيف 104 x6.53خلية/ سم(2 11.39 %) . اما في الخريف والربيع فكان العدد الكلي 104x15.53و 104x15.18 خلية/ سم2( 27.08% و26.48 %) على التوالي . اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان اعلى قيمة لدليل الغنى (8.3) في الشتاء واقل قيمة (3.09) في الصيف للطحالب الملتصقة على نبات القصب في حين سجلت اعلى قيمة لدليل الغنى (4.3) في الشتاء واقل قيمة (2.6) في الصيف لطحالب الطين . ان اعلى قيمة لدليل التنوع (4.02) في الشتاء واقل قيمة في الصيف (2.94) للطحالب الملتصقة على نبات القصب, وتراوحت قيم دليل التنوع لطحالب الطين بين ( 3.02و (4.03 في الصيف والشتاءعلى التوالي. وتراوحت قيم دليل التكافؤ للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين (0.57 - 0.6) في فصلي الصيف والربيع على التوالي, اما بالنسبة لطحالب الطين فكانت قيم دليل التكافؤ تتراوح بين (1.61 - 1.31) في فصلي الصيف والربيع على التوالي. بينت النتائج ان اعلى نسبة تشابه بين الفصول بالنسبة للطحالب الملتصقة على نبات القصب كانت بين الصيف الربيع وبلغت (0.404), اما اقل نسبة فكانت بين الخريف والربيع اذ بلغت (0.195) وكانت نسبة التشابه بين الفصول لطحالب الطين قد سجلت اعلاها بين الربيع والخريف اذ بلغت (0.369), واوطا قيمة سجلت بين فصلي الربيع والصيف اذ بلغت (0.216), اما درجة تشابه الطحالب بين سطحي الالتصاق فقد كانت 45.728%. | A seasonal study was conducted in order to cover the epiphytic Algae on Reed (Phragmites australis) and epipelic algae in Tigris River in Al - Dora site in Baghdad province from November 2014 to June 2015. Some Physiochemical parameters such as Air and water temperature, light penetration, pH, Total dissolved solids (TDS), Total Suspended Solids (TSS), Dissolved Oxygen (DO), Biological Oxygen Demand (B.O.D5), Turbidity (TU), Total hardness, Total Alkalinity (TA), Calcium (Ca), Magnesium (Mg), Water flow, Chlorophyll - a and Pheophytin - a, Total Nitrogen (TN), Total Phosphorous (TP), Active Silicate (SiO3) were collected during the study. In addition, four biological indices [Richness, Diversity (Shannon - Winer), Similarity (Jaccard), and Evenness index] were tested.The studied parameters values ranged as follows : (10.5 - 27) C°, (11 - 32) C° for water and air temperature, respectively. Water pH )7.1 - 7.9( and the sediment pH (7.7 - 8.1), EC (597.0 - 821.67) µS/cm, S‰ (0.38 - 0.50), TDS (298.0 - 410.0) mg/l ,TSS (38.87 - 15.75) mg/l, The turbidity and light penetration, water flow (24.63 - 42.03) NTU, ( 5.17 - 20.5) cm, (0.06 - 0.67) m/min, respectively. While TA (133.33 - 200.53) mg/l, TH (413.33 - 636.67) mg/l, Ca (111.14 - 196.0) mg/l, Mg (33.2 - 78.5) mg/l, DO. concentration ranged 10.15 - 11.5mg/l. B.O.D5 concentration ranged (3.03 - 5.33)mg/l, Nutrients concentration in the study sites ranged as follows : (4.54 - 6.99)µg/l, (12.88 - 15.64)µg/l, (371.14 - 506.10) µg/l for TN, TP and SiO3 - 2. Chlorophyll - a concentration recorded (13.35 - 19.71) µg/cm2 in winter and autumn for epiphytic algae, and (2.17 - 5.84) µg/ cm2 in autumn and summer for epipelic algae. Pheophytin - a concentration varied between epiphytic and epipelic algae, and recorded (1.02 - 6.57) µg/cm2 in spring and summer, (0.37 - 1.02) µg/ cm2 for autumn and spring, respectively for epiphytic and epipelic algae.Total of 183 epiphytic algal species belong to 57 genera as the following : 115 species (26 genera) of Bacillariophyceae; 37 species (11genera) of Cyanophyceae; 25 species (15 genera) of Chlorophyceae; two species of Euglenophyceae; one species to each Dinophyceae, Charyophyceae, Rhodophyceae, and Xanthophyceae were recorded. Regarding the epipelic algal species, total of 154 species (38 genera) as the following : 130 species (24 generra) of Bacillariophyceae, 15 species (seven genera) of Cyanophyceae, eight species (six genera) of Chlorophyceae, and one species of Euglenophyceae were recorded. Moreover, 90 species were shared between the identified epiphytic and epipelic algae at the study site.The seasonal variations of the epiphytic and epipelic algae were notified. According to the epiphytic, the highest count was recorded during winter 2015 and reached 772.05 x 104 cell/g. (48.1%) from the total number of the identified species. The lowest count was noticed in summer and reached 161.13 x 104 cell/g (10.4%) from the total number of the identified species. It is worth mentioning that the total count of epiphytic in autumn and spring was convergent. In autumn the count reached 333.17 x 104 cell/g. (20.07%) from the total number of the identified species; while the count reached 337.92 x 104 cell/g. (21.06%) in Spring, While for epipelic algae the highest count was recorded during winter 2015 and reached 20.07 x 104 cell/ cm² (35.01%) from the total number of the identified species. In summer, the lowest count was noticed and reached 6.53x 104 cell/ cm² (11.39%) from the total number of the identified species. In addition, the autumn count reached 15.53x 104 cell/ cm² (27.08%) from the total number of the identified species; while the spring 15.18x 104 cell/ cm² (26.48%).The biodiversity indices values for epiphytic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (2.94 - 4.02) in summer and winter; Evenness index (0.57 - 0.6) in summer and spring; Jaccard index (0.195 - 0.404) between autumn and spring and between spring and summer. The biodiversity indices values for epipelic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (3.02 - 4.03) in summer and winter; Evenness index) 1.31 - 1.61 (in spring and summer; Jaccard index (0.369 - 0.216) between autumn and spring and between spring and summer

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن == Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

Author name: محمـد فضـل سالم الميسـري
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

التاثير الوقائي لمستخلص بذور نبات البلنكو Lallemantia royleana في حماية الكبد من سمية عقار الريفادين في ذكور الفار الابيض == Hepatoprotective Effect of Lallemantia royleana Seeds Extract Against Rifadin Toxicity in Male Albino Mice

Author name: محمد فاضل عبد الحسين
Supervisor name: زينب فاضل شويت الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study aimed to focus on the hepatoprotective effect of Lallemantia royleana seeds extract against rifadin hepatotoxicity in experimental mice.The study was conducted on swiss albino male mice (40), there age ranged from 5 - 8 weeks with weight of 25 - 30 gm that divided into four animals groups : • First group orally administered with (0.1 ml) normal saline (0.9%) for 28 days as control group. • Second group orally administered with ( 0.1 ml) rifadin (1.5 mg/kg/day) for 28 days.• Third group orally administered with (0.1 ml) alcoholic extract of Lallemantia royleana seeds (1%) for 28 days . • Forth group was also orally administered with seeds extract alone for 5 days and with (0.1 ml) seeds extract and rifadin for 28 days, so the total period of this group is 33 days. Blood samples ware collected from experimental animals to measured liver function enzymes (ALT,AST,ALP) levels, liver samples were also collected for histopathological and immunohistochemical studies.Results showed there was animals activity changes in groups especially in drug administered group compared with other groups, which represented by lethargy, introversion,the tendency to sleep, hyperventilation, in addition to change the faeces color and urine color, and these behavioral changes noted after 15 days from experiment began.The statistical analysis of the data showed significant increase (P<0.05) in AST, ALT,ALP levels in blood serum of animal group administered with rifadin (662.04±8.26, 131.575±3.45, 197.00±6.58) respectively compared withcontrol group ( 25.2 ± 21.562 , 445..2±2522, 2.543±6524 ) significant decrease (P<0.05) was also noticed in AST,ALT level in seeds extract group( 2..563±.54., 47.480±1.93) and seeds extract - drug group ( ...531±.5.1, 85.033±2.33) compared with drug group, while significant increase (P<0.05) in ALP enzyme level in animals group administered with seeds extract alone (4..5..±.533 ) compared with drug group.The histopathological changes in liver tissue of experimental grups, was represented by loss of normal architecture of liver tissue and radial organization of hepatic cords in centrilobular region and peripheral regions in animals administered with drug, vaculation and death of hepatic cells, congestion (moderate/ severe) in central veins, and few infiltration of mononuclear leukocyte in centrilobular region. In animals administered with seeds extract - drug group was preserved the hepatic cords radial organization especially surrounding the central vein, congestion (mild/ moderate) in central veins, alarge numbers of balone - shape cells with vaculated hepatic cells, and the histological structure in animals administered with seeds extract was approached to control group, that was no dissociation in liver tissue and hepatic cords radially organized around central vein, and mononuclear leukocyte infiltration in centrilobular region and the adjacent region of portal traid.The immunohistochemical test result revealed significant increase (P<0.05) in apoptotic index and in the cells with Bax protein that stimulating the process of apoptosis possitive reaction in drug administered animals group )%665.22±2542( compared with other experimental groups, also the results revealed significant decrease (P<0.05) in apoptotic index and the cells with Bax protein possitive reaction in animals administered with seeds extract and seeds extract - drug compared with drug group, ( 251.2±2521, 25422±2522) % respectively.

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من نماذج الانسان باستخدام تقنية تفاعل البوليمرز المتسلسل (PCR) والنشاط المضاد لمستخلصات قشور البصل == Isolation and Identification dermatophytes from human Samples By using polymerase chain reaction (PCR) Technique and Antidermatophytic activity of onion peel extracts

Author name: محمد عبد الكريم الخفاجي
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الفطريات الجلدية هي واحدة من مجموعة من الفطريات ذات الصلة وثيقة والتي لديها القدرة على غزو الانسجة المتقرنة (الجلد والشعر) في الانسان والحيوانات لاحداث الاصابة الجلدي دعى Dermatophytosis والمعروفة لنا على انها التهابات حلقة الدودة. لعزل وتحديد الفطريات الجلدية من العينات السريرية ودراسة النشاط المضاد للفطريات antidermatophytic للمستخلصات قشور البصل (Allim cepa) . جمعت 60 عينة من مستشفى ابو قاطع ابي غريب، 22 عينات من مستشفى اليرموك و18 عينة من تلاميذ المدارس الابتدائية في ابو غريب على التوالي. وقد اجريت الدراسة خلال الفترة الممتدة من اكتوبر 2014 الى اذار 2015. باستخدام الفحص المجهري والزرع تشخيصت وجود فطريات جلدية لدى (90) مريض من اصل (100) مريضاﱟ فقط اي بنسبة (90%) ، وقد تبين ان 59 (59%)من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري والزرع . في حين عدد الحالات السالبة في الفحص الزرعي فكان 31 اي بنسبة (31%) حيث كانت انواع مختلفة ل Candida spp، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 10 (10%) حيث كانت اجناس فطرية اخرى مثال على ذلك Penicillium sp, Aspergillus niger . اظهرت الفحوصات المختبرية تباين الانواع الفطرية الجلدية المعزولة اذ ان اكثر الانواع الفطرية الجلدية المعزولة كان الفطر Trichophyton.mentoagrophytes ظهر في 27 عينة (45.7%) ,يليه الفطر Microsporum.canis ظهرفي 18 عينة (30.6%) , والفطر Trichophyton.rubrum كان في 9 عينات (15.25%) وبينما كان الفطر Trichophyton.verrucosum اقل الانواع الفطرية المعزولة وظهر في 5 عينات فقط وبنسبة (8.4%) . واظهرت النتائج تباين في نسبة الاصابة بين الذكور والاناث ، حيث سجلت اعداد ونسب المصابين بالامراض الفطرية تبعا للجنس. اذ سجل عدد الذكور 39 اصابة اي (66.1%) اما عدد الاناث فقد بلغ 20 اصابة اي (33.9%).تبين من خلال هذه نتائج هذه الدراسة ان الاصابات بالامراض الفطرية كانت اكثر تكرارا خلال الاشهر المعتدلة درجة الحرارة حيث لوحظ زيادة نسبة الاصابة في فصل الربيع والذي سجلت فيه اعلى نسبة للاصابة خلال شهر اذار (35%) ،شهر شباط (25%) ، شهر كانون الثاني (18%) ، شهر كانون الاول (12%) ، شهر تشرين الثاني (10%) على التوالي .هرت النتائج وجود علاقة ما بين الاصابة ومناطق سكن المرضى حيث بلغت نسبتها في المناطق الريفية (84%) مقارنة مع المناطق الحضرية التي بلغت (16%) ، كما اظهرت ان الفطريات الجلدية التي تنتقل عن طريق ملامسة الحيوانات اكثر تكرارا (84.4 %) من كانت الملامسة البشرو التي كانت اقل تكرارا (15.6 %).شخصت الفطريات الجلدية المعزولة بطريقة تفاعل سلسلة انزيم البلمرة PCR ،واظهرت النتائج تماثل في الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة وحيث قورن مواقع هذه الحزم مع موقع الحزم ذات الاوزان الجزيئية المعروفة العائدة للدليل الحجمي, حيث جاءت النتائج متماثلة للحجم المتوقع وهو 500bp (زوج قاعدة) كناتج لعملية تضاعف البادىء primerالمتخصص بالفطريات الجلدية لكل M. canis , mentogrophyt T. , T. vrrucosum . وقد تمت دراسة التاثير التثبيطي لكل من المستخلص المائي والكحولي (الحار والبارد ) لقشور ثمرة البصل ، كل على حدة في النمو القطري لمستعمرات الفطريات الجلدية والاكثر تكرارا حيث شملت الفطرين M. canis ,. mentogrophyt T . واظهرت نتائج استخدام المستخلصات النباتية لقشور ثمرة البصل ان ادنى التركيز المثبط للنمو من المستخلص المائي الحار هو (0.78)ملغم/مل للفطر T.mentogrphytes اما الادنى التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل، اما الفطر M .canis فان الادنى التركيز المثبط للنمو هو (0.78)ملغم/مل اما التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل . وللمستخلص المائي البارد فان ادنى التركيز المثبط للنمو هو (1.56)ملغم /مل للفطرT.mentogrphytes واما ادنى التركيز القاتل فقد كان (25) ملغم/مل. واما فطر M .canis فادنى التركيز المثبط للنمو هو (3.125) ملغم /مل والتركيز القاتل فقد كان (12.5) ملغم/مل. كما تبين ان لادنى التركيز المثبط من المستخلص الكحولي الحار والكحولي البارد لقشور البصل هو (0.78) ملغم/مل على النوعين الفطريات ، اما ادنى التركيز القاتل للمستخلص الكحولي الحار والبارد فهو(50) ملغم/مل بالنسبة للفطر M. canis ,. mentogrophyt T . | Dermatophytes are one a group of closely related fungi that have the capacity to invade the keratinized tiusse (skin and hair) of human and other animals to produce cutaneus infection called Dermatophytosis commouly referred to as ring worm infections . To isolate and identify the dermatophytes from clinical samples and to study the antidermatophytic activity of onion (Allim cepa ) extracts . 60 sample from Abu Graib Hospital , 22 samples from Yarmook Hospital and 18 sample from elementany school pupils Abu Graib regian were Collected respectively . The study was conducted during the period extended from oct , 2014 to Mary ,2015 . by microscopial examination and cultivation have been diagnosed with the presence of Dermatophyte at (90) patients only at a rate (90%), has been shown that 59 (59%) of the cases were positive Result by microscopic examination and cultivation. As the number of negative cases in the examination cultivation was 31 ( 31%), where the different genus for Candida sp, either the number of negative microscopic examination and cultivation is 10 cases (10%), where anther genus of fungi for example Penicillium, Aspergillus niger. When you identify the types of fungi, laboratory tests showed fungal species isolated skin variation، The most common fungi isolated were T.mentoagrophyt where the sample was 27 (45.7%), followed by M.canis where the 18 samples (30.6%) , was T.rubrum 9 samples (15.25%), and while The T.verrucosum was less fungal species isolated where , the number of isolated samples only 5 (8.4%).There were significant differences in Infection rate between males and females, were recorded prepare ratios infected with fungal diseases Accordingly sex, and as it was recorded that the number of males 39 (66.1%) The number of females has reached to 20 (33.9%) .It has been shown through this study that fungal diseases Infection were more frequent during of moderate temperature months of year ,observed increase in Infection of the during spring, which recorded the highest rate of infection during the month of March (35%), followed by injuries recorded in the month of February (25% ) then the month of January (18%) and the month of December (12%) and then the November (10%) respectively.about the relationship between infected with Housing areas, showing High incidence was recorded in rural regions (84%) in comparison with urban regions(16%). the study demonstrated a significant shift in the skin fungus that causes the disease towards animal species (84.4% ), while the human species less frequent (15.6%). Diagnosed skin fungi by (PCR) manner enzyme polymerase chain reaction, The results showed similar in molecular weight of packages multiplying and these sites packages as compared to with site with molecular weights known as belonging to the manual volumetric packages ,where the results were similar to the size of the expected site, a 500bp (pair base) as a product of the process started it doubled primer M. canis, T. mentogrophyt, T. vrrucosum.Has been studied the inhibitory effect of each of the aqueous and alcoholic extract (hot and cold) to peel the onion, Separately in growth of the colonies skin fungi isolated from injuries skin diseases, and the most frequent during this study, which included fungi Micrsporum canis , mentoagrophyt Trichophyton.And it showed the results of the use of plant extracts to peel onions that minimum inhibitory concentration(MIC) of the growth of the aqueous extract is (0.78) mg / ml for T.mentogrphytes The minimum Focus concentration (MFC) is 25 mg / ml, either MIC for M .canis is (0.78) mg / ml The MFC 25 mg / ml . To the water cold extract, MIC is (1.56) mg / ml of T.mentogrphytes MFC is 25 mg / ml. The M .canis MIC is (3.125) mg / ml MFC is (12.5) mg / ml.And the MIC of the hot alcoholic and cold alcoholic extract of onion peel is (0.78) mg / ml and the MFC is 50 mg / ml for both M. canis, T. mentogrophyt .

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية Dermatophytes ومقاومتها ببعض المستخلصات النباتية == Isolation and Identification of some Dermatophytes and its control by the plants extracts

Author name: محسن محمد فرج
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لغرض عزل وتشخيص الفطريات الجلدية المسببة لمرض داء السعفة التي تصيب الانسان ودراسة حساسيتها بواسطة المستخلصات النباتية للاغصان الفتية لنبات التين والحليب النباتيlatex,اذ تم جمع 100 نموذجا (قشطات جلدية ،شعر، اظافر) ماخوذة من مناطق مختلفة من الجسم ذكور واناث بفئات عمرية مختلفة من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية التابعة لمستشفى الامام علي() الذين شخصوا من قبل الطبيب المختص كحالات اصابة سريرية بالفطريات الجلدية للمدة ما بين تشرين الاول 2013 ولغاية حزيران 2014.تم فحص النماذج مختبريا بالفحص المجهري المباشر باستعمال هيدروكسيد البوتاسيوم KOH (%10) ثم زرعت النماذج على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ اظهر الفحص المجهري المباشر والزرع 52 مريض بنسبة (52%) من المجموع الكلي للاصابات من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري المباشر والزرع ، في حين كان عدد الحالات الموجبة بالفحص المجهري المباشر وسالبة بالزرع هو 41 مريض بنسبة (41%) ، وكان عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر وموجبة بالزرع هو 0 اصابه بنسبة (0%) ، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 7 اصابات وبنسبة (7%).اظهرت نتائج العزل والتشخيص ستة انواع من الفطريات الجلدية اذ سجل اعلى نسبة الفطر Trichophyton rubrum 33.33% ثم يليه في نفس المرتبة كل من Trichophyton schoenleinii وMicrosporum canis بنسبة20%)) لكل منهما ويليه Trichophyton tunsouransبنسبة 13.33%وكذالك احتلت كل من Trichophyton mentagrophytesو Trichophyton vercosum 6.66% . وبلغت اصابات الذكور46.67% اما اصابات الاناث فكانت 53.33% . واكثر فئة عمرية متاثرة بالاصابات الفطرية الجلدية هي سن العشر سنين اذ بلغت نسبة الاصابة 20% . وحول موسم انتشار هذه الاصابات الجلدية اذ تبين ان الاصابة اكثر تكرارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه النسبة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة خلال شهر نيسان وبنسبة (27 %) ، وادنى نسبة اصابة خلال شهر تشرين الاول وبنسبة (2%) . وفيما يخص مصادر الاصابة بالفطريات الجلدية وجد ان تربية الحيوانات المنزلية والحقلية هي الغالبة وبنسبة (% 33) ، يليه استعمال ادوات الاخرين بنسبة (% 23) وباقي الاصابات لم يوجد لديهم تماس مع الحيوانات ولا لبس الملابس المستعملة .ان المستخلص المائي البارد والكحولي البارد اعطى اعلى فعالية تثبيطية مقارنة بالمستخلص الكحولي الحار والمائي الحار .كما اظهرت الفطريات الجلدية فيما بينها فروق معنوية اذ اظهر الفطر M.canis حساسية اعلى للمستخلصات المختلفة يليه الفطر T.mentagrophytes. ثم الفطر T.rubrum. وقد اظهر المستخلص المائي البارد فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وان معـــدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز75mg/ml)) اما عند تركيز50mg/ml كانت نسبة التثبيط(,18 64.16 12.5,)% على التوالي لكل من الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها 12) , 3.3 4.1 ,) % على التوالي عند التركيز5mg/ml وعند التركيز 0.5mg/ml)) نسبة تثبيط, 0.8) 27.9 , % ( 3.3 .اما المستخلص الكحولي البارد فقد اظهر فاعلية تثبيطية للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وبمعدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز 75mg/ml)) وبنسبة تثبيط مقدارها(56.7,78.9,58)% على التوالي عند التركيز 30mg/ml,اما عند التركيز( 3mg/ml) فقد فكانت نسبة التثبيط (65.6,68.4,50) % على التوالي , ووصلت النسبة المئوية للتثبيط ,46.6) 52.6 , 57.4 ) % للتركيز 0.3mg/ml . اما المستخلص المائي الحار فكان اقل كفاءة ضد الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها( 22 , 2.6 , 30.3)% على التوالي عند التركيز (75mg/ml) ,اما عند التركيز 7.5mg/ml)) فقد بلغت نسبة التثبيط مقدارها3.22,0,3.1) )% على التوالي في حين بلغت بنسبة تثبيط مقدارها (12.2 , 0 , 19.3 ) % لجميع الفطريات عند التركيز. (0.75mg/ml )اما المستخلص الكحولي الحار فقد اظهر فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum عند التركيزmg/ml) 40) بلغت نسبة التثبيط (62.5,53,28) % على التوالي , وعند التركيز ml) (4mg/بلغت نسبة المئوية للتثبيط(24.6 , 51 , 44 )% وعند تركيز 0.4mg/ml) ) بلغت نسبة التثبيط (22.6 , 32.6 (43.4 ,%. وكذلك تم استعمال حليب التين كمستخلص للفطريات قيد الدراسة T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum بتركيز1.5mg/ml)) واثر هذا التركيز على نمو المستعمرات الفطرية وبنسبة تثبيط بلغت (28 , 29.16 , 12.5)% .اذ درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقاري الفلوكونازول وايتريكونازول في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrumوعلى التوالي وبتركيز (7.5mg/ml)للمضاد الفطري fluconazol وكانت بنسبة التثبيط (59.6 , 33.3 , 80.5)% بينما بلغت نسبة التثبيط لنفس المضاد بتركيز 15mg/ml)) (70 , 100 % (88.7, واستخدم ايضا المضاد Itraconazol بتركيز 5mg/ml)) للفطريات قيد الدراسة فبلغت بنسبة التثبيط للمستعمرات الفطرية (28.3 , 22.2 , 53)%. واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلصين المائي والكحولي الباردين لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر T.mentgrophytesفي الارانب. | This study was carried out to Isolate and Identify the Dermatophytes which infect human and control plants (Ficus carica) by using the extracts of the young branches of Fig . One hundred specimens (scale ,nail and hairs) have been taken from everybody were collected from outpatient visiting the Dermatology in Al - amamm ali alyehi Alsalam , which diagnosed as dermatophycosis infection during the period extended from November 2013 through September 2014 . On direct microscopically examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty two fungal isolates.(52%) were positive by direct microscopically examination and culture ,(41%) were positive by direct microscopically examination and negative in culture and (7%) were negative by culture and microscopical examination . The most common fungi isolated were Trichophyton rubrum(33.33 %) followed by Trichophyton schoenleini (20%)M.canis (20%) Trichophyton tunsourans 13.33% Trichophyton mentagrophytesو T.vercosum 6.66% There was recorded among male (46.67%) than female (54.43%) ,the higher percentage for fungal infection was recorded in the age ten years with percentage (20%). Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (27 % ) while the lowest rate was in February (2%). concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (33%) and using others instruments (23%).Young branch extract of the Fig plants ( Ficus carica ) were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and Fluconazol,Itraconazol were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Fig cold water and ethanol extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Microsporum canis was the highest sensitive compared to the other tested fungi.Cold aqueous extract showed of different inhibitory effect according to concentration and fungal test Tricophyton.rubrum,M.canis,Tricophyton.mentgrophytes with average diameters zero and 100% inhibition at concentration (75mg/ml).while concentration(50mg/ml)the inhibitory effect (33.2,64.16,12.5)% respectively for each fungi T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes with inhibition percentage(12,3.3,4.1)% respectively at concentration (5mg/ml),while inhibitory effect at(0.5mg/ml) concentration was (0.8,27.9,3.3)% Cold alcohol extract showed inhibitory effect of fungi T.rubrum,T.mentgrophytes,M.canis,and the average diameters of fungal colonies (zero)and(100)% inhibitory at (75mg/ml) concentration ,respectively at (30mg/ml) concentration ,as well as (3mg/ml) concentration appear inhibitory effect (50,68.4,65.6)% respectively ,and the percentage of inhibitory reach (45.6,52.6,57.4)% at(0.3mg/ml) concentration .Hot aqueous extract showed lowest efficiency against T.rubrum,M.canis. T.mentgrophytes, with in hibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (75mg/ml)concentration the inhibitory effect (3.1,0.1.2)% respectively ,as well as the inhibitory effect (12.2,0,19.3)% of all fungi at (0.75mg/ml)concentration.Hot alcohol extract showed lowest efficiency against (T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes),with inhibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (40mg/ml)concentration the inhibitory effect (62.5 ,53.6, 28)% respectively ,as well as the inhibitory effect (44, 51, 24.6)% of all fungi at (4mg/ml)concentration and the inhibitory effect (43.4,32.6,22.6)of all fungi at (0.4 mg/ml) According to these results the cold aqueous extracts of Fig plants have been diagnosed to examine their effectiveness (In vivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes infection in rabbets

