Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 5,515

دراسة بكتريولوجية عن بكتيريا Moraxella catarrhalis المعزولة من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن في محافظة بابل

Author name: بشرى جبار حمود حمزة التميمي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد صبري عبد الرزاق
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (100) عينة من مرضى يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن(CSOM) في مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل وللفترة من ايلول 2003 ولغاية شباط 2004. تم تشخيص عزلات بكتيريا Moraxella catarrhalis ودراسة بعض عوامل ضراوتها المهمة، وكذلك دراسة وتحديد حساسية ومقاومة هذه البكتيريا للمضادات الحيوية المختلفة، وتاثير بعض العوامل الفيزيائية المؤثرة في نمو البكتيريا والمتمثلة بدرجة الحرارة وpHالوسط، وشملت الدراسة ايضا تاثير مادة الشمع التي تفرزها الاذن على نمو هذه البكتيريا.كانت نتائج الدراسة كما يلي : • تم تشخيص سبع عزلات تعود لبكتيريا Moraxella catarrhalis من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى المزمن، وبنسبة 6.48) (%، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع هو بكتيريا Pseudomonas aeruginosa وبنسبة 33.3)%(، تلتها بكتيريا Staphylococcus aureus 24.07)%(، تلتها بكتيريا Proteus mirbilis 16.6)%(، ثم بكتيريا Streptococcus pneumoniae (%13.8)و Acinetobacter وKlebsiella sp.بنسبة (2.77%) لكل منهما.• عند التحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتيريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت البكتيريا عدم امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثاني في حين امتلكت كافة العزلات عامل الاستعمار الثالث. • اظهرت اثنان فقط من العزلات قابليتها على انتاج انزيم البروتيز الخارج خلوي(Extra cellular protease)في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين والسايدروفورات وكذلك عدم قدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة امكانية نمو البكتيريا في درجات الحرارة الواقعة بين (40 - 25)م وكان افضل نمو لها في درجة حرارة (35)م في حين لم تنمو هذه البكتيريا في الدرجات الحرارية اعلى من (45)م.• اظهرت النتائج ان هذه البكتيريا تنمو في مدى اس هيدروجيني pH يتراوح من (8 - 4.5) وكان افضل نمو عند pH (4.5). في حين لم تنمو هذه البكتيريا عند قيمة pH (9).• اظهرت جميع العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيوية Penicillin Gو Ampicillin وAmoxycillinو Tetracycline. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية Chloramphenicolو Ciprofloxacinو Cephalexinو Cefotaximeو Cephalothin وGentamicin.• تم الكشف عن تاثير المادة الشمعية التي تفرزها الاذن على نمو بكتيريا M. catarrhalis ، اذ اظهرت النتائج تاثيرا مثبطا لنمو اربع عزلات فقط من بكتيريا M. catarrhalis في حين لم تتاثر باقي العزلات. | In this study, 100 ear swabs samples were obtained from patients suffering from chronic suppurative otitis media (CSOM), admitting to Hilla Teaching hospital in Babylon province during the period September 2003 to February 2004, the isolates of Moraxella catarrahlis were identified, and studied their virulence factor, their antibiotic resistance, the effect of wax substance of human ear, and some physical factors (pH, Temperature) on the bacteria M. catarrahlis growth. Results obtained in this study can be summarized as follow : • Only seven isolates of M. catarrahlis were identified (6.48%), also other isolates Pseudomonas aeuroginosa was the most common isolated (33.3%), followed by Staphylococcus aureus (24.07%) and Proteus. mirabilits (16.6%), Streptococcus pneumoniae (13.8%), Klebsiella sp. and Acinetobacter (2.77%).• Invistigation of pathogenicity factors such as Adhesion or colonization factors results showed ability all isolates of M. catarrahlis to produce (CFA/III) only.• M. catarrahlis isolated during this study possessed only colonization factor III, colonization factor I, II were not presented on this bacterium.• Two isolates only were able to produce extra cellular protease, but all isolates were unable to produce haemolycin, sidrophores, and capsules.• This bacterium were able to grow in a temperature range (25 - 40)C and the optimum temperature for growth was (35)C, no growth was detected at temperature more than (45)C.• M. catarrahlis were grown at pH ranging from (4.5 - 8), it was showed that the optimum pH was at (4.5),and there was no growth recorded at pH (9).• All isolates showed complete resistant to Penicillin G, Ampicillin, Amoxycillin and Tetracycline, and was resistant to lesser extent to Ciprofloxacin, Chloramphenicol ,Cephalothin, Cefotaxime, Cephalexin, and Gentamicin.• The effect of wax substance of human ear showed affected only four isolates by waxy substance.

دراسة لمجتمع الطحالب (الدايتومات) في نهر دجلة بين بغداد ومنطقة الدجيل == Study the community of Algae (Diatoms) in river Tigris between Baghdad and Al - Dujail

Author name: بثينة عبد العزيز حسن المكدمي
Supervisor name: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
General topic: Biology
Specific topic: plant - aquatic life
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current the study included and analysis of Diatoms community in the sector of the Tigris River and in the area between Dejail spend in Salahuddin province to the Muthanna Bridge area before entering the river to the city of Baghdad. Six sites have been Chosen along the river to collect samples of water per month for the duration of January until December 2014, physical and chemical factors of water were measurement, also included a study of the quality and quantity of phytoplanktonic diatome epipelic and epiphytic on (Phragmites australis Trin ex Stand ) Diatoms, also addressed the evaluation of the Tigris River water quality in the study area for the purpose of living aquatic - based Canadian Model (Canadian Council of Ministers of Environmental Water Quality Index), in addition to measurement of total concentrations of some heavy metals in water samples and applied pollution - index to evaluated the level of pollution. The results showed the presence of spatial and temporal heterogeneity in rates of physiochemical characteristics of the region studied values , as factors rates ranged as follows : Temperature of the air and water between 11.54 - 38.41c °, 13.43 - 30.36 c°, the depth, light transmittance and turbidity rates were fluctuated in different stations and seasons, as it ranged between 4.25 - 6.83 meters, 38.33 - 76.66 cm 13.03 - 136.76 NUT the flow velocity ranged between 0.50 - 3.37 m/s respectively, as for values of conductivity (EC) , Sodium chloride NaCl , TDS, and salinity increased trend of Muthanna Bridge area , with rates 711 - 1592 ms/cm, 1.5 - 3.5 % , 380.66 - 898.33 mg /L and 0.43 - 0.99 per thousand respectively. Characterized sector water as neutral or alkaline mild in terms of pH , as it ranged between 7.07 - 7.65 , also recorded an increase in dissolved oxygen, DO and bio - oxygen demand, BOD in the winter, and fall gradually in the spring and autumn values , the lower values recorded in the summer and were 2.20 - 9.13 and 0.41 - 3.90 mg / l ,Also the water of study aria Characterized with highly concentrations for Ca compared with Mg and ranged 54.66 - 164.66 and 23.66 - 39.66 mg / L, respectively, while values of Cl and Fl were between 31 - 99 and 0.08 - 0.39mg/L. Water sector characterized as very hardness , amounting to total hardness between 241.66 - 556.66 mg/L, either alkalinity rates ranged values was 86 - 142 mg /L. the result of study prevailed that the values of NO2,NO3,PO4 Affected by various additions to the river hyphen as a remnants of human activity or rainfall , as values ranged between 0.002 - 0.006 mg/L , 0.37 - 1.13 mg/L and 0.19 - 2.51 mg/L, respectively. Also the silicate, SiO3 and Sulphate SO4 recorded high values in all and some stations and ranged 2.84 - 4.74 and 85 - 554 mg/L respectively. The Chlorophyll (a, b and c) of planktonic diatoms recorded clearly fluctuated values in the current study, and arrangement for both (0.02 - 0.30, 0.07 - 1.10 and 0.03 - 3.46 mg/L. also appeared that the chlorophyll values of epipelic diatoms were higher than in planktonic , when recorded for ( a , b , c) 0.35 - 3.85, 0.08 - 1.53 and 0.10 - 3.07 mg /L respectively. In the current study 515 taxa of diatoms were diagnosed, they were distributed among the planktonic, epipelic and epiphytic on (Phragmites australis). Diatoms belonging to 21 families and 55 genus , Including 16 families and 47 genus of pennales and 5 families and 8 genera of centrales. The study was also able to record 29 new species as a new record for Iraqi flora, belong to pennales diatoms, and distributed as a flowing : 7 species (Bacillaria Paradoxa var.tumidula.Grun, Campylodiscus bicostatus W.Smith, Cymbella brehmii Hust, C. hebridica Gregory C. norvegica Grun, Diatoma vulgare var. constricta.Grun,. D. vulgare var. fromes astries abnormale,) planktonic, 4 species Gomphonema intricatum var.vibrio(Ehr.Cl) , Navicula incerta (Nach.Grunow),N. punctata var.punctata W.Smith , Surirrila suecice Grunow) Epipelic, 5 species (Achnanthes exigua var.heterovalva Krasske, Gomphonema subtile, G. tenellum Kutz , Synedra cyclopum Brutschy, S. incisa A.Boyer.) epiphytic on (Phragmites australis), Achnanthes plonensis Hust.4 species Anomoeoneis serians var.apiulata, Denticula thermalis Kutz., Navicula subrhyncocephala Hust., associate between epiphytic and epipelic diatoms, 6 species ,Achnanthes grimmei Krasske., Anomoeoneis vitera Grun., Gomphocymbella ancyli (Cleve)Hust., Navicula capitatoradiata nomen novum., Nitzschia incospicua Grun, distributed among the three environments, 2 species Cocconeis scutellum Ehr. and Navicula rhyncocephala var.germaini, as planktonic and epipelic, and one species Nitzchia obtusa var.multistriata Hohn, associate between planktonic and epipelic diatoms. The qualitative study has shown that 377 taxa of planktonic diatoms belonging to 20 families and 49 genus, which pennales were, dominate by 90.45 % (341species and 42 genus), while the centrales recorded 4.55% with ( 36 species and 7 genus) from the total of planktonic diatoms. The total number of species of planktonic diatoms wandering variation depending on the seasons and the stations, as the St4, recorded the highest number of species (65) in the winter, while the lowest number (17) species was at St1, in the summer. Also Observed heterogeneity in rates of total of individuals of plankton diatoms in different seasons and stations study, as it scored the highest average number 216.36 × 104 cells / L at St4, in the winter , and the lowest 33.62 × 104 cells /L at St2, in autumn. 298 taxa of epipelic diatoms have been diagnosed in this study, belonged to18 families and 45 genus, dominated by pennales with 94.93% (40 genus, 281 species). While the centrals recorded 5.74% (5 genus , 17 species), clearer variations observed in total of numbers for species in different seasons and stations, as recorded the highest numbers 70 species at St5, in winter, so for the St6 and St2, recorded the lowest 18 species in summer and autumn, also the numbers of individuals differenced ,as recorded the highest 91.48 x103celle/cm2 at St3 in autumn, and the lowest 6x 103 cells/cm2 at St6 in summer. The total numbers of species of epiphytic diatoms on P.australis plant reached 333, belonged to 19 families and 45 genus, the pennales recorded the highest percentage, 94.29% (39 genus and 314 species), so for the centrales get 5.71% and (19 species, 6 genus), a variation in numbers of species in different seasons and stations of study observed, as found to outweigh the 3rd St, in number of species in autumn and scored 75 species, while the St2, recorded the lowest number 38 species during the summer. Also appeared variation in the total number of individuals depending on the seasons and stations, as it scored the highest rate of cells 209.4 × 104 cells / g wet weight in the St4, in autumn, and the lowest number 25.41 × 104 cells / g wet weight at St6, during the summer. In this study Adopted four ecological indexes ( richness , diversity, the similarities and differences ) as the results showed that evidence richness and diversity of planktonic diatoms wandering values ranged between 13.58 - 3.93 and 4.05 - 2.67 , The highest value of the similarity 0.261, and the lowest value 0.103, the highest value of the difference 0.957 and the lowest value 0.586. As evidence of the richness and diversity of epipelic diatoms ranged between 19.45 - 6.61, and 3.89 - 2.05, respectively, Also recorded the highest value of the similarity 0.313 and the lowest value 0.086 , so for found the highest value of the difference 0.826, and the lowest value 0.524. While evidence richness and diversity of epiphytic diatoms recorded values ranged 16.89 - 10.44 , and 3.95 - 3.12 , respectively. While the highest value for the similarities 0.420 and the lowest value 0.173 .The highest value of difference 0.742 and the lowest was 0.408 ,when calculating the indices of water quality for the purpose of living aquatic organisms by using 15 factors ( water temperature , turbidity TDS, pH, DO, chloride, NO2 , NO3 , PO4, Fe , Cd, Cu, Pb, Ni and Zn) , the results showed that the quality of water of Tigris River for living aquaculture in area studied area got a (conservative estimate) , as evidence of the highest value 79.64 at St4, in winter and the lowest 65.95 at St1, in summer. The study also included a measurement of the total concentration of some heavy metals in water samples such as iron , cadmium , copper, lead , nickel, zinc , and their values ranged between 0.24 - 1.27 , ND - 0.038 , 0.033 - 0.383, 0.0178 - 0.469, ND - 0.323, 0.020 - 0.231 mg / L, respectively. From results we can concluded that the waters of Tigris River in the study area is contaminated with heavy metals more than the rest of the studied factors , especially regarding cadmium , copper, lead and zinc , and the two stations St3 and St6 were most polluted than the others. When applying heavy metal pollution index , we find evidence that the highest value (100) for the element Cd in all stations while recorded the lowest value ( 0.33 ) for the element Ni.

تاثير مجموعة الفلوروكوينولونات في فاعلية انزيمي البروتييز والهيمولايسين للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية

Author name: بثينة محمد طه عبد الحسين
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت هذه الدراسة عزل وتشخيص بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus من اثنين من مستشفيات بغداد خلال المدة من تشرين الثاني 2006 الى حزيران 2007 . تناولت هذه الدراسة جمع 500 عينة سريرية شملت عينات الادرار, والدم , ومسحات الجروح , والحروق , والاذن , والانف , والمهبل , والدمامل , والقشع , والعين . • زرعت العينات (المسحات وعينات الادرار والدم) مباشرة على وسط اكار الدم, لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري, حضنت الاطباق بدرجة حرارة 37م° لمدة 24 ساعة . اخضعت العينات للفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية , وشخصت على هذا الاساس 100 عزلة بكتيرية تعود للمكورات العنقودية الذهبية (S.auerus) وبنسبة عزل 20% . • اختبرت حساسية العزلات تجاه سبعة مضادات جرثومية , ستة منها تعود الى مجموعة الفلوروكوينولونات , ومضاد حياتي واحد هو الاوكساسلين الذي يعود الى مجموعة البيتا - لاكتام ,وقد بينت النتائج ان البكتريا المعزولة كانت مقاومة وبنسب عالية لكلا المجموعتين من المضادات الجرثومية قيد الدراسة , اذ كانت نسبة مقاومة Enrofloxacin 80% , 72 Ofloxacin % ,ثم Pefloxacin 71% . كما تقاربت نسب مقاومة المضادين الجرثوميين Levofloxacin وNorfloxacin , اذ كانت 57% و52% على التوالي , فيما بلغت المقاومة ضد Ciprofloxacin 33% فقط . • اظهرت91 % من العزلات قيد الدراسة مقاومة للاوكساسلين ,وهذا يشير الى مقاومة تلك العزلات للمثسلين (Methicillin - resistant Staphylococcus aureus)• اوضح اختبار التراكيز المثبطة الدنيا (Minimal inhibitory concentrations) ان Levofloxacin كان الاكفا في تثبيط هذه البكتريا , اذ بلغت قيمة MIC بين (64 - 4) مايكروغرام / مل , في حين تراوحت قيم MIC للـ (Ciprofloxacin) بين (512 - 4) مايكروغرام / مل وOfloxacin بين ((512 - 16 مايكروغرام / مل وNorfloxacin بين (1024 - 16) مايكروغرام / مل . • اختبرت قدرة العزلات المحلية على انتاج انزيم الهيمولايسين على اوساط الدم باستخدام الاصناف الاربعة لدم الانسان ( A ,B, AB,O ) , وقد كانت منتجة وبنسبة 82.75 % عند استخدام الصنف A , وبنسبة 93.10% عند استخدام الصنف AB وبنسبة 79.31% عند استخدام الصنف B , وبنسبة 79.41 % عند استخدام الصنف O , وهذا يظهر بوضوح ان صنف الدم AB هو افضل الاصناف لمعرفة نوع التحلل . • تم التحري عن قابلية البكتريا قيد الدراسة على انتاج انزيم البروتييز على وسطي اكار الحليب الفرز واكار كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز واعتماد ظهور هالات شفافة حول المستعمرات . كانت العزلات منتجة لهذا الانزيم بنسبة 79.31 % على وسط اكار الحليب الفرز , وبنسبة 82.75 % على وسط اكار كولومبيا , الذي اظهر كفاءة اعلى في الكشف عن هذا الانزيم. • حضرت التراكيز تحت المثبطة للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin وLevofloxacin واختبر تاثيرها في فعالية انزيمي الهيمولايسين والبروتييز ولوحظ ازدياد فعالية هذين الانزيمين عند التراكيز المدروسة, فقد ازداد النشاط الهيمولايسيني باستخدام صنف الدم A الى 86.20% للمضادات الجرثومية الاربعة, الصنف B الى 86.20% باستخدام Norfloxacin , و82.75% مع المضادين الجرثوميينCiprofloxacin وOfloxacin , و89.65% للمضاد Levofloxacin , الصنف AB % 100للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin , والى96.55 % للـ Levofloxacin , اما الصنف O فقد ارتفع الى 74.41% للـ Norfloxacin والى 75.86% للـ Ciprofloxacin وOfloxacin والى 93.10% للـ Levofloxacin .ارتفعت فعالية انزيم البروتييز الى 86.20 % عند التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات الجرثومية الاربعة. | This study was included the isolation and identification of Staphylococcus aureus from two of Baghdad hospitals , during the period of November 2006 to June 2007. Five hundreds clinical samples of urine and blood and the swabs of wounds , burns, ear, nose, vagina, abscesses, sputum and eye, were collected .The samples were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria , the plates were incubated at 37°C for 24 hours . The samples were objected to the microscopic examination and biochemical tests , though 100 bacterial isolates were belonged to Staphylococcus aureus (20%) .The susceptibility of the isolates was tested toward 7 antimicrobial agents , six of them belong to the Fluroquinolones group and one antibiotic (Oxacillin) belongs to the Beta - Lactam group . The results showed that these bacteria were highly resistant to both groups of the studied antimicrobial agents . The percentage of resistance to Enrofloxacin was 80% , followed by Ofloxacin 72% then Pefloxacin 71% , Levofloxacin and Norfloxacin were nearly identical 57% and 52% respectively , while the resistant to Ciprofloxacin was only 33% .Ninety - one percent of isolates were resistant to Oxacillin , Thus it was Methicillin - resistant Staphylococcus aureus (MRSA) .The test of minimal inhibitory concentrations (MICs) showed that Levofloxacin was the most active in inhibiting these bacteria , its MIC was ranging between 4 - 64 gml , while for Ciprofloxacin , the MICs values ranged from 4 - 512 gml , Ofloxacin 16 - 512 gml , Norfloxacin 16 - 1024 gml .The ability of the isolates for the production of hemolysin enzyme was studied on blood agar media by using the four human blood groups (A, AB, B, O ) . 82.75% of the isolates were producing hemolysin by human blood group A , 93.10% with group AB , 79.31% with group B , and 72.41% with group O , this clearly showed that AB blood group is the best type to detect hemolysin activities .The ability of bacteria to produce protease enzyme on skim milk agar and skim milk Columbia agar media was investigated , and depending on the appearance of clear zones around the colonies , 79.31% of isolates were able to produce this enzyme on skim milk agar media and 82.75% of isolates were able produce this enzyme on skim milk Columbia agar , which was more suitable for detecting this enzyme .The sub - inhibitory concentrations of Ciprofloxacin , Norfloxacin , Ofloxacin and Levofloxacin were prepared and its effect on the hemolysin and protease activity was tested . The activity of the two enzymes were increased by using these concentrations , hemolytic activity raised by using blood group A to 86.20% with the four antimicrobial agents , group B to 86.20% with Norfloxacin, 82.75% with Ciprofloxacin and Norfloxacin, and 89.65% with Levofloxacin , group AB 100% with Ciprofloxacin , Norfloxacin and Ofloxacin , and to 96.55% with Levofloxacin , while by using blood group O it is raised to 74.41% with Norfloxacin , 75.86% with Ciprofloxacin and Ofloxacin , 93.10% with Levofloxacin . Protease activity raised to 85.20% with the sub inhibitory concentration of the four antimicrobial agents.

الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية عند الاناث المصابات بقصور الغدة الدرقية == Physiological Disorders in Some Liver and Kidney Functions in Females Hypothyroid Patients

