Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 5,515

استخدام عوامل استحثاث لانتاج مؤيضات ثانوية من بعض عزلات انواع الفطر واختبار فعاليتها الضد بكتيرية والخلايا السرطانية Penicillium والكولسترول == Use of inducing agents in secondary metabolites production from some Penicillium isolates and assay their activity against bacteria , cancer cells and cholesterol

Author name: امل صالح عبد الرضا
Supervisor name: توفيق محمد محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The current study was designed to investigate active compounds from different Penicillium isolates ,that isolated from different sources , using different media . Eleven isolates related to five species : P. chrysogenum, P.paxilli , P. citrinum, P. cosmopolitanum, P. digitatum were isolated. After primary screening was performed , the best isolates that have high antibacterial activity against gram positive and gram negative bacterial was selected. The selected isolates were cultured on fermentation media according to the suitable media for each isolate, and the active compounds were extracted using ethyl acetate as a solvent. P. cosmopolitanum and P. chrysogenum were cultured on penicillin production medium (PPM) , P. paxilli was cultured on Aspergillus complete medium (ACM) and P. digitatum and P. citrinum were cultured on solid state fermentation media consist of wheat bran . The efficiency of fungal crude extracts from each isolate against the reference strains S. aureus NCTC 6571 and E. coli ATCC 25922 and against Candida albicans (pathogenic and reference strain)was examined, and the Minimum inhibitory concentration (MIC) was determinated for each extracts.The inhibition zone of fungal extracts against E. coli and S. aureus ranged between (20 - 50) mm , and they had high activity against C. albicans ( reference and pathogenic isolate) ranged between 25 - 45 mm.Induction of secondary metabolite production by the selected fungi was carried out using biological factor (Streptomyces sp.) , chemical agent (colchicine) and physical agent by UV radiation. Apparently that the biological induction by Streptomyces isolate was the best compared with the other treatments.The results revealed that the two fungal extracts ALO1 and Apax exhibit a high antioxidant activity at low concentrations and volumes of the extract compared to ascorbic acid as control. ALO1 had radical scavenging activity (RSA%) reach 99.9% at volume 3μl , and Apax had RSA 91.6% at concentration 500μg/ml. Also, the fungal extract ,ALO1, showed a significant activity as anticancer agent against RD - cell line. The IC50 of ALO1 was 8.5μl after 24h and 23.76μl after 72h. The hypercholesterolemia ability of ALO1 in vivo and in vitro was assayed . In vivo experiment designed using female albino mice and divided into three groups each one contain 8 mice : group 1 treated with 10μl , group 2 treated with 20μl of ALO1 , and group 3 treated with normal saline as control group. The results showed that total cholesterol , triglycerides, LDL and VLDL were significantly reduced when compared with control group while the HDL level was increased in comparing with control group. The chemical analysis of the crude extracts showed that Apen2 contained 259 μg/g of penicillin G when analyzed with HPLC apparatus . Also the GC mass analysis of ALO1 showed that Docasadionic acid initialize area76.18% and Palmitic acid initialize area 15.09% from the total identified compounds.Whereas the GC mass analysis of Apax showed that Hexandioic acid initialize area40% and Stearolic acid initialize area 35.57% from the total identified compounds.In addition , it was detected the presence of penicillin biosynthetic gene cluster : pcbAB, pcbC and penDE in P. cosmopolitanum and P. chrysogenum.The result showed that gene pcbC and penDE were found in the genomic DNA but the gene pcbAB was not amplified by PCR.

دراسة تصنيفية وبيئية لحشرات نصفية الاجنحة المائية وشبة المائية Heteroptera : Hemiptera في محافظة البصرة == Taxonomical And Ecological Study of Aquatic And Semiaquatic Insects(Heteroptera : Hemiptera) In Basrah Provience

Author name: اسماء عبد الزهرة سبع العيداني
Supervisor name: ضياء خليف كريم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: Present studies dealing with the taxonomical and ecological studies of the aquatic Hemiptera : Heteroptera in eight stations in Basrah provience ,which are : Al - Medina , Al - Qurna , Basrah center ,Shat Al - Arab , Al - Zubair , Abu Al - Khasib , Al - Faw and Sullein Marsh, collection was done twise monthly during the period from April 2012 to March 2013 .Results showed the presence of nine species belonging to aquatic Hemiptera , three belonging the group Gerromorpha and six the group Nepomorpha,as follows : Group : Gerromorpha(Popov,1971)Family : Gerridae ( Leach , 1815)1 - Aquarius nebularis(Schellenberg,1800)Family : Mesoveliidae(Douglast and Scott , 1867 )2 - Mesovelia vettigera( Horvath , 1895 ) ( apterous )M .vettigera( Horvath , 1895 ) ( macropterous )Family : Macroveliidae3 - Macrovelia hornii(Uhler , 1872 )Grouop : Nepomorpha(Popov,1968)Family : Nepidae ( Latreille , 1802 )4 - Nepa cinerea( Linnaeus , 1758 )Family : Corixidae ( Leach,1815 )Subfamily : Cymatianiae ( Walton , 1940 )5 - Cymatia bonsdorffii(Sahlberg , 1819 )Subfamily : Corixinae ( Leach , 1815 )6 - Sigara(Vermicorixa) latelaris ( Leach , 1815 )Family : Belostomatidae ( Leach , 1815 )7 - Lethocerus fakir(Mayr , 1852)Family : Notonectidae ( Latreille , 1802 )8 - Anisops sardeus(Herrich - Schaeffer , 1849)AbstractBFamily : Pleidae ( Fieber , 1851 )9 - Plea leachi(McGregor and Kirdaldy,1899)Among the collected species ,six were regarded as new records to the Iraqi fauna of this order,they were : A. nebularis,M. vettigera( macrpterous) , M . vettigera( apterous), Ma.hornii , N.cinerea , C.bonsdorffii andP.leachi.Study also deal with the measuring of some ecological aspects like air and water temperatures , salinity , pH and dissolved oxygen ,and their effected on the monthly distribution of the aquatic Hemiptera. Temperature was the most effective aspect in the monthly distribution of the insects ,as the lowest numbers were recorded in Summer months and the highest number were in Winter months , the ranges of the air temperatures were 9 - 43º C and water temperatures were 2 - 33º C .The highest concentrations of salinity was recorded in Al - Zubair , Abu Al - Khasib and Al - Faw reached to 35g/l in Al - Zubair in July , the pH ranges were the same in all stations and was alkalid , their ranges were 7.3 - 7.8 , about the dissolved oxygen it was low and same in all stations except in Sullein Marsh which reached to 11 mg/l in January .The concentration of some heavy metals in water also studied like Fe, Pb, Cu and Zn , the highest concentrations were to Fe and Zn in Basrah center and Al - Zubair, and the highest concentration for Fe in Al - Zubair reached to 6362.21μ/L in August, while highest concentration for Zn in Basrah center reached to 1365.92μ/L in July, while in the other stations the concentrations were lowest .The study also used the water boatmen Sigara latelaris(Leach,1817) as bioindicators of heavy metals pollution in the water of Basrah provience , and taken Sullein marsh as control , and measuring the concentrations of the heavy metals in insects tissues , water and sediments , the results showed that the insects collected from the water of the center of the city can accumulate Fe andAbstractCZn in their tissues and the highest concentrations reached to 3562.16 and 3778.12 μ /gm for Fe and Zn in July , while in the insects taken from Sullein marsh were 286.25 and 285.17 μ /gm .The concentrations of heavy metals in water and sediments of the city center were measured and the highest concentration was for Fe and Zn , and reached to 1569.91 and 1365.91 μ /L of the water of city center , while reached to 215.01 and 223.14 from the same metals in the water of Sullein marsh , the concentrations of the same metals were recorded in sediments of the city center and reached to 2865.16 and 1982.56 μ /gm for Fe and Zn , and the highest concentrations of the same metals in Sullein marsh were 418.57 and 393.74 μ /gm .

دراسة تاثيرالسمية النباتية والوراثية لتراكيز مختلفة من الاوكسينات ومضادات التلوث في استحثاث الكالس الاولي لنخيل صنف الحلاوي. (Phoenix dactylifera L.) التم == Assessment of Phytotoxicity and Genotoxicity of different Auxins concentrations and decontamination agents on initiation of date palm (Phoenix dactylifera L.) primary callus of Hillawii cv.

Author name: اسراء عبد الرزاق حميد السامر
Supervisor name: صبيح داود محمد العطبي | محمد حمزة عباس
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Tissue
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The present study was conducted to evaluate the effect of different concentrations of the growth regulators 2, 4 - D; Dicamba and NAA on the induction of date palm (Phoenix dactylifera L.) primary callus Hillawii cv., by analyzing morphological, biochemical; anatomical and molecular responses. Three concentration of 2, 4 - D (10; 50 and 100 mg/L), Dicamba (1; 5 and 10 mg/L) and 30 mg/L of NAA were examined during the course of this study. in addition, several antimicrobial agents were selected to evaluate their morphological and biochemical impacts on the primary callus of date palm including the antibiotics (Gentamycin 50 mg/L and Chloramphenicol 50 and 100 mg/L), as well as, the fungicides (Switch 1 g/L and Beltanol 1 ml/L), After induction of the primary callus from each treatments, the following results were obtained : 1. The results showed that the treatments with 2, 4 - D at 10 mg/L and Dicamba at 1 and 5 mg/L did not stimulate any callus growth over the time of incubation on MS medium.2. It was evident that the treatments of different growth regulators have a significant effect on the initial period (day) for callus initiation, the shortest period have been obtained with the low concentration of 2, 4 - D (50 mg/L) and Dicamba (10 mg/L) which were 67.57 and 66.75 days, respectively, while the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) led to increase this period significantly up to 120 days.3. Both fresh and dry weight of date palm primary callus decreased significantly at the treatment of high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) up to two folds compared to the treatment at low concentration of 2, 4 - D (50 mg/L), similar trend of results were found with browning percentage and intensity.4. Biochemical analysis of produced date palm primary callus revealed that the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) led to a significant increase in the total content of carbohydrates; Proline, Peroxidase activity and Phenolic compounds which considered as a stress indicators, and another decrease of total soluble proteins and free amino acids was accompanied with this treatment compared to the same growth regulator at low concentration and Dicamba treatments.5. Anatomical study revealed that asignificant damage was caused by the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) on date palm primary callus, this damage was evident from the abundant and distribution of tannins compounds across the primary callus tissues, thus, was accompanied with high percent of browning, compared with the treatments of 2, 4 - D at low concentration, Dicamba and NAA.6. The analysis of Protein profile revealed the similarity between the patterns of control treatment (juvenile leaf of Hillawii cv.) and 2, 4 - D at low concentration, as well as, Dicamba. Similarity indices results for protein profile of date palm primary callus proved the genetic similarity of 100% between control treatment and both 2, 4 - D (50 mg/L) and Dicamba ones, while, the lowest similarity percentage was observed with high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L).7. The results of RAPD marker analysis of the extracted genomic DNA form date palm primary callus using four deca oligonucleotide primers showed the efficiency of three primers (OPAR3; OPAR8 and P.650) in their amplification of examined DNA,. RAPD profile revealed an identical matching between control treatment and 2, 4 - D at low concentration, followed by Dicamba and NAA auxins, while, the increasing in 2, 4 - D concentration up to 100 mg/L led to disappearance and the appearance of new DNA bands compared to control treatment, with a highest genetic distance among other treatments.Similarity coefficient analysis showed that the highest genetic similarities were found between control treatment and 2, 4 - D (50 mg/L) with similarity index of 96% , followed by Dicamba and NAA treatments with indices of 74 and 66%, respectively, the lowest similarity index was obtained between control and 2, 4 - D at high concentration which was 27%.8. The screening results of antimicrobial agents showed that the treatment with Switch fungicide (1 g/L) and Gentamycin antibiotic ( 50 mg/L) did not stimulate any callus growth over the time of incubation on MS medium supplemented with either 2, 4 - D or Dicamba.9. Beltanol fungicides (1 ml/L) treatment had a negative effect on the initiated primary callus either by 2, 4 - D or Dicamba, its treatment led to a high significant reduction in total solubleprotein and free amino acid content compared to control results, while an increase of total carbohydrates, Phenolic compounds, Proline and Peroxidase activity was detected with Beltanol fungicide.10. The Chloramphenicol treatment at low concentration (50 mg/L) showed positive results on the growth of primary callus at 2, 4 - D or Dicamba auxins according to morphological and biochemical analysis.

عزل وتشخيص بعض انواع البكتريا المكسرة للهيدروكاربونات النفطية الاليفاتية في الترسبات النفطية لمحافظة البصرة == Isolation and Identification of some species of degradable Bacteria of N - Alkanes hydrocarbons compounds in oil sludge at Basrah Governorate

Author name: استبرق عبد الحسين سلمان جدي البوغازي
Supervisor name: ميثم ايوب عبد القادر الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the oil industries, large amounts of oil sludge are generated through the refining of crude oil. The main reason for its composition that is when exporting crude oil various kinds of oils (heavy and light ones) are mixed together for the purpose of exportation. But , the mixing process between different types cannot be fully , due to the lack of homogeneity among different quality of crude oil . So, the heavy parts of oil are precipitated to the bottom of tank and with passage of time they accumulate to be sediments that’s known as oil sludge stated at the bottom of the oil storage tank in the cleaning process , oil tanks are emptied and discharged in some spaces or reservoir (pits) located near the tanks called "oil pits". Which are places of dump excess oil of various types of oil from different oil tanks or they are close places from oil / water separating unites .From these spots, samples of two kinds of oil sludge : the bottom of oil tank (during the maintenance of the tank) and oil pits (near the unities of separating water from oil) are collected. Also, samples of soil surrounding the oil pits from five oil locations in Basrah city are collected too. Those locations are : west of Gurna, Northern Rumela, Southern Rumela, Nahar Umar, Alzubeir.At the rate of redundantly for each location and for each type of the study samples.This investigation is considered as the first which conducted in Iraq which include firstly the isolation and identification different types of bacterial species from different oil sludge, and secondly use some of them in biodegradation studies for two kinds of carbon sources of oil sludge : (oil sludge of tank bottom , oil sludge of oil pits) .Oil degrading bacterial species have been isolated on a selective mineral salt medium Bushnell and Hass Mineral Salt Medium (BHMS), supplemented with a carbon source. They are also identified depending on the Morphology and biochemical characteristics; four genus of bacteria (out of 89 bacterial isolates of oil sludge from the tank bottom)Bare identified. They include : 32 Pseudomonas spp. , 27 Rhodococcus spp. 21 Bacillus spp. , 9 Arthrobacter spp. , Also four genera of bacteria (out of 101bacterial isolates of oil sludge from the oil pits) are identified. They include : 41 Pseudomonas spp. 27 Rhodococcus spp. , 22 Bacillus spp. 11 Arthrobacter spp. , , While 8 species and 3 genus of bacteria (out of 259 bacterial isolates of the soil surrounding the oil pits) are identified. They include : 41 Aeromonas spp., 39 Corynebacterium spp., 39 Pseudomonas aeruginosa, 36 Bacillus spp., 33 Micrococcus leteuc, 23 Enterobacter intermedius, 22 Pseudomonas fluorescens, 12 Micrococcus varians 7 Staphylococcus epidermidis, 4 Staphylococcus saprophyticus,3Staphylococcus aureus .The biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and two compounds of Pristane and Phytane are measured. Also, the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and the two compounds of Pristane and Phytane are measured for each four genus which were isolated from the oil sludge pits, and it is also done for one isolated genus from the soil surrounding the oil pits. The measuring process was fulfilled as a comparative study with the control flasks. Thus, the oil sludge (tank bottom ) was used as a source of carbone in the first experiment While, the oil sludge (oil pits) was used as a source of carbone in the second experiment . The incubate time of the experiment is 27 days during which a lost of the percentage of hydrocarbon compounds each 9 days are recorded by using( Capillary Gas Chromatography ). The results showed the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard toCbacteria 73.8 % Pseudomonas spp., 70.3 % Rhodococcus spp. 65.7 % Arthobacter spp., 55.6 % Aeromonas spp.,51.5 % Bacillus spp., Whereas, the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria 80 % Pseudomonas spp., 74.9 % Aeromonas spp., 70.4 % Rhodococcus spp., 64.8 % Arthobacter spp.,55 % Bacillus spp., While , The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard to bacteria 73.7 % Pseudomonas spp.,70.3 % Rhodococcus spp. 65.6 % Arthobacter spp., 55.3 % Aeromonas spp. ,51.2 % Bacillus spp., Whereas, The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria79.2 % Pseudomonas spp., 73.8 % Aeromonas spp., 69.2 % Rhodococcus spp.,63.7 % Arthobacter spp., 53.7 % Bacillus spp. It was found that there is approximately match between the biodegradation of mole percentage by using the area and those by using the concentration for each component .

التحلل والمعالجة الاحيائية للمركبات الهيدروكاربونية النفطية بوساطة سلالات Streptomyces وNocardiopsis المعزولة من الترب الملوثة بالنفط في محافظة البصرة - العراق == Biodegradation and bioremediation of petroleum hydrocarbons by Streptomyces and Nocardiopsis strains isolated from oil contaminated soil of Basrah Governorate - Iraq