دراسة اصطباغ المادة الوراثية للنطف وعلاقتها بعقم الرجال العراقيين == Study of Chromatin Staining of Sperms among Infertile Iraqi Men

Author name: ماجد حميد جعفر الدباغ
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف الدراسة الحالية الى تقييم سلامة المادة الوراثية للنطف لكل من الرجال السليمين والعقيمين وذلك من خلال استعمال الفحصين Acridine orange (AO.) وAniline blue (AB.) ، ومن ثم تقييم العلاقة بين متغيرات السائل المنوي مع كل من الفحصين السابقين اعلاه.تم فحص السائل المنوي ل (39) من الذكور السليمين ومتوسط اعمارهم (33.61± 5.23 ) سنة في حين كان عدد الذكور العقيمين الذين تم اجراء فحص السائل المنوي لهم هو(111 ) وكان متوسط اعمارهم ( 44.121 ± 6.708 ) سنة. كذلك اجري فحص (AO test ) لكل من الذكور السليمين والعقيمين من اجل معرفة سلامة المادة الوراثية للنطف. فيما بعد اجري فحص (AB test ) لكل من الرجال السليمين والعقيمين لقياس مدى تكثيف المادة الوراثية (Chromatin condensation ) التي تحصل اثناء تكوين الحيامن في الخصى والمهمة في المحافظة على سلامة المادة الوراثية. تم تقسيم المرضى العقيمين الى سبع مجاميع ، تتضمن مرضى قليلي النطف(oligozoospermia;O.) عددهم 12 ومرضى ذوي نطف قليلة العدد وشاذة(oligoteratozoospermia; OT.) عددهم 10 ومرضى يعانون من قلة عدد النطف وبطيئة الحركة وشاذة (oligoasthenoteratozoospermia; OAT.)عددهم 18 ومرضى يعانون من بطئ في حركة النطف(asthenozoospermia; A.) عددهم 6 ومرضى لديهم النطف بطيئة الحركة وشكل شاذ (asthenoteratozoospermia; AT.)عددهم 17 ومرضى نطفهم فقط شاذة الشكل(teratozoospermia; T.) عددهم 22 واخيرا مجموعة مرضى العقم غيرالمشخص وعددهم 26 . اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود فرق معنوي ( P< 0.05 ) بين الضرر في (DNA ) في نطف المرضى العقيمين مقارنة بالذكور السليمين باستعمال فحص (AO test )،في حين لم يسجل اي فرق معنوي بين مجموعتي الذكورالخصبين والعقيمين باستعمال فحص (AB test ). كذلك اظهرت نتائج الدراسة علاقة سالبة(r = - 0.575 ; P= 0.050), بين (AO test ) ومستويات الاس الهيدروجيني pH للسائل المنوي في مجموعة المرضى قليلي النطف(O) ، وكذلك ( r = - 0.500 ; P = 0.034) في مجموعة المرضى الذين يملكون نطف قليلة وبطيئة الحركة وشاذة المظهر(OAT). كذلك اظهرت مجموعة المرضى قليلي النطف علاقة سالبة ( r = - 0.634 ; P = 0.027)بين فحص (AO test) وكل من نشاط النطف (sperm activity) الصنف (A) وكذلك ظهرت علاقة سالبة ( r = - 0.684 ; P = 0.014) مع وقت التميع للسائل المنوي (semen liquefaction time). بالمقابل ظهرت علاقة سالبة قوية بين فحص ( AB test ) والنسبة المئوية لعدد النطف (r = - 0.840 ; P = 0.037) وكذلك مع النسبة المئوية للشكل المظهري الطبيعي للنطف( r = - 0.875 ; P = 0.022) في مجموعة المرضى ذوي نطف بطيئة الحركة . من ناحية اخرى النتائج اظهرت ان نسبة الضررفي المادة الوراثية لفحص (AO test ) كانت اكبر من نسبة فحص (AB test ). وبينما لوحظت علاقة موجبة بين الفحصين ( AO ,AB ) لاغلب مجاميع العقم السابقة فانه لم يسجل وجود فروق معنوية بين الفحصين (AO , AB ) لجميع مجاميع العقم. من النتائج التي ظهرت في هذه الدراسة نجد ان فحص السائل المنوي كان غير كافيا لتحديد خصوبة الرجل من عدمها بمعزل عن فحص المادة الوراثية والتي اظهرت كفاءتها في تحديد سلامة DNA النطف ، واخيرا فان الدراسة الحالية اظهرت ان فحص ( ( AO هو اكثر دقة من فحص (AB ) في التعرف على الضررالحاصل للمادة الوراثية. | The aim of this study was to evaluate the sperm DNA integrity for fertile men and infertile patients by using acridine orange (AO) test and aniline blue (AB) test, then to assess correlation between semen parameters with both AO test and AB test. Also to study the correlation between results of AO test and of AB test.Seminal fluid analysis was performed for thirty nine fertile men with average age (33.61 ± 5.23) years, and one hundred eleven infertile patients with average age (40.121 ± 6.708) years. The AO test was performed also for fertile and infertile men, then the chromatin condensation was measured by using AB test for fertile and infertile men. Infertile patients were divided into seven groups included Oligozoospermia (O.)=12, Oligoteratozoospermia (OT.)=10, Oligoasthenoteratozoospermia (OAT.)=18, Athenozoospermia (A.)=6, Asthenoteratozoospermia (AT.)=17, Teratozoospermia (T.)=22 and Unexplained infertility group=26. The results of the present study showed a significant (P< 0.05) difference in DNA fragmentation percent between fertile and infertile men by using AO test, but no significant difference (P>0.05) assessed by using AB test between both fertile and infertile men. Also a negative correlation was recorded between AO test and pH in oligozoospermia group (r = - 0.575; P= 0.050), and oligoasthenoteratozoospermia group ( r = - 0.500 ; P = 0.034). There was a good negative correlation assessed between AO test and grade (A) for sperm activity ( r = - 0.634 ; P = 0.027) , and liquefaction time ( r = - 0.684 ; P = 0.014) in oligozoospermia group. On the other hand, a strong negative correlation was noticed between AB test and sperm concentration (r = - 0.840 ; P = 0.037), and sperm morphology percentage ( r = - 0.875 ; P = 0.022) in asthenozoospermia group. Furthermore, results of DNA fragmentation percentage using AO test was higher than those using AB test with no significant difference. While there was a positive correlation between AO test and AB test in most of infertility groups, but no significant difference was assessed between the percentage of AO test and AB test in all infertility groups. From the results of this study, it was concluded that the seminal fluid analysis was not enough to obtain the fertility potential, and the sperm DNA integrity test was essential to detect DNA fragmentation in fertility clinics and laboratories. Both AO and AB test were easy and not expensive to perform for integrity test. Finally, AO test was more accurate test to detect abnormality of sperm DNA than AB test.

دراسة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل sativus Raphanus ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في الارانب == A Study the Protective Effect of Alcoholic Extract of Plant Raphanus Sativus (Radish) Seeds against the Oxidative Stress Induced by Sodium Nitrite on Liver and Kidney of Rabbits

Author name: لينا احمد عبد العزيز
Supervisor name: عالية حسين علي | مختار خميس محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى معرفة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم NaNO2على كبد وكلى ذكور الارانب. باستخدام كحول 70% لاستخلاص المركبات الفعالة من البذور. استخدمت في الدراسة الحالية 25 ارنب ذكر قسمت الى 5 مجاميع تضمنت كل مجموعة 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوم. المجموعةT1 : جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم, المجموعة : T2 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 50 ملغم/كغم, المجموعة : T3 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 100 ملغم/كغم, المجموعة : T4 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل وبجرعة 200 ملغم/كغم, بالاضافة الى المجموعة : C مجموعة السيطرة جرعت فمويا بجرعة من الماء المقطر مساوية لحجم الجرعة المعطاة لمجاميع المعالجة. اوضحت نتائج الدراسة الحالية في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم حصول ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد (AST, ALT ,(ALP,مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين, ناتج اكسدة الدهون) وانخفاض في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم والمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل 200,100,50 ملغم/كغم لوحظ حصول انخفاض في مستوى انزيمات الكبد (,AST, ALT ,(ALP مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين وناتج اكسدة الدهون) وحصول ارتفاع في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم فقط. بينت نتائج الفحص النسجي لكبد المجموعة المعاملة بنتريت الصوديوم توسع الجيبانيات الدموية, احتقان الاوعية الدموية, ارتشاح الخلايا الالتهابية, تنكس دهني ومائي, تنخر, زيادة اعداد الخلايا الكبدية ثنائية النواة, واظهرت النتائج النسجية لكلى المجموعة المعاملة بمادة نتريت الصوديوم انكماش الكبيبة, احتقان, ارتشاح الخلايا الالتهابية , نزف , تنكس , وذمة, تضخم. بينت نتائج الفحص النسجي لانسجة الكبد والكلى للمجموعة المعاملة بمستخلص البذور وجود حالة اصلاح لهذه الاعضاء. اعتمادا على نتائج الدراسة الحالية نستنتج ان المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة (50 و100 و200 ملغم/كغم) يمتلك فعالية مضادة للاجهاد التاكسدي المستحدث بمادة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في ذكور الارانب. | The aim of this study is to investigate the protective effect of Radish (Raphanus sativus) seeds alcoholic extract against oxidative stress induced by sodium nitrite NaNO2 on liver and kidney in male rabbits. By using 70% alcohol to extract active compound from seeds of R.S. Twenty five adult male rabbits were divided into five groups (five rabbits in each group) and treated daily for 30 days. Group T1 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 , Group T2 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 50 mg/kg of alcoholic extract, Group T3 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 100 mg/kg of alcoholic extract, Group T4 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 200 mg/kg of alcoholic extract from Raphanus sativus seeds as well as Group C : control intubated orally distilled water. Founded in rabbits intubated with NaNO2, that there was increasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), and oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and a decrease in the level of glutathione (GSH) comparing with control . In rabbits intubated with NaNO2 + 50,100,200 mg/kg of alcoholic extract found that there was decreasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and increasing in the level of GSH in comparison with rabbits intubated with NaNO2 only. The histological sections of liver which was treated with S.N. revealed dilation of blood sinusoids, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells, fatty and hydropic degeneration, necrosis and increase number of binucleated hepatocyte. Histological sections of kidney which was treated with S.N. presence of glomerular shrinkage, congestion, infiltration of inflammatory cells, haemorrhage, degeneration, edema, hypertrophy. Histological examination of liver and kidney tissue which was treated with seeds extract, revealed healing of these organs. In conclusion according to results obtained from this study that alcoholic extract of Raphanus sativus seeds in dose (50,100,200 mg/kg) have protective effect against oxidative stress induction by sodium nitrite on liver and kidney in male rabbits.

دراسة مناعية لمستضدات الدم وعلاقتها بسرطان الثدي القنوي في عينة من النساء العراقيات == Immunological study on blood antigens and their relationship with ductal breast cancer in a sample of Iraqi women.

Author name: ليث باسم علي الحسيني
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تكمن اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع الامراض السرطانية وقد اكدت الدراسات المتعلقة بسرطان الثدي على دور مجموعتي ABO وMNS ، اضافة الى ان مجموعة الدم Lewis تلعب دورا اساسيا كجزيئات مرتبطة بالسرطان Cancer associated molecules جمعت 100 عينة دم من مريضات سرطان الثدي القنوي Ductal breast carcinoma ومثلها لنساء صحيحات مقاربة بالعمر للمقارنة.اهتمت الدراسة في ايجاد تردد مجاميع الدم ABOو Lewis وMNS وLutheran للمريضات والصحيحات ،اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية وتكوين المعقدات المناعية في مريضات السرطان وعلاقة ذلك بمجاميع الدم المختلفة. نمطت مجاميع الدم المختلفة باستعمال كشف التلازن الدموي Hemagglutination test كما استعمل فحص انخفاض العيارية للمصل كمعيار لتكوين المعقدات المناعية اضافة لاستعمال تثبيط تكوين المعقدات المناعية بالمستضد الحر كدليل على انفتاح المعقدات المناعية. واستعمال كشف تثبيط التلازن لدراسة نوعية الاضداد المعنية في هذه الدراسة. اظهرت نتائج العينة المدروسة عدم وجود فروق معنوية لصنفي الدم O وA في المريضات مقارنة بالصحيحات, بينما كانت نسبة صنف الدمB منخفضة في المريضات حيث بلغت 10% مقارنة بنسبة 24% للصحيحات وكانت النتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.001) ، في حين ابدت مجموعة دم Lewis في المريضات ترددا مغايرا عن تلك التي في الصحيحات, فقد بلغ تردد مجموعة دم Le( a - b+) %40 عند المريضات مقارنة بنسبة تردد %55 في الصحيحات وكان التحليل الاحصائي مشير الى معنوية هذا الفرق p<0.05)) ،اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b - )فلم تعطي فرقا معنويا فكانت %29 في المريضات مقارنة بنسبة %31 للصحيحات ، كما اظهرت مجموعة دم Le (a - b - ) نسبة بلغت %23 في المريضات مقارنة بنسبة %10عند الصحيحات اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b+) فكانت 8%و4% في المريضات والصحيحات على التوالي وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.005). فيما يتعلق بدور المجموعة MNS فقد اتضح من الدراسة ان المجموعة MN كانت الاكثر ازديادا اذ بلغت نسبة ترددها في المريضات %77 مقارنة مع %57 في الصحيحات(p<0.001). اما نسبة تردد النمط الوراثي Lu(a - b - )لمجموعة الدمLutheran فقد كانت عالية اذ بلغت 31% في المريضات, و7% في الصحيحات(p<0.001), بينما كانت نسبة تردد النمط الوراثي Lu (a - b+) منخفضة في المريضات اذ كانت 65% بينما كانت 82% في الصحيحات(p<0.001).اظهرت نتائج العينة المدروسة استجابة مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSوLutheran حيث كانت مجموعتي الدم AوO اكثر المجاميع اعطائا لعيارية ضادة لمستضد او مستضدات كريات دم البقر فقد بلغت 2.9 ± 8.9 و0.9 ± 7.4 للمريضات على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 0.9 ±5.0 و0.7±6.5 لمجموعتي الدم AوO للصحيحات على التوالي .(P<0.05) اما مجموعة الدم Lewis فقد لوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Le(a - b+) كانت الاعلى اذ بلغت 8.5 ± 2.0 في المريضات و5.7 ± 0.7 في الصحيحات (P<0.05). وقد بلغ معدل عيارية النمط الوراثي MM 7.3±1.8 للمريضات مقارنة بعيارية 5.1±1.3 للصحيحات ( (P<0.05وكان الاعلى بين العيارية الموجبة للانماط الوراثية الاخرى لمجموعة الدم MNS. ولوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Lu(a - b+) الاعلى حيث بلغ 7.4 ± 1.2 في المريضات وكان معدل تلك العيارية 5.8 ± 0.7 في الصحيحات ( (P<0.01. سجلت نتائج العينة المدروسة تكون المعقدات المناعية Immune complexes في مصول مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSو Lutheran من خلال انخفاض في معايير الاضداد الضادة لكريات دم الابقار بعد تكوين المعقدات المناعية. ابدى 54 نموذجا للمريضات و37 نموذجا للصحيحات انخفاض في معايير الاضداد بعد تكوين المعقدات المناعية فقد كانت النسبة المئوية للمريضات المكونة للمعقدات 83.0% وكانت العيارية 7.1 ± 0.8 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات % 63.0بمعدل عيارية 5.5 ± 0.6 قبل تكوين المعقدات المناعية ((P<0.01، اما بعد تكوين المعقدات المناعية اصبحت النسبة المئوية للمريضات 65.1% بمعدل عيارية 2.9 ± 0.4 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات 58.7% بمعدل عيارية 3.0 ± 0.5 واشارت نتائج التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية بين النسبتين.تشير نتائج الدراسة الحالية الى ان هنالك ترابط بين وجود الجزيئات المسؤولة عن مجاميع الدم ووجود سرطان الثدي القنوي اذ حدد هذا الترابط اعتمادا على تلازم المرض مع المجموعة واختلافه في الصحيحات.اشارت نتائج الدراسة الحالية الى القابلية الكبيرة لمريضات سرطان الثدي القنوي على تكوين المعقدات المناعية وحددت بعض معالم نوعية الاضداد الداخلة في تلك المعقدات. سجلت هذه الدراسة ظاهرة انقلاب الصنف (من مجموعة الدم B الى AB) لاول مرة.تمت مناقشة نتائج الدراسة في ضوء النتائج المتوافرة في الابحاث العلمية ذات الصلة . | Blood groups antigens are important molecules their phenotypic expression are associated with various type of diseases as well as cancer, especially, Blood groups ABO, Lewis, MNS and Lutheran. The present study dealt with the frequency distribution of these molecules patients of ducted breast cancer and matched healthy Iraqi women. In addition the immune response toward red blood corpuscles antigen(s) and immune complexes formation were investigated.Different type of blood groups were typed by using direct hemagglutination tests, tube and Anti - human globulin test. The occurrence of immune complexes were detected using a lowered hemagglutinin titers befor and after incubating sera at room temperature and 4C. in addition, The specificity of immune complexed immunoglobulin was analyzed using free saliva antigens and hemagglutination inhibition.The results showed the followings.There no significant differences in the frequency distribution of A and O and blood groups in patient and healthy control, However Blood group B frequency was 10% in patient vs. 24% in controls (p<0,001) .On the other hand however Lea - b+ blood group approach a frequency of 40 % in patients vs 55% in controls (p<0.05).The difference of frequency of Lea+b - in patients and controls was not significant . Lea - b - Lewis blood group gave a frequency distribution of 23% in patients compared to 10% in controls (p<0.05) .In the MNSs blood group, The phenotype MN gave a highly significant frequency distribution 77% in patients vs 57% in controls (p<0.001) .In Lutheran blood group Lu a - b - showed a 31% frequency distribution in patients vs 7% in controls ( p<0.001). Various blood groups type patients demonstrated an elevated anti - bovine antibody immune response,Blood group A and O patient showed elevated mean titers .The titers in patients more 8.9±2.9 and 7.4±0.9 respectively compared to a controls mean atiters of 5±0.9 and 6.5 ±0.7 respectively . Among lewis blood groups ,the mean titer of Lea - b+ was the highest. It was8.5±2.0 in patients vs 5.7±0.7 in healthy controls (p<0.05). Likewise ,MM blood type gave a mean titer of 7.3±1.8 vs 5.1 ±1.3 in the controls (p<0.05) . The study provide the information of immune complexes (Ics) in patient and control sera . The percentage of sera giving immune complexes was 83% in patients vs 63% in controls. The respective titers after immune complexes formation were 7.1±0.8 in patients vs 5.5±0.6 in controls before (Ics) formation that rendered the titer to 2.9±0.4 in patients and 0.3±0.5 in controls after Ics formation . This study revealed a status of blood group B conversion to AB. In conclusion, the present study indicated that there were association between blood groups molecule and ductal breast cancer . The result are discussed bared on the available data on ductal breast cancer as related to blood groups molecule

تاثير مبيدي القوارض فوسفايد الزنك والراكومين في افراج الدجاج العراقي المحلي Gallus domesticus == The effects of Rodenticides Znic Phosphide and Racumin in a young Iraqi local chickens Gallus domesticus

Author name: لؤي عبد الامير ناجي العامري
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | حسين عبد المنعم داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة التعرف على تاثير مبيدي القوارضRodenticides فوسفايد الزنك Zinc Phosphide والراكومين Racumin في افراخ الدجاج العراقي المحليGallus domesticus بعد تعريضهم تجريبيا للمبيدين المذكورين ولعدم وجود دراسة مشابهة اخرى تتناول هذا الموضوع الحيوي، فقد درست اهم الجوانب التي تتعلق بتاثير هذين المبيدين على الافراخ، وشملت الدراسة المعايير التالية : 1. قياس الجرعة المميتة الوسطية Median Lethal Dose (LD50) بلغت قيمة الجرعة المميتة الوسطية (19.3) ملغم/كغم بالنسبة لمبيد فوسفايد الزنك مما يوضح السمية العالية لهذا المبيد، في حين بلغت قيمتها (309) ملغم/كغم بالنسبة لمبيد الراكومين وهذا يوضح السمية المعتدلة لهذا المبيد.2. التغيرات السلوكية Behavioural Changes لوحظ على الافراخ الخاضعة للتجربة تغيرات سلوكية ازدادت شدتها بزيادة فترة التعرض لمبيد فوسفايد الزنك وتمثلت باعراض الاعتلال العصبي والخمول Depression وانخفاض الشهيةAnorexia وانتفاخ الحوصلة فضلا عن الاسهال الاخضر اللونGreen diarrhea، في حين كانت اعراض التعرض المزمن لمبيد الراكومين هي نزف خارجي وداخلي رافقه اورام دموية Haematomus نتج عنها عرج Lameness او كبر حجم الراس او انتفاخ احد العينين وازرقاق Cyanosis المنطقة المحيطة بها واختلاجات عصبية Convulsions فضلا عن الاسهال الابيض اللون White diarrhea. 3. التغيرات المرضية العيانية Gross Pathological Changes تمثلت التغيرات المرضية العيانية بعد التعرض المزمن لمبيد فوسفايد الزنك في كل من الكبد والكلية باحتقان Congestion ونزف Hemorrhage وتغير لوني مع شحوب واضح في الحواف وزيادة نسبية في الحجم وانخفاض وزني ازداد معنويا بزيادة فترة التعرض فضلا عن انخفاض وزن الجسم العام، اما التعرض المزمن لمبيد الراكومين فاظهر ضمور Atrophy واصفرار Yellowish وانخفاض وزني معنوي شديد في كل من الكبد والكلية فضلا عن انخفاض وزن الجسم العام.4. الدراسة النسجية والنسجية المرضية Histological and Histopathological Study اوضح التعرض المزمن لمبيد فوسفايد الزنك في كل من الكبد والكلية حصول احتقان ونزف وزيادة سمك المحفظة وارتشاح وانتشار عدة بؤر للخلايا الالتهابية Infiltration and foci of inflammatory cells ترافق هذا مع تغيرات تنكسية Degeneration changes وتكاثر القنوات الصفراوية Proliferation of bile duct (بالنسبة للكبد) وبداية تليف Fibrosis ووجود واضح لحبيبات الهيموسدرين Hemosiderin granules فضلا عن انسلاخ Separation او اختفاء Disappearance جزئي او كامل للخلايا الظهارية المبطنة للنبيبات الكلوية وانكماش العديد من الكبيبات Shrinkage of glomeruli مسببة توسع الحيز المحفظي Enalrgement of capsular space، اما التعرض المزمن لمبيد الراكومين فاظهر حالة نقص الاوكسجين Hypoxia في كل من الكبد والكلية مسببة موت وتدمير واسع للخلايا مع فقدان البنية الخلوية Loss of cytoarchitecture (بالنسبة للكبد) فضلا عن اختفاء الخلايا الظهارية المبطنة للعديد من النبيبات مع غشائها القاعدي احيانا او وجودها بشكل ركام تالف ضمن تجويف نبيب الكلية وانكماش العديد من الكبيبات او اختفائها التام وبالتالي توسع الحيز المحفظي. | The present study aimed to examine the effects of two rodenticides; highly toxic Zinc Phosphide and moderately toxic Racumin in young Iraqi local chickens Gallus domesticus. Therefore the study was involved the following parameters with their results : I. Median Lethal Dose (LD50) The (LD50) value for Zinc Phosphide was (19.3) mg/kg, whereas for Racumin was (309) mg/kg. The results revealed that Zinc Phosphide was highly toxic rodenticide while the Racumin was moderately toxic rodenticide.II. Behavioural Changes The behavioural changes mainfested by young chickens were treated with Zinc Phosphide for two successive periods (45 & 75) days indicated that the intensity of abnormal behaviour increases with the progressive time. The symptoms were nerves breakdown, depression, anorexia, crop swelling, in addition to a green diarrhea. The symptoms of prolong exposure (35) day to Racumin were characterized by hemorrhage, haematomus that result in lameness or head enlargement or swelling of one of the eyes with cyanosis in the area around. Moreover there was some periodical convulsions with white diarrhea.III. Gross Pathological Changes The gross pathological changes after prolonged exposure to Zinc Phosphide in young chickens represented by congestion, hemorrhage, color changes with margins pale and increasing of the size of both the liver and kidney. The weight of two organs was reduced beside to decrease the total body weight. While the gross pathological changes after prolonged exposure to Racumin were characterized by atrophy, yellowish beside to decrease the weight of liver, kidney and total body weight.IV. Histological and Histopathological Study The histological study revealed some histopathological changes in the liver and kidney. These were represented by congestion, hemorrhage, increasing in the thickness of capsule, infiltration and spreading of many foci of inflammatory cells, degeneration changes, proliferation of bile ducts (to liver), fibrosis, appearance hemosiderin granules beside to separation or partial disappearance of lining epithelial cells of the renal tubules and shrinkage of many glomeruli cause to increase the capsular space. Regarding the prolong exposure of young chickens to Racumin resulted in a hypoxia of both the liver and kidney cause to death and destruction of many cells, loss of cytoarchitecture (to liver), disappearance of the lining epithelial cells of the renal tubules sometimes with basement membrane and shrinkage of many glomeruli or disappearance it cause to increase the capsular space.

