Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 6,985

استهداف الخلية السرطانية بواسطة نانو الهجين الحويصلي كنهج جديد لموت الخلايا المبرمج == Targeting Cancer Cell by Nano Hybrid Liposome : A new Approach for apoptosis

Author name: نورا عبد عواد
Supervisor name: قسمة محمد تركي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الخلفية : يعتبر العلاج الهادف للسرطان بالنانو حقلا مهما للبحث عن علاجات خاصة بالسرطان لتجنب الاعراض الجانبيه للادويه الكيمياويه التقليديه ،ولان خلايا السرطان تعاني من عطل في منظومة الموت المبرمج يؤدي هذا الى تفضيلهه لمسارات البقاء على قيد الحياة ومقاومة الادويه ولهذا يعتبر تحفيز الموت المبرمج في الخلايا السرطانية من الوسائل المفضلة للتطبيق في اي دواء مستحدث لعلاج السرطان .ان اهداف العلاج بالنانو هو رفع الكفاءة العلاجية للدواء وانتقائيتة والتغلب على مقاومة الخلايا له والتي تمثل عقبة في علاج السرطان.وقد يفيد استعمال الاجسام النانويه الدهنية المهجنة بكل هذه الاغراض في علاج السرطان .تتكون الاجسام النانوية الدهنية المهجنه من مع الايثر)C12(EO)23)L - DMPC والذي يتداخل انتقائيا مع جدار الخلية السرطانية مؤديا الى موتهاالاهداف : تقييم قابلية اجسام النانو الدهنيه المهجنه والمصنعه محليا على احباط نمو خلايا سرطان عنق الرحم والرابدومايوساركوما كتاكيد لحصول الموت المبرمج في زراعتها المحضونه مع الهجين الحويصلي المصنع مختبريا.طرق العمل حضرت اجسام النانو الدهنية الهجينة من مزج [DMPC & C12(E0)23] ومزجها في وسط زررعي خاص ثم بعد ذلك يتم وضعها في حمام مائي لامواج فوق الصوتية Sonicatore) ) للحصول على الشكل الكروي والحجم النانوي الهجين وللتاكد من ذلك تم فحصها باستخدام المجهر الالكتروني الماسح (SEM) ومجهر القوة الذرية (AFM) , وتم تحديد حيوية الخلايا عن طريق احتساب نسه الخلايا الميتة الى الحية بعد تصبيغهه بالصبغات التي تبين سمية الخلايا Crystal Violate&MTTوتم فحص والتاكد من الموت المبرمج بتقنيات متعدده منها الصبغات المتفلوره واختلال شدة نفاذية المايتوكوندريا وقياس فعاليه انزيم PCR وال, (Caspase - 3) النتائج : النتائج تمكن الهجين الحويصلي الواقع ي مجال وانتقائية النانو من احباط انقسام خلايا سرطاني عنق الرحم، والرابدومايوساركوما وبتركيز نصفي (IC50) مساوي لــ (0.2 mmol)، بينما لم تتاثر الخلايا اللمفاوية الطبيعية بهذه الظروف.وكان التاثير واضحا في كل الطرق التي استعملت لقياس الموت المبرمج وقدمت ادله واضحة على ان الهجين الحويصلي قادر على تحفيز الموت المبرمج في خلايا سرطاني عنق الرحم والرابدمايوساركوما عند حضنها مع الجرعه المحبطه النصفية للهجين الحويصلي ولمدة 24 ساعه .الاستنتاجات : يمكن اعتبار الهجين الحويصلي المصنع كوسيلة ممكنه للعلاج بالنانو وباقل اضرار جانبيه للخلايا الطبيعيه مقارنة مع العلاجات المستعمله الاخرى. وتوصي هذه الدراسة ببحث طريقة عمل الهجين الحويصلي وقابليته على احباط نمو انواع اخرى من الخلايا السرطانيه في المختبر وفي البحوث الحيه | Background : Cancer targeted nanotherapy represent an exciting field in the search for new cancer specific therapies to avoid conventional chemotherapy side effects. Because cancer cells usually have malfunctioning apoptotic machinery which favors survival pathways and drug resistance, cancer cell apoptosis is the favorable event to be induced in any new anticancer agent development. Nanotherapy goals are to elevate therapeutic efficiency, selectivity, and overcome drug resistance as major obstacle in cancer treatment. Hybrid nanoliposomes (nHLs) may fulfill all these features in cancer therapeutics.Hybridnanoliposomes (HLs) composed of L - α - dimyristoylphosphatidylcholine (DMPC) and Polyoxyethylene (23) dodecyl ether (C12 (EO)23) can integrate selectively into the cancer cell membrane inducing cancer cell death.Objectives : to assesses the capacity of locally synthesized hybrid nanoliposome to inhibit the growth of cervix cancer cells (HeLa) andrabdomyosarcoma(RD)to confirm the event of apoptosis in HeLa and RD cell lines incubated with in - house synthesized and characterized nHLs.Methods : hybrid nanoliposomes(nHLs) synthesized by sonication method from a mixture of DMPC and C12(EO)23 in tissue culture media RPMI - 1640 for 6 hours at 300W and 40ºC then filtration with 0.2µm filter. Shape and size characterized with scanning electron microscope (SEM) and atomic force microscope(AFM). Viability of HeLacell,RD cell, and normal lymphocytes challenged with HLs were determined using MTT and Crystal violate assay. Induction of apoptosis in the challenged cells was examined by staining with fluorescence dye mix cridine orange/propidium iodide,cell gel electrophoresis, mitochondrial membrane potential disruption, caspase - 3 activity and real time PCR.Results : synthesized nHLs were in nanozise range and selectively inhibited HeLa cells proliferation with IC50 of 0.2mM with no effect against normal lymphocytes. Apoptosis was evident ofHeLa cells population and RD was evident of treated with nHLs.All apoptosis detection procedures used gave a clear defined significant indication that nHLs was capable of inducing apoptosis in HeLa and RD cells incubated with the IC50.Conclusion : synthesized nHLs may considered as promising nanotherapy, this study recommends further inspections for the mechanism of action of nHLs and there capabilities to inhibit other types of cancers both invitro and in vivo.

التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لبروتينات (CD24, CD44 وALDH1) للخلايا الجذعية السرطانية في سرطان الثدي : دراسة سريرية مرضية == Immunohistochemical Expression of Stem Cell Markers CD24, CD44 and ALDH1 in Invasive Breast Carcinoma A Clinicopathological Study

Author name: حسنين غسان حسين
Supervisor name: سالم رشيد حمودي العبيدي
General topic: Medicine
Specific topic: Tissue Diseases
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد سرطان الثدي واحدا من الاورام السرطانية الاكثر شيوعا في النساء بالعالم يوقدر بحوالي 1,7 مليون حالة جديدة مسجلة في عام 2012 (بنسبة 11,9% من باقي الاورام السرطانية). في العراق سرطان الثدي يعتبر الاكثر شيوعا لدى النساء ويشكل ما نسبته 34,8% من بين باقي الاورام السرطانية (سجلات وزارة الصحة). الخلايا الجذعية السرطانية تعرف بانها : مجموعة صغيرة من الخلايا السرطانية داخل الورم السرطاني تعتبر المخزون لاعادة تكاثر الخلايا السرطانية وتكوين تنوع خلوي ذات تخصص مختلف في مراحل نموها, من المؤشرات المقبولة للخلايا الجذعية السرطانية هي : CD24 , CD44 , CD133 , EPCAM وALDH1).الهدف من الدراسة : تقييم التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمؤشرات الخلايا الجذعية السرطانية (CD24 , CD44 وALDH1) في كل من النسيج الطبيعي للثدي , الورم الغدي الليفي الحميد في الثدي وسرطان الثدي (بنوعيه سرطان الثدي القناتي الاختراقي وسرطان الثدي الفصي الاختراقي) وعلاقة هذا التعبير المناعي النسيجي الكيميائي مع المتغيرات السريرية المرضية (العمر , حجم الورم السرطاني , درجة التمايز للورم السرطاني وحالة الغدد اللمفاوية).المرضى , المواد وطرق العمل : من تاريخ نيسان 2012 الى اذار 2013 , تم اخذ 133 عينة نسيجية تشمل 37 عينة نسيجية للمجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني ( 12 عينة لنسيج طبيعي للثدي و25 عينة للورم الحميد ) و96 عينة نسيجية للمجموعة المصابة بالورم السرطاني ( تتالف من 51 حالة رفع ثدي كامل و45 عملية استئصال للورم) حيث تكونت من 87 حالة من سرطان الثدي القناتي الاختراقي وتسع حالات من سرطان الثدي الفصي الاختراقي. اخذت الانسجة الارشيفية المطمورة في شمع البارافين للمدة بين 2011 و2013 من ملفات المختبرات التعليمية لدائرة مدينة الطب ومختبر الغدق التخصصي الخاص ومن معهد الطب العدلي في بغداد. وكل المعلومات السريرية تم استحصالها من البيانات الخاصة بالمرضى. كل العينات اعيد تقيمها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين وتم التحري عنها بواسطة الصبغة المناعية النسيجية الكيميائية للمؤشرات (CD24 , CD44 وALDH1).النتائج : وجد انه هناك علاقة ذات دلالة احصائية بين الحالة الصحية للثدي (ان كان الثدي طبيعي , به ورم حميد او ذات ورم سرطاني) والتعبير المناعي النسيجي الكيميائي للمؤشرات الثلاثة للخلية الجذعية السرطانية (CD24, CD44 وALDH1).التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمؤشر CD24 في نسيج الثدي : عشرة حالات من اصل 37(27%) للمجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني يكون التعبير المناعي موجب. بالنسبة للمجموعة المصابة بالورم السرطاني , 41 حالة من اصل 87(47,1%) من حالات سرطان الثدي القناتي الاختراقي واربع حالات من اصل 9(44,4%) من حالات سرطان الثدي الفصي الاختراقي يكون التعبير المناعي موجب. ولم تكون العلاقة ذات دلالة احصائية بين مؤشر (CD24) والمتغيرات السريرية المرضية (العمر, حجم الورم, درجة التمايز وحالة الغدد اللمفاوية).التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمؤشر CD44 في نسيج الثدي : ثمانية حالات من اصل 37(21,6%) للمجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني يكون التعبير المناعي موجب. اما ما يخص المجموعة المصابة بالورم السرطاني, 27 حالة من اصل 87(31,03%) من حالات سرطان الثدي القناتي الاختراقي وثلاث حالات من اصل 9(33,3%) من حالات سرطان الثدي الفصي الاختراقي يكون التعبير المناعي النسيجي موجب. توجد علاقة ذات دلالة احصائية بين مؤشر CD44 للخلايا الجذعية السرطانية مع حالة الغدد اللمفاوية حيث كانت قيمة (P) تساوي (0,0140). ولم يكن هنالك علاقة ذات دلالة احصائية بين مؤشر (CD44) وباقي المتغيرات السريرية المرضية (العمر, حجم الورم ودرجة التمايز).التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمؤشر ALDH1 في نسيج الثدي ينقسم الى : 1. التعبير المناعي لمؤشر ALDH1 في نسيج الخلايا السرطانية : سبعة حالات من اصل 37(18,9%) للمجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني يكون التعبير المناعي موجب. وفيما يخص المجموعة المصابة بالورم السرطاني, 34 حالة من اصل 87(39,2%) من حالات سرطان الثدي القناتي الاختراقي وثلاث حالات من اصل 9(33,3%) من حالات سرطان الثدي الفصي الاختراقي يكون التعبير المناعي موجب. توجد علاقة ذات دلالة احصائية بين مؤشر ALDH1 للخلايا الجذعية السرطانية مع حالة درجة تمايز الورم حيث كانت قيمة (P) تساوي (0,0323). ولم يكن هنالك علاقة ذات دلالة احصائية بين مؤشر ALDH1 وباقي المتغيرات السريرية المرضية (العمر, حجم الورم وحالة الغدد اللمفاوية).2. التعبير المناعي لمؤشر ALDH1 في النسيج المحيط للخلايا السرطانية : ثمانية حالات من اصل 37(21,6%) للمجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني يكون التعبير المناعي متوسط الى قوي التعبير في الخلايا المحيطة للخلايا السرطانية و29(78,4%) حالة يكون التعبير المناعي منعدم الى ضعيف في هذه الخلايا. اما ما يخص مجموعة المصابة بالورم السرطاني للثدي, 47 حالة من اصل 87(54,2%)من حالات سرطان الثدي القناتي الاختراقي وخمس حالات من اصل 9(55,6%) من حالات سرطان الثدي الفصي الاختراقي يكون التعبير متوسط الى قوي. من هذه الدراسة وجد انه لايوجد علاقة ذات دلالة احصائية بين التعبير المناعي لمؤشر ALDH1 في النسيج المحيط للخلايا السرطانية والمتغيرات السريرية المرضية (العمر, حجم الورم, درجة التمايز وحالة الغدد اللمفاوية).الاستنتاج : - توجد علاقة ذات دلالة احصائية بين مجموعة الغير مصابة بالورم السرطاني والمجموعة المصابة بالورم السرطاني للثدي من حيث التعبير المناعي للمؤشرات (CD24, CD44 وALDH1) في الخلايا الجذعية السرطانية. - هنالك علاقة ذات دلالة احصائية بين فرط التعبير المناعي لمؤشر CD44 وحالة الغدد اللمفاوية في حالات سرطان الثدي. - في هذه الدراسة توجد علاقة ذات دلالة احصائية بين فرط التعبير المناعي لمؤشر ALDH1 في الخلايا السرطانية ودرجة التمايز في الورم السرطاني للثدي. - نتائج المتحصلة من هذه الدراسة تقترح بان فرط التعبير المناعي النسيجي الكيميائي للمؤشرات المناعية (CD24, CD44 وALDH1) قد ترتبط بحالة تحول الورم الى النوع السرطاني وكذلك بالحالة البايولوجية لسرطان الثدي. | Breast Cancer is the most frequent diagnosed cancer among women worldwide with an estimated 1.7 million new cancer cases diagnosed in 2012 (11.9% of all cancers). In Iraq, cancer of the breast is the commonest cancer in females, in 2010 constituted 34.8% of all other malignancies in women. Cancer stem cells have been defined as - a small subset of cancer cells within a cancer that constitute a reservoir of self - sustaining cells with the exclusive ability to self - renew and to cause the heterogeneous lineages of cancer cells that comprise the tumor, the well - accepted cancer stem cell markers are CD44, CD24, CD133, CD166, EpCAM and ALDH1.Aim of the studyTo assess the immunohistochemical expression of CD24, CD44 and ALDH1 as stem cell markers in normal breast tissue, fibroadenoma and breast carcinoma (Invasive ductal and Invasive lobular carcinomas), in correlation with some clinicopathological parameters (Age of patient, tumor size, tumor grade and lymph node status).Patients, materials and methods From April 2012 to March 2013, total of (133) tissue samples of surgical breast biopsies were included in this retrospective study, 37 cases of non - malignant breast cases (12 cases of normal breast tissue and 25 fibroadenoma case) and 96 cases of malignant breast cases (51 mastectomy case and 45 cases of excisional biopsies) were all of them invasive breast carcinoma, eighty seven cases were of invasive ductal carcinomas and nine cases of invasive lobular carcinomas. The samples were obtained from archival paraffin embedded blocks for the years (2011) to (2013) from the histopathology files of department of pathology in Teaching Laboratories of medical city Hospital, Al - Ghadaq’s private Laboratory and Institute Of Forensic Medicine in Baghdad.. The histopathological diagnosis had been revised and all cases were stained by immunohistochemical technique with CD24, CD44 and ALDH1 tumor markers.Results There was significant difference among the three states of health status (normal breast cases, fibroadenoma cases and invasive breast carcinoma) and immunohistochemical expression of stem cell marker (CD24, CD44 and ALDH1 epithelial and stromal expression). Regarding Immunohistochemical expression of CD24, ten cases out of 37(27%) of non malignant breast cases were positive of CD24 expression. For malignant breast cases, forty one invasive ductal carcinoma cases out of 87(47.1%) and four invasive lobular carcinoma cases out of 9(44.4%) were CD24 with positive expression, and there was no significant difference regarding CD24 expression in relation to different clinicopathological variables (age of the patient, tumor grade, lymph node status and tumor size). For CD44 immunohistochemical expression, eight cases out of 37(21.6%) of non malignant breast cases were positive of CD44 expression. For malignant breast cases, Twenty seven invasive ductal carcinoma cases out of 87(31.03%) and three invasive lobular carcinoma cases out of 9(33.3%) were positive CD44 expression, and there was a significant difference regarding CD44 expression in relation to lymph node status of the patients (P=0.0140). Regarding the age of the patient in invasive breast carcinomas there was no significant difference between CD44 expression and the three groups of the patient age, so as for grade of tumor and tumor size (P > 0.05). Regarding ALDH1 epithelial immunohistochemical expression, seven cases out of 37(18.9%) of non malignant breast cases were positive of CD44 expression, while for malignant breast cases, thirty four invasive ductal carcinoma cases out of 87(39.2%) and three invasive lobular carcinoma case out of 9(33.3%) showed a positive expression of epithelial ALDH1. There was no significant difference in epithelial ALDH1 expression between different age groups of the patients. CD44 immunohistochemical expression was significantly different in different grades of invasive breast carcinomas (P=0.0323). The mean value of ALDH1 - E expression showed no significant difference between cases with positive lymph node involvement and those with a negative lymph node involvement, also there was no significant correlation in epithelial ALDH1 immunohistochemical expression in relation to the tumor size. For stromal ALDH1 immunohistochemical expression, eight cases out of 37(21.6%) of non malignant breast cases were moderate/strong of stromal ALDH1 expression and 29(78.4%) cases were none/weak expression. Regarding malignant breast cases, forty seven invasive ductal carcinoma cases out of 87(54.2%) and five invasive lobular carcinoma cases out of 9(55.6%) were moderate/strong expression of stromal ALDH1, and there was no significant difference regarding stromal expression of ALDH1 in relation to different clinicopathological variables (age of the patient, tumor grade, lymph node status and tumor size). Conclusions • A statistical significant correlation has been found between Malignant Breast cases and Non Malignant Breast cases regarding the Immunohistochemical over expression of stem cell markers (CD24, CD44 and ALDH1 epithelial and stromal Expression).• There was a statistical significant correlation between CD44 immunohistochemical expression and lymph node status in invasive breast carcinomas cases.• A statistical significant correlation has been found between ALDH1 Epithelial immunohistochemical expression and Grade of tumor in cases of invasive breast carcinoma. • The results of this study suggest that higher stem cell markers (CD24, CD44 and ALDH1) expression may be associated with malignant transformation and progression in breast cancer biology

تقييم كهروتشخيصي لمرضى اعتلال جذور الاعصاب العنقية == ELECTRODIAGNOSTIC ASSESSMENT IN PATIENTS WITH CERVICAL RADICULOPATHY

Author name: زينه سليم فخري
Supervisor name: نجيب محمد | احسان محمد
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Cervical radiculopathy can be defined as pain in a radicular pattern in one or both upper extremities related to compression and/or irritation of one or more cervical nerve roots. In the electrodiagnostic laboratory, various types of electrodiagnostic studies may be considered when evaluating a patient for cervical radiculopathy. Potential tests including (needle electromyography, motor and sensory nerve conduction studies, late responses, and somatosensory evoked potentials) serves to confirm the presence of radiculopathy, establish the involved nerve root level, determine if axon loss or conduction block is present, grade the severity of the process, estimate the age of the radiculopathy and exclude other peripheral nerve diseases that mimic radiculopathy.The aim of this study was to approve the usefulness of the electrodiagnostic studies (NCS, EMG and SSEP) in the diagnosis of cervical radiculopathy, asses the role and accuracy of the SSEP test (specifically spinal N13 component) in the diagnosis of cervical radiculopathy, identify the extent and distribution of cervical paraspinal muscles denervation in cervical radiculopathy and match the electrodiagnostic results with imaging data in the localization of the root lesion involved.This is case control study had been conducted during the period from April 2016 to October 2017. Ninety five (95) patients with cervical radiculopathy with a mean age of (48.4±11) years and twenty six (26) healthy control subjects with a mean age of (45.2±10.1) years involved in the study. Each subject submitted for medical history, clinical examination and electrophysiological study using Nicolete Viking Quest , EMG, NCS, EP measuring system.XIIFor SNCS, Onset latency, SNAP amplitude and conduction velocity, while for MNCS, distal motor latency, CMAP amplitude and conduction velocity, in addition to the minimal F wave latency (that assess the late response) of median and ulnar nerves are performed.Whereas for right and left sides median nerve SSEP test, the following peak and interpeak latencies (1) N9; (2) N13; (3) N20; (4) N9 - N20; (5) N9 - N13 ; (6) N13 - N20 are measured.Concerning the needle EMG, the following parameters; insertional activity, spontaneous activity and motor units action potential characteristics (duration and phases) of the right and left trapezius, rhomboids major, deltoid, biceps, triceps, extensor indicis and first dorsal interosseous muscles are considered and recorded. In addition to the assessment of the spontaneous activity of the cervical paraspinal muscles.The results of this study revealed that there are significant differences; higher values for the patients when compared with that of control groups regarding Rt and Lt sides N13 peak latency, N9 - N13 and N13 - N20 inter - peak latency. Moreover, the sensitivity of SSEP components in comparison with the MRI (as a gold standard) is the higher for that of spinal N13.From the EMG and MRI findings, C6 and C7 cervical roots are the most roots affected in respect to C5, C8 or C4 roots.Consequently, there are mismatching in the percentages of cervical radiculopathies when diagnosed by the MRI of the cervical spine, needle EMG of the upper limbs muscles and that of the cervical paraspinal muscles, in such a way that Rt C7 radiculopathy 71.6% by cervical spine MRI mismatched with that of upper limbs EMG (66.3%) and 5.3% by the cervical paraspinal muscles.However, the percentages of each level of cervical radiculopathy proved to be higher by the combination of the EMG abnormaities of the cervical paraspinalXIIImuscles with that of the upper limbs muscles than by using the EMG of the paraspinal muscles or upper limbs muscles in an isolation (for Rt C6 radiculopathy 4.2% by paraspinal muscles EMG, 66.3% by upper limb and 68.4% by combination.Furthermore, the sensitivity of the EMG in cervical radiculopathy (using the MRI as a gold standard) increases by the combination of the abnormalities of the cervical paraspinal muscles with that of the upper limbs muscles, for example the sensitivity of Lt C6 radiculopathies 89.9% by upper limbs EMG, 93.2% by the combination of the EMG of PSM with that of the upper limbs muscles.In conclusion, traditional electrodiagnostic tests (NCS, EMG and SSEP) proved to be useful and complementary to the clinical examination in the evaluation of patients with cervical radiculopathy. The benefit of SSEP test for the evaluation of radiculopathies is based on the fact that signs and symptoms in radiculopathies can usually be related to injury of the afferent fibers and the SSEP test can monitor injury to these fibers.In addition to, spinal N13 is a sensitive technique suitable for detecting early and mild symptomatic cervical nerve root lesion.Moreover, cervical paraspinal muscles EMG is complementary to the upper limbs muscles EMG since that significant percentages of cervical radiculopathy will be missed if the examination of PSM is not part of the electrodiagnostic evaluation of patients with suspected radiculopathy. Furthermore, the sensitivity of the needle EMG is increased by the combination of the EMG of the paraspinal muscles with that of the upper limbs muscles, without paraspinal muscles needle EMG the screen of cervical radiculopathy misses much of its sensitivity. Finally, EMG and MRI are valuable and complementary diagnostic tools in the localization and extent of the cervical roots lesion.

