Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 100 out of 11,481

تاثير المستحلب الحيوي المنتج من بكتريا Leuconostoc mesenteroides ssp. cremoris المعزولة محليا في البكتريا المرضية المعزولة من ادوات القسطرة واصابات المجاري البولية == Effect of Biosurfactant Produced by Locally Leuconostoc mesenteroides ssp. cremoris in Pathogenic Bacteria Isolated from Catheters and Urinary Tract Infections

Author name: عدنان ياس خضير عباس
Supervisor name: جيهان عبد الستار سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

الازالة الحيوية لعنصر الرصاص مختبريا باستخدام نبات الشمبلان Ceratophyllum demersum L == Bioremediation of Lead Labrotary by Ceratophyllum demersum L.

Author name: عبد الجبار جاسم الجريان
Supervisor name: عبد الجبار جاسم الجريان | عدنان حسن عفچ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لتقييم ثلاثة انواع من النباتات المائية هي الشمبلان demersum L . Cratophyllum واللزيج Nagaus armata L. والخويصةVallisneria spiralis L. , كعوامل للازالة الحيوية لعنصر الرصاص Bioremediation من البيئة المائية لبحيرة الزوراء المجهزة من نهر دجلة ,وتحديد اثر عنصر الرصاص في بعض معاييرالنمو لنبات الشمبلان C. demersum . اظهرت النتائج ان محتوى الرصاص في نبات الشمبلان C. demersum بلغ ((0 - 14 جزء بالميلون وهو اعلى من محتوى نباتي N. armata وV. Spiralis اللذين سجلا( 0 . 12) و( 0 .13) ,جزء بالمليون على التوالي ,وهذا ماانعكس على تركيز الرصاص في مياه نبات الشمبلان C. demersum الذي سجل ( ppm ( 0.25 مقارنة بتركيز الرصاص في المحتوى المائي لنباتي N.armata وV.spiralis واللذين سجلا0.50) ( 0.52 )) جزء بالمليون وعلى التوالي .كما اظهرت نتائج التجربة المختبرية ان الازالة الحيوية لعنصر الرصاص من ثلاث بيئات مائية ملوثة بثلاث مستويات منه 6,4,2 ppm نامي فيها نبات الشمبلان C.demersum كانت كفائته على الازالة الحيوية لهذا العنصر قد بلغت 100% عند نهاية الاسبوع الثالث وبداية الاسبوع الرابع للتجربة وفي المعاملة المغذاة بـ 6 جزء بالمليون من عنصر الرصاص.اما الازالة الحيوية لعنصر الرصاص في المعاملة المخهزة بتركيز ((4 ppm فقد بلغت 100% عند نهاية الاسبوع السادس من التجربة . اما الازالة الحيوية لعنصر الرصاص في المعاملة المجهزه بـ ((2 ppm وكذلك معاملة السيطرة Control والتي تحتوي مياهها على (0.5 ppm) من عنصر الرصاص , قد بلغت %100 عند نهاية الاسبوع الثامن من التجربة.كما اثبتت الدراسة التاثير الضار لعنصر الرصاص المتجمع في انسجة نبات الشمبلان C.demersum في النمو الظاهري للنبات , والمتمثل بعدد الفروع وعدد الاوراق السوارية ووريقاتها , فقد ظهر جليا العلاقة العكسية بين نسبة الازالة الحيوية وانخفاض النمو الظاهري . ويعزى السبب في هذه العلاقة الى تاثير الرصاص المتجمع في انسجة النبات على اهم عملية فسيولوجية فيه الا وهي عملية البناء الضوئيphotosynthesis , التي بدورها سيكون لها التاثير السلبي الكبير على النمو الظاهري للنبات والمتمثل بعدد وفروع , عدد الاوراق السوارية ووريقاتها والسبب الرئيسي في ذلك قد يعود الى تناقص الكلوروفيل الكلي في النبات مع زيادة تراكيز الرصاص في مياه احواض التجربة , وخلال الفترات الزمنية للقياس . | This study was carried out to evaluate the efficiency of three aquatic plants : Ceratophyllum demersum , Najaus armata and Vallisneria spiralis as bioremediation agents for Lead aquatic environment of AL - Zawraa park feeded from Tiger rever,and determination of Lead toxic effect on some growth parameters C.demersum. The results revealed that lead content of C. demesum plant was the highest (0.14) ppm as compared to other tested plant N.armata and V.spiralis which recorded (0.12) and( 0.13) ppm respeetivaly ,this result reflected on the lead concentration in aquatic environment of C.demersum plant which recorded (0.25 )ppm copared with lead concentration in aquatic environment of N.armata and V.spilis plants which recorded (0.25 and 0.50) ppm respeetively. The results of labrotary exprements for remediation of lead for three diffirent concentration of lead contaminated aquatic environment (2,4,6)ppm showed the high efficiency of C.demersum plant in bioremediation of lead from aquatic environment up to (100%) at the end of the third week and beginning of the fourth week in 6 ppm lead treatment ,while in 4 ppm lead treatment it achieved (100%) at the end of the sixth week .the bioremediation of the lead from aquatic invironment in 2 ppm lead treatment and control 0.5 ppm lead achieved (100%) at the end of eighth week. The results also showed hrumfull effect of accumulated lead in C.demersum plant tissue on some parameters(number of branches,number of leaves and leaflets) as manifested by the negative relationship between the bioremediation and tested plant growth parameters. The causal agent of this negative relationship may refer to the influence on photosynthesis efficiency which lead to severe reduction in plant growth parameters (number of branches,number of leaves and leaflets) and this suggestion confirmed by the significant reduction of total chlorophyll content in all lead treatments.

دراسة بكتريولوجية وخلوية لنماذج القشع لمرضى التهاب الجهاز التنفسي السفلي لدى المصابين وغير المصابين بسرطان الرئة == Bacteriological and Cytological Study for Sputum from Lower Respiratory Tract Infection in Both Lung Cancer and Non Lung Cancer Patients

Author name: عاصفة علي حسين الجنابي
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | علاء غني حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (260 )نموذجا للقشع من المرضى البالغين المراجعين للعيادات الاستشارية والراقدين في كل من المستشفى الجامعي لكلية صدام الطبية ومعهد ومستشفى الطب والاشعاع النووي للفترة من ايلول 2001 ولغاية نيسان 2002 . وقد صنفت النماذج الى مجموعتين ، المجموعة (1) وتضم (210)مريضا مصابا بالتهابات القناة التنفسية السفلى من غير المصابين بسرطان الرئة ،تراوحت اعمارهم (14 - 85 ) سنة ، من بينهم (124)ذكورا ، و(68)اناثا. اما المجموعة (2) فتضم (50)مريضا مصابا بالتهابات القناة التنفسية السفلى من المشخصين بالاصابة بسرطان الرئة ،وقد تراوحت اعمارهم (40 - 80) سنة ،من بينهم (39)ذكورا ،(11) اناثا . 1 - اظهرت النتائج ارتفاع نسبة الاصابة لدى الذكور مقارنة بالاناث في كلتا المجموعتين (1) و(2) اذ بلغت (58.5%)،(76%)على التوالي ،في حين كانت الفئات العمرية المتقدمة اكثر عرضة للاصابة بهذه الالتهابات وفي كلتا المجموعتين .كما وجد ان نسبة المدخنين تفوق نسبة غير المدخنين في المجموعتين اذ بلغت (58.5%) في المجموعة (1)في حين بلغت (80 %)في المجموعة (2). 2 - عزلت البكتريا الهوائية واللاهوائية الاختيارية من نماذج القشع ، كما اجري الفحص المباشر لها باستخدام صبغة كرام والصبغة المقاومة للحامض A FB للتحري عن عصيات التدرن (T.B.).3 - تم تشخيص (129) نموذجا موجبا للزرع البكتريولوجي توزعت (95)نموذجا (2 .45% )في المجموعة (1)،و34 نموذجا (68 %) في المجموعة (2) ، في حين بلغ عدد النماذج التي لم تعزل فيها البكتريا المرضية (131)نموذجا ،توزعت (115 )نموذجا (54.7%) في المجموعة (1) ،16 نموذجا (32 %)في المجموعة (2) .بينما ظهر نمو مختلط في (13)نموذجا (13.6 %)في المجموعة (1) في حين بلغت 4 عينات (11.7 %) في المجموعة (2) .4 - اوضحت نتائج التشخيص البكتريولوجي للبكتريا المرضية المعزولة في المجموعة (1)،ان بكتريا S.pneumoniae كانت المسبب الاكثر شيوعا وبنسبة (51.4 %) تلتها بعض افراد العائلة المعوية (41.9 %)من بينها S. marcescens, E.cloacae ,K .pneumoniae وبنسبة عزل (7.4 %) ،(4.6 %) ، (2.8 %) على التوالي تلتها P. aeruginosa (13 %) تلتها S. aureus (11.2 %)، في حين تساوت نسبة عزل كل من M.catarrhalis , H.influenzae (4.6 %) لكل منهما .5 - اما البكتريا المرضية المعزولة في المجموعة (2) فكانت النسبة الاكبر لبكتريا S.pneumoniae 30 %تلتها بعض افراد العائلة المعوية 20 % من بينها S.marcescens ,E. cloacae ,K .pneumoniae وبنسب 12.5 % ،5 %،2.5 %على التوالي ، تلتها S.aureus 15 % تلتها نسب متساوية من P.aeruginosa, M.catarrhalis 12.5 % لكل منهما واخيرا H.influenzae 10%.6 - اما فيما يخص M.tuberculosis فقد اعتمد في تشخيصها على الفحص المجهري دون الزرع البكتريولوجي وكانت نسبة الفحص الموجب لمسحة القشع 11.6 % في المجموعة رقم (1) في حين لم تشخص اي نتيجة موجبة لتلك المسحة في المجموعة (2) .7 - اجري فحص الحساسية للعزلات البكتيرية المرضية تجاه 15 مضادا حيويا وهي (Ampicillin, Penicillin G, Cloxacillin, Co - Trimoxazole, Erthromycin , Tetracycline , Cephalexine, Ciprofloxacin, Cefotaxime, Lincomycin , Gentamicin, Pipracillin, Tobramycin, Ceftazidime, Amikacin) واظهرت النتائج وجود تباين واضح وبنسب مختلفة في مقاومة هذه العزلات للمضادات المستخدمة وللمجموعتين (1)،(2) .كما اظهرت العزلات البكتيرية في المجموعة (2) المصابين بسرطان الرئة مقاومة اعلى مقارنة بالعزلات البكتيرية في المجموعة (1) وقد اظهرت كل من S. pneumoniae ، S. aureus ، M. catarrhalis ، H. influenzae اعلى نسبة مقاومة تجاه الكلوكساسيلن والامبسيلين والبنسلين (ج) والتي بلغت 69.1% ، 64.8% ، 52.1% على التوالي في حين اقل نسبة مقاومة لهذه العزلات تجاه السبروفلوكساسين والسيفاتاكسين 4.2% و12.7% على التوالي ، اما P.aeruginosa ، K. pneumoniae ، E. cloacae ، S. marcescens فقد اظهرت اعلى نسبة مقاومة تجاه الامبسيلين والسيفالكسين ، والكوترايموكزازول 100% ، 90.7% ، 88.3% على التوالي بينما بلغت اقل نسبة مقاومة للمضادات الاميكاسين والسبروفلوكساسين والسيفاتاكسيم 14% ، 20.9% ، 37.2% على التوالي .8 - تم تحديد قيم التراكيز المثبطة الدنيا MIC لبعض العزلات البكتيرية تجاه ثمانية مضادات (الامبسلين ، السيفاتاكسيم ،السيفتازديم ،البنسلين ،الببراسلين ،السبروفلوكساسين ،الارثرومايسين ،الجنتاميسين) وقد تباينت قيم MIC لهذه المضادات تجاه العزلات البكتيرية، اذ ابدت كل من M.catarrhalis ,S.aureus, S. pneumoniae اعلى مدى للمقاومة تجاه مضادات الامبسلين ،البنسلين ،السيفاتاكسيم ،اما البكتريا العصوية السالبة لكرام P.aeruginosa ,S.marcescens, E.cloacae ,K.pneumoniae فكان اعلى مدى للمقاومة تجاه الببراسلين والجنتاميسين في حين كان اقل مدى للمقاومة للعزلات البكتيرية كافة لمضاد السبروفلوكساسين .9 - اختبرت العزلات البكتيرية المقاومة لمجموعة البيتالاكتام ومنها (الامبسلين ،الببراسلين ،السيفتازديم) وقد حددت قيم MIC لها بوجود مثبطات انزيمات البيتالاكتاميز ومنها مثبط حامض الكلافيولنك وبطريقة النسبة الثابتة 2 : 1 لخليط المثبط /المضاد على التوالي ،كما استخدام مثبط التازوباكتم مع الببراسلين المحضر تجاريا بنسبة 8 : 1 على التوالي . وقد اظهرت النتائج ان استخدام مثل هذه المثبطات اعطى فعالية عالية واسترجع المضاد لكفاءته للقسم الاكبر من العزلات المقاومة.وقد ابدى خليط التازوباكتم / الببراسلين افضل تاثير تازري اذ بلغت نسبة حساسية الخليط 76.9 %، كما وجد ان بان هذا الخليط ذو فعالية تفوق خليط حامض الكلافيولنك /الببراسلين .10 - بينت الدراسة الخلوية لكافة النماذج قيد الدراسة وجود الخلايا الالتهابية (الحادة غالبا ) كما لوحظ وجود التغيرات الخلوية السابقة لحدوث السرطان (خلايا التنسج الحرشفي والحثل النموي بمختلف درجاته )في كلتا المجموعتين فضلا عن وجود الخلايا السرطانية في مجموعة المصابين بسرطان الرئة . وقد بلغت نسبة خلايا التنسج الحرشفي في المجموعة (1)و(2) 37.1 %، 34 % على التوالي في حين نسبة وجود خلايا التنسج الحرشفي والحثل النموي للمجموعتين (1)و(2) قد بلغت 10.5 % ،26 % على التوالي . كما وجد ان نسبة التغيرات الخلوية اعلى في الفئات العمرية المتقدمة لاسيما لدى المدخنين اذ بلغت 74.3 %، 90.9 % للمجموعتين (1) ،(2) على التوالي .11 - كما اظهرت نتائج الفحص الخلوي لقشع المرضى المشخصين بالاصابة بسرطان الرئة سيادة لنوع السرطان الحرشفي من بين انواع السرطان الرئوي وبنسبة 50 % تلتها السرطان الغدي 14 % ثم السرطان ذو الخلايا الصغيرة 10 % وان نسبة 26 % كانت للنماذج التي لم يشخص فيها نوع السرطان الرئوي بالفحص الخلوي . | This study included collection of 260 sputum samples from adult patients referred to the outpatient clinic and admitted to both Saddam College of Medicine University Hospital and Institute of Nuclear Medicine from the period September 2001 till April 2002.The samples were classified into two groups : The first group included 210 patients , ranged (14 - 85) years old : 124 males and 86 females , with lower respiratory tract infections with no history of lung cancer and the second group include 50 patients having lower resporatory tract infections who are known cases of lung cancer, their age range from (40 - 80) years; 39 males and 11 females.1 - The results reveal higher incidence of lower respiratory tract infection in males than in females in both groups since it was 85.5%, 76% in the two groups respectively. There were a high incidence of lower respiratory tract infection with increasing age in the two groups of patients. Also it was found that incidence of smokers was higher than non - smoker in the 2 groups studied since it was 58.5% in the first groups and 80% in the 2nd group.2 - Isolated aerobic and faculative anaerobic bacteria and they were stained by Gram stain and acid - fast stain (AFB) examined . 3 - There was 129 positive sample for bacteriology culture divided into 95 sample 45.2% in the first group, 34 sample 68% in the 2nd group whereas 13 sample were negative for pathogenic bacterial growth, divided into 115 sample 54.7% in the 1st group 16 sample 32% in the 2nd group. Mixed bacterial growth was noticed in 31 sample 13.6% in the first group while 4 samples 11.7 in the 2nd group.4 - Results of bacterial diagnosis reveal species and percentage of bacteria isolated from first group that S.pneumoniae was the major and the commonest cause of LRT1 51.4% followed by some enteric group 41.9% including : K.pneumoniae, E.cloacae, S.marceseens with percentage of isolates : 7.4%, 4.6%, 2.8% respectively, followed by P.aeruginosa which constitute 13%; than S. aureus 11.2% while equal percentage of isolates from both H influenzae and M. catarrhalis 4.6% for each.5 - For the lung cancer patients groups the predominant bacterial growth was for S.pneumoniae 30% followed by some entric group 20% including K.pnumoniae, E. cloacae, S.marcescens with percentage of isolates 12.5%, 5%, 2.5% respectively. Bacteria S. aureus comes next 15% of isolate, followed by P. aeruginosa and M. caqtarrhalis 12.5% for each and H. influenzae comes at the end of the list 10%.6 - For the dinguses of M. tuberculosis we depended on microscopical examination without bacteriological culture , the positive percentage of sputum smear was 11.6% in group (1) while we can not diagnosis any positive result in group (2). 7 - Antibiotic sensitivity test was doing for all the pathogenic bacterial isolates to 15 antibiotic that were Ampicillin, Penicillin G, Cloxacillin, Co - Trimoxazole, Erthromycin , Tetracycline , Cephalexine, Ciprofloxacin, Cefotaxime, Lincomycin , Gentamicin, Pipracillin, Tobramycin, Ceftazidime, Amikacin the results reveal a clear variation in antibiotic sensitivity among different bacterial isolates for both groups. Also the bacterial isolates for the lung cancer group have shown higher antibiotic resistance than the isolates for the first group in general . S. pneumoniae , S. aureus , M. catarrhalis , H. influenzea show highest resistance percentage toward cloxacillin, ampicillin, pencillin G , 69.1%, 64.8%, 52.1% respectively while the lowest resistant percentage for this isolate for ciprofloxacin , cefetoxime 4.2% , 12.7% respectively . While P. aeruginosa, K. pneumoniae , E. cloacae , S. marcescens it show highest resistant percentage for ampicillin, cephalexine , co - trimoxazole 100%, 90.7% , 88.3% respectively . While the lowest resistance percentage for the antibiotic amikacin, ciprofloxacin , cefotaxime 14%, 20.9%, 37.2% respectively .8 - Results of MIC were determined for some bacterial isolates towards eight antibiotic (Ampicillin, cefotaxime, cefazidime, penicillin, pipracillin, ciprofloxacin, erythromycin, gentamicin). And reveal a marke of variation among MIC values for different regard, S. pneumoniae, S. aureus and M. catarrhalis have shown the highest range of resistance towards Ampicillin , penicillin, cefotaxime while the Gram negative bacillius (K. pneumoniae, E. cloacae, S. marcescens, P. aeoginisa) have shown a high range of resistance towards pipracillin , gentamicin. Most of bacteria isolates showed little resistance toward ciprofloxacin.9 - Bacterial isolates that revaled resistance to betalactm group (Ampicillin, pipracillin, ceftazidine) were tested for MIC values in the presence of beta lactamases inhibitors including clavulanic acid in a ratio of 2 : 1 for antibiotic inhibitor respectively. Also tazobactam inhibitor was mixed with pipercillin prepared commercially with 8 : 1 respectively. And the results revealed that the use of such inhibitors gives higher activity and made the antibiotic retain its effectiveness for a large portion of resistance bacterial isolates. The Tazobactam / piperacillin mixture have shown the best synergestic effect since its sensitivity reach 76.9%. Also found that this mixture was of activity that exceed calvulanic acid/ piperacillin mixture.10 - Cytological study of sputum samples explain in both groups have revealed the presence of inflammatory cells (predominantly acute). Also it reveals the presence of precancer cytological changes including squamous metaplasia and different graded of dysplasia cellular a typical in both group studied. Also it reveals presence of cancer cell in lung cancer group.Squamous metaplsia changes occur in the non lung cancer group 37% and 34% in the lung cancer group. Combined squamous metaplsia and dysplasia was seen in 10.5% in the 1st group and 26% in the 2nd group. Also the incidence of precancers cellular changes (including squamous metaplasia and dysplasia) were noticed with advanced age especially among smokers 74.3%. 90.9% for the 1st and 2nd group respectively.11 - Also sputum cytology examination for lung cancer patients revealed predominant of squamous cell carcinoma variety 50% followed by adenocarcinoma group, the small cell carcinoma group 10% and 26% of cases the exact cancer subtype was not determined by sputum cytological examination.

دراسة علاقة الكورتيزول ومقاومة الانسولين في رجال قصور الغدة الدرقية غير المصابين بالسكري == Study the relationship of cortisol and insulin resistance in non - diabetic hypothyroidism men

Author name: ظلال عبد الخالق جمعة
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية للتحري عن مستويات الكورتيزول ومقاومة الانسولين بالعلاقة مع زيادة مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية ((TSH في مرضى قصور الغدة الدرقية من الذكوروالتي اجريت على 48 شخصا من المراجعين الى المركز التخصصي للغدد الصم ومرضى السكري في بغداد للفترة من 10/10/2014 ولغاية 14/2/2015. شملت مجموعة قصورالغدة الدرقية 24 رجلا تراوحت اعمارهم بين 20 - 60 سنة ومجموعة السيطرة 24 رجل تراوحت اعمارهم بين 20 - 56 سنة. ارتفع مستوى Mu/lTSHمعنويا (P˂0.01)في مجموعة قصورالغدة الدرقية (41.74±3.61) قارنة بمجموعة السيطرة(1.97±0.264). اظهرت مستويات هرمون الثايروكسين T4nmol/Lفي مجموعة قصورالغدة الدرقية (48.59±0.98) انخفاضا معنويا P˂0.01)) مقارنة بالسيطرة .(80.12±3.09) اظهرت مستويات T3nmol/lعدم وجود فروقات معنوية (p≥0.05) بين المجموعتين (1.31±0.14)؛ (1.52±0.083) على التوالي. ارتفعت مستويات الكورتيزول ng/ml(274.08±9.3) في مجموعة المرضى معنويا(P<0.01) مقارنة بمجموعة السيطرة (174.33±13.55).ازداد مستوى الانسولين(15.13±1.14) µIU/ml في المرضى مقارنة بالسيطرة (8.28 ± 0.76) معنويا (P<0.01).لم تكن الفروقات معنوية p≥0.05)) في مستويات كلوكوز الدم(4.84±0.15) ؛ mmol/l(4.98±0.11)بين المجموعتين .لم تكن الفروقات معنويةp≥0.05)) في مستويات HbA1c%بين المجموعتين (5.50±0.18;5.50±0.18) على التوالي. ازدادت مستويات مقاومة الانسولين معنويا (P<0.01)في مجموعة المرضى (3.39±0.29) مقارنة بمجموعة السيطرة (1.81±0.16) . ارتفع معامل كتلة الجسم BMI(kg/m2)معنويا (P<0.01) في مجموعة المرضى (25.81±0.39) مقارنة بالسيطرة (23.72±0.49). لم يكن ضغط الدم الشرياني العالي (11.58 ± 0.37) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05)) عند مقارنته مع مجموعة السيطرة (11.46 0.22). لم يكن ضغط الدم الشرياني الواطئ(9.04±0.40) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05))عند المقارنة مع مجموعة السيطرة(8.46±0.23) .. كان معدل العمر (39.00±1.92; 35.54±2.29) بين المجموعتين. اظهر TSH وCortisolارتباطا موجبا (0.65)ومعنويا (P<0.01).اظهر الكورتيزول وT4علاقة سالبة ( - 0.32) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكورتيزول علاقة سالبة ( - 0.18) غير معنويةp≥0.05) ) مع T3. اظهر الانسولين وكلوكوزالدم علاقة موجبة (0.09) غيرمعنوية (p≥0.05). اظهراالانسولين والHbA1c% علاقة سالبة ( - 0.09) غير معنوية p≥0.05)).كانت العلاقة موجبة (0.42) ومعنوية (P<0.01) بين الانسولين والكورتيزول. اظهرالانسولين وTSHعلاقة موجبة (0.36) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكلوكوز وTSHعلاقة سالبة ( - 0.16) وغير معنوية p≥0.05)). اظهرTSHو HbA1c%علاقة موجبة (0.05) غير معنوية ( - 0.08)كانت مقاومة الانسولين والكلوكوز علاقة موجبة (0.32) ومعنوية(p≤0.05).وجدت علاقة سالبة( - 0.08) بين مقاومة الانسولين وHbA1c%غير معنوية p≥0.05)).اظهرت مقاومة الانسولين ومعامل كتلة الجسم BMI علاقة موجبة(0.33) ومعنوية (p≤0.05). كذلك اظهرBMI وTSH علاقة موجبة (0.39)ومعنوية(P<0.01) . اظهر BMI وT4علاقة سالبة ( - 0.36) ومعنوية (P<0.01). بين BMI وT3علاقة موجبة (0.002) غير معنوية(p≥0.05) . اظهر BMIوالعمرعلاقة سالبة( - 0.001) غير معنوية p≥0.05)). استنتجنا من هذه الدراسة بان ارتفاع مستوى الTSH يؤدي الى ارتفاع مستوى الكورتيزول في مرضى قصور الغدة الدرقية مع زيادة مستويات الانسولين والمصاحبة لزيادة مقاومة الانسولين وزيادة معامل كتلة الجسم BMI. | The present study aimed to investigate the cortisol levels and insulin resistance and their relationship with increasing level of Thyroid stimulating hormone (TSH) in the hypothyroid male patients. The study was carried on 48 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Baghdad province. The study began on10/10/2014to 14/2/2015.The subjects were divided into 2groups (control and hypothyroid).Each group included 24 males, their ages ranged between 20 - 60; 20 - 56years respectively. The results showed a highly significant (P˂ 0.01) increase in the level of TSH in overt hypothyroid patients (41.74± 3.61mu/l) in comparison with control (1.97± 0.264mu/l). Levels of T4nmol/L (48.59 ± 0.98) showed a significant (p˂0.01) decrease in comparison with control (80.12±3.09). T3nmol/L levels were not significantly (p≥0.05) between two groups (1.31±0.14); (1.52±0.083) respectively. Cortisol levels (274.08±9.37) ng/ml increased significantly (P<0.01)in the patients group in comparsion with control group (174.33±13.55). Insulin (15.13±1.14)µIU/ml increased significantly (P<0.01) in the patients group in comparison with control. (8.28 ± 0.76(Glucose levels mmol/l in patients (4.84±0.15) and control group (4.98±0.11) were not significant (p≥0.05). HbA1c (%) levels in the study groups (5.50±0.18; 5.50±0.18) were not significant (p≥0.05). Insulin resistance (%) increased significantly (P<0.01) in patients group(3.39 ±0.29)when compared with control group (1.81±0.16). Body mass index (kg/m2) increased significantly (P<0.01) in patients group (25.81±0.39) in comparison with control group (23.72± 0.49). High arterial blood pressure in patients group (11.58 ± 0.37) was not significant (P≥0.05) in comparison with control group (11.46± 0.22). Low arterial blood pressure in patients group (9.04±0.40) was not significant (P≥0,05) in comparison with control group(8.46±0.23). Mean of age was (39.00±1.92;35.54±2.29) in both groups. There is a positive correlation (0.65) between cortisol and TSH at (P<0.01) level in patient group; while cortisol showed negative correlation ( - 0.32) between cortisol and T4 at (p<0.05). Cortisol showed non - significant (p≥0.05) negative correlation ( - 0.18) with T3. Insulin and glucose showed positive (0.09) non - significant correlation (p≥0.05).Insulin and HbA1C% showed ( - 0.09) non - significant correlation (0.42).TSH & Insulin in patients group showed positive (0.36) significant correlation (P<0.01). TSH & Glucose in patients group showed negative( - 0.16) non - significant (p≥0.05) correlation. TSH & HbA1C% in patients group showed positive (0.05) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and glucose correlation was positive (0.32) significantly (p≤0.05) in patients group. Insulin resistance & HbA1C% in patients group showed negative ( - 0.08) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and BMI showed positive (0.33) significantly (p≤0.05).BMI and TSH showed significant (P<0.01) positive (0.39) correlation. BMI & T4 showed significant (P<0.01) negative ( - 0.36) Correlation in patients groups. BMI & T3 showed positive (0.002) non - significant (p≥0.05) correlation. BMI & Age showed negative ( - 0.001) non - significant (p≥0.05). We concluded from this study that increasing levels of TSH causing an elevation of cortisol levels among hypothyroid patients with increasing insulin levels accompanied by increased insulin resistance and BMI index.

استخدام بعض المثيرات اللاحياتية في زيادة بعض مركبات الايض الثانوي لنبات السبحبــــــح Melia azedarach L. بزراعة الانسجة == In vitro use of some abiotic elicitors to increase secondary metabolites production of Melia azedarach L

Author name: طه علاوي احمد
Supervisor name: سعدية حسن محمود | الاء جبار طه
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية, قسم علوم الحياة, كلية العلوم, الجامعة المستنصرية بهدف زيادة انتاج بعض مركبات الايض الثانوي في المزارع النسيجية لنبات السبحبحMelia azedarach L. ومقارنة انتاجيتها مع انتاجية النبات الكامل. تم تعقيم الاجزاء النباتية (بذور , اوراق) باستخدام مادة هايبوكلورات الصوديوم بتركيز 1% لمدة 5 دقائق , 2% لمدة 10 دقائق للاوراق والبذور على التوالي. استبعدت البذور لعدم استجابتها للانبات ولاستحثاث الكالس. استحث الكالس من زراعة الاوراق الفتية المفصولة من النبات على الوسط الغذائي MS بوجود تراكيز مختلفة من منظمي النمو Benzyl adenine (BA) و2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) بالتراكيز 0.0, 0.5., 1.0, 1.5 او 2.0 ملغم/لتر, كما استخدم الوسط الغذائي MS بوجود تراكيز مختلفة من منظمي النمو IBA) Indolebutyric acid) بتركيز (3.0,2.0,1.0 او 4.0) ملغم/لتر وBA بتركيز (0.5 او 1.0) ملغم/لتر. اظهرت النتائج ان 2,4 - D بتركيز 1ملغم/لتر قد اعطى اعلى معدل للنسبة المئوية لاستحثاث الكالس بلغت 90% واعلى معدل للوزن الطري بلغ 618.4 ملغم, وقد استعملت التوليفة اعلاه لادامة الكالس المستحث, وكان الحضن في الظلام افضل. اما الوسط الحاوي على IBA, BA فلم يكن فعالا في استحثاث الكالس. قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهازHigh Performance Liquid Chromatography ((HPLC لعينات المستخلص الميثانولي للاوراق والمزارع النسيجية للكالس. تميز المستخلص الميثانولي للكالس بارتفاع محتواه من بعض تراكيز المركبات الثانوية مقارنة بمستخلص الاوراق. وبغية زيادة انتاج المركبات الثانوية وظفت مثيرات كيميائية وفيزيائية تضمنت حامض الساليساليك (Salicylic acid) بالتراكيز 50, 100, 150 او 200 ملغم /لتر, ونترات الفضة Silver nitrate)) بالتراكيز 0.1, 0.2, 0.3 او 0.4 ملي مولر, والضوء (Light) لفترات التعرض لـ 24 ساعة ظلام, 12 ساعة ضوء, 16 ساعة ضوء, 24 ساعة ضوء والاشعة فوق البنفسجية ((Ultraviolet كانت مدة التعريض 10 او 20 دقيقة. استنتج من تاثير العوامل الكيميائية والفيزيائية ان الاشعة فوق البنفسجية كانت الافضل في زيادة الوزن الطري والجاف للكالس. وان الضوء كان الاكثر تاثيرا في زيادة تراكيز المركبات الثانوية في المزارع النسيجية لكالس نبات السبحبح اذ بلغــــت لمركـــــب (p - hydroxy benzoic acid ) 00.0805, ولمركــــــــب (p - cinamoylmelianolone) 0.1461, ولمركب ((Azadirachtin 0.6234, ولمركــــب (1 - cinnamoyl - 3,11 - dihydroxymeliacarpin) 0.1983, ولمركب (Salanin) 0.1846 ملغم/غم. واوضحت النتائج ان جميع المعاملات سواء الفيزيائية والكيميائية ادت الى زيادة تركيز مركب الازادرختين Azadirachtin مقارنة بمعاملة السيطرة, وبلغ اعلى تركيز له 0.7262 ملغم/غم عند استخدام نترات الفضة بتركيز 0.3 ملي مولر. | This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biology Department, College of Science, Al - Mustansiriyah University. The major objective of this study was to elicitation of some secondary metabolites using abiotic elicitors added to the tissue culture medium of Melia azedarach L. plants. The productivity was compared with those produced by the intact plants. Plant parts (seeds and leaves) were disinfected by NaOCl at 1% for 5 min and 2% for 10 min respectively. Callus was initiated on leaves explants grown on MS medium supplemented with Benzyl adenine (BA) and 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) at concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l and another medium supplemented with Indole butyric acid (IBA) at concentrations 1.0, 2.0, 3.0 or 4.0 mg/l and Benzyl adenine (BA) at concentrations 0.5 or 1.0 mg/l. Results showed that 2, 4 - D at 1.0 mg/l was the most effective for increasing the percentage of callus induction reached 90% and the mean highest fresh weight reached 618.4 mg. The same combination was used for callus maintenance. The quality and quantity of phytochemicals were investigated using methanol extracts of leaves and Callus tissues were analyzed using High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Results also showed an increase of secondary metabolites concentration in methanol extracts of callus cultures. Callus cultures were treated with chemical and physical elicitors, namely : salicylic acid (SA) at the concentrations 50, 100, 150 or 200 mg/l, silver nitrate (AgNO3) at the concentrations 0.1, 0.2, 0.3 or 0.4 mM, and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the UV exposure time was 10 or 20 minutes. Results showed significant differences between the various treatments. UV increased callus fresh and dry weight. The highest concentration of secondary metabolites in callus cultures of Melia azedarach L. were obtain by light treatment, (p - hydroxy benzoic acid) 0.08050, (p - cinamoylmelianolone) 0.1461, (Azadirachtin) 0.6234, (1 - cinnamoyl - 3,11 - dihydroxymeliacarpin) 0.1983, (Salanin) 0.1846 mg\g. Results also showed that all chemicals and physical treatment led to increase concentration of Azadirachtin compared to control treatment and the highest concentration reached to 0.7262 mg\g when using silver nitrate at 0.3 mM.

دراسة وراثية مناعية للمصابات بداء انتباذ بطانة الرحم == Immunogenetic Study in Endometriosis Patients

Author name: ضياء جواد كاظم القاضي
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | علي حسين ادحية
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى تقييم الخلفية المناعية والوراثية - المناعبة لمرض انتباذ بطانة الرحم في عينة من المريضات العراقيات. تمثلت معايير التقييم بمايلي : مجاميع الدم ABO ومستضدات خلايا الدم البيض البشرية من الصنف الاول (A وB وC) والثاني (DR وDQ) وواسمات الخلايا اللمفية المحيطية (CD3 وCD4 وCD8 وCD56) والمستوى المصلي للحركيات الخلوية (IL - 4 وIL - 6 وIL - 10 وIFN - γ) والمستوى المصلي الكلي للغلوبيولينات المناعية (IgA وIgG وIgM) وبروتينات المتمم (C3 وC4) والبلعمة والمستوى المصلي لهرمون الحليب (Prolactin) والهرمونين الجنسيين FSH وLH.شملت الدراسة 54 امراة من المصابات بمرض انتباذ بطانة الرحم واللاتي كن مراجعات لمستشفى العلوية للنسائية والتوليد (بغداد) خلال الفترة اذار 2005 - كانون الثاني 2006. وكان معدل العمر لهن ± الخطا القياسي عند التشخيص 27.3 ± 5.4 سنة. شملت الدراسة ايضا عدد مماثل من النساء غير المريضات (عينة سيطرة) والمطابقات للمريضات من ناحية العمر (25.1 ± 6.7 سنة) والعرق (عراقيات عربيات).توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت مجموعة الدم A تكرارا مرتفع معنويا (Pc = 0.016) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (48.1 مقابل 22.2%)، في حين اظهرت مجموعة الدم O تكرارا منخفض معنويا (Pc = 4 x 10 - 4) في المريضات (5.6 مقابل 35.2%).2. اظهرت ثمانية من مستضدات خلايا الدم البيض البشرية تكرارا مرتفع معنويا في المريضات، وهي A28 (59.3 مقابل 14.8%) وB7 (66.7 مقابل 9.3%) وB12 (68.5 مقابل 16.7%) وB27 (46.3 مقابل 7.4%) وCw6 (44.4 مقابل 1.9%) وCw7 (68.5 مقابل 20.4%) وDR1 (59.3 مقابل 24.0%) وDR11 (27.8 مقابل 5.6%)، في حين اظهر مستضدان اخران تكرارا منخفض معنويا في المريضات وهما A19 (14.8 مقابل 44.5%) وB5 (5.6 مقابل 44.5%). وعند تقدير النمط الفرداني (HLA - halpotype) اتضح بان Cw7 هو اكثر المستضدات تكرارا في الانماط الفردانية المقدرة (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. اظهرت الخلايا اللمفية الموجبة للواسم CD3 (30.6 مقابل 60.5%) والواسم CD4 (13.4 مقابل 30.9%) تكرارا منخفض معنويا في المريضات، في حين لم تظهر الخلايا الموجبة للواسم CD8 فرقا معنويا ولكن كانت النسبة CD4/CD8 هي الاخرى منخفضة معنويا في المريضات (0.65 مقابل 1.6). اما الخلايا الموجبة للواسم CD56 فقد كان تكرارها في المريضات مرتفع معنويا عند المقارنة مع السيطرة (18.1 مقابل 10.6%).4. ارتفع المستوى المصلي معنويا (P ≤ 0.001) للحركي الخلوي IFN - γ في مريضات انتباذ بطانة الرحم عند المقارنة مع السيطرة (47.69 مقابل 21.26 بيكوغرام/مل)، وقد لوحظ ذلك ايضا للحركيات الخلوية IL - 4 (13.49 مقابل 10.47 بيكوغرام/مل) وIL - 6 (37.05 مقابل 22.11 بيكوغرام/مل) وIL - 10 (36.66 مقابل 20.74 بيكوغرام/مل) ولكن بمستوى اقل من المعنوية (0.05 و0.01 و0.01، على التوالي). ولمزيد من الفهم لدور الحركيات الخلوية في مرض انتباذ بطانة الرحم، فقد حسبت النسبة مابين IFN - γ وكل من IL - 4 وIL - 6و IL - 10 وكذلك مابين IL - 6 وكل من IL - 4 وIL - 10. اظهرت النسب الخمسة المحسوبة ارتفاعا في المرضى، ماعدا النسبة IL - 6/IL - 10 فقد كانت متقاربة في المريضات ونساء السيطرة,5. اظهرت الغلوبيولينات المناعي الثلاث (IgA : 172.7 مقابل 124.6 ملغم/د.لتر؛ IgG : 1437.9 مقابل 1126.3 ملغم/د.لتر؛ IgM : 159.3 مقابل 113.4 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي مرتفع معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.6. اظهر بروتيني المتمم (C3 : 72.3 مقابل 152.1 ملغم/د.لتر؛ C4 : 16.7 مقابل 32.3 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي منخفض معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.7. اظهر معامل البلعمة انخفاضا معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (17.37 مقابل 49.68%)، وكذلك الحال بالنسبة لمعامل NBT فقد انخفض هو الاخر معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات (21.18 مقابل 65.80%).8. لم يظهر المستوى المصلي لهرمون الحليب او هرمون LH فرقا معنويا مابين المريضات والسيطرة، وعلى العكس من ذلك فقد ارتفع معنويا (P ≤ 0.05) المستوى المصلي لهرمون FSH في المريضات مقارنة بنساء السيطرة (11.85 مقابل 6.06 ملي وحدة دولية/مل). | The present study aimed to evaluate immunological and immunogenetic backgrounds of endometriosis in a sample of Iraqi patients. The parameters of evaluation were ABO blood groups, HLA - class I (A, B and C) and - class II polymorphisms, peripheral lymphocyte markers (CD3, CD4, CD8 and CD56), serum level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IFN - γ), total serum level of immunoglobulins (IgA, IgG and IgM) and complement components C3 and C4, phagocytosis and serum level of prolactin and sex hormones (FSH and LH).Fifty four female patients with endometriosis were investigated. The patients were referred to the Al - Alwayia Hospital for Gynecology and Obstetrics (Baghdad) during the period March 2005 - January 2006. Their age's main ± standard error at the time of diagnosis was 27.3 ± 5.4 year. A similar number of healthy females (control sample) was included in the study, and they matched patients for age (25.1 ± 6.7 year) and ethnicity (Iraqi Arabs).The Study reached the following results : 1. Blood group A showed a significant (Pc = 0.016) increased frequency in patients as compared to controls (48.1vs. 22.2%), while blood group O showed a significant (Pc = 4 x 10 - 4) decreased frequency (5.6 vs. 35.2%). 2. Eight HLA antigens showed a significant increased frequency in patients. They were A28 (59.3 vs. 14.8%), B7 (66.7 vs. 9.3%), B12 (68.5 vs. 16.7%), B27 (46.3 vs. 7.4%), Cw6 (44.4 vs. 1.9), Cw7 (68.5 vs. 20.4), DR1 (59.3 vs. 24.0%) and DR11 (27.8 vs. 5.6%). Two further antigens showed a significant decreased frequency in the patients, and they were A19 (14.8 vs. 44.5%) and B5 (5.6 vs. 44.5%). HLA - halpotype estimation revealed that Cw7 occurred most frequently in most of the estimated haplotypes (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. Peripheral lymphocytes positive for CD3 (30.6 vs. 60.5%) and CD4 (13.4 vs. 30.9%) showed a significant decreased frequency in patients, while CD8+ lymphocytes showed no significant difference. The CD4/CD8 ratio also showed a significant decrease (0.65 vs. 1.6). The only cells that showed a significant increased frequency were CD56+ cells (18.1 vs. 10.6%). 4. Interferon - γ showed a significant (P ≤ 0.001) increased serum level in endometriosis patients as compared to controls (47.69 vs. 21.26 pg/ml). The same increase was observed for IL - 4 (13.49 vs. 10.47 pg/ml), IL - 6 (37.05 vs. 22.11 pg/ml) and IL - 10 (36.66 vs. 20.74 pg/ml), but with a lower level of significance (P ≤ 0.05, 0.01 and 0.01, respectively). For a further understanding of cytokines in endometriosis, the ratio of IFN - γ to IL - 4, IL - 6 and IL - 10, as well as, the ratio of IL - 6 to IL - 4 and IL - 10 were assessed. The five assessed ratios were increased in the patients as compared to controls, with the exception of IL - 6/IL - 10 ratio, which came approximated in patients and controls. 5. The three immunoglobulins (IgA : 172.7 vs. 124.6 mg/dL; IgG : 1437.9 vs. 1126.3 mg/dL; IgM : 159.3 vs. 113.4 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) increased serum levels in patients as compared with controls. 6. Both complement components (C3 : 72.3 vs. 152.1 mg/dL; C4 : 16.7 vs. 32.3 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) decreased serum levels in patients as compared with controls. 7. The phagocytic index was significantly (P ≤ 0.001) decreased in the patients as compared with controls (17.37 vs. 49.68 %). Similarly, the NBT index was also significantly (P ≤ 0.001) decreased (21.18 vs. 65.8 %) in the patients. 8. Serum level of prolactin and luteinizing hormone (LH) hormones showed no significant difference between patients and controls. In contrast, the follicle stimulating hormone (FSH) showed a significant (P ≤ 0.05) increased serum level in endometriosis patients as compared with controls (11.85 vs. 6.06 mIU/ml).

دراسة وراثية وجزيئية لعزلات محلية مرضية من بكتريا Klebsiella المقاومة للمعادن الثقيلة والمنتجة لانزيم B - Lactamase == A Genetic and Molecular Study of Local Pathological Isolates from Klebsiella Resistant to Heavy Metal and Productive of ? - Lactamase Enzymes

Author name: صلاح مهدي حسن السعدون
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (536) عينة ادرار من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من اربعة مستشفيات في بغداد للفترة الواقعة من 22/12/2004 - 27/5/2005.2 - من خلال نتائج الزرع البكتريولوجي الاولي استطاعت (286) عزلة (63.8%) من النمو باستخدام وسطي اكار الماكونكي واكار الدم وقد كان من بينها (85) عزلة مخاطية وبنسبة (29.7%)، فيما اظهرت نتائج التشخيص المورفولوجي والكيموحيوي للعزلات المخاطية ومن خلال نتائج استخدام نظام Api 20E عائدية (36) عزلة الى جنس الكلبسيلا، توزعت مابين (18) عزلة للنوع K.planticola K.pneumoniae و(7) و(6) عزلات للنوع عزلات للنوع K.terrigena و(4) عزلات للنوع K.oxytoca و(1) عزلة للنوع K.ornithinolytica. 3 - تم التحري عن عدد من عوامل الضراوة لانواع الكلبسيلا، اذ اظهرت نتائج الفحص المجهري باستعمال طريقة التصبيغ السالب ان العزلات جميعها (100%) محاطة بمحفظة، كما بينت جميع العزلات (100%) عدم قدرتها على انتاج الهيمولايسين، بينما اظهرت (61.1%) من العزلات قدرتها على انتاج السايدروفورات بنموها في الوسط الحاوي 2 - 2 ثنائي بايريديل (M9)، واظهرت جميع العزلات ايضا (100%) قابلية الالتصاق بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار اناث صحيحات، فيما كان (66.6%) من العزلات منتجة للبكتريوسين.4 - اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز باستخدام الطريقة اليود القياسية السريعة، اذ اظهرت (23) عزلة (63.8%) قدرتها على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز بهذه الطريقة، بفترات تراوحت مابين اقل من دقيقة الى (5) دقائق.5 - اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف باستخدام الطريقة الثلاثية الابعاد (غير المباشرة)، واظهرت النتائج بان 18 عزلة من مجموع 36 (33.3%) لها القدرة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف توزعت مابين 5 عزلات من مجموع 18 (27.7%) للنوع K.planticola و3 عزلات من مجموع 6 (50%) للنوع K.pneumoniae وعزلتان من مجموع 7 (28.5%) للنوع K.terrigena وعزلة واحدة من مجموع 4 (25%) للنوع K.oxytoca وعزلة واحدة فقط من مجموع 1 (100%) للنوع K.ornithinolytica.6 - اجري اختبار الحساسية للمضادات لجميع العزلات تجاه (24) مضادا للحياة، لقد اظهرت جميع العزلات نمط المقاومة المتعددة، اذ كانت (100%) من العزلات مقاومة للامبسلين والكاربنسلين والببراسلين والسيفالوكسين، بينما كانت العزلات جميعها حساسة للاميكاسين والسفيبيم والاميبينيم والنورفلوكساسين، فيما تفاوتت نسب المقاومة لباقي المضادات.7 - حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من البنسلينات والسيفالوسبورينات ومجموعة الامينوكلايكوسيدات والكينولونات وغيرها من المضادات، واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في قيم الـMIC بين الانواع البكتيرية المختلفة سيما المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف، فقد استطاعت اغلب العزلات مقاومة تراكيز عالية من الامبسلين، والكاربنسلين والببراسلين والسسيفالكسين غير انه لم تستطع سوى عزلات قليلة وبضمنها المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف من النمو في تراكيز عالية من الاميكاسين (AK)، والسيفيبيم (PEF)، والامبينيم (IMP)، والنورفلكساسين (NX)، والسيروفلكساسين (CF).8 - درست قابلية العزلات على تحمل تراكيز مختلفة من المعادن الثقيلة وذلك بانمائها على اوساط ضمت تراكيز مختلفة من تلك المعادن. وقد اظهرت النتائج انخفاضا في مستوى تحمل البكتريا للمعادن الثقيلة، وكان هنالك اختلافا واضحا من بين تلك العزلات لتحمل معدن النحاس، الكروم، الكوبلت، الزنك، الكادميوم، الزئبق، الرصاص، الفضة. 9 - تمت دراسة محتوى الدنا البلازميدي لمجموعة من العزلات والتي اظهرت مديات عالية من المقاومة لمضادات الحياة والمعادن الثقيلة، وبينت النتائج احتواء معظم العزلات على اكثر من حزمة بلازميدية واحدة، بينما خلت بعض العزل من اي حزم وبذلك تصبح مقاومة للمضادات والمعادن الثقيلة فضلا عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز صفة الكروموسومية.10 - اجري فحص الاقتران البكتيري مابين عزلات منتقاة من انواع بكتريا الكلبسيلا اتسمت بمقاومتها العالية الى اكثر من مضاد وتحملها للمعادن الثقيلة فضلا عن انتاجها لانزيمات البيتالاكتاميز وبين السلالة القياسية E.coli MM294، وقد استطاعت 9 عزلات من مجموع 14 عزلة تحقيق عملية الاقتران بنجاح (وبنسبة 64.2%) فيما اخفقت 5 عزلات، واستطاعت الخلايا الاقترانية الناتجة من التزاوج من النمو على اوساط الاختبار الحاوية على مضادي الامبسلين والريفامبسين معا. 11 - تم التحري عن المحتوى البلازميدي للخلايا الاقترانية ووجد ان اغلب البلازميدات كانت قد انتقلت من السلالة الواهبة متمثلة بالعزلات قيد الدراسة الى السلالة القياسية، اذ استطاعت 7 عزلات اقترانية من مجموع 9 وبنسبة (77.7%) من اعطاء فحص انزيم البيتالاكتاميز موجب ونسبة (77.7%) لفحص التحري عن ESBLs. فضلا عن ذلك فقد انتقلت مقاومة مشتركة لاكثر من مضاد حيوي ومعدن ثقيل للخلايا الاقترانية مما يدل على ان هذه الصفات محمولة بلازميديا. | 1 - This study included the collection of 536 urine samples from patients suffering urinary tract infection from four hospitals located in Baghdad to the period between 22/12/2004 - 27/5/2005. 2 - Using MacConkey blood agar in primary bacterialogical culture, 286 isolates (63.84) were grown, among them 85 isolate (29.71) were mucoid. Result of morphological & Biochemical diagnosis besid using Api 20E showed there were 36 isolates related to genus Klebsiella. These comrised as K.planticola (18 isolates), K.terrigena (7 isolets) and K.pneumonia (6 isolates) & K.oxytoca (4 isolates) and one isolates of K.ornithinolytica. 3 - Some virulence factors of Klebsiella species were detected. Microscopic examination using negative stain revealed that all the isolates (100%) were capsulated, besid they were unable to produce heamolysine. While (16.1%) of the isolate were siderophore producer when they showed their ability to grow in 2 - 2 dipyridyl media (9M media). All the isolates (100%) showed adherence ability to epithelial cell isolated from urine of healthy women, whereas 66.6% of the isolates were bacteriocin producer. 4 - The rapid standard iodometric method was used for the dection of B - lactamase production. Results showed that 23 isolate (63.84) were B - lactamase producer and the time of positive results ranged from less than (1 - 5)mins. 5 - The indirect three - dimentional method was performed to detect the Extended - spectrum B - lacatamase (ESBLs). Results revealed that only 18 isolates (33.3%) were ESBLs producer. These comprised 5 isolated from 18 (27.7) to K.planticola, 3 isolates from 6 (50%) to K.pneumonia, 2 isolates from 7 (28.5%) to K.terrigena, one isolates from 4 (28%) to K.oxytoca & one isolate (100%) to K.ornithinolytica. 6 - Antibiotic sensitivity test was performed using 24 different antibiotic. All isolates showed multidrug resistance. Results showed that all the isolate (100%) were able to resist Ampicillin, Carbencillin, Piperacillin, Cephalexin, while they were sensitive towards Amikacin, Cefepime, Imepinem and Norflaxacin. Resistance rate to other antibiotic were variant. 7 - The minimal inhibitory concentration (MIC) for Penicillins & Cephalosporins, Aminoglycoside group, Qinolones & other antibiotics were determined. Considerable differences observed between the MIC for ESBLs producer isolates and the non - producer - both groups were able to resist high concentration of Ampicillin, Carbenicillin, Piperacillin & Cephalexin while only the ESBLs producer outcome of non - producer isolates were able to grow in considerable concentration of Amikacin, Cefepime, Imepinem, Norflaxacin & Ceprofloxacin. 8 - The ability to tolerate different concentration of heavy metals were studied by growing them in media containing different concentration of these metals. There were great differences & decreas & in the level of bacterial tolerance to heavy metals including (Cu, Cr, Co, Zn, Cd, Hg, Pb, Ag) while many isolates could not tolerate low concentration of copper nor chrome. 9 - Plasmid profile of some isolated specially these showed high antibiotic & heavy metal resistance were determined. Result showed that most of the isolates examined harboured more than one plasmid band. While some isolates were plasmidless, A condition implying that B - lactamase production, antibiotic & heavy metal resistance are under chromosomal control. 10 - Bacterial conjugation was performed between selected isolates of Klebsiella specially those with high antibiotic resistance, heavy metal tolerance, besid B - lactamase production and the standard strain E.coli MM294. There were (9) successful conjugation from 14 (64.2%). The transconjugant cells were able to grow of selective media containing both of Ampicillin & Rifampicin. 11 - Studying plasmid profile of transconjugated cells showed that most the plasmid were transferred from the donore (represented by bacterial isolated) to recipient (the stander stranted). Out of 9, 7 transconjugant cells (77.7%) gave positive result to B - lactamase production & ESBLs. In addition multidrug resistance & heavy metal tolerance were transferred to the transconjugant cells, a condition implying that they are plasmid mediated.

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

Author name: علاء سالم حمزة
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة وراثية للبكتريوسين المنتج من بكتريا Klebsiella spp. المعزولة من مصادر سريرية مختلفة

Author name: علاء سالم حمزة حبيب
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع (200) عينة سريرية توزعت الى (50) عينة ادرار و(50) عينة قشع و(50) عينة من التهابات الاذن الوسطى و(50) عينة من اصابات الجروح والحروق، ومن خلال نتائج الزرع البكتريولوجي على اوساط اكار الماكونكي واكار الدم ووسط Eosin Methylen Blue , والتشخيص المظهري والكيموحيوي، وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API20E ، تم الحصول على( 40 ) عزلة تعود لبكتريا Klebsiella. توزعت الى 20 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و(11) عزلة للنوع K.oxytoca و(9) عزلات تعود للنوع K.planticola . تم الكشف عن مدى قابلية العزلات على انتاج البكتريوسين بثلاث طرائق تضمنت : طريقة الحفر (wells)، وطريقة اقراص الاكار cup assay))، وطريقة التخطيط المتقاطع ( (cross - streaking assay. وتم الحصول على سبع عزلات منتجة للبكتريوسين . تم استخلاص البكتريوسين بنوعيه المرتبط بالجدار وغير المرتبط بالجدار , واظهر البكتريوسين الخام المرتبط بالجدار فعالية عالية مقارنة بالبكتريوسين غير المرتبط بالجدار , وكانت فعالية البكتريوسين المرتبط بالجدار (5120) وحدة/مل، وكان تركيز البروتين (4000) مكغم/مل وقطر منطقة التثبيط (20) ملم , بينما كانت الفعالية للبكتريوسين غير المرتبط (320) وحدة/مل وتركيز البروتين (500 )مكغم/مل وقطر منطقة التثبيط (15) ملم . اظهر البكتريوسين الخام المرتبط بالجدار تاثيرا على مجموعة من البكتريا المرضية تضمنت Enterobacter sakazaki ، Shigella flexneri، E. coli، Acinetobacter baumannii ، Enterobacter aerugenes ، K.planticola Proteus mirabilis ، Serratia marcescens، Enterococcus fecalis ، Staphylococcus aureus . ولم يظهر البكتريوسين فعالية على Enterococcus faecalis ، Serratia marcescens ، Proteus mirabilis ، Pseudomonas aeruginosa تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحيوية للعزلات البكتيرية المنتجة للبكتريوسين، فقد تم استخدام (13) مضادا حيويا شملت كل من ( Cefotaxim وGentamycin وNorfloxacinو Nitrofurantoinو Amikacinو Ampicillin وTrimethoprimو Pipracillinو AztreonamوImipenem وCiprofloxacin وAugmentin وCephalexin ) وتم اختيار العزلات الاكثر مقاومة لهذه المضادات لاكمال الجانب الوراثي . تمت دراسة المحتوى البلازميدي للعزلات الاربعة (K2, K4, K20,K38) التي كانت اكثر مقاومة لمضادات الحيوية , وبينت النتائج احتواء العزلة(K4 )على حزمتين بلازميديتين، اما العزلات الاخرى فقد احتوت على حزمة بلازمية واحدة , ثم اجريت عملية تحييد الدنا البلازميدي باستخدام مادتي SDS ومادة Acridin orange , لم تنجح مادة SDS في تحييد الحزم البلازميدية , بينما نجحت مادة Acridin orange في تحييد الحزم البلازميدية عند تركيز (512) مايكروغرام/مل .تم التحري عن قابلية العزلات المحيدة على انتاج البكتريوسين والمقاومة لبعض مضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة واظهرت النتائج فقدان العزلات (K2, K4, K38) لصفة انتاج البكتريوسين، واحتفاظ العزلة ((K20 بصفة انتاج البكتريوسين. بالنسبة لمضادات الحيوية , احتفظت العزلات بمقاومتها لمضادات Ciprofloxacin وNorfloxacin وTrimethoprim , اما بقية المضادات والتي شملت كل من Pipracillin وAztreonamو Ampicillin وCefotaximو Gentamycinو Nitrofurantionو Amikacinو Cephlexin وAugmentin، فقد اصبحت العزلات حساسه لها.اجري فحص الاقتران البكتيري بين العزلات (K2, K4, K20,K38) والعزلة القياسية E.coliMM294, وقد نجحت العزلتان ( K2, K4) في تحقيق عملية الاقتران بينما فشلت العزلتان (K20,K38) في تحقيق عملية الاقتران , وقد اكتسبت العزلة القياسية صفة انتاج البكتريوسين والمقاومة لمضادات الحيوية قيد الدراسة . | The study included (200) clinical sample, (50) urine,(50) sputum , (50) sample of otitis media and (50) sample with injuries and burns. Morphological and biochemical tests were employed to diagnose bacterial species and the results showed they were (40) isolates.They were (20) K.pneumoniae ,(11) isolates of K.oxytoca and(9) isolates of K.planticola. The ability of isolates to produce bacterocin were detected by three methods included the methods of wells, cup assay method, and cross - streaking assay. Results revealed that(7) isolates were able to produce bacteriocin.The wall - degraded bacteriocin was (5120) unit\ml, and protein concentration was (4000) μg/ml and the diameter of inhibition area was 20mm, while non wall - degraded was (320)unit\ml and the protein concentration (500) µ\ml and the inhibition area (15) mm. The effect of crude bacteriocin on some clinical isolates including Enterobacter sakazakii,S.auereus, K.oxytoca , Shigella flexneri, E. coli, Acinetobacter baumannii, K. planticola and Enterobacter aerogenes was studied. The results showed thier was effect on the above isolates, while the isolates of Proteus mirabilis, Serratia marcescens, Enterococcus fecales and Ps.aeruginosa were resistant to bacteriocin. Sensitivity of isolates that produced the bacteriocin was tested against (13) antimicrobial agents included (Cefotaxime, Gentamycin, Norfloxacin, Nitrofurantoin, Amikacin, Ampicillin, Trimethoprim, Pipracillin, Aztreonam, Ciprofloxacin, Imipenem ,Augmentin and Cephalexin). Results revealed that four isolates were resistant to the antibiotics. The plasmid content of the four isolates (K38, K20, K4, K2) which were the most resistant to the abovementioned antibiotics was studied ,The results showed That these isolates contain plasmids of different molecular weight. Curing was conducted by the use of SDS and Acridin orange. The isolates lost the plasmids at concentration 512µg/ml of Acridin orange. The production of bacteriocin and the resistance of the four selected isolates to the antibiotics were studied. The results showed that three of the examined isolates were unable to produce bacteriocin, they were (K38, K4, K2).The fourth isolate(K20) was able to produce bacteriocin.The four isolates appeared to resist the antibiotics Trimethoprim, Ciprofloxacin and Norfloxacin, while they were sensitive to the other antibiotics. The bacterial conjugation between (K38, K20, K4, K2) isolates and the standard strain E.coli MM294 was studied. The results showed That (2) isolates (K4, K2) were successful in transferring plasmids , while the other two (K20, K38) failed. The transconjugants were able to produce bacteriocin and resist Antibiotics.

تقدير مستوى انترلوكين - 1 - بيتا وانترلوكين - 6 في مصول وادرار اطفال مصابين بالتهاب الحويض والكليه الحاد == Estimation of IL - 1? and IL - 6 in Sera and Urine of Acute Pyelonephritis Patients

Author name: علاء لعيبي عبد الله الصرخي
Supervisor name: انتصار ناظـم خلخال
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد التهاب الحويض والكلية الحاد من الامراض المعدية الشائعة في الاطفال وقد يؤدي الى تلف الكلى الدائم.صممت هذه الدراسة لغرض قياس مستويات اثنين من الانترلوكينات المهمة خلال الاصابة البكتيرية هما IL - 6 او IL - 1β، لدى الاطفال المصابين بالتهاب الحويض والكلية الحاد ولتحقيق هذا الهدف فقد جمعت (95) عينه ادرار ودم من اطفال باعمار تتراوح من (2شهر - 12عام) يعانون من حمى,حرقة عند التبول, وكثرة التبول (زيادة عدد مرات التبول) في مستشفى ابن البلدي للاطفال ومستشفى حميات للاطفال (بغداد) لمدة خمسة اشهر فضلا عن (20) عينه ادرار ودم لاطفال اصحاء من نفس الفئة العمرية عدت كمجموعة سيطرة. شخص 26 من الاطفال المصابين بالتهاب الحويض والكلية الحاد بواسطة الاعراض السريرية المميزة (حمى,غثيان,قيء, الم في الخاصرة , مع عسر وكثرة التبول) من قبل الاخصائي بالامراض البولية كما تم تاكيد التشخيص بالفحوصات المختبرية المتوفرة فضلا عن اجهزة الكشف بالموجات فوق الصوتية. كانت نتائج النسب المئوية للمظاهر السريرية للمصابين (الحمى,كثرة التبول,الم خاصرة، عسر التبول,والغثيان او القيء (88,4%, 83,3%, 61,5 %, 53,8%, 34,6%) على التوالي.اما نسب الحالات الاخرى (المعقدة) فكانت : 34,4% مع ارتداد مثاني, 23% مع hydronephros،19,2%يعانون من فشل كلوي حاد, 7,6% حصى الكلية 3,6% مع ارتفاع ضغط الدم.اظهرت النتائج ان النسبة المئوية للاطفال المصابين من الذكور (65,38%) اعلى من الاناث (34,62) كما ظهرت فروقات معنوية واضحة بين المصابين من الفئات العمرية المختلفة مقارنة مع بعضها وكذلك مع السيطرة,كذلك ظهرت فروقات معنوية مهمة في اعداد الخلايا القيحية والبكتريا البولية فضلا عن تراكيز البروتين البولي عند مقارنتها بين الفئات العمريه ولدى الجنسين كذلك مع السيطرة.شخصت العوامل المسببة للاصابة باستخدام نظام(Vitek2) وتم تاكيد التشخيص عند زرع الادرار على وسط اكار عالي الدقة والخصوصية باصابات المسالك البولية (HiCrome) تعتمد نتيجة التشخيص على التفاعل اللوني بين انزيمات العزلات البكتيرية المختلفة ومكونات الوسط الزرعي المتخصص هذا. واظهرت النتائج ان النسب المئوية للعزلات البكتيرية كانت كالاتي : (50%, 15,38% ,7,6%, 23,09%) لبكترياEnter.fecalis ,S.aureus ,E.coli, اصابة مختلطة باكثر من جنس بكتيري , فضلا عن الخميرة Candida albecans (3,85%)، كما ازدادت اعداد خلايا الدم البيض لاسيما الخلايا العدلة وعلى مستوى (p<0.05) , وبمستوى (p<0.01) عن بروتين CRPلدى الاطفال المصابين مقارنة مع مجموعة السيطرة، بينما لم تظهر اي فروقات معنوية في مستويات اليوريا والكرياتنين في الدم بين المرضى والسيطرة.قيسـت تراكـيز IL - 1β في الادرار والمصل للاطفال المصابين وكانت معدلاتها (1060,09, 571,84) جزء من الغرام/ مل على التوالي واظهرت فروقا معنوية مهمة عند مقارنتها مع معدلاتها في ادرار ومصول اطفال السيطرة ( 34,5, 45,29) جزء من الغرام/ مل عند مستوى معنوية (p < 0.05).لوحظت فروقات معنوية واضحة عند مقارنة معدلات IL - 6 في الادرار والمصل والتي بلغت ( 109,42, 28,86) جزء من الغرام/ مل مع معدلاتها لدى السيطرة (12,59, 6,93) جزء من الغرام/ مل عند مستوى معنوية ((p< 0.05. | Acute pyelonephritis (APN) is a common infectious disease in children may result in permanent renal damage. This study has been designed for measuring the level of IL - 1β and IL - 6 in pediatric APN during bacterial infection .A total of (95) urine &blood sample have been collected from children 2month - 12 years suffering from fever, dysurea, frequency from Dec.2013 - Apr.2014 at Ibn Al - Blady hospital and Welfare Teaching Hospital/ Medical city in Baghdad. Twenty Sample from healthy individuals of the same age range as control group. Twenty - sex patients of APN were included in the present study, those patients have been diagnosed by urologist, the diagnosis have been confirmed by available investigation methods; laboratory tests and ultrasound. Results of clinical features (fever, frequency, loin pain, dysuria and nausea or vomiting) were 88.4%, 83.3%, 61.5%, 53.8%, 34.6% respectively, Others were presented as complicated cases 34.6% with vesicoureteral reflux, 23.0% with hydronephros, 19.2% with acute renal failure, 7.6% with stone and 2.6% with hypertension. The percentage of infected males 65.38% was higher than females 34.62% and clear significant differences (p < 0.01) were noted between patients of different ages groups .Also important differences (p < 0.01) have been appeared in pyuria nembers and bacteruria as well as in proteinuria concentrations when compared between patients of two genders in different age groups to control group. Vitek 2 system has been used for suspected the identification of APN causative agents , diagnosis that was supported by culturing urine samples on high specialized and accurate medium; HiCrome medium which is specific for UTIs, Identification result depend on coloured reaction between microorganism enzymes and some reagents in that culture medium.Results were as following : 50.0% of E. coli , 15.38% of Staphylococcus. aureus , 7.6% of Enterococcus.faecalis ,and 23.09% of mixed infection (more than one bacterial genus), finally the yeast Candida albicans is 3.85%.No significant differences in urea and creatinine levels in patients sera compared to control while white blood cells specially neutrophiles (p < 0.05) as well as C - Reactive protein (p < 0.01) were significantly higher in patients than control. Level of IL - 1β has been measured in urine and serum of patients, the means 1060.09, 571.84 pg/ml respectively , have been clarified important significant differences p < 0.05 in comparison with their levels in controls 34.05, 45.29 pg/ml . Apparent significant differences p < 0.05 have been showed between IL - 6 concentration in urine and serum of patients ,means were; 109.24, 28.86 pg/ml comparing to control 12.59, 6.93 pg/ml .

تقييم بعض عوامل التخثر وتضخيم جين tRNA - histidine لدى الاشخاص المصابين بداء السكري النوع الثاني == Estimation of Some Clotting Factors and PCR Amplification of tRNA histidine in Type2 - Diabetic Patients

Author name: صفا نهاد عبد شبر
Supervisor name: داخل غاني عمران الوطيفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: يتميز مرض السكري Diabetes Mellitus بحصول اضطرابات في ايض سكر الكلوكوز وينتج مرض داء السكري اما بسبب انخفاض افراز الانسولين او عدم استجابة الانسجة المحيطة لهرمون الانسولين بصورة طبيعية.طبقت الدراسة الحالية لتقييم تراكيز بعض عوامل التخثر Clotting Factors الموجودة في المسارات الداخلية Intrinsic والخارجية Extrinsic والعامة Common لدى المرضى المصابين بداء السكري من النوع الثاني Type2 - diabetes ومن خلال الجنسين (رجال ونساء).شملت الدراسة الحالية فحص 180 شخصا، كان منهم 90 شخصا مصابا بداء السكري النوع الثاني ( 45 رجلا و45 امراة). اما العدد الباقي (90 شخصا) فقد كانوا اشخاص اصحاء استخدموا كمجموعة سيطرة (45 رجلا و45 امراة). وطبقا للفترة العمرية فقد قسم اشخاص الدراسة الى ثلاث مجاميع، المجموعة الاولى (40 - 49 سنة)، المجموعة الثانية (50 - 59 سنة)، المجموعة الثالثة (60 - 69 سنة).اظهر جميع المرضى في هذه الدراسة ارتفاعا معنويا (P < 0.05) في مستوى تراكيز سكر الدم Blood Sugar عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء.وبشان نتائج عوامل التخثر اظهرت قيم تركيز الفايبرنوجين (وهو المكون الرئيسي للمسار العام) انخفاضا واضحا (P > 0.05) في اغلب مجاميع المرضى المصابين بداء السكري بالمقارنة مع مجاميع الاشخاص الاصحاء.وفيما يخص نتائج العامل الثابت Stable Factor (FVII) وهو من اهم مكونات المسار الخارجي لتخثر الدم فقد اعطت ارتفاعا ملحوظا (P < 0.05) في اغلب مجاميع مرضى داء السكري عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء.بينت قيم تراكيز العامل المضاد للنزف (FVIII) Anti - hemophilic وهو المكون الرئيسي في المسار الداخلي، انخفاضا معنويا (P < 0.05) لدى اغلب المجاميع العمرية المصابة بداء السكري عندما قورنت مع الاشخاص الاصحاء.وبخصوص تقنية Poly Chain Reaction (PCR) والتي تضمنت عزل الجين المسؤول عن تشفير الحامض tRNA - histidine فقد بينت عدم وجود اختلافات بين عينات مرضى داء السكر والجين tRNA - histidine.ومن النتائج المبينة في ماسبق، يمكن الاستنتاج بان المسار الخارجي لتخثر الدم يبدو اكثر فاعلية عند مرضى السكري نسبة للمسار الداخلي Intrinsic من خلال ارتفاع مستوى تركيز العامل Stable Factor (FVII) والذي بدوره يجعل مرضى السكري اكثر عرضة لحصول الجلطات الدموية. | Diabetes mellitus is commonly defined as a metabolic disturbances of glucose metabolism resulted because of either insulin release deficiency or peripheral tissue that does not respond properly to insulin. The present study was applied to estimate specific clotting factors included in extrinsic and common pathway of patients affected with type - 2 diabetes mellitus from both sexes (men and women). The study included 180 subjects, of those, ninety (90) subjects (45 men, 45 women) were affected with type - 2 diabetes mellitus. The others remaining number (90) were used as a healthy control sample (45 men, 45 women). According to age, all subjects of the study (patients and control) were subdivided into three subgroups; (40 - 49 ) , (50 - 59) , and (60 - 69) years old. The resulted showed a significant increase of glucose level (P < 0.05) compared with the healthy group. Regarding results of clotting factors, values of fibrinogen, the final components of common pathway, explained a marked drop (P < 0.05) in most patient groups matching with the healthy groups. About results of stable factor (F VIII), the essential components of extrinsic pathway, explained a remarks heightening (P < 0.05) in most of diabetic patient groups when compared with healthy control groups. Results of anti - hemophilic factor (principal factor of intrinsic pathway) were significantly decreased (P <0.05) in most patients groups of both sexes matching with healthy groups. Concerning data of PCR technique which involved gene encoding tRNA - histidine did displayed no differences between tRNA - histidine and diabetic patients. From results which are explained above it can be concluded that extrinsic pathway of blood clotting appears more active in relative to intrinsic pathway through increased concentration of factor (VIII) which in turns can render the diabetic patients who are highly susceptible to thrombotic events.

