Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 1,997

دراسة الخصائص المظهرية والوراثية للستريه المستوحدة والمعزولة من منتجات الالبان وعينات سريريه في محافظة ذي قار == Phenotypic and Genotypic Characteristics of Listeria monocytogenes Isolated from Dairy Products and Clinical Samples at Thi - Qar province

Author name: رنا هادي محسن العطار
Supervisor name: راجي طعمه الزاملي | يحيى عبد الرضا عباس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

التوصيف الجزيئي لبكتريا الشيجيلا والسالمونيلا المعزولة من الاطفال المصابين بالاسهال في مدينة الناصرية == Molecular Characterization of Shigella spp. and Salmonella enterica Isolated from Diarrheal Children in Al - Nassiriyah City

Author name: سراج صادق حسين
Supervisor name: عزت حسين مزعل | محمد هاشم الياسري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

دراسة العلاقة المحتملة بين الاصابة ببكتريا المعوية اللولبية ومرض القلب الاقفاري == Study of the Prospective Relation Between Helicobacter pylori Infection and Ischemic Heart Disease

Author name: صفاء صادق عمران
Supervisor name: منال بادي صالح | عواطف حمید عیس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

التنوع الجيني للاشريشيا القولونية المسببة لخمج البولي والطبيعة المعزولة من مرضى كبت المناعة == Molecular Typing of Uropathogenic and Normal Flora Escherichia coli Isolated from Immunosuppression Patients

Author name: احمد رمثان حسين
Supervisor name: منال بادي صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

الكشف الجزيئي لبعض عوامل الضراوة من بكتريا المكورات المسبحية القيحية و المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من المرضى المصابين ب?لتهاب البلعوم واللوزتين في محافظة ذي قار/ العراق == Molecular detection of some virulence factors of Streptococcus pyogenes and Staphylococcus aureus isolated from Pharyngitis and Tonsillitis patients in Thi - Qar province/Iraq

Author name: بيداء رسول داخل
Supervisor name: سعد سلمان هميم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

العزل و الكشف الجزيئي لبعض جينات الضراوة والبلازميدات لبكتريا السالمونيلا من الاطفال المصابين بالاسهال في محافظة ذي قار /العراق == Isolation and Molecular Detection of Some Virulence Genes and Plasmids of Salmonella enterica from Diarrheal Children in Thi - Qar Province/Iraq

Author name: زمن كريم حنان
Supervisor name: منال بادي صالح | عزت حسين مزعل
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:

التنميط المصلي والكشف الجزيئي لبعض جينات المقاومة لجرثومة الاشريشيا القولونية Escherichia coli المعزولة من الاطفال المصابين باخماج المجاري البولية في مدينة الناصرية == Serotyping and molecular detection of some resistance genes of Escherichia coli isolated from urinary tract infected children in Nasiriyah City

Author name: وداد سمير جعاز الازيرجاوي
Supervisor name: سعد سلمان هميم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:

دراسة مقارنة بين الطرق التقليدية والجزيئية لتشخيص اللشمانيا الجلدية في محافظة المثنى == Study Of Comparison Between Traditional Methods And Molecular Diagnosis Of Cutaneous Leishmaniasis In Al - Muthanna Province

Author name: جميلة عبيد مزهر
Supervisor name: غادة باسل علي | ياسر دخيل كريمش الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

دراسة مناعية لحالات الاسقاط الجرثومي لدى النساء التي تعاني من داء القطط في محافظة المثنى == Study of Some Immunological Aspects in Women with Infectious Miscarriage due to Toxoplasmosis in Al - Muthanna Governorate

Author name: اسماء ثامر علي
Supervisor name: وئام سعد الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

دراسة مقارنة لبعض التقنيات المستخدمة في تشخيص Mycobacterium tuberculosis في محافظة المثنى == COMPARATIVE STUDY FOR SOME TECHNIQUES USED FOR DETECTION OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN AL - MUTHANNA PROVINCE

Author name: نهاية عواد عريان الظالمي
Supervisor name: حيدر حميد متعب
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

دراسة تشخيصية لانتشار طفيلي Cryptosporidium parvum في الاطفال المصابين بالاسهال في محافظة المثنى - العراق == Diagnostic study for distribution of Cryptosporidium parvum in diarrhoeic children in Al - Muthanna Province - Iraq

