Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 11,619

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

Author name: هند يوسف خلف
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض المعالم المناعية لمرضى التصلب المتعدد العراقيين == Study of Some Immunological Parameters in Iraqi Patients with Multiple Scler

Author name: هند قصي اسماعیل الفرضي
Supervisor name: حازمة موسى خلیل العباسي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory condition that affects central nervous system (CNS) causing neurological dysfunction. The current study aim was the evaluation of the role of Methylprednisolone (MP), Interferon Beta (IFN - β) as disease treatments, and to investigate their influence on CD25+ FoxP3 T regulatory cells (it was counted by flow cytometry technique), IL - 8, IL - 17 (pro - inflammatory cytokines), IL - 12 (inflammatory cytokine (T cells differentiation Factor)), IL - 10, TGF - β (anti - Inflammatory cytokines) it estimated by ELISA technique, also the total and differential WBC count, ESR, CRP (inflammatory indicators), patient characteristics, clinical manifestation and life style characteristics. Forty - five Iraqi MS patients (15 untreated as early onset patients, 15 MP treated patients and 15 IFN - β treated patients), in addition to 15 apparently healthy individuals as control. For patients treated with MP, samples collected after treatment period, while patients treated with IFN - β samples were collected in remission status.The study revealed the following results : 1. Patient general characteristics showed that according to gender distribution female : male ratio was 2 : 1 (66.67% : 33.33%), according to the age of onset, (< 30 years) group of patients were the highest frequency in study sample (37.9%), 57 years was the maximum age of onset and 13 years was the minimum, with mean (34.93), Baghdad was the highest governorate in MS onset (73.33%). 2. Total WBC count showed that patients treated with MP (10.38*103μl) increases significantly (P≤0.002), (P≤0.001) as compared with both patients treated with IFN - β (7.45*103μl) and control (7.33*103μl) respectively. Lymphocytes were decrease significantly (P≤0.013), (P≤0.030) patients treated with MP and INF - β respectively (1.82), (1.92) as compared to control (2.58) and there were a significant decrease (P≤0.03) in patients treated with MP (1.82*103μl) as compared to untreated patients (2.47*103μl).Neutrophils was increase significantly (P≤0.016) and (P≤0.000) in patients treated with MP and untreated patients respectively (7.81), (5.99) as compared to control (3.82), there were also a significant increase in patients treated with MP (P≤0.04), (P≤0.001) ascompared with untreated patients (5.99*103μl) and patients treated with IFN - β (4.73*103μl) respectively. Basophils decrease significantly (P≤0.001), (P≤0.014) in both patients treated with MP and INF - β respectively (0.05), (0.06) as compared to control (0.08).3. CD25+ FoxP3+ Tregs counting showed a significant increase (P≤0.002) in untreated patients (28.01%) as compared to control 14.06%), while there were a significant decrease (P≤0.016), (P≤0.007) in both patients treated with MP and IFN - β respectively(3.70%), (2.44%) as compared to control, also there were a significant increase (P≤0.000), (P≤0.000) in untreated patients (28.01%) as compared with patients treated with MP (3.70%) and patients treated with IFN - β (2.44%) respectively.4. Serum cytokines estimation showed that IL - 8 decreased significantly (P≤0.026) in untreated patients (0.003pg/ml) as compared to control (0.016), while IL - 10, IL - 12, IL - 17 showed no significances and TGF - β increased significantly (P≤0.028) inpatients treated with MP (700.27) as compared to control (392.13), while there were a significant increasing (P≤0.001), (P≤0.001) in patients treated with MP (700.27pg/ml) as compared with untreated patients (235pg/ml) and patients treated with IFN - β (484.67pg/ml) respectively. Saliva cytokines estimation showed that IL - 8 was increased significantly (P≤0.023) in patients treated with IFN - β (0.578) as compared to control (0.223), IL - 10 increased significantly (P≤0.017) in patients treated with MP (0.023) as compared to control(0.00), IL - 12 decreased significantly (P≤0.003) in patients treated with IFN - β (4.93) as compared to control (24.07), IL - 17 increased significantly (P≤0.018) in patients treated with MP (19.17) as compared to control (0.00).

تاثير الكلنبيوتيرول على بعض المعايير الفسلجية في ذكور الارانب Oryctolagus cuniculus == Effect of the Clenbuterol on some physiological parameters in male rabbits Oryctolagus cuniculus

Author name: هند ضياء هادي
Supervisor name: الية حسين علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية للتعرف على التاثيرات الفسلجية لعقار الكلنبيوتيرول في وظائف الكبد, والكلى, وتركيز الدهون, والكلوكوز ومستوى بعض هرمونات (TSH,T4,T3,T,Prolactin,LH,FSH). استخدم في هذه الدراسة 32 ذكرا بالغا من الارانب قسمت عشوائيا الى اربع مجاميع, والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوما , المجموعة الاولى جرعت فمويا بـ الماء المقطر, المجموعة الثانية جرعت فمويا بـ 2مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الثالثة جرعت فمويا بـ 4 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الرابعة جرعت فمويا بـ 6 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول. جمعت عينات الدم في مرحلتين الاولى بعد 14يوما والثانية بعد 30 يوما من بدء التجريع لغرض الدراسة الفسلجية. ادت المعاملة بعقار الكلنبيوتيرول الى انخفاض معنوي (P<0.05) في معدل وزن الجسم لكل المجاميع المجرعة بالعقار مقارنة بمجموعة السيطرة بعد 30 يوما من التجريع . واوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاع غير معنوي 0.05)<(P في كل من انزيمي الاسبارتيت الناقل للامين AST وانزيم الالنين الناقل للامينALT في المجموعتين الثانية والثالثة المجرعة بالعقار لمدة 14 , 30 يوما , بينما لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة ولمدة 14 ,30 يوما من التجريع, ولم يلاحظ وجود اي فرق معنوي 0.05)< (Pفي تركيز انزيم الفوسفاتيز القاعدي ALP لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 ,30 يوما بعد المعاملة. كما بينت الدراسة وجود انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى حامض اليوريك في كل المجاميع المجرعة لمدة 14 يوما, كذلك انخفض مستوى الحامض بصورة غير معنوية 0.05)< (Pفي المجموعة الثانية بينما انخفض بصورة معنوية(P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة بعد 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة, اوضحت النتائج ارتفاع غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى الكرياتنين لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة اذ كان هناك ارتفاع معنوي(P<0.05) لمدة 30 يوما بعد التجريع, احدث العقار انخفاض غير معنوي0.05)< (P في مستوى اليوريا لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما, بينما انخفض مستوى اليوريا بصورة معنوية (P<0.05) في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة, فضلا عن دور العقار في الانخفاض المعنوي (P<0.05) في مستوى الكولسترول لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية اذ كان هناك انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pبعد مرور 14 يوما بعد التجريع, كما اظهرت النتائج انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الكليسريدات الثلاثية في المجموعة الثانية لمدة 14 , 30 يوما بينما انخفض مستوى الكليسريدات الثلاثية معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة. احدث العقار ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (Pفي مستوى الـ HDLفي المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) بعد مرور 30 يوما من التجريع, كما بينت النتائج انخفاضا معنويا (P<0.05) في مستوى الـ LDL في المجموعة الثانية المجرعة لمدة 14 يوما بينما انخفض مستوى الـ LDL بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, وكذلك انخفض مستوى الـ LDL معنويا(P<0.05) في المجموعتين الثانية والثالثة لمدة 30 يوما من التجريع بينما انخفض بصوره غير معنوية 0.05)< (P في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, كما لوحظ انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الـ VLDL لكل المجاميع خلال 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك انخفاض معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع, اظهرت المجاميع المجرعة ارتفاع غيرمعنوي 0.05)< (P في مستوى الكلوكوز لمدة 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30يوما من التجريع. كما اوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاعا غير معنويا في مستوى الهرمونات LH, FSH وT لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع , اضافة الى انخفاض مستوى هرمون الحليبProlactin بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما من التجريع , كما اظهرت النتائج ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (P في مستوى هرمون T3في المجموعة الثانية المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما بينما ارتفع معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة, كما نلاحظ ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P في مستوى هرمون T3 في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما, وبينت النتائج ايضا ارتفاع مستوى هرمون T4معنويا (P<0.05) في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P لمدة 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة , كمالوحظ وجود ارتفاع معنوي ((P<0.05 في مستوى هرمون الـ TSH للمجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14,30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة. | This study was designed to investigate the physiological effects of Clenbuterol drug on liver, kidney function, lipidprofile ,concentration of glucose and level of some hormones (FSH,LH,T,PRL,T3,T4,TSH). Thirty two adult male rabbits were used in this study, the animals were randomly divided into four groups and treated daily for 30 days, the G1 intubated orally distilled water (control), G2 intubated orally 2 µg/kg/bw of clenbuterol drug, G3 intubated orally 4µg/kg/bw of clenbuterol drug, G4 intubated orally 6µg/kg/bw of clenbuterol drug. Blood samples were collected in two stages the first stage after 14 days, second stage after 30 days of treatment for physiological study. The treatment with Clenbuterol drug lead to a significant(P<0.05) decrease in the mean of the body weight in all the exposed groups with drug as compared with control group for 30 days. The statistical results of this study showed non significant(P>0.05) increase in both AST and ALT enzyme in the second and third groups exposed with drug for 14, 30 days, while we note significant(P<0.05) increase in the fourth group as compared with control group for 14,30 days after treatment .As for the concentration of the ALP enzyme didn,t demonstrated a significant (P>0.05) difference during 14,30 days after treatment . The results showed that there are non significant(P>0.05) decrease in the uric acid level in all the exposed groups for 14 days ,as uric acid level non significant (P>0.05)decrease in the second group, while significant(P<0.05) decrease in the third and fourth groups for 30 days after treatment compared with control group. Results explained non significant(P>0.05) increase in the creatinine level in all the treated groups with drug for 14, 30 days except fourth group there was a significant (P<0.05) increase for 30 days after treatment, drug caused non significant (P>0.05) decrease in the urea level in all the treated groups for 14 days, while urea level a significant(P<0.05) decrease in all the exposed groups with drug for 30 days as compared with control group. In addition the role of drug in significant(P<0.05) decline in the cholesterol level in all the treated animals for 14, 30 days except the second group there was non significant(P>0.05) decrease for 14 days after treatment . Results also explained non significant(P>0.05) decrease in the T.G level in second group for 14, 30 days, while T.G level a significant (P<0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group.Drug caused non significant (P>0.05) increase in the HDL level in all the exposed groups for 14, 30 days except the second group there was significant(P<0.05) increase for 30 days after treatment, the results showed a significant(P<0.05) decrease in the LDL level in the second group for 14 days, while LDL level non significant(P>0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group, as LDL level a significant decrease(P<0.05) in second and third groups for 30 days after treatment while non significant(P>0.05) decrease in fourth group as compared with control group. We also note non significant(P>0.05) decrease in VLDL level in all the exposed groups with clenbuterol for 14,30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) decrease for 30 days after treatment .Treated animals showed non significant(P>0.05) increase in the glucose level for 14, 30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) inecrease for 30 days after treatment . The statistical results of this study showed non significant (P>0.05) increase in the LH, FSH and T hormones level in all the treated animals for 14, 30 days except the fourth group there was significant (P<0.05)increase for 30 days after treatment, as well as non significant (P>0.05) decrease in the prolactin hormone level in the treated animals for 14, 30 days of treatment. Results also explained non significant (P>0.05) increase in the T3 hormone level in the second group for 14 days after treatment, while significant (P<0.05) increase in the third and fourth groups, we also note non significant(P>0.05) increase in the T3 hormone level in all the exposed groups with drug for 30 days after treatment. The results showed a significant (P<0.05) increase in the T4 hormone level in all the exposed groups for 14, 30 days except second group there was non significant(P>0.05) increase for 30 days after treatment compared with control group , we also note a significant (P<0.05) increase in the TSH hormone level in all the treated animals exposed with drug for 14, 30 days as compared with control group

