Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 2,493

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية == Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

Author name: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
Supervisor name: اخلاص مشرف عیدان | علي حسین ادحیة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

توصيف جزيئي للخلايا الجذعية المتحفزة لتكوين خلايا عصبية == Molecular Characterization of Stem Cells that Induce Neurogenesis

Author name: مائده حسين محمد
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Animal - Molecular Biology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The in vitro isolation, identification, differentiation, and neurogenesis characterization (with molecular studies by conventional and real time - PCR) of stem cells source were investigated to produce two type of stem cells. This two types including neural cells and neural stem cells in culture which use it as a successful sources for further treatments. And finally chosen the best medium formula for maintenance the produced neural stem cells, also to prove their stemness state in culture. The mouse bone marrow mesenchymal stem cells was used as the source of stem cells in this study. Two type of neural differentiation formula was used to induced neural cells and then neural stem cells. The first formula was butylated hydroxyanisole, and the second formula was β - mercaptoethanol reagents. Also three type of different neural stages markers were used; nestin as immaturation stage marker, neurofilament light - chain as early neural marker, and microtubule association protein as maturation marker. These markers were represented the different neurogenesis stages started from mesenchymal stem cells (as undifferentiated cells), neural stem cells production stages, and towards neuron cells (as differentiated cells).The results of immunocytochemistry and real time - PCR of butylated hydroxyanisole differentiation method showed that in contrast to mesenchymal stem cells (as control group), neural differentiated cells showed neural progenitor pattern, by showing stable increased in nestin gene expression significantly through differentiation process for different exposure time, with increased of protein expression significantly compared with control. While, neurofilament light - chain gene and protein expression started to increase significantly, but not - IIreplacedthe nestin expression completely even when its expression passed nestin levels compared with control group. In contrast to the maturation marker microtubule association protein which showed a very low expression during the duration of differentiation period in protein and gene expression (with significant effect) compared with control. This results proved that the cells were still progenitors and do not passed the maturation stage, therefore there was a difficult to define the exactly time of neural stem cells production stage from this formula and as a good formula to produce neuron cells in culture. In other side, the results of immunocytochemistry and real time - PCR of β - mercaptoethanol (as another differentiation formula) were showed that this formula was successful to produce both neural stem cells as well as neuron cells from this formula. This occur through increasing and over expressing of nestin protein and gene significantly within the early hours exposure time reaching to the highest expression levels. Compared with decreased and lower expressed in neurofilament light - chain protein and gene expression levels compared with control; therefore from this stage (exposure time) we can produce neural stem cells in culture. And then decreased and lower expressed of both protein and gene expression of nestin significantly compared with increasing the expression of neurofilament light - chain protein and gene levels throw the late exposure times compared with control, this results indicated that this stage was starting of maturation stage toward neuron cells. Also the proving of this results was lower expression levels of almost all exposure times of microtubule association protein for their protein and gene (with significant effect).The results of gene expression analysis of using four different media formulas to proved the stemness state and maintained the neural stem cells in culture showed that 6 h exposure to β - mercaptoethanol was enough to create - IIIneuralstem cells which maintained using MEM media with 5% FBS, with b - FGF, or with b - FGF &EGF. This study confirms that the molecular characterization study of stem cells in culture will assist to studying and clarifying the neurogenesis pathway through neural differentiation process, by clarified the mechanisms of neural genes through the in vitro differentiation of stem cells, and therefore ability to produced both neuron cells and neural stem cells by using the molecular studies.

امكانية تحفيز بعض الطحالب المعزولة محليا لانتاج الوقود الحيوي == Possibility of stimulation of some locally isolated algae for production of biofeul

