Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 11,619

ارتباط الدهون وهرمونات الغدة مع التغاير في مورث ABCA1 لمرضى السكري من النوع الثاني في محافظة المثنى == Association between Lipids and Thyroid Hormone Profiles with ABCA1 Gene Polymorphism for Type - II - Diabetes Mellitus Patients in AL - Muthanna Province

Author name: شيريهان عبد الحسين مهدي ا لبياتي
Supervisor name: طالب عبد الحسين موسى
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

دراسة تاثير مستخلصي ازهار نبات القيصوم داخل وخارج الجسم على الخصوبة في ذكور الفئران == In vivo and in vitro Study on the Effects of Achillea millefolium Flower Extracts on Fertility in Mice Male

Author name: ضفاف يوسف يعقوب بطي
Supervisor name: Khulood Al-Sameraei | Mohammed A. Ibrahim
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

دراسة بكتريولوجية ووراثية للاغشية الحيوية على العدد الطبية

Author name: داليا صلاح مهدي عباس
Supervisor name: حسن فاضل ناجي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:

التوصيف الوراثي لبعض عوامل ضراوة بكتريا E.coli المعزولة من اخماج المسالك البولية == Genotypic Characterization of someVirulence factors inE.coli isolated from UTI

Author name: عميدة علي عطية العبيدي
Supervisor name: وعد محمود رؤوف | كركز محمدثلج
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:

دراسة التاثيرات السمية لمبيد الادغال كولدتوبيك (80EC (في بعض اعضاء سمكة البعوض Gambusia holbrooki (Girard,1859)

Author name: طيبة نجم حسن
Supervisor name: مها عبد النبي الغريري
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تعدد النمط الوراثي للجين GSTT1,GSTM1 في الاطفال العراقيين المصابين بمرض السكري النوع الاول == Genetic Polymorphism of (GSTM1, GSTT1) Gene in A sample of Diabetes Mellitus type1 in Iraqi children

Author name: سهام مجيد محمد
Supervisor name: بتول علي شهاب | رافد علاء جاسم
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Type1 diabetes mellitus uncommon problem in Iraq which increase incidence of effected young age groups ,and its regards one of the multifactorial disorders with genetics and environmental factors playing important role in its cause and pathogenesis ,complication, prognosis.In diabetes, the defects in cellular metabolism especially hyperglycemia results in increasing free radicals. These radicals react with other vital cellular molecules which are responsible in diabetes side effects. Human glutathione S - transferees (GST) are a family of enzymes that catalysis conjugation of electrophilic substances with glutathione. In this research the deletion and expression of two of the most important genes of this family; GSTT1 and GSTM1 genes was investigated as the risk factor for type1 DM and control of the disease glycated hemoglobin (HbA1c), body mass index (BMI) as ( indicators of diabetic control), in relationship to the age , gender , age of the onset, duration of the disease, and also study of 10 parents of type1 DM to demonstrate the genetic role of GSTs genes in the disease.Forty four type1 DM patients were enrolled (23M & 21 F) and compared with 42 non diabetic counterparts matching with age and gender as regards as control group.Deletion of GSTM1 and GSTT1 genes was observed in (3) diabetics’ patients as compared with control group 3/44 (6.8%), 0/42 (0%) respectively . Also this percentage was increased, 8/11 (72.73) 1/11 (9.09) in the poor control type1 DM (HbA1c < 10), while in the underweight 5/10 (50%), 6/10 (60%) are Significant Correlation between GSTM1 null / GSTT1 present genotype, also study showed more incidence in the male than female patients.There are increase incidence of the expression and deletion of GST genes with aging, chronicity of disease, glycemic control, family GST gene states , and BMI.The type1 DM had effect on the GST states according to the gender, age , age of onset and duration of the disease .

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية == Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

Author name: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
Supervisor name: اخلاص مشرف عیدان | علي حسین ادحیة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

توصيف جزيئي للخلايا الجذعية المتحفزة لتكوين خلايا عصبية == Molecular Characterization of Stem Cells that Induce Neurogenesis

Author name: مائده حسين محمد
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Animal - Molecular Biology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The in vitro isolation, identification, differentiation, and neurogenesis characterization (with molecular studies by conventional and real time - PCR) of stem cells source were investigated to produce two type of stem cells. This two types including neural cells and neural stem cells in culture which use it as a successful sources for further treatments. And finally chosen the best medium formula for maintenance the produced neural stem cells, also to prove their stemness state in culture. The mouse bone marrow mesenchymal stem cells was used as the source of stem cells in this study. Two type of neural differentiation formula was used to induced neural cells and then neural stem cells. The first formula was butylated hydroxyanisole, and the second formula was β - mercaptoethanol reagents. Also three type of different neural stages markers were used; nestin as immaturation stage marker, neurofilament light - chain as early neural marker, and microtubule association protein as maturation marker. These markers were represented the different neurogenesis stages started from mesenchymal stem cells (as undifferentiated cells), neural stem cells production stages, and towards neuron cells (as differentiated cells).The results of immunocytochemistry and real time - PCR of butylated hydroxyanisole differentiation method showed that in contrast to mesenchymal stem cells (as control group), neural differentiated cells showed neural progenitor pattern, by showing stable increased in nestin gene expression significantly through differentiation process for different exposure time, with increased of protein expression significantly compared with control. While, neurofilament light - chain gene and protein expression started to increase significantly, but not - IIreplacedthe nestin expression completely even when its expression passed nestin levels compared with control group. In contrast to the maturation marker microtubule association protein which showed a very low expression during the duration of differentiation period in protein and gene expression (with significant effect) compared with control. This results proved that the cells were still progenitors and do not passed the maturation stage, therefore there was a difficult to define the exactly time of neural stem cells production stage from this formula and as a good formula to produce neuron cells in culture. In other side, the results of immunocytochemistry and real time - PCR of β - mercaptoethanol (as another differentiation formula) were showed that this formula was successful to produce both neural stem cells as well as neuron cells from this formula. This occur through increasing and over expressing of nestin protein and gene significantly within the early hours exposure time reaching to the highest expression levels. Compared with decreased and lower expressed in neurofilament light - chain protein and gene expression levels compared with control; therefore from this stage (exposure time) we can produce neural stem cells in culture. And then decreased and lower expressed of both protein and gene expression of nestin significantly compared with increasing the expression of neurofilament light - chain protein and gene levels throw the late exposure times compared with control, this results indicated that this stage was starting of maturation stage toward neuron cells. Also the proving of this results was lower expression levels of almost all exposure times of microtubule association protein for their protein and gene (with significant effect).The results of gene expression analysis of using four different media formulas to proved the stemness state and maintained the neural stem cells in culture showed that 6 h exposure to β - mercaptoethanol was enough to create - IIIneuralstem cells which maintained using MEM media with 5% FBS, with b - FGF, or with b - FGF &EGF. This study confirms that the molecular characterization study of stem cells in culture will assist to studying and clarifying the neurogenesis pathway through neural differentiation process, by clarified the mechanisms of neural genes through the in vitro differentiation of stem cells, and therefore ability to produced both neuron cells and neural stem cells by using the molecular studies.

التراكم الحيوي للهيدروكربونات في الكتلة الحية لبعض بطنية القدم الارضية والمائية في مدينة بغداد == Bioaccumulation of Hydrocarbons in the Biomass of Some Terrestrial and Aquatic Gastropods in Baghdad City

Author name: زهراء احمد شاكر
Supervisor name: عماد الدين عبد الهادي المختار
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the present study, the concentrations of total petroleum hydrocarbons (TPHs) in tissues and shells of the aquatic and terrestrial gastropods (Melanopsis nodosa and Monacha cantiana) were evaluated.Samples were collected from six sites within Baghdad city which was divided into two sectors, a northern sector and a southern sector whereas each was represented by sampling sites of aquatic and terrestrial habitats to best represent the area affected by hydrocarbon residues.Samples of sediments, soils and snails (collected once every two months for the period from November 2014 to May 2015) were analyzed by using Gas Chromatography (GC). The levels of TPHs ranged between (0.14 - 2.58) μg/g in sediments and soils, between (0.21 - 3.48) μg/g in snail tissues and between (0.10 - 2.65) μg/g in snail shells.The concentrations of TPHs in the biomass of aquatic and terrestrial snails showed significant seasonal variations and strongly dependent on the amount of TPHs in the surrounding media. The concentrations of TPHs in snail biomass were below the permissible limit recommended by world health organization (WHO).The physical and chemical properties of the river water and soil recorded several values ranged between 12.4 - 24.4ºC, 10.0 - 23.7ºC, 705.0 - 1016.0 μs/cm, 344.0 - 1050.0 μs/cm, 7.2 - 8.2, 8.3 - 8.8, 81.3 - 164.0 mg/L, 125.0 - 188.0mg/L, 7.1 - 10.2 mg/L, 2.2 - 5.3 mg/L, 16.53 - 25.42% and 1.46 - 2.84% for water temperature, soil temperature, electrical conductivity of water, electrical conductivity of soil, hydrogen ion concentration in water, hydrogen ion concentration in soil, calcium ion concentration in water, calcium ion concentration in soil, dissolved oxygen, biological oxygen demand, soil moisture and soil organic matter respectively in study area.The study showed a significant positive correlation between TPHs concentration in snail biomass and hydrogen ion concentration in water, electrical conductivity of soil, soil moisture and soil organic matter. Besides, a significant negative correlation was detected between TPHs concentration in snail biomass and water and soil temperature and calcium ion concentration in water and soil.