تقييم بعض المؤشرات الفسلجية والوراثية عند النساء العراقيات المصابات بمتلازمة تكيس المبايض == Assessment of physiological and genetic markers in some Iraqi women with polycystic ovarian syndrome

Author name: لـنا نزار عبد الرزاق
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | رياض محمد المشاط
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تدرج متلازمة تكيس المبايض ضمن اضطرابات الغدد الصماء المعقدة والاكثر شيوعا التي تؤثر على النساء في سن الانجاب والتي تتميز بالعقم ,الشعرانية, ونمو الحويصلات الغير طبيعي ,وزيادة انتاج الاندروجين من المبيض.اشتملت الدراسة على جزاين .ضم الجزء الاول دراسة الخصائص السريرية والهرمونية والبايوكيمائية في حين ضم الجزء الثاني دراسة التغايرات الوراثية للجينات ذات الصلة بمتلازمة تكيس المبايض .تم جمع عينات الدم من 50 امراة عراقية مشخصة بمتلازمة تكيس المبايض (تراوحت اعمارهن 18 - 40سنة) و25 امراة سليمة من مستشفى كمال السامرائي / بغداد للفترة المحصورة بين شهر ايلول ولغاية كانون الاول - 2013. قسمت النساء المشخصات كمرضى بمتلازمة تكيس المبايض الى مجموعتين وفقا للانماط الظاهرية المختلفة من متلازمة تكيس المبايض على النحو التالي : 1. 25 نمط ظاهري شديد2. 25 نمط ظاهري معتدلواظهرت النتائج وجود فروق معنوية في الاعراض السريرية للنمط الظاهري الشديد لمتلازمة تكيس المبايض مقارنة مع النمط الظاهري المعتدل وعينات السيطرة، كاضطراب الدورة الشهرية ( قلة الطمث 24% وندرة الطمث (76%، وكانت الشعرانية موجودة بنسبة84 ٪ والسمنة المفرطة حيث كانت قيمة مؤشر كتلة الجسم (BMI ≥ 35kg/m2) 36٪, في حين لم تكن هناك فروق ذات دلالة احصائية (P> 0.05) لكل من حب الشباب، الشواك الاسود وزواج الاقارب.كما واظهرت النتائج وجود ارتفاع ملحوظ في مستويات الهرمون المحرض للاباضة LH، نسبة الهرمون المحرض للاباضة/ الهرمون المحفز للحويصلات LH / FSH والهرمون الذكري (Testesterone) ايضا في النمط الظاهري الشديد من متلازمة تكيس المبايض اعلى بكثير مقارنة مع النمط الظاهري المعتدل والنساء السليمات في حين كان الارتفاع بنسب اقل لمستوى الهرمونات في النمط الظاهري المعتدل من متلازمة تكيس المبايض مقارنة بمجموعة النساء السليمات, في حين لم تظهر فروق معنوية لمستويات كل من الهرمون المحفز للحويصلات FSH وهرمون الحليب PRL والهرمون المحفز للغدة الدرقية TSH بين مجموعتي المرضى ومجموعة السيطرة.اظهر قياس مستويات الكولسترول ,الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة (LDL) والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا (VLDL) في النمط الظاهري الشديد والمعتدل من متلازمة تكيس المبايض ارتفاعا معنويا مقارنة بالنساء السليمات، في حين كانت نسب البروتين الدهني عالي الكثافة (HDL) مرتفعة في النساء السليمات مقارنة مع النمطين الظاهريين المختلفين من متلازمة تكيس المبايض.في الجزء الثاني من الدراسة، تم استخدام PCR - RFLP وتحليل التتابع المباشر للكشف عن العلاقة بين اثنين من الجينات التي يعتقد لها صلة بمتلازمة تكيس المبايضLHR) وCYP3A5 على التوالي) فقد تم دراسة احدى الطفرات الجديدة(rs6199631) والتي تقع في الاكسون الاخير من جين LHRباستخدام تقنية PCR - RFLP واظهرت النتائج عدم وجود اختلافات ذات فوارق معنوية بين مجموعة المرضى والنساء السليمات حيث ساد النمط الوراثي الخالي من الطفرة وهذا قد يؤكد ثبات هذا التتابع لدى النساء في المجتمع العراقي, في حين اظهرت نتائج تحليل التتابع المباشر وجود طفرة جديدة في الموقع 12084ضمن الانترون الثالث من الجينCYP3A5 وبتردد عالي (%53.3) في النمط الظاهري الشديد في حين كانت ذات تردد منخفض في النمط الظاهري المعتدل (8.3%) ولم يكشف عن وجودها في النساء السليمات.واخيرا بينت الدراسة ان النساء المشخصات بمتلازمة تكيس المبايض تقترن باضطراب هرموني وخلل في استقلاب الدهون كما ويكون للعوامل الجينية تاثير على الاصابة بالمرض. | Polycystic ovary syndrome (PCOS) is the most common, complex, endocrine disorder affecting women in their reproductive years, and is characterized by infertility, hirsutism, abnormal follicular development, and increased ovarian androgen production. The present study was carried out in two parts. The first part comprises clinical, hormonal, and biochemical characteristics and the second part is based on molecular genetic alterations associated with those PCOS.Blood samples of 50 Iraqi women with polycystic ovary syndrome (age ranged 18 - 40 years) and 25 healthy women were collected from Kamal Al - Samarrai Hospital/ Baghdad. Samples were collected from September 2013to December, 2013. Then, the women who have PCOS were divided into 2 groups according to the different phenotypes of polycystic ovary syndrome as follows : 1.25 Severe phenotype.2.25 Mild phenotype.The results showed big differences of the clinical features in severe phenotype of PCOS compared to the mild phenotype and control, such as menstrual cycle problems (oligomenorrhea and amenorrhea) were seen in 24% and 76% respectively , hirsutism was present in 84% and severe obesity (BMI ≥35kg/m2) was found in 36%. There was no significant differences (P>0.05) in two different phenotypes of PCOS (severe and mild) compared to control women for acne, acanthosis nigricans and inter - family marriages.The mean serum LH levels, LH/FSH ratio and also testosterone in severe phenotype of PCOS were significantly higher when compared to mild phenotype and control women. Slightly rising of that hormones levels were noticed to be in mild phenotype of PCOS than that of control group. No significant differences have been noticed in the mean level of FSH, PRL and TSH among the two patient groups and the controls. Cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein (LDL) and very low density lipoprotein (VLDL) levels in severe and mild phenotype of PCOS women were higher when compared to control women, while high density lipoprotein (HDL) in control women were high compared to two different phenotypes of PCOS. In second part of the study, polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and direct sequencing were used to detect the relationship of the two gene candidate (luteinizing hormone receptor (LHR) and CYP3A5 respectively) and PCOS risk. The new SNP rs61996318 on LHR shows no significant differences between patients and control group, which indicate the highly conservative sequence in Iraqi women. A new SNP locate at 12084 within the third intron of the CYP3A5 gene was detected in high frequency (53.3%) in severe phenotype PCOS whereas it found in low frequency in mild phenotype (8.3%) and absent in control group. Finally, the results demonstrate hormonal disorder, lipid disturbance and genetic defect in polycystic ovarian syndrome (PCOS) female.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية == Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

Author name: لمياء علي حسين
Supervisor name: وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

Author name: لمى يوسف مهدي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

Author name: لمى قاسم علي الطائي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة تاثير مستخلصات نباتي البربين Portulaca oleracea والاشنان Seidlitzia rosmarinus على بكتريا Escherichia coli ، Staphylococcus aureus وخميرة Candida albicans المعزولة من المصابين باخماج المجاري البولية == Study the effect of Portulaca oleracea and Seidlitzia rosmarinus extracts on Escherichia coli ,Staphylococcus aureus and Candida albicans that isolated from urinary tract infection patients

Author name: لقاء جميل ابراهيم الجنابي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي البربينportulaca oleracea والاشنان Seidlitzia rosmarinus في نمو البكتريا Staphylococcus aureus وEsherichia coli وخميرة Candida albicans المعزولة من المصابين باخماج المجاري البولية،وذلك باستخدام طريقة الحفر بالاكار لاختبار فعالية المستخلصات ضد البكتريا والخميرة ، ولقد اختلفت نتائج دراسة الفعالية التثبيطية للمستخلصات باختلاف نوع المستخلص نفسه وتركيزه ، ونوع الكائن المجهري. وكانت بكتريا Staph. aureus الموجبة لصبغة كرام اكثرها تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع E. coli السالبة لصبغة كرام ومع خميرة C. albicans . تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل المستخلصات ، وقد بينت نتائج الكشوفات الكيميائية لها ان المستخلص المائي الحار والبارد لنبات البربين يحتوي على قلويدات,تربينات , تانينات , فلافونات وصابونيات. بينما احتوى المستخلص الكحولي البارد والحارعلى قلويدات، تربينات ، تانينات، فلافونات، راتنجات، صابونيات وكومارينات وبلاضافة الى ذلك يحتوي المستخلص الكحولي الحار على الزيوت الطيارة. اظهرت النتائج احتواء المستخلص المائي البارد والحار لنبات الاشنان على القلويدات , فينولات, كلايكوسيدات, تانينات, فلافونات وصابونيات ويحتوي المستخلص المائي البارد بالاضافة الى ما ذكر على التربينات والراتنجات. اما المستخلص الكحولي البارد والحار لنبات الاشنان فيحتوي على فينولات , كلايكوسيدات , تانينات , فلافونات , راتنجات، كومارينات والزيوت الطيارة، ويحتوي المستخلص الكحولي البارد بالاضافة الى ما ذكر على الصابونيات ، والكحولي الحار على القلويدات. وقد قيس pH المستخلصات جميعها وكانت النتائج كالاتي : لنبات البربين المائي الحار 6.6 ، المائي البارد 6.8 ، الكحولي الحار 4.8 والكحولي البارد 5.1. اما لنبات الاشنان فكانت المائي الحار 6.1 ، المائي البارد 6.1 ، الكحولي الحار 4.4 والكحولي البارد 5.4 . بالنسبة الى مستخلصات نبات البربين فقد كان المستخلص الكحولي الحار هو الافضل معنويا بتاثيره في البكتريا والخميرة مقارنة بالمستخلص الكحولي البارد والمستخلص المائي البارد والحار عندما بلغ قطر منطقة التثبيط (17.33)ملم عند عند التركيز 1000ملغم/مل مقارنة ب (13.44 ، 5.44 ، 16.11) للمستخلص المائي البارد والحار والمستخلص الكحولي البارد على التوالي عند التركيز نفسه. وعند مقارنة تاثير التراكيز المختلفة لمستخلص نبات البربين في Staph. aureus اتضح عدم وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية(0.05) للتراكيز (100,800,600) ملغم/مل في تاثيرها على العزلات،فكان التركيز600 ملغم/مل هو اعلى تركيز مثبط للعزلات المختبرة.اما E.coli, C. albicans كان التركيز 1000 ملغم/مل اعلى تركيز مثبط لهما، وكانت بكتريا Staph.aureus الاكثر حساسية لفعل جميع مستخلصات نبات البربين وفي جميع التراكيز المدروسة. اما بالنسبة الى مستخلصات نبات الاشنان فقد كان المستخلص الكحولي الحار هو ايضا الاكثر تاثيرا معنويا في البكتريا والخميرة مقارنة بالمستخلصات الاخرى وفي التراكيز المدروسة جميعها اذ سجل 12.66 ملم في التركيز1000 ملغم/مل. وعند مقارنة تاثير التراكيز المختلفة لمستخلصات نبات الاشنان في albicans ,E.coli , Staph.aureus. C تبين ان التركيز 1000 ملغم/مل لايفرق معنويا عن التركيز 800 ملغم/مل فبذلك يكون التركيز 800ملغم/مل هو اعلى تركيز مثبط للعزلات المختبرة،وكانت بكتريا Staph.aureus الاكثر حساسية لفعل جميع مستخلصات نبات الاشنان وفي جميع التراكيز المدروسة. عند اجراء مقارنة احصائية بين نتائج نباتي البربين والاشنان وجد ان نبات البربين هو الاكثر فعالية في تثبيط العزلات المدروسة،وبينت النتائج ان المستخلص المائي الحار والكحولي الحار لايفرقان معنويا عن بعض للنباتين،وكذلك معدلات اقطار التثبيط للتركيز 200 ملغم/مل لايوجد بينهما فروق معنوية للنباتين،وفعالية النباتين في تثبيط خميرة albicans C. كانت غير معنوية. | This study was done to find the effect of water and alcoholic extracts of Portulaca oleracea and Seidlitza rosmarinus on the growth of Staphylococcus aureus , E. coli and Candida albicans , which isolated from patients suffering from Urinary Tract Infections , by using .well diffusion method. To examin the effect of the plant extracts against bacteria and yeast.The results were different according to type , concentration of plant extracts and type of microorganism.The gram positive Staph.aureus was the most sensitive bacteria for plant extracts in comparison with E.coli and C.albicans.The results of chemical test of the active compounds showed that the hot and cold water extracts of P.oleracea contained , alkaloides , terpens, tannins , flavonoids and saponins , while the hot and cold alcoholic extract contain , alkaloids , terpens , tannins , flavonoids , resins, saponins and coumarins with volatile oils in hot alcoholic extracts.The results of cold and hot water extracts of S.rosmarinus showed the extract contained , alkaloida , glycosides , tannins , flavonides , saponins and phenols. In addition to that the cold water extract contained terpens and resins. The cold and hot alcoholic extracts of S.rosmarinus contained , phenols , glycosides , tannins , flavonoides , resins , coumarins and volatile oils , in addition the cold alcoholic extract contained saponins; while the hot alcoholic contained alkaloids. The pH of the all extracts were measured and the results were as followed : - The hot water extract of P.oleracea 6.6 , cold water extract 6.8 , hot alcoholic extract was 4.8 and cold alcoholic extract was 5.1 . The cold water extract of S.rosmarinus was 6.6 , cold water extract was 6.1 ,hot alcoholic extract 4.4 and cold alcoholic 5.4 . Antimicrobial effect of hot alcoholic extract of P.oleracea was more effective against bacteria and yeast than cold and hot water extracts and cold alcoholic extracts . When the inhibition zone diameter reached 17.33 mm at concentration 1000 mg /ml of hot alcoholic extract , while the inhibition zone diameter was (13.44 , 5.44 , and 16.11 ) mm for cold and hot water extract and cold alcoholic extract respectively at the same concentration . In the comparison with the effect of different concentrations for P.oleracea extract against S. aureus there is no significant difference at (p< 0.05) for the concentrations (600 , 800 , 1000) mg/ml on it’s effect of the tested microorganisms . The 600 mg/ml concentration was the highest one in its inhibition of tested microorganisms . The 1000 mg/ml concentration was the highest inhibitor for C.albicans and E.coli . S.aureus was the most sensetive microorganism for all extracts effects of S.rosmarinus in different concentrations.On the other hand the hot alcoholic extract of S.rosmarinus was the most significant effects in bacteria and yeast . In comparison with the other extracts in all studied concentrations , which have been recorded 12.66 mm in the 1000 mg/ml.In the study of the effect of different concentrations of S.rosmarinus extract , S.aureus , E.coli and C.albicans , it seemed that there is no significant difference between 1000 mg/ml and 800 mg/ml . So the 800 mg/ml concentration was the highest inhibitor for tested microorganisms . S.aureus was the most sensitive for all S.rosmarinus extractions in all studied concentrations.Statistical comparison were done between the results of P.oleracea and S.rosmarinus showed that P.oleracea was the highest effect of inhibition of studied microorganisms , and the results showed non significant difference between hot water and hot alcoholic extracts for the tow plants , also there is no significant difference between these plants on the inhibition zone diameter 200 mg/ml.And the inhibition effect of the two plants not significant on C.albicans

دراسة مناعية ومايكروبايولوجية لمرضى الربو == IMMUNOLOGICAL AND MICROBIOLOGICAL STUDY FOR ASTHMATIC PATIENTS

Author name: كريم شحل جياد الطائي
Supervisor name: كريم شحل جياد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الربو اضطرابا التهابيا مزمنا في المسالك الهوائية وانه مرض متعدد الاسباب تلعب المحفزات غير الارجية اضافة للعوامل الارجية دورا فيه . ان الدراسة الحالية تمحورت بشكل اساسي حول الربو الارجي (Allergic asthma) والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1 - من اجل البحث في العلاقة بين الابواغ الفطرية المحمولة في الهواء والمظاهر السريرية لمرضى الربو العراقيين فقد اجريت دراسة كمية ونوعية للفطريات داخل وخارج المنازل (Indoor and Outdoor) باستخدام طريقة الاطباق المفتوحة وذلك خلال الفترة من كانون الثاني 2001 لغاية كانون الاول 2002. اظهرت النتائج ان كثافة الابواغ الفطرية تتباين تبعا للمواسم والظروف المناخية وان شيوع هذه الفطريات كان داخل وخارج المنازل وفق التسلسل التالي : Aspergillus nigar , Penicillium , Aspergillus flavous , Caldosporium Alternaria . اجريت تقيما لدور هذه الفطريات في حث امراض الارجية لدى 116 من مرضى الربو 50 من الاناث و66 من الذكور تراوحت اعمارهم بين 70 - 5 سنة وكذلك 45 فردا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة وذلك باستخدام اختبار وخز الجلد (Skin prick test) ، وقد ابدى غالبية المرضى فعالية جلدية لخلاصة خليط الفطريات MM1 وMM2 وMM3 وMM4 وMM5 كما لوحظت علاقة ايجابية بين وجود هذه الفطريات داخل وخارج منازل مرضى الربو وبين مدى استجابتهم اليها . تبين من خلال قياس مستوى الضد IgE النوعي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) ان اضداد الفطريات Penicillium ، Aspergillus ، Alternaria كانت الاكثر تكرارا 2 - من اجل الغاء المزيد من الضوء حول دور الاخماج البكتيرية والتي من شانها ان تفاقم نوبات الربو ، فقد اجريت عملية زرع القشع لـ 68 مريضا من مرضى الربو تم خلالها عزل 6 انواع من البكتريا كانت Strepto pneumoniae اكثرها تكرارا (%35.2) تليها بكتريا Staph aureus بنسبة (%30.9) وبكتريا H. influenza بنسبة (%7.3) واخيرا بكتريا Strepto pyogenes وStaph epidermidis وN. cattarrhalis وبنسبة (%4.4) لكل منهما. عزلت (9) عزلات من خميرة C. albicans من اولئك المرضى والذين ابدوا تفاعلات جلدية موجبة باستخدام خلاصات هذه الخميرة . ومن خلال اجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية للعزلات ابدت غالبية تلك العزلات حساسية عالية لمضادات Ciprofloxacin وAugmentin وCefatoxime كما ابدت العديد منها مقاومة لمضادات Ampicillin وCloxacillin وTetracycline وErythromycin .3 - ولالقاء الضوء على الحالة المناعية لمرضى الربو تم تحديد مستويات الاضداد IgA وIgG وIgM واجزاء المتمم C3 وC4 في امصالهم باستخدام طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (Single Radial Immunodiffusion=SRID) ومستويات الضد IgE الكلي بتقنية ELISA تبين من خلالها ، بان متوسط مستويات الضد IgG والضد IgA قد انخفضت معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة مع مجموعة السيطرة وان متوسط مستوى جزء المتمم C3 قد ارتفع معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة بمستواه لدى افراد السيطرة في الوقت الذي لم يحصل تغير جوهري في مستويات الضد IgM والجزء C4 من مكونات المتمم من جراء الاصابة بالربو. فيما يتعلق بتقدير مستويات الضد IgE الكلي فقد اظهرت النتائج ان هنالك ارتفاعا معنويا في مستويات هذا الضد لدى مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة وان هنالك اختلافا معنويا في مستوياته بين كلا الجنسين من مرضى الربو. اوضحت الدراسة كذلك ان هنالك فروقا في تفاعل التلازن الخاص بالبروتين الفعال - C والذي كان اكثر ايجابية لدى مرضى الربو وعلى الاخص منهم اولئك الذين يرافق اصابتهم بالربو الخمج البكتيري ومنها Strepto. pneumoniae بشكل خاص . تبين من خلال العد التفريقي لخلايا الدم البيض ان هنالك ارتفاعا معنويا في اعداد خلايا الدم الحمضة في مرضى الربو بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . ومن ناحية اخرى فقد لوحظت علاقة معنوية بين الارتفاع في اعداد هذه الخلايا ولارتفاع في مستويات الضد IgE وكذلك مع فعالية الجلد التي يبديها مرضى الربو. تم تقدير الفعالية الحجمية لانزيم (ADA) في امصال مرضى الربو باستخدام الطريقة الانزيمية ، لوحظ من خلالها ارتفاعا معنويا في فعاليته لدى هؤلاء المرضى وعلى الاخص لدى الاناث مقارنة بالذكور .4 - باستخدام تقنية الامتصاص الذري اللهبي لتحديد مستويات العناصر Fe وZn وCu وتقنية الامتصاص الذري اللالهبي لتحديد مستويات Se وMg هذا وقد لوحظت ان هنالك انخفاضا في مستويات العناصر Fe وCu وMg وSe وارتفاعا معنويا في مستوى عنصر Zn في امصال مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة | Asthma is a chronic inflammatory disorder of the airways. Its aetiology is multifactorial , in which non - allergic triggers and allergic factors have role to play. The present study is concerned mainly with allergic asthma, and the results can be summarized as the following : 1 - To investigate the relationship between air spora and the clinical expression of asthma in Iraqi patients, a quantitative and qualitative study of indoor and outdoor airborn fungi was carried out during the period January 2001 - December 2002 . The results revealed that the spore density depends on seasonal and climatic changes. The common observed genera, arranged according to their density, were/Aspergillus nigar, Penicillium, Aspergillus flavous, Alternaria, and Cladosporium . The role of the majority of such fungi in induction of allergy was evaluated in 116 asthmatic patients (66 males and 50 females) with an age range 5 - 70 years, in addition to 45 apparently healthy individuals as a control group, by using skin prick test. The highest proportion of those patients (89.7%) showed skin reactivity to the allergen HDM , followed by MMI (75.0%), HD (63.8%), MM2 (48.3%), MM3 (19.8%) and MM5 (16.8%) . Also a positive correlation was observed between the occurrence of these fungi (inside and outside the houses of those patients) and their responsiveness . Measuring serum specific IgE using ELISA technique revealed that the most frequent specific IgE was for Penicillium , Aspergillus and Alternaria. 2 - To provide further insight about the role of bacterial infection that deteriorate asthma attack, sputum cultures were done for 68 patients with asthma . Six bacterial species were isolated, in which Strepto. pneumoniae showed the highest percentage (35.2%), followed by Staph. aureus (30.9%), H. influenza (7.3%), Strepto. pyogenes, staph. epidermidis and N. cattarnhalis (4.4%) for each. Also, nine isolates of Candida albicans were isolated from those patients, to which a skin test response was highly positive among them. Antibiotic sensitivity was done for the bacterial isolates. The majority of those isolates revealed high sensitivity to the antibiotics ciprofloxacin, augmentin and cefatoxime, while, they were resistant to ampicillin, cloxacillin, tetracycline, and erythromycin. 3 - To shed some light on the immune status of patients with asthma the total level of serum immunoglobulins (IgA, IgG, and IgM) and complement components (C3 and C4) were evaluated by using single Radial Immunodiffusion assay (SRID). Serum level of total IgE was also evaluated, but by ELISA technique. The results showed that the mean serum levels of IgG and IgA were significantly decreased in patients with asthma as compared to controls while C3 level showed a significant increase. However, the mean serum level of IgM and C4 showed no much deviation due to asthma. With ranged to the evaluation of total IgE level, the result revealed a significant elevation in the level of this immunoglobulin in sera of patients in comparison to healthy individually. Additionally a significant difference in the levels of total IgE was augmented between both sexes of patients. There was some differences in the degree of positive its of agglutination reaction for the factor C.R.P., such reaction was more positive in patients with asthma, especially those with bacterial infections with special regard to Strepto. pneumonia. Differential count of while blood cells illustrated that eosinophils were significantly higher in patients with asthma compared to the control group . On the other hand a significant correlation was noted between the elevation of eosinophil count and the elevated level of IgE antibody and skin reactivity of asthmatic patients. Volume activity of adenosine deaminase enzyme in serum of asthmatic patients revealed a significant increased activity in the patients especially the females compared to males.4 - Trace elements (Fe, Cu, and Zn) assessment was carried out by flame atomic absorption and the more sensitive flameless atomic absorption (Se and Mg) . A significant decrease in Fe, Cu, Se ad Mg, and a significant increase in Zn were clearly observed in asthmatic patients as compared with control group.