دور عصيات حامض اللبنيك كنبيت طبيعي للتاثير على البكتيريا المرافقة المعزولة من الجهاز التناسلي الانثوي == The role of Lactobacilli as a normal microflora in preventing vaginal infection

Author name: صبا عبد الهادي مهدي شبع
Supervisor name: اكرام امين خاكي | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت خمسين عزلة لعصيات حامض اللبنيك من اعالي المهبل من نساء متزوجات مصابات بطريقة المسحة High Vaginal Swab(HVS) تراوحت اعمارهن بين 16 - 45 سنة واخضعت جميع العزلات للفحوصات المجهرية والزرعية الى جانب الفحوصات الكيموحياتية.اختبرت قدرة عزلات عصيات حامض اللبنيك على اعطاء افضل فعالية تضادية على وسط MRS الصلب بطريقة الاقراص Cup Assay Methodضد بعض المجاميع المرضية ومن ثم حضرت رواشح للعزلات الفعالة ودرست قابليتها على التثبيط في وسط MRSالسائل استنادا الى طريقة الانتشار في الحفر .Well Diffusion Assay Method اختبر تاثير pH في الفعالية التثبيطية لهذه الرواشح باستخدام قيم مختلفة للاس الهيدروجيني واجري فحص اختبار الحساسية لعصيات حامض اللبنيك. لوحظ مقاومة عصيات حامض اللبنيك لمعظم المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وان فاعلية الرواشح البكتيرية ضد الممرضات المهبلية كانت افضل مقارنة بفاعلية العزلات.عند اجراء التحليل الاحصائي لمقارنة نتائج تقدير الفعالية التضادية لوحظ وجود فروق معنوية بين انواع عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لخميرةCandida على الوسط الصلب وقد امتلك النوع L.jensenii اعلى فاعلية تثبيطية لها كما تباينت رواشح عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لعزلات الاختبار اذ اظهرت هذه الرواشح اعلى تاثيرا ضد خميرة Candida وامتازت بكتريا E.coli بامتلاكها ادنى مستوى تاثر بهذه الرواشح. اعطت رواشح عزلات عصيات حامض اللبنيك افضل فعالية تثبيطية في pH (4) مقارنة بفعاليتها التثبيطية في pH (5,6) على التوالي في حين لم تظهر اي فعالية تثبيطية للرواشح ضد عزلات الاختبار في pH (7) وقد ظهر ذلك واضحا عند اجراء التحليل الاحصائي وقد وجد ان الاس الهيدروجيني المنخفض (4)يملك تاثيرا تثبيطيا ضد البكترية والخمائر المهبلية الممرضة اكثر من الاس الهيدروجيني الاعلى. | Fifty isolates of lactobacillus ssp. were taken from infected married women vagina by high vaginal swab. The age of the women ranged between (16 - 45) years. The isolated lactobacilli were identified by microscopical, cultural and biochemical tests. The effect of these isolates against pathogenic microorganism were tested on MRS agar medium by using cup assay method where as supernatant from active isolates were tested using the well diffusion assay. The effect of pH of the medium on the inhibitory effect of lactobacilli were also tested by using different values of pH. It has been observed that lactobacillus were resistant to most commonly used antipiotics which where used in this staday and the antimicrobial activity of lactobacillus supernatant were best compore with the antimicrobial activity of lactobacillus isolates against vaginal pathogens When the statistical analysis were done to compare the results of antimicrobial activity significant differences were observed between the lactobacilli species in their antimicrobial activity on Candida on solid MRS agar medium and L.casei have the highest antimicrobial activity, also supernatants of lactobacilli species were different in their antimicrobial activity thus these supernatants had highest effect on Candida while E. coli had lower value of effect by these supernatants, also these supernatants showed best antimicrobial activity at pH (4) compard with their antimicrobial activity at pH (5,6) and did not show any antimicrobial activity at pH (7) and that was clear when the statistical analysis were done. It has been found that low pH is more effective on the inhibitory activity of lactobacilli against vaginal pathogenic bacteria and Candida than at higher pH values

دراسة بكتريولوجية وبيئية لمياه نهر دجلة وثلاث محطات تصفية في محافظة بغداد == Bacteriological and Ecological Studies on Tigris River and three Purification Stations in Baghdad province

Author name: صبا حسين محمد النعيمي
Supervisor name: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | خالد خورشيد كاظم البياتي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمن هذا البحث دراسة بعض العوامل الخاصة بمياه الشرب المؤثرة في صحة الانسان في مدينة بغداد . العامل الاول : هو العامل البايولوجي والفيزيائي والكيميائي الذي يؤثر في جودة مياه نهر دجلة . والعامل الثاني يتضمن دراسة كفاءة تعقيم المياه في ثلاثة محطات تصفية منشاة على طول نهر دجلة . اما العامل الثالث فقد تضمن تقييم مياه الشرب في منطقة الشعلة التي تزود بالمياه من احدى محطات التصفية ( محطة الكرامة ). فضلا عما سبق ,فقد تضمنت الدراسة مقارنة بين تلوث الماء من الناحية البكتريولوجية وحالات الاسهال في الاطفال تحت عمر السنتين, الذين قد راجعوا العيادة الخارجية لمستشفى الشهيد باقر الحكيم في منطقة الشعلة . تضمنت الدراسة ايضا تعيين جودة المياه في ثلاث محطات رئيسة للتصفية , وهي محطة شرق دجلة الواقعة شمال دجلة ومحطة الكرامة الواقعة في وسط دجلة فضلا عن محطة القادسية الواقعة جنوب نهر دجلة في مدينة بغداد , اخذت عينات الماء بواقع مكررين شهريا قبل وبعد عملية التصفية من المحطات المذكورة انفا ابتداءا من كانون الاول - 2009 ولغاية ايلول - 2010 . اما التحاليل البكتريولوجية للماء فقد تضمنت تقدير العدد الحي الكلي للبكتريا والعدد الحي الكلي للبكتريا المعوية والعدد الكلي لبكتريا E.coliوبكتريا Pseudomonas aeruginosa. فضلا عن وجود بعض البكتريا المعوية المرضية مثل Vibrio cholera وspp. Salmonella. حيث جمعت 60عينة من مياه النهر و60 من داخل مشاريع التصفية . وقد استخدمت لتشخيص هذه الانواع من البكتريا الطرائق الاعتيادية المعروفة للتشخيص فضلاعن عدة .API20E بينما تضمنت التحاليل الفيزيائية والكيميائية للماء قبل وبعد عمليات التصفية تعيين المعايير الاتية, الحرارة وتركيز ايون الهيدروجين والكدرة والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الذائبة الكلية والملوحة والاوكسجين الذائب والمتطلب الحيوي للاوكسجين , فضلا عن درجات حرارة الهواء في محطات التصفية الثلاثة. وقد اخذت العينات بواقع مكررين وجمعت 60عينة مياه لقياس الاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين و60عينة اخرى لبقية الفحوصات الفيزيائية والكيميائية . كمااخذت اربعين عينة من ماء الحنفية من المنازل في منطقة الشعلة خلال اشهر الصيف وهي حزيران وتموز واب وايلول من عام 2010. وفي الوقت نفسه, وفي الفترات نفسها السابقة , اخذت عينات مماثلة (اربعون عينة ) من براز الاطفال تحت عمرالسنتين المصابين بالاسهال واربعون عينة مماثلة من براز اطفال اصحاء بالعمرنفسه للمقارنة ولتعيين انواع واعداد البكتريا الحية الكلية المرضية في هذه العينات . ولقد اشارت نتائج هذه الدراسات الى ان درجة حرارة الهواء اثرت بدرجات حرارة البيئة المحيطة وتراوحت بين (15 - 41 م), وكانت درجة حرارة مياه دجلة ما بين ( 13 - 32 م ) , بينما كانت درجة حرارة المياه بعد عمليات التصفية في المحطات الثلاثة بين ( 15 - 33 م) . كان تركيز ايون الهيدروجين للماء ( 7. 48 - 8.08 ) وبعد التصفية كان ( 7.31 - 7.89) اما كدرة مياه دجلة فقد تراوحت بين ( NTU156 - 26 ) ولمياه المحطات الثلاثة بين ( NTU 4 - 1 )كما بينت نتائج الدراسات الحالية الى ان التوصيلية الكهربائية لمياه دجلة كانت اقل منها في مياه المشاريع الثلاثة ( 606 - 776 مايكروسيمنز/سم ) و( 608 - 793 مايكروسيمنز/ سم ) على التوالي . والمواد الصلبة الذائبة الكلية لمياه المحطات ( 425 - 555 ملغرام / لتر ) ولمياه النهر كانت ( 429 - 554 ملغرام / لتر ) . بينما لم تتجاوز الملوحة في كل من مياه النهر والمحطات عن 0.49 ملغرام / لتر. كما كان تركيز الاوكسجين الذائب في مياه نهر دجلة بحدود 7.4ملغرام / لتر بينما اعلى تركيز للاوكسجين الذائب كان 10 ملغرام / لتر. اما المتطلب الحيوي للاوكسجين لمياه النهر فقد كان بحدود ( 1.2 - 4.4 مغرام / لتر ) وهذه النسبة هي ضمن الحدود المسموح بها دوليا .و من جهة اخرى اشارت الدراسات البكتريولوجية الى وجود نسبة عالية من اعداد البكتريا الحية الكلية في مياه المحطات الثلاثة وكانت بحدود ( 1 - C.F.U 64 ), وهذه الاعداد تشير الى عدم كفاءة عمليات التصفية والتعقيم الجارية في المحطات الثلاثة . وخاصة محطة الكرامة , بينما اعداد البكتريا الحية الكلية لمياه نهر دجلة كانت بحدود ( 468 - C.F.U 9100) . اما اعداد بكتريا القولون الكلية وبكتريا E.coli فقد تراوح بين ( 1.1 - 7.1 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة وهذه الاعداد هي اكثر من الحدود المسموح بها دوليا . وقد تجاوزت اعداد بكتريا القولون الكلية في نهر دجلة عن ( 1795 - 63000 خلية / 100مل) ,بينما اعداد بكتريا E.coli فقد كانت بحدود ( 335 - 39000 خلية / 100مل ) .ا ما بالنسبة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa فقد كان عددها ( 2.2 - 23 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة واعلى تركيز في اعدادها كان قد سجل في اشهر الصيف , بينما كانت اعدادها في نهر دجلة بحدود( 580 - 160000 خلية / 100مل ) .ا ما نتائج اعداد البكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coliالمعزولة من مياه الحنفيات في منازل الشعلة فقد سجلت اعلى القيم للبكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coli 16)و9.2خلية/100مل)على التوالي, اما اقل القيم فكانت 1.1)و0.0خلية/100مل)على التوالي. كما اشارت الدراسة الى احتواء عينات البراز الماخوذة من الاطفال المصابين بالاسهال ,ا نواع البكتريا الاتية : - Citrobacter freundii 15% , Klebsiella pneumonia 21% , E.coli 45 % , Pseudomonas aeruginosa 11%,Serratia plymuthica 4% , Serratia ficaria 2% , Pseudomonas fluoresens 2%. وهذه الانواع هي في الواقع متوافقة مع الانواع نفسها من البكتريا المعزولة من ماء الحنفيات من المنازل في الشعلة وهي : - Klebsiella pneumonia 30% , E.coli 27% , Pseudomonas aeruginosa 23% Citrobacter freundii 14%, Serratia playmuthia 3% , Pseudomonas fluoresens 3% . لقد عزلت انواع من البكتريا غير السائدة مثل Sphingomonas paucimobilis, Pantoea spp. من مياه النهر ومياه المشاريع اذ تعود Pantoea spp.الى العائلة المعوية Enterobacteriaceae وتسبب بعض انواعها اعراضا مرضية خطيرة للانسان, وكثيراما تكون ملوثة للادوات الطبية اضافة الى ان بعض الاجناس ممكن ان تصيب مدى واسعا من المحاصيل الزراعية المهمة اقتصاديا ,وانواع من اشجار الغابات حول العالم كما توجد بشكل مجتمعات بكتيرية تلوث خزانات وقود الطائرات النفاثة اماالنوع Sphingomonas paucimobilisفيعود لعائلة Sphingomonasaceae الذي يوجد في البيئات المختلفة بضمنها المائية (مياه البحر والمياه العذبة) وبعض انواعها وخصوصاS.paucimobilis فقد توجد في الاجهزة الطبية في المستشفيات وانواع مختلفة من النماذج السريرية وبالرغم من ان الاصابة بها خطيرة ونادرة فقد تعالج باستخدام المضادات الحيوية . واخيرا اشارت نتائج هذه الدراسة الى ان استهلاك مياه الحنفيات من قبل عموم الناس قد يكون السبب الرئيس لحالات الاسهال التي تصيب الاطفال وغيرهم لاحتوائها على اعداد كبيرة من المسببات المرضية المختلفة. | The present work aimed to study different parameters of the drinking water that affect the health of people of Baghdad city .To perform this target three factors were studied. Firstly ,The Biological ,Physical and Chemical factors that influence water quality of the Tigris river .secondly, evaluation of the efficiency of water purification of three purification stations constructed along the river of Tigris ,and thirdly ,evaluation of drinking water of AL - Shulla region in Baghdad city that is provided with water from one of these purification stations (AL - Karama station). In addition to above ,the study also included the comparison between water pollution with respect to bacteriological point of view and diarrhea cases suffering children under two years of age ,attended the hospital of Baqir AL - Hakkem out - clinic in AL - Shula. The study included determination of the water quality from three main purification station, these stations were located to the Northern (Sharq - Diglla) ,middle (AL - Karama)and southern (AL - Qadisia)parts of Tigris river in Baghdad city.Duplicate water samples were taken on monthly basis before and after purification from December, 2009 to September 2010.Microbial analyses of the water included estimation of the number of total viable microbial counts ,total viable coliforms ,total viable E.coli and Pseudomonas aeruginosa .In addition to the presence of some pathogenic enteric microorganisms e.g. Salmonella spp. , Vibrio cholerae etc. using conventional bacteriological methods and API20E Technique for the identification of these bacteria, while Physical and chemical analyses of water before and after purification included determination of the following parameters ,temperature, pH, turbidity ,electrical conductivity ,total dissolved solids ,salinity ,dissolved oxygen and Biological oxygen demand along with the air temperatures at the three purification stations. . . On the other hand ,forty tape water samples were collected from the houses in AL - Shulla region during summer months June , July ,August and September ,2010.At the same time ,and during the same periods ,forty faecal samples from children under age of two years suffering from diarrhea and forty feacal samples from healthy children of the same age also were collected to determine the total pathogenic microorganisms in these samples .The results of these studies were indicated that the water temperature was influenced by the surrounding temperatures (15 - 41 °C)and the Tigris river temperature was between (13 - 32°C ),whereas the temperature of the water after purification in the three stations were around (15 - 33°C). . The pH of the water was (7.85 - 7.97) and after purification was around (7.31 - 7.87).The Turbidity of the river water was(156 - 26)NTU and of the stations were between (1 - 4NTU) The results of the present study also revealed that the electrical conductivity of the Tigris river water was less than that of the three stations, that is (606 - 776Ms/cm) and (608 - 793Ms /cm) respectively. and the total dissolved solids (T.D.S)were between (425 - 555mg/l)for stations water and were between (429 - 554mg/l) for river water. whereas the salinity of both river and stations water did not exceed 0.49mg/l. The dissolved oxygen concentration was 7.4mg/l in Tigris river, which indicate a good aeration condition while the highest concentration for river water recorded to be 10mg/l. The biological oxygen demand for river was between (1.2 - 4.4mg/l) which is within the International allowable levels. On the other hand ,The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (1 - 64C.F.U/ml), and these numbers indicate a non - efficient purification procedures in all station studied and was exceeding the International allowable levels especially in the AL - Krama station . while total viable bacterial counts of the Tigris river was between (468 - 9100C.F.U/ml).Total coliform counts and pathogenic E.coli counts were both between(1.1 - 7.1cell/100ml )in all the three stations studied ,again,these numbers exceeded the International allowable levels. In Tigris river water ,on the other hand ,the total coliform counts was exceeded the (1795 - 63000cell/100ml )while the pathogenic E.coli count was between (335 - 39000cell/100ml) .Pseudomonas aeruginosa counts was about (2.2 - 23cell/100ml) in the three station and the highest level recorded was in summer seasons ,whereas its counts was in between (580 - 160000cell/100ml) in Tigris river. The highest number for total coliform and pathogenic E.coli were recorded to be (16 and 9.2cell/100ml) respectively. whereas the lower range were (1.1 and 0.0 cell/100ml) respectively. . The results of the present study also revealed that the faecal samples of the diarrhea cases of children contain the following bacteria ,E.coli 45%,Klebsiella pneumonia 21%.while the numbers of other bacteria ,Citrobacter freundii, Pseudomonas aeruginosa , Serratia ficaria ,Serratia plymuthica and Pseudomonas fluorescens were 15%,11%,2%,4% and 2% respectively. . These proportions are in accordance with the same bacterial species isolated from AL - Shulla houses while were 27%for E.coli ,30%for Klebsiella pneumonia and 14%for Citrobacter freundii 23%for Pseudomonas aeruginosa ,3%for pseudomonas fluoresens and 3% for Serratia plymuthica . Finally ,these results clearly indicate that the tape water consumption by the general public might be the main causative factors for diarrhea cases affecting the people due to its high content on other hand ,will reflect the poor purification procedures employed in these different purification stations at least in Baghdad city

دراسة تاثير بعض المطهرات والمعقمات والمنظفات على نمو بعض الفطريات المعزولة من بعض المستشفيات في بغداد == Study the effect of some disinfectants, sterilizers and detergents on growth of some fungi isolated from Baghdad hospitals

Author name: صادق رحيم محمد علي
Supervisor name: منى حمودي الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study aimed to detect the fungal contamination of hospitals in orderto be controlled and limited.A total of 511 environmental swaps were collected from Al - Karamateaching hospital, Al - Sader general hospital, Al - Yarmouk teachinghospital, Baghdad teaching hospital and Imam Ali general hospital inBaghdad city from the period 28,October,2013 to 31,March,2014. Thesamples were collected to isolate and identify the caused and contaminatedfungi in addition to test their sensitivity against certain antiseptic anddisinfectants that are used in hospitals; also their virulence factors forhigher frequency and occurrence genus.These isolates were collected from main sources, the hospitalsenvironment and most of the items used for hospital work in order to detectthe nosocomial pathogens persistent in the hospital ecosystem, whichincludes : sink surfaces, tools and equipments, walls, indwelling medicaldevices, premature incubators, beds, medical trashes, floors and others.Results revealed that fungal contamination in five hospitals was in thepercentage 69.89%, 64.52%, 62.40%, 51.58% and 41.90% respectively. Inaddition, the most contaminated places were the hospitals wards 80%,while it was 77.77% in endoscopy units and 76.92% in the Respiratory careunits. The lowest contaminated places were the emergency units 25.0%then burns units 33.33% and cardiac care unit which was 41.66%. Inrespect with the percentage of occurrence and frequency for the isolatedfungi, it was found out that Aspergillus flavus formed the highest ratio offrequency and occurrence 21.29% and 15.46% respectively, followed byAspergillus niger 18.33% and 13.31% then Penecillium spp. which was10.78% and 7.83%. Regarding other fungi, their frequency and occurrence were different. All fungal isolates were identified depending on themorphological and microscopic examinations as well as biochemical tests.The results on the effect of temperature and pH on fungal growthshowed that the best growth was at 25 - 30 OC, and the best growth wasfound at the pH range 5.0 - 6.0.Results of the test of fungal sensitivity against eight antiseptics andsterilizers used in the hospital showed that the ratio of inhibition of thesecompounds agnaist fungi were different according to types andconcentration of antiseptics as well as genus and species of fungi. Use ofthese compounds in 100%, 50%, 40%, 30% and 20% concentration is veryhigher effective, while more effective if they were used in 10% or 7.5%concentration than in 5% and 2.5%, but not effective in 1.25%concentration.The results showed that Setol (Chloroxylenol) has significantly the mosteffective compound on fungi, followed by Formalin (Formaldehyde), thenCarmal (Tension, active surfactants, non - ionic) and Alwazir (Sodiumhipochlorite).Testing some of virulence factors aflatoxin production, lipaseproduction , protease production and haemolysis test, it was found that A.flavus has higher lipase production and protease production than otherfungi. A. flavus and A. niger were capable of blood hemolysis in 3 daysonly, but in different diameters of lysis zone, 1.8mm and 1.6mmrespectively. Some isolates of A. flavus are capable to aflatoxin production.Depending on all results, hospitals contain different fungal species andgenus, antiseptics and disinfectants have an effect on fungal growth if theyare used in a correctly.

دراسة كيميائية وبايولوجية لمركبي Stigmasterol و? - sitosterol كمكونات فعالة متواجدة في نبات البنفسج العطري (العائلة : البنفسجية) المزروع في العراق == Phytochemical and Biological Study of Stigmasterol and ? - sitosterol as Active Constituents Present in Viola odorata L.Plant (Family : Violaceae) Cultivated in Iraq

Author name: شيماء فخري جاسم السالم
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد هذه الدراسة مسح لبعض المكونات الفعاله لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. وعزل هذه المركبات الفعالة (Stigmasterol and β - sitosterol)، كما تم اجراء دراسه بايولوجيه لتحديد فاعليتها كمركبات مضادة للاكسدة وكمضادات بكتيرية حيث تضمنت الدراسه مايلي : - • تم استخلاص هذه المركبات كمستخلص خام من كل جزء من اجزاء النبتة الجذور،الاوراق, الازهار والبذور باستخدام الميثانول والبتروليوم ايثر واجراءالتقدير الكمي والنوعي للمركبين Stigmasterol) و( β - sitosterolفي كل جزء باستخدام تقنيات TLC, HPLC,CC• تم استخلاص وعزل وتشخيص المركبين (Stigmasterol and β - sitosterol) وذلك باستخدام طرق استخلاص وتجزئه وعزل مختلفه• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. والمركبات الستيرويدية Stigmasterol) و( β - sitosterol كمضادات للاكسدة على المركب 1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) الفعال لاحتوائه على الجذور الحرة وتحويله الى مركب 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine باستخدام التراكيز 25, 50, 100, 200 و400 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata Lو المركبات الستيرويديه( Stigmasterol و( β - sitosterol كمضادات بكتيرية فاعلة ضد بكتيريا staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa وبتراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع المضاد الحيوي Gentamicin كمعاملة قياسية• اظهرت النتائج وجود كميات كبيرة من المركبات الستيرويدية(Stigmasterol and β - sitosterol )في كل اجزاء نبتة البنفسج العطري Viola odorata L. اذ كانت تراكيز مركب Stigmasterol في الاوراق 2 ملغم/100مليلتر وللازهار 7.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 4.5 ملغم/100مليلتر وللبذور 2.4 ملغم/100مليلتر, فيما كانت تراكيز المركب β - sitosterol في الاوراق 3.2 ملغم/100مليلتر وللازهار 5.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 9.2 ملغم/100مليلتر وللبذور 3 ملغم/100مليلتر, اذ كان اعلى تركيز للمركب Stigmasterol في مستخلص الازهار 7.3 ملغم/100مليلتر واعلى تركيز للمركب β - sitosterol في الجذر 9.2 ملغم/100مليلتر.• اظهرت النتائج الفاعلية الكبيرة للمستخلص الخام لنبات Viola odorata L. بالتركيز 400 مايكروغرام/مليلتر كمضاد للاكسدة بنسبة 94% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 72, 80, 84 و92% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية, اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية P≤ 0.05 ما بين التراكيز للمستخلص الخام, فيما اظهر التركيز 400 مايكروغرام/مليلتر لخليط المركبات( stigmasterol وβ - sitosterol) كفاءة كبيرة كمضادات للاكسدة وبنسبة 74% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 59, 63, 66 و70% على التوالي مقارنة بالمعاملة القياسية وبفروق معنوية P≤0.05 ما بين التراكيز.• اظهرت تراكيز المستخلص الخام للنبتة فاعلية كمضاد للبكتيريا اذ كان مدى تثبيط بكتيريا Staphylococcus aureus على الوسط المغذي الصلب 0, 5, 15, 18, 20, 22 و25 مليمتر باستخدام التراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر على التوالي, واظهر خليط الستيرويدات مدى تثبيط 0, 0, 0, 14, 16, 19 و21 مليمتر لنفس التراكيز على التوالي ومقارنة بالمعاملة القياسية, كذلك اظهر المستخلص الخام كفاءة كمضاد بكتيري ضد بكتيريا Pseudomonas aeruginosa بمدى تثبيط 0, 5, 12, 15, 17, 19 و22 مليمتر ولخليط الستيرويدات بمدى تثبيط 0, 0, 0, 11, 13, 17 و18 مليمتر مقارنة بالمعاملة القياسية, وبينت النتائج ان التركيز الادنى المثبط للمستخلص الخام للنبتة ضد بكتيريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaهو 5 مايكروغرام/مليلتر ولخليط الستيرويدات هو 20 مايكروغرام/مليلتر. | This study is considered as a survey of the some secondary metabolits present in Viola odorata L., collected from plant nursery in Baghdad between April and July, followed by the fractionation and isolation of Stigmasterol and β - sitosterol.The biological study demonstrated the effect of the Stigmasterol and β - sitosterol found in Viola odorata L. as antioxidant and antibacterial. This study involved the following : - • Extraction of Stigmasterol and β - sitosterol as a crude extract from each part of the plant roots, leaves, flowers and seeds using (Petrolium ether and Methanol) to qualitative and quantitative estimation of Stigmasterol and β - sitosterol in each part of the plant by using TLC, HPLC and CC. • Fractionation and Isolation of sterols compounds (Stigmasterol and β - sitosterol) present in Viola odorata L., by using different methods . • Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been studies in experimental work to determination the antioxidant activity against1,1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) which is considered as stable free radical and convert it into 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine ,by using different concentrations (25,50,100,200 and 400µg/ml). Compare ascorbic acid.• Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been used to determination the antibacterial activity using different concentrations (2, 5, 10,20,30,40 and 50µg/ml) against staphylococcus aureus and pseudomonas aeruginosa by using agar well diffusion method compare with Gentamicin as a standard control. • The phytochemical results showed that all the plant parts contain high amount of sterols, the quantitative data revealed that the total content of Stigmasterol in roots(4.5mg/100g) ,in leaves(2mg/100g),in flowers(7.3mg/100g) and in seeds(2.4mg/100g).The content of β - sitosterol in roots(9.2mg/100g),in leaves(3.2mg/100g),in flowers(5.3mg/100g) and in seeds(3mg/100g), highest amount of stigmasterol founded in flowers (7.30mg/100g) ,the maximum amount of β - sitosterol in roots (9.2 mg/100g) .• The results showed that crude extract of Viola odorata in concentration of 400µg/ml have a higher antioxidant effect by 94%, and concentrations of 25, 50, 100 and 200 µg/ml by 72, 80, 84 and 92% respectively which are comparing with standard control Ascorbic acid, the results showed there are significant difference at (P≤ 0.05) between the concentrations in the same crude extract, while the stigmasterol and β - sitosterol of Viola odorata also showed higher antioxidant effect in concentration of 400µg/ml by 74% and concentrations of 25, 50, 100 and 200µg/ml by 59, 63, 66 and 70% respectively comparing with standard control Ascorbic acid with significant difference at (P≤0.05) between them ,and with significant difference at (P≤0.05)between the concentrations in the same fraction.• Antibacterial results of crude extract showed Staphylococcus aureus growth inhibition zone by 0, 5, 15, 18, 20, 22 and 25 mm with 5 µg/ml as MIC, while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 14, 16, 19 and 21 mm with 20 µg/ml as MIC comparing with Gentamicine standard control. Furthermore inhibition zone in pseudomonas aeruginosa culture when using crude extract by 0, 5, 12, 15, 17, 19 and 22 mm with 5 µg/ml as minimum inhibitory concentrations (MIC), while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 11, 13, 17 and 18 mm with 20 µg/ml as Minimum inhibitory concentration (MIC) compar with Gentamicin standard control .Stigmasterol and β - sitosterol compound showed inhibition zone by 0,0,0,11,13,17 and 18 mm with 20 µg/ml MICcompared with Gentamicine standard control.

التوصيف المظهري والوراثي للانزيمات المحورة لمضادات الامينوكلايكوسيدية المنتجة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين == Phenotypic and genotypic characterization of aminoglycoside modifying enzymes produced by methecillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: شيــماء عدنان جبر العبيــــدي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 150عزلة سريرية من المكورات العنقودية من مستشفيي الحبيبية والنعمان في مدينة بغداد خلال الفترة من شهر كانون الثاني وحتى شهر نيسان لعام 2011 من اصابات سريرية متنوعة. توزعت العينات ما بين 30 عزلة من الادرار, 84 من خمجات جروح و36 عزلة من مسحات الاذن . • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم, تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص الشكلية والكيموحيوية, ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة نظامي api staph وMast staph kit .لقد تم الحصول على 87 عزلة (58%) على انها Staphylococcus .aureus مقابل 63 عزلة (42%) للانواع الاخرى من هذا الجنس. • بينت نتائج الفحص المسحي المظهري الاولي لمقاومة مضاد المثسلين باستخدام طريقة الانتشاربالاكار ان هنالك 84 عزلة من اصل 87 (%96.5) قد اظهرت مقاومتها لمضاد المثسلين لتكون من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين((MRSA مقابل 3عزلات فقط (3.5%) مستجيبة للمثسلين (MSSA).• اجري اختبارفحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشارالاقراص لجميع عزلات MRSA( ,(84 واستخدم لهذا الغرض ستة مضادات حيوية تعود للمجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجوداختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري للعزلات قيد الدراسة اذا اظهرت هذه العزلات مستوى عال من المقاومة لهذه المجموعة مع نسبة وصلت الى ( 19٪ ( للستربتوميسين, 38)٪ (للاميكاسين, ( 52٪ ( للجنتاميسين ، 62٪) للكاناميسين ،و (69٪) لكل من مضادي ا لنيومايسين والتوبراميسين. • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى(MIC) لعزلات ال MRSA) (لعدد من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لعزلات ال MRSA، اذا اظهرت 16 عزلة مقاومتها للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين (16 - 1024 ميكروغرام / مل ) , و32 عزلة مقاومة للاميكاسين (64 - 128 ميكروغرام/مل ) ، و44 عزلة للجنتاميسين ( 16 - 64 ميكروغرام/مل ) و38 لو 52عزلة للكانامايسين ( 64 - 128مايكروغرام/ مل) , ، و58 للنيوميسين (16 - 1024 ميكروغرام/مل ). ان هذه النتائج تدل على انتشار صفة مقاومة مضادات المجموعة الامينوكلايكوسايدية بين عزلات المكورات العنقودية المقاومة للمثسيلين .• اعتمدت طريقتان لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهما : طريقة الغليان وطريقة المستعمرة المباشر. اظهرت النتيجة ان طريقة المستعمرة المباشرة كان افضل في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.• اختيرت خمسة وعشرون عزلة من بكتريا MRSA التي اعطت نتائج ايجابية في مجال الكشف المظهري لنمط المقاومة لمضاد المثسلين ولمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية للكشف عن الجين mecA المشفرلمقاومة المثيسلين بوساطة تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) . اظهرت نتائج احتواء جميع العزلات (100٪) على جين mecA ,وبلغ حجم القطعة المكثرة 314 زوج قاعدة بمقارنتها بدلائل الدنا الحجمية .• اجري الفحص الوراثي بتقنية ال PCR للكشف عن ثلاث جينات مشفرة للانزيمات المحورة لمضادات المجـــموعة الامــينوكلايكوسيـــدية في عــزلات ال MRSA وشـمـــلت aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa.بينت النتائج ان جين ) ′aac(6’) - Ie+aph(2’ هو الاكثر انتشارا وبنسبة 84٪ (21/25) تلاه جين ant(4’) - Iaو aph(3’) - IIIa بنسبة 76.3٪ (19/25) و44٪ (11/25) على التوالي.• بلغ معدل تواجد aac(6’) - Ie+aph(2’) مع ant(4’) - Ia, مقدار 64٪ (16 / 25) ويمثل اعلى نسبة تواجد في العزلات قيد الدراسة, فيما بلغت نسبة تواجد جيني ant(4’) - Ia وaph(3’) - IIIaمعا 40٪ (10/25) لتحل نسبة تواجد كلا من aac(6’) - Ie+aph(2’) مع aph(3’) - IIIa ثالثا وبمعدل 32٪ (8/25).اما نسبة تواجد هذه الجينات الثلاث معا فقد بلغ 28%(7/21(. • لوحظ ان هنالك ترابط بين الصفة المظهرية لمقاومة المضادرات مع الصفة الوراثية , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين aac(6’) - Ie+aph(2’) ذات مقاومة عالية لمضاد الجنتامايسين وايضا مقاومة لاغلب انواع المضادات الامينوكلايكوسيدية الاخرى.بينما كانت العزلات الحاملة للجين ant(4’) - Ia هي عزلات ذات مقاومة عالية لمضادي التوبرامايسين والنيومايسين ,ومن ناحية اخرى كانت العزلات الحاملة للجين aph(3’) - IIIa اظهرت مقاومتها العالية للمضادين الكانامايسين والاميكاسين.• في هذه الدراسة كانتالاربع وعشرين 24 عزلة الحاملة لجين mecA من اصل 25) 96%( كانت على الاقل مترابطة مع احد جينات الانزيمات المحورة AME او اثنان منها او جميعا ,ويعد هذا مؤشرا لوجود ترابط كبير بين مقاومة العزلات لمضادات الامينو كلايكوسايدية وبين مقاومتها للمثسلين في العزلات المحلية .في الوقت نفسة ظهرت ضمن النتائج عزلة MRSA واحدة اتسمت بمقاومتها المظهرية لمضادات هذه المجموعة غير انها خلت من اي جين في الفحص الوراثي مما يدل على امتلاكها نمط اخر من المقاومة تجاه هذة المجموعة . | • A total of 150 Clinical isolates of Staphylococcus species were collected from two hospitals : Al - habibia and Noaman hospitals in Baghdad city during the period from January to April 2011. Types and the numbers of these clinical samples were distributed as (30) isolates from urine, (84) isolates from wound infections and (36) isolates from ear swabs. • The isolates were initially diagnosed by culturing on MacConkey agar and blood agar followed by performing some morphological and biochemical tests . A confirmatory test as final diagnoses were done using api 20 and MAST staph kits. The results have showed that Staphylococcus aureus comprised 87(58%) isolates while other Staphylococcus species represented 63 isolates (42%) .• Results of primary screening test for methicillin resistance using disk diffusion method have revealed that 84 isolates(96.5%) were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus(MRSA), while only 3 isolates (3.5%)were methicillin sensetive Staphylococcus aureus (MSSA).• Antibiotic susceptibility test for all the 84 MRSA isolates was performed against 6 antibiotic of aminoglycosides group using disc diffusion method. The result have demonstrated clear differences in the phenotypic resistance among isolates of the current study . They showed high - level of resistance to aminoglycosides group, and the percentage of isolates reached to(19%) for streptomycin, (38% ) for amikacin ,(52% ) for gentamicin, (62%) for kanamycin and ( 69%) for each of neomycin and tobramycin . • Two fold was serial dilution agar used to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) for the MRSA isolates against aminoglycosides group. The results have showed that there were differences in the MIC values among MRSA isolates when 16 isolates were resistance streptomycin (MIC ranged 16 - 1024 µg/ ml) , 32 isolates resistance amikacin (64 - 128 µg/ ml), 44 isolates to gentamicin (16 - 64 µg/ ml) , 52 isolates to kanamycin (64 - 128µg /ml), and 58 isolates to neomycin (16 - 1024 µg/ ml). The results indicate the prevalence of aminoglycosides resistance pattern in all the MRSA isolates. • The two different methods boiling method and the direct colony method were used to prepare template DNA in order to be used in the polymerase chain reaction test. The results revealed that the direct colony methode was better in demonstrating the result as comparied with the boiling method . • Twenty five isolates which gave positive results in phenotypic detection for methicillin and aminoglycoside group resistance , were selected to detect mecA gene encoding methicillin resistance using PCR technique.The results showed that all the isolates (100%) harbored merA gene with amplified size 314 bp as compared with DAN ladder . • Genotypic detection was performed to detect three genes encoding aminoglycoside modifying enzymes in MRSA isolates. They were aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa genes.The results showed that aac(6') - Ie - aph(2") gene was the most prevalent Aminoglycoside modifying enzymes (AME) gene when the rate was 84% (21/25) of the resistant isolates followed by ant(4') - Ia and aph(3') - IIIa when the rates were 76.3% (19/25) and 44% (11/25) of these isolates respectively.• The coexistence rate of aac(6') - Ie - aph(2") with ant(4') - Ia was 68% (16/25) which it represents the most predominant rate in the isolates of the current study followed by the coexistence between of ant(4') - Ia with aph(3') - IIIa which was 40% (10/25) and the third rate for aac(6') - Ie - aph(2") with aph(3') - IIIa by 32% (8/25). The coexistence rate of the three genes in all the isolates was 28% (7/25).• The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern.The isolates harboring aac(6’) - Ie+aph(2’) gene are considered to be high resistant to gentamicin and even to all aminoglycosides ,while the isolates harboring this gene were highly resistant to tobramycin and neomycin and the isolates carrying aph(3′) - IIIa gene showed the high resistance to amikacin and kanamycin in MRSA. • In this study, the 24 isolates harboring mecA gene out of 25 ( 96%) were carried either one or more than one aminoglycoside modifying gene and this represents an indicator for high correlation between aminoglycoside and methicillin resistance in our local isolates .From the other hand the results showed that there was a MRSA isolates which confer phenotypic resistance to aminoglycoside group but it not encode for any of AME gene ,this may indicate that such isolates confer another type of resistance toward this group

دراسة مرضية نسيجية ومناعية كيميائية نسيجية للخلايا اللمفاوية المرتشحة في العقد اللمفاوية المشمولة في سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي == Histopathological and Immunohistochemical study on Lymphocytic Infiltrate in Lymph nodes involved by in Colorectal cancer and Breast carcinoma

Author name: شيماء عبد الرضا ناجي الربيعي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سالم رشيد حمودي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة كبحث رجعي ، اذ اجريت على (85) حالة مرضية لانسجة مطمورة بشمع البارافين واخذت العينات من المرضى المصابين بالاورام الحميدة والخبيثة للقولون والمستقيم والثدي والتي تعود للفترة من 2006 - 2008 .جمعت العينات من مستشفى مدينة الطب/ المختبرات التعليمية ومستشفى امراض الجهاز الهضمي للفترة من تشرين الاول 2008 ولغاية حزيران 2009 . قسمت هذه العينات الى ثلاثة مجاميع : 1 - المجموعة الاولى تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان القولون والمستقيم والحاوية على العقد اللمفاوية.2 - المجموعة الثانية تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان الثدي والحاوية على العقد اللمفاوية.3 - المجموعة الثالثة (35) عينة من بلوك شمع البارافين منها (15) عينة تحتوي على التنسج اللمفاوي للعقد و(20) عينة طبيعية تعتبر كمجاميع سيطرة.تم تحليل هذه العينات من العقد اللمفاوية في المجاميع الثلاثة احصائيا حسب العمر , الجنس , وجود او عدم وجود السرطان المنتشر وعلاقته بارتشاح الخلايا اللمفاوية ، درجة التمايز ومرحلة الانتشار للسرطان.ولغرض التشخيص النسيجي قطعت العينات بجهاز المايكروتوم بسمك 4 مايكرومتر وصبغت بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين.امتدت الدراسة لتشمل تحديد التنميط المظهري للخلايا اللمفاوية المرتشحة والتي تشمل الواسمات CD8+, CD3+ بطريقة التصبيغ النسيجي المناعي . وقد خلصت الدراسة الى النتائج التالية : 1 - في الوقت الذي تراوح العمر لمرضى سرطان القولون والمستقيم بين (23 - 70) سنة وبمعدل (43,2) سنة ، فان النسبة الاكبر قد شخصت في عمر يتراوح بين (61 - 70) سنة.2 - اغلب حالات سرطان القولون والمستقيم كانت وسطية التمايز وكانت موجبة بنسبة (75%) للواسم CD3+ وبنسبة (25%) للواسم CD8+ للخلايا اللمفاوية المرتشحة.3 - ان النسبة من 75 - 80% من حالات سرطان القولون والمستقيم كانت في مرحلة C.4 - اظهرت الخلايا اللمفاوية الحاملة للواسم CD8+ فروقات معنوية بين سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي عند مستوى احتمالية (P<0.05). | This study was designed as retrospective study. A total number of cases were eighty five (85) formalin - fixed paraffin embedded tissue blocks of colorectal and breast cancer, in addition to benign lesions that related to the period between 2006 - 2008 . The samples were collected from Teaching Laboratories / Medical City and Gastrointestinal Teaching Hospital/ Medical City during the period extended from October 2008 till June 2009. These paraffin blocks were divided into (3) groups : 1. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of colorectal carcinoma (CRC) with their lymph node drainage.2. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of breast carcinoma with their L.N drainage.3. In addition thirty five (35) tissue blocks, including (15) blocks lymph node follicular hyperplasia and (20) blocks of normal lymph node were examined as control groups.All these tissues were analyzed according to age, gender, presence or absence of tumor metastasis with infiltration of lymphocyte, histological grading, and staging.For definitive histological diagnosis the samples were made by microtome at 4μm thickness and stained by hematoxylin and eosin stain.This study was extended to determine the phenotype of cell surface antigen markers, namely CD3+ and CD8+ markers of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal antibodies to these markers.The results of this study can be described as follows : 1 - The age of patients with CRC ranged from (23 - 70) year with mean of (43.2) year. The highest percentage was diagnosed in the age (61 - 70) year.2 - Most of the cases of the CRC were moderately differentiated grade, (75%) were CD3+ positive results, while (25%) of them were CD8+ positive results.3 - From 75 - 80% of the CRC cases were in stage C.4 - In respect to CD8+ infiltrated lymphocytes, there were significant differences (P <0.05) between CRC and breast carcinoma, 20%, 56% respectively.

دراسة التنوع الوراثي لضروب مختلفة من الفلفل الحلو Capsicum annuum L. لعينات من الاسواق المحلية باستعمال بعض التقانات الوراثية الجزيئية == Genetic diversity study for different varieties of sweet pepper Capsicum annuum L. for samples from local markets by using some molecular genetic techniques

Author name: شيماء صباح مهدي
Supervisor name: احسان عرفان حسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Genetics
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: درس التباين الوراثي في 22 عينة محلية ومستوردة من ثمار الفلفل الحلو Capsicum annuum L. التي جمعت من الاسواق المحلية العراقية باستعمال بعض المعلمات الجزيئية ، فضلا عن تعيين تركيز مادة الكاروتينات Carotenoids في ثمار الفلفل الحلو باستعمال تقانة الكروماتوغرافيا السائلة عالية ا لاداءHigh - performance liquid chromatography (HPLC)، كما كشف عن ثلاثة من الجينات المسؤولة عن انتاج هذه المادة وهي Lycopene β - cyclase (Lcyb)، β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) وCapsanthin - capsorubin synthase (Ccs) مع اجراء التسلسل التتابعي للدنا DNA sequencing لهم.درس التباين الوراثي باستعمال تقانة عديد التكوين ذات القطعة الطولية المضخمةAmplified fragment length polymorphism (AFLP) ولثلاثة توافقات بين البوادئ المستعملة في جميع العينات. انتج التوافق الاول EACG/MAGG اربعة حزم في عينات الفلفل المدروسة وبعدد ثلاثة حزم احادية الشكل Monomorphic bands في كل عينة، ما عدا عينتي الفلفل الاردني البرتقالي والاحمر التي انتجت اربع حزم في كل عينة كانت واحدة منها متعددة الاشكال Polymorphic bands وبنسبة مئوية 25% وكانت كفاءة التوافقPrimer efficiency 21.43% مع قوة فعالية تميزية Discriminatory power بنسبة 100%. انتج التوافق الثاني EAAG/MAAT اربعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 28.57% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%، بينما انتج التوافق الثالث EACA/MCTG سبعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل، ماعدا عينة الفلفل الاخضر العراقي/بلد قد انتج ثلاثة حزم وكانت ايضا احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 50% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي وتوزعت العينات ضمن التحليل العنقودي في ثلاثة مجاميع رئيسة. المجموعة الاولى ضمت ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي، بينما المجموعة الثانية فقد ضمت الفلفل العراقي/بلد الاخضر والمجموعة الثالثة فتكونت من عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. لقد اوضح هذا المخطط وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي مع عينات الفلفل الاخرى ما عدا الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبنسبة 0.94 وهي اعلى قيمة تشابه, بينما كانت قيمة التشابه مع عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر بنسبة 0.68. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي وعينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبقيمة 2.236. استعملت في دراسة تقانة تكرار التسلسل البسيط Simple Sequence Repeat (SSR - PCR) ستة بوادئ، وان هذه البوادئ قد انتجت 33 حزمة كان منها 24 حزمة متعددة الاشكالPolymorphic bands، بينما كان تسعة حزم منها احادية الشكل Monomorphic bands. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي، وبينت النتائج بان العينات قد توزعت ضمن التحليل العنقودي في عشرة مجاميع رئيسة. لقد اوضحت النتائج وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد واليوسفية الاخضر وبنسبة 1 وهي اعلى قيمة تشابه بالمقارنة مع اقل قيمة تشابه لعينة الفلفل الاسباني الطويل الاخضر وبقيمة 0.35. نسبة التشابه العالية قد ظهرت ايضا بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر والاحمر وبقيمة 0.98 وكذلك بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/صويرة الاخضر وثمار الفلفل الحلو الايطالي الاخضر وبقيمة 0.94. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد الاخضر والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر وعينة الفلفل الايراني البرتقالي وبقيمة 5.656، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاخضر والاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. استعملت في تقانة الدنا متعدد الاشكال المضخم عشوائياRandom amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) خمس بادئات عشوائية، وكانت نسبة التعدد الشكلي لجميع البوادئ 100% مع ظهور حزمة متميزة واحدة وبحجم جزيئي 1800 زوج قاعدة عندما استعمل البادئ C52، بينما لم تنتج البادئات الاخرى اية حزم متميزة. نتائج شجرة القرابة الوراثية التي رسمت بالاعتماد على معامل Jaccard للتشابه الوراثي قد وزعت العينات ضمن التحليل العنقودي الى ثمان مجاميع رئيسة. اظهرت شجرة القرابة وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/اليوسفية الاخضر وثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر بنسبة 0.84 وهي اعلى قيمة تشابه، بالمقارنة مع تشابه وبقيمة صفر بين ثمار الفلفل الحلو الايراني الاصفر وبين عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. اظهرت قيم البعد الوراثي بين عينات ثمار الفلفل الحلو المدروسة اعلى قيمة كانت بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الصيني الاصفر والايراني الاخضر وبقمة 5.0، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاسباني الاخضر والايطالي الاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. قدر اعلى تركيز للبيتا - كاروتين في عينة الفلفل الايطالي الاصفر وبقيمة 1415.73 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع اقل قيمة التي هي 94.32 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني الاخضر. كانت اعلى قيمة في الفلفل الاصفر في العينة الايطالية واقل قيمة للون نفسه كان في عينة الفلفل الايراني الاصفر وبقيمة 710.89 مايكروغرام/مليلتر، اما اعلى تركيز للبيتا - كاروتين للفلفل البرتقالي فكان في العينة الايطالية وبقيمة 898.5 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع 574.33 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني البرتقالي. الفلفل الاحمر قد سجل اقل قيمة لتركيز البيتا - كاروتين وهي 245.27 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل الاردني الاحمر، بينما سجل الفلفل الاسباني الاحمر اعلى قيمة وهي 435.41 مايكروغرام/مليلتر. الفلفل الاخضر قد سجل اعلى قيمة في عينة الفلفل الايطالي وبقيمة 232.43 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع قيمة 98.86 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر. كشف عن بعض الجينات التي لها علاقة بتصنيع البيتا - كاروتين باستعمال تقانة Polymerase chain reaction (PCR)، وباستعمال الترحيل الكهربائي لهلام الاكاروز بتركيز 2%. وجد الجين Lcyb في 11 عينة فلفل مدروسة عند الكشف عنه باستعمال البوادئ الخارجية External primers، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 19 عينة فلفل حلو مدروسة وبحجم 360 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية Internal primers. وجد الجين Crtz باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 3 عينات هي الفلفل الاردني البرتقالي، والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر والفلفل الايراني الاخضر وبحجم 760 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. وجد الجين Ccs باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر والفلفل الايطالي البرتقالي وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 7 عينات اخرى من ثمار الفلفل الحلو وبحجم 490 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Lcyb في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في عينات الفلفل الحلو المدروسة بين عينة الفلفل العراقي/الصويرة الاخضر وبين عينة الفلفل الايراني الاخضر وبقيمة 0.903، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل الاردني الاصفر وعينة الفلفل الصيني الاصفر وبقيمة 0.539. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطع الجين Crtz وجود نوعين من التغيرات الجينية هي الحذف Deletion والاستبدال Substitution في الفلفل الاردني البرتقالي. لقد كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية الكوانين G بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 846 و850، واستبدال القاعدة النايتروجينية الثايمين T بالقاعدة النايتروجينية السايتوسين C في المواقع 852، 860 و861، كذلك كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الادنين A في الموقعين 856 و862 واستبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 864 و870. طفرات الحذف ايضا كانت موجودة، اذ حذفت القواعد النايتروجينية ATA من قطعة الجين Crtz في عينة الفلفل الاردني البرتقالي بالمقارنة مع التسلسل التتابعي القياسي Refseq. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Ccs في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة، كما ان هناك بعض طفرات الاستبدال قد حدثت. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في قطع الجين Ccs بين عينة الفلفل الايطالي البرتقالي وبين عينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.966، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وعينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.611. | Genetic variation was studied in 22 local and imported samples of bell pepper fruits Capsicum annuum L., which collected from local Iraqi market by using some molecular markers. Estimation of carotenoids by using high - performance liquid chromatography (HPLC) was done in all samples. Detection of three genes; Lycopene β - cyclase (Lcyb), β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) and Capsanthin - capsorubin synthase (Ccs), were also studied and the DNA sequencing was done for these genes.Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was studied for three selective amplification primers in all samples. The first selective amplification primer (EACG/MAGG) produced 4 bands for the studied bell pepper fruits with 3 monomorphic bands in each sample, except the orange and yellow Jordanian bell pepper samples, which produced 4 bands one of them polymorphic band with 25% ratio and 21.43% primer efficiency with 100% discriminatory power. The second selective amplification primer (EAAG/MAAT) produced 4 monomorphic bands in each sample with no polymorphic bands with 28.57% primer efficiency and 0% discriminatory power, whereas the third selective amplification primer (EACA/MCTG) produced 7 monomorphic bands in each sample, except the Iraqi/Balad green bell pepper, which produced 3 monomorphic bands with no polymorphic bands and the primer efficiency is 50% with 0% discriminatory power. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 3 main groups. The first group was included the red and orange Jordanian bell pepper fruits samples, whereas the second group included the Iraqi/Balad green bell pepper and the third group included the rest samples. The results of this distribution revealed a high similarity between red and orange Jordanian bell pepper and the other bell pepper samples, except Iraqi/Balad green bell pepper with 0.94 values. This value is the higher, whereas the similarity with the Iraqi/Balad green bell pepper is 0.68 values. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between red and orange Jordanian bell pepper and the Iraqi/Balad green bell pepper with 2.236 values. Six primers were used with single sequence repeat (SSR - PCR) technique. These primers produced 33 bands. The number of polymorphic bands is 24, whereas the number of monomorphic bands is 9. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 10 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Balad green bell pepper and Iraqi/Yousifia green bell pepper with 1 value. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.35), which are found in Spanish long green. There are another high values were revealed between Jordanian yellow and red bell pepper with 0.98 value. Also, other high similarity values revealed between and Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian green bell pepper with 0.94 values. The genetic distance between the studied samples revealed the highest values between Iraqi/Balad and Yousifia green bell pepper with Iranian orange bell pepper with 5.656 values, in comparison with the lowest genetic distance between Jordanian green and yellow bell pepper with 1.0 value. The random amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) was used five randomly primers. The percentage of polymorphic bands is 100%, with one distinguished band which is produced by using C52 primer with 1800 base pair. The other primers did not produce any distinguished band. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 8 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Yousifia green bell pepper and Jordanian yellow bell pepper with 0.84 values. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.0) which are found between Iranian yellow bell pepper and the other samples. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between Chinese yellow bell pepper and Iranian green bell pepper with 5.0 values, in comparison with the lowest genetic distance between Spanish green bell pepper and Italian yellow bell pepper with 1.0 value. The higher value of β - carotene concentration was found in Italian yellow bell pepper sample with 1415.73 µg /ml, in comparison with 94.32 µg /ml, which is estimated in Iranian green bell pepper. The highest concentration values of β - carotene in yellow bell pepper was found in Italian sample, in comparison with the lowest value for the same color, which found in Iranian yellow bell pepper with 710.89 µg /ml. The highest concentration value of β - carotene in orange bell pepper was found in Italian sample with 898.5 µg/ml, in comparison with 574.33 µg/ml in Iranian orang bell pepper sample. The red bell pepper was estimated lowest concentration of β - carotene with 245.27 µg/ml in Jordanian red bell pepper, in comparison with highest value in Spanish red bell pepper with 435.41 µg/ml. The green bell pepper was estimated highest concentration of β - carotene in Italian green bell pepper with 232.43 µg/ml, in comparison with lowest value with 98.86 µg/ml in Iraqi/Souwyera green bell pepper sample. Some of genes which related with β - carotene production were detected in all samples by using Polymerase chain reaction (PCR), and the products produced by this approach were resolved on 2% agarose gels. The Lcyb gene was detected in 11 bell pepper samples by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 360 base pair in 19 bell pepper samples when internal primer was used. The Crtz gene was detected in Iraqi/ Souwyera green bell pepper sample with amplified band more than 1500 base pair by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 760 base pair in 3 bell pepper samples; Jordanian orange bell pepper, Iraqi/ Yousifia green bell pepper and Iranian green bell pepper when internal primer was used. The Ccs gene was detected by using the external primers in Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian orange bell pepper with amplified band more than 1500 base pair, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 490 base pair in 7 bell pepper samples when internal primer was used. The DNA sequences results for the Lcyb gene in some green bell pepper samples revealed high similarity between its nucleotides and Refseq for the same gene, with some differences in nucleotide sequences for some bell pepper samples. The highest similarity between nucleotide sequences was found between Iraqi/Souwyera green bell pepper sample and Iranian green bell pepper sample with 0.903 value, whereas the lowest similarity was found in Jordanian yellow bell pepper and Chinese yellow with 0.539 value. The nucleotide sequences results for the Crtz gene revealed two types of genetic changes, such as deletion and substitution in Jordanian orange bell pepper. The results found substitution in the guanine (G) nucleotide base with thymine (T) nucleotide base in 846 and 850 positions. Also, substitute the thymine nucleotide base with the cytosine (C) nucleotide base in the 852, 860 and 861 positions. Substitution also found in the cytosine nucleotide base with adenine (A) nucleotide base in the 856, 862 position, and substitute the cytosine nucleotide base with the thymine nucleotide base in the 864 and 870 positions. Deletions of nucleotide bases was also found like ATA sequence in the Crtz gene of Jordanian orange bell pepper in comparison with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene. The nucleotide sequences results for the Ccs gene in some bell pepper samples revealed high similarity with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene with some differences in some nucleotide bases of the studied samples, like substitution. The highest similarity between nucleotide sequences for the Ccs gene was found between Italian yellow and green bell pepper samples with 0.966 values, whereas the lowest similarity was found in Iraqi/Balad green bell pepper with 0.611 values.

تاثير Lactobacillus fermentum وLactobacillus gasseri في طفيلي الابواغ الخبيئة داخل الجسم الحي == Effect of Lactobacillus fermentum and Lactobacillus gasseri on Cryptosporidium parvum invivo

Author name: شيماء داود سلمان
Supervisor name: سبا طاهر محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to study the effect of some bacterial probiotics on the parasite Cryptosporidium parvum invivo, 60 of feces samples were collected from fetal in calves farm belong to College of Veterinary \ Baghdad University, their aged from one to two weeks and suffer from a severe watery diarrhea. Samples were examined to detect the presence of the parasite oocysts by using Modified Cold Zeinl Neelson Stain method.Oocysts of parasite were isolated from positive feces samples by using saturated salt solution method and used to induce infection in mice .The study of laboratory animals shown that the perpant period of the parasite ranged between 3 - 4 days and did not notice any clear clinical signs neither infected mice nor treated ones.The study included nine groups; five treatment groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells,supernatant of L.fermentum,suspension of L.gasseri cells,supernatant of L.gasseri and the drug spiramycin, two preventive groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells and suspension of L.gasseri cells befor and after infected , and two groups that used as positive control (infected mice)and negative control (healthy mice).The results showed that all treatment groups suffered from a gradual decrease in rates of oocysts shedding and the groups treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day and eighth, respectively, and efficiency treatment was 81.44%, 81.72% , respectively while groups that treated with supernatant of bacteria was stopped oocysts shedding on the tenth day, and efficiency treatment 76.33%, 75.28% , respectively.On the other hand treated groups with spiramycin drug did not stop shedding of parasite oocysts to the eleventh day after treatment and recorded less efficiency treatment reaching to 65.14% compared with the positive control group, which continued shedding oocycts to the end of experiment.Also, the results showed that the preventive groups that treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day after the treatment, and for both types of bacteria,the highest treatment efficiency reached to 85.91%and 86.55%, respectively. The statistical analysis showed significant differences between the control group and the treated groups in level of probability (P≥0.05).According to the results of histological study, the changes occurred in the small intestine before and after treatment, showed that in the tissue sections of the positive control group animals the parasite adhesion clearly on brush border of the epithelial intestine tissue.The treated groups with two types of bacteria and their supernatants showed disappearance of the parasite from the intestinal tissue with simple changes included hydropic degeneration and increase in the number of goblet cells when compared to a group of spiramycin which led to the occurrence of damage in the mucous layer and the shorten in lengths of the villi , dehydration and infiltration in lymphocytes with destruction in tissue (necrosis).

دراسة جزيئية لعوامل الالتصاق في بكتريا Escherichia coli الممرضة للمسالك البولية وعلاقتها بمقاومة Fluoroquinolones == Molecular Study of Adherence Factors in Uropathogenic Escherichia coli Related to Fluoroquinolones Resistance

Author name: شيماء خضر عباس العلاق
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 150عينة ادرار من مرضى خمج المسالك البولية ومن مختلف الاعمار للفترة من تموزالى تشرين الثاني 2011 .اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات الزرعية والمجهرية والفحوصات الكيموحيوية , والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات في وقت مبكر للكشف عن الانواع بواسطة استخدام فحص Api20E .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق وجين مقاومة الفلوروكوينولونات باستخلاص الدنا البكتيري بطريقة الغليان ومن ثم اخضع الى اختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) . تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية , فضلا عن تقدير التركيز المثبط الادنى (MIC) لاربع مضادات من الفلوروكوينولونات . اظهرت النتائج ان توزيع اصابات اخماج المسالك البولية في الاناث (99(66%) بينما بلغت في الذكور 51(34%)) وسجلت اعلى نسبة من الاصابة في النساء البالغات المتزوجات 67(44.7%) .اظهرت النتائج ان بكتريا E.coli كانت الاكثر شيوعا في مرضى خمج المسالك البولية 65 عزلة (43.3%). بينت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان (100%) , اذ اظهرت نسب مختلفة من الالتصاق تراوحت بين 8 الى 63 خلية بكتيرية / خلية طلائية .اظهرت عزلات E.coli احتوائها على ثلاثة انواع من عوامل الالتصاق (CAF) وبنسب مختلفة . النوع الاول (CAFl) ووجد في 58 عزلة (89%) , النوع الثاني (CAFΠ) ووجد في 35 عزلة (54%) والثالث (CAFШ) وجد في 36 عزلة (55%) . عند اختبار حساسية العزلات تجاه 12 مضاد جرثومي , اظهرت عزلات E.coli مقاومة تامة (100%) لمضاد Augmentin(Amoxicillin/Clavulanic acid) (99%) بينما كانت اقل مقاومة للمضادات Pefloxacin , Norfloxacin, Nitrofurantoin وبنسبة(34, 35, 22)% على التوالي .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة من المقاومة المضاعفة المشتركة (42%) كانت في العزلات التي قاومت خمسة الى ثمانية مضادات . فيما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لاربعة مضادات من الفلوروكوينولونات ,فاظهرت النتائج ان هناك اختلافا واضحا في قيمتها . تم اختيار 28 عزلة E.coli من عزلاتنا المحلية بالاعتماد على درجة مقاومتها العالية للمضادات ,اظهر كشف البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) المفرد (Uniplex PCR) والمشترك (Multiplex PCR) عن وجود جينات الالتصاق الضارية والمتضمنة P (papC), type 1 fambria fimH ,adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ) حيث تم الكشف عن(22 isolates (79%),20(71%), 6(21%),4(14%)) على التوالي . تم الكشف عن جين مقاومة الكوينولونات gyrA في كل العزلات 28 (100%). في هذه الدراسة تم اعتماد gyrAبديلا عن استخدام 16s rRNA في تشخيص السلالات البكتيرية.اذ اعطت جميع العزلات حزم عند الحجم الجزيئي (518 bp) دلالة على وجود الجين باستخدام تقنية (PCR) .واخيرا .اظهرت النتائج ان عزلات E.coli الممرضة للقناة البولية (UPEC) والمقاومة للكوينولونات تبدي انخفاضا في عوامل ضراوتها عن العزلات الحساسة للكوينولونات ,اظهرت نتائجنا اعلى نسبة لعوامل الضراوة في العزلات التي قاومت ثمانية مضادات اعطت نسبة 18% منها تمتلك عامل الالتصاق الاول (CAFl) , 14%تمتلك (CAFΠ) و12% من هذه العزلات تمتلك (CAFШ) وذلك يشير الى ارتباط مباشر لمقاومة الكوينولونات مع انخفاض وجود جينات الضراوة (تراجع جيني).و اظهرت النتائج ايضا انه جينات الضراوة اقل انتشارا (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) في العزلات التي قاومت كل مضادات الفلوروكوينولونات .هذه العلاقة ربما تتاثر بواسطة التراجع الجيني . | One hundred fifty urine samples were collected from urinary tract infection patients from different ages during the period of July 2011 to November 2011. The bacterial diagnosis on cultural and microscopical characteristics of bacterial cell and biochemical tests. The final and accurate diagnoses of the isolates as the early mentioned species were done using the API 20E system. Molecular identification for adhesion factors and fluoroquinolone resistant gene was done by DNA extraction by boiling method, then subjected to conventional PCR .The antibiotic sensitivity test was done, also the minimum inhibitory concentration (MIC) for four Fluoroquinolone antimicrobial agents was studied. The results showed that the distribution of UTI in female were 99(66%), while in male were 51 (34%). However, the high percentages of UTI were observed within the adult married women 67(44.7%). The results showed that E.coli was the most common microorganisms in UTI patients, 65 isolates (43.3%). All the isolates showeded ability of adherence to uroepithelial cells of human's urinary tract (100%) of the isolates presented adherence that mean number of bacteria adhered to uroepithelial cells ranged from 8 to 63. E.coli isolates exhibited the presence of three types of colony adhesion factors (CAF) at different rate. Type one (CAFl) observed in 58 isolates (89%), while type two (CAFΠ) in 35 isolates (54%), and (CAFШ) in 36 isolates (55%). Sensitivity of E.coli local isolates toward 12 antimicrobial agents showed complete resistance (100%) to Augmentin (Amoxicillin/Clavulanic acid), while they were less resistance to Pefloxacin, Norfloxacin, Nitrofurantoin at (34, 35, 22)% respectively. The results showed that the highest rate of multidrug resistance (42%) was observed in isolates were able to resist 5 to 8 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentrations for four Fluoroquinolone antimicrobial agents showed an obvious different between their values.The local isolates of E. coli selection 28 isolates depending upon high degree of multi antibiotic resistance. The PCR assay (Uniplex PCR and Multiplex PCR) showed prevalence of virulent adhesion genes P (papC), type 1 fambria fim H, adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ), were detected (22 isolates (79%), 20(71%), 6(21%), 4(14%)) respectively. The quinolone resistance gene gyrA detected in all isolates 28 (100%). In the present study depended upon gyrA gene (housekeeping gene) as alternative to 16s rRNA for the identification bacterial strains. All the isolates give bands at the molecular size (518 bp) an indication of a gene by using PCR technique. Finally ,the results have shown that Fluoroquinolone resistant uropathogenic E.coli (UPEC) isolates express fewer virulence factors than Fluoroquinolone susceptible isolates .The persent results showed the highest rates of virulence factors in isolates that resisted eight antibiotics which was obtained to 18% of these isolates have(CAF l ), 14% have(CAFΠ ) and 12% of the isolates have (CAFШ). This finding suggests that fluoroquinolone could be directly associated with decreased prevalence of virulent genes (genetic back) .Also the results showed that all 4 virulent genes under the study were lower prevalent (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) in the isolates resistance for all fluoroquinolone and quinolone antimicrobial agents. that the relationship may be influenced by the genetic background.

تقييم المعادن الثقيلة لنهر دجلة ضمن مدينة بغداد باستخدام دلائل التلوث == Heavy Metals Assessment of Tigris River within Baghdad City by Pollution Indices

Author name: شهد رياض زكي الربيعي
Supervisor name: عادل حسين طالب الزاملي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية للفترة من شهر تشرين الثاني 2013 ولغاية شهر حزيران 2014, اذ تم جمع عينات الدراسة (ماء، رواسب، نباتات) خلال كل شهرين في ثلاثة مواقع في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد. تضمنت الدراسة تقدير تراكيز (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والزنك) في الماء (الذائب والكلي) وفي الرواسب (الكلي والمتوافر احيائيا) لنهر دجلة، وتم قياس نفس المعادن على انواع مختلفة من النباتات التي تم جمعها من مواقع الدراسة.اما الخصائص الفيزيائية والكيميائية لمياه النهر والمتمثلة في درجة حرارة الهواء والماء, الاس الهيدروجيني, الكدرة , الاوكسجين الذائب والتوصيلية الكهربائية فقد سجلت قيما ترواحت ما بين : ١٧٫٩ - ٤١ م°، ١١٫٧ - ٢٥٫٥ م°، ٧٫٨ - ٨٫٧، ٦٫٦ - ٣٧٫٢ NTU ، ٧٫٧ - ١١٫٣ ملغم/لتر و٨۰٦ - ١٩٤۰ مايكروسيمنز/ سم على التوالي .اظهرت نتائج الدراسة ان معدل التراكيز للمعادن الثقيلة الذائبة (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين) كانت ١٫٥١ ، ٣۰١٫١، ١٨٫١٨، ٢٩٫۰٣ ، ١٧١٫٤ و٤٣٫۰٣ ميكروغرام / لتر على التوالي. وكانت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار باستثناء الكروم والرصاص.بينما كان المعدل الاجمالي للمعادن الثقيلة في مياه نهر دجلة ٥٫٣۰ ،٤٦١٫٦۰، ٣٢٫۰٣، ٧٩٫٩٩ ،٢٢١٫٤٦ و١٢٦٫٦٣ميكروغرام / لتر على التوالي . والتي اعتبرت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار، باستثناء الكادميوم، الكروم والرصاص.في الرواسب ، كان معدل الاجمالي للمعادن الثقيلة ٧٫٣٨، ١٦٤٫٩٤،٣٩٫٤١، ٨٤٫٨٩ ٧١٫٥٢ و١٢٨٫٧٣ ملغم/كغم على التوالي. في حين يتراوح التوافر البيولوجي للكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين في رواسب نهر دجلة بين (قيم غير محسوسة - ۰٫٣٢) ، (۰٫٣٩ - ٣٫٤٢) ، (۰٫٨٩ - ٣٫١٩) ، (۰٫٤٢ - ٢٫٨٤) ، (۰٫٧٨ - ٥٫۰٤) و(۰٫٨٦ - ١٧٫١٨) ملغم/كغم على التوالي.تم تقييم شدة تلوث مياه النهر بالمعادن الثقيلة باستخدام مؤشر التلوث (PI) والتي اظهرت ان درجة تلوث المعادن الثقيلة في عينات المياه كانت متوسطة للمواقع حسب الترتيب التالي : ٣>٢>١.كما قيمت شدة تلوث الرواسب النهرية بالمعادن الثقيلة المدروسة بواسطة استخدام دلائل تلوث الرواسب وهي كل من مؤشر التراكم الارضي (I - geo - Index) ، مؤشر حمل التلوث (PLI - Index) ، مؤشر عامل التلوث (CF - Index) ، درجة التلوث (Cd - Index) ومؤشر عامل الاغناء EF - Index)).فيما يتعلق بتقييم تلوث الرواسب باستخدام المؤشرات البيئية فقد بينت نتائج مؤشر التراكم الارضي (I - geo) المحسوب للعناصر المدروسة ان المواقع المدروسة غير ملوثة بعنصري النحاس والزنك ولكنها قوية التلوث للغاية بعنصر الكادميوم في حين اظهرت قيم مؤشر التراكم الارضي للرصاص بانها درجة تلوث معتدلة وغير ملوثة الى متوسطة التلوث لعنصري الكروم والنيكل. كما اظهرت قيم مؤشر حمل التلوث(PLI) بان كل المواقع كانت ملوثة بمجموع المعادن المدروسة.اوضحت نتائج عامل التلوث(CF) بان المواقع جميعها سجلت تلوث عاليا جدا بعنصر الكادميوم ، ولكنها واطئة التلوث بعنصر الزنك في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل تلوث معتدلا بهذا العنصر، بينما سجل تلوث معتدلا بعنصر الكروم ،النحاس والنيكل في جميع المواقع .بينما سجلت الرواسب تلوثا عاليا بعنصر الرصاص في جميع المواقع المدروسة.وفقا لنتائج مؤشر درجة التلوث (Cd) فقد اعتبرت جميع المواقع على درجة عالية جدا من التلوث بالمعادن المدروسة.فضلا عن ذلك بينت نتائج عامل الاغناء EF - Index)) بان كل المواقع تصنف على انها عالية للغاية مع الكادميوم ومعتدلة الاغناء بعناصر الكروم، النحاس والنيكل واغناء مهم بعنصر الرصاص وحد ادنى من الاغناء بعنصر الخارصين في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل اغناء معتدل.اظهرت نتائج قيم BCF& BSF في جميع النباتات بانها اكثر من 1 مما يشير الى ان النباتات مؤشر احيائي جيد لكافة العناصر المدروسة في منطقة الدراسة وكذلك اوضحت نتائج معامل التركيز الاحيائي((BCF لجميع المعادن المدروسة في عينات النباتات انها اعلى من قيم معامل الترسيب الاحيائي ((BSF مما يدل ان مصدر التراكم لهذه العناصر في النباتات كان من الماء. | This study was carried out from November 2013 to June 2014; the samples were collected every two months in three sites in the Tigris River within Baghdad city. It included estimate concentration of (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) in dissolved and total water and sediments (total& bio - available) of Tigris River. The same metals were measured in different types of plants collected from study sites.Physical and chemical properties of river water had values ranged between 17.9 - 41.0 C˚, 11.7 - 25.5 C˚, 7.8 - 8.7, 6.6 - 37.2 NTU, 7.7 - 11.3 mg/l and 806 - 1940 µs/cm for air and water temperature, pH, turbidity, dissolve oxygen and electrical conductivity, respectively.Study results showed that mean of heavy metals concentrations (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) were 1.51 µg/L, 301.10 µg/L, 18.18 µg/L, 29.03 µg/L, 171.40 µg/L and 43.03 µg/L, respectively in dissolved water and they were within permissible limits for Iraqi standard specifications exceptions of Cr and Pb. While the total of heavy metals in Tigris River water average was 5.30 µg/L, 461.60 µg/L, 32.03 µg/L, 79.99 µg/L, 221.46 µg/L and 126.63 µg/L, respectively and they were within permissible limit for Iraqi standard specifications exceptions of Cd, Cr and Pb.In sediment samples, mean of heavy metals concentrations were 7.38 mg/kg, 164.94 mg/kg, 39.41 mg/kg, 84.89 mg/kg, 71.52 mg/kg and 128.73 mg/kg, respectively. While the ranges of bioavailability for Cd, Cr, Cu, Ni, Pb and Zn in sediments of Tigris River are (ND - 0.32), (0.39 - 3.42), (0.89 - 3.19), (0.42.2.84), (0.78 - 5.04) and (0.86 - 17.18) mg/kg, respectively.Severity of river water pollution with studied heavy metals were assessed by using Pollution Index (PI) which showed that the degree of pollution by heavy metals in the water samples moderates contamination for the sites in the following order : 3>2>1.Also, pollution of river sediments in the studied heavy metals were assessed by using sediment pollution indices such as geo - accumulation index (I - geo), pollution load index (PLI), contamination factor (CF), contamination degree (Cd) and enrichment factor (EF).Related with the assessment of sediments pollution by using the ecological indices, the results of geo - accumulation index (I - geo) for studied heavy metals cleared that the studied sites unpolluted with Cu and Zn, while strongly to extremely pollute with Cd while the Igeo values of Pb show moderately polluted degree and unpolluted to moderately polluted degree with Cr and Ni. The values of pollution load index (PLI) showed that all sites are polluted with total studied metals (PLI value of > 1).Results of contamination factor (CF) observed that all the sites recorded very high contamination with Cd , while low contamination with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate contamination with it, and recorded moderate contamination with Cr, Cu and Ni in all sites, while the sediments recorded considerable contamination with Pb in all studied sites. According to the result (Cd) indicates that all studied sites showed very high degree of pollution with studied metals. As well as, the enrichment factor results (EF) showed that all sites can be classified as extremely high enrichment with Cd, moderate enrichment with Cr, Cu and Ni, significant enrichment for Pb and minimal enrichment with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate enrichment.The results showed that BCF &BSF values in all plants were more than 1 and this can be considered that plants can be a good bio - indicator for all the heavy metals studied in study area, also BCF values for all elements were more than (BSF) values in all plants samples which lead to plant samples bioaccumulation source with these metals was from water.

الكشف الجزيئي عن انواع البكتريا وفايروس التهاب الكبد المرتبطين مع بيتا - ثلاسيميا == Molecular Detection of Bacterial and Hepatitis Virus Types Associated with ? - Thalassemia

Author name: شـهـد رعـد مزعـل
Supervisor name: اياد محمد علي فاضل
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة التحري عن انواع الاصابات البكتيرية والالتهاب الكبد الفايروسي المرتبط بمرض الثلاسيميا نوع الكبير ومقارنتها مع الاشخاص المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير.لغرض التشخيص انواع البكتيريا جمعت نوعين من عينات من مرضى الذين راجعوا مستشفى ابن بلدي.عينات الادرار تضمنت (41عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و18من المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير) وعينات الدم تضمنت (25عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و25عينة من المرضى غيرمصابين بثلاسيميا نوع الكبير). اعتمادا على تحديد الصفات الزرعية للمستعمرات والصفات المورفولوجية للخلايا البكتيرية ومن ثم الصفات الكميوحيوية كما امكن تشخيص العينات باستخدام .VEKIK2systemاظهرت النتائج التشخيص في عينات الادرار في المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير ان بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 25% بينما انواع اخرى من بكتيريا ظهرت بنسبة 6% ,5% ,3% ,3% ,2% ,2% ,2% ,2%, 1.3% لبكتيريا klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia على التوالي. بينما من جانب اخر كانت نتائج التشخيص عينات الادرار لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير حيث كانت بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 28% بينما ظهرت نتائج الانواع بكتيريا الاخرى بنسبة 12% ,7% ,5% ,3% ,4% ,4% ,4% ,4% ,4% على التوالي لبكترياklibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp ..اظهرت نتائج تشخيص عينات الدم ان بكتيريا الاكثر تواجدا في المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير والمرضى غيرمصابين بثلاسيمميا النوع الكبير كانتEscherichia coli 24% ,15% على التوالي. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 6% ,3% ,5%, 5%,5% ,3% ,2% ,2%, 2% على التوالي لبكتيريا streptococcus pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 7%, 5%, 3.2% ,3.2% ,3.2%3.2%, 3.2%, 3.2%,3.2% على التوالي لبكتريا sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca,proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea.spp. اما بالنسبة لتاثير بعض المضادات الحيوية على بكتيريا Escherichia coli فقد اظهرت النتائج اختبار الحساسية لمضادات باستخدام VITKE 2 systemمقاومة هذه العزلات امبسلين (98%) وسيفاتريكسون (95%) السبروفلوكساسين (46%) السيفوتازيديم (44 (%والاموكسيسيلين (43% (والسيفوتاكزيم (40%) وليفووكساسين) 78%) والنالدكسك اسد (50%) ميثوبريم (27%) سيفابيم (40%) اكستابنيم (20%).استعملت طريقة التحليل الجزيئي PCR analysis للكشف عن عوامل الفوعة الجينية والمقاومة والتقارب الوراثي التي تمتلكها بكتيريا Escherichiacolii ، وباستخدام بادئات متخصصة لكل من الجين الخاص بالاهداب من النوع الاول (fimH) والجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII). وجين خاص بتحلل الدم (hly) وجين خاص بالالتصاق (eae) وجين خاص ب لمقاومه مضاد حيوي ((bla - cmy2 كانت النتائج ان جين (fimH) بنسبة (58%) ، فيما كانت نسبة الجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII) (58%) بينما جين خاص بالالتصاق (eae) كانت نسبة (20%). ونسبة جين خاص بتحلل الدم (hly) (28%), ونسبة الجين خاص بمقاومة المضاد الحيوي ((bla - cmy2 كانت (83%) بينما كانت نسبة ظهور كل جينات) 5.7%), وكانت نتائج الجين الخاص بتقارب الوراثي (Box) (58%).ولغرض دراسة الاصابات الفايروسية مرتبطة بمرض ثلاسيميا النوع الكبير وباستخدام تقنية ELSLA جمعت عينات الدم (88 من المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير و62 من مرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير) تم جمع العينات من مركز الوطني لنقل الدم لتحري عن وجود الالتهاب الكبد الفايروسي نوع ( CوB) حيث كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (B) لدى المرضى مصابين مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (17%) بينما كانت نسبة لدى المرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (16%).بينما كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (C) (82.9 %) ,(8 ,83%) لدى مرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبيرو غير مصابين بثلاسيمياالنوع الكبير على التوالي . | This study was carried out to detect the types of bacterial and viral infections which associated with β thalassemia major comparison to non thalassemic patients group.For Bacterial types identification two different kinds of samples were collected from Ibin ALBalady hospital. Urine samples which included (41from thalassemic patients and 18 from non thalassemic patients) and blood sample which included (25 from thalassemic patients and 25 from non thalassemic patients) depending on their cultural, morphological as well as biochemical characterization. The result identification that in urine sample showed that was most prevalent kind was Escherichia coli with percentage 25%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 6%, 5%, 3%, 3%, 2%, 2%, 2%, 2%, and 1.3%. Klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia respectively. While, on other hand, in non thalassemic patients the result identification that in urine sample the most prevalent kind was Escherichiacoli with percentage 28%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 12%, 7%, 5%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4% for klibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively. The result for blood sample identification also showed that the Escherichia coli was most common in thalassemic and non thalassemic patients it with a percentage 15%, 24% respectively, and other types bacteria were also obtain with a percentage 6%, 3%, 5%, 5%, 5.3%, 2%, 2%, 2% for , sterptococcus pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively from thalassemic patients and other types bacteria were obtain from non thalassemic with a percentage 7%, 5%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3% for sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp receptivity, and the results confirmed by identification VITEK 2 system kit. The VITEK 2 SYSTEM Antibiotics sensitivity test kits results revealed that Escherichiacoli were resistance to following antibioses Ampcilin (98%), Cefatriaxone (95%), Ciprofloxacin (46%), Cefipime (74%) Liovfaxacin (78%), Tetracylin (70%), Cefotaxim (40%), Aomxcilin (43%), Nalidexic acid (50%), Extapenem (20%), ceftazidime (44%). Moreover, low percentage of resistance was shown to, extapenem (20%) Trimethoprim (27%). PCR Methods used of molecular diagnosis of virulence genes, resistance, genotyping genes of E. coli by using specific primers to type 1 fimbria gene (fimH) and capsule gene (kpsMTII), hemolysin (hly), intimin (eae), ceftriaxone (bla - cmy2). PCR results the presence fimH (58%) and kpsMTII (40%) while hly (28%), eae 25%, (bla - cmy2) (83%). While the prevalence of all genes together with a percentage (7.5%) The results of box - PCR genotyping was 80%. To study the viral infection which associated with β thalassemia major by used ELSLA technique sample (88 from thalassemic and 62 from non thalassemic patients) were collected from Iraq National blood bank. For detection of HBS and HCV the result showed that HBS17% in thalassemic patients while in non thalassemic patients was16% while HCV were (82.95%), (83.87%) is percentage thalassemic patients receptivity

استجابة تراكيب وراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتحمل تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم خلال مراحل مختلفة من النمو == Response of barley genotypes Hordeum vulgare L. for tolerance different concentrations of Sodium Chloride through different growth stage

Author name: شروق محمود وسين
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2008 - 2009 بهدف التعرف على مدى تحمل بعض التراكيب الوراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم في مراحل مختلفة من النمو . تضمنت الدراسة تجربتين : التجربة الاولى هي دراسة تاثير تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم (0 ، 50 ، 100 ، 150 و200) مليمول/لتر على ستة تراكيب وراثية من الشعير هي بركة، بيكسون، فوريست ، بركة × بيكسون، بركة × فوريست وبيكسون × فوريست في بعض المؤشرات المظهرية كنسبة وسرعة انبات البذور وطول الجذير والرويشة والمساحة الورقية . نفذت التجربة في مختبر الدراسات العليا ، قسم علوم الحياة / كلية العلوم / الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية وقد استعمل محلول مغذي nutrient solution كوسط لزراعة البذور .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في المؤشرات المدروسة كما اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية للشعير في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهر التركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح فقد اعطى القيم 93.00% عن نسبة الانبات و7.36 بذرة/يوم عن سرعة الانبات، 6.72 سم عن طول الجذير و8.30 سم عن طول الرويشة. اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع لقسم علوم الحياة ، كلية التربية / ابن الهيثم / جامعة بغداد من خلال زراعة بذور التراكيب الوراثية بركة وبيكسون وبركة × فوريست بعد معرفة تحملها للملوحة (التجربة الاولى) في اصص بلاستيكية لدراسة تاثير تراكيز كلوريد الصوديوم السابقة المذكورة اعلاه على بعض المؤشرات المظهرية والفسلجية كاطوال الجذور واحجامها واوزانها الجافة وارتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري والمساحة الورقية ومحتوى بعض العناصر الغذائية في الجزء الخضري (كالنتروجين والفسفور والبوتاسيوم والصوديوم والكلور) ونسبة البروتين ومحتوى الكلوروفيل ومحتوى البرولين ونسبة الدهون والمحتوى النسبي للرطوبة في الاوراق بالاضافة الى بعض مكونات الحاصل وهي الحاصل البايولوجي ، طول السنبلة ، وزن السنبلة/نبات ، عدد الحبوب/سنبلة، وزن الحبوب/سنبلة، وزن 1000 حبة ووزن الحبوب/اصيص . كما تمت دراسة (محتوى البوتاسيوم والصوديوم والكلور) والجهد الازموزي لتربة التجربة بعد الزراعة . وقد استخدم التصميم العشوائي الكامل CRD)) وبتجارب عاملية لتنفيذ التجربتين وبثلاثة مكررات في التجربة الاولى، واربعة مكررات في التجربة الثانية، وقد تم تحليل النتائج احصائيا وقورنت المتوسطات باستعمال اقل فرق معنوي (L.S.D.)على مستوى احتمال 0.05 .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في معظم المؤشرات المدروسة. وزيادة معنوية في محتوى الحامض الاميني البرولين ومحتوى الصوديوم والكلور في الانسجة المختلفة للتراكيب الوراثية المدروسة ، كما زاد معدل الجهد الازموزي ومحتوى الصوديوم والكلور وانخفض محتوى البوتاسيوم في ترب التراكيب الوراثية مقارنة بها قبل الزراعة . كذلك اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهرالتركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح، فقد اعطى قيما عليا في معظم المؤشرات المدروسة كالوزن الجاف للجذور 1.01 غم/نبات، وارتفاع النبات بعد مرور شهر من التعرض للملح 54.00 سم، وارتفاع النبات بعد مرور ثلاثة اشهر من التعرض للملح 63.90 سم، والوزن الجاف للجزء الخضري 0.35 غم/نبات، والمساحة الورقية 53.51 سم2، ومحتوى النتروجين 10.83 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى البوتاسيوم 8.22 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى الكلور 7.45 ملغم/غم وزن جاف، ونسبة البروتين 18.70%، ومحتوى الكلوروفيل 33.20 مايكروغرام/سم2، ومحتوى البرولين 14.01 ملغم/لتر، ونسبة الدهون 5.27%، وبعض مكونات الحاصل مثل الحاصل البايولوجي 11.01 غم/اصيص وطول السنبلة 5.84 سم، وعدد الحبوب/سنبلة 25.39 حبة/سنبلة، ووزن الحبوب/سنبلة، 0.81 غم/سنبلة، ووزن 1000 حبة 28.93 غم، ووزن الحبوب /اصيص 4.22 غم/اصيص، يليه التركيب الوراثي بيكسون ثم بركة × فوريست . كما اظهرت النتائج وجود تباين بين ترب التراكيب الوراثية للشعير في محتوى بعض العناصر، اذ اعطت تربة بركة اقل معدل لمحتوى عنصر البوتاسيوم بلغ 231.70جزء بالمليون، واعلى محتوى للكلور بلغ 2.74 ملي مكافئ/لتر . | This study has been performed during the agricultural season of 2008 - 2009 in the aim to recognize how some genotypes of barley Hordeum vulgare L. tolerate different concentrations of NaCl in different growth stages . Two sets of experiment has been done : The first was to determine the effect of different concentrations of NaCl (0,50,100,150 and 200) mM/l on some morphological parameters (% and rapidness of seeds germination, radical and plumule length and leaf area). Of six genotypes of barley cultivars Baraka, Bekson, Forest, Baraka × Bekson, Baraka × Forest and Bekson × Forest . The experiment was done in the Labrotary of higher studies, Department of Biologey, college of science, AL - Mustansiriyah University, by using petri dishes supplied with nutrient solution. The result showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to asignificant decrease in the studied parameters. Also the result revealed adifference among the genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype showed agood tolerating capacity against high saline concentration so it gave values 93% for percentage of germination, 7.36 seed/day of rapidness of germination, 6.72 cm of radical length and 8.30 cm of plumule length. The second set was carried out in the green house of the Department of Biologey, college of Education (Ibn AL - Haitham), Baghdad university via planting seeds of Baraka, Bekson and Baraka×Forest genotypes after determination of their salinity tolerance (set No.1) in plastic pots in order to study the effect of the above mentioned NaCl concentrations on some of their morphological and physiological parameters such as root length and size, shoot and root dry weights , content of some nutrient elements in the shoot (such as N, K, Na and Cl), protein %, chlorophyll content, proline content, lipid proportion and leaf relative humidity, beside some yield components : biological yield, spike length, weight of spike/plant, number of grains/spike, weight of grains/spike, weight of 1000 grains and weight of grains /pot Additionally, determination of (K, Na and Cl content)and osmotic potential in experiment soil after planting. The completely RandomiZed Design (CRD) with Factorial experiments was applied with three replicates for the first experiment and four replicates for the second experiment, Data were statistically analyzed to find out the least significant differences between treatment at 0.05 level. The results showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to a significant decrease in studied parameters and a significant increase in content of proline acid, Sodium and Chloride in the different tissue of the studied genotypes. Also increased the average of osmotic potential, content of Sodium, Chloride and decrease of potassium content in soil of the genotypes as compared with it befor planting. Moreover, the result revealed a difference among genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype exhibited a good tolerating capacity against high saline concentration so it provides higher values in most of the studied parameters as root dry weight 1.01 gm/plant, shoot length after one month of salt treated 54.00Cm,shoot length after three months of salt treated 63.90 Cm, shoot dry weight 0.35 gm/plant, leaf area 53.51Cm2, Nitrogen content 10.83 mg/gm dry weight, Potassium content 8.22 mg/gm dry weight, Chloride content 7.45 mg/gm dry weight, % protein 18.70 %, chlorophyll content 33.20 mg/cm2, proline content 14.01 mg/L, % lipid 5.27%, biological yield 11.01 gm/pot , spike length 5.84Cm, number of grains /spike 25.39 grain/spike, weight of grains /spike 0.81 gm/spike, weight of 1000 grains 28.93mg and weight of grains/ pot 4.22 gm/pot; then, Bekson genotype and Baraka × Forest. The result showed that there is a variation among soil of the genotypes of barley in content of some elements when soil Baraka gave least avarege of Potassium content as (231.70 ppm) and higher Chloride content as (2.74 m.q/L)

دراسة العلاقة بين مجاميع الدم واضداد النطف في الرجال قليلي الخصوبة == A study on relation between blood groups and Anti - sperm antibodies in infertile men