امكانية تحفيز بعض الطحالب المعزولة محليا لانتاج الوقود الحيوي == Possibility of stimulation of some locally isolated algae for production of biofeul

Author name: ثائر محمد ابراهيم العكيلي
Supervisor name: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
General topic: Biology
Specific topic: plant - aquatic life
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the current study, samples of algae have been collecting from( Springs , Streams and Rivulets)including in northern of Iraq (the area on the Iraqi - Iranian and Turkish borders, and from the middle in the areas of (Tarmiya and Alabegi) several races of used algae in biofuels such as : Scendesmus spp , S . quadricouda , S . Dimorphus,Chroococcus sp. ,Chlorococcum humicola , Microcystsp. , Asterococcus sp. ,Chlorella sp , Oscillotoriasp. , Anabena sp , Nostoc. sp. , Ankistrodesmus falcatus.diagnosed , were isolated and prepared pure cultures of Asterococcus sp. , S dimorphus, C.humicola and were selected three culture medium (BG11, Chu13, Chu10)for culturing and development of these algae under controlling conditions (2 ± 25 ° C, intensity of illumination 3000 Lux and 8 : 16 light : darkness system).Experiments include three axes, the first representing the study of the influence of media - type and installed in curves and growth rates (K) and doubling time(G) and estimate the biomass of the tested algae, in addition to monitoring the effectiveness of the quality of the medium in the chemical content of algae and of (total of lipids, proteins, carbohydrates content and fatty acids). A second include the treatment are (remove nitrogen from the media, addition NaCl with 2 g.l - 1, addition of vitamins mixture (B1, B6, B12) in the following concentrations (0. 1, 0.1, 0. 01) mg .l - 1, respectively and change the current speed (as a mixing factor) of 400 and 850 l. h - 1). Third axis include the efficiency of the Photobioreactor system test (Tubular Photobioreactor named( I.TH.1) designed by a researchers for the purpose of comparison between culturing in bottles and the possibility of the application of expandingproduction in the reactor system of 120 liters, for testing C. humicola in Chu13media.The results showed that the highest growth rate recorded in BG11 for Asterococcus sp, was 0.343 cells . day - 1 depending on the absorbance values at of 650 nm wavelength, while the highest rate depending on the number of cells scored in Chu13 after the addition of vitamins mixture for C.humicola was 1.16 cells .day - 1, while the lowest growth rate(K) scored in Asterococcus sp, In Chu10 after the removal of nitrogen and reached 0.04 cells . day - 1, as less doubled time(G) scored when Chu13 after the addition of NaCl to Asterococcus sp, and reached 1.12 day depending on the absorbance values, while less doubling time(G) was relying on the number of cells in C.humicola in Chu13 after the addition of vitamins and amounted to 0.257day.The highest doubled time(G)13.7 and 15.05 day was scored in BG11 after removing N2 form culture medium of Asterococcus sp, depending on the absorbance values and the number of cells respectively. The highest biomass value recorded at Asterococcus sp with current speed 400 l.h - 1 and amounted to 0.724 mg .g - 1 dry weight,while the less biomass0.203 mg.g - 1 dry weight at the same algal after the addition of NaCl to Chu10 .The highest value of total lipids recorded at removing nitrogen from the Chu13 inS.dimorphus amounted 320.8 mg . g - 1 (dry weight) while it was less than at the C.humicola in control. As Chu10 recorded the highest percentage of total lipids was registered at S.dimorphus in BG11 after removing nitrogen and stood at 81.48%. The lowest percentage was registered with C.humicola in Chu10 amounted to 32.49%.The highest amount of total proteins , when Asterococcus sp developed at current speed of 400 l . h - 1 in Chu13 amounted to 299.7 mg . g - 1 (dry weight), while the least value was registered at S.dimorphus amounted to 8.9 mg . g - 1 in BG11 - free of nitrogen. While recorded the highest percentage of total proteins when Asterococcus sp, after the addition of NaCl to BG11media and amounted to 51.17%, while the lowest percentage was registered to the same alga after removing nitrogen from the BG11 and amounted to 5.7%.Results prepared that the highest amount of total carbohydrates, was recorded in the S.dimorphus when the velocity of 400 l . h - 1 and amounted to 63.09 mg . g - 1 (dry weight), and the least amount was registered in Asterococcus sp in Chu10 after the addition of vitamins. While the highest percentage recorded for carbohydrates in S.dimorphus in control BG11 reached 41.67%,and the lowest percentage was in Asterococcus sp at Chu10 after the addition of a mixture of vitamins and stood at 4.65% .When the follow - up impact of the transactions used in the experiments in quality and quantity of fatty acid (Luric, Palmetic, Stearic, Lionoleic, α - liolenic, Oleic, Archidic, DHA), we find that the the final concentrations have varied significantly, recorded acids Luric, Palmetic, Stearic higher concentrations when Asterococcus sp. In Chu13 after the addition of NaCl first and, second and was 46.7, 381.27 mg . l - 1, respectively, while the acid Stearic amounted to 117.0 mg . l - 1 after removing nitrogen from BG11. While α - linoleic, Linoleic asid recorded the highest amount it reached 188.3, 22.7mg.l - 1 when Chu10 after the addition of vitamins and at the speed of 400 l . h - 1, respectively, for Asterococcus sp, As Oleic, Archidic, DHA acids recorded the highest amount in C.humicola amounted to 125.08, 131.8,175.65 mg .l - 1 , at the current speed of 400 l . h - 1 in the first and second acides, when BG11 after removing nitrogen, DHA acid,as in terms of percentages acids, we find that the current study showed the highest percentage of Linoleic, Luric amounted to 39.69, 84.9% at the control Chu10 and Chu13 after treatment with vitamins respectively in Asterococcus sp.While DHA Oleic, α - linoleic, Stearic acids recorded highest percentage reached to 43.39, 44.25, 46.71, 46.85%, respectively, in S.dimorphus in BG11control , after treatment with vitamins to Chu10and after the addition NaCl toBG11respectively . As Archidic, Palmetic acids recorded the highest percentage in C.humicola amounted to 28.42, 62.6%, respectively, in BG11control and the speed 850 l . h - 1.the highest amount of saturated fatty acids S.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 951.7 mg . l - 1 after the addition NaCl to Chu13 .The highest percentage was registered at the same alga 92.5% in Chu13control. Current studie also recorded the highest amount of unsaturated fatty acid U.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 488.2 mg .l - 1 when adding vitamins to Chu10, while the highest percentage recorded in S.dimorphus amounted to 91.79% when adding NaCl to BG11.I n applying the experience of the test reactor, the photobioreactor of 120 liters and choosing alga C.humicola inChu13 and 400 l .h - 1, we find that the system I.TH.1 has given the results and the differences were not significant in terms of impact on growth rates and the doubling time of replication when compared with the first and second controls(Chu13 represent first control sized 150 ml and the process to shake once a day and the second control mixing factor 400 l . h - 1 in 3 - liter size). In terms of the impact of I.TH.1 on the biomass it has increased significantly when the first control while non - significant differences were recorded for the second control at the level of probability (P≤ 0.05) either when the effect in the chemical content of the total of studied alga, we find it recorded 199.6, 200.5, 198.2 mg . g - 1 of total lipids and 218.5, 214.3, 185.9 mg . g - 1 of total proteins and 147.7, 165.1, 143.2 mg . g - 1 of total carbohydrates in the first , second control, I.TH.1respectively. These results show no significant differences between the results of I.TH.1 and education in bottles laboratory. either at the level of the quantity and quality of fatty acids, we find that there is variation in the results as recorded all the fatty acid was significantly higher for the first control except Luric acid which disappeared from the second control and I.TH.1 , while there was a significant decrease in α - Liolenic, Olice, Archidic acids. While I.TH.I recorded an increase in Palmetic, Linolic, DHA acids compared with the second control, with the advent of acidic Myrestic and Stiric in the system and the disappearance in two controls, That shows the importance of the use of these bioreactors in the biofuel production studys.