التقييم الكهروفسلجي لالياف الاعصاب الصغيرة والكبيرة قبل وبعد الديلزة للمرضى المصابين بالعجز الكلوي المزمن == Electrophysiological Assessment of Small and Large Nerve Fibers Dysfunction Pre and Post Dialysis in Patients with Chronic Kidney Disease

Author name: فارس كاظم خضير
Supervisor name: نجيب حسن محمد
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يتم التشخيص لمرضى الكلى المزمنة وظيفيا وتتتميز بالانخفاض التتدريجي لراجعة فيه في معدل الترشيح الكبيبي . ومما يزيد من تعقيدها هو عدم القدرة على الحفاظ على مستويات طبيعية من منتجات الايض للبروتين (اليوريا والكرياتينين) وكذلك الحفاظ على مستوى ضغط الدم الطبيعي واختلال في انتاج كريات الدم الحمراء والهيموغلوبين واختلال في معدلات الصوديوم والماء والاملاح . يعتبر اعتلال الاعصاب المحيطية من المضاعفات الشائعة للمرضى المصابين بالفشل الكلوي وهم معرضين اكثر من غيرهم للاصابة بالتهاب الاعصاب المحيطية المتعدد . الفحص الكهروفسلجي مهم اضافة الى الفحص السريري لاجل التشخيص المبكر لمثل هذه المضاعفات وكذلك للتمييز والتفريق بين الانواع المختلفة للاعتلال العصبي المحيطي. هدفت هذه الدراسة الى : (1) تقييم وظيفة الدراسة الكهروفسلجية في تشخيص الاعتلال العصبي للمرضى الذين يعانون من الفشل الكلوي المزمن .(2) معرفة القيم القياسية الاكثر ضرورية من دراسة توصيل العصب، ليتم تنفيذها كاختبار اولي في تشخيص الاعتلال العصبي الالياف الصغيرة.(3) الارتباط بين شدة الاعتلال العصبي المحيطي ومستوى الكرياتينين في الدم.ثلاث مجموعات من المواضيع المدرجة في هذه الدراسة : المرضى البالغين من مرض الكلى المزمن ليس على غسيل الكلى بعد، المرضى على غسيل الكلى ومراقبة الموضوعات.اجريت هذه الدراسة في وحدة الفسلجة العصبية في مستشفى اليرموك التعليمي، في الفترة من يونيو / حزيران 2016 الى سبتمبر / ايلول 2017.اجريت هذه الدراسة على ثلاثة مجاميع بكلا الجنسين تالفت المجموعة الضابطة من اثنان واربعين (42) متطوعا اصحاء (22 ذكور و20 اناث). تراوح عمر هذه الفئة بين 20 و75 سنة بمتوسط (52.48 ± 10.63) سنة. 22 - 75 سنة للذكور بمتوسط العمر (53.54 ± 14.57) سنة، و20 - 74 سنة للاناث بمتوسط العمر (51.42 ± 11.91) سنة. كان جميع الاشخاص الذين تم فحصهم من هذه المجموعة لا يعانوا من امراض مزمنة، مع عدم وجود تاريخ طبي من امراض الجهاز العصبي. لا يوجد تاريخ من تعاطي الكحول او تناول المخدرات. وقد كان اغلبهم من الاقارب العاديين، والعاملين الطبيين، والطلاب والعاملين . شملت الدراسة ثمانون مريضا يعانون من الفشل الكلوي المزمن. قسموا الى مجموعتين : ا - اربعون (40) مريضا مصابين بامراض الكلى المزمنة يراجعون عيادة امراض الكلية والغسيل الكلوي وهم غير خاضعين للعلاج بالديلزة ومعدل الكرياتنين في مصل الدم لديهم مرتفع بشكل مطرد اكبر من 2.5 ملغ / دلزمن كلا الجنسين (22 ذكور و18 اناث)، تراوحت اعمارهم بين( 35 و72 سنة) بمتوسط حسابي (55.35 ± 9.05) سنة.وتتراوحت مدة الاصابة بالاعتلال بين (2 - 10) سنوات، مع متوسط (8.72±3.65) سنواتب - اربعون (40) مريضا مصابين بامراض الكلى المزمنة خاضعين للعلاج بالديلزة الدموية من كلا الجنسين (21 ذكور و19 اناث)، تراوحj اعمارهم بين (43 - 70 سنة) بمتوسط (56.98 ± 7.40) سنة. تراوحت مدة الاعتلال بين (7 - 15) سنة بمتوسط (13.87 ± 5.41) سنة.تم تعريف جميع الاشخاص ال 122 (المرضى والسيطرة) في هذه الدراسة حول هدف وطبيعة الدراسة وتم استحصال موافقتهم على شمولهم بالدراسة. شملت الاستقصائات الكهروفسلجية تخطيط الاعصاب المحيطية الكهربائي وتخطيط العضلات الكهربائي،اذ شمل تخطيط الاعصاب المحيطية كفاءة الاعصاب الحسية بواسطة قياس الكمون الحسي، ارتفاع الجهد الحركي للاعصاب الحسية وسرعة التوصيل الحسي لكل من ( العصب الناصف"الوسطي"، العصب الزندي، والعصب الربلي)،اضافة الى دراسة وظائف الاعصاب الحركية من خلال دراسة الكمون الحركي القاصي ،سرعة التوصيل الحركي ،ارتفاع الجهد الحركي للاعصاب الحركية، قيمة الكمون الوسطى لموجة اف، التشتت الزمني وانعدام التوصيل الكهربائي لكل من الاعصاب التالية : - (العصب الناصف "الوسطي"، العصب الزندي ، العصب الشظوي المشترك والعصب الظنبوبي). في تخطيط العضلات الكهربائي تم فحص العضلات التالية : العضلة ذات الراسين والعضلة الاولى الظهرانية بين العظام للاطراف العليا اما بالنسبة للاطراف السفلى تم فحص العضلة المتسعة الانسية للفخذ ،العضلة الظنبوبية الامامية والعضلة الباسطة القصيرة للاصابع اذ تضمن الفحص استقصاء سعة الموجة، مدة كمون الفعل للوحدة الحركية والزيادة التدريجية في شدة المنعكس عند استمرار التنبيه. وكذلك تم فحص الاستجابة المتعاطفة للجلد للعصب الناصف "الوسطي"و العصب الشظوي المشترك الايمن. بينت الدراسة الكهروفسلجية لوظائف الاعصاب الحسية انخفاض ذو معنى في وظائف الاعصاب الحسية لدى المرضى الذين يعانون من الفشل الكلوي المزمن مقارنة بالاشخاص الاصحاء .اذ لوحظ زيادة في الكمون الحسي، انخفاض الجهد الحركي للعصب الحسي ونقصان في سرعة التوصيل الحسي . ولا يوجد فرق معنوي(p> 0.05) بين كلا النوعين من المرضى عدا فيما يتعلق بالكمون الحسي وسرعة التوصيل الحسي للعصب الناصف والزندي وكذلك العصب الربليز . اما فيما يخص تخطيط الاعصاب الحركية لكلا المجموعتين من المرضى بينت الدراسة انخفاضا ذو معنى لدى هؤلاء المرضى مقارنة بالاشخاص الاصحاء والتي شملت زيادة في الكمون الحركي القاصي وقيمة الكمون الوسطى لموجة اف ونقصان في سرعة التوصيل الحركي. اما الاستجابة المتعاطفة للجلد فقد اظهرت تدنيا معنويا(p< 0.05) لدى مرضى الفشل الكلوي المزمن في كلتا المجموعتين من المرضى عند مقارنتها مع الاشخاص الاصحاء . كما اظهرت الدراسة زيادة في التشتت الزمني في مرضى الفشل الكلوي في مجموعة قبل الديلزة وجدت في 39 عصب من اصل 204 عصب (19.3٪) وكانت اعلى نسبة في العصب الشظوي المشترك الايمن (28.57٪) ، في حين كانت اقل نسبة في العصب الزندي الايمن (12.5٪). وظهرت ايضزايادة التشتت الزمني في المرضى الخاضعين للديلزة وجد في 36 عصب من اصل 203 عصب (17.73٪) وكانت اعلى نسبة في العصب الشظوي المشترك الايمن(24.13٪)، في حين ان اقل نسبة مئوية في العصب المتوسط الايمن (12.5٪). كما اظهرت الدراسة ايضا وجود انعدام جزئي للتوصيل الكهربائي في المرضى الغير خاضعين للديلزة وكانت اعلى نسبة في العصب المتوسط الايمن (25٪)، في حين ان اقل نسبة شملت العصب الظنبوبي الايمن (11.11٪)، واظهرت الدراسة ان 38 عصب من اصل 204 عصب تم فحصها (18.62٪) تعاني من انعدام جزئي للتوصيل. اما المرضى الخاضعين للديلزة الغسيل الكلوي فقد كان هناك 34 عصب من اصل 203 عصب تم فحصها (16.74٪) يعاني من انعدام جزئي للتوصيل . وكانت اعلى نسبة هي في العصب المتوسط الايسر (25٪)، في حين ان النسبة المئوية الدنيا تشمل العصب الظنبوبي الايمن (7.69٪). نستخلص من هذه الدراسة ان تقييم الاعصاب الحسية اكثر اهمية من الحركية في تشخيص اعتلال الاعصاب الطرفية في وقت مبكر لدى مرضى الفشل الكلوي المزمن الغير خاضعين للديلزة كذلك الاستجابة المتعاطفة للجلد هي مفيدة جدا في الكشف عن اعتلال الالياف العصبية الصغيرة في المرضى المصابين بالاعتلال الكلوي المزمن ( قبل وبعد الغسيل الكلوي). وعلاوة على ذلك، فان مستوى الكرياتينين لديه علاقة عكسية واضحة مع كل معطيات دراسة توصيل العصب لدى المرضى الغيرخاضعين للديلزة (كلمزاادت نسبة الكرياتينين في مصل الدم يؤدي الى انخفاض قراات دراسة توصيل العصب). معظم مرضى الاعتلال الكلوي المزمن (الخاضعين وغير الخاضعين للديلزة) لديهم شذوذ في دراسة توصيل العصب في الاطراف، ولكن الاصابة في الاطراف السفلية هي اكثر من الاطراف العلوية.* اعتمد في تعريب المصطلحات العلمية على : 1. المعجم الطبي الموحد انكليزي عربي ،رئيس التجرير د.محمود الجليلي الطبعة الثانية،1978. 2. الموجز المصور لفحص الجهاز العصبي. ترجمة د.عبد الهادي الخليلي - بغداد - 1992 د.موريس فان الن. د.روبرت روزنسكي. | The Chronic Kidney Disease (CKD) is a purposeful identification portrayed by an irretrievable and step by step advancing decrease in glomerular filtration rate (GFR). Furthermore, it is intricate by a rising incapability to preserve common stages of protein metabolism products (such as urea, creatinine, standard blood pressure, hematocrit, sodium, water, calcium phosphate homeostasis, potassium and acid base balance). A further frequent involvement is the Peripheral neuropathy of Chronic kidney disease. Nevertheless, patients who suffer CKD are further exposed to increase peripheral polyneuropathy. Neurological impediments that is subsidiary to the uremic status, participate fundamentally to the sickness and death to patients who suffer renal failure. The occurrence of peripheral neuropathy stays extreme in advanced renal dysfunction Electrophysiological study (nerve conduction study NCS and electromyography EMG) is useful adjunct test to the medical history and clinical examination in the diagnosis of such complication, early detection and differentiation from an axonal type of peripheral neuropathy. The aims of this study are designed to : (1) Evaluate the function of electrophysiological study (NCS and EMG) in diagnosing the neuropathy for patients who suffer CKD. (2) Decide and rule out the most necessary parameters of NCS and EMG, to be performed as preliminary test in the diagnosis of small fiber neuropathy. (3) Correlation between the severity of the peripheral neuropathy and the level of serum creatinine.Three groups of subjects included in this study : Adult patients of chronic kidney disease not on dialysis yet, Patients on hemodialysis and control subjects. The present study was carried out at the neurophysiology unit in Al - Yarmouk Teaching Hospital, in the a period from June/2016 to September /2017.The control group consists of forty two (42) healthy volunteers (22 males and 20 females). The age of this group ranged between 20 to 75 years with a mean 52.48 ±10.63 years. Males are 22 - 75 years with a mean of age 53.54± 14.57 years, and 20 - 74 years for females with a mean of age 51.42±11.91 years. Eighty patients included in this study had chronic kidney disease. They consist of two groups : A - Forty (40) patients with chronic kidney disease on customary attend the Kidney and Dialysis clinic not on dialysis with steadily high serum creatinine (> 2.5 mg/dl of) either sex (22 males and 18 females), their ages ranging between 35 and 72 years with a mean 55.35 ± 9.05 years. The duration of CKD is ranged between 2 – 10 years, with mean 8.72 ± 3.65 yearsB - Forty (40) patients with chronic kidney disease on regular hemodialysis (21 males and 19 females), their ages ranging between 43 to 70 years with a mean 56.98 ±7.40 years. The duration of CKD is ranged between 7 - 20 years with mean 13.87 ± 5.41 years. All of 122 subjects (patients and control) that were included in this study were informed about the aim and technique of the study and their acceptance was taken.Each subject was submitted to medical history and electrophysiological tests (NCS and EMG) of the two limbs i.e. the upper and the lower. These tests include : 1 - Sensory nerve conducting study (SNCS) for Median, Ulnerand Sural nerves, in which, distal sensory latency, sensory nerve action potential (SNAP) amplitude and sensory nerve conduction velocity (SNCV) are performed. 2 - Motor nerve conducting study (MNCS) for Median, Ulnar, Fibular (Common peroneal), and tibial nerves , which includes measurement of distal motor latency (DML), compound muscle action potential (CMAP) amplitude, Motor nerve conduction velocity (MNCV), Mean F - wave latency, Terminal latency index (TLI), Temporal dispersion (TD%) and Conduction block (CB%).3 - Sympathetic skin response (SSR) of right median and right fibular nerves. 4 - Needle EMG for proximal and distal muscles like : biceps, and 1st dorsal interosseous muscles for upper limb and vastusmedialus, tibialis anterior and Extensor digitorium brevis for lower limb, in which insertional activity, spontaneous activity, motor unit action potential (duration, amplitude and polyphasia%) and recruitment pattern are considered. The results of this study revealed that sensory NCS was considerably altered in all kinds of CKD patients as weigh against the healthy control subjects in the form of prolonged distal sensory latency, decreased SNAP amplitude and slowing of SNCV. However, there were not statistically significant differences (P>0.05) between pre dialysis and post dialysis Peripheral Neuropathy except in the SNAP amplitude of right and left median and right ulnar and sural sensory nerves whereas the differences are statistically significant (p<0.05).As for the study of motor nerve conduction, theprolonged DML, slowing of conduction velocity and prolonged mean F - wave latency are perceived in both groups of patients when compared with those of healthy control subjects. However, the differences are also statistically significant (P<0.01) in the TLI of right median and ulnar nerves, distal CMAP amplitude of the right ulnar nerve, distal motor latency (DML) of left median and right ulnar nerves, MNCV (m/sec.) of left median nerve and prolongation or mean F - wave latency of left median, common peroneal and right tibial nerves (P<0.05). Also Sympathetic Skin Response significantly (P<0.01) changed detected in both groups of patients when compared with those of healthy control.Moreover, in both patients groups, abnormal TD% are observed increased temporal dispersion in CKD pre dialysis patients is found in 39 out of 204 nerves (19.3%) However the higher percentage of abnormal TD% is in the right common peroneal nerve (28.57%), while the lower percentage is in the right ulnar nerve (12.5%).Increased temporal dispersion in CKD post dialysis patients is found in 36 out of 203 nerves (17.73%) However the higher percentage of abnormal TD% is in the right common peroneal nerve (24.13%), while the lower percentage is in the right median nerve (12.5%).In both patients groups, abnormal CB% are observed that the higher percentage of conduction block (CB%) in motor nerves of CKD pre dialysis patient involves right median nerve (25%), while the lower percentage involves right tibial nerve (11.11%).Whereas there are 38 out of 204 examined nerve with conduction block (18.62%).And also show that the higher percentage of conduction block (CB%) in motor nerves of CKD post dialysis patient involves left median nerve (25%), while the lower percentage involves right tibial nerve (7.69%). Whereas there are 34 out of 203 examined nerve with conduction block (16.74%).In conclusion, this study reveals Sensory NCS is more useful and helpful than the motor NCS in the diagnosis of early peripheral neuropathy in CKD pre dialysis also Sympathetic skin response (SSR) abnormality are very useful in the detection of small fiber neuropathy in CKD patients (pre and post dialysis).Moreover, the serum creatinine level have strong correlation with NCS parameters in CKD pre dialysis patients (when increase level of s.cr lead to decrease the NCS parameters).Most CKD patients had abnormal NCS parameters in both limbs, but the abnormalities in the lower limbs are more than the upper limbs

تقييم تاثيرات المتفورمين والستاقلبتين على تفاعلية الاوعية الدموية الدماغية لدى مرضى السكري من النوع الثاني بواسطة دوبلر الدماغ : دراسة سريرية مقارنة == Evaluation The Effects of Metformin and Sitagliptin on Cerebral Vasoreactivity in Diabetic Patients (Type 2) By Transcranial Doppler : A Comparative Clinical Study

