Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 1,146

استخلاص الايضيات الثانوية المنتجة من عزلات الستربتومايسيس في محافظة بابل == Extraction and Characterization of Secondary Metabolites produced by Streptomyces spp. Isolates in Babylon Province

Author name: فرقان محمد حسين الاسدي
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | محمد صبري عبد الرزاق
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى استخلاص وتوصيف مركبات الايض الثانوي ذات الفعالية ضد البكتيرية والمنتجة من عزلات محلية لبكتريا الستربتومايسيس. تم خلال الدراسة جمع 98 عينة تربة مختلفة خلال الفترة من شباط الى نيسان 2014 من مناطق مختلفة في محافظة بابل/العراق. تم عزل وتشخيص وتوصيف عزلات الستربتومايسيس باستخدام طرق قياسية مختلفة فيما تم المسح الاولي واستخلاص وتنقية المركبات الفعالة باستخدام طرق قياسية مختلفة اخرى. تم تشخيص المركبات ذات الفعالية ضد البكتيرية باستخدام تقنية الغاز الكروماتوكرافي - مطياف الكتلة (GC - MS) فيما تم تحديد التركيز المثبط الادنى للمركبات الفعالة باستخدام طريقة التخفيف بالاكار. اظهرت النتائج ان 41 عزلة ستربتومايسيس قد تم تشخيصها وتوصيفها بالاعتماد على الخصائص المظهرية والفسلجية وكذلك تحديد الوان الهايفات الهوائية والغزل الارضي substrate mycelium للمستعمرات النامية. تم انتخاب عزلتين من الستربتومايسيس لدراسة التجارب الاخرى لكونها اظهرت اعلى فعالية ضد بكتيرية وهما العزلتان SMI - 04 وSMI - .10 تضمن المسح الاولي اختبار 41 عزلة Streptomyces ، اظهرت ستة منها فعالية جيدة ضد البكتيريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام (المكورات العنقودية الذهبية وبكتريا القولون)، فيما اظهر المسح الثانوي امتلاك عزلتين من الستربتومايسيس اعلى طيف فعالية ضد بكتيرية للبكتريا الموجبة لصبغة غرام ( Staphylococcus aureus , Staphylococcus epidermidis) والسالبة لصبغة غرام (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae). تم دراسة توفير الظروف المثلى لانتاج المركبات ذات الفعالية ضد البكتيرية باستخدام عوامل مختلفة تضمنت نوع الوسط الزرعي للانتاج (وسط فول الصويراقم - 1)، دالة الحموضة 7.0، فترة الحضانة 4 ايام بدرجة حرارة 30 مئوية بالنسبة للعزلة SMI - 04 فيما كانت ظروف الانتاج للعزلة SMI - 10 هي وسط فول الصويراقم - 1 كوسط زرعي، دالة الحموضة 7.0، وفترة الحضانة 5 ايام بدرجة حرارة 30 مئوية. وجد ان مزيج الميثانول والكلوروفورم (وبنسبة 1 : 2) هو افضل مذيب ذو قدرة استخلاص فائقة لمركبات الايض الثانوي ذات الفعالية ضد البكتيرية. تضمنت خطوات التنقية الجزئية استخدام الكروماتوكرافي الورقي مع مزيج الميثانول والكلوروفورم (وبنسبة 1 : 2) حيث اظهرت النتائج وجود بقعة ذات قيمة معامل سريان Rf (0.77) للعزلة SMI - 04 وبقعة اخرى ذات معامل سريان Rf (0.71) للعزلة SMI - 10 . اظهرت نتائج عمود الكروماتوكرافي ان اعلى فعالية ضد البكتيرية كانت في الجزء fraction (11) للعزلة SMI - 04 والجزء fraction رقم (9) للعزلة .SMI - 10 اظهرت نتائج استخدام تقنية الغاز الكروماتوكرافي - مطياف الكتلة (GC - MS) وجود مركبين ذات فعالية ضد البكتيرية هما eicosane من العزلة SMI - 04 وbutylated hydroxytoluene من العزلة SMI - 10. اظهرت النتائج ان قيم التركيز المثبط الادنى لمركب eicosane كانت 32 مكغ/ مل و64 مكغ/ مل لبكتيريا Staphylococcus aureus وEscherichia coli على التوالي بينما كانت قيم التركيز المثبط الادنى لمركب butylated hydroxytoluene 16 مكغ/ مل و32 مكغ/ مل لبكتيريا Staphylococcus aureus وEscherichia coli على التوالي والذي يظهر ان المركب الاخير ذو فعالية ضد البكتيرية اقوى من المركب الاول. واستنادا للمعلومات المتوافرة فان تشخيص هذين المركبين يعد اول تسجيل في عزلات الستريبتومايسيس في العراق | This study was aimed for extraction and characterization of antibacterial metabolites produced by local isolates of Streptomyces spp. in Babylon Province, Iraq. Ninety eight different soil samples were collected during the period from February to April 2014 from different areas in Babylon province/Iraq. Streptomyces isolation, identification and characterization involved different standard methods. Screening, extraction, and Partial purification of bioactive compounds were carried out using different standard techniques. The antibacterial compound in the active fraction was identified through Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) analysis. Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) for the identified compounds were determined using two - fold agar dilution method. Results revealed that forty one Streptomyces isolates were identified and characterized depending on the morphological (cultural and microscopical), physiological characteristics, and color determination. Two isolates (Streptomyces isolate SMI - 04 and SMI - 10) were selected because of their potent antibacterial activity in the screening test. Primary screening test involved testing of 41 Streptomyces isolates. Results exhibited that only six isolates showed significant antibacterial activity toward two test bacterial isolates (Staphylococcus aureus and Escherichia coli). Secondary screening test revealed that two isolates (Streptomyces isolates SMI - 04 and SMI - 10) had broad spectrum activity against two Gram - positive (Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis) and three Gram - negative (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae). Optimization of production conditions indicated that antibacterial productivity were applied using the following parameters (soya bean broth1 medium, pH adjusted at 7.0, and incubation time for 4 days at 30°C) for Streptomyces isolates SMI - 04 and soya bean broth1 medium, pH adjusted at 7.0, and incubation for 5 days at 30°C for Streptomyces isolate SMI - 10. Methanol with chloroform in a ratio of (2 : 1) was found to be the best solvent with maximum extraction capability for antibacterial metabolites. Partial purification steps including Thin Layer Chromatography (TLC) with methanol - chloroform in a ratio of (2 : 1 v/v) was the best mobile phase, one spot was visualized for isolate SMI - 04 with Rf value of 0.77 and one spot for isolate SMI - 10 with Rf value of 0.71. Column chromatography exhibited that two active fractions, fraction No.11 of isolate SMI - 04 and fraction No.9 of isolate SMI - 10 which gave considerable antibacterial activity. Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) technique indicated the presence of two compounds with antibacterial activity; eicosane for Streptomyces isolate SMI - 04 and butylated hydroxytoluene for Streptomyces isolate SMI - 10, which possessed potent antibacterial activity. Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) values of eicosane were 32µg/ml and 64µg/ml for Staphylococcus aureus and Escherichia coli, respectively while the MICs of butylated hydroxytoluene was 16 µg/ml for Staphylococcus aureus and 32 µg/ml for Escherichia coli which indicated the potent antibacterial activity of the latter compound. According to our knowledge, these antibacterial compounds are first recorded and identified from Streptomyces spp. in Iraq

تقييم الانزيمات المعدنية المحللة للبروتين - 9 MMP - 9 والانترلوكين - 18 (IL - 18) في دم الحبل السري والنسج البيني في الولادات القيصرية والمهبلية الطبيعية == Matrix Metalloproteinase - 9 and IL - 18 Level in Cord Blood and Tissue Matrix in Caesarean and Normal Vaginal Delivery

Author name: خوله عبد الحمزة شمران مشجل
Supervisor name: ريا سليمان صلاح الدين بابان | مي فاضل ماجد الحبيب
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ماتركس ميتالوبروتياز Matrix metalloproteinases اختصارا (MMPs) وهي انزيمات تعتمد على الزنك وتحتوي على اندوبيبتيداز endopeptidases . هذه الانزيمات لها القدرة على احداث التحلل في جميع انواع البروتينات للمصفوفة خارج الخلية، ولكن ايضا يمكن معالجة عدد من الجزيئات النشطة بيولوجيا. ومن المعروفة انها تقوم بالمشاركة في انشقاق والانقسام لمستقبلات سطح الخلية، واطلاق المعقدات المسؤولة عن موت الخلية (مثل معقد FAS)، وعدم تفعيل السيتوكينات cytokines. وايضا خلال فترة الحمل تحدث تغيرات فسيولوجية خاصة مثل نضج عنق الرحم، وتمزق الاغشية الجنينية، وانفصال المشيمة والذي تتطلب اعادة تشكيل المصفوفة خارج الخلية (ECM) . السيتوكين مثل الانترلوكين (IL - 18)يلعب دورا حاسما في دفاع المضيف، وانها قد تكون جزء في توفير حاجز لعنق الرحم/ ساقطي ضد الغزو الميكروبي من السائل الذي يحيط بالجنين وقد يكون بمثابة علامة لعنق الرحم للعدوى داخل الامنيوتك Amniotic. الاجهاد التاكسدي، وهي حاله تتميز بعدم التوازن بين الجزيئات المؤكسدة، بما في ذلك الانواع الاكسجين التفاعلية (ROS)، وبين دفاع المضادات للاكسدة Antioxidant . هذه ROS قد يسبب اصابات الانسجة مما يؤدي الى تلف البروتينات الخلوية داخل الخلايا ، والحمض النووي DNA التي تورطت في مضاعفات الحمل في بوقت مبكر اثناء المخاض، ويمكن ان يؤثر على طريقة الولادة . استجابة الجسم المناعية تتضمن المضادات للاكسدة الانزيمية وغير الانزيمية التي تقلل من تاثير هذه الجذور الحرة. تهدف هذه الدراسة الى تقييم العلاقة بين مستويات انزيم ماتركس ميتالوبروتياز - 9 (MMP - 9 )ووضعية الحمل. الطرق : في هذه الدراسة تم تعيين ستة واربعين النساء الحوامل (31 حاملا خضعن للولادة الطبيعية، 33 حاملا خضعن للولادة القيصرية. . تم جمع نموذج الدراسة من صالات النسائية والتوليد في مدينة الامامين الكاظمين الطبية خلال فترة من حزيران من 2015 الى تموز من 2016.واخذت موافقة النساء الحوامل قبل الدخول لصالة العمليات, وتم اخذ عينات من الدم وقطعة من النسيج جمعت خلال خمس دقائق من الحبل السري. تم جمع عينات الانسجة الحبل السري ايضا اثناء الولادة. واستخدمت عينات دم وانسجة لقياس الفلزي المصفوفة (MMP - 9)، وانترلوكين 18 (IL - 18)، وايضا تم استخدام نماذج الدم لقياس معدل جهد التاكسد في مصل الدم والمضادات للاكسدة (SOD) والعناصر النزرة. النتائج : اظهرت النتائج ان تدهور في المستويات الحيوية ل( MMP - 9و IL - 18) في الدم النساء اللواتي خضعن الولادة الطبيعية. وكانت عالية في النساء اللواتي خضعن للعملية القيصرية وبالاضافة الى ذلك، فان مستويات الانزيمات المضادة للاكسدة الاقل بين النساء اللواتي خضعن للولادة الطبيعية واعلى بين النساء اللواتي خضعن للعمليات القيصرية. وذكرت في الدراسة ايضا انخفاض كبير في مستوى العناصر النزرة المؤشرات الحيوية (الزنك والنحاس والمغنيسيوم) في الدم النساء اللواتي خضعن للعملية القيصرية مقارنة مع مجموعة النساء اللواتي خضعن الولادة الطبيعية. الفحص النسيجي للنسيج الحبل السري من النساء الحوامل كشفه عن نتائج مطابقة لنتائج فحوصات الدم حيث بينت عن ارتفاع معنوي في تركيز انزيم MMP - 9 والانترلوكين IL - 18 في النساء اللواتي خضعن للعملية القيصرية مقارنة مع مجموعة النساء اللواتي خضعن الولادة الطبيعية.الاستنتاجات : ارتبط الولادة الطبيعية مع زيادة الاكسدة وانخفاض في النشاط المضادة للاكسدة وفي المقابل انخفاض الاجهاد التاكسدي وزيادة في النشاط الانزيمي المضادة للاكسدة (SOD) في الولادات القيصرية ،. واضاف لذلك ارتبط الولادة الطبيعية بانخفاض معنوي في مستويات انزيم MMP - 9 والسايتوكينات IL - 18 مقارنة مع مجموعة النساء اللواتي خضعن الولادة الطبيعية. ومن ناحه اخرى اظهر الفحص النسيجي هنالك تركيزات عالية MMP - 9 وIL - 18 في الانسجة الحبل السري للمراة التي تخضع للعملية القيصرية بالمقارنة مع النساء اللواتي الولادة الطبيعية. | Matrix metalloproteinases (MMPs) are calcium - dependent zinc - containing endopeptidases. These enzymes are capable of degrading all kinds of extracellular matrix proteins, but also can process a number of bioactive molecules. They are known to be involved in the cleavage of cell surface receptors, the release of apoptotic ligands (such as the FAS ligand), and cytokine inactivation. During pregnancy, specific physiological changes such as cervical ripening, rupture of the fetal membranes, and placental detachment require the remodeling of the extracellular matrix (ECM). Cytokine like Interleukin - 18(IL - 18) play a critical role in host defense, and it may participate in providing a cervical/decidual barrier against microbial invasion of the amniotic fluid and might serve as a cervical marker for intra - amniotic infection. Oxidative Stress, a state characterized by an imbalance between pro - oxidant molecules, including reactive oxygen species (ROS), with antioxidant defense. These ROS may cause tissue injury resulting in cytotoxic damage to cellular proteins, and DNA which has been implicated in early pregnancy complications and during ,labor and may effect on mode of labor. Body defense response involves enzymatic and non - enzymatic antioxidant buffering pathways which reduce the effect of these free radicals. This study aimed to assess the relationship between matrix metalloproteinase enzyme levels and delivery mode and also an attempt to assess the impact of oxidative stress on maternal antioxidant defense during labour and correlate it with mode of parturition. Methods : A case - control study design was employed in this study. Sixty four pregnant women were recruited 31 term pregnant women with normal vaginal delivery and 33 term pregnant women underwent cesarean section delivery. At the time of their admission to operation theatre, blood samples were taken and a piece of tissue was collected from umbilical cord after delivery . Blood and tissue samples were used to measure matrix metalloproteinase (MMP - 9), Interleukin - 18 (IL - 18), Superoxide Dismutase (SOD) activity and trace elements levels was determined in the umbilical cord blood only. Placental tissue was prepared and stained for histological assessment. Anti - MMP - 9 and Anti - IL - 18 monoclonal antibody laboratory kits were employed to demonstrate degradation and cytokine levels in umbilical cord tissue. Results : results showed that both blood MMP - 9 and IL - 18 levels were significantly higher in term women who underwent cesarean section compared with those women who underwent normal vaginal delivery. In addition, the enzymatic anti - oxidant SOD was significantly lowest among term women who underwent normal vaginal delivery when compared term women who underwent cesarean section. The present study also reported a significant decreases in level of trace elements (Zn, Cu and Mg) in blood of term women who underwent NVD compared those a with C/S labor (P<0.01). The histological examination of umbilical cord tissue revealed that term women underwent normal vaginal delivery group had the lowest reactivity with both anti - MMP - 9 and anti - IL - 18 monoclonal antibody in comparison to term women underwent cesarean section group. From the study it was concluded that term pregnancy women underwent normal vaginal delivery was associated with increased oxidative stress and decreased anti - oxidant activity. In contrast, term pregnancy underwent cesarean section was associated with low oxidative stress status and high enzymatic anti - oxidant activity (SOD). In other hand, pregnancy underwent with cesarean section was significantly associated with high levels of serum MMP - 9 and IL - 18 and high level of enzymatic anti - oxidant activity (SOD). While the Histological examination showed high MMP - 9 and IL - 18 concentrations in the umbilical cord tissue of term women underwent cesarean section in comparison to term women underwent normal vaginal delivery

تعدد الاشكال الجيني للكالكتين - ? في مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي == Galectin - 8 Gene Polymorphism In Rheumatoid Arthritis Patients