تعدد الاشكال للنيوكليوتيدة المفردة لبعض الحركيات الخلوية في مرض المعي الالتهابي لدى مرضى عراقيين == Single Nucleotide Polymorphisms of some Cytokines in Inflammatory Bowel Disease of Iraqi Patients

Author name: ابتسام بداي حسان الكناني
Supervisor name: بتول علي شهاب | علي حسين ادحية
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Inflammatory bowel disease (IBD) is a world healthcare problem that involves two major forms : Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Immunogenetic predisposition is one of the risk factors for the disease, and cytokines are among these factors. Therefore, the association between 13 SNPs (single nucleotide polymorphisms) of cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IFNG, TNF and TGFB1) and IBD was determined in samples of Iraqi Arab patients (34 CD and 66 UC). The patients were referred to the Gastrointestinal Tract Unit at Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Yarmouk Teaching Hospital and Al - Zuafrania General Hospital in Baghdad for diagnosis and treatment during the period August 2013 - October 2014. A control sample of 43 individuals was also included.The following results were reached by the study : 1. Interleukin - 1 alpha gene (IL1A - 889) : frequencies of CC genotype and C allele were significantly increased in CD (58.8 and 73.5%, respectively) and UC (54.6 and 71.2%, respectively) patients compared to controls (25.5 and 40.7%, respectively). In contrast, TT genotype and T allele frequencies were significantly decreased in CD (11.8 and 26.5%, respectively) and UC (12.1 and 28.8%, respectively) patients compared to controls (44.2 and 59.3%, respectively).2. Interleukin - 1 beta gene (IL1B - 511) : Frequency of TC genotype was significantly increased in UC patients compared to controls (63.6 vs. 39.5%; P = 0.018), while CC genotype frequency was decreased (6.1 vs. 32.2%; P = 0.061). No variation was observed in CD patients.3. Interleukin 1 receptor type 1 gene (IL1R1pstl 1970) : Frequencies of TT genotype and T allele (47.1 and 67.7%, respectively) were significantly increased (P = 0.026 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients compared to controls (20.9 and 34.97%, respectively). In contrast, CC genotype (11.8 vs. 51.2%) and allele C (32.4 vs. 65.1%) frequencies were significantly decreased (P = 2.8*10 - 4 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients. For UC, the patients demonstratedgnificant increased frequencies of TC genotype (48.5 vs. 27.9%; P = 0.045) and T allele (63.6 vs. 34.9%; P = 5.1*10 - 5) compared to controls. As in CD, UC patients also demonstrated significant decreased frequencies of CC genotype (12.1 vs. 51.2%; P = 1.7*10 - 5) and C allele (36.4 vs. 65.1%; P = 8.6*10 - 5).4. Interleukin 2 gene (IL2+166) : Among CD patients, frequencies of TT genotype (41.2 vs. 6.9%) and T allele (64.7 vs. 43.0%) were significantly increased in patients compared to controls (P = 0.001 and 0.009, respectively). In contrast, TG genotype (47.1 vs. 72.1%; P = 0.035) and G allele (35.3 vs. 56.9%; P = 0.009) frequencies were significantly decreased. Almost, similar observations were made in UC patients.5. Interleukin 4 gene (IL4 - 590) : it was observed that frequencies of TT genotype (52.9 vs. 11.6%; P = 1.2*10 - 4) and T allele (70.6 vs. 24.4%; P = 1.6*10 - 8) were significantly increased in CD patients compared to controls. In contrast, CC genotype (11.8 vs. 62.8%, P = 5.6*10 - 6) and C allele (29.4 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased. In the case of UC, frequencies of TC genotype (69.7 vs. 25.6%; P = 1.1*10 - 5) and T allele (62.1 vs. 24.4%; P = 4.6*10 - 8) were significantly increased in patients, while CC genotype (3.0 vs. 62.8%; P = 2.5*10 - 12) and C allele (37.9 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased in patients.6. Interleukin 4 receptor gene (IL4R+1902) : frequencies of GG genotype (47.1 vs.11.6%) and G allele (55.9 vs. 37.2%) were significantly increased in CD patients compared to controls (P = 0.001 and 0.023, respectively). In contrast, GA genotype (17.7 vs. 51.1%; P = 0.004) and A allele (44.1 vs. 62.8%; P = 0.023) frequencies were significantly decreased. In UC patients, frequencies of GG genotype (57.6 vs. 11.6%) and G allele (75.8 vs. 37.2%) were significantly increased (P = 1.0*10 - 6 and 1.9*10 - 8, respectively); while frequencies of AA genotype (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5) and A allele (24.2 vs. 62.8%; P = 1.9*10 - 8) were significantly decreased.7. Interleukin 6 gene (IL6+565) : Comparing patients to controls revealed that GG genotype frequency was significantly increased in CD (70.6 vs. 13.9%; P = 1.5*10 - 8) and UC (69.7 vs. 13.9%; P = 4.4*10 - 7) patients, and a similar increased frequency of G allele was observed. In contrast, the GC genotype frequency was significantly decreased in CD (23.5 vs. 76.7%; P = 3.7*10 - 6) and UC (24.2 vs. 76.7%; P = 7.0*10 - 6) patients.8. Interleukin 12B gene (IL12B - 1188) : Frequency of A allele was significantly increased in CD patients compared to controls (67.7 vs. 47.7%; P = 0.015), while C allele was significantly decreased (32.4 vs. 52.3%; P = 0.015). For UC, the heterozygous genotype AC showed a significant increased frequency in patients compared to controls (66.7 vs. 30.2%; P = 3.6*10 - 4), while CC genotype frequency was significantly decreased (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5). 9. Interferon gamma gene (IFNG+874) : The AT genotype showed a significant increased frequency in CD patients compared to controls (58.8 vs. 30.2; P = 0.020), while TT genotype frequency was significantly decreased (11.8 vs.39.5%; P = 0.009). For UC, AA genotype (54.6 vs. 30.2%; P = 0.018) and A allele (74.2 vs. 45.4; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly increased in patients. In contrast, TT genotype (6.1 vs. 39.5%; P = 2.8*10 - 5) and T allele (25.8 vs. 54.7%; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly decreased. 10. Tumor necrosis factor alpha gene (TNF - 308) : Comparing CD patients to controls revealed no significant variation, while UC patients demonstrated a significantly (P = 0.006) increased frequency of G allele (71.2 vs. 52.3%) and a decreased frequency of A allele (28.8 vs. 47.7%). 11. Interleukin 1 receptor antagonist (IL1RNmaspl 11100), interleukin 10 gene (IL10 - 1082) and Transforming growth factor beta (TGFB1codon 25) genes : Comparing patients to controls revealed no significant variations in genotype or allele frequencies.The presented results of the 13 cytokine SNPs in CD and UC patients are the first report in Iraqi patients, and their findings highlighted the role of these SNPs in etiopathogenesis of both groups of IBD, and paved the way for further investigations to determine the role cytokine gene polymorphisms in susceptibility to IBD or their protective effects.

مقارنة تشريحية ونسيجية مظهرية وهرمونية للجهاز التناسلي الانثوي في الدجاج والبط == A Comparative Study of anatomical histomorphometrical and hormonal in Genital Tract between Hens and Ducks