Author name: احمد عبد برغال الاسدي
Supervisor name: كوثر هواز مهدي | نادية عبد الامير المظفر
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: سبعة سلالات من البكتريا الخيطية تعود الى جنسي Streptomyces وNocardiopsis عزلت من ترب شركة مصافي الجنوب الملوثة بالنفط الخام في البصرة جنوب العراق، وقد تم اختبار قدرتها على النمو بوجود النفط الخام باستعمال وسط ملحي سائل مزود بالنفط الخام كمصدر وحيد للكربون. شملت السلالات على S. variabilis 7525 وS. variabilis SW75 وS. cellulosae XFB - T وS. parvus S86 وS. bacillaris S4BW2 وS. flavoviridis VITHM - 1 وN. synnemataformans ITD - 3 بنسبة تشابه من 99٪ الى 100٪. في هذه الدراسة تم العثور على سلالات جديدة من البكتريا الخيطية المعزولة من التربة الملوثة شخصت باستعمال تحديد تتابعات جين الحامض النووي الريبوزي 16S rRNA وقد اظهرت السلالات قدرات مختلفة على تحلل النفط الخام في الوسط الملحي السائل من 50.2٪ الى 72.4٪. كما تم تقييم تاثير الظروف الزرعية من درجة الحرارة والدالة الحامضية وتركيز النفط الخام والعناصر النزرة في نمو سلالات البكتريا الخيطية وتحلل النفط الخام، وقد لوحظ ان اعلى نمو للخلايا واعلى تحلل للنفط الخام كان 80٪ في ظروف زراعة مثالية ( درجة حرارة 30 ᵒم ودالة حامضية 7 بعد 10 ايام من الحضن وزادت هذه النسبة الى 85٪ من قبل السلالة S. cellulosae XFB - T بعد اضافة العناصر النزرة.في حين اظهرت نتائج اختبار التحلل الحيوي للنفط الخام في التربة من قبل سلالات البكتريا الخيطية منفردة بعد 60 يوما من الحضن تحت ظروف مختلفة ، اظهرت ان اعلى قيمة للتحلل كانت 87 ٪ من قبل النوع S. bacillaris عند درجة حرارة 30 ᵒم وحجم لقاح مضاف 10مل/ 25غم تربة ومستوى رطوبة 40٪.المعالجة الاحيائية هي ستراتيجية فعالة لتنظيف المواقع الملوثة بالهيدروكربونات. ونتيجة تاثر الكائنات الحية الدقيقة من تلك التربة يحدث لها اضطراب وبالتالي يتم انتقاء الاحياء المجهرية القادرة على استهلاك الهيدروكربونات لاستخدامها في هذه التقنية الفعالة في التعامل مع الملوثات الهيدروكربونية. الهيدروكربونات التي تتفاعل مع نسجة التربة والكائنات الحية الدقيقة هي التي تحدد مصير الملوثات وطبيعتها الكيميائية والقدرات الهادمة للميكروبات. الاثار المحتملة لنشارة الخشب، وخليط من روث الابقار والغنم وتعديل المكملات الغذائية لتحفيز الكائنات الدقيقة الاصلية وزيادة المعالجة البيولوجية للهيدروكربونات، هذه العملية تم اجراءها باستعمال طريقة المعالجة خارج الموقع بطريقتي الكومة والمفاعل الحيوي، بخلط التربة الملوثة مع نشارة الخشب والروث الحيواني ودعم التربة بالمغذيات والعناصر النزره مع توفير الرطوبة الملائمة والظروف المواتية لنمو الكائنات الحية الدقيقة كما قدمت التهوية الصناعية للتربة في الكومة والمفاعل بوساطة شبكة من الانابيب المثقبة لمحاكاة المعالجة الحيوية التي استمرت مدة 90 يوما.خلال تلك الفترة، رصدت الهيدروكربونات النفطية الكلية (TPHs) وازالة الالكانات الاعتيادية والتغيرات في المجتمعات البكتيرية. وقد اظهرت النتائج ان (TPHs) قد انخفضت من 52غم/كغم الى 10.6 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 79.6٪ ومعدل تحفيز كان 71.4٪ في تجربة الكومة ومن 52غم/كغم الى 13.5 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 74٪ ومعدل تحفيز كان 63.5٪ في تجربة المفاعل الحيوي. وخلال مدة 45 يوما من الاختبار بلغت اعداد الكائنات الحية الدقيقة من البكتيريا المضافة والمستوطنة التي تحلل المواد الهيدروكربونية اعلى مستوى لها 2 × 710 خلية/ غم و1.1 × 710 خلية/ غم في الكومة والمفاعل الحيوي على التوالي.بناء على هذه المعطيات، نستنتج ان المعالجة الحيوية خارج الموقع افضل ستراتيجيه غير مكلفة وفعالة وصديقة للبيئة وبالتالي قد توفر خيارا قابلا للتطبيق لمعالجة التربة من الملوثات الهيدروكربونات النفطية. | Seven actinomycetes strains from genera Streptomyces and Nocardiopsis isolated from hydrocarbon contaminated soil in Basra Governorate, Iraq were selected for their capacity to grow in the presence of crude oil. Their growth rates and biodegradation ability were investigated in mineral salt media supplemented with light Remella crude oil. These strains consist of Streptomyces variabilis 7525, Streptomyces variabilis 5W75, Streptomyces cellulosae XFB - T, Streptomyces parvus S86, Streptomyces bacillaris S4BW2, Streptomyces flavoviridis VITHM - 1 and Nocardiopsis synnemataformans ITD - 3, that the sequence identity range from 99% to 100%. Our study find a new actinomycetes strains isolated from contaminated soil. these strains appears different capacity on the degradation of crude oil in mineral salt media , the highest was found to vary from 50.2% to 72.4%.The effect of the cultivation factors (temperature, pH, and concentration of crude oil and trace elements ) on growth of the actinomycetes strains and crude oil degradation was evaluated. The highest cell growth and the amount of crude oil degraded 80% were observed in optimized cultivation conditions (30oC and initial pH 7) after 10 days, this ratio reached to 85% by addition of trace elements solution at same condition by S. cellulosae XFB - T.The biodegradation test lasted 60 days in soil by actinomycetes strains at different factors shown the highest of the crude oil was removed in experiment that inoculums with 10ml of each bacterial strain, value 87% by Streptomyces bacillaris S4BW2 at 30oC. Bioremediation is an efficient strategy for cleaning up sites contaminated by hydrocarbons. Microorganism of soil is affected by hydrocarbon disturbance thus selective enrichment of hydrocarbon utilizers occurs. The technology is very effective in dealing with petroleum hydrocarbon contamination. Hydrocarbons react with the soil matrix and microorganisms determining the fate of the contaminants relative to their chemical nature and microbial degradative capabilities. The potential effects of sawdust, and mixture of cow and sheep dung as amendment nutrient supplements to biostimulate autochthonous microflora and augmentation for hydrocarbon bioremediation were investigated in test biopile and bioreactor. The soil was ground and fluffed by admixture of 1.5% sawdust, then supplemented with the necessary minerals and watered to provide conditions favoring microorganism growth industrial aeration was provided in pile by system of a abundant perforated drainage - pip network to simulate bioremediation treatments through a 90 - day period. During this period, we monitored total petroleum hydrocarbons (TPHs) and n - alkanes degradation and changes in bacterial communities. The (TPHs) had been reduced from 52 to 10.6 g/kg (79.6 %), the rate of Biostimulants Efficiency (BE) was (71.4%) in biopile and from 52 to 13.5 g/kg (63.5 %) in bioreactor . In soil, the dominant microorganism population comprised Gram - positive bacteria from actinomycete group and autochthonous microorganisms which decompose hydrocarbons reached highest level 2 x 107 and to 1.1 x 107 CFU/g at 45 days in biopile and bioreactor respectively . Based on these data, the study conclude that is ex situ ( Biopile and bioreactor ) experiment the best strategy, inexpensive, efficient, and environmentally friendly and may thus offer a viable choice for petroleum hydrocarbons - contaminated soil remediation.

دراسة للطفيليات المعوية المعزولة من الخضروات المطرية من بعض اسواق مدينة بغداد

Author name: وسن عداي مهدي المرسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: A study was carried out during the period from November 2010 to October 2011 to detect the intestinal parasites which contaminate the common fresh vegetables. A total of 303 samples were taken from three wholesale markets and three retail markets, in Baghdad province. Ten kinds common vegetables were selected. These vegetables were Celery (Apium graveolens); Parsely (Patroselinum crispum); Garden cress (Lepidium sativum); Leek (Allium porrum); Radish (Raphanus sativus); Lettuce (Lactuca sativa); Spinach (Ipomoea aquatica); Beet (Beta vulgaris); Mint(Mentha spicata) and Cabbage (Brassica oleracea).Sedimentation and floatation techniques were used for samples examination. Three different solutions (ZnSO4, saturated NaCl , saturated sucrose ) were used in floatation technique. The present study has been shown that the collected samples of vegetables were contaminated with sixteen species of intestinal parasites. It was found that the percentages of contamination with these parasites were as following : (Giardia lamblia) (29.4%), Entamoeba histolytica(24.5%), Entamoeba coli(16.9%), Balantidium coli (8%), coccidia(9.9%) and Blastocystis hominis(0.7%). For intestinal helminthes Ascaris lumbricoides (15.6%), Toxocara spp.(10.3%), Fasciola spp. (5.3%), Schistosoma haematobium (1.7%), Schistosoma masnsoni (1.4%), Taenia spp. (4.7%), Diphyllidum caninum (3.9%), Trichuris trichiura (3.3%), Enterobius vermicularis (6.9%) and Nematoda larvae (6.3%).The present study revealed that the percentage of contaminated vegetables by using sedimentation technique (72.3%) was significantly higher than that of flotation techniques (53.1%). Additionally it was found that, the different kinds of vegetables showed a significant difference in the percentages of contamination with the parasites in both techniques. Thus, the percentage of contaminated Garden cress was (93.5%), (72.4%) in both sedimentation and flotation technique respectively, while Cabbage showed (50%), (36.7%) respectively.A significant high percentage of contamination was recorded in Al - Nahrin wholesale market (89.2%) in comparison with low percentage (59.4%) in Al - Rasheed wholesale market. Additionally, it was found that the percentages of contaminated vegetables in wholesale (76.26%) were significantly higher from that of retail market (64.76%).The present study, also, showed that the percentage of detection of parasites by using ZnSo4 solution (31.2%) was more efficient than that showed by saturated sucrose (8.9%). Additionally; the soaking with normal saline (47.83%) showed a higher percentage of contamination than that by using distilled water (17.39%).The percentages of seasonal contamination were varied significantly, therefore, it was found that spring showed the highest percentage (29.7%) while summer the lowest (20.9%). The washed samples of Garden cress which obtained from the three wholesale markets, reduced the percentages of contamination with parasites but did not remove the parasites completely. Therefore, a significant difference has been noticed between washed (56.76%) and unwashed samples (76.66%).Concerning, the percentages of infections with intestinal parasites, it was found that the medical center (14 July) showed (29.4%) while Al - Ameria center (19.2%). Furthermore, the percentage of parasites infections was significantly higher in the summer (46%) than in winter (12.67%).The present study indicated that there were a positive coordination between the high percentages of contaminated vegetables and the high percentages of infection in the medical centers as in the case of G.lamblia and E.histolytica.Finally, it could be conducted that the contaminated vegetables played an important role in transmission of intestinal parasites to human, particularly, when these vegetables were eaten fresh without sterilization or good washing.

دور بعض اجناس الساينو بكتريا في التحلل الحيوي لبعض المركبات النفطية

Author name: محمود خلف صالح الجبوري
Supervisor name: علي صالح حسين الجبوري | اياد محمد علي فاضل العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: تناولت الدراسة عزل وتشخيص ثلاثة اجناس من السيانوبكتريا من بيئات التربة والمياه العذبة في محاولة لمعرفة دور هذه الاحياء في عملية التحلل الحيوي للمركبات الهيدروكاربونية وهذه الاجناس هيNostoc sp. , Anabaena sp. ,Microcyst sp. واستخدم نوعان من المركبات الهيدروكاربونية هي نفط كركوك الخام وزيت الغاز.بينت النتائج ان لجميع عزلات السيانوبكتريا المختبرة القدرة على استحلاب واسع للمركبات الهيدروكاربونية في النسب 2%,1%,0.5% في العزلات الحاوية على الحويصلة المغايرة ، بينما كانت النسب 1%,0.5% هي اكثر استحلابا في الجنس Microcyst sp. غير الحاوي على الحويصلة . في حين لم تكن العزلات ذات قدرة عالية على الاستحلاب في التركيز5% . وقد اظهرت التحاليل المجراة باستخدام جهاز طيف الاشعة تحت الحمراء تغيرا واضحا في تركيب هذه المركبات النفطية.كما تناولت الدراسة تاثير هذه المركبات في بعض الفعاليات الفسلجية للسيانوبكتريا مثل كمية الكلوروفيل(A) وبعض التغيرات المظهرية والخلوية في السيانوبكتريا مثل تكرار الحويصلات المغايرة ، وقد بينت النتائج ان المركبات النفطية ادت الى اختزال كبير في نسبة الكلوروفيل (A) حيث كان التناسب عكسيا بين نسبة الكلوروفيل وتركيز المركب الهيدروكاربوني . كما ادت المركبات الهيدروكاربونية الى زيادة كبيرة في عدد الحويصلات المغايرة ، وان النسب 1%,0.5% من هذه المركبات كانت الاكثر تاثيرا في زيادة عدد الحويصلات .كما تناولـت الدراسة اجراء اختبار البقائية للـسيانوبكتـريا في التراكيــز 80,60,40,20 ) % ) من النفط الخام وزيت الغاز وقد لوحظ ان بقائيـة الاجناس في زيت الغاز كانت اعلى منها في النفط الخام مما يدل على ان تاثير زيت الغاز كان اقل من تاثير النفط الخام .

الخصائص البيئية لمياه الصرف في معمل دباغة بغداد - العراق

Author name: علياء سلمان مهدي
Supervisor name: ميسون مهدي صالح الطائي | مجيد حسن
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:

دراسة تشريحية ونسجية وكيمونسجية مقارنة للغدة الدرقية وجار الدرقية في نوعين من الفقريات العراقية (بيز ابن عرس، Herpestes javanecus والقنفذ طويل الاذن ، Hemiechinus auritus) باستعمال الواسم Anti - Calcitonin, code 140778) ) == Study of Thyroid and Parathyroid Gland in Two Iraqi Vertebrates ( Weasl , Herpestes javanicus and Long - Eared Hedgehog , Hemiechinus auritus) Using Marker (Anti - Calcitonin, code 140778)

Author name: رنا علاء عبد الحميد هايس العامري
Supervisor name: حسين عبد المنعم داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Anatomy
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التعرف على الوصف التشريحي والتركيب النسجي والكيمو نسجي - المناعي للغدتين الدرقية وجار الدرقية لنوعين من اللبائن العراقية ممثلة ب بيز ابن عرس ( ( Herpestes javanicus والقنفذ طويل الاذن ( Hemiechinus auritus ) وقد استعملت تقنيات مختلفة لانجاز الدراسة .• الغدة الدرقية Thyroid Glandاظهر الفحص التشريحي للغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H. javanicus) البالغ (ذكور, اناث) ان الغدة تتكون من فصين (ايمن, ايسر) وتاخذ موقعا في منطقة العنق اسفل الحنجرة. ويتموضع فصا الغدة على جانبي الرغامى عند الحلقات (5 - 1) من حلقات الرغامى ولم يلاحظ وجود تركيب البرزخ (Isthmus) الذي يربط بين فصا الغدة , ويتباين لون الغدة بين البني والاحمر وفي الغالب تظهر بلون بني محمر(Reddish brown) يظهر فصي الغدة في شكل بيضوي او اهليجي, اظهرت نتائج الدراسة الحالية في حيوان القنفذ ( H. auritu ) تماثلا واضحا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص الوصف التشريحي باستثناء كون فصا الغدة بيضويتي الشكل.تحاط الغدة في حيوان بيز ابن عرس بمحفظة من نسيج ضام (Connective tissue) تتكون من طبقتين, طبقة خارجية External layer)) تتالف من الياف مغراوية (Collagenous fibers) وقليل من الياف مرنة ((Elastic fibers ويتخللها ارومات ليفية Fibroblast)), وطبقة داخلية ((Internal layer تتالف من الياف مغراوية يتخللها الياف عضلية ملساء Smooth muscle fibers) ) ,كما تتضمن المحفظة اوعية دموية ((Blood vessels واعصاب (Nerves), تمتد من المحفظة الداخلية حويجزات رقيقة تقسم الغدة الى فصيصات غير مكتملة . اظهرت المحفظة في حيوان القنفذ تماثلا مع المحفظة في حيوان بيز ابن عرس.يتكون نسيج الغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس بصورة رئيسية من الجريبات (Follicles) والخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) واوعية دموية واعصاب. تتخذ الجريبات اشكالا متعددة منها بيضوي (Oval), ومنها دائري ((Rounded, واحيانا تظهر بشكل غير منتظم (Irregular shape), وتكون الجريبات باحجام مختلفة صغيرة, متوسطة وكبيرة . اظهر القنفذ تماثلا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص حجم وشكل الجريبات. تبطن الجريبات في بيز بن عرس اما بنسيج ظهاري مكعبي واطئ بسيط ( Low simple cuboidal epithelial tissue) او نسيج ظهاري مكعبي بسيط (Simple cuboidal epithelial tissue) , بينما في حيوان القنفذ يظهر نسيج ظهاري عمودي بسيط (Simple columnar epithelial tissue) فضلا عن النسيج الظهاري المكعبي الواطئ البسيط والظهاري المكعبي البسيط . تحتوي تجاويف الجريبات على مادة جيلاتينية هي الغروان Colloid)) , وتظهر الجريبات تباينا في كمية الغروان اذ ان بعض الجريبات تكون مملؤة بالغروان والبعض الاخر يحتوي على كمية قليلة والقليل منها يظهر خاليا تماما من الغروان في كلا الحيوانين موضوع الدراسة, تنتشر في نسيج الغدة خلايا تدعى بالخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) او تسمى خلايا الكالسيتونين (Calcitonin cells) او (C - cells), وتظهر هذه الخلايا باشكال متباينة يتراوح بين الدائرية (Rounded) الى مضلعة الشكل ( (Polygonal shape, وهي تظهر اما بشكل مفرد (Single) او بشكل تجمعات (Clusters) في نسيج الغدة, وتحتل هذه الخلايا موقعين اساسيين في نسيج الغدة , الاول داخل جريبي Intrafollicular position) ) وتكون بين الغشاء القاعدي والخلايا الظهارية الجريبية والثاني بين جريبي Interfollicular position)) وتكون بين جريبات الغدة الدرقية , وتكون قليلة العدد ولم تظهر اختلافا في حيوان بيز ابن عرس عن القنفذ .اظهر التفاعل الكيمونسجي المناعي في حيوان بيز ابن عرس والقنفذ استجابة واضحة للتفاعل المناعي مع الاجسام المضادة للكالسيتونين, وظهرت الخلايا متقبلة للون البني وهو دليل التفاعل المناعي .• الغدة جار الدرقية Parathyroid Gland توجد الغدة جار الدرقية بتماس مع الغدة الدرقية وتحاط بمحفظة من نسيج ضام وهي امتداد لمحفظة الغدة الدرقية والتي تتكون من الياف مغراوية والياف مرنة ((Elastic fibers والياف عضلية ملساء واوعية دموية واعصاب . توجد الغدة جار الدرقية في موقعين طرفي قمي وطرفي جانبي. تمتد من محفظة الغدة جار الدرقية حويجزات الى داخل الغدة لتفصلها الى فصيصات غير كاملة، وتنتشر داخل نسيج الغدة. اما في القنفذ ( H.auritus ) فانها تقع ضمن نسيج الغدة الدرقية وتظهر بشكل فصوص (4 - 2) فصوص دائرية او بيضوية الشكل محاطة بمحفظة رقيقة تفصلها عن جريبات الغدة الدرقية.تم تمييز ثلاثة انواع من الخلايا في نسيج الغدة جار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس اذ تمثلت الخلايا الاكثر انتشارا بالخلايا الرئيسة ((Chief cells، والخلايا الحمضة (Oxyphil cells) وخلايا الماء الشفافة ( (Water - clear cellsوهي تماثل الخلايا في نسيج القنفذ وتترتب بشكل حبال خلوية ضمن نسيج الغدة.اظهرت الغدة جار الدرقية في بيز ابن عرس استجابة للتفاعل الكيمو نسجي المناعي, اذ ظهرت خلايا الغدة متقبلة للون البني دليل التفاعل المناعي اذ تظهر الاستجابة المناعية للخلايا على مستوى السايتوبلازم والغشاء البلازمي في الخلايا الرئيسة ( (Chief cells, واظهرت الاستجابة المناعية في الغدة للقنفذ اختلافا بالنسبة لشدة استجابة الخلايا حيث كانت اقل من حيوان بيز ابن عرس .اوضحت نتائج الدراسة الحالية الخاصة بتحليل الاحماض الامينية في مستخلص الغدة الدرقية وجار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H.javanicus ) (ذكور، اناث), تشخيص (13) حامضا امينيا في الذكور و(11) حامضا امينيا في الاناث, اما في حيوان القنفذ H.auritus (الذكور، الاناث), فقد تم تشخيص (12) حامضا امينيا في كل من الذكور والاناث. | Anatomical examination of thyroid gland in adult (males &females) H. javanicus revealed that the gland consist of two lobes (right & left), situated below the layrnx in neck region. The two lobes located at the sides of trachea (1 - 5) rings of trachea. they appear without Isthemus. The colour of the gland is reddish brown. The shape of the lobes either to be oval or elliptical. On the other hand the thyroid gland in H. auritus showed a clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the oval shape of the gland. Thyroid gland of H. javanicus surrounded by capsule of connective tissue consist of external layer of collagenous and elastic fibers, fibroblast and internal layer consist of collagenous fibers with smooth muscle fibers, the capsule also contain blood vessels and nerves. Thin trabeculae extend from the capsule divided the gland into incomplete lobules. The capsule of thyroid gland in H. auritus showed clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the adipose tissue between the capsule and gland tissue in H. auritus.Histologically thyroid gland in H. javanicus consists of follicles, parafollicular cells, blood vessels and nerve. The follicles appear in different shapes (oval, rounded and irregular shapes, and have different size (small, medium and large). The thyroid gland tissue in H. auritus has the same appearance of that in H. javanicus. The follicules in H. javanicus lined by epithelial tissue either to be Lwo simple cuboidal or simple cuboidal epithelium. In H. auritus lind by Lwo simple cuboidal, simple cuboidal or even simple columnar epithelial tissue. The follicular cavities contain different quantities of colloid, and few of them lack of collid in both under investigated animals. Parafollicular cells are spreading in gland tissue; they also called calcitonin cella or c - cells. These cells have different shapes either to be rounded or polygonal shape, and found as single or clusters. They are either to be interfollicular or intrafollicular position. The immunohistochemistry reaction revealed clear positive reaction for calcitonin , and the appearance of brown colour represented evidence for the immune reaction .• Parathyroid glandResults of the present study revealed that parathyroid gland situated closely with thyroid gland in both animals under investigatin . The gland surrounded by a capsule of connective tissue represented as an extension from the capsule , which consist of collagenous fiber, elastic fibers, smooth muscles fibers and blood vessels and nerves. The parathyroid gland situated at two position (lateral terminal / apical terminal) the trabeculae wich exted from the gland capsule to the gland tissue separated the gland into incomplete. In H. auritus the parathyroid gland formed from (2 - 4) lobes with rounded or oval shapes and surrounded by thin capsule separated from the thyroid gland follicles.Three types of cells have been differentiated in the parathyroid tissue in H. javanicus represented by chief cells wich apper the most abundant in comparison with the other two types, the second type are the oxyphil cells and the third are water - clear cells, they are similar in both animals and appear as a cellular cords within the gland tissue. The immunohistochemical study in parathyroid gland of H. javanicus reveald positive reaction for calcitoninin, where ̛s the cells appear ̛s in brown color giving the evidence for the immune reaction in cytoplasm and plasma membrane of the chief cells In H. auritus there was clear immune reaction but less than H. javanicus . Result of the present study related with the amino acid analysis of the thyroid and parathyroid glands extraction in H. javanicus (mals &females) declear (13) amino acid in males and (11) in female while in H. auritus (male &females) there were (12) amino acid in both male and females.