Author name: طارق قادر طلاب
Supervisor name: محمد عبد الاخوة الفحام | فائق ايشو كوريال
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: التهاب المفاصل الروماتويدي هو مرض التهاب المفاصل الالتهابي المزمن مع معدلات كبيرة للمراضة والوفيات .التشخيص المبكر مهم للمعالجة وتحقيق افضل النتائج . لقد اجريت هذه الدراسة في الفترة ما بين بداية تشرين الثاني عام 2016 وحتى نهاية تشرين الثاني عام 2017 على 90 شخصا تم تشخيص 50 منهم على انهم مصابين بالتهاب المفاصل الروماتويدي (مجموعة المرضى) الذين كانوا يحضرون للعيادة الخارجية للمفاصل بمستشفى بغداد التعليمي وكان هناك ايضا 40 اخرون من مجموعة الاصحاء. تم جمع عينات الدم من المرضى والاصحاء لاكتشاف تعدد الاشكال الجيني للكالكتين - 8 والذي تم اجراؤه بواسطة تفاعل سلسلة البوليميريز الخاص بتضخيم الطفرة (ARMS - PCR)كما تم تقييم مستوى الكالكتين - 8 والاجسام المضادة لل CCP في مصل الدم بواسطة مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم ELISA)). تم قياس بروتين سي التفاعلي( CRP) بواسطة nephlometer كما تم فحص العامل الروماتويدي RF) ) بواسطة طريقة تراص اللاتكس . كان مجموع مرضى الدراسة الحالية 50 مريضا، كان متوسط اعمارهم (10.4±46.5) سنة ، وكانت نسبة الاناث سائدة اكثر من الذكور في نسبة (F : M 2.6 : 1). لقد اوضحت الدراسة الحالية انه لم يكن هناك اختلاف كبير بين المرضى والاصحاء في ما يتعلق بتعدد الاشكال الجيني للكالكتين - 8 وكشفت الدراسة الحالية ان مستوى الكالكتين - 8 كان اعلى في مجموعة الاصحاء (87.83 ± 182.93) من مجموعة المرضى ( 36.68± 25.79 ) وهذا الفرق ذو دلالة احصائية (P<0.001 ) ,في ما يتعلق بالاجسام المضادة للCCP فقد تم اكتشافها في 45 من المرضى بينما كانت سالب في جميع عناصر مجموعة الاصحاء والفرق كان ذو دلالة احصائية P <0.001 ) ) ,كما اظهرت الدراسة ان بروتين سي التفاعلي كان موجبا في 25 مريضا وفي 11 فردا من مجموعة الاصحاء وهذا الفرق ذو قيمة احصائية (p= 0.03), كما كشفت النتائج الحالية ان اختبار العامل الروماتويدي كان موجبا في 25 مريضا وكذلك 9 افراد من مجموعة الاصحاء وهذا الفرق ذو دلالة احصائية (p= 0.007) ,كما ان معدل ترسيب الدم لمجموعة المرضى اعلى من مجموعة الاصحاء وذو دلالة احصائية عالية (P <0.0001 ) . لقد اوضحت الدراسة انه لم يكن هناك اي اختلاف ملحوظ بين مجموعة المرضى ومجموعة الاصحاء فيما يتعلق بتعدد الاشكال الجيني للكالكتين - 8كما بينت الدراسة ان لمستوى الكالكتين - 8 في مصل الدم نتائج ممتازة للتمييز بين مجموعة المرضى ومجموعة الاصحاء.ان مستويات الكالكتين - 8 كانت اعلى في مجموعة الاصحاء من مجموعة المرضى , كان هناك ارتباط كبير سلبي بين مستويات الكالكتين - 8 والاجسام المضادة للCCPومعدل ترسيب الدم والعامل الروماتزمي وهذا يشير الى ان مستوى منخفض من الكالاكتين - 8 يرتبط بشكل كبير مع مستوى عال ( مستوى متزايد) من الاجسام المضادة للCCPومعدل ترسيب الدم والعامل الروماتويدي ، وبالتالي يمكن ان يشير الى نشاط المرض وشدته. | Rheumatoid arthritis is chronic inflammatory arthritis disease with significant morbidity and mortality .Early diagnosis is important for beter treatment and outcome. Galectins are potent immune regulators and modulate a range of pathological processes, such as inflammation, autoimmunity, and cancer, Accumulated evidence shows that several family members of galectins play positive or negative roles in the disease development of RA, through their effects on T and B lymphocytes, myeloid lineage cells, and fibroblast - like synoviocytes. This case controls study assess the association between serum galactin - 8 gene polymorphism in RA and controls .And also measure the serum level of Galectin - 8 in RA patient and controls and its validity in early diagnosis. Patients and Methods : This study was conducted in the period between November 2016 till the end of November 2017 on ninety (90) subjects, fifty (50) of them (patient group) were diagnosed as established RA patients, who were attending the Rheumatology Outpatient Clinic of Baghdad Teaching hospital, and other forty (40) were apparently healthy control group. Blood samples were collected from patients and controls to assess serum galectin - 8 and ACCP by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA), the CRP was measured by nephlometer, and RF by latex agglutination method, Whereas Galectin - 8 gene Polymorphism done by Amplification - Refractory Mutation System - PCR (ARMS - PCR).Results : 50 case study group included in the current study, their mean age 46.5±10.4 years, the females were predominant than males in a ratio (F : M 2.6 : 1). The current study revealed that serum levels of galectin - 8) higher in control group (182.93±87.83) than patient group (36.68±25.79) and this difference is statistically significant (P - value < 0.001).At the optimum cut off value of serum gal - 8 ≤ 95.7 we found that maximum accuracy was 95.6 , sensitivity 98.0%, specifity 92.5% and AUC was 0.971 this indicate that the biomarker has excellent valid results to differentiate bet patient and control. In the present study there was negative significant correlation between serum galectin - 8 and ESR,ACCP,RF. there was no significant difference between patients and controls regarding galectin - 8 gene polymorphism. TT allele had the highest association with RA while AT allele had the weakest association with RA, however; all these alleles did not associated significantly with RA.Anti - CCP antibodies were detected in 45 (90.0%) patients and were not detected only in 5 (10.0%) patients. Out of 40 healthy controls; the anti - CCP was negative in all healthy controls (100.0%), , with extremely statistical difference (P <0.001) between the patients and healthy control group. The present study showed that CRP was positive in 25 patients (50.0 %), and in 11 subjects (27.5%) from control group and this difference is statistically significant p - value= 0.03The present findings revealed that RF test was positive in only 25 patients (50.0%), and was positive in nine subjects (22.5%) from control group and this difference was statistically significant (P - Value = 0.007 ), Mean level of ESR of patient group higher than control group and is highly statistically significant (P - Value < 0.0001).Conclusions : The study shown that there was no significant difference between patient and controls regarding galectin - 8 gene polymorphism, and there was significantly less serum galectin - 8 in patient compared to control, also there was negative significant correlation between serum galectin - 8 and ESR,ACCP,RF.At the optimum cut off value of serum gal - 8 ≤ 95.7 we found that maximum accuracy was 95.6 , sensitivity, specifity and AUC was 0.971 this indicate that the biomarker has excellent valid results to differentiate between patient and control

التقييم الوظيفي للبطين الايمن في مرضى ارتفاع الضغط الشرياني باستخدام تقنية شدة صدى القلب == Physiological Assessment of Right Ventricular Function in Patients with Systemic Hypertension Using Strain Echocardiography

Author name: حيدر عامر توفيق
Supervisor name: حنان لؤي العمري | غازي فرحان حاجي
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: البطين الايمن او البطين المنسي هو عبارة عن حجرة ذات شكل غير منتظم وتركيب هندسي معقد . على الرغم من ان التركيز كان في السابق على الجزء الايسر من القلب من الناحية الوظيفية والمرضية ، فهناك عدد متزايد من الادلة على اهمية البطين الايمن وخاصة اهميته في الحفاظ على استقرار الدورة الدموية للجسم ، مستوى النشاط في المرضى الذين يعانون من قصور القلب المزمن ومدى التحسن في المرضى الذين يعانون من امراض صمامات القلب.ارتفاع ضغط الدم الشرياني هو مشكلة صحية عامة رئيسية واسعة الانتشار على المستوى العالمي. تعرف امراض القلب الناتجة عن ارتفاع ضغط الدم باعتلال عضلة القلب الناتجة عن استجابة عضلة القلب للاجهاد الميكانيكي الناتج عن ارتفاع ضغط الدم وتاثير الهرمونات العصبية وعوامل النمو التي تؤدي الى تشوهات متنوعة تشمل تضخم البطين الايسر , الاضطراب الانقباضي والانبساطي ، ومضاعفاتها السريرية بما في ذلك عدم انتظام ضربات القلب وقصور القلب.في دراسة صدى القلب للبطين الايمن ، يجب اجراء التقييم الشامل باستخدام نوافذ صوتية متعددة وتقنيات مختلفة. ان طريقة تتبع البقع الصغيرة باستخدام تخطيط صدى القلب ثنائي الاتجاه هي طريقة جديدة لحساب تشوه عضلة القلب في الصور القياسية ذات المقياس الرمادي حيث كل قطعة صغيرة من عضلة القلب في صورة تخطيط صدى القلب لديها نمط فريد خاص بها من البقع.كان الهدف من هذه الدراسة هو : تقييم تاثير ارتفاع ضغط الدم الشرياني على وظيفة البطين الايمن الانقباضي والانبساطي مقارنة مع المجموعة الضابطة وتحديد تاثير ارتفاع ضغط الدم الشرياني على ميكانيكة البطين الايمن بقياس قيمة التشوه الطولي ثنائي البعد .وكان العدد الاجمالي المشمول في الدراسة ( 200 ) شخص من كلا الجنسين ( 118 من الرجال و82 من الاناث ) ، تتراوح اعمارهم من ( 40 - 60 ) سنة ، وتم تقسيمهم الى مجموعتين : 1 - 100 شخص من المرضى الذين يعانون من ارتفاع ضغط الدم الشرياني . 2 - 100 شخص من الاشخاص الاصحاء يمثلون المجموعة الضابطة. وقد تم اخذ التاريخ الطبي الكامل ، تخطيط القلب الكهربائي , قياس ضغط الدم , تصوير الصدر بالاشعة السينية وقياسات الطول والوزن لكل الاشخاص , تم اجراء تخطيط صدى القلب لجميع الاشخاص باستخدام جهاز GE Vivid E9® .نتائج هذه الدراسة اكدت وجود فرق معتد من الناحية الاحصائية فيما يتعلق بوظيفة البطين الايمن الانبساطية بين مجموعة المرضى والمجموعة الضابطة ( P = 0.001 ) .وفيما يتعلق في قياس قيمة التشوه في البطين الايمن كذلك اكدت الدراسة انخفاض قيمة التشوه في البطين الايمن للمرضى مقارنة بالمجموعة الضاغطة وكان الفرق معتد من الناحية الاحصائية ( P = 0.001 ) .و كشفت الدراسة ان نسبة الارجحية من الانحدار اللوجستي متعدد المتغيرات ان سمك الحاجز بين البطينين كان المؤثر الاكبر على قيمة التشوه في البطين الايمن .نتائج هذه الدراسة وضحت انخفاض نسبة التشوه الطولي للبطين الايمن وبالتالية تاثر الوظيفة الانقباضية عند مجموعة المرضى وعلاقة هذا التاثر القوية مع تضخم الحاجز بين البطينين الشيء الذي لم تستطع الفحوصات التقليدية في اكتشافه | The right ventricle or the forgotten chamber is multi - compartmental in orientation with a complex structural geometry. Although the focusing in cardiology was placed on left heart physiology and pathology in the past, there is a growing body of evidence for the importance of the RV especially the maintenance of normal body hemodynamics, exercise capacity in chronic heart failure and survival in patients with valvular heart disease. Arterial hypertension is a major public health problem due to its high prevalence globally. Hypertensive heart disease is the cardiomyopathy which result from myocardial response to the mechanical stress from elevated blood pressure , the influences of neurohormones , growth factors, and cytokines and then leads to variety of abnormalities includes left ventricular hypertrophy (LVH), systolic and diastolic dysfunction, and their clinical complication including arrhythmias and heart failure .In echocardiographic studies, a comprehensive assessment of the right ventricle should be performed using multiple acoustic windows and different image techniques .The two dimensions speckle tracking echocardiography is a novel non - invasive echocardiographic method to calculate myocardial deformation in standard grey - scale images in which every little piece of myocardium in echocardiography image has its own unique pattern of speckles. The aim of this study was to : evaluate the effect of systemic arterial hypertension on systolic and diastolic right ventricular function and to determine the effect of systemic arterial hypertension on right ventricle mechanics using two dimensional longitudinal strains.The total number of hypertensive patients and apparently healthy control subjects were (200) of either sex (118 male and 82 female), their age range from (40 - 60) year; they were divided into two groups : 100 Patients with hypertension, 100 apparently healthy control subjects. Each patient and control subject was submitted to full medical history, physical examination, ECG, chest X - Ray, blood pressure determination and subject’s anthropometry measurements. Echocardiography was performed for all subjects using a GE Vivid E9® system in which M - mode, two dimensional , color, pulse and continuous wave Doppler , tissue Doppler and speckle tracking imaging were obtained according to the American Society of Echocardiography guideline of using Echocardiography in Adult Hypertension.Trans - tricuspid E/A ratio was decreased in hypertensive group (1.10±0.12) versus (1.39±0.28) in normotensive group with statistically significant difference p value =0.001. The mean tricuspid E/ é ratio was (4.95±1.34) in hypertensive patients while was (3.90±0.98) in control group, the p value was 0.001 and there was significant difference between them. It was observed that the mean 2D - RVGLS was ( - 20.12 ± 3.80) % in hypertensive patients versus ( - 25.90 ± 2.18) in normal subjects, the P value was 0.001 and there was significant difference between the two groups. The odds ratio of multivariate logistic regression revealed that the diastolic interventricular septum thickness was the strongest factor affect RVGLS in this study, odds ratio for IVSD, RWT, and LVPW were respectively 2.418, 1.978, and 1.761. This study conclude that RV longitudinal strain is significantly impaired in hypertensive patients group and strongly correlates with heart remodeling and it is superior to more conventional functional parameters of RV systolic function.

تقويم معدل الاستنبات ومستوى السايتوكينات في المريضات المصابات بالعقم الغير مفسر بعد الخضوع لخدش بطانة الرحم == Evaluation of Implantation Rate and Cytokines Level of unexplained Infertile Patients Undergoing Induced Endometrial Scratching

Author name: ايمان حسن فليح
Supervisor name: عفان عزت حسن | الفت محمد علي النقاش
General topic: Medicine
Specific topic: Obstetrics and Gynecology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: العقم مشكلة عالمية تؤثر على الملايين من الازواج ،ان اقرب تعريف للعقم هو مرض يصيب الجهاز التناسلي ويؤدي الى الفشل في تحقيق الحمل السريري بعد مرور12 شهرا او اكثر من الجماع الجنسي غير المحمي.وقد اقترحت العديد من الدراسات وجود تاثير ايجابي في خدش بطانة الرحم المقصودة على معدل نجاح انغراس البيضة المخصبة، وخاصة في النساء اللاتي عانوا فشل متكرر او اجهاض متكرر او العقم بدون اسباب مبررة. احداث خدش في بطانة الرحم يعزز رد فعل التهابي وهو مفيد لتفضيل زرع الجنين. يتم تجنيد الخلايا القاتلة الطبيعية والبلاعم والخلايا الشجيرية في الموقع المصاب وكميات متزايدة من السايتوكينات وعوامل النمو والجاذبات الكيمياوية، مثل عامل النخر (TNF - α) وinterleukin - 6 (IL - 6) ، مما يعزز غرس ناجح.صممت الدراسة لتقصي تاثير خدش بطانة الرحم على افراز المصل والبطانة من TNF - α وIL - 6 ، وتاثيره على تعزيز عملية الزرع الناجحة. اجريت الدراسة في مستشفى العلوية التعليمي ومركزمتخصص لعلاج العقم في بغداد. سجلت هذه الدراسة مريضات يعانون من عقم غير مفسر لاكثر من سنة وبعمر اقل من 45 عاما. تم اجراء دراسة هرمونية اساسية ، وتم تقسيم عينة الدراسة كما هو محدد الى ثلاث مجموعات ، 31 (29.5 ٪) على الجماع العفوي الطبيعي ، 31 (29.5 ٪) للتلقيح داخل الرحم (IUI) و43 (41.0 ٪) للتخصيب الاصطناعي) الاخصاب خارج الجسم اوطفل الانبوب) ثم تعريض جميع المريضات الى خدش بطانة الرحم في اليوم 8 من الدورة الشهرية (الدورة التي سبقت دورة الاخصاب خارج الجسم اوطفل الانبوب في مجموعة الاخصاب الاصطناعي او طفل الانبوب) ، عن طريق استخدام الناظور الرحمي ، تم قياس TNF - α وIL - 6 في افرازات المصل والبطانة قبل وبعد الخدش.كانت معدلات الحمل 22 (33.33 ٪) ، 20 (30.30 ٪) ، و24 (36.4 ٪) عن مجموعة الجماع العفوي الطبيعي ، التلقيح داخل الرحم ، والتخصيب الاصطناعي، على التوالي ، وكانت حسابات الاختطار النسبي للحمل اعلى للمجموعة العفوية مع 1.194 RR ، 95٪ CI (0.892 - 1.1601) ، تليها مجموعة التلقيح داخل الرحم مع RR 1.038 ، 95٪ CI (0.757 - 1.423) ، وادنى في مجموعة التلقيح داخل الرحم ، مع RR 0.824 ، وCI 95٪ (0.600 - 1.131).من خلال قياس اثنين من اهم السيتوكينات في افرازات المصل والبطانة من المرضى المشاركين في هذه الدراسة قبل وبعد خدش بطانة الرحم ، وجد انه كان هناك فرق ذو دلالة احصائية (قيمة p <0.001) في TNF المصل والبطانة لانها كانت 3.84 ± 2.41 بيكوغرام / ديسيلتر ، و3.81 ± 2.30 بيكوغرام / ديسيلتر ، على التوالي ، وارتفعت الى 17.35 ± 6.39 بيكوغرام / ديسيلتر في المصل و22.84 ± 9.67 بيكوغرام / ديسيلتر في افرازات بطانة الرحم بعد خدش. كما اظهر IL6 اختلافا معنويا في المصل وفي افرازات بطانة الرحم ، حيث بلغ متوسط مستويات المصل IL6 4.27 ± 2.18 بيكوغرام / ديسيلتر قبل الخدش وارتفع الى 16.46 ± 4.27 بيكوغرام / ديسيلتر بعد الخدش ، في حين كان IL6 في افراز بطانة الرحم 3.86 ± 2.42 بيكوغرام / ديسيلتر قبل الخدش وزيادة الى 22.35 ± 9.14 بيكوغرام / ديسيلتر بعد الخدش.كان تاثير خدش بطانة الرحم على مؤشر النبض ذو دلالة احصائية مع فارق متوسط 0.893 ± 0.393 حيث كان 3.584 ± 0.373 قبل الخدش وانخفض الى 2.690 ± 0.357 بعد الخدش ، مع تغير متوسط النسبة بنسبة 24.54٪ ± 9.95٪.كانت هناك علاقة ارتباط معتدلة ذات دلالة احصائية مهمة بين تطور الحمل وارتفاع مستوى المصل والـ TNF ، وكانت اعلى في افرازات بطانة الرحم من TNF المصل ، ولكن بالنسبة لـ IL6 لم يكن هناك سوى علاقة ضعيفة ذات دلالة احصائية بين بطانة الرحم IL6 والحمل.وخلصت هذه الدراسة الى ان خدش بطانة الرحم يزيد معدل الحمل في جميع مجموعات الدراسة ولكن الحمل العفوي اكثر من التلقيح داخل الرحم، والاخير اكثر من التخصيب الاصطناعي. يسبب خدش بطانة الرحم زيادة كبيرة في تركيزات المصل وافرازات البطانة من TNF - α وIL - 6. وارتبط ارتفاع مستويات TNF - α وIL - 6 مع نتائج حمل افضل. ان خدش بطانة الرحم يقلل من معدل مؤشر المقاومة الشريانية للشريان الرحمي الذي يعني معدل تدفق افضل للدم وبالتالي تحسين نتيجة الحمل. | Infertility is a worldwide problem, affecting millions of couples, and never an old subject. Infertility is “a disease of the reproductive system defined by the failure to achieve a clinical pregnancy after 12 months or more of regular unprotected sexual intercourse. Several studies have suggested a favorable effect of endometrial injury on the implantation success rate, especially in women with recurrent implantation failure or recurrent abortion or unexplained infertility. When local injury - induced in endometrial tissue this enhance an inflammatory reaction which is useful for favors implantation of embryo. Natural killer cells, macrophages, and dendritic cells are recruited to the injured site and increased quantities of cytokines, growth factors, and chemokines like Tumor necrosis factor - alpha, and interleukin - 6, all are secreted, thus resulting in a successful implantation. This prospective interventional study was designed to evaluate the effect of endometrial scratch on serum and endometrial secretion of Tumor necrosis factor - alpha and interleukin - 6, and its effect on promoting successful implantation. The study was done in Al - Alwia Teaching Hospital and privet infertility treatment center in Baghdad from January 2016 till December 2017. This study enrolled 105 female patients with unexplained infertility for more than 1 year and with age under 45 years. Basic hormonal study was done, and study sample was divided as indicated into three groups, 31 (29.5%) for natural conception, 31 (29.5%) for intrauterine insemination and 43 (41.0%) for in vitro fertilization program ,then all patients undergone endometrial scratch, at day 8 of menstrual cycle (in in vitro fertilization program group the scratch of endometrium done in the cycle that preceded the in vitro fertilization procedure ), by using hysteroscopy. Tumor necrosis factor - alpha, and interleukin - 6 was measured in serum and endometrial secretions before and after scratch. pregnancy rates for three groups was 22 (33.33%), 20 (30.30%), and 24 (36.4%) for Natural, Intra Uterine Insemination and In Vitro Fertilization , respectively and when calculate the relative risk (beneficial risk) for pregnancy it reveal that the highest for Natural conception group with 1.194 RR, 95% confidence interval (0.892 - 1.1601), followed by Intra Uterine Insemination group with RR of 1.038, 95% confidence interval (0.757 - 1.423), and lowest in In Vitro Fertilization group, with RR of 0.824, and 95% confidence interval (0.600 - 1.131). By measuring two of the most important cytokines in serum and endometrial secretions of patients involved in this study both before and after endometrial scratch, it was found that there was a highly significant difference (p - value <0.001) in serum and endometrial Tumor necrosis factor - alpha, as were 3.84 ± 2.41 pg/dl, and 3.81 ±2.30 pg/dl, respectively, and increased to 17.35 ±6.39 pg/dl in serum and 22.84 ±9.67 pg/dl in endometrial secretions after scratch. Also interleukin - 6 showed highly significant difference in serum and in endometrial secretions, as the mean serum levels of IL6 was 4.27 ±2.18 pg/dl before scratch and increased to 16.46 ±4.27 pg/dl after scratch, while the interleukin - 6 in endometrial secretion was 3.86 ±2.42 pg/dl before scratch and increased to 22.35 ± 9.14 pg/dl after scratch. The effect of endometrial scratch on pulsatility index was statistically significant with a mean difference of 0.893 ±0.393 as it was 3.584 ± 0.373 before scratch and decreased to 2.690 ± 0.357 after scratch, with mean percent change of 24.54% ± 9.95% reduction. There was a moderate statistically significant positive correlation between developing pregnancy and higher serum and endometrial Tumor necrosis factor - alpha, and that it was higher in endometrial secretions than serum Tumor necrosis factor - alpha , but for interleukin - 6 there was only a weak statistically significant correlation between endometrial interleukin - 6 and pregnancy. This study concluded that endometrial scratch increase pregnancy rate in all study groups but Natural conception is more than Intra Uterine Insemination and Intra Uterine Insemination is more than In vitro Fertilization - Embryo Transfer. Endometrial scratch causes a significant increment in serum and endometrial concentration of Tumor necrosis factor - alpha and IL - 6. Higher levels of Tumor necrosis factor - alpha and interleukin - 6 were associated with better pregnancy outcomes. Endometrial scratch decrease pulsatility index which mean better blood flow rate and good pregnancy outcome.