دراسة مناعية وبكتريولوجية لمرض روماتزم المفاصل الرثياني لدى النساء الكرديات == Immunological and Bacteriological Study of Rheumatoid Arthritis in Kurdish Women

Author name: فيان محمد صالح
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية اذ اكدت الدراسات على دور مجموعتي الدم ABO وLewis في هذه الامراض ، وبما ان مجموعة الدم Lewis تلعب دورا اساسيا في الالتصاق الخلوي Cell adhesion فقد ركزت الدراسة الحالية في جانب تنميط مجاميع الدم على مدى تكرار هذه المجاميع في مريضات التهاب المفاصل الرثياني مقارنة بالسليمات ، اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في المريضات وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع الدم المختلفة . كانت عينات المريضات 50 عينة ومثلها للسليمات للمقارنة ،تم تقصي انماط مجموعة الدم ABO وانماط مجموعة الدم Lewis. اظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي في نسب مجموعة الدم ABO في المريضات مقارنة بالسليمات اذ كانت النتائج غير معنوية ، في حين ابدت مجموعة دم Lewis في المريضات تكرارا مغايرا مقارنة بالسليمات فقد ازداد تكرار مجموعة دم Le( a+ b - ) عند المريضات حيث بلغ (%56) مقارنة بنسبة تكرار (%14) في السليمات (X2=38.77,P=4.77×10 - 10)،في حين كانت مجموعة دم Le (a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها الى (%8) في المريضات مقارنة بنسبة تكرار السليمات (%70) (X2=80.8,P=2.5×10 - 19)، ان الارتفاع في نسب مجموعتي الدم Le (a+ b - ) وLe (a+b+)كان له علاقة بحالة الافراز وعدمها لدى المريضات.اما ما يخص الدراسات المصلية فقد كانت نتائج فحص تلازن اللاتكس RF وبروتين سي الفعال ومعدل ترسيب كريات الدم الحمركلها ايجابية مع الاختلاف في النسب بين المريضات ، اما الفحوصات المناعية فقد اشارت النتائج بالنسبة لاختبار التحري عن وجود المستضد (H) في لعاب المريضات والسليمات ذوات صنف دم لويس Le.a الى وجود هذا المستضد في صنف الدم هذا حيث كانت نسبة امتلاك هذا المستضد عند المريضات 58% والسليمات 50% , وايضا اجري اختبار لتحديد مستوى المستضد (H) في لعاب المريضات والسليمات من صنف دم لويس Le.b وLe.a+b+ اذ بينت النتائج الى قلة منسوب النتاج الجينيﻟ (Se.gene) لديهن وكانت النتائج كالاتي : معدل العيارية للمريضات لصنف دم Le.b (44±57.5) وللسليمات (86.85±40.11) اما المريضات ذوات صنف Le.a+b+ فقد سجلوا عيارية (5.7±11.7) والسليمات (32±0.00) هذه النتائج تدل على معنوية الفروق بين المريضات والسليمات من صنف Le.a+b+ . اكد اختبار تقدير عيارية الاضداد الضادة لكريات الدم الحمر لدى المريضات والسليمات الى ان مصول مريضات التهاب المفاصل الرثياني ابدت استجابة مناعية تجاه مستضدات كريات دم الصنف OLe. للانسان. استخدم كشف الاقتران المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) في تقدير الاضداد الضادة للعابين(الميوسين) نمط (Le.a,Le.b,Le,a - b - ) في مصول المريضات والسليمات(تخفيف المصل 1 : 128 ) حيث ابدت استجابة مناعيه ضد اللعابين وسجلت قراءات عالية المعنوية بين المريضات والسليمات. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | The importance of antigen of blood groups emerged as molecules associated with autoimmune diseases, where studies have confirmed the role of the two sets of blood ABO and Lewis in these diseases, and as the blood group Lewis plays an essential role in the adhesion has focused the present study on the side of the standardization of blood groups on how frequently these totals in rheumatoid arthritis patients compared to control, either side of the immune system study has touched on the presence of the immune response in the patients and the relationship of those responding totals different blood.Samples of the patients were 50 samples and the same for probable comparison. The results showed a lack of significant difference in the proportions set of ABO blood in the patients compared to control because the results were insignificant, while expressed blood group Lewis in the patients again different from those in healthy. An increased frequency of blood group Le (a + b - ) in patients was (56%) compared with (14%)frequency in healthy(control), while the blood group Le (a - b+) group resistant to the disease its frequency was (8%) in patients compared with healthy control (70%).The results indicate for the screening test for the presence of antigen (H) in the saliva of the patients and control of( Le.a) was(58%) in patients and (50%) in control. The result of serological tests(RF,CRP and ESR) were all positive.The level of antigen (H) in the saliva of the patients and control class of blood Lewis ( Le.b) and (Le.a + b +) was : Le.b patients (44 ± 57.5) compared to control (86.85 ± 40.11) patients of ( Le.a + b +) has registered titer (5.7 ± 11.7) and (32 ± 0.00) in control Anti - OLe.a blood group titer antibodies demonstrated insignificant rise of titers in patients sera compared to control. The results of anti - mucin titer to mucin pattern (Le.a, Le.b, Le. a - b - ) in the sera of patients and control were very significant.The abnormal frequency distribution of Lewis blood groups molecules in patients compared to healthy control,the low level of H - gene productin patients versus controls and the highly significant rise in anti - salivary mucin autoantibodies first time reported here indicate the probable important anociation of these multifactorial factors in the etiopathogenesis of Rheumatoid Arthritis.

دراسة تشريحية مقارنة لمراتب من عائلة عرف الديك Amaranthaceae في العراق == Comparative Anatomical Study of Taxa From The Family Amaranthaceae in Iraq

Author name: فريال خالد خلف
Supervisor name: عذية ناهي سلمان المشهداني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Anatomy
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نبذة تاريخية عن علم تشريح النباتنبذة تاريخية عن علم تشريح النباتالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لمراتب عائلة عرف الديك قيد الد راسةالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لكل نوعتشفيف الاوراق الخضرية والكاسية| طريقة التقطيع اليدويالمنظر السطحي لبشرة السيقان |نظام التعرق في الاوراق الكاسية

دراسة لبعض الهرمونات الجنسية لدى الاشخاص المصابين بداء المقوسات الكوندية المراجعين لبعض مستشفيات بغداد == Study of some sexual hormones in infected humans with Toxoplasmosis attenuated in some Baghdad hospitals

Author name: فرح محمود شتيب ابراهيم الوائلي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد داء المقوسات احد الامراض الوبائية الذي ينتشر على نطاق واسع جدا في جميع انحاء العالم. سببه هو الاصابة بطفيلي التوكسوبلازما Toxoplasma gondiiويساعد في انتشاره الظروف المناخية والجغرافية والعادات الاجتماعية والثقافية والغذائية. وقد اجريت هذه الدراسة على 130 امراة (حوامل ومجهضات) مصابات بداء المقوسات واللاتي يعانين من حالات الاجهاض او بدونه. وقد وجد ان 90 مريضة من اللواتي تم احالتهن من قبل الاخصائي لمستشفى فاطمة الزهراء (عليها السلام) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة ضد داء المقوسات, و90 رجل مصاب بداء المقوسات من المركز الوطني لنقل الدم وقد تراوحت اعمارالاشخاص بين 15 - 45 سنة في الفترة من ديسمبر 2014 الى مارس 2015 وبالتوازي مع ذلك، تم اختيار 60 امراة و30 رجل سليمين كمجموعة سيطرة. وقداظهرت النتائج ان نسبة الاصابة بهذا الطفيلي للنساء والرجال كانت 69.23% و66.67% على التوالي باستخدام طريقة فحص التلازن test Agglutination وطريقة الاليزا ELISA . ودلت النتائج على ان مجموعة الخطر الكبيرة من النساء الحوامل المصابات بداء المقوسات تتراوح اعمارهن بين 21 - 30 سنة اذ شكلت (61.54٪) من الحالات. واظهرت النتائج ان نسبة الاجهاض وفقا لعدد مرات الاسقاطات للنساء الحوامل قيد الدراسة بلغت (61.54٪) من عدد النساء الحوامل اللاتي اجهضن مرة واحدة او اثنتين. وقد كان تركيز الضد المناعي IgG مرتفع معنويا (0.05 >P), حيث كان بمتوسط (4.02 ± 0.39) عند الرجال و(8.50 ± 0.41) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة الصحية حيث كانت عند الرجال (0.343 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.418 ± 0.03)، في حين تراكيز الضد المناعي IgM سجلت ارتفاعا غير مهم وكانت بمستوى (0.603 ± 0.07) عند الرجال و(0.540 ± 0.08 ) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة حيث كان عند الرجال (0.151 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.325 ± 0.03). وتمت دراسة تراكيز العديد من الهرمونات في مصل مثل (testosterone, Estradiol, Progesterone, Prolactin, Follicle Stimulating Hormone and Luteinizing Hormone). وكانت نتائج هذه التجارب تكشفت عن وجود فرق معنوي (0.05 >P) في مستوى الاستراديول في النساء المصابات (المجهضات والحوامل) (43.62 ± 7.12 نانوغرام / مل) ( 682.11 ± 12.23نانو غرام/مل)، وفرق غير معنوي في الرجال المصابين (501.32 ± 82.09 نانوغرام / مل) وانخفاض معنوي (0.05 >P) في مستوى هرمون البروجسترون في النساء المصابات المجهضات والحوامل (3.12 ± 2.33 نانوغرام / مل) (7.81 ± 1.52 نانو غرام/ مل) و(5.51 ± 1.25 نانوغرام / مل) في الرجال المصابين بالمقارنة مع السيطرة للنساء (3.81± 3.22 نانو غرام/ مل) (10.72±2.23 نانو غرام/ مل) وللرجال (4.01 ± 0.02). ومع ذلك، فقد لوحظ عدم وجود فروق معنوية كبيرة في مستوى البرولاكتين حيث سجلت انخفاضا كبيرا في المرضى المصابين من النساء والرجال مقارنة بالمجموعة الضابطة. واظهرت النتائج ان مستويات هرمون تستوستيرون ليست ذات دلالة احصائية مسجلة بين مجموعتي النساء والرجال. واظهرت النتائج عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية في تركيز مستويات هرمون FSH للنساء والرجال المصابين. وكذلك في مستوى هرمون LH في النساء المصابات والرجال المصابين. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widely all over the world. The cause of it is the infection by the parasite Toxoplasma gondii. Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition. The present study was conducted on 130 women infected with toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 90 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite. And 90 men infected by toxoplasmosis from National Blood Transfusion Center ranging in ages between 15 - 45 years for the period from December 2014 to March 2015. Parallel to that, 60 healthy women and 30 healthy men were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infections by the parasite for women and men were 69.23% and 66.67% respectively using Agglutination and ELISA methods. The results indicated the great risk group of pregnant women with toxoplasmosis at the age between 21 - 30 year was (61.54%) of cases. The results showed that the rate of abortion, according to the projection of the number of times women were pregnant as a percentage (61.54%) of those who aborted once or twice. The concentrations of IgG were significantly elevated (P<0.05), the levels were (4.02 ± 0.39 IU /ml) in men and (8.50 ± 0.41 IU /ml) in woman, compared to a healthy control group where it was in men (0.343 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.418 ± 0.03 IU /ml), while the concentrations of IgM registered no significant elevated the levels were (0.603 ± 0.07 IU /ml) in men and (0.540 ± 0.08 IU /ml) in women, comparison to a healthy control group where it was in men (0.151 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.325 ± 0.03 IU /ml). The serum concentrations of several hormones were studied such as (Testosterone, Estradiol, progesterone, Prolactin, Follicle stimulating hormone and Luteinizing hormone). The results of these trials revealed a significant (p<0.05) increase in level of Estradiol hormone in women (aborted and women) (43.62±7.12 ng/ml) (682.11±12.23 ng/ml) and non - significant for infected men (501.32 ± 82.09 ng/ml) and a significant (p< 0.05) decline in progesterone level in infected women aborted and pregnant (3.12 ± 2.33ng/ml) (7.81±1.52 ng/ml) and (5.51 ± 1.25 ng/ml) for infected men when compared with control for women (3.81± 3.22 ng/ ml) (10.72±2.23 ng/ ml) and for men (4.01± 0.02 ng/ml). However, no significant differences were noticed in the level of prolactin where it registered significant decrease in infected patients in women and men comparison to control subjects. And the results showed that testosterone levels have no statistical significance registered between the two group's women and men. The results showed the absence of significant differences in the concentration of FSH hormone level among infected women and infected men. As well as in the level of LH hormone in infected women and infected men

التغيرات النسجية والنسجية الشكليائية القياسية لعقار الليفيتراسيتام في بعض اعضاء الجهاز التكاثري في الفئران البيض == Histological and Histomorphological Changes of Levetiracetam Drug in Some Reproductive Organs in White Mice

Author name: فائزة جبار جودة الربيعي
Supervisor name: نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was conducted to study the effects of Levetircetam (LEV) drug at concentration of 350 mg/kg/day body weight on selected organs of male and female reproductive system in albino mice, Mus muculus (Swiss mice). The animals divided into three treated groups, the first group treated once a day for 14 days, the second group treated once a day for 30 day and the third group treated once a day for 45 days, in addition to 3 control groups one for each treated group.The results of the present study declare the following : • Selected organs of male reproductive system (testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis).The results revealed significant degrease (P<0.05) in the percentages of the weight of testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis in treated animals for 14, 30, 45 days respectively in comparison with control group. The results also showed significant decrease (P<0.05) in percentages spermatogonia of the treated animals, when compare with control group. The percentages of the primary spermatocyte, secondary spermatocyte and spermatid increased significantly (P<0.05) in all three treated groups when compare with control groups and significant decrease (P<0.05) in percentage of spermatozoa, number of Sertoli cells, Leydig cells and diameter of Leydig cells nuclei. The mean diameter and thickness of somniferous tubules and height of epit helial cells and thickness of the tubules in the caput (head) and cauda (tail) epididymis in treated animal when compare with control group.The results of present study also showed that treatment with drug lead to histopathological changes in testes of animals treated with drug when compared with control groups such as degeneration, necrosis of spermatogenic cell and vacuolated of some seminiferous tubules, hypotrophy of interstitial and accumulation of spermatid at different stages of spermatogenic cells in lumen of tubules and degeneration of some of Leydig and separation of Sertoli cells from the basement membrane. Also results of percent study revealed some histopathological changes in caput (head) and cauda (tail) epididymis of treated animals with drug when compared with control groups, these change represented by degeneration some of epithelial cells and detachment of basement embrane and appearance of phagocytes in lumen of tubules and degeneration of epithelial cells and appearance of vacuoles between epithelial cells in addition to the damage of tubules. • Selected organs of female reproductive system significant increase (P<0.05), mean weight of ovary, oviducts and uterus of treated animals with drug for 14, 30, 45 days in comparison compared with control groups.Significant decrease (P<0.05) number of primary follicles and significant increase (P<0.05) in number of secondary follicles and significant increase (P<0.05) number of mature follicles of treated animals with drug about 14, 30, 45 days when compared with control group, significant increase (P<0.05) in number follicular cysts and corpus lutues of treated animals with drug when compared with the control groups, and significant decrease (P<0.05) diameter of growth follicles and corpus luteus and significantlyincrease (P<0.05) in diameters follicular cysts of treated animals with drug when compared with control groups. The results revealed some histopathological changes in ovary of treated animals with drug for when compared with the control groups, these changes represented by hypertrophy of cortex, degeneration of granular layer and accumulated some of cells in the middle of follicular lumen, degeneration in ovum and situated at the central position with increasing in the number of follicular cysts, separated of ovum from columns ovum, appearance of some abnormal ovum in some of follicles of ovaries.Significant decrease (P<0.05) in height and numbers of mucus folds in ampula and isthmus regions in oviduct of treated animals with drug when compared with control groups in addition to replacement of the ciliated columnar cells by cuboidal cell with the degreasing in the density of the cilia and the height of the secretory cells in addition hemorrhage, necrosis, hypoplasia and death of the columnar epithelial cells of the mucus folds, with the appearance of vacuoles, phagocytes in the center of the lumen,hypertrophy and hyperplasia in the tunica muscularis. Results also showed significant decrease (P<0.05) in numbers of endometrial glands of treated animals with drug when compared with control and significant increase (P<0.05) number of blood of treated animals with drugs when compared with control group and appearance significant increase (P<0.05) in high of epithelial cells of endometrium and thickness of lamina propria of three treated animals with drugs when compared with control group.The results revealed a histopathological changes in endometrium of treated animals with drug when compared with control such as hyperplasia and hypertrophy the epithelial layer and lamina propria and atrophy of endometrial glands and hyperplasia in epithelial of endometrial gland and detached basement membrane in some of them

دراسة مقاومة بكتريا Enterococcus faecalis المسببة لالتهابات المجاري البولية لبعض المضادات الحيوية وانتاجها لانزيمات ? - Lactamase == Study The Resistance of Enterococcus Faecalis that caused Urinary Tract Infection to some Antibiotics & its Production for ? - Lactamase Enzymes"

Author name: فاطمة صبيح علي السعدي
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم التحري عن وجود بكتريا Enterococcus faecalis في (389) عينة ادرار جمعت من مرضى مصابين باخماج القناة البولية ، ومن مختلف الفئات العمرية ، وللمدة ما بين (اب2005 - ) الى (كانون الثاني2006 - ) ، اذ اعتمدت الصفات الزرعية للمستعمرات والمجهرية لخلايا البكتريا ، والاختبارات الكيموحيوية (Biochemical tests) ، والتشخيص المصلي بطريقة لانسفيلد ، والتشخيص بعدة (API - 20 strep) ، وامكن تشخيص (27) عزلة تابعة لهذا النوع و(3) عزلات من النوعfaecium Enterococcus. اجري فحص الحساسية لعزلات E.faecalis المدروسة باستخدام (24) مضادا حيويا، وقد اظهرت العزلات مقاومة متعددة تجاه المضادات الحيوية ما بين (18 - 15) مضادا حيويا, وكانت جميع العزلات مقاومة وبنسبة (%100) لاربعة عشر مضادا حيويا، في حين كانت حساسة بنسبة (%100) تجاه البعض الاخر،كما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعشرة مضادات حيوية ، واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في قيمها. تم اختبار قابلية العزلات المدروسة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز بطريقة اليود القياسية السريعة وطريقة النايتروسفين ، واظهرت النتائج عدم مقدرة هذه العزلات على انتاج انزيم البيتالاكتاميز . تم الكشف عن قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز (Protease) وانزيم اللايبيز (Lipase) والبكتريوسين ((Bacteriocin وقدرتها على التلازن الدموي (Haemagglutination) ، واظهرت النتائج ان (26 عزلة) وبنسبة (% 96.3) كانت منتجة للبروتييز ، و(7عـزلات) (% 26.0)للانواع المنتجة لللايبيز ، و(23عزلة) (% 85.2) للانواع المنتجة للبكتريوسين ، فيما لم تظهر اي عزلة من العزلات المدروسة القدرة على التلازن الدموي . اظهرت العزلات المدروسة قابلية على الالتصاق بالخلايا الطلائية للمجاري البولية للانسان، وقد تباينت العزلات في قيم معدلات الالتصاق ما بين (78.0 - 22.10) بكتريا/خلية ، كما اجري اختبار تثبيط الالتصاق البكتيري في (4) عزلات منتخبة ذات معدل التصاق (52.6 و56.4 و77.5 و78.0 ) بكتريا/خلية باستخدام التركيز تحت المثبط الادنى وما تحته لاربعة مضادات حيوية بعد تنمية العزلات في وسط حاوي على تلك التراكيز ومقارنة ذلك بمعدل التصاق نفس العزلات المنماة في نفس الوسط الخالي من اي تركيز للمضادات الحيوية المستخدمة في الاختبار ، وقد اظهرت نتائج التحليل الاحصائي فرقا معنويا بين معدلات الالتصاق للعزلات المدروسة بوجود وعدم وجود تلك التراكيز من المضادات الحيوية المستعملة . اظهرت النتائج قابلية عزلتين وبنسبة (%7.4) على انتاج انزيم الهيمولايسن وكان التحلل من نوع بيتا (β - haemolysis)، كما اظهرت هاتين العزلتين القابلية على انتاج السايتولايسين والذي هو عبارة عن (هيمولايسين - بيتا/البكتريوسين) ، كما تم دراسة تاثير تركيز تحت المثبط الادنى لمضادي Nitrofurantoin وCiprofloxacin على انتاج الهيمولايسين الخام للعزلتين المنتجة (7و14) ، عن طريق حساب الفعالية النوعية للهيمولايسين الخام قبل وبعد التعرض لتلك التراكيز، اذ بلغت الفعالية النوعية للهيمولايسين الخام قبل التعرض للمضاد الحيوي للعزلتين (7و14) حوالي (1.6 و8.3) وحدة تحلل/مكغم على التوالي ، واظهرت النتائج ان هنالك تاثيرا مثبطا كبيرا لتلك التراكيز المستخدمة من المضادات الحيوية على انتاج الهيمولايسين الخام . | To detection Enterococcus faecalis in (389) urine samples were collected from urinary tract infection patients from all the ages during the period of (August 2005) till (January 2006) . Detection depending on cultural & microscobial characteristics of bacterial cell & Biochemical tests & Serological diagnosis by Lancefield method & Diagnosis by (Api - 20 strept ) was done to find (27) isolates of this species & (3) isolates of the species Enterococcus faecium. The antibiotic sensitivity test was done by using (24) antibiotics, the isolates showed multiresistant against (15 - 18) antibiotics. All the isolates were resistant by (100 %) against (14) antibiotics , while the isolates were sensitive by (100 %) against other antibiotics, also the minimum inhibitory concentration for ten antibiotics was studied, & the results showed an obvious different between their values . The ability of the isolates for βeta - Lactamase enzymes production was studied by standard rapid iodometric method & by nitrocefin method .The results showed the disability of these isolates for βeta - Lactamase enzymes production. To detection of the isolates ability of production of protease enzyme ,lipase enzyme ,bacteriocin, the ability of haemagglutination .The results showed that (26 isolate) (96.3 %) were protease producer , & (7 isolates) (26.0 %) were lipase producer, & (23 isolate) (85.2 %) were bacteriocin producer , while none of isolates under the study showed the ability of haemagglutination.The isolates showed the ability of adherence to the uroepithelial cells of humans urinary tracts .The isolates showed different adherence rates between (22.10 - 78.0) bacteria/cell .The inhibition of bacterial adherence was studied for four selected isolates which were their adherence rates were (52.6,56.4,77.5,78.0) bacteria/cell by using the minimum inhibition concentration & below it for four antibiotics after the isolates were cultured in a medium containing these concentration & comparing this with the adherence rates of the same isolates in the same medium but empity of any of antibiotics concentration that were used in the test. The Statistical analysis showed a significant difference between the adherence rates for the studied isolates in the presence & absence of these concentrations of the antibiotics in this study. The results showed the ability of two isolates (7.4 %) of enzyme hemolysin production & the hemolysis was from the Beta type (β - hemolysis) & those two isolates showed the ability of cytolysin production which is (hemolysin - βeta/bacteriocin). The effect of the below minimum inhibition concentration of Nitrofurantoin & Ciprofloxacin on the production of crude hemolysin of the two producer isolates (7 & 14) by calculating the specific activity for crude hemolysin before & after exposure to these concentrations. The specific activity for crude hemolysin before exposure to the antibiotics for the two isolates (7 & 14) about (1.6 & 8.3) hemolytic unit/mg respectively .The results showed that there was inhibitory effect of the used concentrations of antibiotics on production of cr

انتشار ودراسة التضاد لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من فتحتي المنخرمن طلاب المدارس في محافظة ميسان == Prevalence and Study the Antagonism of Staphylococcus aureus Isolated from Nares of School Children s in Maysan Governorate

Author name: فاطمة يوسف موسى المحمداوي
Supervisor name: امال عباس محمد الفخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الدراسة الحالية تضمنت جمع 500 مسحة جمعت من انوف طلاب المدارس الابتدائية في محافظة ميسان للفترة ( من تشرين الاول لسنة 2014 الى ايار لسنة2015 للفئة للعمرية 6 - س11 سنة ) للتحري عن حاملي المكورات العنقودية الذهبية اخذت العينات من 8 مدارس ابتدائية (4 مدارس من المناطق الريفية و4 مدارس من المناطق الحضرية). شملت العينات الماخوذة 230 عينة من الذكور و270 عينة من الاناث . وكذلك تم التحري عن البكتريا والاعفان التي قد تكون موجودة في الانف والتي قد تقلل من نسبة تواجد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية في الانف. وقد استخدمت الطرق المختبرية القياسية في تشخيص هذه البكتريا وتم التاكيد باستخدام نظام API 20 .Vitick 2Compact system, وقد اظهرت النتائج ان 140 (28%) عزلة من العينات المدروسة ( 5841.43%)) عزلة اناث و82 ) (58.57عزلة ذكور) هي من النوع المكورات العنقودية الذهبية الموجبة لانزيم التجلط Coagulase Positive Staphylococcus aureus (CoPS).ولمعرفة ما اذا كانت الظروف المعيشية(الريف والمدينة) تؤثر على معدل حمل S.aureus في مناطق الريف والمدينة في محافظة ميسان تم استخدام اختبار مربع كاي حيث عكست نتائج التحليل ان هناك فروق معنوية جدا وصلت الى X2 = 34.747 تحت احتمالية (P ≤ 0.01) بين حاملين ال S.aureus ضمن مناطق الريف والمدينة مما يعكس ان الظروف المعيشة مرتبطة بنسبة حمل هذه البكتريا.كما كانت نسبة الانواع البكترية الموجبة لصبغة غرام الاخرى هي : Staphylococcus epidermidis 226 (45.2 %) Streptococcus spp 176 (35%), Staphylococcus saprophyticus 9(1.8), Aerococcus viridians 4 (0.8)% , Staphylococcus haemolyticus 2(0.4). هذا وقد خضعت العينات الموجبة لانزيم التجلط الى اختبار الحساسية الدوائية بواسطة طريقة الانتشار بالاقراص وقد استعمل 18مضاد حيوي حسب المعاييرالمختبرية العالمية لعام 2012 حيث كانت نتائج الحساسية الدوائية كالاتي : (Methicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%),Amoxyllcin(63.5%), Cefixime (61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28%), Erythromycin(30%),Azithromycin (28.57%),Ciprofloxacin (17.85%) .Clarthromycin (12.17%), Tobramycin (9.28%) , Doxycyclin (7.10%), Vancomycin (5%), Amikacin (2.85%) ,Gentamicin (1.42%), Clindamycin (1.42 %), Levoflaxacin (0.0%), وقد اظهرت النتائج ان المضاد الحيوي Levoflaxacin هوالمضاد الاكثر فعالية بين المضادات المستخدمة فقد وصلت حساسية جميع العزلات الى( 100 %) بينما اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة عالية لمضادات Beta - lactams . اجري الاختبارالتركيز المثبط الادنى Minimum Inhibitory Concentration (MIC) للعينات المعزولة بواسطة نظام الVitek 2 . بينت النتائج ان 8 ( 5.7%) عزلة هي من النوع الكورارات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin resist Staphylococcus aureus MRSA) ) حيث قاومت التركيز 0.5mg للمضادالحيوي Oxacillin . بالاظافة الى ذلك دلت نتائج فحص الحساسية بواسطة الفايتك احتواء هذه العينات المقاومة على البروتين المرتبط بالنسلين المحور 2 PBP واحتوائها على جين ال mecA . تناولت الدراسة ايضا عزل الاعفان الموجودة في الانف حيث تم دراسة 50مسحة وتم الحصول على الانواع الفطرية التالية ( Pencillium Spp, A niger. . A. terrus , Cladosporium Spp, Alternia Spp)) .كما وتم دراسة الفعل الثبيطي لرواشح هذه الاعفان على بكترياS. aureus اوضحت النتائج ان عفن ال Alternaria له القابيلة على تثبيط نمو بكتريا الS. aureus حيث بلغ معدل قطر التثبيط ( 24.67) ملم على التوالي , بالاظافة الى ذلك درس التاثير الثبيطي للبكتريا المتواجدة كنبيت طبيعي في الانف على بكتريا S.aureus حيث اختيرت بكتريا المكورات العنقودية البشرويةS.epidermidis حيث استخدمت طريقة الانتشار بواسطة الحفر well diffusion method لمعرفة تاثير الخلية البكتريا الكاملة وكراشح لهذه البكتريا ضد S.aureus لوحظ ان بكتريا S. epidermdis لم تبدي اي تاثير تثبيطي اتجاه الS.aureus سواء كخلية بكترية كاملة او كراشح لهذه البكتريا. بينما الكشف عن تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا S.aureus بواسطة epidermdis . S بواسطة استخدام جهاز Spectrophotometer اظهرت النتائج ان الامتصاصية بطول موجي 630 نانومتر فقد لوحظ انخفاض الامتصاصية من 0,022 لعالق بكتريا ال S.aureus مع سكر الكلوكوز بتركيز %0,25 المحضون لمدة 73 ساعة بدرجةحرارة 37 سيليزية الى 0,009 عند اظافة البكتريا المضادة S. epidermdis لعالق ال S aureus مع الكلوكو | The current study includes comprises 500 Nasal swab collected from the primary school students in the Maysan Governanat to investigate Staphylococcus aureus carriers for the period from (October to May 2014 - 2015 in the age group 6 - 11 years).The samples were taken from eight primary schools (4 schools from rural areas and 4 schools in urban areas),The samples taken include 230 sample from males and 270 sample from females, also to investigate for bacteria and fungi that may be present in the nose, which may reduce the percentage of the presence of the bacteria Staphylococcus aureus in the nose. The standard laboratory methods were used in the diagnosis of these bacteria and confirmed diagnosis using the API 20 system and the Viteck - 2 Compact System. The results showed that 140 (28%) isolates of the studied samples (58 isolated from females and 82 isolated from males) were Coagulase Positive Staphylococci(CoPS).To know whether that the living conditions (live in rural and urban districts) effect the rate of S. aureus carriers statistical analyses using chi square test for carriers in urban and rural districts revealed highly significant difference X2=34.747 (P≤0.01)which indicated that the living conditions and the rate of carriers are related.The proportion another gram positive bacteria were Staphylococcus epidermidis226(45.2%),Streptococcus spp176(35%),Staphylococcus saprophyticus 9(1.8%) Aerococcus viridians 4(0.8%) and Staphylococcus haemolyticus2(0.4).CoPS isolated were submitted to sensitivity test by kirpy - Bauer Disk diffusion method according to CLSI, 2012,18antibiotic has been used and the resistance rates ethicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%)Amoxycllin(63.5%),Cefixime(61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28),Erythromycin(30%),Azithromycin(28.57%),Ciprofloxacin(17.85%)Tobramycin (9.28%),Doxycyclin(7.10%),Vancomycin(5%)Amikacin(2.85%),Gentamicin 1.42%, Clindamycin (1.42 %), and Levoflaxacin (0.0%).The results showed that the antibiotic Levoflaxacin was the most effective antibiotic among them all isolates were a sensitive and reached to (100%) while most the isolates showed high resistance to Beta - lactame antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) was used by Vitek 2 system showed that 8 isolates of (5.7%) samples were Methecillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA)were they resisted to the minimum inhibitory concentration 0.5 for the antibiotic Oxacillin as well as the results of the examination sensitivity shown by Vitek 2 - System.These resistance isolates associated contain pencillin binding protein 2 PBP and contain the mecA gene.The study also included the isolation of Fungi from the nose, were the study showed 50 swabs got the following types (Pencillium spp, Aspergillus . niger, Aspergillus . terrus, Cladosporium spp, Alternaria spp).The inhibitory effect of the filtrates of these Fungi against S. aureus was studied, were results showed that the mold Alternaria spp only has the ability to inhibit the growth of S. aureus where average of inhibition zone reach to(24.67) mm in addition the present study include the control of S.aureus by the other bacteria which considered normal flora in the nose, Staphylococcus epidermidis selected for this purpose.Well diffusion method was used as Whole bacteria and filtrate for this purpose and results show that there are no inhibitory effect of S.epidermidis on S.aureus by this method. While biofilm formation of S.aureus was inhibited by S. epidermidis by detected using Spectrophotometer (360nm) results of the absorbency was decrease from 0.022 for suspension of S.aureus with glucose 0.25% incubated for 73 hour at 37 °C to 0.009 for suspension of antagonistic bacteria S. epidermidis added to the suspension of S. aureus and glucose 0.25% under the same condition and this indicate that the biofilm was inhibited by S.epidermidis