دراسة نوعية للبكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من بيئة واخماج مستشفى عفك العام == Qualitative Study of Gram Negative Bacteria Isolated from Environment and Infections of Afak General Hospital

Author name: زينب عبد الكريم عليوي الفرحاني
Supervisor name: علي عبد الرحيم الناشي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Qadisiyah
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع 400 عينة سريرية وبيئية من مستشفى عفك العام في محافظة الديوانية للفترة من 1/11/2012 ولغاية 31 /3/2013 لغرض دراسة نوعية البكتريا السالبة لصبغة كرام والملوثة لبيئة واخماج المستشفى ومدى حساسية العزلات البكتيرية ومقاومتها للمضادات الحيوية والمطهرات شائعة الاستخدام .اظهرت هذه الدراسة ان 236 عينة وبنسبة 59% قد اعطت نتيجة موجبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 31 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 56.37 % و206 عينة من مصادر بيئية وبنسبة 59.43% بينما كانت 164 عينة وبنسبة 41% سالبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 24 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 43.63% و140 عينة وبنسبة 40.57 % من مصادر بيئية من مستشفى عفك العام .كانت العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام المشخصة والبالغة 236 عزلة قد توزعت على اربعة اجناس وهي Pseudomonas شملت نوعين : P.aeruginosa 12.7% ، P. flourescens 8.5 % ، Klebsiella شملت K. pneumoniae 10.5% ، K.oxytoca 10.5% ، Serratia marcescens 3.4% ، Acenitobacterشملت A. baumanni 2.1% ، A.lwoffii 1.2% ، A.calcoceticus 0.8 %، Escherichia شملت E. coli 45.5% ، E.hermanni 4 % . كانت نسبة التلوث البكتيري في العينات السريرية الحروق والجروح قد بلغت 53.3 ، 60 % على التوالي ، بينما التلوث البكتيري في العينات البيئية المتمثلة بردهات دخول المرضى ، المطبخ ، صالات العمليات الجراحية ، ردهات الخدج وملابس العاملين في المستشفى قد شكلت النسب 66.6 ، 53.8 ، 60 ، 54.6 ، 40% على التوالي . كما اختبرت حساسية العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام اتجاه 13 مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة وحساسية مختلفة تباينت حسب نوع العزلات البكتيرية وطبيعة المضاد الحيوي .كانت اعلى مقاومة اظهرتها بكتريا K.pneumoniae تليها K.oxytoca اتجاه مضاد Tetracycline اذ بلغت النسبة 96% و92% على التوالي . كما تميزت كل من بكتريا E.hermanni ، A.baumanni بمقاومتة عالية اتجاه ال Gentamycin اذ بلغت 80.3% ، 80% على التوالي اما P.aeruginosa فقاومت ال Tobramycin بنسبة عالية بلغت 90 %، بينما تميزت جميع البكتريا المعزولة في هذه الدراسة بحساسيتها اتجاه مضاد ال Imipenem . اما اختبار حساسية العزلات البكتيرية اتجاه المطهرات فقد ابدت مقاومة متفاوتة حسب نوع العزلات البكتيرية وتركيز وطبيعة المطهر وشملت المطهرات المستخدمة في التضاد الجرثومي كلا من الفورمالين والبوفيدين - ايودين والهبتين والديتول حيث كانت اعلى مقاومة اظهرتها E.coli اتجاه مطهر الفورمالين بتركيز 12.5% اذ بلغت 93.4% . درست بعض عوامل الضراوة المنتجة من الانواع البكتيرية ومنها انتاج المحفظة فوجد ان عزلات كل من بكتريا A. baumanni، P. aeruginosa ، K. pneumoniae وE.coli منتجة للمحفظة وبنسبة 40 ، 33.33 ، 100 ، 23.36 % على التوالي ، اما انزيم الهيمولايسين فوجد ان جميع عزلات A.baumanni غير منتجة لهذا الانزيم في حين جميع عزلات P. aeruginosa كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% ، اما انزيم البروتيز فوجد اعلى نسبة لانتاجه في P.aeruginosa بنسبة 100 % وادنى نسبة في بكتريا E.coli وبنسبة 14 % ، كانت اعلى نسبة لانتاج انزيم الجلاتينيز من قبل كل من A.baumanni وP.aeruginosa وبنسبة 100 % وتميزت عزلات K.pneumoniae بعدم القدرة على انتاجه . | The study included the collection of 400 clinical specimens and environmental from Hospital Afak General in the province of Diwaniyah for the period from 1/11/2012 until 3/31/2013 for the purpose of study quality the gram negative bacteria and contaminated environment and hospital infections and the sensitivity of the bacterial isolates and their resistance to antibiotics and antiseptics commonly used . This study showed that 236 sample and 59% gave a positive result for the examination of bacterial for bacteria gram negative distributed among the 31 sample sources of clinical and increased by 56.37% and 206 samples from environmental sources and increased by 59.43% while the 164 sample and 41% negative for screening bacterial for bacteria gram negative distributed among the 24 samples from clinical sources, and by 43.63% and 140 sample and by 40.57% from environmental sources of Afak General Hospital. The bacteria gram negative isolates diagnosed, amounting to 236 isolation has distributed over four genera Pseudomonas They included two types : P.aeruginosa 12.7%, P. flourescens 8.5%, Klebsiella included K. pneumoniae 10.5%, K.oxytoca 10.5%, Serratia marcescens 3.4% , Acenitobacter included A. baumanni 2.1%, A.lwoffii 1.2%, A.calcoceticus 0.8%, Escherichia included E. coli 45.5%, E.hermanni 4%. The percentage of bacterial contamination in clinical samples of burns and wounds had reached 53.3,0.60% respectively, while bacterial contamination in environmental samples of lobbies entry of patients, the kitchen, Eat surgeries, lobbies premature and clothes of hospital personnel had formed ratios of 66.6, 53.8 0.60 , 54.6 0.40%, respectively. The sensitivity of the bacteria gram negative isolates tested for direction 13 have shown antibiotic - resistant bacterial isolates and different sensitivity varied by type of bacterial isolates and the nature of the antibiotic. The highest resistance exhibited by the bacteria K.pneumoniae followed K.oxytoca direction Anti Tetracycline as the percentage reached 96% and 92%, respectively. It also marked by both bacteria E.hermanni, A.baumanni resisting the trend of high Gentamycin reaching 80.3%, 80%, respectively, and P.aeruginosa resisting the Tobramycin high proportion reached 90%, while all characterized bacteria isolated in this study sensitivity counter direction the Imipenem . The test of the sensitivity of the bacterial isolates direction disinfectants have shown resistance varying according to the type of bacterial isolates and the concentration and nature of the cleanser included disinfectants used in contrast bacterial both Formalin and Povidin - Iodine and Hibtin and Dettol had the highest resistance exhibited by E.coli direction antiseptic Formalin concentration of 12.5% reaching 93.4% . I studied some of the virulence factors produced by bacterial species, including the production of the wallet and found that all isolates of bacteria A. baumanni, P. aeruginosa, K. pneumoniae and E.coli producing capsule and by 40, 33.33, 100, 23.36%, respectively, while the enzyme was found haemolysin that all isolates A.baumanni unproductive for this enzyme, while all P. aeruginosa isolates were producing this enzyme by 100%, while the enzyme protease and found a higher proportion of production in P.aeruginosa 100% and the lowest percentage in the bacteria E.coli and 14%, the highest percentage for the production of an enzyme gelatinase by both A.baumanni and P.aeruginosa and 100% K.pneumonae isolates were characterized by the inability to produce it

دراسة تصنيفية لبعض اجناس العويئلة الفراشية Papilionoideae في العراق == Comparative Taxonomic study of some genera Papilionoideae subfamily in Iraq

Author name: شيماء محي حسون
Supervisor name: نداء عدنان ابو سراج
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم / جامعة بابل للفترة من شهر شباط 2016 الى شهر اب 2017 . وقد جمعت العينات من اماكن مختلفة من شمال العراق ووسطه . وقد تناول البحث الحالي دراسة تصنيفية مقارنة شملت بعض الصفات المظهرية العامة والدقيقة للبذور وكذلك دراسة صفات حبات اللقاح , ودراسة الصفات التشريحية لبعض الاجزاء النباتية , فضلا عن الدراسة الجزيئية . وشملت الدراسة تسعة عشر نوعا تعود تسعة اجناس مختارة من عشائر مختلفة من العويئلة الفراشية في العراق , وتضمنت نوعان للجنسAstragalus L. هما A.kahiricus DC. وA.rhodosemius Boiss.and Hausskn ونوع واحد لكل من الاجناس L. Coluteaالنوع Col.cilicica Boiss. ; Coronilla L. النوع Cor. scorpioides (L.)W.D.Koch. ; Glycyrrhiza L. الضرب G.glabra var. glandulifera (Waldst. et Kit) Regel et Herd. ; Hippocrepis L. ; النويع Hi.unisiliquosa L. subsp.bisiliqua (Forssk.)Bornm. ; Hymenocarpos Savi. النوع Hy.circinnatus (L.) Savi. ; Pisum L. النويع P.sativum subsp. elatius (M.Bieb.) Aschers. بالتحديد الضرب var.pumilio Meikle ; والجنس Scorpiurus L. الضرب S.muricatus var.subvilosus (L.) Lam. , فضلا عن تسعة انواع للجنس Onobrychis Mill. هي O.acaulis Bornm. , O.caput - galli (L.) Lam. , O.crista - galli (L.) Lam. , O.carduchorum Townsend , O. megatophros Boiss. , O.haussknechtii Boiss. , O. galegifolia Boiss. , O.ptolemaica subsp. macroptera Townsend. , O.ptolemaica subsp. ptolemaica (Del.) DC. , O.schahuensis Bornm.. اقتصرت الدراسة المظهرية على الصفات المظهرية العامة والدقيقة للبذرة باستعمال المجهر الضوئي Light microscope والمجهر الالكتروني الماسح Scanning electron microscope لسطح غلاف البذرة , وقد دلت النتائج على اهمية صفات البذرة من الناحية التصنيفية , اذ تم تحديد ابرز الصفات والاكثر اهمية في عزل العشائر والاجناس زيادة على عزل الانواع , لاسيما شكل البذرة ولونها وعدد البذور في البقلة , علاوة على الزخرفة السطحية لغلاف البذرة والتي لها الدور البارز في الفصل بين افراد العشيرة Coronilleae , كما كان لها الدور في فصل كل من العشائر المدروسة عن بعضها . اما صفات حبات اللقاح فقد كانت من الصفات المظهرية ذات القيمة التصنيفية العالية لعزل العشائر والاجناس , فقد دلت النتائج وجود اثنان من الطرز المختلفة هما : Colpate وColporate اذ امكن تمييز حبات لقاح الجنس Onobrychis بكونها ذات حبات لقاح من النوع Colpate , كما فصلت حبات لقاح النوع Hymenocarpos circinnatus عن باقي الاجناس بالاستناد الى عدد فتحات الانبات فقد تميز بكون حبات لقاحه سداسية وسباعية فتحات الانبات , كما كان لشكل وحجم الحبة وشكل الاخدود فضلا عن صفات الزخرفة السطحية لجدار الحبة المدروسة تحت المجهر الالكتروني الدور التصنيفي الجيد في فصل الانواع قيد الدراسة. اما جانب الدراسة التشريحية فقد شملت الدراسة صفات البشرة للوريقات والكاس الزهرية والتويج (ورقة العلم) والسيقان , فضلا عن دراسة المقاطع المستعرضة للسيقان ونصول الوريقات والسويقات وحاملات النورات والثمرة (البقلة) . كما شملت الدراسة طبيعة الكساء السطحي وانواع البلورات المنتشرة وانماط اﻠﺗﻌﱠرق Venation patterns. وقد دلت النتائج الى اهمية كل الجوانب التشريحية المدروسة في الفصل بين الاجناس المدروسة وكذلك بين الانواع. وتضمنت الدراسة ايضا التصنيف الجزيئي باستعمال تقانة البلمرة المتسلسل Polymerase chain reaction (PCR) من خلال معرفة تتابع Sequencing المنطقة النووية ITS اذ كان للدراسة الجزيئية اهمية تصنيفية لمعرفة علاقات التقارب والتباعد بين انواع الاجناس المدروسة , وتم التعرف على النوع A.rhodosemius كتسجيل جديد للجنس ضمن الانواع المنتشرة في العراق . | This study was conducted in the laboratories of the Faculty of Science / University of Babylon for the period from February 2016 to the month of August 2017. Samples were collected from various parts of northern Iraq as well as in the central regions .The present investigation deals with a comparative taxononmic study , included some gross and micromorphological characters , as well as the pollen grains characteristics and anatomical characteristics of some plant parts , as well as the molecular study . The study included nineteen species belonging to nine selected genera from different tribes of papilionoideae subfamily in Iraq , and included two species of genus Astragalus L. ( A.kahiricus DC. and A.rhodosemius Boiss.and Hausskn ) , and one species of each genera Colutea L. (Col.cilicica Boiss.) , Coronilla L. (C.scorpioides (L.) W.D.F.Koch) , Glycyrrhiza L. (G.glabra var.glandulifera (Waldst. et Kit) Regel et Herd) , Hippocrepis L. ( Hi.unisiliquosa L.subsp.bisiliqua (Forssk.)Bornm. ) , Hymenocarpos Savi. (Hy.circinnatus (L.) Savi. ) , Pisum L. (P.sativum subsp. elatius (M.Bieb.) Aschers. var.pumilio Meikle. ) and Scorpiurus L. ( S.muricatus var.subvilosus (L.) Lam. ) , in addition to nine species of genus Onobrychis , O.acaulis Bornm. ; O.caput - galli (L.) Lam. ; O.crista - galli (L.) Lam. ; O.carduchorum Townsend. ; O. megatophros Boiss. ; O.haussknechtii Boiss. ; O. galegifolia Boiss. ; O.ptolemaica subsp. macroptera Townsend. ; O.ptolemaica subsp. ptolemaica (Del.) DC. ; O.schahuensis Bornm. The morphological study was limited to gross and micromorphological characters of seed using light microscopy and a scanning electron microscopy for the surface of seed coat . the result indicated the taxonomic importance of the seed characteristics , the most important valuable in isolating the tribes and genera , also species. Especially the seed shap , colour and the number of seeds in the pod . In addition to the surface ornamentation of seed coat , Which had a important role in the separation of members of the tribe Coronilleae, and had a role in the separation of each of the studied tribes. The characteristics of pollen grains have good taxonomic value in isolation of tribes and species . the results indicated that there are two different types of pollen grains , colpate and colporate , the polle grains of Onobrychis can be distinguished from other genera by lacking germinating aperture ,pollen grains of Hymenocarpos circinnatus was separated from the other of the species based on the number of germination pores , The shape and size of the grain and the shape of the colpus as well as the characteristics of the surface ornamentation of the grain wall studied under the electronic microscope, the role of good classification in the class of species under study. pollen grains of other genera were separated based on the characteristics of germination pore , the shape , size of the grain and the shape of , in addition to the characteristics of ornamentation of studied grain wall under the electron microscope . As the anatomical study , included the characteristics of the epidermis of leaves , the calyx , corolla and stems , as well as the study of transverse sections of stems , leaflets petioles , peduncles and the pod . also the nature of indumentum , types of crystals , and venation patterens . the results showed the importance of all anatomical aspects studied in separation between the studied genera as well as between species. The study also included molecular systematic using polymerase chain reactions (PCR) through sequencing of nuclear (ITS) region . it was clear that the molecular study has taxonomical significance to know the phylogeny and relationships of convergence and divergence between species . A.rhodosemius was identified as a new species registry in Iraq.A.rhodosemius is recognized as new species for Iraq.