مجموعة التباين الوراثي احادي القاعدة للتلومريز, XPC وXRCC7 المتغيرة جينيا في المرضى المدخنين العراقيين المصابين بورم المثانة == Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Panel for Telomerase, XPC, and XRCC7 Genes Variants in Iraqi Smoker Patients with Bladder Tumor

Author name: صالح علي محمود
Supervisor name: هدف ظافر الياسين | اسامة سليمان الناصري
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: سرطان المثانة هو واحد من اكثر الاورام الخبيثة شيوعا في المسالك البولية. يعتبر استهلاك التبغ لفترات طويلة احد العوامل الرئيسية المسببة لتطور سرطان المثانة ، والتي تسبب تلف الحمض النووي. ولذلك ، فان مسار اصلاح الحمض النووي هو من اهم النظم التي تحافظ على سلامة الجينات ومنع التسرطن. وكان الهدف من هذه الدراسة هو معرفة تاثير التباين الوراثي احادي القاعدة لثلاثة جينات مسؤولة عن اصلاح الحمض النووي TEP1 / rs2228041 , XPC / rs2228000) و( XRCC7 7003908 على الخطر بالاصابة بهذا المرض.الاهداف : ان الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو محاولة ايجاد علاقة بين التباين الوراثي احادي القاعدة الموجودة في ثلاثة جينات مختلفة مسؤولة عن اصلاح الحمض النووي والتحقق من تاثير تدخين التبغ على التباين الوراثي الموجود في جنات اصلاح الحمض النووي البشري TEP1 / rs2228041 ) ، XPC / rs2228000 و(XRCC7 7003908 في المرضى الذين يعانون من سرطان المثانة في وتاثيرها على تطور ومرحلة المرض.المرضى وطرق العمل : اشتملت هذه الدراسة على مجموع من 62 مريض مشخص بسرطان المثانة و38 شخص من الاصحاء مطابقين لهم بالعمر والجنس. تم جمع هذه العينات في الفترة من فبراير الى سبتمبر لسنة 2017 في دراسة مقارنة لمجموعه المرضى والاصحاء التي اجريت في قسم الكيمياء الحيوية في كلية الطب بجامعة بغداد.تم الكشف عن النمط الجيني لل TEP1 / rs2228041 (C> T) وXPC rs2228000 (C> T) باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل وطريقة سانجر في ايجاد تسلسل الحمض النووي.بينما كشف عن النمط الجيني للتباين الوراثي XRCC7 (T> G) باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والمتحدد بطول القطعة المتباينة الشكل, (PCR - RFLP) وتاكيده تسلسل الحمض النووي باستخدام طريقة سانجر. تم حساب نسبة الارجحية (OR) ومجال الثقة 95 ٪ (CI) كمقياس للتاثير المشترك للتدخين السجائر ، والجينات اصلاح الحمض النووي المتباينة الشكل على خطر الاصابة بسرطان المثانة وتطوره ومراحلهه.النتائج : في هذه الدراسة ، اظهر الاليل T المتباين الشكل للجين TEP1 rs222804 علاقة معنوية في زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR = 4.7, *p=0.04). ايضا ، اظهر الاليل T وجود علاقة معنوية في زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة بين الافراد المدخنين (OR =7.02, *p=0.01)علاوة على ذلك ، اظهر الاليل T علاقة معنوية لمرحلة T2 لسرطان المثانة ((OR=13.2, **p=0.001 اظهر النمط الوراثي المغاير الزيجة من XPC rs2228000 (C> T) زيادة كبيرة في خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR=2.75, *p value<0.05). كذلك ، قد وجدت الدراسة ان المرضى الذين يعانون من الاليل متعدد الاشكال للنمط الجيني T قد زاد بشكل كبير من خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR= 2.7; *p = 0.02).احصائيا, وجدت زيادة معنوية كبيرة في خطر الاصابة بسرطان المثانة عند الاشخاص المدخنين الحاملين للاليل T (OR= 4.3; **p = 0.004).علاوة على ذلك ، لوحظ ايضا ان الطرز الوراثية للاليل T ترتبط بزيادة ملحوظة في خطر T1 (OR= 3.9 **p = 0.005).في الدراسة الحالية ,ان خطر الاصابة بسرطان المثانة قد ازداد بشكل كبير لدى الاشخاص الحاملين للجين متعدد الاشكال متماثل الزيجة الوراثية (للنمط الجيني GG) (OR= 4.0; *p = 0.03) في حين ان النسبة بهذا الخطر قد قلت لدى الاشخاص الذين لديهم جين من النوع الطبيعي (للنمط الجيني TT). ايضا ، زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة زيادة كبيرة احصائيا بين الافراد الحاملين للاليل G(OR= 5.5; ***p = 0.0001). كما لوحظ ان النمط الوراثي للاليل G مرتبط بزيادة كبيرة بخطر الاصابة بالمرحلة T2 لسرطان المثانة (OR= 3.7; **p = 0.001) ، وايضا Ta (OR= 3.5; **p = 0.003).استنتاجتوحي الدراسة الحالية ان وجود الانماط الجينية المتباينة الاشكال لجينات اصلاح الحمض النووري للمروثات يمكن ان يزيد من خطر الاصابة بسرطان المثانة ويؤثر ايضا على تطور ومراحل المرض في حين ان النمط الجيني الطبيعي يمكن ان يقلل من خطر الاصابة بسرطان المثانة وزيادة معدل البقاء على قيد الحياة لمرضى سرطان المثانة. علاوة على ذلك ، يمكن لهذه الاشكال الجينية ان تكون اداة مفيدة لمعالجة المرض للافراد الذين لديهم مقاومة لعلاج السرطان. | XPC Xeroderma pigmentosum CXPG Xeroderma pigmentosum G AbstractBackgroundBladder cancer is one of the most common malignancies of the urinary tract. Prolonged tobacco consumption constitutes the major etiological factors for bladder cancer development, which induce DNA damage. Therefore, DNA repair pathway is a crucial system in maintaining genomic integrity and preventing carcinogenesis. The present work was aimed to predict the consequence of three polymorphisms of the DNA repair genes (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000, and XRCC7 7003908) on the disease predisposition.ObjectivesThe main objective of this study is attempted to find the association between SNPs in different DNA repair pathway and investigating the influence of active tobacco smoking on human DNA repair gene polymorphisms (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000 and XRCC7 7003908) in patients with bladder cancer in and the impact of these polymorphism on the staging and development of the disease.Subjects and MethodsA total of 62 of histo - pathologically confirmed diagnosed bladder cancer patients, and 38 age - matched healthy controls were involved in the study. All were recruited from February to September 2017 in a case - control study conducted at the Department of Biochemistry - College of Medicine University of Baghdad. Genotyping of the TEP1/rs2228041 (C>T) and XPC rs2228000 (C>T) was evaluated using polymerase chain reaction and fully genotyped by Sanger sequencing method. Genotyping of the XRCC7 polymorphism (T>G) was evaluated using a polymerase chain reaction - restricted fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and confirmed by Sanger sequencing method. The odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) were calculated as a measure of the combined effect of cigarette smoking, and DNA Repair Genes Polymorphisms on bladder cancer risk, staging.ResultsIn this study, the polymorphic T allele of the TEP1 rs222804 polymorphism showed a significant association in increase bladder cancer risk OR = 4.7, p=0.04. Also, the T allele showed a significant association in increase bladder cancer risk among smoker individuals OR= 7.02, p=0.01. Furthermore, the T allele showed a significant association for the T2 stage of bladder cancer (OR=13.2, p=0.001). Heterozygous genotype of the XPC rs2228000 (C>T) showed a significant increase in bladder cancer risk OR =2.75, p value<0.05. Also, the study found that patients with the polymorphic allele (T genotype) have significantly increased the risk of bladder cancer (OR= 2.7; p = 0.02). A statistically highly significant increased in bladder cancer risk was found in the smoker individuals who carrying T Allele (OR= 4.3; p = 0.004). Moreover, T Allele genotypes were also observed to be associated with a significantly increased risk of T1 (OR= 3.9; p = 0.005). In the current study, individuals with the homo polymorphic gene (GG genotype) have significantly increased the risk of bladder cancer (OR= 4.0; p = 0.03), while subjects having the homo wild - type gene (TT genotype) could decrease the risk of bladder cancer. Also, a statistically highly significant increased bladder cancer risk in the smoker individuals who carrying G Allele (OR= 5.5; p = 0.0001). G Allele genotypes were also observed to be associated with a significantly increased risk of T2 (OR= 3.7; p = 0.001), and for Ta (OR= 3.5; p = 0.003).ConclusionThe present study suggested that having polymorphic genotypes of DNA repair gene polymorphisms (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000 and XRCC7 7003908) could increase the risk of bladder cancer and also affect the development and staging of the disease while having the wild type genotypes could decrease the risk of bladder cancer and increase the survival rate of bladder cancer patients. Furthermore, these gene polymorphisms could be a useful tool to tackle these emerging problems and is an attractive target for individual anticancer treatment.

مستوى الكالبروتيكتين بروتين (S - 100) في مصل الدم للمرضى المصابين بالتهاب الفقار المقسط في العراق وعلاقته بالعلاج, نشاط المرض وتنميط.HLA == The Serum Level of Calprotectin (S - 100 protein) in Iraqi Patients with Ankylosing Spondylitis and its Relation with Treatment, Disease Activity and HLA Typing

Author name: خالد محمد عبد الواحد
Supervisor name: جاسم محمد كرحوت | محمد هادي العصامي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لقد اجريت هذه الدراسة في الفترة ما بين تشرين الاول عام 2016 وتشرين الاول عام 2017 على 90 شخصا تم تشخيص 60 منهم على انهم مصابين بالتهاب الفقار المقسط (مجموعة المرضى) وكان 30 منهم يتناولون العلاج التقليدي (الستيرويد و/او العقاقير السامة للخلايا) الذين كانوا يحضرون للعيادة الخارجية للمفاصل بمستشفى بغداد التعليمي في حين كان هناك 30 مريضا اخرين يتلقون العلاج البيولوجي Inliximab infusion)) وهم يحضرون ردهة العلاج البيولوجي وكان هناك ايضا 30 اخرون من مجموعة الاصحاء. تم جمع عينات الدم من المرضى والاصحاء لتقييم الكالبروتيكتين(Calprotectin) (Matrix(metalloproteinase - 3) في مصل الدم وتم الكشف عنها بواسطة مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم ELISA)). تم قياس hs - CRP بواسطة nephlometer كما تم فحص HLA B - 27 بواسطة التفاعل المتسلسل للبوليميريز في الوقت الحقيقي RT - PCR)). كان مجموع مرضى الدراسة الحالية 60 مريضا، كان متوسط اعمارهم 40.05 ± 8.02 سنة ، وكانت نسبة الذكور سائدة اكثر من الاناث في نسبة (M : F 11 : 1). لقد اوضحت الدراسة الحالية ان مستويات الكالبروتيكتين في المصل كانت اعلى في مجموعة المرضى (89.23 ± 73.97) من مجموعة الاصحاء (54.94 ± 20.51) وكان هذا الفرق ذو دلالة احصائية (P= 0.0148) ، وكان اعلى ايضا في المرضى الذين عولجوا بالعلاج التقليدي مقارنة بالمرضى الذين عولجوا بالعلاج البيولوجي (infliximab infusion) وكان الفرق ذو دلالة احصائية (P = 0.0013) بينما لم يكن هناك فرقا احصائيا بين المرضى الذين كان BASDAI وBASFI < 4.0 وغيرهم من المرضى الذين كان BASDAI و4.0 ≤ BASFI ولا بين المرضى الذين HLA B - 27 ايجابية وغيرها سلبية. لقد كان متوسط مستوى المصل من مركب Metalloproteinase - 3 من المرضى اعلى من مجموعة الاصحاء وكان ذو دلالة احصائية عالية (P= 0.0093)وكان اعلى ايضا في المرضى الذين عولجوا بالعلاج التقليدي ، مقارنة بالمرضى في العلاج البيولوجي (infliximab infusion) والفرق كان ذو دلالة احصائية (P value = 0.0235). وفيما يتعلق باختبار hs - CRP الذي كشف ان متوسط مستوى hs - CRP في المصل للمرضى كان اعلى من مجموعة الاصحاء وكان ذو دلالة احصائية عالية (P= 0.0001) وكان اعلى ايضا في المرضى الذين عولجوا بالعلاج التقليدي ، مقارنة بالمرضى الذين كانوا يتلقون العلاج البيولوجي (infliximab infusion) وكان هذا الفرق ذو دلالة احصائية(P = 0.0235). لقد اظهرت الدراسة الحالية ان HLA B - 27 كان ايجابيا في 34 مريضا (56.7 ٪) ، ولم يكن موجبا في اي شخص من مجموعة الاصحاء وكان هذا الفرق ذو دلالة احصائية عالية (P < 0.0001) وكان هناك فرق كبير من hs - CRP بين مجموعات HLA B - 27 الايجابية والسلبية (P= 0.0437) ولم يتم الكشف عن اختلافات اخرى (ESR ، Calprotectin ، MMP - 3 ، BASDAI ، BASFI) بين مجموعة المرضى HLA B - 27 الايجابية والسلبية. فيما يتعلق بالعلاقة بين ESR وCalprotectin وMMP - 3 وhs - CRP في كلا المجموعتين من المرضى. كان هناك ارتباط مباشر كبير بين hs - CRP وESR (P value = 0.005) ولم يلاحظ اي ارتباط بين المعلمات الاخرى في كلتا المجموعتين من المرضى.لقد اوضحت الدراسة ان الكالبروتيكتين في المصل كان اعلى في مجموعة المرضى من مجموعة الاصحاء وكان اعلى في المرضى الذين يتلقون العلاج التقليدي مقارنة بالمرضى المعالجين بالعلاج البيولوجي ولم تكن هناك علاقة بين مستوى الكالبروتيكتين في المصل ونشاط المرض ولا بوجود HLA B - 27 . | patients were diagnosed as established ankylosing spondylitis patients, thirty (30) patients of them were on conventional treatment (steroid and/or cytotoxic drugs) who were attending the Rheumatology Outpatient Clinic of Baghdad Teaching Hospital, while the other thirty (30) patients were on biological treatment (infliximab infusion) attending biological therapy room and other thirty (30) were apparently healthy control group. Blood samples were collected from patients and controls to assess Serum calprotectin and matrix metalloproteinase - 3 which were detected by enzyme linked immunosorbent assay, the high sensitivity C - Reactive Protein was measured by nephelometer,, wherease Human Leucocyte Antigen B - 27 has been done by real time polymerase chain reaction. Out of 60 patients study group included in the current study, their mean age was 40.05 ± 8.02 years, the males were predominant than females in a ratio (M : F 11 : 1). The current study revealed that serum level of calprotectin is higher in patient group (89.23±73.97) than control group (54.94±20.51) and this difference is statistically significant (P - value =0.0148), and also is higher in patients treated with conventional treatment, than in patients treated with biological treatment (infliximab infusion) and the difference is statistically significant (P - value =0.0013) while the difference is not statistically significant between patients whose Bath Ankylosing Spondylitis Disease Activity Index and Bath Ankylosing Spondylitis Functional Index < 4.0 and other patients whose Bath Ankylosing Spondylitis Disease Activity Index and Bath Ankylosing Spondylitis Functional Index ≥ 4.0 nor between patients whose Human Leucocyte Antigen B - 27 positive and others negative. Mean serum level of matrix metalloproteinase - 3 of patients is higher than control group and is highly statistically significant (P - Value 0.0093) and also higher in patients treated with conventional treatment, than in patients on biological treatment (infliximab infusion) and the difference is statistically significant (P - value =0.0235). Regarding high sensitivity C - Reactive Protein test which revealed that mean serum level of high sensitivity C - Reactive Protein of patient higher than control group and is highly statistically significant (P - Value =0.0001) and also higher in patients treated with conventional treatment, than in patients on biological treatment (infliximab infusion) and this difference is statistically significant (P - value = 0.0235). The current study showed that Human Leucocyte Antigen B - 27 was positive in 34 (56.7 %) patients, and in no subject ( 0 %) from control group and this difference is highly statistically significant (P - Value < 0.0001) and there is a significant difference of high sensitivity C - Reactive Protein between positive and negative Human Leucocyte Antigen B - 27 groups (P - value =0.0437) and no other differences detected of (Erythrocyte Sedimentation Rate, Calprotectin, matrix metalloproteinase - 3, Bath Ankylosing Spondylitis Disease Activity Index, Bath Ankylosing Spondylitis Functional Index) between positive and negative Human Leucocyte Antigen B - 27 patients group. Regarding the correlation between Erythrocyte Sedimentation Rate, Calprotectin, matrix metalloproteinase - 3 and high sensitivity C - Reactive Protein in both patients groups; there is a significant direct correlation between high sensitivity C - Reactive Protein and Erythrocyte Sedimentation Rate (P - value=0.005) and no correlation is observed between the other parameters in both patients groups. The study had showed that serum Calprotectin is higher in patients group than control group and also higher in patients on conventional treatment than in patients on biological treatment, and there is no relation between serum calprotectin level and disease activity nor Human Leucocyte Antigen B - 27 typing

قياس الفعالية الانزيمية وتحديد الطفرات الجينية لانزيم الثايوبيورين الناقل لمجموع المثيل في عينة من الاطفال العراقيين المصابين بسرطان الدم اللمفاوي الحاد == Thiopurine S - Methyltransferase Phenotype and Genotype in a Sample of Iraqi Children with Acute Lymphoblastic Leukemia

Author name: نوار سمير محمد
Supervisor name: منال كمال رشيد | حسنين حبيب غالي
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Background : The most common childhood cancer is acute lymphoblastic leukemia which is only treated with chemotherapy alone.All modern protocols of acute lymphoblastic leukemia treatment used thiopurine drugs as an essential anti - cancer drug which used for a long period of time. The 6 - Mercaptopurine is an anti - cancer drug widely used for treating acute lymphoblastic leukemia patients. The patients with low Thiopurine S - Methyltransferase enzyme activity is with an increased risk of developing drug toxicity and consequently unsuccessful acute lymphoblastic leukemia outcome and even death.Thiopurine S - Methyltransferase is one of the main enzymes involved in 6 - mercaptopurine metabolism, and the low activity of this enzyme is strongly correlated to the Thiopurine S - Methyltransferase genetic polymorphism.Aim : Find out the three most common Thiopurine S - Methyltransferase enzyme polymorphism TPMT*3A, TPMT*3B and TPMT*3C in Iraqi pediatric patients with acute lymphoblastic leukemia, and its frequencies. Analyses of Thiopurine S - Methyltransferase activity in the serum of those patients, and compare the results with other population. Methods : This is a cross - sectional study included eighty - one (81) Iraqi pediatric patients with acute lymphoblastic leukemia during the maintenance phase of their UKALL protocol treatment, receiving 6 - Mercaptopurine drug with age range from 1.83 (1year and 10 months) to 16.25 (16 years and 3 months). Thiopurine S - Methyltransferase activity was measured in the patients’ serum by Enzyme - Linked Immunosorbent Assay technique and three of Thiopurine SMethyltransferase genetic polymorphisms were detected by allelespecific multiplex - PCR analysis after DNA extraction from the whole blood. Liver Function Tests were measured by calorimetric method; Alanine Aminotransferase, Aspartate Aminotransferase, Alkaline Phosphatase and Total Serum Bilirubin in addition to Complete BloodCount measured by automated hematology system. Results : There was significant difference in the mean of Thiopurine S - Methyltransferase activity between pediatric patients carrying the wild - type allele TPMT*1 (n=49), with allele frequencies of 60.4% and pediatric patients (n=32) carrying the mutant alleles (TPMT*3A or TPMT*3C) with allele frequencies of 81.2% and 18.7% respectively. The TPMT*3B allele was not detected in this group. The P - value was highly significant (P<0.000**).Conclusion : This study is the first to analyze Thiopurine SMethyltransferase mutant gene frequency in a sample of the Iraqi population, and it revealed the presence of TPMT*3A and TPMT*3C genetic polymorphism but not a TPMT*3B mutant allele. Thiopurine S - Methyltransferase activity was low in the patients with mutant gene as compared with the wild - type allele patients. Finally, genotype and phenotype of Thiopurine S - Methyltransferase enzyme is an essential predictor to reduce the cytotoxic effects of the anticancer drug and successful acute lymphoblastic leukemia treatment.