Author name: بان حسين حميدي
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية لبيان الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية لدى النساء العراقيات المصابات بقصور الغدة الدرقية. اجريت الدراسة على 120 امراة في المركز التخصصي لامراض الغدد الصم والسكري الواقع في منطقة الرصافة بالقرب من مستشفى الكندي . للفترة من 20/10/2013 ولغاية25/1/2014. قسمت مجموعة الدراسة الى اربعة مجاميع : (مجموعة السيطرة control, مصابات سابقا بقصور الغدة ومعالجات Euthyroid, قصور تحت السريري Subclinical hypothyroidism(SCH) , قصور الغدة العلني او الواضح Overt hypothyroid(OH) )تضمنت كل مجموعة 30 امراة . اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى هرمون Thyroid stimulating hormone(TSH)في القصور تحت السريري 18.23± 2.34 mu/l)) والقصور العلني (41.37± 3.75 mu/l) مقارنة مع مجموعة السيطرة 2.09± 0.23 mu/l)) والقصور في المعالجات) 2.89± 0.20 mu/l) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون Thyroxin (T4) (46.36± 2.32nmol/L) ومستوى طبيعي لهرمون Tri - iodothyronine (T3) في مجموعة القصور العلني مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; ( 1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة القصور المعالجات (87.10 ± 2.16nmol/L); ( 1.58 ±0.05 nmol/L) على التوالي .اظهرت النتائج انخفاضا غيرمعنويا (p˃0.05) في مستوى هرمون T4 في مجموعة القصور تحت السريري (77.76 ±2.31 nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73± 2.11nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (78.10 ± 2.16nmol/L) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون T3 في مجموعة قصور تحت السريري (1.52± 0.08nmol/L) ومجموعة القصور العلني (1.30 ± 0.11nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (1.58 ± 0.05nmol/L) على التوالي. اظهرت فحوصات الكبد ارتفاعا معنويا (P<0.05) في مستويات انزيمات الـ Glutamic - oxaloacetic transaminase(SGOT) (23.05±2.67U/L) وGlutamic pyruvic transaminase(SGPT) (21.89±2.35U/L) وAlkaline phosphatase (ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مستويات الـ SGOT في مجموعة السيطرة(8.80 ± 0.88U/L) والقصور المعالجات (11.36 ± 0.85 U/L) ومستوى الـ SGPT في السيطرة (13.46 ± 0.75 U/L) والقصور المعالجات (10.93±1.03U/L)و كذلك مستويات الـ ALP في السيطرة(65.27±2.65U/L)و القصور المعالجات (65.27±2.87U/L).ازدات مستويات انزيمات الكبد SGOT(11.88±1.42U/L) وSGPT (14.08±1.87nmol/L) وALP(65.27±2.87U/L )زيادة غيرمعنوية (P˃0.05) في مجموعة قصور تحت السريري مقارنة مع مجموعة السيطرة لانزيم SGOT(8.80 ± 0.88U/L) ومجموعة قصور المعالجات (11.36 ±0.85U/L) ومستوى انزيم SGPT في مجموعة السيطرة (13.46±0.75U/L) ومجموعة قصور المعالجات (10.93±1.03U/L) وكذلك انزيم ALPفي مجموعة السيطرة (50.27 ±2.65U/L) ومجموعة قصور المعالجات (65.27 ± 2.87U/L) . ازدادت مســــتويات البروتين الكلي (7.49 ± 0.16 g/dl) والبليروبين (1.23 ± 0.11 mg/dl )بصورة معنوية (P<0.05) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مجاميـع السيطرة ((0.613 ± 0.04 mg/dl) , ( 6.82 ± 0.04 g/dl والقصـــــور المعالجات{(0.653 ± 0.04mg/dl),(6.93 ± 0.07g/dl)}على التوالي .انخفض مستوى البروتين الكلي في مجموعة القصور تحت السريري (6.91 ±0.089g/dl) انخفاضا غير معنوي p˃0.05))مع مجموعة السيطرة (6.82±0.04g/dl) ومجموعة قصور المعالجات (6.93 ±0.07g/dl) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية (p˂0.05) في مستويات البليروبين (0.883 ± 0.08mg/dl)في مجموعةالقصور تحت السريري مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (0.613±0.04mg/dl) و(0.653 ±0.04mg/dl) على التوالي. اظهرت مريضات القصور تحت السريري والقصور العلني زيادة معنوية (P<0.05) في مستويات الدهون (mg/dl) الدهون الثلاثية TG (144.27 ± 9.89mg/dl) , (165.30 ± 3.70) والكولستيرول TC (233.37 ± 12.92 mg/dl), (301.87 ± 11.05mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة LDL - C (176.57 ± 13.03 mg/dl) , (238.60 ± 10.59 mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (28.80 ± 1.96mg/dl) , (33.07 ± 0.74mg/dl) مقارنة مع مستويات السيطرة والقصور المعالج في مستويات الكولستيرول TC(154.86 ± 5.94mg/dl) , (173.93± 3.11mg/dl)و كــــــذلك الدهون الثلاثية TG(94.83± 3.53mg/dl) , ( 88.57± 4.15mg/dl) والـــــبروتينات الدهنــــــية الواطــــــئة الكثافة(97.43 ± 5.90mg/dl) , (118.47 ± 4.85mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (19.23 ± 0.73 mg/dl) , (17.73 ± 0.84mg/dl) على التوالي ,وانخفاضا معنويا (P<0.05) في البروتينات الدهنـــــية عالية الكثافة HDL - Cفي مجمـــــوعتي تحت السريري والقصور العلني (25.27 ± 0.95 mg/dl) ,(27.93 ± 0.68 mg/dl) مقارنة مع السيطرة (37.17 ± 0.77mg/dl) , والقصور المعالج (38.47 ± 0.67mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (mmHg) في مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (14.30 ± 0.24 ) و(13.36 ± 0.19 ) مقارنة مع السيطرة والقصور المعالجات (11.56 ± 0.20),(11.67 ± 0.19)على التوالي.و كذلك اظهرت الدراسة هناك زيادة معنوية (P<0.05) في ضغط الدم الانبساطي في كل من مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (7.76 ± 0.17),(6.93 ± 0.22)على التوالي مقارنة مع السيطرة والقصور في المعالجات (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22)على التوالي.و لوحظ كذلك زيادة معنوية في قياس كتلة الجسم BMI(Kg/H2) (P<0.05) في مجموعتي التحت السريري والقصور العلني او الواضح (29.30 ± 0.90),(28.90 ± 0.73) مقارنة مع مجموعة السيطرة والقصور العلني (24.10 ± 0.39),(24.73 ± 0.49) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية في مســــتوى الكــــرياتنين (P<0.05) في مجموعة تحت السريري (1.07 ± 0.07mg/dl) وفي القصور العلني (1.26 ± 0.06mg/dl) مقارنة مـــع مجموعــــــــة الســــــيطرة (0.846 ± 0.03mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (0.836 ± 0.02mg/dl). ازداد مستوى حامض البوليك( uric acid )زيادة معنوية (p<0.05) في مجموعة مرض قصور الغدة العلني (7.11 ± 0.11mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة وقصور المعالجات (3.78 ± 0.18mg/dl) , (3.66 ± 0.16mg/dl) على التوالي.و كذلك لوحظ زيادة غيرمعنوية (p˃0.05 ) في مستوى حامض البوليك في مجموعة القصور تحت السريري (4.00±0.22mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ±0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ±0.11mg/dl) . انخفض مستوى الكالسيوم بصـــــورة معنـــوية (P<0.05) في مجمــــوعة القصـــــور تحت السريري±0.09) 8.38)و العــــــلني (8.12 ± 0.10 mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة ومجمــــوعة قصــــور المـــــعالجات (8.92 ± 0.05 mg/dl) , (8.80 ± 0.06mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى الفسفور (P<0.05) في مجموعة قصور الغدة العلني (5.49 ± 0.18mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ± 0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ± 0.11mg/dl) .كما اظهرت النتائج زيادةغير معنوية (p˃0.05 ) في مستوى الفسفور في مجموعة قصور تحت السريري ( 4.00 ± 0.22 mg/dl) مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (2.89 ± 0.07mg/dl) , ( 3.26 ± 0.11 mg/dl) على التوالي. ارتفع مستوى المغنيسيوم (P˃0.05) بصورةغير معنوية (2.67 ± 0.09mg/dl - )مقارنة مع السيطرة (2.12 ± 0.02mg/dl) ومجمــــوعة قصـــور المعالجات (2.29 ± 0.05mg/dl) وازداد مستوى المغنسيوم في مجموعة قصور تحت السريري (2.14 ± 0.03 mg/dl) زيادة غير معنوية (P˃0.05)مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.12 ± 0.02 mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات ( 2.29 ± 0.05mg/dl). نستنتج من الدراسة الحالية ان قصور الغدة الدرقية العلني اثر على وظائف الكبد والكلى واوضحت القيم المدروسة اعلاه في (مرضى القصور في المعالجات) رجوعها الى الحالة الطبيعية بعد تناولهم العلاج L - levothyroxine بجرعتي (50ملغم) او (100 ملغم). | Thyroid gland is one of the largest endocrine gland ,it is shaped like abutter fly located in appropriate place slightly below the larynx .It secretes 93%of thyroxin (T4) , 7% tri - iodothyronin (T3) and the third hormone calcitonin. The present study aimed to investigate physiological disorders in some liver and kidney functions in hypothyroid Iraqi women .The study was carried on 120 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Rusafa region, near AL - Kindey Hospital . That study began on 20/10/2013 to 25/1/2014 . The subjects were divided in to 4 groups (control, euthyroid ,subclinical(SCH) and overt hypothyroid(OH)).Each group included 30 females .The results showed a significant(P˂ 0.05) increase in the level of TSH in subclinical (18.23 ± 2.34mu/l) and overt hypothyroid patients (41.37 ± 3.75 mu/l) in comparison with control (2.09 ± 0.23mu/l) and euthyroid groups (2.89 ± 0.20mu/l). The level of T4 (46.36 ± 2.32 nmol/L) showed a significant (p˂0.05) decrease with normal T3 in OH group (1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; (1.70 ± 0.07 nmol/L) euthyroid (87.10 ± 2.16 nm0l/L) ;(1.58 ± 0.05 nmol/L) respectively.The level of T4 showed no significant (p˃0.05)decrease (77.76 ± 2.31 nmol/L) in SCH group in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) and euthyroid (87.10 ± 2.16 nmol/L) groups respectively.The level of T3 showed no significant (p˃0.05) decrease in SCH (1.52 ± 0.08 nmol/L) and OH group(1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (1.70 ± 0.07 nmol/L) and euthyroid (1.58 ±0.05 nmol/L) groups respectively. The changes in liver function tests in OH group showed a significant (P˂0.05) increase in the levels of Glutamic - oxaloacetic transaminase (SGOT) (23.05 ± 2.67U/L), glutamic pyruvic transaminase (SGPT)(21.89 ± 2.35 U/L) and Alkaline Phosphatase( ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) in comparison with SGOT in control (8.80 ± 0.88 U/L) , euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) and SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L)euthyroid (10.93 ± 1.03 U/L), and in the level of ALP in control(50.27 ± 2.65 U/L),euthyroid (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.The levels of SGOT(11.88 ± 1.42 U/L) ; SGPT(14.08 ±1.87U/L) and ALP (65.27 ±2.87 U/L) non significant increase (p˃0.05) in SCH group in comparison with SGOT in control (8.80 ±0.88U/L) and euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) ,SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L) and euthyriod (10.93 ± 1.03 U/L) and ALP in control (50.27 ± 2.65 U/L) ,euthyriod (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.Total serum protein(TSP) (7.49 ± 0.16 g/dl) and bilirubin (1.23 ± 0.11 mg/dl) were increased significantly (P˂ 0.05) in OH patients in comparable with control (6.82 ± 0.04 gm/dl) ; (0.613 ± 0.04 mg/dl),euthyroid(6.93 ± 0.07gm/dl) ;(0.653 ±0.04 mg/dl) respectively. TSP level in SCH group (6.91 ± 0.08 g/dl) was no significant decrease (p˃0.05)in comparison with control (6.82 ± 0.04 g/dl) and euthyroid (6.93 ± 0.07 g/dl) groups respectively.The levels of bilirubin (0.883 ± 0.08 mg/dl) was not significantly (p˃0.05) increase in SCH group in comparable with control (0.613 ± 0.04 mg/dl ) and euthyroid (0.653 ± 0.04 mg/dl). The SCH and OH patients showed an increase (P˂ 0.05) in the level of lipid profile (mg/dl) in total cholesterol(TC) (233.37 ± 12.92) ;(301.87 ±11.05);triglyceride( TG) (144.27 ± 9.87); (165.30 ±3.70); low density lipoprotein( LDL) (176.57 ± 13.03) (238.60 ± 10.59); and very low density lipoprotein(VLDL) (28.80 ± 1.96) ; ( 33.07 ± 0.74) respectively in comparison with the control and euthyroid in the levels of TC (154.86 ± 5.94);(173.93 ± 3.11); TG (94.83 ± 3.53); (88.57 ± 4.15) : LDL (97.43 ± 5.90) ; (118.47 ± 4.85) and VLDL (19.23 ± 0.73) ; (17.73 ± 0.84) respectively. There was a significant (P˂0.05) decrease in the levels of high density lipoprotein (HDL) in SCH and OH (25.27 ± 0.95 mg/dl) ; (27.93 ± 0.68 mg/dl)in comparison with control and euthyroid groups (37.17 ± 0.77 mg/dl);( 38.47 ± 0.67mg/dl) respectively. A significant (P˂0.05) increase in the level of systolic blood pressure(BP) mm Hg in OH and SCH groups (14.30 ± 0.24 mmHg);(13.36 ± 0.31mmHg) when compared with control and euthyroid (11.56 ± 0.20);(11.67 ± 0.19) respectively , there was a significant(P˂0.05) increase in the level of diastolic blood pressure(DBP) mmHg in OH and SCH groups (7.76 ± 0.17mmHg);(7.37 ± 0.17mmHg) in comparison with control and euthyroid groups (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22) respectively. Body mass index (BMI) value (Kg/H2) increased significantly(P˂0.05) in SCH group(29.30 ± 0.90) and OH group (28.90 ± 0.73)in comparison with control (24.10 ± 0.39)and euthyroid (24.73 ± 0.49). Creatinine level increased significantly (P˂0.05) in SCH and OH groups (1.07 ± 0.07mg/dl);(1.26 ± 0.06mg/dl), in comparable with control and euthyroid groups (0.846 ± 0.03),(0.836 ± 0.02) respectively. The level of uric acid increased significantly (P˂0.05) in the OH group(7.11±0.11mg/dl) in comparable with control, euthyroid (3.78±0.18mg/dl),(3.66±0.16mg/dl) respectively.The level of uric acid non significantly increase (p˃0.05) in SCH group (4.42 ± 0.28 mg/dl) in comparison with control (0.846 ± 0.03 mg/dl ) and euthyroid ( 0.836 ± 0.02 mg/dl) respectively. The level of calcium decreased significantly (P˂0.05) in the SCH (8.38 ± 0.09mg/dl) and OH group(8.12 ± 0.10 mg/dl) in comparable with control, euthyroid (8.92 ± 0.05mg/dl),(8.80 ± 0.06mg/dl) respectively. Phosphorus increased significantly (P˂ 0.05) in the OH patients group (5.49 ± 0.18mg/dl) when compared with control,euthyroid groups (2.89 ± 0.07mg/dl),(3.26 ± 0.11mg/dl) respectively.The level of phosphorus increase non significantly (p˃0.05) in SCH group (4.0 ± 0.22 mg/dl) in comparison with control (2.89 ± 0.07 mg/dl) and euthyroid (3.26 ± 0.11 mg/dl) .In OH group magnesium(2.67 ± 0.09mg/dl) increase non significantly (P˃ 0.05) in comparison with control (2.12 ± 0.02mg/dl), euthyroid (2.29 ± 0.05) respectively.The level of Mg(2.14 ± 0.03 mg/dl) in SCH was not significant increase (p˃0.05)in comparison with control (2.12 ± 0.02 mg/dl ) and euthyroid (2.29 ± 0.05 mg/dl)groups. Euthyroid group showed normal levels for the above studied parameters which means that the levels of these parameters returned to the normal values in treated hypothyroid group (euthyroid patients)with Levothroxine - L at a dose 50mg or 100 mg orally.

دراسة فعالية البكتريوسين المنتج من قبل بكتريا Lactobacillus plantarum في عوامل الضراوة لبكتريا Acinetobacter baumannii == Study The activity of Bacteriocin produced from Lactobacillus plantarum on virulence factors of Acinetobacter baumannii

Author name: ايناس ابراهيم جاسم المشهداني
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 22 عزلة بكتيرية تعود لبكتريا baumannii Acinetobacter ، عزل (15) منها من عينات الدم وعزلتان من عينات الادرار و(5) عزلات من عينات الحروق ، تم التاكد من تشخيصها من خلال الصفات الزرعية والمجهرية والاختبارات الكيموحيوية ومن ثم استخدام اختبار - 20E API.• تم التحري عن حساسية العزلات اتجاه (20) مضادا حيويا ، فاظهرت جميع العزلات مقاومة لكل من مضاداتCarbenicillin ، Cefixime ، Cefotaxime ، Ceftazidime، Cetriaxone ، Ampicillin/ Sulbactam ، وكان مضاد Imipenem الاكثر فعالية ضد العزلات ، اذ بلغت نسبة المقاومة (40.90)% ، وتبين ان (68.18)% من العزلات مقاومة مابين(16 - 20) مضاداحيويا .• اظهرت النتائج ان جميع العزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتميز عدا عزلة واحدة (Ab4) لم تنتج هذه الانزيمات ، في حين امتلكت 3 عزلات فقط (13.6)% من مجموع 22 عزلة القدرة على انتاج انزيمات البيتالاكتميز واسعة الطيف .• كذلك بينت النتائج ان جميع العزلات منتجة لجميع عوامل الضراوة المدروسة والمتضمنة : الحركة الارتعاشية ، المحفظة ، الخمل ، الغشاء الحيوي ، الانزيم المحلل للدهون (Lipase) وحوامل الحديد (Siderophore) بنسبة (100) % ، في حين جاء انتاجها للانزيم المحلل للبروتين (Protease) والبكتريوسين باقل نسبة (13.6 , 31.8)% على التوالي .• درس تاثير البلانترسين المنقى جزئيا من بكتريا Lactobacillus plantarum في نمو ثلاث عزلات منتخبة تعود لبكتريا A.baumanniiاعتمادا على امتلاكها عوامل الضراوة ومقاومتها لمضادات الحيوية والتي شملت Ab20 , Ab17 , Ab2 . • اعطى بكتريوسين البلانترسين تاثير تثبيطي جيد ضد العزلات المنتخبة عند التراكيز (62.5 ،125 ،250 ، 500 ) مايكروغرام/مليلتر ، حيث بلغ التركيز المثبط الادنى (62.5) مايكروغرام/مليلتر .• استخدم التركيز تحت المثبط الادنى (31.25) مايكروغرام/مليلتر من البلانترسين المنقى جزئيا للتحري عن تاثيره في عوامل الضراوة المدروسة للعزلات المنتخبة ، فاظهر تثبيطه لالتصاق العزلات المنتخبة بالخلايا الطلائية عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة (8.2 ، 9.3 ، 7.8 ) بعد المعاملة بالبلانترسين في الوقت الذي بلغت (73.5 ،90.5 ،86.2 ) وعلى التوالي قبل المعاملة ، كما اظهر البلانترسين تاثيرا تثبيطيا لالتصاق هذه العزلات على البولستارين وانتاج الانزيم المحلل للبروتين (Protease ) وانتاج البكتريوسين ، وتسبب في فقدان تكوين الغشاء الحيوي ، كما ادى الى تثبيط نسبي في انتاج الانزيم المحلل للدهون (Lipase ) ، في حين لم يؤثر على كل من الحركة الارتعاشية ، المحفظة وانتاج حوامل الحديد .• درس تاثير التركيز تحت المثبط الادنى للبلانترسين المنقى جزئيا على حساسية العزلات لمضادات الحيوية ، اذ اظهرت النتائج تاثير متباينا في مقاومة وحساسية العزلات المنتخبة لمضادات الحيوية | • During this study a total of 22 bacterial isolates of Acinetobacter baumannii were collected , 15 isolates from blood sample , two isolates from urine sample and 5 isolates from burn samples . All isolates were then subjected to the cultural , microscopical and biochemical examination and using API 20E system for identification this bacteria .• Sensitivity of isolates was tested against 20 Antimicrobial agents, results revealed that all isolated of A. baumannii were resistant to Carbenicillin , Cefixime , Cefotaxime , Ceftazidime , Cetriaxone, Sulbactam / Ampicillin . Imipenem was found to be the most effective against the isolates , the resistance to Imipenem was 40.9% . 68.18% of isolates resistance 16 to 20 antibiotics.• The results showed also that all isolates had the ability to produce β - Lactamases enzyme except one isolate (Ab4) , Three isolates 13.6 % were able to produce Extended Spectrum β - Lactamases. • All isolates were able to produce all virulence factors such as : Twitching motility , capsule , fimbria , biofilm , lipase, siderophore with percentege 100% . While for producing protease and bacteriocin were decreasid to 13.6% and 31.8% respectivelly .• The effect of partially purified plantaricin from Lactobacillus plantarum was studied on growth of three A.baumannii isolates possessing high resistance to Antibiotics and able to produce virulence factors (Ab2 , Ab17 and Ab20) .• Plantaricin Showed a good inhibitory effect against A.baumannii isolates at concentration 65.5 , 125 , 250 , 500 Mg/ml and the minimum inhibitory concentration (MIC) was showed 62.5Mg/ml.• The effect of sub MIC of partially purified plantaricin 31.25Mg/ml on virulence factors of A.baumannii was studied , plantaricin had inhibitory effect on Adherence of isolates on epithelial cells , the adherence mean was 8.2 , 9.3 and 7.8 after treatment with plantaricin compare with before treatment 73.5 , 90.5 and 86.2 . The results showed also that plantaricin had inhibitory effect on adherence of isolates on polystyrene , protease and bacteriocin production and biofilm formation , relative inhibitory of lipase production , while plantaricin don't have any effect on twitching motility, capsule and Siderophore.• The effect of sub MIC of plantaricin on sensitivity of A.baumannii isolates to Antibiotics was studied , the results showed that different pattern of resistance to Antibiotics .

التداخل البكتيري مع عوامل ضراوة خميرة الكانديدا المسببة لحالات التهاب الفرج والمهبل == Bacterial Interference In The Virulence Factors Of The Yeast Candida Causing Vulvovaginal Candidiasis