التحري عن بعض المعايير المناعية وتعدد الطرز الوراثية لجين IL - 13 في مرضى الربو في محافظة ذي قار == Investigation of some Immunological parameters and polymorphism of IL - 13 gene in patients of asthma in Thi - Qar province

Author name: هند حسين صالح الطائي
Supervisor name: علي نعيم سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Asthma is a chronic inflammatory disease of the airways in which many cells and cellular elements play a role. Causes recurrent episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness, and coughing. These episodes cause airflow obstruction, often reversible either spontaneously or with treatment. The current study was conducted at the Labs of college of Education for pure science and Al - Hussein Teaching Hospital in Thi - Qar province, during the period from October 2014 to May 2015. The study aimed to investigate role of polymorphism of IL - 13 gene in patients with asthma and to evaluate their immune status by measuring the levels of some immunological parameter immunoglobulins ( IgE) by enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) and (IgG, IgM ) by single redial immune diffusion (SRID) and measure the levels of interleukins (IL - 6, IL - 17) in the serum using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), the study included test phagocytic cells on phagocytosis (coefficient of phagocytosis) and the total and differential count of white blood cells .A total of 100 patients with bronchial asthma (68 females) and (32 males) whose age lies between 17 - 62 years have enrolled in this study. DNA was extracted and RFLP - PCR was performed by using primers specific for the gene IL - 13, the results showed the presence of mutations in a48 sample out of 100 patients with asthma at site 1112C/T after using restriction enzyme BstUI. the statistical analysis showed correlation between the occurrence of the disease and the emergence of mutation (C / T) in the promoter region of IL - 13 gene when compared with the healthy control in population of Thi - Qar province .When it was compared the patient group with healthy control group there was a high significant increase (P ≤ 0.001) in serum IgE, IgG of patients with asthma compared with healthy control group. And no significant difference in serum IgM of patients with asthma compared with healthy control group. Decrease coefficientphagocytosis was significantly (P ≤ 0.001) in all patients with asthma compared with healthy control group. Levels of interleukin (IL - 6, IL - 17) measured in serum of 60 a sample of patients with asthma, and in the serum of 20 samples from healthy control group. The results showed a significant increase (P ≤ 0.001) in the levels of these interleukins in the serum of patients with asthma compared to the control group.Also there was increased in the rate of counting the total of WBCs and differential cell lymphocytes, eosinophil, neutrophil, basophil, and monocyte (P ≤ 0.001) in patients with asthma compared with the healthy people in the control group.

التغاير الفصلي في التركيب النوعي للطحالب الملتصقة على اجزاء مختلفة من نبات القصب Phragmites australis من مواقع مختارة في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق == Seasonal Variations in Species Composition of Epiphytic Algae on Different Parts of Phragmites australis in the Tigris River - Baghdad - Iraq

Author name: هند ابراهيم احمد البياتى
Supervisor name: جنان شاوي الحساني
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسة شهرية للطحالب الملتصقة على السيقان والاوراق الحية والميتة لنبات القصب Phragmites austrlis Trin ex Stand في نهر دجلة في موقعي الاعظمية والجادرية ضمن مدينة بغداد ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 ولغاية شهر حزيران 2015 . شملت الدراسة قياس العوامل الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ، مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء) والاس الهيدروجيني (pH) والتوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰ S) والمواد الذائبة الكلية (TDS) والمواد الصلبة العالقة (TSS) والقاعدية الكلية (TA) والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD5) والعسرة الكلية (T.H) والكالسيوم والمغنسيوم والكدرة (Turbidity) ونفاذية الضوء (light penetration) وسرعة الجريان (F.W) والكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا والنتراتNO3 والنتريت NO2 والامونيا NH3و الفوسفات الفعالة (PO4) - 3و السيليكا الفعالة - 2) (SiO3 . فضلا عن ذلك تمت دراسة نوعية وكمية للطحالب الملتصقة على السيقان الحية والسيقان الميتة والاوراق الحية والاوراق الميتة لنبات القصب وقيست اربع مؤشرات للتنوع الحيوي ( دليل شانون للتنوع ودليل الغنى ودليل التكافؤ ودليل جاكارد للتشابه ) . اوضحت نتائج الدراسة ان معدل قيم درجة حرارة الهواء والماء تراوحت 18 - 39 م و12 - 31 م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني 7.6 - 8.1 واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت 130 - 191.6 ملغم.لتر - 1. بينما وصلت قابلية التوصيل الكهربائي 500 - 870 مايكروسمنز.سم - 1. في حين سجلت قيم الملوحة 0.305 - 0.538 جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية 250 - 430 ملغم .لتر - 1، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن 0.91 - 0.03 ملغم .لتر - 1، والاوكسجـين المذاب بين 8.4 - 5 ملغم.لتر - 1 ، وقيم المتطلب الحيوي بين 4.1 - 0.9 ملغم .لتر - 1 ،العسرة الكلية 465 - 120ملغم CaCO3.لتر - 1 ، الكالسيوم 97.4 - 41. ملغم . لتر - 1، المغنسيوم 17.6 - 74.9 ملغم .لتر - 1 ،الكدرة 87.1 - 28.6NTU ، نفاذية الضوء 90 - 34 سم ، سرعة الجريان 0.3 - 0.1 م . - 1ثا ، النترات الفعالة 0.98 - 0.72 ملغم .لتر - 1 ,النتريت الفعال 0.02 - 0.004 ملغم . لتر - 1 , الامونيا 0.23 - 0.09 ملغـم. لتر - 1 ، في حين تراوحت قيــم الفـوسفات الفعالة 0.73 - 0.1ملغم . لتر - 1 والسيليـكا الفعالة 4.1 - 3 ملغم . لتر - 1 . شخص 174 نوعا تعود الى 52 جنس كان منها138 نوعا 31جنس تعود الى صف الطحالب العصوية Bacillariophyceae مكونة 79.3% من العدد الكلي لانواع الطحالب الملتصقة 10انواع تعود لرتبة الدايتومات المركزيةCentrales و128 نوعا تعود لرتبة الدايتومات الريشيـــة Pennales و18 نوعا ) 10.3% ، 13 جنس) تعود الى صف الطحالب الخضر Chlorophyceae و17 نوعا (9.7% ،8 جنس ) تعود الى صف الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae ونوع واحد وجنس واحد(0.5) للطحالب البرواتية Dinophyceae.سجلت الدراسة الحالية 6 انواع من الطحالب المشخصة لاول مرة في العراق تعود لصف الطحالب العصوية تمثلت بـ Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow وNavicula exilissima Grunow وNavicula microcephalo Grunow وPleurosigma obscurum W.Smith وStauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys وStenopterobia intermedia Lewis , وقد اوضحت ابعاد النوع وصفاته الاساسية فضلا عن تصويره فوتوغرفيا بالكاميرا الرقمية .تفوقت الاجزاء الميتة من سيقان واوراق نبات القصب P . australis باعداد انواع الطحالب الملتصقة عليها مقارنة مع السيقان والاوراق الحية للنبات المضيف , سجل 96 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية ,و 95 نوع على السيقان الميتة , 50 نوع على الاوراق الحية , 61 نوع على الاوراق الميتة شكلت الطحالب العصوية 82% , 84.2 % , 80 % , 83 % نوع على التوالي , اما الطحالب الخضر فقد تراوحت بين 10.4 % , 6.3 % , 8.1 % , 4.9 % نوع, والطحالب الخضر المزرقة 8.3 % , 7.3 % , 6.5 % , 9.8 % نوع في موقع الاعظمية , اما في موقع الجادرية فقد سجل 85 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية و90 نوع على السيقان الميتة و57 نوع على الاوراق الحية و74 نوع على الاوراق الميتة , سادت فيها الدايتومات بنسبة 80.3 % ,82 % , 81 % , 82.4 % على التوالي , اما الطحالب الخضر 8.2 % , 9.4 % , 5.2 % , 6.7 % والطحالب الخضر المزرقة 9.4% , % 8.2 , 10.5%, 9.4 % نوع على التوالي تباين العدد الكلي للطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة لنبات القصب باختلاف الفصول والمواقع ، اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة 854.7×104 خلية.غم - 1 وزن رطب على السيقان الحية في الربيع واقل عدد كلي للطحالب 108.64× 104 خلية.غم - 1 على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية في حين تراوح العدد الكلي لافراد الطحالب الملتصقة في موقع الجادرية بين 114.77×909.47 - 104× 104 خلية.غم - 1 وزن رطب على الاوراق الحية والسيقان الحية لنبات القصب في الشتاء والربيع على التوالي . تراوحت قيم كلوروفيل - ا للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين 2.831 - 1.586 ملغم.سم - 2 في الخريف والربيع على التوالي في موقع الاعظمية و3.108 - 0.941 ملغم.سم - 2في الشتاء والربيع على التوالي في موقع الجادرية , بينما تراوحت قيم الفيوفايتين - ا بين 0.981 - 0.037 ملغم .سم - 2 في الخريف والصيف على التوالي في موقع الاعظمية و0.895 - 0.027 ملغم.سم - 2في الخريف والصيف في موقع الجادرية . اظهرت ادلة التنوع الحيوي اعلى قيم دليل الغنى 16.9 للطحالـــب الملتصقـة علــى السيقان الحية لنبات القصبP. australis في الربيع في موقع الجادرية وظهرت اقل قيم الدليل 7.7للطحالب الملتصقة على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية ، واعلى قيم دليل التنوع شانون بلغت 4.19 في الربيع للطحالب الملتصقة على السيقان الحية في موقع الجادرية ، في حين سجل اقل قيم دليل التنوع 3.1 على الاوراق الحية في الصيف في موقع الاعظمية ، سجلت اعلى قيمة تكافؤ 0.740 في الشتاء للطحالب الملتصقة على الاوراق الحية في موقع الجادرية واقل قيمة بلغت 0.58 على السيقان الحية في الخريف في موقع الاعظمية. كما بينت النتائج اعلى نسبة تشابه لدليل جاكارد Jaccard بين الفصول كانت بين الربيع والخريف للطحالب الملتصقة على السيقان الميتة اذ بلغت 51.7 % في موقع الاعظمية , في حين بلغت اعلى نسبة تشابه في موقع الجادرية 49.6 % بين الربيع والخريف على السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الخريف اعلى نسبة تشابه 40.2 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 37 % بين السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الربيع اعلى نسبة تشابه 48 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة وجاء الصيف بـ اعلى نسبة تشابه بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في موقع الاعظمية , اما موقع الجادرية فقد سجل اعلى نسبة تشابه 44.6 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في الخريف وسجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 40.2 % على السيقان الحية والاوراق الميتة وسجل الربيع اعلى نسية تشابه 59.5 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل فالصيف اعلى نسبة تشابه 41.4 % على السيقان الميتة والاوراق الميتة . خلصت الدراسة الى ان مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد عسرة وذات طبيعة قاعدية معتدلة وسجل تنوع عالي مع تباين ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة للنبات المائي الواحد اذ فضلت الطحالب جزء الورقة الملتف حول الساق ولم تفضل جزء الورقة الممتد افقيا على سطح الماء وازداد تنوع الطحالب الملتصقة على الاجزاء الميتة في فصول الدراسة كافة باستثناء الربيع الذي سجل زيادة في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء الحية من سيقان واوراق نبات القصب اما مواسم الذروة فكانت في فصلي الربيع والخريف وسجل الشتاء انخفاض ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة بسبب الظروف البيئية الغير الملائمة . | This work was conducted monthly to study the epiphytic algae on dead and live stems , leaves of aquatic plant Phragmites australisn Trin ex Stand on the Tigris River at Al - Jadriya and Al - Adhmia sites within Baghdad City during the period between October 2014 and June 2015. The physicochemical factors were measured in the studied area. These factors were temperature (air and water), pH (water), electrical conductivity (EC), salinity (S‰), water flow, total dissolved solids (TDS), total suspended solids (TSS), turbidity and light penetration. Also the study included total alkalinity (TA), total hardness (TH), calcium, magnesium, dissolved oxygen (DO), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, Nitrate(NO3), Nitrite(NO2), Amonia(NH3), Ractive phosphate (PO4) - 3 , Reactive Silicates (SiO3 - 2), chlorophyll - a and pheophytin - a. The quantitative and qualitative study for epiphytic algae on different part of macrophytes (Phragmites australisn Trin ex Stand ) were done. Also four biodiversity indices (Shannon - Weaver, richness, evenness and similarity) were calculated. The studied factors ranged as follows : 18 - 39 C° , 12 - 31 C° for air and water temperature, respectively. The turbidity and light penetration, water flow, EC, S‰, TDS and TSS were 28.6 - 87.1 NTU, 34 - 90 cm, 0.3 - 0.1m.Sec - 1., 500 - 870µs.cm - 1, 0.305 - 0.538 ‰, 250 - 430 mg.l - 1 and 0.03 - 0.91 mg.l - 1, respectively. While7.6 - 8.1, 130 - 191.6 mg CaCO3.l - 1 , 120 - 465 mg .l - 1 , 41.1 - 97.4 mg.l - 1 , 17.6 - 74.9mg.l - 1 for pH, TA, TH, Ca++ and Mg++, respectively. Nutrient concentrations ranged 0.98 - 0.72 µg.l - 1 , 0.02 - 0.004µg.l - 1 , 0.09 - 0.23µg.l - 1, 0.1 - 0.73 µg.l - 1 , 3 - 4.1µg.l - 1 for Ractive Nitrate, Nitrite,Amonia, Ractive phosphate and Silica. A total of 174 taxa of epiphytic algae were found in the present study. Bacillariophyceae (diatoms) was the dominate class with 138 species (128 species belonged to pinnate diatoms and 10 for centric diatoms) and represented 79.3% from the total identified algae. Other classes sequenced as follows : Chlorophyceae (18 species and 10.3%), Cyanophyceae (17species and 9.7%) and one species (0.5%) for Dinophyceae .Six of the algal taxa were recorded in the present study are new to Iraqi flora. The new record of algae belong to Bacillariophyceae are Navicula exilissima Grunow , Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow , Navicula microcephalo Grunow, Pleurosigma obscurum W.Smith, Stauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys , Stenopterobia intermedia Lewis. The results of this study include description of the basic characteristics of these taxa together with complete photographic documentation. Highest number of epiphytic algae were recorded on dead stems and leaves of aquatic plant P. australis comparison with living parts of the host plant , 96 species of epiphytic algae were recorded on living stems , 95 species on dead stems , 50 species on living leaves and 61 species on dead leaves . The proportion of Bacillariophyceae was %82, %84, %80, %83 respectively while Chlorophyceae was ranged %10.4, %6.3, %8.1, %4.9 and Cyanophyceae recorded %8.3, %7.3, %6.5, %9.8 species in Adamia site . While in Jadria site it has recorded 85 species of epiphytic algae on living stems , 90 species on dead stems , 57 species on living leaves and 74 species on dead leaves diatoms was dominant %80.3, %82, %81, %82.4 respectively Chlorophyceae recorded %8.2 , %9.4, %5.2, %6.7 species and Cyanophyceae %9.4, %8.2, %10.5, %9.4 species respectively .Numbers of epiphytic algae fluctuated among study sites, seasons and parts of aquatic plants showed that highest count was recorded 845.7 × 104 cell.gm - 1 wet weight on living stems in spring and the lowest count was recorded 108.64 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves in winter at Al - Adhmia site .While the total number of epiphytic algae on P. australis at Al - Jadria site ranged between 114.77× 104 - 909.47 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves and living stems of the host plant in winter and spring respectively .Chlorophyll - a concentration varied among Seasones , and recorded between 1.586 - 2.831 mg.cm - 2 in autumn and spring respectively at Al - Adhmia site , and ranged between 0.941 - 3.108 mg.cm - 2 in winter and spring respectively at Al - Jadria site . Pheophytin - a concentration varied and recorded between 0.037 - 0.981 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Adhmia site and 0.941 - 0.895 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Jadria site .The highest value of richness in this study was 16.9 on the living stems in spring at Al - Jadria site and the lowest value was 7.7 on dead leaves in winter at Al - Adhmia site . Shannon - Weaver index values ranged between 4.19 on the living stems in spring at Al - Jadria site and 3.1 on the living leaves in summer at Al - Adhmia site. Evenness index recorded highest value 0.740 on the live leaf in winter at Al - Jadria site While the lowest value 0.58 on live stem in autumn at Al - Adhmia site . Higher percentage for Jaccard similarity index 51.7% obtained between autumn and spring seasons on dead stems at Adhmia site While the highest percentage of similarity at Al - Jadria site was 49.6% between autumn and spring on dead stems and living stems.The water quality of Tigris River within Baghdad city is estimated as a moderate alkalinity and hardness , high diversity and marked contrast in total number of epiphytic algae was recorded on same host plant , algae prefer parts of leaves that wrapped around stem and not the leaf blade that extended horizontally on the surface of the water , diversity increased on dead parts of plant in all study seasons except spring which showed an elevated in the total algae number on living parts (stems and leaves ) for reed plant , peak seasons was Spring and Autumn while Winter record a significant decrease in algae number which attributable to environmental conditions in appropriate.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

