Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 3,310

دراسة مقارنة لفعالية لقاح التيفوئيد من عترة محلية وقياسية مع اللقاح التجاري == Comparative Study of the Typhoid Vaccine Effectiveness from Local and Standard Strain With Commercial Vaccine

Author name: وفاء بيد الله حميدي الركابي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: حمى التيفوئيد, تسسبب بواسطة بكتريا السالمونيلا تايفي (S. Typhi) Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi, وينتقل معويا في الانسان حصرا بمدى من التهاب معوي متوسط الى امراض جهازية شديدة وينتشر عن طريق البراز - الفم من خلال تلوث الماء والطعام. هدفت الدراسة الحالية الى تحضير ثلاثة انواع من اللقاحات ضد حمى التيفوئيد من عترة محلية لبكتريا S. Typhi تضمنت لقاح متعدد السكريد Polysaccharide ومتعدد السكريد الشحمي Lipopolysaccharide وخلية كاملة مقتولة Whole cell killed. اجريت هذه الدراسة للفترة من شهر نيسان 2014 وحتى شهر حزيران 2015, تم الحصول على العترة المحلية S. Typhi من المركز الوطني للبحوث والرقابة الدوائية / وزارة الصحة العراقية. شخصت S. Typhi (العترة المحلية) بطرق التشخيص التقليدية كالفحص المجهري والفحوصات البايوكيميائية ونظام التشخيص APi20 وVitek - 2 والفحوصات المصلية, اكدت جميعها هوية البكتريا التي تنتمي الى Salmonella Typhi. تم الحصول على جودة جيدة وفعالية في اللقاحات المحضرة محليا من الناحية البيولوجية والكيميائية والفيزيائية والمناعية مقارنة مع اللقاح التجاري المستورد ، على الرغم من ان لقاحي WCK وLPS رفعا درجة حرارة الجسم في مجموعتي خنازير غينيا الملقحة بهما مقارنة مع المجموعتين المحصنة بلقاحي PSالمحلي والتجاري . ان نتيجة الاختبار الكيميائي (لمتبقيات الفينول والفورمالين) باستخدام تقنيتي Hight - Performance Liquid Chromatography (HPLC) و(Gas Chromatography (GC، قيمة الاس الهيدروجيني PH ومحتوى البروتين امن بالمقارنة مع بروتوكول منظمة الصحة العالمية للقاح التيفوئيد. ايضا في الفحوصات الفيزيائية كان حجم جزيئات لقاح PS المحلي اقل من المستورد، ان صغر حجم جزيئات اللقاح دعم الاستجابة المناعية. في الاختبار المناعي بواسطة تقنية Enzyme Linked Immunsorbent Assay ((ELISA, اظهرت جميع اللقاحات اختلافات معنوية (P<0.05) في مصل خنازير غينيا المعاملة بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعة السيطرة. كان لقاحي PS التجاري والمحلي ذا اهمية معنوية في التفاعلات المناعية reactogenicity اقل من لقاحي LPS وWCK ، ولكن كل منهم اظهر حماية (70 ، 80 ، 80 و90) ٪ على التوالي ضد جرثومة S. Typhi الضارية. اللقاحات المحلية قد تكون قادرة على تعزيز مناعة التكيفية adaptive immunity من خلال تسجيلها اختلاف معنوي (P<0.05) في حساب مجموع الكريات البيض بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعتي اللقاح التجاري والسيطرة. واوصت الدراسة تطوير انتاج عراقي للقاح تيفوئيد PS من هذه العترة الضارية. | Typhoid fever, which is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi (S. Typhi) is an exclusively human enterically transmitted, range from mild gastroenteritis to severe systemic disease and spread by the fecal - oral route via contaminated food and water. In current study aimed to production three types of vaccines against typhoid fever from local strain S. Typhi, include polysaccharides (PS), Lipopolysaccharide (LPS) and Whole Cell Killed (WCK) vaccine. This study was carried out during the period from April 2014 until June 2015. The local strain of S. Typhi was obtained from The National Center of Drugs Control and Research (NCDCR) / Iraqi Ministry of Health. Identification of S. Typhi (local strain) by traditional methods of diagnosis as microscopic examination and biochemical tests as Api20 system diagnosis, Vitek - 2 and serological test .All confirmed the identity of the bacteria belonging to S. Typhi. Good quality and efficacy was obtained in the locally produced vaccines from the biological, chemical, physical and Immunological compared with the imported commercial vaccine, although WCK and LPS elevated body temperature in a vaccinated guinea pigs groups with them compared with local PS and Commercial Vaccinated groups. That a result of chemical test (phenol and formalin residuals) by High - Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Gas Chromatography (GC), PH value and protein content were safety side comparative with WHO protocol typhoid vaccine. Also in physical test, the particles size of local PS vaccine was less than Com. V., the smaller of particles size of vaccine supports the immune response. In Immunological test by Enzyme Linked Immunsorbent Assay ELISA was showed that the titration of all vaccines and have significantly differences (P<0.05) in the sera of treated guinea pigs between first and booster dose compared with control,. The Commercial and local Vi PS. vaccines were significantly less reactogenicity than LPS and WCK vaccines, but all of them provided (70, 80, 80 and 90) % protection respectively against virulent S. Typhi organism. The prepared vaccines may be able to enhance the adaptive immunity through its recorded significant different (P<0.05) in the total leukocytes count between first and booster dose compared with the Commercial Vaccine and control groups. The study recommends to developing production of Iraqi Vi Polysaccharide. Typhoid vaccine from this local virulent strain of S. Typhi.

العلاقة بين مستوى الكلوكوز في الدم مع بعض المعايير الكيموحيوية في متلازمة تكيس المبيض == The Relation Between Blood Glucose level and Some Biochemical Parameters in Polycystic Ovarian Syndrome