Author name: ياسمين عبد الامير كاظم
Supervisor name: هناء حنين منكلو | صباح عبد الحميد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في البيت الحيواني التابع لقسم علوم الحياه كليه العلوم ، في الجامعه المستنصريه ولمدة ثلاثة اشهر من 15 سبتمبر - 15 ديسمبر 2013. ووكان الهدف من هذه الدراسة هو دراسة مقارنة لثلاثة اهداف اساسيه هي التشريحية والنسيجية والهرمونية في الجهاز التناسلي الانثوي بين الدجاج والبط الناضج وغير الناضج جنسيا. تم استخدام اثني عشرمن اناث الدجاج الغير ناضج والناضج جنسيا مقابل اثني عشرمن اناث البط الغير ناضج والناضج الذي وصل مرحله النضج الجنسي ، وتم تقسيمها الى اربع مجموعات ( 6 في كل مجموعة) وفي البحث تم تحقيق ثلاثة اهداف : الهدف الاول ( تشريحي ) : ان الجهاز التناسلي الانثوي في الطيوريتكون من مبيض وقناه البيض ، المبيض : هو كتلة متعرجة فاتحه اللون خاملة نسبيا قبل سن البلوغ وبعد النضج الجنسي يتضاعف بدوره الى مايشبه العنقود وذلك لانه مؤلف من مجموعة من الحويصلات ذات اقطار مختلفة تتراوح ما بين 40 ملم الى مكروسكوبيه صغيره ،كان طول ووزن المبيض في الدجاج غير ناضج وكان (12.49±0.33 ملم ,0.37 ± 0.01 غم ) على التوالي وكان الفرق معنويا على مستوى (p ˂ 0.01) عن الدجاج الناضج ( 49.64± 0.27 ملم , 47.22 ± 0.70 غم) على التوالي وايضا كان في البط غير الناضج(17.58± 0.12 ملم ,0.37± 0.11 غم ) على التوالي ، ولكن في البط الناضج لوحظ زيادة معنويه كبيرة (p ˂ 0.01) التي كانت ( 44.0± 0.86 ملم ،16.89 ± 0.21 غم ) على التوالي . اما قناه البيض فهي انبوبه عضليه ذات جدران مطاطيه مختلفه السمك تكونت من نسيج عضلي يحرك القناة حركه دوديه مستمرة وتكونت من خمس مناطق تختلف اطوالها باختلاف وظائفها ,حيث ان الطول والوزن والعرض في المناطق الخمسة من قناة البيض كانت للدجاج والبط الناضج اعلى وبفارق معنوي عالي (p ˂ 0.01) عن غيرالناضجة في كلا من الدجاج والبط. ولكن في الدجاج الناضج كانت القياسات الثلاثه للطول والعرض والوزن اعلى وبفرق معنوي(p ˂ 0.01 ) مما في البط الناضج .الهدف الثاني ( النسيجي ) : المبيض تالف من القشرة والنخاع حيث احتوت القشرة على العديد من الحويصلات المبيضيه التي كانت في مراحل مختلفة من النمو وهي البدائية الاولية، الحويصله الثانويه والثالثيه والناضجة طبقة وطبقة من النسيج الطلائي المكعب البسيط ، واما بالنسبة الى قناة البيض اليسرى ففي مرحله قبل البلوغ كانت رقيقة ومستقيمه وغير متمايزة بشكل جيد .واما عند وصولها للنضج الجنسي فان قناة البيض اصبحت متمايزة بشكل جيد الى خمس مناطق ( القمع ، المعظم ، البرزخ ,الرحم والمهبل ) .القمع تالف من منطقتين متمايزتين احدهما قمعية الشكل رقيقة شفافه تواجه المبيض لالتقاط البويضه وتمتازباختفاء الطيات والغدد . في حين ان الجزء الاخرهو منطقه انبوبيه ضيقة ذات جدار سميك قليلاو يمتاز بوجود طبقة من الطيات تتخللها الخلايا الافرازية العمودية التي استندت على النسيج الليفي ، اما الجزء الثاني فهو المعظم (منطقه افراز الالبومين)والذي افرز باربع طبقات من الالبومين طبقتين من الزلال الخفيف وطبقتين من الزلال الكثيف والتي افرزت من نوعين من الغدد الانبوبيه وغدد وحيده الخلية على التوالي حيث هذه الاخيره توجد داخل طيات واسعه ومتشعبه والتي لوحظت في معظم كلا من الدجاج والبط الناضج وطبقة من النسيج الطلائي العمودي البسيط وكذلك طبقة العضلات الملساء للمعظم هو اكثر سمكا ومرتبه بشكل واضح في طبقات محددة مما كانت عليه في القمع واخيرا طبقه مصليه، وتلتها منطقة انتقالية بين المعظم والبرزخ وتسمى هذه المنطقة(منطقة غير الغديه) والجزء الثالث البرزخ الذي تالف من منطقتين متمايزتين على اساس مظهره الفيزيائي الطبيعي الظاهر للعين قاصيه ودانيه ويعتمد على اساس نوع الخلايا الافرازيه واما نسيجيا فانه تالف من الغشاء المخاطي ذا نسيج طلائي العمودي مع وجود الطيات الابتدائية والثانوية ، ذات الغدد الانبوبيه الكبيره الحجم والعدد ووظيفتها افراز الاغشيه الرقيقه الداخلية والخارجية التي تحيط بالصفار وتدعم الغدد هذه نسيج يتكون من طبقه ليفيه وعائيه . الجزء الرابع الذي يلي البرزخ هو الرحم وكان مؤلفا من منطقتين اولاهما تكون راسيه انبوبيه قصيره ومنطقه ذيليه شبيهه بالكاس ذات جدران عضليه سميكه حيث لوحظ في رحم البط الغير ناضج طيات مؤلفة من نسيج طلائي عمودي مخاطي افرازي ومدعم بنسيج ليفي وعائي اما في رحم البط الناضجة فقد ظهرت طيات كبيره من نسيج طلائي عمودي غير افرازي تدعمه طبقة عضلية ملساء دائرية داخلية سميكة وطبقة عضلية طولية خارجية اما الجزء الخامس والاخير من قناة البيض فهو المهبل والذي يصل قناه البيض بالمجمع فقد ظهر شكليا كانبوب عضلي سميك قصيرمكون من طيات طولية قصيرة. ونسيجيا تكون من طبقة من النسيج الطلائي العمودي الكاذب وتخللته خلايا افرازيه في الطيور البالغة وغير البالغة نظرا لان وظيفة المهبل هي للخزن وليس له دور في تكوين البيضة .اما الهدف الثالث (الهرموني) فقد اظهرت النتائج انه عندما وصلت الطيور مرحلة النضج الجنسي حدث تحفيز للمبيض لافراز هرمون الاستروجين وبالتالي ارتفع معدل الدهنيات وترسيب الدهون في صفار البيض في الحويصلات الناميه وكانت النتائج زيادة كبيرة في مستوى هرمون الاستروجين في بلازما الدم في البط مقارنة مع الدجاج على مستوى معنوي جدا ( (p ˂ 0.01في كل وقت من اوقات عملية وضع البيض ، ولكن ، على العكس من ذلك هرمون البروجسترون في بلازما الدم كان مستوى الهرمون في الدجاج اعلى على مستوى معنوية من البط (p ˂ 0.01 ) في كل وقت من اوقات وضع البيض ، وايضا تركيزات هرمون التستوستيرون في الدجاج كانت اعلى مما عليه في البط على مستوى معنوية (p ˂ 0.01).اما نتائج قياس الهرمونات في البط غيرالناضج فقد اظهرت ان مستوى هرمون الاستروجين يزيد زياده معنوية كبيرة بفارق معنوي (p ˂ 0.01)مما عليه في الدجاج غير الناضج ، ولكن كان مستوى البروجسترون في الدجاج الغير الناضج اعلى مما هو عليه في البط غير الناضج وعلى مستوى معنوية عالي (p ˂ 0.01).ومن هذا نرى انه كان للهرمونات دور هام اثناء عملية التبويض والتي تم على هذا الاساس قياسها وعلى هذا الاساس ومما اظهرته النتائج كانت هناك علاقة قوية بين النتائج التشريحية والتغيرات النسيجية ومستويات الهرمونات اثناء مرحلة النضج الجنسي مقارنة مع هذه المعايير قبل النضج الجنسي . | The present study has been carried out in the animal house of Biology Department, College of Science, Al - Mustansiriya University for three months from 15 September to 15 December 2013. The aim of this study is to make a comparative study of anatomical, histological and hormonal on genital tract between immature and mature hens and duck. Six immature and six mature female hens versus six immature and six mature female ducks ,have been housed into four groups : 1 - Anatomical : the reproductive system in fowls consist of ovary and left oviduct, ovary is a mass of light - colored herringbone inert before puberty and after sexual maturity turn into a cluster of vesicles of different diameters ranging from 40 mm microscopic small size, the differentiations between the length of immature and mature ovary in hens and ducks were 12.49 ± 0.33 mm ,17.58 ± 0.12 mm respectively . while the mature ovary of hens and ducks were 49.64 ± 0.27mm, 44.00 ± 0.86 mm respectively. The weights of immature ovary of hens and ducks were 0.37 ± 0.01 gm,0.73 ± 0.11 gm respectively while the weight of mature ovary of hens and ducks were 47.22 ± 0.7 gm ,16.89 ± 0.21 gm respectively. The left oviduct consist from five regions its parameters different according to its function . Moreover, that the length, weight and width of the parameters of five regions of oviduct were significantly differences (p˂0.01) between immature and mature hens and duck. Noticed, that increases from immature parameters to mature ages in hen and duck. But in hens showed higher significant differences (p˂0.01) in most parameters. 2 - Histological : the ovary consists from cortex which contains numerous follicles in different stages of development that are classified as primordial primary, secondary and tertiary follicles in mature hens and duck as a layer of simple cuboidal epithelium, Moreover, the left oviduct only in ages of immature hens and duck were thin and straight and not well differentiated tube. In ages of mature hens and duck the oviduct become well differentiated into five distinguishable regions ( infundibulum , magnum ,isthmus ,uterus and vagina). The infundibulum is consisting from two regions in hens the cranial region has a thin walled funnel - like shape which has elliptical opening called( fimbriae infundibulais )region, it's wall was thin transparent membrane facing the ovary, their internal surface showed disappearance of folds and glands . While the caudal region (neck region) of the infundibulum which is called (tubu infundibularis ) showed a narrow slightly thick wall tube and showed small and very short longitudinal oriented folds with tubular glands But , in infundibulum in mature duck and hen showing infolded layer of columnar secretory cells supported on fibro - vuscular tissue, the second part magnum display thick and wide lumen and their folds appeared the longer in mature hens and duck ,The mucosa of the magnum is thick wall, arranged in long, wide and branched more voluminous folds, variable in size and length than else where with narrow clefts between them lined with simple columnar epithelium and The smooth muscular layer of the magnum is thicker and clearly arranged in definite layer than in the infundibulum , magnum in mature chicken showing mucine secreting and columnar epithelium surrounded by layer of muscle fibers , The magnum wall in mature duck showing infolded layer of epithelium columnar non - secretory with its stroma surrounded by smooth muscle layer and serosa layer duck, There are a transitional zone between the magnum and the isthmus. This zone is called non - granular zone. The isthmus in mature hen showing infolded of columnar mucosa secreting epithelium with stalk of fibro - vascular and showed primary and secondary folds, but in mature duck showing ciliated pseudo stratified epithelium layer with apical surface columnar and mucine secreting cells supported by fibro - vascular stroma. The uterus the difference between immature duck and mature duck; That in immature duck showing infold large like villi lined by mucous secreting columnar epithelium supported by fibro - vascular stroma but in mature duck showing a wall of uterus in which there was infolded villi like projection into the cavity of columnar non - secretory epithelium with thick inner circular layer and thinner outer longitudinal layer of smooth muscle fibers, the final part of the oviduct is the vagina which appeared a short thick muscular tube of short longitudinal oriented folds. In immature hen showing ciliated pseudo stratified columnar lining epithelium within mucine secreting cells. But, in vagina of mature hen showing infolded layers covered by ciliated pseudo stratified columnar epithelium cells with isolated mucine secreting cells In vaginal wall of mature duck showing infolded layer of ciliated pseudo stratified columnar epithelium cells within isolated secretory cells.3 - Hormonal : From our results in mature showed,a significant increase (p˂0.01) in the level of the plasma estrogen E2 of duck compared with hen in all time from oviposition, but , on the contrary in plasma progesterone hormone the level in hens increased significantly (p˂0.01) from ducks in all time of oviposition , also Testosterone concentrations in hens increase significantly (p˂0.01) from ducks that was indicated for its important role during ovulation. In immature duck the level of estrogen E2 increase significantly (p˂0.01) from hens, but the plasma progesterone concentration increase significantly (p˂0.01) in immature hens in comparison with the ducks .These findings showed strong relationship between anatomical parameters and histological changes and hormonal levels during sexual maturity when compared with these parameters before puberty