Author name: نوران رعد جمعة البركات
Supervisor name: محمد عوده ملاح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

دراسة الانماط الجينية لطفيلي الجيارديا لامبليا في الانسان. == Genotyping Study For Giardia lamblia Parasite in Human

Author name: نبا منذر تركي
Supervisor name: محمد عوده ملاح | ياسر دخيل كريمش الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

تحديد حركيات الالتصاق والغزو وتكوين الفلم الحيوي للبكتريا المعزولة من مرضى اصابات الحروق في مدينة السماوة == Determination of Adhesion, Invasion and Biofilm Formation Kinetics of Bacteria Isolated from Patients with Burn infections in Al - Samawah City

Author name: حسين ثائر عبد العباس
Supervisor name: زياد متعب الخزاعي | جيهان فاضل اشرف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

تاثير المستخلص المائي لقشور ثمار بعض النباتات على الاحياء المجهرية المسببة لحالات الاسهال خارج الجسم الحي في قضائي السماوة والرميثة == The effect of aqueous extract of some fruit peels on microorganisms that cause diarrhea in vitro in Samawa and Rumaitha court

Author name: فاطمة عبد الكاظم مايع الظالمي
Supervisor name: ياسر دخيل كريمش الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

تاثير الاشعة السينية على بعض المعايير المناعية في العاملين في الاشعة التشخيصية في محافظة المثنى == THE EFFECT OF X - RAY ON SOME IMMUNOLOGICAL PARAMETERS AMONG RADIOLOGY TECHNICIANS IN AL - MUTHANNA PROVINCE

Author name: مروة حسين محل
Supervisor name: وئام سعد الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

الكشف المناعي والجزيئي للمرضى المصابين بالبروسيلا في محافظة المثنى == Immunological and Molecular Detection of Human Brucellosis Patients in Muthanna province

Author name: احمد شايع كريم الجياشي
Supervisor name: طارق جعفر فعل الجنديل
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Muthanna
First pages:

التوصيف الوراثي لبعض عوامل ضراوة بكتريا E.coli المعزولة من اخماج المسالك البولية == Genotypic Characterization of someVirulence factors inE.coli isolated from UTI

Author name: عميدة علي عطية العبيدي
Supervisor name: وعد محمود رؤوف | كركز محمدثلج
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية == Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

Author name: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
Supervisor name: اخلاص مشرف عیدان | علي حسین ادحیة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

دراسة مقارنة لفعالية لقاح التيفوئيد من عترة محلية وقياسية مع اللقاح التجاري == Comparative Study of the Typhoid Vaccine Effectiveness from Local and Standard Strain With Commercial Vaccine