Author name: احمد محمد حسن المظفر
Supervisor name: حيدر كاظم حسون | محمد رشاد ابراهيم
General topic: Medicine
Specific topic: Medicines and Toxins
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان مرض السكري من النوع الثاني يزيد من خطر الاصابة بالجلطة الدماغية ب (3 - 6) اضعاف وذلك بسبب اضطراب وظيفة النسيج الطلائي للاوعية الدموية وما ينتج عنه من تصلب مبكر لشرايين الجسم بشكل عام ومنها شرايين الدماغ. ان الكشف والعلاج المبكرين لذلك يقلل من خطر الجلطة الدماغية. ان جهاز دوبلر الدماغ هو جهاز لفحص شرايين الدماغ ومن الممكن تطبيق بعض الاختبارات الفسلجية لفحص مرونة وتفاعلية شرايين الدماغ.لقد اثبتت الدراسات السابقة ان ضعف تفاعلية شرايين الدماغ يزيد من احتمالية الاصابة بالجلطة الدماغية ولذلك من الممكن تقييم تاثيرات الادوية المستخدمة لعلاج داء السكري من النوع الثاني على تقليل خطر الاصابة بالجلطة الدماغية.هدف الدراسة : لقد اجريت هذه الدراسة من اجل تقييم تاثيرات عقاري المتفورمين والسيتاقلبتين والجمع بينهما على تفاعلية الاوعية الدموية الدماغية في مرضى السكري من النوع الثاني والمشخص حديثا باستخدام جهاز دوبلر الدماغ.طريقة العمل : اجريت هذه الدراسة في عامي (2015 - 2016) وقد شارك في الدراسة 182مريضا جميعهم من المصابين بداء السكري من النوع الثاني والمشخص لديهم حديثا. تم استبعاد مائة وثلاث مرضى اما الباقين تم تقسيمهم الى اربعة مجاميع. المجموعة الاولى هي مجموعة الضبط (وشملت 20 مريض) حيث تم علاجهم بواسطة ضبط النظام الغذائي وممارسة الرياضة فقط اما المجموعة الثانية فقد تم علاجهم بعقار المتفورمين بجرعة قدرها خمسمائة ملغرام مرتين يوميا لمدة ثلاثة اشهر اضافة الى ضبط النظام الغذائي وممارسة الرياضة للاقلال من وزن الجسم ووشملت 20 مريض . اما المجموعة الثالثة فقد تم علاجهم بعقار السيتاقلبتين عن طريق الفم مرتين يوميا لمدة ثلاثة اشهر وبجرعة قدرها خمسون ملغرام اضافة الى ضبط النظام الغذائي وممارسة الرياضة وشملت 19 مريض. اما المجموعة الرابعة فقد عولجوا بالسيتاقلبتين والمتفورمين مجتمعين مع ضبط النظام الغذائي وممارسة الرياضة ايضا وشملت 20 مريض. وقد اخذت موافقة جميع المرضى شفهيا قبل المشاركة. بعد ذلك تم اجراء الفحوصات المختبرية وفحص دوبلر الدماغ للشريان المخي الاوسط وتم تسجيل سرعة جريان الدم الانقباضية والانبساطية والوسطى وتم تسجيل معامل مقاومة الشريان ومعامل القدرة الانبساطية والانقباضية للشريان. ثم تم فحص تفاعلية الشريان المخي الاوسط بواسطة قياس مؤشر كتم النفس ومؤشر مدى التوسع الكامل للاوعية الدموية ومقياس فرط جريان الدم لكل مريض قبل وبعد ثلاثة اشهر من العلاج.النتائج : سجلت جميع مجاميع الدراسة زيادة ذات دلالة احصائية في مؤشر كتم النفس الا ان اكثرها قوة كان في المجموعة الرابعة (مجموعة الجمع) حيث كانت الزيادة من 0.64±0.029)) الى (0.87±0.035) مقارنة بالمجموعة الاولى (مجموعة الضبط) حيث كانت الزيادة من (0.67±0.027 ) الى (029 ( 0.72±0.اما بالنسبة الى مؤشر مدى التوسع الكامل للاوعية الدموية , لم تظهر جميع مجموعات الدراسة زيادة ذات دلالة احصائية في هذا المؤشر الا المجموعة الرابعة (مجموعة الجمع) حيث اظهرت هذه المجموعة زيادة ذات دلالة احصائية في هذا المؤشربعد العلاج من 30.3±1.18%)) الى (35.75±2.09%) .وفيما يتعلق بمقياس فرط جريان الدم , لم تظهر المجموعة الاولى (مجموعة الضبط) فرق ذو دلالة احصائية بعد العلاج بينما اظهرت المجموعتين الثانية والثالثة (مجموعتي المتفورمين والسيتاقلبتين) زيادة ذات دلالة احصائية وقد اظهرت المجموعة الرابعة (مجموعة الجمع) الزيادة الاكبر في هذا المقياس من بين جميع مجموعات الدراسة من ) 1.24±0.057) الى ( 1.59±0.06) .الاستنتاجات : 1. ان ادوية الميتفورمين والسيتاقلبتين منفردة زادت بصورة ملحوظة من تدفق الدم الانبساطي من للشريان المخي الاوسط وتخفيض RI وPI هذا التاثير اكثر وضوحا عندما يتم اعطاء كل من الدوائين معا مما يزيد من مرونة شرايين الدماغ.2. ان ممارسة الرياضة وبرنامج الحمية الغذائية زاد من مؤشر كتم التنفس كما الميتفورمين وعلاج السيتاقلبتين. ومع ذلك، فان التاثير اكثر وضوحا مع مزيج من الميتفورمين والسيتاقلبتين.3. ان ممارسة الرياضة وبرنامج الحمية الغذائية ،وادوية الميتفورمين والسيتاقلبتين لا يزيد مقياس مدى التوسع الكامل للاوعية الدموية او مقياس فرط جريان الدم في المرضى الذين يعانون من النوع 2 من داء السكري الذي اكتشف لديهم حديثا. بينما الجمع بين علاج الميتفورمين والسيتاقلبتين له تاثير اكثر اهمية في مقياس مدى التوسع الكامل للاوعية الدموية او مقياس فرط جريان الدم.4. وقد وجدت الدراسة وجود تناسب عكسي ذا دلالة احصائية واضحة بين نسبة السكر في الدم ومعدل السكر التراكمي من جهة ومقاييس تفاعلية الاوعية الدموية الدماغية (مؤشر كتم التنفس ومؤشر فرط جريان الدم ) من جهة اخرى.5. ان الجمع بين عقار المتفورمين والسيتاقلبتين في علاج مرضى السكري من النوع الثاني يقلل خطر الاصابة بالجلطة الدماغية من خلال زيادة كل مقاييس تفاعلية الاوعية الدموية الدماغية (مؤشر كتم النفس ومقياس مدى التوسع الكامل للاوعية الدموية ومؤشر فرط جريان الدم ) | Diabetes mellitus type 2 increases the risk of stroke 3 folds. It do so by inducing endothelial injury and accelerated atherosclerosis. Early diagnosis and treatment lower the risk of stroke. Transcranial Doppler examination applied with certain physiological tests can be used to test vasoreactivity of intracranial arteries. Impaired cerebral vasoreactivity can predict the risk of stroke. Therefore , this diagnostic test can be used for evaluation the effect of oral hypoglycemic drugs on risk of stroke. This study was conducted for evaluation and comparison of the effects of metformin, sitagliptin and their combination on cerebrovascular reactivity in patients with newly diagnosed type 2 diabetic patients. A total of 79 patients were involved in this study. They are all with newly diagnosed type 2 diabetes mellitus. They were divided into four groups; control, metformin, sitagliptin and combination. A verbal consent were taken from each participant. Control group includes twenty patients and was treated with dietary control and regular exercise. Metformin group includes twenty patients and was treated with metformin 500mg twice daily plus dietary control and exercise. Sitagliptin group includes nineteen patients and was treated with sitagliptin 50mg twice daily plus dietary control and regular exercise. Finally, combination group includes twenty patients and was treated with dietary control and regular exercise plus metformin 500mg with 50mg of sitagliptin twice daily. Treatment duration was three months. Biochemical tests were done before and after treatment. Measurement of hemodynamic parameters including systolic, diastolic and mean velocities with pulsatility and resistive indices was done by transcranial Doppler before and after treatment. Vasoreactivity measures which include breath - holding index, FRVD and transient hyperemic response rate ,all were recorded for each patient before and after treatment. In control group, there was significant statistical increase in breath - holding index from (p=0.008). In metformin group, breath - holding index also significantly increased (p<0.000). In sitagliptin group, breath holding index showed significant increase (p<0.000). Finally, combination group showed highest level after treatment among study group (p<0.000). Regarding FRVD; control group revealed insignificant statistical difference after treatment (p=0.702). Metformin group showed increase in FRVD it was statistically insignificant (p=0.071). Sitagliptin group exhibited non - significant statistical difference in FRVD (p=0.701). On the other hand, combination group revealed significant statistical increase in FRVD (p=0.001). In control group, THRR increased after treatment but it was insignificant change (p=0.209). Metformin group showed increase in THRR which was significant change (p=0.019). Sitagliptin group showed significant increase in THRR (p<0.000). Finally, combination group showed significant statistical increase in THRR (p=0.0003) which was the highest value among groups after treatment. From the results obtained in this study we can conclude that treatment with metformin plus sitagliptin increase all parameters of cerebral vasoreactivity in this study. Furthermore, decrease in fasting blood sugar and HbA1c correlates inversely with increase in breath - holding index after treatment

تاثير عقار السيتاقلبتين على الصدفية المزمنة من النوع اللويحي لدى مرضى السكري في العراق == Effect of Sitagliptin on chronic plaque psoriasis of diabetic patients in Iraq

Author name: سرمد نوري الدجيلي
Supervisor name: نصير عبد الامير الحرجان | محسن عبد الحسين الظالمي
General topic: Medicine
Specific topic: Medicines and Toxins
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: مرض الصدفية يعتبر من الامراض المزمنة النظامية المعقدة والمحفزة مناعيا بواسطة خلية المناعة من نوع ت ويتميز بلويحات حمراء مقشرة من الجلد والمفاصل. وقد حفز وسطاء الالتهابات 17IL - ,TNF - α وIL - 6 وربما عملية الجهد الناكسدي على انقسام خلايا بشرة الجلد وتمايزها مما ادى الى ظهور الصفات المميزة للمرض. مرضى الصدفية مع النوع اللويحي لا سيما مع ارتفاع مؤشر كتلة الجسم لديهم خطر الاصابة بمرض السكري من النوع الثاني وارتفاع الدهون. العلاجات الحديثة البيولوجية للمرض مثل مضادات α - TNF ومضاد ustekinumab) IL - 17) قد اسفرت عن نتائج افضل من العلاجات التقليدية غير ان استخدامها قد انحسر لعدد قليل من المرضى لما لها من اثار جانبية خطيرة. السيتاقلبتين يعتبر من الكابحات لانزيم الدايبيبتديل ببتايتيز4 وله تاثير مضاد للالتهابات للمرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع الثاني وبدون اي تاثيرات جانبية . ولذلك فان الهدف من الدراسة الحالية هو تقييم اثر السيتاقلبتين على درجة باسي عبر التداخل مع معلمات متلازمة الايض, وسطاء الالتهابات وعلامات الاجهاد التاكسدي لمرضى الصدفية المصابين بالسكري من النوع الثاني.المرضى وطرق العمل : لقد اجريت الدراسة على 48 مريضا مصابا بمرض الصدفية يعانون من داء السكري وتم تقسيمهم الى مجموعتين : مجموعة البلاسيبو (ن = ٢٤) : اعطيت١٠٠ملغم من كبسولة البلاسيبو مرة واحدة يوميا بالاضافة الى مراقبة النظام الغذائي وممارسة التمارين الرياضية لمدة ١٢ اسبوع. مجموعة السيتاقلبتين (ن = ٢٤) : اعطيت قرص السيتاقلبتين ١٠٠ملغم مرة واحدة يوميا بالاضافة الى مراقبة النظام الغذائي وممارسة التمارين الرياضية لمدة ١٢ اسبوع. وقد تم الحصول على عينات الدم من المرضى في كلا المجموعتين قبل وبعد استخدام ١٢ اسبوعا من العلاج لقياس تركيز المصل من السكر بعد الصيام ، HbA1c، الدهون الثلاثية، الكولسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة ،البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا ،البروتين الدهني عالي الكثافة ، α TNF - ، IL - 17، IL - 6، IL - 10، MDA وGSH، ودراسة العلاقة مع درجة باسي بعد ١٢ اسبوعا من العلاج. تم اجراء الخزعات من نوع لكمة مع قطر ۵ملم سمك لكلا المجموعتين قبل وبعد ١٢ اسبوعا من العلاج وارسالها للفحص النسيجي.النتائج : مقارنة مع خط الاساس في مجموعة السيتاقلبتين ومجموعة البلاسيبو بعد ١٢ اسبوعا من العلاج مستوى السكر بعد الصيام، نسبة HbA1c، الدهون الثلاثية، الكولسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة ، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، TNF - α ، IL - 17 وIL - 6في مصل الدم اظهرت انخفاضا معنويا (0.05 >P) بعد ١٢ اسبوعا من العلاج بالسيتاقلبتين وارتباطا ملحوظا موجبا مع درجة باسي (0.05 >P) . في المقابل مستوى البروتين الدهني عالي الكثافة، IL10 وGSHفي الدم اظهرت ارتفاعا معنويا (0.05 >P) بعد ١٢ اسبوعا من العلاج بالسيتاقلبتين وارتباط سلبي ملحوظ مع درجة باسي (0.05 >P) . وكشف فحص الانسجة تغييرات معنوية (0.05 >P) بعد ١٢ اسبوعا من العلاج بالسيتاقلبتين في الصفات النسيجية للبشرة والخلايا اللمفاوية المتسللة لادمة الجلد بالمقارنة مع قبل العلاج لمجموعة السيتاقلبتين وبعد١٢ اسبوعا من العلاج لمجموعة البلاسيبو ولا يوجد اي تاثير معنوي على الاوعية الدموية لادمة الجلد.الاستنتاج : كشفت الدراسة ان السيتاقلبتين قد خفض درجة باسي دون غياب كامل للويحات الصدفية من خلال تحسن ارتفاع السكر في الدم، الدهون، وسطاء الالتهابات او السيتوكينات ومسارات الاجهاد التاكسدي مع تاكيد النتائج السريرية والمناعية من حلال التحسن الملحوظ في التغييرات النسيجية المرضية . | Psoriasis represents a complex chronic systemic T cell immune - mediated inflammatory disease characterized by erythematous, scaly plaques of skin and joints. Inflammatory mediators such as IL - 17, IL - 6, TNF - α and possibly oxidative stress process have stimulated abnormal proliferation of keratinocytes and differentiation resulting in characteristic appearance of psoriasis. Psoriatic patients with plaque psoriasis particularly those with high body mass index have increasing risk of developing a diabetes mellitus type 2 (DM2) and hyperlipidemia. Advance treatment of psoriasis with biological agents such as TNF - antagonists and IL - 17 antagonist like ustekinumab have been tried with a better result than traditional treatment. However their use have been limited in some patients, because of severe side effects. Sitagliptin is a dipeptidyl peptidase - IV (DPP - IV) inhibitor exerts anti - inflammatory effect when used in patients with type 2 diabetes without any reported severe side effects. Therefore the objective of current study was to assess the effect of Sitagliptin on psoriasis area and severity index (PASI) score in psoriatic patients with diabetes via interfering with metabolic syndrome parameters, inflammatory mediators and oxidative stress markers.Patients and Methods The study was conducted on 48 diabetic patients with moderate to severe plaque psoriasis who were divided into two groups : Placebo group (n=24) patients were administered placebo once daily plus dietary control and exercise for 12 weeks ; Sitagliptin group (n=24) patients were administered Sitagliptin tablet 100mg once a day plus dietary control and exercise for 12 weeks. PASI score for all patients was assessed before and after 12 weeks of treatment. The fasting blood samples were obtained from the patients in both groups at baseline and after 12 week of therapy used to measure the concentration of serum fasting blood sugar (FBS), HbA1c, triglyceride(TG), cholesterol, low density lipoprotein (LDL), very low density lipoprotein (VLDL), high density lipoprotein (HDL), tumor necrosis factor alpha (TNF - α), intreleukin - 17 (IL - 17), intreleukin - 6 (IL - 6), intreleukin - 10 (IL - 10), malondialdehyde (MDA) and reduced glutathione (GSH), and to determine their correlation with PASI score after 12 weeks of treatment. Punch biopsies with size of 5mm diameter were performed for both groups at baseline and after 12 week of treatment and sent for histopathological examination and psoriasis histopathological score (PHS) was measured for patients in both groups at baseline and after 12 week of treatment. Results : Compared with baseline in Sitagliptin group and placebo group after 12week, the level of PASI score was significantly reduced (P < 0.05) after 12 weeks of Sitagliptin treatment. The level of FBS, HbA1c, TG, cholesterol, LDL, VLDL, TNF - α, IL - 17, IL - 6 and MDA were significantly reduced (P < 0.05) after 12 weeks of Sitagliptin treatment when compared with baseline in Sitagliptin group and placebo - treated group after 12 week and positively correlated (P < 0.05) with PASI score. In contrast the level of HDL, IL10 and GSH were significantly increased (P < 0.05) after 12 weeks of Sitagliptin treatment in comparison to baseline in sitagliptin group and with that of placebo - treated group after 12week and negatively correlated with PASI score (P < 0.05). PHS was significantly reduced (P < 0.05) after 12 weeks in comparison to baseline in Sitagliptin - treated group and with that of placebo - treated group after 12 week. Histopathological examination also revealed a significant improvement (P < 0.05) in epidermal histological features and dermal lymphocytic infiltration with no effect on dermal blood vessels.Conclusion The present study revealed that Sitagliptin reduce PASI score without complete absence of psoriatic plaques via an improvement in hyperglycemia, hyperlipidemia, inflammatory mediators or cytokines and oxidative stress markers with confirmation of our clinical and immunological results by significant improvement in PHS.

تاثير الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب وعلاقتها مع مستضدات الكريات البيض البشرية - النوع الثاني - DRB1 في المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي == Influence of Anti - infliximab Antibodies and its Association with HLA - class II - DRB1 alleles in Iraqi patients with Rheumatoid arthritis

Author name: محمد احمد الكرخي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: التهاب المفاصل الرثوي هو مرض مزمن ذاتي المناعة يصيب عدة اعضاء من الجسم ومن ضمنها المفاصل ويمكن ان يؤدي الى تدمير المفاصل والعجز الشديد اذا لم يعالج في وقت مبكر. المضادات لعامل نخر الورم عامل الفا (TNFα) مثل اينفلياكسيمب (INF) وهو من الاجسام المضادة وحيدة النسيلة خيالية ادخلت في عام 2010 من قبل وزارة الصحة كعوامل فعالة للغاية لعلاج المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي الحاد متوسط الشدة او الشديد الذي لا يستجيب للعلاج التقليدي.اينفلياكسيمب يمكن ان يحفز على تكوين الاجسام المضادة لعقار اينفلياكسيمب (ATIS)، ولكن هذه الاجسام المضادة من الممكن ان تؤدي الى نقص فعالية الاينفلياكسيمب او تاثيرات جانبية سلبية.وفقا لمعلوماتنا المتاحة انه لا توجد اية معلومات عن هذه الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب وارتباطها مع النتائج السريرية، العلامات المصلية ومستضدات HLA - classІІ - DRB1 في المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي.وقد اجريت هذه الدراسة لاعطاء فكرة واضحة عن تكون ودور هذه الاجسام المضادة في الاستجابة السريرية للمرضى لعقار الاينفلياكسيمب وكذلك توضيح تاثير مستضداتHLA - classІІ - DRB1 على القابلية المناعية لعقار الانفلياكسيمب في تكوين هذه المضادات.المرضى والطرق : شملت الدراسة 100 شخص. حيث تضمنت ما مجموعه 50 مريضا الذين توافقوا مع المعايير المنقحة لمرض التهاب المفاصل الرثوي (الكلية الامريكية لامراض الروماتيزم 1987 و2010) في المواءمة مع 50 مجموعة السيطرة (25 اشخاص اصحاء و25 مرضى مصابين بالتهاب المفاصل الرثوي لم يعالجوا بعقار اينفلياكسيمب). وقد اجريت هذه الدراسة خلال الفترة من بداية شهراذار 2014 حتى نهاية شهر ايلول 2014 في وحدة العلاج البيولوجي لقسم امراض الروماتيزم / مستشفى بغداد التعليمي، مختبر الدراسات العليا / فرع الاحياء المجهرية / كلية الطب - جامعة بغداد، المختبرات التعليمية / مدينة الطب، وحدة زرع الكلى / مستشفى الكرامة التعليمي ومركز التطابق النسيجي البحثي / كلية طب الكندي / جامعة بغداد. تم جمع عينات الدم من مجموعة السيطرة والمرضى الذين يعانون من التهاب المفاصل الرثوي في والذين تمت معالجتهم بعقار الانفلياكسيمب لاكثر من ثلاثة اشهر لغرض تقييم الاجسام المضادة لعقار الاينفلياكسيمب،مضادات - CCP، بروتين سي التفاعلي والتنميط الجيني HLA - DRB1.المرضى الذين لم تتكون لديهم الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب فتمت متابعتهم لمدة 6 اشهر واعادة فحصهم للتحقق من وجود الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب,anti - CCP وبروتين سي التفاعلي.تم الكشف عن الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب والاجسام المضادة لل CCP بواسطة جهاز فحص الانزيم الرابط المناعي (ELISA) ,اما بروتين سي التفاعلي(CRP) فتمت قياسته بواسطة جهازNephelometer في حين تم اجراء تحليل التنميط الجيني النوع الثاني DRB1 بواسطة بادئات محددة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR - SSO) لكل من المرضى ومجموعة السيطرة الاصحاء.النتائج : من اصل 50 مريض في الدراسة الحالية، كان متوسط العمر (45.24 ± 9.15سنة) وكانت الاناث اكثر من الذكور (اناث : ذكور 3 : 1).تم اكتشاف الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب في خمسة وثلاثون مريض(70٪) من مرضى التهاب المفاصل الرثوي بعد فترة ثلاثة اشهر من العلاج بهذا الدواء, بينما لم تتكون هذه المضادات للعقار في 15 (30٪) منهم.في حين لم يتم الكشف عن اية اجسام مضادة في مجموعة السيطرة (الاصحاء ووالسيطرة المرضية)، كان الفرق على درجة عالية وذات دلالة احصائية (قيمةp = 0.000001)، ومع حساسية وخصوصية (70٪، 100٪) على التوالي. في نفس المدة من العلاج تم الكشف عن الاجسام المضادة لل - CCP في 47 (94٪) من المرضى بينما لم يتم اكتشاف هذه الاجسام المضادة في في 3 (6.0٪)منهم، في حين تم الكشف عن هذه الاجسام المضادة في 22 (88٪) من مجموعة السيطرة ولم يتم اكتشافها في 3 (12٪) منهم.بينما لم يتم اكتشاف اية اجسام مضادة لل - CCPفي مجموعة الاصحاء ,وكان الفرق معتد للغاية وذات دلالة احصائية (قيمة p=0.0005) مع حساسية وخصوصية (94٪، 100٪) على التوالي.تم توثيق علاقة قوية بين نشوء الاجسام المضادة للانفلياكسيمب والاجسام المضادة لل - CCP (قيمة p = 0.006).وفيما يتعلق بفحص بروتين سي التفاعلي، تم الكشف عنه في 26 (52٪) من مجموعةالمرضى بينما لم يتم الكشف عنه في 24 (48٪) منهم، كما انه كان ايجابيا في كل مجموعة السيطرة المرضية, بينما في مجموعة السيطرة للاصحاء، كان ايجابيا في 10 (40٪) وسلبيا في 15 (60٪) وكان الفرق ذات دلالة احصائية عالية (قيمة p= 0.000014) مع تدني في الحساسية والخصوصية (52٪، 60٪) على التوالي.ولم تسجل الدراسة الحالية اي ارتباط ذو قيمة بين نتيجة بروتين سي التفاعلي وتكون اضداد اينفلياكسيمب (قيمةp = 0.084).بالنسبة لمجموع المرضى الذين لم يتم اكتشاف اضداد ال انفلياكسيمب لديهم والبالغ عددهم 15 مريض فتمت متابعتهم بعد 6 اشهر من فترة العلاج بال انفلياكسيمب لغرض التحقق من احتمالية تكون الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب ,اضافة الى اعادة فحص اضداد - CCPو بروتين سي التفاعلي ,اظهرت النتائج عن عدم وجود فرق احصائي بين نتائج الفحص بعد 3 اشهر وونتائج الفحص بعد 6 اشهر وكانت قيمة - p((0.067، 0.067 و1.0) على التوالي.وعلاوة على ذلك، كشفت الدراسة وجود علاقة ايجابية بين HLA - DRB1 * 04 (DR4) اليل مع 35 مريض مصاب بالتهاب المفاصل الرثوي تمت علاجهم بال اينفلياكسيمب حيث تمت مقارنتهم مع 25شخص من مجموعة السيطرة للاصحاء وكان الفرق ذات دلالة احصائية (قيمة p = 0.001).واخيرا كشفت الدراسة الحالية عن عدم وجود اي ارتباط بين HLA - DRB1 وتكون الاجسام المضادة لل اينفلياكسيمب في المرضى الذين يعانون من التهاب المفاصل الرثوي (قيمة p = 0.0914).الاستنتاجات : اظهرت الدراسة الحالية على ان ما يقرب من ثلاثة ارباع المرضى العراقيين المصابين بمرض التهاب المفاصل الرثوي تتكون لديهم الاجسام المضادة لل ااينفلياكسيمب بعد ثلاثة اشهر من العلاج مع هذا العامل البيولوجي مع عدم وجود اي ارتباط للعامل الوراثي (اليل DRB1 - HLAالنوع الثاني) مع تكونها، كما اثبتت الدراسة وجود ارتباط وثيق بين العامل الجيني الاليل( HLA - DRB1 * 04 (DR4مع نشوء مرض التهاب المفاصل الرثوي في المرضى العراقيين. | Rheumatoid arthritis is a systemic chronic autoimmune inflammatory polyarthritis leads to joints destruction and severe disability if not treated early. Tumor necrosis factor alpha antagonists such as infliximabwhich is a chimeric monoclonal antibody have been introduced and approved in 2010 by Ministry of Health as highly effective agents for the treatment of Iraqi patients with moderate to severe Rheumatoid arthritis that not responds to conventional treatment.Infliximab can induce formation of anti - infliximab antibodies, however, these antibodies may lead to lack of efficacy to Infliximab or adverse reactions.According to our knowlege no information is available about these antibodies to infliximab and their association with clinical findings , serological markers and HLA - class ІІ - DRB1 antigens in iraqi patients with Rheumatoid arthritis.The present study was conducted to give a clear idea about the development and the role of these antibodies in clinical response of patients to infliximab and demonstration the effect of HLA - class ІІ - DRB1 antigens on the immungenicity of infliximab. Patients and Methods : The study covered 100 subjects. It included a total of 50 patients who met the revised criteria for RA (the American College of Rheumatology 1987 and 2010) in aligment with the 50 control group(25 healthy individuals and 25 RA patients not treated by infliximab). This study was carried out during the beginning of March 2014 till the end of September 2014 in the Biological Therapy Unit of the Deparment of Rheumatology/Baghdad Teaching Hospital, the laboratory for Higher Studies/Microbiology Deparment/Baghdad College of Medicine, the Teaching Laboratories/Medical City, the Kidney Transplant Unit/ Al - Karama Teaching Hospital and HLA Research Center /Al - kindy College of Medicine/Baghdad University. Blood samples were collected from control group and patients with RA on infliximab therapy for more than three months duration for assesment of antibodies to infliximab , anti - Cyclic Citrullinated Peptide(anti - CCP) ,C - reactive Protein(CRP) and for Human Leukocyte Antigen - DRB1(HLA - DRB1) genotyping.The patients with negative anti - infliximab antibodies were follow up and reinvestigated after 6 month of infliximab therapy for anti - infliximab antibodies, anti - cyclic citrullinated peptide and C - reactive Protein.Anti - bodies to infliximab and anti - Cyclic Citrullinated Peptide antibodies were detected by Enzyme Link Immunosorbent Assay (ELISA), the C - reactive protien (CRP) was measured by Nephlometer . whereas the genotyping analysis for HLA - class ІІ - DRB1 had been done by polymerase chain reaction - sequence specific primers (PCR - SSO) for both patients and healthy control group.Results : Out of 50 case study group included in the current study, their mean age was (45.24± 9.15) the females were predminance than males in a ratio (F : M 3 : 1).Thirty five (70%) of RA patients developed antibodies against infliximab after three months of treatment with this drug ,15 (30%) of them were negative for these antibodies, while no anti - inflixmab antibodies were detected in control groups( (healthy and case control) ,the difference was a highly statistically significant(P - value=0.000001), and with sensitivity and specificity (70 %,100%) respectively.At the same duration of treatment the anti - CCP was detected in 47 (94%) patients and negative in 3 (6.0%), while in case control was postive in 22 ( 88%) and negative in 3(12%), and was not detected in all healthy control group,the difference was highly satistically siginficant ( p - value =0.0005) with sensitivity and specificity (94%,100%) repectively.A strong correlation was reported between the development of anti - infliximab and anti - CCP antibodies (p - value=0.006).Regarding the CRP test ,it was positive in 26 (52%) patients and negative in 24 (48%), also it was positive in all case control group while in healthy control group ,it was reported positive in 10(40%) and negative in 15(60%) with highly statistically significance(p - value=0.000014) with low sensitivity and specificity (52%, 60%) respectively.No significant correlation was reported between CRP and development of anti - infliximab antibodies (p - value=.084).Fifteen patients group with negative anti - infliximab antibodies were follow up and re - investigated after six months of treatment with infliximab for anti - infliximab ,anti - CCP antibodies and CRP, the results showed no statistical difference of these test after three and six month of infliximab treatment with p - value (0.067, 0.067 and 1.0) respectively.The study revealed a positive association of HLA - DRB1*04(DR4) allele with 35 patients with RA on infliximab therapy whom compared with 25 healthy control and the difference was statistically significant (p - value=0.001).There was no association found between the HLA - DRB1 and development of antibodies to infliximab in patients with RA (p - value=0.0914).Conclusions : The current thesis showed that approximately three quarter of Iraqi patients with RA developed antibodies against infliximab after three months of treatment with this biological agent and without association of genetic factor( HLA - class ІІ - DRB1 alleles) with their development ,also the study suggested an association of susceptibility of RA in Iraqi patients with HLA - DRB1*04(DR4).