Author name: ثائر محمد ابراهيم العكيلي
Supervisor name: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
General topic: Biology
Specific topic: plant - aquatic life
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the current study, samples of algae have been collecting from( Springs , Streams and Rivulets)including in northern of Iraq (the area on the Iraqi - Iranian and Turkish borders, and from the middle in the areas of (Tarmiya and Alabegi) several races of used algae in biofuels such as : Scendesmus spp , S . quadricouda , S . Dimorphus,Chroococcus sp. ,Chlorococcum humicola , Microcystsp. , Asterococcus sp. ,Chlorella sp , Oscillotoriasp. , Anabena sp , Nostoc. sp. , Ankistrodesmus falcatus.diagnosed , were isolated and prepared pure cultures of Asterococcus sp. , S dimorphus, C.humicola and were selected three culture medium (BG11, Chu13, Chu10)for culturing and development of these algae under controlling conditions (2 ± 25 ° C, intensity of illumination 3000 Lux and 8 : 16 light : darkness system).Experiments include three axes, the first representing the study of the influence of media - type and installed in curves and growth rates (K) and doubling time(G) and estimate the biomass of the tested algae, in addition to monitoring the effectiveness of the quality of the medium in the chemical content of algae and of (total of lipids, proteins, carbohydrates content and fatty acids). A second include the treatment are (remove nitrogen from the media, addition NaCl with 2 g.l - 1, addition of vitamins mixture (B1, B6, B12) in the following concentrations (0. 1, 0.1, 0. 01) mg .l - 1, respectively and change the current speed (as a mixing factor) of 400 and 850 l. h - 1). Third axis include the efficiency of the Photobioreactor system test (Tubular Photobioreactor named( I.TH.1) designed by a researchers for the purpose of comparison between culturing in bottles and the possibility of the application of expandingproduction in the reactor system of 120 liters, for testing C. humicola in Chu13media.The results showed that the highest growth rate recorded in BG11 for Asterococcus sp, was 0.343 cells . day - 1 depending on the absorbance values at of 650 nm wavelength, while the highest rate depending on the number of cells scored in Chu13 after the addition of vitamins mixture for C.humicola was 1.16 cells .day - 1, while the lowest growth rate(K) scored in Asterococcus sp, In Chu10 after the removal of nitrogen and reached 0.04 cells . day - 1, as less doubled time(G) scored when Chu13 after the addition of NaCl to Asterococcus sp, and reached 1.12 day depending on the absorbance values, while less doubling time(G) was relying on the number of cells in C.humicola in Chu13 after the addition of vitamins and amounted to 0.257day.The highest doubled time(G)13.7 and 15.05 day was scored in BG11 after removing N2 form culture medium of Asterococcus sp, depending on the absorbance values and the number of cells respectively. The highest biomass value recorded at Asterococcus sp with current speed 400 l.h - 1 and amounted to 0.724 mg .g - 1 dry weight,while the less biomass0.203 mg.g - 1 dry weight at the same algal after the addition of NaCl to Chu10 .The highest value of total lipids recorded at removing nitrogen from the Chu13 inS.dimorphus amounted 320.8 mg . g - 1 (dry weight) while it was less than at the C.humicola in control. As Chu10 recorded the highest percentage of total lipids was registered at S.dimorphus in BG11 after removing nitrogen and stood at 81.48%. The lowest percentage was registered with C.humicola in Chu10 amounted to 32.49%.The highest amount of total proteins , when Asterococcus sp developed at current speed of 400 l . h - 1 in Chu13 amounted to 299.7 mg . g - 1 (dry weight), while the least value was registered at S.dimorphus amounted to 8.9 mg . g - 1 in BG11 - free of nitrogen. While recorded the highest percentage of total proteins when Asterococcus sp, after the addition of NaCl to BG11media and amounted to 51.17%, while the lowest percentage was registered to the same alga after removing nitrogen from the BG11 and amounted to 5.7%.Results prepared that the highest amount of total carbohydrates, was recorded in the S.dimorphus when the velocity of 400 l . h - 1 and amounted to 63.09 mg . g - 1 (dry weight), and the least amount was registered in Asterococcus sp in Chu10 after the addition of vitamins. While the highest percentage recorded for carbohydrates in S.dimorphus in control BG11 reached 41.67%,and the lowest percentage was in Asterococcus sp at Chu10 after the addition of a mixture of vitamins and stood at 4.65% .When the follow - up impact of the transactions used in the experiments in quality and quantity of fatty acid (Luric, Palmetic, Stearic, Lionoleic, α - liolenic, Oleic, Archidic, DHA), we find that the the final concentrations have varied significantly, recorded acids Luric, Palmetic, Stearic higher concentrations when Asterococcus sp. In Chu13 after the addition of NaCl first and, second and was 46.7, 381.27 mg . l - 1, respectively, while the acid Stearic amounted to 117.0 mg . l - 1 after removing nitrogen from BG11. While α - linoleic, Linoleic asid recorded the highest amount it reached 188.3, 22.7mg.l - 1 when Chu10 after the addition of vitamins and at the speed of 400 l . h - 1, respectively, for Asterococcus sp, As Oleic, Archidic, DHA acids recorded the highest amount in C.humicola amounted to 125.08, 131.8,175.65 mg .l - 1 , at the current speed of 400 l . h - 1 in the first and second acides, when BG11 after removing nitrogen, DHA acid,as in terms of percentages acids, we find that the current study showed the highest percentage of Linoleic, Luric amounted to 39.69, 84.9% at the control Chu10 and Chu13 after treatment with vitamins respectively in Asterococcus sp.While DHA Oleic, α - linoleic, Stearic acids recorded highest percentage reached to 43.39, 44.25, 46.71, 46.85%, respectively, in S.dimorphus in BG11control , after treatment with vitamins to Chu10and after the addition NaCl toBG11respectively . As Archidic, Palmetic acids recorded the highest percentage in C.humicola amounted to 28.42, 62.6%, respectively, in BG11control and the speed 850 l . h - 1.the highest amount of saturated fatty acids S.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 951.7 mg . l - 1 after the addition NaCl to Chu13 .The highest percentage was registered at the same alga 92.5% in Chu13control. Current studie also recorded the highest amount of unsaturated fatty acid U.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 488.2 mg .l - 1 when adding vitamins to Chu10, while the highest percentage recorded in S.dimorphus amounted to 91.79% when adding NaCl to BG11.I n applying the experience of the test reactor, the photobioreactor of 120 liters and choosing alga C.humicola inChu13 and 400 l .h - 1, we find that the system I.TH.1 has given the results and the differences were not significant in terms of impact on growth rates and the doubling time of replication when compared with the first and second controls(Chu13 represent first control sized 150 ml and the process to shake once a day and the second control mixing factor 400 l . h - 1 in 3 - liter size). In terms of the impact of I.TH.1 on the biomass it has increased significantly when the first control while non - significant differences were recorded for the second control at the level of probability (P≤ 0.05) either when the effect in the chemical content of the total of studied alga, we find it recorded 199.6, 200.5, 198.2 mg . g - 1 of total lipids and 218.5, 214.3, 185.9 mg . g - 1 of total proteins and 147.7, 165.1, 143.2 mg . g - 1 of total carbohydrates in the first , second control, I.TH.1respectively. These results show no significant differences between the results of I.TH.1 and education in bottles laboratory. either at the level of the quantity and quality of fatty acids, we find that there is variation in the results as recorded all the fatty acid was significantly higher for the first control except Luric acid which disappeared from the second control and I.TH.1 , while there was a significant decrease in α - Liolenic, Olice, Archidic acids. While I.TH.I recorded an increase in Palmetic, Linolic, DHA acids compared with the second control, with the advent of acidic Myrestic and Stiric in the system and the disappearance in two controls, That shows the importance of the use of these bioreactors in the biofuel production studys.

تعدد الاشكال للنيوكليوتيدة المفردة لبعض الحركيات الخلوية في مرض المعي الالتهابي لدى مرضى عراقيين == Single Nucleotide Polymorphisms of some Cytokines in Inflammatory Bowel Disease of Iraqi Patients