Author name: هديل مكي حبيب المؤمن
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

تاثير حامض الجبرلين والبراسينولايد في بعض صفات النمو والحاصل لصنفين من نبات الشبنت Anethum graveolens L. == Effect of GA3 and Brassinolide on Some growth and Yield Parameters for two Cultivars of Plant Anethum graveolens L

Author name: وائل شاكر حميد الجبوري
Supervisor name: ماهر زكي فيصل الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت تجربة حقلية في الحديقة النباتية العائدة لقسم علوم الحياة، كلية التربية للعلوم الصرفة - ابن الهيثم - جامعة بغداد، في الموسم النمو 2015 - 2016 لدراسة تاثير تركيز حامض الجبرلين والبراسينولايد وتداخلهما في بعض الصفات المظهرية والكيميائية والمركبات الفعالة طبيا والحاصل ومكوناته في صنفين نبات الشبنت هما الصنف المحلي والصنف الهولندي. نفذت التجربة باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة Randomized Complete Block Design (RCBD) وبثلاثة مكررات اذ تضمنت الدراسة صنفين نبات الشبنت واضافة خمسة تراكيز من البراسينولايد هي (0 و0.5 و1 و2 و3) ملغم.لتر - 1 ورش حامض الجبرلين على المجموع الخضري بتركيز 50ملغم.لتر - 1 وبدون رشه. وبهذا تكون التجربة عاملية (2 × 2 × 5 ×3) اذ تضمنت 60 وحدة تجريبية، وسمدت الوحدات التجريبية وفق معاملاتها. ويمكن ايجاز النتائج التي تم الحصول عليها كما ياتي : 1. اختلاف صنفي نبات الشبنت (المحلي والهولندي) عن بعضهما في الصفات المدروسة، فقد تفوق الصنف المحلي على الصنف الهولندي في صفة ارتفاع النبات ووطول الحامل الزهري وتركيز الفسفور ونسبة الكاربوهيدرات في المجموع الخضري ونسبة الكاربوهيدرات في الثمار ووزن 1000ثمرة. فيما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي في صفة طول الجذر وحجم الجذر وقطر الساق والوزن الرطب والوزن الجاف ومعدل النمو المطلق واستدامة الكتلة الحيوية وعدد النورات الزهرية وحاصل الثمار في النبات الواحد وحاصل الثمار في الوحدة التجريبية الواحدة وحاصل الثمار الكلي وتركيز النتروجين في المجموع الخضري وتركيز الكالسيوم وتركيز البوتاسيوم وتركيز المغنيسيوم ونسبة البروتين في المجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي في الاوراق وتركيز النتروجين في الثمار، نسبة البروتين في الثمار ونسبة الزيت والوزن النوعي.2. اظهرت الدراسة ان المعاملة بحامض الجبرلين والبراسينولايد والتداخل بينهما ادى الى زيادة معنوية في الصفات المدروسة ، عند رش 50 ملغم.لتر - 1 من حامض الجبرلين وتركيز 2 ملغم.لتر - 1 في معظم الصفات والبعض منها عند التركيز 1 ملغم. لتر - 1 من البراسينولايد على المعاملات الاخرى. 3. اظهرت نتائج الفحص والتشخيص الكروماتوغرافي باستعمال تقنية HPLC تشخيص ستة مركبات فعالة في الزيت الطيار لبذور صنفي نبات الشبنت هي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole وP - anisaldehyde وLinalool). وقـد تـفوق الصنـف المحــلي على الصنـــف الهـولـندي باعطائــه اعــــلى تركـيــز لكل مــن المركبات الفــــعالـــة هـــما P - anisaldehyde) وLinalool)، عند رش حامض الجبرلين بتركيز 50 ملغم . لتر - 1 والبراسينولايد بتركيز1 ملغم. لتر - 1 ، بينما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي باعطائـه اعلى تركيز للمركبات الفعالة وهي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole) عند رش 50 ملغم. لتر - 1 الجبرلين و2 ملغم. لتر - 1 البراسينولايد. | A Field study was conducted at the farm of Biology Department, College of Education (Ibn AL - Haitham) for pure science, University of Baghdad during the growth season 2015 - 2016, on study the effect of Gibberellic acid concentration and brassinolide and their intraction on both morphological and chemical characteristics, the components of yield, determining the medically active compoands in two varieties of Dill plant, local and Holand varieties.The experiment was designed as Randomzied Complete Block Design (R C B D) with three replications. which two varieties of Dill plant and spray of Gibberellic acid (50) mg.liter - 1 and non spray and five concentration of brassinolide (0, 0.5 , 1,2 and 3) mg.liter - 1 The experiment was as designed factorial experiment (2x2x5x3) included sixty experimental units The plants were managed fertilized recommaded.Can be summarized the results that were obtained as follows : 1.different the variety of dill plant (local and holand) from each other in the traits, the local variety surpassed the holand variety in the plant height, the length of the pregnant syphilis, Concentration of phosphate, the percentage of carbohydrates in the shoot, the percentage of carbohydrates in the fruits, weight of a thousand fruits. As outweigh the holand variety at the local variety in the character of the root length, root size, stem diameter, wet weight, dry weight, the absolute growth rate, the sustainability of biomass, the number of inflorescences, holds fruits per plant, holds the fruits in a single experimental unit, holds overall fruits, Concentration nitrogen in the shoot, calcium Concentration, potassium Concentration, the percentage of protein in the shoot, the total chlorophyll content in the leaves, the Concentration of nitrogen in the fruits, the percentage Albroonin in fruits, oil content, specific weight.2. The study showed that treatment with acid and Gibberellin and brassinolide and overlap between them led to a significant increase in the traits, at a spray 50 mg.L - 1 Gibberellin acid and concentration of 2 mg.L - 1 in most qualities and some of them at a concentration of 1 mg.L - 1 brassinolide the rest of the transactions.3. Screening and diagnosis chromatographic results showed the use of HPLC technique diagnosed six compounds in the volatile oil fruit plant varieties Dill are : (Anethol , Limonene , Carvone , Dillapiole , P - anisaldehyde and Linalool). Local variety was higher than the holand variety by giving it the highest concentration of the two active compounds are P - anisaldehyde and Linalool), especially when the spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid and 1 mg. L - 1 of brassinolide, while the superiority of the holand breed Local product by giving it the highest concentration of other active compounds which four : (Anethol , Limonene , Carvone and Dillapiole), especially at a spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid. and 2 mg. L - 1 of brassinolide.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد
Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة جزيئية ونسيجية مناعية للنساء المصابات بمرض سرطان الثدي في محافظة ذي قار,العراق == Molecular and Immunohistochemical Study in Women with Breast Cancer in Thi - Qar Province