دراسة بعض المتغيرات الحياتية عند مرضى التهاب الكبد نمطي بي وسي == Study of some biological variables in patients with hepatitis B and C

Author name: ياسر ماجد كامل
Supervisor name: عباس عراك عباس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعتبر فيروسات التهاب الكبد نمطي B وC من الفيروسات المنتقلة عن طريق تلوث الدم وذات الانتشار الواسع في انحاء العالم .تصيب هذه الفيروسات معظم السكان,متبرعي الدم ,مرضى الثلاسيميا,مرضى الغسل الكلوي وغيرهم ممن يتعرضون لعمليات سحب ونقل دم عادة,او من تجرى عليهم العمليات الجراحية او عن طريق الحقن او المخدرات.قد تتفاقم الاصابة احيانا نحو حدوث الاصابة المزمنة والتي تكون على درجة من الخطورة بحيث تؤدي الى تليف الكبد او الاصابة بسرطان الكبد.اجرينا الدراسة على 63 شخصا منهم 33 مصابون بالتهاب الكبد الفيروسي النمط B و30 اخرون مصابون بالنمط Cجمعوا من وسط مرضى الثلاسيميا (فقر الدم البحر الابيض المتوسط),مرضى غسل الكلى او متبرعي الدم والقسم الاخر مرضى عاديون لكن جميعهم مصابون واجريت عليهم فحوصات الكشف Anti - HCV وHBsAg بالاضافة الى الفحوصات اللاحقة من اختبارات ELISA وmini - VIDAS لغرض الكشف عن الاضداد. استخدمنا ايضا عينة عشوائية من 30 شخصا صحيحا لغرض المقارنة مع بعض الفحوصات المستخدمة في فحوصات الدم والدهون والغلوبيولينات المناعية.بالنسبة لمرضى التهاب الكبد نمط Bبينت الدراسة ان معدلات فحوص الدم التالية : Hb, MCH, MCHC, RBC , وplatelets قد اظهرت انخفاضا ملحوضا مقارنة مع الاشخاص السليمين, وهذه الفحوص دلائل على وجود حالة من فقر الدم.بينت الدراسة ايضا ارتفاعا في العدد الكلي لكريات الدم البيض وانخفاضا في كل من الكريات (القعدة والعدلة واللمفية),بينما اظهرت ارتفاعا في مستوى الكريات الاحادية في كلا الاصابتين (B وC) .فحوصات الدهون كشفت عن ارتفاع في مستوى الكولسترول والدهون الثلاثية والبروتينات الدهنية منخفضة الكثافة مقارنة بالاصحاء.كما كشفت الدراسة عن ارتفاع في انزيمات الكبد (ALT, AST, total and direct bilirubin, alkaline phosphatase) في كلا نمطي مرضى التهاب الكبد. اما بالنسبة لمرضى التهاب الكبد النمط Cفقد اظهروا انخفاضا في مستوى كل من ( BMI, PCV, Hb, MCH , platelets) مقارنة مع الاشخاص الاصحاء.خلايا الدم الاحادية واللمفية اظهرت ارتفاعا مقارنة بمجاميع الاصحاء مع انخفاض في مستوى الخلايا العدلة. كما اظهرت فحوصات الدهون انخفاضا ملحوظا في الكولسترول والبروتينات الدهنية قليلة الكثافة.كما بينت الدراسة الاحصائية باستخدام معامل الارتباط (سبيرمان) وجود علاقات واضحة بين بعض المؤشرات الحيوية وهي : في مرضى HBV : 1. MCH والبيليروبين الكلي وجود علاقة متوسطة ايجابية 2. MCHمع الالبومين بعلاقة قوية سالبة 3. MCH مع انزيم الفوسفاتيز القاعدي بعلاقة متوسطة سالبة 4. الخلايا العدلة مع البيليروبين الكلي بعلاقة موجبة متوسطة ومع الالبومين ايضا بعلاقة موجبة متوسطة 5. الخلايا الاحادية لكريات الدم البيض مع الالبومين بعلاقة قوية سالبة وفي مرضى HCV : 1. الهيموغلوبين مع البيليروبين الكلي بعلاقة متوسطة موجبة 2. معدل انضغاط الخلايا PCV مع انزيم AST بعلاقة قوية سالبة3. MCV مع AST بعلاقة متوسطة سالبة 4. الخلايا الحمضة لكريات الدم البيض مع الالبومين بعلاقة موجبة قوية 5.الدهون الثلاثية مع البيليروبين المباشر بعلاقة موجبة متوسطةتقترح هذه النتائج بان الاصابات بالتهاب الكبد الفايروسي نمط ب وسي تؤدي الى نوع من فقر الدم وانخفاض مستويات بعض دهون البلازما وكذلك الى اختلاف الردود المناعية بين النوعين, لذا توصي هذه الدراسة بفحص مرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط ب وسي للكشف عن مؤشرات فقر الدم ومستويات دهون البلازما تجنبا للتطورات السلبية الخطيرة مثل الفشل القلبي والكثير من امراض الاوردة والشرايين وان معالجة مثل هذه الاختلالات قد يعزز الحالة الصحية العامة للمرضى وخاصة في الطور المزمن للاصابة. | Hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) are blood born viruses which are distributed throughout the world. These viruses may infect the general population, blood donors and others such as thalassemia, hemodialysis and hemophilic patients and individuals who are exposed to blood, operations and injection of drugs. The chronic infection may lead to serious disease which promote to fibrosis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The study applied on 63 patients (33 HBV and 30 HCV) all from : thalassemia patients, hemodialysis patients and blood donors previously marked as hepatitis patients with later confirmatory process with mini - VIDAS and ELISA. The study used a random pattern of control group to compare our results of some hematological, biochemical and Immunological parameters of these HBV and HCV patients. The study used spearman rank correlation coefficient to clear the relations among liver function test parameters against : hematological, lipid profile test and immunological parameters. The study found that Hemoglobin (Hb), Mean Corpuscular Hemoglobin (MCH), Mean Corpuscular Hemoglobin Concentration (MCHC), Red Blood Cells counts (RBC counts) and platelets decreased in HBV patients comparing to control group, which refer to a type of anemia.An increase in White Blood Cells (WBCs) total count and a decrease in Deferential WBC (Basophils, neutrophils, lymphocytes), while Monocytes increased in both HBV and HCV patients. Lipid profile tests revealed a significant decrease in cholesterol, triglycerides and Low Density Lipoprotein (LDL) levels of HBV patients compared to controls. Alkaline Transaminase (ALT), Aspartate Transaminase (AST), total and direct bilirubin and alkaline phosphatase significantly increased in both HCV and HBV. Immunoglobulins classes M and A found to be significantly high in HBV.And for HCV patients we found that Body Mass Index (BMI), Packed Cell Volume (PCV), Hb, MCH and platelets are decreased comparing to control group. Monocytes and lymphocytes found to be significantly increased in HCV patients comparative with control group, with a decrease in neutrophils. Lipid profile tests showed a significant decrease in cholesterol and low density lipoprotein (LDL). The significant noted correlations among parameters according to Spearman rank coefficient were : In HBV patients : 1. Mean Corpuscular Hemoglobin and bilirubin total with a negative moderate correlation (R= - 0.49, P=0.05).2. Mean Corpuscular Hemoglobin and albumin with a high negative correlation (R= - 0.65, P>0.05) 3. Mean Corpuscular Hemoglobin and alkaline phosphatase with moderate negative correlation (R= - 0.51, P>0.05).4. Neutrophils and total bilirubin with a moderate positive correlation (R=0.54, P<0.05) and positive correlation with albumin (R=0.51, P<0.05).5. Monocytes and albumin with high negative correlation at (R= - 0.62, P>0.05). In HCV patients : 1. HB and Total Bilirubin with a moderate positive correlation at (R=0.49, P<0.05).2. PCV and AST with a high negative correlation at (R= - 0.62, P<0.05).3. MCV and AST with a moderate negative correlation at (R= - 0.55, P<0.05).4. White blood eosinophil and albumin with a high positive correlation at (R=0.6, P<0.05).5. Triglycerides and direct bilirubin with a moderate positive correlation (R=0.5, P=0.05).These results suggest that HBV and HCV infections lead to a certain type of anemia and decreased certain plasma lipids and dissimilar immunological outcomes. The study recommend testing HBV and HCV patients for anemia and plasma lipid parameters to avoid serious consequences such as heart failure and many coronary and artery diseases as well as to generally improve the health of HBV and HCV patients especially those at chronic stages