Author name: ابتسام بداي حسان الكناني
Supervisor name: بتول علي شهاب | علي حسين ادحية
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Inflammatory bowel disease (IBD) is a world healthcare problem that involves two major forms : Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Immunogenetic predisposition is one of the risk factors for the disease, and cytokines are among these factors. Therefore, the association between 13 SNPs (single nucleotide polymorphisms) of cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IFNG, TNF and TGFB1) and IBD was determined in samples of Iraqi Arab patients (34 CD and 66 UC). The patients were referred to the Gastrointestinal Tract Unit at Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Yarmouk Teaching Hospital and Al - Zuafrania General Hospital in Baghdad for diagnosis and treatment during the period August 2013 - October 2014. A control sample of 43 individuals was also included.The following results were reached by the study : 1. Interleukin - 1 alpha gene (IL1A - 889) : frequencies of CC genotype and C allele were significantly increased in CD (58.8 and 73.5%, respectively) and UC (54.6 and 71.2%, respectively) patients compared to controls (25.5 and 40.7%, respectively). In contrast, TT genotype and T allele frequencies were significantly decreased in CD (11.8 and 26.5%, respectively) and UC (12.1 and 28.8%, respectively) patients compared to controls (44.2 and 59.3%, respectively).2. Interleukin - 1 beta gene (IL1B - 511) : Frequency of TC genotype was significantly increased in UC patients compared to controls (63.6 vs. 39.5%; P = 0.018), while CC genotype frequency was decreased (6.1 vs. 32.2%; P = 0.061). No variation was observed in CD patients.3. Interleukin 1 receptor type 1 gene (IL1R1pstl 1970) : Frequencies of TT genotype and T allele (47.1 and 67.7%, respectively) were significantly increased (P = 0.026 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients compared to controls (20.9 and 34.97%, respectively). In contrast, CC genotype (11.8 vs. 51.2%) and allele C (32.4 vs. 65.1%) frequencies were significantly decreased (P = 2.8*10 - 4 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients. For UC, the patients demonstratedgnificant increased frequencies of TC genotype (48.5 vs. 27.9%; P = 0.045) and T allele (63.6 vs. 34.9%; P = 5.1*10 - 5) compared to controls. As in CD, UC patients also demonstrated significant decreased frequencies of CC genotype (12.1 vs. 51.2%; P = 1.7*10 - 5) and C allele (36.4 vs. 65.1%; P = 8.6*10 - 5).4. Interleukin 2 gene (IL2+166) : Among CD patients, frequencies of TT genotype (41.2 vs. 6.9%) and T allele (64.7 vs. 43.0%) were significantly increased in patients compared to controls (P = 0.001 and 0.009, respectively). In contrast, TG genotype (47.1 vs. 72.1%; P = 0.035) and G allele (35.3 vs. 56.9%; P = 0.009) frequencies were significantly decreased. Almost, similar observations were made in UC patients.5. Interleukin 4 gene (IL4 - 590) : it was observed that frequencies of TT genotype (52.9 vs. 11.6%; P = 1.2*10 - 4) and T allele (70.6 vs. 24.4%; P = 1.6*10 - 8) were significantly increased in CD patients compared to controls. In contrast, CC genotype (11.8 vs. 62.8%, P = 5.6*10 - 6) and C allele (29.4 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased. In the case of UC, frequencies of TC genotype (69.7 vs. 25.6%; P = 1.1*10 - 5) and T allele (62.1 vs. 24.4%; P = 4.6*10 - 8) were significantly increased in patients, while CC genotype (3.0 vs. 62.8%; P = 2.5*10 - 12) and C allele (37.9 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased in patients.6. Interleukin 4 receptor gene (IL4R+1902) : frequencies of GG genotype (47.1 vs.11.6%) and G allele (55.9 vs. 37.2%) were significantly increased in CD patients compared to controls (P = 0.001 and 0.023, respectively). In contrast, GA genotype (17.7 vs. 51.1%; P = 0.004) and A allele (44.1 vs. 62.8%; P = 0.023) frequencies were significantly decreased. In UC patients, frequencies of GG genotype (57.6 vs. 11.6%) and G allele (75.8 vs. 37.2%) were significantly increased (P = 1.0*10 - 6 and 1.9*10 - 8, respectively); while frequencies of AA genotype (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5) and A allele (24.2 vs. 62.8%; P = 1.9*10 - 8) were significantly decreased.7. Interleukin 6 gene (IL6+565) : Comparing patients to controls revealed that GG genotype frequency was significantly increased in CD (70.6 vs. 13.9%; P = 1.5*10 - 8) and UC (69.7 vs. 13.9%; P = 4.4*10 - 7) patients, and a similar increased frequency of G allele was observed. In contrast, the GC genotype frequency was significantly decreased in CD (23.5 vs. 76.7%; P = 3.7*10 - 6) and UC (24.2 vs. 76.7%; P = 7.0*10 - 6) patients.8. Interleukin 12B gene (IL12B - 1188) : Frequency of A allele was significantly increased in CD patients compared to controls (67.7 vs. 47.7%; P = 0.015), while C allele was significantly decreased (32.4 vs. 52.3%; P = 0.015). For UC, the heterozygous genotype AC showed a significant increased frequency in patients compared to controls (66.7 vs. 30.2%; P = 3.6*10 - 4), while CC genotype frequency was significantly decreased (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5). 9. Interferon gamma gene (IFNG+874) : The AT genotype showed a significant increased frequency in CD patients compared to controls (58.8 vs. 30.2; P = 0.020), while TT genotype frequency was significantly decreased (11.8 vs.39.5%; P = 0.009). For UC, AA genotype (54.6 vs. 30.2%; P = 0.018) and A allele (74.2 vs. 45.4; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly increased in patients. In contrast, TT genotype (6.1 vs. 39.5%; P = 2.8*10 - 5) and T allele (25.8 vs. 54.7%; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly decreased. 10. Tumor necrosis factor alpha gene (TNF - 308) : Comparing CD patients to controls revealed no significant variation, while UC patients demonstrated a significantly (P = 0.006) increased frequency of G allele (71.2 vs. 52.3%) and a decreased frequency of A allele (28.8 vs. 47.7%). 11. Interleukin 1 receptor antagonist (IL1RNmaspl 11100), interleukin 10 gene (IL10 - 1082) and Transforming growth factor beta (TGFB1codon 25) genes : Comparing patients to controls revealed no significant variations in genotype or allele frequencies.The presented results of the 13 cytokine SNPs in CD and UC patients are the first report in Iraqi patients, and their findings highlighted the role of these SNPs in etiopathogenesis of both groups of IBD, and paved the way for further investigations to determine the role cytokine gene polymorphisms in susceptibility to IBD or their protective effects.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق == Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

Author name: زينة نبيل نصيف العزاوي
Supervisor name: صباح فرج عبد الاحد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Invertebrates
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

Author name: هديل مكي حبيب المؤمن
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد
Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

Author name: ميس عماد احمد
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية == Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

Author name: نشميل علي حسن الهواسي
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن == Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

Author name: محمـد فضـل سالم الميسـري
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية == Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

Author name: لمياء علي حسين
Supervisor name: وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

Author name: لمى يوسف مهدي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

Author name: لمى قاسم علي الطائي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة مناعية ومايكروبايولوجية لمرضى الربو == IMMUNOLOGICAL AND MICROBIOLOGICAL STUDY FOR ASTHMATIC PATIENTS