تركيزات البلازما والاداة المساعدة للتشخيص لعامل النمو البطاني الوعائي (VEGF) ، مصفوفة ميتالوبروتيناز - 2 (MMP - 2) ، مثبطات الانسجة لمركب الميتالوبروتيناز - 2 (TIMP - 2) والمستعمرة الضخمة (M - CSF) في النساء اللواتي يعانين من ورم الثدي : دراسة مقارنة مع م == Plasma Concentrations and Diagnostic Utility of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF), Matrix Metalloproteinase - 2 (MMP - 2), Tissue Inhibitors of Metalloproteinase - 2 (TIMP - 2), and Macrophage Colony Stimulating Factor (M - CSF) in Women with Brea

Author name: اسيل نبيل كامل
Supervisor name: باسل عويد محمد صالح | كفاح حمدان
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: سرطان الثدي هو الورم الخبيث الاكثر شيوعا في النساءويعتبرالسبب الرئيسي الثاني لوفاة مرضى السرطان في العالم. تعتبر الوقاية والكشف المبكر هوالطريقة الاكثر فعالية لمكافحة السرطان. خلال العقد الماضي ، جذبت الكثير من علامات البيوكيميائية لسرطان الثدي انتباه العديد من الباحثين. هذه العلامات يمكن استخدامها في مراقبة العلاج ، والتنبؤ بدرجة اصابة الانسجة ، وسلوك الورم ، ومدى انتشاره ، واحتمالية اصابةالعقد الليمفاوية. من بين هذه الواصمات الحيوية ، عامل نمو بطانة الاوعية الدموية (VEGF) ، خلايا البلعوم المحفزة للحفظ (M - CSF)، ومصفوفة الميتالوبروتنيز MMP - 2))، ومثبطات الانسجة لمركب الميتالوبروتينيز(TIMP - 2). تشير الدلائل المتزايدة الى ان قياس VEGF هو افضل مرشح لتشخيص سرطان الثدي (افضل من مستضد السرطانCA 15 - 3 ) خاصة في المرحلتين الاولى والثانية وكذلك في التمايز بين الورم الخبيث وورم الثدي الحميد. اظهرت الدراسات ان قياس VEGF لا سيما مع CA 15 - 3 ، اعلى فائدة وقوة تشخيصية في الكشف عن سرطان الثدي.وفي الاونة الاخيرة ، تم التوصل في البحوث الحديثة الى ان TIMP - 2 قد يكون ذو فائدة في التشخيص المبكر لسرطان الثدي في مراحله الاولى زتهدف هذه الدراسة الى : 1) قياس تركيزات البلازما لبعض المرقمات الحيوية الجديدة بما في ذلك : عامل نمو بطانة الاوعية الدموية (VEGF) ، ومصفوفة الميتالوبروتينيز ((MMP - 2 ، ومثبط الانسجة لمركب الميتالوبروتينيز ((TIMP - 2 ، وعامل تحفيز مستعمرة البلعم (M - CSF) بالاضافة الى مثبط السرطان 15 - 3 ( CA15 - 3) في النساء المرضى الذين يعانون من ورم الثدي بالمقارنة مع النساء الاصحاء.2) التحقيق في الاداة التشخيصية لكل من المرقم الحيوي المقاس (وبالاقتران مع بعضها البعض) في الكشف عن ورم الثدي و(3) مقارنة النتائج مع معلمات الهستوباثولوجي ( العمر, الجنس , الحالة الزوجية , سن الياس حجم الورم , مرحلة الورم السرطاني , مستقبل الاستروجين , مستقبل الروجيستيرون ومستقبلات 2 Her)المواد وطرق العمل : اشتملت الدراسة على 88 امراة عراقية تم تقسيمهم الى ثلاثة مجاميع : 38 امراة مصابة بسرطان الثدي (Group I, BC) ، 25 امراة مصابات بورم الثدي الحميد الغدي الليفي Fibroadenoma (FA) (Group II, FA benign ) اللواتي تم تشخيصهن من قبل مجموعة اخصائي الاورام و25 امراة سليمة (كمجموعة ضابطة). تم تشخيص ورم الثدي من قبل مجموعة من الاخصائيين في الاورام. حيث تم التشخيص بناء فحوصات تجرى على عينة تؤخذ من خزعة نسيجية من ورم الثدي او بعد استئصال الثدي. تم تنفيذ اجراءات التدريج العلاجي على اساس فحوصات الجسم والدم ، والتصوير الشعاعي للثدي ، وفحص الثدي بالموجات فوق الصوتية ، والاشعة السينية للصدر حسب توفرها وضرورتها. تم اجراء تصنيف الاورام وتدريجها اعتمادا على معايير الاتحاد الدولي لمكافحة سرطان الاورام - (UICC - TNM) واللجنة الامريكية المشتركة لمرحلة مكافحة السرطان. تم تقسيم النساء المصابات بسرطان الثدي الى مجموعات فرعية على اساس مراحل السرطان ؛ المجموعة (ا) : تشمل 12 امراة في المرحلة الاولى (T1N0M0) ، حيث حجم الورم <2 سم ، المجموعة ب : 14 امراة في المرحلة الثانية (T2N0M0 ، T2N1M0 ، T3N0M0) ، حجم الورم (2 - 5) سم ومجموعة C : تشمل 12 امراة في المرحلة الثالثة (T2N2M0 ، T3N1M0 ، T3N2M0 وT4N2M0) ، كما كان لديهم حجم الورم > 5 سم. في هذه الدراسة تم استبعاد النساء المصابات بسرطان الثدي في المرحلة المتقدمة (المرحلة الرابعة) ، والنساء اللواتي يعانين من المرض سابقا او اللواتي يعانين من انواع اخرى من السرطانات؛ السرطانات التناسلية الانثوية (سرطان المبيض ، سرطان عنق الرحم ، سرطان الرحم) ، اورام الكلى ، القولون والمستقيم ، البنكرياس ، الرئة والراس والعنق. ايضا ، تم استبعاد المدخنين والنساء اللواتي يتناولن المشروبات الكحولية من هذه الدراسة. تم سحب عينة الدم من كل امراة لقياس VEGF ، M - CSF ،TIMP - 2,MMP - 2 و3 CA15 - . ايضا تم قياس مصل 25 هيدروكسي فيتامين D (25OHD) ومعلمات الدهون بما في ذلك الكولسترول الكلي (TC) ، والدهون الثلاثية (TG) ، والكوليسترول الدهني عالي الكثافة (HDL - C) ، والكولسترول الدهني منخفض الكثافة (LDL - C) فقط في المجموعة الاولى والمجموعة الثانية | Breast cancer (BC) is the most common malignancy in women and the second leading cause of their death from cancer in the world. The most effective way to combat cancer is its prevention and early detection. During the last decade, biochemical markers of breast cancer have attracted the attention of many researchers. Among these biomarkers, the interest points to Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF), Macrophage Colony Stimulating Factor (M - CSF), Matrix Metalloproteinase - 2 (MMP - 2), Tissue Inhibitors of Metalloproteinase - 2 (TIMP - 2). Growing evidence indicates that measurement of VEGF maybe the best candidate for BC diagnosis (better than CA 15 - 3) especially in stages I and II as well as in the differentiation between BC and benign breast tumor. More recently it has been reported that TIMP - 2 maybe useful in early diagnosis of BC and differentiation of breast cancer stages. The aim of this study are to : (1) Measure the plasma concentrations of some of new biomarkers including : Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF), Matrix Metalloproteinase - 2 (MMP - 2), Tissue Inhibitor of Metalloproteinase - 2 (TIMP - 2) and Macrophage - Colony Stimulating Factor (M - CSF) in addition to CA 15 - 3 in women patients with breast tumor in compare son with healthy control women, (2) Investigate the diagnostic utility of each of the measured biomarker (and in combination with each other) in detection of breast tumor and (3) Correlate the findings with the clinicopathological parameters (age, menopause, marital status, stages, tumor size, Estrogen Receptor (ER), Progesterone Receptor (PR) and Her - 2/neu receptor) in those patients.Subjects and Methods : Eighty - eight Iraqi women were enrolled in the study; 38 women with primary breast cancer (BC, Group I), 25 women with Fibroadenoma (FA) benign breast tumor (FA, Group II) and 25 apparently healthy women (served as control group). The diagnosis of breast tumor was achieved by the Oncology group. Histopathology investigations were performed by Consultant Histopathologic based on tissue biopsy of mammary tumor or after mastectomy. Tumor classification and staging were performed depending on criteria of International Union against Cancer Tumor - Node - Metastasis (UICC - TNM) classification and the American Joint Committee on Cancer Staging. Accordingly, women with breast cancer were classified into subgroups based on the stage of their BC; Group A : 12 women with stage I, Group B : 14 women with stage II, and Group C : 12 women with stage III. Exclusion criterion includes those women with breast cancer of advanced stage (stage IV), a previous history of multiple type of cancers; female reproductive tract cancers (ovarian, cervical and endometrial cancers), renal, colorectal, pancreatic, lung, head and neck tumors. Blood sample was aspirated from each woman for the measurement of plasma VEGF, M - CSF, MMP - 2, TIMP - 2 and serum CA15 - 3 by using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Also, serum vitamin D3 was measured in group I only using ELISA and serum lipid profile parameters were measured in group I and group II. Results : The mean (±SD) values of plasma levels of VEGF (p<0.001), MMP - 2 (p< 0.001), TIMP - 2 (p < 0.001), M - CSF (p < 0.05), and CA 15 - 3 (p<0.001) of group I was significantly higher compared to that of group II and controls. However, the mean value of plasma MMP - 2 was the only measured biochemical marker which was significantly increased in group II compared to controls (p<0.001). Regarding the BC stages, the mean values of all the measured biochemical markers were significantly higher in stage III than in stage I and stage II (p<0.001). Interestingly, the mean (± SD) value of plasma TIMP - 2 levels was the only biochemical marker of the measured ones which was significantly increased in stage II than in stage I (p=0.001). The cut - point value of plasma VEGF (>55.73 pg/ml) or TIMP - 2 (>102 ng/ml) (for both, AUC=1.0) was the excellent test in differentiating women with stage I of BC from healthy women. While that of VEGF (>55.73 pg/ml), TIMP - 2 (>102 pg/ml) or CA15 - 3 (>10.82 u/ml) (for all, AUC=1.0) was considered as the best test in discriminating the BC stage II from healthy women. While, the cut - point value of plasma TIMP - 2 (>142 ng/ml) which has the highest (AUC=1.0) considered as the excellent test in differentiating BC stage I from women with fibroadenoma benign tumor (FA). While that of VEGF (>88.67 pg/ml) or TIMP - 2 (>254 ng/ml) which has the highest (for each, AUC=0.991) was considered as the best test in discriminating the BC stage II from FA. In addition, the plasma measurement of VEGF has the superior diagnostic utility in differentiation of FA women and healthy control women (p<0.001, AUC=0.998).Conclusion : Measurement of plasma VEGF (cutoff >55.22pg/ml) or TIMP - 2 (cutoff >102 ng/ml) is the best biochemical marker in diagnosis of stage I or stage II BC and differentiates them from healthy women; they have more diagnostic utility than CA 15 - 3. Also, measurement of TIMP (cutoff > 142 ng/ml) has the excellent diagnostic utility in diagnosis and differentiation of stage I BC from benign tumor fibroadenoma (FA). Moreover, TIMP - 2 (cutoff > 254 ng/ml) or VEGF (cutoff > 88.67 pg/ml) has the superior diagnostic utility over that of CA 15 - 3 in diagnosis and differentiation of stage II BC from FA. Plasma measurement of TIMP - 2 was the best biochemical marker in studying early progression of BC; it can differentiate stage II from stage I BC. Furthermore, plasma measurement of VEGF was found to be the excellent parameter in differentiation between women with FA from healthy ones.

تفاعل انزيم البلمرة المتسلسل النسخي العكسي ذي الوقت الواقعي كاداة تشخيصية جزيئية في التحري عن الجينات المدمجة الشائعة في عينة من الاطفال العراقيين المصابين بابيضاض الدم اللمفاوي الحاد == Real time reverse transcriptase polymerase chain reaction as diagnostic molecular tool in screening of common fusion genes in sample of Iraqi children with acute lymphoblastic leukemia

Author name: اريج عماد كاظم
Supervisor name: بان عباس عبد المجيد | سلمى عباس الحداد
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases - Blood
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ابيضاض الدم الليمفاوي الحاد عند الاطفال هو مرض متنوع له اصناف وراثية متعددة تستجيب بصورة مختلفة للعلاج الكيميائي. توجد الكثير من التغايرات الكروموسومية المؤدية الى انتاج جينات مدمجة مصاحبة لحدوث هذا المرض.اهداف الدراسة : لدراسة تعبير الجينات المدمجة الشائعة في ابيضاض الدم اللمفاوي الحاد عند الاطفال باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل ذي الزمن الواقعي وربط نتائج هذه الدراسة مع مختلف المؤشرات السريرية والمختبرية ثم تقييم هذا التعبير بعد العلاج الاولي.المرضى, المواد وطرق العمل : اجريت هذه الدراسة المستقبلية للحالات والشواهد باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل ذي الزمن الواقعي لدراسة تعبير الجينات المدمجة MLL - AF4 ,BCR - ABL1 ,E2A - PBX1 ,TEL - AML1 وSIL - TAL1 في ناضح نقي العظم ل 48 مريض بابيضاض الدم اللمفاوي الحاد قبل العلاج مع 46 شخوص ضابطة, تم جمعها من مستشفى حماية الطفل التعليمي / دائرة مدينة الطب للفترة من 1 تموز 2013 الى 31 حزيران 2014. استعمل جين GAPDH كجين مراقب داخلي لدراسة تعبير الجينات المذكورة بعد العلاج.النتائج : من اصل 48 مريض بابيضاض الدم اللمفاوي الحاد, كان هناك 21 ذكرا" و27 انثى مع نسبة ذكور الى الاناث 0.78 : 1 . تراوحت اعمارهم بين 2 شهر الى 13 عام مع متوسط عمر 5 اعوام . تراوحت اعمار 26 مريضا" بين 1 - 5 سنوات. اظهر الفحص الجزيئي الكشف عن نسخ الجينات المدمجة TEL - AML1، E2A - PBX1 وp190 1BCR - ABL في 20.8%, 16.7% و2.1% من المرضى، على التوالي، بينما لم يتم الكشف عن نسخ p210 1BCR - ABL ، MLL - AF4 وSIL - TAL1. بالاضافة الى ذلك، اظهر احد المرضى تعبير نسخي لكل من TEL - AML1 وE2A - PBX1 في الوقت نفسه. وجدت التعابير الجينية بعد بدء العلاج في 2 مرضى من اصل 12 مريض.الاستنتاجات : ان تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل ذي الزمن الواقعي طريقة جزيئية دقيقة وقابلة للتطبيق في تصنيف ابيضاض الدم اللمفاوي الحاد في الاطفال. ان نتائج التصنيف الجزيئي للاطفال العراقيين المصابين بابيضاض الدم اللمفاوي الحاد مشابهة نوعا" ما للتقارير العالمية جاعلة TEL - AML1 الجين المدمج الاكثر انتشارا". | Pediatric acute lymphoblastic leukemia is a heterogeneous disease with various genetic subtypes that respond differently to treatment. Many chromosomal aberrations with resultant fusion genes are known to be associated with the disease.Objectives : To study the expression of common fusion genes in pediatric acute lymphoblastic leukemia using a quantitative real time polymerase chain reaction technique, correlate results with different clinical and laboratory findings and evaluate these expressions after initial treatment.Subjects, materials and methods : A case - control prospective study was conducted using qPCR technique to study the expression of TEL - AML1, E2A - PBX1, BCR - ABL1, MLL - AF4 and SIL - TAL1 fusion genes in bone marrow aspirates of 48 untreated acute lymphoblastic leukemia pediatric patients and 46 control subjects, were recruited at the Children Welfare teaching hospital / Medical City directorate for the period from 1st of July 2013 to 31st of June 2014. Post - induction transcripts’ evaluation for 12 ALL patients was done by comparative quantification method using GAPDH as a reference gene.Results : Out of 48 acute lymphoblastic leukemia patients, 21 were males and 27 were females with a male to female ratio of 0.78 : 1. Age ranged from (2 months to 13 years) with 26 patients aged between 1 - 5 years whereas the median age was 5 years. The mean age was 5.9 years + standard error of 0.51 years. Molecular screening demonstrated detection of TEL - AML1, E2A - PBX1 and BCR - ABL1 p190 transcripts in 20.8%, 16.7% and 2.1% of patients, respectively. BCR - ABL1 p210, MLL - AF4 and SIL - TAL1 transcripts were not expressed. One patient expressed both TEL - AML1 and E2A - PBX1 transcripts. Post induction transcripts were detected in 2 out of 12 patients.Conclusions : Real time PCR technique is an applicable molecular method in classifying and predicting prognosis in pediatric ALL. The molecular classification of Iraqi children with ALL is mostly similar to reports worldwide making TEL - AML1 fusion gene the most prevalent type

الاهمية السريرية لدراسة كهروفسلجـة القلب لدى مرضى التسارع الاذيني الانتيابي حول العقدة الاذينية البطينية == CLINICAL IMPORTANCE OF CARDIAC ELECTROPHYSIOLOGICAL STUDY IN PATEINTS WITH ATRIOVENTRICULAR NODAL REENTRANT TACHYCARDIA