دور Foxp جين والاحماض النووية الرايبوية متناهية الصغر ,145 ,146a ,20aفي عينة من المرضى العراقيين المصابين بمرض تصلب الاعصاب المنتشر == The Role of Foxp3 and MicroRNAs (20a, 146a, 145, and 155) in a Sample of Iraqi patients with Multiple sclerosis

Author name: زينب عبد الاله عبد الجواد الجوادي
Supervisor name: عائدة رشيد منصور الدرزي | بان عباس عبد المجيد
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Multiple sclerosis is a devastating central nervous system autoimmune disorder that is characterized by a series of inflammations, demyelinations, and neurodegenerations that affect the brain and spinal cord. The epigenetic studies specially micro Ribonucleic acid expression represent an important field of researches that probably uncover the obscurities behind the multiple sclerosis pathogenesis. The aims of the present work were to study the expression of micro Ribonucleic acids (20a, 146a, 155, and 145) and forkhead box P3 genes by real time polymerase chain reaction relative quantification technique, to correlate their expression according to different clinical parameters, and to perform chromosomal analysis on the multiple sclerosis patients peripheral blood lymphocytes. A case - control study was performed on 25 newly diagnosed untreated multiple sclerosis patients during their attendance to Multiple Sclerosis clinic, or during their admission to the Neuromedical ward (10th floor) in Baghdad Teaching Hospital, and Special Nursing Home (5th floor) in Baghdad Medical City as well as from the Neuromedical Consultancy Unit in Al - Yarmouk Teaching Hospital in Baghdad city, in addition to 25 apparently healthy controls which were medical staff with no history of having any autoimmune disease or receiving any steroid or immunomodulatory therapy. Furthermore, chromosomal analysis was performed for multiple sclerosis patients. This work was conducted during the period from 1st of April 2015 to 31st of March 2016.From a total of 25 multiple sclerosis patients, 23 of them were females and 2 were males with a female to male ratio (F : M) of 11.5 : 1. The ages of these patients ranged between 18 - 55 years; mean age was 33.32 + 9.45 years. Studying of micro Ribonucleic acids expression revealed a significant down - regulation in micro Ribonucleic acid - 20a and forkhead box P3 gene while up - regulation of micro Ribonucleic acid - 155 expression in multiple sclerosis patients in comparison to controls. Micro Ribonucleic acid - 146a was directly associated with inflammation, and multiple sclerosis disease activity. On the other hand, micro Ribonucleic acid - 145 was not associated with significant changes in its expression in relation to multiple sclerosis disease. Chromosomal analysis was done for multiple sclerosis patients and it was normal.In conclusion, multiple sclerosis is associated with significant changes in micro Ribonucleic acids expression including micro Ribonucleic acid - 20a, micro Ribonucleic acid - 146a, and micro Ribonucleic acid - 155 but not micro Ribonucleic acid - 145 as well as to a significant change in forkhead box P3 gene expression that can be measured by real time polymerase chain reaction technique. Furthermore, multiple sclerosis is not associated withgross chromosomal abnormalities.

الكشف الجزيئي عن فايروس الجي سي وجينات البي ثلاثة وخمسون والشبكية الجيني والبتا - كتنين في المرضى المصابين بالاورام الغدية للقولون والمستقيم == MOLECULAR DETECTION OF JC VIRUS, P53, RETINOBLASTOMA GENES AND ? - CATENIN IN PATIENT WITH COLORECTAL ADENOCARCINOMA

Author name: ابراهيم فاضل ابراهيم الدروبي
Supervisor name: فائزة عبد الله مخلص | بان عباس عبد المجيد
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمهيد : يعود فايروس الجي سي الى عائله الفيروسة التوارمية. ينتشر الفايروس بين السكان وعلى نطاق واسع حول العالم. يحمل الفايروس جينة Ag T والتي لها القدره على التكوين السرطاني في الانسجة من خلال التفاعل مع المسارات التنظيمية المختلفه, ويمكن ان تتداخل مع التحكم في دوره الخلية واليات عدم الاستقرار الجيني.العلاقة بين فايروس الجي سي وسرطان القولون وسرطان المستقيم لايزال المنظر ينتضرالقرار النهائي.اهداف الدراسة : 1. تحد يد الدور المحتمل لفايروس الجي سي في سرطان القولون والمستقيم من خلال الكشف والتقدير الكمي لجينة التي وتحميل جينة الاكنوبروتين واظهار الحامض النووي الدي ان اي للفايروس في كل من الخزعات النسيجية السرطانية والطبيعية للقولون والمستقيم. 2. الكشف عن الايجابية المصلية من خلال فحص الاجسام المضادة للفايروس في مصول مجموعه البحث.3. تقدير الرابطة المحتملة بين فايروس الجي سي مع البيتاكاتانين وملاحظة قابلية الفايروس على كبح او تحديد عمل الجينات المشبطة للاورم البي خمسة وثلاثون والشبكية الجيني.طرق العمل : تم تصميم البحث كدراسة مستقبلية للسيطرة على الحالة وانطوت على اخذ الجزعات الطازجة لانسجة القولون والمستقيم من خلال تنظير القولون والمستقيم وقد شملت على 28 مريض مصاب بورم القولون والمستقيم الخبيث وثلاث وثلاثون مريض ممن لم يشخص لديهم ورم سرطاني قي القولون والمستقيم والذين راجعوا وحدة التنظير في مستشفى الاورام ومستشفى بغداد التعليمي ومستشفى اليرموك التعليمي خلال الفتره من حزيران 2013 ولغاية اذار2014. تم الكشف عن جينة فايروس الجي سي ( التي جين) والاكنوبروتين بواسطة جهاز تفاعل سلسلة البلمره وكذلك فحص الحامض النووي الدي ان اي لفايروس الجي سي من خلال التهجين الموقعي وكذلك تم الكشف عن الاجسام المصلية المضادة للفايروس بطريقة الاليزا. تم الكشف عن البيتا - كتنين وبروتين الشبكية الجيني بطريقة المعلمات المناعية والكشف عن البي خمسة وثلاثون بتقنية التهجين الموقعي الفلوري.النتائج• بالنسبة لمجموعة السرطان كان اعلى نسبة تردد للاصابة بورم القولون والمستقيم (35.71%) في المجموعة العمرية مابين 50 - 59 سنة. كان سرطان القولون والمستقيم اكثر شيوعا في الذكور منه في الاناث وبنسبة 1.8 : 1.• اضهر الفحص النسيجي ان النوع الاكثر شيوعا كان بنسبة 85.72% من نوع غدية غير ميوسينية.وان ورم القولون الاكثر شيوعا هو غدية متباينة بشكل معتدل (75%) بين درجات غدية ورم القولون والمستقيم• تم الكشف عن جينة الورم لفايروس الجي سي بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل وسجل اعلى تردد للاصابة(57.1%) واعلى نسبة نسخ من الجين في مجموعة السرطان مقارنته بمجموعة السيطرة (27.3%) وكانت نتائج الحمل الفايروسي لمجموعة السرطان بمعدل416.93±217.77 نسخة/مايكروغرام اما مجموعة السيطرة فكانت بمعدل229.866±111.49 نسخ /ميكروغرام والتي اضهرت بدورها فرق كبير بين مجموعات الدراسة.• تم تشخيص جينة الاكنوبروتين لفايروس الجي سي بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل في مجموعة السرطان وكانت النتسبة ( 53.6%) وهي اعلى من النسبة التي تم تشخيصها في مجموعة السيطرة والتي كانت (15.2%). الحمل الفايروسي في مجموعة السرطان كان بمعدل 317±129.12 نسخة/ مايكروغرام وهو اعلى من معدل الحمل الفايروسي في مجموعة السيطرة (152.94±10514) نسخة/ مايكروغرام .• وجد اتفاق كبير بين نتائج تشخيص جينة التي وجينة الاكنوبروتين بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل لمجموعة السرطان ومجموعة السيطرة.• بطريقة التهجين الموقعي لل(دنا) لفيروس الجي سي, اضهرت النتائج ان 53.6% من مجموعة السرطان اضهرو نتائج موجبة لفايروس الجي سي . اما مجموعة السيطرة فاضهرت (30.3%). وكان الفروق ذات دلاله احصائية بين مجموعاتا لدراسة P<0.05 . تبين وجود فروق ذات دلالة احصائية بين مجموعات الدراسة بشان كثافة اشارة ونسبة الاصابة ونمط تورط (P <0.05)، في حين لا توجد فروق كبيرة عثر فيما يتعلق بالمشاركة غدي او اللحمية (P = 0.458)• لم يتم العثورعلاقة ذات دلالة احصائية عند مقارنة ال (دنا ) بواسطة التهجين الموقعي وفقا لدرجات ومواقع الورم.• وجد اتفاق كبير بين نتائج تشخيص جينة التي بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل ونتائج التشخيص بطريقة التهجين الموقعي لل ( دنا) بين مجموعات الدراسة.• وجد اتفاق متوسط بين نتائج تشخيص جينة الاكنوبروتين بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل ونتائج تشخيص فايروس الجي سي بطريقة التهجين الموقعي لل (دنا) بين مجموعات الدراسة.• فحص المضاد المناعي لفايروس الجي سي بطريقة الاليزا اضهرت وجود مضاد مناعي في 14/ 22(63.6%) مريض من مجموعة السرطان في حين وجد ان 15/28 (53.6%) من مجموعة السيطرة تحمل المضاد المناعي. (p=0.474) وجد توافق ضعيف بين نتائج تشخيص فايروس الجي سي بطريقة الوقت الحقيقي لتفاعل البلمرة المتسلسل ونتائج التهجين الموقعي لل (دنا) ونتائج فحص المضاد المناعي في مجموعات الدراسة.• تم الكشف عن توطين البتا كتنين في النووية بطريقة الفحص النسيجي المناعي الكيمياوي وكانت بنسبة12/28 ( 42.86%) من مجموعة السرطان، في حين لم يكشفت على تلطيخ نووي ايجابي في مجموعة السيطرة (P <0.05). لم يتم العثور على علاقة احصائية لا مع درجات الوروم ولا الى موقع الورم.• تم الكشف عن بروتين جينة الشبكية الجيني بتقنية الفحص النسيجي المناعي الكيمياوي.بالنسبة لمجموعة السرطان 10/28 (35.7%) اضهرت تلطيخ نووي ايجابي في حين ان 18/28 (64.3٪) كشفت عن تلطيخ نووي سلبي اما مجموعة السيطره فاضهرت(100%) تلطيخ ننووي ايجابي. لا اتفاق بين نتائج فحص جين الرتينوبلاستوما وجينة التي وجينة الاكنوبروتين وكذلك التهجين الموقعي لل (دنا) بين مجموعات الدراسة.• بطريقة التهجين الموقعي الفلوري تم الكشف عن التعبير الجيني للبي خمسة وثلاثون. فوجد ان خمسة حالات تم شطب موقع البي خمسة وثلاثون من كرومسوم رقم 17. ثلاث حالات وجدت فيها شطب كروموسوم 17 وحالة واحد وجد فيها خليط من شطب موقع البي خمسة وثلاثون وايضا شطب لكروموسوم رقم 17.الاستنتاجاتابرزت هذه الدراسة الدور المحتمل للفايروس الجي سي التي قد تشارك في طرق مختلفة في التسبب في سرطان القولون والمستقيم، والتي تتفق مع دراسات اخرى. على الرغم من هذه الادلة دور JCV في الاورام الخبيثة القولون والمستقيم وoncoproteins في تعزيز التحول لا يزال بعيدا عن الوضوح. | John Cunningham Virus (JCV) a member Polyomaviridae family is a type of human polyomavirus. It’s widespread virus detected in different populations throughout the world. JCV encodes for T - Ag which have oncogenic capability through interaction with different regulatory pathways and can interfere with cell cycle control and genomic instability mechanisms. The association between JCV and colorectal carcinoma still awaits the final conformation. Aims of study : 1. Determine the possible role of JCV in colorectal carcinoma by detection, quantification of T - Ag gene and agnoprotein gene load and demonstrating JCV DNA in both colorectal carcinoma and normal colonic tissue biopsies. 2. Detect the seropositivity of JCV antibodies among the study groups.3. Estimate the possible interaction of T - Ag with B - catenin and P53 and retinoblastoma tumor suppressor genes. Methods : This study was designed as prospective case - control study that involved fresh colonic tissue biopsies taken through colonoscopy from 28 patients with colorectal cancer and from 33 patients who did not have colorectal carcinoma attending to GIT endoscopic unit of Oncology Hospital, Baghdad Teaching Hospital, and Al - Yarmouk Teaching Hospital during the period from June 2013 to march 2014. JCV DNA was detected and quantified by real time PCR for T - Ag gene and agnoprotein genes. Using JCV bioprobe, chromogenic in situ hybridization (CISH) technique was used to detect JCV in tissue biopsies. Serological detection of JCV IgG antibodies was detected by ELISA. B - catenin and retinoblastoma protein products were detected by immunohistochemistry. Tumor suppressor gene P53 was detected by fluorescent in situ hybridization technique. Results : • Among the total 28 colorectal carcinoma cases, the highest frequency 10/28(35.7%) were detected in age group 50 - 59 years and its more frequent in male than female with ratio 1.8 : 1.• Histopathological finding revealed that 24(85.72%) cases were non mucinous adenocarcinoma and moderately differentiated adenocarcinoma was more frequent 21/28 (75%) among grades of CRC.• JCV T - Ag was detected in 16 (57.1%) of CRC group and 9/33(27.3%) of control group, with viral load VL mean 416.93 ± 217.77 copy/µg for CRC group and 229.866 ± 111.49 copy/µg for the control group which in turn showed significant difference between the study groups• Agnoprotein gene was detected in 12/28 (42.9%) of CRC group with VL mean (317 ± 129.12) compared to 5/33 (15.2%) with VL mean (152.94 ± 105.14) in non CRC patient (p=0.016). • Substantial agreement was found between T Ag gene and agnoprotein gene by real time PCR for both CRC group K=0.72 and control group K=0.784.• Using chromogenic in situ hybridization technique JCV DNA was detected in 15/28(53.6%) of CRC compared to 10/33(30.3%) in control group (p=0.065). Significant differences were detected comparing the percentage of JCV DNA in study groups according to intensity, score and signal pattern of involvement (p<0.05).• Substantial agreement was found between T Ag by qPCR and JCV DNA by CISH among the study groups. Moderate agreement was found between JCV agnoprotein gene by qPCR and JCV DNA by CISH among the study groups. • Serological detection of JCV antibodies by ELISA revealed 14/22 (63.6%), 15/28 (53.6%) of CRC group and control group showed positive results respectively. (p=0.474). Poor agreement was found between (T Ag by real time PCR and by CISH) and JCV antibodies by ELISA in the study groups.• Nuclear localization of B - catenin was detected by immunohistochemistry in 12/28(42.86%) of CRC groups, while none of the control group revealed positive nuclear staining (p<0.05). No significant associations found neither to grades nor to the site of tumor.• Retinoblastoma protein was detected by IHC. Only ten out of 28 (35.7%) showed positive nuclear staining, 18/28 (64.3%) of CRC revealed negative nuclear staining. All control group showed positive nuclear staining (p=0.000). No agreement was found between Rb protein and JCV T Ag, agnoprotein gene and JCV DNA by CISH among study groups.• P53 deletion was detected using FISH technique. Five cases out of 25 were with deleted p53 region, 3/25 were with deleted whole chromosome 17, and 1/25 revealed combination signals of deleted p53 region and deleted whole chromosome 17. The results were invalid for statistical analysis.Conclusion : This study highlighted the possible role of JCV which might participate in different ways in the pathogenesis of colorectal carcinoma, which in agreement with other studies. Despite these evidences the role of JCV in colorectal malignancies and its oncoproteins in promoting transformation is still far from clear