Author name: كريم شحل جياد الطائي
Supervisor name: كريم شحل جياد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الربو اضطرابا التهابيا مزمنا في المسالك الهوائية وانه مرض متعدد الاسباب تلعب المحفزات غير الارجية اضافة للعوامل الارجية دورا فيه . ان الدراسة الحالية تمحورت بشكل اساسي حول الربو الارجي (Allergic asthma) والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1 - من اجل البحث في العلاقة بين الابواغ الفطرية المحمولة في الهواء والمظاهر السريرية لمرضى الربو العراقيين فقد اجريت دراسة كمية ونوعية للفطريات داخل وخارج المنازل (Indoor and Outdoor) باستخدام طريقة الاطباق المفتوحة وذلك خلال الفترة من كانون الثاني 2001 لغاية كانون الاول 2002. اظهرت النتائج ان كثافة الابواغ الفطرية تتباين تبعا للمواسم والظروف المناخية وان شيوع هذه الفطريات كان داخل وخارج المنازل وفق التسلسل التالي : Aspergillus nigar , Penicillium , Aspergillus flavous , Caldosporium Alternaria . اجريت تقيما لدور هذه الفطريات في حث امراض الارجية لدى 116 من مرضى الربو 50 من الاناث و66 من الذكور تراوحت اعمارهم بين 70 - 5 سنة وكذلك 45 فردا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة وذلك باستخدام اختبار وخز الجلد (Skin prick test) ، وقد ابدى غالبية المرضى فعالية جلدية لخلاصة خليط الفطريات MM1 وMM2 وMM3 وMM4 وMM5 كما لوحظت علاقة ايجابية بين وجود هذه الفطريات داخل وخارج منازل مرضى الربو وبين مدى استجابتهم اليها . تبين من خلال قياس مستوى الضد IgE النوعي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) ان اضداد الفطريات Penicillium ، Aspergillus ، Alternaria كانت الاكثر تكرارا 2 - من اجل الغاء المزيد من الضوء حول دور الاخماج البكتيرية والتي من شانها ان تفاقم نوبات الربو ، فقد اجريت عملية زرع القشع لـ 68 مريضا من مرضى الربو تم خلالها عزل 6 انواع من البكتريا كانت Strepto pneumoniae اكثرها تكرارا (%35.2) تليها بكتريا Staph aureus بنسبة (%30.9) وبكتريا H. influenza بنسبة (%7.3) واخيرا بكتريا Strepto pyogenes وStaph epidermidis وN. cattarrhalis وبنسبة (%4.4) لكل منهما. عزلت (9) عزلات من خميرة C. albicans من اولئك المرضى والذين ابدوا تفاعلات جلدية موجبة باستخدام خلاصات هذه الخميرة . ومن خلال اجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية للعزلات ابدت غالبية تلك العزلات حساسية عالية لمضادات Ciprofloxacin وAugmentin وCefatoxime كما ابدت العديد منها مقاومة لمضادات Ampicillin وCloxacillin وTetracycline وErythromycin .3 - ولالقاء الضوء على الحالة المناعية لمرضى الربو تم تحديد مستويات الاضداد IgA وIgG وIgM واجزاء المتمم C3 وC4 في امصالهم باستخدام طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (Single Radial Immunodiffusion=SRID) ومستويات الضد IgE الكلي بتقنية ELISA تبين من خلالها ، بان متوسط مستويات الضد IgG والضد IgA قد انخفضت معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة مع مجموعة السيطرة وان متوسط مستوى جزء المتمم C3 قد ارتفع معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة بمستواه لدى افراد السيطرة في الوقت الذي لم يحصل تغير جوهري في مستويات الضد IgM والجزء C4 من مكونات المتمم من جراء الاصابة بالربو. فيما يتعلق بتقدير مستويات الضد IgE الكلي فقد اظهرت النتائج ان هنالك ارتفاعا معنويا في مستويات هذا الضد لدى مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة وان هنالك اختلافا معنويا في مستوياته بين كلا الجنسين من مرضى الربو. اوضحت الدراسة كذلك ان هنالك فروقا في تفاعل التلازن الخاص بالبروتين الفعال - C والذي كان اكثر ايجابية لدى مرضى الربو وعلى الاخص منهم اولئك الذين يرافق اصابتهم بالربو الخمج البكتيري ومنها Strepto. pneumoniae بشكل خاص . تبين من خلال العد التفريقي لخلايا الدم البيض ان هنالك ارتفاعا معنويا في اعداد خلايا الدم الحمضة في مرضى الربو بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . ومن ناحية اخرى فقد لوحظت علاقة معنوية بين الارتفاع في اعداد هذه الخلايا ولارتفاع في مستويات الضد IgE وكذلك مع فعالية الجلد التي يبديها مرضى الربو. تم تقدير الفعالية الحجمية لانزيم (ADA) في امصال مرضى الربو باستخدام الطريقة الانزيمية ، لوحظ من خلالها ارتفاعا معنويا في فعاليته لدى هؤلاء المرضى وعلى الاخص لدى الاناث مقارنة بالذكور .4 - باستخدام تقنية الامتصاص الذري اللهبي لتحديد مستويات العناصر Fe وZn وCu وتقنية الامتصاص الذري اللالهبي لتحديد مستويات Se وMg هذا وقد لوحظت ان هنالك انخفاضا في مستويات العناصر Fe وCu وMg وSe وارتفاعا معنويا في مستوى عنصر Zn في امصال مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة | Asthma is a chronic inflammatory disorder of the airways. Its aetiology is multifactorial , in which non - allergic triggers and allergic factors have role to play. The present study is concerned mainly with allergic asthma, and the results can be summarized as the following : 1 - To investigate the relationship between air spora and the clinical expression of asthma in Iraqi patients, a quantitative and qualitative study of indoor and outdoor airborn fungi was carried out during the period January 2001 - December 2002 . The results revealed that the spore density depends on seasonal and climatic changes. The common observed genera, arranged according to their density, were/Aspergillus nigar, Penicillium, Aspergillus flavous, Alternaria, and Cladosporium . The role of the majority of such fungi in induction of allergy was evaluated in 116 asthmatic patients (66 males and 50 females) with an age range 5 - 70 years, in addition to 45 apparently healthy individuals as a control group, by using skin prick test. The highest proportion of those patients (89.7%) showed skin reactivity to the allergen HDM , followed by MMI (75.0%), HD (63.8%), MM2 (48.3%), MM3 (19.8%) and MM5 (16.8%) . Also a positive correlation was observed between the occurrence of these fungi (inside and outside the houses of those patients) and their responsiveness . Measuring serum specific IgE using ELISA technique revealed that the most frequent specific IgE was for Penicillium , Aspergillus and Alternaria. 2 - To provide further insight about the role of bacterial infection that deteriorate asthma attack, sputum cultures were done for 68 patients with asthma . Six bacterial species were isolated, in which Strepto. pneumoniae showed the highest percentage (35.2%), followed by Staph. aureus (30.9%), H. influenza (7.3%), Strepto. pyogenes, staph. epidermidis and N. cattarnhalis (4.4%) for each. Also, nine isolates of Candida albicans were isolated from those patients, to which a skin test response was highly positive among them. Antibiotic sensitivity was done for the bacterial isolates. The majority of those isolates revealed high sensitivity to the antibiotics ciprofloxacin, augmentin and cefatoxime, while, they were resistant to ampicillin, cloxacillin, tetracycline, and erythromycin. 3 - To shed some light on the immune status of patients with asthma the total level of serum immunoglobulins (IgA, IgG, and IgM) and complement components (C3 and C4) were evaluated by using single Radial Immunodiffusion assay (SRID). Serum level of total IgE was also evaluated, but by ELISA technique. The results showed that the mean serum levels of IgG and IgA were significantly decreased in patients with asthma as compared to controls while C3 level showed a significant increase. However, the mean serum level of IgM and C4 showed no much deviation due to asthma. With ranged to the evaluation of total IgE level, the result revealed a significant elevation in the level of this immunoglobulin in sera of patients in comparison to healthy individually. Additionally a significant difference in the levels of total IgE was augmented between both sexes of patients. There was some differences in the degree of positive its of agglutination reaction for the factor C.R.P., such reaction was more positive in patients with asthma, especially those with bacterial infections with special regard to Strepto. pneumonia. Differential count of while blood cells illustrated that eosinophils were significantly higher in patients with asthma compared to the control group . On the other hand a significant correlation was noted between the elevation of eosinophil count and the elevated level of IgE antibody and skin reactivity of asthmatic patients. Volume activity of adenosine deaminase enzyme in serum of asthmatic patients revealed a significant increased activity in the patients especially the females compared to males.4 - Trace elements (Fe, Cu, and Zn) assessment was carried out by flame atomic absorption and the more sensitive flameless atomic absorption (Se and Mg) . A significant decrease in Fe, Cu, Se ad Mg, and a significant increase in Zn were clearly observed in asthmatic patients as compared with control group.