الاصابات الطفيلية في بعض اسماك نهر دجلة، منطقة الكريعات في محافظة بغداد, العراق == parasitic infections in some fishes from Tigris River, Al - Graiat location in Baghdad Province, Iraq

Author name: فاطمة خلف عطوان
Supervisor name: فاطمة خلف عطوان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت خلال الدراسة الحالية 578 سمكة من منطقة الكريعات الواقعة على نهر دجلة في محافظة بغداد اثناء المدة من شهر تموز 2015 ولغاية نهاية شهر اذار 2016. تضمنت هذه الاسماك، التي تعود الى 19 نوعا : 140 سمكة بلعوط ملوكي، 118 سمكة خشني، 66 سمكة بنيني كبير الفم، 46 سمكة حمري، 42 سمكة كارب اعتيادي، 38 سمكة بلطي احمر البطن، 21 سمكة بلطي ازرق، 14 سمكة قطان، 12 سمكة شبوط، 12 سمكة بني، 12 سمكة بنيني صغير الفم، 11 سمكة ذهبية، 11 سمكة شلك، 7 اسماك عراض، 7 اسماك سمنان، 6 اسماك ابو الزمير، 5 اسماك ابو براطم، 5 اسماك جري لاسع و5 اسماك مرمريج. فحصت الاسماك خارجيا وداخليا لتشخيص طفيلياتها. بينت النتائج وجود 77 نوعا من الطفيليات تضمنت : 14 نوعا من حاملات الاهداب، 17 نوعا من البوغيات المخاطية، 41 نوعا من الطفيليات احادية المنشا، اربعة انواع من المخرمات ونوعا واحدا من الديدان شوكية الراس. تم في هذه الدراسة تسجيل 22 نوعا من الطفيليات لاول مرة في العراق، تضمنت اربعة انواع من حاملات الاهداب هي : Trichodina centrostrigeata، T. intermedia، T. urinaria وTripartiella rhombi، عشرة انواع من البوغيات المخاطية هي : Myxobilatus baicalensis،Myxobolus bizerti ،M. branchialis ، M. chuatsi،M. dermatobius ، M. exiguus،M. kubanicum ،M. niei ، M. sphaerocapsularis وM. squamae، ثمانية انــــــواع مــــــن الطــــــفـــيـليات احادية المــــــنشا هــــي : Cichlidogyrus sclerosus، C. tilapiae، Dactylogyrus lenkoranoides،Gyrodactylus comephori، G. ibragimovi، G. macronychus، G. masu وParadiplozoon megalobramae. كما عد 50 نوعا من الاسماك مضيفات جديدة في العراق لـ 30 نوعا من الطفيليات.اظهرت انواع الطفيليات المسجلة في هذه الدراسة اختلافا في مواقع تطفلها في او على اجسام مضيفاتها، كما تباينت في نسب وشدد اصابتها للمضيفات المختلفة من الاسماك، كما بينت الدراسة الحالية وجود تباين في انواع واعداد الطفيليات التي تصيب انواع الاسماك، اذ كانت اسماك الكارب الاعتيادي والخشني مصابة باكبر عدد من انواع الطفيليات (21)، يليها كل من الشبوط والحمري (13)، وسمكة القطان (12)، وكل من البلعوط الملوكي وابو براطم والبنيني كبير الفم (11)، والبلطي احمر البطن (عشرة)، والسمكة الذهبية (خمسة)، وكل من البني والعراض (ثلاثة)، والشلك (اثنين)، وكل من البنيني صغير الفم والبلطي الازرق وابو الزمير والمرمريج والسمنان مصابة بنوع واحدا من الطفيليات، في حين لم تسجل اصابة باي نوع من الطفيليات في الجري اللاسع. | During the present investigation, a total of 578 fishes were collected from Al - Graiat location on the Tigris river at Baghdad province during the period from July 2015 until the end of March 2016. These fishes, which belonged to 19 species, included : 140 Chondrostoma regium, 118 Planiliza abu, 66 Cyprinion macrostomum, 46 Carasobarbus luteus, 42 Cyprinus carpio, 38 Coptodon zillii, 21 Oreochromis aureus, 14 Luciobarbus xanthopterus, 12 Arabibarbus grypus, 12 Mesopotamichthys sharpeyi, 12 Cyprinion kais, 11 Carassius auratus, 11 Leuciscus vorax, seven Acanthobrama marmid, seven Alburnus mossulensis, six Mystus pelusius, five Heteropneustes fossilis, five Barbus barbulus and five Mastacembelus mastacembelus. These fishes were externally and internally examined to identify their parasites. The results showed the presence of 77 species of parasites which included : 14 species of Ciliophora, 17 species of Myxozoa, 41 species of Monogenea, four species of Trematoda and one species of Acanthocephala. Among these parasites, 22 species were recorded for the first time in Iraq. These included : four species of Ciliophora (Trichodina centrostrigeata, T. intermedia, T. urinaria and Tripartiella rhombi), ten species of Myxozoa (Myxobilatus baicalensis, Myxobolus bizerti, M. branchialis, M. chuatsi, M. dermatobius, M. exiguus, M. kubanicum, M. niei, M. macrocapsularis and M. squamae), eight species of Monogenea (Cichlidogyrus sclerosus, C. tilapiae, Dactylogyrus lenkoranoides, Gyrodactylus comephori, G. ibragimovi, G. macronychus, G. masu and Paradiplozoon megalobramae). Also, 50 species of fishes were regarded as new hosts for 30 species of these studied parasites. The present study appeared a difference according to the site of infection on or in their hosts as well as in their prevalence and intensity of infections to their fish hosts, and showed verified in number and species of parasites that infected fishes. Among the infected fishes cyprinus carpio and Planiliza abu harbored the highest number of parasites species (21), followed by Arabibarbus grypus and Carasobarbus luteus (13), Luciobarbus xanthopterus (12), Chondrostoma regium and Barbus barbulus and Cyprinion macrostomum (11), Coptodon zillii (10), Carassius auratus (5), both of Acanthobrama marmid and Mesopotamichthys sharpeyi (3), Leuciscus vorax (2), both of Alburnus mossulensis and Cyprinion kais and Mastacembelus mastacembelus and Mystus pelusius and Oreochromis aureus (1), but there is no infection appeared with parasites in Heteropneustes fossilis.

تاثير المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين Ficus carica domestica وقشرة الرمان Punica granatum على بعض الاحياء المجهرية المعزولة من الجروح والحروق == THE EFFECT OF HOT WATER & COLD ALCOHOL EXTRACTS OF FIG FRUITS Ficus carica domestica & PERICARP OF POMEGRANATES FRUITS Punica granatum ON SOME MICRO ORGANISM ISOLATED FROM WOUNDS & BURNS

Author name: عمر موفق انور العلي
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف هذه الدراسة هو الاختبار التجريبي لتاثيرات المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين وغلاف ثمرة الرمان على نمو ثلاثة انواع من البكتيريا المصاحبة للحروق والجروح الجلدية . خمسون من المسحات جمعت من مرضى مستشفى الواسطي التعليمي الذين تعرضوا لحوادث الحروق والجروح وللمدة من 20 كانون الاول 2005 ولغاية 18\3\2006 اتبعت الطرائق التصنيفية لتحديد اهم الانواع المتواجدة . جمعت النماذج النباتية لثمرة التين وقشرة ثمرة الرمان من السوق واجريت عليها طرائق الاستخلاص بالماء الحار والكحول البارد للحصول على مادة مركزة والذي خفف الى تراكيز (250,200,150,100,50) ملغم\مل . وبموجب الطرائق المذكورة انفا وباستعمال طريقة الاقراص الورقية تم الحصول على النتائج الاتية : - اولا : - اظهرت طرائق التشخيص للنماذج ان البكتيريا الموجبة لصبغة غرام Staphylococcus aureus كانت البكتيريا اكثر تواجدا في النماذج ( %50) تبعتها النوعان الاخران Pseudomonas aeruginosa , Escherichia coli واللذان يمثلان نسبة (%30) من النماذج . ثانيا : - اجري الكشف على المركبات الموجودة في النماذج النباتية المستخدمة وبين الكشف احتواء المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين على الكلايكوسيدات فقط بينما مستخلصات قشرة ثمرة الرمان احتوت على عدد من النواتج الثانوية هي القلويدات والكلايكوسيدات والفلافونويدات والفينولات ولا تحتوي على التربينات والستيرويدات والصابونيات .ثالثا : - كانت التاثيرات التي اظهرتها مستخلصات الماء الحار والكحول البارد لغلاف ثمرة الرمان على تثبيط نمو اقطار الانواع البكتيرية الثلاث واضحــــــــــة . اذ ان اختزال اقطار النمو كانت بمدى ( 11 - 13 ) ملم عند التركيز 50ملغم\مل ازدادت الى (16 - 18) ملم عند التركيز 250ملغم \مل بالنسبة الى النوعين Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa بينما الاختزال في اقطار نمو Escherichia coli كان حوالي (%60) مقارنة مع النوعين الاخرين . اختزال النمو بالنسبة الى الانواع البكتيرية الثلاث التي كانت تحت تاثير تراكيز مختلفة من المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين كان معدوما او ضعيفا كما في معاملة الاستخلاص الكحولي التي طبقت على ( S.aureus وP.aeruginosa) حيث بلغ ( 1 ) ملم عند التركيز 50 ملغم\مل وازدادت الى ( 2 ) ملم عند التركيز 250 ملغم\مل . واخيرا اظهرت نتائج الاختزال باستعمال المستخلصين ( المائي الحار والكحولي البارد) بالنسبه لنباتي ( التين والرمان ) عدم وجود فروق معنوية مؤثرة على (Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa). | The aim of this study was to investigate experimentaly the effects of hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit and pericarp of Pomegranate on growth of three skin and burn wound pathogenic bacteria . Fifty swab samples were collected from patients exposed to accidental wounds and burn from hospital for a period extending between 20 th December 2005 to 18 th March 2006 .Bacterial identification methods are followed to determine most common ones . Also plant samples ( Fig fruit and pericarp of Pomegranate) were collected from local market . The hot water and cold alcohol extraction were obtained as a stock solution then diluted into a range of conc.( 50,100,150,200,250) mg/ml .According to the above mentioned methodology and by using disc paper method it was possible to obtain the following results : - First : - Identification methods showed that gram - positive bacteria Staphylococcus aureus was the most present bacteria in the samples (50%) followed by the other two common bacetira Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli which represent about one - third of the bacetira present in the samples .Second : - The hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit contain only glycosides . While extracts of Pomegranate contain a number of secondary metabolites such as : ( alkaloids, glycosides, flavonoids, phenols but no terpens , steroids, saponins and resins were detected .Third : - The effects of hot water and cold alcohol of pericarp of pomegranate fruit extraction on growth inhibition of the three bacetira under investigation were obvious. Growth diameters reductions were ranging between (11 - 13) mm at conc. (50) mg/ml and increased to the range of ( 16 - 18 ) mm at conc. (250) mg/ml for both Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa .While diameter reduction of Escherichia coli growth was about (60%)comparing with the other two species of bacteria .Growth diameter reductions of the three bacterial species exposed to different concentrations of hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit showed a nil or weak results except for alcohol exract treatment applied to Staphylococcus aureus and Pseudomonas aerugionsa which were both exhibited a weak results of reduction (1)mm at (50) mg/ml concentration increased to (2)mm at (250) mg/ml . Finaly , the results of growth reduction by the two methods extraction (hot water and cold alcohol ) of the two plants ( Fig and Pomegranate) exhibited non - significant differences on (Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa).

تاثير جسيمات ثاني اوكسيد التيتانيوم 2TiO النانوية والميكروية على انبات ونمو بذور نباتي الحنطة والرز ومركباتها == Effect of titanium dioxide TiO2 nano and bulk particles on seeds germination and growth of wheat (Triticum aestivum L.) and rice (Oryza sativa L.)

Author name: علياء محسن يوسف
Supervisor name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

دراسة الميكروبية والتداخل البكتيري للفطريات المصاحبة لالتهابات الانف والاذن لمرضى السكري وابيضاض الدم == Microbial Study and Bacterial Interaction with Mycosis Associated with Nose and Ear Inflammatory of Diabetes and Leukemia Patients

Author name: علیاء فخري خلف البیاتي
Supervisor name: امال عباس محمد الفخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred and ten clinical samples were collected from hospitalized patients in hematology - oncology department in Baghdad Teaching Hospital and Al - Kindy Teaching Hospital, during the period from November 2014 to June 2015.The samples included 48 female and 62 male patients who are suffering from diabetes mellitus (DM) and leukemia. The ages of patients ranged between 13 - 82 years. The swab samples taken from the nose and ear of patients were (67 with diabetes mellitus and 43 with leukemia). The results of fungal culturing revealed that 50 samples of DM patients (74.63%) and 31 samples of leukemia (72.09%) were diagnosed as positive ones.From the collected clinical samples that gave positive results; it was found that Candida spp. was the most common fungi isolated from ear swabs (50%) followed by Aspergillus spp. (42.86%) and Penicillum spp. (7.14%).The results of fungal (molds) species isolated from the nose of DM patients revealed highly significant differences between fungal rates, Aspergillus spp. were isolated with highest levels (48.15%), followed by Penicillum spp. (37.04%); however, Rhizopus spp. was isolated with low levels (14.81%). On the other hand, it was found that Candida spp. and Rhodotorula spp. were the most yeasts isolated from the nose of DM patients. They were isolated with rates as (45.83%) and (41.67%) respectively. Nevertheless, the genus Cryptococcus spp. was isolated with low levels (12.50%). The results also revealed that males were more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungal are more prevalent in ages over fifty and ages between thirty one and fifty years compared with younger ages between ten and thirty years old. From the collected clinical samples of leukemia patients, highly significant differences were found between the rates of fungal infection. The level of Aspergillus spp. was (90.91%) and Rhizopus spp. (9.09%), while the levels of yeasts were (88.24%) and (11.76%) for Cryptococcus spp. and Candida spp. respectively.The frequent species of Aspergillus identified included A. niger (37.78%), followed by A. flavus (35.56%), A. fumigatus (17.77%) and A. terreus with lowest levels (8.89%). The results also revealed that males are more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungi are more prevalent in ages 31 - 50, followed by younger ages (10 - 30) compared to old ages, over fifty years old.All fungal isolates were identified according to macroscopic and microscopic characteristics in addition to biochemical tests for yeast identification. Vitek 2 system is another confirmatory test which was carried out for further characterization for the yeast species. The results of Vitek 2 system revealed that Candida spp. were isolated with the highest level (41.67%), followed by Cryptococcus spp. (37.5%) however, Rhodotorula spp. was isolated with a low level (20.83%). A confirmatory test for the selected isolates of A. fumigatus using polymerase chain reaction (PCR) analysis technique was also conducted. This test has been done by using primers specific for hemolysin gene (aspHS). The results of the molecular method were closely related to those obtained from cultural methods with exception of one isolate which was positive by PCR method nevertheless, it was negative by culture method. The results of PCR analysis technique, revealed that 6 isolates out of total 8 (75%) were positive for the presence of aspHS gene compared to culture methods which showed 5 isolates out of total 8 (62.5%) had the ability to induce hemolysis when grown on blood agar .The inhibitory effect of Bacillus subtilis against Aspergillus spp. was also conducted, the results indicated that B. subtilis isolate has antimicrobial activity against Aspergillus spp; the diameter of inhibition fungal growth were 39.3 ± 01.5, 48.6 ± 02.2, 40.5 ± 02.8 and 43.5 ± 01.7 mm for A. fumigates, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with the diameter of controls which were 80.0 ± 05.3, 78.0 ± 03.9, 43.5 ± 01.7 and 72. ± 02.6 mm respectively. The radial inhibition growth of Aspergillus spp. treated with B. subtilis were 51%, 38%, 47% and 44% for A. fumigatus, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with treatment of control.

دراسة بعض الجوانب المناعية والجزيئية في المرضى المصابين بداء المقوسات العيني == Study of some Immunological and Molecular Aspects in Ocular Toxoplasmosis Patients

Author name: علي نزار ياسين
Supervisor name: اسراء قاسم العبيدي | وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current study was conducted on 179 patients who attended the Retina Unit in Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital in Baghdad from the beginning of March to the end of September 2014. The patients were divided a according to the clinical diagnosis to 3 roups; the first included 50 patients infected with ocular toxoplasmosis(OT) while 45 patients with uveitis ; In addition a control group was of 84 apparently healthy individuals (they don’t have any infection in their eyes.) was included. The sera patients were initially diagnosed by immune Latex test. The results showed that all the ocular toxoplasmosis patients (100%) were positive while none of the uveitis patients gave positive result, In control group,30 cases were infected with toxoplasmosis(35.7%) with a significant differences between the three groups (p<0.01). ELISA test results for specific T. gondii IgG and IgM antibodies for were 84% positive to ocular toxoplasmosis as 42 patients versus 16% as 8 cases with negative test, while the positive rate in uveitis patients was 31.1% and considered as positive uveitis group, versus 31 negative case with rate 68.9%.The control group was reevaluated showed 35 positive case from 84 and formed a group called Asymptomatic toxoplasmosis. The levels of specific IgG and IgM were measured by international unit / ml.for all groups. The IgG level was 1.661 ± 0.187 IU/ml. in O.T. group followed by positive uveitis group 1.596 ± 0.157 and Asymptomatic toxoplasmosis group 1.501± 0.257 while negative uveitis group and control were recorded 0.389± 0.190 and 0.350 ± 0.167 respectively.IgM levels were increase in O.T. group 1.922 ±0.510 followed by positive uveitis group 1.867 ± 0.061 then asymptomatic toxoplasmosis came 1.744 ± 0.070. Finally the negative uveitis and control groups were registered 0.632 ± 0.166 and 0.618 ± 0.236 respectively.The study of some properties, coupled with ocular toxoplasmosis, including the sex and age for positive IgG antibody groups as it reflected the probability of female to male rate of 74.28% and 25.72%, respectively for OT group, while positive uveitis 58.33% and 41.67% respectively. Asymptomatic toxoplasmosis group has recorded 53.33% and 46.67%, respectively, with no significant differences between the three groups. The age variable has the results of the current study showed no significant differences between positive IgG antibody groups, as OT group focused within the age range 40 - 49 years and 60 - 70 years and similar rate of 22.88%, while positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis groups focused within at the age range 20 - 29 years and 33.33% and 30% respectively. As for positive IgM antibody groups and sex differences, with no significant differences recorded as OT group of males 71.43% and females 28.57%, while asymptomatic toxoplasmosis group 60% for males and 40% for females recorded. The positive uveitisgroup was limited to females only 100%. As well as not significant differences between positive IgM antibody groups were recorded for variable of age as it was OT group within the age range 30 - 39 years and 50 - 59 years with a similar rate 28.57% and 40 - 49 years by 42.86%. As positive uveitis group was within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate 50%, while asymptomatic toxoplasmosis group within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate of 40% and 40 - 49 years by 20%.Investigation of a specific part of B1 gene in size 469 base pair for positive cases to ELISA test was done by conventional PCR test. O.T. group recorded 10 positive results from 42 patients in 23.8% percent, while positive uveitis group that has 14 patients in which only 3 positive cases in 21.4 percent. Three positive cases was recorded also in asymptomatic toxoplasmosis group in 8.6% percent. No significant differences for this test between studied groups in probability (p.0.05). Real - time PCR was applied also on a positive studied groups to ELISA test also.O.T. group recorded 14 positive case in 33.3% percent, positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis registered only 7 case in rate 50% and 20% respectively, No significant differences for real - time PCR in probability (p.0.05) between the three groups.The present study included als o that contain measuring changes in thelevels of some cytokines that estimated by pg. /ml. for all studied groups.The level of IL - 4 in positive uveitis group reached to 28.22 ± 7.74 followed by asymptomatic toxoplasmosis group 26.72 ± 3.72.then O.T.group 21.39 ± 5.03 while negative uveitis group reached a concentration 16.17 ± 5.66,control group came finally and reached lowest concentration 5.08 ± 2.8.High level of IL - 6 was in O.T. group 33.09 ± 19.57 and positive uveitis group 22.26 ± 9.74 then asymptomatic toxoplasmosis 16.83± 6.06, negative uveitis registered 15.94 ± 6.11,control group came to record the lowest concentration 11.70 ± 5.44. An increase in IL - 10 was record in O.T.gruop 24.24 ± 6.27 followed by negative uveitis group 21.35 ±7.64 then asymptomatic toxoplasmosis group 19.15± 3.95 while positive uveitis showed a level 17.65 ± 2.75,the lowest level was in control group 14.28 ± 2.79. High level of Interferon - gamma Inducible Protein - 10 ( IP - 10 ) was got in O.T. group in a concentration 22.66 ± 3.48followed by positive uveitis group 17.09 ± 1.97, then negative uveitis group 16.91± 3.02. Asymptomatic toxoplasmosis group reached 16.89 ± 2.46 and lowest concentration in control group 14.78 ± 2.26.Granulocytes - macrophages colonies stimulating ( GM - CSF) registered a highest level in positive uveitis 47.44 ± 15.04 followed by O.T. group 45.14 ±10.05 the negative uveitis group 43.12± 9.35 and Asymptomatic toxoplasmosis record 39.26± 12.03 while control group the lowest concentration 29.44± 5.29.There were no significant differences between the studied groups (p.0.05). in the levels of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF).