Author name: ياسمين سرمد حسن الصائغ
Supervisor name: عالية حسين علي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد متلازمة تكيس المبيض المتعدد ((PCOS من الاكثر شيوعا بين اضطرابات الغدد الصماء والتي تصيب النساء في عمر الانجاب. ماتزال امراضية هذه المتلازمة غير معروفة ولكن الكثير من الباحثين يعزونها الى عوامل وراثية واضطرابات ايضية والسمنة وفرط الاندروجين ومقاومة الانسولين، فضلا عن فرط الانسولين. هدفت هذه الدراسة الى ايجاد العلاقة بين مستوى الكلوكوز مع اختبارات اليوريا والكرياتنين، فضلا عن البروتين المتفاعل C في عينة من النساء العراقيات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد، اذ اجريت الدراسة الحالية على (51) امراة يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد و(10) نساء سليمات كمجموعة سيطرة في المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة على الانجاب/جامعة النهرين للفترة من شباط الى اب للعام 2014. تم تشخيص النساء الخاضعات للدراسة باستخدام جهاز الامواج فوق الصوتية (السونار) لفحص الرحم والمبيض واسندت بالاستبيان ان كن يعانين من ندرة الطمث (oligomenorrhea)، انقطاع الطمث الثانوي (secondary amenorrhea) او دورة حيضية منتظمة، فضلا عن الفحوصات الهرمونية والتي تضمنت الهرمون المحفز للحويصلات المبيضية ((FSH، الهرمون اللوتيني (LH)، هرمون الحليب (PRL)، هرمون الايستروجين (E2) وهرمون التيستوستيرون ((Testosterone. اذ جمع (5) مل من الدم الوريدي من كل امراة صائمة صباحا، واذيب 75 غرام من الكلوكوز بـ 300 - 500 مل من الماء واعطي لكل النساء الخاضعات لهذه الدراسة. تم جمع المعلومات والتي شملت العمر ومؤشر كتلة الجسم ( (BMIو فترة العقم من كل امراة خاضعة للدراسة، ثم تم اجراء اختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار فقط) واختبار اليوريا في الدم واختبار كرياتنين المصل واختبار الهوموسيستين واختبار البروتين الفعال C لكل النساء في هذه الدراسة. كما وتم اجراء اختبار اليوريا والكرياتنين فضلا عن اختبار البروتين المتفاعل C مع منتصف الاختبار لتحمل الكلوكوز الفموي لكل النساء الخاضعات في هذه الدراسة لغرض ايجاد العلاقة المحتملة بين السكر وهذه الاختبارات. قسمت المريضات الى عدة مجاميع وفقا لاختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار) ونوع العقم وحالات الاجهاض ومؤشر كتلة الجسم وفترات العقم ووفقا للفئات العمرية. وبعد ذلك تم تحليل البيانات احصائيا. اظهرت نتائج الدراسة عدم وجود فروق معنوية(P>0.05) بين مجاميع المريضات (PCOS) مقارنة بمجموعة السيطرة فيما يخص عامل العمر،و لكن وفقا للفئات العمرية، لوحظ زيادة تكرار هذه المتلازمة للنساء ضمن الفئة العمرية التي تتراوح بين 21 - 30 سنة. كما واظهرت هذه الدراسة ان اغلب المريضات يعانين من الوزن الزائد والسمنة المفرطة، وارتفاع السكر في الدم. اما فيما يخص حالة العقم فقد قسمت المريضات لمجموعتين، مجموعة تعاني من عقم اولي 52.95%) ) والمجموعة الثانية تعاني من عقم ثانوي ((47.05% . اضافة الى ذلك، حوالي (29.42%)من المريضات يعانين من حالات الاجهاض، ولم تلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في فترات العقم بين المريضات اللواتي يعانين من الاجهاض مقارنة باللواتي لا يعانين من الاجهاض، وايضا بين المريضات اللواتي لديهن عقم اولي مقارنة باللواتي لديهن عقم ثانوي. اما بالنسبة للتحليل الهرموني، فقد لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) بهرمون الحليب لدى المريضات اللواتي يعانين من زيادة الوزن والسمنة المفرطة. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية (P>0.05)في تركيز الهرمون المحفز للحويصلات والهرمون اللوتيني وهرمون الايستروجين والهرمون الذكري التيستوستيرون بين المريضات ومجموعة السيطرة. ايضا اظهرت النتائج حصول ارتفاع معنوي(P<0.05) في تركيز الهوموسيستين في المريضات اللواتي يعانين من فترة عقم 9 سنوات فما فوق. لوحظ ايضا وجود علاقة ايجابية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز مع تركيز كل من اليوريا والكرياتنين في الدم، بينما لوحظت علاقة عكسية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز وتركيز البروتين المتفاعل C في الدم. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في مستويات اليوريا والكرياتنين والبروتين المتفاعل C بين مجاميع المريضات ومجموعة السيطرة الصائمات.نستنتج من نتائج الدراسة الحالية ان متلازمة تكيس المبيض مرتبطة بالسمنة، ومقاومة الانسولين، فضلا عن اضطرابات الطمث. وان ارتفاع الهوموسيستين مرتبط بمقاومة الانسولين والسمنة. المريضات اللواتي لديهن فرط الانسولين قد يتطور لديهن مرض السكري. كما وان ارتفاع هرمون الحليب مرتبط بالسمنة المفرطة والوزن الزائد في المريضات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبيض المتعدد (PCOS). | Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder which affect women at reproductive age. The pathophysiology of this syndrome still unclear, but many researchers were attributed this syndrome to genetics, metabolic disorders, obesity, hyperandrogenism, insulin resistance and hyperinsulinemia. This study was aimed to identify the correlation of glucose level with blood urea, serum creatinine and C - reactive protein test in some Iraqi women suffering from polycystic ovarian syndrome. The present study was carried out for (51) PCOS women and (10) healthy women as control with age between (17 - 49) years at High Institute for Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technologies / AL - Nahrain University, from February to August, 2014. The females were diagnosed by ultrasound scan for ovarian and uterine features and supported by a questionnaire if they have oligomenorrhea, secondary amenorrhea or regular menstrual cycle, as well as reproductive hormonal assay performed for all women involved; FSH, LH , prolactin, E2 and testosterone. Blood samples (about 5 mL) were collected from each fasting woman in the morning, and 75 gm of glucose loaded in 300 - 500 ml of water and given to the subjects. The information included; age, BMI and duration of infertility were recorded for all subjects. Oral glucose tolerance test (Mid - test only), blood urea test, serum creatinine test, homocysteine test and C - reactive protein test were performed for all subjects. Blood urea, serum creatinine and C - reactive protein tests were performed with mid - test OGTT for all subjects provided the correlation between blood glucose levels and these parameters. PCOS women divided into groups according to mid - test OGTT, type of infertility, abortion cases, BMI values, duration of infertility and according to age groups. Crude data were statistically analyzed. As for the age, no significant differences (P>0.05) were observed among PCOS groups and controls. According to age group, higher prevalence of PCOS women was observed in age group with age range 21 - 30 years . The most of PCOS women were overweight and obese, and they had higher glucose levels. As for the infertility, infertile PCOS women were divided into two groups, PCOS women suffering from primary infertility (52.95%) and secondary infertility (47.05%). About 29.42% of PCOS women had abortion. Non significant differences (P>0.05) in duration of infertility between PCOS aborted vs. non aborted ones, and between primary and secondary. Higher prolactin level (P<0.05) was recorded in obese and overweight women, while non significantly differences (P>0.05) were recorded in FSH, LH, E2, and testosterone level among PCOS groups and controls. Higher homocysteine level (P<0.05) was observed in PCOS group with duration of infertility (≥9 years). Weak positive correlation was demonstrated between glucose with blood urea and glucose with serum creatinine. While negative weak correlation of glucose level with C - reactive protein level was recorded. Moreover, non significant differences (P>0.05) in urea, creatinine and C - reactive protein levels among fasting PCOS groups and control.In conclusion, the present study supported the association of PCOS cases with obesity, insulin resistance, and menstrual disturbances. Elevation of homocysteine levels related to insulin resistance and obesity in PCOS women. Hyperinsulinimic PCOS women had higher prevalence risk to develop type 2 diabetes mellitus. An elevation of prolactin level associated with obesity and overweight in PCOS patients

زيادة بعض مركبات الايض الثانوية لنبات الزيتون Olea europaea L باستخدام نترات الفضة النانوية والبولي اثيلين كلايكول خارج الجسم الحي == Increasing of some secondary metabolites of Olea europaea L. Using silver nitrate nano particle and polyethylene glycol elicitor In Vitro

Author name: وسن محمد موسى السويدي
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in callus induce from leave and shoot tips of Olea europaea L. in vitro.Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant.Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that ms medium containing 1 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 50 % under light conditions, the highest callus fresh and dry weight were recorded 630,43.0mg at concentrations 1,2 mg/l 2,4 - D respectively.Shoot tips and Stigma cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulatorsincluding Benzyl Adenine BA at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of shoot tips reached 80 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2534,552 mg at concentration 3mg/l BA respectively. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of Stigma reached 40 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2070,404 mg at the concentration 4mg/l BA respectively.In order to increase theproduction of secondary metabolites, some elicitors were used including Poly Ethylene Glycol (PEG) at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 %, and silver nano particles AgNO3 NPs at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l.Results showed that 1.5mg/l concentration of AgNO3NPs caused highly significant production in most of the secondary metabolites (Glycosides compound) of callus for Olea europaea L while 2mg/l concentrations of AgNO3 NPs caused highly significant production in some of the secondary metabolites (Glycosides compound) of shoot tips for Olea europaea L. Results showed that 2% concentration of PEG caused highly significant production of the secondary metabolites (Fenolic compound) of callus for Olea europaea L. while 1.5% concentrations of PEG caused highly significant production b in most of the secondary metabolites (phenolic compound) of shoot tips for Olea europaea L.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

Author name: هند يوسف خلف
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض المعالم المناعية لمرضى التصلب المتعدد العراقيين == Study of Some Immunological Parameters in Iraqi Patients with Multiple Scler