Author name: ايمان ناطق ناجي البياتي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | سناء مسلم الصفار
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 200 عينة من اعالي المهبل ( H.V.S ) High Vaginal Swab من نساء متزوجات توزعت بين 130 امراة غير حامل ( Non Pregnant Women ) ( NPW ) منهـن 90 كن مصابات بالتهاب الفرج والمهبل Vaginitis و( 40 ) منهن كن سليمات لغرض السيطرة (H ) Healthy Control والباقــي ( 70 ) عينة من نساءحوامل ( P.W. ) Pregnant Women ، منهـن( 40 ) امراة مصابة بالتهاب الفرج والمهبل و( 30 ) اخرى سليمـة سيطرة . استمرت فترة جمع العينات من 1/6/2002 الى 1/2/2003 تحت اشراف الكادر الطبي المتخصص في قسم النسائية والتوليد في مستشفى النعمان العام في الا عظمية / بغداد . كما تم تخصيص استمارة استبيان لكل مريضة دون فيها كل ما يخص المريضة من اعراض سريريه ونتائج التشخيص والفحص المختبري والملاحظات العامة .اعتمادا على الاعراض المرضية والفحوصات المختبرية التشخيصية تم تحديد ثلاث انواع من الالتهابات المهبلية وهي : ا - التهاب الفرج والمهبل اللانوعيBacterial Vaginosis (BV.) ..ظهرت الحالة في (23) مريضة من مجموع (70) امراة حامل [ فيهن (40) مريضة و( 30) اخرى سليمة ] بنسبة (33%) من الحوامل ، كما ظهرت في ( 25) امراة غير حامل من مجموع ( 130) امراة [فيهـن ( 90 ) مريضة ] بنسبة ( 19% ) من النساء غير الحوامل .ب - التهاب الفرج والمهبل الكانديدي Volvavagianal Candidiasis (VVC) .. ظـهرت الحالة في ( 13) مريضة من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة ( 18%) [فيهن ( 30) امراة سليمة و( 40) اخرى مريضة ] كما ظهرت في ( 43) مريضة من مجموع ( 130) امراة غير حامل بنسبة (33%) [فيهن ( 40) امراة سليمة و(90) اخرى مريضة جـ - التهاب ناتج من اصابة مختلطة Mixed Infection (MI) ظهرت الحالة في ( 4) مريضات من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة (6% ) [ فيهن ( 30) امراة سليمة و(40) اخرى مريضة] كما ظهرت في (22) مريضة من مجموع (130) امراة غير حامل بنسبة ( 17) [ فيهن (30) امراة سليمة و(40) امراة اخرى مريضة] . وقد تم عزل 74 عزلة من خميرة الكانديدا عزلت ( 38 ) عزلة منهـن( 43 ) امراة مصابة بالكانديـدا ( VVC ) عزلت ( 16 ) عزلة من (22) مريضة مصابة باصابة مختلطة (M.I ) وعـزلت ( 5 ) عزلات من مجمـوعة السيطرة من النساء غير الحبلى ومن جانب اخـر عزلت ( 11 ) عزلة من ( 13 ) امراة مصابة بالكانديدا ( VVC ) و( 3 ) عزلات من 4 نساء مصابات اصابة مختلطة ( M.I ) وعزلة واحدة من مجموعة السيطرة للنساء الحوامل. وهذه النتائج تدل على سيادة خميرة الكانديدا في التهاب الفرج والمهبل لدى مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل.و تم تشخيص الانواع التالية من خميرة الكانديدا وهي : Candida albicans ( 37 عزلة ) ، C. tropicalis ( 20 عزلة ) C. glabrata ( 7 عزلات) C.dubliniensis ( 7 عزلات ) وC.parapsilosis عزلة واحدة وC. krusei عزلتين. امكن الحصول على 588 عزلة بكتيرية من مجموع عدد الحالات الموجبة للزرع البكتيريولوجي لمجموعتي المرضى والسيطرة البالغ عددهم ( 140 ) امراة شخصت فيها سبعة اجناس من البكتيريا اللاهوائية والانواع التابعة لها وهي : Peptostreptococcus spp, Peptococcus spp, Prevotella spp , Streptococcus spp, Bacceroides spp, Propionibacterium spp, Lactobacillus spp, كما تم تشخيص انواع من البكتريا المتحملة لوجود كميات قليلة من الاوكسجين وهي : Strept . mitis , Entero , faecalis , Gardnerella vaginalis اضافة الى اربع اجناس وبعض انواعها من البكتريا الهوائية وهي Proteus spp , Staphylococcus spp , Escherichia spp, Pseudomonas spp .ولقـد كان النوعان G.vaginalis , Bacteroides fragilis من اكثر الانواع عزلا في مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل المصابات بالتهاب الفرج والمهـبل اللانوعي B.V . وفيما يخص عوامل الضراوة لخميرة الكانديدا والانواع التابعـــة لها وجد ان 28 عزلة ( 76 % ) منتجة للانزيم الحال للشحوم المفسفرة Phospholipase و6 عزلات ( 16 % ) ضعـيفة الانتاجية لهـذا الانـزيم و( 3 ) عزلات ( 8 % ) غير منتجة من اصل ( 37 ) عزلة للنوع C. albicans اماعزلات C. tropicalis فكانت 15 عزلة ( 75 % ) منتجة للانزيم و3 عزلات ( 15 % ) ضـعيفة الانتاجية وعزلتان ( 10 % ) غير منتجة من اصل 20 عزلة . اما عزلات النوع C.dubliniensis فكانت منـها ( 5 ) عزلات ( 71% ) منتجة من اصل (7) عزلات فى حين انتجت عزلة واحدة للنوع C.glabrata هذا الانزيم .وعند دراسة انتاج الانزيم الهاضم للبروتينات Proteinases كعامل اخر من عوامل الضراوة فقد تباينت قدرة الانزيمات المنتجة مـن عزلات الكانديدا على هظم البروتيــن بين ( 175 - 30 ) مكغم / مل وتفاوتت العزلات في قابليتها على انتاج الانزيم فكانت هناك 29 عزلة منتجة من اصل 74 عزلة كانديدا وكانت ( 7 ) منـها مـن النوعC.albicans و( 8 ) منها للنـوع C. tropicalis , وثلاث منها للنوع C. dubliniesis وعـزلة واحـدة للنـوع C. glabrata ولم تتمكن عزلات النوعين الاخرين من انتاج الانزيم وهما C.parapsilsosis وC. krusei . ومن حيث عامل الضراوة الثالث وهو قدرة الخميرة على الالتصاق بالخلايا الطلائية فقد تفاوتت ايضا عزلات الخميــرة فـــي اظهار هـــذه القدرة وكان النوعان C. albicansوC. dubliniensis هما الاكثر كفاءة في الالتصاق من بين الانواع الاخرى وكانت نسبة خلايا الخميرة الملتصقة بالخلايا الطلائية في درجة الحرارة 25 م اعلى من التي حصلت عند درجة 37 م للعزلة نفسها ولكن التحليل الاحصائي لم يظهر فروقا معنوية عالية .كانت جميع عزلات خميرة الكانديدا مقاومة لمادة النستاتين وبتراكيز عالية جدا بلغت 256 مكغم / مل في حين كان المستحضر Clotrimazole هـو الافضل مـن بين مشتقات الازول الاخرى اذ كانت جميع العزلات حساسة له فقـد تراوحت قيـم (MIC ) بيـن ( 2 - 125, 0) مكغم / مل للنوعين C.albicans , C.tropicalis و( 0.5 - 0,125) للنوعين C.dubliniensis وC.glabrata وكانت قيم MFC اكبر او تساوي 4 مكغم / مل . بينـما تفاوتت حساسية عزلات الخميرة اتجاه مشتقات الازول الاخرى اذا اظهرت ثلاثة انواع من الخميرة مقاومة لمضاد Ketoconazule وهي C. albicans , C.dubliniensis , C. glabrata اذ تراوحت قيم MIC ( 0.5 - 32 )،( 0.25 - 16 ) , 160.25 - - مكغم / مل على التوالي بينما كانت الانواع الثلاثة الاخرى حساسة له . وكانت قيم MFC على العموم اكبر ويساوي 32 مكغم / مل . وكانت جميع العزلات حساسـة لمضاد Miconazole اذ تراوحت قيم ( MIC ) مـن ( 4 - 8 ) مكغم / مـل ضد النوع C. albicans واقلها هـــي للنوع C.dubliniensis وهي (0.125 - 1.0) مكغم / مـل بينما كانت قيمة MFC تتراوح بين اكبر او يساوي 4 الى اكبر او تساوي 16 حسب نوع العزلة . وكانت قيم MIC للمضاد Fluconazole مرتفعة لكنها لم تتجاوز 32 مكغم / مل ولذا اعتبرت العزلات حساسة ولكن بتراكيز عالية بينما كان MFC له اكبر او يساوي 64 .كانت قيم MIC لمضاد Amphotericin B هــي الافضل اذا بلغت (0,125 - 0,5 ) مكغم / مل اما MFC فكان يساوي 1 مكغم / مل لقد اظهرت النتائج ان طريقة التخافيق باستعمال الوسط الزرعي السائل لتحديد MIC هي الافضل مقارنة باستعمال الوسط الزرعي الصلب اذ كانت قيم MIC مرتفعة مقارنة بقيم MIC بالطريقة الاولى .ولدراسة الفعالية التضادية لبعض انواع البكتريا المعزولة من اعالي المهبل على عوامل الضراوة وحيوية خميرة الكانديدا ، انتخبت 32 عزلة بكتيرية تابعة لاجناس مختلفة على اساس ما اظهرته من تاثير تضادي في التجارب الاولية على عوامل الضراوة او الحيوية او كلاهما وهذه العزلات هي ثلاث عزلات تابعة للنوع Peptostreptococcus prevotii ، ثلاث عزلات تابعة للنوع propianibacterium granulosum، وست عزلات تابعة للنوع Lactobacillus acidophilus وخمس عزلات تابعة للنوع L. gensenii وثلاث عزلات لكل من النوعين Streptococcus mitis وEnterococcus faecalis كما وانتخبت عزلات الخميرة الاكثر كفاءة في التجارب قيد الدراسة واعتمادا على نتائج الجزء السابق .بعد ان نميت العزلات البكتيرية السابقة الذكر في اوساط زرعية مناسبة لكل منها تم الحصول على رواشح مزارعها السائلة وتم تركيز الرواشح الــى نصف الحجم ( رم 1) والى ربع الحجم ( رم 2 ) مع الاحتفاظ بجزء من الراشح غير المركز . لم تظهر الرواشح غير المركزة تاثيرا على هذه العوامل ولقد بدا واضحا تاثير الراشح المركز لمرة واحدة او لمرتين وبدرجات متفاوته وذلك لاختلاف الاجناس البكتيريا والانواع التابعة لها . كانت اكـثر الـرواشح تاثيرا هـي الـرواشح المركزة م1 وم 2 لكـل مـن العزلات Sm3 , Ef3 , Lj5 , La5 , La6 على فعالية الخميرة في انتاج الانزيمات الهاضمة للبروتين والانزيمات الحالة للشحوم المفسفره وكان النوع C. albicans اكثر حساسية اتجاه المعاملة بهذه الرواشح مقارنة مع الانواع الاخرى ، كما اثرت هذه الرواشح على خفض نسبة الانبات في المصل وبفرو قات معنوية كبيـرة وصلت الى >0.001 P . واظهر ( رم1 ) ( رم2 ) للعزلة La 6 تاثيرا في خفض حيوية الخميرة مقدرة بوحدة مستعمرة لكل مل ( CFU/ml ) وتبين ان لحموضة هذه الرواشح تاثيرا في عملية التثبيط ولكن لا يعزى له التاثير الكلي. فعند مقارنة تاثير الحموضة فقط فـــي اوساط زرعيه سائلة ذات pH محدد ومماثل الى pH الرواشح مما يشير الى ان هذه الرواشح تحتوي مركبات ذات تاثير مثبط ، كما لم تظهر رواشح العزلات الاخرى تاثيرا واضحا او كان بعضها غير مؤثر . ولمحاولة فهم طبيعة تاثير خلايا العزلات البكتيرية السابقة على عملية التصاق خميرة الكانديدا بسطوح الخلايا الطلائية وجدنا ان العزلات Lj5 , La5 , Pp3 , Pg3 , Sm3 , Ef3 , La6 هي الاكثر تاثيرا في خفض نسبة الالتصاق وعلى التوالي وقد اظهرت العزلات طرقا مختلفة في طبيعة منع الالتصاق اما باحاطة خلايا الخميرة بغلاف من خلايا البكتريا او باحاطة الخلية الطلائية بغلاف من خلايا البكتريا او كلاهما مما يمنع التصاق الخميرة بسطح الخلية الطلائية وذلك من خلال غلق المستقبلات على سطوح الخلايا. | 200 high vaginal swabs were taken from 200 married women, 130 of them were non - pregnant (N.P) and 70 were pregnant (P.) women. Of the 130 N.P : 90 were suffering from vaginitis and 40 were healthy controls. Of the pregnant group 40 were suffering from vaginitis and the rest 30 were healthy controls. Thus there were a total of 130 infected and 70 healthy. Sample were taken during the period of first of June 2002 till the end of Feb. 2003, under the supervision of specialized gynecologist in the general No’man hospital in Adhamia , Baghdad . A special questionnaire was prepared for each individual. As result of cultural and microbiological examinations of the sample and depending on the clinical and microbiological features of the 130 infected pregnant (90) and non - pregnant (40) women their vaginitis were devided into three groups, namely : (a) : Bacterial vagnosis (B.V) : Appeared in (23) out of (70) pregnant women [ including (30) healthy and (40) infected i.e. 33% ]B.V. also appeared in 25 non - pregnant women out of 130 [ including (40) healthy and (90) infected i.e. 19% ](B) : Volavaginal condidiasis (V.V.C).Appeared in 13 women out of (70) pregnant women ( 18%) [including 30 healthy and (40) sick] it V.V.C also appeared in (43) infected non - pregnant women out of 130 ( 33%)[ including (40) healthy and (90) sick](C ) : Volvavaginosis due to mixed bacterial and fungal infection. I.e. mixed infection (M.I) : Appeared in (4) patient out of (70) pregnant women (6%) [including 30 healthy and (40) sick women ] . It also appeared in (22) patients out of (130) non - present women [including (40) healthy and (90) sick pregnant women] A total of (74) isolates of candida SPP were isolate from non pregnant and pregnant women of this number 38 isolates from (43) VVC non pregnant cases, (16) isolates from 22 MI non pregnant cases, 5 isolates from 40 healthy non pregnant group, 11 isolates from 13 VVC pregnant women, 3 isolates from 4 MI pregnant women, and one isolates from 30 healthy.The following species of Candida were identified : C. albicans 37 isolates , C. tropicalis 20 isolates , C. glabrata 7 isolates , C. dubliniensis 7 isolates , C. parapsilosis one isolate , and C. kursei 2 isolates .Bacteriologically 588 isolates of bacteria were obtianed form 140 women positive for bacterial cultural ; these include several species of 7 anaerobic bacterial genera ; peptostreptococcus, peptococcus , Streptococcu spp, prevotella spp, Bacteroides spp, lactobacillus spp and propionibacterium spp. Similarly the following microaerophilliic bacteria were isolated; Gardnnerella vaginalis, Enterococuus faecalis , and Streptococcus mitis . The following aerophilic were also isolated, staphyllococcus spp, proteus spp Escherichia spp and pseudomonas spp. the most frequently isolated species a mong infected women group with ( B.V) were Bacteriodes fragilis and G. vaginals . Concerned the virulence factors of the yeast candida spp like production of phospholipases and proteinasas, besides the adherence on epithelial cells ( from human mouth ) and drug tolerance. Phpspholipase was produced by 28 isolates (76 %) out of 37 of C. albicans whereas the rest 6 isolates (16 %) were weak producers and 3 isolates (8 %) did not produce this enzyme. On the other hand out of 20 isolates of C. tropicalis 15 (75 %) were weak producer and 2 isolates (10 %) were not producers of the enzyme . Of The 7 isolates of C. dubliniesis 5 (71% ) could produce the phospholipase also one ( 14 % ) of the 7 isolated of C.glabrata could produce theis enzyme . The enzyme proteinase was produced by 29 out of 74 (39 %) isolated of candida spp out these 17 were C.albicans 8 were C. tropicalis , 3 were C. dubliniesis , one was C. glabrata the other species did not produce the enzyme. Ability of the isolates for attachment onto the surface of epithelial cells varied according to the species. Both C.albicans , C. dubliniesis were more efficient than other species . The percentage of epithelial cells attached by yeast cells were higher at 25C than at 37 C for the same isolate of the yeast, though this difference was not significant. As the resistance to antifungals concerned, we found that all isolates of candida were resistant to nystatin . The measured minimum inhibitory concentration (MIC) reached 256 g/ml . On the other hand , all isolates of candida were much more susceptible to clotrimazole with MIC ranging ( 0,125 - 2 ) g/ml for C.albicans and C. tropicalis and about ( 0,5 - 0.125 ) g / ml for C.dubliniesis and C.glabrata . The minimum fungicidal concentration (MFC) was 4 ug/ml or more for these Candida spp .The (MIC) for ketocanazole against C. albicans , C.dubliniesis , C.glabrata ranges were [0.5 - 32, 0.25 - 16 and 0.25 - 16] g / ml respectively, whereas the other species of candida were more sensitive to ketaconzole , and the ( MFC ) generally was equal to or higher than 32 ug / ml .The (MFC) for Miconzole was (4 - 8) g / ml against C. albicans an (1 - 0.125) g / ml agianst C.dubliniesis , the ( MFC ) ranged between equal to or higher than 4 and 16 g / ml . Fluconzole was less effctive than the others as the (MIC) values agianst all species were 32 g / ml or les. While the (MFC) was equal to or higher than 64 g / ml. Amphoterricin B was the most effective as the (MIC) values against all isolates of candida were (0.125 - 0.5) g / ml and MFC was 1 g/ ml.For the determination of (MIC) we found that using serial dilution of liquid cultures was better than using solid agar media. The recorded (MIC) result using agar media were higher than those obtained in liquid media.We studied the antagonistic effect against virulence factors of Candida spp by (23) isolates of bacteria isolated from healthy vagina. The selection of the candida and the bacterial isolates based on preliminary tests. So three isolates of peptostreptococuus prevotii, three isolates of propionibacteriume granulosum, six isolates of lactobacillus acidophilus , five isolates of lactobacillus jensenii , three isolates of each of streptococcus mitis , and Enterococcus feacalis were used in such tests as culture filtrates and / or as bacterial cells.The cultural filtrates were concentrated to the half or to the quarter volume of the original, as the non - concentrated culture filtrates did not show any effect. Different filtrates showed different levels of effect, the more effective were the double or quadruple concentrates of the culture filtrates of L.acidophilus isolates no 5 and 6, L.jensenii isolates No. 5, Enter.faecalis isolates No. 3 and strep.mitis isolates No. 3 . These filtrates adversely affected the phospholipase and proteinase enzymes, C.albicans being more affected than other species. Also these filtrates reduced significantly (P < 0.001) the percentage of germ forming cells of C.albicans . The culture filtrate (conc. to half or to quarter volume) of isolate No. 6 of L.acidophilus greatly reduced the viability (CFU /ml) of C.albicans and other species. This effect was not totally due to the acidity (low pH) since similar pH values in control tests did not reduce viability to the same level and did not effect the yeast cells. We found that adhesion of candida cells to epithelial cells was reduced in the presence of bacterial cells. The following bacteria were effective and they are listed below starting from the most to the less effective in reducing the number of adhering yeast cells (the number refers to the isolate number L.acidophilus 6, Enter. feacalis 3, Strep. mitis 3, P.granulosum3 peptost. prevotii 3 , L.acidophilus 5 and L.jensenii 5 .Some species of bacteria prevented adhesion by surrounding the yeast cells while other species surrounded the epithelial cells some did both

المؤشرات الحيوية في اللعاب والدم في النساء المصابات بسرطان الثدي == Biomarkers in Saliva and Blood of Breast Cancer in Women

Author name: ايدن كامل محمد
Supervisor name: خالد مهدي صالح | ماهرة نوري احمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يشكل سرطان الثدي المرتبة الاولى من بين اكثر السرطانات شيوعا في العراق، وقد اصبح يشكل اكبر تهديدا لصحة النساء العراقيات. يمتاز سرطان الثدي بكونه مرض شديد التغاير بسبب تنوع خصائصه المظهرية، نتائجه السريرية، وتباين استجابته للعلاجات المختلفة. لذلك فان الدراسة الحالية تحاول ان تضع تصنيف شامل لسرطان الثدي عند النساء العراقيات من خلال تحديد قوة عوامل الخطورة الاكثر شيوعا ، ومستويات بعض الدوال الحيوية قبل وبعد عملية الازالة الجراحية وفيما اذا يمكن الكشف عنها في اللعاب كسائل جسمي تشخيصي بديلا عن الدم.تم تصميم هذه الدراسة لتشمل 181 امراة عراقية من مراكز ومستشفيات الكشف المبكر عن السرطان والامراض النسائية خلال الفترة من تموز 2013 ولغاية تشرين الثاني 2014 . كان عدد النساء السليمة من امراض الثدي 50 امراة ، و131 امراة تعاني من امراض الثدي (111 منهن لديهن سرطان الثدي الخبيث ، والـ 20 المتبقية منهن يعانين من امراض الثدي الحميدة) ، حيث تم تاكيد التشخيص السريري باستخدام تقنية الرشف بالابرة الدقيقة من قبل المتخصصين في هذه المراكز.باستخدام استمارات الاستبيان ، تم الحصول على بيانات التاريخ الطبي لكل النساء المشمولات بالدراسة لتحديد عوامل الخطورة المرافقة لسرطان الثدي كالعمر ، والتاريخ العائلي للمرض ، والعمر عند اول دورة طمثية ، والعمر عند بدا سن الياس ، واستخدام موانع الحمل الفموية ، والحالة الزوجية ، والاجهاض ، والرضاعة ، والتعرض السابق لامراض الثدي والاشعاع ، بالاضافة الى التدخين. كما تم الحصول على بعض المقاييس البدنية كالطول ووزن الجسم ومحيط الخصر والورك لتحديد حالة البدانة لدى كل النساء المشمولة بالدراسة.تم جمع عينات الدم واللعاب من كل النساء لتحديد صنف الدم حسب نظام ABO ونظام لويس وحالة الافراز وكذلك لتقدير مستويات الدوال الحيوية فيهما والتي تضمنت الاسترادايول والبروجيسترون والـCancer Antigen 15 - 3 وCarcinoemberyonic Antigen والبروتين الكلي. اما عينات الخزعة فقد استحصل عليها فقط من النساء المصابات بسرطان الثدي بعد عملية الاستئصال الجراحي واخضعت للفحص الامراضي النسجي والجزيئي لغرض تصنيف السرطان الى انواعه الرئيسية وانماطه الثانوية باستخدام تقنية الكيمياء المناعية النسجية. لقد بينت الدراسة الحالية العديد من النتائج والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1. هناك اربعة عوامل خطورة فقط والتي يمكن الوقاية منها (البدانة وامراض الثدي السابقة واستخدام موانع الحمل والاسقاط) هي التي رافقت بشكل معنوي سرطان الثدي ، في حين سجلت معظم عوامل الخطورة التي لا يمكن الوقاية منها كتاريخ المرض العائلي وحالة اللاافراز وطمث مبكر وسن ياس متاخر زيادة معنوية من خطورة اصابة النساء بسرطان الثدي. ان التاثير التراكمي لعوامل الخطورة هذه اوضح بان 99.1% من النساء المصابات بسرطان الثدي لديهن واحد او اكثر من عوامل الخطورة سواءا تلك التي يمكن الوقاية منها او التي لا يمكن الوقاية منها وبتوشيجات مختلفة بالمقارنة مع 68% من النساء السليمات و75% من النساء المصابات بامراض الثدي الحميدة.2. ان تراكيز جميع الدوال الحيوية المستخدمة في هذه الدراسة قد ارتفعت في دم النساء المصابات بسرطان الثدي عن الحد الاعلى لمدياتها الطبيعية وعن تلك المسجلة عند النساء الطبيعيات والمصابات بامراض الثدي الحميدة ما عدا البروجيسترون الذي بقي تركيزه ضمن الحدود الطبيعية في كل المجاميع. كما تبين بان جميع الدوال الحيوية امكن العثور عليها في عيينات اللعاب وان معامل الجزء اللعابي خاصة للدالتين CA 15 - 3 والبروتين الكلي سجل ارتفاعا معنويا لدى النساء المصابات بسرطان الثدي (14.51% و9.86% على التوالي) بالمقارنة مع (10.65% و2.08% على التوالي) عند النساء السليمات و(12.28% و2.41% على التوالي) للنساء المصابات بامراض الثدي الحميدة .3. بينت الدراسة ان اكثر انواع سرطان الثدي شيوعا عند النساء العراقيات طبقا لتصنيف الامراض النسجية هو السرطان الاجتياحي حيث شكل 92.8% من المجموع الكلي لحالات سرطان الثدي في هذه الدراسة ، والنسبة المتبقية (7.2%) تعود للسرطان الموقعي. في حين اظهر التصنيف الجزيئي بان اكثر الانماط الثانوية شيوعا من السرطانات الاجتياحية هو النمط luminal - like حيث شكل (80.6%) ، واما النسبة المتبقية فشكلت (9.7%) لكل من النمطين HER2 - enriched وbasal - like. وان معظم حالات النمط basal - like كانت من الدرجة الثالثة (90%) بالمقارنة مع 21.7% في حالات النمط luminal - like و10% في النمط HER2 - enriched.4. ان عوامل الخطورة التي لايمكن الوقاية منها هي وحدها التي سجلت ترددات عالية بين حالات النمط basal - like بحيث ان 90% من نساء هذا النمط كن في عمر ما قبل سن الياس ، و70% منهن كان لديهن دورة طمثية غير طبيعية ، و40% منهن لديهن تاريخ عائلي للمرض في اقارب الدرجة الاولى ، و100% من نساء هذا النمط لا يمتلكن صفة الافراز الوراثية. 5. بغض النظر عن البروجيسترون ، فان تراكيز جميع الدوال الحيوية انخفضت بشكل معنوي في عينات الدم واللعاب ولجميع الانماط الثانوية بعد عملية الازالة الجراحية للورم عما كانت عليه قبل الازالة الجراحية ، غير ان حالات النمط basal - like بقيت تراكيز الدوال فيها اعلى وبشكل معنوي عن تلك الموجودة في النمطين الاخرين. 6. على الرغم من ان معامل الجزء اللعابي لكل من الاسترادايول والبروجيسترون والـ CA 15 - 3 لم تتغير قيمته بعد عملية الازالة الجراحية للورم عن تلك المسجلة قبل الازالة الا ان قيمته بالنسبة للدالة CEA (قبل وبعد العملية) ولدالة البروتين الكلي (بعد العملية) قد ازدادت بشكل معنوي في حالات النمط basal - like بالمقارنة مع تلك الموجودة في النمطين الاخرين . يمكن ان نستنتج بان صفة الافراز الوراثية تعد كعامل خطورة قوي لسرطان الثدي خاصة اذراافقتها عوامل خطورة اخرى ، كما ان اللعاب يعد كسائل جسمي تشخيصي يمكن استخدامه للتحري عن العديد من الدوال الحيوية المتعلقة بسرطان الثدي على الاقل للتفريق بين سرطان الثدي وبقية امراض الثدي الحميدة وكذلك بين الانماط المختلفة لسرطان الثدي الاجتياحي. | In Iraq, breast cancer ranks the first among the commonest malignancies, which became one of the major threats to Iraqi female health. Breast cancer is a highly heterogeneous disease due to its diverse morphological features, clinical outcome and response to different therapeutic options. Therefore, the current study attempt to establish a comprehensive classification of breast cancer in Iraqi women via determining the strength of most common risk factors, levels of some biomarkers pre - and post - surgical operation, and whether they are detectable in saliva as an alternative diagnostic fluid as well as of blood. This study has been designed upon 181 Iraqi women in different sites and hospitals for early detection of breast cancer and gynecology Hospital during the period from July 2013 to October 2014. Women involved in this study include 50 healthy, and 131 breast diseased (111 from them are with malignant breast cancer and 20 with benign - breast disease), the diagnosis was confirmed according to the fine needle aspiration (FNA) technique carried out by specialists. By using questionnaire list, clinical history of all women was obtained to determine risk factors associated with breast cancer such as age, family history, age at menarche and menopause, oral contraceptive use, marital status, pregnancy, abortion, breast feeding, previous exposure to breast disease and radiation, as well as smoking. Physical measurements were obtained from all women including height, body weight, waist and hip circumference to determine their obesity status.Blood and saliva samples were collected from all women to determine ABO and Lewis blood groups, secretory status, as well as biomarkers levels including estradiol, progesterone, CA 15 - 3, CEA, and total protein. However, tumor biopsies were obtained only from breast cancer women postoperatively and subjected to histopathological and molecular investigation to classify the major types and subtypes of breast cancer by using immunohistochemistry technique.The present study revealed several results which can be summarized as follows : 1. Only four preventable risk factors (obesity, previous breast disease, oral contraceptive use, and abortion) were significantly (P < 0.05) associated with breast cancer, while most of the non - preventable risk factors including positive family history, non - secretors, early age at menarche and late age at menopause were significantly (P < 0.05) increased the risk in women for getting breast cancer. Furthermore, the accumulative effect of all these risk factors showed that 99.1% of Malignant breast cancer women have combination of one or more risk factors whether they are preventable or non - preventable which are present in different combination in comparison with 68% of normal breast and 75% of benign breast - diseased women.2. The concentrations of all biomarkers investigated in this study were elevated in the blood of malignant - breast women and become higher than those in normal and benign breast diseased women as well as higher than upper limits of their normal range except progesterone which remained within its normal range. Furthermore, all biomarkers were detectable in the saliva samples and the salivary fraction index (Sf %) particularly of CA 15 - 3 and TP were significantly higher in Malignant breast cancer women (14.51%, 9.86% respectively) than those in normal breast (10.65%, 2.08% respectively) and benign breast (12.28%, 2.41% respectively). 3. The most common type of breast cancer among Iraqi women according to histopathological classification was invasive carcinoma (92.8%), while the rest belong to in situ ductal carcinoma (7.2%). Whereas molecular classification showed that the most frequent subtypes of invasive carcinoma among Iraqi women was Luminal - like carcinoma (80.6%), while the rest (9.7%) were recorded for each HER2 - enriched and basal - like. The majority of basal - like cases were found at the 3rd grade (90%) when compared with 21.7% in luminal and 10% in HER2. 4. Non - preventable risk factors recorded high frequency among basal - like cases; 90% of them are at premenopausal status, 70% have abnormal menarche, 40% having first - related women getting breast cancer, and 100% of them are non - secretors.5. In spite of progesterone, concentrations of all other biomarkers were significantly decreased postoperatively in blood and saliva of all subtypes when compared with their concentrations preoperatively, but cases with basal - like carcinoma still have higher concentrations than those in luminal and HER2 whether pre - or postoperatively. 6. Although the salivary fraction of estradiol, progesterone, and CA 15 - 3 didn’t change after surgical removal of tumor from that of preoperatively, its values for CEA (pre - and postoperatively) and total protein (only postoperatively) were significantly increased in basal - like cases in comparison with those in luminal and HER2 subtypes.It can be concluded that secretor status should be considered as a strong risk factor for getting breast cancer particularly when combined with other risk factors, also saliva as diagnostic body fluid is a promised sample to search for several biomarkers related with breast cancer at least to differentiate between breast cancer and other benign breast diseases as well as between the different subtypes of invasive breast carcinoma.