Author name: امـين عبد الحسن مانع العـلواني
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases - Heart
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعتبردراسة كهروفسلجة القلب من الفحوصات القسطارية الضرورية لدى المرضى المصابيين بالتسارع الاذيني الانتيابي والذي يحدث بسسب ظاهرة عودة الدخول الكهربائي حول العقده الاذينية البطينية. تهدف هذه الدراسة الى معرفة الاهمية السريرية لكهروفسلجة القلب في تقييم مرضى التسارع الاذيني الانتيابي حول العقده الاذينيه . لقد خضعوا جميع المرضى الى اجراء قسطرة كهربائية القلب وخلال هذه العملية تتم دراسة كهروفسلجة القلب حيث تم مراقبة التوصيل الكهربائي بين حزمة هز والبطينين وتثبيت سرعة التيار الكهربائي بين الاذين والبطين اثناء التسارع الانتيابي. وشملت هذه الدراسةتسعة وثلاثون مريض من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. ومن خلال دراسة كهروفسلجة القلب لديهم تم تقسيمهم الى مجموعتيين المجموعه النموذجية الاكثر انتشارا حسب قياسات المسافة بين البطين والاذين اثناء التسارع الاذيني الانتيابي والتي تكون اقل من 60 مل/ثانيه. وكان عددهم ثلاثة وثلاثون مريض. والمجوعة الثانية وهي اللانموذجية والاقل شيوعا وكان عددهم ستة مرضى. والمسافة بين البطين والاذين اثناء التسارع الانتيابي اكثر من 60 مل/الثانيه. اظهرت النتائج الى ان اكثر من نصف المرضى تكون العقده الاذينيه الحبيبه ذات فيزيولجية ثنائية الذراع (البطيئ والسريع) 62% وهو الغالب في العادة، ولكن من خلال هذه الدراسة وجدت نسبة تكاد تكون عالية 38% نسبيا بين هولاء المرضى حيث كانت العقدة الاذينية البطينية ثلاثية او رباعية الذراع حيث يشترك اكثر من ذراع بطيئ في التسارع الانتيابي. بعد الاعتماد على نتائج الدراسة وتحديد نوع التسارع الاذيني الانتيابي يتم كوي الحزمه الكهربائية في الذراع البطيئ بعد تحديد مكان الذراع بالاعتماد على التشريح والموقع اثناء الدراسة. مع الاخذ بنظر الاعتبار ان جميع المرضى تم كوي الذراع لهم وبشكل ناجح ولكن القسم الاكبر 59% تم قطع الذراع بشكل تام حيث لاثوجد اي اشارات لكهروفسلجة القلب بعد الكوي والقسم الاخر تم كوي الذراع بشكل غير كامل او تغير في التركيب التشريحي للذراع وكانوا 41% من المرضى بالاعتماد على وجود بعض المواصفات من البداية من دون رجوع التسارع الاذيني الانتيابي بعد الكوي خلال تحفيز القلب بعد الكوي. وتم الاستنتاج من خلال الدراسة ان النساء يعانون بنسبة اكبر من تسارع فوق الاذيني المنتظم مقارنة بالرجال. مع وجود نسبة ليست بالقليلة والتي تصل الى ثمانية وثلاثون بالمئة من المرضى تكون فيها فزيولوجية العقده الاذينيه ثلاثية او رباعية الذراع مقارنة بالفيزيولوجية ثنائية الذراع وهو الشائع بالعادة. | AV nodal reentrant tachycardia (AVNRT) considered as the most common regular supraventricular arrhythmia in humans. It originates from a location within the heart above the bundle of His. It is more common in women than men. It represents an important cause of palpitations and to lesser extent, dizzy spells and syncope. An invasive electrophysiological study is a helpful procedure in the classification of AVNRT into common (typical) and uncommon (atypical) types. This study aims to : (1) Assess the role of electrophysiological study in the classification of AVNRT. (2) Explore the presence of multiple pathways in respect to the usual dual AV nodal pathways. And (3) Used EP study as predictor for successful ablation of the slow pathway. This study was conducted on Thirty nine (39) patients of either sex with paroxysmal supraventricular tachycardia corresponding to an AVNRT referred for catheter ablation. Each subject was submitted for history taking, examination, ECG, Echo study and basic invasive cardiac electrophysiological procedure that include right - sided cardiac catheterization through the femoral veins and programmed pacing was performed after localization of the catheters in the heart using the standard stimulation protocol to induce the tachycardia. In addition, His bundle study which involve measurement of atrial - His (AH) interval, Ventricular - atrial time (VA) as a baseline and after tachycardia induction, demonstration of the AH jump and/or echo beat (ectopic) pre and post ablation of the slow pathway using radiofrequency energy. However this study was conducted in Leipzig Heart Center/Germany from January 2013 to February 2014. The result of this study reveals that 33 (84.6%) of the patients developed typical AVNRT and 6 (15.4%) with atypical AVNRT. 25 patients (64.1%) were females (23 (92%) typical type and 2 (8%) atypical type) and 14 patients (35.9%) were males (10 (71.4%) typical type and 4 (28.6%) atypical type). Among the patients group with typical AVNRT the 91.7% discovered to have two AV nodal pathways and 84.6% with three pathways in respect to 8.3% with two AV nodal pathway and 15.4% with three pathways within the patients group with atypical AVNRT. Accordingly, 38.5% of all patients in this study discovered to have multiple pathways. Concerning ablation and modification of the slow pathway, complete ablation is achieved in 59% while modification of the pathways was noticed in 41%. In conclusion, this study concludes that an invasive electrophysiological study is a safe and reliable method for identification of patients with high risk of tachyarrhythmias. Moreover, most of the female patients discovered to have typical AVNRT. Unusually, higher percent of patients developed multiple pathways (more than two pathways) with respect to the usual dual pathways. The disappearance of post ablation EP data (AH jump and/or echo beat) reflect successful complete slow pathways ablation whereas the appearance of these data considered being a modification of the slow pathway

دراسة التعبير الوراثي للجينات P53, KRAS, c - MYC & Her - 2/neu وانواع الرنا المايكريوية miR - 21, 34a, 92 & 98 على عينات ماخوذة من الغسول القصبي والانصباب الجنبي لمرضى مصابين بسرطان الرئة ومرضى مصابين بامراض رئوية مزمنة غير سرطانية == Expression of P53, KRAS, c - MYC, Her - 2/neu genes and microRNAs 21, 34a, 92 & 98 in cancerous and non - cancerous bronchial wash and pleural aspirate

Author name: حسين عبادي الجبوري
Supervisor name: بان عباس عبد المجيد | عدنان الجبوري
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Background : Lung cancer is the leading cause of death from cancer in men all over the world. Most of newly diagnosed cases were in advanced stage and beyond radical treatment due to late appearance of worrying symptoms and absence of effective screening method for high risk groups. Nowadays, depending on recent advances in molecular studies researches are directed toward finding molecular markers for diagnostic, therapeutic and prognostic purposes. Aim of study : To investigate the possibility of using expression of P53, KRAS, Her - 2/neu, c - MYC and microRNAs 21, 34a, 92, and 98 as a molecular biomarkers for detection of lung cancer in samples of bronchial wash and pleural fluid. Material and Methods : A prospective case control study on a total of 120 samples, sixty bronchial washes and sixty pleural effusions. The samples were taken from patients recruited at the Thoracic Surgical Unit in the Specialized Surgery Hospital/ Medical City during the period from March 2012 to April 2014. The work was performed in the Department of pathology and forensic Medicine, Baghdad college of Medicine. The specimens were thirty bronchial wash and thirty pleural fluid samples positive for lung cancer cells by cytopathology, and similar number of negative samples. Studied genes were amplified using qRT - Realtime PCR. Housekeeping genes for normalization of mRNAs was GAPDH and RNU - 48 for microRNAs. Expression was calculated using equation; Expression = (2 - ΔΔCt). Results : Results of Ct values for each marker were obtained from Max Pro 5000 Agilent Technology PCR software and raw and standardized Ct values were analysed using SPSS - 22 software. The mean, standard deviation, t - test, ANOVA test and LSD (least significant difference) were obtained before and after normalization. A statistically significant differences in the expressions of p53, KRAS, c - MYC, Her - 2/neu and microRNAs, 21, 34a, 92, & 98 genes were found between positive and negative (control) samples with a significant p - values of <0.05. Conclusion : According to this study a conclusion could be reached; the study of expression profiles of mRNAs of P53, KRAS, c - MYC, Her - 2/neu and microRNAs 21, 34a, 92 and 98 genes can be used as a biomarker in the detection of lung cancer, differentiating subtypes, and screening of high risk groups

استخدام الصبغة المناعية p16INK4a والتهجين الموقعي وتاثيرها على فحوصات عنق الرحم الصحيحة والملتبسة == The Use of p16INK4a and In Situ Hybridization and Their Impact on the Healthy and Equivocal Pap Smears of the Cervix

Author name: ثناء جميل الخشالي
Supervisor name: ندى صالح امين | هدى مهدي الخطيب
General topic: Medicine
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Throughout the past thirty years, the perception of cervicalcarcinoma has shifted from that of a mysteriously fatal disease, to one ofthe sexually transmitted, human papillomavirus (HPV) related infection.HPV DNA has been found in almost all cervical invasive and preinvasivecervical neoplasms.Conventional Pap smear, which was established in the early sixtiesreduced effectively the morbidity and mortality related to cervical cancer.Given the lower sensitivity of the Pap cytology test, new diagnosticparameters have been established. The histological features ofpreinvasive cervical neoplasia (CIN1, CIN2, and CIN3) are wellunderstood. However, misinterpretation of the morphological criteriacould lead to significant variability.The aim of this study is to identify women with equivocal and normalPap smear who are at risk for developing cervical cancer through the useof p16INK4a immunostaining and human papillomavirus (HPV) DNAtesting using in situ hybridization (ISH).Materials and MethodsIn order to identify human papillomavirus infection in minorcytological and histological abnormalities, biopsies collected from 60women 25 - 66 years of age with normal cervices and Pap smears (groupI), abnormal cervices and Pap smears (group II) and with cervicalcarcinoma (groupIII) referred to the Colposcopy Clinic in BaghdadTeaching Hospital - Medical City Complex, during the period from June2013 through July 2014. Cytology samples collected with ThinPrep forIVliquid base cytology (LBC), punch biopsy for histopathology formalinfixed and paraffin embedded. In situ hybridization (ISH) and p16INK4aimmunohistochemistry in addition to routine hematoxylin and eosin(H&E) stain were used to evaluate the histological specimens.ResultsThe age, age of marriage and parity of the three groups werestudied in relation to each of ISH and p16INK4a reactions. Agedistribution was highly significant among all age groups; in both ISH andp16 test results GI &GII (p=0.00), GI & GIII (p=0.00), GII &GIII(p=0.00) in both ISH and p16 test results. The age of marriage was notsignificant among the groups in both ISH and p16; GI & GII p (0.93), GI&GIII (0.12), GII &GIII (0.30). The effect of parity was insignificantamong all groups; GI & GII = (p = 0.66), GI & GIII (p = 0.82), GII &GIII (p = 0.79) in both ISH and p16 test resultsp16INK4a immunoreaction : Among group I there was a negativereaction in all the specimens collected. In specimens from group II, therewas a very mild or focal p16INK4a immunoreaction in one specimen(5%), a moderate immunoreactivity in 9 specimens (45%), and a highpositive reactivity in 10 specimens (50%) (p=0.000). Group III showedvery high immunoreaction in all the specimens collected.In situ hybridization (ISH) in group I was mild positive in 4specimens (20%) which showed diffuse signal pattern. A mild positivereaction with diffuse nuclear staining was noticed in 4 (20%) of thecervical specimens. Moderate positive reaction with diffuse staining ofthe nucleus was observed in 8 (40%) of the specimens. The remaining 8(40%) of the specimens showed both diffuse and punctate staining of theVnuclei. Among group III specimens, the nuclei in the epithelial cellsshowed both punctate and diffuse signal patterns.Chi square was done to compare results concerning ISH & variousgroups was highly significant (p= 0.00) ConclusionHPV infection is prevalent and can be missed by the conventional Pap smear. The severity of the disease was directly proportional with the age of women in this study. p16 overexpression was correlated with the positivity of ISH. This may support the use of either, or both, tests to improve the accuracy of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) diagnosis, and help in the triage of women with equivocal lesions.

تاثير قطر دوالي الخصيه على نوعية السائل المنوي للمرضى المصابين بدوالي الخصية غير السريري == The Impact of the diameter of spermatic veins on Seminal fluid Analysis of patients with Subclinical Varicocele

Author name: ابراهيم جاسم حمادي
Supervisor name: غسان ثابت سعيد | رعد حفظي توفيق
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان الصحة الانجابية هي انعكاس للحالة الصحية العامة والتي تشمل الصحة العقلية والفيزيائية والاجتماعية وليس مجرد مجموعه الامراض المتعلقة بالجهاز التناسلي ووظائفه وعليه يعد العقم مرضا يستحق التشخيص والعلاج . يعرف العقم على انه عدم القدرة على الانجاب بعد سنة من الزواج بدون وجود اي مانع للعلاقة بين الزوجين . يشمل العامل الذكري حوالي 25 - 30 % من كل حالات العقم وايضا 30% اخرى بالاشتراك مع العامل الانثوي . ان 60% من عقم الرجال ناتج عن عوامل جينية اما الاسباب الاخرى فقد تكون نتيجة لدوالي الخصيتين ، عوامل بيئية ، عقاقير طبية ، تعاطي الكحول او التعرض المستمر للحرارة العالية او المواد الكيميائية....الخ. يعد مرض دوالي الخصيتين من الامراض الشائعة بين الرجال الذين يعانون من العقم وهو عبارة عن توسع وتعرج الاورده الناقلة للدم الراجع من الخصيتين نتيجة لتلف الصمامات الوريدية وينعكس ذلك سلبا على الوظيفة الطبيعية للخصية نتيجة لارتفاع درجه حرارة الخصية بسبب تراكم الفضلات الكيميائية من الغدد فوق الكلوية وكذلك الكليتين اضافة الى اسباب اخرى. يشكل دوالي الخصية السريري حوالي 15% بين الرجال ويشخص سريريا بفحص الخصيتين . اما في حالات اخرى لايمكن تشخيص دوالي الخصيه عن طريق الفحص السريري فقط وعليه تستخدم وسائل اخرى للتشخيص حيث يتم استخدام اجهزه الفحص بالموجات فوق الصوتية (السونار) لغرض تشخيص حالات كهذه ويسمى الدوالي غير السريريه وهو موضوع البحث . اجريت الدراسة على 122مريضا في عيادة علاج العقم في مستشفى اليرموك التعليمي بغداد/العراق. وقد استثني من الدراسة اي مريض مصاب باي مرض ممكن ان يتعارض مع الخصوبة وقد اخذت معلومات عامة من المرضى كذلك تم قياس الطول والوزن وقد اجريت لهم بعض التحاليل المختبرية كتحليل السائل المنوي وقياس مستوى بعض الهرمونات في الدم والتي شملت الهرمون المحفز للحويصلات((FSH,هرمون الجسم الاصفر (LH) وهرمون الشحمون الذكري(Testosterone) .كذلك تم فحص السائل المنوي للتاكد من وجود جينFasL)) لمجموعه تتكون من 60 مريضا والذين يعانون من الدوالي غير السريريه في مختبرات جامعة مانشستر مترو بوليتان في المملكة المتحدة. قسم المرضى الى مجموعتين الاولى تشمل المرضى المصابين بالدوالي السرير ي والمجموعة الثانية وتشمل المرضى المصابين بالدوالي غير السريري وقد تم مقارنه النتائج مع 50 مريضا سليما وقادرا على الانجاب . لقد اجريت عمليات جراحيه لعلاج الدوالي غير السريريه ل 60 مريضا وملاحظه التغيرات التي قد تطرا على متغيرات السائل المنوي والهرمونات وكذلك حجم الخصية . اوضحت الدراسة تاثيرا سلبيا بين المرضى الذين يعانون من الدوالي السريريه ومتغيرات السائل المنوي حيث كان التاثير واضحا في قله اعداد الحيوانات المنوية وكذلك سرعتها وشكلها الطبيعي كما اثر سلبا على حجم الخصيه المصابة وكذلك اظهر الفحص زيادة معنويه في هرمون (FSH) ونقص واضح في الهرمون الذكري (T).دون التاثير على هرمون LH)). اظهرت الدراسة تاثير دوالي الخصية غير السريري على متغيرات ا لسائل المنوي حيث كان التاثير على عدد الحيوانات المنوية وكذلك على سرعه الحيوانات المنوية وعلى شكلها الطبيعي دون التاثير على حجم الخصية او على هرمونات FSH),) او LH)).مع تاثير معنوي واضح على هرمون التستوستيرون(T) وكانت نتائج فحص ال FasL))مرتفعه لدى مرضى المجموعه. يستنتج من هذه الدراسة ان دوالي الخصية غير السريريه له تاثير واضح على بعض متغيرات السائل المنوي والهرمون الذكري وان اجراء العملية الجراحية لبعض المرضى يساعد في تحسن مستوى الخصوبة لديهم | Reproductive health is a state of complete physical, mental and social well - being and not merely the absence of disease or infirmity in all matters relating to the reproductive system and to its functions and processes. Infertility should, therefore considered to be a disease process worthy of investigation and treatment. Infertility defined as the inability of a couple to conceive after 1 year of unprotected intercourse. Male factors alone constitute about 25% - 30% of all cases of infertility, and they contribute to another 30% in combination with female factors and about 60% of male factor infertility may be due to genetic causes, others could be due to varicocele, genitourinary infections, environmental agents drugs, alcohol, life style factors like age and obesity. Varicocele is a state of dilated, elongated and tortuous veins of the pampiniform plexus of the spermatic cord typically developed during adolescent and have been found in about 15٪ of the general populations This condition is pathophysiologically characterized by retrograde flow in testicular veins found clinically as the presence of a palpable, soft scrotal mass, could be associated with mild to moderate pain, and they can also be associated with infertility. The size of varicocele is variable according to the severity of the disease. It ranges from large palpable mass of veins easily felt by the patient to varicocele that is only discovered by ultrasound study called subclinical varicoele. The treatment of the large sized varicocele is recommended and known to cause relief of the symptoms and might cause improvement to the seminal fluid quality and the state of fertility while the subclinical varicoele treatment is still controversial as there are results of some studies that showed a significant improvement of fertility after surgical treatment otherwise the treatment in many centers is still not indicated. The study objectives were to determine the relationship between subclinical varicocel and male fertility parameters in addition to follow up treated subclinical patients to determine the effects of surgical treatment on the seminal fluid and fertility. Data analyzed for 122 patients included in this study , full comprehensive history was taken ,physical examination ,testicular color Doppler ultrasound examination , pre and post operative assessments of seminal fluid analysis also evaluation serum levels of some reproductive hormonal profile includes, Follicle stimulating hormone (FSH), Luteinizing hormone (LH) and Testosterone (T) in addition to the expression of FasL mRNA gene in seminal sperms of the patients with subclinical varicocele . The Doppler ultrasound was done to all included patients to measure the testicular volume and the accurate size of the dilated testicular veins to diagnose the subclinical cases , the veins diameter 2.5 mm was used as a cutoff point. Follow up was done for 60 patients of subclinical group pre and post varicocelectomy .Fifty healthy fertile male of similar age were included in this study as a control group.The study was done in male infertility clinic of Al - Yarmouk Teaching Hospital Baghdad, Iraq from the 1st of October 2013 to the end of December 2014 while the FasL expression of 60 samples of subclinical varicocele patients were studied in Manchester Metropolitan University . Health and science laboratories - UK. Results showed that the subclinical varicocele affects male fertility with a significant negative correlation between subclinical group and some of semen parameters including : sperm morphology, percentage of progressive motile sperms and also a significant positive correlation between sperm count and FasL gene. The results also supported the hypothesis of clinical varicocele effects on male fertility as there was a significant negative correlation with the total sperm count, percentage of progressive motile sperms and also there was a significant increase in FSH with decreased testosterone (T) and mild decrease in the testicular volume. From this study we can conclude that subclinical varicocele cause decrease in sperm count, motility and sperm morphology and to some extend hormonal serum levels but no significant changes for testicular volume. Samples of subclinical patients showed a significant expression of FasL RNA and the surgical treatment of such cases gave an improvement to the state of fertility.