دراسة فسلجية وجزيئية للتغاير الجيني لمستقبلات فيتامين د في النساء المصابات بمرض السكري من النوع الثاني == Physiological and Molecular Study of Vitamin D Receptor Gene Polymorphism in Type II Diabetic Women

Author name: نورا ماجد حميد ابو خمرة
Supervisor name: حيدر كامل زيدان السعدي | محمد عبد الله جبر
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى تقييم دور تعدد اشكال مستقبلات فيتامين (د) وارتباطها بتطور مرض السكري وتاثيرها في الاناث قبل وبعد سن الياس. جينات مستقبلات فيتامين (د)، تتضمن (Apa - I, Taq - I, Fok - I وCdx2) و(جين الفاEstrogen receptor - ) التي حددت بواسطة تفاعل سلسلة البوليميريز - تباين اطوال قطع التقييد وتقنية تفاعل سلسلة البوليميريز المتعدد المتخصص في الاليل, في حين ان الهرمونات والتي تتضمن (الاستراديول والانسولين) والمؤشرات الفسيولوجية (فيتامين د، الكولسترول، البروتين الدهني عالي الكثافة، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، الهيموجلوبين A1C، الجلوكوز الصيامي في الدم، مقاومة الانسولين، الحساسية للانسولين ، ضغط الدم الانقباضي وضغط الدم الانبساطي). اجريت هذه الدراسة في الفترة من اذار 2016 الى تشرين الاول 2016، حيث تم جمع العينات من مستشفى الصدر التعليمي في محافظة النجف. وقد بلغ عدد العينات (80) مريضا مصابين بداء السكري من النوع الثاني بمتوسط عمر (36 - 65 سنة ، وقسمت العينات الى مرحلة ما قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث, كذلك قسمت حسب مدة المرض وحسب التاريخ العائلي، ومؤشر كتلة الجسم، ومضاعفات المرض (ضغط الدم المرتفع). كما تضمنت الدراسة 40 شخصا اصحاء على ما يبدو بمتوسط عمر (36 - 65 سنة)، حيث ان مجموعة السيطرة تقارن مع مجموعة المرضى. قسمت الدراسة الحالية الى جزئين رئيسيين : الاجزاء الفسيولوجية والجزيئية. واظهرت النتائج ان المرضى الذين يعانون من مرض السكري من النوع الثاني، كان لديهم معنويا (p ≤ 0.05) مستوى اعلى من الكوليسترول ، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، الهيموغلوبين A1C، الانسولين، مقاومة الانسولين ونسبة السكر الصيامي في الدم مقارنة بمجموعة السيطرة، في حين ان معدلات الحساسية للانسولين تنخفض معنويا (P≥0.05) في مرضى السكري من النوع الثاني عند مقارنتهم بمجموعة السيطرة. كان معدل الاستراديول معنويا ( ≤ 0.05) اعلى في الاناث قبل انقطاع الطمث في حين انخفض في الاناث بعد سن الياس لكل من مجموعة السيطرة ومرضى السكري من النوع الثاني. واظهر الضغط الانقباضي والانبساطي فرقا معنويا بين المرضى الذين يعانون من السكري النوع 2 ومجموعة السيطرة. وفقا للمقارنة بين النساء قبل انقطاع الطمث وبعد سن الياس في كل من مرضى السكري ومجموعة السيطرة، اظهرت النتائج ارتفاع معنوي (p ≤ 0.05) في معدلات مستوى هرمون الاستراديول، ومعدلات مستوى هرمون الانسولين ومقاومة الانسولين في كلتا المجموعتين. من ناحية اخرى، اظهرت المقارنة بين المرضى قبل انقطاع الطمث الذين يعانون من السكري ومرحلة ما قبل انقطاع الطمث ارتفاع معنوي (p ≤ 0.05) في معدل مستويات الكوليسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة، هيموغلوبين A1c معدل مستويات (HBA1c)، الجلوكوز الصيامي في الدم , ومستويات هرمون الاستراديول، ومعدلات مستوى هرمون الانسولين، ومقاومة الانسولين، وحساسية الانسولين وضغط الدم الانبساطي. وفقا لمقارنة مرضى السكري بعد انقطاع الطمث ومجموعة السيطرة بعد سن الياس، كانت هناك اختلافات معنوية (p ≤ 0.05) في معدل مستويات الكوليسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة، معدل هيموغلوبين A1c، الجلوكوز الصيامي في الدم , هرمون الاستراديول ومعدلات مستوى هرمون الانسولين، ومقاومة الانسولين وحساسيةالانسولين. اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود ارتباط معنوي (p ≤ 0.05) بين فيتامين (د) مع الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في النوع الثاني من مرضى السكري. في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود علاقة عكسية معنويه بين فيتامين (د) مع كل من الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في حين تم العثور على علاقة ايجابية معنوية بين فيتامين (د) والبروتين الدهني عالي الكثافة في مرحلة ما بعد انقطاع الطمث في مرضى السكري. في مجموعة السيطرة بعد انقطاع الطمث تم العثور على علاقة عكسية معنويه بين فيتامين (د) ومستوى السكر الصيامي في الدم. اظهر تحليل الارتباط وجود علاقة معنوية عكسية بين معدلات مستوى الكالسيوم وضغط الدم الانقباضي في مجموعة السيطرة، وبينما في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود علاقة ارتباط معنوية بين الكالسيوم ومؤشر كتلة الجسم، بينما وجدت علاقة معنوية عكسية بين الكالسيوم وكلا من البروتين الدهني عالي الكثافة والعمر بالاضافة الى ارتباط ايجابي معنوي مع الاستراديول في المرضى بعد سن الياس. من ناحية اخرى، في مجموعة السيطرة قبل انقطاع الطمث، تم العثور على ارتباط عكسي معنوي بين الكالسيوم وضغط الدم الانقباضي، في حين وجود علاقة طردية معنوية مع هرمون الانسولين ومقاومة الانسولين. في حين لوحظ وجود علاقة عكسية معنوية في مجموعة السيطرة بعد سن الياس بين الكالسيوم ومستوى السكر الصيامي في الدم ومؤشر كتلة الجسم. هنالك ارتباط معنوي كبير بين هرمون الانسولين مع البروتين الدهني عالي الكثافة والعمر وحساسية الانسولين، في حين كان هناك علاقة طردية معنوية بين الانسولين مع مؤشر كتلة الجسم ومقاومة الانسولين في النوع الثاني من مرضى السكري. في مجموعة السيطرة كانت هناك علاقة ارتباط معنوية طردية بين الانسولين ومقاومة الانسولين، ارتباط معنوي عكسية مع حساسية الانسولين. في كل من مرضى السكري قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث ومجموعة السيطرة كانت هناك علاقة سلبية كبيرة جدا بين الانسولين وحساسية الانسولين، في حين وجود علاقة طردية معنوية مع مقاومة الانسولين. في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، كانت هناك علاقة ايجابية كبيرة بين الانسولين والدهون الثلاثية , البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا ومؤشر كتلة الجسم. في مرحلة ما بعد انقطاع الطمث مرضى السكري، كانت هناك علاقة سلبية كبيرة بين الانسولين والهيموغلوبين .A1c ايضا هنالك علاقة طردية معنوية كبيرة بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم في مجموعة السكري. في مجموعة السيطرة كان هناك ارتباط طردي كبير بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم ,وعلاقة عكسية معنوية مع الكولسترول وحساسية الانسولين. وفقا لمجموعة السيطرة قبل انقطاع الطمث، كان هناك ارتباط ايجابي كبير بين الهيموغلوبين A1c والجلوكوز الصيامي في الدم، في حين وجود علاقة عكسية كبيرة مع الكولسترول، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا وحساسية الانسولين. من ناحية اخرى، في مجموعات مرضى السكري قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث وجدت علاقة طردية معنوية بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم , وارتباط ايجابي كبير مع الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في مجموعة ما قبل انقطاع الطمث فقط. اظهرت نتائج التحليل الوراثي لتباين النوكليوتيدات المفردة، للجينات المستقبلة لفيتامين د باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البوليميريز - تباين اطوال قطع التقييد ان هناك فرقا غير معنوي في الاشكال الجينية (Apa - I, Fok - I, Taq I - ) و(Estrogen receptor - alpha ) بين المرضى ومجموعة السيطرة باستخدام نفس التقنية اعلاه. بينما وجد فرق معنوي بين المرضى ومجموعة السيطرة وفقا للتغاير الجيني في الجين (CdxII)وفقا الى الجين (Apa - I)، كان النمط الوراثي المتماثل (AA) اكثر تواترا في المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 (41٪) من مجموعة السيطرة ، في حين ان النمط الوراثي المتغاير (CA) اكثر تكرارا في مجموعة السيطرة من المرضى. نتائج الجين (Taq - I)، كان النمط الوراثي المتماثل (TT) اكثر تواترا في مجموعة السيطرة من المرضى الذين يعانون من السكري من النوع 2 ، في حين ان النمط الوراثي المتغاير (TC) كان اكثر تكرارا في المرضى من مجموعة السيطرة. وفقا الى الجين (Fok - I)، كان النمط المتماثل (CC) اكثر تواترا في مجموعة السيطرة من المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 ، في حين ان النمط المتغاير (CT) اكثر تكرارا في السيطرة من المرضى ، والنمط المتماثل (TT) كان اكثر تواترا في المرضى من مجموعة السيطرة بينما الجين (ER_alpha)، كان النمط المتماثل (AA) اكثر تواترا في المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 من مجموعة السيطرة ، في حين ان النمط المتغاير (AG) اكثر تواترا في السيطرة من المرضى ، والنمط المتماثل (GG) كان اكثر تكرارا في المرضى من مجموعة السيطرة | This study aimed to evaluate vitamin D receptor gene polymorphism role and its correlation with the development of diabetes disease and its effect in pre and post menopausal females. Vitamin D receptor gene including ( APA - I, FOk - I, Taq - I and CdxII) and (Estrogen receptor alpha gene) determined by Polymerase Chain Reaction (PCR) , restriction fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and Allele specific multiple (ASM - PCR), while the hormones including (Estradiol and Insulin) and the physiological parameters ( Vitamin D, Cholesterol, High density lipoprotein, Triglyceride, Low density lipoprotein, very low density lipoprotein, Hemoglobin A1c, Fasting Blood Glucose, insulin resistance, insulin sensitivity, systolic and diastolic blood pressure). This case - control study was done in a period of March 2016 to October 2016 ,where the samples collected from Al - Sadr Teaching Hospital in Najaf Province. The number of samples was (80) females with type 2 diabetes with an average age (36 - 65 year), all of them were with type 2 diabetes are divided to pre menopause and post menopause, also divided according to duration of disease and according to age groups, family history, body mass index and complications with disease (hypertensive blood pressure). Also, the study included 40 apparently healthy people with an average age ( 36 - 65 year) , as control matched with disease group. The present study divided into two main parts : physiological and molecular parts . The results showed that patients with type 2 diabetes , had significantly( p ≤ 0.05 ) higher cholesterol, Triglyceride, Low density lipoprotein, very low density lipoprotein, Hemoglobin A1c, insulin, insulin resistance and Fasting blood glucose levels rate than control group, while the levels rate of insulin sensitivity is decreased significantly (p ≤ 0.05) in type 2 diabetic patients when compared with control group . The Estradiol levels rate was significantly (p ≤ 0.05) higher in premenopausal females while it decreased in postmenopausal females of both control and type 2 diabetic patients. Systolic and diastolic pressure showed significant difference between patients with type 2 diabetic and control. According to the comparison of premenopausal and postmenopausal women in both diabetic patients and in control group, the results showed significant ( p ≤ 0.05) elevation in Estradiol hormone level rates, Insulin hormone level rates and insulin resistance in both groups. On the other , the comparison of premenopausal patients with diabetic and premenopausal control groups the statistical analysis showed significant elevation (p ≤ 0.05) in cholesterol levels rate, Low density lipoprotein (LDL), HemoglobinA1c levels rate (HBA1c), fasting blood glucose (FBG), Estradiol hormone level rates, Insulin hormone level rates, insulin resistance ,insulin sensitivity and diastolic blood pressure. The results of correlation analysis in pre menopausal diabetic patients showed there are significant negative correlation between vitamin D with both Triglyceride (TGC) and very low density lipoprotein (VLDL) while significant positive correlation has been found between vitamin D and high density lipoprotein (HDL) in post menopausal diabetic patients. In post menopausal control group a significant negative correlation has been found between vitamin D and fasting blood glucose (FBG) level.In pre menopausal diabetic patients, the results of correlation analysis showed there were significant positive correlation between calcium and BMI, while significant negative correlation has been found between calcium and both high density lipoprotein (HDL) and age in addition to significant positive correlation with Estradiol in post menopausal diabetic patients.On the other hand, In pre menopausal control group, a significant negative correlation has been found between calcium and systolic blood pressure, while a significant positive correlation with insulin hormone and insulin resistance. While, in post menopausal control group a significant negative correlation has been found between calcium and fasting blood glucose (FBG) level and body mass index. In both premenopausal and postmenopausal diabetic patients and control group there were highly significant negative correlation between Insulin and insulin sensitivity, while highly significant positive correlation with insulin resistance. In pre menopausal diabetic patients, there were significant positive correlation between insulin and Triglyceride (TGC), very low density lipoprotein (VLDL) and BMI. In post menopausal diabetic patients, there were significant negative correlation between insulin and HBA1c.On the other hand, in premenopausal and postmenopausal diabetic patients groups there were highly significant positive correlation between hemoglobinA1c (HBA1c) and fasting blood glucose (FBG), and significant positive correlation with TGC and VLDL in premenopausal group only. The genetic analysis of the Single Nucleotide Polymorphisms , for vitamin D receptor gene by using RFLP - PCR technique showed that there non - significant difference in the genotype polymorphisms of (APA - I, FOk - I and Taq - I) and (Estrogen receptor - alpha gene) between patients and control by using the same technique above, While there were significant differences according to (Cdx - II gene) by using (ASM - PCR) technique. According to (Apa - I gene), the homozygote pattern (AA) were more frequent in patients with type 2 diabetes than control group, While the heterozygote (CA) pattern more frequent in control than patients.The results of (Taq - I gene), the homozygote pattern (TT) were more frequent in control than patients with type 2 diabetes group, While the heterozygote (TC) pattern more frequent in patients than control. According to (Fok - I gene), the homozygote pattern (CC) were more frequent in control group than patients with type 2 diabetes, While the heterozygote (CT) pattern more frequent in control than patients, and the homozygote (TT) pattern was more frequent in patients than control group.While the (ER_alpha gene), the homozygote pattern (AA) were more frequent in patients with type 2 diabetes than control group, While the heterozygote (AG) pattern more frequent in control than patients, and the homozygote (GG) pattern was more frequent in patients than control group

دراسة مقارنة، مجهرية ، جزيئية، بين الاميبا الحالة للنسيج E. histolytica والاميبا المتغيرة E. dispar في مرضى محافظة بابل == Comparative Study , Microscopic and Molecular , Between Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar in Babylon Patients

Author name: شمس حامد كاظم خليل السلطاني
Supervisor name: ماهر علي جتان القريشي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية في الفترة من شهر ايلول2015 ولغاية اب 2016 للتحري عن وبائية الطفيليات المعوية الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica والاميبا غير الممرضة Entamoeba dispar بطريقة الفحص المجهري وطريقة تفاعل سلسلة البلمرة PCR والمقارنة بين كلا الطفيليين في بعض جينات عوامل الضراوة السستين بروتينيز 5 وamoebapor A ، Ap - B ، Ap - C . كذلك تضمنت الدراســـــة تقدير تركـــــيز الضــــد الافرازي S - IgA ، وكذلك قياس تركيز الاضداد IgA ، IgG ، IgMفي مصول المرضى والسيطرة.بلغ عدد العينات المفحوصة 200 عينة خروج لمرضى يعانون من الاسهال لفئات عمرية مختلفة تم جمعها من المستشفيات والمراكز الصحية وبعض العيادات الخاصة في محافظة بابل، تم فحص العينات بطريقة المسحة المباشرة وطريقة تفاعل تسلسل البلمرة باستخراج الدنا الخاص بالطفيليات منها ، في مختبرات المستشفيات والمراكز الصحية ومختبر الطفيليات المتقدم في كلية العلوم/ جامعة بابل .اظهرت نتائج الفحص المجهري ان نسبة الاصابة الاجمالية بالطفيليات المعوية اميبا الزحار 20% ) 40عينة) ، بينما بلغت 73% بطريقة تفاعل تسلسل البلمرة في حين كانت نسبة الاصابة 27.5 % لطفيلي E. dispar باستخدام البرايمر الخاص بهذا الطفيلي Ed - 1. وتضمنت الدراسة الحالية ارتباط عامل العمر والجنس ومنطقة السكن واشهر السنة بنسبة انتشار كلا الطفيليين وباستخدام الفحص المجهري وPCR واوضحت نتائج التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية في عدد المصابين بين العمر والجنس الريف والمدينة وباختلاف نوع الطفيلي، بينما وجدت فروق معنوية لنسب انتشار كلا الطفيليين حسب اشهر السنة .بينت نتائج الفحص المجهري حسب الفئة العمرية ان اعلى نسبة اصابة بلغت 37.5% للفئة العمرية (1 - 10) سنة ، بينما بلغت اقل نسبة اصابة 2.5 % للفئة العمرية (31 - 40) سنة، في حين اشارت الدراسة الجزيئية الى ان اعلى نسبة اصابة36.36 و41.3 % للفئة العمرية (1 - 10) سنة واقل نسبة اصابة هي 9.09 و3.4% لكلا من طفيلي E. dispar وE. histolytica ، على التوالي.حسب الجنس بلغت اعلى نسبة اصابة لطفيلي E. histolytica للذكور67.5 % في حين كانت في الاناث32.5 %بطريقة الفحص المجهري ، اي كانت اعلى من نتائج الـــ PCR ، اذ بلغت 41% ، 59 % للاناث والذكور على التوالي ، مقارنة بطفيلي E. dispar 73% للذكور اعلى من الاناث 27%.بلغت نسبة الاصابة بطفيلي اميبا الزحار حسب منطقة السكن في الريف 75% اعل من المدينة 25% بطريقة الفحص المجهري ، مقارنة بنتائج الـــ PCR كانت نسب الاصابة في الريف 69% اعلى من المدينة 31% ، بينما لطفيلي E. dispar في المناطق الريفية 64% اعلى من المدينة 36%.وفقا للاشهر السنوية للدراسة كانت الاصابة اكثر شيوعا في يونيو ويوليو 20و 27.5% على التوالي بطريقة الفحص المجهري، واقل نسب في نوفمبر وديسمبر ويناير ومارس بنسبة 2.5% , مقارنة لنتائج الـــPCR لاميبا النسيج كان الاصابة اكثر شيوعا في يونيو ويوليو 16.6 ، 33.3 % على التوالي، وكان اقل تواترا في اكتوبر، نوفمبر، ديسمبر، ومارس 3.3% ، في حين لطفيليE. dispar كان معدل الاصابة مرتفع في مايو ويوليو 36.36% ، واقل في سبتمبر9.09٪، مع وجود فروقات معنوية بين الطفيليات لكلتا الطريقتين.اوضحت نتائج الدراسة الجزيئية ان هناك تغاير في الدنا الخاص بعوامل الضراوة في كلا الطفيليين ، اذ كانت جميع عينات طفيلي اميبا الزحار موجبة للجين البادئ سستين بروتينيز 5 CP5 وكذلك لــ amoebapor A ، Ap - B، Ap - C، في حين لطفيلي E. dispar وجدت سبعة عينات 63.6% موجبة لــ amoebapore A ، وستة عينات 54.5% لــ Ap - B ، وثلاث عينات 27.2% لــ Ap - C، مع وجود فروق معنوية لكلا الطفيليين . اظهرت نتائـــــــــــــــــج الدراسة المناعية وجود فــــــــــــــروق معنوية للمرضــــــى المصابيــــــن بطفيلي اميبا الزحار مقارنـــــــــــــــة مع مجموعــــــــــة السيطــــــــــرة ، وبلـغ مستوى تركيز الكلوبيوليــــن المناعي S - IgA (8.582 ± 0.351) مايكروغرام/ ديسيلتر لطفيلي E. histolytica و(5.213 ± 0.421) مايكروغرام/ ديسيلتر لــ E. dispar و(1.935±0.03) مايكرو غرام/ ديسيلتر لمجموعة السيطرة ، كذلك بلغ اعلى تركيز لـــــ IgA , IgG, IgM (387.9 , 707.4, 294.9) ملغ/دل لطفيلي اميبا الزحار مقارنة مع طفيلي E. dispar مع مجموعــــــــــة السيطــــــــــرة ، مع وجود فروق معنوية للمرضى المصابين باميبا الزحار . | The present study conducted in the period from September 2015 to Augusts 2016 to determination of epidemiology for Entamoeba histolytica and nonpathogenic Entamoeba dispar by microscopic examination and conventional PCR and compromise some virulence factors cysteine proteinase CP5 gene , amoebapore A , Ap - B, Ap - C, for both parasites and estimate immunoglobulin G,A,M, and S - IgA in serum of patientsAll stool samples (200) collected from patients for different ages suffering from diarrhea or bloody diarrhea and attended to some hospitals and medical centers in Babylon governorate . All samples were examined by direct wet preparation method and polymerase chain reaction by extract the parasites DNA, in hospital and medical centers laboratories and the advanced parasites laboratory in the Biology Department / College of Science / Babylon University. The microscopic examination results show out of 40 stool samples had E. histolytica with percent 20% ,in compromise to PCR product infection rate was higher 73% , and for E. dispar 27.5% by Ed - 1 primer specific for this parasite.This study includes the relation of age, gender, and residence for both parasites infection, without significant differences for both parasites, while the annual study months had significant differences for both parasites by two methods . The microscopic study results according to ages group the highest infection percentage 37.5% for ages (1 - 10) year and the lower percentage was 2.5% for ages (31 - 40) year, while by PCR technique higher percentage 41.3 , 36.36 % for ages (1 - 10) , while the lower percentage was 3.4% , 9.09 % for (21 - 30) years, for E. histolytica and E. dispar , respectively . According to the gender, the infection Percentage in male and female 67.5% , 32.5% respectively by microscopic examination ,is higher than infection rate by PCR product 59% , 41%, for E. histolytica respectively, in compromise for E. dispar in male 73 % is higher than female 27 %.E. histolytica infection according to rural regions was 75 % higher than urban regions 25 % by microscopic examination ,in compromise to PCR product ,infection rate in rural regions was 69 % higher than urban regions 31 %, while for E. dispar in rural regions was 64% higher than urban 36 %.According to annual months of the study, the most frequent infection was in June and July 20 , 27.5% respectively by microscopic examination , and lower frequent was in November , December , January and March 2.5%, in compromise to PCR product results for E. histolytica the most frequent infection was in June and July (16.6 , 33.3)% respectively , and lower frequent was in October, November , December , and March 3.3% , while for E. dispar The high infection rate was in May and July 36.36%, and lower frequent was in September 9.09 %, with significant differences between parasites for both methods. For molecular study results, out of (40) stool samples, only (29) sample showed positive for CP5 gene marker for E. histolytica and 11 (27.5%) samples showed negative for this gene, moreover (11) stool samples showed also positive for (Ed) primer which is specific for E. dispar ,all samples of E. histolytica were positive for cysteine proteinase CP5 gene , amoebapore A , Ap - B, Ap - C, while for E. dispar only seven samples 63.6% positive for amoebapore A, six samples 54.5 % for Ap - B, and three samples 27.2% for Ap - C , with significant differences between both parasites virulence factors genes. The level of secretory IgA showed significant differences in patients with E. histolytica compared with control group, The level of secretory - IgA was (8.582 ± 0.351) μg /dL for E. histolytica and (5.213 ± 0.421) μg /dL for E. dispar and (1.935±0.03) for control group.The result of the present study, revealed the concentrations of immunoglobulin IgA , IgG , IgM, (387.9 , 707.4, 294.9 mg/dl), were higher in E. histolytica patients group compared to E. Dispar patients and control group , with a significant differences at p ≤ 0.05 for E. histolytica group