تاثير مادة الاومنيباك 350 على كروموسومات الفئران المشععة بالاشعة السينية X - Ray == Omnipaque 350 Effect on Irradiated Mice Chromosomes with X - Ray

Author name: ايات علي محمود الجبوري
Supervisor name: مثنى ابراهيم ملك
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Wasit
First pages:
Abstract: الاومنيباك (350) هو مادة لونية , غير متاينة ,تحتوي على ذرات الايودين في تركيبها الكيميائي. يتم استعمال هذه المادة في كثير من التطبيقات الطبية المهمة المتمثلة في التصوير الاشعاعي كالمفراس الحلزوني, جهاز الرنين المغناطيسي وتطبيقات الاشعة السينية لتسهيل تشخيص الاصابات المرضية المختلفة وذلك باعطاء صورة لكل تراكيب الجسم مثل الاوعية الدموية, جهاز القناة الهضمية بالاضافة الى انسجة واعضاء الجسم الاخرى. تم تصميم هذه الدراسة لتحديد تاثيرات هذه المادة (الاومنيباك 350) على كروموسومات خلايا نخاع عظم الفئران المختبرية بالاضافة الى تعريضها الى ثلاث ضربات من الاشعة السينية (60 كيلو الكترون فولت في كل ضربة) في محاولة للتقرب بعمل المفراس الذي يعطي عدة ضربات لجرعة واحدة وفي ان واحد. اجريت هذه الدراسة في مختبر الوراثة الخلوية \قسم علوم الحياة\ كلية العلوم في جامعة واسط وذلك لغرض تحديد تاثيرات مادة الاومنيباك لوحدها او بدمجها مع الاشعاع وباستخدام عدة اختبارات خلوية - جينية كاختبار معامل انقسام الخلايا الطبيعية, التشوهات الكروموسومية ومعدل تكون النوى الصغيرة. وعلى هذا الاساس قسمت الحيوانات المختبرية الى مجموعتين : مجموعة السيطرة ومجموعة المعالجة. مجموعة السيطرة تضمنت ثلاث مجاميع, الاولى مجموعة السيطرة السالبة عوملت ب(0,25مل) ماء مقطر والثانية عرضت للاشعاع (ثلاث ضربات من جرعة 60 كيلو الكترون فولت لكل حيوان) اما الثالثة فقد حقنت بمادة الاومنيباك (0,25 مل) من خلال الحقن بالغشاء البيريتوني وتركت لمدة 24 ساعة. اما مجموعة المعالجة فقسمت ايضا الى ثلاث مجاميع وذلك بحقن مادة الاومنيباك لمرة واحدة (25,.مل) ولكن بفترات زمنية مختلفة تضمنت قبل وبعد وبين تشعيعين مع الاخذ بنظر الاعتبار عن وجود فرق معنوي عندما تكون (P< 0.05). اظهرت دراستنا الحالية ان مادة الاومنيباك لوحدها بالمقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة 1 لها القدرة على تقليل المعامل الطبيعي لانقسام الخلايا ((P=0.006 ورفع معدل كلا من التشوهات الكروموسومية (P=0.001) ومعدل تكون النوى الصغيرة ((P=0.0009. علاوة على ذلك , اظهرت النتائج بان مستويات معامل الانقسام الطبيعي للخلايا ومعدل تكون التشوهات الكروموسومية والنوى الصغيرة تكون متشابهة في حالة حقن الاومنيباك قبل التشعيع (معامل الانقسام P=0.120,),(التشوهات الكروموسومية, P= 0.070),(النوى الصغيرة, P=0.067) او حقنها بعد التشعيع (معامل الانقسام P=0.169,),(التشوهات الكروموسومية, P= 0.465),(النوى الصغيرة, P=0.321).كما اثبتت نتائجنا ان تاثير مادة الاومنيباك 350 لوحدها على كروموسومات الفئران المختبرية هو مشابه لتاثير الاومنيباك والاشعاع معا (سواء تم حقن الاومنيباك قبل التشعيع او بعد التشعيع) وذلك من خلال عدم وجود فروق معنوية (P>0.005) في هذه المجاميع وفي جميع الاختبارات. واهم ما اظهرت دراستنا ان حقن الاومنيباك بين فترتين من الاشعاع اعطى فرقا معنويا كبيرا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة 1 وفي جميع الاختبارات (معامل الانقسام P=0.0009 وفي التشوهات الكروموسومية P=0.0004 ومعدل تكون النوى الصغيرP=0.0005). واخيرا , اثبتت دراستنا بان مادة الاومنيباك لها تاثير ضار على كروموسومات خلايا نخاع عظم الفئران اكثر من الاشعاع اذا استخدم الاخير في جرع قليلة ,وتعود سمية الاومنيباك الى وجود الايودين في تركيبه الكيميائي والذي يمتاز بانه يساعد على زيادة امتصاص وتركيز الاشعة في الخلايا ناهيك عن كونه يمتلك تاثيرات ضارة على .DNA | Omnipaque (OP) 350 is non - ionic iodinated contrast medium frequently utilized in many medical applications such as CT - scan (computed tomography), MRI (magnetic resonance image) and X - ray, which improves the body structures or fluids contrast in medical imaging processes. The CT using can help to take clear contrast images between body tissues and organs, particularly the visibility of blood vessels and gastrointestinal system structures. Therefore, this study was established to investigate the effects of OP 350 on chromosomes of mice bone marrow stem cells following very low doses of X - ray (60 KeV, 3 doses per animal), mimicking the CT - scan effects on patients post OP 350 injection. The present study was carried out in the Laboratory of Cytogenetic at Department of Biology/ College of Science/ Wasit University. Cytogenetic effects of OP 350 alone, and OP 350/X - ray combination on chromosomes of bone marrow stem cells of albino males’ mice were evaluated through measuring mitotic index (MI), chromosomal aberrations (CAs) and micronuclei (MN). Therefore, the laboratory animals were divided into two groups : control groups and treated groups. Control groups consisted of three groups : negative control 1 (received 0.25 ml distilled water); the second group (X - ray group) was irradiated by three doses of 60 KeV. The third group was positive control, which was intraperitoneally injected with 0.25 ml of OP 350 and left for 24 hour while the treated groups were also divided into three groups by injection OP 350 before, after X - ray exposure and between two X - ray irradiation. The results were taken and analyzed (probability value was considered significant at P <0.05). The results showed that OP 350 treatment alone, in comparison with negative control group 1 (treated with 0.25 ml of distilled water), has the ability to increase the level of CAs (P=0.001), MN (P=0.0009) and reduce MI (P=0.006) significantly in mice bone marrow stem cells. Moreover, similar CAs, MN and MI levels were observed within the OP 350/X - ray combination treated a group in terms of OP 350 was giving before X - irradiation (MI (P=0.120), CAs (P=0.070), MN (P=0.067)) or after X - irradiation (MI (P=0.169), CAs (P=0.465), MN (P=0.321)).Therefore, the impacts of OP 350 alone is similar to the impacts of OP 350/X - ray combination treated a group in terms of OP 350 was giving before or after X - irradiation. So, there is not significantly different in all tests between these groups (P>0.005). Nevertheless, OP 350 treatment between two X - ray irradiations showed higher induction in CAs (P=0.0004) and MN (P=0.0005) and lower reduction in MI (P=0.0009) in comparison with negative control group 1. Finally, the study suggested that OP 350 has higher detrimental effects on chromosomes of mice stem cell than X - ray (if had utilized at low doses). The toxicity of OP 350 can be related to the iodine existence in its chemical structure, which may absorb and concentrate the X - ray in the cells, as well as, iodine has a harmful effect on DNA

دراسة مناعية ووراثية لداء السكري النوع الاول في عينة من المرضى العراقيين == Immunological and genetic study of type I diabetes mellitus in a sample of Iraqi patients

Author name: انور عبد ناصر
Supervisor name: احسان عرفان حسين | حازمة موسى خميل
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة على 50 عينة دم ماخوذة من اطفال تراوح متوسط اعمارهم من 7 - 12 سنة, كان منها 35 (18 ذكور, 17 اناث) عينة دم لاطفال مصابين بداء السكري - النوع الاول Type 1 Diabetes Mellitus (T1D), وعلى 15 (9 ذكور, 6 اناث) عينة دم لاطفال اصحاء التي عدت كعينة قياسية. قدر تركيز بعض الحركيات الخلوية بادئة الالتهاب في مصل العينات المدروسة التي شملت IFN - γ وIL - 17, وبعض الحركيات الخلوية مضادة للالتهاب وشملت IL - 4، IL - 10 وTGF - β1, وباستعمال تقانة الاليزا ELISA. اظهرت النتائج تراكيز عالية من الحركي الخلوي IFN - γ في مصل المصابين بداء السكري - النوع الاول، اذ بلغ تركيزه 1.575 بيكوغرام/مليلتر بالمقارنة مع 0.921 بيكوغرام/مليلتر لدى العينة القياسية. اظهرت نتائج التحليل الاحصائي باستعمال اختبار Mann - Whitney U وجود فروق معنوية في هذا الحركي الخلوي بين الاطفال المصابين والعينة القياسية وتحت مستوى احتمالية P<0.05. اظهرت النتائج ايضا انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 17A في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ التركيز في مصل دم المصابين 0.010 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.029 بيكوغرام/مليلتر. اظهرت النتائج انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 4 في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ التركيز في مصل دم المصابين 0.015 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.021 بيكوغرام/مليلتر, كما اظهرت النتائج انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 10 في مصل دم المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ متوسط التركيز في مصل دم المصابين 0.068 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.111 بيكوغرام/مليلتر. بينت النتائج ارتفاعا ملحوظا في تركيز الحركي الخلوي TGF - β1 في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ متوسط التركيز في مصل دم المصابين 1.659 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.444 بيكوغرام/مليلتر. اظهره نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية في تركيز TGF - β1 بين كلا العينتين وتحت مستوى احتمالية P<0.05. اشارت نتائج قيم معامل الارتباط باستعمال تحليل Pearson Correlation بين الحركيات الخلوية المدروسة الى وجود فروق معنوية في بعض الحركيات الخلوية, بينما لم تظهر وجود اية فروق معنوية في الحركيات الخلوية الاخرى. اظهر التعدد الشكلي لجين IFN - γ T/A +874 المتضخم باستعمال تقانة نظام الممانعة للتضخيم Amplification refractory mutation system (ARMS - PCR) نسبة اعلى من تكرار الاليل t في عينة المصابين بالمقارنة مع تكرار الاليل a، بينما سجل الاليل t نسبة اعلى من الاليل a في العينة القياسية. ظهر الاليل a كاليل مسبب Etiological faction (EF) بلغت قيمته 0.451, ومرتبط مع المرض في عينة المصابين، بينما ظهر الاليل t كاليل وقائي من المرض Preventive faction (PF) وبلغت قيمته 0.299. اظهرت نتائج التحليل الاحصائي للنمط الوراثي TT نسبة اعلى لدى العينة القياسية بالمقارنة مع عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول, وظهر هذا النمط كنمط وراثي وقائي من خطر الاصابة بداء السكري, وظهر النمطان الوراثيان TA وAA كنمطين وراثيين مرتبطين مع خطر الاصابة بداء السكري. اظهرت نتائج الترحيل الكهربائي وجود الجينين IL - 17A وIL - 17 - F في عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول والعينات القياسية, ولعدم توفر الانزيمات القاطعة والوقت الكافي لم تتم دراسة التعدد الشكلي لهذه الجينات. اظهر التعدد الشكلي لجين IL - 4 - 590 (C˃T) المتضخم باستعمال تقانة ARMS - PCR نسبة اعلى من الاليل c في عينة المصابين بالمقارنة مع الاليل t وظهر الاليل c كاليل مسبب مرتبط مع خطر الاصابة بالمرض، بينما سجل الاليل t نسبة اعلى من الاليل c في العينة القياسية، وظهر الاليل t كاليل وقائي من المرض. اظهر النمطان الوراثيان TT وTC كنمطين مرتبطين مع الجزء الوقائي من خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول وظهر النمط الوراثي CC كنمط وراثي مرتبط مع خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول. كشف عن محث الجين 10IL - في الموقعين - 592 و- 1082 في عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول والعينة القياسية، واظهرت النتائج وجود هذين الموقعين في محث الجين IL - 10 في جميع العينات المدروسة. اظهرت نتائج التعدد الشكلي للجين TGF - β1 في الموقع Codon 10 : +869*C/T بان الاليل t كاليل مسبب ومرتبط مع المرض, بينما اظهر الاليل c كاليل وقائي من خطر الاصابة بالمرض. وظهر النمطان الوراثيان TT وCC كانماط وراثية مسببة ومرتبطة مع خطر الاصابة بداء السكري, بينما ظهر النمط الوراثي CT كنمط وراثي مرتبط مع الجزء الوقائي من المرض. بينت نتائج التعدد الشكلي للجين TGF - β1 في الموقع Codon 25 : +915*G/C بان الاليل g ظهر كاليل مسبب ومرتبط مع خطر الاصابة, بينما ظهر الاليل c كاليل وقائي من المرض. ظهر النمط GG كنمط وراثي مرتبط مع خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول, بينما لم يظهر النمطان الوراثيان GC وCC اي ارتباط معنوي مع المصابين بداء السكري - النوع الاول, وكان نمطان مرتبطين مع الجزء الوقائي من خطر الاصابة بالمرض. نتائج التسلسل التتابعي لمحث الجين IL - 10 في الموقعين الطافرين - 592 و- 1082 قد سجلت العديد من الطفرات الجينية من نوع الاضافة، الحذف والاستبدال مع نسبة عالية من النوع الاخير من الطفرات الجينية في جميع العينات المدروسة ولكلا الموقعين. | This study was included 50 blood serum samples were collected from children with age ranged between 7 - 12 years. Thirty five samples collected from children with Type 1 Diabetes Mellitus (T1D), and 15 blood serum samples collected from healthy children as a control sample. The concentrations of some pro - inflammatory interleukins like IFN - γ and IL - 17 were detected. Anti - inflammatory interleukins like IL - 4, IL - 10 and TGF - β were also detected by using Elisa instrument. The results revealed high concentrations of IFN - γ in T1D patient’s blood serum with 1.575 Pg/ml in comparison with 0.921 Pg/ml in control sample. The statistically results by using Mann - Whitney U test revealed significant differences between T1D patients and control samples. The results also revealed decreasing in IL - 17 concentrations in T1D patient’s blood serum with 0.010 Pg/ml in comparison with the control sample with 0.029 Pg/ml. No significant differences were detected in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the same statistical test. The results showed increasing in TGF - β concentration in T1D patient’s blood serum in comparison with the control sample. The concentration was 1.659 Pg/ml in patients, whereas the concentration of TGF - β in control sample was 0.444 Pg/ml. The results of Mann - Whitney U test showed significant differences in TGF - β concentrations between both samples. The results revealed decreasing in IL - 4 concentration in blood serum of T1D patients in comparison with the control sample. The concentration was 0.015 Pg/ml in patients, whereas the concentration of IL - 4 in control sample was 0.021 Pg/ml. No significant differences were found in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the same statistical test. The results also revealed decreasing in IL - 10 concentration in T1D patient’s blood serum in comparison with the control sample, with 0.068 Pg/ml in patient sample and 0.111 Pg/ml in control sample. No significant differences were found in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the Mann - Whitney U test. The results of correlation coefficients by using Person Correlation test between the studied interleukins showed significant differences among some interleukins, but no significant differences were detected with the other interleukins. The polymorphism of IFN - γ T/A +874 gene, which amplified by using amplification refractory mutation system (ARMS - PCR) was showed increasing in T allele frequency of T1D patients in comparison with the A allele frequency, whereas the T allele frequency was higher from the A allele frequency in control sample. The A allele revealed as Etiological faction (EF) and correlated with the disease in T1D patients sample, whereas the T allele revealed as Preventive faction (PF). The TT genotype showed higher percentage in control sample in comparison with T1D patients sample when Hardy - Weinberg equilibrium was used, and this genotype revealed as preventive faction from infection by this disease. The TA and AA genotypes revealed as etiological faction with risk by having this disease. The gel electrophoresis of IL - 17A and IL - 17F genes revealed the presence of both genes in all studied samples. The polymorphism of IL - 4 - 592 (C>T) gene which amplified by ARMS - PCR technique was showed high C allele frequency in T1D patients sample in comparison with T allele frequency, and the C allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the T allele showed high frequency from the C allele frequency in control sample, and the T allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The TT and TC genotypes revealed as preventive faction from infection by this disease, whereas the CC genotype revealed as etiological faction with risk by having this disease. The promoter of IL - 10 gene in - 592 and - 1082 positions were detected in both of the studied samples. The results of polymorphism of TGF - β1 gene in Codon 10 : +869*C/T position showed that the T allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the C allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The TT and CC genotypes revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the CT genotype revealed as preventive faction from infection by this disease. The results of polymorphism of TGF - β1 gene in Codon 25 : +915*G/C position showed that the G allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the C allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The GG genotype revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the GC and CC genotypes showed no significant correlation with the T1D disease, and these genotypes revealed as preventive faction from infection by this disease. The DNA sequences of the IL - 10 gene promoter were recorded many gene mutations with addition, deletion and substitution types, with high percentage of the last type of gene mutations in all of the studied samples and for both - 592 and - 1082 positions.

دراسة وراثية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المسببة لاخماج الحروق والجروح في محافظة بابل

Author name: انوار كاظم حسين الصفار
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Genetics
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل وتشخيص 20 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa من اصل 87 مسحة من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي نتيجة لاصابتهم باخماج الحروق والجـروح حيث كانت نسبة عزل هذه البكتريا مـن الحروق %45.5وهي اعلـى مـن الـجروح والبالغة % 9.25 . تم التاكد من التشخيص باستخدام نظامAPI - 20E فضلا عن اجراء الاختبارات الزرعية والمجهرية والكيموحياتية.درست بعض عوامل الضراوة التي تمتلكها هذه البكتريا فقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات البكترية حاوية على المحفظة (Capsule) واظهرت مستعمرات العزلتين61 و62 عند تنميتها على وسط Tryptic soy agar اللزوجة العالية بسبب الانتاج المفرط لمادة الالجنيت المكونة للمحفظة.اظهرت بعض العزلات قابلية في انتاج السايدروفور(Siderophore) والبعض الاخر انتاج الهيمولايسين, في حين كانت العزلات كافة منتجة لانزيمات البروتيز مما يشير الى ان عزلات البكتريا تمتلك احد الانظمة لتزويدها بالحديد اما السايدروفور او انتاجها للهيمولايسين.درس تاثير بعض المضادات الحيوية اذ اظهرت نتائج الدراسة ان جميع العزلات كانت مقاومة لكل من الامبيكلوكس والسيفوتاكسيم والكاربنسلين والاموكسسلين والكولستين والتتراسايكلين والسيفالكسين والجنتامايسين والامبسلين والكلورمفنيكول والترايمثبريم بنسبة % 100 والستربتومايسين بنسبة % 85 والاميكاسين % 70والسبروفلوكساسين % 65, في حين كانت جميع العزلات حساسة لكل من الامبينيم والريفامبسين بنسبة % 100 .اظهرت عزلات بكتريا P.aeruginosa المعزولة من اخماج الحروق والجروح اربعة انماط للنسق البلازميدي وبعضها كان خالي مــن البلازميدات اذ اظهـرت العزلتين 22 و24 احتوائها على بلازميد كبير مفرد فضلا عن وجود ثلاث حزم بلازميدية صغيرة, اما النمط الثاني فقد اشتركت العزلتين61 و62 باحتوائها على بلازميد كبير مفرد وحزمتين بلازميديتين صغيرتين, والنمط الثالث اظهرت العزلة 25 احتوائها على حزمة بلازميدية كبيرة, اما النمط الرابع فقد اشتركت العزلات27 و32و34و87و93 باحتوائها على حزمتين بلازميديتين صغيرتين في حين كانت العزلات 48و49و71و78 خالية من البلازميدات على الرغم من مقاومتها المتعددة للمضادات الحيوية ويعتقد بان الجينات المشفرة لصفة المقاومة للمضادات الحيوية قد تكون كروموسومية.اجريت عملية الاقتران البكتري للعزلات 24و25و62 كعزلات واهبة مع السلالة المستلمة E.coli MM294 واظهرت النتائج انتقال البلازميدات ونقل صفة المقاومة لعدد من المضادات الحيوية وهي الامبسلين والتتراسايكلين والستربتومايسين والكلورمفينكول اضافة الى نقل صفة اللزوجة. كما بينت نتائج عملية التحول الوراثي للعزلات 22و24و25و61و 62انتقال البلازميدات الى جميع العزلات المتحولة واكتسبت الخلايا المتحولة المقاومة للمضادات الحيوية, واوضحت نتائج هذه الدراسة اشتراك هذه العزلات في بعض البلازميدات المتحولة اذ انها تشابهت في انتقال صفة المقاومة للمضادات الحيوية فيما بينها, كما في حالة تشابه المجموعة 22 - A مع 62 - B في اكتساب صفة المقاومة لمضادات الاموكسسلين والتتراسايكلين والامبسلين والترايمثبريم والكلورمفينكول, والمجموعة 22 - B مع 61 - A في صفـة المقاومة لمضادات الاموكسسلين والامبسلين والسيفاتكسيم والترايمثبريم والكلورمفينكول,وتشابهت المجموعة 24 - B مع 61 - E في اكتساب صفة المقاومة لمضادات الاموكسسلين والامبسلين والترايمثبريم, اما مجموعة 24 - A فقد تشابهت مع المجموعة 25 في نقل صفة المقاومة لمضادات الاموكسسلين والامبسلين والترايمثبريم والكلورمفينكول, وتشابهت المجموعـة 61 - C مع المجموعة 62 - A في نقل صفة المقاومة لمضادات الاموكسسلين والتتراسايكلين والامبسلين والسيفاتكسيم والترايمثبريم والكلورمفينكول, اضافة الى اكتساب الخلايا المتحولة في العزلتين 61و 62الصفة المخاطية. | Twenty strains of P.aeruginosa were isolated from 87 swab samples of patients suffering from burn and wound infections in Al - Hilla Teaching Hospital of Babil Governorate. The results appeared that the isolation of P.aeruginosa from the burn was more (45.5%) than from wound (9.25%). All bacterial isolates were identified by the biochemical, cultural and microbial characteristics and confirmed by api - 20 E system. Some of the bacterial virulence factors, were studied. The results showed that all bacterial isolates were capsulated and the colonies of P.aeruginosa no. 61 & 62 showed mucoid phenotype on tryptic soy agar plates due to overproduction of alginate of the capsule. Some of the isolates showed the ability to produce siderophore, while others (50,53,61,62,65,71,87 and 93) produce haemolysin indicating that these isolates had one Iron providing system either siderophore or haemolysin production; All the isolates produced protease. Also, all isolated showed multiple resistance to antibiotics, they were resistant (100%) to Cefotaxime, Carbencillin, Amoxycillin, Colistin, Tetracyclen, Cephalexin, Gentamicin, Ampcillin, Chloramphenicol and Trimethoprim. The others showed variable resistance to Streptomycin (85%), Amikacin (70%), Ciprofloxacin (65%). All of the isolates were sensitive (100%) to Impenium and Rifampicin. The DNA content of these isolates revealed the presence of four types of plasmid profiles and some of them are plasmidless (48,49,71 and 78) on agarose gel electrophoresis. The DNA content of the isolates No. 22& 24 showed single large plasmid band and three small plasmid bands.The second type 61 and 62 showed the presence of single large plasmid and two small plasmid band, third type isolate no.25 showed a large plasmid band only. The fourth type (the isolates 27, 32,34, 87 and 93) revealed the presence of two small plasmid bands on gel electrophoresis. The plasmids, of the isolates 24, 25 and 62 was transferred by conjugation into the recipient plasmidless cells of E.coli MM294, the results showed that these plasmids encoded for Ampcillin, Tetracyclin, Streptomycin and Chloramphenicol resistance and mucoid phenotype. The plasmids of the isolates 22, 24, 25, 61 and 62 were transformed into the plasmidless competent cells of E.coli MM294. The results showed that all transformed plasmids encodes antibiotic resistance and the plasmids of the isolates 61 & 62 encoded mucoid phenotype in transformant colonies in addition to antibiotic resistance. The results also pointed to the plasmids of the group 22 - A was similar to the plasmid of group 62 - B in acquiring the resistance to antibiotics (Amoxcillin, Tetracyclin, Ampcillin, Trimethoprim and Chloramphenicol ).The plasmid of group 22 - B was similar to the plasmid of group 61 - A in acquining the resistance to antibiotics (Amoxcillin, Ampcillin, Cefotaxime, Chloramphenicol and Trimethoprim). The plasmid of group 24 - B was similar to group 61 - E in acquiring the resistance to antibiotics ( Amoxcillin, Ampcillin, Trimethoprim), group 24 - A was similar to group 25 in acquiring the resistance to antibiotic (Amoxcillin, Ampcillin, Trimethoprim and Chloramphenicol) and group 61 - C was similar to group 62 - A in acquiring the resistance to antibiotics (Amoxcillin, Tetracyclin, Ampcillin, Cefotaxime, Trimethoprim and Chloramphenicol) and mucoid phenotype .