تقييم مستوى بعض السايتوكينات الدهنية والبروتين الدهني الواطي الكثافة المؤكسد ومستوى دهون الدم قبل وبعد استعمال الميثوتركسيت في مصل مرضى داء الصدفية : دراسة حالات مرضية - مجموعة ضبط == Evaluation of some serum adipokines, oxidized low density lipoprotein and lipid profile before and after methotrexate treatment of chronic plaque psoriasis (A case - control study)

Author name: حيدر عبد جبار داود العمار
Supervisor name: مناف صالح داود | محمد كاظم الحطاب
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعتبر داء الصدفية من الامراض الالتهابية الشائعة التي تصيب الجلد وهو ذاتي المناعة ويصيب الناس بمعدل (2 - 4)% من مجموع سكان العالم. خلايا T المخترقة لانسجة الجلد، الانترلوكينات، والسايتوكينات مثل visfatin)) ، وهرمونhigh molecular weight adiponectin - ذات اوزان جزيئية كبيرة ، وبروتينات رابطة ريتونولية رباعية (RBP - 4) مع البروتين الشحمي الواطئ الكثافة المؤكسدox - LDL جميعها تؤثر بداء الصدفية. عادة يبدو جلد المريض بداء الصدفية مقشرا ومغلف بلون ابيض فضيا وممكن ان يصيب بقية اجزاء الجسم. يطرا على حياة المريض بداء الصدفية نفس ما يطرا على مرضى السكري من الدرجة الثانية او المرضى النفسيين او مرضى القلب من تغيرات. ويكون المريض بداء الصدفية بدينا مقارنة بعامة الناس. على الرغم من ان معرفتنا بسبب السمنة التي يصاب بها المريض بداء الصدفية الا ان هنالك الكثير من الدراسات التي وضعت بهذا الشان تفترض بان السبب هو افراز السايتوكينات المحفزة للالتهاب بواسطة الانسجة الشحمية ربما هو المسؤل عن تدهور حالة الصدفية. الدراسة الحالية قامت باجراء اختبارات لقياس التغيرات الحاصلة في مستويات انزيم الفيزفاتن ، وهرمون سايتوكين دهني ذات اوزان جزيئية كبيرة HMW - adiponectin، وبروتينات رابطة ريتونولية رباعية (RBP - 4) مع البروتين الشحمي الوطئ الكثافة المؤكسدox - LDL وكذلك اقتران هكذا تغيرات مع مدى نشاط او استفحال المرض. الاهداف : ان هدف الدراسة هو : لمعرفة التغيرات الحاصلة في مستويات انزيم الفيزفاتنvisfatin ، السايتوكين الدهني(الاديبونكتين) ذات اوزان جزيئية كبيرةHMW - adiponectin ، وبروتينات رابطة ريتونولية رباعية (RBP - 4) مع البروتين الشحمي الواطئ الكثافة المؤكسدoxidized - LDL في مصل مرضى داء الصدفية قبل وبعد العلاج بالميثوتراكسيت بالمقارنة بمستوياتها في مجموعة الضبط وكذلك لتقييم تاثير ذلك العلاج على مستويات الدهون الاخرى في المصل وكذلك بقياس تاثيره على مناطق الصدفية وشدة المؤشرPASI score. اجريت مقارنة بين السايتوكينات الدهنية و(ox - LDL) المؤكسد مع مؤشر كتلة الجسم (BMI) ومنطقة الصدفية وشدة المؤشر (PASI) وقيمهم التخمينية في وباء الصدفية. اخيرا لتاسيس دور المعطيات المذكورة اعلاه في عملية نشؤ المرض( داء الصدفية). المواد وطرق البحث : اشتملت الدراسة على ست وثمانون شخص (86) من الحالات المطابقة في الجنس والعمر المطابقة للدراسة الحالية (43 مصابين بالصدفية و43 اشخاص اصحاء) اما الحالات المصاحبة بارتفاع ضغط الدم او داء السكري قد تم استبعادها من هذه الدراسة. متوسط العمر كان (41±14.37) للمرضى، بينما كان (35±18.66) لمجموعة الضبط. تم اجراء هذه الدراسة في استشارية الجلدية في مستشفى مرجان التعليمي في مدينة الحلة، وتم اجراء الاختبارات في مختبرات المستشفى ومختبر قسم الجهاز الهضمي خلال الفترة بين (حزيران 2013) الى (اب 2014). تم سحب عينات المصل الماخوذ من الدم لاستخدامه من اجل ايجاد مستوى واجراء اختبارات لقياس التغيرات الحاصلة في مستويات الفيزفاتنvisfatin ، السايتوكينات الدهنية ذات اوزان جزيئية كبيرةHMW - adiponectin ، وبروتينات رابطة ريتونولية رباعية (RBP - 4) مع البروتين الشحمي الواطئ الكثافة المؤكسدox - LDL ومستوى المحتوى الدهني العام في المصل. تم قياس هذه السايتوكيتات في جميع الحالات بواسطة طريقة الفحص المناعي ELISA. تم تقييم نشاط داء الصدفية وكفاءة الميثوتريكسيت بواسطة مؤشر شدة المرض (PASI) وتاثير الميثوتريكسيت على مستويات السايتوكينات الدهنية المذكورة اعلاه والبروتينات الدهنيه المؤكسدة ذات الكثافة الواطئةox - LDL في المصل. النتائج : اظهرت نتائج هذه الدراسة زيادة واضحة (p<0.05) في الفيزفاتنvisfatin ، الاديبونكتن ذات اوزان جزيئيه كبيرةHMW - adiponectin، ونسبة تركيز البروتين الدهني المؤكسد الواطئ الكثافة (ox - LDL) ، ونقصان واضح (p<0.05) في نسبة تركيز البروتين الريتونولي الرباعي الارتباط (RBP - 4) في مصل مرضى الصدفية عندما تقارن مع مجموعة الضبط. اظهرت الدراسة ارتباطا كبيرا بين (ox - LDL) والفيزفاتن visfatin، وبين الاديبونكتين ذو اوزان جزيئيه كبيرهHMW - adiponectin وكذلك البروتين الرباعي الارتباط الريتونوليRBP - 4. فيما اظهرت نتائج الدراسة انه ليس هنالك علاقة بين الفيزفاتن والاديبونكتن ذو اوزان جزيئية كبيرة والبروتين الدهني الواطئ الكثافة المؤكسد ومؤشر كتلة الجسم (BMI) بينما بينت الدراسة علاقة سلبية واضحة بين البروتين الرباعي الارتباطRBP - 4 مع BMI. من ناحية اخرى اكدت النتائج ارتباطا كبيرا مباشرا بين الفيزفاتنvisfatin والاديبونكتن ( HMW) و(ox - LDL) ومؤشر الشدة (PASI) في هذه الدراسة، بينت نتائج الدراسة ايضا ارتباطا سلبيا واضحا بين (PASI) والبروتين الرباعي الارتباط RBP - 4. بالاضافة الى ذلك يوجد اختلاف واضح في معدلات مستوى الدهون في مصل مرضى الصدفية عند المقارنة مع مجموعة الضبط. اخيرا اوضحت الدراسة ، تاثير الميثوتركسيت على مستوى السايتوكينات و(ox - LDL) ومستوى دهون الدم من خلال الانخفاض الكبير في مستوياتها بعد المعالجة وبواسطة متوسط الاختلاف الكبير في قيم (PASI) قبل وبعد المعالجة لمرض الصدفية. الاستنتاجات : تشير نتائج هذه الدراسة الى ان بعض السايتوكينات الدهنية في مصل الدم ومنها انزيم الفيزفاتنvisfatin ، الاديبونكتين ذات اوزان جزيئية كبيرة HMW - adiponectin، والبروتين ذو رابطة ريتونولية رباعية (RBP - 4) مع البروتين الشحمي الواطئ الكثافة المؤكسدox - LDL)) في مرضى داء الصدفية يمكن ان تكون مؤشرات جيدة للتنبؤ بشدة مرض الصدفية وكيفية متابعة العلاج. عند اجراء مقارنة في مرضى داء الصدفية بين السايتوكينات الدهنيه والبروتين الشحمي الواطئ الكثافة المؤكسدox - LDL مع مناطق الاصابة بالصدفية ومؤشر الشدة (PASI) اظهرت الدراسة ارتباط ايجابي ايجابيا مع فيزفاتن، الاديبونكتن ذات اوزان جزيئية كبيرة و(LDL)ox) المؤكسد،، بينما يرتبط سلبيا مع بروتين الرباعي الارتباط الريتنولي RBP - 4بينما اظهرت الدراسة عدم وجود ارتباط بين هذه السايتوكينات ومؤشر كتلة الجسم (BMI).اظهرت الدراسة علاقة قوية بين شدة المرض ومستوى دهون الدم المختلفة في مرضى الصدفية من خلال قياس مؤشر الشدةPASI)) قبل وبعد اخذ علاج MTXكما بينت نتائج الدراسة تاثيرا واضحا للميثوتريكسيت الفموي على مستوى دهون الدم و(ox - LDL) المؤكسد في مرضى الصدفية، بالاضافة الى تحسن سريع في حجم الصدفية، مما يشير الى الدور المناعي لهذا العلاج في داء الصدفية. | Psoriasis is a common inflammatory autoimmune skin disease that affects 2 - 4%of the world population. T - cells infiltration, interleukins and cytokines including adipocytokines like visfatin, high molecular weight - adiponectin(HMW - adiponectin) and retinol binding protein - 4(RBP - 4), together with oxidized low density lipoprotein(ox - LDL) have been implicated in psoriasis pathogenesis. Many epidemiological evidence speculate that patients with psoriasis may be more obese compared with the general population. Although the definite mechanism underlying the correlation between obesity and psoriasis is uncertain, several studies had hypothesized that, the secretion of pro - inflammatory cytokines by adipose tissue may deteriorate psoriasis. Objectives : The aim of the present study is : To investigate the changes of serum visfatin level, HMW - adiponectin, RBP - 4, and oxidized - LDL in psoriatic patients before and after treatment with oral methotrexate therapy in comparison to their levels in control subjects to evaluate the impact of this drug on their serum levels and on psoriatic lesions by measuring psoriasis area and severity index(PASI). To ascertain the association between these adipocytokines and oxidized - LDL with body mass index(BMI) and psoriasis area and severity index(PASI) and their predictive value in plaque psoriasis . Finally, to establish the role of above mentioned parameters in the pathogenesis of psoriasis. Subjects and Methods : A total of 86 subjects (43 with Psoriasis and 43 healthy controls) were enrolled in this study. Their mean age was (41± 14.37) for patients, and (35.81± 18.66) for the control group. The study conducted in dermatology outpatient clinic in Merjan Teaching Hospital in Hilla City, and investigations were done in laboratory units of the hospital through the period from June 2013 to September 2014. The sera obtained from blood were used to determine the level of serum visfatin, HMW - adiponectin, RBP - 4, oxidized - LDL by enzyme - linked immunosorbent assay(ELISA), while lipid profile levels were estimated by spectrophotometric kits. Assessment of psoriasis disease activity and methotrexate efficacy were done by psoriasis area and severity index (PASI)score and methotrexate effects on serum levels of the above mentioned adipokines and oxidized low density lipoprotein.Exclusion criteria include : any person with hypertension, diabetes mellitus, pregnancy, smoking, alcoholism, and other medical diseases even other types of psoriasis disease.Results : Results of this study showed significant increase (p˂0.05) of serum visfatin, HMW - adiponectin, and oxidized - LDL concentrations, and significant decreases (p˂0.05) of retinol binding protein - 4(RBP - 4) concentration in sera of plaque psoriasis when compared with control group. There was a significant correlation between oxidized - LDL and visfatin, HMW - adiponectin and retinol binding protein - 4(r = 0.81, 0.68, ̵ 0.77)(p value˂0.001) respectively . Regarding the anthropometric parameters, this study shows no correlation between visfatin, HMW - adiponectin, RBP - 4, oxidized - LDL and body mass index(BMI)(r= 0.121, 0.043, - 0.170, - 0.049)respectively(p˃0.05). The findings of the present study confirm a significant association between visfatin, HMW - adiponectin, RBP - 4 and oxidized - LDL and PASI score(r= 0.77, 0.64, ̵ 0.77, 0.72)(p˂0.001) respectively. Additionally, there was a significant mean difference in lipid profile in serum of psoriatic patients when compared to control subjects(p value˂0.001). Finally, the impact of systemic methotrexate on above adipocytokines and oxidized - LDL was determined by significant reduction of their levels after treatment and by a significant mean difference in PASI score before and after treatment in psoriatic lesions size. Conclusions : Results obtained by this study indicate that some adipocytokines including serum visfatin, HMW - adiponectin and RBP - 4 levels, in addition to oxidized - LDL measured in patients with plaque psoriasis were closely associated with disease severity and could be used for prediction and treatment follow up.In patients with plaque psoriasis the PASI score is positively associated with serum visfatin, HMW - adiponectin and oxidized - LDL, while negatively correlated with serum retinol binding protein - 4 level, while the study results revealed no significant correlation between BMI and study parameters. This results may indicate that, these parameters could be independently regulated through the path of psoriasis process.The study findings confirm the association between psoriasis and abnormal lipid profile and also the study showed a significant correlation between lipid profile and PASI score(p˂0.05).The study results showed the good effect of oral methotrexate upon the serum adipocytokines and oxidized - LDL - c levels in psoriatic patients, in addition to better remission of psoriatic lesions, which indicate the immune modulatory role of this drug in psoriasis

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Bacteroides fragilis المعزولة من النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري == Molecular and Bacteriological Study of Bacteroides fragilis Isolated from Women with Bacterial Vaginosis

Author name: زهراء قيس سلمان
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | بشرى جابر عمران
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة 150 مريضة يعانين من التهاب المهبل البكتيري ، تم جمع ما مجموعه 300 مسحة من عنق الرحم وافرازات مهبلية من هؤلاء المريضات بمعدل مسحتين اثنتين لكل مريضة و150 عينة دم جديدة تم جمعها من المريضات عند مراجعتهن الى مستشفيين في محافظة بابل هما : مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي العام، و150 عينة دم جديدة كمجموعة سيطرة ، خلال الفترة من شباط الى تشرين الاول 2016. باستخام معايير امسلز تم تشخيص النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل البكتيري. وقد خضعت المسحات لطرق مختلفة لتحديد B.fragilis باستخدام الاساليب البكتريولوجية التقليدية. وجد ان 31 عزلة موجبة (20.6٪) باستخدام الاوساط الانتقائية. فضلا عن ذلك، تم تطبيق طرق الكشف الجزيئي باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16 sRNA ، وكانت 44 عزلة (29.33٪) ايجابية وتعود لبكتريا B.fragilis وكذلك استخدم المعلم الوراثي nanH حيث كانت 39 عزلة (88.6٪) ايجابية. بالاضافة الى ذلك، تم فحص العزلات المعزولة على الاوساط الانتقائية الخاصة بالبكتريا للكشف عن قابلية البكتريا للالتصاق (adherence ability) بالخلايا المخاطية. كما تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية (Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate (TCP) test اذ كانت مكونة للاغشية بنسبة (100%). حيث اظهرت العزلات 31 الموجبة المستخرجة من الوسط الانتقائي قدرة البكترياعلى تكوين ال Biofilm وكانت نسبة تكوين البيوفيلم (83.9٪) و(16.1٪) للوضع العالي والمعتدل على التوالي، في حين لم تكن هناك عزلات غير قادرة على تشكيل بيوفيلم. اما فيما يتعلق بتاثير بوفيدون - اليود بنسبة 10٪ على تكوين البيوفيلم، فقد اظهرت نتائج هذه الدراسة ان قدرة البكتريا على تكوينه قد تقلصت لتكون نسبة التشكيل قوي (6.5٪ (ومعتدل (71٪) و(22.6٪) لم يظهر اي تشكيل للبيوفيلم . تم فحص تاثير 10% povidone - iodine المستخدمة في الطب النسائي على انتاج الاغشية الحيوية . وقيمت الدراسة قابلية B.fragilis على انتاج bacteriocin وتاثيرها على بعض العزلات البكتيرية. اظهرت النتائج ان لعزلات البكتريا قدرة تازرية لتثبيط نمو العزلات المدروسة بنسب. فضلا عن ذلك، هدفت هذه الدراسة الى التعرف على علاقة التغايرالجيني(TLR - 4 Polymorphism) باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم (PCR - RFLP) .وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية وكانت نسب انتشارها في مجموعة المرضى CC(36.0%) وThr399Ile : CT(12.0%) ,TT(52%) بينما نسب انتشارها في مجموعة السيطرة كانت TT(34.0%) , CC(60.0%) and CT(6.0%) وقد اظهرت وجود اختلاف وهو اختلافا معنويا, فيما بلغت نسبة انتشار الاليل T في المرضى (58%) بالمقارنة للسيطرة (37%) مع وجود اختلاف معنوي .وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA(46.0%) ,GG(50.0%) and GA(4.0%) في مجموعة المريضات بينما في مجموعة السيطرة كانت نسب الانتشار AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) مع عدم وجود فارق معنوي بينهما , اما نسبة انتشار الاليل G (52%) في مجموعة المريضات بالمقارنة بمجموعة السيطرة (62%) ويعد فارقا معنويا بينهما . تناولت الدراسة تحليل تسلسل جينات معينة من عزلات B.fragilis وكشفت نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin حيث تم تحديدها في 117/117 (100٪ (بمقارنة تسلسلها مع تلك التي في قاعدة البيانات في بنك الجينات وكانت نسبة الثغرات بينهما (0)٪ ، اما بالنسبة للعزلة الثانية فقد تم التعرف على نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin في 116/116 (100٪) وبثغرات 0/116 (0٪)، اما بالنسبة لجين Phospholipaseتم تحديدها في 129/129 (100٪) مع ثغرات 0/1129 (0٪) لكل من العزلتين . اخيرا تم تحليل العلاقات التطورية بين العزلات محلية من B.fragilis والعزلات العالمية من B.fragilis باستخدام تسلسل الجينات لل Enterotoxin وPhospholipaseحيث اظهر تحليل تسلسل الحمض النووي لجين Enterotoxin ان عزلات B.fragilis المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بعزلة B. fragilis المسجلة عالميا (AB026625.1) و(U67735.1) ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور (0.01%) في حين ان نتائج تحليل النشوء والتطور من تسلسل جينات Phospholipase كشفت ان نفس العزلات المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بالعزلة المسجلة عالميا (CP011073.1) ، ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور كانت (0.003 - 0.005%). | This study included 150 women with bacterial vaginosis (BV), a total of 300 swabs (as two high vaginal swabs for each woman and vaginal discharge ) were taken from each woman. In addition to fresh blood samples were collected from the same 150 women with bacterial vaginosis and 150 healthy women as control group , these women admitted to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics , in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Teaching Hospital, and Al - Hillah General Teaching Hospital during the period from February until October 2016. Women suffering from bacterial vaginosis were diagnosed according to Amsels criteria .The high vaginal swabs were subjected to different methods for identification of Bacteroides fragilis by using traditional bacteriological methods . It was found that 31(20.6%) isolates were recovered by using selective media . Furthermore , molecular detection methods was applied by using 16s rRNA gene ,where 44(29.33%) isolates were positive , and using nanH gene where 39(88.6%) isolates were positive out of the 44 isolates , these genetic markers were used for confirmation detection of B.fradilis isolates . In addition , the 31 isolates recovered from selective media were investigated to detect adherence of B.fragilis to mucosal epithelia cells .Also , biofilm formation was tested in semi quantitative microtiter plate test . The result revealed that all isolates were biofilm former , biofilm formation were accounted (83.9%) and (16.1%) for high and moderate mode respectively , while there were no isolates that do not express biofilm formation . Regarding on effect of 10% povidone - iodine on biofilm formation ,the result of this study demonstrated that internal douche effectively reduced the viability of biofilm forming to strong (6.5%) , moderate (71%) and (22.6%) shown no biofilm formation . The study was also evaluated the susceptibility of bacteriocin produced by B.fragilis on some isolates of bacteria . The result revealed that B.fragilis have synergistic ability to inhibition the growth of studied isolates with different ratios . Additionally, this study aimed to investigate the relation of Asp299Gly and Thr399Ile Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in the Toll - like receptor - 4 (TLR - 4) with the incidence of bacterial vaginosis .The result elucidated that at the site of Thr399Ile SNP, there were three genotypes for this SNP among patients ; TT,CC and TC with frequency of (52%) ,(36.0%) and (12.0%) respectively , whereas , the genotype frequency among control group were TT(34%) ,CC(60%) and TC(6.0%) with significance differences between patients and control . However, the frequency of allele T (mutant) was higher among patients (58%) than control (37%) with significant difference. The site of Asp299Gly SNP also showed three genotype among patients with frequency of AA(46.0%), GG(50.0%) and GA(4.0%) , whereas the genotype frequency among control group were AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) with no significant differences between patients and control . Additionally , the frequency of allele G(mutant) was higher among control(62%) than patients (52%) with significant differences between them . The study deal with sequence analysis of specific genes of B.fragilis isolates revealed that the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 117/117(100%) by comparing its sequence with that in the database in gene bank by Blast program with gaps 0/117(0%) and for the second isolate the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 116/116(100%) and with gaps 0/116(0%) , while for phospholipase gene was identified in 129/129(100%) with gaps 0/1129(0%) for first isolates.Finally ,the phylogenetic relationships between two local isolates of Bacteroides fragilis and Bacteroides fragilis global isolates were analyzed using the enterotoxin and phospholipase genes sequence. The DNA sequencing analysis of enterotoxin gene revealed that B. fragilis local number (No.1and No.2) isolates were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (AB026625.1) and (U67735.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis enterotoxin gene were show different out of tree at total genetic change (0.01%) , while the phylogenetic analysis results of phospholipase gene sequences revealed that B. fragilis local isolates ( No.1and No.2) were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (CP011073.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis phospholipase gene showed difference out of tree at total genetic change (0.003 - 0.005 %).