Author name: هبة لفتة عبد الغالبي
Supervisor name: منال بادي صالح | مها شاكر حسن
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Breast cancer is a complex and multifactorial disease resulting in abnormal cell growth that leads to malignant tumor formation.In this study we focus on mutations of breast cancer susceptibility genes 1 and 2 (BRCA1 and BRCA2), immunohistochemical evaluation of estrogen, progesterone, HER - 2 receptors, ABO blood groups , white blood cells and clinicopathological parameter ( age, breast feeding, family history and tumor site) .Eighty five blood samples were taken from patients who attended Al - Hussain teaching hospital and oncology unit in Al - Habboby hospital during the period (from August /2014 to April /2015) , fifty blood samples were collected from healthy women as a control group who attended Al - Hussain teaching hospital and divided into groups according to age, family history, age at first brith, breast feeding. For histopathological and immunohistochemical analysis fifty tissue samples were collected from patients with breast cancer who were undergoing surgical resection (mastectomy). Blood samples were obtained by venepuncture , using a 5 ml disposable syringe , and they were divided into three aliquots, which were 1 ml, 2 ml and 2ml, for collect serum, genetic studies and hematological parameters (leucocycte count and ABO blood groups) study. The tissue samples were collected from the 50 patients with breast cancer for histopathological diagnosis and for Immunohistochemical analysis (estrogen receptor, progesterone receptor and here2/nue) The total patients were divided according to their age in to five groups (30 - 39), (40 - 49), (50 - 59), (60 - 69) and (≥70 years). results of present study revealed that a highest incidence of breast cancer (41%) occur in the age oup between 40 - 49 years, there is a significant difference among patients groups (P ≤ 0.01).The results of our study showed that (77) of patients lactating and from those according to period of lactation we found that the highest percentage of patients (37.6%) were lactating for period between (18 - 22months) and the lowest percentage (10.38%) lactating for period between (1 - 6 month). Family history of breast cancer indicates a strong association with risk of developing breast cancer. The result of the present study revealed that the family history positive in 31 cases (36.47%), and 54 cases (63.52%) had negative family history of breast cancer.The results of present study showed that (41.5%) had first birth at age (20 - 29years), (23.37%) had their first birth in age group (15 - 19 years) and (30 - 39 years), and (9.09%) had first birth at age (≥40 years).Regarding the tumor site, we found that most of patients (50.5%) the tumor mass was located in the right side and (38.8%) cases the tumor mass were located in the left side.The DNA was extracted from blood samples by using Accupower® genomic DNA extraction kit. Each concentration and purity of all DNA samples have been measured by Nanodrop. Samples with a purity ranged from 1.2 to 1.8 have been enrolled in this study for the molecular detection of BRCA1/2 gene mutation in patients and control groups. Detection of BRCA1/2 gene mutation by multiplex PCR revealed that (185 del AG mutation in BRCA1 gene) was detected in 6 patients (7.05%) out of 85 cases with breast cancer, and (5382 ins C) mutation in the same gene was detected in 2 patients (2.35%). Regarding (6174 del T) mutation in BRCA2 gene was detected in 3 patients (3.52%). While this mutation was not detected in the control groups.Histopathologically, carcinoma was divided into 44 cases (88%) ductal carcinoma {from which 42 cases (84%) were invasive ductal carcinoma, and 2 cases (4%) were comedocarcinoma}, and 6 cases (12%) cases invasive lobular carcinoma. Results revealed that 2 cases (4%) were stage I, 13 cases (26%) were stage II, 24 cases (48%) were stage III and 11 cases (22%) were stage IV, also our results showed that the 2 cases (4%) were grade I, 23 cases (46%) were grade II and 25 cases (50%) were grade III. The results of immunohistochemical analysis for breast cancer samples showed that Estrogen receptors were present in 36 cases (72%), and 14 cases (28%) were negative, while Progesterone receptors detected in 27 cases (54%), and 23 cases (46%) were negative, on the other hand the expression of HER - 2/neu showed positive results in 28 cases (56%), and 22 cases (44%) were negative.Regarding the ABO blood groups, we found that most of the cases carry blood group A (40 cases, 47.05 %), and the lowest frequency was for blood group AB (7 cases, 8.23%).The results of the present study showed that leukocytes count, lymphocytes count, monocytes count, neutrophils count and basophiles count were lower in patients than the control group, with a significant difference (p value ≤ o.o1). While the eosinophils count was significantly higher in patients than the controls (p value ≤ o.o1).

دراسة الهياة الكروموسومية لنوع من اسماك المياه العذبة العراقية سمكة ابو الزمير العميق Mystus pelusius == Karyotyping Study of one Species of Iraqi Freshwater Fish ( Mystus pelusius )

Author name: هبة حسين رسن
Supervisor name: اسماء سامي ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The fish has a great economic and environmental importance, however the cytogenetic studies on them still few, especially the chromosomal studies of local fish, therefore current study aimed to identify the karyotype (Chromosomal type and number) and the sex determination system to a species of Iraqi freshwater fish, which is Mystus pelusius (Solander in Russell, 1794) fish in Iraq, as (20) fish (10) male and (10) female were hunted from Tigris river in Al - Kraat area of Bagdad city.The current study was done to investigate the karyotype, where the chromosomal preparations has been preparing from kidney cells according to (air - drying technique).The results of the males and females kidney cells metaphase chromosomes study showed that the diploid chromosome number was 2n=32, which represents less chromosomal number recorded so far in the studied Iraqi fish, also the results showed that the males chromosomal types included 2n=(6m+13sm+7st+6t) and fundamental number FN=51, the females chromosomal type was 2n=(6m+12sm+8st+6t) and FN=50, also it observed that the first sub metacentric pair was the largest within the biarmed chromosomes.The results revealed that the male (heterogamety) and the female (homogamety), accordingly it follows the sex determination system (XX/XY), as the (X) chromosome represented by medium sized submetacentric (sm) chromosome and (Y) chromosome by small sized subtelocentric (st) chromosome.The results of Giemsa - banding technique (G - banding) showed that the rich regions with Guanine (G) and Cytosine (C) nitrogen bases called (G - light) bands and the rich regions with adenine (A) and thymine (T) called (G - dark) bands, thus it determined more accurately the sister chromosomes in Mystus pelusius males and females, more over thistechnique described sex chromosomes better, it has been observed that most chromosomes in both sexes have (G - light) bands, as all (uniarmed) (telocentric, subtelocentric) autosomes pairs entirely contain (G - light) bands, while in the (biarmed) (metacentric, submetacentric) autosomes chromosomes the light bands concentrated in their telomeres, while the rest regions of these biarmed chromosomes have dark bands. Results of (G - banding) technique confirmed which was shown by the traditional pigmentation method (Giemsa staining technique) about the sex chromosomes discrimination, where this technique showed more accurately and better that the male was heterogamety through a observation of medium sized submetacentric (X) chromosome with (G - light) bands in telomric position of (short arm), while the subtelocentric (Y) chromosome was the larger within the uniarmed chromosomes and it was marked by being entirely dark and lack of (G - light) bands, while it was observed in females a medium sized submetacentric (sm) pairs with (G - light) bands in the telomeric of long and short arms which represents (XX) sex chromosomes, and according to this the females considered to be homogamety and the males heterogamety, and proved that the sex determination system in Mystus pelusius fish was a simple sex determination system of (XX/XY) type

دراسة انتاجية البكتريوسين من بكتريا Enterococcus faecium المعزولة من مصادر سريرية == Study of the Bacteriocin production from Enterococcus faecium isolated From clinical sources