Author name: شروق ابراهيم محمود عزيز اغا
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم استخدام 92 عينة دم وسائل منوي لذكور قليلي الخصوبة وكذلك نفس العدد من ذكور خصبين , حيث تم الحصول عليها للفترة المحصورة من تشرين الثاني 2006 ولغاية حزيران 2007 . اجري فحص الدم على جميع العينات لتحديد مجاميع الدم طبقا لنظام ABO ونظام لويس , بينما تم التحري عن اضداد النطف باستخدام فحص ELISA النوعي وكما تم تحديد عيارية هذه الاضداد في العينات الموجبة باستخدام Tray - agglutination test (TAT). اظهرت نتائج هذه الدراسة علاقة معنوية (p≤0.01) مابين نوع مجاميع دم لويس وحالة الخصوبة حيث سجل صنف دم Lea 4.4% وصنف Leb 14.1% وصنف Lea - b - 81.5% في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع 20.7 % , 15.2 % ,64.1% على التوالي في الذكور الخصبين . بينما اظهر فحص ELISA نتيجة موجبة لوجود اضداد النطف بنسبة 5.4% , 32.0% في كل من البلازما المنوية ومصل الدم على التوالي في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع الذكور الخصبين حيث لم تسجل اي نسبة وجود للاضداد في مصل الدم . من جهة اخرى فقد اظهرت النتائج علاقة معنوية ( (P≤0.01 ما بين وجود اضداد النطف في مصل دم الذكور قليلي الخصوبة ومجاميع الدم نظام ABO , حيث سجل صنف الدم O , اعلى نسبة للاضداد بلغت 55.0% بالمقارنة مع 45.0% لجميع اصناف الدم الاخرى . كما اظهرت النتائج وجود نفس العلاقة المعنوية( (≤0.05 ما بين مجاميع دم لويس ونسبة اضداد النطف حيث سجل صنف دم لويس Lea - b - اعلى نسبة اضداد بلغت 69.0% بالمقارنة مع 31.0% لكلا الصنفين Lea , Leb كذلك اظهرت النتائج عدم وجود علاقة معنوية ما بين اضداد النطف وعدد النطف في الذكور قليلي الخصوبة ذوي مجاميع الدم ABO ومجاميع دم لويس .واخيرا فقد اظهرت النتائج وجود تراكيز طبيعية لجميع الهرمونات الجنسية في عينات مصل الدم لجميع الذكور قليلي الخصوبة سواء حسب نظام ABO او نظام لويس. | Ninety two samples of blood and seminal fluid of low fertility males and equal number of the same samples from fertile males ,were obtained from November 2006 till June 2007 . The grouping was carried out according to ABO and Lewis system , While antibodies of sperms were detected by using specific ELISA test , and the titer in the positive samples was determined by Tray - agglutination test (TAT) . The results of this study revealed a significant correlation (P≤ 0.01) between the phenotype of Lewis blood groups and the fertility state , in which 4.4% Lea, 14.1% Leb and 81.5% Lea - b - phenotypes were recorded in the low fertility males , in comparison to 20.7% ,15.2% and 64.1% respectively in those fertile males . However the ELLISA screening test in low fertility males showed positive results 5.4% and 32.0% in seminal plasma and serum samples respectively , in comparison to 0% in serum of fertile males . On the other hand , the results demonstrated a significant correlation (P≤ 0.001) between the presence of anti - sperm antibodies in the serum of infertile and the ABO blood groups , Whereas ,the group O recorded a highest presence of anti - sperm antibodies 55.0% in comparison to that recorded by the remaining groups 45.0% . Also the same significant correlation (P≤ 0.05) has been obtained between the Lewis blood groups and the presence of anti - sperm antibodies, in which Lewisa - b - phenotype recorded the highest percentage 69.0% comparison to 31.0% for those of Lea and Leb together . Further more the results also showed that in low fertility males, who had ABO and Lewis blood groups, there were non significant correlation between anti - sperm antibodies and number of sperms .Finally the results showed normal concentration of all sex hormones in the serum of all infertile males in spite of their ABO and Lewis blood groups

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين == Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

Author name: شذى فارس طارق
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

الكشف عن انواع الجنس Fusarium المنتج للفيومنسين ب1 على حبوب الذرة الصفراء باستخدام الطرائق الجزيئية ودراسة تاثيراته المرضية النسيجية على الفئران البيض == Detection of Fusarium Species Producing Fumonisin B1 on Maize Using Molecular Methods and Study Its Histopathological Effects on Albino Mice

Author name: سيناء وليد محمد سعيد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | سالم رشيد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص انواع الجنس Fusarium المرافقة للذرة وقابليتها على انتاج السم FB1 باستخدام الطرق التقليدية والجزيئية. كما تم دراسة الظروف المثلى لانتاجه فضلا عن تاثيره على انسجة الكبد والكلية والطحال وقياس انزيمات الكبد والطحال في ذكور الفئران المجرعه فمويا بالسم.تم جمع ثمانية وثمانين عينة ذرة للفترة ما بين تشرين الثاني 2013 واذار 2014 من الاسواق المحلية ومخازن الحبوب في بغداد (35 عينة ذرة من مخازن الحبوب و53 عينة من الاسواق المحلية) كما وتم الكشف عن الفطرين المنتجين للفيومينيسين وهما Fusarium verticillioides وF. proliferatum باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة (PCR) وتقنية فصل الصفائح الرقيقة (TLC) وتقنية الاليزا.(ELISA) وكانت النتائج كما ياتي : 1. الاجناس الفطرية المعزولة من الذرة هي : الفطر Aspergillus وكان الاكثر سيادة (58.6%) تليه الفطرياتFusarium (17.5%) ثم Rhizopus (6.7%), Alternaria (6.1%), Mucor وPenicillum (3.9%), Bipolaris (1.9%) وTrichthecium (1.2%).2. النوع الاكثر سيادة ضمن جنس Fusarium كان F. verticillioides (70.64%) 3. اظهرت النتائج باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة المتسلسلة (species specific PCR) ان من بين سبعة وسبعين عزلة, فقط ثلاثة عشر عزلة تعود للجنس F. verticillioides ومن بين تسع عزلات فقط عزلة واحدة تعود للجنس F. proliferatum.4. تمتلك جميع عزلات F. verticillioides الثلاثة عشر الجين fum1 وبذلك يعد المنتج الرئيسي للسم FB1 مقارنة مع عزلة F. proliferatum التي لم تمتلك الجين.5. من بين العزلاتF. verticillioides الثلاثة عشر, كانت العزلة FV1 هي الاكفا في انتاج FB1 (175.39 جزء في البليون) على وسط فطيرة الذرة بينما تراوح تركيز السم FB1 لبقية العزلات يتراوح بين (21.31 - 170.51 جزء في البليون).6. كانت نتائج الظروف المثلى لانتاج السم FB1 هي وسط فطيرة الذرة وفترة حضانة 21 يوم ودرجة حرارة مثلى 20ºم.7. حددت الجرعة القاتلة المتوسطة (LD50) للسم FB1 لذكور الفئران وهي 1800 جزء في البليون.8. لوحظت زيادة في تركيز انزيمات الكبد والكلى للفئران بعد تجريعها فمويا بالسم FB1 عند التركيزين 800 و1200 جزء في البليون مقارنة مع مجموعة السيطرة.9. كشفت النتائج ان التغيرات في انسجة الكبد والكلى والطحال للفئران المجرعه فمويا بالسم FB1بالتركيزين 800 و1200 جزء في البليون، ظهرت زيادة التغيرات 10. التنكسية والموت المبرمج للخلايا مقارنه مع مجموعة السيطرة. | The study aimed to identify Fusarium species associated with maize grains and their ability to produce Fumonisin B1 using traditional and molecular methods. The optimal conditions of FB1 production were assayed. The effect of FB1 on liver, kidney and spleen tissues of albino mice were studied and measured its effects on enzymes in affected liver and kidney.Eighty - eight maize samples were collected between November 2013 and March 2014 from local markets and silos of Baghdad province (thirty - five from silos and fifty - three from markets). Fusarium verticillioides and F. proliferatum were investigated and their ability to produce Fumonisin B1 was detected using : Polymerase chain reactions (PCR), Thin layer chromatography (TLC) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) techniques. The following results were obtained from the current study : 1. The fungal genera isolated from maize were : Aspergillus (58.6 % ) followed by Fusarium (17.5% ), Rhizopus (6.8 %), Alternaria (6.1 %), Mucor and Penicillium (3.9 %), Bipolaris (1.9 %), and Trichothecium (1.2%).2. The predominant species among Fusarium was F. verticillioides (70.64%).3. The use of species specific PCR reactions for Fusarium species revealed that out of seventy seven isolates, thirteen isolates only belong to F. verticillioides and out of nine isolates, one isolate only belong to F. proliferatum.4. All the thirteen F. verticillioides isolates were shown to possess fum1 gene (FB1 producer), whereas the F. proliferatum isolate was shown not to possess this gene. 5. Among the thirteen isolates of F. verticillioides, FV1was the most efficient one in production of FB1(175.39 ppb) on patty maize medium, while the concentration of FB1 for other isolates ranged between (21.31 - 170.51) ppb. 6. The optimum culture conditions for FB1 production using solid state fermentation included : patty maize medium with incubation period 21 days at 20ºC. 7. The median lethal dose 50 (LD 50) of FB1for male mice was 1800ppb.8. liver enzymes (AST, ALT, ALP) and kidney functions (Creatinine and Blood urea) were increased in male mice which were orally gavaged FB1 at 800 and 1200ppb concentrations comparing with control group.9. The histopathological changes in the liver, kidney and spleen of orally gavaged mice by FB1 at 800 and 1200 ppb, showed a significant increase degenerative changes and apoptotic cells in comparison with control group

دراسة عن كبسولة بكتريا Acinetobacter baumannii وتاثيرها على الاستجابة المناعية == Study on capsule of Acinetobacter baumannii and its effect on Immune Response

Author name: سيناء مهدي شاكر الخفاجي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • عزلت 34 عزلة بكتيرية تعود للنوع Acinetobacter baumannii من بين 424 عينة شملت عينات ( جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) وبنسبة 8.01% جمعت من المرضى الراقدين في مستشفى بغداد التعليمي / مدينة الطب ، وقد شخصت من خلال الصفات الزرعية (المستعمرات) والمجهرية ( البكتريا) والاختبارات الكيميائية الحياتية وباستخدام نظام Api 20 E ، وقد كانت معدلات الاصابة ببكتريا Acinetobacter baumannii في العينات المشخصة (جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) هي (15 ، 11، 6 ، 2) % على التوالي .• التحري عن عزلة كفوءة منتجة للكبسولة ، اذ امكن الحصول على عزلة كفوءة منتجة للكبسولة عند تنمية العزلات في وسط اغار نقيع القلب والدماغ المضاف اليه 5% كلوكوز وبفترة حضن 5ايام ودرجة حرارة 30 م.• التحري عن حساسية عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii تجاه 19 مضادا للحياة ، وقد اظهرت العزلات البكتيرية حساسية بنسبة 100% للمضاد Imipenem ومقاومة بنسبة 100% لمضادات الحياة (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin , Cephalothin , Tetracyclin , Aztreonam , Ciprofloxacin ) • حددت التراكيز المثبطة الدنيا لـ 8 مضادات للحياة Ciprofloxacin وGentamicin وAmikacin وTobramycin وCefotaxime وPipracillin وPiracillin +Tazobactum وCefepime واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في الـMIC لهذه المضادات ،اذ تراو حت قيم الـMIC لهذه المضادات (4 - 512 ، 8 - 1024< ،4 - 256 ، 4 - 1024< ، 16 - 1024< ، 8 - 256 ، 8 - 512) مكغم /مل على التوالي .• التحري عن قابلية عزلات Acinetobacter على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات ، اذ اظهرت العزلات البكتيرية قابليتها على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات نوع الدوز Aldose وتغييره الى لون بني .• التحري عن قابلية 18 عزلة بكتيرية منتخبة بصورة عشوائية تعود للنوع Acinetobacter baumannii على تلزين كريات الدم الحمر للانسان وباصنافه الاربعة A , B, AB, O في اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates ، وقد بينت النتائج قابلية العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للاصناف A , B AB, فيما اخفقت العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للصنف O .ثانيا - الجانب المناعي : استهدف هذا الجانب استخلاص الكبسولة من العزلة الكفوءة ودراسة تاثير تراكيز مختلـفة (25 ، 50 ، 100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على الخلايا المناعية باختيار المعايير الاتية : عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، التشكل الزهري التائي والبائي ، عملية البلعمة ، اختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم ، معامل انقسام خلايا نخاع العظم في الفئران والتحري عن الاضداد المتخصصة بمستخلص الكبسولة باجراء اختبار اخترلوني . ومنها تم الحصول على النتائج الاتية : • عدم تاثير التراكيز (25 ، 50 ، 100) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، فيما اظهرت التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل تاثيرا على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية .فقد سببت انخفاضا في عيوشية هذه الخلايا .• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التائية المكونة للتشكل الزهري الفعال والكلي نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل على الخلايا التائية.• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية البائية المكونة للتشكل الزهري نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل.• اظهرت النتائج زيادة في عملية البلعمة عند استخدام التركيز 100 مكغم /مل من مستخلص الكبسولة فيما انخفضت عملية البلعمة عند استخدام التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في النسب المئوية للخلايا المكونة للفورمازان باستخدام التراكيز (100 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في معامل الانقسام الخيطي لخلايا نخاع العظم في الفئران باستـــخدام التركيزيـــن (100 ، 250) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• تكون خطوط ترسيب بين مستخلص الكبسولة ومصول الارانب الممنعة به باستخدام المصل بدون تخفيف وعند تخفيفه بنسبة 1 : 10 ، فيما لم تظهر اي خطوط ترسيب عند استخدام التخفيفين 1 : 100 و1 : 1000 او عند استخدام المصل قبل التمنيع .ثالثا - الالتصاق البكتيري وتثبيط الالتصاق البكتيري : تضمن هذا الاختبار مقارنة التصاق عزلات مكونة للكبسولة وغير مكونة للكبسولة على البولستايرين ومقارنة التصاق عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار الانسان لمعرفة دور الكبسولة في الالتصاق ، فضلا عن تثبيط الالتصاق البكتيري باستخدام : ا - اضداد مستخلص الكبسولة Capsular antibodies ،اذ تم الحصول على مضاد الكبسولة بعد تمنيع الارانب بمستخلص الكبسولة ومفاعلة المصل المضاد للكبسولة مع عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة لبكتريا Acinetobacter baumannii ومن ثم اجراء اختبار الالتصاق البكتيري لمعرفة دور اضداد الكبسولة في تثبيط الالتصاق .ب‌ - ماتحت التركيز المثبط الادنى subMIC من خلال تنمية العزلة المكونة للكبسولة في وسط نقيع القلب والدماغ السائل BHIB الحاوي على تركيز الـ subMIC لبعض المضادات البكتيرية ، واجري اختبار الالتصاق البكتيري ومقارنة ذلك بمعدل نفس العزلة المنماة في نفس الوسط الخالي من الـ subMIC لمعرفة تاثير الـsubMIC في عملية تخليق الكبسولة وعملية الالتصاق البكتيري .• اظهرت نتائج اختبار الالتصاق على البولستايرين قابلية العزلتين المكونتين للكبسولة على البقاء ملتصقة على البولستايرين فيما اخفقت العزلتين غير المكونتين للكبسولة بالبقاء ملتصقتين على البولستايرين .• بلغ معدل التصاق البكتريا المكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية للانسان (35.62) وبذلك هو اعلى من معدل التصاق البكتريا غير المكونة للكبسولة (19.68) .• اظهرت الاضداد المتخصصة للكبسولة تاثيرا مثبطا لالتصاق العزلة المكونة للكبسولة ، فيما لم تؤثر في التصاق العزلة غير المكونة للكبسولة .• ادى ما تحت التركيز المثبط الادنــــى subMIC للمضاديــــن Ciprofloxacin 64 مكغم/مل وPiracillin + Tazobactum 16 مكغم /مل الى تثبيط الالتصاق البكتيري ، اما في حالة المضادين Cefotaxime 1024 مكغم /مل وGentamicin 4 مكغم /مل فلم يكن هنالك تاثيرا في عملية الالتصاق اذ كان الالتصاق طبيعيا اي انه لم يكن له تاثير ايضا في عملية تخليق الكبسولة .رابعا - الدراسة النسيجية : درست التغييرات النسيجية المختلفة في الفئران المحقونة بالعالق البكتيري Acinetobacter baumannii ومستخلص الكبسولة في الاعضاء ( الكبد ، الطحال ، الكلية ، الرئة ، الامعاء ) ، اذ ظهر تاثير للعالق البكتيري ومستخلص الكبسولة في كل الاعضاء وقد لوحظ تاثير العالق البكتيري في الكبد بوجود خثارات كثيرة داخل الكبد مع وجود تغير دهني ووجود قطيرات دهنية داخل نسيج الكبد ، والطحال ظهر فيه تضخم باللب الابيض في منطقة الخلايا البائية ومنطقة الخلايا التائية ، اما الرئة فقد وجد فيها احتقان مع انخماس ، وظهر في الكلية توسع بسيط في محفظة بومان مع وجود قطيرات دهنية او تغير دهني داخل الكبيبات ووجود تنكس استسقائي في بعض النبيبات ، وفي الامعاء ظهر تضخم في لطخ باير وتنكس مخاطيني . اما تاثير مستخلص الكبسولة فقد ظهر في الكبد بوجود خثرة داخل اوردة الكبد مع توسع في الجيبانيات ، وفي الرئة ظهر ارتشاح خلايا التهابية حول الاوعية الدموية ووجود خلايا التهابية حول القصبات ، اما في الكلية يلاحظ تغيير دهني في الكبيبات ، وظهر في الطحال تكوين دم خارج النخاع مع وجود فرط تنسج في اللب الابيض ، وظهر في الامعاء تضخم لطخ باير مع وجود تنكس مخاطيني . | Acinetobacter baumannii was isolated from 424 samples from wound , urine , sputum , and blood , which were collected from Baghdad hospital / Medical city, 34 isolates (8.01 %) of Acinetobacter baumannii was identified depending on the morphological , cultural ,and biochemical characteristics , by Api 20 E system. The infection rate by Acinetobacter baumannii identified samples (wound , urine , sputum , and blood ) were (15 , 11, 6, 2) % respectively .Detection the efficiency of isolate to produce a large capsular polysaccharide . Under incubation period 5 days at 30 C º and cultural media (Brain heart infusion agar + 5 % glucose) for production of a large amount of capsular polysaccharide . The susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates to 19 antibiotics were performed . All isolates were susceptible 100% to imipeneme and resistant 100% to (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin, Tetracycline , Aztreonam , Ciprofloxacin , Cephalothin Minimum inhibitory concentration ( MIC) of 8 antibiotics (Ciprofloxacin , Gentamicin , Tobramycin , Amikacin , Cefotaxime , Pipracillin , Pipracillin + Tazobactum , Cefipeme ) were determined , which they were ( 4 - 512 , 8 - >1024 , 4 - >1024 , 4 - 256 , 16 - >1024 , 8 - 256 , 8 - 512) μg /ml respectively . The ability of Acinetobacter isolates to discolored blood agar that containing sugars was detected .All isolates showed their ability to discolored blood agar that containing sugars only from type aldose. Ability of isolates that chosen randomly to agglutinate red blood cells of human A,B,AB,O blood groups in micro titration plates was done . Results showed the ability of the isolates to agglutinate red blood cells groups A,B,AB only but not blood group O . Second : Immunological aspect : Extraction of capsular polysaccharide from the efficient isolate number (26) had been done . Then the effect of different concentrations( 52, 50 ,100, 150 , 250 , 500) μg/ml of capsular extract on immune cells were studied according to following parameters : Viability of polymorph nuclear leukocytes and lymphocytes , T&B lymphocytes rosette formation , phagocytosis in vitro, reduction of nitroblutetrazolium , mitotic index test for bone marrow cells in mice , and investigation about specific capsular antibodies by ochterlony test. All these immunological tests were done , the following Results were : No effect was found of concentrations (25,50,100) μg/ml of capsule extract on viability of polymorph nuclear cells & lymphocytes , while concentrations (150, 250 , 500) μg/ml decreased it .The concentrations (100,150,250,500) μg/ml of capsular extract decreased the percentage of T&B rosette formation . Hundred μg/ml of capsular extract increase phagocytic index , while (150, 250, 500) μg/ml inhibited it . Capsular extract concentrations (100, 250, 500) μg/ml decreased number of cells producing Formosan , and (100, 250) μg/ml of capsular extract decreased mitotic index in mice. Precipitation lines were found between capsular extract and serum of immunized rabbits without dilution and with the dilution 1 : 10 .Third : Bacterial adherence and inhibition bacterial adherence : Comparison the adherence between encapsulated isolates and non encapsulated isolates on polystyrene and comparison the adherence between capsulated isolate and non encapsulated isolate on epithelial cells which took from urine to know the capsular role in adherence , and inhibit the bacterial adherence by using : 1 - capsular antibodies which were obtained after immunized the rabbits with capsular extract ,then reaction of the serum with encapsulated and non encapsulated isolates and after that the adherence test was done .2 - sub minimum inhibitory concentration (SubMIC) after growing encapsulated isolate in brain heart infusion broth containing subMIC of some antibiotics and the test of bacterial adherence was done and comparison between the same isolate growing in brain heart infusion broth with subMIC and without subMIC to find the role of subMIC in capsule production process . Results of adherence test on polystyrene showed the ability of encapsulated isolates to adhere on polystyrene while non encapsulated isolates washedout . The rate of encapsulated isolate adhere on human epithelial cells was 35.62 , and that was higher than the rate of non encapsulated isolate which was 19.68. Specific capsular antibodies inhibit adherence of encapsulated isolate, while it had no effect on non encapsulated isolate adherence . SubMIC of the antibiotics ciprofloxacin and piracillin+tazobactum had an inhibitory effect on encapsulated isolate adherence , while their was no effect when subMIC of antibiotic cefotaxime and gentamicin was used. Fourth : Histological aspect : Different histological changes in mice after injected with bacterial suspension and capsular extract were studied in organs (liver , spleen, kidney, lung, intestine) . The effect of bacterial suspension and capsular extract was noticed in all the studied organs . The effect of bacterial suspension in liver was noticed by many clotting inside the liver with fatty changes in the liver tissue , in spleen increased in white pulp size in the region of T&B cells , in lung congestion , in kidney enlargement in bowman capsule with fatty changes inside tubules with hydrobic degeneration in many tubules , in intestine enlargement in payers patches and mucosal degeneration . The effect of capsular extract was noticed in liver by the appearance of clot inside liver’s veins with enlargement in sinuses , in lung infiltration of inflammatory cells around the blood vessels with inflammatory cells around tracheas , in kidney fatty changes in glomerulus . in spleen , blood formation out of the marrow with reactive hyperplasia , in intestine enlargement in payer patches with mucosal degeneration

دراسة تاثير المحورات المناعية للمستخلص الايثانولي لبذور نبات Azadirachta indica على الاستجابة المناعية للفئران الملقحة ببكتريا Proteus vulgaris == Study the Immunomodulatory Effect of Ethanolic Azadirachta indica Seeds Extract on the Immunologic Response in Mice Vaccinated with Proteus vulgaris

Author name: سيف مزعل عبد
Supervisor name: طارق فعل الجنديل | تركي مفتن سعد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Muthanna
First pages:
Abstract: جمعت 100 عينة من عينات الادرار من النساء الحوامل الذين اتن الى مستشفى الاطفال والولادة في مدينة السماوة، خلال فترة تمتد من نوفمبر الى يناير 2012. تضمنت الدراسة العزل والتشخيص البكتريلوجي لبكتريا Proteus vulgaris ، واختبار الحساسية للمضادات الحياتية وكذلك تضمنت الدراسة تاثير المحورات المناعية المتمثلة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم على الاستجابة المناعية للفئران الملقحة بمستضد جرثومة P. vulagris. تضمنت الدراسة ثمانية مجموعات ( 40 فار في كل مجموعة) وتمت معاملة المجاميع كما يلي (I : معاملة بالماء المقطر، II : معاملة بمستضد بكتريا p. vulagris فقط ، III : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ، IV : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ة ، V : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا البر وتيس فلكارس معا ، : VI : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا البر وتيس فلكارس ، : VII معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا . P .vulagris معا، VIII : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا . P .vulagris وتم حقن المجموعتين الاخيرتين بمقدار 5 ملغم لكل كغم من وزن الجسم من مادة بردنزولون (Prednisolone) المثبطة للمناعة قبل 5 ايام من اجراء المعاملة . اجريت جميع هذه المعاملات في اليوم الاول في اليوم الرابع وضحي بالحيوانات في اليوم 8 لاختبار Nitro blue tetrazolium NBT) مقاسا بجهاز الاليزا ، في اليوم 14 لاجراء معامل تفاعلات فرط الحساسية المتاخرة ومعامل تحول الخلايا اللمفاوية المقاسة بطريقة الاليزا )في اليوم 21 و28 لقيايس anti - proteus vulgaris antibody titer ولاجل اختبار serum electrophoresis لقياس بروتينات المصل ). اظهرت النتائج تاثيرات واضحة للمحورات المناعية المستخدمة في الدراسة وفي المجاميع الممنعة بمستضد البر وتيس فلكارس ومن خلال تحسن الاستجابة المناعية غير النوعية والمناعة الخلوية الخلطية مقارنة مع المجاميع غير المعاملة بالمحورات المناعية، واشارت النتائج الى ارتفاع ملحوظ في نسبة الخلايا الموجبة لفحص NBT في المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية وبفوارق احصائية معنوية بالمقارنة بمجاميع السيطرة السالبة (معاملة بالماء المقطر فقط) والسيطرة الموجبة المعاملة بالمحورات المناعية او اللقاح فقط . وقد ظهر ارتفاع في النسبة المئوية لمعامل الخلايا الموجبة لفحص NBT في كل المجاميع وسجلت المجموعةV اعلى نسبة مئوية للخلايا الموجبة لفحص NBT ( 57% ) وبفوارق احصائية معنوية (P≤ 0.01) وسجلت المجموعة IV ادنى نسبة مئوية (5%) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة 0 ) I% )، كما لوحظ ارتفاع واضح في النسبة المئوية لمعامل التحول للخلايا اللمفية في الدم المحيطي ، حيث اعطت جميع الحيوانات الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية نتائج اعلى من تلك الممنعة وغير معاملة بالمحورات المناعية وبفوارق احصائية معنوية وسجلت المجموعة V اعلى مستوى للنسبة المئوية لمعامل تحول الخلايا اللمفاوي في الدم (264%) ، بينما اعطت المجموعة IV ادنى نسبة وهي ( 17% ) .اما نتائج فحص الحساسية المتاخرة في الجلد فقد سجلت حيوانات المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية نتائج اعلى وبفوارق احصائية معنوية ( P≤ 0.01) عن مجاميع السيطرة الموجبة والسالبة واعطت المجموعة V. اعلى قيمة بلغت بعد 24 ساعة من حقن مستضد البر وتيس ، وكانت جميع نتائج فحص الحساسية المتاخرة المسجلة في الحيوانات بعد 24 ساعة افضل منه بعد 48 ساعة. وعند قياس عيارية اضداد anti proteus vulgaris بواسطة الوميض الاشعاعي غير المباشر، اظهرت المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية ارتفاع مستوى هذه الاضداد مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة وبفوارق احصائية معنوية بمستوى P≤ 0.01) ) وسجلت اعلى معيار حجمي لتلك الاضداد بمستوى 512 بعد 21 يوم التمنيع. كذلك سجلت المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية ارتفاع ملحوظ في قيمة كاماكلوبيولين والفا - 1 والفا - 2 وبيتا عند تحليل البروتين بجهاز الترحيل الكهربائي وبفوارق احصائية معنوية ( P≤ 0.01) عن مجاميع السيطرة الموجبة والسالبة المعاملة بالمحورات.حيث سجلت المجموعة V (19.24 ± 0.80, 8.68 ± 0.23, 27.31 ± 0.06, 34.02 ± 0.21 ) على التولي بعد 21يوم من التمنيع وكذلك اعلى قيمة كاماكلوبيولين والفا - 1 والفا - 2 وبيتا سجلت في المجموعة 19.26 ± 0.8 )V , 8.17 ± 0.38 , 27.43 ± 0.12 , 34.10 ± 0.06 ) على التوالي بعد 28 يوم من التمنيع . من خلال النتائج اظهر المحلول الايثانولي لنبات النيم تحسنا واضحا على الاستجابة المناعية غير الخصوصية والمناعة الخصوصية بشقيها الخلطي والخلوي. | A total of 100 urine samples were collected from pregnant women who attended to Children and delivery's hospital in Samawah city, during the period extended from November to January 2012. The study is carried out for bacteriological isolation and identification of P. vulagris, antibacterial susceptibility testing and to investigate the immunomodulatory effect of the Ethanolic neem seeds extract on the immune response of mice vaccinated with Proteus vulgaris antigens. The study included eight groups; the first group (I) was treated with distilled water. group II included mice treated with Proteus vulgaris antigens only (III) : injected mice subcutaneously with a dose of (600 µg /Kg) ethanolic neem seed extract, IV group included injected subcutaneously with a dose of (400 µg /Kg) ethanolic neem seed extract only, The V, VI groups mice were treated with combination of p.vulgaris and ethanolic neem seed extract while (VII and VIII) groups mice were injected with the immunosuppressive drug prednisolone prior to the forthcoming treatment 5 days. All these treatments were carried out at day 1, and then the mice were sacrificed at day 8 to estimate phagocytic activity index by ELISA reader and on day I4 for estimation of lymphocyte transformation by MTT index by ELISA reader and for delayed - type hypersensitivity reaction test at 24 , 48 and 72 hours after proteus vulgaris antigens injection, at day 21 and 28 for (anti - proteus vulgaris antibody titer) by indirect immunoflourescent assay and for serum electrophoresis to estimate the serum fraction.In this regard, all groups of mice showed different significant increases(P≤ 0.01) in the NBT index which represent the phagocytic activity% as compared to group I (0%), which was injected with distilled water (negative control group). The best treatment efficiency was recorded in - group V (57%), while the lowest treatment efficiency was recorded in - group IV (5%). The results of lymphocyte transformation index in mice of all groups showed different significant increases by MTT assay which represent the lymphocyte transformation index as compared to group I (0%). The best treatment efficiency was recorded in - group V (264%), while the lowest treatment efficiency was recorded in - group VI (17%).Delayed type hypersensitivity (DTH) index estimated by skin test in footpad of the mice that immunized with P vulgaris antigens and treated with ethanolic neem seed extract and the high value in the group V after 24 hours. The best delayed type hypersensitivity (DTH) index was recorded in group V. The anti - Proteus antibodies assessed by indirect immunoflourescent test also showed a significant increase titer in immunomodulator - treated and - vaccinated mice in comparison with negative and positive groups. At 21, 28 days, and the best treatment efficiency was recorded in - group V after 21 days with titer of 512. In all mice a significant increase in the value of gamma globulin fraction and Alpha - 1 serum fraction and Alpha - 2 Fraction and Beta serum fraction were observed in group V (19.24 ± 0.80, 8.68 ± 0.23, 27.31 ± 0.06, 34.02 ± 0.21) respectively after 21 days of immunization, and also The highest values of gamma globulin fraction and Alpha - 1 serum fraction and Alpha - 2 Fraction and Beta serum fraction were observed in V (19.26 ± 0.8 , 8.17 ± 0.38, 27.43 ± 0.12, 34.10 ± 0.06 ) respectively after 28 days of vaccination of mice. The results demonstrated a clear immunomodulatory effect of the ethanolic neem seed extract (improvement of non - specific, and cellular immune response) of the treated mice immunized with proteus vulgaris .

الكشف عن السمية الوراثية لمستخلصات نبات الحرمل Peganum harmala L . باستعمال بعض المؤشرات الخلوية والجزيئية == Detection of genetoxic effect of Peganum harmala L. extracts by using some molecular and cytogenetic markers

Author name: سيف محمد ابراهيم
Supervisor name: نضال نعمة حسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Molecular Biology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Evaluation of genetoxicity of the aqueous and alcoholic extracts of Peganum harmala L. seeds was assayed in onion roots Allium cepa as a biological system. Onion roots were subjected to different concentrations of aqueous and alcohol extracts (10,25,50,100,200%) V/ W for different periods( 24,48,72) hrs in order to study the effects of these extracts on onion′s root growth and some cytological properties included, (Mitotic index, phase index, proportion and types of chromosomal aberrations), as well as to assess the effect of these extracts on the DNA of onion roots using Random amplification polymorphic DNA (RAPD) technology.The results revealed that all harmala seeds extracts the aqueous and alcoholic caused a significant reduction of onion root growth, the reduction was positively proportional with the increasing concentrations of the extracts. The half maximal effective Concentration (EC50) against onion′s root growth was 50% in the case of using the aqueous extract while it reached 25% in the case of alcoholic extract. This result indicate the efficiency of the alcoholic extract over the aqueous extract on onion′s root growth.Results also showed that both harmala seeds extracts resulted in significant reduction of the mitotic index (MI) of onion′s roots tips compared with the control treatment .The reduction of the MI was also positively proportional with the increasing concentrations of the extracts .Although MI was not affected by the increase in duration of exposure .Therefore ,since the concentration 100% and 25% of the aqueous and alcoholic extracts respectively lowered the MI to nearly 50% compared to the control, they were considered sub lethal, whereas the concentration 200% of both extracts which caused a reduction of the MI to nearly 22% compared to control treatment was considered as lethal concentrations. The results showed a significant reduction prophase and significant increase of metaphase in onion′s root cells due to the treatments with both extracts. Moreover high percentages of chromosomal aberrations were alsodetected, and these aberrations were also positively associated with the increasing concentration and exposure periods. to The most frequent abnormalities were (Chromosomes stickiness, Chromosomal bridges , Chromosome disturbance and C - mitosis) .Moreover some other infrequent chromosomal abnormalities were also appeared such as ( Lagging chromosome ,Star anaphase, Shifting of poles, Polyploidy).The effect of both harmala seeds extracts was tested on DNA of onion′s roots using a random amplification polymorphic DNA (RAPD). Out of ten random primers used, seven were gave multiple bands for all studied, samples with molecular weights ranged between (90 - 1400) base pair .The results of random amplification showed that all harmala extract concentrations tested caused damage to DNA which mutations revealed as loss of a single or more band, or appearing of new bands. Additionally the total lost and gained band in samples treated with alcoholic extract reached 43 bands compared to the samples treated with the aqueous extract which revealed 35 bands , This result indicate the effectiveness of the alcoholic extract over the aqueous in it′s effect on DNA of onions roots. Furthermore, The results showed that the total number of the gained bands was more than that of the lost ones for both extracts with most primers used . The total numbers of the new bands in the samples treated with the aqueous extract were 27 bands whereas 32 bands , with alcoholic extract. However ,the total number of lost bands in samples treated with aqueous extract were 8 bands compared to 11 bands with alcoholic extract.The percentage of the genomic template stability (GTS% ) was lowered initially from the concentration 10% for both extracts ,this reduction was negatively associated with the increasing concentrations of the extracts, indicating the existence of great damage to the DNA with the increasing concentrations of the extract. The decrease of GTS in samples treated with alcoholic extract was more than that with the aqueous extract. A highest reduction 78.56% was detected at concentration 25 and 200 % in samplestreated with the aqueous extract, whereas a higher reduction 69.03% was recorded lower at concentration 50% in samples treated with alcoholic extract.Genetic dendrogram of samples treated with exposed to harmala seeds extracts in addition to the control using Jaccard coefficient of genetic variation and based on RAPD results showed segregation of onion samples treated with aqueous extract from samples treated with aqueous extract from samples treated with alcoholic extract, as well as segregation of the control treatment in a single group, this result confirms the great damages of onions root DNA when treated with harmala seed extracts..

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

Author name: سوسن محمد كريم
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من المرضى المصابين بداء السعفة في محافظة ذي قار ودراسة تاثير بعض العوامل في نمو تلك الفطريات == Isolation and identification of dermatophytes from patients with tinea in Thi - Qar Province and studying some factors effecting on their growth

Author name: سوزان خالد كاظم العسكري
Supervisor name: ياس خضير عباس | محمد حسين مشهد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية عزل وتشخيص بعض انواع الفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة ((Tinea من المرضى المراجعين للاستشارية الجلدية في مستشفى الامام الحسين التعليمي في محافظة ذي قار , اذ جمعت 180عينة مرضية شملت 128عينة قشور جلدية و24عينة شعر و28 عينة اظافر من مرضى يعانون من داء السعفة (( Tinea للفترة من 13/8/2014 الى 1/1/ 2015 . بلغ عدد العينات المرضية الموجبة للزرع 110 عينة وبنسبة 61.1 % , اذ شكل عدد اصابات الاناث 74 وبنسبة 67.27 % , اما اصابات الذكور فقد بلغت 36 وبنسبة 32.73 % . بينت الدراسة ان الاصابة بسعفة الجسم (Tinea corporis) احتلت المرتبة الاولى من بين الاصابات وبنسبة 57.27 % ثم سعفة الراس ((Tinea capitis 17.27 % , ثم سعفة القدم 12.73 (Tinea pedis)% وشكلت سعفة الاظافر (Tinea unguium) بنسبة 9.09% , ثم سعفة اللحية (Tinea barbae)بنسبة 3.64 % . شخصت الفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة باستخدام عدد من الاختبارات التشخيصية وقد وجد ان الفطر Microsporum canis اكثرها ظهورا وبنسبة 36.36 % يليه الفطــر Trichophyton tonsurans وT. verrucosum وM. gypseum وM. fulvum وبنسبـــة 27.27 % , 17.27 % , 12.73 % و6.36 % على التوالي . بلغت اعلى نسب للاصابة بسعفة الراس والجسم والقدم والاظافر في الاناث , في حين كانت اعلى نسبة للاصابة بسعفة اللحية في الذكور . وكان لعامل العمر تاثير في نسبة الاصابة , اذ احتلت الفئة العمرية (10≥) النسبة الاعلى في سعفة الراس , بينما كانت الفئة العمرية ( 31 - 40) النسبة الاعلى لاصابة سعفة الجسم والقدم واللحية اما سعفة الاظافر فكانت الفئة العمرية ( 21 - 30) النسبة الاعلى . بلغت نسبة الفطريات المفضلة للحيوان Zoophilic)) 53.6 % تلتها الفطريات الجلدية المفضلة للانسان (Anthropophilic) بنسبة 27.2 % , ثم الفطريات الجلدية المفضلة للتربة (Geophilic) وبنسبة 19.2 % . كما تناولت الدراسة تاثير بعض العوامل البيئية مثل نوع الوسط الغذائي ودرجة الحرارة والاس الهيدروجيني ومدة الحضن في نمو ثلاثة انواع من الفطريات الجلدية التابعة لجنس Microsporum وهي Microsporum canis وM. gypseum وM. fulvum . وقد اظهرت نتائج الدراسة ان افضل وسط غذائي لنمو الانواع الفطرية المعزولة هو Agar Sabouraud's Dextrose مقارنة مع وسطي Potato Dextrose Agar وCorn Meal Dextrose Agar , وكانت درجة الحرارة المثلى لنمو الفطريات الجلدية هي 25 م̊ . في حين كان الاس الهيدروجيني (pH = 6) للوسط الزرعي SDA هو الافضل في تنمية الفطريات الجلدية . كما اوضحت الدراسة زيادة معدلات اقطار المستعمرات الفطرية الجلدية النامية على الوسط الزرعي SDA عند pH = 6ودرجة حرارة 25 م̊ بزيادة مدة الحضن . كما تم استخــــدام تقنيــــة تفاعـــــل سلسلــــــة البلمرة ( PCR ) باستخــــدام البادئ ITS1 - 2FW - ITS1 - 2FV لتشخيص بعض انواع الجنس Microsporum . كما شملت الدراسة الكشف عن المواد الفعالة في المستخلص الكحولي لاوراق نبات اكليل الجبل ( Rosemarinus officinalis) اذ وجد ان المستخلص يحتوي على الفينولات والقلويدات والصابونينات والعفصيات والتانينات والراتنجات والكلايكوسيدات ولا يحتوي على الكومارينات. وقد تبين ان لهذا المستخلص قدرة تثبيطية ضد الفطريات الجلدية وبلغ اعلى تثبيط عند التركيز 200 ملغم / مل . وقد تباين التركيز المثبط الادنى (MIC) حسب النوع الفطري , فكان اقل تركيز مثبط ادنى للمستخلص الكحولي لاوراق نبات اكليل الجبل 25 ملغم / مل تجاه معظم الانواع الفطرية الجلدية , كما وجد ان المضاد الفطري Griseofulvin اكثر فعالية من المضاد الفطري Ketoconazole في تثبيط الفطريات الجلدية . | A study of isolation and identification of dermatophytes in Thi - Qar Province was conducted . A total of 180 clinical samples ( 128 skin scraping samples , 24 hair samples and 28 nails samples ) were collected from patients suffering Tinea and were consulting in Dermatology unit in AL - Hussein Teaching Hospital during 13/ 8/ 2014 to 1 / 1 / 2015 . 110 samples were positive for culture with a percentage of 61.1 % . Females infections were 74 cases ( 67.27 %) ,while male infections were 36 cases (32.73 %) . The study showed that Tinea corporis was the most Tinea infections with a percentage of 57.27 % . Tinea capitis , Tinea pedis , Tinea unguium and Tinea barbae had a percentage of 17.27 % , 12.73 % , 9.09 % and 3.64 % respectively . The isolated fungal species causing Tinea were Microsporum canis , Trichophyton tonsurans , T. verrucosum ,M. gypseum and M. fulvum with a percentage occurrence of 36.36 % , 27.27 % , 17.27 % , 12.73 % and 6.36 % respectively . Tinea capitis , Tinea corporis , Tinea pedis and Tinea unguium were high in females , while in males , Tinea barbae was the highest . Infection with Tinea was affected with patients age , so patients under 10 years old had tinea capitis more than others ; Tinea corporis , Tinea pedis , and Tinea barbae had the highest infection percentage in ages between 31 - 40 years . Tinea unguium had the highest infection percentage in patients with ages between 21 - 30 years . Zoophilic dermatophytes had the percentage of 53.6 % , Anthropophilic dermatophytes and Geophilic dermatophytes presented as 27.2 % and 19.2 % respectively . The effects of some environmental factors such as culture media , temperature , pH and incubation period on M. canis , M. gypseum . M. fulvum was studied .The best culture media for these dermatophytes was Sabouraud's Dextrose Agar comparing with Potato Dextrose Agar and Corn Meal Dextrose Agar. The optimum growth temperature was 25 oC , while pH = 6 was the best for culturing dermatophytes on SDA and 25 oC . Polymerase Chain Reaction (PCR ) with primer ITS1 - 2 FW - ITS1 - 2 RV was used to confirm the identification of Microsporum species . The alcoholic extract of Rosemarinus officinalis contained phenols , alkaloids , resins , tannins and glycosides , saponins . The extract had the highest inhibition activity against the isolated fungi at the concentration of 200 mg / ml . The minimal inhibitory concentration ( MIC ) of the alcoholic extract of Rosemarinus officinalis was 25 mg / ml . Griseofulvin was more active than Ketoconazole against dermatophytes

دراسة مناعية لمرضى القرحة المعدية المصابين ببكتريا Helicobacter pylori == Immunological Study of Gastric - Ulcer Patients Infected with Helicobacter pylori

Author name: سهى طالب يحيى الجميلي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | محمد عيسى محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة جمع خزع نسيجية (Biopsy) وعينات دم من 92 مريض يعاني من عسر الهضم، التهاب وقرحة المعدة، قرحة الاثني عشري وسرطان المعدة. وكانت اعمار المرضى تتراوح بين 17 - 76 سنة . جمعت العينات في الفترة ما بين كانون الاول 2011 ونيسان 2012 في مستشفى الكاظمية التعليمي في بغداد. وشملت الدراسة 20 شخص سليم كمجموعة سيطرة. اخضعت مجموعة المرضى فقط للتنظير المعدي العفجي لاستاصال الخزع النسيجية لاجراء الاختبارات البكتريولوجية بينما جمعت عينات الدم من مجموعة المرضى وايضا من مجموعة السيطرة لاجراء الاختبارات المناعية. للتحري عن وجود بكتريا Helicobacter pylori استخدمت عدة اختبارات شملت اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية، الزرع البكتيري، اختبار الانتشار المناعي وايضا الاختبارات المصلية التي شملت اختبار التحري عن الاجسام المضادة ((IgM IgG, IgA والمتمم (C4, C3) واختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) (ELISA)، للتحري عن مستوى الانترفيرون كاما Interferon gamma (IFN - γ) الانترلوكين - 8 Interleukin - 8 (IL - 8). تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي لبكتريا H. pyloriباستخدام طريقة Murphy وقدرت كمية البروتين باستخدام جهاز المطياف الضوئي والتي كانت (2.76028 مغم/مل) وايضا تم تقدير الوزن الجزيئي للبروتينات المستخلصة باستخدام جهاز الترحيل الكهربائي.و خلصت هذه الدراسة كالاتي : 1. انتشار بكتريا H. pylori بلغ (44.56%) بين 92 مريض.2. لا يوجد ارتباط معنوي احصائيا بين عامل العمر والاصابة ببكتريا H. Pylori. بينما وجد احصائيا تاثير عامل الجنس على الاصابة ببكنريا H. pylori.3. نتيجة الزرع البكتيري اعطت (7.31%) من (41) مصاب، بينما اعطى اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية واختبار الضد لبكتريا H. pyloriالسريع النسب (44.56% و64.13%) على التوالي من 92 مريض.4. اظهرت نتائج الترحيل وجود عشرة حزم بروتينية ذات اوزان جزيئية تتراوح بين (16.914 - 340.476) كيلو دالتون مقارنة مع حزم البروتينات القياسية.5. استخدم مستخلص بروتينات الغشاء الخارجي للبكتريا كمستضد للتحري عن وجود الاجسام المضادة للبكتريا باستخدام اختبار الانتشار المناعي الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون خطوط ترسيب بين المستخلص ومصل المريض.6. اختبار التحري عن الاجسام المضادة والمتمم اعطى عيارية عالية للمستضدين IgG, IgA والمتمم C3 بينما عيارية كل من الجسم المضاد IgM والمتمم C4 بقيت طبيعية مقارنة بمجموصة السيطرة.7. اختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم(ELISA) اعطى فروقات معنوية عند مستوى P0.05 لكل من الانترفيرون كاما (IFN - γ)و الانترلوكين - 8 (IL - 8) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | This study includes collection of biopsy and blood specimens from patients with age ranged between 17 - 76 years that suffering from dyspepsia, gastritis, duodenal ulcer, and gastric cancer during the period between December 2011 to April 2012 at AL - Kadhymia teaching hospital . This study also involved twenty healthy persons as a control group. Patients group were subjected to gastroduodenal endoscopy, gastric biopsy were taken from them for bacteriological investigations. Blood samples were also collected for immunological tests, while only blood samples were collected from control group. The Detection of Helicobacter pylori was performed using several laboratory investigations such as biopsy urease test, bacterial culture, precipitation test, and serological test which include immunoglobulins and complement quantitation and enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Interferon gamma (IFN - γ) and Interleukin - 8 (IL - 8) detection. Outer membrane proteins were extracted from these bacteria using Murphy method and the concentration of proteins were calculated by using spectrophotometer, then proteins detected and the molecular weight of proteins were evaluated by using electrophoresis.The results of this study revealed the following : 1. Prevalence of H. pylori in (44.56%) from 92 patients.2. No significant relation between age factor and distribution of H. pylori, but there is a significant relation between gender factor and distribution of H. pylori 3. The result of biopsy culture was (7.31%) from (41) infected patients, while biopsy urease test and Rapid anti H. pylori test gave (44.56% and 64.13%) respectively from 92 patients.4. Electrophoresis results revealed ten bands which renged between (16.914 - 340.476) KDa with protein concentration of (2.76028) mg/ml.5. Outer membrane proteins were extracted from H. pylori isolates and used as antigen to detect specific H. pylori antibodies using precipitation test in which the formation of precipitating line considered as a positive result.6. High titer of IgG, IgA and C3 appeared in patients group, while a normal titers of IgM and C4, as a result of immunoglobulins and complement quantitation.7. Enzyme - Linked Immunosorbent Assay technic for detection of IFN - γ and IL - 8 revealed statistically significant high level in compared with control group.

دراسة فعالية بعض المستخلصات لطحلب Cladophora glomerata == Study the activity of some extracts of alga Cladophora glomerata

Author name: سهام نعمة لفتة
Supervisor name: احمد ساهي دويش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية عزل جنس من الطحالب الكبيرة من بيئة مائية وتشخيصها , اذ تم عزل طحلب Cladophora glomerata من بحر النجف من محافظة النجف الاشرف. تضمنت الدراسة ايضا قياس بعض الصفات الفيزيوكيميائية لمياه بحر النجف والمعزول منه طحلب Cladophora glomerata , اذ شملت القياسات كل من درجة حرارة الهواء والماء , الدالة الحامضية , التوصيلية الكهربائية,المواد الصلبة الذائبة ,الملوحة,وتركيز بعض الايونات السالبة والموجبة للاملاح الموجودة في ماء البحر .بينت النتائج ان درجة حرارة الهواء كانت ( 24)م˚ في حين كانت درجة حرارة الماء (18) م˚ ,فيما كانت قيمة الدالة الحامضية (7.89) وقيمه التوصيلية الكهربائية (20500) ميكروسيمنز / سم وكانت قيمة الملوحة (1.62) 0/00 . في حين كانت نتائج قياس بعض الايونات الموجبة والسالبة للاملاح هي كالاتي : الكالسيوم والمغنسيوم والصوديوم والبوتاسيوم والكلوريدات والكبريتات (3085 و1376 و3815 و6.8 و2988 و3694 ) ملغم/ مل على التوالي .استخلص طحلب Cladophora glomerata باستخدام ثلاث انواع من المذيبات وتمثلت بـ (الكحول الاثيلي وخلات الاثيل والكلوروفورم ) ومن ثم تم اختبار فعالية هذه المستخلصات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus وProteus mirabilis وEscherichia coli .كانت محصلة الاستخلاص ( الحار - البارد ) لطحلب Cladophora glomerata باستخدام المذيبات المختلفة الكحول الاثيلي %(128 - ) وخلات الاثيل %(84 - ) الكلوروفورم %(54,8 - 13,2). استعملت تراكيز مختلفة من مستخلصات الطحلب الكبيرCladophora glomerata (256,128,64,32) ملغم /مل لدراسة تاثيرها على البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق باستعمال اطباق بتري وذلك عن طريق قياس قطر منطقة التثبيط.بالنسبة الى المستخلص الاثيلي لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , وقد بلغت من معدلات اقطار مناطق التثبيط , 9 , 15, 20) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis.، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه والتي كانت (10 ,10 ,11 ,17) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص خلات الاثيل لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص البارد اكفا في تاثيره في البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ كانت معدلات اقطار مناطق التثبيط (10 , 10 , 12 , 15) ملم لكل من بكتريا : S. aureus وPs. aeruginosa وPr.mirabilis. وE.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الحار وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9.8) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 13 , 13 , 17 , 20 ) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. ، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9) ملم وعلى التوالي.كان مستخلص الكلوروفورم الحار لطحلب Cladophora glomerata معنويا اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى لجميع المذيبات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق, لذا استعمل هذا المستخلص انموذجا للتجارب اللاحقة .اظهرت نتائج الكشف عن المركبات الفعالة باستعمال التفاعلات الكيميائية احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلبCladophora glomerata على كل من التانينات والصابونينات والفلافونويدات والقلويدات والكلايكوسيدات والتربينات والفينولات والراتنجات.واظهرت نتائج التحري عن المحتوى الكيميائي من المواد الفعالة باستعمال تقنية الـGC - Mass Spectrophotometer احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata الذي اظهر كفاءة عالية في تثبيط نمو الاحياء المجهرية المعزولة من خمجات الجروح والحروق لاحتوائهما على العديد من المركبات ذات التاثيرات البايولوجية ضد المايكروبية. | The present study includes isolation and identification of Macro - alga from water body. Macro - algae was isolated ,Cladophora glomerata from Baher Al - Najaf region in Holy Najaf city . This experiment includes the measurement of some chemical and physical characteristics of Baher AL - Najef water which Cladophora glomerata was isolated from it . Temperature, electric conductivity (EC),PH, hardness and concentration of ions : Chloride, Sulphates and Carbonates. The Results were showed that the measurements of : air temperature was (24)˚C while water temperature was (18) ˚C, EC (20500) µS/cm; PH (7.8 ) ; and salinity (1.62)0/00.The concentration of positive and negative ions such as Ca, Mg, Na, K, Cl and SO4 were (3085,1376,3815,3815,6.8,2988 and 3694) mg/ml respectively Three types (Ethanol, Ethyl acetate and Chloroform) were used to extract Cladophora glomerata in order to evaluate their antibacterial activity against some bacterial isolates which isolated from wound and burn infection includes ( Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Proteus mirabilis Escherichia coli,) .The percentage yields of extracts of ( hot - cold ) for Cladophora glomerata were Ethanol ( 8 - 12 ) % , Ethyl acetate ( 4 - 8 ) % and Chloroform (13.2 - 54.8) %. Different concentrations of these algal extracts had prepared which were (32, 64, 128 and 256) mg/ml and the antagonistic activity against the isolated bacteria from wound and burn infection were evaluated by measured the diameter of inhibition zone. The effect of hot Ethanol extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 15 , 9 , 11 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with cold Ethanol extract which were ( 17 , 11 , 10 , 10) mm , respectively. The effect of cold Ethyl acetate extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15 , 12 , 10 , 10 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with hot Ethyl acetate extract which were ( 9.8 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. The effect of hot Chloroform extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 17 , 13 , 13 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli respectively , when compared with cold Chloroform extract which were ( 9 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. Because hot Chloroform extract of Cladophora glomerata was more efficiency effective than the other extracts , only the hot Chloroform extract of Cladophora glomerata will used in the next experiments. Results indicated that the active chemical compounds in hot Chloroform extract of Cladophora glomerata were Tannins, Saponins , Flavonoids, Resins , Glycosides , Terpenes, Alkaloid and Phenols. Results indicated that hot Chloroform extract of Cladophora glomerata has a lot of active chemical compounds against micro - organisms by using the GC - Mass Spectrometry technology

دراسة مقارنة لبعض انواع النحل من فوق عائلة Apoidea الملقحة لنبات الجت Alfalfa Medicago sativa في محافظة بابل == Comparative study for some insect pollinators Apoidea that pollinated Alfalfa Medicago sativa in Babylon

Author name: سهاد حميد حسن
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي شعلان معيلف الاعرجي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة اختيار 13 حقلا من حقول الجت Medicago sativa من مناطق معينة من محافظة بابل لدراسة عملية التلقيح الحيوي لهذا المحصول خلال مدة التزهير للفترة ما بين مايس الى تشرين الاول لعام 2004، حيث استخدمت خلال هذه المدة شبكة صيد الحشرات القياسية لاخذ العينات التي بلغ عددها الكلي 185 عينة ، وقد تم تشخيص (47) نوعا تعود الى(18) جنسا تحت ست عوائل تابعة الى فوق عائلة النحل Apoidea وهي Megachilidae ,Halictidae , Anthophoridae , Andernidae , Ctenoplectridae , Apidae.قورنت عوائل النحل التابعة الى فوق عائلة Apoidea تبعا لعدد الانواع والاجناس والكثافة الكلية لكل منها، وقد وجد ان عائلتي Halictidae وMegachilidae كانتا الاكثر وفرة في عدد الانواع والاجناس وكثافة الافراد مقارنة مع العوائل الاخرى وقد شكلتا نسبة 61.1 % و72.3 % و88.5 % من العدد الكلي للاجناس والانواع والنماذج المجموعة على الترتيب. كما لوحظ وجود تذبذب في عدد العوائل والاجناس والانواع والكثافات باختلاف شهور الدراسة. وقد تبين ان شهر تموز هو الشهر الاعلى كثافة (عدد الافراد/50 كنسة) اذ بلغت الكثافة فيه 22.7 فرد/50 كنسة بينما كان شهر مايس هو الاقل عددا وبلغ 4.34 فرد/50 كنسة.تم دراسة التواجد الشهري لعوائل النحل في حقول الجت من حيث الكثافة وعدد الانواع وتبين ان العوائل اختلفت في عدد الانواع التي تمثلها وكذلك كثافاتها باختلاف شهور الدراسة.اختيرت عشرة انواع من ملقحات محصول الجت التابعة الى فوق عائلة Apoidea على اساس كثافاتها ، ثباتها وتكرار تواجدها في العينات خلال مدة الدراسة بالاضافة الى سهولة تشخيصها بالعين المجردة لغرض الدراسات اللاحقة ، وهذه الانواع هي : Megachile rotundata , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus, Megachile sp.2 (near to M.latimanus) , Nomia melanderi , Apis mellifera , Megachile sp.4, (near to M. texana), Nomia sp.2(near to N. nortoni) , Homalictus sp.1 (near to H. rowlandi) , Nomioides variegata . تم مقارنة الانواع العشرة المنتخبة من حيث معدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها ، نسب حبوب لقاح الجت ضمن الحمولة ، وزن الجسم/ملغم ، طول الخرطوم/ملم، مدة البقاء على الزهرة مقاسا بالثانية وعدد الانتقالات بالدقيقة.واظهرت النتائج ان الاناث قد تفوقت على الذكور في جمع اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح وللانواع العشرة. بينت النتائج ان هنالك ستة انواع من النحل قد تفوقت في معظم نواحي الكفاءة المنتخبة وهي : Megachile rotundata وMegachile sp.2 وsp.4 Megachile تعود لعائلة Megachilidae كذلك الانواع Nomia melanderi وNomia sp.2 (Halictidae) وApis mellifera ( Apidae) وتميزت اناث النوع M. rotundata معنويا بانها الاكثر كفاءة في حمل اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح خلال الدراسة بلغ 49750 حبة لقاح تلته اناث الانواع Megachile sp.2 وsp.4 Megachile وN. melanderi بلغ عدد ما حمل كل منهم على الترتيب (34300 , 32600 , 31550).اما ذكور النحل فقد تميزت بحمل اعداد لا باس بها من حبوب اللقاح فقد حملت ذكور rotundata . M22125 حبة لقاح تلته ذكور N. melanderi فقد حملت 16725 حبة لقاح مما يدل ان لها دورا في عملية تلقيح ازهار الجت. اختلفت معدلات اعداد حبوب التي تحملها الملقحات اختلافا معنويا باختلاف شهور الدراسة،فقد كان معدل عدد حبوب اللقاح المحمولة في شهري تموز واب اعلى مقارنة مع الشهور الاخرى وكانت اعداد حبوب اللقاح المجموعة من قبل اناث النوع M. rotundata اعلى معنويا مقارنة بالانواع الاخرى بلغت 52000 و50875 حبة لقاح خلال شهري تموز واب على الترتيب.من ناحية اخرى بلغ اعلى معدل لنسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح 91.5 % بواسطة اناث النوع M. rotundata تلته اناث النوع N. melanderi اما اقل نسبة فقد بلغت 62.6 % بواسطة النوع Nomia sp.2 .تفاوتت معدلات النسب المئوية لحبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبصورة معنوية بين شهور الدراسة ،وقد تميز كل من شهري تموز واب مقارنة بالشهور الاخرى بارتفاع معدلات نسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبلغت هذه النسبة 100% في شهر تموز بواسطة النوع M. rotundata وN.melanderi ، اما في اب فقد بلغت(100،94.1%)على الترتيب للنوعين المذكورين. وعليه فانه يبدو ان الانواع الستة هي ملقحات متخصصة لمحصول الجت.تم في هذه الدراسة ايضا قياس معدل اوزان الملقحات (ملغم) ذكورا واناثا وبينت النتائج وجود فروق معنوية واضحة بين اوزان الانواع المدروسة,وبناء عليه فقد قسمت الانواع حسب الوزن الى ثلاث مجموعات كبيرة ومتوسطة وصغيرة،كما اشارت النتائج الى وجود علاقة ارتباطية موجبة بين وزن الجسم ومعدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها هذه الملقحات. اظهرت النتائج ان ازهار الجت تزار بمجموعتين من النحل حسب طول الخرطوم(اللسين) هما مجموعة النحل طويل اللسين ،بلغت النسبة المئوية لعدد الانواع التابعة لهذه المجموعة 49% اما المجموعة الثانية فهي مجموعة النحل قصير اللسين بنسبة51% من المجموع الكلي للانواع. وبلغ اكبر معدل لطول اللسين 4.34 ملم لنحل العسل mellifera A. في حين ان اقل معدل بلغ 1.55 ملم للنوع Nomia sp.2 . واوضحت النتائج ان الملقحات المنتخبة قد اختلفت اختلافا معنويا في مدد بقائها على ازهار الجت .اقل مدة بقاء سجلت للنوع M. rotundata على ازهار محصول الجت بلغت 2.22 ثانية تلاه النوع N. melanderi 3.01 ثا ونلاحظ ان عدد الانتقالات قد ارتبط عكسيا مع مدة بقائها فقد سجل النوع M. rotundata اكبر عدد لانتقالاته على محصول الجت بلغت 22.2 انتقالة/د واقل عدد للانتقالات بلغ 11 انتقالة/د للنوع Nomia sp.2 . | Thirteen fields of Alfalfa Medicago sativa were selected from certain region in Babylon governorate to study its pollination biology during flowering period , May to October 2004, the standard insect net was used to collect (185) samples.During study the period, about (47) species were collected from the Alfalfa fields belong to (18) genus under (6) families of the super family Apoidea, these families were Megachilidae, Halictidae, Anthophoridae, Andernidae, Ctenoplectridae, Apidae.The families of Apoidea that have been collected were compared according to the number of species, number of genera and density of individual of each taxonomic group.It was found that the families Halictidae and Megachilidae were the highest in the number of species , genera and density of individual compared with other families , However, these two families represented 61.1% , 72.3% , 88.5% of total number of the genera , species and their densities respectively .The monthly variations in the number of families , genera, species and density of Apoidea were discussed . It was found that the month of July was highest in the density (number of individual/ 50 beat) reached to 22.7, while the lowest number reached to 4.34 on May.The monthly occurrence of different families of Apoidea in Alfalfa fields was investigated according to the rate of densities and the rate of number of species , However, It was appeared that the families varied in number of species and densities of each month for the study period.The alfalfa pollinators species were selected according to their densities , consistence, occurrence during the study period and easily recognized by necked eye for further study. these were included : Nomia sp2.(near to N. nortoni) , Nomia melanderi , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus , Nomioides vareigata , Homalictus sp.1(near to H. rowlandi) (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2(near to M.latimanus) , Megachile sp.4 (near to M. texana)(Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae).The ten selected pollinators were compared according to the average of pollen load, the percentage of Alfalfa pollen grain in the pollen load , body size , length of proboscis, visit duration/s , visit frequency/m ,and the result showed that the females were usually collect more pollen grain than the males of same species in all the ten selected species .It was found that six species pollinators within the ten selected species of Apoidea were significantly more active in most of the efficiency factors , these were Nomia sp2. , Nomia melanderi , (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 (Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae). The females of M.rotundata was significantly more efficient in pollen grain collection , the average number of pollen grain reached to (49750) followed by females of , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 , Nomia melanderi (34300 , 32600, 31550) pollen grain respectively . While 22125 pollen grain was collected by M. rotundata males followed by males of Nomia melanderi (16725). which seems they were importance in the pollination of Alfalfa flowers .The selected pollinators varied in average number of pollen grain in various months . However, it was found that the pollen load of each species was high during July and August compared with other month, the pollen load of females M.rotundata was (52000, 50875) pollen grain in July and August respectively.On the other hand, the highest average percentage of Alfalfa pollen grains was reached to 91.5% by females of M.rotundata followed by Nomia melanderi reached to be 85.7% , while the lowest percentage was 62.6% by Nomia sp2.The average percentage of Alfalfa pollen grain within pollen load was different significantly in each month of the study period. However, it was found that the percentage of Alfalfa pollen grain was high during July and August compared with the other months . The highest percentage of Alfalfa pollen grain was reached to (100 %) in July by M.rotundata and Nomia melanderi and was reached to (100 , 94.1%) in August also by the two species respectively . thereupon, it seems clearly that these six species of Apoidea were appeared to be specialization for Alfalfa crop pollination.The average of body size of pollinators species for males and females were measured .The results illustrated that there was significant variation in body size of selected species. Thereupon , the selected species were grouped into three groups : big, medium and small. It was found that there was positive correlation relationship between the body size and pollen load of pollinators .The results showed that the flowers of Alfalfa crop were visited by two grouped of bees , which were long-tongued bees with the percentage of 49% , and short- tongued bees with the percentage of 51% of the total number of species . The highest average of proboscis length was reached to 4.34 mm for A.mellifera , while the lowest average was reached to 1.55 mm for Nomia sp2 .The results appeared that the selected pollinators were significantly differences in the visit duration to the flowers (second) , the lowest average of the visiting duration of the pollinators was reached to 2.22 second for M.rotundata followed by Nomia melanderi which was reached to 3.01second . It was found that the visiting duration of pollinators was correlated negatively with visit frequency per minute . However , the M.rotundata has highest visiting frequency reached to 22.2 visit/ minute while the lowest visiting frequency was reached to 11 visit / minute by Nomia sp2

انتاج الليفان من البكتريا المعزولة من تربة الجذور وتقييم العوامل المؤثرة على انتاجه == Levan Production by Bacteria Isolated from Rhizosphere Soil and Evaluation of Factors Affecting its Production

Author name: سناء بشير كاظم
Supervisor name: صفاء الدين احمد شنتر القيسي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعتبر منطقة التربة المحيطة بالجذور مصدرا مهما للعديد من الاحياء المجهرية مثل الفطريات والبكتريا والبكتريا الخيطية. في الدراسة الحالية، تم عزل البكتريا المنتجة لليفان من التربة المحيطة بالجذور. حيث تم الحصول على 15 عينة من التربة المحيطة بجذور البقوليات ( الباقلاء واللوبيا ) خلال الفترة بين تشرين الاول 2014 الى كانون الثاني 2015، من ثلاث مزارع للبقوليات في ناحية كنعان، محافظة ديالى. تم عزل 52 عزله من بكتريا الجذور (الرايزوسفير) واختبرت لمعرفة قابليتها لانتاج الليفان وذلك بالاعتماد على نمو المستعمرات المخاطية عند تنمية هذه البكتريا على وسط الاكار المغذي الحاوي على السكروز. وقد اظهرت النتائج مقدرة 36 عزلة بكتيرية جذرية على انتاج الليفان من المجموع الكلي للعزلات. شخصت العزلات الاربع الاكثر كفاءة لانتاج الليفان ووصفت بواسطة الفحوصات المظهرية والبايوكيميائية القياسية والاختبارات على المستوى الجزيئي. تم اجراء التشخيص الجزيئي لهذه العزلات الاربعة باستخدام 16S rDNA والتي اظهرت ان طول تسلسل المنطقة كان (946، 1056، 1064و1154) زوجا قاعديا للعزلات (2، 3، 23 و33) على التوالي. ان محاذات التسلسل في بنك الجينات اظهر ان العزلات الاكثر كفاءة كان لديها نسبة عالية من التشابه (98، 96، 98 و99) % على التوالي وتبعا لاقرب جار تطوري لهذه العزلات, تم التعرف عليها تبعا لتتابع جين (16S rRNA) وتبعا للفحوصات الشكلية والكيموحيوية , وشخصت على انها (Brachybacterium phenoliresistens، Elizabethkingia anophelis، Arthrobacter globiformis، Pseudomonas brassicacearum) على التوالي. تم تشخيص الليفان المنتج من هذه العزلات الاربعة باستخدام تقنية TLC والتي اظهرت تكون الليفان من نوع واحد من السكريات الا وهو الفركتوز. وقد تم تشخيص الليفان المنتج بواسطة بكتريا B. phenoliresistens باستخدام تقنيتي FTIR وتقنية الرنين المغناطيسي النووي NMR. تحليل الليفان بواسطة هاتين التقنيتين اثبتت انتاج الليفان بواسطة هذه العزلة. تم دراسة تاثير العوامل الغذائية والفيزيائية على انتاج الليفان بواسطة العزلات الاكفا. كان مصدر الكاربون الامثل لانتاج الليفان بواسطة هذه العزلات هو السكروز، حيث كان انتاج هذه العزلات هو 7.88، 7.94، 7.8 و7.77 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis، A. globiformis ، P. brassicacearum على التوالي. تم استخدام اربع مصادر مختلفة للنايتروجين لمعرفة افضل مصدر نيتروجيني لانتاج الليفان. حيث كان الكازائين هو افضل مصادر النيتروجين لانتاج الليفان حيث كان انتاج هذه العزلات 8.12، 8.2، 8.24 و8.56 غم/لتر للعينات الاربعة على التوالي. تم استخدام تراكيز مختلفة للسكروز لانتاج الليفان حيث كان اعلى انتاج لجميع العزلات عند التركيز 300غم/لتر وكان الانتاج بواسطة هذه العزلات 7.97، 7.94، 8.06 و7.95 غم/لتر على التوالي. تم استخدام قيم pH مختلفة لمعرفة افضل اس هيدروجيني لانتاج الليفان حيث كان افضل اس هيدروجيني هو 7.8 لكل العزلات، وكان الانتاج 7.88، 7.94، 7.8، 7.77 غم/لتر على التوالي. فضلا عن ذلك، تم اختبار عدة ظروف مثل فترة الحضن المثلى، درجة الحرارة، معدل الرج. كانت فترة الحضن المثلى للعزلة E. anophelis 48 ساعة حيث انتجت 8.46غم/لتر، في حين كانت 72 ساعة لباقي العزلات حيث انتجت 8.58، 8.53 و8.7 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens ، A. globiformis وP. brassicacearumعلى التوالي. درجة الحرارة المثلى لانتاج الليفان بواسطة العزلة B. phenoliresistens كانت عند 30 درجة مئوية حيث انتجت 7.87 غم/لتر، وكانت درجة الحرارة المثلى هي 33 درجة مئوية للعزلتين E. anophelis وA. globiformisحيث انتجت عندها 8.04 و8.6 غم/لتر على التوالي. في حين كانت درجة الحرارة المثلى للعزلة P. brassicacearum 40 درجة مئوية وكان انتاجها 8.24 غم/لتر. استخدمت ثلاث معدلات رج لمعرفة افضل معدل رج لانتاج الليفان. تم الحصول على اعلى انتاج لليفان عند معدل رج 150 هزه/دقيقه، حيث كان الانتاج للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis وA. globiformis هو 8.12، 8.54 و8.27 غم/لتر على التوالي. | The Rhizosphere zone is a narrow volume of soil which surrounds the plants roots and influenced by the activity and growth of the root. In the present study, Levan producing bacteria were isolated from rhizosphere soil, fifteen rhizosphere soil samples were obtained from the legumes roots cowpea and broad bean (Vinga unguiculata L. and Vicia faba) during the period from October 2014 to January 2015, which were collected from three legumes farms in Kana’an Village, Diyala Governorate. A total of 52 Rhizobacterial colonies were isolated, purified and screened for their ability to produce levan, depending on growing of mucoid colonies on sucrose nutrient agar. The results showed that thirty six isolates out of the total number of the isolates were identified as levan producers. The most efficient four isolates were identified and characterized according to standard biochemical and Molecular tests. The Molecular identification of these four isolates was carried out by using 16S rDNA, which resulted in sequenced region of 946, 1056, 1064 and 1154 base pair in length respectively. The sequence alignment in the gene bank indicated that the most efficient isolates (2, 3, 23 and 33) have high percentage of similarity (98, 96, 98 and 99 % respectively), in comparison with the retrieved consensus sequences. The closest phylogenetic neighbor for these isolates is predicted according to the 16S rRNA gene sequence, morphological and biochemical tests. These isolates were identified as (Brachybacterium phenoliresistens, Elizabethkingia anophelis, Arthrobacter globiformis and Pseudomonas brassicacearum) respectively. Levan production by these four isolates were characterized by using Thin Layer chromatography (TLC) technique, which revealed that levan is composed of only one sugar which is fructose. Levan produced by B. phenoliresistens was characterized by Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy techniques. The instrumental analysis indicated that Levan was produced by the selected isolate. The effect of some nutritional and physical factors were investigated on levan production by the highest four isolates. Sucrose was the best carbon source for levan production in all isolates that gave (7.88, 7.94, 7.8 and 7.77) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively. In addition, four nitrogen sources were used to identify the best nitrogen source for levan production. Casein was the best nitrogen source for all isolates that gave (8.12, 8.20, 8.24 and 8.56) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively,. Moreover, different sucrose concentrations were used to assess the best concentration for levan production. The highest levan yield by all isolates was at the sucrose concentration of 300 g/l, which gave (7.97, 7.94, 8.06 and 7.95) g/l respectively. Different pH values were also used to determine the best pH value for the levan production. The four isolates gave their highest levan production (7.88, 7.94, 7.80 and 7.77) g/l at pH 7.8. Further, conditions were examined like optimal incubation period, temperature and agitation rate. The optimal incubation period was 48 hs for E. anophelis that gave 8.46 g/l and 72 hs for B. phenoliresistens, A. globiformis and P. brassicacearum which gave (8.58, 8.53 and 8.7) g/l respectively. Whereas, the optimal temperature was 30ºC for B. phenoliresistens that produced 7.87 g/l , 33 ºC for E. anophelis and A. globiformis which gave (8.04 and 8.6) g/l, and 40 ºC for P. brassicacearum that gave 8.24 g/l. Three agitation rates were used to identify the best agitation rate for levan production. The highest levan production yield was obtained at 150 rpm by the isolates B. phenoliresistens, E. anophelis and A. globiformis which gave (8.12, 8.54 and 8.27) g/l respectively.

مقارنة تشخيصية جزيئية وبكتريولوجسة لبكتريا الزائفة الزنجارية المعزولة من مرضى السكري النوع الثاني وامراض اخرى == Comparison the Molecular and Conventional Identification of Pseudomonas aeruginosa isolated from Diabetes Type II and other Diseases

Author name: سناء محمد حبيب الشمري
Supervisor name: اسماء محمد صالح المهيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Fifty clinical samples suspected as Pseudomonas aeruginosa were collected from patients with different diseases, diabetic foot ulcers, U.T.I., wounds, burns, keratitis, external otitis from September 2015, till February 2016, from hospitalized patients in four different Baghdad hospitals (Al - Kindi General Teaching Hospital, Al - Yarmuk General Teaching Hospital, Alkadhmiya General Teaching Hospital, and AL - Shiakh Zaied Hospital).The study population targeted both gender from different ages groups.The collected samples were cultured on different selective and differential media and tested biochemically in order to identify P.aeruginosa, then the identification was ensured by using two molecular methods which are conventional PCR in the detection of ecfx gene and 16SrDNA gene and real time PCR with commercial kit from sacace (qualitative detection of P.aeruginosa) and with gyrB gene using specific primers to each gene.Sensitivity for each test was measured then compared with other tests to determine the test efficiency. The results showed that the sensitivity for API20NE test was (80%), the sensitivity for molecular tests as flows : ecfx test was (92%), 16SrDNA test was (96%), the commercial kit test was (98%) and for gyrB test was (92%).The present study shows that using more than one target gene is reducing the probability of misidentification of P.aeruginosa that may be caused by variation in primer or probe targets.According to the type of infection the comparison was done. The results of P.aeruginosa detection for diabetic foot isolates were compared with other isolates. The results showed that there is a remarkabledifference in the API20NE test; as well as, with the oxidase test (according to the time that oxidase test need it to give the dark purple color as a positive result), for the mucoid strains of this bacterium. The results of detection isolates by using gyrB gene were differed too.Then a comparison in simplicity, cost, accuracy and time of P.aeruginosa identification between molecular methods and API20NE test (biochemical test) and between molecular tests themselves were performed. The results of these comparisons show that the molecular methods are better than API test in all aspects of the comparison. Real time PCR is better than conventional PCR in simplicity, accuracy and time but not in cost.All isolates were tested for antibiotic sensitivity using nine antibiotics. The results showed that most isolates were sensitive to Levofloxacin (94%), Ticarcillin - clavulanic acid (Timinim) (88%), Gentamicin (82%) and (80%) to both Pipracillin and Imipenem, while the isolates appeared resistant to another antimicrobials represented by (72%) to Augmentin, (34%) to Ceftazidime, (38%) to Colistin, and (28%) to Ciprofloxacin. In the present study, Levofloxacin represents the most effective antibiotic against P. aeruginosa isolates with the all types of infection.The present study improves the importance of the rapid and accurate detection of the bacterial types and thus giving the right antibiotics to patients to obtain rapid recovery and prevent any complications that may lead to death.

الكشف عن البارفوفايروس B19 بوساطة التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي في مرضى اورام الدرقية == Detection of Parvovirus B19 by Immunohistochemistry in Patients with Thyroid Tumors

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | علي حسین محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Thyroid cancer is the most common neoplasm of endocrine system. In Iraq thyroid cancer ranks the eighth among ten cancers in females.Therefore, it is a growing health problem.The present study was conducted to evaluate whether or not parvovirus B19 play a role in thyroid tumors and the correlation between the existence of virus and activation of NF - κB p65. Also this study extended to determine relevant cytokines (IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α) in the microenvironment of thyroid tumors by using immunohistochemical technique.This study designed as a retrospective study. A total number of 94 formalin - fixed paraffine - embeded thyroid tumors tissue collected from archive of Histopathology Department of the Teaching Laboratories, Medical/ City, Al - Shaheed Ghazi Hospital Lab, Al - Kindy Hospital Lab, Alkarama Hospital Lab and Central Public Health Lab during the period July 2013 - November 2013. All samples are referred to the period between 2010 - 2013. Tissue blocks were divided into three groups. First group included 53 tissue block of malignant thyroid whereas second group included 41 tissue blocks of benign thyroid tumors and third group included 21 tissue blocks as control group were selected from the same benign cases which have normal tissue. From each block, seven sections of 4μm thickness were taken, one section was stained with Hematoxylin and Eosin (H&E) and the other six sections were immunohistochemically stained for human parvovirus B19, NF - κB p65, IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with malignant thyroid tumors ranged from 20 - 70 year with mean age 40±11.63 year while in benign tumors, the mean age was 37.6±11.19 year, ranged from (16 - 59) year.The papillary thyroid carcinoma was the most common type among malignant histopathological types 61%. In benign tumors the most common was follicular adenoma 29.3%.Human parvovirus B19 expression was higher in malignant tumors than in benign with no significant difference P=0.09 while it was significantly higher in malignant 66% and benign tumors 48.8% compared with their counterparts of control group 4.8%, p˂0.001.NF - κB p65 was positively expressed in all cases of malignant tumors 100% and 97.6% in cases of benign tumors compared with control group 23.8% with significant difference p˂0.001.IL - 6 expression was higher in benign than in malignant tumors with no significant difference p=0.22 while it was significantly higher in benign 90.2% and malignant tumors 81.1% compared with control group 52.4%, p=0.01 and p=0.03 respectively.Immunostaining reaction for IL - 8 was significantly higher in malignant tumors than that in benign 69.8% versus 31.7%, p˂0.001, while positive reaction was not detected in any tissue of control group.IL - 10 was expressed in 83% of malignant tumors, in 95.1% of benign tumors and 71.4% control group. The percentage of IFN - α positive was 83% in malignant tumors compared with 63% in benign tumors and normal tissue 52%. The difference was significant between malignant and benign tumors p=0.04 and between malignant and control group p=0.007.There was a significant correlation between human parvovirus B19 score category and IFN - α score r=0.296, p=0.031. But no significant correlation was noticed between B19 and the other cytokines.