تقدير الاسبارجين في مرضى سرطان الدم بوساطة الاسبارجينيز المقيد والمنقى من Portulaca oleracea L == Estimation of Asparagine in Serum Leukemia Patients by Immobilized L - asparaginase Purified from Portulaca oleracea L

Author name: هادي ساجد عبد العباس عبد الله
Supervisor name: محمد عبد الله جبر جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: جمعت عينات النباتات قيد الدراسة من منطقة الرارنجية \مدينة الحلة\العراق. وصنفت النباتات من قبل د.نداء عدنان في قسم علوم الحياة \كلية العلوم \جامعة بابل بالاعتماد على الصفات المظهرية للنباتات . تم التحري عن فعالية انزيم الاسباراجينيز والمحتوى البروتيني في المستخلص الخام لهذه النباتات , تبين ان اعلى فعالية نوعية لانزيم الاسباراجينيز في نبات البربينة Portulaca oleracea L., ثم قدرت الفعالية الانزيمية في اجزاء النبات والتي شملت (الاواق, السيقان,الجذور, نبات كامل) حيث ظهرت اعلى فعالية في النبات الكامل مقارنة بالاجزاء الاخرى ,بالاعتماد على هذه النتائج استخدم نبات البربينة Portulaca oleracea L. كمصدر لانتاج وتنقية وتوصيف والاستخدام الطبي لانزيم الاسباراجينيز.درست الظروف المثلى لفعالية انزيم الاسباراجينيز من النبات الكامل وقد اشارت النتائج الى ان اعلى فعالية للانزيم قد تحققت بحضن الانزيم الخام مع الاسبراجين بتركيز 200mM بنسبة 1 : 3 في محلول دارئ فوسفات البوتاسيوم المنظم بتركيز 0.05 مولار بدالة حامضية 8 وبدرجة حرارة 37 م مع الانخفاض التدريجي في الفعالية النوعية للانزيم الخام بعد خزنه لفترات زمنية محددة .تم تنقية انزيم الاسباراجينيز الخام المستخلص من نبات البربينة بثلاث خطوات تضمنت الاولى الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة 90% ثم التنقية بكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستحدام السيفاديكس G - 100 وبعدها التنقية بكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام السيفاديكس G - 150 وقد ظهرت ثلاثة اشكال للانزيم حيث بلغت الفعالية النوعية للانزيم النقي 7440 وحدة\ملغم وعدد مرات التنقية 4.08 وبحصيلة انزيمية بلغت 22.7%.تم توصيف الاسباراجينيز النقي ,اذ بلغ الوزن الجزيئي52±1 كيلو دالتون باستخدام كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام السيفاديكس G - 100 بوجود البروتينات القياسية والتي هي Trypsin (23 KD), Pepsin (34.5 KD), Egg Albumin (43KD) , and Bovine serum albumin (67 KD) وكان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم هو 8 في حين كانت درجة الحرارة المثلى لفعالية وثبات الانزيم هي 37 م وعند دراسة الثوابت الحركية للانزيم , ظهر ان معدلات قيم ثابت ميكالس (Km) والسرعة القصوى (Vmax) وعدد التحول(Kcat ) كانت 250 ملي مولار و100 ملي مولار \دقيقة و350 1\ثانية على التوالي. قيد الانزيم باستعمال الاكار,الاكاروز والجيلاتين وتم توصيف الانزيم المقيد ومقارنته مع الانزيم الحر. اظهرت نتائج الدراسة كفاءة التقييد باستعمال مادة الاكاروز والاكار والجلاتين حيث بلغت ( (70,72,78 % على التوالي وكما تبين من النتائج ان اعلى فعالية للانزيم الحر والمقيد بالاكاروز كانت عند الدالة الحامضية 8 اما الانزيم المقيد بالاكار والجيلاتين فكانت اعلى فعالية عند الدالة الحامضية 9. بالمقابل كانت درجة الحرارة 37 م هي المثلى للفعالية للانزيم المقيد بالاكار والجيلاتين والحر و40 م للانزيم المقيد بالاكاروز. واستخدم الانزيم المقيد في تقدير تركيز الاسبارجين في مصل الدم , اظهرت النتاج ارتفاع واضح في تركيز الاسباراجين لمرضى اللوكيميا (سرطان الدم) حيث بلغت〖10〗^( - 2) - 〖10〗^( - 3) مولار مقارنة مع الاشخاص الطبيعيين حيث بلغت〖10〗^( - 4) - 〖10〗^( - 7) مولار | Plants samples were collected during 2016 (August to September) from Al - Raranjia Hamlet field / Al - Hilah city / Iraq. These samples were classified by Dr. Nidaa Adnan Muhammed ,Biology Department/ Collage of Science / University of Babylon , according to their morphological characteristics. Activity of asparaginase was detected in whole plant, leaves, steems and roots extracts. Results showed that Portulaca oleracea L. was the best one from group of tested plants for research due high yield of L - asparaginase enzyme . Maximum asparaginase activity was detected in whole plant extracts which was 43.55 U/ml in comparison with 37.74,33.16 and 36.8 U/ml in extracts of leaves, steems and roots respectively. According to these results whole plant of Portulaca oleracea L. were used as a source for asparaginase production, purification , characterization, and medical application . Activity of crude asparaginase extracted from whole plant were under optimal conditions studied. Results revealed the maximum activity of asparaginase was achieved when the enzyme was incubated with asparagine 200mM at 37°C in the presence of potassium phosphate buffer 0.05 M solution/plant sample (g) (3 : 1 ratio) at pH8 , with gradually increase in activity with increase of the substrate and gradually activity decrease after particular storage period. Crude asparaginase extract was purified in three steps ( Ammonium sulfate precipitation (90%), gel filtration chromatography technique by Sephadex G - 100 and gel filtration chromatography method by Sephadex G - 150. There are three isoform of enzyme while Specific activity of the purified asparaginase was 7440 U/mg and 4.08 Purification folds, 14.5 % yield. Characterization of the purified asparaginase showed that the molecular weight of the enzyme was 52±1 Kilo Dalton by gel filtration chromatography using Sephadex G - 100 in the presence of four standard proteins which they are Trypsin (23 KD), Pepsin (34.5 KD), Egg Albumin (43KD) , and Bovine serum albumin (67 KD). pH 8 was the optimum pH for enzyme activity and stability, while 37°C was the optimum temperature for both enzyme activity and stability, with Km of 250 mM toward L - asparagine as substrate and the maximum velocity (Vmax) and Kcat of 100 mM/min, 350 sec^( - 1) respectively . The activity of immobilized enzyme was determined and compared with free enzyme ,where immobilizing Efficiency of agar , agarose and gelatin techniques was ( 72 %,78 % and 70 % ) respectively, all immobilizing technique proved that the activity of the enzyme was increased significantly compared with free enzyme, where agar and gelatin methods showed more stability of enzyme at alkaline pH (pH 9) , whereas only agarose method get the enzyme more heat stability to enzyme than other immobilizing methods. There are significant elevation level of asparagine concentration in leukemic human serum samples than normal human serum samples , where reached to 〖10〗^( - 4) - 〖10〗^( - 7) M of asparagine in normal human serum samples while it was 〖10〗^( - 2) - 〖10〗^( - 3) M of asparagine in leukemic serum blood samples.

تاثير النحاس النانوي والمستخلص حيويا في بعض المؤشرات الحيوية لنبات الفجل Raphanus sativus L. == Effect of copper nanoparticles and copper nanoparticles that extract biologically in some biochemical parameters of radish (Raphanus sativus L.)

Author name: سمية يحيى عبد عبيس
Supervisor name: رحاب عيدان كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تمت هذه الدراسة في مختبر النبات المتقدم لقسم علوم الحياة/كلية العلوم/جامعة بابل خلال السنة 2016 - 2017، وقد تضمنت هذه الدراسة بيان تاثير اربعة عشر معاملة من النحاس بالتراكيز (0.1 و3.5 و63.5) جزء بالمليون والنحاس النانوي الجاهز بالتراكيز (0.1 و0.3 و1.5 و23.5 و43.5 و63.5) جزء بالمليون والمستخلص المائي لاوراق نبات الدمس Conocarpus erectus L. (5%) والمحلول المزيج (مستخلص نباتي 5%+ كبريتات النحاس 0.1 مل مولر) وللمقارنة (الماء المقطر) على انبات ونمو بذور نبات الفجل Raphanus sativus L. في تجربتين احدهما في اطباق والثانية في اصص.وفي اوراق نبات الدمس تم انتاج النحاس حيويا وباستعمال تقنيات UVS وXRD وFTIR وSEM وEDX لتشخيص عنصر النحاس النانوي وتحديد مجاميعه الفعالة وخصائصه الاخرى وقد تم التوصل الى النتائج التالية : 1. ظهرت قمة الامتصاص بحدود 395 نانوميتر من خلال تقنية UVS، وكان معدل حجم دقائق النحاس النانوي 39 نانوميتر وفقا تقنية XRD وSEM وظهر وجود مجاميع فعالة سببت ثباتية لدقائق النحاس النانوي وفقا لما اشرته تقنية FTIR. 2. سبب المستخلص النباتي انخفاضا معنويا لمعظم المؤشرات الحيوية المدروسة في تجربتي اطباق بتري والاصص عدا المساحة الورقية ومحتوى البروتين اللذان ارتفعت قيمهما معنويا مقارنة مع عينة السيطرة.3. سبب المزيج تشجيع بعض المؤشرات الحيوية التي ثبطت بتاثير المستخلص النباتي او تاثير النحاس بالتركيز الاعلى (63.5 جزء بالمليون والمحضر من كبريتات النحاس) عند المقارنة مع كل من المستخلص النباتي لوحده او عند المقارنة مع التراكيز الاعلى للنحاس، ولكن معظمها بقيت ذات تثبيط معنوي عند المقارنة مع عينة السيطرة مثل النسبة المئوية لمعامل سرعة الانبات وطول المجموع الجذري ومحتوى الكاربوهيدرات ومحتوى السايتوكروم P450، وكانت مثبطة اكثر عند المقارنة مع التركيز الاعلى للنحاس مثل البرولين والميتالوثايونين. وثبطت بعض مؤشرات النمو بتاثير المزيج عند المقارنة مع كل من المستخلص النباتي لوحده او النحاس بالتركيز الاعلى او عند المقارنة مع السيطرة مثل الوزن الطري للمجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي. في حين ازداد بعضها عن عينة السيطرة بعد ما خفض تاثيره مقارنة مع التركيز الاعلى للنحاس مثل الوزن الجاف للمجموع الخضري والمساحة الورقية ومحتوى الكاروتينات والبرولين والكلوتاثيون. 4. اختلفت كبريتات النحاس في التاثير تبعا لتركيزها وقد ازدادت قيم بعض مؤشرات النمو مع انخفاض التركيز مثل النسبة المئوية للانبات وطول المجموع الجذري والوزن الطري للمجموع الجذري، والوزن الجاف للمجموع الخضري والمساحة الورقية ومحتوى البرولين ومحتوى السايتوكروم. وكان التركيز 3.5 جزء بالمليون للنحاس مشجعا لطول المجموع الخضري والوزن الطري للمجموع الخضري والوزن الجاف للمجموع الجذري بصورة معنوية عن عينة السيطرة. 5. اختلفت دقائق النحاس النانوية في تاثيرها باختلاف التركيز. ولوحظ ان مؤشرات النمو شجعت مع انخفاض التركيز مثل النسبة المئوية للانبات وسرعته وطول المجموعين الخضري والجذري والوزن الطري والجاف لهما والمساحة الورقية ومحتوى الكلوروفيل الكلي والكاروتينات والبرولين والكاربوهيدرات والسايتوكروم. وتبين زيادة تلك المؤشرات عند التركيزين 1.5 و0.5 جزء بالمليون لدقائق النحاس النانوي اذ اعطيا افضل نتيجة، وعند التركيزين الاخيرين (0.3 و0.1 جزء بالمليون) انخفضت قيم المؤشرات المدروسة ولكن لم يحدث فرق معنوي عند المقارنة مع عينة السيطرة لمعظمها. ازداد محتوى البرولين والكلوتاثيون ومضادات الاكسدة معنويا عند زيادة تراكيز النحاس النانوي وانخفضت بانخفاضها. | A Laboratory study, the study was conducted to study the effect of copper at concentration 0.1, 3.5, 63.5 ppm (a Copper sulphate CuSO4) and the effects of available nano - copper at concentration 0.1, 0.3, 0.5, 1.5, 23.5, 43.5 and 63.5 ppm, with study the effects of leave water extraction of Conocarpus erectus (5%) and the effect of mixture solution (plant extraction + CuSO4 0.1milimolar) and for comparison the distilled water used, experiment was carried out with fourteen treatments. At first stage of research, the nano copper was produced biologically from mixture solution and observation, the fast color changes with appearance of red residue. And with utilize UVS, XRD, FTIR, SEM, EDX technologies was detected the nanocopper elements and absorption peak was appeared at 395nm by using UVS technology. The average size of nanoparticle of copper was approximately 39 nm by using XRD and SEM, the technology of FTIR showed the present active groups due to stability of nanoparticle of copper. At the second stage of research, plant extraction was added, mixture solution , concentrations of CuSO4 and concentrations of nanocopper rather than control sample for the seed of plant Raphanus Sativus L. for two experiments, the first was cultured at petri dish and continued for 5 days, and the second was cultured in pots and continuous for 30 days, the results showed the following : 1. The plant extraction caused significantly increased for most biomarker whereas in experiment of petri dish or in pots experiment except the area of leave and protein content were significantly increased as compared with control .2. The mixture caused stimulation of some biomarkers that are inhibited by the effects of plant extraction or the effects of copper at highest concentration (63.5 ppm that are prepared from CuSO4). But non significantly for most of it as compared with plant extract or with highest concentration for copper, but most of them remained with significantly inhibited as compared with control such as indice of seed emergence speed, length of root system, carbohydrate content and cytochrome p450, or more inhibited as compared with highest concentration such as proline and metallothionien. Some indices growth were inhibited by mixture effects as compared with plant extraction alone or with the copper at highest concentration compared with control such as vegetative system of fresh weight and the total content of chlorophyll. While some of them were alleviated as compared with control after decreasing its effect as compared with highest concentration of copper such as dry weight of vegetative systems, area leave, carotenoid content, proline and glutathione. 3. The copper as Copper Sulphate was caused different effects according to its concentration. The values of some growth indices were increased, with decreased the concentration such as % of germination, length of roots systems, fresh weight of roots system, dry weight of shoots systems, leave area, proline content and cytochrome contents. While the concentration 3.5 ppm of copper was important due to increase the length of vegetative system, fresh weight of vegetative systems, dry weight of root system as significant with control. Chlorophyll a and b were significantly decreased as well as total chlorophyll content compared with the control, Carotenoid, carbohydrates, proline, glutathione, total antioxidants, metallothionien with concentration were also decreased. 4. Preparation of nanparticle copper was at different concentrations caused, different effects according to concentration, observation, the growth indices were stimulated by lower concentration such as % of seed germination, % of speed seed germination, length of both vegetative and roots systems, fresh weight of both vegetative and roots, dry weight of vegetative and roots systems, leave area, contents of each chlorophyll a and b (non significant), total chlorophyll, carotenoid, proline, carbohydrate and cytochrome p450, each of these parameters at the concentration (1.5, 0.5) ppm for nanoparticle of copper gave the best results, while they were decreased at the (0.1 , 0.3) ppm concentration , but occur significant as compared with control, it remained better than control although its value decreased. The highest concentration of nanocopper caused significantly increased of proline content, glutathione, total antioxidants metallothionien which gave the best values that similar for control at the concentration 23.5 ppm and these values were decreased with the lowest concentration

استخدام دقائق الفضة النانوية المنتجة من بكتريا الزوائف الزنجارية Pseudomonas aeruginosa كنظام لتسليم الممنع == Silver nanoparticles of Pseudomonas aeruginosa as an immunogen delivery system