التغيرات النسجية والنسجية الشكليائية القياسية لعقار الليفيتراسيتام في بعض اعضاء الجهاز التكاثري في الفئران البيض == Histological and Histomorphological Changes of Levetiracetam Drug in Some Reproductive Organs in White Mice

Author name: فائزة جبار جودة الربيعي
Supervisor name: نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was conducted to study the effects of Levetircetam (LEV) drug at concentration of 350 mg/kg/day body weight on selected organs of male and female reproductive system in albino mice, Mus muculus (Swiss mice). The animals divided into three treated groups, the first group treated once a day for 14 days, the second group treated once a day for 30 day and the third group treated once a day for 45 days, in addition to 3 control groups one for each treated group.The results of the present study declare the following : • Selected organs of male reproductive system (testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis).The results revealed significant degrease (P<0.05) in the percentages of the weight of testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis in treated animals for 14, 30, 45 days respectively in comparison with control group. The results also showed significant decrease (P<0.05) in percentages spermatogonia of the treated animals, when compare with control group. The percentages of the primary spermatocyte, secondary spermatocyte and spermatid increased significantly (P<0.05) in all three treated groups when compare with control groups and significant decrease (P<0.05) in percentage of spermatozoa, number of Sertoli cells, Leydig cells and diameter of Leydig cells nuclei. The mean diameter and thickness of somniferous tubules and height of epit helial cells and thickness of the tubules in the caput (head) and cauda (tail) epididymis in treated animal when compare with control group.The results of present study also showed that treatment with drug lead to histopathological changes in testes of animals treated with drug when compared with control groups such as degeneration, necrosis of spermatogenic cell and vacuolated of some seminiferous tubules, hypotrophy of interstitial and accumulation of spermatid at different stages of spermatogenic cells in lumen of tubules and degeneration of some of Leydig and separation of Sertoli cells from the basement membrane. Also results of percent study revealed some histopathological changes in caput (head) and cauda (tail) epididymis of treated animals with drug when compared with control groups, these change represented by degeneration some of epithelial cells and detachment of basement embrane and appearance of phagocytes in lumen of tubules and degeneration of epithelial cells and appearance of vacuoles between epithelial cells in addition to the damage of tubules. • Selected organs of female reproductive system significant increase (P<0.05), mean weight of ovary, oviducts and uterus of treated animals with drug for 14, 30, 45 days in comparison compared with control groups.Significant decrease (P<0.05) number of primary follicles and significant increase (P<0.05) in number of secondary follicles and significant increase (P<0.05) number of mature follicles of treated animals with drug about 14, 30, 45 days when compared with control group, significant increase (P<0.05) in number follicular cysts and corpus lutues of treated animals with drug when compared with the control groups, and significant decrease (P<0.05) diameter of growth follicles and corpus luteus and significantlyincrease (P<0.05) in diameters follicular cysts of treated animals with drug when compared with control groups. The results revealed some histopathological changes in ovary of treated animals with drug for when compared with the control groups, these changes represented by hypertrophy of cortex, degeneration of granular layer and accumulated some of cells in the middle of follicular lumen, degeneration in ovum and situated at the central position with increasing in the number of follicular cysts, separated of ovum from columns ovum, appearance of some abnormal ovum in some of follicles of ovaries.Significant decrease (P<0.05) in height and numbers of mucus folds in ampula and isthmus regions in oviduct of treated animals with drug when compared with control groups in addition to replacement of the ciliated columnar cells by cuboidal cell with the degreasing in the density of the cilia and the height of the secretory cells in addition hemorrhage, necrosis, hypoplasia and death of the columnar epithelial cells of the mucus folds, with the appearance of vacuoles, phagocytes in the center of the lumen,hypertrophy and hyperplasia in the tunica muscularis. Results also showed significant decrease (P<0.05) in numbers of endometrial glands of treated animals with drug when compared with control and significant increase (P<0.05) number of blood of treated animals with drugs when compared with control group and appearance significant increase (P<0.05) in high of epithelial cells of endometrium and thickness of lamina propria of three treated animals with drugs when compared with control group.The results revealed a histopathological changes in endometrium of treated animals with drug when compared with control such as hyperplasia and hypertrophy the epithelial layer and lamina propria and atrophy of endometrial glands and hyperplasia in epithelial of endometrial gland and detached basement membrane in some of them

دراسة بعض الجوانب المناعية والجزيئية في المرضى المصابين بداء المقوسات العيني == Study of some Immunological and Molecular Aspects in Ocular Toxoplasmosis Patients