دراسة تشريحية مقارنة لبعض انواع العائلة المركبة Asteraceae L == Comparative Anatomical Study of Some Species from The Family Asteraceae L

Author name: وفاء حميد مجيد محمد النعيمي
Supervisor name: اسراء كريم نصر الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Anatomy
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study included comparative anatomical study for 10 cultivated species of the family Compositae collected from public gardens for different region of Baghdad city, these species are : 1 - Aster amellus L. )استر(2 - Cosmos sulphureus Cav. )كوزموز(3 - Dahlia variabilis Willd. )داليا(4 - Gaillardia pulchella Foug. )عنبر كشمير(5 - Gazania splendens Hork. )ك ا زنيا(6 - Gerbera jamesonii Hook. )جربي را(7 - Helichrysum bracteatum Vent. )ورد الكاغد(8 - Tagetes erecta L.)جعفري(9 - Tagetes patula L.)قديفة(10 - Zinnia elegans Jacq. )زينيا(The study dealt with some anatomical characters and study are Compared for the first time to these species in Iraq.The study included the features of ordinary epidermal cells leaves stems, and involucre bracts, and also stomatal complexes, Actinocytic type was recorded as new founding in the species Aster amellus. The study included cross sections of the roots and also exposed the constituent tissues of it and the varies in the thickness of epidermis cortex, vascular cambium as well as the arrangement of phloem which have an important role in the studies species.studying of cross sections of stems showed important taxonomic characters like thickness of epidermis, presence or absence of collenchymatypes and rows number, characteristic of the vascular bundles in terms of forms and numbers, therefor the species were divided into groups.The vascular cylinder characters also gives prominent anatomical characters importance in terms of being continuation or intermittent.The study of vertical section of leaf showed important anatomical characteristic like thickness of upper and lower epidermis thickness of palaside and spongy layer, layers number and from of vascular bundles. The venation system of was investigated and compared between species.The study included characteristic of cross sections of petiole in terms of thickness of cuticle, epidermis and collenchyma number and forms of vascular bundles. The vertical sections of involucre bracts also studied.Indumentum of different parts of plant (leaves, stems, bracts and fruit) are also studied in details, glandular hairs and eglandular hairs where studied in terms of cells number, lengths, apexes and bases forms and other characters in addition to papillae which occur in some species. Petals venation were investigated and compare between species.The study also resulted in the presence of internal secretory structures, the study showed the locations of these structures, dimensions and the method of formation to these structures which gave an important anatomical character. The study showed the presence of crystal, which differ in the, forms and sizes which contributed to the isolation of species it was the first time note sphaerocrystals (Inulin crystal) in tuberous root cortex of Dahlia variabilis the prismatic crystals of the type styloid in root cortex of Gerbera jamesonii.The study showed results and characters and these were presented for the first time. Investigation include field photographs of studied species and plates of sections which studied in different plant parts in addition to many tables.

دراسة مقارنة لفعالية لقاح التيفوئيد من عترة محلية وقياسية مع اللقاح التجاري == Comparative Study of the Typhoid Vaccine Effectiveness from Local and Standard Strain With Commercial Vaccine

Author name: وفاء بيد الله حميدي الركابي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: حمى التيفوئيد, تسسبب بواسطة بكتريا السالمونيلا تايفي (S. Typhi) Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi, وينتقل معويا في الانسان حصرا بمدى من التهاب معوي متوسط الى امراض جهازية شديدة وينتشر عن طريق البراز - الفم من خلال تلوث الماء والطعام. هدفت الدراسة الحالية الى تحضير ثلاثة انواع من اللقاحات ضد حمى التيفوئيد من عترة محلية لبكتريا S. Typhi تضمنت لقاح متعدد السكريد Polysaccharide ومتعدد السكريد الشحمي Lipopolysaccharide وخلية كاملة مقتولة Whole cell killed. اجريت هذه الدراسة للفترة من شهر نيسان 2014 وحتى شهر حزيران 2015, تم الحصول على العترة المحلية S. Typhi من المركز الوطني للبحوث والرقابة الدوائية / وزارة الصحة العراقية. شخصت S. Typhi (العترة المحلية) بطرق التشخيص التقليدية كالفحص المجهري والفحوصات البايوكيميائية ونظام التشخيص APi20 وVitek - 2 والفحوصات المصلية, اكدت جميعها هوية البكتريا التي تنتمي الى Salmonella Typhi. تم الحصول على جودة جيدة وفعالية في اللقاحات المحضرة محليا من الناحية البيولوجية والكيميائية والفيزيائية والمناعية مقارنة مع اللقاح التجاري المستورد ، على الرغم من ان لقاحي WCK وLPS رفعا درجة حرارة الجسم في مجموعتي خنازير غينيا الملقحة بهما مقارنة مع المجموعتين المحصنة بلقاحي PSالمحلي والتجاري . ان نتيجة الاختبار الكيميائي (لمتبقيات الفينول والفورمالين) باستخدام تقنيتي Hight - Performance Liquid Chromatography (HPLC) و(Gas Chromatography (GC، قيمة الاس الهيدروجيني PH ومحتوى البروتين امن بالمقارنة مع بروتوكول منظمة الصحة العالمية للقاح التيفوئيد. ايضا في الفحوصات الفيزيائية كان حجم جزيئات لقاح PS المحلي اقل من المستورد، ان صغر حجم جزيئات اللقاح دعم الاستجابة المناعية. في الاختبار المناعي بواسطة تقنية Enzyme Linked Immunsorbent Assay ((ELISA, اظهرت جميع اللقاحات اختلافات معنوية (P<0.05) في مصل خنازير غينيا المعاملة بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعة السيطرة. كان لقاحي PS التجاري والمحلي ذا اهمية معنوية في التفاعلات المناعية reactogenicity اقل من لقاحي LPS وWCK ، ولكن كل منهم اظهر حماية (70 ، 80 ، 80 و90) ٪ على التوالي ضد جرثومة S. Typhi الضارية. اللقاحات المحلية قد تكون قادرة على تعزيز مناعة التكيفية adaptive immunity من خلال تسجيلها اختلاف معنوي (P<0.05) في حساب مجموع الكريات البيض بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعتي اللقاح التجاري والسيطرة. واوصت الدراسة تطوير انتاج عراقي للقاح تيفوئيد PS من هذه العترة الضارية. | Typhoid fever, which is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi (S. Typhi) is an exclusively human enterically transmitted, range from mild gastroenteritis to severe systemic disease and spread by the fecal - oral route via contaminated food and water. In current study aimed to production three types of vaccines against typhoid fever from local strain S. Typhi, include polysaccharides (PS), Lipopolysaccharide (LPS) and Whole Cell Killed (WCK) vaccine. This study was carried out during the period from April 2014 until June 2015. The local strain of S. Typhi was obtained from The National Center of Drugs Control and Research (NCDCR) / Iraqi Ministry of Health. Identification of S. Typhi (local strain) by traditional methods of diagnosis as microscopic examination and biochemical tests as Api20 system diagnosis, Vitek - 2 and serological test .All confirmed the identity of the bacteria belonging to S. Typhi. Good quality and efficacy was obtained in the locally produced vaccines from the biological, chemical, physical and Immunological compared with the imported commercial vaccine, although WCK and LPS elevated body temperature in a vaccinated guinea pigs groups with them compared with local PS and Commercial Vaccinated groups. That a result of chemical test (phenol and formalin residuals) by High - Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Gas Chromatography (GC), PH value and protein content were safety side comparative with WHO protocol typhoid vaccine. Also in physical test, the particles size of local PS vaccine was less than Com. V., the smaller of particles size of vaccine supports the immune response. In Immunological test by Enzyme Linked Immunsorbent Assay ELISA was showed that the titration of all vaccines and have significantly differences (P<0.05) in the sera of treated guinea pigs between first and booster dose compared with control,. The Commercial and local Vi PS. vaccines were significantly less reactogenicity than LPS and WCK vaccines, but all of them provided (70, 80, 80 and 90) % protection respectively against virulent S. Typhi organism. The prepared vaccines may be able to enhance the adaptive immunity through its recorded significant different (P<0.05) in the total leukocytes count between first and booster dose compared with the Commercial Vaccine and control groups. The study recommends to developing production of Iraqi Vi Polysaccharide. Typhoid vaccine from this local virulent strain of S. Typhi.