تقييم بعض العوامل المسببة للاجهاض التلقائي للنساء في محافظة بغداد : دراسة مصلية ونسيجية == Evaluation of Some Spontaneous Abortion - Causative Factors for women in Baghdad Province A Serological And Histological Study

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | سالم رشيد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الاجهاض التلقائي احدى المشاكل السريرية المهمة التي تؤثر على النساء الحوامل خلال (20 - 22) اسبوع الاولى من الحمل مسببة خطر على الام وجنينها.وبهدف القاء الضوء على بعض مسببات الاجهاض وموت الاجنة داخل الرحم. تم اختيار (70) امراة من النساء المجهضة ، قسمت النساء الى مجموعتين ، الاولى هي المجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل (52) والثانية مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الثانية من الحمل (18) . اجريت المقارنة مع(20) من النساء ذوات حمل طبيعي انتهى حملهن بولادة طبيعية.جمعت نماذج الدم والمشايم خلال الفترة من تشرين الثاني 2008 ولغاية نيسان 2009 في مستشفيات بغداد. اجريت الفحوصات المختبرية لتحديد مستويات هرمون البروجسترون والاستراديول واضداد داء المقوسات IgM, IgG الانترلوكين - 6 وسكر الدم والبروتين الكلي والتغيرات النسجية في مشايم النساء المجهضة باستخدام صبغة الايوسين - هيماتوكسلين وصبغة الكمزا. بنيت الدراسة الحالية النتائج الاتية : - 1 - لوحظ وجود انخفاض معنوي (P< 0.01 ) في مستوى هرمون البرجسترون والاستراديول لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل المختلفة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 2 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات IgG في (%41.43) من المجموع الكلي للنساء المجهضة, بينما لوحظ وجود اضداد داء المقوسات IgM في (%5.6 ) من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل.3 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستوى 1L - 6 بين النساء المجهضات ومجموعة السيطرة. 4 - لوحظ ارتفاع معنوي (P< 0.01 ) و(P< 0.05 ) في مستوى البروتين الكلي في مصل النساء المجهضة خلال مرحلة الحمل الاولى والثانية على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 5 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستويات الكلوكوز بين مجموعة النساء المجهضة ومجموعة السيطرة . 6 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقات ترابطية في المرحلة الاولى من الاجهاض التي كانت علاقة موجبة بين ( IgM,IgG) داء المقوسات (P< 0.01 ) وعلاقة معنوية موجبة بين البروحسترون والاستراديول مع مستوى السكر بالـدم (P< 0.05 ) وعلاقة معنوية موجبة بين IgG داء المقوسات والعمر.7 - وجود علاقات ترابطية قوية بين هرمون البروجسترون و1L - 6 (P< 0.05 ) و(P< 0.01 ) المرحلة الاولى والثانيةعلى التوالي من الحمل وهرمون البروجستون والاستراديول (P< 0.05 ) في المرحلة الثانية من الاجهاض . 8 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية ظهور الحالات المرضية في المشايم المجهضة والتي شملت الاستسقاء المائي Hydropic Degeneration التليف Fibrosis وتجمع الهايلين Hyalinization وحالة الذوى Ischemia والتفاعل المناعي Immunological reaction وعدم وجود الطفيلي نسيج المشيمة باستخدام صيغة كمزا . | The spontaneous abortion is considered as one of the important clinical problems that is may effects pregnant women during the 1st 20 - 22 weeks of pregnancy causing dangers to the mother and her fetus.The present study was designed to focus on some spontaneous abortion causes and fetal death and fetal death in the uterus. (70) Women were selected to represented the samples of spontaneous aborted women.The women were classified into two groups , the first represented aborted women during the first trimester of pregnancy (52) , the second trimester of pregnancy (18) , in comparison with result of (20) normally delivered pregnancies. The samples (sera and placenta) were collected during the period from November 2008 to April 2009 in Baghdad.Laboratory tests were performed to determine serum levels of difficult parameters which include progesterone ,estradiol , Toxoplasma IgG,IgM , IL - 6 , blood sugar, total protein .Histopathological changes of aborted placenta was performed using haematoxylin - eosin , giemsa stain to differentiate nuclear and cytoplasmic morphology of parasite.Results 1 - Significant decrease (p<0.01) in the level of progesterone and estradiol hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy compared with control.2 - Anti - Toxoplasma IgG, IgM were positive in (41.43%), (5.6%) of total aborted women, respectively.3 - There was no significant difference (p>0.05) in level of IL - 6 between aborted women and control. 4 - There was a significant increase in the level of total protein in the serum of women with abortion in first and second trimester of pregnancy compared to control (p< 0.01, p< 0.05).5 - There was no significant difference in the levels of blood sugar between women with abortion and control.6 - The results of present study revealed correlations between the parameter in first trimester that was positive correlation between IgG with IgM toxoplasmosis (p<0.01), significant positive correlation between blood sugar with progesterone,estradiol hormone,(p<0.05) and significant positive correlation between age with IgG toxoplasmosis (p<0.05). 7 - There was a correlation (positive) between progesterone with IL - 6 in first and second trimester (p<0.05, p<0.01), respectively. And progesterone with estradiol (p<0.05) in second trimester. 8 - The histological study shows hydropic degeneration fibroids with hyalinization of fibrinosis changes, immunologic reaction, ischemia and negative histological parasite with Giemsa.

تحفيز انتاج الاحماض الدهنية من الطحالب المعزولة محليا والمستخدمة للوقود الحيوي == Stimulation of the Production of Important Fatty Acid from Locally Isolated Algae Used for Biodiesel

Author name: سمارة سعد فرج حمادي
Supervisor name: فكرت مجيد حسن | ناظم حسن حيدر
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل عشرة عزلات(Chrococcus disperses, Chrococcus minor, Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) من الاحواض ومن نهر دجلة في العراق . اختبرت العزلات من حيث نموها وانتاجها للدهون. اظهرت العزلات ) C.dispersus, A,augstumalis and C.vulgaris) اعلى نمو وانتاج للدهون ، لذا تم اختيارها لغرض انتاج الدهون الحيوية . حفزت العزلات المختارة بدراسة تاثير الرقم الهيدروجيني والملوحة في النمو وانتاج الدهون. بينت النتائج بان اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.dispersus بلغ 2.68 غم / لتر عند الرقم الهيدروجيني 9 ، بالمقارنة الى تركيز واطئ للدهون ( 1.78 غم/لتر) عند الرقم الهيدروجيني 5 . في حين تم الحصول الى اعلى سرعة نمو (k) واقل فترة تضاعف (G) للعزلة عند الرقم الهيدروجيني 5 . اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.vulgaris بلغ (3.45 غم/لتر) حصل عند الرقم الهيدروجيني الواطئ (pH6) ، بينما اعلى انتاج للدهون كان عند الرقم الهيدروجيني 8 . في حين اعلى نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. بالمقارنة ، حفز انتاج الدهون من قبل A.augstumalis وبلغ (2.75 غم/ لتر) عند الرقم الهيدروجيني العالي 11. اما اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون من قبل العزلة C.dispersus، حفزت بخفض تركيز الملوحة وبلغ (2.94 غم/ لتر) عند التركيز 0.4 غم/ لتر من NaCl . بالمقارنة الى اعلى نمو واقل فترة تضاعف للطحلب حصلت عند التركيز العالي للملوحة (1.5 غم/ لتر). واظهرت النتائج ايضا بان العزلة C.vulgaris قادرة الى تحمل تراكيز عالية من الملوحة اكثر من(1.5 غم/لتر)، واعلى انتاج للدهون بلغ 1.72 غم/ لتر تم الحصول عليه عند تركيز الملوحة (1 غم/لتر ). في حين اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة حصلا عند التركيز 0.8 و0.4 غم/ لتر من الملوحة على التوالي . اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون حفز من قبل A.augstumalisعند الرقم الهيدروجيني المتدني وبلغ 2.5 غم/ لتر عند التركيز 0.4 غم/ لتر من الملوحة ، بالمقارنة مع اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف حصلت عند التركيز الواطئ من الملوحة (0.021غم/ لتر). درس التاثير المشترك للرقم الهيدروجيني والملوحة في انتاج الدهون والسكر والبروتين في داخل الاحواض الزجاجية ذات سعة 5 لتر. اعلى انتاج للدهون والسكر والبروتين من قبل العزلة C.dispersusتم الحصول عليها عند الرقم الهيدروجيني ( pH9، الملوحة 0.4 غم/ لتر) وبلغ 8.4 و0.525 و0.018 غم / لتر على التوالي. في حين اقل انتاج للدهون والسكر والبروتين تم الحصول عليها عند ( pH7، والملوحة 0.075 غم /لتر ). اما في حالة C.vulgaris ، اعلى انتاج للدهون والبروتين تم الحصول عليه عند (pH6، والملوحة 0.075غم/ لتر) . في حين انتاج الدهون من قبل A.augstumalisفضل الظروف القاعدية ، واعلى انتاج للدهون حصل عند (pH11، والملوحة 0.075غم/ لتر).وبلغ 4.42غم/ لتر. اظهرت النتائج ايضا ، بان اعلى محتوى للدهون(%) للعزلة C.vulgarisبلغ 33.2% ( 0.33 غم دهن /غم من الوزن الجاف للطحلب) عند (pH7، والملوحة75 0.0 غم/لتر) ، بالمقارنة مع اقل محتوى للدهون تم الحصول عليه من قبل العزلتين C.dispersus, A.augstumalis وبلغ 16 و13.8% عندما حفزت العزلتان عند (pH11، والملوحة 0.075 غم/ لتر) و(pH9، والملوحة 0.4 غم/ لتر بالتتالي). اظهرت نتائج نتائج تحليل الدهون بجهاز GC، بان مكونات الدهون للعزلة C.dispersus عند (pH7، والملوحة 0.075غم/ لتر) تحتوي حامض الستياريك (1.09غم/ لتر)، في حين لم تظهر الدهون عندما حفز الطحلب عند (pH9 ، الملوحة 0.4غم/لتر). اما في حالة C.vulgaris تم الحصول فقط الى حامض الستياريك (9.78غم/ لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075غم/ لتر)، بينما تم الحصول الى حامض الاوليك (1.15غم/ لتر) وحامض الستيارك (1.26غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.126غم/لتر) عند المعاملة (pH6 والملوحة 0.075غم/ لتر). بالمقارنة مع مكونات الدهون المنتجة من قبل A.augstumalisاحتوت حامض الاوليك (1.12غم / لتر) وحامض الستياريك (0.17 غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.082غم/لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075 غم/ لتر). بينما احتوت الدهون فقط حامض الستياريك (3.96 غم/ لتر ) عندما حفز الطحلب عند المعاملة (pH11 والملوحة 0.075غم/ لتر). | Ten microalgae isolates (Chrococcus dispersus, Chrococcus minor ,Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) were isolated from ponds and Tigris river in Iraq. The isolates were screened for growth and lipid production, the isolates C.dispersus, A.augstumalis and C.vulgaris exhibited higher growth rate and lipid production. Therefore, these isolates were selected for the purpose of algae biodiesel production. The selected isolates were stimulated by studying the effect of different levels of pH and salinity on growth and lipid production. The results showed higher lipid production by C.dispersus which reached (2.68g/l) at pH value of 9, in comparison to lower lipid concentration of (1.78g/l) at pH5. While higher growth rate (K) and shorter doubling time (G) were observed at pH5. The lipid production by C.vulgaris reached maximum of (3.45g/l) at lower pH 6, while, minimum lipid production was observed at pH8. Also, higher growth rate and shorter doubling time were recorded at pH5. In comparison, lipid production was stimulated by A.augstumalis and reached (2.75g/l) which was obtained at pH value of 11. However, higher growth rate and shorter doubling time were observed at pH5. Results also had showed that lipid production by C.dispersus was stimulated by decreasing salinity concentration and reached maximum of (2.94g/l) at 0.4 g/l of NaCl. In comparison higher growth rate and shorter doubling time of algae were observed at higher salinity concentration of 1.5g/l. The results also showed that the isolate C.vulgaris was able to tolerate salt concentration up to 1.5 g/l, maximum lipid production was obtained (1.72 g/l) at salt concentration of 1g/l. While, higher growth rate and shorter doubling time were observed at (0.8 and 0.4 g/l) of salinity, respectively. The results also exhibited that lipid production was stimulated by A.augstumalis at lower salinity level and reached maximum of (2.5 g/l) at 0.4 g/l of salinity, in comparison to higher growth rate and shorter doubling time recorded at lower salinity concentration of 0.2g/l. The combined effect of pH and salinity together on lipid, carbohydrate and protein production were studied, the experiments were carried out in 7.5 liter glass pools. Maximum lipid, carbohydrate and protein concentration of C.dispersus were observed at (pH9 and salt 0.4g/l) and reached (8.43, 0.525 and 0.018g/l), respectively. While, minimum concentration of lipid, carbohydrate and protein production was observed at (pH7 and salt 0.075g/l).In case of C.vulgaris, higher total lipid production and protein was obtained at (pH6and salt0.075g/l).While, lipid production in microalgae A.augstumalis was favored by alkaline condition and maximum lipid production was observed at (pH11 and salt 0.075g/l) and reached 4.42 g/l. The results also reevaluated that the higher oil content was observed in A.augstumalis reached 16% (0.16 g of oil/ g of dry algal biomass) at (pH11 salt 0.075g/l), in comparison to lower oil content (%) observed with C.dispersus and C.vulgaris which reached (13.8 and 11.21%) when stimulated with (pH9 salt 0.4g/l) and (pH6 salt 0.075g/l), respectively. Analysis of lipid content by GC instrument, had shown that the lipid content of algae C.dispersus at (pH7 salt 0.075g/l), contained only stearic acid (1.09g/l) while, no lipid was detected when algae were stimulated at (pH9 salt 0.4g/l). In case of C.vulgaris only stearic acid (9.78g/l) was found at treatment (pH7 salt 0.075g/l) while, oleic acid (1.15 g/l), stearic acid (1.26 g/l) and palmitic acid (0.126 g/l) were observed. At treatment (pH6, salt 0.075g/l).In comparison, lipid content produced by A.augstumalis included, oleic acid (1.12 g/l), stearic acid (0.17 g/l) and palmitic acid (0.08 g/l) found in treatment (pH7 salt 0.075 g/l). While, lipid content was only Stearic acid (3.96g/l) when the algae were stimulated at (pH11 salt 0.075 g/l.

اكثار نبات الخلة البلدي Ammi visnaga نسيجيا وتقدير بعض مركبات الايض الثانوي فيه == Micro propagation and Estimation of some Secondary metabolite in Ammi visnaga plant A thesis

Author name: سعدة عبد الفتاح سعيد
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عبد الجاسم محيسن جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري هذا البحث في مختبرات مركز بحوث التقنيات الاحيائية / جامعة النهرين بهدف زيادة انتاج الخلين في المزارع النسيجية لنبات الخلة البلدي Ammi visnaga وتقديره بالتحليل الكمي والنوعي بجهاز HPLC ثم مقارنته مع مستخلص الاوراق والبذور الجافة من النبات الكامل In vivo. تم انبات البذور في ظروف معقمة على وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 1, 0.5 ملغم / لتر على التوالي والحصول على بادرات دون الكالس .اظهرت النتائج بان وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 3.5و1 ملغم / لتر على التوالي كان فعالا في استحداث الكالس فتفوقت السويقة الجنينة السفلى باعطاء معدل نسبة مئوية 100% بالضوء على كالس الاوراق الذي كانت نسبته 83.3 % وكذلك تفوق نفس الوسط بالوزن الطري والجاف للسويقة الجنينية السفلى مقارنة مع كالس الاوراق للضوء والظلام . فقد بلغ الوزن الطري لكالس السويقة الجنينية السفلى من الضوء 1005.6 ملغم وفي الظلام 916.5 ملغم . بينما بلغ الوزن الجاف في الضوء لكل من كالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية 48.5و39.9 ملغم على التوالي وفي الظلام 45.5 و41.1ملغم .تباينت طبيعة ولون الكالس تبعا للجزء النباتي وظروف الحضن تميز كالس السويقة الجنينية السفلى بطبيعة هشة ولون اخضر في الضوء وازداد هشاشة ولون ابيض مائل للاخضرار في الظلام . بينما اختلف الكالس المستحدث من الاوراق الفتية واتصف بتماسكه ولونه الاخضر في الضوء مقارنة بالكالس المستحدث في الظلام اذ كان اقل تماسكا وذو لون ابيض .تم الحصول على كالس ذو وزن عالي وبكميات كبيرة عند اعادة زراعته Subculture على نفس وسط الاستحداث ثلاث مرات .اعطت مستخلصات الاجزاء النباتية البذور الجافة والاوراق للنبات المزروعة في الحقل In vivo منحنيات عالية لمركب الخلين مع انعدامه بمنحنيات مزارع الكالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية بخلاف مركب الكومارين اذ تميزت مستخلصات مزارع كالس بانتاجه، وارتفع منحناه بمستخلص كالس الاوراق الفتية في الضوء.لقد تم بنجاح الحصول على نبيتات كاملة لكالس نبات الخلة البلدي عند زراعته على وسط MS حيث مزود ﺒ NAA 0.5 ملغم / لتر وBA 1 ملغم / لتر تم نقلها على نفس الوسط بدون NAA . | this study was conducted in The laboratories of Biological technology center / university of Al - Nahrain, during 2007 - 2008.The aim of this study was to increase the production of Khellin from Ammi visnaga In vitro and its determination by the quantitative and qualitative Analysis by HPLC and comparing it with the extracts of plant part In vivo. Seeds have been germinated under sterilized conditions on MS medium supplied with NAA at0.5 mg/L and BA at1mg/L and It has achieved to plantlets without any production of callus .Results showed that MS medium supplied with NAA 3.5 mg/L and BA 1.0 mg/L was that most effective on callus induction. Thus, the calli of hypocotyls incubated in light were significantly superior(100% induction) in comparison with young leaves calli which gave 83.3%.Results also showed that the same medium produced more fresh and dry weights of hypocotyls callus has and young leaves ones exposed or not to light .Accordingly the fresh weight of the hypocotyls calli and young leaves achieved 1005.66, 916.5 mg in light. respectively and 800.8,702.5 in dark successively. As for the dry weight hypocotyls calli reached 48.5 mg in light and 45.5mg in dark while young leaves calli gave 41.11mg in dark and 39.9mg in light .The difference in nature and color of the calli depends on the type of explant and incubation conditions. Calli of hypocotyls was fragile nature with green color in light, the fragility increased in darkness and the color was white and greenish. Calli of young leaves were compact and green color in light while less coherent and white at dark .In order to obtain larg quantities of calli, subculture on the above mentioned medium is recommended for at least three times.The highest level of khellin was obtained in vivo by using extracts of different parts (dry seeds and leaves) in comparison with callus that production in in vitro (calli).Regeneration was successfully achieved from calli cultured firstly on MS medium supplemented with NAA0.5mg/L and BA1.0mg/L then transfersed to the same medium with out NAA.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة للمرضى المحبطين مناعيا ودراسة للاستجابة المناعية ضد المبيضات البيضاء == Isolation and identification of fungi associated with and study immunocompromised patients of the immune response against Candida albicans

Author name: سعاد يوسف لفتة
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: خلال فترة الدراسة التي امتدت من تشرين الثاني/2003 ولغاية نيسان/2005 فقد تم اخضاع 300 مريضا يعانون من مختلف الامراض الخبيثة الى فحص داء الفطريات واظهر 17 مريضا من المجموع الكلي ان نتائج زرع الدم كانت ايجابية وان خميرة مبيضة المبيضات Candida albicans كانت المسؤولة عن معظم الاصابات بالفطريات ومن بين الحالات السبعة عشر التي تم عزلها فان تسعة منها (53% من مجموع الحالات) كانت من نوع C. albicans وان الاصابات بفطريات اخرى سواها والتي تم عزلها بلغ عددها اربعة (23% من مجموع الحالات) كانت من Aspergillus spp التي تم عزلها من حالة فردية من حالاات Cryptococcus spp وحالة ثانية من حالات زرع Trichosporone spp . ولقد اتبع اسلوب API (API candida and API 20 C AUX) كطريقة مرجعية لتشخيص ماتم عزله. وبالمقارنة مع الاساليب التي قدمت مؤخرا وهي انظمة (ID32 C) و(VITEK YBC) فان نظام API 20 CAUX وID32 كانامطابقين لمستوى السلالتين وبدون حاجة الى مزيد من الفحوصات الاضافية لتشخيص 13 حالة من الحالات الخمسة عشر التي تم عزلها اي 86.6% وان اهم ما تم التوصل اليه ثبوت ان نظام VITEK YBC يصلح جدا للمقارنة مع API 20 CAUX. ومن بين المرضى الثلاثمائة الذين تم زراعة دمهم تم فحص 71 منهم للتاكد من وجود او عدم وجود اصابة فطرية دون اجراء فحوصات على اعضاء الجسم الاخرى غير المصابة وكانت عينات الادرار هي الاكثر شيوعا من بين العينات الاخرى ومع ذلك فان عينتين فقط من مجموع 35 عينة اتفق على انها موجبة الزرع.و من بين المرضىالسبعة عشر الذين اثبت الزرع وجود فطريات لديهم فان ثمانية منهم كونوا مستعمرات من نفس الانواع الموجودة في النماذج الاخرى وان اكثر المواقع شيوعا لتكوين المستعمرات مع نفس الاحياء المجهرية كانت المجاري التنفسية والمجاري البولية - التناسلية. وكان متوسط العدلات (Neutrophils) في عينات دم موجبة الزرع 1136 خلية/ملم3 مع انحراف معياري مقداره ±1637 خلية/ملم3 في حين كان المتوسط لحالات الزرع السالبة 2701 مع انحراف معياري مقداره ±1667 . وباستعمال فحص ELISA لمضادات الجسيمات BioRad) (المتوفر تجاريا فان 25 مريضافقط من مجموع المرضى الثلاثمئة الذين اجروا الفحص اظهروا نتائج ايجابية. وان تسعة من بين هؤلاء الخمسة والعشرين اظهروا نتائج موجبة لزرع الدم ايضا في حين اظهر الستة عشر الاخرون نتائج زرع سالبة. ولم يظهر اي من افراد فريق السيطرة الاصحاء نتائج موجبة. وكانت قراءة نماذج الدم موجبة الزرع 1.11 مع انحراف معياري مقداره 0.68 في حين ان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لحالات الزرع السالب لاعضاء فريق السطرة الاصحاء كانت 0.43 مع انحراف معياري مقداره ±23 وان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لاعضاء فريق السيطرة الاصحاء كان 0.38 مع انحراف معياري مقداره 0.123. وقد اظهرت تراكيز interleukins التي تم فحصها بهذه الطريقة اختلافات كبيرة بين مجموعات الدراسة المختلفة وكذلك اختلافات بين افراد المجموعة الواحدة وان التركيز المتوسط ل IL - 1α في نماذج زرع الدم الموجبة بلغ 30.94 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±80.33 في حين ان التركيز المضبوط لحالات الزرع السالب بلغ 16.08 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 3.26 وكان التركيز المضبوط ل IL - 8 في نماذج الدم موجبة الزرع 389.2 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±383.15 في حين ان متوسط التركيز كان 163.0 بيكوغرام \مل مع انحراف معياري مقداره ± 289.9 وكان متوسط التركيز لدى مجموعة السيطرة المؤلفة من الاصحاء 5.02 بيكوغرام \مل م مع انحراف معياري مقداره ±1.81 . وكان تركيز GM - CSF في نماذج الدم 12.90 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±31.79 في حين ان متوسط تركيز حالات الزرع الموجبة كان 2.68 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 10.19. وان متوسط تركيز افراد مجموعة السيطرة الاصحاء بلغ 0.85 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 0,45. ولم يظهر مستوى الغلوبيولين المناعي اية متغيرات ملموسة بين مجموعات الدراسة سواء اكان الفحص IgG او IgM او IgA ولقد اظهر مستوىالعنصر التكميلي ل C3 اختلافات بارزة بين مجموعات الدراسة لكونه اوطا في مجموعة الزرع الموجب. وعلى كل حال لم تلاحظ اختلافات كبيرة في المجموعات بالنسبة الى C4 . وكان مستوى C Reactive Protein في المجموعات الدراسية المختلفة قد كشف عن اختلافات بارزة p=0.001 وعلاوه على ذلك فان الاختلافات كانت واضحة بين الافراد الذين هم ضمن نفس المجموعة. وكان المتوسط التقريبي لمستوى CRP في نماذج زرع الدم الموجبة 261,9 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±384.4 وفي نماذج زرع الدم السالبة بلغ 178,8 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±364.2 وفي مجموعة السيطرة التي افراده من الاصحاء بلغ 1.7 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±7.7 . وكان مستوى CRP في 58,8 من الحالات في مجموعة الزرع الموجب قد تجاوز 96 ملغ\لتر في حين ان 37.4% فقط من مجموعة الزرع الموجب تجاوزت هذا الرقم. ولم يكن يوجد بين افراد فريق السيطرة الاصحاء من تجاوز هذا الرقم.و كانت جميع الحالات التي تم عزلها بعد الفحص تستجيب الى الامفوتيريسين B مع (MIC =<1 مايكروغرام\مل) باستثناء C. krusei المنفرد الذي تم عزله والذي كان اقل استجابة من اي نوع اخر مع MIC مقداره 2 مايكروغرام\مل وMIC 50 المزدوج. وكانت نسبة سلسلة MIC الى الامفوتيريسن B تتراوح بين 0.125 الى 2 مايكروغرام\مل وبصوره عامة فان Non - albicans Candida اظهرت MIC اعلى من C. albicans التي تم عزلها وان 84.6% من الCandida التي تم عزلها كانت تستجيب الى الامفوتريسين والباقي اي 1.4% كانت حساسيتها حسب مقدار الجرعة. وان نسبة سلسلة MICs الى الفلوكونازول تراوحت بين (0.25 - 64) مايكروغرام\مل وكان جميع ما تم عزله ذا حساسية عالية تجاه الفلوكونازول باستثناء C. krusei التي اظهرت MIC عال حيث بلغ 32 واما MIC 50 وMIC 90 فقد كانت 16 مايكروغرام\مل و32 مايكروغرام\مل على التوالي. وان جميع ال Candida التي تم عزلها ونسبتها 84.6% استجابت الى الفوكونازول في حين ان نسبة 15.4% كانت حساسيتها حسب الجرعة.ان سلسلة الMIC تجاه الاتراكونازول كانت تتراوح بين (0.015 - 1) مايكروغرام\مل وكانت جميع C. albicans التي تم عزلها حساسة تجاه الاتراكونازول واظهرت خمائر الCandida الاخرى non - albicans Candida استجابة اقل نسبيا مع الحاجة الى تراكيز دوائية اعلى من اجل التوصل الى MIC وان 96.2 % من الCandida التي تم عزلها استجابت الى الاتراكونازول وان الباقي اي 30.8% كانت تستجيب حسب الجرعة. | Through the period of this study which extended from November 2003 to April 2004, 300 patients with different types of malignancies were tested for fungemia. Out of those, 17 patients showed positive blood culture results. Candida albicans accounted for the majority of fungal infections. Out of the 17 fungal isolates, 9 (53%) were C. albicans, others non C. albicans came next in frequency constituting 4 isolates (23.5%). Two isolates of Aspergillus spp. could be detected while a single isolate of Cryptococcus spp and another of Trichosporon spp. isolate were cultured API system (API Candida and API 20C AUX) was used as a reference method for the identification of isolates. Compared with the other newly introduced techniques (ID 32C systems and VITEK YBC). ), the API 20C and the ID 32 system were in agreement with the species level, without additional tests, for the identification of 13 of the 15 (86.6%) isolates.Overall, the updated Vitek YBC compares favorably with the API 20C in the identification of common yeasts. Among the 300 patients whose blood were cultured, 71 of them were screened for fungal infection from other parts of the body. Urine was the commonest sample obtained. However, two samples only out of the total (35 samples) were accepted to be culture positive. Among the 17 patients whose blood cultures proof the existence of fungi, 8 were colonized with the same species in other specimens. The most frequent sites of colonization with the same organism were the respiratory tract and urogenital tract.The mean of neutrophils count of the blood culture positive samples was 1136/c.mm with a standard deviation (SD) of 1637, whereas the mean count of culture negative cases was 2701 with a SD of 1923. Mean count of healthy control group was 5027 with a SD of 1667. Statistical analysis showed significant differences between the study groups. Using commercially available Candida - specific antibody test (Bio - Rad), 25 patients showed positive results out of the 300 patients tested. Nine of them showed positive blood culture as well, whereas the rest (16) gave negative culture results. None of the healthy control group showed positive results. Mean OD readings of the blood culture positive samples was 1.11 with a SD of 0.68, whereas the mean OD readings of the culture negative cases was 0.43 with a SD of 0.23. Mean OD readings of healthy control group was 0.38 with a SD of 0.123. Interleukins (ILs) concentration tested in this study showed significant variations among the different groups of the study as well as within the same group. Mean concentration of IL - 1α in the blood culture positive samples was 30.94 pg/ml with a SD of 80.33, whereas the mean concentration of the culture negative cases was 16.08 pg/ml with a SD of 28.75. Mean concentration of healthy control group was 7.92 pg/ml with a SD of 3.26. Mean concentration of IL - 8 in the blood culture positive samples was 389.2 pg/ml with a SD of 383.l5, whereas the mean concentration of culture negative cases was 163.0 pg/ml with a SD of 289.9. Mean concentration of healthy control group was 5.02 pg/ml with a SD of 1.81. Mean concentration of Granulocyte Macrophage - Colony Stimulating Factor (GM - CSF) in the blood culture positive samples was 12.90 pg/ml with a SD of 31.79, whereas the mean concentration of culture negative cases was 2.68 pg/ml with a SD of 10.19. The mean concentration of healthy control group was 0.85 pg/ml with a SD of 0.45. Serum immunoglobulins level showed no significant differences among the groups of the study whether IgG, IgM or IgA were tested. Mean level of C3 complement component showed significant differences between the groups of the study, being lower in culture positive group, and followed by culture negative group. However, no significant differences were noted in the groups in regard to C4. Level of CRP in different groups of the study shows significant variations (p=0.001). Moreover, variations are clear between individuals within the group itself. Approximate mean of CRP level in blood culture positive samples was 261.9 mg/L with a SD of 384.4 and, in blood culture negative samples was 178.8 mg/L with a SD of 346.2 and in healthy control group was 1.7 mg/L with SD of 7.7. CRP level in 58.8% of cases in culture positive group exceeded 96 mg/L. while only 37.4% of cases in culture negative group exceeded this value. Non in the control group exceeded this figure. All the tested isolates were susceptible to amphotericin B, with MICs ≤ 1ug/ml with the exception of a single isolate of C. krusei which was less susceptible than any other spp with MIC of 2 ug/ml and MIC50 of 2. The range of MICs to amphotericin B was from 0.125 to 2 ug/ml. In general, non - albicans Candida showed higher MIC than C. albicans isolates. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to amphotericin while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to fluconazole was from 0.25 to 64 ug/ml. All isolates were highly sensitive to fluconazole with the exception of C. krusei which showed a high MIC (32) and MIC50 and MIC90 of 16 and 32 ug/ml respectively. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to fluconazole while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to itraconazole was from 0.015 to 1.0 ug/ml. Most C. albicans isolates were sensitive to itraconazole. Non - albicans Candida showed relatively lower susceptibility with the need for higher drug concentrations to attain the MIC. 69.2% of Candida isolates were susceptible to itraconazole while the rest (30.8%) were susceptible in a dose - dependant way.

نزعات مقاومة مكروليد في العقدية المقيحة والرئوية المعزولة من الاطفال العراقيين المصابين بامراض الحلق المعدية == Macrolide Resistance Trends in Streptococcus pyogenes and Streptococcus pneumoniae Isolated from Iraqi children with throat infections

Author name: سعاد عبد الجبار عبد الزهرة الساعدي
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على مرضى مراجعي العيادة الاستشارية في مستشفى ابن البلدي في مدينة بغداد (العراق) للفترة من تشرين الثاني 2007 الى شباط 2008 . تم تعين المرضى بشكل عشوائي اذ تم اختيار 108 حالة (60 انثى و48 ذكر) تراوحت اعمارهم بين 18 شهر الى 12 سنة والذين يعانون من التهاب الحنجرة والبلعوم .تم جمع مسحات البلعوم من كل مريض بهدف عزل وتشخيص البكتريا . اعتمد كل من فحص D - test وOptochin كفحص اساسي لتميز بكتريا Streptococcus pyogenes المقاومة للمضادات الميكروليدية . اظهرت النتائج ان 94 حالة ظهرت عليهم العلامات السريرية واعراض التهاب اللوزتين والبلعوم ، 7 حالات ظهرت عليهم اعراض الحمى القرمزية (Scarlet fever)، و14 مريض اعتبروا حاملين للمرض .تم تشخيص بكتريا S. pyogenes في 65 عزلة من اصل 73 وكانت 16 منها مقاومة لمضادات الحياة الميكروليدية ، وتم تشخيص 8 عزلات من Streptococcus pneumoniae .توزعت المجاميع المقاومة للمضادات الحياة الميكروليدية الى : مجموعة بكتريا مقاومة من نوع iMLSB بواقع 3 عزلات ، ومن نوع cMLSB بواقع 8 عزلات ومن نوع M - phenotype بواقع 5 عزلات ، واظهرت عزلتين من نوع معكوس D - Shape (Inverted D - Shape) .كانت التراكيز المثبطة الدنيا باستخدام تقنية التخفبف الدقيق Micro - dilution لـ17 مضاد حيوي متفاوتة بالنسبة الى العزلات (حساسة او مقاومة للمضادات الميكروليدية واشكالها المظهرية) . اظهرت بكتريا S. pyogenes الحساسة للـerythromycin والـclindamycin تركيز مثبطا ادنى عند 0.25 مايكروغرام/مليليتر لكل من الـCo - amoxicillin + clavulanic acid وceftriaxone .بكتريا S. pyogenes التي قاومت كل من erythromycin وclindamycin كانت حساسة عند التركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر للـampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وceftriaxone وciprofloxacin وgatifloxacin .كانت عزلات S. pyogenes من نوع M - phenotype حساسة للتركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر من azithromycin وlincomycin وampicillin وCo - ampicillin cloxacillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وcephalothin وcefotaxime . ادنى تركيز مثبط لعزلات S. pyogenes من نوع D - Shape موجب كان 0.25 مايكروغرام/مليليتر لمضادات ampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin . كانت عزلات S. pneumoniae حساسة لكل مضادات الحيوية التي تم دراستها وبتراكيز مثبطة ادنى تراوحت بين (1 - 0.25) مايكروغرام/مليليتر .تم تحديد 3 عزلات من S. pyogenes متحملة للبنسلين . يستنتج من ذلك ان عزلات الـS. pyogenes المقاومة لمضادات الميكروليدية كانت تحتل نسبة عالية ، واكثر الاشكال المظهرية شيوعا كان من نوع cMLSB .كل من العزلات المقاومة للـfluoroquinolone والمتحملة للبنسلين penicillin tolerant كانت متواجدة في العزلات المقاومة والحساسة لمضادات الميكروليدية .حساسية عزلات S. pyogenes لمضادات الحيوية كانت متفاوتة بالنسبة الى حساسيتها او مقاومتها لمضادات الحيوية الميكروليدية وكذلك بالنسبة الى التنويع المظهري للعزلات المقاومة . | This study was conducted on patients attending the consultant clinic at Ibn - Al - Balady Hospital in Baghdad, Iraq from November 2007 to February 2008. The patients were allocated randomly, after they examined thoroughly by pediatrician, to be admit in this study. A total number of 108 (60 girls and 48 boys), their ages ranged from 18 months to 12 years, with provisional diagnosis of tonsillo - pharyngitis were enrolled in this study. Throat swab was obtained from each patient for isolation and identification of microorganisms. Double - disk test (D - test) and optochin test, fundamental for discrimination macrolide resistant Streptococcus pyogenes were done. The results showed that 94 patients had clinical signs and symptoms of tonsillo - pharyngitis, 7 patients were diagnosed as scarlet fever and 14 patients were considered as carriers. S. pyogenes was identified in 65 out of 73 isolates; sixteen of them were macrolide - resistant strain, and (8 isolates) of Streptococcus pneumoniae were identified. The phenotypes of macrolide resistant S. pyogenes were distributed as iMLSB (3 isolates), cMLSB (8 isolates) and M phenotype (5 isolates). Two isolates showed inverted D - Shape patterns. The minimum inhibitory concentration (MIC), using microdilution technique, of seventeen antimicrobials were varied with respect to the isolates whether susceptible or resistant to macrolide in addition to their phenotypes. The lowest MIC for susceptible isolates to erythromycin and clindamycin, was 0.25 µg/mL of Co - amoxicillin + clavulanic acid and ceftriaxone. S. pyogenes which resisted to both erythromycin and clindamycin were susceptible to 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, ceftriaxone, ceftazidime, ciprofloxacin and gatifloxacin. M - phenotype of S. pyogenes isolates were susceptible to 0.25 µg/mL of azithromycin, lincomycin, ampicillin, Co - ampicillin - cloxacillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, cephalothin and cefotaxime. The lowest MIC for S. pyogenes characterized by positive D - shape test was 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid and gentamicin . S. pneumoniae isolates were susceptible to all tested antimicrobials with MIC range of 0.25 - 1 µg/mL. Penicillin - tolerant S. pyogenes was detected in 3 isolates. It concludes that Macrolide resistant S. pyogenes was found in high percent, and the commonest phenotype was cMLSB. Both fluoroquinolone resistant isolates and penicillin tolerant isolates were detected in both Macrolide resistant and susceptible isolates. The susceptibility of S. pyogenes isolates to antimicrobials was varied in respect to their susceptibility or resistance to macrolide as well as to the phenotypes of resistant isolates.

بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية في تعقيدات الحـمـل == SOME IMMUNOLOGICAL AND BIOCHEMICAL CHANGES IN PREGNANCY COMPLICATIONS

Author name: سعاد الماس براخاس
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية المرافقة لتعقيدات الحمل. تم جمع (120) انموذجا من دم لنساء حوامل، قسمت على اربع مجاميع تتضمن (30) نموذج لنساء ذوات مقدمة الارتعاج و(30) نموذجا لنساء ذوات سكري الحمل و(40 ) نموذجا لنساء ذوات فقر الدم و(20) نموذجا لنساء حوامل اصحاء ظاهريا، وقد اعتمدت المجاميع الثانية والثالثة والرابعة بمثابة مجاميع السيطرة للحالة المرضية الرئيسية مقدمة الارتعاج.وقد خلصت الدراسة المناعية الى النتائج الاتية : - 1 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgM معنويا (P<0.001) في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 173.7 mg /dl ± 43.5 مقارنة بمعدل مستوياتها لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم والبالغ 118.4 mg/dl±43.5 و131.1 mg/dl±43.7 على التوالي ،في حين لم يكن هناك فرقا معنويا بالمقارنة مع ذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن 181.7 mg/dl± 55.6.2 - ارتفعت قليلا مستويات الكلوبيولين المناعي IgG في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها mg/dl 1285± 377.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى مجاميع السيطرة الثلاثة والبالغ 1145mg/dl ±374.1 و1117.2 mg/dl± 378.3 و280.4± 1233.9 mg/dl على التوالي ولم يكن هذا الارتفاع معنويا.3 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgA معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فكان معدلها 279.9 mg/dl± 94.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء الاصحاء والبالغ 177.1 mg/dl ±70.2 في حين لم يكن الارتفاع ذي دلالة معنوية مقارنة بمعدل مستواه عند ذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 94.37±210.4 mg/dl و261.3 mg/dl± 85.7 على التوالي.4 - ارتفاع في مستويات جزئي المتمم C3 وC4 معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغت معدلاتها 188.3 mg/dl±40.1 و47.1± 14.6 مقارنة بمعدلاتها مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم108.9 mg/dl ±44.2 و139.9 mg/dl± 40.8 و29.9 mg/dl± 12.5 و34 mg/dl± 11.8 على التوالي ، في حين لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 157.1 mg/dl ±55.4 و37.6 mg/dl ±11.5 .5 - ارتفعت مستويات البروتين الجنيني الالفي معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها 63.2 ng/ml ±34.6 مقارنة بمعدل مستواه عند النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 27.6 ng/ml ± 12.4و 30.4 ng/ml± 12.8و18 ng/ml ± 10.4على التوالي.6 - ارتفاع في مستويات البروتين الفعال - C في امصال 36.6% من النسوة ذوات مقدمة الارتعاج مقارنة بارتفاعه لدى 10% من ذوات فقر الدم و20% من ذوات سكري الحمل ، في حين لم تبدي اي من النساء الحوامل الاصحاء تفاعلا موجبا لهذا الفحص.فيما اشارت نتائج الفحوصات الكيموحيوية الى ماياتي : - 1 - ارتفع مستوى الكلوكوز في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.7±103.4 mg/dl مقارنة بمعدل مستواه لدى مجموعة النساء ذوات فقر الدم والبالغ g/dl 76±11.9 وكان الارتفاع ذا دلالة احصائية ( P<0.001)، بينما لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 86.3 mg/dl±10.4 ، غير ان مستواه يقل وبشكل معنوي ( P<0.001) مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 163.4 mg/dl± 19.9.2 - ارتفع مستوى الكولسترول الكلي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 217.5 mg/dl 41.8 ± مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات فقر الدم والبالغ 187.2 mg/dl±30.5 وكان الارتفاع ذ ا دلالة احصائية (P<0.001) بينما لم يكن الارتفاع ذا دلالة احصائية مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 195.5 mg/dl± 19.5، في حين كان يقل وبشكل غير معنوي مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 221.5 mg/dl ±41.3 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى اليوريا في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.6 ± 35.6 mg/dlمقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن22.2 mg/dl± 4.9 و23.9 mg/dl±6.4 و24 mg/dl± 5.7 على التوالي.4 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى الكرياتنين في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 1.1 mg/dl± 0.4 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 0.6 mg/dl ± 0.2 و0.6 mg/dl ± 0.2 و0.2 ± 0.7 mg/dl على التوالي.5 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى حامض اليوريك في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 7.4 mg/dl± 2.5 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 3.7 mg/dl± 1 و4.1 mg/dl± 1.2 و4.6 mg/dl±1.1 على التوالي.6 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GOT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط Median)) U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 6 U/L و7 U/L و5 U/L على التوالي.7 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GPT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 8 U/L و8 U/L و6 U/L على التوالي.8 - لم يكن هناك فرق معنوي في مستوى انزيم الفوسفاتيزالقاعدي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 27 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحــــمل والـبالغ 34 U/L و25 U/L و28 U/L على التوالي.اما نتائج الفحوصات الدمية فاشارت الى ما ياتي : - - 1ظلت مستويات الهيموكلوبين ضمن حدودها الطبيعية عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء مقارنة بمستواه لدى النساء ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 1 ± 9.2 g/dl .2 - ظلت مستويات مكداس الدم متقاربة وضمن حدودها الطبيعية لدى النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء فيما انخفض مستوياته لدى ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 2.8 ± 28.2 %.3 - ارتفعت اعداد خلايا الدم البيض معنويا (P<0.001) عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 3.7 ± 12.2 ×109 /L مقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن9.1×109/L ± 1.9 و109/L 8.8 × 2.1± و109/L 8.8 × ± 2.6 على التوالي .4 - لم تكن هناك فروقات معنوية في اعداد الصفيحات الدموية بين النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وظلت ضمن حدودها الطبيعية. | The present study was designed to focus on some immunological and biochemical changes accompanied pregnancy complications. 120 pregnant women were selected to represent the samples, the women were classified into 4 groups, the first group (30 samples) represented preeclamptic women, the second group (30 samples) represented gestational diabetic women, the third group (40 samples) represented anemic women, and the fourth group (20 samples) represented healthy pregnant women. The 2nd, 3rd, and 4th groups considered as a control groups for the main group, preeclamptic women.The results of immunological study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001) in the levels of immunoglobulin IgM in the sera of preeclamptic women (43±173.7mg/dl) in comparison with healthy women and anemic women 43±118.4 mg/dl , 43.5±131.1 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.6±181.7 mg/dl.2 - There was some elevation (non - significant) in the level of immunoglobulin IgG in the serum of preeclamptic women in comparison with the three control groups.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of immunoglobulin IgA of preeclamptic women (94.5±279.9mg/dl) ,in comparison with healthy women 70.2±177.1 mg/dl , while there were no significant differences in comparison with anemic women and gestational diabetic women 4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of complement components C3 and C4 of preeclamptic women 40.1±188.3 mg/dl, 14.6±47.1mg/dl respectively comparison with healthy women and anemic women 44.2±108.9 mg/dl, 40.8±139.9 mg/dl and 12.5 ±29.9 mg/dl,11.8±34 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.4±157.1 mg/dl and 11.5 ±37.6 mg/dl.5 - A significant increase (P<0.001) in the levels of Alpha - fetoprotein in the sera of preeclamptic women 34.6 ±63.2 ng/ml in comparison with healthy women 11.5±27.6 ng/ml , anemic women 12.4±30.4 ng/dl , and gestational diabetic women 10.4±18 ng/dl .6 - The serum levels of C - reactive protein recorded to be increased in 36.6% of preeclamptic women in comparison with 10% of anemic women and 27% of gestational diabetic women, while all the healthy women showed negative result to this test.The biochemical study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of glucose of preeclamptic women 13.7±103.4 mg/dl in comparison with anemic women 11.9 ±76 mg/dl, but not significant with healthy women 10.4±86.3 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 19.9±163.4 mg/dl .2 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of total cholesterol of preeclamptic women 41.8 ±217.5mg/dl in comparison with anemic women 30.5 ±187.2 mg/dl, but not significantly with healthy women 19.5±195.5 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 41±221.9 mg/dl.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of urea of preeclamptic women 13.6 ±35.6 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 4.9±22.2 mg/dl , 6.4± 23.9 mg/dl and 5.7±24 mg/dl respectively.4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of creatinine of preeclamptic women (0.4 ±1.1 mg/dl) in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.2 ±0.6 mg/dl , 0.2 ± 0.6 mg/dl and 0.2±0.7 mg/dl respectively.5 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of uric acid of preeclamptic women 2.5 ±7.4 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.9 ±3.7mg/dl , 1.2 ± 4.1 mg/dl and 1.1±4.6 mg/dl respectively.6 - There was no significant difference in the levels of GOT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.7 - There was no significant difference in the levels of GPT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.8 - There was no significant difference in the levels of alkaline phosphates enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.The hematological study showed following features : - 1 - The hemoglobin's level remain within its normal range in preeclamptic women , and gestational diabetic women , as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who showed a significant decrease (P<0.001) the mean was 0.9± 9.2 g/dl. 2 - The hematocrit level remain within its normal range in preeclamptic women, and gestational diabetic women, as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who revealed a significant decrease (P<0.001) the mean was 2.8 ± 28.2 % .3 - A significant increase (P<0.001) in the counts of white blood cells in preeclamptic women 3.7 ±12.2 × 109 /L. in comparison with healthy women , anemic women and gestational diabetic women, 1.9 ±9.1×109/ L , 2.1 ± 8.8×109 / L and 2.6 ±8.8×109 / L respectively.4 - There was no significant difference in the platelets counts in preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.

دراسة تاثير الغشاء الحيوي المنتج بواسطة Klebsiella pneumonia المعزولة سريريا على بعض جوانب الجهاز المناعي == Study the Effects of Biofilm of Klebsiella pneumoniae Isolated Clinically on Some Immune System Aspects

Author name: سرى مؤيد عباس العبيدي
Supervisor name: علي حسين علوان العامري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد بكترياKlebsiella pneumoniae من الممرضات الخطرة التي بامكانها ان تسبب اصابات حادة, شملت الدراسة عزل 50 عزلة من البكتريا من مصادر سريرية مختلفة من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد (مستشفى ابن البلدي, مستشفى الكندي التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب) لغرض دراستها من محاور عدة بعد ان شخصت البكتريا اعتمادا على الطرق التقليدية بالتشخيص من حيث صفاتها الزرعية والكيموحيوية فضلا عن استعمل جهاز vitek2 compact system لتاكيد التشخيص, اظهرت نتائجنا ان عدد ونسبة عزلات بكترياKlebsiella pneumoniae التي تم الحصول عليها وفقا للمصادرالسريرية (الادرار,الدم ,القشع، حروق, مسحة الاذن ، القيح, الجروح والخروج) كانت 22 (44٪)، 11 (22٪)، 4 (8٪),4 (8٪), (3) (6٪)، 3 (6٪)، 2 (4٪) و1 (2٪) على التوالي. المحور الاول ركز على دراسة المقاومة للمضادات المختلفة وتحديد التركيز الادنى للمضادات الحيوية لتثبيط نمو البكتريا, استعملت المضادات الاتية (,amikicin, azteronam cefepime ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin (trimethoprim/ sulfamethoxazole and لوحظ ان المضادات amikicin, impenem meropenem and اكثر فاعلية ضد هذه البكتريا. من جهة اخرى اظهرت العزلات قدرة مختلفة على انتاج الغشاء الحيوي، حيث استخدمت في هذه الدراسة طريقتان لمعرفة قدرة العزلات لتشكيل الغشاء الحيوي، وكالتالي كانت النسبة في طريقة Congo - Red Agar (CRA) 72 % مكونة للغشاء و20 % غير منتجة و8 % غير محددة الانتاجية, في حين طريقة اطباق المعايرة الدقيقة 80 % مكونة و20 % غير قادرة على تكوين الغشاء. العزلات الاقوى لانتاج الغشاء الحيوي اختيرت لمعرفة مقاومتها للمضادين Ciprofloxacin and Meropenem لاجراء مقارنة المضادات بين الخلايا المفردة والخلايا المكونة للغشاء الحيوي, حيث اظهرت النتائج ان المقاومة للمضادات تصبح اكثر بحوالي 10 مرات بالنسبة للخلايا المكونة للغشاء الحيوي مقارنة مع الخلايا المفردة. المحور الثاني تضمن اجراء التجارب المناعية وشملت عملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة وعملية البلعمة, اجريت هذه التجارب على اكفا عزلتين من كل مصدر من ناحية تكوين الغشاء الحيوي والاكثر مقاومة للمضادات الحيوية, من ناحية اخرى عرضت هذه العزلات لمصدر الاشعة فوق البنفسجية بطول موجي 240 نانوميتر ولمدة نصف ساعة وذلك لاجراء مقارنة بين العزلات نفسها قبل وبعد التعرض وتاثير ذلك على استجابة الجهاز المناعي داخل وخارج الجسم الحي. حيث اظهرت التحليلات الاحصائية وجود فروق عند مستوى معنوية (0.001) لعملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة (داخل الجسم الحي) والبلعمة (خارج الجسم الحي) عند المقارنة مابين العزلات قبل وبعد التشعيع ومابين البكتريا في حالة كونها خلايا مفردة وفي حالة تكوينها الغشاء الحيوي, يدلل ذلك ان الجهاز المناعي اكثر فاعلية ضد الخلايا المفردة من الخلايا المكونة للغشاء الحيوي وللعزلات نفسها قبل وبعد التشعيع.اخيرا اجريت دراسة للتحري عن نسبة وجود الجينات التي يعتقد انها مسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي بواساطة جهاز تفاعل البلمرة التسلسلي وكانت النسبة للجين mrkA 92% وللجين mrkD 50% في العزلات الغير مشععة واصبحت النسبة 53% MrkA و23% MrkD للعزلات بعد التشعيع. كخلاصة هذه النتائج تؤيد ان الاستجابة المناعية ضد البكتريا المكونة للاغشية الحيوية هي اقل كفاءة والتي تضمنت في الدراسة عنها للخلايا المفردة ومما يعني نحن بحاجة لاجراء دراسات اخرى تشمل للجوانب المناعية الاخرى المتخصصة في استجابة الجهاز المناعي. | Klebsiella pneumoniae is a dangerous pathogens that can cause severe diseases. This study included the isolation of 50 isolates of bacteria from different clinical sources from different hospitals in Baghdad city (Ibn - albalady hospital, Teaching Al - Kindy hospitals and Teaching laboratory in medical city hospitals through August 2014 to December 2014) for the purpose of examination of several axes after confirmation the diagnosis of bacteria depending on traditional methods of diagnosis in terms of relying on cultural and biochemical characteristics then used vitek2 a compact system. These results showed that the number and percentage of isolate according to the sources (urine, blood, sputum, burns, ear swabs, pus, wounds and stool ) were 22(44%), 11(22%), 4(8%), 4(8%), 3(6%), 3(6%), 2(4%) and 1(2%) respectively. The first axis of this studies focused on the isolates resistance to different antibiotics and determination the minimum inhibitory concentration of antibiotics ( amikicin, azteronam, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin, trimethoprim/ sulfamethoxazole) that inhibits the growth of bacteria, the obtained results showed that the antibiotics amikicin, impenem and meropenem more effective against the isolates. On other hand the isolates showed different ability to produce biofilms, to examine this ability two methods were used (Congo - red agar methods and Tissue culture plate methods), the percentage of isolates formed biofilms in method (CRA) 72% produce biofilm and 20% non productive and 8% non - specific in CRA, while in TCP method 80% composed and 20% are not able to form the membrane. Higher production of biofilms isolates were exposed to Ciprofloxacin and Meropenem to make a comparison the antibiotic resistance between planktonic and biofilms producers isolates, the results showed that resistance to antibiotics became 10 times higher than planktonic. The second axis was the immunological experiment which included opsonization, bactericidal activity and phagosytosis. The strongest isolates that were chosen from each sources depended on biofilms formation, and antibiotic resistance, the same isolates were exposured to radiation by UV light wave length 240nm for 30min to compare between the same isolates after and before radiation to determine the immune response. Statistical analysis showed a significant differences P (0.001) to all immunogical experiments opsonization and bactericidal (preformed in vivo for wild and mutant type) activity phagocytosis (preformed in vitro for bacteria in planktonic and biofilm form). The immune system response was more effective against planktonic than biofilms formation bacteria to phagocytosis and between isolates for bactericidal assay and opsonization after and before radiation. Finally the genetic study used serial polymerase chain reaction to determine the proportion of the presence of genes that are believed to be responsible of biofilm production ratio was mrkA 92% and mrkD 50% of wild isolates that became at ratio 53.8% mrkA and 23% mrkD in isolates after radaiation, as a conclusion these findings support that immune response to bacteria vital constituent of membranes differ from the response in the case of single cells and there is need to make other immunological studies include specialized aspects of the immune system response.

تحضير الدقائق النانوية لاوكسيد واوكزالات النحاس ودراسة فعاليتها ضد بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المعزولة من اصابات الحروق والجروح == Preparation of Copper Oxide and Oxalate Nanoparticles and Their Effects Against P.aeruginosa and Methicillin - Resistant S.aureus from Burn and Wound Infections

Author name: سرمد فاروق هادي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ست وثمانون عينة سريرية (57 من الجروح و29 من الحروق) من مرضى مصابين بانواع مختلفة من الجروح والحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد وهي : مستشفى اليرموك التعليمي ومستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الحروق في مدينة الطب خلال الفترة من ايلول الى كانون الاول 2014. العينات المجموعة فحصت باستخدام ملون كرام ثم زرعت على اوساط اكار الدم واكارالماكونكي بالاضافة الى الاوساط التفريقية الانتقائية (وسط اكار السيدوموناس لعزل Pseudomonas aeruginosa ووسط المانيتول الملحي لعزل (Staphylococcus aureusكما اجريت الاختبارات الكيموحيوية التالية : الكاتاليز والاوكسديز والكواوكيوليز واختبار API 20 NE لغرض تشخيص الـ P.aeruginosa بالاضافة الى ذلك، وبالاعتماد على نظام VITEK2 compact تم اجراء الاختبار التاكيدي لتشخيص P.aeruginosa وS.aureus كشف الزرع البكتيري لـ 86 عينة الماخوذة من الجروح والحروق، ان 75 عينة )%87.2 ( وجد فيها نمو بكتيري هوائي (عينات ايجابية)، بينما العينات السلبية كانت (11) ونسبتها 12.8 %. اظهر زرع عينات الحروق والجروح نسبة عالية %)45.3 ( ,34 عزلة من P.aeruginosa وبالتالي اقترح ان يكون هو المسبب المرضي الاكثر شيوعا، بينما S. aureus كانت نسبتها 28.0 % (21 عزلة). تم زرع جميع عزلات S. aureusعلى وسط agar CHROM حيث سجلت 66.6 %منها كانت مقاومة للمثسيلين اي Methicillin Resist Staphylococcus aureus (MRSA) و33.3 % حساسة للمثسيلين ايMethicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) ، نفس النتائج اعلاه تم الحصول عليها باستعمال طريقة Cefoxitin disc diffusion. خضعت 34عزلة عائدة لبكتيريا P.aeruginosa لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية قيد الدراسة، واظهرت النتائج ان كل العزلات %100.0كانت مقاومة للمضادات Carbenicillin وDoxycycline في حين اظهرت مقاومة عالية نسبيا للمضادات الاتية Amoxicillin /Clavulanic acid % 85.3% Cefipime , , 82.4 Netilmicin 76.5% واخيرا Azetreonam 61.8% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Gentamicin ,35.3% Tobramycin 32.4% واخيرا Ciprofloxacin ,29.4 % بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لمضاد% Imipenem 14.7 . من جهة اخرى, خضعت 21 عزلة عائدة لبكتريا S.aureus لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية واظهرت مقاومة عالية نسبيا لكل من Azithromycin ; 76.2% Cefoxitin Clathromycin; 66.7% 62.0% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Chloramphenicol ,%47.6 42.9% Ciprofloxacin Doxycycline, 38.0% بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لكل من Gentamycin , 19.0% Tobramycin Vancomycin , 14.3% 9.5% واخيرا Clindamycin . 9.5% تم تحضير دقائق نانوية لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس بنجاح بطريقة كيمياوية مرنة مستندة على التفكك الحراري لمواد اولية من حامض الاوكزاليك. تم تشخيصها باستعمال الطرق التالية : التحليل النمطي من انحراف الاشعة السينية (XRD) ، والمجهر الالكتروني الماسح (SEM) والتحويل الرباعية لامتصاص الاشعة تحت الحمراء(FT - IR) . تم قياس الفعالية المضادة للبكتيريا لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس النانوية المحضرة لكل من P.aeruginosa وMRSA باستعمال طريقة الانتشار في الحفر وطريقة تخفيف المرق. بينت النتائج بان كلا النوعين من الدقائق النانوية لها القدرة على منع نمو عزلات البكتيريا تحت الدراسة. كما تم تحديد التركيز المثبط الادنى MIC والتركيز القاتل الادنى MBC لكلا النوعين من الدقائق النانوية حيث كانت قيم MIC وMBC لاوكسيد النحاس ضد P.aeruginosa في التراكيز 1600 و3200 مايكروغرام/مل على التوالي، في حين كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/ مل على التوالي. اما بالنسبة لـ MRSA فان قيم MIC وMBC للدقائق النانوية لاوكسيد النحاس كانت في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/مل على التوالي، بينما كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس النانوية في التراكيز 200 و400 مايكروغرام/مل على التوالي. | Eighty six clinical samples (57 wounds and 29 burns swabs) were collected from patients with different types of wounds and burns from hospitals in Baghdad City : Al - Yarmuk Teaching Hospital, Baghdad Teaching Hospital and Burn Hospital in Medical City at a period between September to December 2014. The collected samples were examined by Gram stain then cultured on Blood agar and MacConkey agar media, as well as differential selective media including Pseudomonas agar for isolation of Pseudomonas aeruginosa and Mannitol salt agar for isolation of Staphylococcus aureus bacteria. The following biochemical tests were performed : catalase, oxidase, coagulase tests, and API 20 NE in order To diagnose P.aeruginosa. Additional, Confirmatory test was performed by using VITEK2 compact system in order To identify P.aeruginosa and S.aureus. The results of bacterial cultures revealed that out of 86 samples obtained from burns and wounds, 75 samples forming 87.2 % were observed to have an aerobic bacterial growth (positive samples), while negative samples, (11) represented 12.8%. The results of bacterial culture from burn and wound samples revealed high percentage of 45.3% of P.aeruginosa (34 isolates). Hence, it was suggested to be the most common pathogen, while S.aureus represent 28.0% (21 isolates). All isolates of S.aureus were cultured on CHROM agar medium which revealed that 66.6 % of them were Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and 33.3% Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), the same results were obtained by using Cefoxitin Disc Diffusion method. The Antibiotic sensitivity test on thirty four isolates of P.aeruginosa showed that all isolates 100.0% were resistant to Carbenicillin and Doxycycline; relatively high resistance to Amoxicillin/Clavulanic acid, 85.3 %; Cefipime, 82.4 %; Netilmicin, 76.5 % and Azetreonam, 61.8 %. These isolates have relatively moderate resistance to Gentamicin, 35.3%; Tobramycin, 32.4%; Ciprofloxacin, 29.4%, and relatively low resistance to Imipenem, 14.7 %. On the other hand, (21) isolates of S.aureus were tested for antibiotics sensitivity, indicating relatively high resistance to Azithromycin, 76.2%; Cefoxitin, 66.7% and Clathromycin, 62.0%. They also have relatively moderate resistance to Chloramphenicol, 47.6%; Ciprofloxacin, 42.9%, Doxycycline, 38.0% and relatively low resistance to Gentamycin, 19.0%; Tobramycin, 14.3%; Vancomycin, 9.5 % and Clindamycin, 9.5%.Copper oxide and oxalate nanoparticles were prepared successfully via soft chemistry route based on the thermal decomposition of oxalic precursors. They were obtained with a well - controlled morphology and particle size. These nanoparticles were characterized by using : X - ray diffraction (XRD) pattern analysis, Scanning Electron Microscope (SEM) and Fourier Transform Infra - Red spectroscopy (FT - IR). The antibacterial activity of the obtained copper oxide and oxalate nanoparticles against P.aeruginosa and MRSA were estimated by using Well Diffusion and Broth Dilution methods. The results showed that both types of nanoparticles have the ability to inhibit growth of the bacteria under study. The Minimal Inhibitory Concentration (MIC) and Minimal Bactericidal Concentration (MBC) of copper oxide nanoparticles against P.aeruginosa were found to be 1600 and 3200 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively. For MRSA, the MIC and MBC values of copper oxide nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 200 and 400 µg/mL respectively

دراسة مقارنة لازالة سمية الافلاتوكسين B1 وM1 باستخدام بعض الطرائق البايولوجية والفيزيائية == Comparative Study for Detoxification of Aflatoxins (B1 and M1) by Using Some Biological and Physical Methods

Author name: سجى يحيى عبد الجليل ابراهيم
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي | لبيب احمد الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Anbar
Language: Arabic
University location: Anbar
First pages:
Abstract: بعد تلوث الاغذية والاعلاف بالافلاتوكسين(AFB1) B1 احد اسباب المشاكل الاقتصادية والصحية الخطيرة . ووجدت الافلاتوكسين (AFM1) M1 في منتجات الالبان عندما تستهلك الحيوانات المرضعة علفا ملوثا بالافلاتوكسين B1 . تهدف الدراسة الحالية الى الكشف عن مستوى AFB1 في عينات اعلاف الحيوانات اللبنية ومستوى AFM1 في عينات منتجات الالبان في الاسواق المحلية باستخدام تقنيات مختلفة (استشراب الطبقة الرقيقة TLC، الاستشراب السائل عالي الاداء HPLC والممتز المناعي المرتبط بالانزيم ELISA). ودراسة الكفاءة الفيزياوية (تطبيق البلازما غير الحرارية)، فضلا عن الازالة السمية الحيوية (biodetoxification) لـسموم الافلاتوكسنات AFB1 وAFM1 من عينات الاعلاف والحليب على التوالي. وشملت الدراسة 275 عينة من اعلاف الحيوانات اللبنية والبان غذائية من مختلف مناطق بغداد خلال الفترة اذار 2014 - مايس 2015. تضمنت عينات اعلاف الحيوانات اللبنية 145 عينة موزعة على 55 عينة مستوردة و90 عينة محلية ، شملت كل منهما الذرة والقمح والشعيرو فول الصويا واعلاف الحيوانات اللبنية الكاملة والقش، بينما تكونت عينات منتجات الالبان من 130 عينة موزعة على 65 عينة مستوردة ومحلية لكل منهما وشملت الحليب السائل ، الحليب المجفف ، الجبن الابيض والناعم ، فضلا عن اللبن. بينت النتائج عدم وجود فرق معنوي (p≤0.05) بين تقنيتي HPLC وELISA %44.8) و41.3% على التوالي( لكشف AFB1 في عينات اعلاف الحيوانات اللبنية وAFM1 ) 50% و53.8% على التوالي) في عينات منتجات الالبان، التي قد تشير الى حساسيتهما وخصوصيتهما. في حين ان هنالك فرق معنوي (p≤0.05) بالمقارنة مع تقنية TLC (%37.9 عن AFB1 و38.5% عن AFM1). اظهرت تقنية ELISA مستوى اعلى اداء من HPLC في النتائج اذ تمكنت من الكشف عن اوطا تركيز 0.001 نانوغرام/غرام من AFB1 في القمح المحلي في حين HPLC تمكنت من الكشف عن اعلى تركيز 817.9 نانوغرام/غرام للــ AFB1 في القش المحلي ، فضلا عن قدرة ELISA في الكشف عن اوطا واعلى تركيز من AFM1 في الجبن المحلي عند (0.3 و939.67) نانوغرام / لتر على التوالي كانت اعلاف الحيوانات اللبنية الكاملة المستوردة ملوثة جميعها بــ AFB1 وبنسبة تلوث اكثر من المحلية. في حين كانت الذرة والقمح والقش المحلية اكثر تلوثا بــ AFB1 من المستوردة، بينما فول الصويا المحلي والشعير اوطا تلوثا. ان اعلى مستوى من التلوث بــ AFM1 في اللبن والحليب والجبن المحلي والمستورد يمكن ان تشكل خطرا على الصحة العامة. اظهرت الازالة السمية الفيزيائية بتطبيق البلازما غير الحرارية بان 10 ثانية كان افضل وقت تعرض لازالة سموم AFB1 وAFM1 من عينات اعلاف الحيوانات اللبنية والحليب الملوث على التوالي، عندما كان زمن التعرض عند (5 و10 و15) ثانية وحدها. تضمنت الازالة السمية الحيوية المعالجة بعترة الخميرة (Saccharomyces cerevisiae) وعترة البكتيريا (Streptococcus salivarius) في تراكيز متسلسل (1.5 × 104 - 1.5 × 108) خلية / مل، واظهرت النتائج ان افضل تركيز للعترتين البكتيرية والخميرة كان 1.5 × 108 خلية / مل لازالة سمية AFB1 وAFM1 من عينات الاعلاف والحليب على التوالي. | Contamination of feed and food by Aflatoxin B1(AFB1) is a cause of serious economic and health problems. Aflatoxin M1(AFM1) is found in dairy products when lactating animals consume feed contaminated with AFB1.The current study aimed to detection of AFB1 level in dairy animal's feed samples and AFM1 level in dairy food samples at the local markets using different techniques : (Thin Layer Chromatography (TLC), High Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Enzyme Linked Immune Sorbent Assay (ELISA), also study the efficiency of physical (non - thermal plasma application) , in addition to biodetoxification of AFB1 and AFM1 from feed and milk samples respectively .The study included collection of 275 dairy animal's feed and dairy food sample from different regions of Baghdad during March 2014 - June 2015. The dairy animal's feed samples consists of 145 sample distributed into 55 imported sample and 90 locale sample , each of them included corn, wheat, barley, soybeans, complete dairy animal's feed and straw ,While the dairy food samples consists of 130 sample distributed into 65 imported and local sample, each one of them included liquid milk, powder milks, white and soft cheeses, in addition to yoghurt . There was no significant (p≤0.05) difference in the result between HPLC and ELISA techniques in detection of AFB1 (44.8% and 41.3%, respectively) from dairy animal's feed samples and AFM1 (50% and 53.8%, respectively) from dairy food samples, that may refer to their sensitivity and specificity. While have significance (p≤0.05) difference when compared it with TLC technique (37.9% of AFB1 and 38.5% of AFM1). The ELISA technique has highest performance than HPLC , that can detect lowest concentration of AFB1 at 0.001 ng/g in the local wheat ,but HPLC can detect highest concentration of AFB1 in the local straw at 817.9 ng/g., in addition to ability of ELISA to detect lowest and highest concentration of AFM1 in the local cheese at (0.3 and 939.67) ng/L respectively . All the imported complete dairy animal's feed samples were contaminated with AFB1 more than locally samples . While the local corn, wheat and straw were more contaminated with AFB1 than imported; while local soybean and Barley were less contaminated. The highest level of AFM1 contamination was obsorved in the local and imported yogurt , milk and cheese which could be a serious risk for the public health .The physical detoxification using non - thermal plasma application showed that 10 seconds was the best exposure time for detoxification of AFB1 and AFM1 from contaminated dairy animal's feed and milk samples respectively , when exposure time was at (5, 10 and 15) seconds alone. The biodetoxification include treatment with yeast strain (Saccaromyces cerevisiae) and bacterial strain (Streptococcus salivarius) at alone in serial concentrations (1.5 x 104 - 1.5 x 108) cfu/ml, the results showed that the best concentration of bacterial and yeast strains was 1.5 x 108 cfu/ml for detoxification of AFB1 and AFM1 from feed and milk respectively.

تقييـم كفاءة وحـدة المعالجـة فـي شركـة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتريا في الازالة الحيوية لعنصري النحاس والرصاص == Evaluating the Efficiency of Treatment Unit in Diyala Electrical Industries Company and Use of Bacteria in the Vital Element for the Removal of Copper and Lead

Author name: ساهرة حسين حسن الخالدي
Supervisor name: فكرت مجيد حسن | عدنان نعمة عبد الرضا
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت هذه الدراسة تقييم كفاءة محطة معالجة مياه الصرف الصناعي والمنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتيريا المعزولة من المحطة للمعالجة البيولوجية. اخذت العينات شهريا من المحطة قبل المعالجة وبعدها للمدة من تشرين الثاني 2014 الى اذار .2015 وتم قياس بعض العوامل الفيزيائية مثل : درجة الحرارة والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) والتوصيل الكهربائي(EC) والملوحة. كما تم قياس تراكيز خمسة معادن ثقيلة وهي الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك .اظهرت النتائج وجود فرق معنوي قبل المعالجة وبعدها لدرجة الحرارة في كانون الاول عام 2014 فقط ، وقد تراوحت قيمها بين17.7م° في شباط 2015 الى 29.1مº في كانون الاول 2014 قبل المعالجة و16.6 ºم الى 26.01 مº في شباط 2015 وتشرين الثاني 2014، على التوالي. في حين لم يسجل قيم الاس الهيدروجيني فروق معنوية في جميع مرحل الدراسة قبل وبعد عملية المعالجة، اذ تراوحت القيم على النحو الاتي : 7.4 - 6.8 ( قبل ) في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي,) 7.01 - 7.8 بعد( في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي.سجلت النتائج ارتفاع تركيز الاوكسجين المذاب في وحدة المعالجة في مراحل الدراسة كلها، الا في شباط 2015، وتراوحت تراكيز الاكسجين المذاب 5.5 - 2.8جزء بالمليون في اذار 2015 وشباط 2015 و7.8 - 3.95جزء بالمليون في شباط 2015 وكانون الاول 2014 قبل المعالجة وبعدها على التوالي. كما لحظ انخفاض المتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) بعد المعالجة فتراوحت تراكيزهما 144 - 13) ) جزء بالمليون بالنسبة لقيم COD و(39.9 - 0) جزء بالمليون لقيم BOD . سجلت النتائج انخفاضا في قيم التوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰) في كانون الاول 2014 وشباط 2015 فقط، وتراوحت قيم التوصيلية الكهربائية على النحو التالي(1547 - 209) مايكروسمنز/سم قبل المعالجة و(448 - 1218) مايكروسمنز/سم بعد المعالجة. اما بالنسبة لقيم الملوحة فتراوحت بين ( 0.12 - 0.96) جزء بالالف قبل المعالجة و(0.27 - 0.75) جزء بالالف بعد المعالجة. لم يسجل فرق معنوي كبيرلتراكيزالعناصر الثقيلة المدروسة, اذ سجلت اعلى تراكيز لها ( 0.53و 0.99 و0.68و 0.7و(0.25 جزء بالمليون لمعادن الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك قبل المعالجة. في حين كانت تراكيزها بعد المعالجة ( 0.45و 0.41 و0.7 و0.7 و0.36) جزء بالمليون للرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك.تم عزل 60 عزلة بكتيرية من محطة المعالجة واستعملت ثلاثة انواع من البكتريا المعزولة وهي Pseudomonas aeruginosaوEscherichia coli وSulfate Reducing Bacteria. واستعملت في المختبر كعامل امتزاز , كما استعملت تراكيز مختلفة من الرصاص والنحاس100)و 150 و200) جزء بالمليون لاختباركفاءة امتزاز البكتريا المعزولة. فضلا عن ذلك تم اختبار تاثير ثلاثة عوامل مؤثر في امتزاز الرصاص والنحاس وهي الحرارة 25) و30و 37) مº ومستويات مختلفة من الاس الهيدروجيني (3و4.5 )، فضلا عن مدة التماس استخدمت مدتين ( 2 و24 ) ساعة .تم الحصول على نسب عالية لامتزازالرصاص وكما ياتي 95% و95.3% و99.7% للبكتريا E.coli , P. aeruginosaو SRBعند37مᵒ على التوالي. بينما كانت نسب امتزاز النحاس 40.63% و% 50.51و %80.57 للبكتريا E.coli , P. aeruginosa وSRB. عند درجة حرارة 37مº, على التوالي. اظهرت E.coli نسبا مختلفة من الامتزاز للمعادن تراوحت من 6.4% الى 95% في تركيز الرصاص من100 و200 جزء بالمليون وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 لكل من فترات التماس 2 و24 ساعة على التوالي . في حين تراوح امتزاز النحاس من3.5% الى %40.63 في 100 و200 جزء في المليون عند اس هيدروجيني 4.5 وخلال مدة تماس 2 و24 ساعة , على التوالي .حققت P. aeruginosa امتزازا على النحو الاتي : تراوح امتزاز الرصاص من 1.39٪ في التتركيز150 جزء في المليون الى 97.9٪ في200 جزء في المليون عند قيمة الاس الهيدروجيني3 وبفترات تماس 2 و24 ساعه على التوالي. اظهرت SRB فعالية امتزاز اكبر من الانواع البكتيرية الاخرى المستخدمة في الدراسة, وقد تراوح امتزاز الرصاص من 14.97% بتركيز 100 جزء من المليون وقيمة الاس الهيدروجيني ولفترة تماس 24 ساعة الى 99.32% في تركيز الرصاص200 جزء في المليون وقيمة الاس الهيدروجيني 3 وبفترة تماس 2 ساعة. سجلت النتائج وجود فروق معنوية في درجات الحرارة عند استخدام بكتيريا SRB في امتزاز النحاس الرصاص.واظهرت النتائج اعلى نسبة امتزاز عند 200 جزء بالمليون للعناصر كلها كما اظهرت ان هذا النوع من البكتريا قادرة على امتزاز الرصاص بمعدلات اعلى من النحاس . وفضلا عن ذلك، تم تسجيل زيادة امتزاز المعادن في درجة حرارة 37مᵒ وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 وعند مدة تماس 2 ساعة لانواع البكتريا التي شملتها الدراسة. وسجلت انواع البكتريا لمعزولة تباينا في كفاءة الامتزاز للعناصر , اذ كانت كفاءة امتزاز Sulfat Reducing Bacteria اعلى من P.aeruginosa وE.coli ، بينما كانت كفاءة امتزاز P.aeruginosa اعلى من E.coli.كشفت الدراسة ان محطة المعالجة ليست فعالة لازالة المعادن الثقيلة من مياه الصرف الصناعية والاستخدام المنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية لذا تحتاج المعالجة البايولوجية اضافة انواع من البكتريا قيد الدراسة والتي اثبتت كفاءتها في ازالة المعادن الثقيلة اذا تبين من الدراسة ان SRB هو البكتيريا الاكثر فعالية لازالة عنصري النحاس والرصاص من محاليلها المائية تليها بكتريا P.aeruginosa. | This study is conducted to evaluate the efficiency of plant treatment of the industrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries, and to use the isolated bacteria from the treatment plant for bioremediation. Sampling were taken monthly from pre and post - processing treatment during the period from November, 2014 to March, 2015. Some physicochemical factors were taken such as : temperature, pH, dissolved oxygen, Biological oxygen demand (BOD), chemical oxygen demand (COD), electrical conductivity, and salinity. In addition, the concentration of five heavy metals was determined such as : lead (Pb), cadmium (Cd), iron (Fe), Copper (Cu) and Zinc (Zn). Temperature of wastewater in treatment plant showed only a significant difference between temperature before and after treatment in December, 2014, it's values were ranged between 17.7°C in February 2015 to 29.1°C in December 2104 before the treatment, and 16.6°C to 26.01°C in February 2015 and November 2014, after treatment. Whereas, pH was not significant in all study periods before and after treatment process. Its values were ranged as follows : 6.8 - 7.4 (before) in December 2014 and March 015, respectively and 7.01 - 7.8 (after) in December 2014 and March 2015, respectively. Dissolved oxygen concentration was raised after treatment process during all the study periods, except in February2015, the concentrations of dissolved oxygen were ranged 2.8 - 5.5ppm in March 2015 and Februray 2015 and 3.95 - 7.89ppm in February2015 and December 2014 before and after treatment process, respectively. Biochemical oxygen demand (BOD) and Chemical Oxygen demand (COD) concentrations were decreased after treatment, their concentrations were ranged from 13ppm to 144ppm (COD) and 0 - 39.9ppm (BOD), the lowest values refer to after and the highest values were before treatment process. Electrical conductivity (EC) and salinity (S‰) values were decreased only in December 2104 and February 2015, they were ranged as follows : 209 - 1547 ϻS/cm (before the treatment), 448 - 1218 ϻS/cm (after the treatment) for EC, 0.12 - 0.96 ϻS/cm (before the treatment), and 0.27 - 0.75 ϻS/cm (after the treatment) for S‰, spectively. All heavy metals concentrations were not effected scientifically by the treatment. Maximum concentrations (ppm) of these metals were 0.53, 0.99, 0.68, 0.7, 0.25 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn before the treatment. While their concentrations (ppm) after the treatment were 0.45, 0.41, 0.7, 0.7 and 0.36 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn. Sixty isolates of bacteria were isolated from the treatment plant. Three isolated bacteria (Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Sulfate Reducing Bacteria) were used in the laboratory as an adsorbed factor. Different concentrations of Lead and Copper (100, 150 and 200 ppm) were used to investigate the potential adsorption of these isolated bacteria. In addition, three factors affecting lead and copper adsorption were studied. Different temperatures (25, 30, 37 °C), different levels of pH (3 and 4.5), and two contact time (2 and 24 hrs) were used in these experiments. Maximum adsorption of Lead were obtained for about 95%, 95.3% and 99.07% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. While Copper adsorption were 40.63%, 50.51% and 80.57% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. E. coli has attained different percent of metals adsorption. The adsorption was varied from 6.4% to 95% in lead concentration of 100 and 200 ppm at pH 4.5 for both values for 24hrs and 2hrs, respectively. While the Copper adsorption ranged from 3.5% to 40.63 in 100 and 200ppm at pH4.5 for 24hrs and 2hrs, respectively. P. aeruginosa has achieved the adsorption as follows : Lead adsorption was ranged from 1.39% (in lead concentration 150ppm) to 97.9% (in 200ppm) at pH3 for 24hrs and 2hrs contact time, respectively. SRB has more action in adsorption than other bacteria in this study. The adsorption of lead was ranged from 14.97% in 100ppm of its concentration at pH3 for 24hrs contact time to 99.32% in 200ppm of Lead concentration at pH3 for 2hrs contact time. The results recorded significant differences in temperature when sulfur bacteria was used in the adsorption of lead and recorded significant difference in the adsorption of copper. For heavy metals concentration, the results recorded the highest percentage adsorption at 200ppm concentration for both elements, also results showed that the type of bacteria were able to adsorb lead at higher rates than copper. Moreover, increased adsorption of metals was recorded at high temperature and pH4.5 for a 2hr contact time by the studied bacteria. The three isolated bacteria were varied in their abilities to adsorbed elements, the results recorded the adsorption efficiency of sulfat reducing bacteria was higher than P. aeruginosa and E. coli, while the adsorption efficiency of P. aeruginosa was higher than E.coli. This study revealed that the treatment plant are not efficient to remove the heavy metals from the indistrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries and it needs to add the efficiency bacteria to the plant wich removal heavy metals. The study concluded that SRB and P.aeruginosa are the most efficient bacteria to remove the Pb and Cu from their solution.