Author name: هاله عباس جاسم
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | شروق ريس كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 290 عينة سريرية من المرضى الراقدين والمراجعين لمستشفيات بغداد وتوزعت هذه العينات الى 177عينة ادرارو113 عينة خروج ، اظهرت نتائج الزرع البكتريولوجي على وسط المكورات المعوية الانتخابي Ej media ووسط المكورات المعوية التاكيدي Bile esculin azide agar والتشخيص المظهري والكيميوحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API 20 strep تشخيص 27عزلة(%9.31) من بكتريا Enterococcus faecium من عدد العينات الكلي ،وكانت 11 عزلة ( 6.21%) منهامن الادرارو16 %14.15)) عزلة من الخروج . اختبرت حساسية عزلات E.faeciumل11 نوع من المضادات الحيوية واظهرت النتائج مقاومة عالية لل Naldixic acid(81%)و (63%) TetracyclineوAmpicilin (52%)بينما كانت المقاومة لل Ciprofloxacin(48%)و(41%) Erythromycin .ومن الناحية الاخرى اظهرت العزلات مقاومة واطئة لل Penicillin (26%) وNitrofurantion (22%)و وVancomycin (18%)وكانت (19%)لل Trimethprim و(15%)Chloramphenicol. كانت (7%)فقط من العزلات مقاومةللGentamycin.اجريت تجارب التحري عن البكتريوسين من بكتريا E.faecium وكانت جميع العزلات منتجة (100%)ولمدى واسع من التاثير على البكتريا الموجبة والسالبة مع اقطار تثبيط (8 - 15 )مليمتر و(9 - 27)مليمتر على العزلات العائدة لنفس النوع . اختيرت العزلة EH(1) كعزلة كفوءة الانتاج مع فعالية نوعية 1.28 وحدة/مايكروكرام بروتين بتركيز بروتين 250 مايكروكرام /مليمتر بعد ان قيست الفعالية في العزلات(EH1,EH6,EH13) التي كانت افضل العزلات انتاجية للبكتريوسين بطريقة الاقراص. ووجد ان وسط Mann Regusa Sharp السائل والصلب هو افضل وسط لانتاج البكتريوسين من بكتريا E.faecium وان هذه البكتريا تنتج البكتريوسين في درجات حرارية بين 16 - 45 م ، واختيرت العزلة E3 والبكتريا Staphylococcus aureus, Staphylococcs epidermidis,Escherichia coli, Sallmonella كعزلات دالة ، استخلص البكتريوسين من العزلةE1 بصورته الخام بعد تنمية هذه العزلة على وسط Mann Regusa sharp السائل وتم الحصول على بكتريوسين ذي فعالية نوعية )1,28 وحدة / مايكرو كرام) بروتين وبتركيز بروتين 250 (مايكروكرام /مليلتر) وهذا البكتريوسين مقاوم للدرجات الحرارية (80,100، 121)م لمدة (15 و30 )دقيقة ، كذلك مقاوم لمدى من الرقم الهيدروجيني (8 - 2) ،ومقاوم للخزن في درجات حرارة (0،4 ،37) م لمدة (يوم ,اسبوع) . اجريت التنقية الجزئية للبكتريوسين الخام المستخلص من العزلة E1 بالترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع ( 40% و75% )واظهرت النتائج ان الترسيب بـ40%كان الافضل الذي بلغت الفعالية النوعيةفيه 44.137 وحدة/مايكروكرام بروتين وبتركيز بروتين 290 مايكروكرام/مليمتر . وكانت فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا ثابتةعند 80م لمدة 30 دقيقة و100 م لمدة (15,5)دقيقة لكن انخفضت فعاليته لتصل الى 0.8 )وحدة /مايكروكرام بروتين( في 30 دقيقة , وفقدت الفعاليةعند121م لمدة 15 دقيقة ، كانت الفاعلية ثابتة عند مدى من الرقم الهيدروجيني (8.5 - 5.5) والخزن عند صفردرجة مئوية لمدة اسبوع. | The study has involved collecting (290) clinical samples collected from admitted and refeard patients of Baghdad hospitals .The samples distributed into (177) urine sample and (113) faeces samples . Results from bacteriological culture on selective Enterococcus medium EJ medium , Enterococcus medium (bile esculin azide agar) in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20 strep system showed that only27 isolates (9.31%) were identified as Enterococcus faecium ,11 (6.21% ) isolate from urine samples and 16isolate (14.15% ) from faeces samples . The Antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecium isolates was tested towards 11 types of antimicrobial agents .The isolate showed a high resistance to Naldixic acid (81%) ,Tetracycline (63%) and ampicilin (52%) ,while (48%) of the isolate were resistant to Ciprofloxocin and (41%)resistant to Erythromycin . From the other hand Enterococcus faecium isolates showed low resistance to otherantimicrobial agent : Pencilin(26%),Nitrofurantion (22%) , Vancomycin (18%) and Trimethprim (19%) and Chloramphenicol (15%). Only(7%) of the isolates were resistant to gentamycin . Bacteriocin detection experments were carried on Enterococcus faecium and the results that all isolates were produce bacteriocin (100%) with wide range effect on gram positive and negative bacteria bacterial growth , with diameter (8 - 15)millimeter and (9 - 27)millimeter on the same isolates species ,EH1 isolate chosen as the best producer isolate bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration(250) microgram/ millimeter after the activity detected in isolates EH1,EH6,EH13 were the best bacteriocin production isolates by using disk method on the Mann Regusa Sharp agar . And founded the solid and broth Man Ragusa sharp medium was the best medium for bacteriocin production from E.faecium and this bacteria produce bacteriocin in tempreture degree between )16 - 45(C, E3isolate and the bacteria Salmonella ,Escherichia coli ,Staphylococcus aureus ,staphylococcus epidermidis chosen as indicating isolates, the bacteriocin extracted from E1in the crude form after growth this isolate on Mann Regusa Sharp broth and obtained on bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration (250) microgram /millimeter and this bacteriocin resistant for tempreture degrees 80,100,121 C for (15 ,30) minute also resistant to PH range (2 - 8) and resistant the storage in tempreture degree 0C,4 Cfor (day ,week). Then partial purification applied for this crude bacteriocin by precipitation with Ammonium sulphate of (40%,75%) saturation percentage .Results showed the precipitation in percentage 40% was the best with a specific activity reached in it to 44,137unit /migrogram protein and protein concentration 290 microgram/millimeter . The partial purified bacteriocin activity was stable at 80C for 30 minutes ,100C for( 5 ,15) minute ,but its activity decrease to reach to 0.8 unit/mg protein in 30 minute and lost activity in 121 C for 15 minute. Its activity was stable in PH (5.5 - 8.5) and storage at 0C for week

دراسة التاثير الخلطي لبعض المضادات الحيوية على فعالية المكونات الخلوية لبكتريا البروسيل == Study the effect of some antibiotics combination on the cell component activity for Brucella Spp

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل نوعين من بكتريا البروسيلا وتحديد انماطها الحيوية وهي البروسيلا المجــــــــــهضة (Brucella abortus)والبروسيلا المالطية (Brucella melitensis)المعزولة من الانسان . وتحديد حساسيتها لمضادات الحيوية وتــــــــحديد التركيز المثبط الادنىMIC))لبعض المضادات الحيوية المستخدمة في علاج داء البروسيلوسز Brucellosis)). فضلا عن التحري عن التاثير الخلطي لمضادات الحيوية وعند التراكيز تحت المثبطة الدنيا (sub - MIC)في نموها وعلى المكونات الخلوية المتمثلة بفعاليات انزيماتها, ونفاذية غشائها الخلوي ومكونات عديد السكرايد الشحمي المستخلص منها وعوامل التصاقها (Colony factor), فضلا عن تاثيرها في طور المستعمرات والتصاق خلايا البروسيلا على سطح الخلايا الطلائية . حيث اظهرت النتائج الاتي : • ان النمطين الحيويين السابع من البروسلا المجهضة والثالث من البروسيلا المالطية هما الاكثر انتشارا .• حساسية عزلات البروسيلا المجهضة والمالطية لكل من مضادات,Gentamicin,Kanamycin,Tobramycin,Naldixic acid .فيما قاومت مضادات,Lincomycin Rifampicin , Cephalaxicin ( وعلى التوالي .• بلغ التركيز المثبط الادنى لمضادات Doxycyclin ,Tetracyclin,Streptomycin ,Erythromycin ,Rifampicin (5,10,10,40,40) مكغم/مل وعلى التوالي • وجود تاثير تازري في نمو بكتريا عند خلط كل من مضاديDoxycyclin+Rifampicin,Erythromycin+Doxycyclin ,Erythromycin+Rifampicin,Tetracyclin+Rifampicin ,Tetracyclin+Erythromycin• غير مضاد Doxycyclin طور المستعمرات الملساء للبروسيلا الى طورها المتوسط فيما لم يوثر مضاد Rifampicin في طور المستعمرات فبقيت ملساء, وغير خلط مضاديDoxycyclin+Rifampicin طور المستعمرات الى الطور الخشن الفاقد للامراضية . • ثبط مضاديDoxycyclin+Rifampicin انتاج انزيمات Catalase ,Urease ,Oxidase ,Nitrate reductaseمن قبل البروسيلا المالطية والمجهضة عند استخدامها بصورة مفردة وخلطية • جاء التاثير الخلطي لمضادات Doxycyclin+Rifampicin تازريا في مكونات عديد السكرايد الشحمي عندما خفض نسبة المكونات السكرية والدهنية في مستخلص عديد السكرايد الشحمي بطوره المائي والفينولي لتبلغ المكونات السكرية للمستخلص(147,144) مكغم/مل للبروسيلا المجهضة بطورها المائي والفينولي وعلى التوالي و(145,138)مكغم/مل للبروسيلا المالطية وبطوريها المائي والفينولي . ومقارنة مع معاملة السيطرة(172,189) مكغم/مل بطوريها المائي والفينولي . اما المكونات الدهنية فبلغت لمستخلص البروسيلا المجهضة (60.6,56.5 )مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي ولمستخلص البروسيلا المالطية (44.4,36.3 )مكغم/مل وعلى التوالي لطوريها الفينولي والمائي ومقارنة بمعاملة السيطرة للبروسيلا المجهضة (82.1,77.3) مكغم/مل وللبروسيلا المالطية(92.1,64.6) مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي .• تبين قدرة كل من البروسيلا المالطية والمجهضة على تكوين عوامل الالتصاق بانواعـــــــــــها الثلاثة (CAF/I, CAF/II ,CAF/III), فضلا عن تكوينها لانواع اخرى من عوامل الالتصاق تم الكشف عنها وبطرائق محورة . كما استطاعت المضادات الحيوية المستخدمة خــــــــــلطا (Doxycyclin+Rifampicin )من منع خلايا البروسيلا عن تكوين هذه العوامل كافة.• اثر استخدام مضادي Doxycyclin+Rifampicinخلطا على خفض عدد خلايا البروسيلا الملتصقة بسطوح الخلايا الطلائية مسببا خفض اعدادها لتبغ معدل عدد الخلايا للبروسيلا المجهضة 6, وللبروسيلا المالطية 3 مقارنة بمعاملة السيطرة 51 و55 وعلى التوالي .• تسبب معاملة البروسيلا بمضاديDoxycyclin+Rifampicin خلطا خللا في نفاذية غشائها الخلوي السايتوبلازمي ونضوحا لحامضها النووي عندما بلغ طيف الامتصاص حامضها النووي(2.21,2.33) لكل من البروسيلا المجهضة والمالطية وعلى التوالي ومقارنة بمعاملة السيطرة(0.72,0.73). | Two types of Brucella isolated from human included Br. abortus and Br. melitensis were determine there biotype, Antibiotic sensitivity and MIC for some antibiotic used for brucellosis treatment were applied.mixed affect of antibiotics at concentrations of sub MIC on the growth and on cellular containt of brucella represented by enzymatic activity, cellular membrane permeability lipopolysaccharide contents,colony phase,colony adhesion factor beside adhesion on epithelial cells to brucella.the results showed that biotype 7 from Br.abortus and biotype 3 from Br. melitensis were the dominant isolated. All isolated of Br . abortus , Br. melitensis sensitive completely to gentamycin, kanamycin ,tobramycin, naldixic acid while its resistantto lincomycin ,rifampicin ,cephlothin , doxycyline The MIC to doxycycline,tetracycline,streptomycine,erythromycine,rifampicin were ( 40 , 40 , 10 , 10 ,5 ) g/ml respeactivelly.There was a synergistic effect on bacterial growth when the following antibiotics mixed as follow : ( doxycyline - rifampicin , erythromycin - rifampicin , rifampicin - tetracycline , erthromycin - tetracycline )The doxycycline had changed the colony from smooth phase to intermediate phase while the rifampicin had not affect the smooth phase . The mixed affect of doxycylin _ rifampicin have changed the smooth colonies to rough colonies .Both doxycyline , rifampicine inhibited the activity of catalase , urease , oxidase , nitrate , reductase that produced by Br. abortus and Br.melitensisThe synergistic effect of doxycycline and Rifampicin on the content of lipopolysaccharide.The mixed effect of antibiotic caused a decrase in the polysaccharides in aqueous and phenolic phases .In this case it gave a values (144,147) g/ml for Br. abortus and (138,145) g/ml for Br. melitensis in comparison with contral with read to(172,180.1) g/ml to aqueous and phenolic extraction respeactivelly. While the lipid content showed value of (60.6,56.5) g/ml for Br. abortus and (44.4,36.3) for Br. melitensis in comparison with control that gave a values (82.1,77.3) g/ml for Br. abortus and (92.1,64.6) for Br. melitensis in aqueous and phenolic phases respeactivelly .Both Br.abortus and Br. melitensis had ability to from colony adhesion factor(CAF/I,CAF/II,CAF/III) in addition to another colony factors(i.e CAF/III) that had modified due to presence of tannic acid. The mixed effect of doxycycline - Rfampicin inhibit the formation of these factor.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin causesd a decrase of brucella adhesion on the epithelial cell surface.The average of Br. abortus (6) and Br. mlitensis(3) in comparison with control 51,55 cell/filed respectively.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin caused a defeact in cytoplasmic membrane permeability hance the absorbance of Naldaxic acid a values 2.21,2.33 for Br. abortus and Br.melitensis in comparison with acontrol that showed avalues 0.72,0.73 respectivelly.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