العلاقة بين مستوى الكلوكوز في الدم مع بعض المعايير الكيموحيوية في متلازمة تكيس المبيض == The Relation Between Blood Glucose level and Some Biochemical Parameters in Polycystic Ovarian Syndrome

Author name: ياسمين سرمد حسن الصائغ
Supervisor name: عالية حسين علي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد متلازمة تكيس المبيض المتعدد ((PCOS من الاكثر شيوعا بين اضطرابات الغدد الصماء والتي تصيب النساء في عمر الانجاب. ماتزال امراضية هذه المتلازمة غير معروفة ولكن الكثير من الباحثين يعزونها الى عوامل وراثية واضطرابات ايضية والسمنة وفرط الاندروجين ومقاومة الانسولين، فضلا عن فرط الانسولين. هدفت هذه الدراسة الى ايجاد العلاقة بين مستوى الكلوكوز مع اختبارات اليوريا والكرياتنين، فضلا عن البروتين المتفاعل C في عينة من النساء العراقيات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد، اذ اجريت الدراسة الحالية على (51) امراة يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد و(10) نساء سليمات كمجموعة سيطرة في المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة على الانجاب/جامعة النهرين للفترة من شباط الى اب للعام 2014. تم تشخيص النساء الخاضعات للدراسة باستخدام جهاز الامواج فوق الصوتية (السونار) لفحص الرحم والمبيض واسندت بالاستبيان ان كن يعانين من ندرة الطمث (oligomenorrhea)، انقطاع الطمث الثانوي (secondary amenorrhea) او دورة حيضية منتظمة، فضلا عن الفحوصات الهرمونية والتي تضمنت الهرمون المحفز للحويصلات المبيضية ((FSH، الهرمون اللوتيني (LH)، هرمون الحليب (PRL)، هرمون الايستروجين (E2) وهرمون التيستوستيرون ((Testosterone. اذ جمع (5) مل من الدم الوريدي من كل امراة صائمة صباحا، واذيب 75 غرام من الكلوكوز بـ 300 - 500 مل من الماء واعطي لكل النساء الخاضعات لهذه الدراسة. تم جمع المعلومات والتي شملت العمر ومؤشر كتلة الجسم ( (BMIو فترة العقم من كل امراة خاضعة للدراسة، ثم تم اجراء اختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار فقط) واختبار اليوريا في الدم واختبار كرياتنين المصل واختبار الهوموسيستين واختبار البروتين الفعال C لكل النساء في هذه الدراسة. كما وتم اجراء اختبار اليوريا والكرياتنين فضلا عن اختبار البروتين المتفاعل C مع منتصف الاختبار لتحمل الكلوكوز الفموي لكل النساء الخاضعات في هذه الدراسة لغرض ايجاد العلاقة المحتملة بين السكر وهذه الاختبارات. قسمت المريضات الى عدة مجاميع وفقا لاختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار) ونوع العقم وحالات الاجهاض ومؤشر كتلة الجسم وفترات العقم ووفقا للفئات العمرية. وبعد ذلك تم تحليل البيانات احصائيا. اظهرت نتائج الدراسة عدم وجود فروق معنوية(P>0.05) بين مجاميع المريضات (PCOS) مقارنة بمجموعة السيطرة فيما يخص عامل العمر،و لكن وفقا للفئات العمرية، لوحظ زيادة تكرار هذه المتلازمة للنساء ضمن الفئة العمرية التي تتراوح بين 21 - 30 سنة. كما واظهرت هذه الدراسة ان اغلب المريضات يعانين من الوزن الزائد والسمنة المفرطة، وارتفاع السكر في الدم. اما فيما يخص حالة العقم فقد قسمت المريضات لمجموعتين، مجموعة تعاني من عقم اولي 52.95%) ) والمجموعة الثانية تعاني من عقم ثانوي ((47.05% . اضافة الى ذلك، حوالي (29.42%)من المريضات يعانين من حالات الاجهاض، ولم تلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في فترات العقم بين المريضات اللواتي يعانين من الاجهاض مقارنة باللواتي لا يعانين من الاجهاض، وايضا بين المريضات اللواتي لديهن عقم اولي مقارنة باللواتي لديهن عقم ثانوي. اما بالنسبة للتحليل الهرموني، فقد لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) بهرمون الحليب لدى المريضات اللواتي يعانين من زيادة الوزن والسمنة المفرطة. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية (P>0.05)في تركيز الهرمون المحفز للحويصلات والهرمون اللوتيني وهرمون الايستروجين والهرمون الذكري التيستوستيرون بين المريضات ومجموعة السيطرة. ايضا اظهرت النتائج حصول ارتفاع معنوي(P<0.05) في تركيز الهوموسيستين في المريضات اللواتي يعانين من فترة عقم 9 سنوات فما فوق. لوحظ ايضا وجود علاقة ايجابية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز مع تركيز كل من اليوريا والكرياتنين في الدم، بينما لوحظت علاقة عكسية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز وتركيز البروتين المتفاعل C في الدم. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في مستويات اليوريا والكرياتنين والبروتين المتفاعل C بين مجاميع المريضات ومجموعة السيطرة الصائمات.نستنتج من نتائج الدراسة الحالية ان متلازمة تكيس المبيض مرتبطة بالسمنة، ومقاومة الانسولين، فضلا عن اضطرابات الطمث. وان ارتفاع الهوموسيستين مرتبط بمقاومة الانسولين والسمنة. المريضات اللواتي لديهن فرط الانسولين قد يتطور لديهن مرض السكري. كما وان ارتفاع هرمون الحليب مرتبط بالسمنة المفرطة والوزن الزائد في المريضات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبيض المتعدد (PCOS). | Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder which affect women at reproductive age. The pathophysiology of this syndrome still unclear, but many researchers were attributed this syndrome to genetics, metabolic disorders, obesity, hyperandrogenism, insulin resistance and hyperinsulinemia. This study was aimed to identify the correlation of glucose level with blood urea, serum creatinine and C - reactive protein test in some Iraqi women suffering from polycystic ovarian syndrome. The present study was carried out for (51) PCOS women and (10) healthy women as control with age between (17 - 49) years at High Institute for Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technologies / AL - Nahrain University, from February to August, 2014. The females were diagnosed by ultrasound scan for ovarian and uterine features and supported by a questionnaire if they have oligomenorrhea, secondary amenorrhea or regular menstrual cycle, as well as reproductive hormonal assay performed for all women involved; FSH, LH , prolactin, E2 and testosterone. Blood samples (about 5 mL) were collected from each fasting woman in the morning, and 75 gm of glucose loaded in 300 - 500 ml of water and given to the subjects. The information included; age, BMI and duration of infertility were recorded for all subjects. Oral glucose tolerance test (Mid - test only), blood urea test, serum creatinine test, homocysteine test and C - reactive protein test were performed for all subjects. Blood urea, serum creatinine and C - reactive protein tests were performed with mid - test OGTT for all subjects provided the correlation between blood glucose levels and these parameters. PCOS women divided into groups according to mid - test OGTT, type of infertility, abortion cases, BMI values, duration of infertility and according to age groups. Crude data were statistically analyzed. As for the age, no significant differences (P>0.05) were observed among PCOS groups and controls. According to age group, higher prevalence of PCOS women was observed in age group with age range 21 - 30 years . The most of PCOS women were overweight and obese, and they had higher glucose levels. As for the infertility, infertile PCOS women were divided into two groups, PCOS women suffering from primary infertility (52.95%) and secondary infertility (47.05%). About 29.42% of PCOS women had abortion. Non significant differences (P>0.05) in duration of infertility between PCOS aborted vs. non aborted ones, and between primary and secondary. Higher prolactin level (P<0.05) was recorded in obese and overweight women, while non significantly differences (P>0.05) were recorded in FSH, LH, E2, and testosterone level among PCOS groups and controls. Higher homocysteine level (P<0.05) was observed in PCOS group with duration of infertility (≥9 years). Weak positive correlation was demonstrated between glucose with blood urea and glucose with serum creatinine. While negative weak correlation of glucose level with C - reactive protein level was recorded. Moreover, non significant differences (P>0.05) in urea, creatinine and C - reactive protein levels among fasting PCOS groups and control.In conclusion, the present study supported the association of PCOS cases with obesity, insulin resistance, and menstrual disturbances. Elevation of homocysteine levels related to insulin resistance and obesity in PCOS women. Hyperinsulinimic PCOS women had higher prevalence risk to develop type 2 diabetes mellitus. An elevation of prolactin level associated with obesity and overweight in PCOS patients