دراسة تشريحية مقارنة لتراكم الصابونيات وتقديرها في نبات Yucca gloriosa Variegata L. الكامل ومزارعه النسيجية

Author name: انسام غازي عبد الحليم علي
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | كاظم محمد ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد نبات الخنجر الاسباني Yucca gloriosa Variegata L. نبات زينة وطبي مهم, ينمو في المناطق الجافة وشبه الجافة حول العالم. يعد التكاثر الخضري التقليدي للنبات عن طريق العقل والخلفات وسيلة غير كافية نظرا الى الاعداد المحدودة التي يستطيع انتاجها، وعليه توفر تقنية زراعة الانسجة النباتية طريقة بديلة للانتاج التجاري لهذا النبات. ازداد الاهتمام بنبات Y. gloriosa لان جميع اجزاء النبات غنية بالمركبات الستيرويدية التي لها قيمة علاجية واسعة. اجريت الدراسة بهدف اكثار هذا النبات نسيجيا واختبار انتاج الانسجة من الصابونيات الستيرويدية في انسجة الزروعات ومقارنتها مع محتوى هذه المركبات في النبات الكامل باستعمال التحليلات الكروماتوغرافية والمجهر الفلوريسيني والذي يعتبر طريقة جديدة فعالة لتقدير مستوى تراكم المركبات الثانوية واختبار المنتجات النباتية الطبيعية التي تستعمل كعقاقير طبية. لدراسة الاخلاف خارج الجسم الحي اضيفت تراكيز مختلفة من منظمات النمو البنزل ادنين BA)) وحامض النفثالين NAA)) وتداخلهما الى الوسط الغذائي موراشيج وسكوج(MS) لاستحثاث الكالس من الاوراق والبراعم. سجلت النسبة المئوية لاستحثاث الكالس والوزن الطري ولون وبنية الكالس بعد 1.5 و6.0 اشهر من الزراعة. استحث الكالس من اجزاء الاوراق في وسط MS مجهز ﺑ 6 ملغم/لتر NAA. اظهرالتداخل بين 0.2 ملغم/لتر BA و1.5 ملغم/لتر NAA تاثير ملحوظ في نشوء الكالس من البراعم. تم اختبار تاثير اضافة منظم النمو الثايدايازورون (TDZ) ﺑتراكيز مختلفة (0.0, 0.1, 0.5 او (1.0 ملغم/لتر الى وسط MS مجهز ﺑ BAو NAAفي استحثاث الكالس. سجل اسرع نمو واكثر انتاجية للكالس من البراعم في الوسط المجهز ﺑ 0.1 ملغم/لتر BA مع 1.5 ملغم/لتر NAA و1.0 ملغم/لتر TDZ. اظهر TDZ تاثيرا ايجابيا في ٳستحثاث الكالس من البراعم مقارنة مع BA او NAA, واعطت بعض التداخلات تكوين مباشر للافرع الخضرية. تميز الكالس الناتج من البراعم بلونه الٲبيض المائل الى الكريمي وبكونه متراص, بينما كان كالس الاوراق اخضر اللون ومفصص. تم اختبار تاثير عدة تداخلات من BA 3)، 6، 7، 8 او 9 ملغم / لتر) و0.05) NAA، 0.1 او 0.2 ملغم / لتر) في تكوين النبيتات على وسط MS في غضون 12 اسبوعا، كان اعلى تكوين للنبيتات بوجود 9) ملغم / لتر) BA و0.1) ملغم / لتر) NAA . حدد تاثير اندول حمض البيوتريك (IBA) بتراكيز مختلفة في تكوين الجذور. ان افضل تجذيرللنبيتات كان في وسط MS بقوة ½ المجهز ﺑ 1.0 ملغم / لتر IBA. استخلصت وشخصت الصابونيات الستيرودية التايكوجينين والجيتوجينين من اجزاء النبات الكامل (اوراق، جذور وقمم نامية) ومزارعه النسيجية (الكالس، الاجزاء الخضرية التي تم اخلافها بطريقة مباشرة وغير مباشرة، الجذور) من النبات. جرى الكشف الاولي للصابونيات الستيرويدية باستعمال الطبقة الرقيقة الكروماتوغرافية (TLC). كما قدرت الصابونيات الستيرويدية (التايكوجينين والجيتوجينين) باستعمال الكروماتوغرافي عالي الاداء (HPLC). اظهرت مستخلصات الكحول البيوتانولي وجود التايكوجينين والجيتوجينين في كل جزء من النبات ومزارعه النسيجية بمدى يتراوح من 128.29الى409.75 ومن51.04 الى236.62 مايكروغرام/غرام على التوالي. سجلت اعلى قيمة للسابوجينينات sapogenins في اوراق النبيتات المعاد اخلافها بطريقة غير مباشرة. ان كمية هذه المركبات كانت جديرة بالاعتبار في انسجة الكالس المعامل مع TDZ اعتمادا على فترة نشوء الكالس القصيرة (ثلاثة اسابيع). نفذت دراسة تشريحية لملاحظة تراكم الصابونينات في اجزاء النبات الكامل ومزارعه النسيجية باستعمال المجهر الفلوريسيني وتبين بان اعلى تراكم قد ظهر في انسجة اوراق النبيتات التي تم اخلافها بطريقة غير مباشرة وفي انسجة الكالس المستحث نشوءه بمنظم النمو .TDZ سجل تغير في محتوى الصابونيات خلال فترات نمو الكالس المختلفة. | Yucca gloriosa Variegata L. is an important ornamental and medicinal plant, grows in arid and semi - arid regions around the world. Traditional vegetative propagation of the plant by cuttings and offsets is not adequate due to the limited numbers that can be produced. Plant tissue culture technique provides an alternative method for commercial propagation of this plant. The interest in Y. gloriosa increased because all parts of this plant are rich in steroidal compounds that have vast therapeutic values. This study was performed to propagate this plant in vitro and investigate the yield of steroidal saponins in the plant tissue cultures. Comparison of the saponins yield in intact plant and tissues or organs derived from it using chromatographic analysis and fluorescence microscopy was carried out. To search the potential of in vitro rapid regeneration of this plant, different concentrations of 6 - Benzyladenine (BA), 1 - naphthaleneacetic acid (NAA) and combinations of both were assessed for callus induction on leaf and bud explants using Murashige and Skoog (MS) medium. Callus response initiation percentage, fresh weight, texture and color of the callus were evaluated after 1.5 and 6.0 months in culture. The appropriate medium for callus initiation on leaf explants was MS medium supplemented with 6.0 mg/l NAA. A combination of 0.2 mg/l BA and 1.5 mg/l NAA also exhibited a remarkable callus induction on bud explants. Addition of thidiazuron (TDZ), BA and NAA at various concentrations (0.0, 0.1, 0.5 or 1.0 mg/l) were examined for callus initiation. Faster growth and more proliferation of callus on bud explants were observed on MS medium supplemented with 0.1 mg/l BA + 1.5 mg/l NAA + 1 mg/l TDZ. Results showed that TDZ was more efficient for inducing callus than BA or NAA however some combinations gave direct shoot regeneration. Calli derived from bud explants were whitish to creamy and compact, while calli derived from leaf explants were greenish. The influence of different combinations of BA (3, 6, 7, 8 or 9 mg/l) and NAA (0.05, 0.1 or 0.2 mg/l) on shoot proliferation on MS medium were tested. Within 12 weeks, the highest shoot formation was in the presence of BA (9 mg/l) and NAA (0.1 mg/l). The effect of indole - 3 - butyric acid (IBA) at different concentrations on root proliferation was determined. The best rooting of plant microshoots was found in MS medium provided with 1.0 mg/l IBA. The extraction and identification of steroidal sapogenin tigogenin and gitogenin from both intact plant parts (leaves, rhizomes and shoot apices) and tissue cultures (calli, direct and indirect regenerated shoots, rhizomes) of Y. gloriosa Variegata L. were performed. Preliminary identification of steroidal sapogenin was done using thin layer chromatography (TLC). Qualitative and quantitative assessment of steroidal saponins (tigogenin and gitogenin) was also performed by using high performance liquid chromatography (HPLC). The butanolic extracts showed the existence of tigogenin and gitogenin in all plant parts and their tissue cultures ranging from 128.29 to 409.75 and 51.04 to 236.62 μg/g respectively. Maximum sapogenins value was recorded in indirect regenerated shoots. The amount of these sapogenins in callus treated with TDZ was considerable since callus initiated rapidly within 3 weeks. Anatomical study investigating saponins accumulation in both intact plant parts and their tissue cultures were performed using fluorescence microscopy under ultraviolet (UV) to determine the site of saponin accumulation. Histological analysis using fluorescence microscope showed that saponins primarily accumulated in indirect regenerated leaf tissues and in callus treated with TDZ. Saponins levels changed during different periods of callus growth

قابلية بعض النباتات المائية على الازالة الحيوية لعنصر الرصاص من الماء الملوث : دراسة مقارنة == Phytoremediation Ability of Some Aquatic Plants of Lead from Polluted Water : A comparative study

Author name: انسام صباح عباس
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي
General topic: Biology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة المقارنة لاول مرة في العراق لتوضيح كفاءة النباتات المائية عشبة النيل(Mart.) Solms. Eichhorina crassipes والهايدريلا Hydrilla verticillata (L.F) والشمبلان Ceratophyllum demersum L. على ازالة عنصر الرصاص عند وجودها في حوض ماء واحد مجتمعة ، وقد استخدمت تراكيز مختلفة من عنصر الرصاص (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر وبواقع ثلاث مكررات لكل تركيز.جمعت النباتات بعد مرور (4، 7، 14، 21، 28) يوما من احواض التجربة المختبرية وقيست النسبة المئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه وكذلك كمية العنصر المتراكم في كل نبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي لكل نبات وقدرت كفاءة النباتات في ازالة عنصر الرصاص كنسبة مئوية للازالة في النباتات.واشارت نتائج التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية (P<0.05) بين التراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر والايام (4، 7، 14، 21، 28) في مستوى امتصاص الرصاص من النباتات وكذلك وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية (P<0.05) بين التراكيز والايام في نسبة الازالة ولوحظ ان تراكم عنصر الرصاص في النباتات يزداد بزيادة التركيز وكذلك بمرور مدة التعريض.اظهرت النتائج ان نبات عشبة النيل كان اكثر كفاءة في امتصاص ومراكمة عنصر الرصاص داخل انسجته ، اذ بلغت تراكيز عنصر الرصاص في نبات عشبة النيل وبوجود نباتي الشمبلان والهايدريلا بعد مرور ثمانية وعشرين يوما (5.35، 6.38، 8.01 ، 10.02، 8.02) ملغم/كغم للتراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر .في حين كانت تراكيز عنصر الرصاص في نبات الهايدريلا وبوجود نباتي عشبة النيل والشمبلان بعد مرور ثمانية وعشرين يوما (4.20، 5.22، 6.25، 7.25، 0.97) ملغم/كغم للتراكيز المدروسة ، ولوحظ ان نبات الشمبلان كان اقل كفاءة في مراكمة عنصر الرصاص عند وجوده مع نباتي الهايدريلا وعشبة النيل، اذ كانت تراكيز عنصر الرصاص (0.30، 0.42، 3.35، 5.32، 6.25، 0.28) ملغم/كغم بعد مرور ثمانية وعشرين يوما للتراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر على التوالي.بينت النتائج انه يمكن استخدام نباتي الهايدريلا وعشبة النيل في المعالجة الاحيائية للمياه الملوثة بعنصر الرصاص، اذ اظهر النباتين نسبة ازالة مرتفعة لعنصر الرصاص عند وجودهما معا في حوض ماء واحد، وكانت النسب المئوية للازالة (99.40، 97.86، 90.50، 67.60، 19.62)% عند التراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر بعد مرور ثمانية وعشرين يوما على التوالي وهي نسب مرتفعة مقارنة بما سجل عند استخدام نباتي الشمبلان والهايدريلا وكذلك اعلى من نباتي عشبة النيل والشمبلان، وهذا يدل على ان لنباتي الهايدريلا وعشبة النيل القابلية على ازالة عنصر الرصاص بكفاءة عالية.بينت النتائج ان النسبة المئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه في جميع التجارب تزداد بزيادة التركيز وتنخفض بمرور مدة التعريض ، اذ سجلت اعلى نسبة مئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه عند استخدام ثلاث نباتات مائية عشبة النيل والهايدريلا والشمبلان (90.80)% عند التركيز 50 ملغم/لتر وبعد مرور اربعة ايام في حين بلغت ادناه (0.30)% عند التركيز 10 ملغم/لتر وبعد مرور ثمانية وعشرين يوما من التعريض. بلغت اعلى قيمة لمعامل التركيز الحيوي ((BCF عنصر الرصاص (178.33) ملغم/كغم في نبات عشبة النيل بوجود نباتي الهايدريلا والشمبلان و(140) ملغم/كغم في نبات الهايدريلا وبوجود نباتي الشمبلان وزهرة النيل ، في حين كانت اقل قيمة لمعامل التركيز الحيوي (0.67) ملغم/كغم في نبات الشمبلان وبوجود نباتي الهايدريلا وزهرة النيل ، ولوحظ ان معامل التركيز الحيوي يزداد بمرور مدة التعريض وينخفض بزيادة التركيز مما يدل على ان كفاءة النباتات تتاثر بالتراكيز العالية.

استعمال الهائمات النباتية ادلة احيائية لتقييم تاثير الانشطة البشرية على نوعية مياه نهر بيت زوينة محافظة ديالى == Use of Phytoplankton as Biological Indicator to Evaluate the Anthropogenic Impact on Water Quality of Beat - Zwana River - Diyala

Author name: انتصار كريم عبد الحسن الدراجي
Supervisor name: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
General topic: Biology
Specific topic: plant - aquatic life
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current study was conducted in five selected positions variety of human activities along the agricultural project named (Beat zwana River) located in Jadedat - alshat, within the province of Diyala, for the period from October 2013 until June 2014, the study included measurement of twenty - two physiochemical factors of river water environment, as well as to study the quality and quantity of community phytoplankton, has also been applied in the study a number of environmental indexes.The range of studied properties were : 10.83 - 38.75°C and 9.17 - 28.5°C for air and water temperature, water depth (16.50 - 284.33 cm), light penetration (14.50 - 152cm) , turbidity (0.27 - 106.98) NTU, electrical conductivity, EC,(514.83 - 1027.5) μS/cm , salinity (1.15 - 4.88 part per thousand), total dissolved solids, TDS (287.83 - 861.6) mg/l and total suspended solids TSS (2 - 49.87) mg/l, pH (6.25 - 7.98), dissolved oxygen, DO (3.65 - 11.25)mg/l and Biological Oxygen Demand. BOD5 (1.07 - 4.35) mg /l, total alkalinity, TA (115.33 - 178.5 ) mg /l, total hardness, TH ( 221.83 - 338.83) mg/l, Calcium, Ca (52.08 - 101.36) mg CaCO3/l, and Magnesium ,Mg (74.62 - 177.89) mg CaCO3 /l, Nitrate NO3(1.55 - 6.55) mg /l, effective phosphate PO4 (0.02 - 4.16) mg/l, Sulfate, SO4 (131.5 - 283) mg/l ,effective Silicate (4 - 2.10) mg/l, , Chlorophyll - a, ( 0.12 - 28.02) and Phaeophytin - a, (0.85 - 25.93). mg/l, respectively.Results of the present study showed that most of the studied characteristics and private (Salinity, EC, TH, PO4, BOD5, Turbidity, TDS , Ca and Mg) were of an influential or higher rates when comparing the permissible limits environmentally overall used properties of water for irrigation or aquaculture or for human consumption, according to recommendations of WHO, FAO Organization, as well as the Iraqi specifications for the river water, which shows that human activities in the region significant effect on water and environment of project.The number of phytoplankton algae that have been diagnosed in this study reached 200 species belong to 72 genera, within nine classes of the following basic algae Bacillariophyceae, Chlorophyceae, Cyanophyceae, Euglenophyceae, Raphidophyceae, Dinophyceae, Chrysophyceae, Xanthophyceae, and Cryptophyceae. The diatoms algae formed the largest percentage, as record them 131 species belong to 28 genus, and consisting 65.5%, followed by chlorophyceae 30 species belonging to 22 genus and 15%, then Cyanophyceae,22 species, to 10 genus and 11%, followed by algae Euglenophyceae 8 species belonging to 3 genus and 4%, then Cryptophyceae 3species ,to 3 genus and 1.5%, while all of the Xanthophyceae and Dinophyceae recorded 2species belonging to 2 genus and 1%, and finally the Chrysophyceae and Raphidophyceae, found them 1 species belong to 1 genus and 0.5%. Also the results showed that the distribution and biodiversity of diagnosed phytoplankton at the level of the sites, It was found that there is different for each classes from the ranks of the algae, as recorded presence in the first site 90 species belonging to 43 genus, and at the site - 2, 50 and 35 genus, and in site - 3, 68 species and 38 genus, 66 species belonging to 38 genus in site - 4, while presence 127 species belonging to 45 genus at site - 5.The quantitative study of phytoplankton in the lower and the higher ranges at the five sites ( S1, S2, S3,S4 and S5) of the study area respectively recorded the following values, (1780 - 7246 , 300 - 8180 , 220 - 2950, 560 - 3020 and 540 - 6860 cells /ml, and rates generally each site respectively, as well as 2923.6, 2027.0, 871.1, 1344.4 and 2324.6 cells/ml. when comparing the amount of algae that have been counted, we find that the highest 2923.6 rate cells/ml scored St - 1 and less than the rate of 871.1 cells/ml record in S3.In the current study we were able to record six new genus and species after checking with (Checklist of algal flora in Iraq, 2014) and consisted of these algae to : Westella linearis G. M. Smith, Navicula goppertiama Bourrelly .1981, Oedogonium minus (Wittr.) Witrock 1875. Gonyostomum seme Geitler,Gomphoniuma capitum. Bourrelly .1981, Phcus tourus (lemm.) skvortzow 1928.Also in the current study, many ecological indices were used and represented as follows : Richens index (Marglef index (1968), Similarity index (Sorenson index - 1942), Difference index (Bray and Curtis index, 1957), Presence index depended on (Chandler, 1970) and Shannon Weaver index for diversity, To evaluate the relationship between the sites and the quantity and quality of algae studied and water quality. The highest value for richness 16.246, recorded ta S5 and the highest value of the similarity 0.849 was between S1 and S5, the highest value of the difference 0.491 recorded among of S4 and S5, the highest amount of the presence of his record genus Navicula spp from pennales diatoms, feather at the level of individuals in the sample, as recorded following him to the species N. goppertiana and N. cryptocephala 3200 and 2356 cell/ml in October and November in 2013, while the highest value of diversity 1.878, by Shannon Weaver index recorded in S4. This gives an indication of the variation in the quality of water and nutrients and a physiochemical factors that lead to growth provides supportive conditions andthe spread of some species and a specific one for some of phytoplankton during the months of the year and different locations.On the basis of diversity index values, that was between 1.03 - 1.878 as less and higher, can be considered waters of the five sites between light pollution to medium pollution, and classified all within the second water category according (Wilhm guide - 1975). And this gives a conclusion no matter what the view that the water agricultural project environment (Beat - Zwana River) may be directly affected by human activities practiced by the population as well as other environmental impacts experienced by the entire region from various external and internal factors pollutants.

تاثير مستخلص نبات السذب (Ruta chalepensis) في التحليلات الوراثية الخلوية والمناعية في الفئران البيض == The Effect of Sudab plant (Ruta Chalepensis ) Extract in Cytogenetics and Immunological Analysis in Albino mice

Author name: انتخاب محسن عبد علي الاسدي
Supervisor name: مناهل نجيب بحو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية لتقييم المستخلص الخام الميثانولي الحار لاوراق نبات السذب Ruta chalepensis اذ جرى تقدير النسبة المئوية للمستخلص بالنسبة للوزن الجاف واجراء الكشف الكيميائي العام ,ومن ثم دراسة مدى سمية النبات،وذلك باجراء اختبار الجرعة الوسطية المميتة LD50 ( 50Lethal Dose ) في الفئران البيض ,ولتحديد التراكيز المثلى تم انتخاب (3 و5 و10) % من قيمة LD50 ،وتم استخدام هذه التراكيز في التجارب اللاحقة وهي (58و88و176) ملغم/كغم فضلا عن اجراء فحص السمية الخلوية لكريات الدم الحمراء للخروف ( SRBCs) Sheep Red Blood Cells باستخدام التراكيز الناتجة من اجراء تجربة LD50. لذلك شملت هذه الدراسة ثلاثة محاور : -  اختبارات التحليلات الوراثية الخلوية Cytogenetics Analysis المتمثلة باختباري دليل الانقسام الخيطي Mitotic Index والتشوهات الكروموسوميةChromosomal Aberrationsفي خلايا نقي عظم الفارBone Marrow, وبعد التاكد من انعدام التاثيرات السمية الوراثية للمستخلص اجري التداخل مابين التراكيز (58و 88و 176) ملغم/كغم وعقار مايتومايسين - C بتركيز (0.5) ملغم/كغم, وبشكل ثلاث معاملات وهي المعاملة بالمستخلص (قبل) و(بعد) و(مع) المطفر (MMC) ,لاختبار فعالية المستخلص في منع اوتحوير او تقليل فعل العقار, ومعرفة الالية التي تعمل بها المركبات التي يحويها المستخلص.  دراسة تاثير المستخلص في بعض الجوانب المناعية وبالتراكيز المستخدمة نفسها في التحليلات الوراثية الخلوية في نظام الفار الابيض من خلال المعايير الاتية : - - فحص الحساسية العاجل Arthus Reaction وفحص الحساسية الاجل Delayed type hypersensitivity test (DTH) . - فحص العيوشية Viability test والتفعيل Activation والبلعمة Phagocytosis للخلايا البلعمية الصفاقية. - فحص تثبيت المتمم (C.F.T) Complement Fixation Test.  تقدير مدى العلاقة بين التحريات المختبرية الوراثية الخلوية والمناعية. وقد توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : - 1 - احتواء المستخلص الميثانولي لاوراق نبات السذب على التانينات، والراتنجات، والكومارينات، والفلافونات، والقلويدات، والكلايكوسيدات والزيوت الاساسية وعدم احتواءه على الصابونيات، والتربينات والستيرويدات.2 - عدم وجود تاثير سمي على كريات الدم الحمراء للخروف للتراكيز الناتجة من اجراء تجربة LD50 . اما نتائج الدراسة الوراثية الخلوية فهي : - 1 - عدم وجود تاثير سام اومطفر للمستخلص الكحولي الميثانولي لاوراق نبات السذب بالتراكيز الثلاث عند حقنها في الحيوانات المختبرية.2 - اوضحت نتائج التداخل بين المستخلص الكحولي لنبات السذب والمطفر قدرة التراكيز الثلاث من المستخلص في رفع دليل الانقسام الخيطي وخفض التشوهات الكروموسومية وقد اعتمدت القدرة التثبيطية على نوع المعاملة فقد اظهرت المعاملة بالمستخلص قبل ومع المطفر قدرة اعلى من المعاملة بالمستخلص بعد المطفر. 3 - صنف نبات السذب على انه مضاد للطفرة الوراثية من النوع المباشر بالدرجة الاولى ومضاد حيوي للطفرات بالدرجة الثانية.  اما نتائج الدراسة المناعية فقد توصلت الى مستويات جيدة وغالبا معنوية لاغلب الفحوصات المناعية مقارنة بالسيطرتين السالبة والموجبة, والنتائج كالاتي : - 1 - عدم وجود تاثير سمي على الخلايا البلعمية بدلالة فحص العيوشية وحصول استجابة مناعية لانوعية بدلالة زيادة النسبة المئوية لكل من التفعيل والبلعمة.2 - ظهور استجابة مناعية نوعية خلطية معتمدة على الخلايا اللمفاوية البائية بدلالة زيادة كل من معدلات فحص الحساسية العاجل وفحص تثبيت المتمم.3 - حصول استجابة مناعية نوعية خلوية معتمدة على الخلايا اللمفاوية التائية بدلالة زيادة معدلات فحص الحساسية الاجل بزيادة تركيز المستخلص.  اظهر تقدير معامل الارتباط بان هناك علاقة قوية لمعظم التحريات المختبرية الوراثية الخلوية والمناعية, وهذا يدل على مدى العلاقة بين هذه التحريات من جهة ومدى تاثير المستخلص من جهة اخرى. | This study was designed to evaluated the hot crude methanolic extract for Ruta chalepensis . The percentage of extract was determine in percent to dried weight, and making the chemicals investigation for active compound. In addition to studying plant toxicity by making lethal dose(LD50) test in white mice to detected optimum concentration. Three percentage was selected which (3, 5, 10)% from (LD50) value, and these percentage represented by this concentration which (58,88,176) mg/kg. In addition to the cytotoxicity test was making on Sheep Red Blood ells (SRBCs) to these concentration. So that these study included three sides represented by : - Cytogenetics analysis tests which including mitotic index(MI) and chromosomal aberration(CA) tests in mice bone marrow, after certainly from loosing the genotoxic effects of extract, the interaction between three concentration (58, 88, 176) mg/kg and mitomycin (MMC) drug in concentrate (0.5) mg/kg was making in three forms of treatment of extract (before) (after) (with) mutagen MMC to asses extract activity in prevented or modulated or decreased the drug action , and to know the mechanisms which making it the active compound of the extract. - The study of some Immunological side of extract in same concentrates used in cytogenetics analysis which (58, 88, 176) mg/kg in white mice system represented by : - Measuring the body weight of animal before and after Immunization program, Arthus reaction and delayed type hypersensitivity test , Viability, Activation, Phagocytosis andComplement fixation tests. - Evaluating the relationship scope between cytogenetic, and Immunological laboratories investigations and the results of this study shown : - 1 - The methanolic extract of Ruta plant leaves is contain tannins, resins, comarins, flavonoids, alkaloids, glycosids, and essential oils and discontent of saponins, terpins, and steroids. 2 - No toxicity effects on (SRBCs) for concentrations resulted from LD50 test. 3 - No toxic or mutagenic effect of methanolic extract of Ruta plant leaves in this concentration when administration it in laboratories animal .4 - The MMC have mutagenic and cytotoxic effects in concentration (0.5) mg/kg indicate control positive animals test, these effects included the toxicity and mutagenecity for MMC by decrease the mitotic index and increase the chromosomal aberration for mice bone marrow. 5 - The interaction between methanolic extract and MMC shown the three concentration of plant extract is high efficiency in increase the mitotic index and decrease the chromosomal aberration, and these high efficiency independent on treatment type which shown the extract treatment before and with mutagen is highly efficiency from extract treatment after mutagen.6 - The Ruta chalepensis is classified as antimutagenic in first degree and Bioantimutagens in second degree. The results of Immunological study arrived to highly levels mostly significant in compare of negative (PBS) and positive (MMC) controls for most Immunological tests, The resulted shown 1 - Increasing the body weight means when the treatment by methanolic extract for ruta plant by increasing concentration of extract. 2 - No toxicity effect for phagocytic cells shown by Viability test and non specific immune response in indicate increasing all activation percentage and peritoneal phagocytosis 3 - Shown humeral immune response dependent on B - lymphocyte in indicate increased all of Arthus reaction and Complement fixation test.4 - Shown specific cellular immune response dependent of T - lymphocyte in indicate increased delayed type hypersensitivity Test mean by increasing extract concentration. - The correlation ship shown there are a strongly relationship between cytogenetic and Immunological laboratory investigations, and these indicated the relationship between laboratory investigations from side and the extracts effective scope by these test from other sides.