Author name: هند قصي اسماعیل الفرضي
Supervisor name: حازمة موسى خلیل العباسي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory condition that affects central nervous system (CNS) causing neurological dysfunction. The current study aim was the evaluation of the role of Methylprednisolone (MP), Interferon Beta (IFN - β) as disease treatments, and to investigate their influence on CD25+ FoxP3 T regulatory cells (it was counted by flow cytometry technique), IL - 8, IL - 17 (pro - inflammatory cytokines), IL - 12 (inflammatory cytokine (T cells differentiation Factor)), IL - 10, TGF - β (anti - Inflammatory cytokines) it estimated by ELISA technique, also the total and differential WBC count, ESR, CRP (inflammatory indicators), patient characteristics, clinical manifestation and life style characteristics. Forty - five Iraqi MS patients (15 untreated as early onset patients, 15 MP treated patients and 15 IFN - β treated patients), in addition to 15 apparently healthy individuals as control. For patients treated with MP, samples collected after treatment period, while patients treated with IFN - β samples were collected in remission status.The study revealed the following results : 1. Patient general characteristics showed that according to gender distribution female : male ratio was 2 : 1 (66.67% : 33.33%), according to the age of onset, (< 30 years) group of patients were the highest frequency in study sample (37.9%), 57 years was the maximum age of onset and 13 years was the minimum, with mean (34.93), Baghdad was the highest governorate in MS onset (73.33%). 2. Total WBC count showed that patients treated with MP (10.38*103μl) increases significantly (P≤0.002), (P≤0.001) as compared with both patients treated with IFN - β (7.45*103μl) and control (7.33*103μl) respectively. Lymphocytes were decrease significantly (P≤0.013), (P≤0.030) patients treated with MP and INF - β respectively (1.82), (1.92) as compared to control (2.58) and there were a significant decrease (P≤0.03) in patients treated with MP (1.82*103μl) as compared to untreated patients (2.47*103μl).Neutrophils was increase significantly (P≤0.016) and (P≤0.000) in patients treated with MP and untreated patients respectively (7.81), (5.99) as compared to control (3.82), there were also a significant increase in patients treated with MP (P≤0.04), (P≤0.001) ascompared with untreated patients (5.99*103μl) and patients treated with IFN - β (4.73*103μl) respectively. Basophils decrease significantly (P≤0.001), (P≤0.014) in both patients treated with MP and INF - β respectively (0.05), (0.06) as compared to control (0.08).3. CD25+ FoxP3+ Tregs counting showed a significant increase (P≤0.002) in untreated patients (28.01%) as compared to control 14.06%), while there were a significant decrease (P≤0.016), (P≤0.007) in both patients treated with MP and IFN - β respectively(3.70%), (2.44%) as compared to control, also there were a significant increase (P≤0.000), (P≤0.000) in untreated patients (28.01%) as compared with patients treated with MP (3.70%) and patients treated with IFN - β (2.44%) respectively.4. Serum cytokines estimation showed that IL - 8 decreased significantly (P≤0.026) in untreated patients (0.003pg/ml) as compared to control (0.016), while IL - 10, IL - 12, IL - 17 showed no significances and TGF - β increased significantly (P≤0.028) inpatients treated with MP (700.27) as compared to control (392.13), while there were a significant increasing (P≤0.001), (P≤0.001) in patients treated with MP (700.27pg/ml) as compared with untreated patients (235pg/ml) and patients treated with IFN - β (484.67pg/ml) respectively. Saliva cytokines estimation showed that IL - 8 was increased significantly (P≤0.023) in patients treated with IFN - β (0.578) as compared to control (0.223), IL - 10 increased significantly (P≤0.017) in patients treated with MP (0.023) as compared to control(0.00), IL - 12 decreased significantly (P≤0.003) in patients treated with IFN - β (4.93) as compared to control (24.07), IL - 17 increased significantly (P≤0.018) in patients treated with MP (19.17) as compared to control (0.00).

التحري عن بعض المعايير المناعية وتعدد الطرز الوراثية لجين IL - 13 في مرضى الربو في محافظة ذي قار == Investigation of some Immunological parameters and polymorphism of IL - 13 gene in patients of asthma in Thi - Qar province

Author name: هند حسين صالح الطائي
Supervisor name: علي نعيم سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Asthma is a chronic inflammatory disease of the airways in which many cells and cellular elements play a role. Causes recurrent episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness, and coughing. These episodes cause airflow obstruction, often reversible either spontaneously or with treatment. The current study was conducted at the Labs of college of Education for pure science and Al - Hussein Teaching Hospital in Thi - Qar province, during the period from October 2014 to May 2015. The study aimed to investigate role of polymorphism of IL - 13 gene in patients with asthma and to evaluate their immune status by measuring the levels of some immunological parameter immunoglobulins ( IgE) by enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) and (IgG, IgM ) by single redial immune diffusion (SRID) and measure the levels of interleukins (IL - 6, IL - 17) in the serum using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), the study included test phagocytic cells on phagocytosis (coefficient of phagocytosis) and the total and differential count of white blood cells .A total of 100 patients with bronchial asthma (68 females) and (32 males) whose age lies between 17 - 62 years have enrolled in this study. DNA was extracted and RFLP - PCR was performed by using primers specific for the gene IL - 13, the results showed the presence of mutations in a48 sample out of 100 patients with asthma at site 1112C/T after using restriction enzyme BstUI. the statistical analysis showed correlation between the occurrence of the disease and the emergence of mutation (C / T) in the promoter region of IL - 13 gene when compared with the healthy control in population of Thi - Qar province .When it was compared the patient group with healthy control group there was a high significant increase (P ≤ 0.001) in serum IgE, IgG of patients with asthma compared with healthy control group. And no significant difference in serum IgM of patients with asthma compared with healthy control group. Decrease coefficientphagocytosis was significantly (P ≤ 0.001) in all patients with asthma compared with healthy control group. Levels of interleukin (IL - 6, IL - 17) measured in serum of 60 a sample of patients with asthma, and in the serum of 20 samples from healthy control group. The results showed a significant increase (P ≤ 0.001) in the levels of these interleukins in the serum of patients with asthma compared to the control group.Also there was increased in the rate of counting the total of WBCs and differential cell lymphocytes, eosinophil, neutrophil, basophil, and monocyte (P ≤ 0.001) in patients with asthma compared with the healthy people in the control group.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد
Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة جزيئية ونسيجية مناعية للنساء المصابات بمرض سرطان الثدي في محافظة ذي قار,العراق == Molecular and Immunohistochemical Study in Women with Breast Cancer in Thi - Qar Province

Author name: هبة لفتة عبد الغالبي
Supervisor name: منال بادي صالح | مها شاكر حسن
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Breast cancer is a complex and multifactorial disease resulting in abnormal cell growth that leads to malignant tumor formation.In this study we focus on mutations of breast cancer susceptibility genes 1 and 2 (BRCA1 and BRCA2), immunohistochemical evaluation of estrogen, progesterone, HER - 2 receptors, ABO blood groups , white blood cells and clinicopathological parameter ( age, breast feeding, family history and tumor site) .Eighty five blood samples were taken from patients who attended Al - Hussain teaching hospital and oncology unit in Al - Habboby hospital during the period (from August /2014 to April /2015) , fifty blood samples were collected from healthy women as a control group who attended Al - Hussain teaching hospital and divided into groups according to age, family history, age at first brith, breast feeding. For histopathological and immunohistochemical analysis fifty tissue samples were collected from patients with breast cancer who were undergoing surgical resection (mastectomy). Blood samples were obtained by venepuncture , using a 5 ml disposable syringe , and they were divided into three aliquots, which were 1 ml, 2 ml and 2ml, for collect serum, genetic studies and hematological parameters (leucocycte count and ABO blood groups) study. The tissue samples were collected from the 50 patients with breast cancer for histopathological diagnosis and for Immunohistochemical analysis (estrogen receptor, progesterone receptor and here2/nue) The total patients were divided according to their age in to five groups (30 - 39), (40 - 49), (50 - 59), (60 - 69) and (≥70 years). results of present study revealed that a highest incidence of breast cancer (41%) occur in the age oup between 40 - 49 years, there is a significant difference among patients groups (P ≤ 0.01).The results of our study showed that (77) of patients lactating and from those according to period of lactation we found that the highest percentage of patients (37.6%) were lactating for period between (18 - 22months) and the lowest percentage (10.38%) lactating for period between (1 - 6 month). Family history of breast cancer indicates a strong association with risk of developing breast cancer. The result of the present study revealed that the family history positive in 31 cases (36.47%), and 54 cases (63.52%) had negative family history of breast cancer.The results of present study showed that (41.5%) had first birth at age (20 - 29years), (23.37%) had their first birth in age group (15 - 19 years) and (30 - 39 years), and (9.09%) had first birth at age (≥40 years).Regarding the tumor site, we found that most of patients (50.5%) the tumor mass was located in the right side and (38.8%) cases the tumor mass were located in the left side.The DNA was extracted from blood samples by using Accupower® genomic DNA extraction kit. Each concentration and purity of all DNA samples have been measured by Nanodrop. Samples with a purity ranged from 1.2 to 1.8 have been enrolled in this study for the molecular detection of BRCA1/2 gene mutation in patients and control groups. Detection of BRCA1/2 gene mutation by multiplex PCR revealed that (185 del AG mutation in BRCA1 gene) was detected in 6 patients (7.05%) out of 85 cases with breast cancer, and (5382 ins C) mutation in the same gene was detected in 2 patients (2.35%). Regarding (6174 del T) mutation in BRCA2 gene was detected in 3 patients (3.52%). While this mutation was not detected in the control groups.Histopathologically, carcinoma was divided into 44 cases (88%) ductal carcinoma {from which 42 cases (84%) were invasive ductal carcinoma, and 2 cases (4%) were comedocarcinoma}, and 6 cases (12%) cases invasive lobular carcinoma. Results revealed that 2 cases (4%) were stage I, 13 cases (26%) were stage II, 24 cases (48%) were stage III and 11 cases (22%) were stage IV, also our results showed that the 2 cases (4%) were grade I, 23 cases (46%) were grade II and 25 cases (50%) were grade III. The results of immunohistochemical analysis for breast cancer samples showed that Estrogen receptors were present in 36 cases (72%), and 14 cases (28%) were negative, while Progesterone receptors detected in 27 cases (54%), and 23 cases (46%) were negative, on the other hand the expression of HER - 2/neu showed positive results in 28 cases (56%), and 22 cases (44%) were negative.Regarding the ABO blood groups, we found that most of the cases carry blood group A (40 cases, 47.05 %), and the lowest frequency was for blood group AB (7 cases, 8.23%).The results of the present study showed that leukocytes count, lymphocytes count, monocytes count, neutrophils count and basophiles count were lower in patients than the control group, with a significant difference (p value ≤ o.o1). While the eosinophils count was significantly higher in patients than the controls (p value ≤ o.o1).