دالات بيوكيماوية جديدة للساركوبينيا والضعف العضلي لكبار السن في العراق العام الدراسي 2016 - 2017 == Novel Biochemical Markers for Sarcopenia and Muscle Frailty in Iraqi Elderly

Author name: ولاء اسماعيل جاسم
Supervisor name: هدف ظافر الياسين | نزارعبد اللطيف
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعرف الساركوبينيا بانها النقصان التدريجي في قوة وكتلة العضلات الهيكلية وهذا يحصل بتقدم العمر. الساركوبينيا اما ان تكون ابتدائية سببها تقدم العمر فقط بدون وجود اي سبب اخر او ثانوية وسببها تقدم العمر الذي له علاقه بالفعالية , الامراض ولتغذية. العينات وطريقة العمل تم اخذ مجموعه عينات دم من اشخاص يرتادون المستشفى التعليمي في بغداد/قسم الروماتولوجي خلال الفترة من الاول من ايلول 2016 الى نهاية شباط 2017. تضمنت الدراسة 100 عينه لاشخاص يعانون من الساركوبينيا(50 امراه و50 رجل) و50 يبدون اصحاء كمجموعة سيطرة(25 امراه و25 رجل). اخذت المعلومات من جميع الاشخاص وقد تضمنت الجنس والعمر والاصابة بالامراض. ( استبعدالا شخاص الذين يعانون من الروماتيزم الرثوي, داء الذئبة الاحمراري، مرض السكري، امراض الغده الدرقية والاشخاص الذين يتعاطون ادويه تحتوي على ستيرويدات). تم تشخيص الاشخاص الذين يعانون من الساركوبينيا الابتدائية بواسطة اختبار الاداء الحركي لكبار السن وجهاز فحص هشاشة العظم (لتعيين مجموع كتلة عضلات الجسم وكتلة عضلات الهيكل العظمي، ومعامل كتلة الجسم. ). اجريت بعض التحاليل البيولوجية التي تضمنت تحاليل تخص الالتهابات مثل الانترلوكين - 6 والبروتين سي عالي الفعالية والالفا 1 انتي - كيموتربسين ولقياس تليفات العضلات (البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد) ولقياس التقاطع العضلي العصبي ( تركيز السي اكارين فركمنت )ولقياس نمو العضلات تم قياس المايوستاتين.كل المتغيرات البيولوجية قيست بواسطة استخدام تقنية الالايزا. النتائجمعدل قيم كل من كتلة عضلات الجسم والهيكل العظمي والالفا 1 انتي كيموتربسين في مجموعة السيطرة اعلى مما في مجموعة الساركوبينيا وفي الرجال اعلى من النساء وجميع القيم تقل بتقدم العمر. معدل قيم معامل كتلة الجسم ,الانترلوكين - 6 والبروتين سي عالي الفعالية، البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد وقياس تركيز السي اكارين فريكمنت والمايوستاتين في مجموعة السيطرة اقل من المجموعة المصابة بالساركوبينيا وفي النساء اعلى من الرجال وتزداد القيم بتقدم العمر. هنالك فروقات معنويه عالية في قيم جميع المتغيرات P≤0.01 بين مجموعة السيطره ومجموعة الساركوبينيهاما بالنسبة للفروقات المعنوية حسب الاعمار فهناك فروقات معنويه عالية بين كل المتغيرات البيولوجية P≤0.01ما عدا المايوستاتين حيث لا توجد فروقات معنويه بين قيمه P≥0.05اما بالنسبة للعلاقة بين المتغيرات اعتمادا على الجنس فهي ذات فروقات معنويه عالية P≤0.01 ماعدا قيم الفا 1انتي - كيموتربسين والسي اكارين فركمنت حيث كانت الفروفات معنويه P≤0.05 كما لم تكن هنالك فروقات معنويه بين البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد والسي اكارين فركمنت P≥0.05 المناقشه1 - معدل قيم كل من كتلة عضلات الجسم وكتله عضلات الهيكل العظمي والالفا 1 - كيموتربسين في مجموعة السيطرة اعلى مما في مجموعة الساركوبينيا وفي الرجال اعلى من النساء وجميع القيم تقل بتقدم العمر. السبب في ذلك قلة الالياف العضليه , قلة خلايا وحدة الحركه , قلةخلايا الارسال وزيادة كتلة الدهون في الاشخاص المصابين بالساركوبينيا. 2 - معدل قيم كل من الانترلوكين - 6 والسي بروتين عالي الفعالية يقلل من قوة العضلات في حين ان الالفا 1 - كيموتربسين يزيد من قوة العضلات عند الاشخاص المصابين بالساركوبينيا. والسبب في ذلك ان الالفا 1 - كيموتربسين تحمي العضلات من التلف اثناء الالتهابات ولكن زيادة معدل قيمة الانترلوكين - 6 يثبط عمل الالفا1 - كيموتربسين . وتزداد قيم السي بروتين عالي الفعاليه والانترلوكين - 6 بتقدم العمر وفي الرجال اكثر من النساء بسبب زيادة كتلة غضلات الجسم وكتلة عضلات الهيكل العظمي .3 - معدل قيم السي اكارين فركمنت في مجموعة الساركوبينيا اعلى منه في مجموغة السيطرة والسبب في ذلك عند اعادة بناء الخلايا العصبيه والعضليه عند كبار السن او المصابين بالساركوبينيا الاكارين ينقسم بواسطة انزيم الكيموتربسين ويطرح السي اكارين فركمنت الى الدم وتزداد فعالية الكيموتربسين وتقل قوة الخلايا العضليه والعصبيه.4 - معدل قيم البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد في مجموعة الساركوبينيا اعلى من مجموعة السيطرة والسبب انه خلال عملية اعادة بناء الخلايا العضليه العصبيه البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد قيمها ستزداد بسبب قلة الالياف العضلية وكذلك عملية ازالة التعصب مما يؤدي الى ضعف في الكتله العضليه.5 - المايوستاتين ينظم نمو العضلات سلبيا. المايوستاتين اساسا يثبط عمليه تصنيع المايوستاتين وعندما يزداد تركيز المايوستاتين يقل نمو وقوة العضلات.6 - في الاشخاص المصابين بالساركوبينيا معامل كتلة الجسم اعلى من مجموعة السيطرة. زيادة الدهون ووزن الجسم سببها هو قلة الاحتياج الى الطاقه, قلة فعالية الجسم, قله معدل الايض القاعدي واستخدام كمية سعرات اكثر من التي يحتاجها الجسم.7 - اكثر العوامل التي تؤثر على الساركوبينيا تباعا هي كتلة عضلات الجسم الهيكليه,كتلة عضلات الجسم, المايوستاتين, البروكولاجين تايب 3 ان ترمنل ببتايد , السي اكارين فركمنت ثم الالفا 1 - كيموتربسين. | Sarcopenia is defined as the progressive decline in skeletal muscle mass and strength that occurs with aging. Sarcopenia either primary which is age - related and with no other cause except ageing or secondary sarcopenia which is related to activity, disease and nutrition.Subjects and methodsA cross sectional, case - control study was done in Rheumatology Clinic in Baghdad Teaching Hospital (during the period from September first 2016 to the end of March 2017). It included 100 sarcopinic subjects (50 male and 50 female) and 50 non - sarcopinic subjects (25 male and 25 female). Information was taken from each subject including age, & gender and diseases. Patients with inflammatory diseases (rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus), diabetes mellitus, thyroid disease and patients taking steroid therapy were excluded.Subjects with primary sarcopenia in this study were diagnosed by : Short Physical Performance Battery and dual - energy x - ray absorptiometry. appendicular skeletal muscle mass, total lean body mass and body mass index.The biomarkers studied were : inflammation : (interleukin - 6, hs - C - reactive protein and α1 - antichymotrypsin ), for markers of muscle fibrosis : (procollagen type III N - terminal peptide, for markers of functional neuromuscular junctions C - terminal Agrin fragment and myostatin

دراسة المؤشر ات الحيوية للخلايا الجذعية السرطانية FOXM1, TAZ, EpCAM,CD47 في ما يتعلق بالمعلمات النسيجية لسرطان الثدي

Author name: رفاه محمد جعفر الخطیب
Supervisor name: سالم رشید حمودي العبیدي
General topic: Medicine
Specific topic: Tissue Diseases
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

دراسة جزيئية للطفرتين NPM1 - A وFLT3 - ITD مع التعبير النسخي للمورث الجزيئي FLT3 في نموذج من المرضى العراقيين البالغين المصابين بابيضاض الدم النقياني الحاد وعلاقتهما مع المؤشرات السريرية والمختبرية == Molecular Study of NPM1 - A, FLT3 - ITD Mutations and FLT3 Transcript Expression in a Sample of Iraqi Adult Acute Myeloid Leukemia Patients : Their Correlations with Clinicopathological Parameters

Author name: شيماء محمد عبد اللطيف
Supervisor name: ختام رزاق كاظم الخفاجي | علي محمد جواد
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases - Blood
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Acute myeloid leukemia is a hematological malignancy of myeloid progenitor cells characterized by anomalous proliferation, inhibition of differentiation and extension of leukemic cells blocked at the early stage of hematopoiesis. It has a great variability in the pathogenesis, clinical features, and treatment outcomes. Detection of molecular markers has become a smart tool to further division of patients in acute myeloid leukemia subgroups.Nucleophosmin1 mutations are found in approximately 30% of adult acute myeloid leukemia patients and are associated with a good outcome when detected in absence of duplications in the Fms - like tyrosine kinase 3 gene. Over 50 molecular Nucleophosmin1 mutation variants have been recognized; the most common one is Nucleophosmin1 - A mutation.The Fms - like tyrosine kinase 3 receptor is expressed on the surface of hematopoietic stem cells and plays a vital role in normal hematopoiesis. Numerous studies have revealed that high levels of Fms - like tyrosine kinase 3 were expressed in patients with acute myeloid leukemia. Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutations are found in around 20 - 25% of patients with acute myeloid leukemia and are associated with increased transcript level of Fms - like tyrosine kinase 3 and with a poor scenario in adult acute myeloid leukemia patients.Aim of the Study1. Detect the frequency of Nucleophosmin1 - A; Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication along with assessment of Fms - like tyrosine kinase 3 transcript expression in a sample of newly diagnosed Iraqi adult acute myeloid leukemia patients.2. Study the relationship of Nucleophosmin1 - A, Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutations and Fms - like tyrosine kinase 3VItranscript expression with various clinicopathological parameters and French - American - British subtypes of the disease as well as the correlation among the three markers.Materials and MethodsThis is a cross - sectional study, conducted during the period extending between April 2015 and September 2016. The bone marrow aspirate samples of 53 adult acute myeloid leukemia patients were collected at the time of diagnosis and prior to treatment at the Hematology Ward of Baghdad Teaching Hospital in Medical City compared with 53 control individuals. All the control bone marrows obtained from patients with anemia and idiopathic thrombocytopenic purpura and were negative for infiltrative lesions. The related clinical and laboratory data for each patient were registered at the time of diagnosis.The study was conducted at Main Laboratory of Baghdad Teaching Hospital/ Medical City, Clinical and Communicable Diseases Research Center/College of Medicine/ University of Baghdad and Postgraduate Laboratory of Pathology and FoThe RNA was extracted and was reverse transcribed into cDNA. Real time polymerase chain reaction technique was applied on bone marrow aspirate samples of acute myeloid leukemia and control groups to detect the frequency of Nucleophosmin1 - A mutation, Fms - like tyrosine kinase 3 expression using a TaqMan probe and SYBR green assays respectively and detection of Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutation using gel electrophoresis post polymerase chain reaction procedure

دراسة تجريبية لانزيمات البروتييز للزائفة الزنجارية المعزولة من المرضى العراقيين المصابين بتقرح القرنية ودورها في علاج تقرح القرنية المتسبب عن المكورات العنقودية == Experimental Study of Pseudomonas aeruginosa Proteases Isolated from Corneal Ulcer of Iraqi Patients and Their Role in the Treatment of Staphylococcus aureus Keratitis

Author name: عائدة حسين ابراهيم
Supervisor name: جاسم محمد كرحوت | منيرة جلوب اسماعيل
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One - hundred and twenty samples ( corneal scraping) were collected from patients diagnosed to have microbial keratitis (corneal ulcer) who attended Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital from the period between May 2013 and November 2013, Pseudomonas aeruginosa was reported 26 (21.6%) from the total cases. All bacterial isolates were diagnosed by conventional and biochemical tests, and confirmed by Vitek 2 Compact System.The role of proteases enzymes ( Elastase ( LasB), LasA, Alkaline protease and Protease IV ) of Pseudomonas aeruginosa in the corneal ulcer was studied by using genetic and molecular biological method by real time PCR, and the results indicated that three bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa possessed elastase gene (LasB) (11.5%), and only one bacterial isolate of Pseudomonas aeruginosa harbored LasA protease gene ( 3.8%). All bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa were harbored alkaline protease gene (100%), and twenty bacterial isolates were harbored protease IV (76.9%).The results of real - time PCR analysis indicated that four bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa (15.3%) were harbored more than one gene of different proteases enzymes ( elastase, alkaline protease, and protease IV).On the other hand our results showed that one bacterial isolates (3.8%) harbored both LasA protease and alkaline protease genes, and twenty bacterial isolates of Pseudomonas aerugenosa (76.9%) were harbored alkaline protease and protease IV genes.The LasA protease was extracted from Pseudomonas aeruginosa isolate by cooling centrifuge and precipitated supernatant by ammonium sulfate at saturation (80%). The resulted extracted crude enzyme concentration was 60 μg/ml. Then the crude enzyme was partially purified by dialysis and gel filtration chromatography by using Sephadex G - 100. The concentration of partial purified enzyme reached 40μg/ml.IIISummaryThe results of the experimental treatment of bacterial keratitis ( in vivo) of infected eyes rabbits caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was effective was as Lysostaphin in eradicating Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus from the infected corneas after approximately 15 h after giving the drug at dose 100 μl ( concentration 1μg / ml ) . While Vancomycin gave us very little potency in eradicating S. aureusfrom corneas in comparison with potency of LasA protease and Lysostaphin duringthis time but showed good potency very late approximately after 3 days of applicationof treatment.The results of the experimental treatment in vitro (in the test tube ) that is caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was similar to that of Lysostaphin drug in the killing of Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus in the bacterial broth.

تاثير الفيتامينات B1,B6 and B12) على الاعتلال العصبي المحيطي : دراسة نسيجية، نسيجية كيميائية وكيميا نسيجية مناعية == The effect of vitamins B1, B6 and B12 on peripheral neuropathy , Histological , Histochemical and Immunohistological studies

Author name: صالح مهدي علي
Supervisor name: معن حمد الخالصي
General topic: Medicine
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Peripheral neuropathy is a nerve injury process by disease or so on leading to damage of peripheral nervous system . Diabetes mellitus and compression are most common causes of peripheral neuropathy. Vitamins (B1,B6 and B12) commonly used for treatment of peripheral neuropathy. The objective of this study is to compare the effect of vitamins (B1,B6 and B12) on nerve regeneration and recovery after induced sciatic nerve crush injury in experimental animal model.Seventy five male Swiss albino rats were divided randomly into five groups and each group consisted of 15 animals. Group A( which considered as control positive(with crush injury) received normal saline intramuscularly for 45days. Group B received vitamin B1 , group C received vitamin B6 , group D received vitamin B12 and group E which considered as control negative(no crush injury and no treatment) . All animals were injected vitamins intramuscularly for 45days. Tail flick test time was reduced in rats treated with vitamin B12 after crush injury to the Sciatic nerve. Mid thigh circumference (MTC) was significantly increase in B12 treated group after crush injury to the Sciatic nerve. Data analysis was performed by SPSS 20 software using descriptive statistics.IVHistological examination of rats sciatic nerves stain by H&E on day 15 showing degenerative nerve fibers with Schwann cell infiltration in all groups but it is less prominent in group D. On day 45 histological examination of rats gastrocnemius muscles exhibited separation of bundles muscle fibers by connective tissue, variation of fibers in size and shape with atrophy of muscle bundles in all groups .While these were less prominent in rats treated with B12.Van Giesons staining of rat sciatic nerves on day 45 after crush injury. In all groups experimental and control (B,C,D,A) showing degenerative nerve fibers in different areas but less in group D and better organized sciatic nerve fibers in group D.Finally, Immunohistochemical study of (anti S100 protein) of rat sciatic nerves on day 45showed strong activity for those rats treated with vitamin B12 while rats treated with vitamin B1 and B6 exhibited moderate and weak activities respectively .In conclusion vitamin B12 promote peripheral nerve regeneration more than vitamin B1and vitamin B6.