تاثير المستخلصات الخام لجمار النخيل صنف زهدي Phoenix dactylifera cultivar. Zahdi على الخطوط الخلوية السرطانية == Effect of crude extract of Date palm pith Phoenix dactylifera cultivar. Zahdi on cancer cell lines

Author name: امنة موفق مصطفى النعيمي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يمثل هذا البحث دراسة اولية لتقييم تاثير المستخلصات الخام لجمار نخيل التمر صنف الزهدي Phoenix dactylifera cultivar. Zahdi في نمو اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما خط خلايا سرطان العضلة البشري RD وخط خلايا سرطان الخلايا الدبقية البشرية ANG وخط واحد من الخلايا الطبيعية لجنين الجرذ REF والخط المتحول وراثيا VERO فضلا عن دراسة تاثيرها في انقسام الخلايا اللمفاوية البشرية . تم تحضير ثلاثة مستخلصات خام لجمار النخيل وهي مائي(باستعمال الماء المقطر مزدوج التقطير ) وكحولي (باستعمال كحول الايثانول 70% )والعصير الخام (وذلك بعصر الجمار واستعماله مباشرة ). واستعملت اربعة تراكيز مختلفة محضرة بشكل ثنائي من هذه المستخلصات وهي ( 1250، 2500 ، 5000، 10000) مكغم/مل بالنسبة للمستخلص المائي والكحولي ، و(1% ،5% ،10% ، 30% )بالنسبة للعصير ، وتم اختبارها لكل من خطوط الخلايا السرطانية والخط المتحول وراثيا بمعدل ثلاث مكررات لكل تركيز ولمدة معاملة (24، 48 ، 72 )ساعة باستثناء الخلايا الطبيعية التي كانت مدة معاملتها 72 ساعة فقط . وقد اظهرت النتائج وجود تاثير سمي معنوي واضح للمستخلصات الخام في نمو الخلايا السرطانية لثلاث مدد من التعريض ، ووجد ان التاثير التثبيطي للمستخلصات يعتمد على التركيز حيث كانت السمية تزداد بزيادة التركيز وعلى وقت التعريض لبعض التراكيز . لقد اختلفت افضلية المستخلص الاكفا في التاثير السمي على الخطوط الخلوية السرطانية باختلاف نوع المستخلص والتركيز والخط الخلوي السرطاني. اذ كان العصير الخام اكفا المستخلصات الخام تاثيرا في الخط الخلوي السرطاني ANG حيث تراوحت نسب التثبيط لهذا المستخلص من 69.7% للتركيز 1% الى 81.5% للتركيز 30% لمدة التعريض 24 ساعة ، اما في 72 ساعة فقد تراوحت النسب بين (73.8% - 83%) للتراكيز (1% - 30%). اما في الخط الخلوي السرطاني RD والخط المتحول وراثيا VERO فقد كان المستخلص المائي هو الاكفا حيث كانت اعلى نسب للتثبيط عند التركيز 10000مكغم/مل وكانت النسب تنخفض بانخفاض التركيز حيث بلغت النسب (90.7 %، 89%، 88.8% ) (جدول4 - 8) للخط RD و(92.9%، 93.7% ، 91.8% )(جدول 4 - 2) للخط الخلوي VERO لمدد التعريض (24، 48 ، 72 ) ساعة على التوالي اي ان مدد التعريض لم يكن لها تاثير معنوي على نسب التثبيط. عند استعمال المستخلصات الخام بديلا عن المادة المشطرة PHA ، لم يؤد الى تحفيز انقسام الخلايا اللمفية اي انه لايعمل كبديل عن ال PHA . ولكن عند استخدامه كبديل عن الكولجسين لوحظ انه يعمل على ايقاف انقسام الخلايا في مرحلة ال Metaphase مما يدل على ان المستخلصات اظهرت دورا مشابها لعمل الكولجسين ولكن بكفاءة اقل . | This work represented a preliminary study of the effect of crude extracts of date palm pith (Phoenix dactylifera cultivar. Zahdi) on the growing of two cancer cell lines(Human Rabdomyosarcoma - RD) , (Glioblastoma - ANG) and one normal cell line (Rat Embryo fibroblast - REF) and the transformed cell line (VERO). In addition, it involves the study of their effects on the division of the human lymphoid cells.Three crude extracts of date palm pith were prepared which is aquous (using double distilled water), alcohol (using ethanol 70%) and the crude juice(squeezing the pith and use it directly).Four different binary concentrations have been prepared from crude extracts that are concentrations(1250,2500,5000,10000) µg/ml for each aquous and alcoholic, (1%, 5%, 10% 30%)for the crude juice. Each cancerous cell line and the transformed cell line was tested with an average of three repeaters for each concentration and for the treatment periods of (24 ,48 ,72) hours except for the natural cells whose treatment period was only 72 hours . The results show existence of clear significant cytotoxic effect for crude extracts on growth of cancer cells within the three periods of time of exposure .It was found that the cytotoxic effect for crude extracts and depended on concentration and time period of exposure. It is noticed that the cytotoxic effect increased according to concentration .The Effectiveness of more extract in terms of cytotoxicity on cancer cell lines has been varied depending on types of extract , cancer cell line and concentration.the crude juice was found to be the most effective especially on the cell line (ANG) The inhibition rate for this extract were (69.7%) for the concentration 1% to 81.5 for concentration 30% for exposures period 24 hour , while in 72 hour The inhibition rate were (73.8% - 83% ) for concentrations (1% - 3%). While on RD cell line and the transformed cell line (VERO) the aquous extract was more effective , the highest inhibition rate was for the concentration 10000 µg/ml the inhibition rates was increased according to concentration .It was (88.8% , 89% , 90.7%)for RD cell line and (91.8%, 93.7% , 91.8%) for VERO cell line for exposure periods (24, 48, 72) hour respectively. When we use the crude extracts as an alternative for the PHA , it is found that it doesn’t have the ability to motivate the cells division of the lymphoid cells , (i.e. it can't be as alternative for the PHA ). When using it as alternative for colchicin. It is noticed that it works on stopping the division in the tropical phase this is improve that these extracts show the same work like colchicin but less than it.

التباين الوراثي لجين E - selectin المصاحب للاصابه بمرض السكري من النوع الثاني في عينه من الذكور العراقيين العرب

Author name: امال يوسف جبار احمد
Supervisor name: اسماء محمد صالح المهيدي
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Diabetes - Type II (Diabetes Mellitus type 2) is a group of metabolic diseases resulting from high blood sugar because of a defect in insulin secretion, insulin action, or both, and tissue resistance to insulin. This study was conducted to evaluate the serum level of factor E - selectin in patients with diabetes and its relationship to the polymorphisms genetic Jene E - selectin A561C at the site and assess the relationship between classical factor E - selectin factors.The study included 100 male appointed to the Iraqis. The first group (80) patients with diabetes type II and second group (20) of healthy as control samples. The study was conducted at Yarmouk Teaching Hospital / Central Laboratories and Hospital of city Alkazemian, and health center in the Saidiya. For the period from November 2015 until February 2016.We have been identified patients with diabetes type II and control in terms of age, gender, family history of the disease and the duration of diseases and weight (kg) and height (cm) and waist central obesity (cm) And we have been calculate the body mass index calculation. The serum for both groups ,we calculate the level of sugar in the blood and hemoglobin A1c and cholesterol and triglycerides and high - density fat and fat and a low - density and fat and very low - lying density index of atherogenic index.Blood sugar and hemoglobin A1c showed significant differences between patients and control while the cholesterol and fat of all kinds showed no significant differences, except for fat, high - density non - significant differences compared to control patients.It was calculate by the concentration of the adhesion molecule E - selectin in the patients' blood serum (66) and compared to control a person (20) individual using the ELISA device and results showed significant differences in patients than controls.When divided the patients into three groups totals for minor according to the level of the hemoglobin A1c in the blood serum. The first group was less than 6.5, and the second group was between (6.5 to 9.3), the third set was more than 9.3. Control group was divided into two subsections, according to the level of hemoglobin A1c , the first group was less than 6.5, and the second group was between (6.5 to 9.3).SummaryAppeared to increase most of the variables in the third set when the level hemoglobin A1c of more than 9.3.When you link current study results have shown that the sugar in the blood record significant correlation with the body mass index (0.20). The hemoglobin A1c and creatine and cholesterol and low - density lipids significant correlation with central obesity respectively coefficient (0.20) (0.22) (0.23) (0.21) and E - selectin factor (0.21).The molecular study included 74 individual patients and (20) of individual control. It included PCR - RFLP technique. Electric deportation results for Jene E - selectin at the site A561C showed the presence of alleles are A, C and the presence of three genotypes are (AA, AC, CC). Allele A is a higher proportion of allele C in patients and control, and that repeating models genetic (AA, AC , CC) with no significant differences in the patient group than controls. Showed allele A difference no significant in control compared to patients using the test Fisher and relying on the Confidence Intervals (CI) and showed a preventive fraction (PF) of the disease, and that the allele C showed a no significant difference in patients than controls using test Fisher depending on the Confidence Intervals (CI) and showed that the allele C was Etiological fraction (EF). Repeat genotype AA difference is no significant in control compared to patients style of preventive fraction (PF) of disease, showed a repeat genotype AC difference is no significant in patients than controls and appeared style of Etiological fraction (EF) of disease, showed a repeat genotype CC no significant difference in patients than controls and Etiological fraction (EF) of disease. and can be used as indicators of readiness of members of Iraqi society of the male to the disease ..From the study of the genotype to Jene E - selectin at the site A561C a number of the details in the totals for the study, found that there were significant differences between patients and control genotype structures the three (AA, AC, CC) with sugar and E - selectin and hemoglobin A1c , and that there is differences were not significant with the body mass index.

دراسة شكليائية ونسجية للجهاز التكاثري الانثوي لسمكة الشبوط Barbus grypus Heckel,1843 في بغداد == Morphological and histological study of the female reproductive system in the fish Barbus grypus Heckel,1843 in Baghdad

Author name: افين رمضان محسن العاني
Supervisor name: عبد الحكيم احمد الراوي | نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية دراسة مظهرية ونسجية للجهاز التكاثري الانثوي لسمكة الشبوط Barbus grypus, Heckel 1843 وتحديد موسم السرء لها في نهر دجلة . جمعت لهذا الغرض خمس عشرة سمكة شبوط انثى بالغة بمختلف الاطوال والاوزان , قيس الطول الكلي والوزن الكلي لكل سمكة , وقيس وزن وابعاد المبايض , ثم ثبتت المبايض والاجزاء الاخرى للجهاز التكاثري الانثوي بوساطة ثلاثة انواع من المثبتات , وقد بينت الدراسة الحالية الاتي : - 1 - موسم السرء لاناث اسماك الشبوط في نهر دجلة يكون خلال شهري مايس وحزيران .2 - امكانية التمييز بين اغلب اناث وذكور الشبوط البالغة مظهريا خلال موسم السرء دون اللجوء الى التشريح الداخلي , اذ اكتسبت اغلبية الذكور البالغة لوناﱟ بنياﱟ اغمق من الاناث عند المنطقة الظهرية ( الاختلافات اللونية) . وان اناث الشبوط تنضج جنسيا في السنة الرابعة من العمر .3 - صنفت مراحل نضج المبايض على ست مراحل وهي : - (ما قبل النضج الجنسي - الراحة - تقدم النضج - ما قبل السرء - السرء - مابعد السرء ) .4 - امتلاك اناث اسماك الشبوط زوجا من المبايض من النوع الكيسي , واستمرار التجويف المبيضي الى الخلف مع تجويف قناة البيض التابعة لكل مبيض واللتان تتحدان على شكل قناة بيض مشتركة تفتح الى الخارج عن طريق الفتحة التناسلية التي تقع خلف الفتحة المخرجية وامام الفتحة البولية . تكون قناة البيض جانبية الموقع للمبيض ومبطنة بنسيج ظهاري حرشفي بسيط , وتجويف قناة البيض المشتركة هو امتداد لتجويف قناة البيض . 5 - يحاط المبيض بالجدار المبيضي المؤلف من الظهارة السطحية التي تكون صباغية من ناحية المبيض الظهرية وتدعى بالظهارة السطحية الصباغية , والغلالة البيضاء يليه سدى المبيض الحاوي على الخلايا الجنسية الانثوية بمختلف مراحلها , ويبطن التجويف المبيضي بظهارة انتاشية التي هي منشا سليفات البيوض بالمبيض البالغ .6 - يصنف المبيضان على اساس نمط نمو وتكون الخلايا البيضية فيه الى مبيض ذا المجاميع المزامنة .7 - قسمت مراحل تكوين الخلايا البيضية الى تسع مراحل وهي : - (مرحلة سليفات البيوض - مرحلة النويات المحيطية المبكرة - مرحلة النويات المحيطية المتقدمة - مرحلة الاسناخ القشرية - مرحلة المح الابتدائي - مرحلة المح الثانوي - مرحلة المح الثالثي - مرحلة النواة المهاجرة - مرحلة الاماهة ) .8 - وجود نوعين من المشتقات الجريبية : - ا - الجريبات الرتقية التي تظهر على مدار السنة بنسبة قليلة وفي مرحلة مابعد السرء بنسبة كبيرة. ب - جريبات ما بعد الاباضة التي تظهر في مرحلة السرء نتيجة لحدوث عملية الاباضة .9 - اظهرت نتائج الفحص بالمجهر الالكتروني النافذ ماياتي : - ا - ان المنطقة الشعاعية (الغلاف المحي) ذات تركيب متعدد الصفائح ( صفائح كثيرة الكثافة الكترونيا متبادلة مع صفائح اقل كثافة الكترونيا ) , تتخللها قنيات (قنوات) الثقوب التي تخترقهزاغيبات الخلية البيضية وزغيبات الخلايا الحبيبية اذ تكون الاخيرة اسمك من السابقة , ولهذه الزغيبات اهمية كبيرة في زيادة سطح التبادل الايضي مابين خلية البيضة والخلايا الحبيبية . ب - الاسناخ القشرية تظهر بعضها بوصفها حويصلات غشائية متجانسة ذات تحبب دقيق والبعض الاخر يحوي حويصلة غشائية كثيفة الكترونيا داخل حويصلة غشائية متجانسة ذات تحبب دقيق . ج - المح يظهر بشكل صفيحات محية ذات احجام مختلفة , الكبيرة منها تحوي على جسم رئيس ذي محتوى بلوري من المح . د - الحويصلات المطلية تندمج لتكون اجسام متعددة الحويصلات التي تزداد بالحجم لتصبح اجساماﱟ محية والتي تزداد بالحجم لتصبح صفيحات محية . | The present study includes study of morphological and histological structure of the female reproductive system in the adult Shabout Barbus grypus ,Heckel 1843 and specification of the spawning season for this species in Tigris River .Fifteen of the adult female Shabout of different lengths and weights were collected as sample . Their total length and weights are measured . also the weight and dimensions of each ovary were recorded , samples from each ovary and some parts of the female reproductive system are fixed with three different fixatives .The present study shows the following : - 1 - The spawning season for the female Shabout is in May and June in Tigris river .2 - The ability of distinguishing between most of the Shabout males and females externally at the spawning season , the majority of the adult male has darker brown color at the dorsal side than the females (dichromatism ) , At the age of four , female Shabout attain sexual maturity .3 - The ovarian maturity stages are classified into six : - ( Immature , Resting , Maturing , Pre spawning , Spawning , Post spawning ) .4 - The adult female Shabout has a pair of ovaries of Cystovarian condition . the ovarian cavity continuous posteriorly with the oviduct cavity, and the tow oviducts merges in to one common oviduct which opens externally through the genital pore ( in front of urinary pore and behind anus ) . The oviduct laterally lies with the ovary which is lined with the simple squamous epithelial tissue . The tow oviducts merges to form the Common oviduct which its cavity is a continuous to the oviduct cavity .5 - The ovary is surrounded by the ovarian wall that consist of Surface epithelium which is Pigmented on the dorsal side of the ovary knowen as Pigmented Surface Epithelium and Tunica Albugenia and by the Ovarian Stroma were different stages of female germ cells can found .6 - The tow ovaries are classified as group - Synchronous based on oocyte development .7 - The oocyte developmental stages divided in to nine stages : - ( Oogonia stage , Early Perinucleolar Stage , Advanced Perinucleolar Stage , Cortical Alveoli Stage , Primary Yolk Stage , Secondary Yolk Stage , Tertiary Yolk Stage , Migratory Nucleus Stage , Hydration Stage ) .8 - Tow types of follicular derivatives were found : - a - Atretic follicles that appear in small percentage through the whole year, and in a large percentage on post - spawning stage . b - Post ovulatory follicles which appears in spawning stage because of ovulation . 9 - The Transmission Electron Microscope results shows the following : - a - Zona Radiata ( Vitelline Envelope ) has a multi - lamellar structure ( electron dense lamellae alternating with lower electron density lamellae ) with Pore canaliculi( Canals) that intervening it oocyte microvilli and Granulosa microvilli which are thicker than the previous , these microvilli important to increase the metabolic exchange surface between oocyte and granuolsa cells . b - Some of the Cortical Alveoli appear as homogenous vesicles with fine granulation , the other appear to contain electron dense vesicular inside homogenous vesicles with fine granulation . c - The Yolk appear as Yolk platelets with different sizes , the bigger ones contain Main Body of crystalline yolk . d - The Coated vesicles merges in the form of multi - vesicular bodies which increase in size to become yolk bodies which also increase in size to become Yolk Platelets .

دراسة بيئية وامراضية على جرثومة كليبسيلا في عينات سريرية ونهر دجلة في بغداد == Environmental and Pathogenic Study on Klebsiella Spp. in Samples Collected from Patients and Tigris River at Baghdad

Author name: افراح فهد عبد الكريم
Supervisor name: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | كفاح احمد جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تفرعت الدراسه الحاليه خطين رئيسيين.تضمن الخط الاول تقييم نهر دجله ضمن محافظة بغداد من خلال دراسة العوامل الفيزيائيه والكيميائيه والبايولوجيه والتي لها تاثير على نوعية مياه نهر دجله بينما تضمن الخط الثاني دراسه جزيئيه لبعض عوامل الضراوه، المقاومه للمضادات الحيويه وانتاج الغشاء الحيوي لبكتريا K. pneumoniae والمعزوله من مصادر سريريه وبيئيه. محطات الدراسه تضمنت ثلاثة مواقع على نهر دجله ضمن مدينة بغداد، الموقع الاول يقع شمال مدينة بغداد والتي تقع شمال منطقة الكريعات بالقرب من جسر المثنى، والموقع الثاني يقع قرب مدينة بغداد الطبيه قرب جسر باب المعظم بينما يقع الموقع الثالث الى الجنوب بالقرب من جسر الجادريه. جمعت عينات شهريه من المواقع المذكوره انفا والواقعه على نهر دجله ابتداءا من تشرين الثاني/2013 ولغاية تشرين الاول/2014 . فضلا عن ذلك جمعت عينات سريريه من عدة مستشفيات في بغداد وباستخدام حاويات معقمه. اظهرت النتائج ان قيم درجات الحراره لمياه نهر دجله تراوحت بين (9 - 31 م◦) وهذا من صفات جو العراق والذي يتميز بتقلبات موسميه بدرجات الحراره من جهه وبتغيرات يوميه من جهه اخرى، كانت دالة الحامضيه لمياه النهر تميل للقاعديه الخفيفه وتراوحت بين (6.1 - 8.7) مع ظهور حامضيه خفيفه في الموقع الثاني وقد يعود السبب في ذلك الى مخلفات مدينة الطب والتي تدل على وجود تلوث. تراوح تركيز الاوكسجين المذاب بين (6.6 - 9.9 ملغم/لتر) وهذا يظهر ان مياه نهر دجله جيدة التهويه وكذالك اظهرت النتائج ان المتطلب الحيوي للاوكسجين كان ضمن الحدود المسموح بها دوليا ومحليا حيث تراوحت قيمته بين (0.8 - 3.5 ملغم/لتر). العكوره تظهر مدى شفافية المياه وقد تراوحت قيم العكوره لمياه النهر مابين (16 - 102 نفلوميتر) وسجلت الدراسه ارتفاع ملحوظ في قيم التوصيليه الكهربائيه (651 - 1170 ملغم/لتر). كذلك وجد ان قيم المواد الصلبه الذائبه تراوحت بين (406 - 751 ملغم/لتر) وكان لتاثير الفصول عليها اكثر من تاثير المواقع. بينما سجلت الملوحه تركيز (0.72 - 0.39ملغم/لتر). سجلت النتائج لتركيز المعادن الثقيله ما بين (0.001 - 0.6 ملغم/لتر)،(0.00 - 0.25 ملغم/لتر) لكل من الحديد والزنك على التوالي، معدل التراكيز لهذه المعادن اظهر تغايرا شهريا خلال مدة الدراسه حيث كانت معدلات الحديد متجاوزه الحدود المسموح بها دوليا بينما معدلات الزنك ضمن الحدود المسموح بها. تراوحت قيم الفوسفات لنهر دجله مابين (0.11 - 0.37). من جهه اخرى كانت نتائج الدراسه البكتريولوجيه قد سجلت معدلات مرتفعه لكل من العدد الكلي الحي للبكتريا واعداد بكتريا القولون الكليه واعداد بكتريا القولون البرازيه والتي تجاوزت الحدود المسموح بها دوليا ومحليا والتي كانت دليل على وجود تلوث احيائي وقد سجلت القيم ما بين (195 - 8200CFU/ml ) ، (3625 - 160000 cell/100ml ) ، (24000 - 142500 cell/100ml ) على التوالي. جمعت 75 عزله بكتيريه تابعه للجنس Klebsiella spp. وتوزعت مابين 40 عزله بيئيه و35 عزله مرضيه، شخصت العزلات بانها : K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7), K. ornitholytica (5) اعتمادا على الخواص الزرعيه، المجهريه والكيموحيويه وقد تم تاكيد التشخيص باستخدام نظام API - 20E وVITEC2 systemقد تم عد البكتريا باستخدام طريقة الترشيح الغشائي وباستخدام وسط انتقائي.تم تحديد حساسية العزلات تجاه (23) مضاد حيوي واظهرت النتائج بصوره عامه مقاومه العزلات لاغلب المضادات المستخدمه كما اظهر التحليل الجزيئي ان عزلات K. pneumoniae كانت حامله لجين CTX - M gene والذي له علاقه بمقاومة مضادات البيتالاكتام حيث اظهر تفاعل تضخيم السلسله PCR حزمه واضحه وبحجم (551 bp) فضلا عن ذلك تم دراسة جين aac(3) - II والذي يتعلق بمقاومة مضادات الامينوكلايكوسايد وباستخدام PCR حيث ظهرت حزمه واضحه بحجم (877 bp) . درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي باستخدام ثلاثه طرق مختلفه وقد اظهرت النتائج ايجابيه الفحص وكذلك تم تضخيم جين mrkD والذي يعتبر تحت الوحدة المسؤله عن الاتصاق للنوع الثالث من الاهداب واظهر PCR حزمه بحجم (966 bp). عوامل ضراوه اخرى درست جزيئيا لهذه البكتريا وذلك باستخدام تفاعل تضخيم السلسله تضمنت rmpA , magA وkfu وهي جينات مسؤله عن تكوين الكبسوله وحوامل الحديد وكذلك تم تضخيم جين 16SrRNA وذلك باستخدام conventional and real time PCR وذلك من اجل تشخيصها جزيئيا واظهرت النتائج حزم واضحه بحجم (535 bp) لجين rmpA، (797bp) لجين kfu و(160 bp)عند استخدام برايمر متخصص لجين 16SrRNA بينما لم تظهر اي حزمه عند تضخيم جين magA. | The present work was branched into two line first line aim to study Tigris River within Baghdad City to assess Physical, chemical and biological characteristics of water river that influence water quality of the Tigris River. The second line conducted to study molecular characterization of virulence factor, antibiotic resistance genes and biofilm formation of K. pneumoniae isolated from clinical and environmental sources. The study area included three stations on Tigris River Within Baghdad city, the first was located at North of Baghdad in the northern area of Ghera'att City, and the second at middle part in the area Baghdad medical city, whereas the third station located at South part in the area near Al - Jadiriah Bridge. Monthly samples were collected from three station located on Tigris river, from November 2013 to October 2014. In addition Samples were collected from different Hospital’s Environment and patients by using sterile containers.Results obtained showed that temperature value of Tigris water has ranged between (9 - 31 Cº) the climate of Iraq recognized with seasonal fluctuation from one side and day and night fluctuation from other side. The degree of pH in Tigris River tend to be light alkalinity as it ranged between (6.1 - 8.7) with slightly acidic at station2 and this may be due to the effect of medical city discharge that indicate presences of pollution. The concentration of dissolved oxygen was ranged between (6.6 - 9.9) mg/l and it seems that the water of Tigris is ventilated well. The results showed that values of BOD5 ranged between (0.8 - 3.5 mg/l.) which is within the International allowable levels. The Turbidity reflects the transparency in water, the Turbidity's values ranged between (16 - 102) NTU. The results showed that there is a noticeable raise in value the electrical conductivity that recorded between (651 - 1170) mg/l. It is found that the total dissolved solids values were affected by its seasons more than by its locations, It was recorded higher and lower values of (TDS) (406 - 751) mg/l. whereas the salinity recorded (0.72 - 0.39 ppm) .The results showed that concentrations of heavy metals iron and zinc were varied between 0.001 - 0.6 mg/l and 0.00 - 0.25 mg/l respectively. Mean concentrations of these metals in Tigris River showed monthly variations during the study period and the Fe values exceeded the International allowable levels while Zn within permissible limit for Iraqi and WHO standards for river system maintains. Phosphate values ranged between (0.37 - 0.11). On the other side, The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (195 - 8200 C.F.U/ml), While the total coliform and faecal coliform counts exceeding acceptable limits are indicative of pollution that recorded (3625 - 160000 cell/100ml ) and (2400 - 142500 cell/100ml) respectively.A total of 75 klebsiella spp. isolates had been collected and distributed between 40 environmental isolates and 35 clinical isolates. Isolates were identified as K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7) and K. ornitholytica (5) depending on cultural, microscopical, biochemical characteristics, API 20E and VITEK 2 system. Enumeration of klebsiella sp from water samples had been made by using membrane filtration technique with selective media. The results of Antibiotic susceptibility of K. pneumoniae isolates against (23) antibiotic declared that, generally, the isolates were resistant to the most antibiotics used and molecular analysis showed that all isolates were carrying CTX - M gene concern β - lactam group with PCR product band of molecular size 551 bp and aac(3) - II gene which concern with aminoglycosids group resulting in PCR product with band of molecular size 877 bp.Biofilm formation assay was determined through three different methods and the results showed the ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm, also mrkD gene which is adhesive subunit of type3 fimbriae that play important role and mediated biofilm formation had been amplified and results PCR product with band of molecular size 966 bp. Another virulence factor of K. pneumoniae isolates was studied molecularly by using (PCR), magA, rmpA, kfu and for further diagnosed molecularly 16S rRNA genes were amplified using conventional and real time PCR, the results showed that the isolates of K. pneumoniae gave a clear band with a molecular size 535bp for rmpA, 797bp for kfu and160 bp when PCR was performed with the primer that target the 16S rRNA.while no bind had been obtained for magA