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

Author name: نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

دراسة مناعية عن علاقة فايروس الخلية العملاقة للمرضى المصابين بسرطان الفم == Immunological study of relation of Cytomegalovirus in patients with Oral Cancer

Author name: نور الهدى علي عبد الحسين سعيد
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعد حسن محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة كبحث باثر رجعي حيث تم اخذ (70) عينة من الانسجة الفموية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البرافين ، جمعت هذه النماذج من ارشيف الانسجة لمختبرات فرع الانسجة والامراض في كلية طب الاسنان / جامعة بغداد . حيث تعود هذه العينات للفترة بين 1998 - 2008.قسمت هذه العينات النسيجية الفموية الى مجموعتين : - مجموعة تضم (60) عينة اخذت من سرطانات الانسجة الطلائية الحرشفية للتجويف الفمي بينما ضمت المجموعة الاخرى (10) عينات نسيجية خالية من الامراض حسب الفحص النسيجي المرضي كنماذج سيطرة.تم تحليل هذه العينات، اخذين بنظر الاعتبار العمر، الجنس، موقع النسيج المصاب، والتمايز النسيجي، ثم صبغت جميعها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين للتشخيص النهائي.كما تم اجراء التشخيص الجزيئي لدنا فايروس الخلية العملاقة في الخزعات النسيجيه قد انجزت بواسطة جيل حساس ومتقدم من التقانة الاحيائية الجزيئية التي لها قابلية التحديد داخل الخلية للاحماض النووية.امتدت هذه الدراسة لتشمل دراسة نسيجية - مناعية بواسطة التصبيغ المناعي لتحديد انتشار البروتين المنتج من الجين المنشط للسرطان ( p53) ، كذلك لتحديد المستضد الموجود على سطح الخلية اللمفاوية نوع(T ) والمسمى (CD8 ) .مجمل النتائج المستحصلة من هذه الدراسة قد صنفت كالاتي : - كانت اعمار المرضى المصابين بسرطان الانسجة الحرشفية الفموية تتراوح بين (10 - 92) سنة وبمتوسط عمري (56،4) سنة . اعلى نسبة شخصت كانت بالفئة العمرية (45 - 75) سنة ، شكلت سرطانات اللسان النسبة الاعلى بين سرطانات الفم الحرشفية كما شكلت ايضا النسبة الاعلى من النتائج الموجبة لفيروس الخلية العملاقة البشري وانتشار بروتينp53 وكذلك للخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ). اكثر من 80% من حالات سرطانات الفم كانت جيدة التمايز، ضمن سرطانات الفم الحرشفية ، 26 عينة اظهرت نتائج موجبة لفايروس الخلية العملاقة البشري بواسطة التقنية الاحيائية عالية الحساسية ( التهجين بالموقع).مثلت هذه النتائج 43،3% من مجموع سرطانات الفم الحرشفية الخاضعة للتحري، في حين من بين المجموعة نفسها ، 55% (33 عينة من اصل 60) اظهرت نتائج موجبة لفحص انتشار بروتين p53 و18،3% (اي 11 عينة من اصل 60) اظهرت نتيجة موجبة لفحص الخلايا اللمفاوية التائية ( CD8).بينما لم يتم تسجيل اي نتيجة موجبة لفايروس الخلية العملاقة ، انتشار بروتينp53 والخلايا اللمفاوية التائية (CD8 ) ضمن مجموعة السيطرة. سجلت حالات ظهور مشترك لانتشار بروتينp53 الطافر مع دنا فايروس الخلية العملاقة في (18،3%) ومع الخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ) في (10%) بينما سجلت هذه الدراسة حالات ظهور مشترك للخلايا اللمفاوية التائية السامة مع فيروس الخلية العملاقة وطفرة الجينp53 في (1،7%) من سرطانات الفم الحرشفية | This study was designed as retrospective study . A total number of seventy (70) formalin - fixed paraffin - embedded oral tissues that were collected from archives of oral Histology and Histopathology department of Dentistry College/University of Baghdad, during the period from October 2008 till April 2009. All the samples are related to the period between 1998 - 2008.These oral tissue blocks were divided into two groups. A group included sixty (60) tissue blocks with histopathologic diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). And another group included ten (10) tissue specimens that were taken from histopathologically healthy oral tissues.All these tissues were analyzed according to age, sex, site and histological grading.Histopathological sections were made for those oral biopsies and stained by hematoxylin and eosin stain for definitive histologic diagnosis.Molecular detection of cytomegalovirus (CMV - DNA) in those tissue blocks were performed by using highly sensitive version of in situ hybridization (ISH) technique.This research work has further perform immunohistochemical study to demonstrate the prevalence of p53 overexpression. This study also was extended to determine the phenotype of cell surface antigen marker, namely CD8+ marker of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal anti bodies to this CD marker.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with oral SCC ranged from (10 - 92) years with mean of (56.4) years. The highest percentage was diagnosed in the age stratum of (45 - 75) years , the tongue was the most commonly affected site by OSCC. And also represents the major site for CMV infection , p53 gene mutation and CD8 positive - phenotyping results.More than 80% of the OSCC have well - differentiated grade , among oral SCC group, 26 archival tissue blocks showed positive - ISH reactions for CMV - DNA by sensitive version of ISH . This constituted 43.3% of the total screened oral SCC tissues.Thirty - three out of sixty oral SCC showed 55% positive IHC reaction indicating p53 overexpression, and 18.3% (11 out of 60) showed positive IHC reaction pointing for presence of CD8 +ve tumor infiltrating lymphocytes. While , none of those tissues in the histopathologically healthy control group showed reaction for CMV - DNA, p53, or CD8 marker.The co - occurrence of mutated - p53 overexpression with positive CMV infection was localized in (18.3%), whereas co - occurrence of p53 gene mutation and CMV infection along CD8 - positive tumor infiltrating lymphocytes in OSCC were documented in (1.7%) of these cancerous specime

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

Author name: ميس عماد احمد
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين == Study of some immunological aspects of Iraqi patients with ATOPIC DERMATITIS