Author name: احمد جمال حسين السرحان
Supervisor name: فريال جميل عبد عطية
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: في هذه الدراسة تم جمع 155 عينة شملت العينات السريرية والعينات البيئية من مستشفى الحلة التعليمي . بلغ عدد العينات السريرية 58 عينة عزلت من المرضى الذين يعانون من اصابات الحروق والتهاب المجاري البولية وتجرثم الدم وجمعت العينات البيئية 97 عينة من الاسرة والمطهرات وغرف المرضى في مستشفى الحلة التعليمي من اذار 2016 الى ايار 2016 . شخصت العزلات بالاعتماد على الاختبارات المزرعية والكيموحيوية باستخدام نظام Api 20E فضلا عن تاكيد تشخيصها بوساطة جهاز VITEK 2 . ومن مجموع 155 عينة كانت 30 عزلة عائدة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa بنسبة 19.35% . تم التصنيع الخضري لدقائق الفضة النانوية (AgNPs) باستخدام عالق بكتريا P. aeruginosa . كما تمت دراسة صفات دقائق الفضة النانوية باستخدام الاشعة فوق البنفسجية - المرئية الطيفي وحيود الاشعة السينية (XRD) وتشتت طاقة الاشعة السينية (EDX) والاشعة تحت الحمراء الطيفي ( FTIR ) والمجهر الالكتروني الماسح (SEM) . اظهر التحري الجزيئي للسموم الخارجية للبكتريا بوساطة تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وباستعمال بادئات متخصصة للجينات ( EXO A , EXO T and EXO S )امتلاك جميع العزلات جين للسم الخارجي A والسم الخارجي T بينما اظهرت 22 عزلة نتيجة موجبة للسم الخارجي S. هذه النتائج اشارت الى ان وجود جينات السموم الخارجية هي عوامل ضراوة بارزة لعزلات P. aeruginosa . وتم انتاج السم الخارجي A من بكتريا Pseudomonas aeruginosa في وسط مرق الصويا المديلز وتنقيته باستخدام نسبة اشباع 85٪ من كبريتات الامونيوم ثم بواسطة عمود كروماتوغرافيا السائلة عالية الاداء لانتاج سم عالي النقاوة بعد ذلك تم تحديد الوزن الجزيئي للسم المنقى ليكون 71 كيلو دالتون . تضمنت الدراسة المناعية دراسة الخصائص المستضدية للسم المضعف ودقائق الفضة النانوية والمستضد المختلط المكون من التوكسويد ودقائق الفضة النانوية ثم التحري عن الدورالمناعي لدقائق الفضة النانوية كنظام اعطاء .اذ تمت باستخدام20 ارنب قسمت الى اربعة مجاميع كل مجموعة تضمنت 5 ارانب ,حيث حقنت المجموعة الاولى بالتوكسويد فقط اما المجموعة الثانية فقد حقنت بدقائق الفضة النانوية فقط والمجموعة الثالثة فقد حقنت بالمستضد المختلط ,اما المجموعة الرابعة فحقنت بالمحلول الملحي الفسلجي واعتبرت كسيطرة, وبعد انتهاء مده التمنيع تم التحري عن بعض المعايير المناعية . اظهرت نتائج جميع الفحوصات المناعية المستخدمة في هذه الدراسة ان كل من للسم المضعف ودقائق الفضة النانوية والمستضد المختلط قد اعطت زيادة معنوية بالمقارنة مع مجموعة السيطرة وعلى مستوى احتمالية P<0.05 .فقد اظهرت نتائج اختبار اختزال الصبغة ( NBT ) التي تم الحصول عليها لهذه المستضدات الثلاثة في هذا الاختبار بمعدل(66.8%, 60.6% 73.6% ) على التوالي بينما مجموعة السيطرة بمعدل(46.8%) . وتم استخدام اختبار الجلد حيث اظهرت النتائج ان هذه المستضدات الثلاثة اثرت في تفاعل الحساسية sensitivity للارانب وقد ادت المستضدات المحقونة الى زيادة معنويه في قطر الانتفاخ بعد 4),24,48,(72 ساعة مقارنة مع مجموعه السيطرة على مستوى احتمالية P<0.05. وتم استخدام اختبار معامل الانقسام ايضا والنتائج التي تم الحصول عليها بمعدل(26.96%, 22.8%, 32.11%) على التوالي بينما مجموعة السيطرة بمعدل(13.33%). بالاضافة الى ذلك فقد تم استخدام طريقة الانتشار المناعي لتقدير مستوى الانتشار المناعي للكلوبيولينات المناعية في المصل, واظهرت النتائج بان مستوى الكلوبيولينات المناعية بمعدل (17, 19.8 و19.4 ( ملم على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة عند P <0.05. وايضا تم استخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم (ELISA) لتقدير تركيز عناقيد التمايز في المصل CD4 وCD8, وقد كان تركيزCD4 بمعدل (47.49 , 43.82 و63.61 ) نانوغرام/مل على التوالي بينما مجموعة السيطرة بمعدل(26.59) نانوغرام/مل في حين تركيزCD8 بمعدل (2.79 , 3.21و 6.08) نانوغرام\مل بينما مجموعة السيطرة بمعدل (1.6) نانوغرام/مل . وقد اظهرت الدراسة النسيجية بان ليس هنالك افات مرضية في مجاميع الارانب الممنعة بانواع مختلفة من المستضدات . حيث اظهر الكبد ارتشاح للخلايا الالتهابية في المنطقة البوابية والتهاب نقطي في الفصيصات الكبدية في مجموعة السم المضعف ومجموعة المستضد المختلط بينما اظهرت مجموعة دقائق الفضة النانوية ارتشاح للخلايا الالتهابية في المنطقة البوابية فقط . كما اظهر الطحال فرط تنسج للمفاويات في منطقة اللب الابيض لمجاميع الارانب الممنعة . | The study included (155) samples which collected from both clinical and hospital environmental samples. Fifty eight specimens were collected from patients suffering from wounds , urinary tract infections and bacteremia. Ninety seven hospital environmental samples were collected from beds , disinfectants and patient’s rooms at Al - Hilla Teaching Hospital from March 2016 to May 2016. The isolates were identified according to cultural , biochemical test using Api 20 E system and confirmed by VITEK 2 system compact. The results showed that 30/155 (19.35%) gave positive culture for Pseudomonas aeruginosa . The green synthesis of silver nanoparticles (AgNPs) were prepared using P. aeruginosa suspension . The characterization of silver nanoparticles was carried out using UV - Visible spectroscopy, X Ray diffraction (XRD), Energy Dispersive X - ray Crystallography (EDX), Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Scanning electron microscopy (SEM). Genotypic detection of P. aeruginosa exotoxins by polymerase chain reaction was done by using specific primers for exotoxin A, exotoxin T and exotoxin S . All isolates were positive to exotoxin A and exotoxin T whereas (22) isolates gave positive result for exotoxin S gene. These results indicated that the presence of exotoxins genes were prominent virulence factors for P.aeruginosa isolates. Exotoxin A from Pseudomonas aeruginosa has produced in tryptic soy broth dialysate and purified using 85% saturation of ammonium sulphate then by HPLC column to yield highly purified toxin then molecular weight of purified toxin has determined to be 71 KD . The immunological study involved studying the antigenicity properties of the toxoid alone , AgNPs alone and mix antigen then investigating the immunological role of AgNPs as delivery system. It was done by using 20 males New Zealand rabbits and divided into four groups, the first group was immunized with toxoid alone, the second group was immunized with AgNPs alone , the third group was immunized with mix antigen , while the fourth group considered as control group and immunized with normal saline, after the immunization period, some immunological parameters were investigated. In all immunological tests of this study the results revealed that toxoid alone , AgNPs alone and mix antigen were given significantly increased in comparison with control group at P<0.05 . For NBT test , the result that was obtained for these three types of antigens with mean value (66.8%, 60.6% and 73.6%) respectively ,while the control group with mean value (46.8%) . The results of skin test showed these three types of antigens induce the hypersensitivity of the rabbits and the induration diameter of these three types antigen after 4, 24, 48 and 72 hrs. was significantly higher than control at P<0.05. Also , mitotic index test also was used , the result that was obtained for these three types of antigens with mean value (26.96%, 22.8% and 32.11%) respectively ,while the control group with mean value (13.33%) . In addition, the radial immunodiffusion (RID) method was used to detect the immunodiffusion level of the immunoglobulins in serum samples, the results showed that the immunodiffusion level of immunoglobulins with mean values (17, 19.8 and 19.4) mm respectively, in comparison with control group at P<0.05 . The concentration level of the CD4 and CD8 in the serum samples was determined by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) method, the concentration level of CD4 molecule with mean values (47.49, 43.82 and 63.61) ng/ml respectively while the control group with mean value (26.59) ng/ml. And the CD8 molecule with mean values (2.79, 3.21 and 6.08) ng/ml respectively, while the control group with mean value (1.6) ng/ml . Histopathological study showed that there were no pathological lesions in rabbits groups immunized with different types of antigens . The liver showed inflammatory cells infiltration in the portal area and spotty lobular inflammation in toxoid alone and mix antigen groups whereas in AgNPs alone group showed only inflammatory cells infiltration in the portal area . The spleen showed reactive germinal center in white pulp for toxoid alone , AgNPs alone and mix antigen groups

تاثير عنصر النيكل في الحالة الغذائية لبذور وبادرات نبات الخيار اثناء عملية التشرب == The effect of nickel on nutritional status of cucumber seed and seedling during the imbibition

Author name: مروة خالد رزاق
Supervisor name: رحاب عيدان كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى بيان تاثير كلوريد النيكل والمستخلص النباتي (قشور الرمان) على الحالة الغذائية لبذور وبادرات نبات الخيار حيث اجريت تجربة التشرب وتم حساب بعض القياسات المورفولوجية وتقدير بعض المؤشرات الكيموحيوية والجزيئية لبذور الخيار Cucumis sativus L. صنفBETH ALPHAF1 (اردني). نقعت البذور لمده 27 ساعة بتراكيز مختلفة من محلول كلوريد النيكل ( 1*10 - 5و 5*10 - 5 و1*10 - 4و 2*10 - 4 و4*10 - 4 و8*10 - 4 و1*10 - 3 و0.1 ) مولاري, فضلا عن عينة السيطرة (ماء مقطر)، وبثلاثة مكررات لكل معاملة, سجل الوزن الطري للبذور وبمعدل 3 قراءات لكل 3 ساعة والقراءة الرابعة (الاخيرة) تمت بعد 27 ساعة (قبل ظهور الجذير) ولوحظ زيادة الوزن الطري مع زيادة المدة الزمنية (القراءة الرابعة هي الافضل) اذ كانت 7.388غم . كما كان التركيز 5*10 - 5مولاري الافضل في زيادة الوزن الطري مقارنة مع السيطرة اذ بلغ الوزن 6.902غم, وفي حالة التداخل فان القراءة الرابعة مع التركيز 1*10 - 3 مولاري هي اعلى قيمة للوزن الطري اذ بلغ 7.62غم, القراءة الرابعة مع التركيز 0.1 مولاري سبب انخفاض في الوزن الطري بلغ 6.63غم مقارنة مع عينة السيطرة للماء المقطر وللقراءة نفسها. اعيدت التجربة التشرب بتحضير تراكيز النيكل المذكورة سابقا مع المستخلص النباتي (قشور الرمان مستخلص مائي حار تركيزه 1%)، وسجل الوزن الطري مع التركيز, وكان التركيز الافضل في زيادة الوزن الطري للبذرة هو 8*10 - 4 مولاري (7.87غرام) وافضل قراءة كانت الرابعة 6.78 غم، وفي حالة التداخل فكان الوزن الطري الاعلى هو 7.81 غرام عند التركيز 8*10 - 4 مولاري وعند القراءة الرابعة. اخذت القياسات المورفولوجية المتمثلة بالنسبة المئوية للانبات ولمعامل سرعة الانبات للبذور المتشربة لمدة 27 ساعة (20 بذرة في 20 مل ماء مقطر / طبق بتري) وكان اعلاها قيمة عند التركيز 1*10 - 5 مولاري اذ كان 95%, %45 واقلها في التركيز 0.1 مولاري اذ كانت %50, %25 لتجربة تراكيز النيكل بالماء المقطر وتم قياس طول والوزنين الجاف والطري للمجموع الجذري والخضري والمساحة الورقية، ولوحظ زيادة معنوية في اغلبها بالتراكيز الواطئة اذ كانت اعلاها في التركيز 1*10 - 5 مولاري اذ كانت النتائج كالتالي(14.9سم, 5.8سم,10.9 ملغم , 71.3ملغم, 111 ملغم , 265 ملغم, 2.5سم2)لمحلول كلوريد النيكل وتناقصت معنويا مع زيادة التركيز اذ ان التركيز 0.1 مولاري كانت نتائجه سلبية وكانت كالتالي (1.3سم , 0, 1.1 ملغم , 0, 61ملغم, 0, 0 )عند المقارنة مع عينة السيطرة. وفي حالة القياسات المورفولوجية لبذور الخيار المتشربة والمزروعة بطبق بتري فان المستخلص النباتي خفف تاثير النسبة المئوية للانبات ولمعامل سرعة الانبات عند التركيز 0.1 مولاري لكلوريد النيكل المحضر بالمستخلص النباتي(قشور الرمان) (76.67و 33.07%) مقارنة مع كلوريد النيكل المحضر بالماء المقطر (50، %25)على التوالي. محتوى الكاربوهيدرات الكلية ازداد معنويا بالتراكيز الواطئة وكان اعلاها عند التركيز1*10 - 5 مولاري اذ بلغ 748 ملغم/غم واقلها عند التركيز 0.1 مولاري اذ بلغ 210 ملغم/غم ، وكان الانخفاض متدرج في محتوى الكاربوهيدرات الكلية مع زيادة التركيز ايضا, كما انخفض محتوى البروتين مع زيادة التركيز اذ بلغ 28.9 ملغم/غم في التركيز 1*10 - 5 مولاري ، وكان اقله في التركيز 0.1 مولاري اذ بلغ 15.5ملغم/غم وقد زاد محتوى الكلوتاثيون مع زيادة التركيز فكان اعلاه عند التركيز 0.1 مولاري اذ بلغ 26.8 مايكروغرام/غم وكذلك سبب كلوريد النيكل زيادة في محتوى النيكل والبوتاسيوم في لب البذور واغلفتها وكانت هذه زيادة تدريجية مع زيادة التركيز حيث بلغ التركيز1*10 - 5 مولاري في غلاف البذور 18.2مايكروغرام/غم اما في اللب فقد كان 16.1 مايكروغرام/غم اما عند التركيز 0.1 مولاري فقد ارتفع تركيز النيكل اذ بلغ في غلاف البذور 32.1مايكروغرام/غم وفي اللب 27.1 مايكروغرام/غم اما بالنسبة للبوتاسيوم فقد بلغ محتواه في غلاف البذور بالتركيز 1*10 - 5 مولاري 458.00 مايكروغم/غم وفي اللب 558.00 مايكروغرام/غم اما بالتركيز 0.1مولاري فقد كان محتوى البوتاسيوم في غلف البذرة 1175.00مايكروغم/غم وفي اللب 2158.33 مايكروغم/غم, وقد انخفض محتوى الصوديوم في البذور واغلفتها مع زيادة التركيز اذا بلغ محتوى الصوديوم في غلاف البذرة في التركيز 1*10 - 5 مولاري 19.5 مايكروغم/غم اما في اللب فقد بلغ 12.1 مايكروغم/غم اما التركيز 0.1 مولاري فقد كان محتوى الصوديوم في اغلفة البذور 9.1 مايكروغم/غم اما اللب فقد كان 3 مايكروغم/غم تم تقدير تركيز الهرمونات في البذور المتشربة ولوحظ زيادة تركيز الاوكسين والزياتين في التراكيز 1*10 - 5 - 1*10 - 4 مولاري للاوكسين كانت ( 24*10 - 5 - 18*10 - 5ملي مولار) وبالنسبة للزياتين فان التراكيز(1*10 - 5 - 4*10 - 4) مولاري كانت (110*10 - 5 - 204*10 - 5 ملي مولار) وانخفضت قيم كلا الهرمونين بالتراكيز الاعلى الى التركيز 0.1 مولاري اذ بلغ 5*10 - 5 بالنسبة للاوكسين و63*10 - 5 بالنسبة للزياتين, والذي اعطى اقل قيمة. بدا تركيز هرمون الجبرلين بالتناقص تدريجيا مع زيادة التركيز حيث بلغ 44*10 - 3 ملي مولار بالتركيز 0.1 مولاري , في حين ازداد حامض الابسيسك مع زيادة التركيز وصولا الى اعلاه عند التركيز 0.1 مولاري5 23420*10 - ملي مولاري. ان فعالية انزيم الفاامايليز والبروتيز انخفضا تدريجيا مع زيادة التركيز حيث بلغ انزيم الفاامايليز في التركيز 0.1 مولاري 6 ملغم/دقيقة اما انزيم البروتيز فقد بلغ 7.7 وحدة/ مل في حين ان انزيم اليوريز ارتفع معنوياعند المقارنة مع عينة السيطرة عند التراكيز العالية وكان اقلها عند التركيز0.1 مولاري حيث بلغ 21.97 وحدة/مل يزداد تراكم الالنتوين مع زيادة تركيز العناصر الثقيلة الى ان يصل الى حد معين في التركيز 4*10 - 4 مولاري اذ يبلغ محتوى الالنتوين 598مايكروغم/غم ثم يبدا بالانخفاض الى ان يصل الى اقل محتوى في التركيز 0.1مولاري اذ بلغ 207مايكروغموعلى المستوى الجزيئي, فان المؤشرات المدروسة لاختبار الذنب (comet) مثل طول الذنب (comet length) حيث بلغ في التركيز1*10 - 5 مولاري 22 مايكروميتر وبدا بالارتفاع مع زيادة تركيز كلوريد النيكل اذ ب التركيز 0.1مولاري بلغ 169 مايكروميتر اما ارتفاع الذنب (comet high) فقد ارتفع الى 77.8 في التركيز 0.1 مولاري والمعدل الكلي للاجزاء المقطوعة التي تتجمع فيه قطع DNA comet moment)) قد تاثرت بالتراكيز المختلفة لكلوريد النيكل وسببت التراكيز العالية منه ارتفاع في قيم هذه المؤشرات الخاصة بتحطيم DNA اذ وصل الى 3.822 مايكروميتر في التركيز 0.1 مولاري | The study aimed to demonstrate the effect of nickel chloride and plant extract (pomegranate) on the nutritional status of seeds and cucumber seedlings In laboratory, Imbibition in some physiological, biological and molecular experiment conducted for seeds of cucumber(Cucumis sativus L.)class BETH ALPHA F1 Jordon. The seeds soaked for 27 hour with different concentrations of Nickel (1*10 - 5 , 5*10 - 5 , 1*10 - 4, 2*10 - 4 , 4*10 - 4 , 8*10 - 4 و1*10 - 3 , 0.1 ) chloride In addition to control (distilled water). In imbibition experiment, recorded 3 fresh weight at different time (soaking every 3 hour) at the last fresh weight were the forth at 27 h.(before emergence the radical). There were increasing in fresh weight with increasing in time of soaking ,the best period is the fourth 7.388 g at the best concentration was 5*10 - 5 M give significant increasing in fresh weight 6.902 g , in interaction between soaking time and concentration, the best were at the forth and concentration 1*10 - 3 M 6.63g The imbibition experiment is repeated with different concentration of Nickel chloride prepared in plant extract pomegranate peel 1% hot extract. The concentration 8*10 - 4 M was increase the seeds fresh weight 7.87g while the best soaking time was the fourth 6.87g. In interaction between the soaking time and concentration, the best was at the forth and at concentration8*10 - 4M 7.81g After 27 hr ,(20 seed in 20 ml d.w/pettri dish),germination percentage and coefficient velocity percentage of germination were indicated the highest value was at 1*10 - 5 M was 95%, 45% the lowest was at 0.1 M was 50%,25% for each imbibed seeds in experiments (Nickle chloride with d.w) Almost low concentration of nickel chloride caused increasing in length of root and shoot ,fresh and dry weight of root and shoot, and increasing the leaf area too at 1*10 - 5 the result was 14.9cm,5.8cm, 10.9mg, 71.3 mg,111mg,265mg, 2.5 cm2 while the high concentration caused decreasing in all these parameters compared with control as 0.1M the result was (1.3cm,0,1.1mg ,0,61 mg ,0, 0) The concentration of nickel chloride which prepared with pomegranate peel extract showed declining in almost physiological parameters but it alleviate the toxicity concentration (0.1) M by increasing the percentage of germinated in control with nickel chloride prepared by d.w. Total carbohydrate content was significantly increased with low concentration and it was the highest in the 1 * 10 - 5 M of Nicl2 748 mg/g and the The decline was graded with increased of concentration at 0.1M was 210mg/g Protein content decreased with increasing of concentration at 1*10 - 5 M was 28.9 mg/g and in the 0.1 M was 15.5 mg/g while glutation content was increased with increase of concentration of Nicl2 at 0.1M was 26.8 mg/g, Nicl2 caused increasing in nickel and potassium in both seed and coat and these increasing was graded with increased of concentration in coat at 1*10 - 5M was 18.2 µm/g and seed was 16.1 µm/g at 0.1M concentration of nickel in coat was 32.1µm/g and in the seed 27.1µm/g , While sodium content in the coat at 1*10 - 5M 458.00 µm/g and in seed 558.00 µm/g while at 0.1M in coat was 1175.00 µg/g and seed was 2158.33 µm/g. The sodium content in the seeds and their coats decreased with increasing concentration of nickel chloride, the sodium content in the coat at 1*10 - 5 M was 19.5 μ g / g and in seed was 12.1 µg/g while at concentration 0.1M in coat was 9.1 µm/g and seed 3µg/g It has been estimating the concentration of hormones in seeds was observed to increase the concentration of auxin and zeatin in low concentration (1*10 - 4 - 1*10 - 5) M for auxin was (24*10 - 5 - 204*10 - 5 mM) The values of both hormones were reduced by higher concentrations to a concentration of 0.1 M was 5*10 - 5 M for auxin and 63*10 - 5M for zeatin .GA3 It began gradually decreasing with high concentration at 0.1M was 44*10 - 5 mM while ABA was increased with increased of Nicl2 Until it reached above 23420*10 - 5mM in0.1 M The effectiveness of the enzyme Alfaamayles and Protease gradually decreased with the increase of concentration where the enzyme Alfamaylese in the concentration of 0.1 M was 6 mg / min either the enzyme protease was 7.7 units / ml, While the urease enzyme was significantly increased in comparison with the control sample at high concentrations. at the concentration 0.1 M was 21.97 units / mL The accumulation of alantoin increases with the increasw concentration of heavy metals until it reaches a certain concentration of 4 * 10 - 4 M, the content of alantoin was 598 µm/g and then starts to decrease until it reaches the lowest content in the concentration of 0.1 M, which reached 207 µm/gAt the molecular level increased in the some parameters such as comet length at 1*10 - 5 M was 22 µM and at 1*10 - 5 M was 169 µM and comet high was increase to 77.8 µM at 0.1 M and comet moment increase with increasing of concentration of Nicl2 compared with D.W was reached to 3.822 µM at 0.1 M