Author name: علي نزار ياسين
Supervisor name: اسراء قاسم العبيدي | وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current study was conducted on 179 patients who attended the Retina Unit in Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital in Baghdad from the beginning of March to the end of September 2014. The patients were divided a according to the clinical diagnosis to 3 roups; the first included 50 patients infected with ocular toxoplasmosis(OT) while 45 patients with uveitis ; In addition a control group was of 84 apparently healthy individuals (they don’t have any infection in their eyes.) was included. The sera patients were initially diagnosed by immune Latex test. The results showed that all the ocular toxoplasmosis patients (100%) were positive while none of the uveitis patients gave positive result, In control group,30 cases were infected with toxoplasmosis(35.7%) with a significant differences between the three groups (p<0.01). ELISA test results for specific T. gondii IgG and IgM antibodies for were 84% positive to ocular toxoplasmosis as 42 patients versus 16% as 8 cases with negative test, while the positive rate in uveitis patients was 31.1% and considered as positive uveitis group, versus 31 negative case with rate 68.9%.The control group was reevaluated showed 35 positive case from 84 and formed a group called Asymptomatic toxoplasmosis. The levels of specific IgG and IgM were measured by international unit / ml.for all groups. The IgG level was 1.661 ± 0.187 IU/ml. in O.T. group followed by positive uveitis group 1.596 ± 0.157 and Asymptomatic toxoplasmosis group 1.501± 0.257 while negative uveitis group and control were recorded 0.389± 0.190 and 0.350 ± 0.167 respectively.IgM levels were increase in O.T. group 1.922 ±0.510 followed by positive uveitis group 1.867 ± 0.061 then asymptomatic toxoplasmosis came 1.744 ± 0.070. Finally the negative uveitis and control groups were registered 0.632 ± 0.166 and 0.618 ± 0.236 respectively.The study of some properties, coupled with ocular toxoplasmosis, including the sex and age for positive IgG antibody groups as it reflected the probability of female to male rate of 74.28% and 25.72%, respectively for OT group, while positive uveitis 58.33% and 41.67% respectively. Asymptomatic toxoplasmosis group has recorded 53.33% and 46.67%, respectively, with no significant differences between the three groups. The age variable has the results of the current study showed no significant differences between positive IgG antibody groups, as OT group focused within the age range 40 - 49 years and 60 - 70 years and similar rate of 22.88%, while positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis groups focused within at the age range 20 - 29 years and 33.33% and 30% respectively. As for positive IgM antibody groups and sex differences, with no significant differences recorded as OT group of males 71.43% and females 28.57%, while asymptomatic toxoplasmosis group 60% for males and 40% for females recorded. The positive uveitisgroup was limited to females only 100%. As well as not significant differences between positive IgM antibody groups were recorded for variable of age as it was OT group within the age range 30 - 39 years and 50 - 59 years with a similar rate 28.57% and 40 - 49 years by 42.86%. As positive uveitis group was within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate 50%, while asymptomatic toxoplasmosis group within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate of 40% and 40 - 49 years by 20%.Investigation of a specific part of B1 gene in size 469 base pair for positive cases to ELISA test was done by conventional PCR test. O.T. group recorded 10 positive results from 42 patients in 23.8% percent, while positive uveitis group that has 14 patients in which only 3 positive cases in 21.4 percent. Three positive cases was recorded also in asymptomatic toxoplasmosis group in 8.6% percent. No significant differences for this test between studied groups in probability (p.0.05). Real - time PCR was applied also on a positive studied groups to ELISA test also.O.T. group recorded 14 positive case in 33.3% percent, positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis registered only 7 case in rate 50% and 20% respectively, No significant differences for real - time PCR in probability (p.0.05) between the three groups.The present study included als o that contain measuring changes in thelevels of some cytokines that estimated by pg. /ml. for all studied groups.The level of IL - 4 in positive uveitis group reached to 28.22 ± 7.74 followed by asymptomatic toxoplasmosis group 26.72 ± 3.72.then O.T.group 21.39 ± 5.03 while negative uveitis group reached a concentration 16.17 ± 5.66,control group came finally and reached lowest concentration 5.08 ± 2.8.High level of IL - 6 was in O.T. group 33.09 ± 19.57 and positive uveitis group 22.26 ± 9.74 then asymptomatic toxoplasmosis 16.83± 6.06, negative uveitis registered 15.94 ± 6.11,control group came to record the lowest concentration 11.70 ± 5.44. An increase in IL - 10 was record in O.T.gruop 24.24 ± 6.27 followed by negative uveitis group 21.35 ±7.64 then asymptomatic toxoplasmosis group 19.15± 3.95 while positive uveitis showed a level 17.65 ± 2.75,the lowest level was in control group 14.28 ± 2.79. High level of Interferon - gamma Inducible Protein - 10 ( IP - 10 ) was got in O.T. group in a concentration 22.66 ± 3.48followed by positive uveitis group 17.09 ± 1.97, then negative uveitis group 16.91± 3.02. Asymptomatic toxoplasmosis group reached 16.89 ± 2.46 and lowest concentration in control group 14.78 ± 2.26.Granulocytes - macrophages colonies stimulating ( GM - CSF) registered a highest level in positive uveitis 47.44 ± 15.04 followed by O.T. group 45.14 ±10.05 the negative uveitis group 43.12± 9.35 and Asymptomatic toxoplasmosis record 39.26± 12.03 while control group the lowest concentration 29.44± 5.29.There were no significant differences between the studied groups (p.0.05). in the levels of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF).

بيئة وحياتية سمكتي الكارب الكرسين Carassius carassius (L.1758) والخشني Liza abu (Heckel,1843) في ذراع الثرثار - دجلة ونهر دجلة == Ecology & Biology to Crucian Carp Carassius carassius L. and Khishni Liza abu (Heckel,1843) in Tharthar arm & Tigris River