Author name: ميادة نوري اقبال الدوسكي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف الحصول على المزيد من الايضاحات حول تاثير الاضطرابات المناعية على الحالة المرضية عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين ،لقد تم خلال هذه الدراسة اخضاع 124 مريضا من كلا الجنسين (55مريضاﹰمن الذكور و69من الاناث ) تتراوح اعمارهم ما بين(6 - 55 ) سنة من الذين شخصوا كمرضى التهاب جلدي متماحل ،حيث كان بينهم 48 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل البسيط و76 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل الشديد ، اضافةﹰالى(50) شخصاﹰمن الاصحاء ظاهرياﹰ كمجموعة سيطرة ، تم اخضاعهم الى مختلف الاختبارات بضمنها الفحوصات المختبرية المالوفة للحساسيةوقياس المعلمات المناعية حديثة الاكتشاف بالاضافة الى عزل وتشخيص بكتريا الـ Staphylococcus spp. .اظهرت النتائج اختلاف انتشار مرض التهاب الجلدي المتماحل بين مختلف الفئات العمرية وكذلك بين الجنسين حيث كان نسبة انتشار المرض عند الاناث اكثرمن الذكور. من خلال فحص الجلد وباستخدام (13) نوع من المستارجات، تم التوصل الى انه المستارجات داخل المباني indoor allergens اعلى نسبة للتفاعل الموجب لفحص الجلد ضمن كل مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ،ومن بينها كان حلم الغبار المنزل HDM هو اكثر الانواع تكرارا فى الظهور بنسبة =5‚68 في حين كان لثيل البرمودا Bermuda grass وخليط انواع المختلفة النسبة الاعلى بين حبوب اللقاح =7‚ 13 % و1‚ 12 % على التوالي ، وكذلك لخليط الفطريات نوع MMI النسبة الاعلى بين الفطريات =9‚12%. باستخدام اختبار الامتزاز المناعي للانظيم المرتبط ELISA تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي(E) الكلي والنوعي في مصل الدم ، وكانت قيمة المتوسط الحسابي للكلوبيولين المناعي(E) الكلي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد اعلى وذات فرق احصائي معنوي عنها في كل من مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط ومجموعة السيطرة الاصحاء.وكذلك تم احتساب مستوى الكلوبيولين المناعي (E)النوعي في مصل الدم وذلك لـ 19 نوع المستارجات اظهرت نتائج الدراسة ان الكلوبيولين المناعي (E)النوعي الاكثر تكرارا في كل مجاميع الدراسة من المرضى كان للمستارج D2 بنسبة =7‚ 63 % يتبعه للمستارج H2بنسبة = 7‚ 59 % ،ثم للعشب G2 وبنسبة = 9‚ 58 % تبعهم الكلوبيولين النوعي للفطر M1 = 5‚ 57 % ، F29 =8‚ 54 % ، = F23‚ 54 %، W6 =6‚ 51 % ، M4 = 50 % ، G1 = 50 % ، G15 =2‚ 49 % ، W1 =5‚ 43 % ، M6 =8‚ 46 % ، D1 =46 % ، M2 =5‚ 43 % ، بينما كانت نسبة الكلوبيولين (E ) النوعي للـ F73 مساوي لـ T9 = 1‚ 37 % ،و 9‚ 33 % للمستارج W9 . في حين كانت اقل نسب للكلوبيولين النوعي ضد كل من T3 ، T5 وكانت تساوي 4‚ 23 % ،1، 16 % على التوالي .ان نسبة التطابق الاجمالية بين فحص الجلد ومستوى الكلوبيولينات المناعية النوعية لـخمسة من المستارجات كانت بمقدار9‚ 83 % كما كانت حساسية الاختبار بنسبة 100% لاشجار Mediterranean و19% لاعشاب Mugwort في حين كانت نسبة خصوصية الاختبار 98 % مساوية لكل من Plantain ,Betula واعقبتها المستارجات Fagac ,Bermuda =5‚97% ، 7‚96% على التوالي .اما المستارج HD اظهر اقل نسبة خصوصية وكانت2‚74% لم يلاحظ اي اختلاف معنوي في مستوى الكلوبيولينات المناعية (M , A ) واحدى مكونات المتمم C3 في المصل بين المجاميع الثلاثة قيد الدراسة بينما لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الكلوبيولين المناعي G واحدى مكونات المتمم C4 عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاء. وجد ان عدد خلايا اليفة الايوسين في الدم اعلى معنويا عند كل من مجموعتي المرضى بالمقارنة مع الاصحاء. لم تظهر النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي CD3 اي فروقات معنوية ضمن مجاميع الدراسة ،بينما النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي .CDميادة نوري اقبال الدوسكيكانت اعلى معنويا عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عما هو عليه في كل من مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء. المعلم المناعي الـ CD8 اظهر انخفاض معنوي عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاءولوحظ فروقات معنوية في نسبة الخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 ضمن مجاميع الدراسة مما ادى الى ارتفاع نسبة ((CD4/CD8 ارتفاعا ملحوظا ضمن مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومقارنة بالاصحاء وخاصة عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.كذلك لوحظت اضطرابات في الاستجابة المناعية الخلوية تجاه المشطر اللانوعي PHA ومستخلص البروتيني عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.احد النتائج المهمة في هذه الدراسة هي ان متوسط مستوى الانترلوكين نوع IL - 4 يزداد بشكل معنوي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل عن الاصحاء ،ان مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط اظهرت زيادة معنوية مقارنة بمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد والاصحاء (1‚84، 9‚58،4 ‚15 بيكوغرام/مل ) في حين ان مستوى الانترلوكين نوع IL - 5 في المصل كان اعلى في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عن مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء(5‚95، 9‚75، 2 ‚23 بيكوغرام/مل ) ، بالاضافة الى ذلك ظهرت علاقة خطية موجبة بين IL - 5 واعداد خلايا اليفة الايوسين في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اما فيما يتعلق بمجاميع الدم فلم تظهر اية علاقة معنوية موجبة بين مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومجاميع فصائل الدم بالرغم من انتشار مرض الالتهاب الجلدي المتماحل ضمن الاشخاص ذوي فصائل الدم A, B .الجزء الاخير من الدراسة تضمن اخذ مسحات للجلد لكل من المرضى والاصحاء ، تم زرعها بشكل مناسب لعزل وتشخيص بكتريا المتواجدة فيه . لقد اوضحت النتائج ان بكتريا Staphylococcus aureus كانت الاكثر تكرارا لدى مرضى الالتهاب الجلد المتماحل بنسبة 7‚ 76 % وبالاخص مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد بينما Staphylococcus epidermidis كانت نسبتها3‚ 23 % .فيما يخص علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مع مختلف المعلمات المناعية ،فقد لوحظ وجود علاقة خطية موجبة معنوية مع عدد من الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) النوعي ،الى جانب ذلك فقد بينت النتائج وجود علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي مع عدد خلايا اليفة الايوسين عند كل مرضى الالتهاب الجلد المتماحل النسب المئوية للخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 وCD19ونسبة CD4/CD8 وIL - 4 ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اظهرت علاقة موجبة معنوية مع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي ،في حين علاقة الانترلوكين IL - 5 مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي هي علاقة سلبية واظهرت النتائج ايضا وجود الـ Staphylococcus aureus ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل هو مقترن مع زيادة او ارتفاع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مما ادى الى علاقة موجبة .فيما لم تظهر الكلوبيولينات المناعية ( M , A ) علاقة موجبة مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي عدا الكلوبيولين المناعي G حيث اظهر علاقة ضعيفة ،كذلك الحال بالنسبة لعلاقة شدة المرض مع مختلف المعلمات المناعية حيث اظهرت النتائج وجود علاقة موجبة ذات قيمة معنوية احصائيا مع كل من عدد الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) وعدد خلايا اليفة الايوسين ،ونسبة CD4/CD8 ، مستوى الانترلوكين IL - 5 في المصل ، اضافة الى ذلك كانت نسبة انتشار بكتريا Staphylococcus aureus مقترنة مع شدة المرض. | The favor of this work, is first at all, and above all, is all Allah's. I would like to express my profound thanks and sincere gratitude to my supervisor Dr. Rajwa H.AL - Rubai’e for her valuable scientific guidance, encouragement and support that made it possible for me to accomplish this study. I extend my deep gratitude also to my supervisor Dr. Jassem T. AL - Khafaji for his scientific advice, clinical instructions, in addition to his provision of laboratory materials and equipment. I should express my gratitude to the head and all the employees of the Department of Biology in the College of Science, AL - Mustansiriya University.Deepest gratitude goes to consultant center for Allergy and Asthma especially, Dr. Arij AL - Ani and Dr. Omar AL - Janabi for preparing the diagnostic cases and the chemist Mrs. Aysar F.AL - Aumari and Alaa’s father, Hamssa’s mother for their generous help and their kind assistance in presenting the possible facilities in the lab work.Thanks are also dedicated for Fransois Tron for his cooperation in help me to complete our research in laboratories of Rouen University France. My sincere gratitude presented to Dr. Abdul Alkhaliq AL - Naqeb for their efforts and help in statistical analysis.From my deep hearts, I would express my thanks and respect to my colleagues for their encouragement during my study. Finally, I would like to express my deepest and warmest gratitude and indebtedness to my family, for their kind, love and help in one way or another, and to all those who have contributed to the completion and success of this project. Mayada N. AL - DoskiResearcher SummaryA Prospective study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of atopic dermatitis (AD) among Iraqi patients. One hundred twenty four cases of AD (55 males and 69 females), ranging in age between (6 to 55) years, Patients were grouped as mild AD (48) and severe AD (76), according to severity, and (50) apparently healthy individuals used as a control group (24 males and 26 females). They were studied using different allergic, immunological and hematological tests; in addition to that Staphylococcus species were isolated and diagnosed, Atopic Dermatitis occurred in different ages and most frequently in females than males.Skin test analysis of 13 allergens revealed that AD patients had higher proportions of positive skin reactivity to indoor allergens, among them House dust mites HDM was the most frequent = 68.5%, Bermuda grass and grasses mixture had the highest frequency = 13.7%, and 12.1% respectively among pollens, whereas mould mixture I were the most frequent moulds = 12.9%. Enzyme linked immunosorbent assay ELISA was used to measure serum IgE levels. The mean total IgE was significantly higher in severe than in mild AD and healthy control groups. The quantitative of serum specific IgE was carried out for 19 allergens. Among all AD cases, the most frequent specific IgE was found to D2 = 63.7% followed by H2 = 59.7%, G2 = 58 .9%, M1=56.5%, F29= 54.8%, F2= 54.03%, W6= 51.6%, M4= 50%, G1=50%, G15= 49.2%, W1= 43.5%, M6 = 46.8%, D1 = 46%, M2 = 43.5% and F73 and T9 are equal = 37.1% and 33.9 % for W9. However the least rates were to T3 and T5=23.4% and 16.1% respectively, in contrast to that of healthy controls which showed negative results for most allergens with the exception of M1= 24% = followed by W9 = 16% . The relationship of skin test with serum specific IgE level for seven compatible allergens showed an overall agreement of (83.9%) sensitivity for Mediterranean trees=100%, Mugwort=99%, specificity for Plantain equal to Betula = 98%, followed by specificity for Bermuda and Fagac = 97.5%, 96.7% respectively while the least were to HD = 74.2%. No significant differences between all AD patients and healthy controls as well as between two types of AD patients could be detected in IgM, IgA and C3 serum levels, while serum IgG and C4 levels were significantly increased in both types of illness compared to healthy controls. Blood eosinophil counts were significantly higher in all AD patients than healthy controls. No significant differences between all AD patients and healthy subjects in CD3+ lymphocyte percentage while CD19+ lymphocyte percentage was significantly higher in severe AD group than mild and healthy control groups. CD8+ lymphocyte percentage was significantly lower in all AD patients than healthy control group . Statistically significant differences were observed between the study groups in CD4+ lymphocyte percentage, the mean CD4+ / CD8+ ratio was higher in severe AD group compared to mild AD and healthy control. On the other hand a disorder observed in cellular immunity response to PHA and proteins extract among patients with severe AD. One of the important findings of this study, was that the mean serum IL - 4 was significantly increasing among AD patients as compared to healthy controls, also it was significantly higher in mild AD than severe AD and healthy control groups = 84.1, 58.9 and 15.4 pg/ml respectively, whereas serum level of IL - 5 was obviously higher in cases with severe AD group than mild AD and healthy control groups= 95.5, 75.9 and 23.2 pg/ml respectively. More over a significant positive linear correlation was found between IL - 5 and peripheral eosinophil counts in atopic dermatitis. The relationship between AD and ABO system has shown no significant correlation in spite of the highest frequency of A and B blood groups among atopic dermatitis patients. The last part of this study included skin swabs which were taken from AD patients. Samples were cultured on suitable media for isolation then identification bacteria. The results showed that Staphylococcus aureus was the most common organism isolated from AD patients =76.7% while Staphylococcus epidermidis was =23.3%. In severe AD group; the incidence of Staphylococcus aureus was higher than in mild AD group =70 %, 60% respectively. Regarding the association between total serum IgE and different immunological markers, the mean serum total IgE concentration was significantly increased with number of positive skin tests as well as serum specific IgE scored by subjects with AD. Also, the eosinophil counts revealed a statistically significant positive linear correlation with total serum IgE level in all AD group.CD4+ and CD19+ lymphocyte percentage and CD4+/CD8+ ratio among all AD groups showed significant positive linear correlation with total serum IgE concentration.The relationship between total serum IgE levels and IL - 4 concentration gave positive linear correlation; whereas, between IL - 5 and total IgE levels the results showed negative correlation. The results revealed that persistence of Staphylococcus aureus colonization in AD patients was associated with higher levels of total serum IgE leading to positive correlations between serum total IgE and Staphylococcus aureus persistence. There were no significant differences in level concentration of IgM, IgA with the exception of the IgG which showed a weak correlation. In conclusion, the association between AD severity and different immunological markers were assessed. The severity of AD group was associated with higher total serum IgE levels and number of specific IgE scored by subjects, as well as, eosinophil counts, CD4+/CD8+ ratio, level of cytokine in serum (IL - 5), in addition, the persistence of Staphylococcus aureus were associated with severity of AD disease.