اختبار كفاءة اوكسيد المغنيسيوم النانوي في مكافحة الفطر Rhizoctonia solani في نبات الباذنجان

Author name: رشا سعد فوزي
Supervisor name: امنة محمد علي | مهند مهدي عبد
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر السموم الفطرية / قسم وقاية النبات / كلية الزراعة / جامعة بغداد لسنة 2016 من اجل اختبار كفاءة جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوي في مكافحة الفطر Rhizoctonia solani في نبات الباذنجان صنف (اعجوبة العراق ) .تم اختبار المقدرة الامراضية لعزلة الفطر Rhizoctonia solani في الوسط الزرعي PDA على بذور الباذنجان, اظهرت النتائج ان عزلة الفطر Rhizoctonia solani اعطت نسبة اصابة عالية على بذور الباذنجان مقارنة بمعاملة المقارنة (بدون فطر ) حيث توضح النتائج ان نسبة الانبات في معاملة المقارنة بلغت 97.33 %. اما في معاملة الفطر بلغت 12 % . كما وجد ان اضافة جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوي ( MgO) بتراكيز 1 % و2 % و3 % ادت الى تثبيط الفطر مقارنة بمعاملة المقارنة (فطر ممرض ) وتراوحت نسب التثبيط (96.33 % , 100 % , 100 % ). في حين اظهرت نتائج تجربة الاصص ان معاملة البذور وخلط التربة بجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية له اثر ايجابي في رفع النسبة المئوية لانبات بذور الباذنجان وكبح نشاط الفطر Rhizoctonia.solani , وكذلك لها اثر ايجابي في معايير النمو المدروسة . اذ ادت المعاملة بجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية الى زيادة في الوزن الطري والجاف لنبات الباذنجان قياسا بمعاملة الفطر الممرض بمفرده الذي بلغ فيها الوزن الطري والجاف للمجموعين الجذري والخضري 0.18 , 0.06 , 1.60 , 0.52 غم.نبات 1ٙ على التتابع. في حين كانت اوزان المجموعين الجذري والخضري الطري والجاف لمعاملة البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي 0.81 , 0.29 , 4.74 ,1.39 غم.نبات 1ٙ على التتابع, وفي معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي 0.77 , 0.26 , 7.03 , 1.85 غم .نبات 1ٙعلى التوالي . وكانت معاملة المقارنة (بدون فطر ) 0.51 , 0.27 ,4.74 , 1.29 غم .نبات 1ٙعلى التتابع . واظهرت النتائج تاثيرجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية في نسب العناصرالغذائية (النتروجين , الفسفور , البوتاسيوم , الكلوروفيل ) في نبات الباذنجان فقد تفوقت المعاملات التي تحتوي على جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية في نسبة النتروجين فكانت نسبة النتروجين في معاملة البذورالمعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة(بدون فطر ) 2.04 , 2.03 , 1.99 ملغم . سمٙ2على التوالي اما في معاملة الفطر فكانت نسبة النتروجين فيها 1.77ملغم . سمٙ2 .اما نسبة الفسفور في معاملات البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي والتربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة (بدون فطر ) فكانت 0.51 , 0.48, 0.49ملغم . سمٙ2 على التتابع , اما في معاملة الفطر فكانت نسبة الفسفور فيه 0.47ملغم . سمٙ2 . وكانت نسبة البوتاسيوم في معاملات البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة(بدون فطر) 0.37 , 0.41 , 0.36 ملغم . سمٙ2 ,اما نسبة البوتاسيوم في معاملات الفطر فكانت 0.35 ملغم . سمٙ2 ,حيث تفوقت معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي في نسبة البوتاسيوم فيها عن بقية المعاملات . وتفوقت معاملة التربة المعاملة بالنانو في نسبة صبغة الكلوروفيل فيها على بقية المعاملات مقارنة بمعاملة الفطر التي كانت نسبة الكلوروفيل A ( 1.01 , 0.54 مايكروغرام .سمٙ2) على التتابع , في حين كانت نسبة الكلوروفيل B في معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم ( 1.17 , 0.71 مايكروغرام . سمٙ2) على التتابع .ان اضافة جسيمات MgO النانوية ادى الى زيادة نسبة كل العناصر الغذائية المهمة في المعاملات التي تحتوي على هذه الجسيمات . | This Study was conducted in mycotoxin laboratory / Defartment of plant protection / Agri - cuiture collage / Baghdad University in 2016 to test the efficiency of Magnesium Oxide - nano particles to combat Rhizoctonia solani fungi in eggplant type (Marvel of Iraq ). The satisfactory ability to isolating the Rhizoctonia solani fungi was tested in the agricultural sector PDA on eggplant seeds , The results showed that isolation of Rhizoctonia solani was given ahigh injury rate on eggplant seeds Compared to the comparison treatment (Without fungi ) . Where the results are shown the germination rate of comparison treatment was reached to 97.33% ,While in fungi treatment was reached to 12%. It was also found that addition of MgO nanoparticles in concentration (1%, 2% , 3%) led to inhibition the fungi compared to the comparison treatment (pathogenic fungi), the rate of inhibition varied (96.33%, 100% , 100%) .While the results of the experiments showed that the treatment of seeds and mixing the soil with MgO nanoparticles has positive effect to increase the percentage of eggplant seeds germination and curb the activity of Rhizoctonia solani fungi , Also it has positive impact on the studied growth parameters .The treatment of the MgO nanoparticles led to increase in soft and dry weight of eggplant compare with treatment of pathogenic fungi alone in which the soft and dry weight of radical and vegetative groups reached to (0.18, 0.06 , 0.52 gm) plant 1 on the relay . while the soft and dry weights of the radical and vegetative groups in the treatment of fermented seeds by MgO nanoparticles (0.81, 0.29 , 4.74 , 1.39 gm ) plant 1 on the relay . And in the soil treatment which was treated by MgO nanoparticles (0.77 , 0.26 , 7.03 , 1.85 mg) plant 1 on the relay .And the comparison treatment (without fungi ) was being ( 1.29 , 4.74 , 0.27 , 0.51 gm ) plant 1 on the relay . The results showed the effect of MgO nanoparticles in ratios of the nutrients (nitrogen , phosphour, potassium , chlorophyll )in eggplant , hence the treatment which containing MgO nanoparticles was excelled in nitrogen ratio subsequenliy the ratio nitrogen in the treatment of fermented seeds by MgO nano particles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comparison treatment (without fungi )was being (1.99, 2.03 , 2.04 )mg.cm2 respectively. while in the treatment of fungi the ratio of nitrogen was (1.77mg .cm2 ). While the ratio of phosphorus in the treatment of fermented seeds by MgO nanoparticles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comparison treatment (with out fungi ) was (0.49 , 0.48 , 0.51 mg. cm2) on the relay . while in the treatment of fungi , phosphorus ratio was (0.47 mg .cm2 ).And the ratio of potassium in treatment of farmanted seeds by MgO nanoparticles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comperison treatment (without fungi ) was ( 0.37, 0.41 , 0.36 mg . cm2).While the ratio of potassium in fungi treatment was (0.35 mg.cm2) , where the soil treatment which treated by MgO nanoparticles was excelled in the potassium ratio than others treatments . The soil treatment which treated by nano was excelled in the chlorophyll dye ratio than others treatment compare with fungi treatment in which the chlorophyll A ratio was (1.01 , 0.54 mg.cm2) on the relay . whilst the chlorophyll B ratio in the soil treatment which treated by MgO was being (1.17 , 0.71 mg.cm2) on the relay . The addition of MgO nanoparticles led to increase ratio of the all nutrients which are important in the treatment containing this particles

اختبار كفاءة العسل المدعم بالمواد النانوية في مكافحة فطر Aspergillus flavus في بذور الذرة الصفراء المخزونة == Testing honey backed efficient nanomaterials in the against ( Aspergillus flavus) in Maize stored seeds

Author name: ديمة ايوب يوسف مرزوق
Supervisor name: امنة محمد علي | حليمة زغير حسين
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار كفاءة جسيمات اوكسيد الزنك النانوية( ZnO(NP) ) والعسل والعسل المدعم بجسيمات اوكسيد الزنك النانوية ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس في تثبيط الفطر Aspergillus flavus وتحطيم السم المنتج منه تحت الظروف المختبرية . اثبتت اختبارات التضاد ان اضافة كل من جسيمات اوكسيد الزنك النانوي ZnO(NP) بتراكيز 1%, 2%, 3% حققت تثبيطا لنمو الفطر A.flavusعلى الوسط الزرعي PDA بنسبة 98.55%, 100%, 100% على التوالي قياسا بمعاملة المقارنة (فطر ممرض بمفرده والتي بلغت (0.0 , واظهرت نتائج استعمال العسل بتراكيز 10%,20%,%30 الى تثبيط الفطر بنسبة %75.3 ,%78 ,78.6 % على التوالي, في حين بينت النتائج فاعلية العسل المدعم ب NP))ZnO في تثبيط الفطرعند استعماله بتراكيز %10 , %20 , %30 اذ بلغت نسبة التثبيط %85.6, %87 , 87.3 % على التوالي. كما اظهرت النتائج كفاءة مستحضر الفايلكس في تثبيط الفطر بنسبة 74.4%, 100%, 100% عندما كان التركيز المستعمل من الفايلكس 0.1%, 0.2%, %0.3على التوالي. تم اختبار كفاءة جسيمات ZnO(NP)والعسل والعسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس تحت ظروف الخزن بينت النتائج ان جميع المعاملات ادت الى خفض معنوي في نسبة الاختزال وتركيز سم الافلا B1))AFB1 في حبوب الذرة الصفراء المخزونة وبفارق معنوي عن معاملة السيطرة اذ بلغت 0.0و 1.13مايكروغرام/كغم باستعمال جهاز High performance liquid chromatography (( HPLC , باختيار افضل تركيز لكل من المواد المستخدمة لتثبيط نمو الفطر , اذ اظهرت نتائج استخدام جسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس اعطى اعلى نسبة اختزال لسم الافلاB1 بلغ% 93.80 وبتركيز 0.07 و91.15% بتركيز 0.10مايكروغرام/كغم على التوالي كما اظهرت نتائج استعمال العسل نسبة اختزال سم الافلا B1 %79.64 وبتركيز 0.23مايكروغرام/كغم , وتلاه استعمال العسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) اذ بلغت نسبة اختزال سم الافلا B1 %82.30 وبتركيز 0.20مايكروغرام/كغم . اظهرت النتائج كفاءة جسيمات ZnO(NP)والعسل والعسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس في تحطيم الفطر A.flavusومنع انتاج سم الافلا B1 في حبوب الذرة الصفراء قياسا الى معاملة السيطرة التي كانت 1.12مايكروغرام/كغم باستعمال جهاز HPLC , اذ وجد عند استعمال جسيمات ZnO(NP) نسبة اختزال سم الافلا B1 %96.42وبتركيز 0.04 مايكروغرام /كغم , في حين كانت نسبة اختزال السم %72.32وبتركيز 0.31مايكروغرام /كغم عند استعمال العسل , وبينت نتائج استخدام العسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) نسبة اختزال سم الافلا %83.92 B1وبتركيز 0.18 مايكروغرام /كغم , اظهرت نتائج استخدام مستحضر الفايلكس نسبة اختزال سم الافلا %94.64 B1 وبتركيز 0.06 مايكروغرام/كغم . | This study was aimed at efficacy assessment of zinc oxide nanoparticles ZnO(NP), honey, honey fortified with ZnO(NP) and phylex chemical against Aspergillus flavus and its toxin at culture media . Antagonism tests revealed all ZnO(NP) treatments at 1%, 2% and 3% inhibited A. flavus growth on PDA by 98.55, 100 and 100%, respectively compared to untreated control (fungus only control) which was 0.0%. Honey treatments at 10, 20 and 30% inhibited the fungus growth by 75.3 , 78 and 78.6 %, respectively. ZnO(NP) - fortifie honey treatments inhibited fungal growth by 85.6, 87 and 87.3 % at 10, 20 and 30%, respectively. Whereas, phylex treatments could inhibit fundal growth by 74.4%, 100% and 100% at concentrations 0.1, 0.2, 0.3, respectively . ZnO(NP), honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex efficacy at storage condition were tested. All treatments inhibited A. flavus growth and reduced the aflatoxin (AFB1) production in stored corn. HPLC confirmed ZnO(NP) treatment reduced AFB1 up to 93.80 when aflatoxin concentration was 0.07 μg/kg compared to 1.13 μg/kg for control treatment. Whereas, honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex treatments reduced B1 aflatoxin up to 79.64, 82.30. and 91.15%, respectively. B1 concentration values tested for each treatment were 0.23, 0.20 and 0.10 μg/kg compared to1.13 μg/kg for control treatment. The efficacy of ZnO(NP), honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex to damage the fungus A. flavus and prevent AFB1 production in corn grains was tested by HPLC. ZnO(NP) reduced B1 aflatoxin up to %96.42 with 0.04 μg/kg concentration compared to 1.12 μg/kg for control treatment. Honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex treatments could reduce B1 aflatoxin up to 72.32, 83.92 and 94.64%, respectively. B1 concentration values tested in corn grains were 0.31, 0.18 and 0.06 μg/kg compared to1.12 μg/kg for control treatment indicating presence of significant differences

تاثير الجبرلين والكاينتين والسماد المركب NPK في نمو وحاصل الينسون (.Pimpinella anisum L) ومحتواه من بعض المركبات الفعالة == The effect of Gibberellin , Kinetin and compound NPK fertilizer on growth and yield of anise (Pimpinella anisum L.) and some its active compounds

Author name: غفران علاء محمد رضا الخزرجي
Supervisor name: بهاء الدين مكي فيروز الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسـتان حقليتان في الحديقة النباتية التابعة لقسم العلـوم - كلية التربية الاساسية - الجامعة المستنصرية خلال موسم النمو الشتوي 2015 - 2016 تهدم الدراسة الاولى الى معرفة تاثيرتراكيز من منظم النمو الجبرلين ( (GA3 ومستويات من السماد المركب NPK والتداخل بينهما وتتضمن التجربة الثانية معرفة تاثير من منظم النمو الكاينتين ومستويات من السماد المركب NPK والتداخل بينهما التجربة الثانية في بعض صفات النمو والحاصل والمواد الفعالة للزيت الطيار في نبات الينسون (.Pimpinella anisum L) , زرعت بذور الينسون بتاريخ 1/11/2015 اذ استخدمت ثلاثة مستويات من السماد المركب NPK (0 و200و 400) كغم.ھ - 1 اضيفت الى التربة فضلا عن ثلاثة تراكيز من حامض الجبرلين هي 0) و50 و100) ملغم.لتر1 - رشت على النباتات في التجربة الاولى اما التجربة الثانية فقد تضمنت ثلاثة مستويات من السماد المركب NPK (0 و200و 400) كغم.ھ - 1 اضافة الى ثلاثة تراكيز من الكاينتين (0 و50 و100) ملغم.لتر1 - , صممت التجربة وفق تصميم القطاعات الكاملة المعشاة RCBD وبثلاثة مكررات وبذلك تضمنت كل دراسة تجربة عاملية (3×3) بواقع 27 وحدة تجريبية مساحة كل وحدة تجريبية 1.5×1.5 م2 اتبعت كافة عمليات خدمة التربة والمحصول الخاصة بمحصول الينسون من ري وازالة الادغال وتسميد. اظهرت نتائج التجربة الاولى ان اضافة المستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK ادت الى زيادة ارتفاع النبات (13.24%) ووزن الف بذرة (20.21%) وعنصر البوتاسيوم (20%) والمركبات الفعالة Dianethole وTrase - anethole وLimonene وγ - himachalene , كما ادى رش نباتات الينسون بالتركيز 100 ملغم.لتر1 - من حامض الجبرلين الى زيادة ارتفاع النبات (14.88%) ووزن الف بذرة (7.77%) وعنصر البوتاسيوم (7.81%) , وزيادة تركيز المواد الفعالة Trase - anethole وLimonene وShikmic acid, اعطى التداخل بين السماد المركب NPK وحامض الجبرلين زيادة معنوية في بعض الصفات المدروسة اذ ادى التداخل بين المستوى 400كغم.ھ - 1 من السمادNPK وتركيز 100ملغم.لتر1 - من حامض الجبرلين الى زيادة في ارتفاع النبات (29.38%) ووزن الف بذرة (29.41%) وعنصر البوتاسيوم (27.94%) والمركبات Methyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene وShikmic acid. اما في التجربة الثانية فقد ادت اضافة المستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK الى حصول زيادة في ارتفاع النبات (9.65%) والبوتاسيوم (39.20%) ووزن الف بذرة (10.96%) فضلا عن المركبات Anise - aldehyde وMethyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene . كما عمل التركيز 100 ملغم.لتر1 - من الكاينتين على زيادة عدد الاوراق (26.31 %) وعدد التفرعات (43.54%) والوزن الجاف (28.05%) وعدد النورات (26.26%) وعدد ازهار للنورة الرئيسة (26.14%) وعدد البذور في الزهرة الواحدة (26.72 %) وحاصل النبات الواحد (88.66%) وحاصل النبات الكلي (88.59%) وعنصر النتروجين (62.83%) والفسفور (62.96%) والكالسيوم (62.18%) والمغنيسيوم (60.86%) والبروتين (62.71%) والكاربوهيدرات (38.69%) والكلوروفيل (44.17%) والنسبة المئوية للزيت (37.84%) والوزن النوعي (1.07%) وكثافة الزيت(0.51%) ومعامل الانكسار (0.32%) اضافة الى المركبات Anise - aldehyde وMethyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene وShikmic acid , اما التداخل بين التركيز 100 ملغم.لتر1 - من الكاينتين والمستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK اعطى زيادة في المركبات Anise - aldehyde وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene . يستنتج من هذه الدراسة تفوق المستوى 200 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK في معظم الصفات المدروسة ولكلا التجربيتن اما الجبرلين فقد تفوق التركيز 50 ملغم.لتر1 - تفوقا في معظم التراكيز المدروسة , واعطى التركيز 100ملغم.لتر1 - من الكاينتين تفوقا في معظم الصفات المدروسة .

دراسة تصنيفية مظهرية لعائلة حشرات الخنافس الحارقة Coleoptera : Meloidae في محافظة بابل == Taxonomical and Morphological study on the Blister Beetles (Coleoptera : Meloidae) in Babilon province

Author name: اميرة ابراهيم عبد الزهرة
Supervisor name: سعدون ابراهيم اسماعيل
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study deals with morphology and taxonomy of blister Beetles (Coleoptera : Meloidae) in Babylon province.In our investigations ; there were fifteen species representing in nine genera under two subfamilies have been registered, these species are : 1 - Epicauta hirticornis (Haag - Rutenberg) Croscherichia goryi (Marseul)10 - Lydomorphus sp. MaranCerocoma graeca - 1112 - Cerocoma scovitzi Faldermann13 - Lydus mesopotamicus sp. nov.(Linnaeus) 14 - Lydus algiricus Fabricius Lytta nitidula - 2 - Nemognatha chrysomelina (Fabricius)sp. 3 - Nemognatha4 - Zonitis immaculate (Olivier)5 - Zonitis fernancastroi, Pardo Alcaide6 - Mylabris sp.klug 7 - Mylabris syriaca8 - Mylabris tenebrosa Laporte de CastelnauThe species of Lydus mesopotamicus sp. nov. has been described as a new species for science in Iraq, and has been given scientific geographical name.The genus Zonitis Fabricius and its two species; and the genus Lydomorphus Fairemaire have been recorded for the first time in Iraq.Three other species has been diagnosed and recorded for the first time in Iraq, they are : Epicauta hirticornis (Haag - Rutenberg)Fabricius Lytta nitidulaMaranCerocoma graecaThe Epicauta hirticorins (Haag - Rutenberg, 1880) was chosen as a simple type species of this family ; adults are described in details and all species body parts were drawn and pictured.Taxonomic keys for subfamilies, genera and species were desigend according to different of the important characters, especially pronotum, antennae, claws, spines of hind tibiae and pathches of elytra.