العلاقة مابين بعض العلامات الحيوية القلبية الحديثة مع درجة التكلس والتصلب في الشرايين التاجية المقاسة : متابعة علاجية بالستاتين == Association of Some Novel Biochemical Markers with Coronary Artery Calcium Score and Stenosis : Follow Up treatment with Statin

Author name: نور نصير نافع
Supervisor name: باسل عويد محمد صالح | صباح موسى فاضل
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد مفراس شرايين القلب القسطاري من احدث الطرق لتشخيص امراض الشرايين التاجية من خلال التصوير المقطعي (CCTA ) للاوعية الدمويه التاجية، والذي يعد من احدث الطرق التي تطورت بشكل ملحوظ خلال العقد الماضي من خلال تلوين الشرايين التاجية بدون تدخل جراحي لتشخيص المرض وبدقة عالية تتناسب درجة مقياس التصلب (Ca - Score) مع شدة التصلب الشرايين التاجية ويحدد درجة تطور المرض فى المراحل الاولى، ويعد الفتيون اي (Fetuin - A) من احدى العوامل السلبية الحادة المتفاعلة الذي لايزال غير معروف من الناحية الوظيفية الفسلجية، وهنالك العديد من الدلائل والدراسات التي توضح دوره المهم في عملية تكلس الاوعية الدموية الاوستيونكتين (Osteonectin) هو بروتين سكري لاصق ويعتبر عامل نضير صماوي تم تشخيصه حديثا من خلال انعكاس دوره في الحالة المرضية للانسجة الدهنية ، مثل اعادة تجدد الاوعية الدموية. ويعد الفسفاتين (Visfatin) نوع من انواع الاديبوسايتوكينات المتعدد الاوجه والذي يلعب دورا مهما في العمليات الايضية من خلال الجزء الخارجي من تركيبه وكذلك دوره في مختلف الاثار الضارة على الاوعية الدموية من خلال الالتهاب والانتشار . وقد برز حديثا دور البنتراكسين 3 (Pentraxin 3) كعلامة جديدة يعتقد انها اكثر تحديدا في التهاب الاوعية الدموية من البروتينات الاخرى في عائلة البنتراكسين مثل ارتفاع البروتين سي الحاد التفاعلي (hs - CRP).الهدفلدراسة العلاقة مابين العلامات الحيوية القلبية الحديثة الفتيون اي والاوستيونكتين والفسفاتين والبنتراكسين 3 والبروتين سي الحاد التفاعلي(hs - CRP)(Pentraxin 3)(Visfatin)(Osteonectin)(Fetuin - A) في المرضى الذين يشتبه باصابتهم بامراض شرايين القلب التاجية الذين لديهم درجه خفيفة الى متوسطة من تكلس الشرايين التاجية ، ثم مقارنة النتائج مع المرضى للذين يشتبه باصابتهم بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية وايضا لدراسة دور هذه العلامات الحيوية الحديثة مع درجة التكلس (Ca - Score) ودرجة السمنة (BMI) ومستويات الدهون في الدم المتمثلة بقياس (Cholesterol,HDL,TG) ثم دراسة تاثير علاج الدهون الـ (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) على مستوى كل من (العلامات الحيويه القلبية الحديثة ومستوى الدهون ) في المرضى المصابين بامراض تصلب شرايين القلب التاجية الذين يعانون من درجة تكلس خفيفة الى متوسطة ( Ca - Score =1 - 399 Agtaston score) .المواضيع اجريت هذه الدراسة في فرع الكيمياء الحياتية في كلية الطب - جامعة بغداد في المختبرات التخصصية لمستشفى ابن البيطار التخصصي لامراض القلب والشرايين خلال الفترة الممتدة من شباط 2013 الى كانون الاول 2013 من خلال تضمين 200 مريض مصاب بامراض تصلب شرايين القلب التاجية ثم ادراج 65 من المرضى المصابين بامراض تصلب شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية ولا يستخدمون علاج لدهون (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) تم تشخيص شدة التكلس بالشرايين التاجية من خلال قياس درجة التكلس من خلال جهاز فليبس للانظمة الطبية 64 بريليناس . ثم تقسيم المرضى الى 65 مريضا وعلى ثلاثة اقسام بحسب درجة التكلس لديهم والى ثلاثة مجاميع : المجموعة الاولى تضمنت 20 مريض لديهم درجة تكلس تساوي صفر وتتراوح اعمارهم مابين (31 - 65) سنة، والمجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى متوسطة ( Ca - Score1 - 399) تتضمن (25) مريض وتتراوح اعمارهم مابين (47 - 74)سنة، والمجموعة الثالثة ذو درجة تصلب شديدة ( Ca - Score ≥400) وتراوح اعمارهم مابين (49 - 75) سنة. تم متابع تاثير علاج الدهون (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) على مستوى العلامات الحيوية القلبية الحديثة ومستوى الدهون لدى(20) مريض من اصل (25) من المجموعة الثانية تحت اشراف الطبيب الاختصاص في امراض القلب (د.صباح موسى فاضل).النتائجكشفت نتائج هذه الدراسة انخفاض كبيرذو دلالة احصائية في مستويات تركيز كل من : (الاستيونكتين والفسفاتين) مقرون بارتفاع ملحوظ ذو دلادلة احصائية في مستوى تركيز فيتيون اي فضلا عن الارتفاع غير الملحوظ احصائيا في مستوى كل من (البنتراكسين والبروتين سي الحاد التفاعلي) في المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية والثالثة ذو درجة تكلس الخفيفة الى شديدة مقارنة بالمرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية.وقد اظهرت هذه الدراسة وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية لدى المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية بين الفسفاتين والبنتراكسين3 بينما لوحظ وجود ارتباط سلبي ذولالة احصائية بين الفسفاتين والاوستيونكتين في المرضى بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس الخفيفة الى المتوسطة ولوحظ ايضا وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين البنتراكسين والمقياس درجة السمنة من جهة في المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية مع وجود ارتباط ايجابي ذولالة احصائية مابين البنتراكسين 3 والبروتين سي الحاد التفاعلي لدى المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية مقارنة بالمرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية والثالثة ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدة .وكذلك اظهرت هذه الدراسة ايضا وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين الاوستيونكتين والكلوكوز لدى المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية للمجموعة الثالثة ذو درجة تكلس شديدة بينما وجد ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين الفتيون اي ومقياس درجة السمنة من جهة ومابين الفتيون اي ومستوى الكلوكوز من جهة اخرى لدى المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدة فضلا عن وجود ارتباط ايجابي ذو دلالة احصائية مابين البروتين سي الحاد التفاعلي ونسبة مستوى الكلكوز التراكمي بالدم مقارنتا بوجود ارتباط ايجابي ذو دلالة احصائية مع الكلسترول المفيد في الدم في المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية بينما لوحظ وجود ارتفاع ملحوظ في كل من ( قيمة نسبة مستوى الكلكوز التراكمي ومستوى الدهون الثلاثية) ومستوى كل من ( (non - HDL ,AIفي المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدةو المجموعة الثالثة ذو درجة تكلس شديدة مقارنة بالمرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية. وقد ظهرت هذه الدراسة دور علاج الدهون في انخفاض مستوى كل من الفتيون اي والبنتراكسين3 وزيادة مستوى الدهون المفيد للمرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى المتوسطة بعد متابعتهم لمدة تتراوح مابين (6 - 8) شهور. ولوحظ وجود علاقة طردية مابين هذه العلامات القلبية الحيوية الحديثة مع( درجة التصلب وعدد الاوعية القلبية التي حدث فيها التصلب )مع وجود ارتباط مابين درجة التكلس المقاسة من خلال جهاز المفراس مع نسبة التصلب .الاستنتاجنظرا لكون درجة تكلس الشريان التاجي ذو علامة بديلة متزامنة مع امراض تصلب الشرايين التاجية لوحظ تزامن حدوثها مع ارتفاع مستوى الفتيون اي مقارنتا بانخفاض مستوى كل من الاوستيونكتين والفسفاتين مما جعلني اقترح دور هذه العلامات الحيووية القلبية الحديثة في تطور الناحية المرضية المسببة لتصلب الشرايين التاجية على الرغم من ارتفاع مستوى كل من البنتراكسين 3 والحاسة البروتين سي التفاعلي والتي تعكس الدور المهم للالتهاب كعامل اولي وسيط لتقدم المرض. ثم لوحظ دور علاج الدهون بخفض مستوى كل من الفتيون اي وتابنتراكسين 3من خلال (Pleotropic effect ) خلال فترة متابعة (20) من اصل( 25) من المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين القلبية التاجية ذو درجة تكلس خفيفة الى متوسطة لمدة (6 - 8) اشهر. | Coronary Computed Tomography Angiography (CCTA) is a rapidly growing, noninvasive imaging modality that developed quickly over the last decade, and its role for evaluation of Coronary Artery Disease (CAD ) becomes of great promise with high diagnostic accuracy. The presence and extent of Coronary Artery Calcification (CAC) correlates with the overall magnitude of coronary atherosclerotic plaque burden and with the development of subsequent coronary events. Human Fetuin A, is negative acute - phase reactant, its major physiologic functions are not fully understood. Several lines of evidence have suggested that it may play an important role in blood vessel calcification. Osteonectin is an adhesive glycoprotein; it is a newly identified autocrine/paracrine factor that could affect key functions in adipose tissue physiology and pathology through its implication in pathological condition of adipose tissue such as vascular remodelling. Visfatin is an multifaceted adipocytokine, It’s circulating levels are enhanced in different metabolic disease; extracellular part can exert various deleterious effects on vascular cells, including inflammation and proliferation. The Pentraxin - 3 (PTX3) has emerged as a novel marker thought to be more specific to vascular inflammation than other proteins in the PTX3 family such as high sensitive C - reactive protein (hs - CRP). Objective To study the relationship between novel cardiac biomarkers; Fetuin - A, osteonectin , visfatin, PTX3 and hs - CRP in patients with suspected CAD who have mild to severe degree of coronary artery calcification, Ca - Sore (1 - ≥400 ASU),then compare the results to patients with suspected CAD without calcification (Ca - Sore =zero ASU)and to explain the important role of these novel biomarkers in development of CAC , also to the study association of Coronary calcium score and novel biomarkers with obesity markers(BMI), and parameters of dyslipedemia(LDL - cholesterol,HDL - cholesterol).Finally, to demonstrat the effect of statin therapy (Atorvastatin 10 - 40 mg) on both novel biomarker and parameters of hyperlipidemia in patients with mild - to moderate degree of calcification with Ca - Score (1 - 399 )ASU.Subjects This study was conducted at the Department of physiol Biochemistry, College of Medicine, University of Baghdad and at the Cardiologic Clinics of Ibn - Al - Bitar Hospital, Baghdad, Iraq, during the period from February 2013 to November 2013. A total of 200 subjects with suspected Coronary Artery Disease (CAD) were encountered, 65 of them not on statin derivatives treatment were included in this study. These patients were investigated firstly for coronary artery calcium by using Multi - Slice Computed Tomography Scanner (Brilliance 64, Philips Medical Systems). The included 65 patients were classified according to their obtained values of coronary artery Ca score into three groups : Group I (GI) included 20 subjects who have coronary artery Ca score=0.0 Agatston Score unit (ASU), aged range (31 - 65 year) and considered as control group, Group II (GII) involved 25 patients with coronary artery Ca score of more than 1 - 399 ASU, aged range (47 - 74 year) and Group III (GIII) included 20 patients who have coronary artery Ca score of more than 400 ASU, aged range (49 - 75 year).Twenty patients of GII were followed after putting them on atorovastatin therapy (10 - 40 mg/day) for 6 - 8 months under supervision of the Consultant Cardiologist. Investigations included serum measurements of Fetuin A, Osteonectin, Visfatin, PTX3 and hs - CRP by using enzyme immunosorbent assay (ELISA) technique. HbA1c, fasting serum glucose and lipid profile parameters were also measured by using spectrophotometric methods. All investigations were performed in patients of the three groups (GI, GII and GIII) and also in patients post statin treatment. Results The results of this study revealed significant reduction in serum levels of visfatin (P=0.005) and osteonectin (P=0.0001) with significant increased of fetuin A in GIII compared with GI. In GII, serum level of osteonectin was significantly decreased, while Fetuin A significantly increased in comparison with those of GI(for both, P=0.0001). There was no significant differences between GII and GIII in the these three parameters.With regard to the changes in serum concentrations of pentraxin III and hs - CRP, the results found that both of these biochemical markers did not differ significantly among the three groups (GI, GII, and GIII).This study also showed that there was significant negative correlation between visfatin and pentraxin III in G I (r= - 0.495, P=0.027), while in GII, significant negative correlation was observed between visfatin and osteonectin (r= - 0.546, P=0.005). Pentraxin III also showed significant negative correlation with BMI in GI (r= - 0.528, P=0.017), significant positive correlation with BMI in GII (r=0.406, P=0.044) and significant positive correlation with with hs - CRP (r=0.482, P=0.031) in G I. In GIII, pentraxin III showed significant negative correlation with ostonectin (r= - 0.489, P=0.029). There is significant negative correlation of osteonectin with glucose in GIII (r=0.566, P=0.009) , In GII and GIII, Fetuin A showed significant negative correlation with BMI values (r= - 0.424, P=0.035)and with serum glucose (r= - .444, P=0.049) . Respectively in G I, hs - CRP concentration was found to be significantly positively correlated with HbA1c (r= - 0.509, P=0.022).The mean value of HbA1c was found to be significantly increased in GIII compared with GI (P=0.03). The serum level of TG was significantly increased in GIII and GII in comparison to G I (p= 0.019).The mean value of serum HDL - C levels of GIII was significantly decreased in comparison with that of GI (P=0.044). The serum level of VLDL is significantly decreased in both GI and GII compared to G III (P=0. 019.The mean value of non - HDL was significantly higher in GIII than in GII and that of GI (P=0. 0289), The mean values of atherogenic index of GIII and GII were significantly higher than in GI along with significant differences between that of GI and that of GII and III(P =0.0008).The present study showed the effect of complete course of statin treatment on the serum levels of novel cardiac biomarkers, the most effected one was serum PTX3 with significant decrease of its serum levels after treatment compared to that before treatment of the same patients group (P=0.0001) combined with significant decrease in serum level of Fetuin A (p=0.027) after complete course of statin treatment. In addition, there was significant increased of serum of HDL in patients after complete course of treatment compared to their concentration before starting treatment (P= 0.0001). Significant correlations were also observed between the novel studied biochemical markers and the degree and number of the major coronary arteries stenosis as well as between Ca score and stenosis.

ازدياد تعبيرالمعلمة الجزيئية miR - 21 التي تتوسط هبوط منتظم لجين PTEN في سرطان الثدي ومصاحبتها مع عوامل التنبؤ المعروفة == MicroRNA - 21 overexpression mediated phosphatase with homology to tensin (PTEN) downregulated in breast cancer in association with clinicopathological status

Author name: شروق محمد عباس التميمي
Supervisor name: سالم رشيد حمودي العبيدي | علي حسين الخفاجي
General topic: Medicine
Specific topic: Tissue Diseases
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الخلفية : - سرطان الثدي هو الاكثر شيوعا في النساء في كل انحاء العالم . الموروث ( PTEN) هو الموروث المثبط للسرطان ,وهو منظم عكسي(اي مثبط)لاهم طريق لحدوث نمو وتكاثر الخلايا .المعلمة الجزيئية مثل ( miR - 21) هي الجزيئة الاولى التي تم اكتشافها التي تساعد على نمو وتكاثر الخلايا النامية وتمنع موت الخلايا ,اي تطيل من عمر الخلايا النامية. اذا حدث تغير في جزيئة ( miR - 21) وازداد عملها عن الحالة الطبيعية تؤدي الى حدوث نمو مستمر بدون موت الخلايا النامية مما يودي الى حدوث الخلايا السرطانية بالاضافة الى تاثيره على الموروث المثبط لنمو السرطان وهو (PTEN )الذي يعتبر موروث مستهدف له, بحيث يستطيع منع عمل هذا الموروث لذلك يؤدي الى حدوث سرطان الثدي .الهدف من الدراسة : - قياس تعبير المعلمة الجزيئية ( miR - 21) والموروث ((PTEN لمعرفة (زياده او نقصان) على اعتبارهم متغيرات حقيقية عن النسيج الطبيعي وعوامل التنبؤ لسرطان الثدي . المواد وطرائق العمل : - هذه الدراسة هي دراسة تجريبية من الشهر الاول سنة 2013 الى الشهر الاول سنه 2015.تم اخذ خمسين زوجا من العينات, وهذه العينات تؤخذ من سرطان الثدي ومن النسيج الطبيعي للثدي من النساء اللواتي تم استئصال ثديهن بسبب السرطان وهذه العينات تم اخذها في صالة العمليات وكانت العينات طازجة. تم استخلاص شريط ال RNA ثم بعد ذلك تم فحص جزيئة ال (miR - 21) وموروث(PTEN) . وتم تطبيق الواسم المناعي النسيجي الكيمياوي ((IHC لهرمون الاستروجين والبروجستين معher - 2 في العينات التي تم وضعها في بلوكات الشمع وبعد ذلك تم اختيار الحالات الموجبة ل(her - 2)وفحص تضاعف الموروث ( HER - 2) بواسطه تهجين موضعي ذي لونين .النتائج : - معظم الحالات كانت جزيئة ال( miR - 21) مرتفعة في النسيج السرطاني عن ماهو في النسيج الطبيعي وكانت احسن قيمة له (2.940 ) كدليل على ان الجزيئة تغيرت عن قيمته الطبيعية ,وكانت احسن قيمة له (4.156) في حالات انتشار السرطان في العقد اللمفاوية ,وقيمة (6.340 ) كدليل على المراحل المتقدمة من سرطان الثدي .بينما الموروث ( PTEN) كان في جميع الحالات منخفض عن النسيج الطبيعي واحسن قيمة له (0.210) كدليل لتغير تعبيرالموروث عن النسيج الطبيعي , وكانت القيمة) 0.175) دليل انتشاره الى الغدد اللمفاوية, وقيمة (0.098) تمثل المراحل المتقدمة من سرطان الثدي . هنالك علاقه عكسية بين جزيئة ال( miR - 21) والموروث ( PTEN) ولايوجد اي علاقة احصائية بين هذه المتغيرات وبين بقية عوامل التنبؤ الاخرى المعروفة في سرطان الثدي . الاستنتاجات : - التغير في التعبير كل من جزيئة ال ( miR - 21) والموروث (PTEN ) في جميع حالات سرطان الثدي وهنالك علاقة احصائية مع انتشار المرض الى العقد اللمفاوية ومع المراحل المتقدمة من سرطان الثدي . هنالك علاقة احصائية عكسية بين ازدياد التعبير للجزيئة (miR - 21) وانخفاض التعبيرللموروث (PTEN) في عينات سرطان الثدي . | Background : - Breast cancer is the most common cancer in women in worldwide. The phosphatase and tensin homolog gene is a tumor suppressor gene, and a key negatively regulator of cell signaling pathways that regulate growth and survival signaling pathways . More recently, microRNAs are small non protein coding RNAs involved in gene regulation. MicroRNA - 21 was one of the first oncogenic microRNAs and as an anti - apoptotic factor, to be characterized, being up - regulated in numerous tumors including breast cancer. The phosphatase and tensin homolog gene is one of microRNA - 21target genes Aim of the study : - To assess the validity of microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog (PTEN) gene expression as a diagnostic tool for gene alteration .Patients and Methods : - A prospective study , from January 2013 to January 2015. Fifty - pairs of fresh tissues from both breast cancer of invasive ductal carcinoma "NOS" and apparently normal adjacent tissues (from modify radical mastectomy) were by patients were recruited at the Surgical Department /Al - Diawania Teaching Hospital in Al - Diawania city . Total RNA extraction and real - time quantitative polymerize chain reaction technique were used for assessment of microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog gene expression. Tissue sample present in the paraffin embedded blocks belonging to tumor and normal adjacent tissue were used for Immunohistochemistry staining for (estrogen receptor, progesterone receptor and human epidermal growth factor receptor - 2) and dual color - chromogenic insitu hybridization technique for positive human epidermal growth factor receptor - 2 by Immunohistochemistry.Results : - Majority of cases 48(96%) ,were up regulated of microRNA - 21, indicating cancer tissue fold change of microRNA - 21 was significantly higher than that of normal adjacent breast tissue, and the best cutoff value for microRNA - 21 fold change in breast cancer tissues was (2.940)for diagnosis of gene alteration , (≥ 4.156) for positive lymph node involvement and (≥6.340) for higher stage (III,VI).All patients 50(100%) exhibit phosphatase and tensin homolog gene expression down regulation, indicating fold change of cancer tissue for phosphatase and tensin homolog gene expression was significantly lower than that of normal adjacent tissue and the best cutoff value for gene expressional alteration in breast cancer tissues was (0.210) for diagnosis of gene alteration, (≤ 0.175) for positive lymph node involvement and ( ≤ 0.098) for higher stage (III,VI) .Up - regulation of microRNA - A21 and down regulation of phosphatase and tensin homolog gene expression show no significantly correlate with other patients criteria like (age , grade ,size of tumor ,( estrogen receptor, progesterone receptor and human epidermal growth factor receptor - 2) by Immunohistochemical technique and human epidermal growth factor receptor - 2 gene amplification by dual color - chromogenic insitu hybridization technique . Identified significant negative correlation of up - regulation microRNA - 21 and down regulation of phosphatase and tensin homolog gene expression in breast cancer tissues.Conclusion : - gene expression of both microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog was significantly alterated in breast cancer tissues . It has been associated with positive lymph node involvement and higher tumor stage (III,VI)

تاثير التجميد بالتزجيج وطرق الاذابة المختلفة على حيوية وسلامة الحامض النووي للنطف == The Effect Of Laser Thawing After Vitrification On Sperm Motility And DNA Integrity