تقيم بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة وجين Mitochondrial Cytochrome C - 1 oxidase لدى الرجال المدخنين والمصابين بفرط الكريات الحمر الثانوي == Evaluation of Some Oxidant - Antioxidant Parameter and Mitochondrial Cytochrome C - 1 Oxidase Gene in Smokers' Secondary Polycythemic Men

Author name: ميادة عبود محمود فرحان
Supervisor name: داخل غاني عمران الوطيفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: ان الدراسة الجارية تضمنت بحث بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة oxidant - antioxidant parameters)) وعزل mt - DNA لغرض تعيين الجين المشفر للانزيم cytochrome - oxidase - C لدى الرجال المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمر polycythemia)). كان العدد الكلي لا شخاص الدراسة120 رجلا , كان منهم 60 رجلا مدخنا مصابا بفرط الكريات الحمر اما العدد الباقي 60) رجلا( فقد كانوا اصحاء وغير مدخنين وقد استخدموا كمجموعة سيطرة (control). تراوحت جميع اعمار اشخاص الدراسة بين30 سنه الى 60 سنه تم تقسيم جميع اشخاص الدراسة(اصحاء ومرضى) الى ثلاثة مجاميع عمرية وكالاتي؛ المجموع الاولى (30 - 39 سنه) ؛المجموعة الثانية (40 - 49سنه) المجموعة الثالثة(50 - 59سنه). تميز جميع المرضى في هده الدراسة بارتفاع معنوي (p<0.05 ) في قيم حجم الخلايا المضغوط pcv)) عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء وقد لوحظ حصول ارتباط ايجابي (r=0.8) بين قيم pcv ومعدل العمر. اما بخصوص بروكسيدات الدهون lipid peroxidation)) فقد سجل مركب malondialdehyde ( وهو دليل واضح لا كسدة الدهون) ارتفاع واضح (p<0.05 ) لدى كل مجاميع المرضى عند مطابقتهم مع الاشخاص الاصحاء . وقد سجلت قيمه ارتباطا ايجابيا مع كل من العمر (r=0.4) ومستوى ال .(r=0.4) PCV وبشان معايير مضادات الاكسدة(Anti - oxidants) فقد اشرت قيم الكلوتاثيون المختزل (GSH) وهو مضاد اكسده غير انزيمي ) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى المجاميع الثلاثة للاشخاص المدخنين عندما قورنوا مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيمة ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2 )و قيم ال PCV (r= - 0.9).اعطت قيم فعالية الكاتليز (catalase activity) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى جميع الفئات العمرية للاشخاص المدخنين بالمقارنة مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيم فعالياته ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2)و قيم ال PCV (r= - 0.9).وبشان قيم فعاليات انزيم superoxide dismutase فقد تبين كدلك حصول انخفاضا ملحوظ p<0.05) ) لكل الفئات العمرية للاشخاص المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمراء عندما مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء. وتبين حصول ارتباط عكسي بين فعاليات SOD وكل من العمر (r= - 0.5)و PCV (r= - 0.5).نتائج الدراسة الحالية اثبتت بان التدخين وفرط كريات الدم الحمراء ليس لها تاثيرات على الجين المشفر ل cytochrome oxidase c1و الموجودة على DNA المايتوكوندريا باستخدام تقنية الPCR ومن النتائج الموضحة في اعلاه؛ فان الايضاح المدون لهده التغيرات يمكن اعزاءه الى العدد الهائل من الكريات الدم الحمراء ونواتج التدخين السامة والتي يمكن ان تسبب انخفاض جميع فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون وعلاوة على دلك؛ يلعب العمر دورا كبيرا في خفض فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون. | The current study was involved to investigate some oxidant - antioxidants parameters and isolation of mt - DNA for cytochrome c - 1 oxidase gene of smoker men affected with polycythemia . One hundered twenty (120) men were recruited in this study ,of them, sixty (60) smoker men affected with polycythemia and the remaining number (60) men were healthy men and serves as control group in this study . all ages of the enrolled subjects were limited between 30 - 60 years old .According to their ages, they were classified into three groups, first group(30 - 39 years old),second group(40 - 49 years old), and third group(50 - 59 years old). All patients included in this study have packed cell volume (PCV) higher than of their healthy counter parts and showed significant increase (p<0.05) when compared with healthy control men. Moreover, levels of PCV have a positive correlation (r=0.8) with advanced ages. concerning lipid peroxidation, malondialdehyde (MDA)as markers of lipid peroxidation was used, an its results revealed a significant increase (p<0.05) in all groups of smokers' polycythemic men and also showed a positive correlation with age (r=0.4) and PCV(r=0.4) Regarding markers of antioxidants, results of reduced glutathione (GSH) non - enzymatic antioxidants, were significantly decreased (p<0.05) in all tested groups in compared with those control group. it was found that results of GSH proportionate inversely with age (r= - 0.2) and PCV(r= - 0.9). About catalase activity , results of its activity indicated a marked decrease (p<0.05) in three age groups of smokers' polycythemic men in a comparison with control groups . the activity of catalase pointed out a negative correlation with both age and PCV(r= - 0.3 ,r = - 0.6 respectively) Serum superoxide dismutase (SOD)activity were also significantly decrease (p<0.05) in all age groups of smokers' polycythemic men when compared with those control group .The SOD activities were inversely proportionated with age and PCV(r= - 0.5, r= - 0.5, respectively). results of the present study confirmed that the smoking and polycythemia have not effects on cytochrome oxidase C1 gene of mt - DNA by using PCR technique. Finally, according to correct study that mentioned above the possible explanation to these findings can be showed that high PCV and toxic materials produced by smoking can be implicated with drop of antioxidant activities with increase lipid peroxidation. Moreover, aging can be exert negative action on these anti - oxidants that associated with increase lipid peroxidation marker (MDA