التحــري عن سم الباتيولين والفطريات المنتـجــه له في بعض انـواع الفاكــهـه المجـفـفه والسـيـطره عليـه بايولوجيا == Investigation for Patulin toxin producing from some fungi in dried fruits and its biological degradation

Author name: سامي جبار اسماعيل الجدياوي
Supervisor name: شذى علي شفيق | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسه في مختبرات دائرة البحوث الزراعية التابعة لوزارة العلوم والتكنولوجيا للتحري عن تلوث الفواكه المجففه ( المشمش - العنب) المعروضه في اسواق مدينة بغداد ومحافظة كربلاء بسم الباتيولين . اظهرت نتائج التحري عن سم الباتيولين في 21 عينه مختلفه من عينات (المشمش - العنب) المجففه اخذت من مناطق مختلفه من محافظة بغداد اضافة الى عينة من محافظة كربلاء وكانت جميع العينات المفحوصه ملوثه بسم الباتيولين وقد سجلت العينات الماخوذه من مناطق (عنب مجفف)كربلاءK و(مشمش مجفف) الشعلة D وشارع فلسطين C اعلى نسبة تلوث بلغت 30499.5) و2836.3 و1795.3 ) مايكروغرام /غم على الترتيب , في حين سجلت العينات الماخوذه من (مشمش مجفف) الحارثية I ومدينة الصدرS و(عنب مجفف) الحارثية G اقل نسبة تلوث بلغت حوالي (7.8 و11.7 (19.8 مايكروغرام /غم على الترتيب وتباينت درجة تلوث العينات بالفطريات اذ بلغت اعلى نسبة وجود على مستوى الاجناس كانت لجنس Aspergillus spp. حيث كانت نسبة وجوده 100% في عينة(عنب مجفف) الشعب H وبعدها عينات (مشمش مجفف) العطيفية N و(عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف) بغداد الجديدة U و(عنب مجفف) شارع فلسطين A والعلاوي J لنفس الجنس بنسبة (94.12 و94.44 و95.45 و95.56 و96.55)% على الترتيب . وفيما يخص لجنس Penicillium spp. فقد تراوحت نسبة وجوده في العينات من 0.0) - 46.15)% حيث سجلت اقل نسبة وجود في العينه (عنب مجفف) الشعب H 0.0% بينما كانت اعلى نسبة وجود في عينه (مشمش مجفف) كربلاء 46.15%. واظهرت نتائج التحري عن قابلية انتاج سم الباتيولين في 5 عزلات تعود الى A.flavus وA.fumigatus و3 عزلات من فطر P.expansum عزلت من عينات مختلفة هي (عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف)مدينة الصدر S و(عنب مجفف) العطيفية Z حيث ان فطر A.flavus وA.fumigatus لم ينتج سم الباتيولين نهائيا في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة مدينة الصدر والعطيفية انتج سم الباتيولين بعد مرور 5 ايام من تنيمته على الوسط المحفز لانتاج الباتيولين , في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة كربلاء انتج سم الباتيولين بعد مرور 15 يوم وسجلت العزله S اعلى قابليه على الانتاج بلغت 16.5 مايكروغرام/مل في وسط زرعي السائل GCA)) Glugose Czapek,s Apple في حين سجلت العزلة K اوطا قابليه على الانتاج بلغت (13) مايكروغرام / مل تحت نفس الظروف .اما الجانب الثاني من الدراسه فقد اظهرت نتائج ازالة السمية باستخدام المعزز الحيوي العراقي عند تركيز 0.03 ملغرام/مل في الوسط الزرعي السائل GCA الحاوي على الفطر المنتج لسم الباتيولين P.expansum K لمدة 14 يوم الى انخفاض تركيز سم الباتيولين الى 192.18مايكروغرام/مل مقارنة بمعاملة السيطرة ذات تركيز 325.01مايكروغرام/مل من سم الباتيولين , في حين لم يظهراي تركيز لسم الباتيولين عند فحصه بجهاز الـ High Performance liquid Chromatography (HPLC) عند التركيز 0.06ملغرام/مل من المعزز الحيوي العراقي تحت نفس الظروف السابقه. وفيما يخص فعالية استخدام تركيزين من خميرة Saccharomyce boulardii في ازالة سمية الباتيولين في الوسط الزرعي السائل GCA, استخدمت التراكيز( 108 و(1016خميرة/مل وفي كلا التركيزين تم ازالة السمية ولم يظهر اي تركيز لسم الباتيولين . | The results of Mycotoxin Patulin (PAT) detection in 21 samples of dried fruits (grape and apricot) collected from different locations at Baghdad city and one sample from Karbala governorate revealed that all tested samples were contaminated with PAT ,samples K , D and C which collected from Karbala ( dried grape) , Al - shoala (dried apricot) and Palestine Street (dried apricot) showed the highest contamination levels which recorded (30499.5, 2836.3 and 1795.3) µg/ml respectively , while the samples Al - Harthiya (I), Al - Sadr city (S) and Al - Harthiya (G) showed the lowest contamination levels which recorded (7.8 , 11.7 and 19.8) µg/ml respectively. The results also showed that Aspergillus spp. recorded the high percentage of occurrence 100% in sample H collected from Al - Shaab and in samples (N , K , U , A , J) collected from Al - Utaifiyya , Karbala , Baghdad al - jadeeda , Palestine Street and Al - Alawi , the percentage of occurrence is (94.12 , 94.44 , 95.45 , 95.56 , 96.55)% respectively. Also the percentage of Penicillium spp. occurrence percentage rated from 0.0 to 46.15% , samples dried grape which collected from Al - Shaab (H) recorded the lowest percentage of occurrence 0.0% , while sample apricot from Karbala (M) recorded the highest percentage 46.15% . The results of toxigenic ability of five fungal isolates include A.flavus and A.fumigatus and three isolates of P.expansum from three different samples include (K) Karbala (dried grape) , dried apricot of Al - Sadr city (S) and (Z) grape in Al - Utaifiyya . Regarding A.flavus and A.fumigatus were not produced PAT, while P.expansum isolate from S and Z recorded the ability to produce PAT after five days , while P.expansum isolated from K produced PAT after 15 days. The highest ability to produce PAT recorded in S 16.5 µg/ml, and the lowest ability in K 13 µg/ml. The second aspect of the present study was showed the ability of Iraqi probiotic at concentration 0.03 mg/ml to reduce PAT concentration in the culture medium Glucose - Czapeks Apple broth (GCA) containing of P.expansum K for 14 days which recorded 192.18 µg/ml comparing to control treatment 325.01 µg/ml while at concentration 0.06 mg/ml of Iraqi probiotic destroyed of PAT and there was no PAT appeared when examined in High Performance Liquid Chromatography (HPLC). However the results of test the ability of two concentrations of Saccharomyces boulardii (108 and 1016) yeast/ml in PAT detoxification from broth culture of (GCA) showed completely detoxification of Patulin

التاثير التداخلي للرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير Hordeum vulgare L. في وسط رمل == The Interference of Lead Mineral and Nitrogen on Barley Plant (Hordeum vulgare L.) Cultivated on Sandy Soil Culture

Author name: سارة يحيى المندلاوي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2009 - 2010 بهدف التعرف على تاثير الرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير في مرحلتي الانبات والبادرات كل على حدة فضلا عن التاثير التداخلي لهما.صممت تجارب الدراسة الحالية بتحضير اربعة تراكيز مختلفة من الرصاص (200, 150, 100, 50) جزء من المليون (ج.م.م.) اضافة لمعاملة المقارنة, فضلا عن المعاملة بثلاثة مستويات من السماد النتروجيني (اليوريا) (90, 60, 30) كغم/دونم اضافة لمعاملة المقارنة, والتحري عن تاثير كل من هذه التراكيز والمستويات بتجربة عاملية على عدد من الصفات المظهرية والفسلجية لنبات الشعير Hordeum vulgare L. في مرحلتي الانبات والبادرات فضلا عن التاثير التداخلي لكل من تراكيز الرصاص المحضرة مع مستويات السماد النتروجيني المذكورة سابقا. تم اجراء تجربتين في الدراسة الحالية, التجربة الاولى جرت في مختبر الدراسات العليا في قسم علوم الحياة بكلية العلوم - الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية (زراعة مائية) للفترة من 8 - 16/ تشرين الثاني/,2009 اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع للقسم المذكور نفسه من خلال زراعة بذور نبات الشعير في اصص بلاستيكية حاوية على تربة رملية لمدة خمسة واربعون يوما للفترة من 22/ تشرين الثاني ولغاية 7/ كانون الثاني/2010.اظهرت نتائج الزراعة المائية (مرحلة الانبات) عدم تاثر الصفات المدروسة بالمعاملة بتراكيز الرصاص المحضرة, بينما سجلت المعاملة بالسماد النتروجيني وجود انخفاض في معدلات كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة الانبات بغض النظر عن المعنوية من عدمها, فقد كانت نسب الانخفاض في معدلات الصفات المدروسة معنوية على كل من النسبة المئوية للانبات 35.29%, ومعدل الانبات 43.33%, ومؤشر تحفيز الانبات 37.09% وغير معنوية على قيم سرعة الانبات 34.23%. كما اظهرت نتائج المعاملة بتراكيز الرصاص في الزراعة الرملية (مرحلة البادرات) وجود تاثير معنوي سلبي في قيم كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة البادرات (عدا قيم محتوى الرصاص داخل انسجة النبات حيث كان التاثير معنوي ايجابي) فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي على كل من تركيز الكلوروفيل b والكلوروفيل الكلي.بينما اظهرت معاملة النبات بالسماد النتروجيني وبغض النظر عن تراكيز الرصاص وجود تاثير معنوي سلبي في كل الصفات المدروسة في مرحلة الانبات فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي في محتوى النبات لصبغات الكلوروفيل a وb والكلوروفيل الكلي. في حين سجلت زيادة مستويات السماد النتروجيني ارتفاعا معنويا في معدلات محتوى الرصاص داخل النبات وبنسبة بلغت 64.82%.اظهرت نتائج التداخل بين تاثير معاملتي الرصاص والتسميد النتروجيني وجود فروق معنوية في النسبة المئوية للانبات بالنسبة لمرحلة الانبات (الزراعة المائية), فيما سجلت فروق معنوية في جميع الصفات المدروسة في مرحلة البادرات (الزراعة الرملية) عدا صفة الوزن الطري للجذور ومحتوى الصبغات الكلوروفيلية

دراسة فسلجية وجزيئية للبكتريا Lactobacillus reuteri ATCC 23272 وتاثيرها التثبيطي على البكتريا المسببة لالتهاب المهبل == Physiological and Molecular Study of Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and its Inhibitory Effect on the Bacterial Vaginosis

Author name: سارة هيثم صديق النعيمي
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Bacterial vaginosis which is a common infection affecting the female genital tract, can be treated with different methods. One of these methods is the use of probiotic Lactic acid bacteria. The aim of this study was to evaluate the effects of two physiological factors (temperature and pH) on the growth and inhibitory action of probiotic Lactobacilli against the pathogenic Streptococcus agalactiae involved in bacterial vaginosis.A total of one hundred and six vaginal swabs were collected from Iraqi women patients affected with bacterial vaginosis, who attend Gynecological Department of Kamal Al - Samarraiy Hospital, Al - Qanat health care center, and private specialized clinics from October 2014 till March 2015, in order to obtain one hundred Streptococcus species. These swab samples were examined directly at the first. Isolated microorganisms were identified through microscopical, morphological, biochemical tests, and Vitek 2 compact system.The results showed that out of 243 bacterial isolates, 146 (60.08%) were detected as Gram - positive bacteria, whereas 97 (39.91%) were detected as Gram - negative bacteria. A hundred (68.49%) isolates of the Gram - positive bacteria were catalase - negative, while the rest 46 (31.51%) were catalase - positive.For all Gram positive, catalase negative bacteria, the results of the biochemical test and Vitek 2 compact system showed that the most frequent isolated microorganism was Streptococcus agalactiae 57 (57%), followed by Streptococcus faecalis 19(19%), Streptococcus sanguinis 13 (13%),Streptococcus salivarius 6 (6%), Streptococcus ovis 4 (4%), and Streptococcus suis 1(1%).The molecular method using the PCR technique was performed on the most prevalent species Streptococcus agalactiae to detect its virulence factors in order to prove its pathogenicity, the results revealed that, the HylB gene which is responsible for the production of hyaluronate lyase, appeared in 56 out of 57 isolates of S. agalactiae and the CylE gene which is responsible for the hemolysis of the red blood cells, appeared in 53 out of 57 isolates. These virulent isolates were involved in the physiological study.Lactobacillus reuteri ATCC 23272 was used in this study to investigate its effect as probiotic bacteria on the pathogenic bacteria (S. agalactiae). It was cultivated in MRS broth, adjusted to specific initial pH (3.5, 5, 6.5, 8), and at different temperatures of incubation (25°C, 30°C, 37°C, 44°C).The results revealed that the temperature of incubation and the initial pH of the culture medium effected significantly on both the growth rate and the antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272. The temperature 30 °C with the pH 5 were recorded as the best conditions for the antibacterial activity in which the zone of inhibition was (18.2 mm), while the temperature 25 °C with the pH 3.5 resulted in the lowest inhibition zone (0.05mm).The maximum growth rate with an O.D. 1.9297 nm of the L. reuteri ATCC 23272 was obtained at temperature. 30°C and pH 6.5, and the minimum growth rate with an O.D. 0.0002 nm were obtained at temperature 25 °C and pH 3.5.There was a positive correlation between the growth rate of the Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and the zone of inhibition.The optimal growth conditions were recorded in MRS broth, with an initial pH of 5 and a temperature of 30°C and this condition also had parallel effect on the maximum antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272 against S. agalactiae associated with bacterial vaginosis.

استخلاص وتنقية جزئية للكتينات بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات مرضية

Author name: زينب نوري حامد محمد العاني
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع (50) مسحة تعود لمرضى ومراجعين لثلاث مستشفيات عامة في بغداد وذلك للتحري عن عزلات الـ Pseudomonas aeruginosa اخذت من حالات مرضية متعددة شملت الحروق والجروح والتهابات الاذن. وبعد ان اجريت على العزلات التي تم الحصول عليها الاختبارات الكيموحيوية اللازمة لتشخيصها ومنها القابلية على تحليل الدم على وسط الـ Blood agar ، امكن انتقاء (25) عزلة اظهرت قدرتها على انتاج انزيم الـ hemolysinase وتحليل وسط الدم بشكل كامل. اخضعت العزلات بعدها لاختبار القابلية على النمو على وسط السترمايد الانتقائي والقدرة على النمو في 42 م ، اذ انتخبت (18) عزلة منها. ثم تبع ذلك اختبار قابلية العزلات على انتاج اللكتينات من خلال عملية التلازن مع كريات الدم الحمر للانسان بفصائلها (O, B, A) ودم بعض الحيوانات _الماعز ، الدجاج ، الفئران والارانب) حيث تم انتقاء العزلات التي اعطت اعلى عيارية. زرعت العزلات على وسطي الانتاج (GE) Grelets mediumوالمرق المغذي (Nutrient broth) للتحري عن قابليتها على انتاج اللكتينات، ودلت النتائج على انتاجها لنوعين من اللكتينات هما PA - I والـ PA - II ، اذ يتميز الاول بتخصصه تجاه سكر الكالكتوز، فيما يتخصص الثاني بالمانوز. بعد انتهاء فترة التنمية تم استخلاص اللكتينات من اوساط الانتاج لتجري عليها عملية التنقية باستخدام كبريتات الامونيوم ثم التكسير بالموجات فوق الصوتية ، ليتم بعدها انزال الراشح باستخدام طريقة الفصل بكرموتوغرافي عمود الفصل يمكن تلخيص اهم النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : 1 - اظهرت مستخلصات اللكتينات تباينا في الفاعلية التلازنية تجاه كريات الدم الحمر للانسان والحيوان سواء اكانت معاملة بانزيم التربسين ام لم تعامل به، كما تباينت العزلات في انتاجها لانزيم الهيمولايسين وصبغة البايوسين الزرقاء. 2 - تم تحديد درجة الحرارة المثلى لنمو عزلات بكتريا الـ aeruginosa P. وانتاجها للكتينات ب37م عندما بلغ تركيز اللكتين PA - I 95 مايكروغرام / سم3 ، في حين كان تركيزه عند الحرارة 35 م مايكروغرام/ سم3. اما اللكتين PA - II فبلغ تركيزه 40 مايكروغرام / سم3 عند الحرارة 35 م . 3 - وكان لاختلاف الاس الهيدروجيني دور في التاثير على تركيز ونقاوة اللكيتنات المستخلصة. اذ لم يتجاوز تركيز اللكتين PA - II المستخلص من العزلة (Z1) الـ30 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 5.0 في حين بلغ التركيز 105 مايكروغرام / سم3 لنفس اللكتين عند الاس الهيدروجيني الامثل (7.0) . اما اللكتينPA - I فقد انخفض تركيزه من 85 مايكروغرام/ سم3 في الاس الهيدروجيني الامثل ليصل الى35 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 8.0. 4 - تمت تنقية اللكتينات المستخلصة بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام متعدد الاكريلامايد بظروف ماسخة ، من خلال تمرير اربعة نماذج مستخلصة (اضافة الى نموذج البروتينات القياسي). 5 - لدى اختبار حساسية العزلات المعزولة من التهابات الاذن لمضادات الحياة ، اظهرت تباين في مقاومتها للمضادات، وكانت جميع العزلات مقاومة لكل من الامبسلين والاموكسيسيلين، فيما كانت حساسة للمضادات توبرومايسين والجنتامايسين والارثرومايسين. 6 - لاختبار قابلية اللكتينات المستخلصة على الارتباط بالسكريات الموجودة في حليب الام وحليب البقر والحليب المصنع، دلت النتائج بانه اضافة عالق الدم صنف O الى اللكتين مع سكريات الحليب تاركا كريات الدم الحمر حرة. 7 - اثبتت تجربة استخدام المرهم الطبي المضافة له بعض السكريات البسيطة كفاءتها، بعد ان تبين قدرة هذه السكريات على تثبيط تلازن اللكتينات مع كريات الدم الحمر للانسان خارج الجسم.8 - بعد ان حقنت فئران التجارب باللكتينات (PAI,PA - II,PAII) المستخلصة من العزلات (Z4,Z1,Z1) ، كان المحتوى الكاربوهيدراتي فيها (95،48، 30) مايكروغرام/سم3 وتركيز البروتينات (1350،860، 590) مايكروغرام / سم3 على التوالي. كما ولوحظ ظهور حالات غريبة على الفئران الثلاثة في المجموعة الاولى والتي حقنت باللكتينات اعلاه وتركت بدون علاج لمدة ساعة، ما بعد قتلها فقد حدث تحلل دم كامل في الفار الاول ومتوسط في الثاني، في حين لم يحدث اي تحلل للدم في الفار الثالث. وبعد استخدام العلاج في فئران المجموعة الثانية، لم يحدث تحلل دم للفار الاول والثالث وكان التحلل ضعيفا في الثاني. اما فئران المجموعة الثالثة والتي حقنت وتركت لمدة ساعتين بدون علاج، فقد نفق الفار الاول وحدث تحلل ضعيف في دم الفار الثاني وتحلل كامل في الفار الثالث. لم يسبب اعطاء العلاج لفئران المجموعة الرابعة وتركهم لمدة ساعتين اي تحلل لدم الفار الاول والثالث فيما كان ضعيفا في الثاني. اما افراد المجموعة الثانية فقدتركت بعد الحقن ثلاث ساعات بدون علاج، وكان تحلل الدم كاملا في الفار الاول ومتوسطا في الثاني والثالث، في حين لم يحدث تحلل للدم بعد اخذ العلاج. | Fifty samples were collected from several pathogenic cases including burns, wounds and ears belonging to patients and individuals referred to three general hospitals in Baghdad. Samples were subjected to the microbiological tests for detecting Pseudomonas aeruginosa, isolales. Among those tests was the ability of blood analysis on blood agar base medium. A total of (25) isolates were selected which showed the ability to produce the hemololysins. Some suspected isolates were also subjected to grow on ctramide agar, and with stand growth at 42c. Out of (25) only (18) isolate selected due to their ability to grow at 42c. The (18) selected isolates were tested for their ability to produce lectins via the heamagglutination with the human red blood cell groups (A, B, O). Isolates showed higher titers were chosen, when ability to produce lectins, two types (PA - I and PA - II) lectins were detected. Lectin PA - ICharacterized by it’s specify toward galactose, while PA - II was specific to mannose. After lectins were extracted from the production media, they were purfeyed by using ammonium sulphate and fractioned by the ultrasonic waves, followed by descending the filtrate by separation, through the chromatographic column.Results obtained could be described briefly as : 1. Obtained lectins showed were differed in their haemagglutination activity toweras human and animals red blood cells whether they were treated by the trypsin enzyme or not. However, isolates were not similar in producing the hemolysin enzyme and pyocine pigment.2. Optimum temperature for growth of P. aeruginosa isolate, and lectins production was 37c when concentration of lectin PA - I reached 95.0 µg/ml, while at 35c was 35 µg/ml - Regarding PA - II reached 40 µg/ml at 35c.3. Variation of pH played a significant effect on the. concentration and purity of the extracted lectins. At pH5.0 lectin PA - II concentration did in exceed 30, µg/ml while at optimum pH (7.0) it reached 105 µg/ml in the optimum pH to only 35 µg/ml at pH 8.0.4. Extracted lectins purified by gel electrophoresis when four extract in addition to the standard proteins sample were passed through it. The molecular weight of the PA - I was lectin from Z1 was 14.000 Dalton, while PA_II was 12.000 Dalton from the same sample.5. When P. aeruginosa isolates of ear infection were tested for their susceptibility to some antibiotics, they differed in their pattern of resistance. However, all isolates were resistant to Ampicilin and Amoxocilin, but sensitive to Tobramycin, Erythromycin and Gentamycin.6. In order to test the ability of the extracted lectin against some sugar which present in the human milk, raw milk and powder milk, red blood cell group were added to the lectin with the milk samples. Results showed that sugars inhibited haemagglutination with the red blood cells. 7. Experiments and application of the prepared ointment containing simple sugar proved its efficiency when sugar were able to prevent lectin agglutination with human red blood cells (invitro).8. After injecting mouse with the lectins (PAI, PAII, PAII) at (Z1, Z1, Z4) isolates, concentration of CHOs were (30, 48, 95) µg/ml and protein were (135, 860, 590) µg/ml respectively. Abnormal cases were also appeared on the three mice at the first group which was injected by the lectin when they were left without treatment for one hour, after they were killed, the first one was showed complete analysis at red blood cells, while it was not complete in the second and no analysis was showed in the third one, after treatment, no analysis of red blood cells was showed in the first and the third one, but it was not complete in the second one.The third group which injected by the same lectins when they were left without treatment for two hours the first mouse was dead, and the hemolysis was not completed in the second one, but completely in the third one, after treatment no hemolysis was showed in the first and the third one, but weakly in the second one. The fourth group, which injected by the lectins when they were left without treatment for three hours, the first mouse, was showed complete hemolysis, but not complete in the second and third one, after treatment, no hemolysis of red blood cells was showed.

تاثير بعض ملوثات الهواء المنبعثة من بيئة المطابع ومكاتب الاستنساخ على صحة العاملين في مدينة بغداد - العراق == Effect of some Air Pollutants emitted from Printing Units and Copy Centers environment on workers’ health in Baghdad City - Iraq

Author name: زينب نصر عبد اللطيف
Supervisor name: عادل حسين طالب الزاملي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل المواد الدقائقية والدقائق الورقية المتناهية الصغر المنبعثة اثناء عملية تشغيل مكائن الطباعة والطابعات الليزرية فضلا عن استخدام الاحبار والمذيبات العضوية خطرا على صحة الانسان لاسيما اولئك الذين يتعرضون لها لاوقات طويلة في بيئات عمل مغلقة . هدفت الدراسة الحالية لتقييم نوعية الهواء في بيئة عمل المطابع ومكاتب الاستنساخ وتشخيص الاثار المحتملة لبعض الانبعاثات المهنية وتاثيراتها في صحة العاملين ، اذ توصلت الدراسة للنتائج الاتية : اثبتت الدراسة ان هنالك مشكلة تلوث هواء في ما يتعلق بتراكيز الرصاص والزنك في جميع مواقع الدراسة وبنسب تفوق الحدود المسموح بها عالميا اذ بلغ اعلى تركيز للرصاص في هواء المطابع (5.1) ميكروغرام/م3 ، فيما بلغ اقل تركيز للرصاص (1.3) ميكروغرام/م3 . بلغ اعلى تركيز للزنك في هواء المطابع (100.8) ميكروغرام/م3 ، فيما بلغ اقل تركيز للزنك (31.2) ميكروغرام/م3 . اما قيم النحاس في هواء مواقع الدراسة فكانت ضمن الحدود المسموح بها عالميا عدا مكاتب الاستنساخ التي سجلت ارتفاعا ملحوظا بتركيز النحاس بلغ (0.647) ميكروغرام/م3 عند مستوى احتمالية (P<0.05) . تفاوتت تراكيز المواد الدقائقية PM2.5 وPM10بين مواقع الدراسة ، اذ ان المواد الدقائقية PM2.5 لم تتجاوز المحددات العالمية المسموح بها في اغلب مواقع الدراسة خلال شهر شباط مقارنة بشهر نيسان بينما سجل اعلى تركيز تراكيز للمواد الدقائقية 5PM2. في مطبعة الدار الجامعية (55.33) ميكروغرام/م3 في شهر نيسان. في حين تجاوز كلا من المواد الدقائقية PM10 والدقائق العالقة الكلية TSP المحددات العالمية في جميع مواقع الدراسة وسجل اعلى تركيز لهما (667.33) و(917.67) ميكروغرام/م3 على التوالي في مطبعة الدار الجامعية خلال شهر نيسان . لم تتجاوز تراكيز الغازات المقاسة (CO وNO2 وSO2 و(VOCS المحددات العالمية في جميع مواقع الدراسة اذ كانت تراكيزها اقل من الحدود المسموح بها. اذ سجل اعلى تركيز لغازCO ppm (8) في مطبعة النهرين/قسم التصحيف. اما غاز NO2 فقد سجل اعلى تركيز له ppm (2.0) في مكاتب الاستنساخ . بينما VOCs سجلت اعلى تركيز لها في مطبعة النهرين/قرب مكائن التيل ppm (28.0) . اما غاز SO2 فكانت تراكيزه اقل من تحسس الجهاز في جميع مواقع الدراسة. اظهرت نتائج فحص كفاءة الرئة اختلافا نوعيا في عمل الجهاز التنفسي تمثل في نقص سعة الرئة FVC ووجود ضيق في مجرى التنفس((FEV1 لدى مجموعة الطباعين فضلا عن حدوث قصور في وظيفة الجهاز التنفسي لدى مجاميع التعرض المهني والبيئي . وبينت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية بين معايير كفاءة الرئة ومدة التعرض التراكمي للعاملين لملوثات بيئة العمل، في حين لم تتوصل الدراسة الى ايجاد علاقة معنوية بين معايير كفاءة الرئة وحالة تدخين السكائر باختلاف طبيعة العمل . سجلت قيم الرصاص والزنك ارتفاعا في دم عمال المطابع مقارنة بالمجاميع الاخرى، فكانت تراكيزها (26.96) ميكروغرام/100مل و(93.44( ميكروغرام/100مل على التوالي .فيما سجلت قيم النحاس ارتفاعا في دم عمال الاستنساخ مقارنة بالمجاميع الاخرى اذ بلغ تركيزه (.22138( ميكروغرام/100مل . وبينت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية مرتفعة بين تراكيز العناصر الثقيلة في الدم ومدة التعرض التراكمي الا ان الدراسة لم تتوصل الى ايجاد فروقات معنوية بين معدلات قيم العناصر الثقيلة ومجاميع الدم من جهة وحالة تدخين السكائر من جهة اخرى . بينت نتائج اختبارات الدم وجود انخفاضا معنويا لدى مجموعة الاستنساخ في العدد الكلي لخلايا الدم البيض) 7.81×103 (خلية/ملم3 ،بينما سجلت خلايا الدم البيض الحمضة ارتفاعا معنويا لديهم (2.81)% مقارنة بالمجاميع الاخرى . مجموعة الطباعين سجلت انخفاضا معنويا في خلايا الدم البيض الوحيدة (5.78) % مقارنة بالمجاميع الاخرى .اما مجموعة التعرض البيئي/ التصحيف فقد سجلت انخفاضا معنويا في كلا من هيموغلوبين الدم (11.76) غم/100مل وحجم الدم المضغوط (36.28) % وكريات الدم الحمر(4.47 ×106 (خلية/ملم3 مقارنة بالمجاميع الاخرى. | Particulate matter and Nano papers particulate that emitted through printing machines and laser printers operation as well as inks and organic solvents constitute threat on human health especially who exposed for a long time in a closed work environments. The purpose of the current study is to evaluate air quality in the printing presses and copy centers, and diagnosed potential effects of some occupationally emissions and their effects on human health. The study has reached the following results : The study proved that there was air pollution problem concerning lead and zinc contents in all of the study sites in percentages exceed the permitted globally limits ,The highest concentration of lead was recorded in printing presses air (5.1) µg/m3 and the less concentration of lead was recorded (1.3)µg/m3, Highest concentration of zinc was recorded (100.8)µg/m3 in printing presses air and the less concentration of zinc was recorded (31.2) µg/m3, While copper values in air of study sites was within the permitted globally limits except copier offices that recorded a significant increase for copper concentration (0.674) µg/m3 at (P≤0.05). Particulate matters concentrations PM2.5 , PM10 varied in the study sites, most of PM2.5 didn’t exceeded the permitted globally limits in most of study sites during February compared to April, While the highest concentration of PM2.5 was recorded (55.33) µg/m3 in University house printing press during April. Whereas both of PM10 and TSP exceeded the globally limits in all of study sites and recorded their highest concentration (667.33) and (917.67) µg/m3 respectively in University house printing press during April. Gases concentrations) NO2,VOCS,SO2,CO) did not exceed the permitted globally limits in all study sites ,The highest concentrations of CO was recorded (8) ppm in Al - Nahrain printing press, NO2 gas was recorded its highest concentration (2.0) ppm in copy centers ,While VOCs were recorded the highest concentration (28.0)ppm in Al - Nahrain printing press,SO2 gas concentration was less a sensory device at all study sites. The results of lung efficiency showed qualitative difference in the work of the respiratory system represented in a restriction of lung capacity FVC and presence narrowing of the airway FEV1 at the printers group as well as a shortage in respiratory function for occupational and environmental groups , the results of the study showed a significant differences found between lung function parameters and accumulated exposure for environmental work pollutants. Whereas, the results of the study didn’t find a significant relationship between lung efficiency parameters and the status of cigarette smoking, according to the different of working nature. Lead and Zinc contents recorded increased in printing presses workers blood compared with other groups .Lead and Zinc concentrations were recorded 26.96)) µg/100ml and ((93.44µg/100ml respectively, while copper concentrations was recorded increased in copier workers blood compared with other groups, its concentration was recorded (138.22)µg/100ml, the study results has showed significant differences between heavy metals concentrations in blood and accumulative exposure period .Whereas, the study did not find significant differences between heavy metals rates and blood groups on the one hand and the status of cigarette smoking on the other hand. Complete blood count showed significant decreased in copy centers group in total WBCs (7.81×103) cell/ml3 ,While eosinophil was recorded significant increase (2.81)% compared to other groups .Printers group was recorded significant decrease in monocytes (5.78)% compared to other groups .While environmental group was showed significant decrease in both hemoglobin (11.76)g/100ml , hematocrit (36.28)% and red blood cells (4.47×106) cell/ml3 compared to other groups.

تقييم وبائي ومختبري لمرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط C (HCV) لحالات الثلاسيميا == Evaluation of HCV infection in Thalassemic patients Epidemiological, Virological, Immunological, Clinical and Biochemical

Author name: زينب ناصر حسين الطرفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يتميز التهاب الكبد الفايروسي بقابليته الوبائية على اصابة العديد من الافراد ويطلق مصطلح التهاب الكبد الفايروسي على عدد من الفايروسات المصيبة للكبد التي تم تسميتها حسب اكتشافها الى A,B,C,D,E,F,G ويعتبر التهاب الكبد الفايروسي C وBمشكلة كبيرة وذلك لعدم امكانية تشخيص الاصابة الفايروسية منذ البداية لكون اغلب الاصابات تكون بدون اعراض مرضية او باعراض خفيفة.المواد وطرائق العمل : شملت الدراسة الوبائية 1159عينة لمرضى الثلاسيميا الذين يراجعون مركز الثلاسيميا في الرصافة، والمجموعة الثانية 140915 عينة اخذت لمتبرعي الدم في المركز الوطني لنقل الدم اعتمدت من السجلات. وتم اجراء الفحوص الفايروسية (HCV,HBV,HIV) لهذه المجاميع، واجريت الفحوص الفايروسية التشخيصية الاخرى على مرضى الثلاسيميا، فضلا عن اجراء الفحوص المناعية، فحوص الدم، والفحوص الكيميوحيوية.النتائج : افرزت نتائج مرضى الثلاسيميا عن نسبة 24.76% (70عدد الذكور و110 عدد الاناث) موجبة لفحص anti - HCV، ونسبة 0.77% (7 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لفحص HBsAg، وبنسبة 0.34% (2 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لكلا الفحصين (علما ان جميع المرضى بدون علاج الانترفيرون) مقارنة مع متبرعي الدم بنسبة 0.4% لـanti - HCV و0.97% لـHBsAg،علما ان جميع نتائج فحص HIV كانت سالبة لمرضى الثلاسيميا ومتبرعي الدم، هذا بالنسبة للدراسة الوبائية. اظهرت الدراسة التحليلية المختبرية ان نسبة الاصابة بفايروس التهاب الكبد HCV اعلى في الذكور بنسبة 27.48% مقارنة مع الاناث بنسبة 21.35% بوجود فرق ذو دلالة احصائية معنوية لارتفاع نسبة الذكور عن الاناث، فيما لوحظ ان النسبة هي ذاتها 0.3% لذكور واناث مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ولوحظ ارتفاع الاصابة مع ازدياد العمر فاعلى نسبة للاصابة بـ HCV 41.5% هي للاعمار ما بين 21 - 30سنة وللمصابين بـHBV بنسبة 1.7% للاعمار ما بين 1 - 11سنة. ولوحظ ارتفاع نسبة الاصابة بـ HCV بين الاكراد بنسبة 85.7%. اما بالنسبة الى HBV فقد لوحظ ان النسبة هي 5.7% بين الاكراد، اما في العرق العربي فقد لوحظت نسبة HCV 22.83%، وHBV 0.63% وفي الكلدان لوحظ ان نسبة الاصابة بـHCV 20%. اجري فحصPCR على بعض مرضى الثلاسيميا واظهرت الدراسة ان 50% من النتائج موجبة، وباجراء الكشف عن النوع الجيني لفايروس HCV بطريقة RFLP تم الحصول على انماط جينية مختلفة تضمنت 3b,4,6,3a,2b,1b واجريت دراسة مناعية على المرضى الموجبين لفحص PCR، وكشفت النتائج ان 18% من اولئك المرضى قد ابدوا تفاعلات موجبة لاضداد النواة واضداد العضلات الملساء في حين لم يظهر اي نتيجة موجبة لاضداد الدنا، اضداد الميتوكوندريا واضداد الشحوم المفسفرة. اجري الترحيل الكهربائي لبروتينات المصل وتبين وجود ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لبروتين الكلوبيولين مقارنة بالالبومين، بارتفاع معدل بروتين كاما وانخفاض معدل بروتين الالبومين لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص HCV - PCR.اجري على بعض مرضى الثلاسيميا فحوصات عمل الكبد ولوحظ ارتفاع معدل TSB في مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فضلا عن ارتفاع معدل ALTفي المرضى الموجبين لفحص HBsAg عن المرضى الموجبين لفحص anti - HCV، كذلك لوحظ ارتفاع معدل AST لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فيما لوحظ ان معدل انزيم الفوسفاتيز القاعدي هو ضمن الحد الطبيعي لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg، وتم اختيار مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين بـ HCV,HBV واجريت عليهم عدد من الفحوص الكيميوحيوية لمستوى (البروتين الكلي، الالبومين، الكلوبيولين، اليوريا، الكرياتنين، حامض اليورك، البوتاسيوم، الفسفور غير العضوي، الكالسيوم، النحاس، الكلسترول والسكر) في الدم، ولم يلاحظ اي دلالة احصائية معنوية لهذه الاختبارات، عدا اختبار الكولسترول حيث لوحظ انخفاض معدل الكولسترول في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV الى 112.7mmol/L، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـHBV بمعدل mmol\L93.69 كما لوحظ وجود انخفاض ذو دلالة احصائية معنوية بين مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV,HBV مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV، كذلك لوحظ وجود دلالة احصائية معنوية لانخفاض معدل حامض اليورك لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV,HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا غير المصابين، ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى النحاس في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين مقارنة مع المصابين بـHBV. ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى السكر في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة بمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV وتبين وجود فرق معنوي لارتفاع معدل الفسفور غير العضوي لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين بـHCV,HBV مقارنة بالمصابين بـHBV. اجريت الفحوص المناعية على مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين وتضمنت الدراسة المناعية الكشف عن مستويات الكلوبيولينات المناعية في الدم ومكونات المتممة C3,C4فضلا عن الكشف عن اضداد الذات، ولوحظ ارتفاع نسب اضداد الذات لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غيرهم من مجاميعمرضى الثلاسيميا وتبين ارتفاع نسبة اضداد المايتوكوندريا (43.4%)، اضداد الهستون (40.9%)، اضداد العضلات الملساء (17%)، الاضداد النووية (17%)،اضداد شحم القلب (11.6%)، اضداد الشحوم المفسفرة (17%)، اضداد الدنا المزدوج الشريط (31.8%)، اضداد بروتينات النواة A - Jo - 1 (2.27%)، SS - B (4.5%)، A - Scl (3.4%) في حين ان اضداد الذات من نوع A - RNP/Sm,SS - A,A - Sm,AC - B لم يلاحظ اي نتيجة موجبة لها. اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد تم الحصول على نسبة (15.38%) لكل من اضداد الهستون، اضداد شحم القلب، اضداد الشحوم المفسفرة فيما كانت نسبة اضداد الميتوكوندريا (38.46%). كما لوحظ ارتفاع نسبة المصابين بالعامل الرثوي والبروتين الفعال في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بنسبة 46%، 68% على التوالي مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV بنسبة 38.4% لكل من RF,CRP. وتبين وجود فرق معنوي ذو دلالة احصائية لارتفاع الاصابة باضداد الذات ضد الهستون في الاناث مقارنة مع الذكور وارتفاع الذكور عن الاناث في اضداد المايتوكوندريا في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV. كذلك لوحظ ارتفاع بعض الكلوبيولينات المناعية في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بمستوى 1789 mg/dl للـIgG، ولوحظ مستوى 305.8 mg/dl للـ IgA فيما كان المستوى 203.3 mg/dl للـIgM، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV لوحظ ارتفاع مستوى IgG الى mg/dl1823.6، اما مستوى IgM وIgA فقد كان بمستوى 229.6 mg/dl، 278.8mg/dl بالتعاقب، وفي بروتينات المتممة C3,C4 لوحظ انخفاض مستوى C3 الى 82.6mg/dl فيما كان مستوى C4 23.7mg/dl وهو ضمن الحد الطبيعي الادنى في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV، اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد لوحظ ان مستوى بروتينات المتممة C3 اقل من المستوى الطبيعي 78.1 mg/dl فيما كان المستوى 20.3mg/dl الى C4.في اختبارات امراض الدم تم الحصول على دلالة احصائية معنوية لارتفاع معدل PT لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غير المصابين ومرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV، كما لوحظ انخفاض معدل تعداد كريات الدم العدلة لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. ولوحظ انخفاض معدل تعداد الصفائح الدموية لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. | Viral Hepatitis characterized by its epidemic ability to infect many people. Viral hepatitis called to many hepatic viral infection that had been classified into A,B,C,D,E,F,G. Hepatitis C infection considered a big problem related to the inability to diagnose the viral infection from the beginning because of mild or no symptoms. Material & Methods : - The epidemic study contains two groups, first group 1159 sample of thalassemic patients in Al - Rusafa Center For Thalassemic Patients. Second group 140915 samples taken from blood donors in the national blood bank from the records.Viral tests had been done for these groups (HCV,HBV,HIV). Diagnostic tests done on thalassemic patients like immunological, hematological, biochemical tests.Results : - For the epidemic study the result shows a 24.76% for thalassemic patients infected with HCV , 0.77% for thalassemic patients infected with HBV, & 0.34% for thalassemic patients infected with both HCV,HBV. 74.89% for non infected thalassemic patients compared with blood donors of 0.4% for HCV infection, and 0.97% for HBV infection.Studies for investigating laboratory tests done on thalassemic patients after confirming HCV,HBV infections through doing diagnostic viral tests.HCV Viral results shows higher percentage of male to female by 27.48% for male, 21.35% for female respectively and it was seen that the same rate of 0.3% for male and female infected with HBV. Higher infection rate with age increasing of 41.5% for age group 21 - 30 years of HCV thalassemic patients, and 1.7% for age group 1 - 11 years for HBV thalassemic patients. Higher HCV infection rate noticed for Kurdish people 85.7% , Christians 20%, and in Al - Sabeaa 40%.while the percentage of HBV in Kurdish people 5.7%, and no one infected with HBV infection in Christian and Al - Sabeaa people. For Arabic patients the percentage of HCV infection is 22.83% and 0.63% for HBV infection.HCV - PCR Thalassemic patient results show that 50% of results are positive and 50% are negative (11 out of 22 patients), doing genotyping of HCV by RFLP test shows different subtypes of HCV (3b, 2b, 1b, 3a, 4, 6).Immunological study done on PCR positive patients’ shows antibodies percentage of 18% to ASMA, ANA and 0% for each of AMA, ADNA, APL. Electroforeces done for protein of these patients show significant statistical increasing values of protein globulin in comparison to albumin decreasing.For liver function tests, applied on thalassemic patients it had been noticed that there is a significant statistical increasing values in the thalassemic patients infected with HCV as compared to other thalassemic patients not infected with HCV. Increasing the level of ALT in HBV patients compression with HCV patients, increasing the level of AST of HBV, HCV thalassemic patients where the level of alkaline phosphates in the upper limit of normal value of HCV, HBV thalassemic patients.No significant statistical values where noticed for the biochemical tests applied on some thalassemic patients infected with HCV, HBV infection except cholesterol where it had been noticed a decrease of level 112.7 mmol/L in thalassemic patients infected with HCV. 93.69 mmol/L in HBV infection patients, a significant statistical decrease value between HBV , HCV thalassemic patients in comparison with non infected patients.There is a decrease level of uric acid for the thalassemic patients infected with HCV compared with non infected patients, significant increase of copper level in the blood of HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients and not infected thalassemic patients.Significant statistical value increment for the random blood sugar in HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients.Regarding immunological study, it had been noticed that there is an increasing in autoantibody with significant statistical value for thalassemic patients infected with HCV compared with other thalassemic groups. It had been seen that there is an increasing in the mitochondrial antibodies (AMA - M2) 43.4%, antihiston antibodies (AHA)40.9%, antismooth muscle antibodies (ASMA)17%, antinuclear antibodies (ANA)17%, anticardiolipin antibody antibodies (ACL)11.6%, antiphosphotidel serin antibodies (APL - S)17%, antidouble stranded DNA antibodies (A - ds - DNA) 31.8%, other antinuclear proteins like A - Jo1 2.27%, SS - B 4.5%, A - ScL 3.4%, where the other auto antibodies A - RNP/Sn, SS - A, A - Sm, anticentromer B antibodies (A - C - B) show zero percent for each one of them while in the HBV thalassemic patients a 15.38% was obtained for each APL - S , ACL & AHA.. A 38.46% for AMA - M2.There is an increase in rheumatoid factor (RF), CRP in thalassemic patients infected with HCV compared with non infected thalassemic patients with a ratio of 46%, 68% respectively. In HBV thalassemic patients 38.4% for each RF and CRP. Significant statistical difference for increasing incidence with auto antibodies in the females compared with males of autoantibodies type AHA, AMA - M2 in thalassemic patients infected with HCV noticed.We noticed an increasing in the immunoglobulines IgG 1789 mg/dl, 305.8mg/dl for IgA in thalassemic patients infected with HCV while IgM in the upper normal range 302.3 mg/dl, complimentary portions C3, C4 shows a decrease level in C3 82.6 mg/dl, and the level of C4 is 23.4mg/dl, which is regard as the lower normal limit. While in the HBV thalassemic patients we obtain a level 1515.3mg/dl for IgG, 204.8 mg/dl for IgM and for IgA 233.3mg/dl.In the hematological tests of thalassemic patients infected with HCV shows significant increment in the level of PT test was obtained as compared with other groups of thalassemic patients. Percentage decrement in neutrophil of WBC cells in HCV thalassemic patients as compared with HBV and non infected thalassemic patients. There is a decrement in platelets count in HBV thalassemic patients compared with HCV and non infected thalassemic patients.

التاثير المزمن لمبيد الفايديت في نسجية الغلاصم والكبد والكلى لاناث سمكة البعوض (S.F. Baird &Girard ; 1853) Gambusia affinis == Chronic effect of Vydate on gill , liver and kidneys of female mosquito fish Gambusia affinis (S.F. Baird &Girard ; 1853 )

Author name: زينب مؤيد صابر حميد
Supervisor name: مختار خميس حبه
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الفايديت لمبيدMedian lethal concentration في الدراسة الحالية بلغت قيمة التركيز المميت الوسطي واستخدمت الصفة الفسلجية التي Gambusia affinis خلال (96) ساعة (2.4) ملغم / لتر في سمكة البعوض فضلا عن التغيرات المرضية النسجية للتعرف على سمية Bioindicator كدليل حيوي Behaviour بالسلوكمبيد الفايديت وقد وجد بان سمية مبيد الفايديت تزداد مع زيادة كل من التركيـز ومدة التعرض . جمعت 48 سمكة انثى من الاسواق المحلية ومن الجدول المحيط بجامعة بغداد في الجادرية ، قسمت الاسماك الى (4) مجاميع شملت كل مجموعة 12 سمكة عرضت اسماك المجموعة 1 : ( لتركيز 0.12 ملغم / لتر )، المجموعة 2 : (عرضت لتركيز 0.24 ملغم / لتر ) ، المجموعة 3 : (عرضت لتركيز 1.2 ملغم / لتر ) بمبيد الفايديت ، فضلا عن مجموعة السيطرة وبواقع مكررين لكل مجموعة ، ثم شرحت الاسماك بعد كل ( 2، 4، 6 ، 8) اسابيع من التعرض . تم تثبيت العينات بمحلول بوين وحضرت الشرائح المجهرية واستعملت صبغة الهيماتوكسيلين والايوسين . وملاحقة بعضها Erratic swimming اثرمبيد الفايديت في سلوك السمكة من خلال سرعة السباحة العشوائية البعض وزيادة العدائية وسرعة حركة غطاء الغلاصم واستقرار السمكة عند قعر الحوض او بالقرب من سطــــح الماء عند زيادة التركيز . من جانب اخر اثر مبيد الفايديت تصاعديا وبحسب التراكيز المستخدمــــــــة في الدراسة الحالية في بعض اعضاء الجسم مثل : الغلاصم والكبد والكلى . اذ لوحظ حدوث عدة اصابات في الغلاصــم بسبب مبيد الفايديت تمثلت بحصول تضخم الخلايا الكلورية Hypertrophy of chloride cellsو احتقان الاوعية الدموية congestion of blood vessels وانعدام الترتيب الصفائحي Lamellar disarrayو انفصال الخلايا الظهارية عن الغشاء القاعدي Lifting of epithelial cells (Slouphing ) وفرط التنسج للخلايا الكلورية Hyperplasia of chloride cells والتحام الصفائح الثانوية المتجاورة Fusion of adjacent Secondary lamella وتمدد الاوعية الدموية Aneurysm . واحتقان الوريد المركزي والجيبانيات Swelling of hepatocytes سبب مبيد الفايديت انتفاخ الخلايا الكبدية وانعدام الترتيب Haemorrhageو نزفا دمويا Congestion of central vein and sinusoids الدموية وInfiltration of lymphocytes وارتشاح الخلايا اللمفية Loose of radial arrangement الشعاعيو ضمور الخلايا الكبديـــــــــــة Caseous necrosis of hepatocytes حدوث التنخر التجبني للخلايا الكبديةAtrophy of hepatocytes والتليف (التشمع) الكبدي Liver cirrhosis . عانت الكلى ايضا من تاثير مبيد الفايديت من خلال حدوث عدة اصابات فيها مثل تضخم الكبيبات البولية Shrikage of renal tubule lumens,و تضييق تجاويف النبيبات الكلوية Hypertrophy of glomerulusواحتقان الاوعية الدموية واختزال النسيج المولد للدم Reduction of haematopoietic tissue . | In the current study the average value of median lethal concentration was 2.4 mg / L in Gambusia affinis , and we used the physiological characteristic that represented by behavior as a bioindicator , as well as as well as pathological and histological changes to learn about the toxicity of vydate pesticide and found that the toxicity of vydate increased when both concentration and duration of exposure increased . (48) female fishes were collected from local markets and also from the stream that surround Baghdad university campus at Al - jadyria, fishes divided into (4) groups and each group consists of 12 fish : Group1 (exposed to 0.12 mg / L) , Group2 (exposed to 0.24 mg / L) and Group 3 (exposed to 1.2 mg / L) of vydate pesticide. As well as a group for control . Fishes were dissected for for histological preparations after fixation with Bouin’s fluid after each (2,4,6,8) weeks of exposure time. Histological sections were stained with Hematoxylin and eosin . .Vydate pesticide impact on the behavior of G. affinis swimming through random erratic swimming , prosecute each other , increase hostility , increased the opercular movement and the stability of fish was at the bottom of aquarium or at the surface of water when the concentration of pesticide increased . On the other hand vydate impact according to the concentration that used in the current study on some organs of G. affinis such as : gills, liver and kidneys. Where it was noted that a number of histopathological changes in gills due to vydate pesticide such as hypertrophy of chloride cells, congestion of blood vessels, lamellar disarray, lifting of epithelial cells (slouphing), hyperplasia of chloride cells , fusion of adjacent secondary gill lamella and Aneurysm. Vydate pesticide also caused swelling of hepatocytes , congestion of central vein and sinusoids , haemorrhage , loos of radial arrangement infiltration of lymphocytes , caceous necrosis of hepatocytes , atrophy of hepatocytes and liver cirrhosis. Also kidneys suffered from vydate pesticide through several alternative changes such as hypertrophy of glomerulus , shrinkage of renal tubule lumens congestion of blood vessels and reduction of hematopoietic tissue .

الكشف عن جينات البيتالاكتاميز واسعة الطيف لبكتريا الكلبسيلا المعزولة من عينات سريرية وبيئية في محافظة ذي - قار == Detection of ESBLs in Klebsiella spp. Isolated from Clinical and Environmental Samples at Thi - Qar Province

Author name: زينب محمد عيدي اللامي
Supervisor name: يحيى عبد الرضا عباس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: This study aimed for isolation and identification of Klebsiella spp.from clinical and environmental samples and detection the prevalence of some extended spectrum β - lactamases (ESBLs) genes (bla CTX - M, bla CTXM1) in Klebsiella spp. Samples collected were included clinical samples ( Burns , wounds , urinary tract infections, respiratory tract infections, otitis media and vaginal infections ) and hospitals environments. A total of 554 (468 clinical and 86 environmental samples) during the period from October 2013 to March 2014 were collected. Growth on blood agar, MacConkey agar and E.M.B agar was identified by cultural, morphological and biochemical tests and confermated by API 20 E system which revealed that : 45 ∕ 554 ( 8,1%) gave positive growth for Klebsiella spp. as following : 2 ∕ 48 (4.1 %) fromburns , 7∕ 40 (17.5 %) from wounds, 29 ∕315 ( 9.2%) from urinary tract infections, 4 ∕ 25 (16%) from respiratory tract infections, 3 ∕86 (3,4%) from hospitals environments.All the 45 isolates of Klebsiella spp. were screened for their antibiotic resistance against 15 antibiotics of different classes using Kirby - Bauer disk diffusion method. The results showed that all the tested isolates were resistant to at least 6 antibiotics of which they were tested, hence the isolates were considered to be multidrug resistant.The results showed that all of the isolates were found to be resistant to β - lactam antibiotic (ampicillin and amoxicillin) Disk approximation test and not production of ESBLs by these isolates.Combined disk diffusion method was used for detection of metallo - β - lactamase - producing isolates , it was emplace each of imipenem and antibiotic with and without EDTA on Mueller - Hinton agar , because EDTA working to inhibit of metallo - β - lactamase . The results showed that there was no effect for EDTA on the diameter of inhibition zone in all isolates.All the 45 isolates were submitted to molecular detection of some ESBLs genes (bla CTX - M , bla CTX - M1) using PCR technique. The results showed that only 28 ( 62,2%) isolates were carried ) blaCTX - M or blaCTXM1) and 21 isolates were carried both genes (blaCTX - M and blaCTXM1).

تاثير حليب الابل في بعض المعايير الفسيولوجية في اناث الجرذان المختبرية Rattus norvegicus المعامله بالبنزين == The Effect of Camel's Milk in Some Physiological Parameters of Female Rats (Rattus norvegicus) Treated with Benzene

Author name: زينب محمد عباس الغزي
Supervisor name: خالد كاطع الفرطوسي | محمد عجة عودة
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: The present study was conducted in Department of Biology, College of Sciences, University of Thi - Qar, Iraq to investigate the effect of camel's milk on some physiological parameters of female rats (Rattus norvegicus) treated with benzene which included (weight of body and internal organs, hematological and biochemical parameters). The study was included 48 female rats divided into 8 equal groups, 6 for each group, the control group (A) which treated orally with (5 ml /kg) of physiological solution (NaCl 0.9%) for 4 months, camel's milk group (B) which treated orally with (5ml/kg) camel's milk for 4 months, benzene group(1) (C) which injected (I.P.) with (0.2ml/kg) of benzene by two doses for each week for four months, benzene group(2) (D) which injected (I.P.) with (0.4ml/kg) of benzene by two doses for each week for four months, protection group (E) which injected with (0.2ml/kg) of benzene and treated with (5ml/kg) of raw camel's milk for four months, protection group (F) which injected with (0.4ml/kg) of benzene and treated with (5ml/kg) of raw camel's milk for four months, treatment group (G) which injected with (0.2ml/kg) of benzene and after the end of duration of injection treated with (5ml/kg) of raw camel's milk daily for 1 months, treatment group (H) which treated with (0.2ml/kg) of benzene and after the end of duration of injection treated with (5ml/kg) of raw camel's milk daily for one month, and identified the animal weights at the beginning and end of the experiment and after the end of the period experiment all rats were weight organs (heart, liver, kidneys and spleen) and took blood samples to measure the level of malondialdehyde MDA, Ceruloplasmin CP, Total Cholesterol TC, Triglyceride TG, height density lipoproteins HDL, low density lipoproteins LDL, very low density lipoproteins VLDL and the levels of ALT, AST and ALP. The current study showed significant decrease at (P≤ 0.05) in the weight of (body, heart and kidney), and the acidophil, RBCs, SUMMARY

تاثير المعززات الحيوية على الفئران المثبطة مناعيا بالبردنيزولون == Effect of Probiotics on Prednisolone Immunosuppressed Mice

Author name: زينب كاظم عبد
Supervisor name: امنة نصيف جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة لمعرفة دور FOXP3 في الفئران المثبطة مناعيا بالردنيزولون اضافة الى دور المعززات الحيوية في الجهاز المناعي للفئران البيضاء. البردنيزولون هو عقار مثبط مناعيا يستخدم لعلاج حالات الحساسية وامراض المناعة الذاتية. المعززات الحيوية هي كائنات حية تستعمل لتعديل الجهاز المناعي في الانسان والفئران. FOXP3 هو دليل للخلية التائية المنظمة وله دور في الاستجابة المناعية.لذلك استخدمنا في التجربة 30 فار مختبري ابيض ذكر قسمت الى 6 مجاميع كل مجموعة تضم 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 14 يوم : المجموعة 1 : جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالخميرة فقط. المجموعه 2 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام مجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعة 3 : جرعت فمويا ب0.4مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط. المجموعه 4 : جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالبكتريا فقط. المجموعه 5 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعه 6 : جرعت فمويا ب0.6مل من بكتريا Ss والتي تحوي (108×1) خلية\مل وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ارتفاع معنوي في العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء(10000.0 ± 275.4) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(7000 ± 145.07), واظهر العد التفريقي لها انخفاض معنوي في الخلايا اللمفية(23.0 ± 1.51) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((30.0 ± 1.65 وارتفاع معنوي في الخلايا العدلة(75.00 ± 3.59)مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (65.00 ± 2.31) وانخفاض معنوي في الخلايا الوحيدة(( 1.0 ± 0.06مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ±0.06) 3.0) وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة , حصل انخفاض معنوي في عملية البلعمه(15.0 ± 0.82) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(20.0 ± 1.4), وارتفاع غير معنوي في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة(40.0 ± 2.03) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (36.0 ± 1.1), وزيادة غير معنوية في تركيز خضاب الدم(13.3 ± 0.76) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((11.6 ± (0.54 وكذلك زيادة غير معنوية في الوزن الكلي للحيوانات المعامله بالعقار فقط (31.0 ± 1.2) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(30.0 ± 1.1) .واظهرت نتائج التجريع بالمعززات الحيوية (الخميرة والبكتريا) ارتفاع العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء ,واظهر العد التفريقي لها ارتفاع الخلايا اللمفية والوحيدة وانخفاض الخلايا العدلة وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة ,كذلك حصل ارتفاع في عملية البلعمة وارتفاع بسيط في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة . بينت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية في المجموعه المعاملة بالعقار فقط حصول فقدان بالشكل العام للعضو وعدم ظهور الحويصلات اللمفاوية وحصول تنخر في الطحال .واوضحت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجموعه المعامله بالمعززات الحيوية احتفاظ العضو بالشكل العام وحصول ارتشاح للخلايا اللمفية وتحفيز الحويصلات المفاوية داخل العضو.كما اظهرت نتائج التجريع الفموي للمعززات الحيوية بعد وقبل ومع حقن الدواء حدوث حالة تحسسن بالمؤشرات المناعية وكذلك حدوث حالة تحسن وتنشيط مناعي للحويصلات اللمفاوية للطحال والعقدة اللمفاوية. واظهرت نتائج الفحص النسيجي الكيميائي المناعي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجاميع المجرعه بالمعززات الحيوية والعقار ان لها نفس التعبير لل.FOXP3 اعتمادا على نتائج التجربة الحالية نستنتج ان المعززات الحيوية (الخميرة والبكتيريا) تمتلك قابلية على تعديل وتحسين تاثيرات العقار الجانبية على الاعظاء والمؤشرات المناعية وكذلك لها نفس التعبير لل.FOXP3 | Study have been done to see the role of FOXP3 in immunosuppressed mice using prednisolone in addition to the role of probiotic on immune system of albino mice. Prednisolone is immunosuppressive drug used to treat several allergic and autoimmune conditions. Probiotic is a live microorganisms used to modulate human and mice immune system.FOXP3 is Treg marker and have a role in immune system responses. Therefore we took 30 male albino mice were divided into 6 groups (five mice in each group) and treated daily for 14 days : Group 1 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days then injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 14 days. Group 2 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14days. Group 3 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days.Group 4 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days then injected intraperitoneally with(0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 14 days. Group 5 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days. Group 6 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days. Mice treated with prednisolone drug showed a significant increase in total leukocytes count (10000±275.4)cells\1ml.blood as compared with negative control (7000±45.07)cells\1ml.blood, and differential count of leukocytes showed non - significant decrease in lymphocytes(23.0±1.51)cells\1ml.blood as compared with negative control (30.0 ±1.65)cells\1ml.blood, a significant increase in neutrophils(75.00±3.59) as compared with negative control(65.00 ± 2.31), a significant decrease in monocytes (1.0±0.06)cells\1ml.blood as compared with negative control(3.0 ± 0.06)cells\1ml.blood and have no effect on basophils and eosinphils, a significant decreased in phagocytosis(15.0 ± 0.82) as compared with negative control (20.0 ±1.4) , no significant increased Pcv (40.0±2.03) as compared with negative control (36.0±1.1) ,no significant increased Hb (13.3±0.76) as compared with negative control(11.6 ± 0.54) , and no significant increase in total body weight (31.0 ± 1.2)g as compared with negative control (30.0 ±1.1)g. The result of group treated with probiotic show a significant increase in total leukocytes, lymphocytes count, phagocytosis and Hb & Pcv as compared with control group administrated by normal saline only. The histological sections of spleen and lymph node which was treated with prednisolone drug revealed lose the architecture, no lymphoid follicles and necrosis. While the section of spleen and lymph node treated with probiotic showed preservation architecture which contain lymphoid follicles and hyperplasia of lymphocytes. The result of groups treated with probiotic pre, post, together with prednisolone drug showed normalized the immunological and histological parameters to the normal condition as compared with group treated with prednisolone only. The immunohistochemical section for spleen and lymph node show the same expression of FOXP3 in mice treated with probiotic (yeast & bacteria) and prednisolone drug. According to the results obtained from this study it is concluded that probiotic (yeast and bacteria) have immunomodulatory effect against prednisolone in immune system of male albino mice and have the same expression of FOXP3

استخلاص وتنقية وتشخيص زيت نبات الرازقي المستزرع في العراق L. Jasminum sambac ودراسة تاثيره كعامل مضاد للاكسدة == Extraction, Purification and Identification of Jasmine oil in Jasminum sambac L. Cultivated in Iraq and It's effect as antioxidant activity

Author name: زينب عمران سلمان الربيعي
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى استخلاص زيت الياسمين من ازهار واوراق وسيقان وجذور نبات الرازقي المستزرع في العراق Jasminumsambac L., والكشف عن المركبات الموجودة فيه, كما تم اجراء مقارنة بين الزيت الطيار والمستخلص الكحولي الخام للنبات كمركبات مضادة للاكسدة باستعمال الجذرالحر(1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazyle) ((DPPH وذلك باستعمال التراكيز (100,80,60,40,20)l/mlµ والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية. استخلص الزيت الطيار باستعمال طريقة التقطير بالبخار والاستخلاص بالكحول بواسطة جهاز الكلافنجرClavenger apparatus) ), كما تم التعرف على مكونات الزيت الطيار بتقنية كرموتوغرافيا الغاز السائل - مطياف الكتلة. اجريت عملية الاستخلاص الكحولي (الخام) للمركبات الفعالة من النبات بجهاز(Soxhlet), وتم الكشف النوعي عن المركبات الفعالة بواسطة عدد من الكواشف, وبينت النتائج ان المستخلص الكحولي لكلا الجزئين احتوى على مركبات فعالة (القلويدات, الفلافونيدات, التربينات, الصابونيات, التانينات). اشارت النتائج الى ان استخلاص 100غم من نبات الرازقي لكل من الازهار والاوراق انتجت زيتا طيارا 5%, 1.5 % على التوالي, اما السيقان فكانت كمية الزيت الطيار فيها قليلة جدا بحيث كان من الصعب جمعها. اما بالنسبة لجذور النبات فلم يظهر وجود للزيت الطيار فيها. اثبتت الدراسة ان الزيت الطيار للازهار يحتوي على (30 مركبا ) وكان اعلى تركيز لمركب Benzyl acetate حيث بلغت نسبته المئوية 59.37%, يليه مركب Benzyl alcohol بتركيز 14.96%, ثم مركب Benzyl propanoate بتركيز 5.25%. اما زيت الاوراق فاظهرت النتائج انه يحتوي على 43 مركبا وان مركب Benzyl acetate كان الاعلى تركيزا وبنسبة 34.07% , يليه مركب N - carbobenzooxy arginine بتركيز 15.28% , ثم مركب benzyl propanoate بتركيز7.79%.كما اظهرت النتائج الفعالية العالية للزيت الطيار لكل من الازهار والاوراق بالتركيز 100 l/mlµ كمضادا للاكسدة وبنسبة 96.10%, 82.30% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية (حامض الاسكوربك), اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية مابين تراكيز الزيت الطيار لكل من الازهار والاوراق. اما فيما يخص نتائج المقارنة بين الزيت الطيار والمستخلص الخام للنبات فقد تبين ان الفعالية المضادة للاكسدة للزيت الطيار والمستخلص الكحولي لللازهار عند تركيز 100 l/mlµ للزيت الطيار وg/mlµ للمستخلص الخام كانت 96.10% , 33.87% على التوالي, اما بالنسبة للزيت الطيار والمستخلص الكحولي للاوراق عند نفس التركيز فكانت النسبة المئوية المضادة للاكسدة 82.30%, 22.08% على التوالي وبفروق معنوية مابين تراكيز الزيت الطيار والمستخلص الكحولي. | This study aimed was designes to extract Jasmine oil from flowers, leaves, stems, and roots using Jasminum sambac L. which cultivated in Iraq, and detecting the existing compounds. A comparison was conducted between volatile oil and alcoholic extract ( as a crude) of the plant as antioxidant by using the compound 1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazyle (DPPH) as a free radical at the concentrations 20,40,60,80,100 Microliter/ milliliter then compared with ascorbic as a standard treatment. The volatile oil was extracted by using the steam distillation and alcohol extract using Clevenger apparatus. volatile oils were detected by using the chromatography of the liquid gas. In addition, alcoholic crude extract was done by using Soxhlet. The qualitative detection was conducted searching for active compounds through the use of a number of detections reagents.The results of the qualitative detection showed that the alcoholic extract in both plant parts contains the active compounds alkaloids, flavonoids, terpenoids, saponins, tannins. The results showed that 100 g of flowers and leaves has produced a volatile oil estimated by 5% and 1. 5% respectively. While the amount of the volatile oil in the stems was very little to be extracted and thus it was difficult to collect. No volatile oil was detected in plant roots. The study has shown that volatile oil of flowers contains 30compounds and the highest was Benzyl acetate, reaching 59.37%, followed by Benzyl alcohol (14.96%), then Benzyl propanoate which recorded 5.25%. The study showed that volatile oil in leaves contains 43compounds and Benzyl acetateeas represented the highest (34.07%), followed by N - carbobenzooxy arginine (15.28%), then benzyl propanoate (17.79%). The results also showed high volatile oil antioxidant activity in both flowers and leaves at the concentration 100Microliter / ml reached 96.10% and 82.30% respectively compared with Ascorbic Acid. the results also indicate significant differences between the volatile oil concentrations in both flowers and leaves. It has been proved that the maximum antioxidants activity for volatile oils and alcoholic extract of flowers was at a concentration of 100Microliter / ml was reached 96.10%, 33.87% respectively, while for volatile oil and alcoholic extract of the leaves, the percentages were 82.30% and 22.08% respectively, with significant differences between volatile oil and alcoholic extract concentrations.

دراسة التغيرات المرضية والكيميائية الحياتية والصورة الدموية لتاثير مبيد Thiamethoxam في الفئران == The study of Pathological changes ,Biochemical and Hematological picture for effect of “Thiamethoxam in mice

Author name: سحر عبد الهادي محمد جواد الشرقي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ليلـــى جبار محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية تقييم تاثيرات المبيد الحشري الـ Thiamethoxam في الفئران البيض ، وقـــد اعتمد فــي تحديد قـــيم الجرع علـــى قيمة الحد المسموح تناوله يوميا ( ADI ) Acceptable daily intake والذي بلغ 0.004 ملغم/ كغم من وزن الجسم . تمت دراسة التاثيرات الحادة والمزمنة بعد 28,14 يوم من التجريع بالجرع 0.12,0.08,0.04 ملغم/ كغم من وزن الجسم اضافة الى جرعة ADI من خلال المعايير الاتية : التغيرات السريرية والتغيرات في اوزان الاعضاء الكبد والكلية والطحال وعد الكريات الحمر Erythrocytes count وقياس كمية خضاب الدم Haemoglobin estimation والنسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص Percentage of Packed Cell Volume ( PCV ) والعد التفريقي للكريات البيض Differential Leukocytic count وقياس مستوى انزيمات الكبد ALP , GPT , GOT ) ) وقياس مستوى الكرياتنيين Creatinine واليوريا Urea في مصل الدم للكلية ودراسة نسيجية لكل من الكبد والكلية والطحال . وقد ادت هذه الدراسة الى النتائج الاتية : لوحظ على الحيوانات قلة في الحركة والنشاط وتناول العليقة وقلة في كمية الادرار ازدادت بزيادة الجرعة وفترة التجريع . اما معدل وزن الكبد فقد سجل اعلى ارتفاع عند P<0.05 للجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 14 يوم بعد التجريع ، وقد بلغ معدل وزن الكبد 0.16±1.72 غم ، اما لفترة 28 يوم بعد التجريع فقد سجل معدل وزن الكبد انخفاضا الاانه لم يكن معنويا عند مقارنته مع معدل وزن الكبد لحيوانات السيطرة .بينما اظهر معدل اوزان الكلى ارتفاعا لـــــم يكــــن معنويا من الناحية الاحصائية لفترة 14 يوم بعد التجريع عند مقارنته مع معدل اوزان الكلى لحيوانات السيطرة ، اما فترة 28 يوم بعد التجريع فقد اظهرت النتائج انخفاضا معنويا عند P<0.05 اذ كان اقل انخفاض عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم اذ بلغ 0.01±0.18 غم ، بينما كان معدل وزن الطحال منخفضا خلال فترتي التجريع وكان اقل انخفاض عند P<0.005 لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم الذي بلغ معدل وزن الطحال له 0.01±0.06 غم . ان التعرض الحاد والمزمن للمبيد للفترتين 28,14 يوم بعد التجريع سبب ارتفاع في معدل عدد الكريات الحمر ومعدل مستوى خضاب الدم ومعدل النسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص، ولوحظ ان مبيد الـ Thiamethoxam عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم قد سجل اعلى ارتفاعا معنويا P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع لتلك القياسات الدموية حيث بلغت معدلاتها ( 0.17±9.84 كرية / ملم3 ، 0.54±50.60 % ،0.87±16.58 غم / 100 مل ) على التوالي . اما معدل العد التفريقي للكريات البيض فقد سجل اعلى ارتفاع معنوي P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لمعدل الخلايا اللمفاوية حيث بلغ 0.85±80.80 % ، بينما سجل انخفاضا معنويا لمعدل الخلايا العدلة وقد وصل اقل انخفاض P<0.005 عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم مــــن وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع اذ بلغ 0.98±10.00 % ، اما معدل عدد الخلايا وحيدة النواة فقد سجل انخفاضا معنويا P<0.05 وكان اقل معدل عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع الذي بلغ 0.44±5.20 % . كانت التغيرات المرضية النسيجية قد تدرجت شدتها حسب الجرعة والفترة الزمنية ، حيث لوحظ تكفيف خلوي لمفي حول الاوعية الدموية واحتقان وتنخر الخلايا الكبدية مع وجود خلايا تعاني من الموت المبرمج فضلا عن وجود الاورام الحبيبية ، وقد لوحظ اعادة بناء الخلايا الكبدية التي تميزت بفرط تنسج تلك الخلايا وانشطار انويتها بشكل واضح مما يشير الى دور هذا المبيد في احداث الاصابة بالسرطان Cancer ، كذلك لوحظت تغيرات تنكسية في الخلايا المبطنة للنبيبات الكلوية فضلا عن تشتت اللب الابيض في الطحال في المراحل الاولى من اعطاء الجرع تحولت الى فرط تنسج اللب الابيض في مراحل لاحقة . ان النتائج السابقة الذكر ممكن ان تعطي انطباعا وافيا حول التاثير السمي للمبيد الحشري الـThiamethoxam من خلال تاثيراته الواضحة في انسجة الاعضاء وبخاصة نسيج الكبد اضافة الى التغيرات الدموية. | The present study investigates the assessments of the effects of insecticide “ Thiamethoxam “ in white mice the doses given were according to the allowable limits of Acceptable Daily Intake ( ADI ) , which amount to 0.004 mg/ kg b. w. . The acute and chronic effects have been examined after 14 , 28 days of ( 0.04 , 0.08 , 0.12 ) mg/ kg b. w. in addition to the doses of ADI through the following criteria : Behavioral changes , the changes on the weight of the liver , kidney , and spleen , erythrocytes count , haemoglobin estimation , percentages of packed cell volume ( PCV ) , differential leukocytic count , estimation of the level of liver enzymes ( GOT , GPT , ALP ) , estimation of the level of creatinine and urea in blood serum of kidney , and histological examination of the liver , kidney , and spleen .The study reached the following results : It has been observed that there was a reduction in the animals’ movement and activity and having a pellete , the reduction in the amount of urine increased by the increase of the dose and dose duration . The average of liver weight has shown the highest increase at P< 0.05 per dose was at 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days of the dosage time , the average of the liver weight was 0.16±1.72 g but after 28 days of the dosage time , the liver weight decrease though it was not significant in comparison with the average of the liver weight of the control animals’while the averages of kidney weights show an increase , though statistically insignificant , for 14 days of the dosage time in comparisn with average of kidney weight of the control animals’. After 28 days of the dosage , the results show some decrease at P< 0.05 and the least decrease at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.18 g . The average of spleen weight was decrease during the two dosage duration . The least decrease at P< 0.05 for 28 days after the dosage of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.06 g . The acute and chronic exposure to the pesticide for 14 , 28 days of dosage was the cause for the increase of the average of the Erythrocytes count , the average of the Haemoglobin , in the average of the percentage of the Packed Cell Volume ( PCV ) . It was also observed that the “Thiamethoxam” pesticide at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. registered the highest level of P< 0.05 . When it was chronically exposed for 28 days of dosage and the blood measurements were ( 9.84±0.17 cell / mm3 , 50.60±0.54 % , and 16.58±0.87 g / 100 ml ) respectively .The differential Leukocytic count has shown the highest significant level P< 0.005 at the chornic exposure for 28 days after the dosage at 0.12 mg/ kg b. w. of Lymphocyte average of 80.80±0.85 % . Significant decrease of the Neutrophile average has shown a significant decrease and the least decrease was P< 0.005 at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after the dosage . Then showns 10.00±0.98 % . The average of Monocyte has shown a decrease of P< 0.005 and the least average at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after dosage which comes to 5.20±0.44 % .The severe histopathological changes was leveled according to the dosage and the duration , it has observed lymphocytic aggregation a round blood vessels , congestion and necosis of hepatic cells with the existence of cells which suffer from apoptosis as well as the existence of granuloma and it has observed a rebuild of hepatic cells which is characterized by hyperplasia of these cells and the division of its nucleus obviously which refers to the role of this pesticide which causes cancer . In addition degeneration changes have been observed in the renal tubular epithelium besides the depletion in spleen in the first stages of giving dosage and has turned to hyperplasia of white pulp in the following stages .The previously mentioned results can give a sufficient impression about toxicity effect of the insecticide “ Thiamethoxam “ through its obvious effects in the tissue of the organs especially the liver tissue in addition to the hematological changes.

دراسة انتاجية بعض مركبات الايض الثانوية من المزارع النسيجيه لنبات الثوم . Allium sativum L == Study of the yield of some secondary metabolite in tissue culture of Allium sativum L

Author name: زينب سالم حسين
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية, قسم علوم الحياة, كلية العلوم, الجامعة المستنصريه, بهدف زيادة انتاج بعض مركبات الايض الثانوي في المزارع النسيجية لنبات الثوم .Allium sativumL . قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهاز كروماتوكرافيا السائل ذو الاداء الفائقHPLC وقورنت مع مستخلص فص الثوم . حفز الكالس على النشوء باخذ اجزاء من فصوص نبات الثوم بعد زراعتها على الوسط الغذائي (MS) Murashige and Skoog, (1962) الحاوي على تراكيز مختلفة من منظمات النمو شملت Dichlorophenoxy acetic acid ( (2,4 - Dبالتراكيز 0 ,1 ,2 ,3 ,4) ) ملغم/لتر وBenzyl adenine (BA) بتركيز1ملغم /لتر وNaphthalene acetic acid (NAA) بتركيز 0.5 ملغم/لتربالنسبه للوسط الاول اما الوسط الثاني فقد استعملت منظمات نمو شملت 2,4 - D بتركيز, .0.5 ,1 ,1.5 ,2, 2.5) 0) ملغم /لتر وKinetin بتركيز 0.5 ملغم /لتر. واظهرت النتائج ان الوسط الحاوي على 2 ملغم/لتر 2,4 - D وBA بتركيز 1ملغم/لتر وNAAبتركيز0.5 ملغم /لتر قد اعطت اعلى معدل للنسبة المئوية لاستحثاث الكالس بلغت %60 واعلى معدل وزن طري بلغ 839ملغم بالنسبه للوسط الاول وقد استعملت التوليفه اعلاه في ادامة الكالس المستحث. واعطى الوسط الثاني الحاوي على 1.5))ملغم/لتر2,4 - D وKinetin بتركيز0.5))ملغم /لتراعلى نسبه مئويه لاستحثاث الكالس بلغ %50 وقد اعطى الوسط الحاوي على 1.5 , 2ملغم/لتر(2,4 - D) وkinetinبتركيز0.5 ملغم /لتراعلى معدل وزن طري بلغ 748.6,750.0 ملغم/لتر. وبغية زيادة انتاج المركبات الثانوية وظفت عوامل تحفيز فيزيائية وكيميائية تضمنت الاشعة فوق البنفسجية (Ultraviolet) وحامض الساليساليك , وحامض الفنل النين بالتراكيز200,150,100,50,0ملغم/لتر لـحامض السالسيلك (Salicylic acid) وحامض الفنل النين Phenyl alanineبالتراكيز40,30,20,10,0 ملغم/لتراما الاشعة فوق البنفسجية نوع B فقد كانت مدة التعريض 30,20,10,0دقيقة . واظهرت النتائج ان حامض الساليسلك كان افضل محفز لزيادة مركبات الايض الثانويه اذ اعطى حامض الساليسليك افضل تركيز للتحفيز وزيادة الانتاج بتركيز 100 , 150ملغم/لتروقد اعطى التركيز 100ملغم /لتر اعلى معدل وزن طري بلغ 743 ملغم /لتر.اما حامض الفنل النين فقد اعطى التركيز 20 ملغم/لتر زياده معنوية في مركب الallicine اذ بلغ المعدل 52.2 ملغم اما بقية التراكيز فلم تكن الزيادة معنوية.اما بالنسبة للاشعة فوق البنفسجية فقد سببت المده 10دقيقه زيادة معنوية لمركب الagoene اذ بلغ المعدل 37.6 ملغم اما بقية المعاملات فقد اعطت زيادة ولكنها غير معنوية في تركيز المركبات.

تاثير الفعالية التثبيطية لمستخلصات نبات الكبار Capparis spinosa L. في بعض الاحياء المجهرية ذات الاهمية الطبية

Author name: سراء نصيف مسلم
Supervisor name: رضا ابراهيم حسين البياتي | نزار ادورناصر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحـــولية لجذر واوراق وثمار نبات الكبار Capparis spinosa في نمو البكتريا Escherichia coliو Klebsiella spp. Staphylcoccus aureus وPseudomonas aeruginosa والفطــــــــــــــــــــــــــــريات Candida albicans المعزولة من الاصابات الجلـــدية وذلك باستخدام طريقة الحفر بالاكار لاختبار فعالية المستخلصات ضد البكتيريا والخميرة، ولقد اختلفت نتائج دراسة الفعاليــة التثبيطية للمستخلصات باختلاف نوع المستخلص نفسه, وتنوع الكائن المجهري. وكانت بكتريا S. aureus الموجبة لصبغة كرام اكثرها تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا .Klebsiella spp اكثرها مقاومة لفعل المستخلصات النباتية. وتم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل المستخلصات , وقد بينت نتائج الكشوفات الكيميائية لها بان المستخلص المائي يحتوي على المركبات الاتية : كلايكوسيدات وقلويــــــــدات وصابونيات وتانينات والفلافونات والفينولات . وان هذه المركبات لها القابلية عـــــــلى الذوبان في الماء ، اما المستخلص الكحولي لنبات الكبار فانه يحتوي فضلا عما ذكـــــر على مركبات راتنجية ,وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية . بالنسبة الـــــى مستخلصات الجــــذر فقد كان المستخلص المائي افضل في تاثيره على البكتريا والخميرة بتركــــــيز 500 ملغم/ مل , اذ كانت معـــــدلات اقطار مناطق تثبيــــــــط St. aureus وE. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa . 22 ) و13.1 و12 و21.3 ) ملـــــم وعلى التوالــي مقارنة مع معـدلات اقطار مناطـــق التثبيــط للمستخلص الكحـــولي وللتراكيز نفسها ( 4.2و6.8 و3.2 و10.4) ملم وعلى التــــوالي . اما بالنسبة الى مستخلصات الاوراق فقد كان المستخلص المائي افضل من المستخلص الكحــولي في تاثيره في الانواع البكترية St. aureusو E. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa والخمــــــــيرة C.albicans بتركيز 500ملغم/ مل وبمعــــدلات اقطار تثبيــــــط (22 و10.9 و21.5 و21.3 و5.5 ) ملم وعلى التوالي مقارنة مـــع المستخلص الكحـــــــولي وبمعــــدلات اقطار( 21.9 و0 و0 و8.4 و3.2) ملم على التوالي. كما وجد ان المستخلص الكحولي لثمار نبات الكبار ذمو تاثير افضل من المستخلص المائي على البكتريا والخميرة قيد الدراسة وبتركيز 500 ملم /مل. وعند المزج بين مستخلصات الاجزاء الهوائية (الاوراق والثمار) والجزء الارضي (الجذر) بنسبة 1 : 1 ودراسة تاثيرها على البكتريا والخميرة قيد الدراسة , تبين ان خلط المستخلصين له تاثير اقل مقارنة من تاثيرهل منفردا. | The present study dealt with the effects of watery and alcoholic extracts of root, leaves and fruits of Capparis spinosa on the growth of Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella spp. , Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans isolated from patients suffering from skin infection . Agar - well diffusion method was used for this purpose.With respect to inhibitory effects of the plant extracts on the studied microorganisms, the results indicated that there were clear variation. These were depended on the types of the extracts and the kinds of microorganisms. chemical analysis were done on the plant for identification of active compounds. The results have illustrated that watery extract contained the following compounds : Alkaloids, Glycosides, Tanins, Saponins,Phenoles and Flavones. These compounds were all soluble in water. Alcoholic extract of this plant contained, in addition to as mentioned above, rasins compound. These alcoholic extracts were soluble in organic solrents, but not water soluble .Watery and alcoholic extracts of root were applied to study their effect on the microorganism of the present study. The results demonstrated that watery extracts were more efficient, as bacterial and yeast inhibitors , at an extract concentration of 500 mg/ml . These extracts have gave average inhibition zone diameters to Staphylococcus aureus , Escherichia coli, Klebsilla spp., Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans of ( 22 , 13.1 , 12 , 21.3 , 11) mm respectively . while alcoholic extracts which gave average inhibition zone diameters for the same bacteria and yeast of ( 4.2 , 6.8 , 3.2 , 10.4 , 13.4 ) mm respectively.The resutts of this wack also showed that watery extracts of leaves were more efficient, hence they gave, at aconcentration of 500 mg/ml, average inhibition zone diameters to S.aureus , E.coli,Klebsilla spp., P. aeruginosa and C. albicans of (22 , 10.9 , 21.5 , 21.3 , 5.5 ) mm respectively compared to alcoholic extracts that were showed, at the same extract concentration, relatively, lower average inhibition zone diameters, for the same microorganisms of (21.9 , 0 , 0, 8.4 , 3.2) mm respectivelyMoreover, alcoholic extract of C. spinosa fruit, at aconcentration of 500 mg/ml , were efficient, as microbial inhibitor, than watery extracts.Among different currently studied microorganism, Gram positive Staphylococcus aureus was the most sensitive isolates to inhibitory action of the extracts. In contrast, Gram negative Klebsilla spp. Was the most resistant type to the action of these extracts.Few inhibitory response were noticed upon mixing, at rate 1 : 1, of aerial and terrestrial extract of C. spinosa.