الكشف الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه - النوع الاول والتعبير البروتيني ل P27, CDK6,CDK4 وBcl - 2 في سرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن == Molecular Detection of Human T Lymphotropic Virus Type - 1 (HTLV - 1) and Expressional Proteins of CDK4, CDK6, P27 and Bcl - 2 in Hodgkin?s and Non - Hodgkin?s Lymphomas

Author name: نور سامي عبود الليباوي
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | شاكر حماد محمد العلواني
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة على انها دراسة بحثية ذات اثر رجعي ,وسيطره . اذ اشتملت على120خزعة نسجية من منطقة الغدد اللمفاوية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين.جمعت هذه النماذج من ارشيفات الانسجة المرضية لمختبرات مستشفى الحلة التعليمي/ محافظة بابل , مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة كربلاء ,مستشفى الصدر التعليمي/ محافظة النجف ,مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة المثنى ومستشفى القادسية التعليمي/ محافظة القادسية وكذلك العديد من مختبرات الانسجة المرضية الخاصة الموجودة في بابل ,بغداد, كربلاء, القادسيه, المثنى اذ جمعت هذه العينات للفترة من اذار 2016 الى كانون الاول 2016. هذه النماذج تعود للمرضى المصابين بسرطان العقد اللمفاوية للسنوات من 2011 لغاية 2016 .قسمت هذه العينات حسب المجموعات التالية : - 1 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع هودجكن .2 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع اللاهودجكن .3 - اربعون قطعة نسجية لعقد لمفاوية (لايظهر عليها اي تغيرات مرضية نسيجية) ظاهريا سليمة استعملت كمجموعة سيطرة .بعد التقطيع النسيجي لخزع العقد اللمفاوبة وتصبيغها باستخدام صبغتي الايوسين والهيماتوكسلين تم اجراء الفحص التاكيدي الدقيق لغرض التشخيص النهائي من قبل اخصائي الامراض النسيجية لهذه الدراسة. تم تصميم الجانب العملي لهذه الدراسة الذي اتخذ مسارين رئيسين : - 1. التحديد الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بفحصها داخل خلايا الانسجة اللمفاوية حيث تم انجازه بوساطة استخدام تقنية التهجين الموضعي ذات الحساسية العالية .2. اجراء دراسة كيميائية - نسيجية مناعية لوصف الحالة التعبيرية ل CDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27) وفحص الجينات السرطانية للخلايا اللمفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن واللاهودجكن والعقد اللمفاوية السليمة ظاهريا (غير مصابة).ان مجمل النتائج التي تم الحصول عليها هذه الدراسة كانت كما يلي : 1 - نسبة الذكور( (57.5% المصابين بسرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن ومجموعة السيطرة كانت اعلى من نسبة الاناث (42.5%) في هذه المجاميع الثلاثة. حيث كانت نسبة الذكور/اناث هي1 : 1.35.2 - اظهر الفحص النسيجي ان النسبة العليا من مرضى الهودجكن كان من الدرجة المنخفضة (42.5%) يتبعها الدرجة المتوسطة (35%) وادنى نسبة هي الدرجة العليا (22.5%). بينما النسبة العليا من مرضى اللاهودجكن كانت من الدرجة المنخفضة والمتوسطة %37.5)) وادنى نسبة هي الدرجة العليا ( 25%).ا - نتائج الفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت ( 22.5%) 2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK4 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 57.5 % من الانسجة كانت موجبة . 5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ Bcl - 2ان47.5 % من الانسجة كانت موجبة .6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفيروس وCDK4 .7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للCDK4 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال CDK6 وBcl - 2.8 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة ل p27 وعمر المرضى. كذلك علاقة طردية بين p27 وBcl - 2.ب‌ - نتائج للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائية من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة باللاهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت (45%) بينما لم تظهر اي حالة موجبة بتفاعل التهجين الموضعي للفايروس ضمن مجموعة السيطرة .2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 42.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة للp27 بواسطة الاختبارالكيميائي النسجي المناعي ضمن مجموعة السيطرة.3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـCDK4 ان 50% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة . بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي ل Bcl - 2 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السطرة.6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد الفيروس وBcl - 2 وكذلك وجدت علاقة قوية طردية تربط بين الانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفايروس وCDK6.7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للBcl - 2 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال p27 وBcl - 2 فقط .كذلك وجدت علاقة عكسية بين عمر المريض وBcl - 2 .8 - تم تمييز علاقة طردية تربط بين كثافة CDK4 وp27 وكذلك بين CDK4 وBcl - 2

دراسة بكتيرية ووراثية لبكتريا Gardnerella vaginalis وعلاقتها بالولادة المبكرة == Bacteriological and Molecular study of Gardnerella vaginalis association with preterm labor

Author name: ازل علاء عباس الربيعي
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: In this study , one hundred fifty samples were collected from paitents with preterm labor (PTL), who have been attending to Babylon Maternity and pediatric hospital and Al - Hilla Teaching Hospital, at the period from February to October 2016. Two swabs were collected one for culturing and the other for direct extraction for isolation Gardnerella vaginalis.Out of the 150 samples only 6(4%) on culture and 30 (20%) on molecular level isolated from preterm labor caused by Bacterial vaginosis , Urinary tract infection and aborted women. The results isolation and laboratory diagnosis as well as biochemical test approved that there is only 6 isolates belong to G.vaginalis confirmed by using Vitek 2 system and molecular detection by specific primers.Preterm birth is one of the most common causes of neonatal morbidity and mortality. Associated with sub sequent preterm labor in up to 40% of cases as shown in our resultsThe isolates are varied in their ability to produce sidrophore and extracellular protease in addition to their hemolytic activity .Adherence activity were investigated and indicate that G.vaginals have pili on her surface help her to attached and initiated infection Metronidazole was effective in prevent adherence at low concentration (5%) was 100% percentage.All isolates are able to produce biofilm in different level which provided as main step in pathogenesis caused it can evade and evoke the action of immune response and antibiotics , Alum , sodium chloride and sodium bicarbonate were shown very high effectively to eradicationSummaryIIG.vaginalis biofilm which gave results (0%) whereas the thymol extract (carvacrol) were moderate in action gave (50%) effect on Biofilm .Results also preveld that increased of pH value give a chance to overgrowth of G.vaginalis .The results indicated that Lactic acid considered as a limiting factors preventing growth of G.vaginalis when its grown with lactic acid , measured by optical Density (OD) the high production level is (1.901) in 2% concentration Whereas the lowest level is (0.32) in 10% concentration.Isolates Have ability to produce wide spectrum Bacteriocin which inhibited growth of both Gram positive and Gram negative bacteria that founded in vagina environment, Staphylococcus saprophyticus were the most bacteria that inhibited .extracted Vaginolysin was have a completed hemolytic activity in different temperatures (37 - 38 - 40 - 42). The results showed that its activity as were increased in high temperature.Recent study were clarified that purified vaginolysin was active in presence of cholesterol in media, gave (1.205) growth rate measured by the optical density at (100%) concentration. vaginolysin is cholesterol - dependent cytolysin (CDCs) toxin.Antimicrobial activity were investigated to the extracted Vaginolysin to evaluation of its activity depending on inhibition zone, the results showed that candida is more affective between the other microorganism gave (1.3)mm.Some virulence factor have been detected in molecular level ( Vly - SI - LuxS - LexA - rec a - Pl - Fur - Omp - Gal - protease ). Which wereSummaryIIIvaried in production may be as a results to the un presence of this gene in bacteria , may be silent gene or due to the amount of bacteria in sample are rare.Three Antibiotics were used at a molecular level (Tet b) were varied between resistance and sensitive to this gene (10) sample are resist,(RdxA) all sample are sensitive to its gene at percentage (100%), whereas (erna)gene were resist in all samples (100%).The results show there was no sequence homology between Mycoplasma spp. and G. vaginalis in the adhesion level this were detected by P30/P32 specific primer .The outcome of RFLPS - PCR is confirmed that G.vaginalis is virulent and have a role in preterm labor by degradation of membranes with the association of variable Silidase and presence of β - Galactosidase .MBL (mannose binding lectin ) levels were have a direct role pregnancy. It is also apparent that MBL plays a role in the defense against vaginal infection. MBL is essential to successful pregnancy in regards to maternal defense against infection, recent study indicate that MBL deficiency related to pregnancy outcome disorderedthis considered the first study of mannose in Iraq .DNA sequencing were done for two main virulence factor Phospholipase gene and Quorum sensing gene which showed some variation , then recorded in NCBI - gene sequencing as first descriped in Iraq.

التاثير المايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية == The Antimicrobial Effect of Silver Nano Particles (AgNPs) Against Pseudomonas aeruginosa Isolated from Clinical Samples

Author name: سارة عقيل حسن التميمي
Supervisor name: هدى هادي الحسناوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة للكشف عن التاثيرالمايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية, تم جمع 100 عينة من مصادر سريرية مختلفة, تضمنت العينات السريرية عينات الحروق , والادرار, والدم, واصابات الاذن, والقشع تم اخذ هذه العينات من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني 2017. زرعت جميع العينات على وسط السترمايد, وسط اكار الدم, وحضنت كل الاطباق هوائيا بدرجة حرارة C°37 لمدة 18ساعة. تم تشخيص بكتريا الزوائف الزنجارية بالاعتماد على الصفات المظهرية والكيموحيوية.كان توزيع العزلات كالاتي : 22(52.4%) من عينات الحروق, 8(19%) من عينات الادرار, 14.3)6%) عينة من المرضى المصابين بالالتهاب الاذن الخارجية, 4(9.5%) من عينات الدم,2(4.7%) من عينات القشع. اظهرت نتائج اختبار الحساسية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط ان جميع العزلات(26) كانت مقاومة لكل من الببراسلين (100%), السيفوتاكسيم (100%),بينما نسبة المقاومة لكل من الاميكاسين (88%), سيفترياكسون (65%), جنتامايسن (62%), بينما وجدت نسبة مقاومة قليلة للسفتازديم (15%), وكل العزلات كانت حساسة (100) لكل من الميروبينيم, اوفلوكساسين, نورفلوكساسين والسبروفلوكساسين. تم في هذه الدراسة ايضا الكشف عن تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) وطريقة صبغة الكونكو الحمراء (CRA) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الطبق الزرعي النسيجي كانت جميع عزلات الزوائف الزنجارية والبالغ عددها (9) منتجة للاغشية الحيوية, (4) من اصل (9) (44%) من عزلات الزوائف الزنجارية انتجت مستعمرات سوداء بواسطة طريقة صبغة الكونكو الحمراء. وكذالك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير جزيئات الفضة النانوية ((AgNPs على تكوين الاغشية الحيوية باستخدام تراكيز مختلفة (µg/ml 2.5, µg/ml 5, 10 µg/ml, 20µg/ml),حيث اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التركيز (20) وبنسبة تثبيط (100%), من جهة اخرى تم اختبار التاثير البكتيري المضاد لجزيئات الفضة النانوية ضد مختلف انواع العزلات البكتيرية باستخدام طريق التخافيف في الوسط الصلب وتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (12.5 µg/ml, 25 µg/ml, 50 µg/ml, (100 µg/ml, 200 µg/ml وكانت العزلات كالتالي : ـ(S. aureus, E. coli, E. cloacae, K. pneumonia, P. aeuroginosa)اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التراكيز(100 µg/ml, 200 µg/ml).ايضا تم تعريض ظاهرة السوارمنك في عزلات الزوائف الزنجارية لتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml ), ووجد ان اعلى نشاط لجزيئات الفضة النانوية ضد ضاهرة السوارمنك وانتاج البايوسيانين كانت بتركيز ((10 µg/ml, 5 µg/ml .تم زراعة جميع عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية (26)عزلة بوجود نترات الفضة (AgNO3) بتراكيز تتراوح (100 µg/ml - 400 µg/ml ) باستخدام طريقة التخافيف في الوسط الصلب مع قدرات مختلفة لانتاج البيوسيانين. اظهرت النتائج ان جميع العزلات 26((100 المنتجة للبايوسيانين كانت مقاومة للسلفر نايتريت (AgNO3) من خلال ظهور نمو في الطبق الحاوي على التراكيز المذكورة نترات الفضة (AgNO3).في هذه الدراسة تم اختبار بكتريا الزوائف الزنجارية لانتاج البكتريوسين باستخدام عزلات بكترية مختلفة تضمنت العزلات (امعائية مذرقية,مكورات العنقودية الذهبية,اشريكية قولونية, كلبسيلة رئوية). كذلك تم العثور على مجموعة واسعة من منطقة تثبيط (24mm - 30mm) في الانواع البكتيرية اعلاه مع قطر (30mm, 28mm, 24mm, 30mm) على التوالي. عزلات (امعائية مذرقية, كلبسيلة رئوية) كانت الاكثر تاثر والتي انتجت قطر تثبيط ((30mm. في هذه الدراسة ايضا تم تقييم علاقة مقاومة الفضة مع انتاج بيوسيانين في بكتريا الزوائف الزنجارية متعددة المقاومة للمضادات الحيوية. في هذه الدراسة تم استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتاكد من وجود بعض الجينات. في هذه التقنية، تم فحص جينات bla - IMP)) التي تشفر الى انزيم ميتالو - β - لاكتاميز المسؤول عن مقاومة ايميبينيم وجينات (silS ,silE) التي تشفر لمقاومة الفضة في عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية بواسطة استخدام برايمرت خاصة. وقد وجد ان جميع العزلات ال 26 (100%) من بكتريا الزوائف الزنجارية كانت سلبية لهذه الجينات. كما تم استخدام اثنين من البرايمرات المحددة للكشف عن فينازين (بيوسيانين) (phzS, phzM). اظهرت النتائج لل (phzM) ان من اصل 26)) عزلة , 21 (80.8%) اعطت نتيجة ايجابية, , فيما يخص (phzS gene) وجد ان 14(% 53.9) عزلة كانت حامله لهذا الجين . والخاتمة ان جزيئات الفضة النانوية (AgNps) تمتلك تاثير ضد الاغشية الحيوية وايضا لها تاثير بكتيري مضاد ضد بكتريا الزوائف الزنجارية وانواع بكتيرية اخرى, والتي من الممكن استخدامها كعلاج بديل. فيما يخص انتاج البايوسيانين ومقاومة الفضة، ظاهريا كان هناك تاثير البايوسيانين على مقاومة الفضة ولم تكن مقاومة الفضة بسبب نقل وجود جينات (silS, silE). | This study was conducted to detect the antimicrobial effect of silver nanoparticles (AgNPs) against Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples, total of 100 specimens were collected from different clinical sites included urine, burns, ear, blood , and sputum. The specimens were taken from patients admitted to Al - Hilla Teaching Hospital during a period extended from November 2016 to January 2017. All specimens were cultured on selective medium (cetrimide agar), blood agar, then incubated at 37°C for 18 hr. The isolated of P. aeurginosa were diagnosed depending on morphological and biochemical characteristics.The distribution of P. aeurginosa isolates was as follows : 22(52.4%) isolates from burns, 8(19%) isolates from urine, 6(14.3%) isolates from patients with otitis externa, 4(9.5%) isolates were isolated from blood and 2(4.7%) isolates from sputum. Antibiotic susceptibility test using disc diffusion test revealed that all isolates (26) were resistant (100%) to Piperacillin, Cefotaxime. While the resistance rate for Amikacin (88%), Ceftriaxone (65%), Gentamicin (62%), but low resistance rate was found to Ceftazidime (15%) and all isolates were sensitive (100%) to Meropenem, Ofloxacin, Norfloxacin and Ciprofloxacin. The biofilm formation in P. aeurginosa isolates was investigated by two methods include, tissue culture plates method (TCP) and congo red agar method (CRA). The results showed that all isolates 9 (100%) were found to be biofilm producer when investigated by TCP assay, and 4 out of 9 (44. %) isolates of P. aeurginosa were producing black colonies when detected by CRA method.The effect of AgNps on biofilm formation was tested by using different concentrations of silver nanoparticles (2.5 μg/ml, 5 μg/ml,10 μg/ml, 20μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of 20 μg/ml, with an inhibition rate of 100%. On the other hand the antibacterial activity of AgNps was tested against different bacterial species isolates (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomnas aeurginosa) using agar dilution method with different concentrations of silver nanoparticles (12.5 μg/ml, 25 μg/ml, 50 μg/ml, 100 μg/ml, 200 μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of (100 μg/ml and 200μg/ml). On the other hand Swarming motility in P. aeruginosa isolates was detected and subjected to different concentrations of (AgNps) (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml), it was found that the highest activity of AgNps against swarming motility and pyocyanin production of P. aeurginosa was at a concentration of (5 µg/ml, and 10μg/ml).The relation of silver resistance with pyocyanin production in P. aeruginosa was assessed. Screening test for silver resistance was performed by agar dilution method, all (26 isolates) of P. aeruginosa were cultivated in the presence of AgNo3 at a concentration (100 µg/ml - 200 µg/ml, 400µg/ml) using agar dilution method with differing capacities for pyocyanin production. All isolates of P. aeurginosa 26(100%) that produce pyocyanin were found to be resistant to AgNo3.In this study P. aeruginosa isolates were tested for bacteriocin activity by the agar well diffusion method using different bacterial isolates : E. coli, K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae. Wide range of inhibition zone (24mm - 30mm) was found against above bacterial species with diameter (28mm, 30mm, 24mm, 30mm), respectively. The most affected bacteria were K. pneumoniae and E. cloacae isolates, which produce inhibition zone (30)mm.PCR technique was used in this study for investigation some genes. In this technique, blaIMP gene that encode Metallo - β - lactamase enzyme responsible for imipenem resistance and (silE and silS) genes that encoding silver resistance were investigated in P. aeuroginosa isolates by using specific primers. It was found that all 26 (100%) isolates of P. aeuroginosa were negative for these genes. Also two specific primers were used to detect phenazine (pyocyanin) modifying genes (phzM, phzS). According to phzM gene, it was found that out of 26 P. aeuroginosa isolates, 21 (80.8%) isolates gave positive results at 330 bp, in regard to phzS gene, it was found out of 26 P. aeurginosa isolates, 14 (53.9%) isolates gave positive result at 664 bp.In conclusion AgNps have an antibiofilm, antibacterial activity against P. aeruginosa and different bacterial species that could be used as an alternative therapy. In regard to pyocyanin production and silver resistance, phenotypically there was effect of pyocyanin pigment on silver resistance and the silver resistance was not due to carriage of silE, silS genes.

التشخيص والتوصيف الجزيئي لبكتريا Clostridium perfringens المعزوله من حالات مرضية سريرية في مدينة الحلة == Molecular Diagnosis and Characterization of Clostridium Perfringens from Clinical Samples in Al - Hilla city