Author name: علي عودة شاوردي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | عامر علي الشماع
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية اختيار اربع محطات اثنتين منها على ذراع الثرثار واثنتي على نهر دجلة لاجراء مقارنة عدد من العوامل البيئية مثل درجة الحرارة والاوكسجين الذائب وتركيز الاس الهيدروجيني والملوحة والشفافية واجراء مقارنة اخرى لكمية الهائمات النباتية والحيوانية واحياء القاع. فضلا عن دراسة حياتية نوعين من الاسماك هما سمكة الكارب الكرسين Carassius carassius L. والخشني Liza abu (Heckel,1843) والمتمثلة بدراسة العمر والنمو والتغذية والتكاثر في بيئتين مختلفتين هما ذراع الثرثار ونهر دجلة مع تشخيص لانواع الاسماك المتوافرة في نهر دجلة ضمن حدود مدينة بغداد.جمعت العينات ابتداء من شهر اذار 2004 وحتى كانون الثاني 2005 بالنسبة لدراسة العوامل البيئية وحياتية النوعين اعلاه وبواقع نموذج واحد لكل شهرين. تراوحت درجة حرارة المياه في منطقتي الدراسة بين 10م كادنى قيمة خلال شهر كانون الثاني و28م كاعلى قيمة لها خلال شهر تموز على الذراع واتخذت نمطا متشابها لها في الموقعين المدروسين وتراوحت قراءات قرص ساكي بين 28سم في خلال شهر ايلول في نهر دجلة و242سم خلال كانون الثاني على الذراع. كما تراوحت تراكيز الاوكسجين الذائب في الماء بين 6 ملغم/لتر خلال شهر تشرين الثاني على الذراع و10.8ملغم/لتر كحد اعلى في المحطة نفسها خلال ايار على الذراع ايضا. كما سجلت اعلى قيم الملوحة في الذراع) خلال اذار 2004 اذ بلغت قيمتها 1.422 غم /لتر. بينما سجلت ادنى مستوى لها على نهر دجلة خلال شهر تشرين الثاني اذ بلغت 0.480غم /لتر. وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني pH بين 6.6 في المحطة (4) على نهر دجلة خلال شهر كانون الثاني، و8.4 خلال شهر تشرين الثاني على ذراع الثرثار .واوضحت الدراسة ان التواجد السنوي للهائمات النباتية في ذراع الثرثار اقل منه في نهر دجلة، وسجلت الدايتومات Bacillariophyceae تواجدا عاليا مقارنة بصنوف الهائمات النباتية الاخرى مسجلة النسب 92.56%، 92.01%، 96.35% ، 95.45% في محطات الدراسة الاربع على التوالي. جاءت بعدها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. وسجلت الهائمات الحيوانية اعلى نسب تواجد لها في نهر دجلة مقارنة بالذراع وجاءت الدولابيات في المرتبة الاولى 91.65%، 86.65% في الذراع 91.87%، 89.42% في نهر دجلة تلتها مجدافية الاقدام. وسجلت احياء القاع اعلى تواجد لها في الذراع 336 فرد/م2 ، 286 فرد/م2 بينما سجلت 126 فرد/م2 ، و178 فرد/م2 في محطتي نهر دجلة على التوالي. تراوحت الاطوال الكلية لسمكة الكارب الكرسين على الذراع بين 7.0 - 27.5 سم واوزانها بين 5 - 300غم وفي نهر دجلة بين 7.5 - 23.25سم و65 - 210.5غم للاطوال والاوزان على التوالي. كما بينت الدراسة ان نمو سمكة الكارب الكرسين ليس قياسيا. وان نموها في الذراع ونهر دجلة كان لصالح الوزن ، اذ بلغت قيمة (b) في اسماك الذراع (3.62) و(3.40) لاسماك الذراع ونهر دجلة. اما سمكة الخشني فتراوحت اطوالها بين 8.0 - 17.9سم واوزانها بين 7.0 - 95.0غم في الذراع وبين 9.0 - 15.5 سم و8.5 - 55.5غم في نهر دجلة للطول والوزن الكلي على التوالي. وبينت الدراسة زيادة في نمو الاسماك باتجاه الزيادة في مكعب الطول على حساب الوزن. وان معدل نموها النسبي في ذراع الثرثار افضل حالا منه في نهر دجلة اذ كانت قيمة (b) لاسماك الخشني المصيدة في الذراع (2.90) وفي نهر دجلة (2.80). تراوحت شدة التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 10.83 و23.33 درجة/سمكة. ولسمكة الخشني بين 9.75 و25.71 درجة /سمكة. بينما تراوح نشاط التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 33.33% و100% ولسمكة الخشني 81.81% و100%، وان سمكة الكارب الكرسين قارتةOmnivorous وتميل بشكل كبير الى الغذاء النباتي الاصل وقد شكل الفتات العضوي الجزء الاكبر من غذائها في كلا الموقعين المدروسين تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة، ولم تختلف مفردات غذائها المتناول في كلا المسطحين المدروسين. كما بينت الدراسة ان سمكة الخشني هي قارتة ايضا Omnivorous تعتمد في غذائها على المصادر ذات الاصل النباتي وان الفتات العضوي هو المكون الرئيس في غذائها الذي حل بالمرتبة الاولى تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. ولم يحصل اختلاف في نوع غذاء هذه السمكة في موقعي الدراسة. وتبين الدراسة ان كلتا السمكتين المدروستين تتناولان غذاءهما من القاع او قريبا منه. اوضحت الدراسة ان نسبة الجنس لسمكة الكارب الكرسين في ذراع الثرثار2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 1.8 : 1 وان لهذا النوع قمة اطلاق واحدة تمتد من منتصف ايار ولغاية تموز وان التبويض فيها حصصي. وان خصوبة هذا النوع عالية وان البيئتين ملائمتان لتكاثر هذا النوع اما عن تكاثر سمكة الخشني فقد بلغت نسبة الجنس في الذراع 2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 2.11 : 1 وان لهذا النوع دورة تكاثرية متتابعة تستمر عاما كاملا ولها قمة اطلاق واحدة تمتد من شهر شباط ولغاية شهر اذار وان التبويض فيها حصصي وقد تصل الى ثلاث دفعات . وتمتاز بخصوبة عالية.

بعض الجوانب المرضية للمصابين بالحمى غير معروفة الاسباب == CERTAIN PATHOLOGICAL ASPECTS ON FEVER OF UNKNOWN ORIGIN PATIENTS