دراسة كيمونسجية مناعية وعلاجية في الفئران الممنعة والمصابة بالاكياس العدرية == Immunohistochemical and Therapeutic Study in Immunized and Infected Mice With Hydatid Cyst

Author name: افراح عبد الامير صادق العامري
Supervisor name: وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت الدراسة الحالية جوانب اساسية للاصابة بالاكياس العدرية الثانوية لـ 120 فارا من ذكور الفئران البيض Mus musculusسلالة Balb/c، شمل الجانب الاول تحديد دور التمنيع في الجوانب الدموية كالعد التفريقي لخلايا الدم البيض والجوانب المناعية كفرط الحساسية الاجلة ومعامل البلعمة. اوضحت نتائج العد التفريقي ارتفاعا ملحوظا في اعداد الخلايا اللمفاوية بنسبة 64.75% مع حدوث تباين في اعداد الخلايا احادية النواة والحمضة وانخفاضا في اعداد الخلايا العدلة ليصل 32% في مجموعة الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة. وفيما يتعلق بالاستجابة المناعية الخلوية المتخصصة المتمثلة بقياس فرط الحساسية الاجلة في وسادة القدم اليسرى، اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول ارتفاع في معدل سمك وسادة القدم في الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة ، مع ارتفاع في معامل البلعمة بنسبة 74% مقارنة بفئران السيطرة السالبة، فضلا عن التغيرات العيانية لتلك المجموعة ومن ثم انعكس ايجابيا على المظهر الخارجي وحركة الفئران ووزنها وقابليتها على التغذية وعليه اصيبت تلك الفئران تجريبيا بداء الاكياس العدرية الثانوية من خلال الحقن داخل الخلب (البريتون) بـ 2000 رؤيس اولي من اكباد ورئات اغنام مصابة طبيعيا بالاكياس العدرية. اما الجانب الثاني من الدراسة تمثل بمعالجة الفئران المصابة بثلاثة عقاقير من مشتقات البنزيميدازول والايزوكوينولين هي الالبندازول ((ABZ والاوكسفيندازول (OFZ) والبرازكوينتل (PZQ) ومتابعة بعض الجوانب الدموية والمناعية في الفئران بعد الاصابة والتمنيع والمعالجة، وشملت العد التفريقي لخلايا الدم البيض، اختبار فرط الحساسية الاجلة، معدل معامل البلعمة، اختبار النوى الصغيرة واختبار الانتشار المناعي في الهلام. سجلت مجموعة الفئران المعاملة بعقارOFZ وOFZ+PZQ ارتفاع النسب المئوية للعدلات وانخفاض الخلايا اللمفاوية مقارنة مع فئران مجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة في سمك وسادة القدم اليسرى بعد 24 ساعة مقارنة بالمجاميع الاخرى ومقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة معنوية في معدل معامل البلعمة في مجموعة الفئران المعاملة OFZ (53.17%) ومجموعة الفئران المعاملة OFZ+PZQ (71.5%) وانخفاضا معنويا في معدل النوى الصغيرة (28% و29.1%، على التوالي) مقارنة مع الفئران المعاملة بـOFZ+ABZ وABZ+PZQ، مما يدل على كفاءة المعالجة بعقار OFZ بشكل مفرد او متحد. اما الجانب الثالث فتمثل بدراسة تاثير الاصابة بالاكياس العدرية والعلاجات الكيميائية المختلفة في وظائف الكبد اذ اظهرت الدراسة ان انزيمات الكبد وهي AST وALT وALP فضلا عن مستوى البيليروبين الكلي والمباشر في مصل الفئران المعاملة بـ OFZ وبـ OFZ+PZQ كانت نتائجها اقرب الى السيطرة السالبة مقارنة مع المجموعتين OFZ+ABZ وABZ+PZQ.اما الجانب الرابع فشمل دراسة الجوانب الحياتية المتعلقة بوزن الفئران الممنعة والمعاملة بعقار OFZ بشكل مفرد او مختلط مع البرازكوينتل OFZ+PZQحيث ظهر ارتفاعا طفيفا بمعدل وزنها بنسبة 11.13% و12.10% على التوالي مقارنة بفئران السيطرة السالبة مقارنة بالفئران المعاملة بـ OFZ+ABZ وABZ+PZQ التي سجلت زيادة معنوية ((p≤0.001 قدرها 13.50% و14.87% على التوالي. وسجلت مجموعة الفئران المعاملة انخفاضا في معدل وزن الكبد ومعدل تضخهما اذ اختلفت معنويا عن مجموعة السيطرة الموجبة عند مستوى احتمالية p≤0.001. لذا فحصت الاكياس العدرية الثانوية بعد اربعة اشهر من الاصابة وتم قياس وزن وقطروعدد الاكياس العدرية وحساب الكفاءة النسبية للعلاج, اظهرت الدراسة ان عقارOFZ+PZQ اعلى كفاءة علاجية (96.70%) لكونه تسبب باختفاء الاكياس من الطحال وتلته المعاملة بعقار OFZ) 93.75%)، وسجلت المجاميع المعاملة بعقارOFZ+ABZ وABZ+PZQ كفاءة علاجية نسبية بلغت 82.5% و77.5%, على التوالي. شملت الدراسة التغيرات النسجية المرضية في طحال وكبد الفئران بعد اربعة اشهر من الاصابة والمعاملة. بينت النتائج حصول تغيرات نسجية معتدلة مقارنة مع فئران السيطرة الموجبة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية عن طريق الكيمونسجية المناعية ( IHC) اظهرت النتائج زيادة مستوى الحركيات الخلوية المفرزة من قبل الخلايا التائية المساعدة - النوع الاول (Th1) متمثلة بانترلوكين - 2، انترفيرون - كاما وعامل تنخر الورم اظهرت النتائج ارتفاعا معنويا ((P≤0.001 في مستوى تعبير بروتينIL - 2 في مجموعة الفئران المعاملة بـ OFZ+PZQ التي بلغت في الطحال 65.1% والكبد 54.1% مقارنة بالمجاميع الاخرى ومجموعة السيطرة السالبة والموجبة، وزيادة تعبير بروتين IFN - γفي المجاميع المعاملة مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة. وبينت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية عالية ذات دلالة احصائيةp≤0.001 في مستوى تعبير بروتينات TNF - α مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. اما بالنسبة الى الحركيات المفرزة من قبل خلايا Th2 فقد سجلت نقصانا في انترلوكين - 10 وعامل تحويل النمو بيتا لدى الفئران المعاملة بالمجاميع العلاجية الاربعة لاسيما المجموعة المعالجة بـ OFZ+PZQ فقد اظهرIL - 10 تعبير بروتينيا واطئا في الطحال بلغ 29.7% وفي الكبد 8.2% مقارنة بالمجاميع المعاملة الاخرى ومجموعة السيطرة، كما اظهرت الفئران الممنعة والمعاملة مستوى تعبير بروتينات TGF - β فروقا معنوية عند مستوى احتماليةp≤0.001 للمجاميع مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. بشكل عام لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الحركيات الخلوية المنتجة من قبل Th1 وTh2وبشكل متوازن لدى الفئران الممنعة والمعاملة. | The current research in deals with fundamental aspects of the infection of 120 white mice Mus musculus strain Balb/c with secondary hydatid cysts, comprising first aspect the role of immunization in the haematological aspects such as the differential count of white blood cells and the immunological aspects such as the delayed type hypersensitivity and phagocytosis. The results of differential white blood cell count showed marked increase in the numbers of lymphocyte percentage (64.75%) with a variation in the numbers of monocytes and eosinophils and a decrease in neutrophil numbers which reached 32% in mice immunized and orally administered with antioxidants. In connection with delayed type hypersensitivity in the foot pad the results showed a rise in the rate of foot pad thickness in mice immunized and orally administered with antioxidants as the highest thickness reached 0.82 mm at 24 hours after the injection of antigen and phagocytosis index in mice immunized and orally administered with antioxidants showed an increase of 74% compared with negative and positive control mice in addition to the gross changes of this group which was positively reflected on their appearance, movement, weight and feeding. So this group was experimentally infected with secondary hydatid cyst through their intra peritoneal injection with 2000 protoscolices. The second aspect of the study was to evaluate the therapeutic efficacy of three drugs which belong to Benzimedazole and Isoquinoline viz albendazole (ABZ), oxfendazole (OFZ) and praziquental (PZQ) as well as to follow - up some aspects of the haematological and immunological parameters in mice after their infection, immunization and treatment which included differential white blood cell count, delayed type hypersensitivity test, phagocytosis, micronucleus test and agar gel immune diffusion test.Regarding changes in differential white blood cell count, mice treated with OFZ and OFZ + PZQ showed an increase in neutrophils and decline in lymphocytes compared with positive control group. Also, an increase in foot pad thickness after 24hrs compared with other treated groups and positive control group. An increase in the phagocytosis was noticed in OFZ treated group (53.17%) and OFZ+PZQ treated group (71.5%) and a significant decline in the micronucleus test of 28% and 29.1%, respectively compared with mice treatment with OFZ + ABZ and ABZ+ PZQ which indicates the efficiency of OFZ drug treated alone or in a combination form.The third aspect of the study was to evaluate the effect of infection with hydatid cyst and different chemical treatments on liver functions where the study showed that liver enzymes such as AST, ALT and ALP, as well as the total and direct bilirubin serum level in mice treated with OFZ alone and OFZ + PZQ were closer to those of the negative group compared with the groups treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ.The fourth aspect of the study was to evaluate the biological aspects related to weight of the mice treated with OFZ alone or combination with praziquental OFZ+PZQ where a slight increase in the average weight of 11.13% and 12.10%, respectively was occurred in compared with the negative control due to the low number of cyst and cyst fibrosis which occurred in comparison with those existed in mice treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ which showed a significant increase(p<0.001) which reached 13.50% and 14.87%, respectively.The treated group showed a reduction in liver weight and enlargement rate which was significantly different from that of the positive control group at the level of probability of P< 0.001, as OFZ+PZQ caused the disappearance of the cysts from the spleen(96.70%), followed by group treated with OFZ (93.75%) and then by group treated with OFZ+ABZ and ABZ+ PZQ which showed a treatment efficacy of 82.5% and 77.5%, respectively. The study also included the evaluation of the pathological changes of liver and spleen of mice after four months of the infection and treatment. The result showed satisfactory histopathological changes in comparison with positive control group. When investigating the role of some cellular interleukins in the immune response against Echinococcus granulosus through the immunohistochemical (IHC)test, the results showed an increase in the level of cytokines secreted byTh1 such as IFN - γ andTNF - α as well as IL - 2. The results showed higher level of protein expression IL - 2 in mice group treated with OFZ+PZQ which amounted 65.1% in spleen and 54.1% in liver compared with other treated and negative and positive control groups. Also, an increase in protein expression of IFN - γ was occurred in the treated groups compared with the negative and positive controls except in the group which was treated with OFZ+PZQ where no significant differences were appear in the negative control. The statistical analysis showed the presence of high significant differences (p<0.001) in the level of expression proteins TNF - α compared with negative and positive control groups. Reduction level of cytokines secretion from Th2 (IL - 10 and TGF - β) in mice treated with the four treated group particularly the group which was treated with OFZ+PZQ showed that IL - 10 protein expression in spleen was low and reached 29.7% and 8.2% in liver compared with the other treated and control groups. The level of expression of proteins of TGF - β in the immunized and treated mice showed significant differences at the level of the probability of p<0.001 of the group compared with negative and positive control group. Generally, a high significant level of cytokines produced byTh1andTh2 in immunized and treated mice

دراسة بعض المؤشرات البيوكيميائية والدموية لدى العاملين في بيئة معامل طابوق النهروان - بغداد == Study of Some Biochemical and Haematological Parameters among Workers of Al - Nahrawan bricks factories Environment - Baghdad

Author name: اصال غازي حسين الشمري
Supervisor name: كاظم عبد الامير محسن الزيدي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة على العاملين في معامل طابوق النهروان ( 75 عاملا ومجموعة ضابطة مكونة من20 شخص من الكادر التدريسي والطلاب في كليتنا للمقارنة) لمعرفة بعض التاثيرات الصحية للغازات السامة المنبعثة من استخدام وحرق النفط الاسود وحتى مخلفات الدهون المستخدمة في المكائن والسيارات على العاملين فيها. وقد استخدمت التغيرات لبعض الدلائل الدموية والكيميائية وسيلة لمعرفة مديات التاثير وشملت الدلائل البايوكيميائية في مصل الدم : سكر الكلوكوز(Glucose) واليوريا (Urea) والكرياتنين (Criatenein) والصوديوم (Sodium) والكولسترول (Cholesterol) والكلسيرات الثلاثية (Triglyceride) وعدد كريات الدم البيض (White Blood Cell) وكريات الدم الحمراء (Red Blood Cell) وقيمة الهيموغلوبين (Hemoglobin) والصفائح الدموية (Platelets) وقيمة معدل خلايا الدم المرصوصة (Hematocrit) وحجم خلايا الدم الحمراء (Mean Corpuscular Volume) وقد استخدمت الكواشف Kits)) الخاصة بكل دليل للتحليل ومعرفة نسبته. وقد اظهرت النتائج ارتفاع نسب الكرياتنين واليوريا والصوديوم والكليسيرات الثلاثية من ( 53.03 الى 87.21) mmol/L و(3.37 الى 4.61) mmol/L و( 141.3 الى 143.6) mmol/L و( 1.33 الى 2.33 ) /dl mg على التوالي. اما الكولسترول فقد انخفض بشكل طفيف وغير معنوي لدى العاملين من ( 5.12 الى 4.60 ) mmol/L.بينما اظهرت النتائج ان سكر الكلوكوز قد انخفض بشكل معنوي لدى العاملين من 5.64 الى 3.23 mmol/L.اما بالنسبة للفحوصات الدموية فقد لاحظنا ارتفاع كل من اعداد كريات الدم البيض وقيمة خلايا الدم المرصوصة ومعدل حجم خلايا الدم الحمراء على التوالي من (4.63× ml /103 الى 6.75× ml /103) ومن (48.47% الى 49.21%) ومن (85.84fL الى 94.38fL) مع انخفاض كريات الدم الحمراء وقيمة الهيموغلوبين وعدد الصفائح الدموية من (5.47 µl /106× الى 5.39/106× µl) ومن (15.63 gm /dL الى 13.7 gm /dL) ومن (204.1 106× mmol/ الى 146.5 mmol /106× ) وقد استخدمت قيمة t الجدولية عند احتمالية 0.001> P لمعرفة معنوية الفروقات بين مجموعة العمال والمجموعة الضابطة من غير العاملين فيها, كذلك المعدل الحسابي ( x¯ ) والانحراف المعياري S.D والخطا القياسي S.E . وقد تمت مناقشة النتائج بضوء الابحاث ذات العلاقة ، حيث اظهرت النتائج ان الغازات السامة المنطلقة من معامل طابوق النهروان قد اثرت على جهاز الدوران من خلال التغيرات المعنوية في ارتفاع اعداد كريات الدم البيض (WBC) وحجم خلايا الدم الحمراء(MCV) وانخفاض الهيموغلوبين (Hb) والصفائح الدموية (Plts) وقد سبب ذلك في انخفاض كفاءة الكليتين من خلال ملاحظة ارتفاع الكرياتينين واليوريا والصوديوم والكليسيرات الثلاثية .وهو ما يؤشر سوء الحالة الصحية للعاملين في هذه المعامل ويؤكد الحاجة لتدخل الجهات المختصة الصحية والبيئية لايجاد البدائل المناسبة وتخفيف الاثر البيئيEnvironmental impact. | This research was conducted on the workers in the Nahrawan Bricks Factories (75 workers and control group of 20 persons), The aim was to find out some of the health effects from the exhaust poisoning gases on workers. Those gases were released due to the burning fuel of crude oil and even the lubricate oil wastes of heavy machines and vehicles. Changes in some blood and chemical parameters were used as an indicator of the effect range of those pollutant gases. The chemical parameters in blood serum used were : Creatinine ; Urea; Sodium ; Cholesterol ; Triglycerides and Glucose. special kits were used for the analysis to determine their concentration changes. Results shows that creatinine have increased significantly from (53.03 to 87.21 ) mmol/L. also the Urea ; Sodium and Triglycerides were significantly increased from ( 3.37 to 4.61) ml ; (141.3 to 143.6 ) mmol /L ; ( 1.33 to 2.33 ) gm/dl respectively. The cholesterol concentration shows not significant slight decrease from (5.12 to 4.60) mmol /L.While glucose concentration was decreased significantly from 5.64 to 3.23 mmol / L. The Hematology tests shows increase in (WBC) and (MCV) from (4.63 to 6.75) ×103ml ; (85.84 to 94.38) fl respectively while decrease in (Hb) and (Plts) from; (15.63 to 13.7) gm/dl ; (204.1 to 146.5) mmol respectively. Results shows not significant increase in (Hct) from (48.47 to 49.21)% and not significant decrease in (RBC) from (5.47 to 5.39) ×106µl , Statistical analysis was used with t test under probability < 0.001 for comparison between workers and control group in each parameter. Mean concentrations; S.D. and S.E. were also used. Results were discussed and compared with other related studies. These results show that the released poisoning gases from AL - Nahrawan brick factories have serios effects on the circulation system of the workers.Those effects were clear from : 1 - The significant increase changes in the values of White Blood Cell (WBC) and Mean Corpuscular volume (MCV). 2 - The significant decrease in the Hemoglobin (Hb) and the Platelets (Plts). Those effects were behind the low efficiency of the kidney, This low efficiency from the significant increase of Criatenine , Urea, Sodium and Triglyceride.This is an indication of the bad situation of the Workers 'health.Those facts confirm the need to the interference of the health and Environmental authorities to find out their Alternatives and Mitigation Plan.

تاثير الرش الورقي ببيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في نمو وحاصل صنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) المزروعة في المنطقة الديمية == Effect of foliar application of hydrogen peroxide and vitamin C on growth and yield of two cultivars of(Hordeum vulgare L.) planted in the dry farming land

Author name: اسو لطيف عزيز الاركوازي
Supervisor name: وفاق امجد القيسي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت التجربة الحقلية خلال موسم النمو 2015 - 2014في احد حقول ناحية قوره تو - قضاء خانقين - محافظة ديالى بهدف تحديد التاثير المتداخل لكل من بيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في بعض الصفات المظهرية والفسلجية وكذلك بعض مكونات الحاصل لصنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) هما الابيض المحلي والاسود المحلي ، نفذت التجربة وفق تصميم القطاعات كاملة التعشيةRandomized Complete Block Design RCBD وبثلاثة مكررات وتضمنت التجربة الحقلية 72 وحدة تجريبية عبارة عن التداخل بين ثلاثة تراكيزمن بيروكسيد الهيدروجين هي 10،5،0% واربعة تراكيز من فيتامين C هي 0،50،100،150 ملغم.لتر - 1 . بينت نتائج التجربة ان تاثير بيروكسيد الهيدروجين ادى الى انخفاض معنوي في جميع الصفات المدروسة ولاسيما عند التركيز 10% حيث انخفض طـول الجذرملم بنسبة 20.76% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 43.87% , الوزن الجاف للمجموع الجذري غم بنسبة 034.8% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 33.45% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 9.28% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 26.08% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 35.52% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 20.90% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 28.83% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 53.93% و53.755 و47.07% و48.82% و9.48% و42.26% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 101.70% و45.80% و47.45% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 18.23% و22.86% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من الجزء المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنـسبة 24.0% و29.53% و42.74% على التتابع، نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العلـم وفـي الحـبوب % بنسبة 32.47% و32.87% و33.71% على التتابع ، البرولين مايكروغرام.غم وزن طري - 1 بنسبة 13.41% ، فـيتامـين Cملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 40.37% ، انـزيم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.23% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.75% ، وطول السنبلة مع السفا سم بنسبة 12.92% , طول السنبلة سم بنسبة 19.39% , وزن السنبلة غم بنسبة 22.82% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 21.59% , عـدد السنـيـبلات لكل سنبلة سنـيبلة.سنـبلة - 1 بـنسبة 16.54% , وزن الحبـوب فـي السنابل غم بنسبة 18.03% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 23.41% , وزن1000 حبة غـم بـنسبة19.80% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 23.95% , الحاصل الاقـتـصادي كغم . هـ - 1 بنسبة 18.02% .كذلك اوضحت نتائج التجربة ان تاثير فيتامين C ادى الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المدروسة لاسيما عند التركيز 100 ملغم.لتر - 1 حيث ازداد طـول الجذرملم بنسبة 125.00% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 341.88% , الوزن الجاف للمجمـوع الجذري غم بنسبة 177.77% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 159.43% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 21.96% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 84.88% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 108.57% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 76.81% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 122.59% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 352.38% و395.19% و251.55% و274.56% 343.37% و209.66% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 286.77% و296.95% و107.46% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 46.91% و39.81% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنسبة 63.68% و100.00% و96.71% على التتابع , نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العــلـم وفـي الـحـبـوب % بنسبة 124.07% و107.50% و111.92% على التتابع ، البـروليـن مايكروغرام .غم وزن طري - 1 بنسبة 42.03% ، فـيتامـين C ملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 202.06% ، انـزيـم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 105.83% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 142.70% ، طول السنبلة مع السفا سم بنسبة 41.85% , طول السنبلة سم بنسبة 61.61% , وزن السنبلة غم بنسبة 75.58% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 77.62% , عدد السنيبلات لكل سنبلة سنيبلة.سنبلة - 1 بنسبة 59.09% , وزن الحبوب في السنابل غم بنسبة 79.41% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 82.35% , وزن1000 حبة غـم بنسبة 95.58% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 86.52%, الحاصل الاقتصادي كغم.هـ - 1 بنسبة 79.41% .بينت نتائج التجربة ماياتي : - - 1 ان زيادة تركيز بيروكسـيد الهـيدروجـين H2O2 من صفر الى 10% ادى الى حدوث انخـفاض معـنوي في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 2ادى زيادة تركيز فيتامين C من صفر الى 100 ملغم.لتر - 1 الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 3اظهرت النتائج ان التركيز 100 ملغم.لتر - 1 فيتامين C هو الافضل في اعطائه افضل القيم للصفات المدروسة وبغض النظر عن تركيز بيروكسيد الهيدروجين H2O2 مقارنة بالتراكيز الاخرى المرشوشة. - 4اظهرت النتائج تفوق صنف الشعير الابيض المحلي في جميع الصفات المدروسة عدا صفة طول السنبلة مقارنة مع صنف الشعير الاسود المحلي.5 - اظهرت نتائج التداخل الثنائي والثلاثي بين عوامل الدراسة تفوق صنف الشعير الابيض معنويا في اغلب الصفات مقارنة بالصنف الاسود المحلي وتحت جميع التراكيز لكل من فيتامين C وبيروكسيد الهيدروجين H2O2. نستنتج من هذه الدراسة : - الدورالمهم لفيتامين C في حماية العمليات الايضية المختلفة في النبات لكونه من مضادات الاكسده غير الانزيمية من تاثير العوامل المجهدة والمتمثلة ببيروكسيد الهيدروجين. | Field experimental was conducted during the growing season of 2014 - 2015 in one of the fields Quratu sub district/ Khanaqin/ Diala province , aiming to determine the influence of the interaction between both hydrogen peroxide and vitamin c in some morphological and physiological characteristics, also some yield components of two types of Barley (Hordeum vulgare L.) local white and local black. This experiment was carried out by randomized complete block design (RCBD) with three replications; the field experiment included 72 experimental unit of interaction between three concentrations of Hydrogen peroxide 0,5,10 % and four concentrations of vitamin C 0, 50,100,150 mg.l - 1 The results of the experiment showed that hydrogen peroxide effect pulling down significantly decreased in all studied characteristic especially in 10% concentration decreased root length 20.76%, root volume 43.87%, root dry weight 34.80%, root diameter 33.45%, Plant height 9.28%, shoot dry weight 26.08%, leaf area 35.52%, flag leaf dry weight 20.90%, leaf area of flag leaf 28.83%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 53.93%, 53.75%, 47.07%, 48.82%, 9.48%, 42.26%, 101.70%, 45.80%,47.45%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 18.23%, 22.86%, soluble carbohydrate percentage in shoot 24.0%, flag leaf 29.53% and seeds 42.74%, protein percentage in shoot 32.47%, flag leaf 32.87%, and seeds 33.71%, Proline 13.41%, vitamin c 40.37%, catalase 34.23%, peroxidase 34.75%, Spike length with awn 12.92%, spike length 24.05%, weight of spike 22.82%, weight of spike in experimental unit 21.59%, number of spikelet's 16.54%, weight of seed in spikes 18.03%, weight of seeds 23.41%, weight of 1000 seeds 19.80%, biological yield 23.95%, grain yield 18.02%.The results of the experiment showed significantly increased in all studied characteristics especially with 100 mg.l - 1 concentration of vitamin c increased root length 125.00 %, root volume 341.88%, root dry weight 177.77%, root diameter 159.43% , plant height 21.96%, shoot dry weight 84.88, leaf area 108.57%, flag leaf dry weight 76.81%, leaf area of flag leaf 122.59%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 352.38%,395.19%,251.55%, 274.56%, 343.37%, 209.66%, 286.77%, 296.95%,107.46%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 46.91%, 39.81%, soluble carbohydrate percentage in shoot 63.68%, flag leaf 100.00% and seeds 96.71%, protein percentage in shoot 124.07%, flag leaf 107.50%, and seeds 111.92%, proline 42.03%, vitamin c 202.06%, catalase 105.83%, peroxidase 142.70%, Spike length with awn 41.85%, spike length 61.61%, weight of spike 75.58%, weight of spike in experimental unit 77.62%, number of spikelet's 59.09%, weight of seed in spikes 79.41%, weight of seeds 82.35%, weight of 1000 seeds 95.58%, biological yield 86.52%, grain yield 79.41%.The results of experiment showed : - 1 - The increased of hydrogen peroxide concentration from zero to 10% caused significantly decreased in all morphological, physiological and yield to both varieties.2 - The increased of vitamin c concentration from zero to 100 mg.l - 1 caused significantly increased in all morphological, physiological and yield to both varieties.3 - The results showed the concentrations of vitamin c 100 mg.l - 1 are the best to give the best value to all characteristic regardless of hydrogen peroxide concentration compared with other concentrations.4 - The results showed the local white barley superiority in all characteristics except the length of spike compared with local black barley. 5 - Results showed double and triple interaction between studied factors the local white barley superiority significantly in all characteristic compared with local black barley under all concentration for both vitamin c and hydrogen peroxide.We conclude of this study : - The important role of vitamin c in the metabolic various processes in the plant for being non - enzymatic antioxidants from the impact of stress full hydrogen peroxide