زيادة بعض مركبات الايض الثانوية لنبات الزيتون Olea europaea L باستخدام نترات الفضة النانوية والبولي اثيلين كلايكول خارج الجسم الحي == Increasing of some secondary metabolites of Olea europaea L. Using silver nitrate nano particle and polyethylene glycol elicitor In Vitro

Author name: وسن محمد موسى السويدي
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in callus induce from leave and shoot tips of Olea europaea L. in vitro.Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant.Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that ms medium containing 1 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 50 % under light conditions, the highest callus fresh and dry weight were recorded 630,43.0mg at concentrations 1,2 mg/l 2,4 - D respectively.Shoot tips and Stigma cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulatorsincluding Benzyl Adenine BA at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of shoot tips reached 80 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2534,552 mg at concentration 3mg/l BA respectively. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of Stigma reached 40 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2070,404 mg at the concentration 4mg/l BA respectively.In order to increase theproduction of secondary metabolites, some elicitors were used including Poly Ethylene Glycol (PEG) at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 %, and silver nano particles AgNO3 NPs at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l.Results showed that 1.5mg/l concentration of AgNO3NPs caused highly significant production in most of the secondary metabolites (Glycosides compound) of callus for Olea europaea L while 2mg/l concentrations of AgNO3 NPs caused highly significant production in some of the secondary metabolites (Glycosides compound) of shoot tips for Olea europaea L. Results showed that 2% concentration of PEG caused highly significant production of the secondary metabolites (Fenolic compound) of callus for Olea europaea L. while 1.5% concentrations of PEG caused highly significant production b in most of the secondary metabolites (phenolic compound) of shoot tips for Olea europaea L.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

التوزيع الزماني للفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة وبعض طرائق السيطرة عليها == Temporal Distribution of Dermatophytic Fungi the Causative of Tinea Diseases and Some Control Methods

Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي
Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

تاثير التلوث بالمواد العالقة بالهواء واثره على البيئة == THE IMPACT OF POLLUTION ON THE SUSPENDED AIR PARTICLES AND THEIR EFFECT ON ENVIROMENT

Author name: يسرى بدري نوري الحسيني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت هذه الدراسة عدة مواقع من مدينة بغداد في جانبي الكرخ والرصافة، اذ كان الاختيار على اساس الكثافتين المرورية والسكانية، والتي يتمخض عنهما مخلفات حرق الوقود المضاف اليه رابع اثيلات الرصاص وحرق القمامة الناتجة من الفعاليات البشرية المختلفة، مصدرا للتلوث. لذا اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على العناصر الملوثة (الكادميوم، النيكل، الرصاص، الحديد) كملوثات للمنظومة البيئية (تربة - نبات). من خلال تقدير هذه العناصر كما ونوعا في نباتات وترب الدراسة، مع الاخذ بالحسبان التغيرات الفصلية. جرى اعتماد النباتات المعمرة الدفلة Nerium oleander والزيتون Olea europea والنخيل Phoenix dactylifera والترب المزروعة فيها مادة لهذه الدراسة، اذ قيست تراكيز هذه العناصر في الاوراق النباتية المغسولة وغير المغسولة لفصلي الشتاء والصيف وما بعد المطر ومعرفة اي من هذه الحالات الاكثر امتصاصا، كما قيست الكميات المتجمعة من العوالق على اسطح تلك الاوراق بالمقارنة مع مساحة سطح الورقة ومعرفة اي الانواع الاكثر تجميع هذا من جانب، ومن جانب اخر قيست هذه العناصر المرتبطة بمكونات التربة ذات المساحة السطحية العالية (الطين، المادة العضوية، اكاسيد الحديد، كاربونات الكالسيوم ) بطريقة الاستخلاص المتعاقب ومقارنة قيمها بقيم التواجد البيدوكيميائي الطبيعي له في التربة. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ما ياتي : 1 - ان اوراق نباتات النخيل كانت الاكثر تجميعامن حيث كمية الدقائق العالقة على سطح الورقة، تلى ذلك اوراق نبات الدفلة والزيتون. 2 - كان تركيز عناصر الدراسة في اوراق النباتات المغسولة اقل مما في غير المغسولة اذ سجلت تراكيز العناصر في اوراق النباتات المغسولة الترتيب الاتي بعد المطر > فصل الشتاء > فصل الصيف، ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر سلوكا مختلفا عن بقية العناصر وكما في التسلسل الاتي فصل الصيف > بعد المطر > فصل الشتاء.3 - شكلت تراكيز عناصر الدراسة في اوراق الزيتون غير المغسولة اعلى قيما من بين عناصر الدراسة فيما سجلت اوراق نبات الدفلة القيم الاعلى من تراكيز هذه العناصر في الاوراق المغسولة. 4 - دلت تحريات التربة وتحاليلها على الالفة العالية لجميع عنلصر الدراسة مع مفصول الطين ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر ميلا شديدا للارتباط مع الاكاسيد الحرة ( الحديد والالمنيوم ). 5 - بينت المقارنة البيدوكيميائية لقيم عناصر الدراسة مع القيم الاصلية لها ان عنصري الكادميوم والنيكل لم يتجاوزا الحد المسموح بالتلوث فيما تجاوز ذلك كل من عنصري الرصاص والحديد. | This study deals with many sites in Baghdad, both Karh and Russafa. The choice of theses sites are according to the traffic and residential density, which result wastes from burning the fuel that contains lead Tetra ethelate and the burning of garbage that result from human activities and other pollution resources. This study is made to shed light on the polluted elements (Cadmium, Nickel, Lead and Iron) as causers of pollution to environment (soil - plant), through estimating these elements quantitively and qualitatively in the soils and plants of the study, with taking into consideration the seasonal changes.The long - lived plants are regarded in the study like Nerium Oleander, Olea europea and phoenix dactylifera and the soil of plantation.The concentrations of these elements in washed and non washed plants leaves in winter and summer seasons and after rain falling are measured to know which one is the most absorptional. The quantities of suspended particles on leaves surface are measured to be compared with the leave's area and to know which one is the most precipitated.On the other hand, these elements that are bounded with soil components of specific high surface area (clay, organic matter, Iron oxide) calcium carbonate) are estimated by sequence extraction, and comparing their values with the Bedochemical values in the soil.The study reaches the following results : 1. The leaves of palm - date is the most accumulated of the suspended particles amount on leave surface, then Nerium and olive respectively.2. The concentration of the study elements is on higher level in the washed leaves rather than the non - washed leaves. It is reported that the elements in the washed leaves are as the following sequence post - rain> winter> summer, except for Fe which has different behavior as in this sequence summer> post - rain> winter. 3. Nerium shows the higher concentrations of the elements in the washed leaves, while olive shows the higher concentrations of these elements in non - washed leaves.4. The soil investigation of the study indicates that all elements of the study have high binding with the clay except for Fe which has great tendency to be bounded with free oxides (Iron and Aluminum).5. The Petrochemical comparison of the values of cadmium and nickel do not exceed the boundary of pollution while iron and lead do

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق == Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

Author name: زينة نبيل نصيف العزاوي
Supervisor name: صباح فرج عبد الاحد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Invertebrates
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.
1 ... 288 289 290 291 292 ... 465