دراسة مختبرية للسيطرة على الاعمار اليرقية المحتلفة لبعوضDiptera : Culicidae Culex pipiens Say باستخدام منظم النمو Dimilin والمبيد الاحيائي Bacillus thuringiensis Israelensis == Laboratory Stuty on the Control of Culex pipiens Say (Diptera : Culicidae) Different Larval Instar Using Dimilin Growth Regulater and Bio.pesticide Bacillus thuringiensis Israelensis

Author name: زينب عباس عودة
Supervisor name: معن عبد العزيز شفيق
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر بحوث الحيوان / البيت الحيواني /كلية العلوم /الجامعة المستنصرية لتقيم كفاءة منظم النمو Dimilin المثبط لتصنيع الكايتين بواقع ثلاث تراكيز مختلفة (0.5 ، 1.0 ، 1.5 ) جزء بالمليون وكفاءة عالق البكتريا Bacillus thuringiensis israelensis بالتراكيز الاتية (6.25×108، 6.25×1010 و6.25×1012 ) بوغ / مل على الاعمار اليرقية المختلفة لبعوض Culex pipiens.وبلغت اعلى نسبة قتل 100% لمنظم النمو بالتركيز 1.5 جزء بالمليون للفترة 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للفترة 12 ساعة للتركيز 0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الاول، اما اعلى نسبة قتل بلغت %86.67 لمنظم النمو بالتركيز1.5 جزء بالمليون خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 20% خلال 12 ساعة للتركيز0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الثاني. واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 73.33% خلال 48 ساعة للتركيز1.5 جزء بالمليون واقل نسبة قتل بلغت 33.33% للتركيز 1.0 جزء بالمليون خلال 12 ساعة للعمر اليرقي الثالث على التوالي. واعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الرابع بلغت 80% خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للتركيزين 0.5 و1.0 جزء بالمليون لمنظم النمو . واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل للمبيد الاحيائي B.thuringiensis israelensis بلغت 100% للعمر اليرقي الاول بالتركيز 6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 40% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة. وكانت اعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الثاني 100% بالتركيزين 6.25× 1010 و6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 53.33% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة واعلى نسبة قتل بلغت للعمر اليرقي الثالث والرابع 100% على التوالي خلال 48 ساعة للتركيز 6.25×1012 بوغ/مل واقل نسبتي قتل للتركيز 6.25×108 بوغ/مل بلغت 40% و33. 33% للعمرين نفسيهما على التوالي خلال 12 ساعة. كما ودرس تاثير المبيد الحيوي التجاري Antrol للبكتريا B.thuringiensis israelensis في التركيز 0.0105 غم /مل للاعمار اليرقية المختلفة وبينت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 100% خلال الفترتين 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 80% للفترة 12 ساعة للعمر اليرقي الاول . واعلى نسبة قتل بلغت 100% للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع على التوالي خلال 48 ساعة، واقل نسب قتل للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع بلغت 66.67، 53.33 و40% على التوالي خلال 12 ساعة . | This study was conducted at the Researches Laboratory / Animal House / College of Science / Mustansiriyah University to evaluate the efficiency of the growth regulator Dimilin Chitin synthesis inhibitor using three different concentrations of 0.5, 1.0 and 1.5 ppm and the efficiency suspension of bacteria Bacillus thuringiensis israelensis at there concentrations 6.25 × 108, 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml to different larval instars of mosquito Culex pipiens in composion The highest mortality 100% of the growth regulator reached at the concentration1.5 ppm for a period of 48 hours and lowest mortality was 26.67 % for the period of 12 hours for the concentration of 0.5 ppm for the first larval instar, respectively. The highest mortality was86.67 % for the growth regulator at concentration1.5 ppm 48 hours and lowest mortality was 20 % during the 12hours at concentration of 0.5 ppm for the second larval instar, respectively. The results also showed that the highest mortality was73.33 % during the 48hours at concentration of 1.5 ppm and lowest mortality was33.33 % for the concentration of 1.0 ppm during the 12 hours for the third larval instar, respectively. The highest mortality of the fourth larval instar reached 80 % in 48 hours and lowest mortality was 26.67 % at the other two concentrations (0.5 and 1.0 ppm) for Dimilin. The results also showed that the highest mortality of bio - pesticide Bacillus thuringiensis israelensis was100% for the first larval instar at concentration of 6.25 × 1012 spores / ml within 24 to 48 hours and lowest mortality was 40% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours. The highest mortality for second larval instar was 100% at two concentrations 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml within 24 and 48 hours, respectively, and the lowest mortality was 53.33% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours and the highest mortality reached 100% for the third and fourth larval instars respectively, during the 48 hours at concentration of 6.25 × 1012 spore /ml, The lowest mortalities at concentration at 6.25 × 108 spore / ml were 40 and 33. 33% for the same two instars, respectively, within 12 hours. The impact of biocide Antrol at concentration of 0.0105 mg / ml in the first larval instar was 100% in both 24 and 48 hours, and the lowest mortality was 80% for the exposure period of 12 hours. The highest mortality was 100% for second, third and fourth larval instars, respectively, within 48 hours, and lowest mortality for second, third and fourth larval instars were 66.67, 53.33 and 40%, respectively, within the 12 hours exposure period. Finally the results showed that the mortality of the chemical pesticide Temephose was100% for all larval instars within 12 hours.

استخلاص ، تنقية وتوصيف انزيم اللكنين بيروكسيديز المنتج من العزلة الفطرية المحلية Aspergillus terreus == Extraction, purification and characterization of lignin peroxidase enzyme produced from local fungal isolate Aspergillus terreus

Author name: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
Supervisor name: ندى صباح رزوقي | غازي منعم عزيز
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل وتشخيص 18 عزلة فطرية محلية من 75 عينة روث خيول جمعت من نادي الجادرية ونادي العامرية للفروسية في بغداد خلال 8 اشهر للفترة من تموز 2013 الى اذار 2014 . سجلت العزلة A. niger اعلى نسبة ظهور بين العزلات واعلى تكرار % 80 %9.8, على التوالي تبعتها العزلة A.fumigatus (%9.8 , % 48) ثم العزلة A.terreus (% 8.2 , % 46.66) ، بينما سجلت العزلة Absidia cerymbifera اقل ظهور واقل تكرار(%3.28 , % 5.33) تبعتها العزلة Syncephalstrum racemosum ( % 2.67 و( %1.64 على التوالي. اختيرت العزلة A.terreus SG777 كافضل عزلة لانتاج هذه الانزيمات اذ سجلت اعلى فاعلية نوعية لانتاج الانزيمات المحللة للكنين ( لكنين بيروكسيديز 11.828 ، منغنيز بيروكسيديز1.131 واللاكيز 0.527) وحدة /ملغم . ثبتت الظروف المثلى لانتاج الانزيمات المحللة لللكنين من العزلة الفطرية A. terreus SG 777 باستخدام تخمرات الحالة الصلبة ( سيقان الموز كمادة اساس ، فترة الحضن 8 ايام ،حجم اللقاح1 × 105 بوغ / مل ، برقم هيدروجيني 4.5 وبدرجة حرارة 35م°). رسب انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع %80 ثم ازيل الملح من الانزيم المنتج من عفن777 Aspergillus terreus SG باستخدام طريقة النضح الغشائيDialysis تجاه المحلول الدارئ (Tris buffer) ونقي جزئيا بواسطة كروماتوغرافيا التبادل الايونيIon exchange chromatography باستخدام المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدد مرات للتنقية بلغ 5.4 مرة وبحصيلة انزيمية مقدارها %13.7اظهر الانزيم اعلى فغالية وثباتية عند الرقم الهيدروجيني 3.0 ,في حين اقصى فاعلية للانزيم ظهرت عند درجة حرارة 40 م° مع احتفاظ الانزيم بفاعليته عند درجات حرارة تراوحت بين 25) - 35 ) م°. درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة عدة صبغات واظهرت النتائج اعلى نسبة ازالة ( 83.61 %) للانزيم تجاه صبغة الكونغو الحمراء باستخدام 65.51 وحدة / مل منه وبفترة حضن 4 ساعات وتبعتها صبغة المثيلين الزرقاء بنسية تحطيم %58.6 ثم صبغة المثيل الحمراء بنسبة ازالة بلغت % 49.9.بينما سجلت الصبغات الملاكايت الخضراء ، الالورا الحمراء والتارترازين % 24.87 ,% 28.8 , %26 على التوالي كادنى نسبة تحطيم بوساطة الانزيم قيد الدراسة . درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة المركبات الحلقية المتعددة التي تم الكشف عنها وذلك لمقارنة فاعلية الانزيم مع نتائج المعالجات في مصفى الدورة والتي تضمنت (المعالجة الميكانيكية، المعالجة الكيميوفيزيائية والمعالجة البايولوجية ) . اظهرت النتائج ازالة 97.54 % للمركب Di benzo (a ,h) anthrancene باستخدام 65.51 وحدة / مل من الانزيم قيد الدراسة وبفترة حضن 4 ساعات وبدرجة حرارة 40 م° في حين بلغت نسبة الازالة بوساطة معالجات المصفى % 54.37 كما بلغت نسبة الازالة لكل من Floureneو anthrancene قد بلغت % 95.98 و% 83.51 على التوالي مقارنة بنسبة الازالة %84.51 , % 46.83 بوساطة معالجات المصفى . قيد انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام %2 وزن / حجم من الجينات الصوديوم و200 ملي مولار و50 من مل كلوريد الكالسيوم . بينت النتائج ان % 99 من فاعلية الانزيم الحر تم تقييدها .اجريت عملية خزن انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر لمدة اربعة اسابيع عند درجة حرارة 4 م° لمعرفة مدى احتفاظ الانزيم المقيد بفاعليته الانزيمية مقارنة بالانزيم الحر، اذ لوحظ ان الانزيم المقيد قد احتفظ % 88.29 من فاعليته الاصلية بينما احتفظ الانزيم الحر حوالي 66. 02 % من فاعليته الاصلية. استخدم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر في تحطيم صبغة المثيلين الزرقاء ، اذ اظهرت النتائج ان نسبة التحطيم بالانزيم المقيد بلغت حوالي % 40.1 لفترة حضن 4 ساعات بينما بلغت نسبة تحطيم الصبغة حوالي % 25.79 باستخدام الانزيم الحر وبنفس فترة الحضن .حطم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد حوالي% 57.89 من صبغة الكونغو الحمراء عند استخدامه لاول مرة ، وانخفضت قابلية الانزيم المقيد على تحطيم الصبغة الى 16.11% عند استعماله للمرة الرابعة. | Eighteen local isolates were collected from seventy five horse manure samples taken from horses in the Equestrian Club in Jadriya and Al - Amrya / Baghdad that were investigated during the 8 months; the period isolation was started from July 2013 to march 2014. Aspergillus niger was the highest occurrence and frequency (80% and 9.8 %) respectively, followed by A . fumigatus (48 % and 9.8 %) and A. terreus (46.66 % and 8.2 % ) occurrence and frequency respectively , whereas Syncephalstrum racemosum (2.67 % and 1.64%) respectively . The isolate A. terreus had the higher specific activity of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase 11.828, manganese peroxidase 1.13 and laccase 0.53) U/mg. The optimum conditions of ligninolytic enzymes produced from A. terreus SG777 were estimated using solid state fermentation : banana stalks as a substrate, period incubation 8 days, moisture level 1 : 5 w/v inoculum size 1x105 spores /ml, pH 4.5 and temperature 35 °C. Lignin peroxidase produced from A. terreus SG777 precipitated with 80% ammonium sulfate saturation then desalting by dialysis against Tris buffer solution and partially purified by ion exchange chromatography using DEAE - cellulose. The specific activity reached 56.67U/mg with purification fold was 5.4 times and 13.7% recovery. The optimum pH for activity and stability was 3. The maximum activity was observed at 40°C and the enzyme maintained the activity when it was incubated at 25 - 35˚C. Lignin peroxidase removal the dyes during 4hr. Congo red was decolorized to the maximum extent of 83.61% in 4 hr by 65. 51 U/ml of the pure lignin peroxidase, methylene blue decolorized 58.6% and methyl red azo dye was decolorized to the extent of 49.9% ,while Malachite green triarylmethane dye, allura red and tartarazine showed minimum extent decolorized 26, 28.8 and 24.87% respectively. Degradation of poly aromatic hydrocarbons when incubated with 65.51 U/ml lignin peroxidase at 40 °C for 4 hr compared with the Refinery treatment . Results showed (97.54%) removal efficiency of Di benzo (a ,h) anthrancene by lignin peroxidase, while only 54.37% was treated by Refinery treatment. Flourene and anthrancene degradation 95.98% and 83.51% respectively, while the flourene and anthrancene degradation treated by Refinery treatment only 84.51% and 46.83% respectively. Lignin peroxidase immobilization by 2% (w/v) sodium alginate and 200 mM of calcium chloride. Results showed that 99 % from free lignin peroxidase was immobilized. The stability of immobilized and free Lip enzyme was studied during four weeks; remaining activity for immobilized Lip was 88.29 % from its original activity 76 U/ml during four weeks while free Lip remaining activity was 66. 02 % from its original activity (76.04 U/ml). Methylene blue dye degraded about 40.1% by immobilized Lip during four hr compared with free Lip which has removal only 25.79% from dye concentration. The immobilization lignin peroxidase removal 57.89 % from congo red in first use and then the immobilized lignin peroxidase ability reduced to 16.11% dye removal after four uses.

العوامل البيئية المؤثرة على ظاهرة اضطراب الطعام في الانسان والطيور في محافظة بابل == Environmental factors influencing the Eating Disorder Phenomena (pica) in Humans and Birds in Babylon Province

Author name: سحر سعدي محمد السراراتي
Supervisor name: فاضل فرهود مكي الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت الدراسات الحالية في محافظة بابل في الفترة من تشرين الاول 2015 الى حزيران 2016 وذلك لتحديد مدى ارتباط نقص بعض العناصر النزرة مثل مستوى الزنك والحديد والنحاس والكالسيوم في مصل الدم فضلا عن تركيز الهيموغلوبين في الدم للاطفال والنساء الحوامل المراجعين لمستشفى بابل للنسائية والاطفال وبعض العيادات الخارجية والذين يمارسون التغذية على مواد غير غذائية ومقارنتها مع عينات من اشخاص لا يمارسون هذه الظاهرة (مجموعه السيطرة) .وبلغ عدد الاطفال الذين شملتهم الدراسة (350) طفلا تراوحت اعمارهم مابين (ثمانيه اشهر - خمسة سنوات). اما عدد النساء الحوامل اللواتي شملتهن الدراسة فقد بلغ (130) امراة. وقد تم اجراء استبيان لجميع الاشخاص الذين شملتهم الدراسة تضمنت العمر والجنس ونوع المواد غير الغذائية المتناولة ومستوى التعليم والسكن وغيرها لبيان مدى ارتباط تلك العوامل بانتشار ظاهرة اضطراب الطعام (pica) . وايضا شملت الدراسة اجراء مقارنة بين قوانص مجموعتين من الطيور الداجنة (الدجاج المنزلي ) احداهما يعيش بصورة حرة والاخرى مرباة في حقول مغلقة لبيان مدى تاثير ظاهرة اضطراب الطعام (pica) على تركيب النسيج المبطن للقوانص وقد اظهرت نتائج الدراسة الاتي : اولا : محور الاطفال• ان الشكل الشائع لظاهرة اضطراب الطعام في الاطفال هو Geophagia اي اكل التربة وبنسبه 67%• بلغت نسبة الاطفال الذين يمارسون ظاهرة اضطراب الطعام 57.14 % من مجموع الاطفال الذين شملتهم الدراسة .• اظهرت النتائج الحاليه بان معدل نسبه الزنك الكليه في الاطفال اللذين يمارسون ظاهرة اضطراب الطعام تكون منخفضه (81.42±35.40) مايكروغرام/ديسلتر بالمقارنه مع (88.83±15.17) مايكروغرام /ديسلتر للاطفال الاصحاء (P>0.01) .و اظهرت النتائج وجود ارتباط معنوي ايجابي بين مستوى الزنك في مصل الدم ومستوى الهيموغلوبين في الدم (r=0.5) لدى الاطفال المصابين ب Pica.• بلغت نسبة الحديد الكلية للاطفال اللذين يمارسون اضطراب الطعام(38.16±23.91) مايكروغرام/ديسلتر بالمقارنة مع (76.96±15.76) مايكروغرام/ديسلتر للاطفال الاصحاء ولوحظ وجود ارتباط معنوي بين مستوى الحديد في مصل الدم ومستوى الهيموغلوبين في الدم(r=0.7) في الاطفال اللذين يمارسون اضطراب الطعام.• بلغ المعدل الكلي لنسبة الكالسيوم في مصل الدم لدى الاطفال الذين يمارسون اضطراب الطعام(7.72±3.52) ملغم/ديسلتر بالمقارنه مع (9.18±1.34) ملغم/ديسلتر للاطفال الاصحاء ولوحظ كذلك وجود ارتباط معنوي بين مستوى الكالسيوم في مصل الدم ومستوى الهيموغلوبين في الدم(r=0.65) عند الاطفال المصابين ب Pica.• وجد بان هنالك ارتفاعا معنويا في مستوى النحاس في مصل الدم لدى الاطفال الذين يمارسون اضطراب الطعام(27.82±39.68) مايكروغرام/ديسلتر بالمقارنه مع الاطفال الاصحاء(46.58±15.05) مايكروغرام/ديسلتر ووجد بان الارتباط مابين مستوى النحاس في مصل الدم ومستوى الهيموغلوبين في الدم ضعيف لكلا المجموعتين من الاطفال(الاطفال المصابين والاطفال الاصحاء).ثانيا / محور النساء الحوامل • شملت مواد اضطراب الطعام التي تميل النساء لتناولها على الثلج والتربة اذ كانت اعلى نسبة هي نسبة الثلج 46% تليها 42% و12% للتربة والثلج والتربة معا على التوالي .• بلغت نسبة النساء اللواتي يمارسن ظاهرة اضطراب الطعام 38.46% من مجموع اعداد النساء اللواتي شملتهن الدراسة .• اكدت الدراسة وجود تاثير معنوي لعامل فترة الحمل اذ بلغ معدل انتشار ظاهرة اضطراب الطعام 56% خلال الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع 30% و8% و6% خلال الثلث الثالث والثلث الثاني وخلال فترة الحمل باكملها على التوالي (P>0.05).• اظهرت الدراسة الحالية وجود انخفاض معنوي في معدل نسبة الكاليسيوم في مصل النساء المصابات اذ بلغ 8.47 ملغم/ديسلتر بالمقارنة مع 9.06 ملغم/ديسلتر في مجموعة السيطرة (P>0.05).ثالثا\ محور الحيوان• كانت طبقه الكولين المبطنه لقوانص الدجاج المرباة بصورة حرة اكثر سمكا من تلك المرباة في حقول مغلقه.• السطح العلوي للخلايا المكونه للغدد الفارزة لمادة الكولين في الطبقة المخاطية تكون مفككة وغير منتظمة في الدجاج المرباة بصورة حرة في حين كانت تلك الخلايا غير مفككة ومنتظمة في الدجاج المرباة في حقول مغلقه | The present study was carried out in Babylon Province during the period from October 2015 till June 2016 in order to determine the prevalence of pica in children and pregnant women who visited Babylon hospital for children and women and clinics of some specialist physicians in hillah center .Association of pica with deficiency of some trace elements such as zinc, iron, copper and calcium in blood serum and hemoglobin concentration in the blood of the patient who practice pica and those of no pica ,where calculated too.The total number of children's included in the present study was 350 child, with age ranged from less than one year up to six years old. Total number of pregnant women included in the present study was 130 women personal information such as age, sex, residence, habits of eating non - food substance , educational level and standard of living of studied person were interviewed using a questionnaire sheets , in order to determine these association with pica. The adverse effect of pica on structure of tissues lining the inner part of gizzards of two group of domestic chickens, one kept feeding freely in open farm ,the other kept feeding under controlled conditions was studied, too. The results showed the following : 1 - pica in children's - The most common form of pica in children is geophagia in percentage 67% - The percentage of children's practicing pica in Babylon Provence was 57.14%. - Mean plasma zinc in children with pica was significantly lower(81.42±35.40 mg\dl) than those with no pica (88.83±15.17 mg\dl) (P>0.01) , and there was a significantly a positive correlation between zinc level in blood serum and the level of hemoglobin in blood (r=0.5) in children with pica. - Mean plasma iron level in children with pica was also much lower(38.16±23.91 mg\dl) than those of no pica (76.96±15.76mg\dl). And there was a significantly correlation between iron level in serum blood and hemoglobin level in blood (r=0.7) in children with pica. - Mean plasma calcium level in children with pica was(7.72±3.524 mg\dl) which significantly lower than those with no pica(9.18±1.34 mg\dl).and there was a significantly correlation between calcium level in blood serum and hemoglobin level in blood(r= 65) in children with pica. - In contrast mean plasma copper level in pica children was significantly higher (82.27±39.68 mg\dl) than those of no pica (46.58±15.08 mg\dl).and there was weak correlation between copper level in blood serum and hemoglobin level in blood in both groups of children (patient and control group). 2 - pica in pregnant women - The most common forms of pica practiced by pregnant women were ice(46%) ,soil(42%) and soil and ice(12%). - The prevalence of pica in pregnant women in Babylon provence was 38.46% of the total number of women included in this study. - The highest percentage of pica in pregnant women recorded in the 1st trimester (56%)as compared with 30% ,8% ,6% ,in the 2 nd, 3 rd, and whole pregnancy period , respectively. - There was a significant decrease in the mean plasma calcium level of pica women as compared with 9.06% in the non - pica children.3 - Pica in Animals - The thickness of kolin layer of gizzard of chickens reared in an open field much more than those reared in closed system. - The upper layer of the cells that makes the koilin excretory glands in the mucosa layer was disassembled in the gizzard of chickens which were reared freely in the farm, However , those of the chickens reared in the close farm system, were assembled

استخلاص وتنقية انزيم اللايبيز من عفن Aspergillus niger 11414 (ATCC) واستخدامه في تحسين نوعية الدهن الحر == Extraction and purification of Lipase from Aspergillus niger 11414 ( ATCC) to improve the butter oil

Author name: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الد راسة عزل وتنقية انزيم اللايبيز من العزلة القياسية Aspergillus niger 11414 ( ATCC) ثم تطبيقه عمليا في مجال الصناعات الغذائية . • تم تــنمية العزلة وتنشـــيطها على وسط اجار البطاطا والدكستروز Potato dextrose Agar PDA . • تم التحري الاولي عن انتاج انزيم اللايبيز من العزلة A. niger 11414 بطريقة الاطباق باستخدام وسط ( Tween 80 ) ، وظهرت النتيجة موجبة بشكل هالة معتمة تحيط المستعمرة الفطـرية . استخدم وسط Tween 80 واضيف زيت الزيــــتون بـــدل الـ (Tween 80) الى وسط التحري وكانت النتيجة موجبة اذ ظهرت الهالة المعتمة حول المستعمرة لكن بمساحة اكبر مما سبق . • درست عدة معايير ( تركيز زيت الزيتون ، مدة التخمر ، الاس الهيدروجيني الابتدائي ، حجم اللقاح ، درجة الحرارة ) لايجاد الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايـــبيز وكانــــت افضل الظروف لانتاج الانزيم هي ( تركيز زيت الزيتون 1 % ، مدة التخمر 168 ساعة ، واس هــــيدروجيني ابـــتدائي 6 وحجم لقاح 10 × 1 ( بوغ / مل ) ودرجة حرارة 30 م ، اذ سجلت عند هذه الظروف اعلى فعالية للانزيم المنتج . • اظهر الانزيم الخام بعد حضنه باسس هيدروجينية مختلفة لمدة 30 دقيقة ثباتا عند قيم الاسس الهيدروجينية بين ( 5.0 - 4.0 ) ، فيــــما اظهر الانـــــزيم الخام بعد حضنه في درجات حرارة مختلفة لمدة 60 دقيقة ثباتا حراريا عند ( 40 - 50 ) م , احتفظ الانزيم بكامل فعاليته.• استخدمـــت خطوات متسلسلة لغرض تنقية انزيم اللايبيز شـملت اولا التركيز بكبريتات الامونيوم وكان افضلها 30 % حين بلغت اعلى فعالية نوعية عندها بمقدار 3.8 وحدة / ملغم برويتن ، استخدمت خطوة الديلزة للتخلص من الاملاح . لقد اظهرت النتائج ارتفاع الفعالية والفعالية النوعية للانزيم اذ اصبحت 8.64 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 8.73 . بعدها مرر الانزيم المنقى جزئيا على عمود هلام Sephadex G - 75 مرتين وجمعت الاجزاء التي اظهرت فعالية انزيمية ، مرر بعدها خلال عمود هلام Sephadex G - 100 ازدادت خلالها نقاوة الانزيم اذ ارتفــعت الفعالية النوعية الى 142.8 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 143.19 وبحصيلة انزيمية 87.5 % .• درست بعض الخصائص المهمة للانزيم المنقى جزئيا اذ اظهر الانزيم المنقى جزئيا ثباتا تجاه قيم من الاس الهيدروجيني بين ( 5 - 6 ) ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل 5.6 واحتفظ الانزيم المنقى جزئيا بـكامل فعاليته عند درجتي حرارة 30 و40 م على التوالي ولمدة 30 دقيقة وفقد 95 % من فعاليته عند درجة حرارة 80 م وللمدة نفسها ، اما درجة الحرارة المثلى فكانت 35 م . • استعمل اللايبيز المنقى جزئيا في تحسين نكهة الدهن الحر الذي تم معاملته بالانزيم ، اما السيطرة Control فتمثلت باضافة محلول دارىء فوسفات السترات ذي الاس الهيدروجيني 6.0 فقط الى الدهن الحر . اجري تقييس الفعالية على المعاملتين واظهرت النتائج ان هناك تغيرا محسوسا في الدهن المعامل بالانزيم في حين بقيت السيطرة دون تغيير . • استـخدم الدهن الحر المعامل بالانــــزيم والسيطرة Control في صنــع بعض انـــواع الحلويات ( البرمة ). عمل تقييم حسي للمنتوج من خلال 31 عينة للصــــفات ( اللون ، النسجة ، الرطوبة ، الرائحة ، النكهة " الطعم " ) . حللت النتائج احصائيا ووجد فرق معنوي ملحوظ بين الدهن الحر المعامل بالانزيم والسيطرة ، عدا صفة اللون فكان الفرق غير معنوي لكلتا المعاملتين . | In this study the extraction and purification of Lipase from isolated A. niger was studied. The ability of A. niger to produce Lipase was tested on Tween 80 media , indicate the positive result. Better result was obtained by added olive oil instead of Tween 80 media Several culture conditions were studied to determine the optimum conditions for Lipase producing , and the optimum conditions were : Concentration of Olive oil 1 % , period of fermentation 168 hour, initial pH 6 , inoculums size 1×10⁵ ( Spore / ml ) and the temperature 30 ℃ higher activity of produced enzyme was recorded in this conditions. The crude enzyme was stable after incubation at different pH (4 - 5 ) for 30 min., the enzyme was stable after incubation at different temperature (40 - 50) ℃ for 60 min., the enzyme retained all activity . Sequent steps used to purify Lipase. These included the concentration in ammonium sulfate the optimum saturation rate was 30 % , while the enzyme specific activity was 3.8 Unit / mg protein . Dialysis of enzyme resulted in increase of specific activity, which became 8.64 Unit / mg protein. Partially purified enzyme to the gel column sephadex G - 75 twice, the parts which show enzyme activity collected and added to the gel column sephadex G - 100, this increased the enzyme purification and a specific activity increased to 141.76 Unit / mg protein , while the number of purification was 193.19 and 82.46 % yield. Properties of the partially purified Lipase were investigated. Its showed stability against the values of pH (5.0 - 6.0) and the optimum pH was ( 5.6 ). The partially purified Lipase retained all activity 1n the temperature ( 30,40 )℃, for ( 30 ) minutes , and lost 95 % of its original activity at ( 80) ℃ , for the same time , while the optimum temperature was 35 The partially purified enzyme is used for improvement the flavor of butter oil which was treated with the enzyme , while the control was treated by addition phosphate citrate buffer solution ( pH = 6.0) only to the butter oil , the results showed that was sensible changes in the butter oil treated with enzyme while the control remain without any changes. The animal fat which treated with enzyme and the control was used in some kinds of sweets ( Al - Burma ) , making sensible evaluating for the product by (31) samples for characterization (color, texture, moisture, odor and flavor " tastes "). The results were analyzed statistically , and the noticed incorporeal comparison was found between the butter oil treated with enzyme and control , except the properties of color , it was non incorporeal comparison for both samples

دراسة تشخيصية وفسلجية لبعض الفطريات المائية == Diagnostics and physiological study on some aquatic fungi

Author name: سرمد سالم شنيشل
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | سوسن ساجد الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 48 عينة ماء من نهر دجلة من منطقة الشواكة (قرب جسر الشهداء) للفترة بين اب - كانون الاول2002 . اظهرت نتائج الفحوصات المختبرية وجود هايفات غير مقسمة تعود للبيضات في 4 عينات بنسبة 8.33 من مجموع الـ 48 عينة ماء . تم قطع نهايات الخيوط الفطرية ونقلها لوسط اكار مسحوق الذرة (CMA) ، الحاوي على الكلورمفينكول، ولغرض الحصول على مزارع نقية اخذت قطعا من اطراف المستعمرات الفطرية النامية على اكار الذرة بوساطة ثاقبة فلين ، ونقلت لمزارع مائية من اطباق بتري حاوية على ماء مقطر وبذور سمسم نوع Sesamum indicum كطعوم ، وحضنت بدرجة حرارة 20م،فحصت كل 24 ساعة لمدة اسبوع.ووفقا للتشخيص النهائي تم الحصول على نوعين من الفطريات البيضية هما Saprolegnia turfosa وAchlya sp. وعند دراسة اصابة الفطرين المذكورين بينت النتائج ان الفطرين لهما المقدرة على اصابة بيض سمك الكارب نوع Cyprinus carpio بدرجة حرارة 20م . كما بينت نتائج دراسة تاثير اربع درجات حرارية مختلفة 15 , 20, 25, 30 م على الامراضية ان درجة حرارة 15م و20م كانت الدرجات المثلى لحصول الامراضية ، اذ استغرقت الاصابة 20 ساعة للفطر Saprolegnia turfosa و24 ساعة للفطر Achlya spp. ، في حين طالت فترة حصول الاصابة عند ارتفاع الحرارة عند درجة 25م لتصل الى 26 و30 ساعة للفطرين على التوالي ، كما استغرقت فترة الاصابة 48 ساعة للفطرين عند درجة 30م.اوضحت نتائج مقارنة بذور السمسم وبيض سمك الكارب (غير طازج) كطعوم ان البيض كان اكثر كفاءة في جذب السبورات السابحة في المزارع المائية اذ استغرق ظهور النمو 72 ساعة على بذور السمسم في حين استغرقت العملية ذاتها 24 ساعة على بيض سمك الكارب وتم ذلك عند درجة حرارة 20م.نمت الفطريات بصورة جيدة على اوساط اكار الذرة،اكار السمسم واكار بيض الكارب.وتميز الفطر Achlya sp. بنموه بشكل جيد على وسط اكار بيض الكارب اذ ظهر فرق معنوي بالمقارنة مع وسط اكار الذرة. درست قابلية الفطرين على انتاج الانزيم المحلل للدهون Lipase على وسط Tween80 agar والانزيم المحلل لليسيثين Lecithinase،وذلك على وسط Lecithovitelline agar،والانزيم المحلل للنشا amylase على وسط Starch agar وانزيم proteinase المحلل للبروتين على وسط Milk agar ، فضلا عن الانزيم المحلل للجيلاتين Gelatinase على وسـط Gelatine agar ، والانزيم المـحلل للـكايتين Chitinase على وسط Chitin agar , وبينت النتائج مقدرة الفطرين على انتاج الانزيمات اعلاه باستثناء الانزيم Gelatinase وذلك بدرجة حرارة 20م وتعد هذه الدراسة الاولى في التطرق لقدرة هذه الفطريات على انتاج الانزيم المحلل لليسيثين. | Fourty eight water samples were collected from Tigris river - AL - Shauaka area (near AL - Shuhadaa bridge) during the period from (August - December - 2002) only four samples of the (48) showed the occurance of Oomycetes, and Hyphal tips were cut and transferred onto corrn meal agar (CMA)containing Cloromphenicol, for purification a disc of CMA containing hyphal tips was cut by corck borer transferred to a petridishes (aquatic culture) containing Sesamum indicum( sesame seeds) as baits, incubated at 20ºC, examined each 24hr. for one week . Saprolegnia turfosa and Achlya spp. were identified , those two fungi were found to be pathogenic to carp fish eggs at 20º.Studying the effects of four different degrees 15ºC, 20ºC, 25ºC, 30ºC on infection showed at 15ºC and 20ºC Saprolegnia turfosa and Achlya sp. Infected carp fish eggs within 20,24 hr. respectively while they were 26,30 hr . at 25ºC and 48,48 hr. at 30 ºC for both fungi respectively.The comparison between the sesame seeds and non fresh carp eggs as a baits results that the eggs of carp fish was more competent in attraction of zoospores in the aquatic culture, it took only (24 hr.) of the infection of carp fish eggs while the growth on sesame seeds observed took (72 hr.) at (20ºC). Both fungi were good growing on a corn meal agar - sesame agar - carp fish eggs agar and especially Achlya spp. Growth was significant different on carp fish eggs agar .Studying the ability for both fungi to produce the enzymes lipase on (Tween 80 agar), lecithinase on (LV agar), Amylase on (starch agar) as well as protienase on (milk agar) and chitinase on (chitin agar). The results showed that both fungi were able to produce all the above enzymes except for Gelatinase. This study considered the first report about ability of these fungi to produce Lecithinase

الكشف الجزيئي والبكتريولوجي لبكتريا Group B Streptococci (GBS) المحلية في بعض النساء العراقيات الحوامل

Author name: زينب عدي حامد
Supervisor name: نهاية حكمت زكي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • تم جمع مائة وتسعة وثمانين مسحة مهبلية من النساء الحوامل من مستشفى ابن البلدي ومختبر الصحة المركزي ومستشفى كمال السامرائي. حيث تم الحصول على ستة واربعين عزلة من بكتريا Streptococcus agalactiae خلال الفترة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر شباط 2014.• كانت الفئة العمرية للنساء المصابة ببكتريا S. agalactiae تتراوح بين (35 - 37) سنة حيث كانت نسبة الاصابة تصل الى 76.08%.• تم تشخيص جميع العينات مبدئيا بواسطة الطرق المظهرية من خلال الاوساط الزرعية blood agar وchromogenic agar واجري تاكيد التشخيص بواسطة VITEK SYSTEM 2 Identification وكذلك تم تشخيصها بالطريقة الجزيئية PCR للكشف عن جين 16S rRNA.• اجريت دراسة تحليلية مقارنة بين الطرق الثلاثة المظهرية والطريقة الجزيئية المستخدمة في الكشف عن البكتريا، وكانت طريقة التفاعل التضاعفي) (PCR افضل وسيلة للكشف عن S. agalactiae حيث تم تشخيص 46 عينة بواسطته بينما تم الكشف عن 30، 36، 37 عينة من قبل blood agar وchromogenic agar وsystem 2 VITEK على التوالي.• اجري فحص VITEK Antibiotic Sensitivity Test للكشف عن حساسية البكتريا للمضادات الحيوية المختلفة لجميع العزلات المشخصة، وكان اعلى معدل انتشار مقاومة لمضاد tetracycline بنسبة 65.2% وتليها 58.6% و45.6% لمضاداتerythromycin وclindamycin على التوالي.• تم فحص ثلاثة من الجينات التي تشفر لعوامل الفوعمة (sip، scpB، cfb) في جميع العزلات المشخصة، وكانت نسبة 97.8% من اجمالي العزلات تحتوي على الجينات الثلاثة المذكورة.• تم الكشف عن خمسة جينات لمقاومة مضادات Macrolide وكان معدل المقاومة 69.5% من اجمالي العزلات.• تم التحري عن جينات مقاومة لمثيلة الرايبوسوم (ermB، ermA\TR، ermC) في جميع العزلات المشخصة وكان جين ermB الاكثر وفرة بين العزلات بنسبة 64.04% ثم يليه جين ermA\TR بنسبة 23.09% وعلى الرغم من تغيير الظروف المستخدمة في تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز PCR)) لكن هذه الدراسة فشلت في تحديد جين مثيلة الرايبوسوم (ermC) • بينت نتائج التحري عن اثنين من الجينات المشفرة لنظام الدفق efflux pumps وهي (mefA، mreA) ان معدل انتشار الجينين بين العزلات هو 8.69% و69.5% على التوالي.• اظهرت نتائج الدراسة ان 14(% 30.4) من اجمالي العزلات لا يمتلك اي جين من جينات مقاومة الاريثرومايسين الخمسة.• بينت نتائج الدراسة ان عزلة واحدة من بكتريا S. agalactiae رقم) (V12 حاملة لاربعة انواع من جينات مقاومة الاريثرومايسين عدا الجين (ermC). | • One hundred and eighty nine vaginal swabs were collected from Ibn - Albalady Hospital, Central health Laboratory and Kammal Alsamaraie Hospital. Forty - six Streptococcus agalactiae isolates were obtained during October 2013 to February 2014.• The isolates were initially identified phenotypically by blood agar culture media and chromogenic culture media and further identification was performed by Vitek and by molecular methods by 16srRNA - based PCR. • A comparative analysis were performed between three phenotypic detection methods and molecular method by PCR were best tool for S. agalactiae detection which 46 isolates were identified while 37, 36, 30 isolates were detected by Vitek system, chromogenic agar and blood agar respectively.• Vitek Antibiotic susceptibility for different antibiotics were performed to all detected isolates, the highest prevalence of resistance was 65.2% toward tetracycline and followed by 58.6% and 45.6% for erythromycin and clindamycin respectively.• Three virulence - encoding genes (sip, scpB and cfb) were screened in all detected isolates, 97.8% of total isolates were contain the three mentioned genes.• Five macrolide resistance genes were screened and the resistant rate in total isolates was 69.5%.• Three ribosome methylation genes (ermB, ermA/TR, ermC) were screened in all examined isolates; the most prevalence gene was ermB with 63.04%, whereas 23.9% was the prevalence of ermA\TR gene and ermC not detected in any of examined isolates.• Two efflux pump genes (mefA and mreA) were screened and the prevalence rate was 8.69% and 69.5% respectively

تاثير العسل والغذاء الملكي وخليطهما على الخطوط الخلوية السرطانية == Effect of Honey, Royal jelly & their mixture on cancer Cell lines

Author name: زينب غازي حسين السلطان
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | شلال مراد العتابي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة تقييم تاثير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما في بعض خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية خارج الجسم الحي Invitro، فضلا عن دراسة قابلية تاثير العسل والغذاء الملكي على انقسام الخلايا اللمفاوية البشرية . كما تم تحضير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما باذابتهم في وسط زرعي خال من المصل SFM (serum free media) ، واختبرت الفعالية السمية لهذه التراكيز في الخطوط الخلوية السرطانية منها AMN - 3، RD وخط الخلايا المتحول وراثيا Vero وخط الخلايا الطبيعي REF بثلاثة تراكيز( 1000 - 10.00 - 100.00 ) ميكروغرام/مل ، وضمن مدد تعريض مختلفة (24 - 48 - 72) ساعة ، و72 ساعة منها فقط عند الخط الخلوي الطبيعي REF . كانت النتيجة لتلك التراكيز تاثيرا سميا واضحا وبمعنوية عالية على نمو الخلايا السرطانية وخلال المدد الثلاث من التعريض ، في حين لم يكن هنالك تاثيرا واضح للتراكيز نفسها على نمو الخلايا الطبيعية (REF) . وان اكثر التراكيز التي لها تاثير سمي هي خليط من العسل والغذاء الملكي سواء كان ( متساوي او غير متساوي ) ، ثم تراكيز الغذاء الملكي ، واخيرا العسل . اما اكثر الخطوط تاثرا بهذه التراكيزRD اذ بلغت نسبة التثبيط عند التركيز 100.000 ميكروغرام/مل لمدة 72ساعه 92% (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم AMN - 3 وان نسبة التثبيط 92%عند 48 ساعه (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم Vero اذ بلغت نسبة التثبيط 90%عند (مزيج العسل والغذاء الملكي) خلال 48 ساعه .واعتمدت على تراكيز المستخدم ،اذ ان التراكيز العالية (10.000100.00 - ميكروغرام/مل) هي الاشد تاثيرا اي الاكثر تثبيطا . ومن ثم عمدنا الى دراسة العسل والغذاء الملكي عند انقسام الخلايا اللمفاوية بواسطة مقارنة المحتوى البروتيني قبل وبعد اضافة العامل المشطر PHA وضمن مدة تعريضية قدرها 72 ساعة. ولوحظت زيادة بتراكيز المحتوى البروتيني بعد اضافة العامل المشطرPHA بالنسبة للعسل والغذاء الملكي مقارنة مع السيطرة السالبة والموجبة بمستوى احتماليه (P<0.005)وسبب هذه الزيادة تعود للتاثير التازري لتراكيز العسل والغذاء الملكي مع المادة المشطرةPHA | The evaluation of variety concentrations of honey, the royal jelly and their mixtures effect was carried out on the normal and some cancer cell lines (Invitro) in this study, in addition of studying Honey and Royal jelly effect abilities on the human lymphocyte division. Different honey , royal jelly and their mixture concentrations were prepared by melting them in a culture media, purified from serum (SFM). The toxicity activity of these concentrations was tested in the cancer cell lines AMN - 3, RD, Vero, and normal cells line with three concentrations (100.000 - 10.000 - 1000)µg/ml and with different exposure periods (24 - 48 - 72) hours , only 72 hours for the normal cells line REF. The results of toxicity effect was obvious with high significance for those concentrations for growing the cancer cells line during the three periods of the exposure , while there wasn’t any obvious effect on the same concentrations in growing the normal cells (REF). The most effective concentration that has toxicity effect is the concentration of the mixture of royal jelly and honey, whether it is (equal or not), then after, the royal jelly concentration, and the honey. The most affected cell lines by these concentrations are RD ,as the inhibition rate was up to 92% at the concentration 100.000 µg/ml within 72 hours ( the honey and RJ mixtures) , then AMN - 3 ,92% within 48 hours ( the honey and RJ mixtures). For Vero, the inhibition rate was 90% within 48 hours (for the honey and RJ mixtures) These rates depended on the used concentrations , as the high concentrations was(100.000 - 10.000) µg/ml ,were the most affecting i.e. the most inhibiting .Then it was intended to study Honey and Royal jelly for the lymphocyte division by total protein comparison before and after adding the mitogen factor PHA and within 72 hours exposure time. An increase in the protein concentration were remarker after PHA addition for the honey and R.J in comparative with the negative and positive control with estimation range (P<0.005).The reason of that increase was the synergistic effect of the honey and the royal jelly concentration with the mitogen PHA

تاثير الصبغات الحيوية في مكونات الجدران الخلوية للبكتيريا المعزولة من المرضى المصابين بالاكزما الجلدية

Author name: زينب عويد شاطي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 100 مسحة جلدية خلال الفترة من تشرين الاول 2013 لغاية اذار 2014 من المرضى الذين يعانون من الاكزما الجلدية من مستشفى الامام علي ومستشفى الشهيد الصدر في العاصمة بغداد والذين كانت تتراوح اعمارهم بين (5اشهر - 70 سنة) ,من مجموعهم كانت (72 %) موجبة الزرع البكتيري ,و( 38%) سالبة للنمو . وقد اظهرت النتائج التالي : • ان كلا الجنسين يتاثر بالاكزما ,مع ارتفاع النسبة لدى الاناث 57% على الذكور 43% ضمن الانواع المختلفة للاكزما .• ان اعلى ارتفاع للاكزما كان ضمن الفئة العمرية 5اشهر - 9 سنوات ( 45 %) ,متبوعة بالفئة العمرية 30 - 39سنة كانت( 14 %) بينما اقل نسبة (5%) كانت ضمن الفئة العمرية 20 - 29 سنة .• الاكزما التلامسية كانت اعلى نسبة للانتشار(57 %) , يليها الاكزما الولادية بنسبة ( 35 %) والاكزما القرصية( 5%) بينما الاكزما العصبية كانت (3%).• من مجموع 100 مريض يعاني من الاكزما في جميع مجاميع الدراسة ,ظهرت Staphylococcus aureusباعلى نسبة 20عزلة (57.14%) ,تليهاStaphylococcus haemolyticus بسبع عزلات ( 20%)Pseudomonas, fluorescens, خمس عزلات (14.28 %) ,وعزلتان لبكتريا Enterobacter aerogenes ( 5.7%) وعزلة واحدة لبكتريا Staphylococcus warneri (2.8%) .• اختبرت العزلات البكتيرية للمضادات الحيوية.• P. fluorescens كانت مقاومة 18 مضاد حيوي وحساسية لمضادي ( neomycin ,(nitrofurantoin, حيث اظهرت العزلات مقاومة 100 % لمضادات (lactams,erythromycin ,azithromycin ,oxacillin ,trimethoprimβ) ومقاومة 50 % لمضادات (levofloxacin ,rifampicin ,norfloxacin )• E. aerogenes قاومت مضادات البيتالاكتام بنسبة 100 % ,وكانت حساسة بنسبة 100 % لمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية ((Amikacin ,gentamicin ,بينما اعطت مقاومة متوسطة لمضاد neomycin .• S.aureus قاومت 11 نوع من المضادات الحيوية وحساسة لثمانية انواع من المضادات ,بينما S.haemolyticus مقاومة 15 نوع من المضادات وحساسة لاربع انواع ومتوسطة لمضاد levofloxacin. وذلك يختلف عن S.warneri الحساسة 14 نوع من المضادات ومقاومة لخمسة انواع ومتوسطة لمضاد Oxacillin .• اختبرت قابلية البكتريا على النمو بوجود تراكيز مختلفة من الصبغات الحيوية (الصبغات الحيوية التي استخدمت الكرستال البنفسجية والمثيل الحمراء والمثيلين الزرقاء) مما سمح بتحديد التركيز المثبط الادنى للصبىغات ,فكان التركيز المثبط الادنى للمثيلين الزرقاء على S. haemolyticus , P.fluorescens بلغ 1ملغ\مل بينما على S .warneri , S .aureus 10 ملغ\مل ,بينما التركيز المثبط الادني للمثيل الحمراء كان 1 ملغ \مل لكل الانواع البكتيرية , التركيز المثبط الادنى للكرستال البنفسجية كان 0.1 ملغ\مل لكل الانواع ماعدا S.warneri التي كان التركيز المثبط لها 1ملغ\مل .• اظهرت البكتيريا السالبة لكرام اقل مقاومة للصبغات من البكتيريا الموجبة لكرام والصبغة المتعادلة ابدت تاثير اكثر من الصبغة الحامضية والقاعدية عند نفس التركيز , وسمحت الصبغة القاعدية بنمو البكتريا الموجبة لكرام بينما ثبطت السالبة لكرام .• اظهرت دراسة تاثير الصبغات على عوامل الضراوة للعزلات البكتيرية عدم تاثرانتاج الكبسولة ولكن تم تثبيط عوامل الالتصاق للعزلات البكتيرية بواسطة الصبغات , بينما استطاعت المعاملة بالصبغات اختزال قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الغشاء الحيوي ,كذلك تناقصت القابلية العالية للعزلات البكتيرية على التلازن مع اللاكتين المستخلص من الخلايا الطلائية بعد المعاملة بالصبغات الحيوية .• استخدمت طريقة المطياف الضوئي لدراسة تاثير الصبغات على نفاذية غشاء الخلية فكانت الزيادة في امتصاص الاشعة فوق البنفسجية لعينات الخلايا دليل على تحلل الخلايا بتاثير الصبغات الحيوية.اذ كشفت النتائج ان الموقع الهدف لتاثيرالصبغات الحيوية هو غشاء الخلية .• استخلص عديد السكريد الدهني من بكتريا P.fluorescens ,وهو احد مكونات الجدار الخلوي ,وتمت دراسة تاثير الصبغة الحيوية على كمية الدهن والسكريد في عديد السكريد الدهني .اذ اظهرت النتائج مستوى عالي للدهن في النموذج غير المعامل بالصبغة 79.33 % ملغ\مل , بينما تناقص مستوى الدهن الى 45.8% ملغ\مل بعد المعاملة بالصبغة , اما كمية السكريد في عديد السكريد الدهني في النموذج غير المعامل بصبغة المثيل الحمراء كانت 123.4% ملغ\مل والتي انخفضت الى 74.2 % ملغ\مل في نموذج عديد السكريد الدهني المعامل بالصبغة . | • One hundred Skin swabs samples were collected during the period from November 2013 to March 2014 from patients suffering from eczema at Al - Sadder hospital and Al - Imam Ali hospital in Baghdad Province . A total of (72%) gave positive cultures ,while (28%) showed negative cultures and the results showed the following : • Both genders were suffering from eczema , with dominance in females (57%) comparable to males (43%) within variable type of eczema.• The highest incidence of eczema was found in age group five months to 9 years (45%) ,followed in the age group (30 - 39) years (14%) , while the lowest percentage (5%) is in age group (20 - 29) years .• Contact dermatitis is the highest percentage of incidence (57%) followed by Atopic dermatitis (35%) and Discoid dermatitis (5%) ,while the lowest percentage is for Neuro dermatitis (3%) .• Out of the one hundred patients with eczema in all study groups , results showed that Staphylococcus aureus isolated at a highest percentage 20 (57.14%), followed by Staphylococcus haemolyticus seven (20%), and Pseudomonas fluorescens five (14.28%) and two isolates of Enterobacter aerogenes (5.7%) ,and one isolate of Staphylococcus warneri(2.8%).• Pseudomonas fluorescens were resistance for 18 antibiotic ,and sensitive to only two antibiotics (Neomycin and Nitrofurantoin ) .The isolates were resistant 100% to β lactams antibiotics ,augmentin ,erythromycin, azithromycin ,oxacillin ,while resistance 50% to levofloxacin ,rifampicin, norfloxacin ,and ciprofloxacin .• Enterobacter aerogenes isolates were resistant to βLactam antibiotics (100%) and appeared sensitivite to Aminoglycosides Antibiotic (amikacin ,gentamicin) in 100% percentage ,but gave intermediate resistance to neomycin .• Staphylococcus aureus isolates were resistant to 11 type of antibiotics and sensitive for eight . While Staphylococcus haemolyticus isolates were resistant to 15 type of antibiotics and sensitive to four and intermediate to Levofloxacin .And that differ from Staphylococcus warneri isolates which sensitive to 14 type of Antibiotics ,while resistant to only five antibiotics ,and intermediate to only Oxacillin. • Testing ability of Bacterial isolates to growth in presence different concentration of biostains (the biostains used are Crystal violet , Methylene blue and Methyl red ) allowed to detecting the sub MIC. the MIC of the methylene blue against S. haemolyticus and P.fluorescens were (1) mg/ml, while against S .warneri and S.aureus were (10) mg/ml ,and the MIC of the methyl red was (1) mg/ml against all type of these isolates , while the MIC of crystal violet against all these isolates were (0.1) mg/ml except against S. warneri was (1) mg/ml .• Studying the effect of biostains on virulence factors for bacterial isolates appeared their were&#39;nt any effect for these biostains on capsule production in these isolates ,and inhibition of adherence factor for these isolates by the stains ,while the treating of bacterial isolates with biostains could reduce the ability of these isolates for forming biofilm ,and the highly ability of these isolates which isolated from eczema patients to agglutinated with the lectin extracted from epithelial cells. But the percentage of agglutination decrased due to the treatment with biostains . • Spectrophotometric method is used to investigate the effect of biostains on cell permeability ,the results revealed that the target of biostains is the cell membrane.• Extracting lipopolysaccharide from Pseudomonas fluorescens which is one of the component of cell wall ,and studying the effect of biostain on the quantity of lipid and sugar, The results showed high level of lipid 79.33mg/ml in sample which not treated with biostain , while the lipid level decreases to 45.8 mg/ml when treated bacteria with the stain, as well as the quantity of sugar in lipopolysaccharide was high in sample not treated to biostain 123.4 mg/ml but decreased to 74.2 mg/ml when sample treated with methyl red stain.

دراسة تاثير بكترياLactobacillus species على نمو وحيوية الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica المعزولة من عينات براز المرضى == Study the Effect of Bacteria Lactobacillus species on the Growth and Vitality of Entamoeba histolytica Isolated from Stool Samples of Patients Thesis Summitted

Author name: زينب فاروق شفيق الريس
Supervisor name: ندى صباح رزوقي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study 60 stool specimens were collected from patients suffering from E. histolytica a who attended at AL - Mahmudiya General Hospital , and Hospital ( Medical City ) from November 2014 until March 2015. These samples of males and femals belong to both ages( 2year - 52 years) . Entamoeba specimens were diagnosed by using two methods : the first one is the wet preparation as a General Stool Examination(GSE) after macroscopic examination for specimen and classifying them according to their consistency (solid ,semisolid and liquid ) and color ( brown and yellow ) and presence of blood and mucous in addition to diagnosing them microscopically to detect the presence of pus cells and both phases trophozoite and cyst for E. histolytica . Special diagnosis tool was used for first time in Iraq to complete the steps for diagnosis of Entanoeba spp. , E. histolytica was isolated and cultivated in vitro on Lock - Egg Medium to which sheep serum added . The aim of this study sheds light on the effect of suspension of Lactobacillus spp. cells and filtrates on growth and viability of E.histolytica( in vitro) by studying the effect of adding different concentrations (1.5 ×10P s/ml from filtrates and suspension of bacterial cells , and examined after (24, 48 and 72) hours of incubation , and note over the ability of various concentrations to inhibition growth of E. histolytica , as well as note the variations of parasite morphological which it suffered during the treatment period . The study reached the following results : 1 - The highest percentage of infection was recorded in the age group (2 - 12 years) by 35%, and the results showed that the incidence in females were higher than males, reaching 60% of the total.2 - During investigation of the antagonist action of lactic acid bacterial isolates against E. histolytica results revealed that suspension of bacterial cells of ( L. fermentum , L. delbruekii ) and L. acidophilus given the high inhibitory effect reached to 97.68% , 99.37%respectively. in concentration ( 1.5 × 10P P) cells/ml after incubation period 72hour compared to metronidazole drug which the inhibitory effect , reaching 67.77% for the same of incubation period . The results also showed that the concentration factor of lactic acid bacteria cells and the time factor have a clear anti - growth of trophozoite phases of the parasite , which is appropriate numbers average of trophozoite phases inversely proportional with increased concentration of lactic acid bacterial cells.3 - The results of filtrate lactic acid bacteria in concentration of (1.5 × 10P8P ) cell/ ml showed inhibitory effect less than suspension in same concentration which the percentage of ( L. fermentum, L. delbruekii ) inhibitory effect reached to 35.92% , while the percentage of L. acidophilus 38.32 % after incubation period 72hour , with significant differences in the value of LSD at a level (P <0.05) for the different concentrations and different times.4 - The results of treatment showed a morphological changes in the trophozoite phases of E. histolytica at different concentrations and different times, including discoloration of eccentric bad by blue dye trypan blue, as well as the decomposition of the plasma membrane and the decomposition of the wall of cyst phase , prejudice of some biological events, including stops the intracellular digestion process , and the small size of the trophozoite phases compara to natural state

تاثير بعض المواد الكيميائية في انتاجية وفعالية ذيفان الفا - هيمولايسين المنتج من المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Effect of some chemical materials on productivity and activity of ? - hemolysin which produced from Staphylococcus aureus Isolated from clinical samples

Author name: زينب فرحان علي الزهيري
Supervisor name: خولة جبر خلف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة عزل بكتيريا المكورات العنقودية من بعض مستشفيات بغداد، والتي شملت : مستشفى بغداد التعليمي، ومستشفى ابن البلدي، والمختبرات التعليمية،و مستشفى حماية الطفولة التعليمي، ومستشفى الكندي حيث امكن الحصول على (110) عزلة، توزعت بواقع (15) عزلة من عينات التهاب المجاري البولية، و(20) عزلة من الحروق، و(46) عزلة من الجروح ،و (17)عزلة من عينات الدم، و(12) عزلة من مسحات الاذن والفم والعيون.شخصت الدراسة (77) عزلة بكتيرية على انها مكورات عنقودية ذهبية من خلال اعطائها نتائج ايجابية في فحص الكاتليز وفحص انزيم مخثر البلازما ، وبقية الفحوص البايوكيمياوية مثل تخمير المانيتول في وسط ملحي تحت ظروف هوائية وقابلية العزلات على تحلل الدم وكانت عزلات Staphylococcus aureus قد توزعت على النحو الاتي (9) عزلات من عينات الدم، و(36) عزلة من الجروح، و(13) عزلة من الحروق، و(9) عزلات من مسحات الاذن والفم والعيون، و(10) عزلات من التهابات المجاري البولية.وقد اظهرت العزلات قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي(Biofilm) اذا استطاعت (35) عزلة (45.45)% من اصل 77 عزلة ان تكون الغشاء الحيوي فيما لم تستطع (42) عزلة (54.54)% المتبقية من تكوين الغشاء الحيوي.اظهرت النتائج ان نسبة العزلات المنتجة لذيفان الفا - هيمولايسين كانت (32) عزلة (41.55)% اما العزلات غير المنتجة للذيفان ، فقد كانت (45)عزلة.اختبرت حساسية العزلات تجاه المضادات الحيوية، وقد كانت نسبة مقاومة العزلات تجاه مضاد Oxacillin هي 100%، اما مضاد Methicillin وCloxacillin ، فقد كانت نسبة المقاومة 98.7 % و97.4 % على التوالي. وكانت نسبة مقاومة مضاد Cephalexin وCefixim هي 93.5 % و76.6 % على التوالي، اما مضاد Rifampicin وVancomcin فقد كانت نسبة مقاومتها 67.5 % فيما كانت نسبة مقاومة Azithromycin وLevofloxacin وBacitracin هي 49.3%، 70.1 %، 93.5 % على التوالي.اختيرت العزلة الكفؤة رقم (19)، وحدد التركيز المثبط الادنىminimum inhibitory concentration (MIC) لمضاد المثيسلين والذي كان تركيزه (32) مايكروغرام / مل.اختبر تاثير مادة CD - Cholesterol، وCholesterol ، وCD ، وMethicillin ، وPbs في فعالية ذيفان الهيمولايسين وكان معيار التحلل Hemolytic Titer هو : 8، 32.768، 65.536، 140.737.488.355.32، E+254.961408 على التوالي.واختبر تاثير المواد نفسها في انتاجية ذيفان الهيمولايسين وكانت النتائج على الاتي : 67.108.864، 549.755.813.888، 274.877.906.944، 576.460.752.303.360، 3.96140812E+25 على التوالي.وقد نقي الذيفان جزئيا بطريقة الترسيب باستخدام كبريتات الامونيوم، واختبرت فعالية الذيفان في حل كريات الدم الحمراء بطريقة الانتشار في الحفر.واختبرت التجربة فعالية الذيفان المنقى جزئيا داخل الجسم الحي في قرنية عين الارانب المختبرية اذ تكونت مناطق تاكل في القرنية بقطر 7.70 ملم بعد 8 ساعات من الحقن وثبطت فعالية هذا الذيفان داخل الجسم الحي باستخدام مادة CD - Cholesterol مع الذيفان حيث اصبح قطر تاكل القرنية 3.95 ملم.استخدمت مادة CD - Cholesterol بوصفها مادة علاجية من خلال استخدامها على هياة قطرات اضيفت الى العين المصابة بالذيفان وادت الى تناقص منطقة التاكل في القرنية من 7.70 الى 3.95.ويستنتج من الدراسة الحالية : اهمية استخدام CD - Cholesterol في تثبيط ذيفان الفا - هيمولايسين في داخل وخارج الجسم الحي وما لهذه المادة من اهمية في المجالات التطبيقية وفي الوقاية من تاثيرات الذيفان وقدرته التحللية للخلايا | In this study, one hundred and ten clinical samples were obtained from hospitals patient at many hospitals of Baghdad governorate : Baghdad teaching hospital, , Ibn - EL Balady hospital, educational laboratories, Protect child teaching hospital, Al - kendi hospital . The types and the numbers of clinical samples were distributed as (15) samples from urinary tract infect , (20) samples from burns infection , (46) samples from wounds, (17) samples from blood, (12) samples from ear, mouth and eyes infections . In this study (77) isolates were diagnosed as cocci cluster gold by giving positive result for catalase test and coagulase enzyme test and the other biochemical tests such as fermentation of mannitol under aerobic conditions and the ability of some isolates to hemolysis blood . S. aureus isolates distributed as follows : (9) isolates from blood samples, (36) isolated from wounds, (13) isolates from burns, (9) isolates from ear, mouth and eyes infection, (10) isolates from urinary tract infections.The isolates showed the ability to form biofilm (35) isolates (45.45%) out of 77 isolates and the other isolates could not form biofilm were : (42) isolation (54.54%),. The results showed that the proportion of isolates producing α - hemolysin was (32) (41.55%) isolates were either non - producing toxin : (45) isolates. The isolates were tested sensitivity to antibiotics and showed proportion of resistant toward Oxacillin which was 100% , Methicillin and Cloxacillin resistance ratio was 98.7% and 97.4%, respectively.The proportion of resistant to Cephalexin and Cefixim were 93.5% and 76.6%, respectively, while the Rifampicin and Vancomcin resistance ratio were 67.5%, while the proportion of resistant to Azithromycin and Levofloxacin and Bacitracin were 49.3%, 70.1%, 93.5%, respectively. The chosen isolate was ( number 19), select the minimum inhibitory concentration (MIC) of methicillin which were (32) micrograms \ ml. Tested the effect of CD - Cholesterol ,Cholesterol ,CD ,Methicillin and Pbs on the activity of toxin α - hemolysin and the hemolytic Titer is : 8 ( line A, well 3), 32.768 (line B, well 4), 65.536 (line B, well 5), 140.737.488.355.32 (line D, well 12) , 4.961408E + 25 (line G, well 12) respectively. It also has been testing the effect of the same material on the productivity of toxin α - hemolysin and the results were respectively : 67.108.864 (line : C well : 3), 549.755.813.888 (line : D ,well : 4), 274.877.906.944 (line : D, well : 3) , 576.460.752.303.360 (line : E, well : 12) , 3.96140812E + 25(line : H, well : 12) respectively.The toxin α - hemolysin was purified by using ammonium sulfate precipitation, and tested the effectiveness of the toxin on the red blood cells by using wells diffusion method . purified toxin was injected inside the living body in the cornea of rabbits eye, and the erosion of cornea where formed with diameter : 7.70 mm after 8 hours of injection but the other eye that injected with CD - Cholesterol that mix with toxin where the erosion diameter was3.95mm.CD - Cholesterol was used in treatment as a drops which added to the affected eye and led to a decrease in corneal erosion area from7.70 mm to3.95.mm We follows from the present study : The importance of using CD - Cholesterol in the inhibition of alpha - toxin inside and outside the living body and the importance of this study in applied medical fields and in the prevention the effects of the toxin on the cells.

دراسة تاثير التدخين على بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى السكري من النوع الثاني == Study the effect of smoking on some haematological and biochemical changes in type 2 diabetic patients

Author name: زينب رشيد حميد
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (105) مريضا" بالسكري النوع الثاني ,شملت المجموعة الاولى (45) مدخنا" والمجموعة الثانية (60) مريضا" من غير المدخنين من الوافدين الى مركز الغدد الصم والسكري التابع لوزارة صحة بغداد ,الرصافة ,مجاور مستشفى الكندي التعليمي. راوحت اعمار المجموعة الاولى (29 - 68 سنة) وبمعدل (48.53) سنة والمجموعة الثانية(24 - 75 سنة ) وبمعدل (52.21) سنة, تم سحب الدم الوريدي بمقدار (10 ملم۳) ,استخدم (2 ملم۳) منها لاجراء الفحوصات الدموية والتي شملت فحص هيموكلوبين الدم,الهيوكلوبين المسكر HbA1c%,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة(PCV%),معدل ترسيب كريات الدم الحمر(ESR),مع قياس ضغط الدم (الانقباضي والانبساطي) واستخدم (8 ملم۳) من الدم لاجراء الفحوصات الكيموحيوية والتي شملت قياس مستويات الكلوكوز الصياميF.B.G) ) , وصورة الدهون الكولستيرول,الكليسريدات الثلاثية(TGs),البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (LDL), الواطئة الكثافة جدا"(VLDL) والعالية الكثافة (HDL), وتم كذلك ايجاد معامل كتلة الجسم BMI. اظهرت النتائج في المجموعة الاولى من مرضى السكري النوع الثاني من المدخنين ارتفاعا"معنويا"(P≤0.05)في مستويات الهيموكلوبين (14.60gm/dl),حجم كريات الدم الحمر المضغوطة PCV% (46.05) ومعدل ضغط الدم(mmHg) الانقباضي (14.24) والانبساطي (8.64), الهيموكلوبين المسكر (%6.14) وانخفاضا" معنويا"(P≥0.05) في ESR(16.6 mm/h) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (12.91gm/dl) ,PCV% (40.68), ومعدل ضغط الدم (mmHg) الانقباضي (13.65) والانبساطي ((7.93 وانخفاضا" في HbA1c% (%5.32) وارتفاعا" معنويا"في ESR(30.45mm/h) واظهرت نتائج الفحوصات الكيموحيوية في المجموعة الاولى ارتفاعا"معنويا" في مستويات الكولستيرول (4.83±0.17mmol/L) ,الكليسريدات الثلاثية (2.48mmol/L), البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (1.56 mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين في الكولستيرول (4.20mmol/L), الكليسريدات الثلاثية (1.61mmol/L),البروتينات الدهنية واطئة الكثافة جدا (0.82mmol/L) انخفض مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة معنويا" (P≤0.05) في المجموعة الاولى (1.30mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (2.25mmol/L). لم تكن الفروقات معنوية في مستويات البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (LDL) بين المجموعتين وكذلك في مستويات سكر الدم الصيامي ومعامل كتلة الجسم BMI. نستنتج من هذه الدراسة الى ان التدخين قد ادى الى ارتفاع في مستويات الهيموكلوبين (Hb gm/dl) ,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة (PCV%), الهيموكلوبين المسكر(%HbA1c), مستوى الكلوكوز الصيامي(F.B.G) وكذلك في مستويات الدهون (Chol.,TGs,VLDL) في المجموعة الاولى مع انخفاض كل من (HDL - c,ESR) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية, على الرغم من عدم وجود فروقات معنوية بين المجموعتين في مستوى الكلوكوز الصيامي (F.B.G), الا ان القيم كانت مرتفعة في المجموعة الاولى مقارنة مع القيم الطبيعية (3.3 - 6.1 mmol/L) وهذا يعود الى عدم تحمل الكلوكوز ((Glucose intolerance بسبب التدخين فضلا عن العلاقة الايجابية بين ارتفاع الهيموكلوبين المسكر (HbA1c%) والكلوكوز الصيامي (F.B.G) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية. | The present study was conducted on 105 diabetic patients type2 . the first group included (45) smokers. The 2nd group (60)non smokers who visited the Diabetic and Endocrine center, near AL - Kindey hospital , the average age for first group was (29 - 68 year), and (48.53), and (24 - 75year) , (52.21) for the 2nd group. 10ml of blood was drawing by veinpuncture,2ml out of 10ml was used for hematological tests (Hb gm/dl, Glycated Hb(HbA1c%),PCV%,ESR) Blood pressure (systolic and Diastolic) was estimated, 8ml of blood was used to estimate the Biochemical tests that included fasting blood sugar (F.B.S) ,lipid profile (cholesterol, Triglycerides, LDL,VLDL and HDL - c) and BMI was calculated for both groups. The results showed in 1st group a significant increase (P˂0.05 ) in Hb level (14.60gm/dl) ,PCV% (46.05), Systolic blood pressure (mmHg) (14.24), Diastolic blood pressure (8.64) ,HbA1c (6.14%) with significant reduce (P≥0.05) in ESR (16.6 mm/h) in compassion with the 2nd non smoker group (12.91gm/dl). PCV% (40.63), Diastolic blood pressure (7.93 mmHg) , with reducing HbA1c (5.32%) and increasing ESR (30.45mm/h). The results of biochemical test revealed in 1st group a significant (p˂0.05) increase In the levels of cholesterol (4.83 mmol/L), TGs (2.48 mmol/L) , VLDL (1.56 mmol/L) in comparison with 2nd group non smoker. Cholesterol (4.20mmol/L), TGs (1.61),VLDL (0.82 mmol/L) . The HDL - c in 1st group was reduced significantly (p˂0.05)(1.30 mmol/L) in comparison with 2nd group (2.25 mmol/L). The differences in levels of LDL, F.B.G and BMI were not significant between the two groups. We concluded from this study that the smoking causing an increase in the levels of Hb gm/dl ,PCV% ,HbA1c% F.B.G and lipid profile (chol., TGs, and VLDL ) in the first group in comparison with 2nd group. Although there was no significant differences in the level of F.B.G between two groups , but the values were highly elevated in comparison to the normal values of F.B.S (3.3 - 6.1 mmol/L) in both groups This may be related to Glucose intolerance due to cigarettes smoking in addition to positive relationship between elevation of HbA1c and F.B.G in 1st group in comparison with 2nd group.

استخلاص وتنقية وتوصيف انزيم بيتا - كالاكتوسيديز من كبد الاغنام == Isolated, Purification and Characterization of Beta - Galactosidase from Sheep Liver

Author name: زهراء عدنان جاسم
Supervisor name: اياد نافع يحيى | سند باقر محمد
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة اختيار افضل طريقة لاستخلاص انزيم البيتاكالاكتوسايديز من كبد الاغنام المحلية, من بين ثمان طرائق, وكان استخدام دارئ الفوسفات (0.2 مولاري وبدالة حموضة 5) هو الافضل في استخلاص الانزيم بفعالية كلية بلغت (78898.5) وحدة. تم ترسيب المحتوى البروتيني باستخدام كبريتات الامونيوم (60)%من بين خمس طرائق للتركيز (التنقية الجزئية), واكملت مراحل التنقية باستخدام التبادل الايوني بعمود DEAE - Sephadex A100 , ومن ثم استخدام الترشيح الهلامي بعمود السيفاكريل S - 300 ( Sephacryl S - 300) اذ بلغت الفعالية النوعية ( 3328.8 ) وحدة / ملغم بروتين والحصيلة الانزيمية مقدارها (41.84)% وعدد مرات التنقية (8.57) مرة. وتم التاكد من نقاوة الانزيم باجراء عملية الترحيل الكهربائي بغياب المواد الماسخة للبروتين اذ ظهرت حزمة بروتينية واحدة في هلام متعدد اكريل امايد, ثم تم توصيف الانزيم واشارت النتائج الى ما ياتي : 1. كان الوزن الجزيئي هو (180) كيلودالتون مقدرا بطريقة الترشيح الهلامي.2. بلغت نقطة التعادل الكهربائي pI للانزيم (4.4).3. اظهرت الدراسة ان الانزيم من البروتينات السكرية وان نسبة الجزء الكربوهيدراتي تشكل (23)% عند تقديرها بطريقة الفينول - حامض الكبريتيك.4. وجد ان الدالة الحمضية الامثل لفعالية الانزيم (5), واظهر الانزيم ثباتا في مدى من قيم دالة الحموضة تراوحت بين (4.5 - 6.5).5. اظهرت النتائج ان درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم كانت (50) م°, عند دالة الحموضة الامثل لفعالية الانزيم, وان درجة الثبات الحراري لهذا الانزيم بين (25 - 60) م°.6. احتفظ الانزيم بكامل فعاليته الانزيمية عند حضنه بدرجة حرارة (50) م° لمدة (50) دقيقة وفقد (7)% من فعاليته في الدقيقة (60) وفقد (23)% من فعاليته بعد (120) دقيقة.7. بلغت قيمة طاقة التنشيط لتحويل المادة الاساس الى ناتج (8.32) كيلو سعرة / مول, بينما بلغت قيمة طاقة التنشيط لمسخ الانزيم (53.84) كيلو سعرة / مول.8. اظهرت دراسة الثوابت الحركية ان معدلات قيم ثابت ميكالس منتن ( Km ) لتفاعل الانزيم تجاه ONPG كانت ( 0.502) ملغم/مل , بينما بلغت قيمة السرعة القصوى ( Vmax ) للتفاعل الانزيمي (1.106) وحدة/مل.9. اظهرت الايونات الموجبة للمنغنيز والمغنيسيوم تاثيرا منشطا, بينما اظهرت ايونات الكوبلت والزنك والكالسيوم والنحاس تاثيرا مثبطا, فيما لم تؤثر ايونات الباريوم في فعالية الانزيم. 10. وجد ان جميع المثبطات المعدنية المستخدمة في الدراسة سببت تثبيطا بدرجة واضحة مما يعطي دليلا على اشتراك المعادن في تفاعل الانزيم.11. وجد ان المستخلص الانزيمي النقي , له القدرة على تحليل سكر اللاكتوز بكفاءة عالية , اذ ارتفعت نسبة اللاكتوز المتحلل من (25.11)% بعد مرور ساعة من الحضن الى (88.3)% بعد مرور 4 ساعات. | The study included the selection of the best methods to extract the enzyme among eight methods. It appeared that phosphate buffer ( 0.2 M, pH : 5) have given the highest activity of the crude enzyme ( total activity = 78898.5 unit). The protein content was concentrated and precipitated by ammonium sulfate (60) %, among other five methods of concentration (partial purification). The purification stages were achieved by using ion exchange column chromatography ( DEAE - Sephadex A 100 column ). Followed by gel filtration chromatography using Sephacryl S - 300. This method extract pure enzyme at a yield of (41.48) %, (8.57) times of purification and specific activity of (3328.8) unit / mg. The purity of enzyme was certified by poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing condition, the enzyme was characterized by the following : - 1 - Its molecular weight was (180) KD as estimated by gel filtration.2 - Its Iso electric point was at (4.4).3 - The result showed that it was a glycoprotein with a carbohydrate content of (23) % as determined by phenol - sulfuric acid method.4 - Its optimum activity pH was (5). The enzyme was stable at pH range between (4.5 - 6.5).5 - The optimum temperature for enzyme activity was (50) C°at the Optimum pH. The enzyme stability temperature range between (25 - 60) C°. 6 - The enzyme keep full effectiveness when incubated in (50) C° for 50 minutes, and lost (7) % of its effectiveness after (60) minutes, and lost 23% of its effectiveness after (120) minutes.7 - The activation energy to convert the substrate to product was (8.32) kilo calorie / mole. The inactivation energy for the denatured enzyme was (53.84) kilo calorie / mole.8 - The average Michael’s constant ( Km ) for the enzyme reactions towards ONPG were (0.502) mg/ml. and its Vmax was (1.106) unite / minutes 9 - The positive ions such as Mg and Mn have shown activating effect of β - galactosidase, While the Co, Zn, Ca and Cu have on inhibitory effect on the enzyme.10 - Metal inhibitors in habited β - galactosidase clearly meaning that it is metallic protein enzyme.11 - The analytical results have indicated that lactose solution analyzed by enzyme. The hydrolysis rate is increased from (25.11) % after one hour to (88.3) % after (4) hours.

المكافحة الاحيائية لبعض ادوار الذبابة المعدنية Chrysomya albiceps (Wiedemann,1819) (Diptera : Calliphoridae) باستخدام الفطر Metarhizium anisopliae (Metschnikoff) Sorokin والبكتريا Bacillus thuringiensis Berliner مختبريا == Biological Control of some stages of Chrysomya albiceps (Wiedemann, 1819) (Diptera : Calliphoridae) Using Metarhizium anisopliae (Metschnikoff) Sorokin and Bacillus thuringiensis Berliner Under Laboratory Conditions

Author name: زهراء سعد نوشي
Supervisor name: نوال صادق مهدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Insects
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The work involved studying effects of serial concentrations of Metarhizium anisopliae on the life stages of blow fly Chrysomya albiceps (Wiedemann,1819) (larvae, pupae, adults) were conducted under laboratory conditions.The results showed that all insects stages were sensitive to the fungus. Treating of larval food and direct spraying larvae by the concentrations 2.8×106, 2.8×107, 2.8×108 conidia/ml led to increasing accumulated mortalities percentages depending on the concentration and time. Various malformations were depected.Examination of some serial histopathological sections for some dead infected larvae under compound microscope showed adhesion of fungal conidia on insects body wall and fungal hyphae invated insects internal muscles and hemocoel.Treating of blow fly pupae by direct spraying with fungal suspension concentration mentioned above led to mortalities about 13.33, 26.67, 33.33 % respectively so that adult emergency percentages were about 86.67 - 66.67% while in the control treatment was 96.67%.Adult stage showed high sensitivity when they were directly sprayed with the above concentrations which led to mortalities of about 46.67, 56.67, 70% respectively after a week of treatment.The study also conducted to evaluate serial concentrations of commercial formulation suspension (Antrol) of Bacillus thuringiensis israelensis. As a microbial control agent against Chrysomya albiceps (blow fly) larvae and adults under laboratory conditions. The results revealed that percentages of accumulated mortalities of second instar larvae were 30 - 63.33% for the doses 100 - 2000 ppm respectively , Mortalities rate increased with increased of time, treating larval food with 1000 ppm ofbacterial suspension caused mortality rate reached 30% after two days, later reached 72.96% after 12 days. The bio assays results of treating adults food showed that mortalities percentage were 33.33 - 73.33 when their food was treated by 100 - 2000 ppm of bacterial suspension. The results indicated that B thuringiensis has a potential to be a bio control agent for Ch. albiceps.Results of treatment of food of larvae by combination of mixed concentrations of fungal suspension (2.8×106 or 2.8×107 conidia / ml) and bacterial suspension (100 or 200 ppm) and direct spraying the larvae with fungal suspension led to high and rapid mortalities more than using fungus or bacterial suspension alone .Treatment of the second instar larvae with the combination A(100 ppm + 2.8×106 conidia / ml , bacterium + fungus respectively) led to accumulated mortality percentage about 30 % after one day of treatment , this percentage raised up to 66.67 % . Combination B which was consists of concentration (200 ppm + 2.8×106 conidia / ml bacterium + fungal suspension respectively) caused larval mortality percentage about 86.67 % and the adult percentage emergency was 13.33 % , while in control treatment was 96.67 % . The combinations of fungal and bacterial suspension have a synergistic effect as indicated by the results .