Author name: شذى صادق المراياتي
Supervisor name: غسان ثابت سعيد
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان التجميد بطريقة التزجيج تعتبر من طرق تجميد النطف البشرية وتعتمد على التجميد السريع للماء الى الحالة الزجاجية من خلال زيادة اللزوجة بدون تكوين بلورات داخلية (داخل الخلية). ان التجميد من الممكن ان يؤدي الى تاثيرات ضارة على تركيب ووظيفة النطف البشرية وان الاضرار الناتجة من التجميد من الممكن ان تؤثر على تركيب وسلامة الغشاء البلازمي. وان هذه الاضرار لا تقتصر على اضرار التجميد فقط بل تشمل ايضا على الاضرار الناتجة من عملية الاذابة بسبب اذابة او تبلور الثلج الناتج من التجميد. ان هذه العمليات ( التجميد والاذابة) من الممكن ان تؤثر سلامة الاحماض النووية وكذلك من الممكن ان تؤدي الى تغييرات في نواة النطف البشرية . ان التجميد قد يؤدي الى اجهاد تاكسدي للنطف البشرية كنتيجة الى انحلال الدهون التاكسدي وتقليل الية الدفاعية بواسطة الانزيمات المضادة للاكسدة. خلال عملية التجميد الخلايا والانسجة تخضع الى تغييرات كيميائية وفيزيائية . ان تاثير الليزر ومن خلال التحفيز الضوئي من الممكن ان يقاوم الاضرار الناتجة من التجميد للنطف البشرية وهذا من الممكن ان يؤدي الى تحسين نوعية النطف المجمدة وزيادة قابيلتها على الخصوبة. الهدف : دراسة تاثير الليزر كطريقة لاذابة النطف البشرية المجمدة وتاثيرها على سلامة الاحماض النووية والحركة مقابل الاذابة بدرجة حرارة الغرفة او عن طريق الحمام المائي. الموضوع والطرق : دراسة اجريت على 70 نموذج من النطف البشرية. كل نموذج قسم الى قسمين , قسم قد تم تحضيره بتقنية السباحة الى فوق والقسم الثاني بدون تحضير , وكل قسم قد قسم الى ثلاثة, جمدت, وتم اذابة كل جزء من النماذج بالليزر اوبدرجة حرارة الغرفة او بالحمام المائي بدرجة 37 درجة مئوية . تم دراسة سلامة الاحماض النووية وحركة النطف قبل وبعد التجميد , وكذلك قبل وبعد التحضير بتقنية السباحة الى فوق بطريقة الاكردين اونج (AOT) الحصول بالاعتماد على قياس المذنب (comet).النتائج : اظهرت النتائج ان الاذابة عن طريق الليزر لها تاثير معنوي (P<0.05 ) في تقليل تحطيم الاحماض النووية مع زيادة في الحركة الفعالة للنطف عند المقارنة مع الاذابة بدرجة حرارة الغرفة او بالحمام المائي.الاستنتاج : استنتجت هذه الدراسة ان تجميد الحيامن له اثار مؤذية تؤثر على سلامة الاحماض االنووية وحركة النطف البشرية. ان الاذابة بالليزر تحافظ على سلامة الاحماض النووية والحركة النشطة للنطف وان تقنية السباحة الى فوق كذلك تؤدي الى تنشيط النطف وتقليل تحطم الاحماض النووية. | Vitrification is a method of sperm freezing based on the rapid cooling of water to a glassy state through extreme elevation of viscosity without intracellular ice crystallization. Cryopreservation may lead to deleterious changes of sperm structure and function. Cryoinjury is not limited to the freezing process but may also occur during the thawing process as the ice melts or recrystallizes. It have been reported that cryopreservation/thawing significantly lead to alterations of sperm DNA integrity and could alter the quality of the spermatozoon’s nucleus. Cryopreservation induces oxidative stress in the spermatozoa due to increasing rate of lipid peroxidation and suppression of the antioxidant enzyme defense mechanism. These effects of cryopreservation lead to spermatozoa damage including nucleic acids. Subjects and methods : This prospective study carried on 70 cryopreserved semen samples. Each sample wasdivided into two parts, one part is unprepared and other part was prepared by swim - up technique and each part is divided into 3 parts, freezed and thawed by three methods of thawing by laser irradiation till melting for one part, and by room temperature and water bath at 37°C for the other two parts. The semen parameters were assessed by microscopical examination and the DNA integrity assessed by acridine orange test and comet assay before vitrification and after the three methods of thawing as well as before and after preparation. Result : The results of cryopreserved semen samples showed that laser irradiation thawing has a significant increase in sperm motility as well as a significant decreased DNA fragmentation (P < 0.05) versus room temperature and water bath thawing in addition sperm preparation by swim up method also lead to improve sperm motility and DNA integrity (P < 0.05).Conclusions : Vitrification has a deleterious effect on sperm DNA integrity and motility. Laser irradiation thawing methods of post freezing sperm improves post - thaw motility and DNA integrity. Sperm preparation by swim up technique for sperm preparation increasing motility and decrease DNA damage after thawing . The results of the acridine orange test and comet assay gave relatively similar predictive values for DNA fragmentation.

تاثيرات عقاري المتفورمين والاناستروزول على شكل ووظيفة المبيض في بمتلازمة تكيس المبايض في الجرذان : دراسة شكلية قياسية، نسيجية، وكيميانسيجية == The Effects of Metformin and Anastrozole on the Morphology and Function of the Ovary in Polycystic Ovarian Syndrome Rat Model, Morphometrical, Histological, and Immunoistochemical Study

Author name: علي محسن عبد الامير
Supervisor name: معن حمد الخالصي
General topic: Medicine
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

دراسة الانترلوكين - 6 ,عامل تنخر الورم - الفا وبعض العناصر النذرة في مصل مرضى متلازمة الالم العضلي الليفي == A Study of Serum Interleukin - 6, Tumor Necrosis Factor - ? and Some Trace Elements in Patients with Fibromyalgia Syndrome

Author name: رغد عماد الدين ناجي
Supervisor name: قسمة محمد تركي | محمد هادي العصامي
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: متلازمة الالم العضلي الليفي واحدة من اسباب الالم الشائع في الام الجهاز الهيكلي الذي ينتشر في اجزاء مختلفة من الجسم .تتميز هذه المتلازمة بانتشارها في الاناث وهي تصيب الفئات العمرية (۲۰ - ٧۰ ) سنة وتنخفض بعد هذا العمر . ترتبط هذه المتلازمة عادة باعراض متعلقة بالمرض وهي : التعب , تصلب العضلات , اضطراب النوم , ضعف التركيز , اضطرابات نفسية , والصداع .وعلى الرغم من ظهور الكثير من النظريات , الا ان اسباب المرض غير معروفة لحد الان .الهدف : لقياس مستوى تركيز الانترلوكين - ٦ , عامل تنخر الورم - الفا وعلاقتها باعراض الالم وقباس مستوى بض العناصر الندرة ( الزنك , النحاس , السيلينيوم ) لمرضى هذه المتلازمة.المكان : اجريت هذه الدراسة للفترة الزمنية من تشرين الثاني ۲۰١۰ الى تموز۲۰١١. وتم اختيار المرضى من المراجعين للعيادة الاستشارية الخارجية في مستشفى بغداد التعليمي لقسم امراض المفاصل والتاهيل . تم اجراء التحاليل في المختبرات التعليمية العائدة لمستشفى بغداد التعليمي ومركز السموم في مستشفى الجراحات التخصصي .الاشخاص : تضمنت الدراسة ٥٧ مريضا من مرضى متلازمة الالم العضلي الليفي ( ٤٩ انثى + ٨ ذكور ) تراوحت اعمارهم بين ( ٤٣٫۰١٧ ± ١۰٫٩٤٥ ) سنة ومجموعة المتبرعين الاصحاء عددهم ٣٤ (۲٨ انثى + ٦ ذكور ) .طرق العمل : تم قياس كل من الانترلوكين - ٦ , عامل تنخر الورم - الفا , البروتين التفاعلي - سي وهرمونات الغدة الدرقية باستخدام طريقة اليزا .اما العناصر الندرة ( الزنك , النحاس , السيلينيوم ) فقد تم استخدام طريقة الامتصاص الطيفي الحراري .تم التعبير عن النتائج بالمعدل ± معدل الغلط القياسي ومع احتمالية وقوع الغلط اقل من ( ۰٫۰٥ ) كمغزى احصائي .النتائج : اظهرت النتائج ان هناك فروقا معنوية بين مصل الانترلوكين - ٦ , عامل تنخر الورم - الفا , والبروتين التفاعلي - سي - عالي الحساسية , بين مرضى متلازمة الالم العضلي الليفي ومجموعة المتبرعين الاصحاء .اما تحاليل هرمونات الغدة الدرقية , فلم تكن هناك فروقات معنوية بين المرضى ومجموعة الاصحاء .وكانت هناك فروقات معنوية في نتائج العناصر الندرة ( الزنك , النحاس , السيلينيوم ) بين المرضى والاصحاء .الاستنتاج : البحوث السلوكية البايوكيميائية ركزت على فهم العلاقة بين متلازمة الالم العضلي الليفي والسايتوكينات , وهذا قد يقود الى فهم اكثر لاعراض هذه المتلازمة . ان ارتفاع مستوى الانترلوكين - ٦ , وعامل تنخر الورم - الفا لمصل مرضى المتلازمة يعد محفزا لاعراض التعب , زيادة الشعور بالالم , الكابة , وعامل التنخر واظهر ايضا ارتباطا بالتوتر العصبي واضطراب النوم .الميكانيكية المقترحة هي ان الانترلوكين - ٦ يحفز افرازات هرمونات قشرة الكظر المعتقد تتحفز بافراز هرمون الافراج عن الكورتيكوتروبين الفرز من قبل تحت المهاد. | Background : Fibromyalgia Syndrome (FMS) is a common chronic widespread pain syndrome , usually associated with other somatic and psychological symptoms including fatigue , sleep disturbance , and cognitive difficulties like difficult concentration . The prevalence of fibromyalgia is reported to be 2 - 4% with a female to male ratio of about 9 : 1, its prevalence increase with age from (30 - 50) , declining thereafter . The etiology and pathophysiology of fibromyalgia has not been clearly understood and that makes the disorder a frustrating condition for the patients and the physician . The etiopathology of fibromyalgia is not clear , though cytokines like interleukin - 6 is a potent stimulator of hypothalamic - pituitary axis via activation of the hypothalamic corticotrophin - releasing hormone (CRH) . Objective : To evaluate interleukin - 6 (IL - 6), tumor necrosis factor - alpha (TNF - α)and high sensitivity - C Reactive Protein (hs - CRP) and their relation with symptoms included in the underlying etiopathology of fibromyalgia patients since interleukin - 6 is a potent stimulator of hypothalamic pituitary axis via activation of the hypothalamic CRH .Setting : This cross sectional case - control study was performed at the Rheumatology and Rehabilitation Consultation unit , Baghdad Teaching hospital/medical City during the period from November 2010 to July 2011 . The laboratory tests were done in The Teaching Laboratory / Medical City , and The Toxicology Center / The Hospital of Specialized Surgeries Subjects : The study included 57 patients with FMS ( 49 females + 8 males ) , their mean age ( 43 ± 10.9) years , and 34 healthy control individuals ( 28 females + 6 males ) who their age and sex matching with the FMS patients . Methods : Serum levels of Interleukin - 6 , Tumor Necrosis Factor - α , high sensitivity - C Reactive Protein , and thyroid hormones were estimated by using ELISA technique . Zinc(Zn) , Copper(Cu) , and Selenium(Se) were estimated by Flame , and Flameless Atomic Absorption Spectrophotometric techniques. Results : The results show that the mean (± S.D.) values of serum IL - 6 , TNF - α , and hs - CRP concentrations were significantly higher in fibromyalgia patients than healthy control (p<0.05). Mean values of Sera of thyroid hormone levels were non - significant when compared with control group . The results of serum concentration of Zn , Cu , and Se of FMS patients were significantly different from that of control group ( p<0.05) .Conclusion : The elevated IL - 6 and TNF - α in FMS patients considered a promotion to fatigue , hyperalgesia , pain and depression . TNF - α is also associated with stress , rapid eye movement sleep and allodynia .

الندرونيت الصوديوم في الفصال العظمي للمفصل الظنبوبي : تاثيره على معلمات بناء وانحلال الغضروف, لبتين والفعاليات الفيزيائية للمرضى العراقيين == ALENDRONATE SODIUM IN KNEE OSTEOARTHRITIS : EFFECTS ON ANABOLIC AND CARTILAGE DEGRADATIVE MARKERS, CIRCULATING LEPTIN AND THE CLINICAL ACTIVITY IN IRAQI PATIENTS

Author name: سيناء عبد الامير كاظم
Supervisor name: حيدر مهدي جواد | سامي سلمان شهاب
General topic: Medicine
Specific topic: Medicines and Toxins
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقدمة : الفصال العظمي من الامراض الاكثر شيوعا في العالم والذي يصيب النساء اكثر من الرجال ويتميز هذا المرض بانه يحدث نتيجة لخلل في جميع مكونات المفصل متمثلا بانحلال الغضروف وتهشم العظم الملاصق له والتهاب الغلاف المحيط بالمفصل. متسببا في تقليل عرض الحيز الانسي للمفصل.الهدف من الدراسة : تقييم دور عقار الندرونيت الصوديوم ALN)) لمرضى الفصال العظمي للمفصل الظنبوبي ومعرفة تاثيره على مستوى الفعاليات الحياتية للمرضى التي تتمثل بمستوى الالم ومستوى تيبس المفصل وتاثيره على مستوى وظيفة المفصل الظنبوبي. وتقييم مدى تاثيره على معلم البناء 1β TGF , معلم انحلال الغضروف CTXII, مستوى لبتين في الدم, مايلوبيروكسيدييز MPO, الكالسيوم, مستويات الدهون بانواعه وفوسفات الالكلاين والبروتين التفاعلي C.طريقة العمل : ادخل 116 مريضا مصابا بمرض الفصال العظمي للمفصل الظنبوبي ضمن هذه الدراسة وكانوا بعمر من 45 سنة او اكثر وبالدرجة الثانية من المؤشر الشعاعي لكلكرين ولورنس (KL) مع قياس الوزن والطول, عرض الحيز الانسي للمفصل الظنبوبي, التغييرات الكيمياوية المختبرية المتمثلة بمستوى الكالسيوم, مستويات الدهون بانواعه متمثلة بقياس نسبة الكولسترول , الدهون الثلاثية, البروتينات الدهنيه عالية الكثافة والبروتينات الدهنية واطئة الكثافة , فوسفات الالكلاين والبروتين التفاعلي C وقياس المعلمات المناعية بطريقة الالايزا لكل من معلم البناء 1β TGF , معلم انحلال الغضروف CTXII, مستوى لبتين في الدم, مايلوبيروكسيدييز MPO. حيث تم قياس المستويات المذكوره اعلاه قبل البدا باخذ العلاج. تم اعطاء المرضى 10 ملغم من عقار الندرونيت الصوديوم (ALN) واعيد تقييم حالة المرضى بعد اكمال الاشهر الثلاثة من العلاج.النتائج : لوحظ ان هناك تحسن معتد على الفعاليات الفيزيائية واعراض الفصال العظمي , مع انخفاض معتد في معلم TGF β 1 (لاتوجد مقارنة بين تغيره وتحسن حالة المرضى, غير ان له علاقة بزيادة كتلة الجسم) , معلم انحلال الغضروف ) CTXIIحيث له علاقة بتحسن الفعاليات الحياتيه للمرضى), مستوى لبتين في الدم. مع تغير غير معتد في عرض الحيز الانسي للمفصل, مستوى الكالسيوم, مايلوبيروكسيدييز, مستويات الدهون بانواعه متمثلة بنسبة الكولسترول , الدهون الثلاثية, البروتينات الدهنيه عالية الكثافة والبروتينات الدهنية واطئة الكثافة , فوسفات الالكلاين والبروتين التفاعلي C. الاستنتاج : عقارالندرونيت صوديوم له فعالية كبيرة في تحسين الفعاليات الحياتية لمرضى الفصال العظمي وتقليل الالم الناتج من المرض دون تاثير معتد على تغير تركيب المفصل على الرغم من تقليله لمعلم اضمحلال الغضروف. عدم تاثير العقار على مستويات الدهون في الجسم المتمثلة بنسبة الكولسترول , الدهون الثلاثية, البروتينات الدهنية عالية الكثافة والبروتينات الدهنية واطئة الكثافة يجعله امنا نسبيا للمرضى المصابين باختلال نسبة الدهون. | Background : Osteoarthritis is a common arthritic disorder and responsible for 2 % of disability of people in all world. Osteoarthritis has believed to be principally a cartilage defect associated with focal articular cartilage degradation. Alendronate sodium (ALN) interferes with normal bone formation and turnover cycle in the body by slowing bone loss with elevating bone mass. . Aims of the study : This study was done to evaluate the effects of alendronate sodium on disease activity and physical function in patients with knee osteoarthritis, to evaluate the biochemical parameters in osteoarthritis patients including serum alkaline phosphate, calcium, c - reactive protein and lipid profile in form of analysis of serum cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein and high density lipoprotein. Also to study the impact of ALN on anabolic in form analysis of serum transforming growth factor beta 1 (TGF - β1) , cartilage degradative in form of C - terminal cross linked - telopeptide of type II collagen (CTXII), Myloperoxidase (MPO) and leptin markers in osteoarthritis patients and to determine its effectiveness in slowing progression of disease. .Patients and methods : The patients were habitants of the cities of Al - Diwaniyhia (consulting the Rheumatologic Unit in Al - Diwanyhia Teaching Hospital) and Baghdad (consulting the Rheumatologic Unit in Baghdad Teaching Hospital). From those patients, 116 osteoarthritic patients 45 years old and more with Kellgren and Lawrence X - ray grade II and more with knee pain were enrolled in this study. Base line assessment was done including measurement of joint space width, assessment of WOMAC scoring(pain, function and stiffness), body mass index and the biochemical parameters (serum alkaline phosphate, calcium, c - reactive protein and lipid profile in form of analysis of serum cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein and high density lipoprotein) with enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) analysis of serum (transforming growth factor beta 1 (TGF - β1) , C - terminal cross linked - telopeptide of type II collagen (CTXII), MPO and Leptin. They were instructed to take ALN 10 mg daily. Reassessment was done after 3 months of treatment. Results : A significant symptomatic improvement in WOMAC scoring regarding pain and stiffness (P<0.001) were observed associated with non significant improvement in function, significant reduction (P<0.001) in serum CTXII, Leptin and TGF - β1. A nonsignificant reduction in serum calcium and MPO, associated with no significant changes in serum Alkaline phosphatase, C - reactive protein, lipid profile(serum cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein and high density lipoprotein) and joint space width were also reported. CTX II after treatment showed no significant correlation with BMI, however it showed significant positive correlations with WOMAC score. On the other hand, TGF - β1 showed significant positive correlation with BMI, but no significant correlations with WOMAC score. Conclusion : Alendronate sodium in patients with osteoarthritis has clinical efficacy in reducing symptoms especially pain through inhibition of leptin and CTXII with no significant structural improvement despite reduction of CTXII and TGF - β1 with no effects on inhibition of further disease progression. Relatively safe in old patients with dyslipidemia since there is no associated lipid disturbances with ALN. The reduction in level of CTX - II in the present study may be considered as one of the mode of actions of alendronate in patients with osteoarthritis
1 ... 31 32 33 34 35 ... 46