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض ابيضاض الدم النخاعي الحاد لمرضى عراقيين == Association of Glutathione - S - Transferas (GSTP1) gene polymorphism with Acute Myeloid leukemia in Iraqi patients

Author name: ميادة خالد ابراهيم
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was carried out to investigate the relationships between acute myeloid leukemia (AML) patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1 class (GSTP1) by using Polymerase Chain Reaction (PCR) - Restriction Fragment Length Polymorphism (REFLP) and measurement of some clinical parameters of patients and control.This study included 120 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with AML were diagnosed by the consultant of The National Center of Hematology medical City, Center for Hematology AL - Mustanseria University, hematology clinic of Baghdad Hospital and Alkadhymian medical city teaching hospital during the period from October 2014 to May 2015. Those AML cases then have been diagnosed by a specialized hematologists depending on bone marrow aspiration, biopsies reports and other diagnostic criteria for AML according to the International Staging System (ISS).Sixty individuals healthy also included as control group, their age range were between 15 - 70 years. Blood were used as samples to found the correlation between genotyping of GSTP1 and all studied parameters.Molecular studies involved DNA extraction and PCR - RFLP was carried to detect the genetic polymorphism of GSTP1 for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department / College of Sciences for women. The results showed that in the age for patients and control group were no significant difference in group less than 30 years old, while showed significant difference (P˂0.05) between other groups 30 - 50 years and 50 - 70 years, were (30%) (38.30%) (33.3%) and (23.0%) respectively.The results showed that there were significant different between patients (10.40±2.97) and controls (6.25±0.37) in the mean of white blood cells count (WBCc) (P˂0.48), the mean of hemoglobin (Hb) in patients was (8.11±0.37) and in control was (12.81±1.31) and the different was highly significant between them.The results of genetics polymorphism of the GSTP1 showed the significant difference (P˂0.05) between patients were (56.67%) and controls were (65.00%) in wild genotype AA, while the heterozygous genotype AG and homozygous mutant genotype GG were in AML patients and in controls were no significant different.Distribution of GSTP1 polymorphism and age of patients groups showed that there were significant difference between all age groups and all types of gene polymorphism, were (38.24%), (32.35%), (29.41%) in AA genotype, in AG were (26.32%), (21.05%), (52.63%) and in GG were (57.14%), (42.86%) and (0.00%) respectively.The results of relationship between the sex and AML patients showed that mutant genotype GG genotype was more in male (85.71%) than female (14.29%) with highly significant increase and the risk of male to be effect was more 1,5 than female. The mutant allele G is more frequent in male (0.38) than female (0.17). The data also showed no significant difference between the GSTP1 polymorphism and the mean value of WBC, but the mean value of Hb was shown significant different (P˂0.05), the heterozygous genotype AG showed the highest value (11.35± 0.73).Distribution of GSTP1 polymorphism between control groups according to non - smoking and smoking in the genotype AA+AG, (93.33%), (90.00%) respectively, showed significant difference (P<0.05), while in genotype AG+GG (26.67%), (43.33%) showed high significant difference (P<0.01) and the mutant allele G was more frequency in smoker control (0.27) but in non - smoker was (0.17).Results of this study suggest that GSTP1 gene polymorphisms was not associated with AML disease and GSTP1 has no active role in the pathogenesis of AML, while the age and sex may have a risk factor for progression AML

الدور المحتمل للانترليوكين - 33 (33 - IL) في النساء ذوات مقدمة الارتعاج == The possible Role of IL - 33 in preeclamptic women

Author name: مها محمود شاكر
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية بهدف تقصي بعض المتغيرات المناعية وبالتحديد interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin IgG and antiphospholipid IgG عند الحوامل المصابات بمقدمة الارتعاج وقد امتدت الدراسة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر كانون الثاني 2014. اشتملت الدراسة على 90 امراة حامل تراوحت اعمارههن (16 - 42) منهن 60 مريضة بمقدمة الارتعاج من المراجعات لمستشفى بغداد التعليمي قسم النسائية والتوليد ومستشفى فاطمة الزهراء التعليمي و30 امراة ذات حمل طبيعي للمقارنة ممن ليس لديهن تاريخ سريري للاصابة بمقدمة الارتعاج, قسمت المريضات الستين وفقا لشدة المرض الى 23 حالة خفيفة و37 حالة شديدة .تضمنت العينات اخذ كل من الدم والادرار اضافة الى مليء استمارة استبيان اعدت بهدف الحصول على تفاصيل الحالة الصحية التي تضمنت العمر بالسنوات وعمر الحمل عدد مرات الولادة عند المشاركات في الدراسة. تم خلال الدراسة قياس مستويات interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid( IgG) بتقنية الاليزا بالاضافة الى قياس كل من Cholesterol and triglyceride وقد تم قياس الطول والوزن لحساب مؤشر كتلة الجسم وتم اخذ اوزان الاطفال لكل من المريضات وذوات الحمل الطبيعي وقد خلصت الدراسة الى نتائج مختلفة يمكن تلخيصها بما يلي : ارتفعت مستويات IL - 33عند مستوى معنوية (P<0.05) لتصلml) (163.78 ± 26.82 pg/ في امصال النساء المصابات بمقدمة الارتعاج وعند كلا من المريضات ذوات الحالة الخفيفة (164.30 ± 28.54 pg/ml) وذوات الحالة الشديدة من المرض (163.45 ±16.71 pg/ml) اذا ما قورنت بمستوياته بنظيراتهن من نساء السيطرة((92.27 ± 11.56 pg/ml يمكن ان تدل هذه التغيرات على دور هذا الانترليوكين في امراضية مقدمة الارتعاج. اما بشان IgE فقد سجل ارتفاعا في مستوياته في مريضات مقدمة الارتعاج ( (275.31 ± 28.89 IU/ml) سواء اكن من ذوات الحالة الخفيفة(30.5.31 ± 48.24 IU/ml) ام الحالات الشديدة( 256.67 ± 36.18 IU/ml) مقارنة بمستوياته التي ضلت ضمن حدودها الطبيعية في امصال النسوة في مجموعة السيطرة (138.26 ±20.17 IU/ml ) .وربما تنذر مثل هذه النتائج بالدور الضار لل IgE في مقدمة الارتعاج. لوحظت علاقة احصائية موجبة بين فرط انتاج IL - 33 مع الزيادة في مستويات IgE عند النساء المريضات. من ناحية اخرى لم تكن هنالك ثمة تغيرات في مستويات اضداد الكارديوليبين واضداد الفوسفوليبد في امصال المريضات بمقدمة الارتعاج(3.54 ± 0.22 pg/ml) ( 3.20 ± 0.19 pg/ml) على التوالي سواء ذوات الحالة المعتدلة(3.73 ± 0.43 pg/ml) ( 2.68 ± 0.28 pg/ml)على التوالي ام الشديدة منها(3.42±0.25 pg/ml) (3.52±0.24 pg/ml) على التوالي والتي ظلت عند مستوياتها الطبيعية(3.34± 0.12 pg/ml) (3.36 ± 0.29 pg/ml) على التوالي عند النساء ذوات الحمل الطبيعي .كما لوحظ ايضا ارتفاعا عند مستوى معنوية في الكولسترول عند المريضات251.4 ± 22 mg/dl),) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (187.3 ± 10.78 mg/dl) كذلك لوحظ مثل هذا الارتفاع في الدهون الثلاثية عند المريضات ذوات مقدمة الارتعاجmg/dl) 251.4 ± 22) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (223.7 ± 29.72 mg/dl وعندما تم احتساب قيمة الدهون منخفضة الكثافة جدا من الدهون الثلاثية فقد وجد انها ترتفع عند مستوى معنوية عند النساء من ذوات مقدمة الارتعاج (49.52 ± 1.12 mg/dl) مقارنة مع نظيراتهن من ذوات الحمل الطبيعي41.82 ± 5.18 mg/dl) ) وكذلك لوحظ ارتفاعا في مؤشر كتلة الجسم عند المريضات 33 ± 0.5 Kg/m2)) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (30 ± 0.6 Kg/m2) في حين لم يلاحظ اي اختلاف في معدل اوزان اطفال كل من المريضات بمقدمة الارتعاج او ذوات الحمل الطبيعي ( .(3.52 ± 0.36 Kg , 3.4 ± 0.31Kg | The present study was designed to focus on some immunological changes; namely interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) accompanied preeclampsia . The study was extended from October 2013 to February 2014. Ninety women whose ages ranged from 16 - 42 years, were enrolled in the study including 60 preeclamptic women, among those attending the Department of Obstetrics and Gynecology in Baghdad Teaching hospital and in Fatima AL - Zahra Teaching Hospital. In addition to, 30 women whose pregnancies were healthy with no history of preeclampsia. The preeclamptic women were divided according to the severity of the disease into 23 with mild preeclampsia and 37with severe preeclampsia. Samples were taken from the 90 participants including blood and urine, in addition to a questionnaire which was prepared for this purpose including patient age, gestational age, parity , weight, height, history of family. There was a significant (P < 0.05) increase in the mean systolic blood pressure (SBP) and diastolic blood pressure (DBP) in women with mild and severe PE (14.84 ± 0.93, 10.06 ± 0.81 mmHg & 17.36 ± 1.08, 11.29 ± 0.73 mmHg respectively) as compared to those of apparently healthy pregnant (control) group (10.59 ± 0.87, 7.38 ± 0.28 mm - Hg respectively). The elevation of albuminuria in preeclamptic women were recorded to be 3 grades (+1,+2,+3). The highest ratio (41.6 %) of preeclamptic were with grade +2, (30.1%) of them recorded to be with +3, grade while (28.3%) with +1 grade. Statistically there were significantly (p < 0.05) differ compare to their counterparts in those with healthy pregnancy (controls) in whom albuminuria wasn’t been detected Levels of interleukin - 33, Total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) were estimated using ELISA technique while lipid profile were estimated by using enzymatic method, results can be summarized as follows : Interleukin - 33 levels significantly elevated (P < 0.05) to reach (163.78±26.82 pg/ml) in preeclamptic women, including both groups of patients, those with mild (164.30 ± 28.54 pg/ml) and those with severe illness (163.45 ± 16.71 pg/ml) in comparison to their counterparts in control group (92.27 ±11pg/ml). Such changes may indicate the pivotal role of interleukin - 33 in the pathogenesis of preeclampsia. Regarding (IgE) also recorded to be significantly elevate (P<0.05) in preeclamptic patients (275.31 ± 28.89 IU/ml), both in those with mild (305.31 ± 48.24 IU/ml ) and those with severe illness (256.67 ± 36.18 IU/ml), also, which it remain within its normal range in control groups (138.26 ± 20.17 IU/ml). These results can be alarming for the noxious role of total IgE in the pathogenesis of preeclampsia. Statistically, a positive correlation was noticed between the overproduction of serum interleukin - 33 and increased levels of serum total IgE in preeclamptic women. On the other hand there were no significant changes in each of anticardiolipin (IgG) and antiphospholipid (IgG) levels which remain within the limits of their normal range in sera of preeclamptic patients (3.54 ± 0.22 pg/ml and 3.20 ± 0.19 pg/ml) respectively, whether those of mild (3.73 ± 0.43 pg/ml and 2.68 ± 0.28 pg/ml respectively) or sever conditions (3.42 ± 0.25 pg/ml and 3.52 ± 0.24 pg/ml) respectively in compareision to their levels in those women whose pregnancies were with no complications (3.34 ± 0.12 pg/ml and 3.36 ± 0.29 pg/ml) respectively. Cholesterol, triglyceride, and very low density lipoprotein recorded significantly elevated (P < 0.05) in preeclamptic patients (264.1 ± 34.54 mg/dl, 251.4 ± 22 mg/dl, 49.52 ± 1.12 mg/dl) respectively as compared to control group (187.3 ± 10.78 mg/dl, 223.7 ± 29.72 mg/dl, and 41.82 ± 5.18 mg/dl respectively).The body mass index also increased in its mean in preeclamptic patients (33 ± 0.5 Kg/m2) at(P < 0.05) as compared to control group (30 ± 0.6 Kg/m2), while there are no significant (P > 0.05) increase in mean of weight of babies of preeclamptic women (3.4 ± 0.31Kg) as compared to control group (3.52 ± 0.36 Kg).