Author name: نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

ترافق بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض السكري النمط - 1 للانسان == Association of some human blood groups and antibodies with type - 1 diabetes

Author name: نور عبد الاله خليل حسين
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 126 نموذجا لمرضى السكري النمط ـ1 (T1D) Type - 1 Diabetes قورنت بـ 100 نموذجا لاصحاء مقاربة بالعمر والجنس مع المرضى. اهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم A وB وO وAB وLe(a+b - )وLe(a - b+) وLe(a - b - )و MMوMN وNNوSS وSsوss فضلا عن دراسة عيارية الاضداد للمرضى والاصحاء اذ استعملت طريقة تنميط مجموعة الدم ABO وLewis وMNSs واستعمل فحص تثبيط التراص لتحديد قابلية الافراز للنمط Le(a - b - ). جاءت النتائج لتشير الى زيادة ملحوظة في تردد مجموعة الدم O ، اذ كانت 39.68% في المرضى و28% في الاصحاء (مربع كاي 7.097 وباحتمالية P<0.01 ). فيما صاحب تردد مجموعة الدم A انخفاضا ملحوظا في المرضى فكان 20.63% اما في الاصحاء فكان 37% (مربع كاي 6.159 واحتمالية P<0.05) .اما مجموعة الدم B فظهرت بتردد 28.57% في المرضى و23% في الاصحاء (مربع كاي 3.615 واحتمالية P<0.05). وانخفض تردد مجموعة الدم AB انخفاضا طفيفا في المرضى عنه في الاصحاء ، اذ كان في المرضى 11.11% و12% في الاصحاء وبفرق غير معنوي (مربع كاي 0.804).ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض ، اذ بلغ ترددها في المرضى 30.95% فيما كان في الاصحاء 21% واشار التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية لهذا الفرق (مربع كاي 5.882 واحتمالية P<0.05). واظهرت المجموعة Le(a - b - ) دورا هاما في قابلية الاصابة بالمرض وبتردد بلغ 18.25% في المرضى و11% في الاصحاء (مربع كاي 4.604 واحتمالية P<0.05). في حين اظهرت المجموعة Le(a - b+) دورا مقاوما للمرض.وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 وذلك بارتفاع تردد الفارزين عن غير الفارزين ، فقد كان في المرضى 69.56% على حين كان في الاصحاء 45.45% وبمعنوية عالية (مربع كاي 11.601 واحتمالية P<0.01). اما مجموعة غير الفارزين فاظهرت مقاومة للاصابة بالمرض.لقد برز دور مجموعة الدم MNSs في المرض ، اذ بلغ تـردد المجمـوعة MN في المرضى 55.55% مقارنة بالاصحاء 41% (مربع كاي 6.377 واحتمالية P<0.05). وقد لعبت المجموعة Ss دورا في المرض وبتردد 23.80% في المرضى مقارنة بتردد 11% في الاصحاء (مربع كاي 7.067 واحتمالية P<0.01)، على حين كانت بعض مجاميع دم MNSs مقاومة للمرض. درست عيارية الاضداد للانماط الدموية تحت الدراسة وقد لوحظ من نتائج الدراسة وجود ارتباط بين بعض المجاميع الدموية وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب Anti - rabbit red blood corpuscles antibodies في مصول مرضى السكري النمط ـ1 مقارنة بالاصحاء اذ استعمل اختبار التحري عن عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب. كان النمطين A وAB اكثر الانماط اظهارا لعياريات عالية ، اذ بلغت في المجموعة A 1949.5 ± 938.7 . اما في المجموعة AB قد كانت 1940.6 ± 1331.3 مقارنة بالاصحاء والتي بلغت 1487.6 ± 1237.5 في المجموعة A و714.7 ± 510.4 في المجموعة AB وكان التحليل الاحصائي ذا شان (قيمة T 35.844 واحتمالية P<0.01) و(قيمة T 167.78 وباحتمالية P<0.01) على التوالي.ان المجموعة Le(a - b+) ارتفعت فيها عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب ، اذ بلغت 1852.9 ± 948.7 في المرضى و1387.3 ± 1192.1 في الاصحاء (قيمة T 51.802 واحتمالية P<0.01).اما عيارية النمط Le(a+b - ) اذ بلغت 1824.8 ± 979.6 في المرضى و1091.1 ± 1088.8 في الاصحاء (قيمة T 40.816 وباحتمالية P<0.01).على حين كانت العيارية للنمط Le(a - b - ) هي 1444 ± 1069.6 في المرضى و1198.6 ± 742.6 في الاصحاء (قيمة T 63.470 وباحتمالية P<0.01). درس مورث الافراز Secretory gene بالنسبة الى عيارية الاضداد، قد كان غير الفارزين ذو عيارية ضادة لكريات دم الارنب عالية مقارنة بالفارزين اذ بلغت في المرضى 2052.6 ± 1557.2 مقارنة بالاصحاء البالغة 1386.7 ± 794.9 (قيمة T 172.65 واحتمالية P<0.01).اما ما يخص مجموعة الدم MNSs ، فقد اظهر النمط MN عيارية مرتفعة والبالغة 1815.3 ± 962.9 وقد افترقت عن مثيلاتها في الاصحاء فكانت 1379.9 ± 1142.5 (قيمة T 162.09 واحتمالية P<0.01).كانت المجاميع O وLe(a - b - ) وLe(a+b - ) ومجموعة الفارزين والانماط MN وSsاكثر Relative risk للمرض اذ بلغت خطورتها النسبية 1.4 و1.7 و1.5 و1.5 و1.4 و2.2 على التوالي. | A total of 126 type - 1 diabetics and an age and sex comparable 100 healthy subjects were studied . The study dealt with finding the frequency of ABO , Lewis , MNSs blood groups in these subjects , besides the frequency of secretors and non - secretors were investigated.Further more , the anti - rabbit antibody immune response among diabetic and healthy subjects was investigated .The frequency distribution of ABO showed the followings :  A significant increase in O - blood group distribution was recorded : 39.68% in patients versus 28% in control (Chi2 7.097 , P< 0.01 ) . A significant decrease in patients A - blood group frequency was seen 20.63% in patients versus 37% in control (Chi2 6.159 , P<0.05 ) . A slight increase in B - blood group frequency in patients was observed (28.57%) compared to control (23%) (Chi2 3.615 , P< 0.05 ) . Likewise , AB - blood group showed a frequency of 11.11% in patients compared to 12% in the control .On the other hand , the frequency distribution of Lewis blood group showed : Le ( a+ b - ) Patients frequency was 30.95% versus 21% in control (Chi2 5.88 , P<0.05 ) . while Le ( a - b - ) gave a patients frequency of 18.25% versus 11% in control ( Chi2 4.6 , P<0,05 ) .Le ( a - b+ ) demonstrated a resistant distribution compared to control .The fraction of secretors among Le ( a - b - ) gave 69.56% versus 45.45% in healthy controls ( Chi2 = 11.6 , P<0.01 ) .The frequency distribution of MNSs blood group showed a role of MN , giving a frequency of 55.55% versus 41% in control (Chi2 = 6.37, P<0.05). Likewise , Ss gave a frequency of 23.80% versus 11% in control (Chi2 = 7.06 , P<0.01 ) .Nonetheless , some MNSs genetic types showed a decreased frequency in diabetics compared to controls .The immunological findings showed that there was an association between blood groups and anti - rabbit red blood cell antibody titers . A and AB were among the groups that gave an increase anti - rabbit red blood cell titers . The mean titer in A was 1949.5 ± 938.7 versus 1487.6 ± 1237.5 ( T 35.8 , P<0.01 ) , while the mean titer in AB was 1310.2 ± 646.3 in patients versus 714.7 ± 510.4 in controls (T 167.78 , P < 0.01).A statistically significant increase in anti - rabbit antibody titers was seen in Le ( a+b - ) and Le ( a - b - ) Lewis blood groups compared to controls .MNSs blood groups genetic types gave an increase in mean MN anti - rabbit antibody titers 1815.3 ± 962.9 versus 1379.9 ± 1142.5 ( T = 162.09 , P<0.01 ) .The relative risk in all blood groups was recorded O , Le ( a - b - ) , Le ( a+b - ) , secretors , MN and Ss showed a relatively increase risk giving a relative risks of 1.4 , 1.7 , 1.5 , 1.5 , 1.4 and 2.2 respectively .The novel findings were discussed based on the available data in the subject

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

Author name: نور شكيب محمد
Supervisor name: ضمياء محمود ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

دراسة مناعية عن علاقة فايروس الخلية العملاقة للمرضى المصابين بسرطان الفم == Immunological study of relation of Cytomegalovirus in patients with Oral Cancer