تطبيقات دلائل نوعية المياه في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق == Application of Water Quality Indices for Tigris River within Baghdad city - Iraq

Author name: زهراء زهراو فرحان الجنابي
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية ابتداءا من شهر شباط 2010 ولغاية شهر كانون الاول 2010, اذ تم جمع النماذج خلال كل شهرين في ثلاث محطات في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد، وتضمنت الدراسة تقييم نوعية مياه نهر دجلة لاغراض الشرب ومعيشة الاحياء المائية والـــــري باستخدام دليــــل نوعيـــة المياه المعتمـــد علـــى الموديل الكنــدي Canadian Council of Ministers of Environment Water Quality Index (CCME WQI) ودليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتيــــــــة Phytoplankton - Index of Biological Integrity (P - IBI). تم قياس العديد من العوامل الفيزيائية والكيميائية مثل درجة حرارة الماء والاس الهيدروجيني, التوصيلية الكهربائية, الملوحة, الكدرة, المواد الصلبة الذائبة, الاوكسجين الذائب, القاعدية الكلية, الكاربونات, البيكاربونات, الكالسيوم, المغنيسيوم, الكلورايد, العسرة الكلية, الصوديوم والبوتاسيوم, الفوسفات الفعال, النترات, النتريت, الامونيا, وقد تراوحت قيم العوامل بين 31.2 - 10.1° و7.1 - 8.4، و- 5901340 مايكروسيمنز/ سم، و0.83 - 0.36 جزء بالالف، و41.03 - 13.15 NTU، و866 - 367 ملغم /لتر، و8.2 - 6.3 ملغم/لتر، و211.0 - 129.2 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر، وقيم غير المحسوسة، و28.8 - 6.45 ملغم HCO3/ لتر، و142.6 - 55.04 ملغم/لتر، و35.96 - 20.09 ملغم/لتر، و134.9 - 24.9 ملغم / لتر، و484 - 232 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر، و63.2 - 17.7 ملغم /لتر، و31.7 - 1.6 ملغم /لتر، وقيم غير محسوسة - 0.3 ملغم/ لتر، و33.2 - 2.21 ملغم/ لتر، على التوالي.و تم قياس بعض العناصر الثقيلة مثل الكادميوم, الكروم, النحاس, الحديد, الرصاص, المنغنيز, النيكل, الزنك, وقد تراوحت قيمها بين قيم غير المحسوسة - 0.039 ملغم/لتر، وقيم غير المحسوسة - 1.3 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة، و0.438 - 0.001 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة - 0.077 ملغم/لتر، وقيم غير محسوسة - 0.778 ملغم/لتر، و0.36 - 0.011 ملغم/ لتر، و0.08 - 0.011 ملغم/لتر، وقيم غير محسوسة - 0.1985 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة - 0.0416 ملغم/لتر، على التوالي.وتم حساب نسبة امتصاص الصوديوم SARو النسبة المئوية للصوديوم الذائب SSP وكاربونات الصوديوم المتبقية RSC، و1.29 - 0.49، و22.1 - 11.2%، واقل من الصفر, على التوالي. تم تشخيص 232 نوع من الهائمات النباتية، تعود الى 88 جنسا، وقد تغلبت مجموعة الدايتومات Bacillariophyceae على بقية المجاميع اذ ضمت 143 نوع تنتمي الى36 جنسا شكلت نسبة 64.12% من العدد الكلي، وسجل 46 نوعا عائدة الى 28 جنسا من الطحالب الخضر Chlorophyceae وبنسبة 20.62 % و24 نوعا (15 جنسا) تعود الى الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae وكانت نسبتها 10.76%. ووجدت كل من الطحالب اليوغلينية Euglenophyceae باربعة انواع عائدة لثلاثة اجناس والطحالب البروات Pyrrhophyceae بنوعين. وتمثلت الصفوف الاخرى بالطحالب الحمر Rhodophyceae والطحالب الكارية Charophyeae والطحالب الصفراءXanthophyceae والطحالب الذهبية Chrysophyceae بنوع واحد لكل منهما.وكانت الانـواع السائدة خلال الدراسة Aulacoseira granulate وSyndra ulna وCyclotella meneghiniana وC. striata وCymbella affinis وNitzschia palea .تراوح العدد الكلي للهائمات النباتية خلال مدة الدراسـة بين952 - 7666 فرد / مللتر، اذ سجلت زيادة واضحة في العدد الكلي للهائمات النباتية خلال فصلي الربيع والصيف، وقد لوحظ في هذه الدراسة سيادة الدايتومات في جميع المحطات وقد وصلت نسبتها الى 99% من العدد الكلي للهائمات النباتية، وقد اظهر النوع Cyclotella ocellata وفرة نسبية عالية وصلت الى45.7% من العدد الكلي للهائمات النباتية.وقد تم حساب دليل نوعية المياه لغرض الشرب باستخدام 20 عاملا : المواد الصلبة الذائبة، والعسرة، والكالسيوم، والمغنيسيوم، والكلورايد، والقاعدية الكلية، والصوديوم، والرصاص، والحديد، والزنك، والنحاس، والكادميوم، والنيكل، والمنغنيز، والكروم، والاس الهيدروجيني، والعكورة، والامونيا، والنترات، والنتريت. اما دليل نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء المائية فقد استخدم 17عاملا في حسابه وهم : المواد الصلبة الذائبة، والكلورايد، والفوسفات، والاوكسجين الذائب، والرصاص، والحديد، والزنك، والنحاس، والكادميوم، والنيكل، والمنغنيز، والاس الهيدروجيني، والكدرة، ودرجة الحرارة، والامونيا، والنترات، والنتريت. واستخدم 15 عاملا لحساب دليل نوعية المياه لاغراض الري وهي : التوصيلية الكهربائية ونسبة امتصاص الصوديوم SAR ونسبة الصوديوم الذائب SSP وكاربونات الصوديوم المتبقية RSC والاس الهيدروجيني والبيكاربونات والكلورايد ووالرصاص والحديد والزنك والنحاس والكادميوم والنيكل والمنغنيز والكروم.اما دليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتية Phytoplankton - Index of Biological Integrity (P - IBI) فقد اختيرت 8 وحدات في حسابه وهي : كثافة الهائمات النباتية (فرد /ملليتر) والوفرة النسبية للطحالب الخضراء المزرقة والوفرة النسبية للطحالب الخضراء والوفرة النسبية للدايتومات المركزية والوفرة النسبية للدايتومات الريشية والوفرة النسبية للطحالب الصفراء والوفرة النسبية للطحالب البروات ودليل الغنى.واشارت نتائج الدراسة ان مياه نهر دجلة جيدة التهوية وعسرة وتميل للقاعدية وملوثة بالمعادن الثقيلة, وكانت قيم المعادن الثقيلة متذبذبة خلال مدة الدراسة باستثناء الرصاص اذ كانت تراكيزه عالية وتجاوزت الحدود المسموح بها للاستخدامات كافة، وكانت المحطة الثالثة اكثر تلوثا من المحطات الاخرى.اظهرت النتائج ان نوعية مياه نهر دجلة لغرض الشرب قد حصلت على تقدير رديء الى حافي، اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 45.7 - 58.4 وفي المحطة الثانية بين 41.8 - 55 وفي المحطة الثالثة 40.3 - 49.5، اذ سجلت اعلى قيمة للدليل في المحطة الاولى في شهر اب. في حين سجلت اوطا قيمة في شهر شباط في المحطة الثالثة، وبذلك تكون مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد غير صالحة للشرب. ان نوعية مياه نهر دجلة لاغراض معيشة الاحياء المائية قد حصلت على تقدير معتدل - حافي اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 71 - 48 وفي المحطة الثانية بين 71.8 - 47 وفي المحطة الثالثة 67.5 - 47.2، اذ سجلت اعلى قيمة خلال شهر شباط في المحطة الثانية، واوطا قيمة في المحطة الثانية ايضا خلال شهر تشرين الاول. لقد حصلت نوعية مياه نهر دجلة لغرض الري على تقدير جيدة - حافية اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 93.9 - 56.4 وفي المحطة الثانية بين 89 - 53.8 وفي المحطة الثالثة 82.7 - 53.8 اذ سجلت اعلى قيمة 93.9 في شهر كانون الاول في المحطة الاولى، بينما سجلت اوطا القيم 53.8 في شهر شباط في المحطتين الثانية والثالثة، ويمكن القول ان مياه نهر دجلة بشكل عام صالحة للاستعمال الزراعي. اما عن دليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتية فقد حصل على تقدير جيد - مقبول اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 72 - 58.7 وفي المحطة الثانية بين 72 - 55 وفي المحطة الثالثة 70 - 52.5 اذ سجلت اعلى قيمة للدليل في المحطة الاولى والثانية خلال شهر شباط، في حين سجلت اوطا قيمة للدليل في المحطة الثالثة خلال شهر حزيران وعند مقارنة قيم دليل التكامل الاحيائي بدليل نوعية المياه لغرض معيشة الاحياء نجد ان قيم كلا الدليلين لم ينخفضا الى الرديء ولم يصلا الى الممتاز، وقد تقاربت قيم الدليلين في اكثر الاحيان مع فارق التقدير. | This study was conducted from February 2010 to December 2010, the samples were collected every two months in three stations in Baghdad city. The study involved the assessment water quality of Tigris River for drinking, aquatic organisms life and for Irrigation by using water quality index. The indices were calculated according to Canadian water index (CCME WQI) and Phytoplankton Index of Biological Integrity (P - IBI).Many parameter were measured such as : temperature, pH, electrical conductivity, salinity, turbidity, total dissolved solids, dissolve oxygen, total alkalinity, carbonate, bicarbonate, calcium, magnesium, chloride, total hardness, sodium, potassium, reactive dissolved phosphate, nitrate, nitrite and ammonia. The results ranged between 10.1°, 8.4 - 7.1, 1340 - 590 µs/cm, 0.83 - 0.36 ‰, 41.03 - 13.15NTU, 367 - 866mg/l, 8.2 - 6.3 mg/l, 211.0 - 129.2 mg/l, carbonate undetectable, 28.8 - 6.45 mgHCO3/l, 142.6 - 55.04 mg/l, 35.96 - 20.09 mg/l, 34.9 - 24.9mg/l, 484 - 232 mg/l, 63.2 - 17.7 mg/l, 31.7 - 1.6 mg/l, undetectable - 0.30 mg/l, 33.2 - 2.21 mg/l, undetectable - 0.039 mg/l respectively. Some heavy metals were measured such as : chromium, cadmium, copper, iron, lead, manganese, nickel and zinc. There values ranged between undetectable to 1.3 mg/l, undetectable, 0.438 - 0.001 mg/l, undetectable - 0.077 mg/l, undetectable - 0.778 mg/l, 0.36 - 0.011mg/l, 0.08 - 0.011mg/l, undetectable - 0.1985 mg/l, undetectable - 0.0416 mg/l respectively. Sodium adsorption ratio(SAR), soluble sodium percentage (SSP), residual sodium carbonate(RSC) were calculated. There values ranged between 1.29 - 0.49, 22.1 - 11.2% and less than zero respectively.223 species of Phytoplankton were recorded belong to 88 genera. The Bacillariophyceae was the dominant group which included 143 species belong to 36 genera consist 64.12% from the total number of phytoplankton. 46 species belong to 28 genera of Chlorophyceae with 20.62 %. 24 species (15 genera) belong to Cyanophyceae which consist 10.76%. Four species (three genera) belong to Euglenophyceae and two species belong to Pyrrhophyceae was found. And the other groups Rhodophyceae, Charophyeae, Xanthophyceae and Chrysophyceae represented by one species for each one.The dominant species were : Aulacoseira granulate وSyndra ulna وCyclotella meneghiniana وC. striata وCymbella affinis وNitzschia palea .The total number of Phytoplankton were ranged between 952 - 7666 cell/ml. In this study diatoms observed in all stations, which was comprised 99% from the total number of phytoplankton composition.Water quality index for drinking calculated by using twenty factors, they were : total dissolved solid, hardness, calcium, magnesium, chloride, total alkalinity, sodium, lead, zinc, iron, copper, cadmium, nickel, manganese, chromium, pH, turbidity, ammonium, nitrite, and nitrate. Seventeen factors have been used to assess water quality index for aquatic organisms life : total dissolved solid, chloride, phosphate, dissolved oxygen, lead, iron, zinc, copper, cadmium, nickel, manganese, pH, turbidity, water temperature, ammonium, nitrite and nitrate. Fifteen factor have been used to assess water quality index for irrigation : electrical conductivity, sodium absorption ratio (SAR), dissolved sodium percentage, residual sodium carbonate, pH, bicarbonate, chloride, cadmium, chromium, copper, iron, lead, manganese, nickel and zinc. The study also was involved the assessment of water quality for Tigris River by using Phytoplankton Index of Biological Integrity (P - IBI) which was calculated by using eight metrices : Phytoplankton Density, relative abundance for blue green algae, green algae, central diatom, pennales, yellow green algae, pyrrophyte algae and species richness index.The results showed that water of Tigris River was well aeration, hard water, alkaline and polluted with heavy metals. The concentration of heavy metals fluctuated during the study period, except lead which have high concentrations and exceeded the limits for all uses. The station 3 was more polluted than other station.Water quality index of Tigris River for drinking was obtained bad - marginal (45.7 - 58.4) in station 1, (41.8 - 55) in station 2 and (40.3 - 49.5) in station 3. The highest index value was recorded in station 1 during august while the lowest value was recorded during February in station 3. so, water quality of Tigris River through Baghdad was unsuitable for drinking. Water quality index of Tigris River for aquatic organisms life was obtained moderate to marginal (48 - 71) in station 1, (47 - 71.8) in station 2, and (47.2 - 67.5) in station 3. The highest value was recorded in station 2 through February, and lowest value was recorded in station 2 through December. Water Quality Index of Tigris River for Irrigation ranged between good to marginal, (56.4 - 93.3) in station 1, (53.8 - 89) in station 2 and (53.8 - 82.7) in station 3. The highest value was recorded in station 1 through December and the lowest value was recorded in station 2 and 3 through February. Generally, we can say that water quality of Tigris River is suitable for irrigation. Phytoplankton Index of Biotic Integrity (P - IBI) was obtained good - acceptable, where the values ranged between (58.7 - 72) in station 1 (55 - 72), in station 2 and (52 - 70) in station 3. The highest value recorded in stations1 and 2 through February, and the lowest value observed in station 3 through Jun. When we compared between the two indices (P - 1B1 and WQI for aquatic organisms life) we found that both indices values don’t declined to bad and don’t reached excellent values, their values were closed up together in most times

دراسة نوعية مياه نهري ديالى ودجلة في الجزء الجنوبي لمدينة بغداد وتاثير بعض العناصر الثقيلة على الفطريات البيضية المعزولة == Study on the quality of water in Diyala and Tigris rivers southern Baghdad and the effect of heavy metals on the isolated aquatic fungi(Oomycetes)

Author name: ريم عمران عيسى الحسوني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله | عبد الرضا طه سرحان
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في الدراسة الحالية اختيار خمس محطات جنوب بغداد ثلاث منها على نهر ديالى الاولى قبل محطة الرستمية والثانية قرب مصبات الرستمية اما المحطة الثالثة فكانت بالقرب من نقطة التقاء نهر ديالى بنهر دجلة . اما المحطتان الاخريان فهما على نهر دجلة واحدة تقع على نهر دجلة قبل التقائه برافده ديالى والاخرى على نهر دجلة بعد نهر ديالى لمعرفة تاثيرنهر ديالى على نهر دجلة . اخذت النماذج من محطات الدراسة كل شهرين لمدة سنة كاملة ابتداء من شهر شباط ولغاية كانون الاول2009 . وقد تم عزل وتشخيص ( 14 ) نوعا فطريا عائدا الى ستة اجناس عائدة الى صنف الفطريات البيضية( Oomycetes ) وهي : Achlya Klebsiana A . americana , A . prolifroides , Achlya sp Saprolegnia ferax , S . anisospora , S . diclina , Saprolegnia sp , Dictyuchus sterile , D . carpophorus , D . polysporus , Pythium . ultimum , Pythiopsis cymosa , Leptomitus lacteus واظهرت النتائج ٲن اعلى عدد للعزلات ( 46 ) عزلةكانت في محطة رقم ( 5 ) في نهر دجلة اما اقل المواقع وجود للفطريات فكانت المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 16 )عزلة وكان الجنس Saprolegnia اكثر الاجناس تواجدا واقل الاجناس وجودا هو الجنس Pythopsis . وبينت النتائج انه يمكن اعتبار الانواع التالية ادلة حياتية على تلوث المياه . A . prolifroides , S . ferax , S . anisospora , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus وسجل النوعين لاول مرة D . polysporus وP. cymosa في العراق ، وقد اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه تراوحت ( 10.5 - 29.5 )م خلال مدة الدراسة ، كما وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني في محطات الدراسة ( 8.3 - 6.8 ) . وقيم التوصيلية والملوحة تراوحت على التوالي (9.8 - 4.9)مايكروسمينز|سم و((3.08 - 0.61غم|لتر للملوحة, اما قيم الاحتياج الكيميائي والحيوي للاوكسجين ( 18.2 - 3.2 ) ملغم|لتر و( 7.3 - 2.2 )ملغم|لتر اما نهر ديالى فكانت قيمة عالية مقارنة بنهر دجلة ,اما الكدرة فتراوحت ( 42 - 14.4 ) (NTU)وكانت قيمها اعلى في نهر ديالى من نهر دجلة وكذلك العسرة تراوحت ( 1617 - 210 ) ملغم|لتر واعلى القيم سجلت في محطة ( 3 ). اما الايونات الموجبة بالنسبة للكالسيوم والمغنسيوم سجلت زيادة في نهر ديالى اعلى من نهر دجلة اما نهر دجلة فقد سجلت المحطة ( 5 ) قيما اعلى من محطة ( 1 ) وذلك لتاثير نهر ديالى في بيئية نهر دجلة . ( ( 872.11 - 65 ملغم /لتر،اما الصوديوم فقد سجل اعلى قيم الايونات الموجبة تراوحت مابين ( 870 - 45 ) ملغم/لتر واقلها البوتاسيوم حيث تراوحت مابين( 18.12 - 1.7 ) ملغم/لتر, اما العناصر الثقيلة فقد كان الزنك اكثر العناصر وجودا في كل المحطات واقلها الكروم وبينت نتائج التحليل بان نهر ديالى ملوث بهذه العناصر ( الزنك ، الرصاص ، الكادميوم ، النحاس ، الحديد ، الكروم ) رغم انها لم تاخذ نمطا معينا خلال السنة . اما في نهر دجلة فكانت مدياتها ضمن الحدود المسموح بها . اما الفوسفات فتراوحت تراكيزه في المواقع المدروسة( 3.8 - 0.1 ) ملغم/لتر وكانت تراكيزه في نهر ديالى كما هو متوقع اعلى من نهر دجلة . اما الكلوريدات فقد سجلت قيم بمدى ( 775.63 - 54.55 ) ملغم/لتر واعلى التراكيز في نهر ديالى المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 775.63 - 199.96 ) ملغم/لتر. وتمت دراسة تاثير بعض العناصر ( الكاديميوم والزنك والحديد والكالسيوم والمغنسيوم والبوتاسيوم والصوديوم ) مختبريا على النمو الخضري والتكاثر الجنسي واللاجنسي وتكوين الجمات لكل من الفطريات الاتية والمعزولة من محطات الدراسة اثناء مدة الدراسةS. anisospora, A . prolifroides , L . lacteusوكانت نتائج التجارب المختبرية كالاتي : 1 - الكادميوم : اخذ بتراكيز ( 2 , 1 , 0.75 , 0.5 , 0.25 ) ملغم / لتر ا - اظهر الفطران L . lacteus وA . prolifroides تحملا لتراكيز الكاديميوم العالية اكثر من الفطر S . anisospora في النمو القطري بشكل معنوي. ب - عملت التراكيز العالية على تثبيط التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات الثلاثة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية عالية اكثر من باقي الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للكاديميوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة .2 - الزنك : اخذ بتراكيز ( 20 , 15 , 10 , 5 , 1 ) ملغم / لتر ا - عملت التراكيز العالية للزنك على تثبيط اقطار المستعمرات للفطريات الثلاثة .ب - عمل التركيز (1)ملغم|لتر على تشجيع التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات المدروسة مقارنة بمعاملة السيطرة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية تجاه تراكيز الزنك اكثر من الفطرين L . lacteus وS . anisospora . اما الفطر S . anisospora يمكن عده مؤشر لتلوث المياه بالزنك لكونه اكثر الفطريات تحملا للتراكيز المرتفعة لهذا العنصر .جـ - التراكيز المختلفة للزنك قللت معنويا اعداد الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides والتراكيز العالية للزنك عملت على زيادة اعداد الجمات للفطر L . lacteus معنويا.3 - الحديد : اخذ بتراكيز ( 5 , 2 , 1.5 , 1 , 0.5 ) ملغم / لتر ا - لم تؤثر التراكيز الواطئة للحديد معنويا على النمو القطري للفطريات المدروسة .ب - التراكيز المختلفة للحديداثرت على تكوين وظهور واعداد الحافظات البوغية والبيضية للفطر A . prolifroides مما يجعل امكانية استخدامه كدليل حياتي لتلوث المياه بهذا العنصر . وكذلك بالنسبةالفطر L . lacteus اما الفطر S . anisospora فانه لم يتاثر بشكل ملحوظ .جـ - اثرت التراكيز المختلفة على الفطران S . anisospora وA . prolifroides بزيادة اعداد الجمات فيه . لكن عمل الحديد على تقليل اعداد الجمات في الفطر L . lacteus .4 - الكالسيوم : اخذ التراكيز ( 150 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - ازدادت اقطار المستعمرات الفطرية بوجود الكالسيوم لكل من L . lacteus وS . anisospora لكن ثبطت اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides . ب - عملت التراكيز( 100 , 80 , 60 ) ملغم / لتر على تحفيز التكاثر اللاجنسي للفطريات اما التركيز (150)ملغم/ لتر ثبط الحافظات البوغية ،وشجعت التراكيز المنخفضة تكوين الحافظات البيضية وزيادة اعدادها للفطر A . prolifroides ،اما الفطر S . anisospora فان تراكيز الكالسيوم المختلفة عملت على تشجيع ظهور الحافظات البيضية وزيادة اعدادها, اما في الفطر L . lacteus فان تراكيز معينة عملت على تشجيع ظهورها وزيادة اعدادها . جـ - شجع الكالسيوم على تكوين الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides ولكنه ثبط اعدادها في الفطر L . lacteus بشكل معنوي.5 - المغنسيوم : اخذ بتراكيز ( 120 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - حفزت التراكيز المختلفة للمغنسيوم على زيادة اقطار المستعمرات لكل من الفطرين L . lacteus , A . prolifroides لكن الفطر S . anisospora عمل المغنسيوم على تثبيط اقطار مستعمراته .ب - اخر المغنسيوم ظهور الحافظات البوغية لكل الفطريات المدروسة وكذلك قلل اعدادها . اما الحافظات البيضية للفطريات المدروسة فقد اظهر المغنسيوم تاثيرا متباينا على الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للمغنسيوم اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , S . anisospora اما فان التركيزين ( 100 , 80 ) ملغم / لتر عملت على زيادة اعداد الجمات في الفطر A . prolifroides.6 - البوتاسيوم : اخذ التراكيز التالية ( 15 , 10 , 75 , 5 , 2.5 ) ملغم / لترا - حفز البوتاسيوم زيادة اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides لكنه ثبط اقطار الفطرين L . lacteus , S . anisospora معنويا مقارنة بمعاملة السيطرة.ب - شجعت التراكيز المنخفضة للبوتاسيوم على تكوين الحافظات البوغية والبيضية للفطر S . anisospora اما التراكيز العالية عملت على تثبيط اعدادها . اما في الفطر A . prolifroides فقد اثر بشكل مختلف ومتباين على تكوين حافظاته البوغية والبيضية .وفي الفطر L . lacteus عملت التراكيز ( 10 , 7.5 , 5 ) على زيادة اعداد حافظاته ج - عمل البوتاسيوم على زيادة اعداد الجمات للفطر A . prolifroides ،وعمل التركيز ( 5 ) ملغم / لتر فقط عمل على زيادة اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , .anisospora S . 7 - الصوديوم : اخذت التراكيز التالية ( 250 , 200 , 150 , 100 , 50 ) ملغم / لتر ا - ثبط الصوديوم اقطار الفطر S . anisospora اما الفطر A . prolifroides فان التراكيز المنخفضة زيدت اقطار مستعمراته اما التراكيز العالية ثبطت اقطار مستعمراته وكذلك الفطر L . lacteus .ب - الفطر A . prolifroides كان اكثر الفطريات حساسية تجاه التراكيز المختلفة للصوديوم خصوصا لتكاثره الجنسي واللاجنسي . اما الفطر L . lacteus فقد شجع الصوديوم تكوين حافظاته البوغية والبيضية . اما الفطر S . anisospora فان التراكيز المختلفة اثرت على تقليل اعداد الحافظات البوغية , وكذلك الحافظات البيضية .جـ - زيدت التراكيز المختلفة للصوديوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة S . anisospora ,A . prolifroides L . lacteus باستثناء التركيز (50)ملغم / لتر الذي عمل على تقليل اعدادها في الفطر الاخير. | In the present study five stations were chosen in the South of Baghdad . three stations on the Diyala river . the first before Al - Rustumia station , the second near the confluences of Al - Rustumia station and the third station was near the point that Diyala river meeting Tigris river . the last two stations , one of them located on Tigris river before it meet's Diyala river and the other after their meeting to limit the ecological effect of Diyala river on Tigris river . The samples were taken from studied stations every two months from February to December 2009. Fourteen species were isolated belong to six genus related to the class Oomycetes .These are : - Achlya klebsiana , A . amricana , A . prolifroides , Achlya .sp , S. ferax , S . anisospora , S .diclina,Saprolegnia.sp,Dictyuchus sterile,D.carpophorus, D . Polysporus , Pythium ultimum , Pythopsis cymosa , Leptomitus . lacteus . The results showed that higher number of isolates was in station ( 5 ) in the Tigris river while the lower number of isolates was in station ( 3 ) near the confluences of AL - Rustumia (16 )isolates. The study showed that Saprolagnia was the most frequent in the peroid of studying and Pythopsis was showed the lower freqency. The result showed that we can consider each of these Speicies : S . anisospora , S . ferax , A . prolifriodes , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus . as indictor of water Pollution . D . polysporus and Pythopsis cymosa were not recorded in Iraq . The ecological studying showed that temperature variability was between (10.5 - 29.5)C˚ in the peirod of studying , and Hydrogen contcentration ( 6.8 - 8.3 ) in the station s of studying . Electeral ions conductivity and salinity was ( 985 - 4920 )µs\Cm ,( 0.61 - 3.08 ) G\l in sequence . Biological Oxygen Demmend and Chemical Oxygen Demmend (3.2 - 18.2 )mg\l , ( 2.2 - 7.3 ) mg\l river was higher as compared with Tigris river the turbidiy valves was ( 14. 4 - 42 )NTU and it was higher in Diyala river then inTigris river so that Hardness range was ( 210 - 1617 ) mg\l . The Cataions consider ( Calisum and Magnesium) recorded increase in Diyala river than Tigris river because of effect of Diyala river on ecological situation of Tigris river ( 65 - 862.11 ) mg\l , ( 13.76 - 545.4 ) mg\l . The Sodium concentration recorded higher values in cataions Concentration ( 45 - 870 ) mg\l and the Polassium was the lowest concentration ( 1.7 - 18.12 ) mg\l. The heavy metal , the Zinc was the only elements present while the Chromum was recorded the lowest concentration . The results also showed that Diyala river Polluted with the elements ( Zinc , Lead , Cadmium , Copper , Iron , Chromum ) . in spite of that it wasn't take regular style .However In the Tigris river it was at the acceptable limitis ,The phosphate , concentrations in the studied stations were between ( 0.1 - 3.8) mg\l and concentration in Diyala river as were higher than Tigris river . The chloride was recorded in range ( 199.96 - 775.63 ) mg\l and higher concentration in Diyala river in Station ( 3 ) near the confluence of AL - Rustumia. All of ecological studies recorded decreased in the second halfe of the year ( 2009 ) compative to first half of that Year because of the level of water increased . Effect of the elements ( Cadmium , Zinc , Iron , Calsium , Magnesium , Potassium , Sodium ) on the radical growth , A sexual and sexual reprodudtion and gemma formation of the following isolated species fungi : S . anisospora , A.prolifroides . L . lacteus . were studied in the laboratory The results were as follows : 1. Effect of Cadmium : was used at the concentration (0.25, 0.5, 0.75, 1,) (mg\l) .a - A . prolifroides and L . lacteus showed more tolerance to the higher concentrations of Cadmium more than S . anisospora of radical growth .b - Higher concentration reduced both the Asexual and Sexual reproduction to the three fungi and the fungus A . prolifroides showed high sensitivity as compared with the other two fungi . Cadmium expanded the period of oogonia formation .c - Cadmium reduced number of gemmae in three fungi.2. Effect of Zinc : was used at the concentration ( 1,5,10,15,20 ) ( mg \l) a - Higher conc. of Zinc reduced the diameters of colonies of all the three fungi , while the low conc. had no effect.b - ( 1ppm ) conc. stimulated asexual and sexual reproduction of the studied fungi and the fungus A . prolifroides was more sensitive to all concs. of Zinc than S . anisospora , L . lacteus while the fungus S . anisospora was tolerant and can consider as bioindicator for water pollution with Zinc because it was the best fungus tolereate to higher conc. of this element.c - Different conc. of Zinc decreased the number of gemme of the S . anisospora and A. prolifroides, but higher conc. of Zinc increased the number of gemmae of L . lacteus 3. Effect of Iron : was used at the concs. ( 0.5 , 1 , 1.5 , 2.5 ) ( mg \l ) a - lower conc. of Iron has no effect on redical growth of fungi while the conc. ( 2,5 ) mg / L reduced the colonies diameter. b - Different concs. of Iron stimulated the formation and number of sporangia of the fungi A . prolifroides , L . lacteus that makes the first one as indicator for water pollution of this element. while the fungus S . anisospore was not affected c - Different concs. of Iron stimulated and increased the number of gemmae to fungi A.prolifriodes , L.lacteus but decrease the gemmae in S.anisospora 4. Effect of Calsium : was used at the concentration ( 40, 60, 80, 100, 150 ) mg \la - Calcium induced an increased of colonies diameters of S . anisospora and L . lacteus , while it redued redical growth of A . prolifroides .b - The concs . ( 60 , 80 , 100 ) mg \l work on stimulation of the asexual reproduction the fungi , while ( 150 ) mg \l redued the sporangia formation . Low conc . induced formation and number of Oogonia in A . prolifroides , while the different conc. Of Calsium stimulated Oogoina formation and number in S . anisospora .in the fungus L . lacteus specific conc . encourage the formation and number of Oogonia .c - Calsium increase the number of gemmae in A . prolifroides and S . anisospora , while reduced it in L . lacteus5. Effect of Magnesium : was used at the conc. (40, 60, 80,100,120) mg \la - Different concs. Of Magnesium stimulated the radial growth of both of fungi A . prolifroides and L . lacteus , while the Magnesium reduced the radial growth of S . anisospora .b - Period of sporangia formation of the there fungi was expanded , and the number of sporangia was reduced of fungi . Oogonia of all fungi showed different effect in different concs. of Magnesium. c - Different concs. of Magnesium reduced the number of gemmae of fungi , except ( 60 ) mg/L for the fungus S . anisospora and ( 40 ) mg\l for the fungus L . lacteus , while ( 80 , 100 ) mg\l stimulated the number of gemmae in A . prolifroides 6. Effect of Potassium : was used at the concs. (2.5, 5,7.5, 10,15) mg\l a - Potassium reduced the radial growth of both fungi S . anisospora and L . lacteus , while increased the Colonies diameter of the fungus A . prolifroides. b - Low conc. of Potassium stimulated the formation and number of sporingia and Oogonia , while higher conc. reduced it. However ,the concs. ( 5 , 7.5 , 10 ) mg\l stimulated the number of sporangia and Oogonia of the fungus A . prolifroides S.anisospora showed irregular style in the formation of sporangia and Oogonia so the fungus L . lacteus . c - Potassium concs. stimulated the number. of gemmae in A . prolifroides , while only ( 5 ) mg\l stimulated the number of gemmae of S . anisospora and L . lacteus. 7. Effect of Sodium : was used at the conc. (50,100,150, 200, 250 ) mg\l a - Sodium reduced the colonies diameters of the fungus S . anisospora , while low conc. increased the radial growth but high conc. reduced the radial growth of A . prolifroides and L . lacteus b - A . prolifroides was high sensitive to different conc. of Sodium specialy the asexual and sexual reproduction . Sodium stimulated the formation of sporangia and Oogonia in L . lacteus , while and reduced it in the fungus S . anisospora .c - Sodium was stimulated and increased of gemmae formation in S . anisospora and , A . prolifroides at different concs. of , while in fungus L . lacteus only ( 150 ) mg / L reduced the number of gemmae and the other concs. stimulated their number .

دراسة تاثير بعض الطرائق الفيزيائية في تحطيم سم الافلاتوكسين B1 المنتج من الفطر Aspergillus flavus في حبوب الذرة الصفراء المخزونة == Study the effect of some physical methods to destroy the toxin aflatoxin B1 product from the fungi Aspergillus flavus on maize stored grains

Author name: ريام حسن طعمة الدراجي
Supervisor name: امنة محمد علي | حليمة زغير حسين
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The study inculded in the plant protection department / College of Agriculture / University of Baghdad evaluate the efficiency of physical agents (ozone, ultraviolet radiation, microwave oven) for inhibiting Aspergillus flavus growth and destroying the mycotoxin that produced in corn seeds . An isolate af A.flavus producing Aflatoxin B1 was obtained from plant protection dept. college of Agric. University of Baghdad . the results showed that hight significant reduction in A. flavus growth between treated and non - treated cultures for all the agents used was observed . The exposition of A. flavus culture to ozone at 2 and 4 g/min . 5, 10 , 20 mins. induced inhibition percentayes of fungal growth 82.16 , 83.30 , 79.96 % and 78.47 , 81.60 , 78.83 % respectively, compared 0 % in control treatment . It was found that the more efficient concentration is 2 g / min for to mins . The inhibition percentages of A.flavus growth were found to be 84.73 , 88.50 , 92.53 % and 81.46 , 94.40 , 87.37 % when the fungal culture exposed to Ulttraviolet radiation at wave length 240 and 365 nm for 30 , 60 , 120 mins . compared with 0 % in control treatment. The best time escposition was found to be 120 mins. and 240 nm and 60 mins. at 365 nm. The biomass weights of A.flavus growth were estimated to be 0.12 ,0.30, 0.42 g and 0.21, 0.38 , 0.44 g when a fungal culture exposed to microwave for 5 , 10 , 20 seconds at 80 Co and 100 Co respectively, compared with 0.26 g in control treatment . The best treatment of each agents was chosen for storage experiment to evaluate the ability of these agents to destroy Aflatoxin B1 produced by A. flavus in contaminated corn seeds . The concentration of the mycotoxin were determined by ELISA test protocol . Results showed destroy toxin IFLA B1 (reduction ratio) the effect of radiation microwave in the center of Japex degree 80 and 100 Co 57.14% and 85.71%, respectively, and for 20 sec ,compared to the treatment comparison 0 % as found significant differences were apparent between transactions and the treatment of comparison, as and the presence of a significant difference to the treatment beam microwave notes degree 100 Co, amounting reduction ratio 85.71%, showed the effect of radiation microwave to break toxin IFLA B1 raw results (percentage reduction) by two notches 80 and 100 Co, 5, 10, 20 times a second and there were no significant differences between the treatments and treatment comparison as well as the existence of clear differences of treatment degree 80 and 100 Co and time of 20 sec and rates reduced 95.09% and 91.18%, respectively, showed the results of destroy toxin IFLA B1 (reduction ratios) contaminated corn and the presence of significant differences apparent between the comparative treatment and the rest of the transactions when it was noted the lack of significant differences between transactions ozone and ultraviolet (240,365 nm) and microwave two - tone effect temperature (80 and 100 Co ) and rates reduced 89.52% and 89.52% and 69.52% and 94.29% and 89.52%, respectively, and was the best treatment is radiation microwave degree 80 Co and by the reduction of 94.29%, and the results showed that there were significant differences apparent between the comparison treatment (non - polluting) and the rest of the transactions and observed significant differences were apparent between transactions (microwave and ozone and ultraviolet radiation) led by microwave treatment of two - tone effect 80 and 100 Co and by the reduction of 100% for both degrees .

التغيرات في بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى قصور الغدة الدرقية == Changes in some haematological indices and biochemical parameters in patients with hypothyroidism

Author name: رويدة يونس لفتة
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (80) شخصا بشكل مجموعتين ، تضمنت المجموعة الاولى مرضى قصور الغدة الدرقية 60 مريضا (40 انثى، 20 ذكر) الذين تراوحت اعمارهم بين (25 - 63 ) سنة وبمعدل 44.23±1.38) ) ومن المراجعين الى مركز الغدد الصم والسكري / التابع لمستشفى الكندي / الرصافة ، شملت مجموعة السيطرة 20 شخصا (15 انثى ، 5 ذكور) تراوحت اعمارهم بين (25 - 60 ) سنة وبمعدل ( 37.00±6.49 ). اظهرت النتائج ارتفاعا (P<0.01) في مستويات هرمون TSH في مجموعة المرضى وبمعدل (5.60±0.78 mU/L) مقارنة بالسيطرة (1.62±0.17 mU/L)، لم تكن الفروقات معنوية (P>0.05) في مستويات T4 (79.82±2.32 nmol/L )، (74.90±2.11 nmol/L) وT3 (1.35±0.05 nmol/L) ،(1.54±0.06 nmol/L) في مجموعتي المرضى والسيطرة على التوالي . كان معامل الارتباط سالبا (P<0.01) في مجموعة المرضى بين TSH وT3 (0.31 - ) وكذلك بين TSH وT4 (0.53 - ) بينما كان الارتباط موجبا (P<0.01) بين T4و T3 (0.54) . انخفض مستوى هيموكلوبين الدم (P<0.01) (<13gm/dL) في الذكور ، (<12 gm/dL) في الاناث وبمعدل (9.47±0.13 gm/dL ) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (12.91±0.30 gm/dL) . بلغت نسبة حصول فقر الدم (38.33%) وعند مستوى معنوية (P<0.01) في مجموعة المرضى وبمعدل مستوى الهيموكلوبين (9.47±0.13 gm/dL) مقارنة ﺒ (20 %) وبمعدل هيموكلوبين الدم (10.82±1.3 gm/dL) في مجموعة السيطرة . كان نوع فقر الدم في مجموعة المرضى وبحسب حجم كريات الدم الحمر الكريي (MCV <80 Ft ) في 8 حالات وبنسبة (34.78 %) وتحت مستوى معنوية ( P<0.01) من نوع صغيرة الحجم (Microcytic anemia) وفي 15 حالة وبنسبة (62.21 %) وعند مستوى معنوية (P<0.01) من نوع طبيعية الحجم (Normocytic anemia) اما حالات عدم وجود فقردم فلقد بلغت 37 حالة وبنسبة (61.67 %) وعند مستوى معنوية (P<0.05) . انخفض مستوى حديد مصل الدم (P<0.05) في مجموعة المرضى في 10 حالات وبنسبة (16.67 %) وبمقدار (10.08±0.5 µmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0 %) وبمعدل (19.83±0.69 µmol/L) . انخفض فريتين مصل الدم (P<0.01 ) وبمعدل (11.21±0.13 µg/L) وبنسبة (36.67 %) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (20 %) وبمعدل ( 6.14±0.12 µg/L) . ارتفع مستوى TIBC ((P<0.01 في 7 حالات وبنسبة (11.67 %) وبمعدل (67.02±0.12 µmol/L ) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (51.23±0.87 µmol/L) ،انخفض مستوى TIBC (P<0.01) في 51 حالة من المرضى وبنسبة (85 %) وبمعدل (29.78±0.32 µmol/L) مقارنة مع السيطرة(51.23±0.87 µmol/L) لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (123.17±1.35 mm.Hg) والانبساطي (mm.Hg 79.27±0.82) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة ((120.20±2.50 mm.Hg ،((78.95±0.18 mm.Hg على التوالي . لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى معامل كتلة الجسم (BMI) في مجموعة المرضى (28.37±0.72) مقارنة مع السيطرة (26.71±1.07) . ارتفع مستوى RDW (P<0.01 ) (17.2±0.12%) وانخفض مستوى MCV (62±0.2 Ft) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة RDW (15±0.22%) وMCV (66.3±0.13 Ft)، انخفض مستوى صوديوم مصل الدم (<135 mmol/L) في 26 حالة وبنسبة (43.33 %) وعند مستوى معنوية ((P<0.01 مقارنة بالسيطرة (0%) بلغت مستويات البوتاسيوم (4.62±0.08 mmol/L) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (4.59±0.07 mmol/L) الا ان هذا الارتفاع لم يكن معنويا ((P>0.05 . نستنتج من هذه الدراسة الى ان قصور الغدة الدرقية في مجموعة المرضى كان من نوع تحت السريري وذلك من خلال ارتفاع مستوى هرمون TSH والمستويات الطبيعية لهرموني T4 وT3 . وكان فقر الدم من نوع صغيرة الحجم ، وطبيعية الحجم مع انخفاض مستوى الصوديوم في مصل الدم. | The present study was conducted on 80 subjects , divided into two groups. The hypothyroid patients group (Ist group) Included 60 subjects (40 females,20 males),their ages ranged between (25 - 63) year by mean (44.23±1.38) ,that visited the center of endocrine and diabetes at AL Kindy Hospital, Rusafa region .The control group was included 20 subjects (15 females,5 males). Their ages ranged between 25 - 60 year by mean (37.00±6.49) The results showed a significant (p<0.01) increase in the level of TSH in patients group (5.60±0.78 mU/L) in comparison (1.62±0.17 mU/L) in the control group . The differences were not significant (P>0.05)in the level of T4 (79.82±2.32 nmol/L) ;(79.90±2.11 nmol/L) and T3 (1.35±0.05 nmol/L) ; (1.54±0.06 nmol/L) in the patient and control groups respectively. There was negative correlation(P<0.01) between TSH and T3 (0.31 - ) ,and also between TSH and T4 (0.53 - ) .while there was a positive correlation (0.54) significant at (p<0.01) between T4 and T3 in the patients group . The level of haemoglobin decreased significantly (P<0.01) in males (<13 gm/dL) and females (<12 gm/dL) with mean (9.47±0.13 gm/dL) in patienst group in comparison with control group (12.91±0.30 gm/dL). The rate of anemia was (38.33%) at the level (P<0.01) in the patients group in comparison with control group (20%) by mean(10.82±1.3 gm/dL) . The type of anemia according to MCV (<80 Ft) was microcytic in 8 cases (34.78%) at level (P<0.01) and it was normocytic in 15 cases (62.21%) in the patienst group at (p<0.01) . The non anemic cases were 37 (61.67%) at level (P<0.05) . The level of serum Iron reduced (P<0.05) in the patients group in 10 cases (16.67%) with mean (10.08±0.5 µmol/L) in comparison (0%) with mean (19.83±0.69 µmol/L) in the control group. The level of Ferritin reduced (P<0.01) by mean (11.21±0.13 µg/L) at rate (36.67%) in comparison (20%) with mean (6.14±0.12 µg/L) in the control group. TIBC was Increased (P<0.01) in 7 cases (11.67%) with mean (67.02±0.12 µmol/L) in the patients group in comparison with the control group (51.23±0.87 µmol/L) . The level of TIBC was decreased (P<0.01) in 51 cases (85%) with mean (29.78±0.32 µmol/L) in the patients group in comparison with control (51.23±0.87 µmol/L) . There was no significant differences (p>0.05) in the level of systolic blood pressure (123.17±1.35 mm.Hg) and diastolic blood pressure (79.27±0.82 mm.Hg) in the patients group in comparison with control (120.20±2.50 mm.Hg) ;(78.95 ±0.18 mm.Hg) respectively . BMI value was not significant (p>0.05) in the patients group (28.37±0.72) in comparison with the control group (26.71±1.07) . The level of RDW increased(P<0.01)(17.2±0.12%) while MCV (Ft) decreased (62±0.2 Ft) in patients group in comparison with control group; the RDW was (15±0.22 %) and MCV (66.2±0.13 Ft) . The level of serum sodium (<135 mmol/L) reduced (P<0.01) in the 26 cases (43.33%) in comparison with control group(0%) . The level of potassium was Increased (P>0.05) (4.62±0.08 mmol/L) in the patients group in comparison (4.59±0.07 mmol/L) in the control group. We concluded from this study that the hypothyroidism in the patients group was subclinical (SCH) ,due to increasing TSH levels but the T4 and T3 levels were normal .The anemia in this group was microcytic and normocytic and reduction in the serum sodium level .

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع عائلة قفازات الاوراق من رتبة نصفية الاجنحة من بعض Hemiptera : Cicadellidae مناطق العراق == Taxonomic and Morphological Study of Some Species of Family : Cicadellidae (Order : Hemiptera) From Some Regions of Iraq

Author name: رواء جعفر حميد
Supervisor name: حسن سعيد جاسم الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Insects
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study included taxonomic and morphological studies of fifteen species of leafhoppers belong to twelve genera of three subfamilies which are : Agalliinae, Deltocephalinae and Typhlocybinae of the Family : Cicadellidae, Order : Hemiptera.The studied species were collected from different regions of Iraq and thesewere species as follow : SubFamily : Agalliinae*1 - Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898**2 - Assuita megacephala SubFamily : Delatocephalinae**1 - Balclutha cytoptera*2 - Balclutha rubrostriata Melichar, 1903**3 - Balclutha xanthous**4 - Cicadulina laterostriata**5 - Circulifer wilsoni**6 - Eucelidius irakensis**7 - Exitianus transversus*8 - Neoalitarus argillaceus Mityaev, 1975**9 - Neoalitarus nigrosus**10 - Opsianus bronopunctatus*11 - Opsius cypriacus Lindberg, 1958*12 - Orosius albicinctus Distant, 1918 SubFamily : Typhlocybinae**Emposca phosphoviridisThe species marked by one star were regarded as new record species to the Iraqi fauna of Cicadellidae while those marked by two stars were regarded as new to science.Species Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898 regarded as sample of the family.

انتاج وتوصيف Protease من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من بعض الحالات السريرية وعلاقته ببعض المضادات الحيوية == Production and Characterization of Protease from Pseudomonas aeruginosa Isolated from Some Clinical Cases and its Relation with some Antibiotic Agent

Author name: رنا مجاهد عبد الله الشويخ
Supervisor name: سمير فتح الله سمعان | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (170) عينة من حالات مرضية مختلفة التي تضمنت (35) مسحة من الجروح و(47) مسحة من الحروق و(25) مسحة من حالات التهابات الاذن الوسطى فضلا عن عينات الادرار التي تضمنت (63) عينة وجمعت العينات من مستشفى الكاظمية التعليمي للمدة من 1 - 5 - 2005 ولغاية 1 - 8 - 2005 .  تم تشخيص (50) عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اذ زرعت على اوساط اغنائية وتفريقية لغرض العزل الاولي ثم اخضعت المزارع البكتيرية للفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها ، ثم استخدمت عدة الفحصapi20E للتشخيص النهائي لهذه العزلات ، اذ تضمنت (8)عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa (16%) من حالات التهاب الجروح ، (16) عزلة (32%) من التهابات الحروق ، (20) عزلة (40%) من حالات التهاب المجاري البولية و(6) عزلات (12%) من حالات التهاب الاذن الوسطى .  اختبرت حساسية بكتريا Pseudomonas aeruginosa ضد (20) مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية . اذ اظهرت بكتريا Pseudomonas aeruginosa نسبة المقاومة(100%) تجاه مضادات الامبسلين ، الاموكسسلين ، الاموكسسلين / حامض كلافيولونك ،الكلوكساسلين والسيفازولين . بينما بلغت نسبة المقاومة لمضادات السيفاكسيم ، الكاربنسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم (98%) ، (84%) ، (80%) و(78%) على التوالي. وبلغت نسبة المقاومة لمضادات الجنتاميسين ، التوبرامايسين ، الببراسيلين ، النورفلوكساسين ، الاميكاسين والسبروفلوكساسين (52%)، (26%) ، (24%) ،(14%) ،(6%) و(4% )على التوالي . في حين اظهرت جميع العزلات لبكتريا Pseudomonas aeruginosa حساسية عالية (100%) تجاه مضادات الازترونام ، امبينيم والسيفابيم البيفلوكساسين والافلوكساسين .  قدرت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs ) للمضادات الحيوية وكانت اعلى نسبة مقاومة لمضادات الاموكسسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم . اما نسبة المقاومة لمضادات الامينوكلايكوسايد فكانت تتراوح (4 - 128) مايكرو غرام / مل للتوبرامايسين ، (4 - 256) مايكرو غرام / مل للجنتاميسين اما لمضاد الاميكاسين فكانت (4 - 128) مايكرو غرام / مل. في حين اظهرت قيم MIC حساسية عالية (100%) لمضادي السبروفلوكساسين والسيفابيم.  اظهرت نتائج خلط مضادات السبروفلوكساسين مع كل من الجنتاميسين والسيفتازديم والببراسيلين نتائج مهمة في تخفيف التراكيز المثبطة الدنيا لكلا المضادين المستخدمين لوحدهما ضد هذه البكتريا . كذلك اظهرت نتائج خلط مضادي التوبرامايسين مع السيفتازديم فعالية عالية عند خلطهما معا واستعمالهما ضد بكتريا Pseudomonas aeruginosa . اظهرت (86%) من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa قابليتها على انتاج انزيم البروتييز . اظهرت النتائج تاثر انزيم البروتييز الخام ببعض المضادات الحيوية التي ادت الى انخفاض في فعالية الانزيم عند زيادة تركيز هذه المضادات .  كانت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتييز عند استخدام وسط لوريا عند رقم هيدروجيني(8) ولمدة(48) ساعة من الحضن بدرجة حرارة(35) م º . نقي انزيم البروتييز من العزلة Pseudomonas aeruginosa PsaW2 باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الايوني DEAE - celluloseوكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100. قدر الوزن الجزيئي للانزيم المنقى بطريقة الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100 وكان (21379 ) دالتون ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية البروتييز (35) م º والرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم كانت (8) . اوضحت نتائج تاثير بعض المثبطات والعوامل المختزلة والكلابية في فعالية الانزيم ، ان فعالية الانزيم قد ازدادت عند معاملته بايونات Ca++ وZn ++ مما يدل انها تلعب دورا في تحفيز وثبات الانزيم ، ولم تثبط فاعلية الانزيم بوجود العوامل المختزلة مثل السستين ، بينما تثبط فعالية الانزيم بوجود العوامل الكلابية EDTA .  اظهر انزيم البروتييز المنقى من بكتريا Pseudomonas aeruginosa فعالية عالية عند خلطه مع مضادي الفانكومايسين والسيفازولين في علاج التهابات العيون في الارانب والمتسبب عنها بكتريا Staphylococcus aureus . |  One - hundred and seventy swab samples were collected from different cases including (35) wound and (47) burn infection , (25) otitis media and (63) samples from urinary tract infections from Al - Kadhymia Teaching Hospital in Baghdad city . The study period was from 1 - 5 - 2005 to 1 - 8 - 2005 .  Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified using different microscopical , cultural characteristics and biochemical tests . Final identification of bacteria were performed by using api20E system. The isolates were 8(16%) from burn infections , 20(40%) isolates from urinary tract infections , 16(32%) isolates from burn infections and 6(12%) isolates from otitis media . The sensitivity of Pseudomonas aeruginosa isolates was been tested against (20) antibiotics showed isolates version resistance with different percentage against antibiotics .Pseudomonas aeruginosa exhibited (100%) resistance to Ampicillin , Amoxycillin , Amoxycillin / clavulanic acid, cloxacillin and cefazolin .While percentages of resistance to cefixime , carbencillin, cefotaxime and ceftazidime were (98%) ,(84%) ,(80%) and ( 78%) respectively .Resistance percentages to Gentamicin ,Tobramycin , Piperacillin , Norfloxacillin , Amikacin and Ciprofloxacine were (52%),(26%),(24%),(16%),(14%)and(4%) respectively. All isolates of Pseudomonas aeruginosa were highly sensitive (100%) to Aztronam , imipenem , cefepime , P - ofloxacin and ofloxacin .  Minimum inhibitory concentrations of Amoxycillin , cefotaxime , ceftazidime and piperacillin showed higher percentage of resistance . While resistance to aminoglycoside antibiotics including Tobramycin was (4 - 128) μ g / ml , Gentamicin was (4 - 256) μ g / ml and Amikacin was (4 - 128) μ g / ml . On the other hand , all bacterial isolates were susceptible (100%) to Ciprofloxacine and Cefepime .  Combinations of Ciprofloxacine with Gentamicin , ceftazidime and piperacillin gave interesting results against the local bacterial isolates in reducing their MIC values . Tobramycin and ceftazidime gave an obvious decrease in MIC values after combination of these drugs and used against Pseudomonas aeruginosa . A (86%) of the isolates of Pseudomonas aeruginosa have ability to produce protease enzyme . Enzyme activity was affected by some antibiotics . This activity was reduced with increasing the concentrations of these antibiotics . The optimum conditions for protease production were in LB medium with a pH (8) after (48) hrs of incubation at (35) C .  Purification of the protease was done using ion exchange chromatography DEAE - cellulose and gel filtration with sephadex G - 100 .  Molecular weight of the purified protease was measured by sephadex G - 100 and it was found to be around (21379 ) Dalton . The optimum temperature of enzyme activity was (35) C . However , the pH (8) was for activity and stability of this enzyme .  Zn++ and Ca++ ions may play a role in the enhancement and stability of the enzyme . Enzyme activity was not inhibited in the presence of reducing agent such as Cysteine , but it was inhibited in the presence of EDTA .  Pseudomonas aeruginosa purified enzyme shows a high activity when combined with Vancomycin and cefazoline and used for the treatment of the eye infection in rabbits caused by Staphylococcus aureus .

دراسة تاثير بعض الاحماض الدهنية على فعالية انزيمات المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من حالات الحروق == Study the effect of some fatty acids on the enzymes activity of Staphylococcus aureus isolated from burns

Author name: رنا عبد الكريم رشيد
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 157 عينة مسحة من المرضى المصابين بالحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد للفترة من شهر تشرين الثاني 2006 ولغاية اذار 2007 . زرعت هذه المسحات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . • اظهرت النتائج ايجابية 144 مسحة لتلوثها بالبكتريا ، وبنسبة 91.7% ، فيما كانت 13 مسحة منها سالبة ، وبنسبة 8.3% .• عزلت 50 عزلة من بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus بنسبة عزل 31.8% ، وشخصت باستخدام الاختبارات المظهرية والكيميائية الحياتية الخاصة بها .• قاومت جميع العزلات (50 عزلة) مضاد الاوكساسلين ، فضلا عن قدرتها على النمو في وسط اكار الاوكساسلين (Oxacillin agar) ، وبذلك كانت مقاومة للمثسلين (Methicillin resistant Staphylococcus aureus) (MRSA) وبنسبة 100% .• تم التحري عن حساسية العزلات تجاه 21 مضادا حيويا ضمن مجاميع مختلفة ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عالية للعزلات البكتيرية لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسة ، في حين كان المضاد الجرثومي الفانكومايسين اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين ، اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له ، وكانت العزلتان R120 وR148 الاكثر مقاومة ، اذ قاومتا عشرين مضادا ، فيما كانتا حساستين للفانكومايسين فقط .• اوضح اختبار Minimum inhibitory concentration (MIC) للاحماض الدهنية ضد العزلتين R120 وR148 ان حامض اللاورك هو الاكفا في تثبيط نمو البكتريا ، اذ بلغت قيمة MIC 0.4 ملغم / مل ، في حين بلغت قيم MIC لكل من حامض المايرستك واللينوليك والبالمتك والاوليك ( 1.6، 1.6، 6.4، 25.6) ملغم/ مل على التوالي .• اختبرت قابلية العزلتين R120 وR148 على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط غراء كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز ، واعتمادا على ظهور هالة شفافة حول المستعمرات كانت نسبة التحلل للعزلتين المدروستين 2.5 ، 2.7 وعلى التوالي . ولذا فقد انتخبت العزلة R148 لاختبار تاثير الحامض الدهني في فعالية انزيم البروتييز فيها . • حضرت تراكيز متعددة من حامض اللاورك (0.0125 ، 0.025 ، 0.05 ، 0.1 ، 0.2 ، 0.4 ، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، واختبر تاثيرها على فعالية انزيم البروتييز ولوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ،اذ بلغت الفعالية معدل 2.36 وحدة / مللتر وبنسبة مئوية تبلغ 79.73% عند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض لتنخفض الى معدل 0.69 وحدة/ مللتر ، ونسبة 23.31% عند تركيز 1.6 ملغم / مل من الحامض .• اختبر تاثير التراكيز المختلفة من حامض اللاورك على وقت تكون الخثرة بوساطة انزيم مخثر البلازما (Coagulase) ، اذ تاخر تكون الخثرة الى الساعة الثانية من اجراء الاختبار عند التركيز 0.05 ملغم/ مل ، في حين كان التاثير الاكبر عند التراكيز ( 0.4، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، اذ تكونت الخثرة بعد مرور 18 ساعة من اجراء التجربة .• تم تقييم تاثير التراكيز المختلفة لحامض اللاورك على فعالية انزيم الهيمولايسين ، اذ لوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ، فعند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض وتخفيف 1/2 بلغت النسبة المئوية للفعالية 52.9% ، لتنخفض هذه النسبة عند تركيز 0.2 ملغم/مل من الحامض ، وتخفيف 1/2 الى 5.9%. | A total of 157 samples of burn swabs were collected from three hospitals in Baghdad during November 2006 to March 2007. Culturing of the samples was done on suitable media to isolate the bacteria.• The results showed that 144 swabs were positive for bacterial contamination (91.7%), while 13 swabs were negative ( 8.3%).• Fifty isolates of Staphylococcus aureus were isolated (31.8 %), the identification was accomplished using morphological and biochemical tests.• All isolates (50 isolates) were resistant to oxacillin and could grow on oxacillin agar , thus they were resistant to methicillin (Methicillin resistant Staphylococcus aureus ) (MRSA) at 100%.• The sensitivity of the isolates against (21) antibiotics was investigated using different groups of antibiotics , the results showed high resistance of isolates to many antibiotics which have been used in the study , while they were sensitive to vancomycin and the two selected isolates - R120, R148 were sensitive to vancomycin only and resistant to all 20 antibiotics .• The minimum inhibitory concentration (MIC) test for fatty acids to the two isolates R120, R148 showed that lauric acid was the best fatty acid in inhibiting bacterial growth when the MIC reached 0.4 mg/ ml while the other fatty acids (Myristic, Linoleic, Palmitic and Oleic ) MIC reached to (1.6, 1.6, 6.4, 25.6) mg/ml respectively .• The ability of the two isolates (R120, R148 ) to produce protease was detected on solid media ( Skim milk Columbia agar) and depending on the development of clear zone the lysis ratio was 2.5 , 2.7 respectively , therefore the R148 isolate was chosen to detect the fatty acid effect on its protease activity .• Multiple concentrations of lauric acid have been prepared (0.0125, 0.025 , 0.05 , 0.1 , 0.2 , 0.4 , 0.8 , 1.6 ) mg/ml and tested for its effect on protease activity . The obtained results showed that the activity decreased at the concentrations studied. The activity reached an average of 2.36 unit/ ml and a percentage of 79.73% at the concentration 0.0125 mg/ ml of the acid , and then reached an average of 0.69 unit/ ml and a percentage of 23.31% at the concentration 1.6 mg/ ml of the acid.• The effect of different concentrations of lauric acid on the time of clot formation by coagulase have been tested . The clot was formed at the 2nd hour of the test at the concentration 0.05 mg/ml while the highest effect was at the concentrations (0.4 ,0.8 ,1.6) mg/ml as the clot was formed after 18 hours from the beginning of the test .• The effect of the different concentrations of lauric acid on the activity of haemolysin was evaluated . A decrease in activity at the concentrations studied was noticed. The activity reached to 52.9% at the concentration 0.0125 mg /ml of acid and the dilution 1/2 then the activity decreased to 5.9% at the concentration 0.2 mg/ml and dilution 1/2

دراسة مقارنة سمية مبيدي الاعشاب 2,4 - D والراوند اب الترا في سمكة البعوض Gambusia affinis == Comparative Study of The HerbicidesToxicity 2,4 - D and Roundup Ultra in Mosquito Fish Gambusia affinis

Author name: رنا عبد الفتاح كمال
Supervisor name: عادل حسين طالب الزاملي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية التاثيرات السمية الحادة ,والمزمنة لمبيدي الاعشاب 2,4 - dichlorophenoxy acetic acide وRoundupultra في سمكة البعوض Gambusia affinis ,واستعملت لمبيد 2,4 - D تراكيز 10و15و20و25و30و35و40و45و50و55 ملغم/لترولمبيد راوند اب الترا التركيز 5و8و11و14و17و20و23و26و29و32 ملغم/لترولمدة 72 ساعة واستعمل كل من التركيز الوسطي القاتل LC50 والتغييرات السلوكية معيارا للتاثيرات السمية الحادة. اما في دراسة التاثيرات السمية المزمنة فقد استعمل تركيزين للمبيد2,4 - D هما 3.25 و6.5ملغم/لتر ومبيد الراوند اب الترا 1.78و3.56 ملغم/لترولمدة 60يوم واستعملت كل من التغييرات السلوكية والتغييرات في النمو والتغييرات النسجية معيارا لملاحظة التاثيرات المزمنة . اظهرت النتائج ان التركيز الوسطي القاتل LC50 32.5 ملغم/لترلمبيد 2,4 - D بينما بلغت قيمة التركيزالوسطي القاتل LC50 17.82ملغم/لترللمبيد راواند اب الترا لسمكة البعوض .كما اظهرت النتائج بان التغييرات السلوكية المتمثلة بالسباحة غيرالمنتظمة والهيجان وفقدان التوازن وزيادة حركة الغطاء الغلصمي وملامسة جدارن الحوض وافراز المخاط تزداد بزيادة التراكيز. اظهرت نتائج التغييرات في النمو انخفاضا معنويا تحت مستوى الدلالة (P< 0.05)في اوزان واطوال اسماك البعوض المتعرضة للمبيد راوند اب الترا اعلى بالمقارنة مع اوزان واطوال الاسماك المتعرضة للمبيد 2,4 - D واسماك مجموعة السيطرة. اظهر الفحص المجهري لنسج كل من غلاصم وكبد وكلى سمكة البعوض بعد تعرضها المزمن لمبيد الاعشاب الراوند اب الترا لمدة 60يوم تشوهات نسجية شديدة في الغلاصم في التركيز 1.78و3.56ملغم/لتروترتمثلت في فرط تنسج الصفائح الغلصمية الثانويه وضمور الصفائح الغلصمية الاولى وحدوث الانوريسما وحصول الشكل الهراوي واندماج الصفائح الغلصمية الثانوية ,اما التشوهات النسجية في الكبد فادت الى تفجي خلايا الكبد في التركيز1.78ملغم/لتر والتنكس الدهني الشديد في التركيز3.56 ملغم /لتر. اما التشوهات النسجية في الكلى فتمثلت في تنخر النبيبات الكلوية وانكماش الكبيبات الدمويه وانكماش النبيبات الكلوية. بينما التشوهات النسجية المرضية في اسماك البعوض المتعرضة لمبيد الاعشاب 2,4 - Dلمدة 60 يوم في التركيزين3.25 و6.5ملغم/لتراذ اظهرت الغلاصم فرط تنسج الصفائح الغلصمية الاولية وتضخم خلايا الصفائح الغلصمية الاولية والثانوية وتضخم الخلايا الكلوريدية وانفصال الخلايا الظهارية . اما في الكبد التغييرات النسجية المرضية ادت الى التنخر وتضخم خلايا الكبد في التركيز 3.25ملغم /لتر وكذلك حصول التغلظ النووي في التركيز6.5 ملغم/لتر. اما التغييرات النسجية المرضية في الكلية كانت خلومحفظة بومان من الكبيبة وانكماش الكبيبات الدموية. | This study included acute and chronic effects of 2,4 - D dichlorophenoxy asetic acid and RoundupUltra herbicides in mosquito fish Gambusia affinis using concentrations for studying acute effects for2,4 - D herbicide (10,15,20,25,30,35,40,45,50and55) mg/l and the concentrations for Round up ultra herbicide were(5,8,11,14,17,20,23,26,29and32) mg/l for 72 hours ,to determine the median lethal concentration ( LC50)and the behavioral changes were used as a standard of those effects .Whereas in the study of chronic effects two concentrations (3.25 , 6.5) mg/l for2,4 - D herbicides and (1.78 ,3.56) mg/l for Round up ultra herbicide were used for 60 days .The behavioral , histological, and growth changes were used as a standard to observe the chronic effects . The value of LC50 for 2,4 - D herbicide was (32.5) mg/l and (17.82) mg/l for Round up ultra herbicide for mosquito fish . The results show that behavioral changes as erratic swimming, hyperactivity, loss of equilibrium, increased in gills operculum and touching aquarium walls, they were increased with increasing concentrations.The results in growth changes showed reduction significantly in weights &tallness of mosquito fish that exposure to Round up ultra herbicide more than weights &tallness fishes exposuring 2,4 - D herbicide according to (P< 0.05) .The microscopic examination of the gills ,liver and kidney tissues of the mosquito fish after 60 days exposure to the herbicide Round up ultra showed sever pathological histological changes in gills in the concentration1.78and 3.56 mg/L like hyperplasia , lifting of the secondary Lamella, Anuerysm and congestion of secondary lamella, Atrophy of primary lamella ,Fusion of secondary lamella and the Club shape. In the liver, pathological changes were seen, leading to Vacuolation of the Hepatocytes in concentration1.78 mg/L and sever hepatocellular fatty degeneration in concentration3.56 mg/L., shrinkage of the renal tubules, necrosis in renal tubules and shrinkage of glomerulus where the pathological alterations in the kidney. While The pathological histological changes in mosquito fish after 60 days exposure to the herbicide 2,4 - D in gills were in the concentrations 3.25 and 6.5 mg/L hyperplasiaof primary lamella ,hypertrophy of primary and secondary lamella ,hypertrophy of chloride cells and Lifting of Epithelial cells. In the liver, pathological changes were seen, leading to Necrosis ,hypertrophy of hepatocells in concentration 3.25 mg/L also the pyknotic in concentration 6.5 mg/L . the pathological alterations in the kidney were vacancy of Bowman capsule and Shirnkage of Glomerulus.

الكشف عن بعض الحركيات الخموية والاخماج البكتيرية في مرضى الفشل الكموي == Detection of some cytokines and bacterial infections in patients with renal failure

Author name: رغد ناجي شهاب احمد
Supervisor name: صدام حسين جبر الحيدري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Urine and blood samples was Collected 245 from patients who were resident of the industrial renal unit of Al - kadhamyiah (p) Teaching Hospital and Al - kindy Teaching Hospital from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 05/11/2014 - 13/1/2015 .The samples were cultured in a suitable culture media for isolation bacteria. Diagnosed bacteria isolation on agar medium accuracy and privacy (Chromagar Orientation medium) as dependent as a result of the diagnosis on the color interaction between the enzymes of different bacterial isolates and the components of the center, specialist this confirmed diagnosis using API 20E and API Staph system results showed that the percentages of the bacterial isolates were as follows The results showed that 140 samples were positive for bacterial growth, It included 66 urine samples, has been negative bacterial 61/66 (92.42%) the isolation of prevailing compared bacterial positive grams for gram - stain and number 5/66 isolates, which accounted for (7.58%) of urine, while the number of bacterial isolates negative for tinted grams 26/74 (43.51%) compared to the isolation positive for gram - stain and number of 48/74 (64.86%) bacterial isolates . results show that the bacteria E .coli was the most sought after the generation of patients with kidney failure as it was isolated 57.57 percent, and by 18.92% isolated from the blood of patients with kidney failure. K.pneumoniae bacteria, followed by 25.75%, then the bacteria S.aureus by 7.57% and were S. aureus bacteria are prevalent in the blood as isolated 45.59%, then all of P. mirabilis and P. aeruginosa bacteria 4.54% P.aeruginosa isolates ratio was one of the blood 13.51%. Isolated the bacteria E.cloacae and Enterococcus spp 2.70% - 18.92% of the blood samples .The results showed that the age groups most affected renal failure were in the age group (50 - 70 years) as showing that the disease affects males and females, the study showed that there is an increase significantly in some measures of patients, male and female , and these standards is protein acute phase, the low increase significantly in the level of IGg and molecules complement C3,C4 in the serum of patients. results showed significant decrease in response to IL - 4 in patients level average of 297.4 pg \ ml compared with the levels in the control group, which recorded 410.1 rate pg \ ml and was a significant decrease in the level P< 0.05. Results show the high level of IL - 17A ,but not significant in patients with Group 79.2 pg \ ml compared with the levels in the control group, average of 76.6 pg \ ml.Results showed a high level of IP - 10 concentration in patients, amounting to an average of 0.318 pg \ ml compared with a total of 0.282 pg control \ ml at the level P< 0.05. results recorded a high level of response for MCP - 1 in patients, amounting to an average of 186.1 pg \ ml compared with normal levels in 116.2 when the total control pg \ ml moral worth at the level P< 0.05. The results of the study slight rises in cytokine rate significant difference was not a statistically significant in all cytokine between males and females have the current study signals are consistent with another study that sex is not at the level of cytokine in the serum of patient.

بعض الجوانب الحياتية ونوع الغذاء وتاثير الاشعة الفوق بنفسجية على ادوار عثة الرز الانجومواSitotroga cerealella Lepidoptera : Gelechiidae) ) == Some biological aspects and effect at food type and Ulitraviolet ray on the (Angoumois ) Sitotroga cerealella (Lepidoptera : Gelechiidae

Author name: رشا سطام حميد الخزرجي
Supervisor name: اياد احمد رضا الطويل | ليلى جبار محمد البهادلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Grain moth Sitotroga cerealella(Olivier) is considered as one of the world wide - spread pest that causing damage to the grain and its products either in the field or in the warehouses . . The sensitivity of Sitotroga cerealella egg is carried out to UV rays at genetic control Department l integrated pest management center / Agricultural Research Directorate / Ministry of Scinence and Technology. The study showed that semi cooked wheat media gave the highest rate of adults emergenc ( 82.00%) from hatched eggs . This media considered as the best medium for rearing the mentioned insect for successive generation .The effect of different tempreture degrees were also studied on the insect biology , the best degree to rear this pest was 30CO because recording the highest average of egg laying which was .5% . +80 of relative humidity 106.6 at The study also showed that the continuing usage of the UV rays has caused consumption of the tube .This explains the differences in the results compared with other researchers results for using the same wave length . . The study also showed that the eggs at age two days is more sensitive to the UV than the other age old of the insect . Besides this there was an effect of the UV rays on the egg hatch where exposure 7.5 min . The the at the time of % .3330the least was UV rays also effected the rate of the emergence of adult males & females ( 0.00% ) at the time of exposure 5 minAs for the UV rays effect on the male & female age lifespan , there was a little effect on the males and showed low decreases , While on the females , There was an increases in the lifespan with average (9.0 days) at exposure time of 2.5 min . While there was decreases in the female lifespan with average 4.5% at exposure time 3 min .The results also showed that the UV rays with wave length of 312 nm has more effect on the biological parametes of the grain moth from the wave length of 365 nm for this pest. The effect of the wave length 312 nm on the different mating ofthe adults emerged from irradiated eggs at 48 hr old were conducted .The results showed that 2 min exposure caused complet sterility to males while 1.5 min caused complet sterility to femaleAlso the study showed that sex ratio was divated for males upen the emergence of femal in same case of the adulte mating. Resulte from irradiated egg at 312 . The appereance of male after mating ( normal female * irradiated male ) ( irradiated female * normal male ) ( irradiated male & female) were ( 100.0 , 80.0 , 72.5 ) respectively at radiation time ( 1.5 mn ) from the other hand . There were clear decrease in femal population as compared with the abov ratio after tadiate the same time and wave length femal were ratio ( 27.5 , 20.0 , 00.0 % ) respectively .

تعدد الاشكال الوراثية لبعض انظمة مجاميع الدم في مرضى ابيضاض الدم النيقياني == Genetic Polymorphism of Some Blood Group Systems in Myelogenous Leukemic Patients

Author name: رشا حسن صدام السوداني
Supervisor name: نصر فرحان عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Assay has been made for ABO, Rh, Lewis, MNS and Duffy blood groups in a sample consisted of 80 affected individuals with chronic myelogenous leukemia (CML) and other sample consisted of 65 individuals affected with acute myelogenous leukemia (AML). Comparison have been made between each of the Leukemia sample with the control samples which consisted of 100 Healthy individuals.The results of the various comparisons were as follows : 1 - There is insignificant difference in frequency of ABO blood group in chronic and acute leukemia as compared with the control sample.2 - There are significant differences for Rh system patterns due to diminish of CcDee and ccDEe phenotypic patterns in both chronic and acute myelogenous leukemia, Moreover, there is an increase in CCDee pattern in CML and also an increase in CcDEe pattern in AML.3 - There are significant differences (P <0.001) for Lewis group blood in CML as compared with the control samples, also there is significant difference (P <0.05) in AML due to decrease in Le (a - b +) phenotype which resistant to the disease, and an increase in Le (a - b - ) phenotype.4 - There are significant differences (P <0.001) for MN blood group in both types of the disease (CML and AML), due to an increase in M + N + phenotype and decrease in M + N - phenotype. Also there is significant difference for Ss blood group in (AML), because of the increase in S + s + phenotype and decrease in S - s+ phenotype.5 - There is significant difference for Duffy group blood in CML, since the Fy (a + b - ) phenotype was decreased and the Fy (a - b +) was increased. But there is no significant difference in (AML).6 - There is no existence of disturbance or deviation in Hardy - Weinberg equilibrium for ABO, Rh and Lewis.7 - There is disturbance in Hardy - Weinberg equilibrium apparently existing for the MN blood group in both types of Leukemia as compared with the control sample . There is an increase in frequency of (N) allele in the patients and a decrease in frequency of (M) allele. There is also deviation (P <0.001) for Ss blood group in AML since allele S was increased ,but allele s was decreased in the patients as compared with the control sample .Moreover , there is deviation from this equilibrium for Duffy group blood in the overall Leukemia sample. The higher frequency of Fy ͣ allele was found in AML, while the higher frequency of Fyb and Fy alleles were found in CML . Such deviations from Hardy - Weinberg equilibrium in hematological malignancies and not deviated in the control sample may give attention about the etiology of the disease concerned.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca والسذاب Ruta chalepensis على الفطريات المعزولة من فروة الراس Tinea capitis

Author name: زينب حكمت عبود الاسدي
Supervisor name: مناهل نجيب بحو | جاسم محمد كرحوت
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 71 نموذج (قشور وشعر) ماخوذ من منطقة الراس من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الكندي التعليمي الذين شخصوا كحالات اصابة سريرية بسعفة الراس في المدة ما بين تشرين الاول 2006 ولغاية ايلول . 2007 فحصت النماذج مختبريا بوساطة الفحص المجهري المباشر باستخدام هيدروكسيد البوتاسيوم (% 10) KOH وصبغة اللاكتوفينول الزرقاء وكذلك بوساطة الزرع على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ ظهر في الفحص المجهري المباشر والزرع نتائج ايجابية في 66 حالة (% 92.95) بينما تم تشخيص 55 عزلة فطرية . عند التعرف على انواع الفطر كان الفطر Trichophyton mentagrophytes هو الغالب (% 36. 61) ، يليه الفطر Trichophyton verrucosum (% 18.30) ، وجاء الفطر Trichophyton rubrum بالمرتبة الثالثة (% 14.08) ، ثم الفطر Trichophyton violaceum (% 5.63) ، والفطر Trichophyton soudanense (% 2.81) .سجلت اعلى نسبة اصابة لدى الذكور قياسا بالاناث اذ بلغ عدد الذكور 37 (% 52.2) بينما عدد الاناث (34) (% 47.8) ، اما بخصوص اعمار المصابين فتراوحت اعمارهم ما بين (14 - 2) سنة ، وتبين عدم وجود فروق معنوية بين نسبة الاصابة واعمار المصابين ، اذ كان المرض اكثر تكرارا لدى المصابين الذين تراوحت اعمارهم (10 - 6) سنة (% 52.1) بينما كان المرض اقل تكرارا لدى المصابين الذين كانت اعمارهم (15) سنة فما فوق (% 2.8). تبين ان الاصابة كانت اكثر انتشارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه الاصابة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة في شهر نيسان بنسبة (% 22.5) ، وادنى نسبة اصابة في شهري اب وايلول (% 1.4) ، اما عن علاقة الاصابة بمناطق سكن المصابين فتبين ان اعلى نسبة اصابة سجلت لدى المصابين من المناطق الريفية (% 81.7) مقارنة بسكان المناطق الحضرية (% 18.3). كان النوع الملتهب هو الغالب بنسبة (60.6%) على النوع المتقشر بنسبة (39.4%) بالنسبة للانواع السريرية لسعفة الراس ، وفيما يخص مصادر الاصابة بسعفة الراس فوجد ان تربية الحيوانات المنزلية او الحقلية هي الغالبة بنسبة (% 56.36) ، يليه وجود اصابات فطرية لدى افراد العائلة بنسبة (% 30.90) ثم استخدام ادوات الاخرين بنسبة (% 12.7). حضرت مستخلصات اوراق نباتي السذاب Ruta chalepensis واليوكالبتوس Eucalyptus camaldulensis باستخدام الماء والكحول الحار والبارد ، كما درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقار الكرزيوفولفين في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية المعزولة من اصابات سعفة الراس والاكثر تكرارا خلال هذه الدراسة والتي شملت الفطر Trichophyton mentagrophytes وTrichophyton verrucosum وTrichophyton rubrum. اظهرت النتائج ان التاثير التثبيطي للمستخلصات المدروسة اعتمد على نوع المستخلص وتركيزه ونوع الفطر المختبر ، اذ اظهر المستخص المائي البارد لاوراق السذاب والمستخلص المائي البارد لاوراق اليوكالبتوس اعلى فعالية تثبيطية لنمو الفطريات المدروسة، وان هذا التاثير يزداد بزيادة تركيز المستخلص ومن جهة اخرى اظــهر الفطـــــر Trichophyton verrucosum اعلى حساسية للمستخلصات المختبرة مقارنة ببقية الفطريات المدروسة.واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلص المائي البارد لاوراق نبات السذاب Ruta chalepensis والمستخلص المائي البارد لاوراق نبات اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In Vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر Trichophyton mentargophytes var mentagrophytes في الارانب. | Seventy one specimens (scale and hairs) have been taken from scalp region were collected from out patient visiting the Dermatology Unit of Baghdad Taching Hospital , and Al - Kindy Teaching Hospitals , which diagnoised as Tinea capitis infection during the period extended from November 2006 through September 2007. On direct microscopical examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty five fungal isolates. The most common fungi isolated were Trichophyton mentagrophytes (36.6 %) followed by Trichophyton verrucosum (18.3 %) Trichophyton rubrum (14.08 %) Trichophyton violaceum (5.63 %) Trichophyton soudanense (2.81 %). There was recorded among male (52.2%) than female (47.8%) , also there was no significant different recorded among patient with (6 - 10) years age groups followed by (14) years age group. Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (22.5 % ) while the lowest rate was in Augest and September (1.4%). High rate was recorded in rural region (81.7 %) in comparison with urban regions (18.3 %). The inflamed (kerion) type (60 - 6%) was most poplur than the scaly type (39.4%) concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (56.36%) followed by infection of the family members (30.9%) and using others instrumeuts (12.7%). Leaves extract of Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and griseofulvin were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca cold water extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Trichophyton verrucosum was the highest sensitive cpmpared to the other tested fungi. According to these results the cold water extracts of Ruta chalepensis and eucalyptus microtheca have been diagnosed to examine their effectiveness (Invivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes var. mentagrophytes infection in rabbets.