تلازم بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض الذبحة الصدرية غير المستقرة

Author name: علي مرتضى حسن
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت دراسة 150 انموذجا لمرضى الذبحة الصدرية Unstable angina و100 انموذج للاصحاء ظاهريا والمضاهين الجنس والاعمار مع المرضى , واهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم ABO وLewis ومجموعة الدم MNS , فقد سجلت النتائج ان تردد المجموعة B كان 33.3% في المرضى, و29% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, اما تردد المجموعة A فلم يعط فرقا بين المرضى والاصحاء, في حين قل تردد المجموعة O في المرضى عنه في الاصحاء, فقد بلغ في المرضى24.7% , و31% في الاصحاء وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, في حين كان تردد مجموعة الدم AB في المرضى 12.0 % وفي الاصحاء بلغ 10% ايضا كان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05 .لقد برز دور المجموعة (Le (a‾ b‾ في القابلية للمرض Susceptibility , وقد سجل هذا النمط ترددا بلغ 30.7% في المرضى و18% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي مشيرا الى معنوية هذا الفرق (P< 0.05), اما المجموعة Le(a+ b - ) فقد سجلت ترددا بلغ في المرضى 15.5% وفي الاصحاء 26% والمجموعة Le(a - b+) كان ترددها 55% في المرضى و18% في الاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.ان مجموعة الدم MNS اعطت مؤشرا الى دورها في المرض وخصوصا دور المجموعة NN اذ بلغ ترددها 19.2% للمرضى مقارنة بتردد 11% للاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.وقد درست الاستجابة المناعية للانماط الدموية التي تحت الدراسة وبينت النتائج ان هنالك ارتباطا بين بعض المجاميع وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر في مصول المرضى مقارنة بالاصحاء.كان النمطان A وB اكثر الانماط اظهارا للعياريات فقد بلغت 43.6 ± 46.6 و61.9 ± 148.9 للمرضى على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 5.6± 5.4 و15.3 ±25.7 للاصحاء وكانت هذه الفروقات ذات اهمية معنوية ((P< 0.05.اقترن ارتفاع عيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر بالمجموعة Le(a - b - ) فقد بلغت العيارية في المرضى 59.5± 67.2 و6.2 ± 5.8 في الاصحاء P<0.01) ). اما عيارية النمط Le(a+ b - ) فقد بلغت 57.6 ± 75.9 في المرضى و7.7± 7.7 في الاصحاء (P< 0.01) في حين كانت العيارية للنمط Le(a - b+) 43.7 ± 117.9 للمرضى, و108.3 ± 559.7 للاصحاء.درس دور مورث الافراز وعلاقته بالاستجابة المناعية فقد سجل المرضى الفارزين عيارية 72.6 ± 77.02 مقارنة بغير الفارزين المسجلين لعيارية بلغت 54.3 ± 63.5 (P< 0.01) في حين كان الاصحاء الفارزين ذوي عياريه 6.0 ± 7.02 مقارنة بغير الفارزين اذ بلغت 6.4 ±5.3 (P< 0.01) .اما العيارية المرتفعة للنمط NN والبالغة 38.4 ± 47.02 فقد اختلفت عن مثيلتها في الاصحاء 8.7 ± 9.4 (P<0.01).كانت الانماط AB وB اكثر خطورة نسبية للمرض, فقد بلغت خطورتها النسبية 1.2 و1.1 على التوالي .وقد نوقشت النتائج في ضوء المعلومات العلمية المتوافرة للموضوع. | A total of 150 unstable angina patients and 100 age and gender comparable healthy controls were investigated. The study dealt with finding the frequency distribution of ABO, Lewis and MNS blood groups .The findings indicated that there was an increase in the frequency of B blood groups (patients 33.3% versus 29% in control, P<0.05). On the other hand however, A gave no significant difference in the patients compared to control. O blood group frequency gave a decreased frequency in patients compared to controls,(24.7% in patients vs. 31% in healthy controls , P<0.05).A noticeable increase in the frequency of Le(a - b - ) was seen in patients (30.7% in patients vs. 18% in controls, P<0.05), However, Le(a - b+) demonstrated a relatively decreased frequency in patients compared to controls, While Le(a+b - ) showed no differences in frequency.In MNS blood groups, NN frequency gave a statistically significant difference ,with a frequency of 19.2% in patients vs 11% in healthy controls.The immunological status in patients and controls was studied, based on a newly developed quantitative criterion (Anti - bovine antibody titers among patients and controls). It was seen that A and B blood groups were among the ones that gave an increased anti - bovine antibody titers giving a mean titers of (43.6 ± 46.6 and 61.9 ± 148.9) in patients vs. (5.6 ± 5.4 and 15.3 ± 25.7) in healthy controls respectively.The increased anti - bovine antibody titers were associated with Le(a - b - ) blood group, That was (59.5 ± 67.2) in patients vs. (6.2 ± 5.8) in healthy control, (P< 0.01).On the other hand however, anti - bovine antibody titers in Le(a+b - ) was (57.6 ± 75.9) in patients vs. (7.7 ± 7.7) in healthy controls, (P< 0,01), While Le(a - b+) gave an opposite titer of (43.7 ± 117.9) in patients vs (108.3 ± 559.7) in healthy control,(P<0.01).The role of secretory gene in the anti - bovine antibody titers distribution was studied among patients . Secretors gave a mean titer of (72.6 ± 77.02) compared to (54.3 ± 63.5) in non secretors.The healthy secretors gave a mean titer of (6.0 ± 7.02) compared to a mean titer of (6.4 ± 5.3) in healthy controls, (P <0.01).NN blood groups gave an anti - bovine antibody mean titer of (38.4 ± 47.02)in patients in respect to a mean titer of (8.7 ± 9.4)in healthy controls, (P <0.01).A relatively high risk was demonstrated among some blood groups.The novel results were discussed based on gathered available immunological data in the subject of atherosclerosis and unstable angina .

دراسة جزيئية لعدد من عوامل الالتصاق البكتيرية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من عينات الادرار من الاطفال دون الخامسة == Molecular study of a number of bacterial adhesion of the bacteria Escherichia coli isolated of urine samples of children under five

Author name: علـي فاضل احمد
Supervisor name: الهام سعيد عبد الكريم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة عزل بكتريا Escherichia coli من عينات سريرية لاطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية ، وقد تم الحصول على ( 72 ) عزلة من بكتريا E. coliمن اطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية الذين اعمارهم دون ( 5 ) سنوات ومن كلا الجنسين من مستشفى ( ابن البلدي للاطفال ، والامامين الكاظمين ( ع ) التعليمي ومستشفى العلوية للاطفال ) وللمدة من 1/11/2014 لغاية 28 / 2 / 2015 . اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات المجهرية والزرعية والفحوصات الكيموحيوية والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات بوساطة استعمال الفحص بنظام ( API 20 E ) . بينت نتائج الدراسة ان نسبة اخماج المسالك البولية في الاناث هي ( 54.2 % ) 39 عزلة ، وفي الذكور ( 45.8%) 33 عزلة.واختبرت حساسية جميع العزلات للمضادات الحيوية وفق طريقة ( Kerby Bauer ) اذ اظهرت جميع العزلات مقاومة 100% لمضادي Ampicillinو Ceftazidime في حين، كانت نسب المقاومة للمضاد Trimethoprim ،Amikacin ، Aztreoname، Tobramycin، gentamycin ، Pipracillin83.3 % ،81.9% ، 72.22% ، 70.8% ، 68.5% ، 65.5 على التوالي ، وكانت نسبة الحساسية 100% لمضادي ، Impenem ، Meropenem .اظهرت عزلات بكتريا E. coli قابليتها على التعبير عن عامل الضراوة الهيمولايسين (نوع بيتا β) اذ كانت 59.7% من العزلات منتجة لهذا العامل . اظهرت عزلات بكتريا E. coli احتواءها على نوعي عاملي الالتصاق CFA/I ، CFA/III اذ كانا بنسبة ( 91.6% ) و( 62.5%) على التوالي ، واظهرت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان ( 100%) ، كما اظهرت جميع العزلات قدرتها على انتاج الغشاء الحياتيBiofilm وبنسبة ( 100%) .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق Fim وPap Gباستخلاص الـ DNA البكتيري بوساطة ( Geneaid Kit ) ومن ثم اخضاع الـ DNA لاختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي ( PCR) . استعملت طريقة تفاعل البوليمر لسلسة الدنا PCR للكشف عن نوعين من عوامل الضراوة الجينية التي تمتلكها بكتريا الـ E.coli بوصفها المسبب الاكثر اهمية لالتهابات المسالك البولية وباستعمال بادئات متخصصة لكل جين ، اذ اظهرت النتائج وجود جين Fim (H) بنسبة 100% ، في حين كان وجود pap G ( I) بنسبة 19.4% ، وكان pap ( III) بنسبة 38.8% في حين كانت نتائج الفحص سالبة للجين pap G (II) . | The Present study included 72 Isolates of Escherichia coli from clinical sample were taken from children with urinary tract infection, whom they were under the age of five year , male and female, taken from ( Ibn Al - balady Hospital for Children), ( Al - Imamayn Al - Khademayn Teaching Hospital) and (Al - A’lwayya Hospital for Children), in the period from 1/11/2014 to 28/2/2015. The bacterial diagnosis depended on microscopic and Cultural specifications, Using the biochemical examinations and the final exact examination of the isolated bacteria by using (ApI 20E) examination system. The study results showed that the infection in the urinary tract of females were 54.2% of 39 isolated bacteria and that of males were 45.8% of 33 isolated bacteria.The Antibiotic susceptibility of .isolated bacteriad one according to Kirby Bauer testing , showed a high degree of , resistance100% to the ceftazidime and ampicillin , while resistance to trimethoprim, amikacin, aztreoname, tobramycin , gentamycin and Pipracillin were 83.3,81.9%, 72.22%,70.8% , 68.5%,65.5respectively.All isolates showed susceptibility 0% to the impenem and meropenem antibiotics .The result of virulence factors of E.coli isolates show indicate the ability 59.7% of isolates produce hemolysin .The isolated bacteria of E.coli showed containing two types of adherence factors CFA/I and CFA/III, and the two ratios were 91.6% and 62.5% respectively. All the isolated bacteria showed that the ability of adherence to epithelial cells of the urinary tract was 100%.All the isolated bacteria showed that the ability to produced Biofilm were 100%.The molecular examination of the genes for adherence factors was made by taking out the bacterial DNA by (Geneaid Kit) and then, the DNA was put to the test of polymerase chain reaction (PCR). Polymerase chain reaction (PCR) was used to find out two types of adhesion factors, Fim (H)and Pap G genes, as they were the cause of the most common urinary tract infections by using specialist primers for each gene. The results showed the existence of Fim (H) gene was 100%,while were Pap G(I) gene 19.4%, Pap(III) gene38.8%, and the results of the test of Pap G(II) gene were negative to all isolates .

بيئة وحياتية سمكتي الكارب الكرسين Carassius carassius (L.1758) والخشني Liza abu (Heckel,1843) في ذراع الثرثار - دجلة ونهر دجلة == Ecology & Biology to Crucian Carp Carassius carassius L. and Khishni Liza abu (Heckel,1843) in Tharthar arm & Tigris River

Author name: علي عودة شاوردي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | عامر علي الشماع
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية اختيار اربع محطات اثنتين منها على ذراع الثرثار واثنتي على نهر دجلة لاجراء مقارنة عدد من العوامل البيئية مثل درجة الحرارة والاوكسجين الذائب وتركيز الاس الهيدروجيني والملوحة والشفافية واجراء مقارنة اخرى لكمية الهائمات النباتية والحيوانية واحياء القاع. فضلا عن دراسة حياتية نوعين من الاسماك هما سمكة الكارب الكرسين Carassius carassius L. والخشني Liza abu (Heckel,1843) والمتمثلة بدراسة العمر والنمو والتغذية والتكاثر في بيئتين مختلفتين هما ذراع الثرثار ونهر دجلة مع تشخيص لانواع الاسماك المتوافرة في نهر دجلة ضمن حدود مدينة بغداد.جمعت العينات ابتداء من شهر اذار 2004 وحتى كانون الثاني 2005 بالنسبة لدراسة العوامل البيئية وحياتية النوعين اعلاه وبواقع نموذج واحد لكل شهرين. تراوحت درجة حرارة المياه في منطقتي الدراسة بين 10م كادنى قيمة خلال شهر كانون الثاني و28م كاعلى قيمة لها خلال شهر تموز على الذراع واتخذت نمطا متشابها لها في الموقعين المدروسين وتراوحت قراءات قرص ساكي بين 28سم في خلال شهر ايلول في نهر دجلة و242سم خلال كانون الثاني على الذراع. كما تراوحت تراكيز الاوكسجين الذائب في الماء بين 6 ملغم/لتر خلال شهر تشرين الثاني على الذراع و10.8ملغم/لتر كحد اعلى في المحطة نفسها خلال ايار على الذراع ايضا. كما سجلت اعلى قيم الملوحة في الذراع) خلال اذار 2004 اذ بلغت قيمتها 1.422 غم /لتر. بينما سجلت ادنى مستوى لها على نهر دجلة خلال شهر تشرين الثاني اذ بلغت 0.480غم /لتر. وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني pH بين 6.6 في المحطة (4) على نهر دجلة خلال شهر كانون الثاني، و8.4 خلال شهر تشرين الثاني على ذراع الثرثار .واوضحت الدراسة ان التواجد السنوي للهائمات النباتية في ذراع الثرثار اقل منه في نهر دجلة، وسجلت الدايتومات Bacillariophyceae تواجدا عاليا مقارنة بصنوف الهائمات النباتية الاخرى مسجلة النسب 92.56%، 92.01%، 96.35% ، 95.45% في محطات الدراسة الاربع على التوالي. جاءت بعدها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. وسجلت الهائمات الحيوانية اعلى نسب تواجد لها في نهر دجلة مقارنة بالذراع وجاءت الدولابيات في المرتبة الاولى 91.65%، 86.65% في الذراع 91.87%، 89.42% في نهر دجلة تلتها مجدافية الاقدام. وسجلت احياء القاع اعلى تواجد لها في الذراع 336 فرد/م2 ، 286 فرد/م2 بينما سجلت 126 فرد/م2 ، و178 فرد/م2 في محطتي نهر دجلة على التوالي. تراوحت الاطوال الكلية لسمكة الكارب الكرسين على الذراع بين 7.0 - 27.5 سم واوزانها بين 5 - 300غم وفي نهر دجلة بين 7.5 - 23.25سم و65 - 210.5غم للاطوال والاوزان على التوالي. كما بينت الدراسة ان نمو سمكة الكارب الكرسين ليس قياسيا. وان نموها في الذراع ونهر دجلة كان لصالح الوزن ، اذ بلغت قيمة (b) في اسماك الذراع (3.62) و(3.40) لاسماك الذراع ونهر دجلة. اما سمكة الخشني فتراوحت اطوالها بين 8.0 - 17.9سم واوزانها بين 7.0 - 95.0غم في الذراع وبين 9.0 - 15.5 سم و8.5 - 55.5غم في نهر دجلة للطول والوزن الكلي على التوالي. وبينت الدراسة زيادة في نمو الاسماك باتجاه الزيادة في مكعب الطول على حساب الوزن. وان معدل نموها النسبي في ذراع الثرثار افضل حالا منه في نهر دجلة اذ كانت قيمة (b) لاسماك الخشني المصيدة في الذراع (2.90) وفي نهر دجلة (2.80). تراوحت شدة التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 10.83 و23.33 درجة/سمكة. ولسمكة الخشني بين 9.75 و25.71 درجة /سمكة. بينما تراوح نشاط التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 33.33% و100% ولسمكة الخشني 81.81% و100%، وان سمكة الكارب الكرسين قارتةOmnivorous وتميل بشكل كبير الى الغذاء النباتي الاصل وقد شكل الفتات العضوي الجزء الاكبر من غذائها في كلا الموقعين المدروسين تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة، ولم تختلف مفردات غذائها المتناول في كلا المسطحين المدروسين. كما بينت الدراسة ان سمكة الخشني هي قارتة ايضا Omnivorous تعتمد في غذائها على المصادر ذات الاصل النباتي وان الفتات العضوي هو المكون الرئيس في غذائها الذي حل بالمرتبة الاولى تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. ولم يحصل اختلاف في نوع غذاء هذه السمكة في موقعي الدراسة. وتبين الدراسة ان كلتا السمكتين المدروستين تتناولان غذاءهما من القاع او قريبا منه. اوضحت الدراسة ان نسبة الجنس لسمكة الكارب الكرسين في ذراع الثرثار2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 1.8 : 1 وان لهذا النوع قمة اطلاق واحدة تمتد من منتصف ايار ولغاية تموز وان التبويض فيها حصصي. وان خصوبة هذا النوع عالية وان البيئتين ملائمتان لتكاثر هذا النوع اما عن تكاثر سمكة الخشني فقد بلغت نسبة الجنس في الذراع 2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 2.11 : 1 وان لهذا النوع دورة تكاثرية متتابعة تستمر عاما كاملا ولها قمة اطلاق واحدة تمتد من شهر شباط ولغاية شهر اذار وان التبويض فيها حصصي وقد تصل الى ثلاث دفعات . وتمتاز بخصوبة عالية.

دراسة بكتيريولوجية وجزيئية للنوع Proteus mirabilis المعزولة من مصادر سريرية وحيوانية == Bacteriological and molecular study of Proteus mirabilis isolated from clinical and animal sources

Author name: علي سعد كاظم حسين
Supervisor name: محمود ابراهيم اسماعيل
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الجانب الاول : شمل هذا الجانب عزل وتشخيص البكتيريا Proteus mirabilis من 801 عينة تضمنت 179 عينة سريرية مختلفة (البول، الاذن والجروح) و622 عينة حيوانية مختلفة (براز الدجاج، مستقيم الابقار، مستقيم القطط ومستقيم الكلاب) جمعت من محافظة بغداد للمدة من 26/10/2015 الى 29/3/2016. بعدها درست الحساسية للمضادات الحيوية وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : .1 88 عزلة بكتيرية تعود للنوع P. mirabilis تضمنت 51 (28.49%) عزلة من العينات السريرية و37 (5.95%) عزلة من العينات الحيوانية وشخصت باستعمال طرق التشخيص التقليدية وعدة الفايتك كما تم تاكيد تشخيصها باستخدام البادئ النوعي للجين 16SrRNA للكشف عنه في جينوم البكتيريا بتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل اذ اظهرت نتائج التشخيص الجزيئي ان جميع العزلات البكتيرية امتلكت الجين .16SrRNA 2. بينت نتائج فحص حساسية عزلات P. mirabilis (88 عزلة) للمضادات الحيوية بطريقة انتشار القرص انها امتلكت المقاومة المتعدة لـ )2 - 8( من المضادات الحيوية المختبرة. كما وجد ان اقل معدل مقاومة لعزلات P. mirabilis السريرية كان لمضادات ciprofloxacin (3.9%) وnorfloxacin (7.8%) وimipenem (9.8%) بينما اقل معدل مقاومة للعزلات الحيوانية كان لمضادات cefoxitin (0%) وamikacin (2.7%) وciprofloxacin (5.4%) وcefepime وimipenem وlevofloxacin (8.1%) لكل منها. الجانب الثاني : شمل الكشف عن بعض عوامل الضراوة ظاهريا والكشف الجزيئي عن ثلاثة جينات مرتبطة بعوامل الضراوة وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : 1. بينت نتائج فحص انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف لبكتيريا P. mirabilis بطريقة القرص التازري المزدوج ان 52.49% (27/51) و48.65% (18/37) من العزلات السريرية والعزلات الحيوانية على الترتيب كانت موجبة للفحص.2. بينت نتائج فحص الفعالية الانحلالية للهيمولايسين لعزلات P. mirabilis على اطباق اكار دم الانسان واطباق المعايرة الدقيقة لدم الانسان والارنب ان 66/88 (75%) عزلة منها كانت محللة للدم من نوع الفا وبيتا على اطباق اكار الدم كما انها اعطت معيارا انحلاليا للدم تراوح بين (16 - 256)، كما وجد ان 22/88 (25%) عزلة لا تمتلك فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر على اطباق اكار الدم ولا على اطباق المعايرة الدقيقة. اظهرت نتائج الكشف الجزيئي عن الجين hpmA (الذي يشفر الى انتاج الهيمولايسين) ان جميع العزلات التي اعطت فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر امتلكت الجين hpmA بينما 19/22 من هذه العزلات التي لم تعط فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر كانت لا تمتلك جين الهيمولايسين gene) .(hpmA3. بينت نتائج فحص تكوين الغشاء الحيوي لبكتيريا P. mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة وعند الطول الموجي 630 نانوميتر ان جميع العزلات (88/88) كانت مكونة له. اذ ان 53.41% (47/88) من العزلات كانت مكونة للغشاء الحيوي بدرجة قوية و25% (22/88) بدرجة متوسطة و21.59% (19/88) بدرجة ضعيفة.4. بينت نتائج فحص انتاج انزيم البروتيز لبكتيريا P. mirabilis على اطباق اكار الحليب الفرز والكشف الجزيئي عن الجين zapA (الذ يشفر الى انتاج البروتيز) ان 82/88 (93.18%) عزلة منها كانت منتجة لانزيم البروتيز على اطباق اكار الحليب الفرز وتمتلك الجين zapA بينما 6/88 (6.82%) عزلات كانت غير منتجة لانزيم البروتيز ولا تمتلك الجين zapA، اي يوجد تطابق مابين الكشف الظاهري والكشف الجزيئي عن الجين zapA.5. بينت نتائج الكشف الجزيئي عن عامل الضراوة الجين ucaA (الذي يشفر الى الهدب UCA) ان جميع عزلات P. mirabilis (88/88) كانت تمتلك هذا الجين.6. بينت نتائج فحص انزيم اليوريز لبكتيريا P. mirabilis على وسط اكار اليوريا ان جميع العزلات (88/88) كانت منتجة له وبسرعات مختلفة. | A. Part One included isolation and identification of Proteus mirabilis from 801 samples, including 179 clinical various samples (urine, ear and wounds) and 622 animal (chicken faeces, cows rectal, cats rectal and dogs rectal) various samples were collected from Baghdad province during the period from 26 - 10 - 2015 to 29 - 3 - 2016. Then, their antibiotic sensitivity was studied. This part concluded the following results : 1. 88 bacterial isolates belong to P. mirabilis species included 51(28.49%) isolates from clinical sources and 37 (5.95%) isolates from animal sources were identified by conventional method, Vitek - 2 compact system and confirmed by using specific primer to detect 16SrRNA gene in bacterial genome by polymerase chain reaction technique. Results of molecular identification showed that all these bacterial isolates were possessed this gene (16SrRNA). 2. The results of sensitivity test by disc diffusion method showed that P. mirabilis isolates were multidrug resistant to (2 - 8) from antibiotics tested. The lowest resistance rates for clinical P. mirabilis isolates were (3.9%) for ciprofloxacin, (7.8%) for norfloxacin and (9.8%) for imipenem while animal isolates showed lowest resistance rates : (0%) for cefoxitin, (2.7%) for amikacin, (5.4%) for ciprofloxacin, (8.1%) for each one of cefepime, imipenem and levofloxacin.B. Part Two consisted of a study of some phenotypic virulence factors and molecular detection of 3 genes associated with virulence factors. This part concluded the following results : 1. The results of extended spectrum - β lactamases test by double disk synergy test revealed that 52.49% (27/51) and 48.65% (18/37) of clinical and animal P. mirabilis isolates were respectively positive for the test. 2. The results of hemolytic activity tests of P. mirabilis isolates on human blood agar plates and hemolytic microtiter plates showed that 66/88 (75%) isolates were alpha - and beta - hemolytic on human blood agar plates and they were giving measurable hemolytic titer between (16 - 256), and 22/88 (25%) isolates did not give hemolytic activity. Results of molecular detection of hpmA gene showed that all isolates were giving hemolytic activity possessed the hpmA gene while 19/22 of these isolates did not give hemolytic activity and did not possess the hemolysin gene (hpmA gene).3. The results of biofilm formation test of P. mirabilis by microtiter plates at wave length 630 nm showed that all isolates (88/88) were positive for the test, results showed a strong biofilm formed was 53.41% (47/88), moderate biofilm was 25% (22/88) and weak biofilm was 21.59% (19/88).4. The results of protease production test of P. mirabilis isolates on skim milk agar and results of molecular detection of zapA gene (protease gene) revealed that 82/88 (93.18%) isolates of P. mirabilis were positive for protease test and they were possessed the protease gene. While 6/88 (6.82%) isolates were negative for protease test and did not possess protease gene, there is congruence between phenotypic and molecular detection of zapA gene.5. The results of molecular detection of virulence factor ucaA gene showed that all of the P. mirabilis isolates (88/88) were possessed this gene.6. The results of urease test of P. mirabilis isolates on urea agar plates showed that all of the isolates (88/88) were positive for the test.