Author name: علي جبار عليوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على ثلاث مجاميع مختلفة، كانت المجموعة الاولى بعدد 59 مريض بالحمى غير محددة الاسباب (FUO) والمجموعة الثانية بعدد 20 مريض بحمى مشخصة (febrile) والتي اعتبرت لمعاملات سيطرة للمجموعة الاولى، اما المجموعة الثالثة بعدد 20 شخص، كانوا اصحاء ظاهريا وتمثل مجموعة السيطرة للدراسة.تمت المتابعة واخذ العينات من المرضى والعمل عليها في مستشفى الكاظمية التعليمي، بغداد.لقد عانى مرضى FUO من اعراض مالوفة مثل الحمى المستمرة والمتقطعة، الصداع، الم الصدر، الم المفاصل، نقصان الوزن وضعف عام وفقدان الشهية وغيرها، وعلامات مرضية منها الم في الضغط على البطن، وتضخم الطحال، واليرقان، وتورم الساق وتقرحات اللسان والجلد. ان مجموعة مرضى FUO اشتركوا كون جميعهم يعانون من الحمى التي تراوحت مدتها من شهر الى ستة اشهر.تم التعرف على الاعراض السريرية من قبل الاختصاصي الموجود واجريت فحوصات المختبرية لجميع المرضى الراقدين والمشمولين بالدراسة اضافة الى فحوصات من مراكز بحثية اخرى ذات صلة بالموضوع.ان البيانات المتحصل عليها اخضعت للتحليل الاحصائي المناسب وبمختلف الطرق.اظهرت الدراسة بان مرضى FUO بسبب الاصابات المرضية المعدية يشكلون (n = 43)% 72.8) من العدد الكلي لهم (59) ثم قسموا بعد التشخيص النهائي بحسب المرض المعدي الى مرضى الحمى المعوية Enteric fever بواقع (n= 14)% 23.7 ومرضى ذات الرئة والتهاب القصبات بنسبة (n= 11) 18.6%، اما نسبة (n=6) 10.1% من المرضى فقد كانت متساوية لكل من مرضى التدرن الرئوي Tuberculosis(TB)، والتهاب المجاري البولية Urinary tract infection(UTI) ومجموعة اصابات مرضية اخرى Other infections. ومن خلال الدراسة ايضا ظهرت نسبة من المرضى (n=16) 27.12 بسبب امراض اخرى وبنسب مختلفة كما في امراض النسيج الوعائي Collagen vascular diseases (n= 4) 6.7%، ومرض التهاب بطانة القلب Endocarditis (n= 3) 5%، ومرضى الامراض الخبيثة Malignancies (n= 2) 3.3% واخيرا نسبة (n= 7) 11.8% من مرضى FUO هم المرضى غير المشخصين. ان مناقشة اربع من الثوابت الرئيسة المدروسة لها اهمية في التفريق بين مختلف حالات FUO وهذه الثوابت هي : 1 - الثوابت الدمية Haematological parameters.2 - الثوابت الكيموحيوية Biochemical parameters.3 - الثوابت المناعية Immunological parameters.4 - الثوابت الجرثومية Microbiological parameters.1 - اهمية الثوابت الدمية : كانت اعلى قيمة لنتائج فحص معدل ترسيب كريات الدم الحمراء Erythrocyte sedimentation rote (EsR) عند مرضى المناعة الذاتية، وذات معنوية قليلة لهذا الثابت عند مختلف حالات FUO الاخرى.2 - اهمية الثوابت الكيموحيوية : لقد اظهرت البيانات بان مصل مرضى FUO له اهمية كبيرة في تقسيمهم من خلال تقدير اليوريا، والكرياتينين، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي، والبيليروبين الكلى، والالبومين، وتسبق الالبومين الى الكلوبيولين، في مصل هؤلاء المرضى.كما ان الترحيل الكهربائي لمصل مرضى FUO اظهر ارتفاعا في قيم α - 2 globulin, α - 1 globulin، مابين مصل مرضى FUO كما في مصل مجموعة الامراض الخبيثة، في حين هنالك ارتفاعا في قيمة β - globulin في مصل مرضى التهاب المجاري البولية، وارتفاعا في قيمة gammaglobulin بدليل زيادة اضداد IgM، وIgG في مصل مرضى المناعة الذاتية مقارنة مع مرضى FUO الاخرين.3 - اهمية الثوابت المناعية : اظهر فحص مصول مرضى FUO اعلى القيم لمختلف الاضداد ومنها Antistreptolysin O titer، وAntiproteinase antibodies، وAntimyeloperoxidase antibodies، وC - reactive protein، وRheumatiod factor وحسب المرض المشخص.ان مصل مرضى حمى التايفوئيد اظهر ارتفاعا في تركيز IL - 1α (72.2 pgm/ml) مقارنة مع مرضى FUO للاخرين، وكذلك ظهرت وزيادة في قيم كل من (CD25) IL - 2 receptor، وIL - 2 (153.2 pgm/ml، 8.6 pgm/ml على التوالي). في حين وجد اقل تركيزيين لـ(IL - 1α، IL - 2) في مصل مرضى الامراض الخبيثة.4 - اهمية الثوابت الجرثومية : اظهر الفحص الجرثومي تشخيص عزلات بكتريا بنسبة 40% Gram positive diplococci، وبنسبة 20% لكل من Gram negative bacilli، وGram positive cocci. ان نتائج زرع الدم لمرضى FUO اظهرت عزلات بكتريا بنسبة 33.3% لكل من Salmonella spp.، وStaphylococcus aureus، وEnterobacter spp. والمسؤولة عن امراض Salmonellosis، وEndocarditis وامراض بكتيرية اخرى.كما تم عزل كل من بكتريا Enterobacter spp.، وPseudomonas aeruginosa، وpneumoiae Streptococcus من عينات السائل الخلبي Pleural fliud وعلى ما يبدو فانهم العاملين المسببين لمرض ذات الرئة Pneumonitis ومرض التهاب الخلب Pleuritis بنسبة 33.3% من الزرع الكلى الموجب لعينات السائل الخلبي للمرض.اما بشان نتائج زرع الادرار الموجب فقد تم عزل وتشخيص كل من بكتريا Staphylococcus aureus، وE. coli، وKlebsiella spp. والتي تمثل نسبة 33.3% من الزرع الكلى لادرار المرضى والمسببة لمرض التهاب المجاري البولية (UTI).وعند زرع المسحات المختلفة (مسحات الجروح والقرح) تم تشخيص عزلات كل من بكتريا E. coli، وPseudomonas aeruginosa وهما العاملين المسببين الرئيسيين لمرض التهاب النسيج الخلوي Cellulitis.اظهرت نتائج اختبار حساسية العزلات للمضادات الحيوية بان المضاد الحيوي Amikacin يمتلك اعلى فعالية وبنسبة 88.9% ويليه المضاد الحيوي Ciprofloxacin بنسبة 58.3% تجاه العزلات المدروسة، في حين المضادين الحيويين Gentamycin، وCefotaxim كانا اقل فعالية تجاه العزلات وبنسبة 20% و12.5% على التوالي. | The importance of microbiological parameters : Bacterial isolates of sputum sample phowed that there was a 40% graw positive diplococci, gram positive cocci and gram negative bacilli showed a percentage of 20% of each.Blood culture for FUO patients demonstrated a 33.3% for each isolate of sacmorella spp., staphylococcus aurens, and Enterobacter spp., which they may be responsible for salmonellosis, endocaraditis and other bacterial infection diseases.Entarobater spp., Psendomonas aeruginosa as well as streptococcus pneumocial were isalated from a pleural fluid sample and it seems to be camsative agent for pneumonitis and pheuritis, this cause repersnet 33.3% out of the total preural fluid culture results.Urine culture results showed a positive culture result of Staphylococcus aureus, E. coli and Klebsiclla spp., and is considered as a causative agent for Urinary tract infection. This positive result represent about 33.3% of the total urine culture result wound and ulcer swabs showed a detection of E. coli and psendamamas areaginosa isolate which are the main causative agent for cellulites. Arihibiotic sensitive result showed that amikacim has the highest antibiotic activity 88.9% followed by ciprofloxacin 58.3%, while Gentamycin and cefotaxime revealed a 20% and 12.5% respectively
1 ... 61 62 63 64 65 ... 100