Author name: علياء محمد حمود الشمري
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | ميساء صالح الشكري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة لمعرفة وبائية بكترياC. Perfringens في العينات المؤخوذة في محافظة بابل. تم جمع 140عينة من الجروح العميقة من المرضى الداخلين في مستشفيات مدينة الحلة الرئيسية (مستشفى الحله التعليمي ومدينة مرجان الطبيه) والذين يعانون من مرض السكري المزمن وايضا من مرضى تعرضوا الى طلق ناري فضلا عن المرضى الذين يعانون من التهاب الخلوي اللاهوائي في الجلد(anaerobic cellulitis ) للفترة من شهر شباط ولغاية شهرتشرين الاول 2016. بالاضافه الى ذلك تم تشخيص وعزل بكترياC. perfringens بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية من خلال طرق التنمية على الاوساط الزرعية الاختيارية لهذه البكتريا واظهرت النتائج الحصول على 3 (2.14%)عزلات كان عزل اثنان منها 1.42%)) من مرضى السكري المزمن اما العزله الثالثه (0.72%) فقد تم الحصول عليها من الذين تعرضوا لطلق ناري في حين لم يتم الحصول على عزلات من المرضى الذين يعانون من الالتهاب الخلوي اللاهوائي . وكذلك تم تاكيد التشخيص باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA وجين16S - 23S spacer rRNA حيث اظهرت النتائج, من اصل 140 عزلة فان 7 عزلات تعود لبكتريا C. perfringens. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا واختبار قابليتها على انتاج انزيم (phpspholipase C) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم. كما تم الكشف عن حساسية عزلات البكتريا اللاهوائية تجاه 24 مضادا حيويا. بينت نتائج الدراسة ان جميع العزلات اظهرت حساسية عالية (100%) تجاه كل من penicillins .مثل benzypencillin, ,amoxicillin فضلا عن حساسيتها تجاه  - lactamase inhibitor مثل Ampicillin - sulbactam وحساسيه عالية لكل من metronidazole وaminoglycosidesومن ناحية اخرى، اظهرت جميع العزلات مقاومة عالية لكل من مضادات tetracyclin, Linezolid, levofloxacin, erthromycin بينما اظهرت هذه العزلات تغاير في درجات المقاومة تجاه مضادات pipracillin, Clindamycin, and Impenem.تم استخدام الطرق الوراثية في الكشف عن جينات المقاومة للمضادات الحياتية كجيناتM,Q,W,B) ) tet الخاصة بالكشف عن المقاومة للتتراسايكلين وجينات erm(A,B) للكشف عن المقاومة للكلندامايسين وجين nim للكشف عن المقاومة للمترونيدازول حيث اظهرت النتائج ان الجين tet M كان ذا سيادة عالية بنسبة 71.42 %تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي لتوكسينات البكتريا (alpha,epsilon, iota) للاستدلال على وجود جينات (cpa, etx, iap)، في C. perfringens وبنسبة 100%, 28.4%, 28.4% )) على التوالي.بالاضافة الى ذلك تم استخدام جينات cpa, etx and iap لقياس تعاقب القواعد النيتروجينية للمادة الوراثية للعزلات المدروسة فضلا عن تسجيلها في بنك الجينات العالمي ( ,(Gene Bank,اذ تم خلال هذه الدراسة ولاول مرة في العراق، الحصول على خمسة ارقام انضمام الى بنك الجينات العالمي (5 accession numbers)، حيث تم نشر هذه الارقام في بنك الجينات الامريكي gene bank - NCBI وهذه الارقام هي : جينiap : KY523199, KY523200 اما فيما يخص الجينetx فكانت الارقام هي : KY523201, KY523202 وفيما يخص الجين cpaفكان رقم الانضمام هو : . KY523203تعد هذه الدراسه انها اول دراسه في العراق تضمنت تحليل , دراسه تعاقب القواعد النايتروجينية للمادة الوراثية فضلا عن التسجيل في بنك الجينات العالمي لسموم عزلات محلية من بكتريا C.perfringens معزولة من عينات سريرية. | This cross sectional and hospital - based study aimed to studying the incidenceof Clostridium perfringens in clinical samples in Babylon province. A total of 140 wound swabs were taken from patients admitted to two main hospitals in Hilla city, Iraq (Hilla Teaching Hospital and Medical Marjan City), during the period from February to October 2016. Swabs were collected from diabetic patients, anaerobic cellulitis, and bullet wounds. These wound swab samples were subjected to different methods for identification of C. perfringens according to standard method. It was found that 3 (2.14%) C. perfringens isolates were recovered, of which 2 isolates (1.42%) were obtained from diabetic patients, 1 isolates (0.72 %) from bullet wounds, No isolates are recovered from the other clinical samples (cellulitis). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA, 16S - 23S intergenic spacer rRNA genes as a genetic marker for confirmation of detection of C. perfringens isolates,7 isolates of C. perfringens out of 140 are detected by using PCR with specific primer.The study also focuses on the ability of this bacteria to produce Phospholipase C and it was found that all isolates are positive for this enzyme (100%) . The results of antibiotic susceptibility testing using Vitek 2 system and disc diffusion method (DDT) of C. perfringens isolates (No.= 3) against 24 antibiotics showed that all isolates were highly sensitive to penicillins, (benzylpenicillin, and amoxicillin), all isolates (3/3) were sensitive to  - lactamase inhibitor such as Ampicillin - sulbactum. They were more susceptible to metronidazole and aminoglycosides in (3/3). On the other hand, all isolates were highly resistant to tetracycline, Linezolid ,levofloxacin, and erythromycin However, these isolates expressed different degree of susceptibility towards other antibiotics (Clindamycin, piperacillin and Imipenem). Molecular detection of C. perfringens of antibiotic resistance genes had been investigated and it had been found that tetracycline resistance gene tet M is the most commonly observed (71.42%) among ribosomal protection genes among C. perfringens isolates. While all isolates (7) gave negative results for other tetracycline resistance genes (tet W and Q, tet B, erm(A), erm(B),nim gens).Furthermore, detection of clostridial toxin (alpha, epsilon, iota toxins was applied using specific genes (cpa, etx, iap) and the results showed that the rate of the presence of these genes are : 100%, 28.8% and 28.4% respectively. The following genes : cpa, etx and iap were used for sequencing analysis, registration in gene bank - NCBI. Five accession numbers were obtained from registration of five sequences of these three genes at gene bank - NCBI : iap gene; accession numbers are : KY523199, KY523200etx gene; accession numbers are : KY523201, KY523202cpa gene; accession number is : KY523203. This is the first study in Iraq which employed analysis sequencing and registration in gene bank - NCBI, of clostriaial toxin of local isolates of C. perfringens obtained from clinical samples

دراسة فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية مع التهاب الاذن الوسطى القيحي في الاطفال == Study of Parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes with suppurative otitis media in children

Author name: ايام محمد صالح علي العامود
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | غانم عبود المولى
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن دور فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية Streptococcus pyogenes في الاطفال الذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي . جمعت 200 عينة (ثلاث مسحات لكل مريض تضمنت مسحة من افرازات الاذن ومسحة من افرازات الانف لدراسة الفيروس ومسحة من افرازات الاذن لدراسة البكتريا و50 عينة دم) من 50 مريض يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل للفترة من شباط (2016) لغاية ايار (2016). والذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى. وتضمنت الدراسة 32 عينة ماخوذه من اشخاص اصحاء كمجموعة سيطرة وتم تقسيمهم الى ست مجاميع عمرية بنفس طريقة تقسيم مجاميع المرضى. شملت الدراسة اربعة اجزاء رئيسية : اولا التشخيص الفيروسي اعتمد على التقنيات المتقدمة (العزل الاولي باستخدام فحص التالق المناعي المباشر لتحديد وتمييز الانواع الثلاثة لفيروس نظير الانفلونزا 1,2, and 3 والتشخيص الجزيئي بواسطة استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي لتحديد وتمييز الانواع الاربعة للفيروس1,2,3, and 4 وتم استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لمشاهدة جزيئة الفيروس . والجزء الثاني فحص البكتريا باستخدام فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 system وتم التحري ايضا عن انزيم الهيمولايسين حيث كانت جميع العزلات منتجه لهذا الانزيم . التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود الجين mga بواسطة تقنية سلسلة تفاعل انزيم البلمرة .الجزء الثالث شمل وجود الفيروس والبكتريا في عينات الاذن للمرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى . الجزء الرابع تضمن دراسة مناعية لمعرفة دور الحركيات الخلوية IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8, and CD56))عند الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم وباستخدام تقنية التالق المناعي المباشر لفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الثلاثة (hPIV 1,2,3) كانت نسبة الاصابة 64% (اي 32 طفلا من اصل من اصل50) وعند استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي ( (RT - PCR وجد ان نسبة الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الاربعة (hPIV_1,2,3 and 4) 44% ( اي 22 من 50) تضمنت الدراسة استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لرؤية جزيئة فيروس نظير الانفلونزا في افرازات الاذن . اظهرت نتائج التشخيص البكتيري ان نسبة الاصابة بالمسبحيات القيحية هي 14%(7 من 50) بعد زرعها على وسط اكار الدم وحضنت لمدة 24 ساعة بدرجة 37 وتم فحصها بواسط المجهر الضوئي بعد تصبيغها بصبغة كرام , تم التشخيص بواسطة استخدام فحص Bacitracin sensitivity وفحص انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم بواسطة فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 systemاظهر التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود mga جين ان جميع العزلات تحتوي على هذا الجين اي نسبة 100% .كما اظهرت الدراسة ان نسبة وجود الفيروس مع البكتريا في في سوائل الاذن بنسبة (16%)( . 4 وكانت نسبة وجود الفيروس (72%) 18وشملت الدراسة ايضا فحص الحركيات الخلوية بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم واظهرت النتائج ارتفاع مستوى السايتوكينات في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء وكان اعلى مستوى لانترليوكين 6 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو) 88.24 )و (100.95) 1Pg/ml على التوالي . في حين كان اعلى مستوى لعامل النخر الورمي نوع الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (99.35 ) و(109.81 ) Pg/ml على التوالي. وكان اعلى تركيز لانترفيرون الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو( 217.16) و(( 197.84 Pg/ml على التوالي . واظهرت النتائج ان تركيز الواسمين المناعيين CD8 وCD56 ان تركيزهما اعلى في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء , اظهرت النتائج ان تركيز CD8 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو ((11.46±1.49 و(14.76±1.73) ng/ml على التوالي . في حين كان تركيز CD65 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (12.82±1.62 )و (10.59±1.19) ng/ml على التوالي | This study aimed to detect the role of of parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes in children suffering from suppurative otitis media. A total of two hundred sample (three swab for each patients include ear swabs , nasopharyngeal secretion for viral study and ear swab for bacterial study and 50blood sample) , were collected from 50 patients suffering from suppurative otitis media attending to AL - Hilla Teaching Hospital in Babylon - Iraq during the period from February 2016 to May 2016. The study includes 35 samples obtained from healthy subject as control group that classified to six group according to age in similar way of patient's with parainfluenza virus infection group years old The study includes four main parts .First one is the viral diagnosis based on relied diagnostic procedure ( Primary detection of parainfluenza virus in ear discharge by direct Immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types, molecular diagnosis by Real - Time PCR technique for the qualitative detection and differentiation of Parainfluenza Virus 1, 2, 3, 4 and diagnosis of parainfluenza virus by transmission electron microscope. The second part includes the bacterial diagnostic based on relied diagnosis procedure (using conventional biochemical reaction and commercial kit (Vitek 2 system). The heamolysis on blood agar was also observed in all isolates. Molecular detection of mga virulence gene for Streptococcus pyogenes was detected using conventional PCR technique. The third part is Co - infection between GAS and HPIV in OM specimens of children with suppurative OM. The fourth part is an immunological study to investigate the role of cytokines (IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8 and CD56) in HPIV infection by ELISA assay . Direct immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types antigen was positive in 64% (32 out of 50) , when we use Real - time reverse transcription PCR(RT - PCR) the percent of children infection with HPIV1, 2, 3, and 4 was 44% (22 out of 50). The study also include the use of transmission electron microscope for visualized the parainfluenza virus particle in ear swab. Streptococcus pyogenes isolates was detected in 14%(7 from 50) the isolate were confirmed after culturing on the blood agar and incubated for 24 hour at 37ºC, then microscopically by Grams̕̕ staining. Identification was done using commercially prepared bacitracin and the type of hemolysis on blood agar by primary biochemical test and confirmatory identification by vitek2 system compact. Molecular Identification of mga gene for Streptococcus pyogene showed that all Streptococcus pyogenes positive result 100%. The occurrence of Bacterial and viral co - infection in middle ear fluids which have been observed in 16% (4 out of 50 cases). HPIV was identified as a single agent in ear swab in 72%(18 out of 50). The study include estimation of some immunological parameter include (IL - 6, TNF - α, IFN - α , CD8 and CD56 ) using ELISA and revealed elevation the concentration of cytokines in sera of otitis media patients in comparison with healthy control groups. The concentration of IL - 6 is higher in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. The high level of IL - 6 Pg/ml in otitis media patients for male and female was (88.24) and (100.91) Pg/ml respectively. Also level of TNF - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (99.3) and (109.8) Pg/ml respectively . The level of IFN - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (217.16 )and (197.84 )Pg/ml respectively. The results also show elevation concentration of CD8 and CD56 in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. For CD8 ng/ml in otitis media patients for male and female was(11.46) and (14.76)ng/ml respectively. The level of CD56 ng/ml in otitis media patients for male and female was (12.82) and (10.59)ng/ml. respectively.

الكشف عن اللولبية البوابية في خزعة المعدة ودراسة مستوى P53 وطفرات مورثة Bax المرتبطة بالقرحة الهضمية == Detection of Helicobacter pylori in Gastric Biopsy and Study the Level of P53 and Bax Gene Mutations Associated With Peptic Ulcer

Author name: اصيل هاشم راضي السعبري
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | مشتاق عبد العظيم وتوت
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اللولبية البوابية هي بكتريا سالبة لصبغة كرام, الذي تصيب غالبية سكان العالم وتسبب امراض مختلفة مثل التهاب المعدة المزمن, القرحة الهضمية وسرطان المعدة. في حين ان غالبية الناس المصابين بالبكتريا اللولبية لا تظهر عليهم اعراض مرضية. ان العوامل الرئيسية التي تحدد تطور الامراض ذات الصلة بالبكتريا اللولبية قد تكون ضراوة البكتريا, وعوامل المضيف الوراثية والبيئية.الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن اللولبية البوابية في انسجة المعدة ودراسة عوامل الضراوة الرئيسية لهذا الممرض والعوامل الوراثية للمضيف في المرضى الذين يعانون من اعراض اصابات المعدة والاثني عشري. وتشمل الطرق الجزيئية ايضا تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) للكشف عن جينات التشخيص والضراوة لبكتريا اللولبية البوابية وتقنية (SSCP) تم القيام بها للكشف عن الطفرات الجينية ل P53 وال Bax جين التي قد تترافق مع عدوى اللولبية البوابية.بلغ العدد الكلي للنماذج (الخزعات) المعوية 180 نموذج. فقط 92 خزعة معدة (51 ٪) اعطى نتيجة ايجابية لللوليبيات البوابية (Helicobacter pylori ) للتشخيص بواسطة التقنية الجزيئية, مع ذلك من بين هذه النتائج الايجابية 60% منها اعطى نتيجة ايجابية للزراع, التي تعتمد على الميزات الكيميائية الحيوية. كما تم اخذ 100 عينة مصل الدم من افراد اصحاء مع عدم وجود تاريخ عدوى بالبكتريا اللولبية كمجموعة سيطرة ونتائج اختبار الاجسام المضادة على اساس (اختبار المصلية) اعطت نتائج سلبية للبكتريا اللولبية.قد تم ملاحظة وجود تكرار عالي للولبية البوابية بالتهاب المعدة المزمن الذي يشكل 88٪ بينما التكرار القليل كان مقداره 3٫3٪ لسرطان المعدة في حين ان 8٫7٪ كان لقرحة الاثنى عشري. وقد كان التكرار العالي لعدوى اللولبية البوابية بين المصابين الذكور اكثر من الاناث, ويعود سبب ذلك لعدة عوامل مثل (متوسط العمر الاجتماعي والاقتصادي ونقص التغذية وسوء النظافة) ويعتبر التدخين احد العوامل الاضافية المرتبطة مع انتشار عدوى (اللولبية البوابية ) بسبب السلوكيات غير الصحية المرافقة للتدخين , والتي قد تشمل نقل البكتيريا من خلال اللعاب بين المدخنين. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان معدل العدوى العالي للمجموعة العمرية (31 - 50) سنة الذي تم تسجيله كان 44٫6٪. علاوة على ذلك فان الكشف عن اللولبية البوابية بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة PCR)) قد اجريت على جميع انواع خزعات المعدة وجين (ure C ) اضافة الى جين (ure A ) اللذان يستخدمان كعلامات للتشخيص التاكيدي للولبية البوابية من خلال استخدام (primers ) خاص لتقنية PCR. وضحت النتائج ان 84٫8٪ و73٫9٪ للولبية البوابية كانت ايجابية لكلا الجينين. للعينات التي اعطت نتائج ايجابية (للتضاعف الجيني amplification ) بواسطة (PCR ), كان 56 عينة ما يمثل (60٪) قد اعطت استجابة لنتائج الزرع. اضافة الى التضاعف بواسطة PCR لعلامات جين (ure C ) وجين (ure A ). اضافة الى ذلك ,المعدل الايجابي للولبية البوابية للخزعات تحت الاختبار كان 51٪ بالاعتماد على الكشف الجزيئي المباشر بواسطة (PCR) باستخدام جين (ure A) وجين (ure C ). علاوة على ذلك, تم فحص جين (cag A) لكل عينات اللولبية البوابية التي تم عزلها. اشارت النتائج الى ان65 عزلة (70٫6٪) كانت ايجابية لتضاعف (PCR ) للجين من نوع cagA) ) حيث ان عزلة 56 (60٫8٪) كانت ايجابية لتضخيم (PCR ) للجين من نوع (cag E ). من بين النتائج الايجابية التي تم عزلها 49 عزلة (53٫3٪) كانت قد اعطت نتائج ايجابية للجين من نوع (cag A ). كذلك وجد تكرار الجين (vac A ) مقداره في الدراسة الحالية 68٫5٪ (63/92). اضافة الى كل اللولبيات البوابية الايجابية لخزعة المعدة 49 (53٫3٪) اظهرت اشارة كاملة للجينات نوع (cagA, cagE وvacA (. بالنسبة للعينات المعدية المتبقية 27 عينة (30٫4٪) التي تحوي سلالات سلبية كانت سلبية للجين (cag E). وقد تم تحديد طفرات جين (p53) في الاكسونات 5 و6و 7 و8 باستخدام طريقة SSCP. ومع ذلك تم استخدام PCR لتضخيم الاكسونات 5 و6 و7 و8 للجين (p53) التي من المعروف انها بقع ساخنة طافرة .تحليل PCR - SSCP يكشف تعديلات في الجين (p53) في عدة اكسونات. حيث ان ستة عشر من التعديلات في الاكسون E5A , سبعة عشر التعديلات في الاكسون E5B6A, وكذلك سبعة عشر التعديلات في الاكسون E7 وتعديل واحد فقط في الاكسون E6B لكن لم يظهرتعديل في الاكسون E8 في الجين (p53). بنفس الاسلوب ان تحليل PCR - SSCP كشف عن تعديلات في جين bax في الاكسونات E1 وE4 وE6. ويظهر ذلك في الاشكال. فيما يخص الاكسون 1 في bax يمكن ملاحظة وجود 6 نماذج فقط تعطي طفرات موضع ايجابية للجين. قد يعزى ذلك الى اللولبية البوابية التي تحفز طفرة bax من خلال قابليتها على انتاج بروتين cag A الذي له القابلية على تغيير التسلسل الجيني والوظيفة. واستنتجنا الى ان التشخيص الجزيئي قدم دليلا توكيديا على وجود اللولبية البوابية في عينات المعدة. ايضا قد تؤثر السلالات الاكثر ضراوة على تحفيز طفرات جينية في جينات ال p53 وال bax. | Helicobacter pylori is a gram - negative bacteria which infects a majority of the world population. It causes various diseases such as chronic gastritis, peptic ulcer and gastric cancer. While majority of the people infected with H. pylori is asymptomatic. The main factors, which determine the development of H. pylori related diseases might be bacterial virulence, host genetic and environmental factors.The aim of this study is detection of H. pylori in gastric tissue and study the main virulence factors of this pathogen and host genetic factors in patients with gasteroduodenal manifestation. Molecular methods include polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis and virulence genes of H. pylori and single strand confirmation polymorphism (SSCP) technique was done to detect the p53 and bax genes mutation may be associated with H. pylori infection. In this study, 180 patient were included, only 92 gastric biopsies (51%) gave positive for the presence of H. pylori diagnosed by direct molecular technique. Among these positive result, 60% gave positive results in cultivation based on biochemical features. In addition, 100 serum samples were taken from healthy individuals, with no history of H. pylori infection as a control group and the results of antibody based test (serological test) were negative for H. pylori.In this study, the high frequencies of H. pylori were observed for chronic gastritis, which constituted 88% while low frequencies were 3.3% for gastric cancer, whereas 8.7% for duodenal ulcer.Also, the highest frequencies of H. pylori infection were found in male patients in comparison to female. On the other hand, the results showed that the high significant infection percentage 44.6%, among age group ranging from 31 - 50 years. Moreover, detection of H. pylori by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique is performed on all gastric biopsy. ure C as well as ure A genes are used as markers for confirmatory diagnosis of H. pylori through using specific primers of PCR technique. The results show that 84.8% and 73.9% of H. pylori are positive for both genes, respectively. Among samples with positive result for PCR amplification, 56 samples (60%) also had positive culture result. Besides, the PCR amplification of ureC and ureA markers. Also, the rate of positive H. pylori in the tested biopsies was 51% depending on direct molecular detection by PCR using the ureA and the ure C genes.In addition, cag A gene is investigated in all H. pylori isolates. The results show that 65 isolates (70.6%) are positive for PCR amplification of cagA gene whereas 56 isolates (60.8%) are positive for PCR amplification of cag E gene. Among of these positive isolates, 49 isolates (53.3%) give positive result for cag A gene. The frequency of the vacA gene found in the present study is 68.5% (63/92).Furthermore, among of all H. pylori positive gastric biopsy, 49 (53.3%) reveal full signals of cagA, cagE, and vacA. The remaining 27 (30.4%) gastric biopsies, harboring cagA - negative strains, are PCR negative for cagE.Mutations of the p53 gene in exons (5,6,7 and 8) are identified by PCR - SSCP method. However, PCR is used to amplify exons 5,6,7 and 8 of p53 gene which are known to be mutational hot spots. PCR - SSCP analysis has detected alterations in the p53 gene in several exons. Where sixteen alterations in exon E5A, nineteen alterations in exon E5B6A, seventeen alterations in exon E7 and only two in exon E6B but no alteration is seen in exon E8 of P53 gene.In the same way, PCR - SSCP analysis detected alterations in Bax gene where only 17% of positive samples gave alteration in the sequence of Bax gene in exons E1, E4 and E6. Regarding exon 1 of Bax gene, it was seen that only 6 samples gave positive gene locus mutation. It conclude that the molecular diagnosis gave an evidence and confirmatory guide on the existence of H. pylori in gastric samples. Also the more virulent strain may be affected on the stimulation of p53 and bax genes mutation.