بيئة وتنوع مجتمع اللافقريات القاعية في الجزء الاوسط من نهر الفرات/ العراق

Author name: زهراء حسين عبيد
Supervisor name: هيفاء جواد جوير | جاسم محمد سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية بشكل اساسي تنوع مجتمع اللافقريات القاعية في الجزء الاوسط من نهر الفرات ، اذ اختيرت ثلاثة مواقع على النهر لجمع العينات الشهرية ,وللمدة من تشرين الاول 2013الى حزيران 2014 . يقع الموقع الاول م1 عند مدينة المسيب ,والثاني م2 في مدينة سدة الهندية , والموقع الثالث م3 عند مدينة طوريج. تضمنت الدراسة ايضا اجراء بعض القياسات الفيزياوية والكيمياوية لمواقع الدراسة.اوضحت نتائج الدراسة للعوامل الفيزياوية والكيمياوية بان هنالك توافقا واضحا بين درجة حرارة الهواء ودرجة حرارة الماء في المواقع المدروسة ,اذ تراوحت بين (35 - 13) م و(29 - 10) م على التوالي وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني المسجلة ما بين (7 - 8.5 ) وقيم الملوحة في مدة الدراسة بين (‰1.04 - 0.66) لذلك عدت المياه قليلة الملوحة (Oligohaline), واظهر تركيز المواد الصلبة الذائبة الكلية TDS قيما تقع ضمن المدى الطبيعي اذ تراوحت بين (813 - 521) ملغم /لتر، بينما تراوحت قيم تركيز المواد الصلبة العالقة TSS مابين (1.60 - 0.11) ملغم/لتر. وتراوحت قيم تركيز الاوكسجين الذائب بين (11.50 - 7.60) ملغم/لتر بينما سجلت نتائج المتطلب الحيوي للاوكسجينBOD5 قيما تراوحت بين (3.80 - 1.50) ملغم/لتر وكانت هذه القيم ضمن المحددات العالمية المسموحة بها في المواقع جميعا . وعلى وفق قيم القاعدية الكلية (220 - 115) ملغم / CaCo3لتر عدت مياه النهر قاعدية خفيفة بينما عدت عسرة جدا على وفق القيم العالية للعسرة الكلية (768 - 324) ملغمCaCO3 /لتر. اما قيم الكالسيوم والمغنسيوم فتراوحت (130 - 58) ملغم CaCO3/لترو(93 - 38) ملغمCaCO3 /لتر على التوالي. عزل (13530) فردا من اللافقريات القاعية ووجد انها تعود الى 33 مجموعة تصنيفية مختلفة وشملت على 69.10% من النواعم و18.24% من الديدان الحلقية قليلة الاهلاب و7.95% قشريات و3.06 % حشرات مائية و1.46 % ديدان خيطية بينما سجل لكل من الديدان المسطحة والعلق نسبة 0.19 % من المجموع الكلي للافراد المعزولة . اذ نلحظ تباين واضح في العدد الكلي للافراد المعزولة بين المواقع الثلاثة ، فقد سجلت اعلى الاعداد في الموقع م2 5333)) فرد, بينما سجلت اقل الاعداد في موقع م1 3953)) فرد. سجل نوعين من الديدان المسطحة (صنف المعكرات) النوع .Castrella sp والنوع .Macrostomum sp وعد الجنسان تسجيل جديد في نهر الفرات ,وذلك في الاشهر من شباط وحتى مايس واعلى عدد منها عزل من الموقع م1 . اما فيما يخص الديدان الخيطية ، فقد سجل نوع واحد منها يعود الى الجنس Seinura sp. في الاشهر من تشرين الاول وحتى شباط 2014, وعزل من المواقع جميعها.سجل 12 نوع من الديدان قليلة الاهلاب بسيادة الانواعLimnodrilus hoffmeisteri وBranchiura sowerbyi وEiseniella tetrahedra ، فضلا عن الانواع Stylaria lacustris وSlavina appendiculata وL. profundicola وL. claparedeanus وL. udekemianus وTubifex tubifex، عد النوعان Pristinella jenkinae , Spirosperma ferox تسجيل جديد في نهر الفرات بينما عد النوع Bothrioneurun pyrrhum تسجيل جديد في العراق .سجل اعلى مجموع من قليلة الاهلاب في الموقع م3 .سجلت في هذه الدراسة مجاميع من القشريات ضمت مزدوجة القدم Amphipoda ومجذافية القدم من العائلة Cyclopoidae فضلا عن النوعMacrobrachium nipponense رتبة عشرية القدم Decapoda , والنوع Sphaeroma annadalei anndalei العائد لمتشابه القدم Isopoda. سجلت القشريات بمجموعها اعلى كثافة نسبية في الموقع (م1) .سجلت خمسة انواع من القواقع تضمنت النوع Viviparus bengalensis والنوع Melanoides tuberculata والنوع Melanopsis nodosa والنوع Melanopsis costata واخيرا النوع وMelanopsis subtingitana ، فضلا عن خمسة انواع من ثنائية المصراع Bivalvia بنسب متفاوتة كان اعلاها النوع Dreissena polymorpha الذي شكل %84 من مجموع ثنائية المصراع المعزولة، بينما شكلت الانواع الاخرى جميعها 16% وشملت الانواع Corbicula fluminalis, والنوع Corbicula fluminea , والنوع Unio tigridis , والنوع Pseudodontops euphraticus . وعد الروبيانM. nipponense , والمحار المخططD. polymorpha كانواع دخيلة الى المنطقة.تضمنت الدراسة قياس معدل رسوخ يرقات المحار المخطط . polymorpha D ، وذلك باستخدام بلاطات اسمنتيه علقت على اعماق مختلفة في النهر ، واوضحت الدراسة ان اعلى معدل للرسوخ سجل في شهر حزيران وان العمق 6 متر هو افضل عمق للرسوخ. عن طريق جمع افراد المحار المخطط من ركائز مختلفة , كاحواض الترسيب في محطة تصفية مياه الشرب في قضاء المسيب , ومرشحات المحطة الكهرومائية لتوليد الطاقة الكهربائية في سدة الهندية والصخور والنبات المتوافرة على حافة النهر, وجد ان الصخور افضل الركائز لالتصاق المحار المخطط. وشملت الدراسة ايضا علاقات الارتباط بين العوامل الفيزيائية والكيميائية للمياه , وبين مجاميع اللافقريات القاعية في النهر باستخدام نظام التحليل الاحصائي التوافقيCanonical Correspondence Analysis (CCA). تضمن البحث دراسة كل من الكثافة الكلية , ومؤشر الوفرة النسبية (Ra - index) للافقريات القاع ، كما استخدم مؤشر الثباتية (S - index) لتحديد مدى ثبوت الوحدات التصنيفية في بيئة نهرية واستخدمت مؤشر شانون وينر للتنوع ( H - index) ومؤشر غزارة الانواع (D* - index) وتجانس ظهور الانواع(E - index) لتحديد قيم التنوع الاحيائي للافقريات المائية المشمولة في هذه الدراسة. كما استخدم مؤشر جكارد للتشابه (Similarity - index) لتوضيح درجة التشابه ما بين مواقع الدراسة في التكوين النوعي للافقريات المدروسة. وتراوحت الانواع المسجلة بين انواع سائدة وفيرة وقليلة ونادرة حسب دليل الوفرة النسبية , كما تبين من خلال ادلة التنوع ان اعلى القيم التنوع الاحيائي سجلت في الموقع (م1) واقل القيم في الموقع (م2) واما اعلى مستوى الاشهر فقد سجلت اعلى قيمة خلال تشرين الثاني 2013 واقل قيمة خلال كانون الثاني 2014, وكانت اغلب الانواع المسجلة انواع ثابتة حسب دليل الثباتية , واظهر دليل معامل جكارد للتشابه ان اعلى نسبة للتشابه سجلت بين الموقع (م1) والموقع (م3) واقل نسبة تشابه بين الموقع (م(2 والموقع (م (3. | The present study is basically concerned with benthic invertebrates diversity in the middle sector of River Euphrates, on which three sites were chosen to collect monthly samples and for a period from Oct. 2013 to June 2014. The first location is located in Al - Mussayab city (S1) , the second one in Saddat Al - Hindyia city ( S2) , while the third location is located in Twereej city (S3) . The study also includes the chemical and physical analysis for the water in the study sites.The results of physical and chemical factors, was almost the same between air temperature and water temperature in the locations, as it ranged between (13 - 35 C0), and (10 - 29C0) respectively , pH values were ranged between (8.5 - 7). According to the values of Salinity whichranged during the study period between (1.04 - 0.66 ‰) ,the water of the river classified as oligohaline. Total Dissolved Solids TDS were ranged between (521 - 813) mg/L, which considered as normal range, while the TSS values were ranged between (0.11 - 1.60 mg/L). Dissolved oxygen values was ranged between (7.60 - 11.50) mg / L, while biological oxygen demand BOD5 recorded values between (3.80 - 1.50 mg / L), All these values mentioned above are accepted by world limitations. According to the values of total alkalinity (115 - 220) Mg CaCo3/l , the river water classified as slight alkaline and classified as very hard according to the total hardness values (324 - 768) mg CaCo3 /l. While the concentrations of calcium and magnesium were (58 - 130), (38 - 93) mg CaCO3/L respectively.Atotal of 13530 individuals of benthic invertebrates were sorted, represented 33different taxonomic group including 69.10% mollusca, 18% aquatic oligochaetes, 7.95% crustacean, 3.06% aquatic insects, 1.46% nematodes ,while each of leech and platyhelminthes was recorded 0.19% of the total invertebrates sorted. It was noted that there was obvious difference in the total number of sorted individuals in the different study sites, so that the highest total number was recorded in site S2 ( 5333) , while the lowest number in the site S1( 3953)From Turbellarian platyhelminthes , the Castrella sp. and Macrostomum sp. were recorded, and the two genera were considered as new records to the River Euphrates ,sorted during the period from Feb. - March, and the highest number sorted from S1. Related to Nematoda, only one species of genus Seinura was recorded during from Oct.2013 to feb. 2014 and it was sorted from all sites.Twelve species of Oligochaetes were recorded , from which Limnodrilus hoffmeisteri, Branchiura sowerbyi, and Eiseniella tetrahedral were the most abundant species. In addition to Stylaria lacustris, Slavina appendiculata, Pristinella jenkinae L. profundicola, L. claparedeianus, L.udekemianus , T.tubifex, Spirosperma ferox, and Bothrioneurum pyrrhum. P. jenkinae and S. ferox were considered as new records for River Euphrates , while B. pyrrhum is considered as new record to Iraq. Oligochaetes worms were recorded in all sites with a highest number recorded in S3.This study also recorded some groups of crustacea includes Amphipoda and Copepod of family Cyclopoidae , in addition to Macrobrachium nipponense from Decapoda, and phaeroma annadalei anndalei from Isopoda. Crustacea was recorded highest total density in S1. Five species of gastropoda were recorded incuding Viviparus bengalensis, Melanoides tuberculata, Melanopsis nodosa , Melanopsis costata , and finelly Melanopsis subtingitana, In addition to five species of Bivalvia, with Dreissena polymorpha as the most adundent species and form a 84% of the total number of bivalves, while all other species form only 16% , and they include, Corbicula fluminalis, Corbicula fluminea , Unio tigridis and Pseudodontops euphraticu. Dreissena polymorpha & Macrobrachium nipponense, were recorded as exotic benthic species to the area. The rate of Zebra mussels D.polymorpha larval settlement was also studied, using artificial sediment as concrete tiles hinging in a different depths . The result shows that the highest settlement rate was recorded in June, and the depth of 6m was the best depth for larval settlment. By collection of zebra mussels from different pillars, including, the sedimentation pond of water purification plant in Al - Mussayab , some screen filters in the Hydroelectric power plants in saddat - Al - Hindyia , in addition to the rocks and plants on the riverside . It was noticed that the rocks was found as the best pillars to mussles settlement. The study included the study of correlations between the physical and chemical factors of water and between groups of benthic invertebrates in the river system using statistical analysis, consensual Canoncial correspondence AnaLysis (CCA).The study also studied each of the total density and, relative abundance index (Ra) and used constancy index (S - index). Shanon - Weiner diversity ( H - index), Species richness index (D - index), Species uniformity index(E - index) to determine the values of biodiversity of aquatic invertebrates and also Jaccard index used for similarity (Similarity - index) to clarify the degree of similarity between the locations in this research. The species that recorded in this study were ranged between dominant ,abaundant, rare species and less abundant species according to relative abundance index. It is clear from the diversity indices that the highest values of biodiversity were recorded at the station (1) and lowest values in the station (2), while between months the highest value of biodiversity was recorded during November 2013, and the lowest values were recorded during January 2014, and according to constancy index, the most species recorded during the period of study were constant species . According to similarity index, site (1) and site (3) found to be very similar.

علاقة بعض المعايير الكيموحيوية في مصول مرضى الفشل الكلوي بعوامل الامراضية في عزلات لبكتريا Enterobacter وProvidencia == Study of some biomarkers in patients with kidney failure and it’s relation with virulence factors in Enterobacter and Providencia

Author name: رشا حاتم شايع العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 182 عينة من ادرار ودم المرضى المصابين بالفشل الكلوي والراقدين في ردهات الكلية الصناعية لمستشفى بعقوبة التعليمي ومستشفى مدينة الطب والبالغ عددهم 130 مريضا لمختلف الاعمار ومن كلا الجنسين للمدة من 5/11/2012 - 13/1/2013 . زرعت العينات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . اذ اظهرت النتائج ايجابية 74 عينة 40.7% للنمو البكتيري والذي تضمن 40 عينة دم 54.05% و34 عينة ادرار 45.95% . فيما كانت 108 عينة سالبة للنمو 59.3%.• تم تشخيص 17عزلة تعود لبكتريا (Enterobacter cloacae) وعزلتان تعودان لبكتريا (Providencia rettgeri) من المرضى المصابين بالفشل الكلوي، وبنسبة 9.34% و1.09%على التوالي ، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع للفشل الكلوي هو بكتريا Escherechia coli وبنسبة24.3%، اضافة الى بكتيريتي Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis بنفس النسبة 4.1%، ثم بكتريا Pseudomonas aeruginosa 1.4%7.• عند التحري عن عوامل الامراضية لبكتريا P.rettgeriو E.cloacaeوالمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت جميع العزلات والتي تعود لكلا الجنسين امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثالث فيما لم تملكا عامل الاستعمار الثاني. كما اظهرت عزلات E.cloacae وP.rettgeri قدرتهما على التلازن مع مجاميع الدم للانسان بنسب متفاوتة .• اظهرت عزلة واحدة فقط تعود لكلا من E.cloacae وP.rettgeri قابليتها على انتاج الانزيم المحلل للبروتين الخارج خلوي(extracellular protease) في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين كما اظهرت جميع العزلات من كلا الجنسين قابليتها على انتاج السايدروفورات وقدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة قدرة عزلتا بكتريا P.rettgeri على انتاج انزيم اليورييز في حين لم تظهر عزلات بكتريا E.cloacae قدرتها على انتاج انزيم اليورييز.• كذلك اظهرت 12عزلة من مجموع 17من عزلات بكتريا E.cloacae وعزلتا P.rettgeri قدرتها على انتاج البكتريوسين ، وتم قياس فعالية البكتريوسين وتحديد الفعالية النوعية له لكلا من نوعي البكتريا . وبلغت فعاليته وفعاليته النوعية لبكترياE.cloacae 22.8 وحدة / مل و0.542 وحدة / مكغم وعلى التوالي ولبكتريا P.rettgeri 23وحدة / مل و0.286 وحدة / مكغم ، وعلى التوالي . من ذلك لوحظ زيادة تركيز البروتين في البكتريوسين المنتج من قبل P.rettgeri 80.4 مكغم/مل مقارنة بتركيزة في E.cloacae 42مكغم /مل ومنه زيادة فعاليتة في P.rettgeri عن E.cloacae.• اظهرت النتائج قدرة 15عزلة من E.cloacae 88.2% وعزلتا P.rettgeri 100%على انتاج انزيم β - lactamase ، كما اظهرت جميع العزلات ولكلا نوعي البكتريا القدرة على تكوين الغشاء الحيوي (Biofilm) .• اظهرت جميع عزلات E.cloacaeمقاومة تامة لمضاد amoxicillin/ clavulanic acid 100%. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية ceftriaxone cefoxitine ،82.4 ceftazidime % ثم تليها مضادات cefotaxime ، trimethoprim 70.6% ثم تليها piperacillin،nalidixic acid ،aztreonam ، )azithromycin58.8,53,53,53)% على التوالي ، ثم يليها مضاد gentamycin 41.2 % ثم تليها باقل مقاومة مضاداتneomicin ،nitrofurantoin، ciprofloxacin (29.4, 29.4(23.5, % على التوالي .اما بكتريا P.rettgeri فقد اظهرت مقاومة تامة لكل من مضادات ceftriaxone ،cefoxitine ، ceftazidime ، amoxicillin /clavulanicacid ، gentamicin ،neomicin ، trimethoprim، Azithromycin بنسبة 100% ، في حين كانت المقاومة اقل لكل من مضادات nitrofurantoin، cefotaxime50%.• اظهرت النتائج ان الفئات العمرية الاكثر اصابة بالفشل الكلوي كانت ضمن الفئة العمرية (61 - 70) سنة . فيما تبين ان المرض يصيب الذكور والاناث ، مع ارتفاع نسبة اصابة الذكور 56.2% على الاناث 43.8% . كما اظهرت معايير مصول المرضى ارتفاع مستويات اليوريا والكرياتنين في مصل الدم ليبلغ معدل (11.6 - 50)ملي مول/لتر و(45 - 1000) مايكرومول/لتر وعلى التوالي .• تم الكشف عن وجود علاقة بين الانزيم المؤكسد لحامض اللاكتيك LDH)) ومرض الفشل الكلوي وكذلك علاقتة الانزيم بعوامل الامراضية لبكتريا E.cloacae وP.rettgeri،حيث وجد في هذه الدراسة ان انزيم LDH)) يكون مرتفع عن القيمة الطبيعية في حالة مرض الفشل الكلوي (قبل الديلزة الدموية) مقارنة بالاشخاص الطبيعين .حيث بلغ مستوى الانزيم عند وجود بكتريا E.cloacae 213.50 وحدة / لتر وبكتريا P.rettgeri 214.52وحدة / لتر . ومقارنة بالاشخاص الطبيعيين 153.63 وحدة /لتر | One hundred eighty two urine samples were isolated from patients who were resident of the industrial kidney unit of Baquba Teaching Hospital and Medical City Hospital suffering from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 5/11/2012 - 31/1/2013. The samples were cultured in a suitable culture media for isolation the bacteria. The results showed that 74 samples (40.7%) were positive for bacterial growth, It included 40 blood samples (54.05%) and 34 urine samples (45.95%).While the rest samples (i.e. 108) were negative for bacterial growth (59.3%). • The results also showed that 17 isolates have been diagnosed as E .cloacae and two have been diagnosed as P.rettgeri with a percentage of 9.34% and 1.09% respectively. Other genus were also isolated, The results showed that common cause is bacteria Escherechia coli with a percentage of 24.3% , Klebsiella pneumonia , Proteus spp. with a percentage of 4.1% and Pseudomonas aeruginosa 1.4%. • P.rettgeri and E.cloacae showed a possession of the first and third colonization factors with a percentage of 100% and both genera showed the ability to agglutinate human blood group with a variable proportions. • One isolate only of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce of extracellular protease while none of the isolates had the ability to produce hemolysin, and all of the isolates showed the ability to produce sydrophorat and capsule formation. • The results of this study showed that the genus P.rettgeri has the ability to produce the enzyme urease while the genus E.cloacae hasn’t had the ability to produce urease. • 12 out of 17 isolate of E.cloacae and the two isolate of P.rettgeri ability to produce bacteriocin. the activity of bacteriocin was measured and the qualitative activity was measured for both the two species,its activity and qualitative activity for E.cloacae were 22.8 unit/ml and 0.542 unit /µgm respectively and for P rettgeri 23 unit/ml and 0.286 unit /µgm respectively .From that we can notice that the increase in protein concentration produced by P.rettgeri 80.4 µgm/ml compared with the concentration in E. cloacae 42 µgm/ml and therefore increasing its efficiency in P.rettgeri compared with cloacae. • The results showed that 15 isolates of E.cloacae 88.2% and the two isolates of P.rettgeri 100% have the ability to produce the enzyme β - lactamase; all the isolates of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce biofilm. • All E.cloacae isolates revealed a resistance to the antibiotic amoxicillin/ clavulanic acid with a percentage of 100%, ceftriaxone cefoxitine and ceftazidime 82.4, cefotaxime and trimethoprim 70.6, and piperacillin, nalidixic acid aztreonam and azithromycin with a percentage of (58.8,53,53,53)% respectively Followed by the antibiotic gentamycin 41.2 Followed by the least resistance to neomicin, nitrofurantoin and ciprofloxacin (29.4,29.4 and 23.5)% respectively.The genus P.rettgeri showed resistance against the antibiotics ceftriaxone, cefoxitine, ceftazidime, amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, neomicin, trimethoprim and azithromycin 100% while this genus showed less resistance against nitrofurantoin and cefotaxime 50%. • The results showed that the most age group infected with kidney failure is between (61 - 70) years. The disease affects women and men alike with a higher proportion of males infection 56.2% over females 43.8%. Patients sera standards showed high levels of urea and creatinine levels in blood serum to rate (11.6 - 50)m mol/L,(45 - 1000)M mol/L respectively. • It was revealed the existence of a relationship between lactic acid oxidative enzyme and kidney failure disease also the relation between the enzyme and virulence factors of P.rettgeri and E.cloacae , It was found in this study that the enzyme (LDH) have higher values in the case of natural situation of kidney failure patient (before dialyziz) compared with normal peoples where the level of the enzyme in the presence of E.cloacae (213.5)unit/L and (214.52) unit/L compared with normal peoples (153.63). • A study of the impact and effectiveness of the enzyme lysozyme in the analysis of the cell wall of the bacteria E.cloacae and P.rettgeri was done, the results showed that the highest effectiveness of the bacterial enzyme reached (0.388 and0.329) unit/L at concentrations (100,200) mg/ml respectively. The enzyme inhibited the growth of both types of bacteria to reach the highest areas of growth inhibition of both E.cloacae and P.rettgeri (25,20) mm at concentrations of the enzyme (100, 200) mg/ml respectively. The statistical analysis showed significant differences at the level (p>0.05).

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

Author name: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
Supervisor name: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

Author name: زاكروس كمال احمد البرزنجي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو بعض البكتريا المعزولة من اخماج الحروق == The Effect of Watery & Alcoholic Plant Extracts of Citrullus colocynthis & Solanum nigrum On Growth of Some Bacteria Isolated from burn Infections

Author name: زيد شاكر ناجي محمود الربيعي
Supervisor name: ياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لثمار نباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli .تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل مستخلص ولكلا النباتين , اذ تبين نتائج الكشوفات الكيميائية لمستخلص الحنظل ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات . وان هذه المركبات لها القابلية على الذوبان في الماء , اما المستخلص الكحولي لثمار الحنظل فيحتوي ( بالاضافة الى ما ذكر ) على مركبات راتنجية وكومارينات وزيوت طيارة , وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية.و بالنسبة الى مستخلصات ثمار عنب الذيب فقد اظهرت نتائج الكشوفات الكيميائية ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , فينولات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات , واما المستخلص الكحولي فانه يحتوي على المركبات الفعالة نفسها الموجودة في المستخلص المائي بالاضافة الى الراتنجات .لدراسة تاثير المستخلصات النباتية لثمار نبات الحنظل وثمار نبات عنب الذيب في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق , تم تحضير نوعين من المستخلصات ولكلا النباتين وهما : المستخلصات المائية والمستخلصات الكحولية .بالنسبة الى مستخلصات نبات الحنظل كان المستخلص المائي اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 480 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الكحولي وللتركيز نفسه ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11 ) ملم وعلى التوالي.اما بالنسبة الى مستخلصات نبات عنب الذيب كان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي على الانواع البكتيرية بتركيز ( 480 ملغم/ مل ) وبمعدلات اقطار تثبيط ( 16.33 , 20.66 , 18 , 16.33 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , وبمعدلات تثبيط ( 16.33 , 20 , 15.33 , 15.33 ) ملم على التوالي عند التركيز نفسه .كانت البكتريا St. aureus ( الموجبة لصبغة كرام ) اكثر الانواع البكتيرية تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا Klebsilla spp. اكثر الانواع البكتيرية مقاومة لفعل المستخلصات النباتية .وبما ان المستخلص المائي هو اكفا من المستخلص الكحولي لنبات الحنظل, وان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , فقد تم المزج بين المستخلصين بنسبة 1 : 1 ودرس تاثير المزيج على البكتريا قيد الدراسة , وقد تبين ان خلط المستخلصين معا لم يعط اي تاثير ضد البكتريا . | This study was done to determine the effect of watery and alcoholic extracts of two plants : Fruits of Citrullus colocynthis and Berries of Solanum nigrum on growth of bacteria isolated from infected burns which are : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli .Evaluation of active ingredients found in each extract for both plants determined.The biochemical analysis revealed that watery extract of Citrullus colocynthis contains : Alkaloids, Glycosides, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones , while the alcoholic extract contains : (in addition to the above mentioned compounds ) Coumarines, Resins and Volatile oils.The biochemical analysis of the watery extract of Solanum nigrum showed that it contains : Alkaloids, Glycosides, Phenols, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones, while the alcoholic extract contains the same active materials in addition to Resins.The effect of watery extract of Citrullus colocynthis on the bacterial growth revealed that at a concentration of 480 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) mm for Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli respectively , when compared with alcoholic extract which were ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11) mm respectively.The study also showed that staphylococcus aureus ( gram positive ) bacteria is most sensitive to plant extract's than the gram negative bacteria , while Klebsilla spp. were most resistant to plant extracts than the others.Because water extracts of Citrullus colocynthis were more effective than the alcoholic extracts , while alcoholic extracts of Solanum nigrum were more effective than watery extracts.A mixture of both extracts was prepared in a proportion of 1 : 1 wt : wt and used to test it's effect on the studied bacteria. No effect have been detected therefore it's useless to use the above mentioned mixture in treatment.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية == Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

Author name: رؤى عبد السادة جبار
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

مسح لمسببات التلوث البكتيري في وحدة الكلية الصناعية وحساسيتها للمضادات الحيوية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Survey of Bacterial contamination in Dialysis Unit and antibiotics susceptibility in some hospitals in Baghdad

Author name: زياد طارق نعمان شهاب
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـم في هذه الدراسة جمع (204) عينة من مستشفيات مدينة بغداد ، وهي كـل مـن ( مستشفى بغداد التعليمــي/ وحدة الكلية الصناعية. ومستشـفى الكرامة التعليمـي / وحدة الكلية الصـناعية ) ، للفـترة مـن كانون الاول 2009 لغاية منتصف اذار 2010 .شملت العينات مسحات من بيئة وحدة الكلية الصناعية التي تضمنت 12 موقـعا وهي كـل من ( الاسرة والمفروشات والارضـية والجـدران والسـطح الخارجي لجـهاز الديـلـزة وجلد المرضى الراقـدين والادوات الطـبية ذات الاسـتخدام الــيدوي وملابـس الكادر الطـبـي وانابيـب دخول وخـروج الماء داخـل جـهاز الديـلزة وفتحات جـهاز الـتبريد والــتدفئـة وادوات الطـعام والاثاث الخشبي والمغاسـل فضلا عن عـينات من هـواء الصالـة وتم الحصول على النتائج الاتية : 1 - كان عدد المسحات والعينات الموجبة (95) عينة من ( 204 ) عينة وبنسبة (%46.56) واحتوت بعـض المسحات على اكثر من عزلة بكتيرية واحدة .2 - تم الحصول على (139) عزلة اجمالية من مجـموع العـينات الموجـبة كان مـنها (122) عزلة بكتيرية نقية مشخصة . شملت هذه العزلات كل من بكتريا Staphylococcus spp. وAcinetobacter spp. وPseudomonas spp. وKlebsiella spp. وCitrobacter freundii وEscherichia coli وEnterobacter spp. وAlcaligens spp. وStenotrophomonas maltophilia وBordettella spp. وOchrobacter anthropi وProteus spp. وShigella spp. وFlavomonas oryzihabitans وPasturella pneumotropica وChrysemonas lutula وBacillus spp. وNocardia spp. وEnterococcus spp. . فقد تم تشخيص هذه الـعزلات عن طريق الصـفات المظهرية والمزرعـية للمستعمرات وكـذلك عن طريـق الفحص المجهري للخلايا وباستخدام الفحوصات الكيموحياتية فضلا عن استخدام فحص API test لغرض التشخيص الدقيق للعزلات .3 - اظهرت العينات الماخوذة من هـواء الصالة والمغاسل نسبة عالية من الثلوث فقد كانت نسبة التلوث لكل منهما (%81.8) بعـدها جاءت الارضية والجـدران تلـيها الاسرة والمفروشات وبنسبة تلوث للعينات الماخوذة بلغت (%58) و(%53) على التوالي .4 - كانت بكتريا المكورات العنقودية الاكثر انتشارا في بيئة وحدة الكـلية الصناعية حيث تم الحصول على (47) عـزلة منها وبنسبة (%38.5) من اجمالي العزلات والتي كانت (122) عـزلة مشخصة . 5 - كانت بكتريا Acinetobacter spp. الاكثر انتشارا من بين العصيات السالبة لصـبغة كرام بعدد عزلات بلغ (15) عزلة من اصـل (65) عزلة سالبة لصبغة كرام وبنسـبة مئوية بلغت (%23.07) من مجموع العـزلات السالبة لصبغة كـرام ونسبة (%12.2) من مجموع العزلات الكلية، تليها كل من بكتريا Pseudomonas spp. وKlebsiella spp. وبنسب مئـوية بلغت (%10.6) و(%4.9) على التوالي من مجموع العزلات الكلية6 - تم التحري عن حساسية (70) عزلة بكتيرية مختلفة لاثني عشر مضادﴽ حيويا وهي كـل Amikacin وAmoxicillin / clavulanic acid وCiprofloxacin وCefotaxim وCefexime وChloramphenicol وGentamycin وPiperacillin وTrimethoprime وOfloxacin وVancomycin وNalidixic acid .7 - اظهرت بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية جدا تجاه المضاد الحيوي Cefexime فقد بلغت نسبة مقاومة هذا المضاد (%100) ، كما اظهرت العزلات مقاومة مرتفعة تجاه كل من المضادات الحيوية Cefotaxime وGentamycin وNalidixic acid حيث بلغت نسبة المقاومة لهذه المضادات (%60) . في حـين اظهـرت هذه العـزلات مقاومة منخفـضة تجاه كـل مـن المضادات Chloramphenicol وCiprofloxacin وOfloxacin وبنسبة مئوية بلغت (%10) لكل مضاد. 8 - اظهرت بكتريا Staphylococcus epidermidis مقاومة بنسبة (%100) للمضاد الحيوي Cefexime ، في حـين كانت نسـبة مقاومة البـكتريا للمـضاد الحـيوي Cefotaxime هـي (%58) كـما كانت نسـبة مقاومتها للمـضادات الحـيوية Nalidixic acid وTrimethoprime (%50) لكـل مـن هذه المـضادات. 9 - كانت بكتريا المكورات العنقودية جميعها حساسة بنسبة (%100) للمـضاد الحيوي Amikacin .10 - اظهرت بكتريا Pseudomonas spp. مقاومة عالية تجاه المضادين Cefotaxime وNalidixic acid وبنسبة مقاومة بلغت (%66) كما كانت نسـبة مقاومة كـل من المضادين Trimethoprim وVancomycin (%55.5) و(%44.4) على التوالـي في حين لم تظهر مقاومة للبكتريا تجاه المضاد الحيوي Amikacin وPiperacillin وOfloxacin وAmoxicillin/ Clavulanic acid .11 - كانت عزلات بكتريا Klebsiella spp. مقاومة بنسبة (%100) لكل من المضادات الحيوية Cefixime وTrimethoprim وVancomycin ، كما اظهرت البكتريا نسـبة مقاومة للمضادات الحـيوية Cefotaxime وPiperacillin وAmoxicillin/Clavulanic acid بلـغت (%66.6) ، يلـيها المضاد الحـيوي entamycin بنسبة مقاومة بلغت (%50) . وكانت بكتريا Klebsiella spp. البكتريا الوحيدة التي اظهرت نسبة مقاومة للمـضاد الحيوي Amikacin بلـغت (%16.6) .12 - تم اجراء فحص MICs لخمسة من المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وهي Amikacin وAmoxicillin / Clavulanic acid وCefotaxime وGentamycin وCiprofloxacin . على البكتريا الاكثر حساسية او الاكثر مقاومة واظهرت العزلات جميعها التي اجري لها الاختـبار نسبة MICs واطـئة تجاه المضاد الحيوي Amikacin حيث تراوحت بين (8 - 1) مايكروغرام/مليلتر حيث كانت العزلات حساسة بشكل كبير للمضاد الحيوي المذكور.13 - اظهرت العزلات قيم MICs مرتفعة للمضاد الحيوي Cefotaxime حيث تراوحت القيم ما بين (128 - 2) مايكروغـرام/ مليلتر بالنـسبة لبكـتريا S. aureus في حين تراوحت القيم مابين (512 - 8) مايكروغرام/مليلتر بالنسبة لباقي المكورات العنقودية السالبة لفحص Coagulase ، اما بالنسبة لعزلات كل من بكتريا Klebsiella spp. وAcinetobacter spp. فـقد كانت قـيم MICs لها للمضاد المذكور تتراوح مابين (512 - 2) مايكروكرام / مليلتر . في حين اظـهرت عزلات بكتريا Pseudomonas spp. قيمMICs منخفضة للمضاد نفسـه حيث تراوحت القيم بين (2.0 - 0.25) مايكروكرام / مليلتر . | In this study has collected (204) samples from the hospitals of Baghdad, these are (Baghdad teaching hospital/Dialysis unit & AL karama teaching hospital/ Dialysis unit), for the period of December 2009 to March 2010.The samples included swabs ofartificial kidney unit environment that has 12 positions these are (beds, furniture, ground, walls, external surface of dialysis, skin of asleep patients, medical instruments - use manual, clothes of medical stuff, tubes of enter and out water inside of dialysis, slots cooling and heating device, Eating utensils, wooden furniture &sinks as well as samples of hall air and it has obtained the following results : 1 - The number of swabs & positive samples was (95) sample from (204) sample in the rate of (46.56%) some of swabs contain more than one bacterial isolate.2 - It has obtained (139) total isolate from the positive samples amount (122) of that were bacterial pure diagnostic isolates all of these isolates included the following kinds of bacteria : Staphylococcus spp., Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Klebsiella spp., Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter spp., Alcaligens spp., Stenotrophomonas maltophilia, Bordettella spp., Ochrobacter anthropi, Proteus spp., Bacillus spp., Chrysemonas lutula, Pasturella pneumotropica, Nocardia spp. and Enterococcus spp. They have diagnosed these isolates by Phenotypic & farming characteristics of colonies & by Microscopic examination for cells by using bio - chemical tests as well as using API test for the purpose of accurate diagnosisfor isolates.3 - The samples taken from the hall air and sinks showed a high rate of pollution that were (81.8%) for every sample after that they were ground followed by beds, furniture, And by contamination of the samples taken at (58%) and (53%) respectively.4 - Staph bacteria were most prevalent in the environment of artificial kidney unit was obtained (47) isolate of them at (38.5%) of the total isolates, which was (122) diagnosed isolate.5 - Acinetobacter spp. were most prevalent among the negative bacilli of gram stain in the number of isolates was 15 out of 65 negative isolate of gram stain and a percentage amounted to 23.07% of the total isolate Followed by Pseudomonas spp. & Klebsiella spp. at (10.6%) & (4.9%) of the total isolates respectively.6 - It was investigated for sensitivity (70) bacterial isolates of twelve different antibiotics and are all of the : Amikacin, Amoxicillin /clavulanic acid, Ciprofloxacin, Cefotaxim, Cefexime, Chloramphenicol, Gentamycin, Piperacillin, Trimthoprime, Ofloxacin, Vancomycin and Nalidixic acid.7 - Staphylococcus aureus showed very high resistance to the antibiotic Cefaxime The ratio of this counter - resistance (100%), isolates also showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime, Gentamycin & nalidixic acid Where the percentage of resistance to these antibiotics (60%).While these isolates showed low resistance to both antibiotics Chloramphenicol, Ciprofloxacin & Ofloxacin at (10%) to both antibiotic.8 - Staphylococcus epidermidis showed resistance by (100%) to antibiotic Cefexime, while the ratio of bacteria resistance to antibiotic Cefotaxime is (58%) also it was the resistance ratio to the antibiotics Nalidixic acid & Trimethoprime (50%) to both of these antibiotics.9 - Staphylococcus bacteria were all sensitive (100%) for antibiotic Amikacin.10 - Pseudomonas spp. Showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime & Nalidixic acid by resistance reached (66%) it was also the resistance ratio of both antibiotics Trimethoprim & Vancomycin (55.5%) & (44.4%) respectively While did not show resistance to the bacteria to the antibiotic Amikacin, piperacillin, Ofloxacin & Amoxicillin/Clavulanic acid.11 - Bacteria isolates Klebsiella spp. Were resistant to every antibiotics Cefixime, Trimethoprim & Vancomycin by (100%), bacteria also showed resistant ratio for antibiotics Cefotaxime, Piperacillin & Amoxicillin/Clavulanic reached (66.6%), followed by antibiotic Gentamycin by resistant reached (50%). Klebsiella spp. Were the only bacteria that showed resistant ratio for antibiotic Amikacin reached (16.6%).12 - It has measured MICs test for five antibiotics that used in in the study these are : Amikacin & Clavulanic acid/ Cefotaxime, Amoxicillin, Gentamycin & Ciprofloxacin. on the bacteria most sensitive or most resistant and all isolates that tested showed low MICs ratio to antibiotic Amikacin where ranged between (1 - 8) microgram/milliliter where the isolates were sensitive to mentioned antibiotic geatly.13 - The isolates showed MICs values increased to antibiotic Cefotaxime where the values ranged between (2 - 128)microgram/milliliter to S. aureus while the values ranged between (8 - 512) microgram/milliliter to the remain negative Staphylococcus bacteria of Coagulase test, as for isolates of Klebsiella spp. & Acinetobacter spp. The values of their MICs for the mentioned antibiotic ranged between (2 - 512) microgram/milliliter. While the bacteria isolates Pseudomonas spp. MICs values were low for the same antibiotic where values ranged between (0.25 - 2.0)microgram/milliliter.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لاوراق نباتي العفص Thuja orientalis L. واذان الصخلة Plantago lanceolata L. على بعض البكتيريا المسببة لالتهابات جروح الجلد == Effect of alcoholic extracts for leaves of Thuja orientalis L. and Plantago lanceolata L. on bacteria causes wounds skin infection

Author name: زيد رعد عباس
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة تاثير المستخلصات النباتية لاذان الصخلة Plantago lanceolata L. والعفص . Thuja orientalis Lعلى العزلات البكتيرية المتضمنة S. aureus وPse. aeruginosa وcoli, K. spp. E. . شخصت العزلات مظهريا وزرعيا وحسب الاختبارات الكيموحيوية . ابدت معظم العزلات تحسسا لمضادات Imipenean ,Aztreonam , Gentamycin وبنسبة 100% ومقاومة لمضادي Cephalothin , Carbencillin بنسبة 100% . اظهرت الدراسة ان للمستخلص المائي البارد لنبات اذان الصخلة تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم / مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli وباقطار تثبيط 9.0 ,9.66 , 6.0 ملم وعلى التوالي , فيما ازداد تاثير المستخلص بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك بينت النتائج فروقا معنوية لتاثير المستخلص الكحولي وعند التراكيز120 , 480 ملغم/ مل ضد جميع العزلات البكتيرية . اظهرت النتائج ان للمستخلص المائي البارد لنبات العفص تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم/مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli, فيما ازداد تاثير المستخلص معنويا بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك وضحت النتائج فروقا معنوية مشابهة لتاثير المستخلص الكحولي على البكتيريا المعزولة وعند التراكيز 120 , 480 ملغم/ مل . يمكن ان يعود تاثير المستخلصات النباتية على البكتيريا المعزولة الى احتواء المستخلصات المدروسة على معظم المركبات الفعالة التي تم الكشف عنها . | The study included the effect of plant extract for Plantago lanceolata L. and Thuja orientalis L. on bacterial isolates which included : S.aureus , Ps. aeruginosa , K. spp. and E.coli. The isolated bacteria were identified a ccording to cultural , morphological and biochemical testes . The majority of isolates were sensitive to Aztreonam , Gentamycin and Imipenean 100% , but they were resistant to Cephalothin and Carbencillin 100% . The study revealed asignificant effect of Plantago lanceolata L. cold water extract at the concentration 120 mg/ ml against each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli with inhibition zone 9.0 , 9.99 , 6.0 mm respectively , whil the effect increased when the concentration increased to 480 mg / ml . Also the results showed a significant effect of alcoholic extract at the concentration 120 and 480 mg /ml aganist isolated bacteria . The result revealed a significant effect of Thuja orientalis L. cold water extract at the concentration 120 mg /ml aganist each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli , while the effect were increased significantly when the concentration increased to 480 mg /ml .Also the result showed a significant effect for alcoholic extract on the isolated bacteria at the concentration 120 , 480 mg /ml . The action of plant extract on bacterial isolates may be due to the presence of active compounds in the studies extract whic were explored .

تعدد النمط الوراثي لجين اصلاح الضرر للـ (DNA) OGG1) لعراقيين مصابين بمرض ابيضاض الدم النقياني الحاد == Genetic polymorphism of (DNA)repair gene (OGG1) in Iraqi acute Myeloid Leukemia patients

Author name: رشا عبد الكاظم طعمة
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة توزيع الانماط الوراثية للجين (Oxoguanine glycosylase - OGG1) في المجتمع العراقي وعلاقته بمرض ابيضاض الدم النقياني الحاد (Acute Myeloid Leukemia - AML) ، اذ شملت الدراسة (68) مريضا مصابين بمرض (AML) مع (60) شخصا من الاصحاء (مجموعة السيطرة) . واخذت عينات الدم من مستشفى بغداد التعليمي (شعبة امراض الدم) والجامعة المستنصرية / ( المركز الوطني لبحــوث وعلاج امراض الـــدم ) وللمدة من تشرين الثاني 2014 ولغاية شباط 2015 . كما تم تقسيم مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة الى اربع مجموعات فرعية بحسب التدخين والجنس فقد صنفت الى ذكر، انثى ، مدخن ، غير مدخن ، وقد اخذت لهم نتائج المؤشرات الخاصة بصورة تحليل الدم الكامل Complete Blood picture) ).اما الكشف عن تعدد النمط الوراثي للجين OGG1)) فقد اجري في مختبر البيولوجي الجزيئي/ كلية العلوم للبنات باستخدام تقنية تفاعل البوليميرز المتسلسل(Polymerase Chain Reaction - PCR) وكذلك استخدمت تقنية تحديد تعدد الاشكال لطول القطعة (Restriction Fragment Length Polymorphism - RFLP) واستخدام الانزيم القاطع Fun4H1)) . اظهرت نتائج الدراسة ان هناك فروقا معنوية بين المرضى والاصحاء في جميع المؤشرات السريرية، وفيما يخص علاقة هذه المؤشرات مع الفئات العمرية للمرضى فقد اظهرت المؤشرات(White blood cells Count - WBCC) و(Red blood cells Count - RBCC) و(Hemoglobin - Hb Concentration) فروقا معنوية فيما بينها في حين لم تظهر اي فروقا فيما بينها فيما يتعلق بالجنس. كما اوضحت نتائج دراسة تعدد النمط الوراثي ان هناك فروقا معنوية بين المرضى، اذ كانت النسبة 30.88, 67.65, 1.47% لكل من الانماط (GG , CG , CC) على التوالي وبفرق معنوي عالي (P<0.01) . اما في السيطرة فقد كانت 38.33 , 60.00 , 1.67% لكل من الانماط الوراثية GG , CG , CC)) وعلى التوالي وبفرق معنوي عالي (P<0.01). في حين لم تكن الفروق بين هذه الانماط وبين المرضى والاصحاء معنوية الا في النمط الوراثي ((CC اذ كانت 30.88 , 38.33% لكل من المرضى والاصحاء على التوالي. اظهرت النتائج ان توزيع تعدد النمط الوراثي في مجموعة السيطرة بحسب الجنس ان نسبة الافراد الذين يحملون النمط الوراثي الحاوي على الاليل المطفر(G) في الذكور 40.52% وفي الاناث كانت النسبة 42.86% ، اما في مجموعة المرضى كانت النسبة الاكبر في الذكور اذ بلغت 69.44% وفي الاناث 65.63% .اما توزيع الانماط الوراثية بحسب التدخين فقد اظهر ان هناك فرقا معنويا بين تعدد الانماط للمرضى اذ كان للمدخنين 1.47 , 62.07 , 34.48% وغير المدخنين 0.00, 71.79 , 28.21% لكل من CC , CG , GG)) وعلى التوالي اذ كان هناك اختلاف معنوي بين المرضى المدخنين وغير المدخنين في النمط الوراثي (CG) . اما مجموعة السيطرة فقد كانت نسبة المدخنين هي 2.94, 41.18 , 55.88% ولغير المدخنين 0.00, 42.31 ,57.69% لكل من GG), CG،CC) على التوالي. فقد اختلفت الانماط الوراثية معنويا فيما بينها ولم تكن الفروق معنوية بين المدخنين وغير المدخنين.واظهرت نتائج توزيع الانماط الوراثية بحسب الفئة العمرية بان اكثر المرضى كانوا في الفئة العمرية (30 - 50 سنة) وكان المجموع (32) مريضا. وقد بينت النتائج ان في الفئة الاقل من30 سنة كانت نسبة الانماط ) 0.00%, 76.47% , 23.53% ) ، وفي الفئة )30 - 50) كانت (3.13%, 68.75 %, 28.13%) اما في فئة الاكثر من (50) سنة فقد كانت (0.00%, 57.89% , 42.11% ) لكل من الانماط (CC , CG , GG) وعلى التوالي. اذ كانت الفروق معنوية بين الانماط في كل فئة من الفئات (P<0.01) وكذلك بين الفئات لكل من النمطين CC) وCG) فقط (P<0.01). اما توزيع الانماط الوراثية بحسب السجل العائلي اظهر ان (25) فردا من مجموع (68) لم يكن لديهم سجل عائلي للمرض و( 19) فردا من الذين لديهم اقارب من الدرجة الاولى مصابين بالمرض و(24) فردا من الذين لديهم اقارب من الدرجة الثانية، اختلفت الانماط الوراثية فيما يتعلق بدرجة القرابة وكذلك بين درجات القرابة لكل من النمطين ((CC , CG فحسب.توصلت نتائج هذه الدراسة الى ان اكثر الانماط الوراثية انتشارا في المجتمع العراقي (كاصحاء ومرضى) هو النمط الوراثي (CG) للجين ((OGG1 وان الجنس والتدخين والسجل العائلي لاتعد من عوامل الخطورة في حين من الممكن عد العمر عامل من عوامل خطورة للاصابة بـ(AML) . | This study was conducted to determine the distribution of the genetic patterns of gene Oxoguanine glycosylase also known as (OGG1) in Iraqi population and its relationship with (Acute Myeloid Leukemia - AML) disease.The study was included (68) AML patients with (60) healthy people. Blood samples were taken from the Baghdad Teaching Hospital (Department of Hematology) and from Al Mustansiriya University / (The National Center for research and treatment of blood diseases), for the period from November (2014) until February (2015). Genotyping of (OGG1) was carried out by (Polymerase Chain Reaction - PCR) - (Restriction Fragment Length Polymorphism - RFLP) using enzyme restriction (Fun4H1).The study results showed that there were significant differences between patients and healthy controls, in Blood picture parameters, As well, the relationship between Blood picture with the age groups for patients group, (Hemoglobin - Hb g/dl concentration), (Red blood cells Count - RBCC) and (White blood cells count - WBCC) have shown significant differences between Patients and Healthy, while did not show any differences among them according to Gender.The genotyping results showed that there were significant difference between all genotype polymorphism of (OGG1) in both patients and controls. It was (30.88 ، 67.65 ، 1.47%) in patients and was ( 38.33 60.00 ، ، 1.67% ) in controls for each of the (CC, CG and GG) respectively (P<0.01) .The difference between patients and controls was significant only in (CC) genotype, It was (30.88 and 38.33%) for both patients and controls respectively.The distribution of the polymorphism genotype according to Gender in the control group, shown that the number of individuals who carry the genotype containing the allele mutagenic (G), equal in the both males and females, as were (13) individual, and the patients had the largest number is in the male reaching (26), and in females (21).The distribution of genotypes in according with smoking, showed that there was a significant difference between the polymorphism of patterns for smokers patients (34.48, 62.07, 1.47%) and non - smokers (28.21, 71.79, 0 : 00%) for each of the CC, CG and GG respectively . There is only significant difference between patients smokers and non - smokers in genotype (CG).In control , the proportion of healthy smokers was (55.88, 41.18, 2.94%) and non - smokers was (57.69, 42.31, 0.00%) for each of the (CC, CG and GG), respectively. Genetic patterns varied significantly among them were not significant differences between smokers and non - smokers.Results of distribution of genotypes in accordance to the age group showed that most patients were in the age group between (30 - 50 years) and it was total (32) patients. The results showed that in the category of least 30 years the proportion of genetic patterns were (23.53, 76.47, 0.00%) and in category (30 - 50) were (28.13, 68.75, 3.13%) but in the class of more than (50) years were (42.11, 57.89, 0.00%) for each of the patterns (CC, CG, GG) respectively.There were significant differences between the patterns in each of the categories (P<0.01), as well as between the groups for each of the types (CC) and (CG) only (P<0.01).The distribution of genotypes according to the family record has showed that (25) person of the total (68) did not have a family history of the disease and (19) individuals who have first - degree relatives with the disease, and (24) individuals who have relatives from the second - degree, Genetic patterns differed among themselves in relation with the degree of kinship, as well as degrees of kinship between both types (CC, CG) only.The results of this study found that the most prevalent genetic patterns in Iraqi population (Healthy and patients) represents the genotype of (CG) the gene (OGG1) and Gender, smoking, and family record do not represent the risk factors but age could be considered a risk factor for the old injury to (AML).

تاثير السستانون وزيت السمسم على بعض الجوانب الفسلجية والنسجية المرضية في ذكور الجرذان == Effect of the sustanon and sesame oil on some physiological and histopathological aspects in male rats

Author name: رشا عبد الامير عبد اللطيف
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تقوم الدراسة الحالية الى معرفة تاثير حقن السستانون وهو من المركبات الستيرويدية البنائية وكذلك زيت السمسم على بعض الوظائف الفسيولوجية في كبد ، كلية ، خصى الجرذان والتي شملت قياس مستويات انزيمات الكبد ( SGOT , SGPT , ALP ) ، الكرياتنين , يوريا الدم والتستوستيرون والتغيرات النسجية الامراضية التي يحدثها السستانون وزيت السمسم في كل من الكبد ، الكلية ، الخصى وجلد الجرذان . تضمنت حيوانات التجربة 50 جرذا ذكرا من نوع Rattus norvegicus قسمت الى مجموعتين بالتساوي وتم تقسيم حيوانات كل مجموعة الى خمسة مجاميع فرعية ( Subgroups ) . ضمت مجاميع التجربة الاولى مجموعة السيطرة السالبة ( علفا وماء ) ، المجموعة الثانية سيطرة موجبة ( 1 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الثالثة سيطرة موجبة ( 2 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الرابعة سستانون ( 10 ملغم /كغم من وزن الجسم) ، المجموعة الخامسة سستانون ( 20 ملغم / كغم من وزن الجسم) .حقنت مجاميع حيوانات التجربة الاولى لمدة 6 اسابيع مرة واحدة اسبوعيا بالسستانون وزيت السمسم وتم سحب الدم منها ثم قتلت في نهاية الاسبوع السادس ، اما مجموعة حيوانات التجربة الثانية فقد عوملت لمدة 6 اسابيع ثم قتلت بعد اسبوعين من نهاية المعاملة بالسستانون وزيت السمسم اي في نهاية الاسبوع الثامن من التجربة . اظهرت نتائج حيوانات التجربة الاولى ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستويات انزيمات الكبد (SGOT , SGPT,ALP) في المجاميع المحقونة بالسستانون ( 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) .بينما اظهرت مجموعتي السيطرة الموجبة الثانية والثالثة ( زيت السمسم ) انخفاضا غير معنوي في مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT ) وانخفاضا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم ALP . ارتفعت مستويات الكرياتنين ويوريا الدم بصورة معنوية ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة بالسيطرة السالبة ، بينما انخفضت قيم هذه المعايير بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة (زيت السمسم ) .ارتفعت مستويات هرمون التستوستيرون معنويا ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة مقارنة مع السيطرة السالبة ومجموعتي السيطرة الموجبة بينما ارتفع مستوى التستوستيرون في مجموعتي السيطرة الموجبة بصورة غير معنوية. بينت نتائج حيوانات التجربة الثانية والمقتولة بعد اسبوعين من نهاية المعاملة ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم الكبد ( SGOT) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون ) مقارنة بالمجموعتين الثانية والثالثة . كذلك ارتفع مستوى انزيم ALP وSGPT معنويا ( P<0.05 ) في المجموعة الخامسة ( 20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة مع بقية المجاميع .انخفضت مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT,ALP) بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة والمحقونة بزيت السمسم .بينما لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الكرياتنين في كافة مجاميع حيوانات التجربة الثانية ، ازداد مستوى يوريا الدم معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 48.2±3.16 ملغم/ 100مل من الدم ) مقارنة بالمجموعة الثانية ( 42.4±0.93 ملغم/ 100مل من الدم) الا انه لم تلاحظ فروقات معنوية في بقية المجاميع . ارتفع مستوى التستوستيرون ( 5.14±0.35 نانوغرام / مل ) في المجموعة الرابعة (سستانون ) معنويا ( P<0.05) مقارنة ببقية المجاميع . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في مستوى الهرمون في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة بالمجموعة الثالثة (زيت السمسم) ( 1.65±0.48 نانوغرام / مل) .لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الهرمون في المجموعتين الثانية والثالثة مقارنة بالسيطرة السالبة . لوحظ استمرار ارتفاع مستويات انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT) معنويا ( P<0.05) في حيوانات التجربة الثانية المقتولة في نهاية الاسبوع الثامن مقارنة بتلك المقتولة بنهاية الاسبوع السادس في المجموعة المعاملة بهرمون السستانون . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في انزيم ALP في حيوانات التجربة الثانية مقارنة بحيوانات التجربة الاولى ، اظهرت المجموعة الثانية (زيت السمسم) ارتفاعا غير معنوي في مستوى الكرياتنين ، الا انه ارتفع معنويا ( P<0.05) في المجموعة الثالثة ( زيت السمسم) وانخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة وغير معنوي في المجموعة الرابعة وكذلك لم تظهر يوريا الدم فروقات معنوية بين المجموعتين . انخفض مستوى هرمون التستوستيرون بصورة غير معنوية في مجاميع السيطرة الموجبة ( الثانية والثالثة سمسم ) وارتفع بصورة غير معنوية في المجموعة الرابعة ، الا انه انخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة ببقية المجاميع. تميزت التغيرات النسجية المرضية في كلى ، اكباد ، خصى وجلود جرذان التجربة الاولى والثانية بما يلي : اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كلى الجرذان المعاملة بـ 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم سستانون والمقتولة في نهاية الاسبوع السادس ( تجربة اولى ) والمقتولة في نهاية الاسبوع الثامن ( تجربة ثانية ) . احتقان دموي في الكبيبات وبين النبيبات مع تنكس وتنخر الخلايا المبطنة الكلوية . اظهرت تلك المعاملة بزيت السمسم في حيوانات التجربتين الاولى والثانية الشكل الطبيعي والمتكون من الكبيبات والنبيبات الدانية والقاصية . بينت المقاطع النسجية في كبد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بالجرعتين 10 و20 ملغم / كغم سستانون تنخر وتنكس مع تلف الخلايا الكبدية ، احتقان دموي مع ارتشاح الخلايا الالتهاية قرب المنطقة البوابية . اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كبد الجرذان ( التجربة الاولى والثانية ) والمعاملة بالسمسم (1مل/كغم من وزن الجسم) شكل الكبد القريب الى الطبيعي المتكون من اشرطة الخلايا الكبدية والوريد الوسطي بينما بينت بعض الخلايا الكبدية في جرذان التجربة الاولى والمعاملة بالسمسم الانقسام الخيطي ( Mitosis) مما يشير الى وجود تحفيز للخلايا الكبدية على الانقسام بوساطة زيت السمسم . اظهرت خصى الجرذان المعاملة بـ10 ملغم/كغم سستانون ( التجربة الاولى ) وجود تنخر داخل النبيبات المنوية مع وجود اعداد قليلة من الحيامن وعدم وجودها في بعض تجاويف النبيبات مقارنة بالسيطرة السالبة مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن ( Spermatogonia) اظهرت جرعة 20 ملغم/كغم سستانون ( تجربة ثانية ) تثخن جدران النبيبات الخصوية مع استمرار التنكس فيها ( تنكس زجاجي ) مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن . تميزت المقاطع النسجية والمعاملة بزيت السمسم في مجموعتي جرذان التجربة الاولى والثانية بالشكل الطبيعي لنسيج الخصى وباحتواء اكثر تجاويف النبيبات المنوية على اعداد كثيرة من الحيامن . بينت المقاطع النسجية المرضية في جلد جرذان التجربة الاولى ( 10 و20 ملغم /كغم سستانون ) زيادة في الغدد الدهنية في الادمة مع عدم وجود بصيلات الشعر ممايدل على تساقط الشعر مع زيادة في الغدد الدهنية تحت الادمة ووجود بصيلات فارغة وتساقط الشعر في جرذان التجربة الثانية ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون مقارنة بالجلد الطبيعي ( السيطرة السالبة ) الذي تميز بوجود بصيلات الشعر والنسيج الضام . اظهرت المقاطع النسجية في جلد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (1مل/كغم من وزن الجسم ) بالشكل القريب الى الطبيعي مع احتوائه على بصيلات الشعر في منطقة الادمة باعداد لا باس بها . مع وجود اعداد كثيرة من بصيلات الشعر في منطقة الادمة في جرذان التجربة الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (2مل/كغم من وزن الجسم) .نستنتج من هذه الدراسة الى ان حقن السستانون بجرعتي (10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) في حيوانات التجربة الاولى قد ادى الى ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT ALP) في حين لوحظ في حيوانات التجربة الثانية ارتفاع انزيمي الـSGOT وSGPT وانخفاض في انزيمALP نتيجة جرح الكبد مع جرح الكلية والذي تميز بارتفاع الكرياتنين ويوريا مصل الدم .ارتفاع هرمون التستوستيرون بالجرعتين اعلاه في حيوانات التجربة الاولى في حين انخفض في حيوانات التجربة الثانية بجرعة 20 ملغم /كغم من وزن الجسم . تميزت الحيوانات المحقونة بزيت السمسم انخفاضا في مستوى هذه الانزيمات مع ارتفاع في مستوى التستوستيرون في كلا حيوانات التجربة . الامر الذي انعكس على انسجة الكبد والكلية والخصية والجلد الذي تميز بغياب بصيلات الشعر في الحيوانات المعاملة بالسستانون . | The present study was aimed to investigate the effect of sustanon (Anabolic Androgenic steroids )and sesame oil on some physiological functions of Liver , Kidney , Testes of rats , that included estimation of Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP (, creatinine , blood urea and testosterone levels.The histopathological study included changes caused by sustanon and sesame oil on Liver , Kidney ,testes and skin . The experimental animals included 50 males Rattus norvegicus rats divided equally into2 groups , 1st and 2nd experimental animal groups , that divided also into 5 subgroups (negative control )( ration and water ) , second group (positive control 1 ml/kg B.W Sesame oil) ; third group ( positive control 2 ml/kg B.W Sesame oil) . Fourth group ( 10 mg/kg B.W sustanon), Fifth group ( 20 mg/kg B.W sustanon) The 1stexp.groups were injected with sustanon , sesame oil weekly for six weeks and were Killed at the end of sixth week . The animals of 2ndexp.were injected the same as in first group but were Killed at eight week. Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP) in the 1stexp increased significantly (P<0.05) . The 2nd and third (sesame oil ) groups showed non significant decrease in SGOT and SGPT enzymes Levels but showed significant decrease (P<0.05) in ALP enzyme level . Creatinine and blood urea increased significantly ( P<0.05) in the 4th and 5th group in comparison with negative control group .The level of creatinine and Blood urea in second and third group decreased non significantly in comparison with negative control . Testosterone level increased significantly (p<0.05) in 4th and 5th group in comparison with negative control and two groups of positive control ,while increased non significantly in both two positive control groups ( sesame oil ). SGOT increased significantly (P<0.05) in the 4th and 5th groups of 2nd exp. animals in comparison two positive sesame control groups. The SGPT and ALP increased significantly (P<0.05) in the fifth group when compared with other groups. SGPT , SGOT and ALP decreased non significantly in the 2nd and 3rd sesame group . creatinine did not show any significant differences in all groups . at 2ndexp animals . Blood urea increased significantly (P<0.05) in 5th group ( 48.2±3.16 mg/100ml blood) in comparison with 2nd sesame group (42.4±0.93 mg/100ml blood) . The other groups showed no significancy.Testosterone level increased (5.14±0.35 ng/ml) significantly (P<0.05) in 4th group (sustanon ) in comparison with other groups . Fifth group showed significant (P<0.05) decrease in the level of Testosterone ( 0.51±0.09 ng/ml) in comparison with 3rd group ( 1.65±0.48 ng/ml) .The 2nd and 3rd groups ( sesame oil ) showed non significancy in testosterone in comparison with negative control . Rats of 2ndexp (The killed at the end of the eighth week) . showed an increase ( P<0.05) of SGOT and SGPT in comparison with Rats of 1st exp( The killed at the end of the sixth week) , while ALP showed significant decrease ( P>0.05). The 2nd group (sesame ) showed non significant increase in the level of creatinine but increased significantly (P<0.05) in the 3rd group (sesame oil ). creatinine decreased significantly (P<0.05) in the 5th group and non significantly in 4th group . Blood urea showed no significant differeneces between two exp.groups. Testosterone level decreased not significantly in 2nd and 3rd groups and increased not significantly in the 4th group.But it showed a significant decreased (P<0.05) in the 5th group (0.51±0.09 ng/ml) in comparison with other groups.Histopathological changes : The histopathological changes in the Kidneys , livers , testes and skins of Rats in experimental one and two were characterized by the following : - The renal sections in rats treated with (10 and 20 mg/kg B.W sustanon), 1st group which killed at the end of six week , and the 2nd group which killed at the end of eight week showed bloody congestion in the glomeruli and btween renal tubules ; with regenerative necrosis of endothelial cells. Sections in 2nd Exp. treated with sesame oil revealed the normal architecture of the kidney composed from glomeruli , proximal and distal tubules . Hepatic sections in two experiments ( 10 and 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed necrosis with regenerative changes and damaged of hepatocytes ; bloody congestion with inflammatory infiltration near the portal area. Liver sections in 1st and 2ndexp .treated with sesame oil (1ml/kg B.w) showed normal Liver shape composed of hepatocytes cords and central vein , the sections in sesame oil (2ml/kg B.W) showed hepatocytes mitosis that refered to the role of sesame oil in cellular (hepatocytes) division stimulation .Testes sections in rats treated with 10 and 20 mg/kg B.W sustanon (1stExp ) showed necrosis intra testicular tubules with presence of few number of sperms ; and absence of others in luminal seminiferous tubules in comparison with control ., with spermatogonial necrosis . The dose 10 mg/kg B.W sustanon (2ndexp , showed testicular tubular necrosis , and azosperma inside the lumen in comparison with control . The dose 20 mg /kg B.W sustanon revealed thickening of the testicular tubules with continuously hyaline degeneration with spermatogonial necrosis ; the testicular sections in 2ndexp , sesame oil showed normal testicular tissue and most testicular tubules contained sperms in high numbers.The skin sections in 1stexp ( 10 , 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed an increase in the sebaceous glands in dermis with abscent of hair follicles that refered to hair fallen with increasing sebaceous glands in hypodermis , presence of empty hair follicles and abscent of hair in 2ndexp . (10 and 20 mg/kg B.W sustanon) in comparison with normal control skin . In the 1st and 2ndexp . sesame oil (1ml/kg B.W) the skin sections revealed shape near normal and contained hair follicles in dermis that can't be neglected with high number of hair follicles in dermis of 1st and 2nd group treated with sesame oil (2ml/kg B.W) .We concluded from this study that the sustanon injection at two doses ( 10 and 20 mg/kg B.W) lead to an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT and ALP) in the 1st group and an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT ) and decrease in the ALP in the 2nd group due to liver injury with kidney injury that characterized by increase in the level of creatinine and serum blood urea . Testosterone was increase in the 1st group at two doses while decrease in the second group at dose 20 mg/kg B.W . The injected two groups with sesame oil showed decrease in the liver enzymes levels with testosterone increase in both experimental groups ,that reflected on the liver ; kidney; testes and skin that characterized by abscense of hair follicles in the animals treated with sustanon

دراسة بعض عوامل الضراوة للبكتيريا المعزولة من ردهات الاطفال الخدج ومقاومتها لمضادات الحياة والمطهرات == Study of Some Virulence Factors of Bacteria Isolated From Instrument Used in Neonatal Intensive Care Units and It is Resistance to Antibiotics and Disinfectants

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني | اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
Key words:
  • Staphylococcus aureus
  • Proteus mirabilis
  • Escherichia coli
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 800 مسحة مختلفة من بيئة ردهات الاطفال الخدج ومن مصادر مختلفة شملت اجهزة سحب السوائل (Suckers) وحاضنات الاطفال الخدج واجهزة انعاش الطفل والميزان وقناع الاوكسجين وادوات قص الحبل السري والارضية والجدران بالاضافة الى ايدي العاملين والكادر الطبي خلال الفترة بين ايلول 2004 الى مايس 2005 .• زرعت العينات (المسحات) مباشرة على وسطي الدم والمكونكي لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري . اخضعت العينات للاختبارات الكيموحيوية والفحص باستخدام انظمة api اذ تم استخدام api 20E للعصيات السالبة وapi staph للمكورات العنقودية وشخصت على هذا الاساس 88 عينة تعود للبكتيريا الموجبة لملون كرام شملت Staphylococcus aureus وبواقع 62 عزلة وStaphylococcus epidermidis وبواقع 26 عزلة وكذلك تم عزل 170 عزلة تعود للبكتيريا السالبة لملون كرام شملت 51 عزلة للنوع Escherichia coli و35 عزلة للنوع Proteus mirabilis و20 عزلة للنوع Pseudomonas aeruginosa و15 للنوع Klebsiella sPP. و8 عزلات للنوع Citrobacter sPP. و7 عزلات للنوع Serratia sPP. و10 عزلات للنوع Enterobacter sPP. و24 عزلة للنوع Acinetobacter sPP. .• اختبرت حساسية العزلات تجاه 15 نوعا من مضادات الحياة شائعة الاستعمال . وبينت النتائج ان معظم انواع البكتيريا المعزولة مقاومة للعديد من مضادات الحياة من مجموعة مضادات البيتالاكتام اذ كانت نسبة العزلات المقاومة للمضاد Augmentin 95.9% تلاه مضاد Carbencillin (93.4%) ثم Amoxicillin (78.2%) . فيما كان مضاد Amikacin وCefotaxime وNorfloxacin اكثر فعالية تجاه العزلات قيد الدراسة وبنسبة مقاومة 4% و15.9% و18.5% على التوالي .• حددت التراكيز المثبطة الدنيا لبعض المضادات المستخدمة في العلاج وشملت المضاد Gentamicin اذ تراوحت قيم MICs ما بين 8 - 1024 مايكروغرام/مل ، والمضاد Cefotaxime 8 - 1024 مايكروغرام/مل وCiprofloxacin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وChloramphenicol 16 - 1024 مايكروغرام/مل وCephazolin 8 - >1024 مايكروغرام/مل وAmikacin 8 - 128 مايكروغرام/مل وTrimethoprim 16 - 1024 مايكروغرام/مل وClavulanic acid+ Amoxicillin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وNorfloxacin 16 - 1024 مايكروغرام/مل وOfloxacin 4 - 512 مايكروغرام/مل وAmoxicillin 4 - >1024 مايكروغرام/مل .• درست بعض عوامل الضراوة للعزلات ومنها قابليتها على انتاج الانزيم الحال للبروتين Protenase اذ اظهرت 40 عزلة (40%) من مجموع عزلات الدراسة القدرة على انتاج هذا الانزيم تضمنت 16 عزلة تابعة لبكتيريا Staph.aureus و15 عزلة لبكتيريا E.coli و9 عزلات لبكتيريا P. mirabilis .• درست قابلية العزلات على انتاج انزيم الهيمولايسين فقد كانت منتجة وبنسبة 42% عند استخدام الدم البشري صنف A وبنسبة 37% عند استخدام الدم البشري صنف B وبنسبة 46% عند استخدام الدم البشري صنف AB وبنسبة 34% عند استخدام الدم البشري صنف O ، ومن هنا يظهر ان صنف الدم AB هو افضل الانواع لمعرفة نوع التحلل .• تم الكشف عن قابلية البكتيريا على انتاج انزيم اليوريز اذ كانت 64.2% من عزلات Staph.aureus منتجة لهذا الانزيم اما P.mirabilis فقد كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% .• اما بخصوص انتاج انزيم البيتالاكتاميز فقد اعطت كل من Staph.aureus وE.coli وP.mirabilis نسب انتاج 57.1% و52.6% 55% على التوالي .• تم تحديد التركيز المثبط الادنى لبعض المطهرات المستخدمة في المستشفيات وتبين ان المطهر Skinsept بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات اذ تراوحت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا مابين 4 - 128 مايكروغرام/مل ، بينما كان مطهر Minudus هو الاقل كفاءة اذ بلغت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا 512 - 4000 مايكروغرام/مل .• تم تحديد قيم التراكيز القاتلة للمطهرات المستخدمة في المستشفيات اذ تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Skinsept ما بين 2 - 256 مايكروغرام/مل وهو الافضل من باقي المطهرات . بينما تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Minudus مابين 1024 - 4500 مايكروغرام/مل .• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا . اذ كان زمن القتل لمطهر Skinsept 5 دقيقة ولمطهر Hibitane ما بين 5 - 10 دقيقة ومطهر Bleach ما بين5 - 20 دقيقة ولمطهر Sekeucid - N ما بين 25 - 30 دقيقة واخيرا مطهر Minudus ما بين 20 - 30 دقيقة . | • In this study , 800 different swabs were taken from neonatal intensive care unit and from many sources , including , suckers system , neonatal incubators , baby mobilization systems , balance , Oxygen mask , imbirical cutting tools , the floor and walls , in addition to the laborers hands and the medical staff , during the period of September 2004 to may 2005.• The swabs were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria. The colonies were tested biochemically by using API system , the API 20E was used for the Gram negative bacteria and API staph. used for staphylococci , though , 88 sample were identificated , these samples were belonged to the G + bacteria , including 62 isolates of Staphylococcus aureus and 26 isolates of Staphylococcus epidermidis were found. Also 170 isolates were belonged to Gram negative bacteria , including 51 isolates of Escherichia coli , 35 isolates of Proteus mirabilis , 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa , 15 isolates of Klebsiella spp. , 8 isolates of Cirtrobacter spp. , 7 isolates of Serratia spp. , 10 isolates of Enterobacter spp. and 24 isolates of Acinetobacter spp.• The susceptibility of the isolates toward 15 types of common antibiotics , was tested , the results showed that several types of isolated bacteria were resistant to many types of antibiotics that belonged to the Betalactam group . The percentage of resistance to Augmentin was 95.9% , Carbenicillin was 93% , then Amoxicillin was 78.2% while Amikacin, Cefotaxime and Norfloxacin were more active against the isolates , with percentage resistance 4% , 15.9% and 18.5% respectively .• The minimal inhibitory - concentrations of some antibiotics were determined. For Gentamicin , the MICs values ranged between 8 - 1024 mg/ml , Cefotaxime , 8 - 1024mg/ml , Ciprofloxacin 4 - 1024 mg/ml, Chloramphenicol 16 - 1024 mg/ml , Cephazolin 8 - 1024 mg/ml, Amikacin 8 - 128 mg/ml, Trimethoprim 16 - 1024 mg/ml, Amoxicillin + Clavulanic acid 4 - 1024 mg/ml , Norfloxacin 16 - 1024 mg/ml , Ofloxacin 4 - 512 mg/ml and Amoxicillin 4 - 1024 mg/ml .• Some of the virulence factors of the isolates were studied , such as the ability of protease production , 40 isolates (40%) were able to produce this enzyme, including 16 isolates of Staphylococcus aureus , 15 isolates of E.coli and 9 isolates of P.mirabilis .• The ability of the isolates for production of Haemolysin enzyme was studied too . 42% of isolates were producing Haemolysin by using Human blood group A, 37% with group B , 46% with group AB and 34% with group O , it appears that AB blood group is the best type to detect hamolysin activities . • The ability of bacteria to produce urease enzyme was detected, 64.2% of S.aureus isolates were producing this enzyme, while P.mirabilis isolates, were 100% producers.• The production of  - lactamase from each of S.aureus , E.coli and P.mirabilis was 57.1% , 52.6% and 55% respectively . • The minimum inhibiting - concentration of some antiseptics used in hospitals were determine. The results showed that the antiseptic Skinsept with its low concentrations was the most active comparing with the other antiseptics , though , the MICS values ranged between 4 - 128 mg/ml while the Minudus was the less active and its MICS values ranged between 512 - 4000 mg/ml .• The values of bactericidal concentration of antiseptics were also determined , the minimal bactericidal concentrations of Skinsept ranged between 2 - 256 mg/ml and it was the best one , while the minimal bactericidal concentrations of Minudus ranged between 1024 - 4000 mg/ml .• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal concentrations of antiseptic was determined , it was 5 minutes for Skinsept , 5 - 10 minutes for Hibitane , 5 - 20 minutes for Bleach , 25 - 30 minutes for Sekeucid - N and finally , 20 - 30 minutes for Minudus .

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

Author name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض السكري النوع الثاني لمرضى عراقيين == The Association of Glutathione - S - Transferase (GSTP1) Genetic Polymorphism in Iraqi Patients with Diabetes MellitusType2

Author name: رغد حميد رشيد
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة لمعرفة ارتباط جينات ازالة السمية لمتعدد النمط الوراثي GSTP1في ظهور مرض السكري النوع الثاني. شملت الدراسة 110 عينة دم لافراد عراقيين. 60 فرد اشخاص مصابين بداء السكري النوع الثاني مشخصين حسب المركز الامريكي للسكري وتراوحت اعمارهم بين (32 - 83 ) سنه اختيروا من مركز السكري التابع للجامعة المستنصرية المعالجين من ارتفاع سكر الدم.50 فرد اصحاء اختيروا كمجموعة سيطرة. خذت عينات من البلازما والدم. عينات البلازما شملت قياس المؤشرات السريرية للمرضى والسيطرة تضمنت مستوى الكلوكوز بالدم , الكوليسترول الكلي ,الدهون الثلاثية , مستوى اليوريا, الدهون ذات الكثافة العالية , الدهون ذات الكثافة الواطئة , الدهون ذات الكثافة الواطئة جدا ,بالاضافة الى كتلة الجسم وضغط الدم. اضافه الى تقييم ارتباط هذه العوامل مع تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1. الدراسة الجزيئيـة شملت استخلاصDNA واستخدام التضاعـــف التسلسـلي (polymerase chain reaction)و تباين اطوال قطع الدنا المقيدة (Restriction Fragment Length Polymorphism) للتحري عن التعدد الوراثي لجينات GSTP1 لجميع افراد هذه الدراسة.الدراسة الجزيئية تمت في مختبر البيولوجي الجزيئي /قسم علوم الحياة/ كلية العلوم للبنات. ظهرت النتائج ان المؤشرات السريرية (العمرAge, الجنسSex , كتلة الجسم body mass index, نسبة اليوريا في الدمblood urea , ضغط الدم الانبساطيdiastolic blood pressure والانقباضي systolic blood pressure والبروتينات الدهنية عالية الكثافة High Density Lipoproteins ) في كلا من المرضى والسيطرة لم تختلف معنويا بينما كان مستوى الكلوكوز بالدم fasting blood sugar في المرضى (184.36±7.64) mg/dl تتراوح ما بين ((341 - 100 اما في مجموعة السيطرة فقد كانت (96.06± 3.72 )mg/dl وتراوحت ما بين ((115 - 83 وكان الفرق معنويا .p< 0.00 اظهرت النتائج ان كلا من مستوى الكوليسترول الكلي((Total Cholesterol ومستوى الدهون الثلاثية (Triglyceride) في المرضى كانت ,184.56±68.66) mg/dl (161.95 ± 10.28 على التوالي واما في مجموعة السيطرة فقد كانت 98.41±9.00) mg/dl, 118.16 ± 7.11) على التوالي وكان الفرق معنويا.p<0.00 وكذلك اظهرت النتائج ان كلا من مستوى البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (Low Density Lipoproteins) ومستوى البروتينات الدهنية ذات الكثافة الواطئة جدا في المرضى كانت,106.00 ± 5.01) mg/dl, 31.58 ± 2.10 ) على التوالي واما مجموعة السيطرة فقد كانت 91. ± 4.90), (22.86 ± 1.25وكان الفرق معنويا p<0.000. نتائج التحري عن تعدد النمط الوراثي لجينات GSTP1 وتوزيعه ضمن مجموعات الدراسة اظهرت ان النمط الوراثي البري Ile/Ile والنمط الوراثي الهجين Ile/Val كانا مختلفين معنويا في مجموعة المرضى (60%, 36.67%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (68%, 32%) وكان الفرق معنوياp<0.000 . النمط الوراثي المطفرVal/Val ظهر في المرضى فقط وكان بمعدل (3.33%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0.00%) وكان الفرق معنويا p<0.000. استنادا الى النتائج المذكورة سابقا فان GSTP1 من الممكن ان يكون له دور مهم في امراضيه السكري النوع الثاني بينما لم يظهر تاثيره على مؤشرات الدهون. | This study was carried out to investigate the relationships between the T2DM patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1, and measurement of some clinical parameters of patients and controls. The study included 110 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with Type2 diabetes were diagnosed according to the American Diabetes Association criteria (American Diabetes Association, 2007); their age range were between (32 - 83) years selected from those attending the National - Diabetes Center/ AL - Mustansiriya - University for treatment with history of hyperlipidemia and hypertension. Fifty individuals healthy also included as control group. Sera and blood were used as samples. The measured parameters in serum included (biochemical testes) : Fasting Blood Sugar (FBS), Total Cholesterol (TC), Triglycerides (T.G), Blood Urea (BU), High Density Lipoprotein (HDL), Low Density Lipoprotein (LDL) and Very Low Density Lipoprotein (VLDL). Additionally, body mass index (BMI) and blood pressure (BP) were determined. Moreover, the correlation between genotyping of Glutathione S - Transferase P1 and all studied parameters was carried out. Molecular studies involved DNA extraction and PCR (Polymerase Chain Reaction) - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) was carried to detect the genetic polymorphism of glutathione - S transferase gene Pi class for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department Sciences/ College for women. The results showed that (age, sex, body mass index, blood urea diastolic blood pressure, systolic blood pressure, high density lipoproteins) for patients and control group were not significant while for the level of fasting blood sugar was (184.36±7.64) mg/dl, ranging from (100 - 341) in patients while in the control group it was (96.06±3.72) mg/dl and ranged between (83 - 115) and it was a significantly difference (P < 0.000).The results showed that total cholesterol and Triglycerides in patients (184.56±68.66 mg/dl, 161.95 ± 10.28 mg/dl) respectively were higher significantly than in controls (98.41±9.00, 118.16 ± 7.11) mg/dl (P <0.001). The data also showed that both of Low density lipoproteins and Very low density lipoproteins in patients were (106.00 ± 5.01 mg/dl, 31.58 ± 2.10 mg/dl) respectively and highly significantly difference (P < 0.001) than in controls (91.27 ± 4.90 mg/dl, 22.86 ± 1.25 mg/dl)(P <0.001) respectively. The results of genetic polymorphism of GSTP1 distribution among the studies groups showed that wild type Ile/Ile and heterozygous Ile/Val were higher significantly between patients (60 %, 36.67 %) and in controls (68 %, 32 %) respectively. The homozygous mutant Val/Val genotype was elevated in the DM patients only and it was (3.33%) compared to controls (0.00%). According to data mentioned above showed that GSTP1 genotype polymorphisms may play an important role in the pathogeneses of type2 diabetes mellitus while its effect on all lipid profile indicators did not show any significant difference.
1 ... 71 72 73 74 75 ... 115