Author name: نور الهدى علي عبد الحسين سعيد
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعد حسن محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة كبحث باثر رجعي حيث تم اخذ (70) عينة من الانسجة الفموية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البرافين ، جمعت هذه النماذج من ارشيف الانسجة لمختبرات فرع الانسجة والامراض في كلية طب الاسنان / جامعة بغداد . حيث تعود هذه العينات للفترة بين 1998 - 2008.قسمت هذه العينات النسيجية الفموية الى مجموعتين : - مجموعة تضم (60) عينة اخذت من سرطانات الانسجة الطلائية الحرشفية للتجويف الفمي بينما ضمت المجموعة الاخرى (10) عينات نسيجية خالية من الامراض حسب الفحص النسيجي المرضي كنماذج سيطرة.تم تحليل هذه العينات، اخذين بنظر الاعتبار العمر، الجنس، موقع النسيج المصاب، والتمايز النسيجي، ثم صبغت جميعها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين للتشخيص النهائي.كما تم اجراء التشخيص الجزيئي لدنا فايروس الخلية العملاقة في الخزعات النسيجيه قد انجزت بواسطة جيل حساس ومتقدم من التقانة الاحيائية الجزيئية التي لها قابلية التحديد داخل الخلية للاحماض النووية.امتدت هذه الدراسة لتشمل دراسة نسيجية - مناعية بواسطة التصبيغ المناعي لتحديد انتشار البروتين المنتج من الجين المنشط للسرطان ( p53) ، كذلك لتحديد المستضد الموجود على سطح الخلية اللمفاوية نوع(T ) والمسمى (CD8 ) .مجمل النتائج المستحصلة من هذه الدراسة قد صنفت كالاتي : - كانت اعمار المرضى المصابين بسرطان الانسجة الحرشفية الفموية تتراوح بين (10 - 92) سنة وبمتوسط عمري (56،4) سنة . اعلى نسبة شخصت كانت بالفئة العمرية (45 - 75) سنة ، شكلت سرطانات اللسان النسبة الاعلى بين سرطانات الفم الحرشفية كما شكلت ايضا النسبة الاعلى من النتائج الموجبة لفيروس الخلية العملاقة البشري وانتشار بروتينp53 وكذلك للخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ). اكثر من 80% من حالات سرطانات الفم كانت جيدة التمايز، ضمن سرطانات الفم الحرشفية ، 26 عينة اظهرت نتائج موجبة لفايروس الخلية العملاقة البشري بواسطة التقنية الاحيائية عالية الحساسية ( التهجين بالموقع).مثلت هذه النتائج 43،3% من مجموع سرطانات الفم الحرشفية الخاضعة للتحري، في حين من بين المجموعة نفسها ، 55% (33 عينة من اصل 60) اظهرت نتائج موجبة لفحص انتشار بروتين p53 و18،3% (اي 11 عينة من اصل 60) اظهرت نتيجة موجبة لفحص الخلايا اللمفاوية التائية ( CD8).بينما لم يتم تسجيل اي نتيجة موجبة لفايروس الخلية العملاقة ، انتشار بروتينp53 والخلايا اللمفاوية التائية (CD8 ) ضمن مجموعة السيطرة. سجلت حالات ظهور مشترك لانتشار بروتينp53 الطافر مع دنا فايروس الخلية العملاقة في (18،3%) ومع الخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ) في (10%) بينما سجلت هذه الدراسة حالات ظهور مشترك للخلايا اللمفاوية التائية السامة مع فيروس الخلية العملاقة وطفرة الجينp53 في (1،7%) من سرطانات الفم الحرشفية | This study was designed as retrospective study . A total number of seventy (70) formalin - fixed paraffin - embedded oral tissues that were collected from archives of oral Histology and Histopathology department of Dentistry College/University of Baghdad, during the period from October 2008 till April 2009. All the samples are related to the period between 1998 - 2008.These oral tissue blocks were divided into two groups. A group included sixty (60) tissue blocks with histopathologic diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). And another group included ten (10) tissue specimens that were taken from histopathologically healthy oral tissues.All these tissues were analyzed according to age, sex, site and histological grading.Histopathological sections were made for those oral biopsies and stained by hematoxylin and eosin stain for definitive histologic diagnosis.Molecular detection of cytomegalovirus (CMV - DNA) in those tissue blocks were performed by using highly sensitive version of in situ hybridization (ISH) technique.This research work has further perform immunohistochemical study to demonstrate the prevalence of p53 overexpression. This study also was extended to determine the phenotype of cell surface antigen marker, namely CD8+ marker of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal anti bodies to this CD marker.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with oral SCC ranged from (10 - 92) years with mean of (56.4) years. The highest percentage was diagnosed in the age stratum of (45 - 75) years , the tongue was the most commonly affected site by OSCC. And also represents the major site for CMV infection , p53 gene mutation and CD8 positive - phenotyping results.More than 80% of the OSCC have well - differentiated grade , among oral SCC group, 26 archival tissue blocks showed positive - ISH reactions for CMV - DNA by sensitive version of ISH . This constituted 43.3% of the total screened oral SCC tissues.Thirty - three out of sixty oral SCC showed 55% positive IHC reaction indicating p53 overexpression, and 18.3% (11 out of 60) showed positive IHC reaction pointing for presence of CD8 +ve tumor infiltrating lymphocytes. While , none of those tissues in the histopathologically healthy control group showed reaction for CMV - DNA, p53, or CD8 marker.The co - occurrence of mutated - p53 overexpression with positive CMV infection was localized in (18.3%), whereas co - occurrence of p53 gene mutation and CMV infection along CD8 - positive tumor infiltrating lymphocytes in OSCC were documented in (1.7%) of these cancerous specime

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

دراسة كيمياوية وبايولوجية لبعض مركبات الايض الثانوي المستخلص من اوراق نبات البشملة L. Eroibotrya japonica المستزرع في العراق == Chemical and Biological Study of Some Secondary Metabolism Compounds Extracted from Bashmala Eriobotrya Japonica L. leaves Cultivated in Iraq

Author name: نعم حيدر جواد سعيد الجوهري
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study containes the extraction and detection some of active compounds in the leaves of Eriobotrya japonica L. and testing the activity of crude extract as an antibacterial and food preservation. Methnol was used in crude extraction and also CC , TLC ,HPLC techniques were used in qultitive and quantative amount of some flavonoid ,terprnoid and phenolic compound .The well in agar to study the effect of crude on Staphylococcus aurus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria in 200 ,100, 50 and 25 mg /ml concentrations , In addition to study of effect of the extraction on meat at 200 mg /ml concentration . The ruselts show that Alcholic crude extract contains flavonoid ,terprnoid and phenolic compounds and the chlororform was the best solvent in separating those compounds . Through the use TLC and HPLC , it was possible to separate terpenoids (Oleanolic acid , ursolic acid , maslinic acid) , flavonoids (Qurcetin, Kaempferol ,Rutine ) and phenolic compounds (Benzoic acid ,caffeic acid ,chlorogenic acid). The results show the high activity of leaves crude extract of Eriobotrya japonica L . in 200 mg /ml concentrationthat is used as a food preservation in minced beef meat. The results also show significant differences at (P<0.05) in Thiobarbutric acid ,Total violate nitrogen measurement ,total bacterial account , and psychrotrophic bacteria account ,AS for the value of PH was governor compared with standard control. The concentrations of cruds extract showed an Antibacterial activity where Staphylococcus aureus where 15 and 26 mm by using 100 and 200 mg/ ml concetrations respectively .furthermore,The crude extractshowed an efficiency as antibacterial agains Escherichia coli with 13and 15mm inhabition zone ; and also Salmonella typhmurium with 14 and 19mm inhabition zone by using 100 and 200 mg / ml concentration , respectively compared with standard control . The ruselts show that minimum inhibitory concentration of the cruds extract agains Staphylococcus aureus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria was 100 mg / ml compared with standard control .

مستويات الرصاص في الدم لسكان بغداد والعوامل المؤثرة على ذلك == Levels of Blood Lead in Baghdad Inhabitants and Factors Affecting Them

Author name: نضال ياس يعقوب
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الرصاص عنصرا" طبيعيا" يتواجد في القشرة الارضية ويستعمل على نطاق واسع في الطلاء والكازولين والبطاريات والعلب المعدنية وبعض الاواني الخزفية. ويتعرض الناس الى الرصاص عن طريق الغبار الملوث ورقائق الطلاء والاطعمة الملوثة..شملت الدراسة 80 شخصا من العاملين في الشركة العامة للبطاريات في الوزيرية والذين يتعرضون للرصاص اضافة الى 10 اشخاص غير متعرضين ( مجموعة السيطرة). تم تحديد مستوى الرصاص في دم الاشخاص المذكورين كما درست معايير الدم لديهم اذ شملت فحوصات الدم : مستوى خضاب الدم (Hb)،حجم الدم المضغوط(pcv)،عدد كريات الدم الحمر(RBCs)،متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا(MCHC) ومتوسط حجم الخلايا(MCV). تم اختيار عينة مؤلفة من (38) شخصا من المتعرضين الذين كان مستوى الرصاص لديهم عالي حيث يبلغ (41.4 مكغم/100 مل) مع انخفاض ملحوظ في مؤشرات الدم الاخرى فكان معدل تركيز هيموكلوبين الدم (12.75 غم / 100 مل) اما مدى النسبة المئوية لحجم الدم المضغوط فقد كان (39.4 غم/100 مل) ومعدل عدد كريات الدم الحمر (5 مليون / مم3) ومعدل متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا بلغ (30.9 غم/100 مل) ومعدل متوسط حجم الخلايا بلغ (77.1 فمتولتر) . تمت دراسة تاثير الرصاص على هذه المجموعة من خلال تدوين المعلومات الخاصة في الاستمارة الاستبيانية وكانت اهم هذة التاثيرات على جهاز الخصوبة في الذكور وتاثيرات على الجهاز البولي وظهور عدد من حالات فقر الدم وحالات من السعال والصداع والاجهاض لدى السيدات والم في المفاصل .و من جانب اخر فقد تم تقسيم عينة المتعرضين الى عدة مجاميع حسب : - 1) الجنس : اذ تم تقسيم العينة الى مجموعتي الذكور والاناث اذ كان معدل تركيز الرصاص في دم الذكور اعلى اذ بلغ(35.2 مكغم/100 مل) اما الاناث فقد بلغ (32.2 مكغم/100 مل) . وظهرت معدلات اقل بالنسبة لمؤشرات الدم الاخرى .2) حالة التدخين : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتي المدخنين وعددهم (36) شخصا والثانية غير المدخنين وعددهم (44) شخصا وكان هناك تقارب في نتائج مستوى الرصاص في الدم للمجموعتين.3) للفئات العمرية : فقد تم تقسيم العينة الى اربع مجاميع فقد ظهر اعلى مستوى لتركيز الرصاص للفئة العمرية (41 - 50) سنة مع انخفاض في مؤشرات الدم الاخرى.4) حسب المهنة : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتين وهما العاملين من داخل الشركة العامة للبطاريات (بابل 1، بابل 2) في الوزيرية والعاملين في المعامل الاهلية المنتشرة في مدينة بغداد .و من الملاحظ وجود علاقة عكسية بين تراكيز الرصاص ومعايير الدم مثل مستويات خضاب الدم والنسبة المئوية لحجم الدم المضغوط وعدد كريات الدم الحمر ومتوسط تركيزهيموكلوبين الخلايا ومتوسط حجم الخلايا. | Lead is one of the natural elements exist in the crust of the earth, and widely used in the coating , gasoline, batteries, tin cans and some ceramics. Usually people are exposed to lead through the polluted dust, coating pieces and polluted food.In 1987 using lead in gasoline has been denied in developed countries but it is still used in the developing countries. One of the causes of the mental retard in children and being behind their colleagues in behave and learn is sedimentation of lead in brain tissues because the children have more ability to absorb lead than adults.Also women and pregnant face increased hazard as a result of lead exposure which negatively affect the fetus and may lead to infertility. Lead absorption also results in many diseases and effects in human body such as : sever anemia, sever and chronic lung inflammation, increase kidney failure among children and adults, and immunity system breakdown. If the lead level was over (75 μg/dl) these people would have a failure in the reproductive system as a result of having atrophy in the testis with inability to product sperms.A study have been performed to estimate the lead level in the blood of Baghdad inhabitations in order to know its effect on the workers' health who exist in polluted places, and exposure effects on the hematological indications such as : total hemoglobin, percentage of Packed Cell Volume (PCV%), Red Blood Cell count, Mean Cell Hemoglobin Concentration (MCHC), and Mean Cell Volume (MCV). 80 workers who are exposed to lead working in the General Company for Battery in Al - Wazeria in addition to other workers from private companies in Baghdad and other 10 persons who are not exposed to lead as the control group, all have been chosen as samples for the study. a sample of 38 exposed persons have been chosen who have high lead level in their blood which was about (41.4 g/100ml) with a significant decrease in the other hematological indications; the Blood Hemoglobin Concentration average was (12.75 gm/100ml), the percentage of Packed Cell Volume average was (39.4%), the Red blood cell count average was (5 million/mml3), and the mean cell hemoglobin concentration average was (30.9 gm/100ml), mean cell volume average was (77.1 FL).Lead effects on this group had been studied through recording the data in questionnaire forms, and the most important effect was on the male fertility system, effects on urinary system, anemia, coughing, headache, miscarriage, and ache in the joints. In the other hand the sample of the exposed persons had been classified into groups according to : - 1 - Gender : - the sample had been classified into 2 groups : male and female, where the lead concentration was higher in the male blood which was about (35.2 mg/100ml) and about (32.2 mg/100ml) in the female blood, in addition to less hematological indications.2 - Smoking case : - the sample had been classified into 2 groups : smokers about (36)persons and nonsmokers about (44)person, the study showed similarity in the results on lead level in the blood of both groups.3 - Age : - the sample had been classified into 4 groups, the higher lead level appeared in age group (41 - 50), with decrease in the other hematological indications of the rest. It is clear that there is a slight relation between lead concentrations and hematological indications such as blood hemoglobin, mean packed cell volume, red blood cell count, mean cell hemoglobin volume and mean cell volume.