تاثير الكليبوسين المنقى جزئيا من البكتريا المعزولة محليا Klebsiella pneumoniae على بعض البكتريا المعوية وعلى بعض الخلايا المناعية == Effect of Klebocin partialy purified from bacteria Klebsiella pneumoniae Local Isolated on some enteric bacteria &on some immune cells

Author name: علي رزاق لفتة
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | عصام فاضل علوان الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 210 عينة سريرية توزعت الى 60 عينة ادرار و50 عينة قشع و50 عينة من التهابات الاذن الوسطى و50 عينة من اصابات الجروح ومن خلال نتائج الزرع البكتريولوجي على اوساط الماكونكي واكار الدم ووسط Eosin Methylen Blue , والتشخيص المظهري والكيموحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام Api20 تم الحصول على 42 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella توزعت الى 23 عزلة بنسبة 54.76% تعود للنوع K.pneumoniae و11 عزلة وبنسبة 26.19% للنوع K.oxytica و8 عزلات وبنسبة 19.05% تعود للنوع K.planticola ، لقد تم التحري عن العزلات المنتجة للكليبوسين ومن خلال تم التوصل الى ان 8 عزلات فقط كانت منتجة للكليبوسين من اصل 23 عزلة هذا وبنسبة 34.78% ، وكان وسط Tryptic soy broth المضاف اليه خلاصة الخميرة بنسبة1% افضل وسط لانتاج الكليبوسين وتعد طريقة اقراص الاكار ملائمة للتحري عن العزلات المنتجة للكيبوسين وطريقة التخطيط المتقاطع كفوءة للتحري عن العزلات الدالة . اختيرت العزلة المنتجة K. pneumoniae 8 كافضل عزلة منتجة للكليبوسين والعزلة K. pneumoniae 2 كافصل عزلة دالة ، تلاها استخلاص الكليبوسين من العزلة المنتجة بعد ان تم حث العزلة بالمايتوماسين سي فكانت فعالية 80 وحدة/مليلتر والفعالية النوعية 800 وحده/مليغرام بروتين . نقـي الكليبوسين المنتج من العزلة المنتخبة بخطوات عدة تضمنت التركيز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسب اشباع 70% وكحول البيوتانول بنسبة 1 : 1 فكان الترسيب بالبيوتانول افضل من الكبريتات الامونيوم اذ بلغت الفعالية 640 وحدة/مليلتر وبفعالية نوعية 2560 وحدة/مليغرام بروتين ثـم تقنيتي كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستعمال المبادل DEAE - Cellulosو الترشيح الهلامي علـى عمـود السيفاكريلS - 200 . وكانت عدد مرات التنقية للكليبوسين بمقدار 10 والحصيلة للكليبوسين المنقى 6%.تم دراسة تاثير الكليبوسين المنقى على بعض انواع البكتريا المعوية المقاومة للمضادات الحياتية والتي شملت : Enterobacter sakazaki Shigella flexneri, E.coli, Citrobacter koseri, , Enterobacter cloacae K.oxytoca, Proteus mirabilis Serratia marcescens, , Enterococcus fecalis Salmonella typhi واظهرت النتائج ان Enterococcus fecalis وCitrobacter koseri, وProteus mirabilis كانت مقاومة لتاثير الكليبوسين المنقى في حين بقية الانواع تاثرت وكان تركيز 100مايكروغرام/مليلتر اكثرفعالية من بقية التراكيز حيث بلغ قطرالتثبيط 20ملم تجاه النوع K.oxytoca تلاها E.coli بقطر 17ملم ثم Shigella flexneri بقطر 15ملم ثم Enterobacter sakazaki بقطر 15 ثم Salmonella typhi بقطر 14 ملم ثم Enterobacter cloacae بقطر 12ملم ثم Serratia marcescens بقطر 12ملم . استعملت تراكيز التالية 10 ، 30 ، 50 مايكروغرام/مليلتر في دراسة التاثير السمي للكليبوسين على بعض الخلايا المناعية من خلال ملاحظة عيوشية تلك الخلايا وقد تم توصل الى عدم وجود تاثير للكليبوسين بتركيز 10 مايكروغرام/مليلتر على شكل وحجم الخلايا PMNs وقدرتها على بلعمة خميرة الكانديدا المقتولة اذ اظهر التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية (0.05< P) مقارنة مع معامل السيطرة . بينما حفز التركيز نفسه قدرة PMNs على قتل الخميرة الحية في الزجاج ، مما يدل على ان الكليبوسين المنقى من K. pneumoniae 8 يعمل على تحفيز الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية . اما التراكيز العالية للكليبوسين المنقى من العزلة المحلية K. pneumoniae 8 فانها سببت تثبيطا ملحوظا لفعاليات الخلايا PMNs واللمفاوية التي اختيرت في هذه الدراسة. | The study has included collecting (210) clinical samples distributed into (60) urine samples, (50) sputum samples, (50) otitis media samples, and (50) wounds infections samples. Through results obtained from bacteriological culture on McConkey, blood, and eosin methylene blue agars in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20E system. Fourty tow Klebsiella isolates distributed into (23) K. pneumonia isolates that represent (54.76%), (11) K. oxytoca isolates that represent (26.19%), and (8) K. planticola isolates that represent (19.05%). Then, the klebocin - producing isolates have been detected and through which it is clear that only (8) isolates produce klebocin in (23) isolates, of percentage (34.78%). Tryptica soy broth medium with yeast extract additive in percentage of (1%) was the best medium for production of klebocin, agar discs method was the best method for klebocin - producing isolates detection, and cross - streaking method was the best method for indicating isolates detection. The producing isolate, K. pneumonia 8, and the indicating isolate, K. pneumonia 2, were chosen as the best producing and indicating isolates respectively. Next, the klebocin has extracted from the producing isolate after isolate induction by Mitomycin C; consequently, the activity was (80) unit/ml and the specific activity was (800) unit/mg of protein. The produced klebocin has been purified from selected isolates via several methods including precipitation utilizing ammonium sulfate in saturation percentage of (70%) and butanol alcohol; as a result, the butanol precipitation was better than that in ammonium sulfate so that the activity reached (640) unit/ml with specific activity of (2560) unit/mg of protein. Then, the second method was purification by ion exchange chromatography using exchanger (DEAE - Cellulose) and the third one was gel filtration over sefacryl S - 200 column. The times of purification of klebocin were (10) and the gain of purified klebocin was (6%). The purified klebocin effect has been studied on group of enterobacteria resisting for antibiotics including Acinetobacter, Escherichia coli, Shigella flexneri, Enterobacter sakazaki, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter cloacae, Citrobacter koseri, Salmonella typhi, Enterococcus faecalis, and Serratia marcescens. The results show that Enterococcus faecalis, Citrobacter koseri and Poteus mirabilis were resistant to the effect of the purified klebocin; however, all the remaining isolates affected. The concentration of (100) µg/ml has more activity than the remaining concentrations so that the inhibition diameter reached (20) mm in the species K. oxytoca, followed by E. coli with diameter of (17) mm, then Shigella flexneri with diameter (15) mm, then Enterobacter sakazaki with diameter (15) mm, followed by Salmonella typhi with diameter (14) mm, then Enterobacter cloacae with diameter (12) mm, followed by Serratia marcescens with diameter (12) mm. Of concentrations of (10, 30, 50) µg/ml, the toxic effect of klebocin on immune cells has been studied through viability of these cells; the study achieved that the klebocin in concentration of (10) µg/ml did not affect on the shape and size of phagocytic cells and its ability of phagocytosis of killed Candida yeast; so that, statistical analysis showed that there is no significant differences (P>0.05) comparing with control factor. However, the same concentration stimulate the macrophages ability of killing living yeast in vivo, which indicate that the purified klebocin from K. pneumonia 8 works on stimulating humeral and cellular immune response. Nevertheless, the high concentrations of purified klebocin from the local isolate, K. pneumonia 8, caused noticed inhibition to activities of macrophages and lymphocytes selected in this study.

بعض الجوانب المرضية للمصابين بالحمى غير معروفة الاسباب == CERTAIN PATHOLOGICAL ASPECTS ON FEVER OF UNKNOWN ORIGIN PATIENTS

Author name: علي جبار عليوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على ثلاث مجاميع مختلفة، كانت المجموعة الاولى بعدد 59 مريض بالحمى غير محددة الاسباب (FUO) والمجموعة الثانية بعدد 20 مريض بحمى مشخصة (febrile) والتي اعتبرت لمعاملات سيطرة للمجموعة الاولى، اما المجموعة الثالثة بعدد 20 شخص، كانوا اصحاء ظاهريا وتمثل مجموعة السيطرة للدراسة.تمت المتابعة واخذ العينات من المرضى والعمل عليها في مستشفى الكاظمية التعليمي، بغداد.لقد عانى مرضى FUO من اعراض مالوفة مثل الحمى المستمرة والمتقطعة، الصداع، الم الصدر، الم المفاصل، نقصان الوزن وضعف عام وفقدان الشهية وغيرها، وعلامات مرضية منها الم في الضغط على البطن، وتضخم الطحال، واليرقان، وتورم الساق وتقرحات اللسان والجلد. ان مجموعة مرضى FUO اشتركوا كون جميعهم يعانون من الحمى التي تراوحت مدتها من شهر الى ستة اشهر.تم التعرف على الاعراض السريرية من قبل الاختصاصي الموجود واجريت فحوصات المختبرية لجميع المرضى الراقدين والمشمولين بالدراسة اضافة الى فحوصات من مراكز بحثية اخرى ذات صلة بالموضوع.ان البيانات المتحصل عليها اخضعت للتحليل الاحصائي المناسب وبمختلف الطرق.اظهرت الدراسة بان مرضى FUO بسبب الاصابات المرضية المعدية يشكلون (n = 43)% 72.8) من العدد الكلي لهم (59) ثم قسموا بعد التشخيص النهائي بحسب المرض المعدي الى مرضى الحمى المعوية Enteric fever بواقع (n= 14)% 23.7 ومرضى ذات الرئة والتهاب القصبات بنسبة (n= 11) 18.6%، اما نسبة (n=6) 10.1% من المرضى فقد كانت متساوية لكل من مرضى التدرن الرئوي Tuberculosis(TB)، والتهاب المجاري البولية Urinary tract infection(UTI) ومجموعة اصابات مرضية اخرى Other infections. ومن خلال الدراسة ايضا ظهرت نسبة من المرضى (n=16) 27.12 بسبب امراض اخرى وبنسب مختلفة كما في امراض النسيج الوعائي Collagen vascular diseases (n= 4) 6.7%، ومرض التهاب بطانة القلب Endocarditis (n= 3) 5%، ومرضى الامراض الخبيثة Malignancies (n= 2) 3.3% واخيرا نسبة (n= 7) 11.8% من مرضى FUO هم المرضى غير المشخصين. ان مناقشة اربع من الثوابت الرئيسة المدروسة لها اهمية في التفريق بين مختلف حالات FUO وهذه الثوابت هي : 1 - الثوابت الدمية Haematological parameters.2 - الثوابت الكيموحيوية Biochemical parameters.3 - الثوابت المناعية Immunological parameters.4 - الثوابت الجرثومية Microbiological parameters.1 - اهمية الثوابت الدمية : كانت اعلى قيمة لنتائج فحص معدل ترسيب كريات الدم الحمراء Erythrocyte sedimentation rote (EsR) عند مرضى المناعة الذاتية، وذات معنوية قليلة لهذا الثابت عند مختلف حالات FUO الاخرى.2 - اهمية الثوابت الكيموحيوية : لقد اظهرت البيانات بان مصل مرضى FUO له اهمية كبيرة في تقسيمهم من خلال تقدير اليوريا، والكرياتينين، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي، والبيليروبين الكلى، والالبومين، وتسبق الالبومين الى الكلوبيولين، في مصل هؤلاء المرضى.كما ان الترحيل الكهربائي لمصل مرضى FUO اظهر ارتفاعا في قيم α - 2 globulin, α - 1 globulin، مابين مصل مرضى FUO كما في مصل مجموعة الامراض الخبيثة، في حين هنالك ارتفاعا في قيمة β - globulin في مصل مرضى التهاب المجاري البولية، وارتفاعا في قيمة gammaglobulin بدليل زيادة اضداد IgM، وIgG في مصل مرضى المناعة الذاتية مقارنة مع مرضى FUO الاخرين.3 - اهمية الثوابت المناعية : اظهر فحص مصول مرضى FUO اعلى القيم لمختلف الاضداد ومنها Antistreptolysin O titer، وAntiproteinase antibodies، وAntimyeloperoxidase antibodies، وC - reactive protein، وRheumatiod factor وحسب المرض المشخص.ان مصل مرضى حمى التايفوئيد اظهر ارتفاعا في تركيز IL - 1α (72.2 pgm/ml) مقارنة مع مرضى FUO للاخرين، وكذلك ظهرت وزيادة في قيم كل من (CD25) IL - 2 receptor، وIL - 2 (153.2 pgm/ml، 8.6 pgm/ml على التوالي). في حين وجد اقل تركيزيين لـ(IL - 1α، IL - 2) في مصل مرضى الامراض الخبيثة.4 - اهمية الثوابت الجرثومية : اظهر الفحص الجرثومي تشخيص عزلات بكتريا بنسبة 40% Gram positive diplococci، وبنسبة 20% لكل من Gram negative bacilli، وGram positive cocci. ان نتائج زرع الدم لمرضى FUO اظهرت عزلات بكتريا بنسبة 33.3% لكل من Salmonella spp.، وStaphylococcus aureus، وEnterobacter spp. والمسؤولة عن امراض Salmonellosis، وEndocarditis وامراض بكتيرية اخرى.كما تم عزل كل من بكتريا Enterobacter spp.، وPseudomonas aeruginosa، وpneumoiae Streptococcus من عينات السائل الخلبي Pleural fliud وعلى ما يبدو فانهم العاملين المسببين لمرض ذات الرئة Pneumonitis ومرض التهاب الخلب Pleuritis بنسبة 33.3% من الزرع الكلى الموجب لعينات السائل الخلبي للمرض.اما بشان نتائج زرع الادرار الموجب فقد تم عزل وتشخيص كل من بكتريا Staphylococcus aureus، وE. coli، وKlebsiella spp. والتي تمثل نسبة 33.3% من الزرع الكلى لادرار المرضى والمسببة لمرض التهاب المجاري البولية (UTI).وعند زرع المسحات المختلفة (مسحات الجروح والقرح) تم تشخيص عزلات كل من بكتريا E. coli، وPseudomonas aeruginosa وهما العاملين المسببين الرئيسيين لمرض التهاب النسيج الخلوي Cellulitis.اظهرت نتائج اختبار حساسية العزلات للمضادات الحيوية بان المضاد الحيوي Amikacin يمتلك اعلى فعالية وبنسبة 88.9% ويليه المضاد الحيوي Ciprofloxacin بنسبة 58.3% تجاه العزلات المدروسة، في حين المضادين الحيويين Gentamycin، وCefotaxim كانا اقل فعالية تجاه العزلات وبنسبة 20% و12.5% على التوالي. | The importance of microbiological parameters : Bacterial isolates of sputum sample phowed that there was a 40% graw positive diplococci, gram positive cocci and gram negative bacilli showed a percentage of 20% of each.Blood culture for FUO patients demonstrated a 33.3% for each isolate of sacmorella spp., staphylococcus aurens, and Enterobacter spp., which they may be responsible for salmonellosis, endocaraditis and other bacterial infection diseases.Entarobater spp., Psendomonas aeruginosa as well as streptococcus pneumocial were isalated from a pleural fluid sample and it seems to be camsative agent for pneumonitis and pheuritis, this cause repersnet 33.3% out of the total preural fluid culture results.Urine culture results showed a positive culture result of Staphylococcus aureus, E. coli and Klebsiclla spp., and is considered as a causative agent for Urinary tract infection. This positive result represent about 33.3% of the total urine culture result wound and ulcer swabs showed a detection of E. coli and psendamamas areaginosa isolate which are the main causative agent for cellulites. Arihibiotic sensitive result showed that amikacim has the highest antibiotic activity 88.9% followed by ciprofloxacin 58.3%, while Gentamycin and cefotaxime revealed a 20% and 12.5% respectively

تاثير تجريع الفئران الحوامل بعقار اللاموترجين على التغييرات النسيجية لخصى الذرية == THE EFFECT OF LAMOTRIGINE ADMINISTERED TO PREGNANT MICE ON HISTOLOGICAL CHANGES OF OFFSPRING TESTES

Author name: علي ابراهيم محمد السماوي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الخلفية العلمية : يعد عقار اللاموترجين ( Lamotrigine ) من اكثر العقاقير الحديثة المستخدمة على نطاق واسع في الوقت الحالي لعلاج مرضى الصرع ولعلاج الاكتئاب ثنائي القطب , ويعد هذا العقار ملائما للاستعمال لدى البالغين والاطفال على حد سواء , اما بالنسبة للنساء الحوامل فتضعه منظمة الغذاء والدواء العالمية ضمن فئة ( سي ) حيث لا توجد لغاية الان دراسات كافية تؤكد سلامة هذا العلاج على الجنين وفيما اذا كان الخطر على الجنين يفوق المنفعة العلاجية بالاضافة الى منع استخدامه اثناء الرضاعة وذلك لان العلاج يفرز في حليب الام المرضع.الهدف من الدراسة : تهدف هذه الدراسة لبيان مدى التاثير السلبي لمتعاطي هذا العقار اثناء فترة الحمل بالنسبة الى الام الحامل والاجنة . وكذلك تهدف الى دراسة التغيرات الشكلية والنسيجية لخصى الاجنة اثناء استخدام الام الحامل هذا العقار .طرائق العمل : ان الحيوانات المختبرية المستخدمة في هذه الدراسة هي الفئران السويسرية البيض ( Swiss - webster ) اذ استخدم مائة وثمان واربعين انثى حبلى بعمر ( 15 - 16 اسبوع) وقد قسمت الاناث الحوامل الى اربعة مجاميع , المجموعة الضابطة اعطي لها محلول فسلجي ملحي والمجاميع الثلاث الاخرى اعطي لها عقار اللاموترجين بواقع (5 , 10 ,20 ) ملغرام لكل كيلوغرام من وزن الجسم حيث كانت طريقة اعطاء العقار عن طريق الفم . تم تقسيم الفئران المختبرية الى مجموعتين رئيسيتين ,الاولى تم البدء بالتجريع من اليوم الاول من الحمل وتم جمع العينات (الاجنة ) في اليومين الرابع عشر او العشرين من الحمل . اما المجموعة الثانية فقد تم التجريع من اليوم السادس من الحمل الى اليوم الرابع عشر او اليوم العشرين على التوالي حيث تم جمع العينات (الاجنة) والبدء باجراء التحضيرات للفحص النسيجي .النتائج : تم تسجيل اوزان الاجنة باعمار (14 و20 ) يوم من الحمل وقد اظهرت النتائج انخفاض كبير في اوزان الاجنة في المجاميع المجرعة , حيث ظهرت هنالك فروق معنوية (P<0.05) بين هذه المجاميع والمجموعة الضابطة حيث وجد ان هنالك تناسب عكسي بين مقدار الجرعة المعطاة وبين اوزان الاجنة المختلفة. ومن خلال الفحص النسيجي للاجنة ,تم قراءة التغيرات النسيجية تحت المجهر الضوئي بعد ان تم تصبيغها بواسطة صبغة الهيماتوكسلين والايوسين ., كذلك بينت النتائج وجود تغيرات نسيجية واضحة بخصى الاجنة حيث ادى العقار الى التقليل من عدد واقطار النبيبات المنوية وكذلك تاثيرها على الخلايا الجنسية البدائية وعلى الخلايا الجرثومية للاجنة مقارنة مع الاجنة المعزولة من المجموعة الضابطة.الاستنتاجات : يستنتج في ضوء ما تقدم ان عقار اللاموترجين له العديد من التاثيرات الجانبية السلبية على الاجنة وبالتحديد على الجهاز التناسلي الذكري للاجنة في الفترة الجنينية وما قبل الولادة بالاضافة الى ملاحظة العديد من التشوهات الجنينية عند استخدام الجرعة عالية التركيز من العقار. | Scientific background : Lamotrigine (LTG) is one of the most modern drugs used widely at present days for treatment of patients with epilepsy and for the treatment of bipolar depression and it is suitable for use for both adults and children. The Food and Drug Administration (FDA) established lamotrigine within the category ( C ), where until now no sufficient studies confirm the safety of this treatment on the fetus and whether the risk for fetus is much higher than the beneficial therapeutic. Lamotrigine also, not recommended for use during lactation because the treatment is secreted in mother breast milk . Aims of the study : This study aims to demonstrate the extent of the negative impact of administration this drug during pregnancy on the mother and its fetuses. Also aims to study the morphological and histological changes induced by lamotrigine in the testis fetal mice .Materiales and method : One hundred forty eight healthy female mothered Swiss albino mice (Mus. musculus) (age : 15 - 16 weeks) and seventy four male albino mice (age : 15 - 17 weeks) were used in this study. In the first study include seventy nine pregnant mice, the drug administration started from ( day 1 ) ( next day of seeing the vaginal plug), and continue drug administration until fetal collection either at (day 14) or at ( day 20 ) of the gestation period. The pregnant mice were divided into four groups including, the control group was given a physiological saline solution and other groups were given lamotrigine doses ( 5,10 and 20 mg/kg ) orally. The second study include sixty nine pregnant mice, the administration started from ( day 6 ). As same as the first study, the administration continue until fetal collection either at ( day 14 ) or at ( day 20 ) of the gestation period and then the preparation for histological examination started .Results : After collection of fetuses at gestation periods (14 or 20 day) the weights of fetuses were recorded and the results showed significant difference (P<0.05) between each treated group in the body weight of fetuses (low, medium and high dose). Certainly, high dose group provides the higher reduction in the body weight among all treated group. Moreover, the histological examination of the fetuses were examined under light microscope after being staining with haematoxyline and eosin. The current study revealed significant reduction (P<0.05) in all testicular parameters of the fetus including for all treated groups as compared to the control group(number of spermatogoni cell /tubules, tubular radius, number of seminiferous tubules / fetus, spermatogonial cell height and germ cell height).Conclusions : This study concluded that Lamotrrigine has many teratogenic effects in dose - dependent manner on fetuses during in utero development on the testicular parameters.

تقييم بعض المؤشرات المناعية للنساء الحوامل المصابات بداء المقوسات == Evaluation of some immunological parameter in pregnant women infect with toxoplasmosis

Author name: علا هوال جاسم هذال التميمي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد داء المقوسات الكونيدية مرضا معديا مستوطنا واسع الانتشارفي كل انحاء العالم سببه الاصابة بطفيلي المقوسات الكوندية. ويعتمد انتشاره على العادات الغذائية للشعوب ,الظروف البيئية والموقع الجغرافي. اجريت الدراسة الحالية على 197 مريضة مشكوك باصابتهن بداء المقوسات واللاتي عانن من حالات الاجهاض او بدونه . اذ وجد ان 70 مريضة من اللواتي تمت احالتهن من قبل الاخصائية الى مستشفى فاطمة الزهراء)ع) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة لطفيلي المقوسات والتي تراوحت اعمارهن من 45 - 18 سنة للمدة من شهر تشرين الاول للعام 2013 ولغاية شهرشباط من عام 2014 . فضلا عن ذلك اختيرت 20 امراة من الاصحاء ولايمتلكن اجساما مضادة لطفيلي المقوسات واعتمدت كعينة سيطرة. اظهرت النتائج ان نسبة الخمج بالمقوسات 35.53 % باستخدام طريقة الاليزا(الامتزازالمناعي المقترن بالانزيم) وطريقة فحص التلازن اذ كانت نسبة الضد المناعي IgG 97.14 % ونسبة الضد المناعي IgM مع الضد IgG 4.29% , في حين ان نسبة الضد المناعي IgM 2.68% .ان مستوى الضدالمناعي IgG اعلى من مستوى الضد المناعي IgMفي مجموع النساء المصابات قيدالدراسة حيث اوضحت النتائج ارتفاعا معنوي(p< 0.05 ) في مستوى الضدIgG (5.461 ± 0.39 IU /ml) مقارنة مع السيطرة(0.159 ± 0.018 IU /ml) وارتفاعا معنوي(p< 0.05 )في مستوى الضدIgM( 0.420 ± 0.035 IU /ml)مقارنة مع السيطرة(0.161 ± 0.019 IU /ml).في حين لم يسجل فرق معنوي في معدل تركيز C3و C 4في كل من مجاميع المصابات والسيطرة. تضمنت الدراسة معرفة الحالة المناعية للنساء المصابات بداء المقوسات من خلال التحري عن مستوى البين ابيضاضي 5 و18 , اذ اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي (p< 0.05 ) في مستوى البين ابيضاضي 5 عند المصابات 805.70 ± 122.30 pg/ml) ) مقارنة مع السيطرة (126.62 ± 35.96 pg/ml) . في حين لم يسجل فرق معنوي في مستوى البين ابيضاضي 18 بين المصابات والسيطرة. وكذلك تم دراسة الخمج بداءالمقوسات وكل من العمرالحملي للجنين وعمر المصابات. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widly all over the world.The cause of it is the infection by parasite Toxoplasma gondii .Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition . The present study was conducted on 197 pregnant women infected by toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 70 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite .Their ages ranged between 18 - 45 years for the period from October 2013 to February 2014 Parallel to that ,20 healthy women were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infection by the parasite was 35.53% using ELISA and Agglutination methods .The perecentage of immunoglobulin G, immunoglobulin M with immunoglobulin G ,and immunoglobulin M antibody was 97.14%, 4.29% ,and 2.68% ,respectivel immunoglobulin G antibody titer was frequently higher than immunoglobulin M titer in the total studied sample., There was asignificant increase in mean concentration of immunoglobulin G (5.461 ± 0.39 IU /ml) during the infection compared to that in control group (0.159 ± 0.018 IU /ml), and significant increase in mean concentration of immunoglobulin M (0.420 ± 0.035 IU /ml) during the infection compared to that in control group (0.161 ± 0.019 IU /ml) also there were no significant differences in the mean concentration of C3 and C4 component of complement in both patients and control groups. The immunity of the patients was also studied by means of detection of the cytokines (interleukin - 5 and interleukin - 18) levels.These results showed a significant (p<0.05) difference in interleukin - 5 level between patients (805.70 ± 122.30pg/ml) and control group (126.62 ± 35.96pg/ml), the seroprevalence of T. gondii infection and gestational age of the fetus age and the age of the patients was also studied

تاثير ليزر ثاني اوكسيد الكاربون 10600 نانوميتر على حيوية وعوامل ضراوة بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية == Effect of CO2 Laser (10600) nm on Viability and Virulence Factors of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus

Author name: عقيلة عبد الزهرة علي
Supervisor name: ايمان ناطق ناجي البياتي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 60 مسحة من مرضى مصابين باخماج جروح العمليات وجروح الحروق وقرحة الفراش للفترة من شهرايلول ولغاية شهرتشرين الثاني لسنة2013 من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد تشمل : مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري للجراحات التخصصية ومستشفى الحروق التخصصي وقسم المختبرات التعليمية في مدينة الطب. زرعت المسحات على وسطي اكار الدم والماكونكي وشخصت باستخدام المعايير البكتريولوجية القياسية. تم تشخيص 40 عينة من مجموع 60 عينة على انها : 20عزلة تعود للنوع البكتيري Staphylococcus aureus و20عزلة تعود للنوع البكتيري Pseudomonas aeruginosa اعتمادا على طرق التشخيص المظهرية والمجهرية والكيموحيوية , واكد التشخيص باستخدام نظامي API Staphو .API 20 E تم اجراء اختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية باستخدام طريقة نشر القرص لجميع العزلات قيد الدراسة ضد 12 مضاد مختلف واظهرت النتائج ان نسبة مقاومة عزلات بكتريا Staphylococcus aureus للمضادات الحياتية كانت كالاتي : 100% لمضادات Methicillin, Piperacillin, Ceftriaxone وCeftazidim و80% لمضاد Tetracyclin و40% لمضادي Gentamycin وNorfloxacin و35%لمضاد Tobramycin و30% لمضاد Ciprofloxacin و15% لمضادAmikacin و0% لمضادي VancomycinوChloramphenicol اما نسبة مقاومة عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa للمضادات الحياتية كانت كالاتي : 100% لمضادات Carbencillin Cefepime,وCeftriaxone و70%لمضاد Amikacin و65% لمضادات Cftazidime,Tobramycinو Gentamycin و55% لمضادي Ciprofloxacin وNorfloxacin و50% لمضادي Piperacillin وImipenm و%30 لمضاد Aztreonam . تم اختبار بعض عوامل ضراوة العزلات البكتيرية والقابلية على تكوين الاغشية الحيوية واظهرت النتائج ان جميع عزلات بكتريا Staphylococcus aureus كانت منتجة لانزيم مخثر البلازما بينما 95% من العزلات كانت منتجة لانزيمات الهيمولايسين)الانزيم الحال للدم) والبروتيز(الانزيم الحال للبروتين) واللايبيز (الانزيم الحال للدهون) ولها القدرة على تكوين الاغشية الحيوية, من جهه اخرى فان جميع عزلات بكتيريا Pseudomonas aeruginosa كانت منتجة لانزيمات الهيمولايسين والبروتيز واللايبيز والصبغات خارج الخلوية بينما 95% من العزلات اظهرت القدرة على تكوين الاغشية الحيوية. اختيرت 12 عزلة للتشعيع بCO2 ليزر ,ست عزلات من بكتريا Staphylococcus aureus وست عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اعتمادا على نتائج اختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية وعوامل الضراوة عند كثافة الطاقة 20003000,2500, واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 60 و90 ثانية.اظهرت نتائج التشعيع ان CO2 ليزرادى الى تناقص في عدد CFU/ml عزلات بكتريا Staphylococcus aureus وبكترياPseudomonas aeruginosa واوضحت نتائج التحليل الاحصائي باستخدام تحليل التباين واقل فرق معنوي ان هناك فروقات معنوية P.value˂0.001في قيمةCFU/ml بين كثافة الطاقة 20003000,2500, واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 60 و90 ثانية خاصة عند كثافة الطاقة 3000واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 90 ثانية. بعد التشعيع تم اجراء فحص الحساسية للمضادات الحياتية وعوامل الضراوة للعزلات المشععة. تم الاستنتاج ان CO2 ليزر له تاثير قاتل على بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa دون التاثير على حساسيتهما للمضادات الحياتية وعوامل ضراوتهما الاخرى . | In this study sixty swabs were collected from patients suffering from surgical wound infections, burn infections and bedsore infections during the period from )September 2013 to November 2013( at many hospitals of Baghdad governorate including : Baghdad Teaching Hospital, Al - Shahid Ghazi Al - Harery Hospital for specialist surgeries, Burns Specialist Hospital and Teaching Laboratories Department in Medical City. All swabs were cultured initially on blood agar and MacConkey agar and diagnosed by standard bacteriological procedures. Forty samples out of sixty were identified as 20 isolates of Staphylococcus aureus and 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa using morphological, physiological and biochemical diagnosis and confirmed by API staph kit and API 20E respectively. The antibiotic susceptibility test was performed for Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates using disc diffusion test against 12 different antibiotics for both genera. The results illustrate that the resistance rates of Staphylococcus aureus isolates were : 100%(20/20) for methicillin, piperacillin ,ceftriaxone and ceftazidim; 80%(16/20) for tetracyclin; 40%(8/20) for norfloxacin and gentamycin; 35%(7/20) for tobramycin; 30%(6/20) for ciprofloxacin; 15%(3/20) for amikacin and 0%(20/20) for vancomycin and chloramphenicol antibiotics.While the resistance rates of Pseudomonas aeruginosa isolates were : 100% (20\20) for ceftriaxone, cefepime and carbencillin ; 70% (14/20) for amikacin; 65%(13/20) for tobramycin, ceftazidim and gentamycin ; 55%(11/20) for ciprofloxacin and norfloxacin; 50%(10/20) for Piperacillin and Imipenem; 30%(6/20) for aztreonam. All Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates were investigated for detection of some virulence factors and biofilm formation. The results revealed that all Staphylococcus aureus isolates (100%) were coagulase enzymes producer, while (95%) of the isolates were haemolysin, protease, lipase enzymes and biofilm producer. All Pseudomonas aeruginosa isolates (100%) were haemolysin, protease, lipase enzymes and extracellular pigments producer while (95%) of the isolates were biofilm producer. Twelve bacterial isolates, six isolates of Staphylococcus aureus and six isolates of Pseudomonas aeruginosa were selected for CO2 laser irradiation according to the results of antibiotic susceptibility test and virulence factors using output power from 4 - 6W corresponding to power densities (2000, 2500, 3000) W/cm2 with exposure time (60 and 90) second. The results of CO2 laser irradiation illustrated that CO2 laser irradiation lead to a reduction in the mean value of the viable number CFUs/ml of all bacterial isolates and the results of the statistical analysis, by using analysis of variance (ANOVA) one way and least significant differences - LSD, showed that there were high statistical significant differences reached to P ˂0.001 in the mean value of the viable number CFUs/ml between power densities)2000, 2500, 3000(W/cm2 and exposure time 60 and 90 second for all the bacterial isolates that were used in the current study especially at power density 3000 W/cm2 at exposure time 90 second. After irradiation, antibiotic susceptibility test and virulence factors were performed. The current study concludes that CO2 laser has bactericidal effect on Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates without any effect on their antibiotic susceptibility and virulence factors

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

Author name: عقيل محمود علي اللامي
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة العلاقة بين انتاج البروتسين وحركة بكتيريا Proteus spp المعزولة من المرضى وبعض صفاتها الحيوية == Study the relationship between proticine production and motion of Proteus spp isolates from patients and some biological characters

Author name: عقيل محمد مجيد حبيب العزي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على عشرين عزلة من بكتريا Proteus من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية عن طريق زرع احدى واربعين عينة ادرار, ومن مرضى مصابين بالتهابات الاذن الوسطى عن طريق زرع احدى وستين مسحة . زرعت عينات الادرار ومسحات الاذن على الوسطين الزرعيين وسط اكار الدم ووسط الماكونكي ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيميائية الحيوية لغرض تشخيص بكتيريا اﻠ Proteus , وتم تاكيد التشخيص باستخدام عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية API 20 E فقد تم تشخيص تسعة عشرة عزلة من البكتريا Proteus mirabiIis ( اربع منهاعزلت من عينات الادرار وخمسة عشرة عزلة من مسحات الاذن ) , وعزلة واحدة من بكتيريا Proteus vuIgaris من مسحات الاذن . فقد اخضعت العزلات البكترية الى اختبار الحساسية للمضادات الحيوية باستخدام المضادات الاتية : ,Pipracillin ,Amikacin ,Azithromycin Oxytetrayclin Gentamycin , , Naldixic acid , Azteroname , Cefotaxime , Ciprofloxacin , Imipneme , واظهرت النتائج تباينا واضحا في مقاومة العزلات المستخدمة اذ كان مضاد Imipneme من اكثر المضادات الفعالة تجاه تلك العزلات البكتيريةوبنسبة100%. تلاه مضاد Ciprofloxacinوبنسبة ( 95 % ) , بينما كانت البكتريا مقاومة بنسبة 100% لكل من المضادين Azithromycin , Oxytetracyclin .و اظهرت جميع العزلات مقاومةلاكثر من مضاد حيوي ( 2 - 8 مضادات). فقد اظهر قسم من العزلات , القابلية على انتاج البروتسين اذكانت سبعة عزلات منتجة للبروتسين بنسبة 35 % بطريقة التخطيط المتقاطع , وستة عشر عزلة منتجة للبروتسين بنسبة 80 %بطريقة الحفر , وكانت طريقة التخطيط المتقاطع اسهل طريقة للتحري عن فعالية البروتسين الخام في العزلات المنتجة. وقد اختبر ت قابلية عزلات بكتريا البروتيس على انتاج البروتسين تجاه بعض انواع من العائلة المعوية مثل E.coli , Acinetobacter baumannii , Klebsiella spp وكذلك Pseudomonas aeroginosa , ولم يظهر اي تاثير تثبيطي لعزلات البروتيس العشرين تجاه اي من عزلات الاختبار المذكورة في اعلاه , فيما اظهرت ثمانية عشرة عزلة من النوع Proteus mirabiIis وعزلة واحدة من النوع Proteus vulgaris (منتجة للبروتسين) تاثيرا تثبيطيا واضحا تجاه بعض عزلات الاختبار الموجبة لصبغة الكرام aureus Staphylococcus , Streptococcus pyogens , وكذلك خميرة Candida albicansوبنسبة 95 % . بينت النتائج وجود علاقة ايجابية بين مقاومة المضادات الحيوية وصفة انتاج البروتسين , فقد كانت عشرة عزلات من اصل 16 عزلة (5 . 62 % ) منتجة للبروتسين ومقاومة للمضادات الحيوية مما يؤكد العلاقة بينهما . واظهر اختبار دينس وجود تشابه كبير بين العزلات (3, 13) و( 9, 19 ) وتشابه في مقاومتها لمضادات Pipracillin , Gentamycin , Amikacin . حيث اوضحت النتائج وجود علاقة بين انتاج البروتسين والحركة التموجية لبكتيريا Proteus فقد كانت نسبة البكتيريا غير المتحركة بحركة تموجية ومنتجة للبروتسين (60%) فيما كانت نسبة المنتجة للبروتسين والمتحركة(20%) وغير المنتجة وغير المتحركة(20%) وغير المنتجة والمتحركة(0%) . | This study was carried out for Bacterial Isolation from different clinical sources. Twenty isolates of bacteria Proteus was isolaled from culturing 41 urine sample of urinary tract infection and 61 ear swabs from otitis media infection. Urine samples and ear swabs were cultured on blood agar medium and MacConkeys medium . The isolated bacteria were diagnosed according to their morphological shapes and by using biochemical tests , Then the diagnosis was confirmed by using Api 20 E , which revealed that 19 Proteus mirabilis isolates (four isolates from urin and 15 isolates from ear swabs) and one isolate of Proteus vulgaris (from ear swab). Antibiotics sensitivity test was carried for all the Proteus bacteria by using the following antibiotics, Pipracillin ; Azithromycin ; Amikacin ; Oxytetracycline ; Gentamicin ; Nalidixic acid ; Azteroname ; Cefotaxime ; Ciprofloxacin and Imipnem the results showed that the antibiotic Imipnem was the most effective antibiotic (100%) , followed by Ciprofloxacin (95%) , while the bacteria were resistant (100%) for Azithromycin and Oxytetracyclin. Most of the isolates were resistant to 2 - 8 antibiotics . The ability of Proteus bacteria to produce proticine was detected in seven isolates (35%) by using cross streaking procedure and 80% by using well method. The proticine activity was detected against Escherichia coli ; Acinetobacter baummannii ; Klebsiella spp . and Pseudomonas aeruginosa , the result showed no effect , while the proticine of 18 isolates of Proteus mirabilis and one isolate of Proteus vulgaris were effective (95%) against some Gram positive bacteria (Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes) and Candida albicans, the results showed that there was a relationship between the production of proticine and antibiotics resistant , since 62.5% of the protecin producing bacteria were resistant to antibiotics. Denes test reveald that some strains (3,13) ; (9,19) were highly identical and also in their resistance to the antibiotics Pipracillin. Gentamycin and Amikacin . The results indicated that there were relationship between the proticine production and the swarming motion of Proteus bacteria , since the isolates with no swarming motion were 60% producer for proticine , while the producer of proticine with swarming were 20% and the no producer of proticine and no swarming 20% while the no producer of proticine and motile were 0.0% .

دراسة الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية في مرضى السكري النمط - 1 والاصحاء == Anti - salivary mucins antibodies in Patients of Type - 1diabetes&healthy controls

Author name: عذراء نجم عبد محمد
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية وعلى دور مجموعة الدم لويس في هذه الامراض . فقد ركزت الدراسة الحالية في جانبها على تنميط مجاميع الدم ومدى تكرار هذه المجاميع في مرضى داء السكري النمط - 1 مقارنة بالاصحاء , اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في مرضى داء السكري النمط 1 - وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع دم لويس ومستضداتها اللعابية . تمت دراسة (59) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث و(50) عينة دم ولعاب وخروج من الذكور ومقارنة ذلك للاصحاء ب(25) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث والذكور .تم تنميط مجاميع دم لويس باستعمال طريقة الشريحة الزجاجية وملاحظة التلازن الدموي تحت تكبير 40x.ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض حيث بلغت نسبتها عند المريضات (33%) مقارنة بالسليمات (12%) (P=3.77×10 - 4**)، في حين كانت مجموعة دمLe(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفظت نسبتها الى (23%) في المريضات مقارنة بنسبة (64%) للسليمات 10 - 9)×4.98=P) ، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+)عند المريضات (17%) مقارنة بالسليمات (16%) (0.462 P=)، في حين كانت مجموعة دم(Le(a - b - في المريضات (23%) مقارنة بنسبة(%8) (10 - 3×1.20 P=) للسليمات . ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) مجموعة مقاومة للمرض اذ بلغت نسبتها في المرضى الذكور (%20) مقارنة بنسبة(24%) للاصحاء (0.239 =P)، في حين كانت مجموعة دم Le(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها في المرضى(32%) مقارنة بالاصحاء(40%)(0.313 P=)، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+) في المرضى (10%) مقارنة بنسبة(16%) للاصحاء(p=0.462) . وكانت مجموعةدم Le(a - b - ) في المرضى(28%)مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (P=0.185).وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 ذات صنفLe(a) . ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة (50%) في المريضات مقارنة بنسبة(33.3%) للسليمات (P=0.015 ) ،اما تردد مجموعة غير الفارزين حيث بلغت نسبتها(50%) مقارنة بنسبة (66.6 %) للسليمات(0.022 P=) ، وفي الذكور كان تردد الفارزين بنسبة(12.5%) في لمرضى مقارنة بنسبة(40%) للاصحاء (10 - 6×6.37 P=)، اما تردد مجموعة الغير فارزين حيث بلغت نستها (87.5%) مقارنة بنسبة(60%) .(10 - 5×1.52 P=) ، كما تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط - 1 ذات صنف Le(a - b - ) ، ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة(%62.5)، اما السليمات فلم توجد نسبة لتحديدها لقله عدد النماذج .اما تردد مجموعة غير الفارزين اذ بلغت نسبتها(%37.5) للمريضات مقارنة بنسة (100%) للسليمات (10 - 22×8.80 P=) ،اما في الذكور كان تردد الفارزين بنسبة (16.6%) للمرضى مقارنة بنسة(8%) بالاصحاء (0.082 P=) ، اما مجموعة تردد الغير فارزين حيث بلغت نسبتها (83.3%) مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (10 - 19×4.94 p=)، اظهرت تجارب كشف الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية وباستعمال كشف الايلازا غير المباشر(مستوى الاضداد مقاس بمعدل الكثافة الضوئية ± الانحراف القياسي)، فلمجموعة Le.a للمريضات كان معدل الاضداد0.0 )±0.085) مقارنة بمعدل0.0127)±0.1495) للسليمات(10 - 8**×8.48=P)، مجموعة Le.b للمريضات كان معدل الاضداد0.011)±0.089) مقارنة بمعدل0.0127)±0.151) للسليمات (10 - 12**×P=6.37) ،مجموعة Le.a+b+ للمريضات كان معدل 0.007)±0.099) مقارنة بمعدل0.0138)±0.288) للسليمات (10 - 13***×9.09=P) ،مجموعة Le.a - b - كان للمريضات بمعدل الاضداد0.003)±0.073) مقارنة بمعدل 0.0076)±0.1207) للسليمات (10 - 13***×9.09=P). تم دراسة تثبيط الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية بالمستضدات اللعابية OL e.a وOLe.b الحرة وكانت النتائج كالاتي : كان معدلات الكثافة الضوئية ±الانحراف القياسي للمعاملات كالاتي : مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.025±0.145) (P=0.490) ،مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.03±0.1) (P=0.142) ،مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط (0.094±0.201) ( P=0.667) ،مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط (0.029±0.103) (10 - 4×P=4.76)، مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.b كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.01±0.118) (10 - 8×2.33=P)، مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OL.b كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.016±0.088)(10 - 3×P=1.29). مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط(0.077±0.189) ( P=0.971)، مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط(0.02±0.097) (10 - 4×P=1.70)..اما في الجانب البكتيري فقد تم تشخيص عزلات بكتريا Staphylococcus aureusو Pseudomonas aeruginosa .وكالاتي : عزل بكتريا Pseudomonas aeruginosa شخصت 5 عزلات aeruginos .P من اصل ( 25) عيبة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراصي (20%) وفي حين بلغت نسبة الزرع للسليمات (0%) من اصل 25)) عينة خروج , وايضا شخصت 4))من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عز ل الاصحاء (%0).عزل بكتريا Staphylococcus aureus شخصت 5 عزلات S. aureus من اصل (25) عينة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراضي الموجب(20%) وفي حين بلغت نسبته للسليمات 0)% )من اصل 25 عينة خروج , وايضا شخصت 4)) عزلات من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عزل الاصحاء (%0).استنتج ان داء السكري النمط - 1 له علاقة بمجاميع الدم ABO ,ومجموعة دم لويس اذ دراستنا هذه اجريت سابقا بنفس الموضوع في قسم علوم الحياة . اشرت الدراسة ان هنالك اضداد ضادة لميوسين اللعاب مسجلة لاول مرة، وهي ملازمة بعيارية عالية (استعمل المصل المخفف 1 : 100) تكثر في المرضى مقارنة بالاصحاء .هنالك زيادة في تكرار عزل البكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus . فيما يدل ذلك وجود تلازم بين نوعي البكتريا والمرض الى ان ذلك يحتاج الى دراسات معمقة . ممكن ان تكون الفروقات بين الذكور والاناث في توزيع مجاميع دم لويس اساسها هرمونات ستيرويدية. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين في مرضى السكري والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | Blood group antigen, are associated with autoimmune diseases . studies emphasized on lewis blood groups. The present study concentrated on finding the frequency distribution of ABO - Lewis blood groups association in type - 1 Diabetes compared to the distribution in healthy controls.The immunological part of this study investigated the immune response in the disease and its relation ship with salivary mucins Lewis molecules. Fiftynine diabetic female samples(blood، saliva،stools) as well as 50 male diabetic sample(blood، saliva،stools) were used in addition to 25sample (blood، saliva،stools )of female and males healthy controls . Typing of blood groups Lewis using the glass slide Not blood agglutination and under magnification 40x.The findings indicated that Lea+b - molecule has arole in disease susceptibility. Ites percentage approach 33% in female patients compared to 12% in healthy controls (p=7.33 x 10 - 4)، On the other hand however, Lea - b+ group gave 23% in diabetic females compared to 64% in healthy females (p= 4.98 x10 - 9). Lea+b+ groups gave 17% in diabetic females and 16% in healthy females (p=0.46).Interestingly however, Lea - b - groups was represented at 23% in diabetic females versus 8% in healthy females (p=1.2x 10 - 3) In males the results of the frequenecies could be summarized as follows : Lea + b - 20% in diabetics vs 24% in controls. p=(0.239).Lea - b+ : 33% in diabetics vs 40% in controls. P=(= 0.31).Lea+b+ : 10% in diabetics vs 16% in controls. P= (0.462).Lea - b - : 28% in diabetics vs 20% in controls. P=(0.185).The role of secretion (se gene role) in diabetes was investigated also, particularly in Lea group and the findings were as follows : secretors female : 50% in diabetics vs 33.3% in controls.(p=0.015).None secretors : 12.5% in diabetics vs 40% incontrols (p=6.37x10 - 6).In addition to that the role of secretion was seen in Lea - b - group as well. Secretor diabetics female, showed 62.5% . There was no available samples in controls.A Statistically siqnificant frequency differences was seen in non secretors diabtic, females compared to controls (37.5% in diabetics vs 100% in controls p=8.8 x 10 - 22).In Males the results of secretions reported a significant difference in non secretors83.3%. In diabetics vs 20% controls ( p= 4.94 x 10 - 3)The other part of the study experiments oriented to uncovering the presence of anti - salivary mucins antibody .Using Lewis types, salivary mucin as coating antigen، and indirect ELISA, we could demonstrate the occurrence of anti - mucin antibodies in patients sera that was from controls.In this respect the level of anti - mucin antibody measured as ELISA mean o.D±SD seen below and as following : In Lea diabetic females group was 0.085+0.02 vs 0.1495±0.0127 in control (p= 8.48 x10 - 8)،In Leb diabetic females group 0.089±0.011 vs 0.151±0.0127 in control group( p= 6.37 x10 - 12)،In lea+b+ diabetic females group 0.099+0.007 vs control groups 0.288+0.0138 in control p=( 9.09 x10 - 13) ،In Lea - b - diabetic females group 0.07+0.003 vs control group 0.1207+0.0076( p=9.09 x 10 - 13)In specificity experiment, using free olea and oleb free saliva as inhibitor for anti - mucin antibody, it was demaonstrated that in female patients group Lea : no inhibition by free Lea was seen (0.6 ± 0.01) vs 0.145±0.02 for treatments before and after inhibition respectively (p=0.49)، similarly there was no inhibitin by the free antigens، similarity there this no inhibition by the free antigens towards antibodies in group Leb.Significnt inhibition of anti - mucin antibody by free Lewis was seen in group : (0.2±0.060) vs (0.103±0.029) before and after inhibitim respectiuly(p=476 x 10 - 4) and similar results was seen in Lea - b - group.The bacteriological study on The isolation of P.aeroginosa from stool samples revealed an isolation frequency of 20% in diabetic vs 0% in control.In addition S.aureus isolation from stool gave a frequency of 20% in patients vs 0% in control.It is concluded that there is areltionship among Lewis blood groups – secretion of there molecules and anti - mucin، immune response directed to aspecific targt and initiating autoimmunity in this particular disease.

التغيرات في مستويات انترليوكين - 33 في مرضى الربو والتهاب الانف التحسسي تحت تاثير العلاج المناعي == Changes of IL - 33 Levels in Asthmatic and Allergic Rhinitis Patients under the Effect of Immunotherapy

Author name: عذراء خلف فلحي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة لتقصي التغيرات في مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 في امصال المرضى المصابين بالربو التحسسي والتهاب الانف التحسسي اضافة الى دراسة اثر العلاج المناعي على هذه المؤثرات المناعية. تم اختبار مئتين وخمسه وتسعين مريض (120ربو, 75 التهاب الانف التحسسي, 100 خاضعين للعلاج المناعي) اعمارهم تتراوح بين 20 - 60 سنة (160 ذكور , 135 اناث), من بين المراجعين للمركز التخصصي للحساسية في بغداد/ الرصافة للفترة من اكتوبر 2014 الى فبراير 2015. تم خلال الدراسة قياس مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 بتقنية الاليزا وبالامكان تلخيص النتائج لهذه الدراسة بالاتي : 1 - تبين من خلال اجراء فحص وخز الجلد باستخدام 15 نوع من المستارجات الاكثر شيوعا ان مستويات التفاعلات الايجابية ترتب كالتالي : 8.7%D. pteronyssinus (D1) , 7.6% D. farina (D2), 7.6% Chenopodium (CH) و7.1% Bermuda grass (G2) في المرضى الذين يعانون من الربو و8.2% D. pteronyssinus (D1), 7.6% D. farina (D2), 7.6% Bermuda grass (G2) و6.6% Chenopodium (CH) في المرضى الذين يعانون من التهاب الانف التحسسي.2 - تبين من النتائج ارتفاع معنوي عالي عند مستوى معنوية (P<0.001) في مستويات الضد IgE سواء عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 33.07 ± 328.78( او التهاب الانف التحسسي (pg/ml 36.09 ± 379.76( بالمقارنة بمستوياته التي انخفضت بشكل معنوي عند مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي (pg/ml 22.75 ± 210.23(. فيما ضلت مستوياته ضمن حدودها الطبيعية عند مجموعة الاصحاء (pg/ml 8.04 ± 81.19).3 - موازيا لذلك فان مستويات انترلوكين - 33 قد سجلت ارتفاعات معنوية عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 13.75 ± 128.07( والتهاب الانف التحسسي ( pg/ml12.78 ± 144.62) فيما انخفضت عن ذلك في مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي لتصل (pg/ml 11.32± 110.79( اما مجموعة السيطرة فكانت (pg/ml 9.06 ± 59.04).4 - وقد وجد ان هنالك علاقة موجبة ذات دلاله معنوية بين مستوى انتولوكين - 33 ومستويات IgE الكلية حيث ان معامل الارتباط في الربو (r = 0.42**), التهاب الانف التحسسي (r = 0.31*), والمرضى الخاضعين للعلاج المناعي (r = 0.41**) على مستوى احتمال (P <0.01**) و. (P <0.05*) | The present study was undertaken to investigate the changes in levels of total IgE and interleukin - 33 in sera of patients with allergic asthma and allergic rhinitis. In addition, the effect of immunotherapy on such immune parameters were investigated. Two hundred and ninety five of allergic patients (120 asthmatics, 75 allergic rhinitis, and 100 receiving immunotherapy) their ages ranged between 20 - 60 years (160 males and 135 females), among those who attended the allergy specialized center in Baghdad /Al - Russafa during the period from October 2014 to February 2015. The control group was included 50 apparently healthy individuals. Levels of interleukin - 33, Total IgE, were estimated using ELISA technique, the results of the study can be summarized as follow : 1 - By doing skin prick test using 15 types of most common allergens for both groups of patients, the recorded results showed to be positive respectively as so : Dermatophagoides pteronyssinus (D1) 8.7%, Dermatophagoides farinae (D2) 7.6%, Chenopodium (CH) 7.6% and Bermuda grass (G2) 7.1% in asthmatic patients and D. pteronyssinus (D1) 8.2%, D. farinae (D2) 7.6%, Bermuda grass (G2) 7.6% and Chenopodium (CH) 6.6% in allergic rhinitis patients.2 - The results showed high significant (P < 0.001) increase in the level of total serum IgE in asthmatic patients (328.78 ± 33.07 IU/ml) and in allergic rhinitis patients (379.76 ± 36.09 IU/ml) compared with its level, which were decreased (210.23 ± 22.75 IU/ml), in those patients who received immunotherapy and compared to level in healthy individuals, which were stayed within normal range (81.19 ± 8.04 IU/ml).3 - In parallel IL - 33 also recorded a significant elevation in both groups of patients (128.07 ± 13.75 pg/ml) in allergic asthma, and (144.62 ± 12.78 pg/ml) in allergic rhinitis. It decreased in group of immunotherapy patients to reach (110.79 ± 11.32 pg/ml), while it was (59.04 ±9.06 pg/ml) in the sera of healthy individuals.4 - A significant positive correlation was found between serum level of IL - 33 and the total IgE as the correlation coefficient in asthma was (r = 0.42**), rhinitis (r = 0.31*), immunotherapy (r = 0.41**) at the level of probability (P <0.01**) and (P <0.05*).
1 ... 94 95 96 97 98 ... 154