دراسة فسلجية وكيموحيوية ونسيجية لمرضى ابيضاض الدم اللمفاوي الحاد غير الوراثي في محافظة كربلاء المقدسة

Author name: همام علي هادي
Supervisor name: ستار جاسم حتروش | رشا حسن جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Karbala
First pages:
Abstract: The rate of cancer infection has increased with a clear rise in the incidence of leukemia in Iraq's common diseases in 2017, which was the seventh place in 1989, as follows. Generally, about 10 among 100,000 people are infected with leukemia, male have the biggest ratio between the patients with leukemia, finally, Acute Lymphocytic Leukemia is increased at patients with 3 to 7 years old. During the period from the beginning of February 2016 to the first week of 2017 in the Center of Oncology of Hematology in the medical city of Hussein in Karbala', 30 patients with acute lymphocytic leukemia their age were ranged from 2 - 13 years old (19 male and 11 female), without familiar history with cancerous disease. The samples were collected before treatment with chemotherapy, and they were follow - up during the stages of treatment. The control group included 30 samples ranging from 1 - 13 years (18 males and 12 females) Numerous biochemical and histological parameters were assessed in the samples of study patients before and after receiving treatment and the recorded results were compared to the control group. The results of the study showed significant results (p<0.05) at the levels of CLEC4E, MDA, Ceruloplasmin Oxidase Concentration and EOP in the group of animals with acute lymphocytic leukemia before receiving treatment compared to healthy individuals. The current study showed decreased concentrations of CLEC4E, Ceruloplasmin Oxidase Concentration, Ceruloplasmin Oxidase Concentration and Ceruloplasmin Oxidase Activity, while EOP levels increased after chemotherapy, while MDA remained at an unrecognized level at diagnosis. The study showed significant differences (p=0.000) when elevating a number of blood parameters, WBC level and Ferritin concentration. When the stud recorded statistically significant rise in the level of platelets and Hb concentration before chemotherapy. At diagnosis, the present study showed a significant difference (p<0.05) in Fe, Cu, Zn and Ni levels in the patients group, before treatment. However, statistical analysis of trace elements in the sera of patients after treatment didn’t show significant differ than their levels at diagnosis. The study the effect of acute lymphocytic leukemia in the function of kidney showed significant increase in the levels of ANP and Urea in sera of patient samples as well as levels of urinary microalbumin comparison to control group levels, contrast to that, Creatinin levels showed significant (p=0.001) decrease in serum of patients group. Comparative study showed that there were statistically significant differences (p=0.000) of ANP, Urea, Creatinin, Uric Acid, and Microalbumin in patients with acute lymphocytic leukemia after receiving chemotherapy compared to healthy peers.In order to evaluate liver function, GOT and GPT levels as well as STP levels in patients with leukemia were observed within the range recorded in healthy individuals. On the other hand, the current study showed a rise in the levels of ALP enzyme in patients exceeded twice that recorded in the group of healthy children. After receiving chemotherapy, the study showed a significant increase (p=0.000) for GOT, GPT and ALP levels for the group of patients compared to healthy individuals, a significant decrease (p=0.000) of STP levels in the group of patients compared to healthy patients. The study identified many differences between patients and healthy males as well as between infected and healthy females at the level of implicit comparisons between the two groups at diagnosis and after treatment, as shown in the table below which summarizes the relationship between patients of both ganders with their healthy peers. The current study showed statistically significant statistically associations, the clearest among them was recorded when CLEC4E correlated to EOP, which were positive in 100% of the study samples at diagnosis and negative in the same samples after receiving chemotherapy. The results of the study showed that 80% of children with acute lymphocytic leukemia were with type 1, L1, 17% of type 2, L2 and 3% of the third type L3, the promise of the first type has a good outcome of the disease as the response is good for treatment and go through recovery after treatment.

دراسة بعض المعايير الفسلجية والكيموحيوية لمرضى الهيموفيليا A وفون ويليبراند في محافظة واسط == Study of some physiological and biochemical Parameters of Hemophilia A and Von Willebrand patients in Wasit Province

Author name: شهد قاسم محمد الحمداني
Supervisor name: كاظم جهيد كاطع الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
First pages:
Abstract: Hemophilia A and Von Willebrand are genetic diseases caused by deficiency or malfunction in one of coagulation factors. Hemophilia is caused by the absence of factor VIII (F.VIII),and Von Willebrand is caused by a deficiency or defect of Von Willebrand factor (VWF),Carried out at Department of Biology - College of Science/University of Wasit in cooperation with Al - Karama and Al - Zahra teaching Hospitals affiliated to Wasit Health Department and some private clinics. This study includes 50 patients of both diseases, (35) Hemophilia type A from males aged between (1 - 28) years and (15) Von Willebrand patients from both sexes, (6) males and (9) females aged between (1 - 17)years were compassion with the group of healthy people which includes 25 people (13) male and (12) female aged between 1 - 28 years. Samples were collected from November 2016 to April 2017. Five (ml) of vein blood were taken and divided into two groups : The first group 1 (ml) of blood is placed in EDTA K3 tube for hematological tests,which includes Hemoglobin (Hb),Packed Cell Volume (PCV),Red Blood Cell (RBCs), Platelets (PLT), Mean Corpuscular Volume (MCV), Mean Corpuscular Hemoglobin (MCH) and Mean Corpuscular Hemoglobin Concentration (MCHC). The second groups (4ml) of blood in the gel and clot activator tubes for biochemical tests, which includes liver enzymes Alanine Transaminase (ALT), Aspartate Transaminase (AST) and Alkaline Phosphatase (ALP) as well as measurement the Total Serum Bilirubin (TSB) and Albumin, kidney function standards that include both Blood Urea and Creatinine, electrolyte standards that includes Potassium (K), Sodium (Na) And Calcium (Ca) as well as hepatitis virus B and C diagnosis. The data were taken for both patients and healthy, and both is divided into two groups, Hemophilia type A depending on ages (1 - 14 and 15 - 28 years) and Von Willebrand depending on sex (males and females) for all the studied criteria, it has been found the following resultssummary Hemophilia Disease The Results show significant decrease in (P<0.05) in the values of Hemophilia type A in the first group (1 - 14 years) Comparison to the second category (15 - 28) years to each of Hb, PCV, RBCs, MCH. with a significant increase (P<0.05) in PLT to first group more than second group , while was not significant differences (P>0.05) between both groups to each of MCHC, MCV. The Results show significant decrease (P<0.05) to Hemophilia type A to first group compared with second group in the level of liver enzymes (ALT, AST, ALP and TSB).While a significant increase (P<0.05) value to patients with each of albumin, creatinine and blood urea in the first group and second group. The Results show a significant increase in (P<0.05) in the level of calcium and sodium ions in Hemophilia type A first group compared with second group while didn’t a significant difference in level of potassium between both groups. Von Willebrand Disease The Result showed significant differences (P<0.05) in Platelet to patients with von Willebrand increased in male and decrease in female while didn’t a significant differences between male and female in each of (Hb, PCV, RBCs, MCV, MCH, MCHC). The Results show significant differences (P<0.05) between male and female to each of AST, ALP and blood urea while didn’t a significant differences between both sexes to each of ALT, albumin ,creatinine, level of total bilirubin TSB in blood serum. The present study show he significant differed between the males and females to each of Na, Ca, K.summary Hemophilia and Von Willebrand The Results show significant difference (P<0.05) between patients with Hemophilia A and Von Willebrand in each of (Hb, PCV). The Result show significant (P<0.05) between Hemophilia A and Von Willebrand in the level of ALT. The Results show he significant difference (P<0.05) between Hemophilia A and von Willebrand to each of Ca, K and Na. Hemophilia and Von Willebrand With control. The Results show significant decrease (P<0.05) in the value of (Hb, PCV, MCH, MCHC) to each of Hemophilia A and Von Willebrand compared with control. The Results show significant increase (P<0.05) in the level of Platelet to each of Hemophilia and Von Willebrand with control. The results show significant increase (P<0.05) in value of (AST, ALP, ALT, TSB) in Von Willebrand compared with control. As well as appeared presence of increase (P<0.05) For all standards above in hemophilia except standard ALT The Result showed significant decreased (P<0.05) in the value blood urea in Hemophilia and von Willebrand with control. The Result show decrease (P<0.05) in the level of Ca in the blood serum to each of Hemophilia and Von Willebrand with control. HBV and HCV The result show increase the percentage infection of Hepatitis with C and B with Hemophilia, Von Willebrand, and the percentage infection of hemophilia which is infected by hepatitis in first group is (45.5%) while the second group (46.15%). The percentage infection of patient with Von Willebrand which is infected with hepatitis (60%) to males and females while the percentage infection to patient with hepatitis (45.71%, 60%) to each of Hemophilia and VonWillebrand respectively

تاثير عقار الديكساميثازون في غرس الكيس الارومي وغضروف وعظم الجنين وبعض المعايير الكيموحيوية في مصل دم الجرذان الحوامل == Effect of Dexamethasone on blastocyst implantation, Cartilage ,bone embryo and some serum biochemical parameters in pregnant rats

Author name: علاء حسين مهدي الصافي
Supervisor name: اكرم يوسف ياسر
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Karbala
First pages:
Abstract: Dexamethasone (DX) is considered one of the steroidal drugs which have varieties of clinical application in medicine for treatment of many different cases. The present study was aimed to know the effect of DX on the implantation of blastocyst during the days 7 and ten of pregnancy, and the process of development of cartilage and bones in the fetuses of albino rats during the days 15 and 20 of pregnancy. In addition to that some physiological parameters aimed to be elucidated in the pregnant rats. The study was conducted in the department of Biology \College of Education for Pure Sciences/ University of Karbala in the period of April, 2016 to May 2017. Ninety four albino rats have been used, among them 10 male rats were used for matting with 84 female rats .The females were divided into three groups, with 28 rats for each group . The first control group was injected with physiological normal saline (0.9%) intraperitoneally. The other two groups were received daily injection via the same route with 0.2 and 0.4 of DX \ 250 gm. of body weight respectively. Each group was further subdivided into four subgroups with seven pregnant female rats for each one. The pregnant rats of each subgroup were sacrificed on the following days : 7,10,15, and 20 respectively The subgroups of the latter two days were used to study the development of the cartilage and bones. Half of the embryos on day 20 of pregnancy from the control and treated groups were used for histological sectioning; while the other half were used to stain the embryonic skeleton according to double staining technique of Whitaker and Dix . All the collected samples which include the implantation sites from the pregnant uteri at days 7 and 10, together with whole embryos from days 15 and 20 of pregnancy, were put in two types of fixatives : 10% formalin and Boun's solution. The collected samples then processed according to the traditional methods of paraffin embedding to be cut into sections of five µm thicknesses. The sections were stained by haemotoxylin and eosin (H&E); one step trichrome; periodic acid Schiff's (PAS) with and without diastase; Alcian blue at pH 1.0 and 2.5. Blood samples from pregnant rats were collected on days 7,10,15,and 20 of pregnancy to check for the following biochemical parameters : concentration of calcium ,phosphate and potassium ions ;alkaline phosphatase ,and acid phosphatase enzymes; and estimation of parathyroid and calcitonin hormones. The results of the H&E stained section of pregnant sites of both the control and treated groups have shown that blastocyst was implanted in the antimesometrial side of the uterus. Most of this side of the uterus has become decidualized tissue, where four zones could be identified : the primary decidual zone; secondary decidual zone ;implantation site; and undifferentiated decidual basal zone. On day 10 of pregnancy the embryos have shifted their position from the antimesometrial side to the mesometrial side of the uterus. The decidual tissue has grown wider and included most of stromal cells of the endometrium. The changing of the position of the embryos at day 10 is important for their survival because they will become nearer to the main blood supply to uterus which are running in the mesometrium. The results of the one step trichrome stained sections from both the control and treated groups have shown clear distribution of collagen fibers in the decidual tissues at days 7 and 10 of pregnancy, which gave an indication of the success of pregnancy up to these stages. The primary decidual zone was devoid of collagen fibers but they are evident in the secondary decidual zone. At day 10 of pregnancy the collagen fibers were more in evidence especially at the mesometrial side of the uterus. The importance of collagen fibers was to give support to the blood vessels supplying the placenta which are coursing through the mesometrium. Positive stain has been revealed in PAS reaction in decidual tissue on day seven of pregnancy without diastase, but it was negative with diastase. No reaction ,in the decidual tissue, with and without diastase was noticed at day ten of pregnancy. With Alcian blue pH 1.0 no reaction was noticed in the decidual tissue of both control and treated groups at days seven and ten of pregnancy. On the other hand positive reaction has come out at pH 2.5. The reaction at that pH was more prominent at the antimesometrial decidual tissue. But it was only depicted in the wall of blood sinusoid of the mesometrial decidual tissue. Tongue like extensions of trophoblasts was noticed to be extending from the recently implanted embryo toward the endometrium, at day seven of pregnancy of both the control and treated group. The trophoblasts were pushing themselves in the direction of mesometrial decidual tissue in order to reach and settle nearer and in the wall of the blood sinusoids of that area. The invasion trophoblasts destination was to reach to the spiral arteries supplying the labyrinthine placenta in the rats. At the 15th day of gestation there was no significant change in the cartilage model in the posterior limbs of the two treatment groups from the control group. The important signal indicated by the present study was observation of cartilaginous cell necrosis, hyperplasia and inflammatory cell infiltration, At the age of near the end of pregnancy in the treatment groups, many of the effects on the bone tissue, which are the existence of a vacuum around the bone cells and the infiltration of inflammatory cells in addition to bone erosion and arthritis and the reduction of cartilage and irregularity of medicine Surface area, hyperlipidemias and leavicular necrosis. Bone marrow squeaks in the control group and the first dose group of dexamethasone were found to be more extensive than the second treatment group. The bones of control group embryos stained with alizarin red has acquired much more red coloration than the treated group embryos, which indicated a slowdown of ossification in their bones compared with control group, Showed that the length of the skull, spine, forelimbs and hind limbs of the fetal fetus at the age of 20 days of gestation of from the treatment groups has decreased for length in the control group but the decline was not significantly level (P <0.05) . The calcium, phosphate and potassium ions concentration was low in the blood serum of treated group ( P< 0.05) during the whole period studied. However the phosphate ions was low in the control group .For the alkaline phosphatase level, it was significantly low ( P< 0.05) in the treated groups compare with the control. On the other hand the level of the acid phosphatase was high in the treated group ( P< 0.05). The concentration of both the parathyroid and calcitonin hormones was significantly higher ( P< 0.05) in the treated groups compared with control. In conclusion, the present study has revealed that DX treatment showed no interference with the process of implantation during the days seven and ten, and with chondrogenesis on day fifteen of pregnancy. While the effect on cartilage formation on the fifteenth day and bone on the twentieth day of pregnancy.

تقويم فعالية الخميرة Candida albicans من المسح المهبلية للنساء في حيوية النطف واحداث العقم

Author name: رقية يحيى عبد الشهيد الطفيمي
Supervisor name: زيدان خليف عمران المعموري | فارس ناجي عبود الهادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The present study aimed to identify some of the molecular dynamic qualities and the type of Candida albicans and determine its virulence factors using some of the phenotypic and molecular techniques and their impact on the semen and causing infertility.The collection of 173 swab of the vagina and the cervix was where 97 women from women with primary infertility, including 78 women with positive and 19 women with a scanning negative.kmaamlh control and 76 women with secondary infertility, including 49 with positive screening women and 27 women with a scanning negative.kmaamlh control, women who Rajan unit infertility in Babylon, a maternity hospital and children and private clinics in the province of Babylon.The use of agricultural methods to isolate and diagnose 127 isolation dating back to Candida vaginal as well as the use of CHROMO agar medium test and test tobacco Agar to distinguish between certain types of Candida, was detected on some virulence factors such as the composition of the Germ tube and spores Alclamadah and production of enzymes case of fat (Alphusfullaypez) and the formation of membrane It was vital to draw your DNA candidiasis and the use of PCR technique where the starters used by the general whiteners, especially for the purpose of diagnosis isolates of Candida albicans and genetic profiling of yeast Candida depending on the variation in the ITS region area. Showed isolate and diagnose types of eggs in women with infertility initial results of 48 women infected with C.albicans by (61.53%), while 30 women is infected Non - C.albicans by (38.46%) either in women with secondary infertility showed the 29 women infected with C.albicans by ((59.18% and 20 women is infected non - C.albican by (40.81%). the results showed the center CHROMO agar medium isolates of Candida species C.albicans was once a green color and isolates C.tropicalis with blue color and with C.krusei color pink and showed C.glabrata violet and C.parapsilosis that showed white.And C.albicans isolates showed C.albicans result is positive for the production of germ tube and spores Alclamadah as well as the center of tobacco Acar which they appear yeast C.albicans white colonies free of filamentous structures, a test of this kind without other types of Candidapositive test.. While the production of enzymes showed a case of fat test (Alphusfullaypez) as a result of the positive isolates C.albicans and C.krusei The results showed that the incidence of candidiasis in women with infertility first was more ratio than the unemployed in secondary infertility. It was the incidence of type C.albicans is the largest in all of the women with primary infertility and secondary infertility women initial rate of 61.53% and 59.18%, respectively, followed by injury type C.glabrata by 17.9% in women with infertility first and 18.36% in secondary infertility. Distributed cases of four age groups and was the highest rates (47.91% (in women with infertility and the first (55.17%) in the women's secondary infertility is located within the age group (30 - 21) years old. In the case of a period of infertility and distributed cases into three periods and was the highest rate of infection is the period (5.1), where the percentage (81.81%) in infertile women was less than the rate of infection is the period (15 - 11), where the ratio of (6.49%) in infertile women. The results showed that the rate of infection C.albicans were higher in women with and who not to say on treatment by (65.33%) of either women with and who took up treatment (53.84%). As well as the incidence is higher in women infertile is Mentzmat appeared menstrual cycle by (63.75%) The women infertile women with regular menstrual cycle and to have a lower rate (55.31%). The incidence of rural women by (67.56%) higher than the women of the city that are represented (58.49%).It was three concentrations preparation 3×107, 5× 107, 7×108cfu/ml of all isolated from C.albicans and raw leach ate Khmer and observe their effect on semen and then finding the value of MED50 effective dose)) concentrations C.albicans way to draw a dose - of responsiveness was found that the concentration curve (107× 5 cfu/ml) top influential focus on movement and Sperm Viability. It was the influence of the C.albicans test on semen Concentration 107× 5cfu/ml over time (after 30 - 60 minutes) and a leaky yeast and after the screening device Alkazh Computer aided sperm analysis (CASA) where he found the impact of the C.albicans on sperm movement, Rapid progressive (a), Slow progressive (b) and Sperm Viability (V) over time after the text of the clock and watch.The pair initiator year ITS4 - ITS5 in the diagnosis of all isolates representing the total isolates succeeded as a return to form of the genus Candida spp. Where the results of the polymerization 520 bp. The pair initiator Specialist in the diagnosis of Candida yeasts belonging to the type C.albicans and succeeded when he polymerization products 344bp, while the rest of the species is C.albicans did not show any polymerization products.Showed genetic profiling products for the ITS using a pair of initiator ITS3 - ITS4 where showed variation in the ITS region area for the pair in the public initiator profiling C.albicans under study
1 ... 113 114 115 116 117 ... 221