Author name: وفاء بيد الله حميدي الركابي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: حمى التيفوئيد, تسسبب بواسطة بكتريا السالمونيلا تايفي (S. Typhi) Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi, وينتقل معويا في الانسان حصرا بمدى من التهاب معوي متوسط الى امراض جهازية شديدة وينتشر عن طريق البراز - الفم من خلال تلوث الماء والطعام. هدفت الدراسة الحالية الى تحضير ثلاثة انواع من اللقاحات ضد حمى التيفوئيد من عترة محلية لبكتريا S. Typhi تضمنت لقاح متعدد السكريد Polysaccharide ومتعدد السكريد الشحمي Lipopolysaccharide وخلية كاملة مقتولة Whole cell killed. اجريت هذه الدراسة للفترة من شهر نيسان 2014 وحتى شهر حزيران 2015, تم الحصول على العترة المحلية S. Typhi من المركز الوطني للبحوث والرقابة الدوائية / وزارة الصحة العراقية. شخصت S. Typhi (العترة المحلية) بطرق التشخيص التقليدية كالفحص المجهري والفحوصات البايوكيميائية ونظام التشخيص APi20 وVitek - 2 والفحوصات المصلية, اكدت جميعها هوية البكتريا التي تنتمي الى Salmonella Typhi. تم الحصول على جودة جيدة وفعالية في اللقاحات المحضرة محليا من الناحية البيولوجية والكيميائية والفيزيائية والمناعية مقارنة مع اللقاح التجاري المستورد ، على الرغم من ان لقاحي WCK وLPS رفعا درجة حرارة الجسم في مجموعتي خنازير غينيا الملقحة بهما مقارنة مع المجموعتين المحصنة بلقاحي PSالمحلي والتجاري . ان نتيجة الاختبار الكيميائي (لمتبقيات الفينول والفورمالين) باستخدام تقنيتي Hight - Performance Liquid Chromatography (HPLC) و(Gas Chromatography (GC، قيمة الاس الهيدروجيني PH ومحتوى البروتين امن بالمقارنة مع بروتوكول منظمة الصحة العالمية للقاح التيفوئيد. ايضا في الفحوصات الفيزيائية كان حجم جزيئات لقاح PS المحلي اقل من المستورد، ان صغر حجم جزيئات اللقاح دعم الاستجابة المناعية. في الاختبار المناعي بواسطة تقنية Enzyme Linked Immunsorbent Assay ((ELISA, اظهرت جميع اللقاحات اختلافات معنوية (P<0.05) في مصل خنازير غينيا المعاملة بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعة السيطرة. كان لقاحي PS التجاري والمحلي ذا اهمية معنوية في التفاعلات المناعية reactogenicity اقل من لقاحي LPS وWCK ، ولكن كل منهم اظهر حماية (70 ، 80 ، 80 و90) ٪ على التوالي ضد جرثومة S. Typhi الضارية. اللقاحات المحلية قد تكون قادرة على تعزيز مناعة التكيفية adaptive immunity من خلال تسجيلها اختلاف معنوي (P<0.05) في حساب مجموع الكريات البيض بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعتي اللقاح التجاري والسيطرة. واوصت الدراسة تطوير انتاج عراقي للقاح تيفوئيد PS من هذه العترة الضارية. | Typhoid fever, which is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi (S. Typhi) is an exclusively human enterically transmitted, range from mild gastroenteritis to severe systemic disease and spread by the fecal - oral route via contaminated food and water. In current study aimed to production three types of vaccines against typhoid fever from local strain S. Typhi, include polysaccharides (PS), Lipopolysaccharide (LPS) and Whole Cell Killed (WCK) vaccine. This study was carried out during the period from April 2014 until June 2015. The local strain of S. Typhi was obtained from The National Center of Drugs Control and Research (NCDCR) / Iraqi Ministry of Health. Identification of S. Typhi (local strain) by traditional methods of diagnosis as microscopic examination and biochemical tests as Api20 system diagnosis, Vitek - 2 and serological test .All confirmed the identity of the bacteria belonging to S. Typhi. Good quality and efficacy was obtained in the locally produced vaccines from the biological, chemical, physical and Immunological compared with the imported commercial vaccine, although WCK and LPS elevated body temperature in a vaccinated guinea pigs groups with them compared with local PS and Commercial Vaccinated groups. That a result of chemical test (phenol and formalin residuals) by High - Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Gas Chromatography (GC), PH value and protein content were safety side comparative with WHO protocol typhoid vaccine. Also in physical test, the particles size of local PS vaccine was less than Com. V., the smaller of particles size of vaccine supports the immune response. In Immunological test by Enzyme Linked Immunsorbent Assay ELISA was showed that the titration of all vaccines and have significantly differences (P<0.05) in the sera of treated guinea pigs between first and booster dose compared with control,. The Commercial and local Vi PS. vaccines were significantly less reactogenicity than LPS and WCK vaccines, but all of them provided (70, 80, 80 and 90) % protection respectively against virulent S. Typhi organism. The prepared vaccines may be able to enhance the adaptive immunity through its recorded significant different (P<0.05) in the total leukocytes count between first and booster dose compared with the Commercial Vaccine and control groups. The study recommends to developing production of Iraqi Vi Polysaccharide. Typhoid vaccine from this local virulent strain of S. Typhi.

التوزيع الزماني للفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة وبعض طرائق السيطرة عليها == Temporal Distribution of Dermatophytic Fungi the Causative of Tinea Diseases and Some Control Methods

Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي
Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

Author name: هند يوسف خلف
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively
1 ... 41 42 43 44 45 ... 80