تاثير نبات Carica papaya على طفيلي Giardia lamblia في الفئران وبعض التغيرات البايوكيميائية والنسيجية == Effect of Carica papaya on Giardia lamblia in mice, some biochemical and histological changes

Author name: مصطفى كاظم ملاخ عزيز
Supervisor name: شذى خضير
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة لمستخلص بذور نبات Carica papaya على 100 من الفئران السويدية التي تتراوح اعمارهم (6 - 10) اسابيع ومعدل اوزانهم (8 - 23) غم المصابة بطفيلي الجيارديا ثم ومعرفة بعض التغيرات المناعية والفسيولوجية المرضية والنسيجية والكيميائية الحياتية الحاصلة في تلك الفئران بعد استخدام مستخلص البذور كعلاج لتلك القئران من الجيارديا ثم مقارنتها مع الفلاجيل.بينت نتائج الدراسة المعطيات التالية : هناك انخفاض في مستوى البروتين الكلي في مصل مجموعة الفئران المصابة بطفيلي الجيارديا والمجموعة التي تم معالجتها بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2٪ و5٪ (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) في حين ارتفع مستواه في مجموعة الفئران التي تم معالجتها من قبل فلاجيل (4.35 ± 0.06) مقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة (4.10 ± 0.06).انخفض مستوى الكلكوز انخفاض طفيفا في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا (7.70 ± 0.04). في حين ارتفع مستوى الكلكوز في مصل الدم في المجموعة المعالجة بالفلاجيل وكذلك المجموعتين المصابة بالجيارديا والمعالجة بمستخلص بذور نبات ال Papaya 2% و5% (10.90 ± 0.04) (10.60 ± 0.05) (10.64 ± 0.07) على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (8.10 ± 0.06).مستوى انزيمات الكبد (GOT, GPT) ارتفعت في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة. انخفض مستوى الكوليسترول في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا وفي مجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 5% (1.50 ± 0.04) (1.64 ± 0.05) على التوالي, بينما ارتفع لدى مجموعة الفئران المعالجة بالفلاجيل (2.65 ± 0.03) ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 2% (2.65 ± 0.08) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (2.50 ± 0.00).ارتفع مستوى الكرياتين في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى البروتينات (A, C, D, E) انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري المغنيسيوم والصوديوم انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري الكالسيوم والبوتاسيوم انخفض في مجموعة الفئران المصابة بلجيارديا بينما ارتفع مستواه في مجموعة الفئران المعالجة بلفلاجيل ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2% و5% مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.اظهرت النتائج تغيرات فسلجية مرضية متنوعة في امعاء وكبد وكلية الحيوانات المصابة بطفيلي الجيارديا شملت قصر في الزغابات المعوية, ارتشاح خلوي التهابي, تنسج مع وجود التنخر واحتقان دموي مع تجمع للدهونافضل النتائج كانت بلنسبة للفلاجيل ومن ثم يليها المستخلص المائي لبذور بنات Carica papaya بتركيز 2%. | This study was conducted to determine the effect of different concentrations of seeds extract of Carica papaya plant on 100 Swedish mice aged (6 - 10) weeks and the rate of their weight (8 - 23) g infected with parasite of Giardia and then knowing some pathological physiological, histological and Biochemical changes that occurred in those mice after using the seed extract as a treatment for those mice from Giardia and then compare it with Flagyl. There is a decrease in the total protein level in serum of the group infected mice with Giardia, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) g/L respectivily while its level increased in the group which treated by Flagyl (4.35 ± 0.06 g/L) compared to the negative control group (4.10 ± 0.06 g/L). Level of glucose low slightly in serum in the group of infected mice with Giardia (7.70 ± 0.04 mmol/L), while its level high in the serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (10.90 ± 0.04, 10.60 ± 0.05, 10.64 ± 0.07) mmol/L respectively compared to the negative control group (8.10 ± 0.06 mmol/L). The level of the enzyme (GOT) and (GPT) high in all groups compared with a negative control. The cholesterol level in serum of the group infected mice with Giardia and the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 5% (1.50 ± 0.04 and 1.64 ± 0.05) mg/dl respectively, while its level high in the serum of the group that dosage with flagyl and the group that dosage with seeds extract of Carica Papaya concentration of 2% (2.65 ± 0.03, 2.65 ± 0.08) mg/dl respectively compared to the negative control group (2.50 ± 0.00 mg/dl). The level of Creatinine in the serum high in all groups compared to the negative control group. The level of vitamin A, C, D and E became low in the serum of all groups compared with negative control group. The level of Mg+2 and Na+ low in a serum of all groups compared with the negative control group. The level of Ca+2 and K+ low in a serum of the group of infected mice with Giardia while its level rise in a serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% compared to the negative control group. Results showed diverse histopathological changes in the intestines, liver and kidney of infected animals with Giardia included Palace in intestinal villi, inflammatory cellular infiltration, hyperplasia, necrosis, bloody vessels congestion and accumulation the fats. The best results were for Flagyl, and then for aqueous extract of Carica papaya in a concentration 2%.
1 ... 95 96 97 98 99 ... 133