تاثير مستخلصات اوراق العنب والخروع والبصل في بعض عوامل استعمار انواع بكتريا التهاب الاذن الوسطى في الانسان == Effect of Grape leaves, Caster bean and Onion extracts in some colonization factors of bacterial species isolated from otitis media in human

Author name: نضال عبد الامير علي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 80 مسحة من المرضى المصابين بالتهابات الاذن الوسطى( Otitis media) المراجعين للعيادة الخارجية في مستشفى الصدر العام في بغداد وللفترة من تشرين الثاني 2007 وحتى كانون الثاني 2008. زرعت المسحات على الاوساط الزرعية (اكار الدم واكار الماكونكي) لعزل البكتريا وتشخيصها باستخدام الاختبارات المجهرية ،و الزرعية واالكيموحيوية . امكن الحصول على 69 عزلة بكتيرية من المجموع الكلي (83) وشخصت بكونها تابعة الى الانواع الاتية : (33) عزلة وبنسبة (39.75 %) Pseudomonas aeruginosa ، (11)عزلة (13.2 % ) aureus Staphylococcus ، و(8) عزلات (9.6 %) epidermidis Staphylococcus و(8) عزلات (9.6 %) Proteus mirabilis و( 5 ) عزلات(6.02 % ) تعود الى Klebsiella pneumoniae و(4) عزلات ( 4.8 %) Escherichia coli، في لم تظهر ( 14) مــسحة بنسبة ( 16.86 %) اي نمو بكتيري . اظهرت النتائج ان الاصابات المفردة هي السائدة عندما بلغت نسبتها( 96.2 %) ،بينما بلغت الاصابات المختلطة ( 3 ) اصابات فقط بنسبة (3.7%). كانت نسبة الاصابات في الاناث (57.2%) اكثر منها في الذكور (42.5 %) فيما سجلت اعلى نسبة للاصابة في الفئة العمرية (اقل من سنة - 10 سنوات) .كما تبين ان الاصابة المزمنة بالتهابات الاذن الوسطى هي اكثر شيوعا من الاصابة الحادة . لدى اختبار حساسية العزلات البكتيرية الى (18) مضادا حيويا ، اظهرت نتائج وجود مقاومة تامة (100%) لبكتريا Ps.aeruginosa ضد كل من Carbenicillin ، Doxycyclin وCeftizoxime في حين كانت حساسة جدا لمضادات Amikacin وImipenem وCiprofloxacin سوى عزلة واحدة ،اما الانواع العائدة للعائلة المعوية فكانت Pr.mirabilis وبكتريا E.coli مقاومة بنسبة (100%) لمضاد Doxycyclin دون غيره وعزلات K.pneumoniae مقاومة وبنسبة (100%) لكل من Doxycyclin وGentamycinو Pipracillin ، وكانت جميع عزلات Staphylococcus spp. مقاومة كليا Methicillin وبنسبة (100%) فيما قاومت مضادات Penicillin وAmpicillin وCloxacillin بنسب اقل . انتخبت العزلات البكتيرية وحسب شدة ضراوتها ومقاومتها للمضادات الحيوية التي شملت Ps.aeruginosa وaureus S.و Pr.mirabilisو K.pneumoniaeو E.coliلدراسة تاثير المستخلصات المائية الباردة لثمار البصل واوراق كل من الخروع والعنب في نمو العزلات ،فقد اظهر مستخلص البصل فعالـية ضد Ps.aeruginosaو aureus . Sو E.coliوعند التراكيز (750 , 1000 ,1250 ,1500 ) ملغم /مل ،عندما بلغ قطر منطقة التثبيط لكل من بكتريا aureus . Sو Ps.aeruginosa وE.coli عند تركيز 750 ملغم /مل (13 , 12 , 11) ملم وعلى التوالي . واظهر مـــستخلص اوراق الــخروع فـعاليــة ضـــد Ps.aeruginosa وaureus S. وE.coli وK.pneumoniae عند التراكيز (250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل حيث بلغت اقطار مناطق التثبيط عند التركيز 1000 ملغم /مل 15.66 , 16.33 , 16.33 , 15.33 ) ) ملم وعلى التوالي . في حين اظهر مستخلص اوراق العنب فعالية ضد جميع الانواع البكتيرية المختبرة وفي التراكيز(250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل ، عندما بلغت اقطار مناطق التثبـــــيط عند التركيز 1000ملغم/مل لكل من بكتريا aureus. S وPr.mirabilisو Ps.aeruginosaو E.coli وK.pneumoniae (32 ,21.3 , 20.6 , 18.6 , 14.3) ملم وعلى التوالي . وكان المستخلص المائي البارد لاوراق العنب هو الاكفا في تاثيره مقارنة بمستخلصات البصل واوراق الخروع . تم اختبار قابلية الانواع البكتيرية المنتخبة على الالتصاق على الخلايا الطلائية قبل وبعد المعاملة بالتركيز تحت المثبط الادنى للمستخلصات النباتية، فقد اظهر التركيز تحت المثبط الادنى للبصل تاثيرا مثبطا للالتصاق الانواع Ps.aeruginosa وaureus . Sو E.coli عندما قلل عدد الخلايا البكتيرية الملتصقة من ( 56.8 , 48.9 , 24.7 ) وعلى التوالي ليصبح (11.6 , 08 21 , 15.3)على التوالي. اظهر مستخلص اوراق العنب تاثيرا مثبطا لالتصاق الانواع المختبرة Ps.aeruginosaو aureus . Sو Pr.mirabilis وK.pneumoniaeوE.coli عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة بعد المعاملة بالمستخلص ( 12.8, 14.8, 8.3 , 16 ,12.8 ) وعلى التوالي ،اما مستخلص اوراق الخروع فقد قلل عدد الخلايا الملتصقة للانواع Ps.aeruginosa وaureus S. وK.pneumoniae وE.coliمن (56.8 , 48.9 ,46.8 ,24.7) لتصبح ( 7 , 13.6 ,4.2 ,4.5) وعلى التوالي ، كان هذا المستخلص الاكفا لتثبيط التصاق الخلايا البكتيرية بالخلايا الطلائية . | Eighty swabs were collected from patients suffering from otitis media who attended Al - sader hospital in Baghdad during November 2007 to January 2008. Swabs were cultured on blood agar and MacConkey agar media to isolate bacteria and to diagnose by microscopic cultural and biochemical testes. Ninety six isolates were isolated and identified to species as follows : (33) isolates (39.75)% were Pseudomonas aeruginosa, (11) were S.aureus with a ratio of (13.2)% and (8) isolates with a ratio of (9.6)% were S.epidermidis .(8) isolates with ratio (19.6)% were Proteus mirabilis, while (5) isolates were Klebsiella pneumoniae with a ratio of ( 6.02) % and (4) isolates with ratio (4.8)% Escherichia coli, However (14) swabs with a ratio of (16.86)% with no growth. Results showed that the infections by a single pathogen were the dominant was reached 96.2%, while the mixed infection was only (3.7)%. The infection in female were 57.2% , while in male were 42.5%. However ,the high percentage of infection were observed within the age range of less than year to ten years . Morever the chronic infection with otitis media were more dominant than the acute infection. Sensitivity of the isolates towards (18) antibiotics were performed. The results showed complete resistance (100%) of Pseudomonas aeruginosa to Carbenicillin, Doxycyclin and Ceftizoxime, while they were sensitive to Amikacin, Imipenem and Ciproflaxcin , except one isolate. Proteus mirabilis and Escherichia coli isolates were (100 )% resistant to Doxycyclin, while Klebsiella pneumoniae isolates were completely resistance (100%) to Doxycyclin , Gentamycin and Pipracillin. All Staphylococcus spp. isolates completely resisted Methicillin (100%) , but resisted Penicillin , Ampicillin , Cloxacillin at less ratios. Bacterial isolates which included Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae ,E.coli were chosen according to their virulence factors and resistant to the antibiotics , to be used for studying the effect of cold - water extracts of Allium cepa (Onion) ,Ricinus communis leaves(Caster bean) and Vitis vinifera leaves(Grape) on bacterial growth ,and adherence to epithelial cells of human . Allium cepa extracts showed activity against Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli at concentration of (750, 1000, 1250, 1500)mg/ml when the diameter of inhibition zones for S.aureus , Ps.aeruginosa, E.coli at (750)mg /ml were (13 ,12 ,11)mm, respectively . The Ricinus communis leaves extracts showed activity against Ps.aeruginosa , S.aureus , E.coli and K.pneumoniae at concentration of ( 250, 500, 750, 1000)mg /ml with diameters of inhibition zones at 1000mg/ml (15.33 ,16.33 ,16.33 ,15.66) mm , respectively. While Vitis vinifera leaves extracts showed activity against all tested bacterial species in concentrations of (250 ,500 ,750 ,1000)mg/ml with inhibition zones at 1000mg/ml concentration for S.aureus, Pr.mirabilis, Ps.aeruginosa, K.pneumoniae, E.coli (32 ,21.3 ,20.6 ,18.6 ,14.3) mm , respectively . Result showed that the cold - water extract of the Vitis vinifera leaves was the most efficient in its effects on bacterial species in comparison with Allium cepa and Ricinus communis extracts . The ability of chosen bacterial isolates for adherence before and after the treatment with sub - minimum inhibition concentration of plant extracts showed the sub - MIC for Allium cepa extract reduced the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli when the adhered bacterial cells decrease from (56.8 ,48.9 ,24.7) to be (11.6 , 21.08 ,15.3) , respectively. Vitis vinifera extract showed inhibition effect on the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae and E.coli when the average of adhered cells after the treatment with the extract were (12.8 , 14.8 , 8.3 , 16 , 12.8) , respectively . Ricinus communis leaves extracts decrease numbers of the adhered cells of Ps.aeruginosa , S.aureus , K.pneumoniae , E.coli to epithelial from ( 56.8 , 48.9 , 46.8 , 24.7) to be ( 7 , 13.6 , 4.2 , 4.5) , respectively
1 ... 289 290 291 292 293 ... 465