التكوين الجنيني والتنسج للدماغ والحبل الشوكي في طائر السلوى Quail Coturnix coturnix (Linnaeus,1758) == Embryonic Development and Histogenesis of Brain and Spinal Cord in Quail Coturinx coturinx (Linnaeus, 1758)

Author name: اسماء بشير عبد
Supervisor name: نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Embryology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التعرف على تكوين الدماغ والحبل الشوكي من مرحلة العصيبة حتى مرحلة الفقس لطائر السلوى Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758) ودراسة التركيب النسجي لهما في الطائر البالغ. حصل على اجنة تراوحت اعمارها ما بين (12) ساعة حضانة الى مرحلة الفقس (17) يوما وكذلك على البالغ واجريت عليها خطوات التحميل الكامل والمجهر الالكتروني الماسح وتحضير الشرائح النسجية بطريقة شمع البرافين، وتم ايضا تحليل الاحماض الامينية للادمغة للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16و 17) يوما والبالغ من طائر السلوى.اظهرت نتائج الدراسة الجنينية للدماغ والحبل الشوكي ان بداءة ظهورهما في جنين طائر السلوى عمر (18) ساعة حضانة اذ حدث تثخنا لطبقة الاديم الظاهر لتكوين الصفيحة العصبية التي تتالف من نسيج ظهاري عمودي مطبق كاذب , وظهرت الطيتان العصبيتان ملتحمتان في عمر (24) ساعة حضانة لتكوين الانبوب العصبي وبعد تمايزه الى حوصلة الدماغ والحبل الشوكي، يتمايز الدماغ على ثلاث حويصلات (الدماغ الامامي ، الدماغ المتوسط , الدماغ المؤخر) في عمر (33) ساعة حضانة، وتالف جدار الدماغ من طبقة البطانة العصبية تليها الطبقة الغطائية.تمايز الدماغ في جنين عمر (40) ساعة حضانة على خمس حويصلات هي (الدماغ الانتهائي والدماغ البيني ، والدماغ المتوسط والدماغ البعدي والدماع النخاعيني) وظهر التركيب النسجي لجداره مكون من ثلاث طبقات هي (البطانة العصبية والغطائية والحافية). وظهر التركيب النسجي لجدار الحبل الشوكي مؤلفا من طبقة البطانة العصبية تحيطها الطبقة الغطائية.وفي جنين عمر (48) ساعة حضانة اتضح الانحناء القحفي اذ يصبح الدماغ المتوسط في المقدمة وكذلك ظهرت حوصلتا الدماغ الانتهائي، واصبح جدار الحبل الشوكي مؤلفا من ثلاث طبقات (البطانة العصبية والغطائية والحافية) في هذا العمر. ظهرت الانحناءات (العنقية والظهرية والذنبية) التي تؤدي الى تقوس الجنين، في عمر (72) ساعة حضانة.تمايز الدماغ البيني في جنين عمر (96) ساعة حضانة على ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد وقد ظهرت في هذا العمر الطبقة البصرية وهي اول طبقات السقف البصري الذي يمثل سقف الدماغ المتوسط وظهر الحبل الشوكي ايضا مكونا من المادة السنجابية التي تمثل الجزء الداخلي من جداره والمادة البيضاء التي تمثل الجزء الخارجي من جداره مع تمايز المادة السنجابية الى القرون الظهرية والقرون البطنية.يتسع تجويف الدماغ الانتهائي ويزداد سمكه في جنين عمر (5) ايام حضانة مع ظهور نوى التكوين الشبكي في قاع الدماغ البعدي وفي عمر (6) ايام حضانة بدات الطبقة السنجابية الليفية السطحية بالتمايز وهي الطبقة الثانية من طبقات السقف البصري، كما تمايزت الطبقة الغطائية في الجدار الجانبي للدماغ البعدي على منطقتين ثانويتين الاولى هي الطبقة الغطائية الداخلية تكون مجاورة لطبقة البطانة العصبية اما الثانية فهي الطبقة الغطائية الخارجية ، وظهرت ايضا الحزمة الطولية الناصفة في قاع الدماغ النخاعيني. وفي جنين عمر (7) ايام لاتختلف جدران الدماغ عن المراحل السابقة ولكن تصبح اكثر سمكا.اما في جنين عمر (8) ايام حضانة وجد الدماغ والحبل الشوكي مشابها لحالة البالغ، يمثل الدماغ الانتهائي المخ الذي يتالف من نصفي كرة المخ ويسمى تجويفها البطين الجانبي (الايسر 1st، والايمن 2nd)، ويتالف نسجيا من منطقتين لحاء الدماغ وتحت لحاء الدماغ ، ويمثل البطين الثالث 3rd تجويف الدماغ البيني، ويتالف الدماغ البيني من ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد.اما الدماغ المتوسط فقد تمايز سقفه على ست طبقات (البصرية ، السنجابية الليفية السطحية ، السنجابية المركزية ، الالبومية المركزية ، السنجابية حول البطنية، والالبومية حول البطنية) اما جزاه القاعي فيتمايز الى السقيفة, وتمايز الدماغ البعدي على جزاين (المخيخ والجسر)، ويتمايز الدماغ النخاعيني ليكون النخاع المستطيل ويمثل البطين الرابع 4th تجويف الدماغ المؤخر, اما الحبل الشوكي فيكون مشابها لحالة البالغ اذ وجدت المادة البيضاء في جزئه الخارجي بينما المادة السنجابية مرتبة على شكل X تمثل جزئه الداخلي وتدعى المنطقة الظهرية منها القرون الظهرية Dorsal horns اما المنطقة البطنية فتدعى بالقرون البطنية وتمثل القناة المركزية تجويفه.وشملت الدراسة الحالية ايضا تحليل الاحماض الامينية في ادمغة اجنة طائر السلوى للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16) يوما حضانة ومرحلة الفقس (17) يوما والبالغ ، ووجد (16) حمضا امينيا هي الاسبارتك (13)، الكلوتامين (13)، السيرين)البالغ) ، الهستدين (13)، الثيروتين (13)، الكلايسين (16)، الارجنين )البالغ) ، الالنين (13)، التايروسين )البالغ)، السستين (13)، الفالين (13)، الميثونين (11)، الايزوليوسين (13)، اليوسين (13)، الفينلالنين)البالغ) ، اللايسين (13) على التوالي , اما اقل تركيز للاحماض الامينية في الاعمار الاسبارتك (14)، الكلوتامين (12)، السيرين)10) ، الهستدين (10)، الثيروتين (12)، الكلايسين (10)، الارجنين )10) ، الالنين (10)، التايروسين )10)، السستين (14)، الفالين (12)، الميثونين (12)، الايزوليوسين (15)، اليوسين (10)، الفينلالنين)14) ، اللايسين (10) على التوالي | The present study aimed to study the development of brain and spinal cord starting from neurula stage till hatching stage (17th day) and adult in quail Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758), using the whole mount, scanning electron microscopeand paraffin wax method were used for preparing histological slides. Amino acids of brains were determinated during different ages (10, 11, 12, 13, 15, 15, 16 and 17 days) in addition to the adult .The embryonic study revealed the first appearance of the brain and spinal cord in Coturnix coturnix was at (18) hrs incubation. The first appearance represented as ectodermal thickening to form the neural plate, which is histologically formed from pseudostratified columnar epithelium. The neural folds fused at age of (24) hrs of incubation to form the neural tube and then differentiated to form the brain vesicle and spinal cord. The brain was differentiated into three vesicles represented by (prosencephalon, mesencephalon and rhombencephalon) at age of (33) hrs incubation. The wall of the brain consist of ependymal and mantle layers. The brain in embryo of (40) hrs incubation differentiate into five vesicles represented by telencephalon, diencephalon, mesencephalon, metencephalon and myelencephalon. The histological study of brain wall decleared that it formed from three layers which were ependymal, mantle and marginal layer. The histological structure of spinal cord wall at the same age showed that it consist of two layer represented by Ependymal layer which surrounded by mantle layer.In embryo at age of (48) hrs incubation, the cranial flexure appeared and the two vesicles of telencephalon were also became clear and the spinal cord wall consist of three layers represented by ependymal, mantle and marginal layers.The cervical, dorsal and caudal flexures appeared at (72) hrs incubation, which lead to curved the embryo.Diencephalon at age (96) differentiated into three regions age which are represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus, at this age the stratum opticum also appeared, which represented the first layer of optic tectum and represented the roof of mid - brain. The spinal cord appeared formed from the gray and white matter, at the same time the gray matter differentiated into dorsal and ventral horns.At age of (5) days incubation the telencephalon cavity enlarge and its thickness increase and reticular formation nuclei appeared at the base of metencephalon. At age of (6) days incubation, the stratum griseumfibrosum superficial which represent the 2nd layer of optic tectum started to differentiate and the mantle layer also differentiated from the lateral wall of Metencephalon into two secondary layers represented by the inner mantle layer which observed besides the epindymal layer and the outer mantle layer, The medial longitudinalfascicule appeared at the base of mylencephalon. At age of (7) days incubation the walls of brain become more thickned. At age of (8) days incubation both brain and spinal cord appeared as in the adult stage. The telencephalon appeared represent from hemispherical cerebrum and their cavity called lateral ventricles (right the 1st and left the 2nd). Histologically formed from two region represented by pallium and subpallium the 3rd ventricle represented the cavity of diencephalon which formed from three regions represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus. The mesencephalon roof differentiated to optic tectum with six layers of opticum, griseumet fibrosum superficiale, griseum centrale, album centrale, griseum periventriculare and album periventriculare. At the same time, the base of mesencephalon differentiated to tegmentum. Metencephalon differentiated into two parts represented by cerebellum and pons, while the mylencephalon appeared differentiated to from medulla oblongata and 4th ventricle represented the cavity of rhombencephalon.On the other hand the spinal cord also appeared as in the adult in appearance, the white matter in its external part and gray matter arranged as X - shape and represented the internal part, the dorsal region of this part represented the dorsal horns while the ventral horns represented the ventral region and the central canal represented its cavity.The present study also include the amino acids analysis for the brain of the bird under investigation in different stage of development (10, 11, 12, 13, 14, 15and 16, days incubation) in addition to the hatching stage (17th day) and the adult. The results revealed that there are 16 amino acid: Aspartic acid , Glutamine , Serine , Histidine , Thronine , Glycine , Arginine , Alanine , Tyrosine , Cysteine , Valinine , Methionine , Isoleucine , Phenylalanine , Lysine , and the highest concentration of amino acid at age of (13,13, adult, 13, 13, 16, adult, 13, adult, 13, 13, 11, 13, 13, adult, 13) respectively and the low concentration at age of (14, 12, 10, 10,12,10,10,10,10, 14, 12, 12, 15, 10, 14, 10,) respectively.

دراسة شكليائية ونسجية للمرئ في نوعين من الطيور العراقية الدراج الاسود العراقي (Linnaeus,1766 (Francolinus francolinus والسماك ابيض الصدر Linnaeus,1758 (Halcyon smyrnensis == Morphological and Histological Study of the Oesophagus in Two Species of Iraqi Birds Iraqi Black Partridge Francolinus francolinus (Linnaeus,1766) and White Breasted kingfisher Halcyon smyrnensis (Linnaeus,1758)

Author name: اسراء عبد الكریم هادي امین البرزنجي
Supervisor name: ايمان سامي احمد الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study aimed to investigate the , morphological description and histological structure of oesophagus in Iraq black partridge (Francolinus francolinus ) and white breasted kingfisher (Halcyon smyrnensis) ,the results revealed the following : - Morphological Description• In both birds the oesophagus was long muscular tube, thin - walled and distensible tube , it was situated between the oropharynx cavity and Proventriculus .• The oesophagus in Iraq black partridge (Ibp) divided into the three regions represented by anterior part (Cervical), median part (Crop) and posterior part (thoracic),while in white breasted kingfisher (Wbk) divided in two regions , anterior part (Cervical) and posterior part (thoracic), because the crop was absent in this bird so that we suggested to regard the median part instead the crop which is found in Iraqi block partridge.• In both birds , the anterior part ( Cervical ) of oesophagus was located in the midline , dorsally to the larynx and trachea , which was fixed byconnective tissue . In the median part of neck , the oesophagus location was changed where it was situated at the right side of the midline , among trachea laterally and Jugular vein , the vagus nerve and thymus dorsally . In (Wbk) , the oesophagus was curved littleness on the right side of midline in contrast to the (Ibp).• In (Ibp) , immediately in the thoracic entrance , the oesophagus returns to the midline and it expanded ventrally pouch , (the crop) which located between clavicle and breast muscles . The internal and external surface of the crop presented irregular folds.• In (Ibp), the anterior part of oesophagus ( Cervical) taken an (S) shaped due to it was longer than its neck region.• In both , the posterior part of oesophagus (thoracic) entered thoracic region and then located dorsally to the trachea , syrinx and heart, ventrally to the lung. Finally, the posterior part of oesophagus(thoracic) opened in to the Proventriculus .• In both birds , the anterior part of oesophagus ( cervical) was longer than posterior part ( thoracic). The internal surface of the oesophagus demarcated longitudinal folds .Histological Study : • The results of the present study showed that the oesophagus wall in (Ibp) consisted of four tunica represented by mucosa, sub mucosa, Muscularis and adventitia or serosa while in (Wbk) composed of three tunica because due to lack the sub mucosa.• Tunica mucosa in (Ibp) oesophagus consisted of three layers represented by lining epithelium , lamina propria and Muscularis mucosa , but in the (Wbk) the layer of Muscularis mucosa was absent.• The lining epithelium of (Ibp) composed of keratinized stratified squamous epithelium , while it consisted of non keratinized stratified squamous epithelium in the (Wbk).• The lamina propria of (Ibp) consisted of loose connective tissue , while in the (Wbk) it consisted of fibrous connective tissue .• The esophageal glands of (Ibp) were situated in the lamina propria , these glands were simple branched alveolar type, while the esophageal glands of (Wbk) were observed within lining epithelium layer and these glands were simple tubular type.• The oesophageal glands in (Ibp) were less developed in the posterior part (thoracic) in comparison to anterior part ( cervical), while theseglands were absent in crop but it arranged along oesophagus in (Wbk).• Tunica Muscularis consisted of two layers thicker, inner circular and thinner outer longitudinal in (Ibp) ,these layers separated by loose connective tissue, whereas inner thin longitudinal and outer thick circular in (Wbk) ,these layers separated by fibrous connective tissue• In both birds the tunica adventitia and serosa consisted of loose connective tissue with blood vessels and nerves but in serosa surrounded by mesothelium .Statistical Study : Iraqi block partridge and Whitebreasted kingfisher : • Results showed that the mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in anterior part (cervical) oesophagus of (Ibp) as compared to (Wbk), while the mean thickness of both tunica muscularis and adventitia were significantly greater in (Wbk) as compared to (Ibp) (p<0,05).• The main thickness of tunica mucosa was significantly greater in median part ( crop) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk) (p<0.05).• The mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in posterior part ( thoracic) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk)(p <0.05).

دراسة تصنيفية مقارنة لمراتب من العائلة السوسنية Iridaceae النامية بريا في العراق == Comparative Systematic Study For The some Taxa of the Family Iridaceae wild growing in Iraq

Author name: اريج عبد الستار فرمان الراوي
Supervisor name: مازن نواف عبود العاني
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Classification
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current study covered 14 taxa of the family Ireidaceae wiled growth in Iraq ,as it has a comparative systematic study of all morphological characters , pollengrains , anatomy , molecular , environmental and geographical distribution in detail , as well as the taxonomical treatment have been down for all taxa with keys for all taxa was done.Survey for must districts of Iraq was done to determined the distribution of taxa , therefor many collection were obtained , new location of taxa distribution were fixed and all the specimens collected including those from herbaria were identified.The comparative study of all the morphological characters of plant parts were recorded down in tables , as well as photo for deferent purposes. Priority taxonomic important were notice to subterranean stems (bulb , rhizome and corm) such as dimension , shape and outer cover of the bulbs and corms especially in genus Iris and Gladiolus.Stems showed very important in isolation and diagnosis , however varied among them , some have normal stems (Gynandriris , Gladiolus and some Iris species) , others have flowering stems (scape) in genus Crocus and some of Iris species.Leaves showed large variation among taxa in shape , dimensions and having sheath , as well as some taxa having stem leaves (Gladiolus and some species of Iris) , others have basal leaves (Gynandriris , Crocus and some Iris species). The variation in bracts and bracteoles in type , dimension and shape were used to identify taxa especially for species belonging to the genus Iris , Gladiolus and Gynandriris .The inflorecences variation were used for isolation and diagnoses especially to Iris species , as well as the variation in floral parts for all taxa, also used for diagnosis such as color , shape and accessory parts showed very important value for taxonomic purpose specially in Iris . Also fruits variations such as dimension , shape and having beak or not showed a great value in identification to Iris sp. , but seed variation have a good taxonomic value which used to identify taxa. The study of Light microscope ( L.M.) and Scanninig electron microscope (S.E.M.) to pollen grains specially in type was shown grate value of taxonomic mattresses , inaperturate pollen grains in some Iris species and monosulcate in taxa of Gladiolus , Gynandriris , Crocus and some species of Iris , as well as the differences in pollen shape , dimensions , sculpturing and germination apertures . The anatomical study for the vertical section of leaves and cross section of stems showed many differentiations of the shapes and tissues among taxa. All taxa shown Anomocytic type of stomatal complex.Molecular study results using Random amplified polymorphic DNA( RAPDPCR) technique appeared great importance among taxa . It was revealed the genetic relationships among 12 taxa belong to genus Iris and Gladiolus , separation of these taxa depending on the presence or absence of bands , and the number of these bands in the gel after electrophoreses , so this is evidence of a genetic diversity or polymorphism among the taxa , as well as obtaining a number of unique bands that give genetic DNA fingerprint for the definition of each taxon . The taxa of the family Iridaceae distributed to their growth sites after collection from the Iraqi distracts , as well as the environmental study to the sites of the plant growth , also the taxa will be distributed on the maps to their geographical distracts , so recorded many of new spreading areas . As a result of this study two species Iris madonna Dykes. and Gladiolus anatolicus Boiss. were identified as new record for Iraq and added to flora of Iraq.

التغيرات الفصلية والموقعية لتراكيز بعض العناصر النزرة في الرواسب والمياه والنبات المائي الشمبلان Ceratophyllum demersum في نهر الفرات عند قضاء سوق الشيوخ جنوب العراق == Seasonal and Reginal changes in concentration of some trace elements in sediment, water, and aquatic plant(Ceratophyllum demersum) in the Euphrates River at Suq Alshuyoukh districtsouthern of Iraq.

Author name: نور كاظم خير الله
Supervisor name: باسم يوسف الخفاجي
General topic: Biology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: The current study was performed to get the knowledge of seasonal and Reginal changes in concentration of some trace elements(Zn, Pb , Ni and Co) in sediment, water and aquatic plant (Ceratophyllum demersum) in the Euphrates River at Suq _ Alshuyoukh district, south of Iraq . The study was include some of the chemical and physical properaties for water (air and water temperature,turbidity, electrical conductivity,salinity,dissolved oxygen , biochemical oxygen dimand, pH,nitrate,phosphat also total organic carbon and sediment texture). The samples were collected from the river on seasonaly from Autumn 2015 to summer 2016. There are three stations were selected for the study , the first station was near by the tourist Alfadhliyah bridge, afertile farmland on both sides of the river. The second station was in Suq_Alshuyokh , it's away from the first station about 15 km , it's a center of boats which used for fishing ,agriculture lands and homes. The third station was located in stream of ALkermashiya which lieson snuffa_marsh (apart of the Hammar marsh) ,It's away from the second station about 11 km and it's near by villages and fertile farmland. The results of study showed that air temperature was ranged between (15.8 - 49.5)° C and water temperature was ranged between (13.8 - 48.7 ) °C . The highest temperature recorded in the third location during Summer. Turbidity concentrations ranged between (5.7 - 15.6) NTU. The electrical conductivity are ranging between (3920 - 8336) Ms/cm , and salinity of water was low (Oligohaline) ranging between (2.50 - 5.33) ppt and recorded the highest concentrations in the third station . the highest value of pH was (8.9) in the secondstation and the lowest value was (7.3) in the first location while the Dissolved Oxygen concentrations ranged between (3.1 - 8.45) mg/L. The biological oxygen demand (BOD5) was ranged between (0.35 - 4.5) mg /L. As for concentration of nitrates was ranged from (0.02 - 6.33) mg/L. and phosphate ranged between (0.01 - 5.8) mg/L. the total organic carbon as percentage was ranged between (0.48 - 3.1) %.while sediment texture was mixed from sand ,silt,clay,the percentage for the mentiond compenents was,(50%,20% and 30%)in station 1,(40%,10%,50%)for station 2 and (10%,20% and 70%) for station3Atomic absorption spectrofotometer was used to estimate four trace elements (Zn,Pb, Co, and Ni) .The concentrations of the mentionel elements in water dissolved phase were (2.86,5.87,1.63,0.51) μg /L,while their concentrations in particulate phase were (12.48,28.21,17.74,1.08) μg /gm dry weight respectively. In sediment the concentrations averages oftrace elements were (142.73,127.70,176.82,29.24) μg /gm dry weight respectively.In aquatic plant (Ceratophylum demersum) the concentrations averages of trace elements were (123.32,117.54,157.54,27.90) μg /gm dry weight respectively . It concluded that the concentration of studied elements in sediment more than their concentration in water (dissolved and particulate) phase and more than their concentration in plant (Ceratophyllum demersum), also all concentrations of trace elements were in the international acceptable values.
1 ... 106 107 108 109 110 ... 221