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Porphyromonas gingivalis المعزوله من المرضى المصابين بامراض اللثه == Molecular and Bacteriological Study of Porphyromonas gingivalis Isolated from Patients with Periodontitis

Author name: فاطمة مالك عبود
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | الهام عباس بنيان
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم جمع 103عينة من الصفيحة الجرثومية العميقة (subgingival dental plaque) من المرضى الذين يعانون من التهاب اللثة المزمن والمتقدم (72, 31) على التوالي لمراجي العيادة الاستشارية لامراض اللثة في كلية طب الاسنان/ جامعة بابل والمركز التخصصي لطب الاسنان في مدينة الحلة. للفترة من كانون الاول 2013 الى حزيران 2014. تم تشخيص وعزل بكتريا P. gingivalis بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية واظهرت النتائج ان 69.5%) 16) منها تم عزلها من التهاب اللثة المزمن وتم عزل 7 (30.5) من التهاب اللثة المتقدم باستخدام التنمية على الوسط الانتقائي الخاص لهذه البكتريا. وكذلك تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي باستعمال المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA حيث اظهر ان12 عزلة من اصل 23 عزلة تم تشخيصها بشكل نهائي انها تعود لبكتريا P. gingivalis. منها حوالي 8 تعود الى التهاب اللثة المزمن و4 تعود الى التهاب اللثة المتقدم. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا للالتصاق(adherence ability) بالخلايا الطلائية المبطنة للفم حيث وجد ان جميع العزلات لها القابلية على الالتصاق بهذه الخلايا وتم ايضا اختبار قابليتها على انتاج انزيم (Gingpain) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم.في هذه الدراسة تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية(Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate test (TCP) اذ كانت مكونة للاغشية الحيوية بنسبة 100% وكذلك تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على انتاج biofilm ووجد ان اعلى تثبيط سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير Clove مقارنة باقل تاثير لمادة السعد ((Cyprus rotundus. وكذلك تم الكشف عن حساسية العزلات لبعض المضادات الحيوية ووجد بان كل العزلات كانت حساسة الى Co - amoxiclave وعلى العكس اغلب العزلات تظهر مقاومة عالية لل Amoxicillin بينما سجلت مقاومة قليلة جدا لل Ampicillinو Metronidazole(16.3%, 20.3%, ) على التوالي. واخيرا تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على تثبيط نمو هذه البكتريا وتوضح النتائج ان اعلى تاثير سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير القرنفل(Clove) mm) 25,30,40) على التوالي مقارنة باقل تاثير لمادة السعدC. rotundus (10mm) .في هذه الدراسة ايضا تم التحري عن التغاير الجيني ((TLR - 4 Polymorphisms باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم ((PCR - RFLP. وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Thr399Ile : CC وCT وTT ، اذ بلغت نسبة انتشارها ((12.5%,10%,77.5% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة TT,CCوبنسبة انتشار(36.6% ,63.4%) على التوالي ، فيما بلغت نسبة انتشار الاليلC السائد في المرضى 82.5 % بالمقارنة للسيطرة 63.3% مع وجود اختلاف معنوي. وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA وAG وGG وبنسبة انتشار % 67.5 و12.5% و20% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة GG, AA وبنسبة انتشار34.4%) 66.6%,) على التوالي. حيث سجلت نسبة انتشار الاليل A السائد (73.75%) في مجموعة المرضى بالمقارنة بمجموعة السيطرة (66.6%) وبفرق معنوي. | In this study, 103 clinical samples were collected from subgingival dental plaque of patients with chronic (CP) and aggressive periodontitis (AP) (72 and 31) respectively, and (n=30) a healthy group admitted to teaching Hospital in college of Dentistry / Babylon University and specialized center of Dentistry in Hilla city, From February 2013 to June 2014). Out of which (n=40) with a chronic periodontitis group from them blood sample were collected for detection of gene polymorphisms in Toll - like receptor - 4 (TLR - 4). These dental plaque samples were subjected to different methods for identification of P. gingivalis mainly traditional bacteriological method. It was found that 23 P. gingivalis isolates were recovered by using selective media where 19 isolates (26.3%) obtained from (CP) and 4 isolates (12.5%) from (AP). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA gene as a genetic marker for confirmation of detection of P. gingivalis isolates, 12 isolates of P.gingivalis out of 23were detected by molecular method focusing on the role of 16s rRNA gene of P. gingivalis. 8 isolates were isolated from CP, and 4 isolates were isolated from AP subgingival plaques. In addition, these 12 isolates were investigated to detect Adherence of P.gingivalis to oral epithelial cells. The result showed that all isolates have ability to adhere to oral epithelial cells. The study also detected the ability of this bacteria for production of Gingipain, it was found that all isolates were positive for this enzyme at a rate 100%.Furthermore, biofilm formation was tested in the semi quantitative microtiter plate test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were accounted for (50%) while there are no isolates that express non biofilm formation.Regarding to effect of Chlorhexidine (CHX) gluconate (0.12%) on biofilm formation, the results of this study demonstrated (CHX) effectively and reduced the viability of biofilm - forming bacteria from moderate to 25%, weak to 75% and no strong. The study was also evaluating the effect of some plant extracts on biofilm formation. The results showed the highest effect for Alum potassium phosphate followed by Clove, in contrast to lowest effect of C. rotundus. And after screening the effect of Flagyl solution on production of bacterial pigment. The results showed that the metronidazole produced the highest inhibition activity range (30 - 10mm). Furthermore, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics had been investigated and it had been found that all isolates were sensitive to co - amoxiclave and, in contrast, the isolates showed high resistance to other type of beta lactam such as amoxicillin (54.3%). In addition, the result showed that the resistance of p. gingivalis was very low for ampicillin and metronidazole (16.3% and 20.3%), respectively.The screening of antimicrobial activity of (CHX) gluconate (0.12%) was carried out and the results showed that it produced the highest inhibition activity whether against p. gingivalis with inhibition zone range 40 - 15mm. Finally in vitro antibacterial activity of Alum, Clove and Cyperus rotundus plant extracts was studied and the results revealed that all tested isolates were inhibited by aqueous extracts at 50% concentration. The maximum inhibition zone was observed in Alum and Clove extracts respectively (30mm, 25mm), compared to the minimum inhibition by Cyperus rotundus (10mm). The antibacterial actions of 20% concentration of plant extract gave lower inhibition zone than 50% concentration of that extract which represented by (19mm, 16mm, and 10 mm) of the previous three mentioned extracts. This study also aimed to investigate the association of Thr399Ile and Asp299Gly single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the (TLR - 4) with the incidence of (CP).The results revealed at the site of SNPThr399Ile, there were three genotypes for this SNP among CP patients; CC, CT and TT with frequency of 77.5%, 10% and 12.5 % respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; CC and TT with frequency of 63.4% and 36.6% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele C (dominant) was higher among CP group (82.5%) than control (63.3) with significant difference. The site of SNP of Asp299Gly also showed three genotypes among CP patients; AA, AG and GG with frequency of 67.5%, 12.5% and 20% respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; AA and GG respectively with frequency of 66.6 and 34.4% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele A (dominant) was higher among CP group 73.75 % than control 66.6%.

دور السايتوكينات المعزولة من انسجة المشيمة المغذية للجنين لدى النساء مع الاجهاض التلقائي == The role of cytokines isolated from feto - placental tissues in women with spontaneous miscarriage

Author name: ميسلون عبد الحميد ناصر
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Basrah
First pages:
Abstract: شملت الدراسة الحالية (172( امراة، تتراوح اعمارهم بين 16 - 41 عاما، من المرضى الذين قدموا الى مستشفى الولادة والاطفال في البصرة بسبب الاسقاط التلقائي غير الكامل في الشهور الثلاثة الاولى من الحمل ، بالاضافة الى النساء مع الحمل الطبيعي في وقت الولادة خلال الفترة من شباط 2012 الى ايار 2014 وتم تقسيمهن الى 3 مجموعات :  المجموعة - ا : وشملت )65) من النساء مع الاجهاض التلقائي المتكرر (RSM) خلال الاشهر الثلاثة الاولى، مع متوسط العمر (25.2 ± 7.28) سنة. المجموعة - ب : وشملت (36) من النساء مع الاسقاط التلقائي غير الكامل في الاشهر الثلاثة الاولى من الحمل ولها على الاقل ثلاثة مرات حمل طبيعي سابق (الاجهاض التلقائي غير المتكرر ( non - RSM بمتوسط من العمر (26.61 ± 6.97) سنة. المجموعة - ج : السيطرة (الحمل الطبيعي) : 71 امراة بمتوسط من العمر (26.17 ± 7.01) سنة. وتم الحصول على الدم الوريدي من المجاميع قيد الدراسة من اجل البحث عن المضاد المناعي م وج الخاص بمقوس قوندي , IgM ) IgG (. والتشخيص المصلي للاصابة بمقوسات قوندي يستخدم على نطاق واسع لفحص النساء الحوامل والمجهضات. كان معدل حدوث داء المقوسات (38.4٪) التي وجدت في 101 مجموعات الاجهاض التلقائي بواسطة فحص (ELISA). اظهرت عينتين (3.08٪) نتائج ايجابية المضاد المناعي (م). بينما كانت 24 (36.92٪) عينة ايجابية للمضاد المناعي (ج) لمقوس قوندي في مجموعات المرضى , بينما لم تسجل اصابة في 71 امراة من مجموعة السيطرة . غالبية النساء المصابة (50٪) في سن (30 - 39) سنة في حالة المضاد المناعي (ج)، في حين ان (10.26٪) في سن (20 - 29) سنة في حالة من المضاد المناعي (م).والنتائج كشفت عن ان اعلى نسبة للاجهاض التلقائي لوحظت في نساء الارياف . وفي الوقت نفسه، تم جمع نسيج الارومة المغذية للجنين خلال عملية الكشط والدم الوريدي للكشف وتقييم السيتوكينات المضادة للالتهابات (IL - 4، IL - 6، IL - 10) والسيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2،عامل نخر الورم - الفا TNF - α، - γ IFN) وقياس تركيزها باستخدام فحص انزيم مرتبط البلمرة المناعي ، تبين تركيز عال (49.97 ± 8.82، 180.7 ± 15.03، 94.34 ± 7.68) للسيتوكينات في الارومة المغذية للجنين (IL - 4، IL - 6، IL - 10 على التوالي) في حالة مجموعة السيطرة بالمقارنة مع مجموعات المرضى وتم الكشف عن نتيجة عكسية في مصل الدم ، في حين ان التراكيز عالية من السيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2، TNF - α، IFN - γ) كانت (134.17 ± 24.37، 432.16 ± 51.7، 100.46 ± 9.94 على التوالي) في حالة مجموعة الاجهاض التلقائي المتكررRSM)) بدلا من مجموعة السيطرة ومجموعة الاسقاط التلقائي غير المتكرر RSM - non مع وجود اختلافات معنوية كبير.p<0.001 وقد تبين في الدراسة الحالية وجود علاقة واضحة بين مناعة الامهات نوع TH2 والحمل الطبيعي، في حين يرتبط رد فعل جهاز المناعة نوع TH1 بفقدان الحمل. والتوازن الدقيق بين السيتوكينات الناتجة عن TH1 / TH2 ممكن ان يمنع خمج مقوسات قوندي . الذي يرتبط مع الانتاج الكبير من TH1 للسيتوكينات الموالية للالتهابات.وعلاوة على ذلك نتائج حساب مستويات CD44، اظهر فرقا معنويا عاليا p<0.001 في حال مقارنة بين مجموعة السيطرة والمجموعتين من النساء المجهضات . وهكذا تم تسجيل ارتباط CD44 مع فعالية خلايا TH2 ؛ لذا فمن المرجح انه قد يكون هناك وجود علاقة بين الحمل الطبيعي وكثافة CD44 على سطح الخلية

فاعلية البرنامج التثقيفي على معارف وممارسات العاملين الصحيين تجاه السيطرة على العدوى في مراكز الرعاية الصحية الاولية في مدينة كربلاء المقدسة == Effectiveness of an Education Program on Health Care Workers' Knowledge and Practices toward Infection Control at Primary Health Care Centers in Holy Karbala City

Author name: سلمان حسين فارس الكريطي
Supervisor name: اركان بهلول ناجي
General topic: Medicine
Specific topic: Nursing
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Faculty Of Nursing
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: دراسة شبه تجريبية اجريت في مراكز الرعاية الصحية الاولية في مدينة كربلاء المقدسة للفترة من اذار 2102 . لغاية نهاية شهر نيسان 2102 لقد هدفت الدراسة الى تقييم فاعلية البرنامج التثقيفي على معارف وممارسات العاملين الصحيين تجاه السيطرة على العدوى في مراكز الرعاية الصحية الاولية في مدينة كربلاء المقدسة. تم تقييم الاحتياج للبرنامج التثقيفي، واظهرت نتيجة التقييم وجود ضعف في معارف وممارسات العاملين الصحيين تجاه السيطرة على العدوى في مراكز الرعاية الصحية الاولية.) شملت عينة الدراسة ) 22 عاملا صحيا اختيروا بشكل غير عشوائي )عمدي( ، وقد قسمت العينة الى مجموعتين مجموعة الدراسة ) 22 ( عاملا صحيا، والمجموعة الضابطة ) 22 ( عاملا صحيا . تم بناء برنامج تثقيفي حسب احتياج العاملين الصحيين واعدت ثلاث استمارات واحدة للمعلومات الخاصة بالعينة لتحديد صفاتها، واستمارتين لتقييم معارف وممارسات العاملين الصحيين ، استعملت للاختبار القبلي والبعدي. تم تحقيق مصداقية الاداة بعرضها على مجموعة خبراء لمراجعتها وتحديد درجة مصداقيتها، وتم تحديد ثبات اداة القياس من خلال الدراسة التجريبية.تم الاختبار القبلي لافراد المجموعتين ومن ثم تطبيق البرنامج التثقيفي لمجموعة الدراسة فقط للفترة من التاسع عشر لغاية الثالث والعشرين من حزيران 2102 ، تم الاختبار البعدي الاول مباشرة بعد تنفيذ البرنامج، ثم الاختبار البعدي الثاني بعد اربعة اسابيع من الاختبار البعدي الاول.تم تحليل النتائج باستخدام الاحصاء الوصفي والاحصاء الاستدلالي. اظهرت النتائج استفادة العاملين الصحيين بعد تطبيق البرنامج التثقيفي حيث الزيادة في مستوى المعرفة والممارسة للعاملين الصحيين وان البرنامج التثقيفي الخاص بالسيطرة على العدوى كان فعالا في تحسين معارف وممارسات العاملين الصحيين المشاركين فيه وعدم وجود اختلافات هامة بين مستوى تحسين معارف وممارسات العاملين الصحيين نتيجة لتطبيق البرنامج طبقا للعمر، المستوى التعليمي، سنوات الخبرة والمشاركة في الدورات التدريبية في الاختبار البعدي لمجموعتي الدراسة والضابطة باستثناء سنوات الخبرة في مجموعة الدراسة فقد اظهرت النتائج وجود اختلافات هامة بين مستوى تحسين معارف العاملين الصحيين في الاختبار البعدي لمجموعة الدراسة .واوصت الدراسة بتوفير الادلة الارشادية والتاكيد على اهمية التعليم المستمر للعاملين الصحيين باستعمال الممارسات المعتمدة على الادلة لتطبيق الاحتياطات القياسية للسيطرة على العدوى. وان هنالك حاجة لاكثر من برنامج تثقيفي حول السيطرة على العدوى في كل مراكز الرعاية الصحية الاولية ولعينة اكبر لتستفيد من النتائج . | A quasi experimental study was carried out at the primary health care centers in holy Karbala city from March 2016 to the end of April 2017.The study aims to assess the effectiveness of an educational program on the knowledge and practices of healthcare workers in Karbala city. Assessment of needs was done to evaluate the needs for the educational program. The result of the assessment revealed that the healthcare workers had deficit knowledge and practice regarding infection control in primary health care centers. A Non - Probability sample of (52) healthcare workers was selected randomly and divided into two groups : (26) considered as a study group and the other (26) considered as control group. An educational program was constructed, and three formats were developed one for assessing demographic characteristics of sample, the other two for assessing healthcare workers knowledge and practice. Validity of the instrument was determined through content validity by a panel of experts, and reliability of the tool was determined through a pilot study.A pre - test was done for both groups; educational programs were applied only for the study group from June 19th to June 23rd 2016. Then the first post - test was applied after the implementation of the program and the follow up after four weeks from 1st post test.Analysis of data was performed through the application of descriptive and inferential statistics.The findings revealed that the healthcare workers of the study group had benefited from the implementation of the educational program; their knowledge and practice were significantly improved comparing with the control group, the infection control education program was found to be effective in knowledge and practices improvement to the participant HCWsand non - significant association between HCWs knowledge and practice improvement effect result by application of the education program and their age, education, years of experience and training session in post - test I for study and control group. Except for years of experience in study group it shows a significant association with knowledge improvement.The study recommends the availability of written guidelines and focus on the importance of continuing education for HCWs using the evidence - based practices for application of standard precautions of infection control; and more educational programs of infection control are needed in all PHC centers and on a larger sample to benefit from the results.

استكشاف الحبكة في رواية وليم فوكنر الصخب والعنف على وفق نظام لونغكر للتحليل السردي : دراسة اسلوبية == An Investigation of Plot in Faulkner’s The Sound and the Fury in Terms of Longacre’s System of Narrative Analysis : A Stylistic Study

Author name: مجيد حميد جاسم
General topic: Foreign Languages
Specific topic: English - Literature
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - College Of Literature - Department Of English Language
Language: English
University location: Basrah
First pages:

اثر برنامج التعلم المستقل في اداء طلبة الكلية للكتابة في اللغة الانكليزية لغة اجنبية == The Effect Of Autonomous Learning Programme On EFL College Students' Performance In Writing

Author name: فاطمة رحيم عبد الحسين الموسوي
Supervisor name: شيماء عبد الباقي البكري
General topic: Educational Sciences
Specific topic: Methods of Teaching English Language
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Rushd College Of Education For Human Sciences
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: القدرة على الكتابة بنحو فعال تزداد اهمية في المجتمع العالمي، والتعليم في الكتابة هو افتراض له دورا متزايدا في تعليم اللغة الثانية والاجنبية. مهارة الكتابة تتمتع بوضع خاص, فمن طريقة الكتابة يمكن للشخص الاتصال مع مجموعة متنوعة من الرسائل الى القارئ او الق | The ability to write effectively is becoming increasingly important in the global community, and instruction in writing is thus assuming an increasing role in second and foreign language education. The skill of writing enjoys special status. It is via writing that a person can communicate a variety of messages to a close or distant, known or unknown reader or readers. Most EFL teachers are keen to talk to students about the importance of becoming autonomous writers. But just telling students that autonomy is in some way a good thing will have little effect unless it is part of a wider - semester design and unless teachers find ways of helping students to become more autonomous. This study aims at investigating the effect of autonomous learning programme on EFL college student's performance in writing and finding out the development in the experimental samples' autonomy. To achieve the aims of the study, the following null hypotheses have been posited.1. There is no statistically significant difference between the mean ranks of the experimental group performance and that of the control group in composing component of the post test. 2. There is no statistically significant difference between the mean ranks of the experimental group performance and that of the control group in style component of the post test. 3. There is no statistically significant difference between the mean ranks of experimental group performance and that of the control group in sentence formation component of the post test. 4. There is no statistically significant difference between the mean ranks of the experimental group performance and that of the control group in usage component of the post test. 5. There is no statistically significant difference between the mean ranks of the experimental group performance and that of the control group in mechanics component of the post test. 6. There is no statistically significant difference between the mean ranks of the experimental group performance and that of the control group in overall composition writing of the post test. 7.There is no statistically significant difference in the experimental group subjects' autonomy between the pre and the post administration of questionnaire. Thus, an experiment is designed.Fourty students from the College of Basic Education at University of Missan have randomly been chosen (twenty students as an experimental group which are taught composition writing by the use of autonomous learning programme and twenty students as a control group which are taught composition writing according to conventional ways) during the academic year 2010 - 2011.The validity of the programme , the questionnaire ,the test, and the scoring scheme have been obtained by exposing them to jury members in the fields of EFL and linguistics. The answers of the test have been separately scored by the researcher and two other scorers separately. By using By using Pearson Correlation Coefficient formula the reliability of the questionnaire has been yields (0.82) and the test has been secured by using Alpha Cronbach Formula (0.84), intrascorer reliability (0.923), and interscorer reliability (0.976). Statistical analysis of data achieved through the test indicates that there are statistically significant differences between the experimental group performance and that of the control group in terms of composing, style, sentence formation, usage, mechanics, and the overall composition of the post test and the post questionnaire in favour of the experimental group. It has been concluded that using the autonomous learning programme develops students’ performance in composition writing and gives them opportunity to make choices that encourage them to reflect on their own interests and preferences. It will also make them start to take responsibility and motivation for learning; plan and carry out their independent learning task; monitor and evaluate their learning. In the light of these results, some recommendations and suggestions for further studies are presented.

اثر انموذجي PACE وCRTs لتدريس القواعد في الاداء الكلامي والكتابي لطلبة الجامعة العراقيين دارسي اللغة الانكليزية لغة اجنبية == The Impact Of PACE And CRTs Models In Teaching Grammar On Iraqi EFL University Students' Oral And Written Performance

Author name: فارس كاظم طعيمه
Supervisor name: شيماء عبد الباقي البكري
General topic: Educational Sciences
Specific topic: Methods of Teaching English Language
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Rushd College Of Education For Human Sciences
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان طلبة الجامعة العراقيين الذين تلقوا تعلم اللغة الانجليزية لا يزالون غير قادرين على فهم استخدام هذه اللغة فعلا في التواصل لا سيما في الاداء الكلامي والكتابي, وان عدم قدرة الطلبة في الكلام والكتابة او ضعفهم فيهما يعزى الى امور كثيرة ؛ منها ضعف مستوى ا | Iraqi college students who have received several years of English teaching frequently remain deficient in their ability to actually use the language and to understand its use in normal communication especially in their oral and written performance.The students' inability in speaking and writing is attributed to many reasons from which the major ones are their poor level in grammar, which is considered an essential part in performing speaking and writing, if not , all the four language skills, as a result of the poor teaching methods that focus only on memorization of rules (based on teacher - centred approaches than students - centred). Therefore, this study is an attempt to examine the impact of PACE and CRTs models in teaching grammar, as they can be used to facilitate meaningful learning on the EFL college students' oral and written performance. The present study aims at finding out : 1 - The Impact of using PACE model in teaching grammar on the EFL Iraqi university students' oral and written performance.2 - The Impact of using CRTs model in teaching grammar on EFL Iraqi university students' oral and written performance3 - The difference between the impact of PACE and CRTs models in teaching grammar on students' oral and written performance. In this respect, this study hypothesizes six null hypotheses stating that : 1 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group which is taught grammar according to PACE model and that of the control group which is taught grammar by the conventional way in their performance on the speaking test.2 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the second experimental group which is taught grammar according to CRTs model and that of the control group which is taught grammar by the conventional way in their performance on the speaking test.3 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the first and second experimental groups in their performance on the speaking test. 4 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group which is taught grammar according to PACE model and that of the control group which is taught by the conventional way in their performance on the written test.5 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the second experimental group which is taught grammar according to CRTs model and the control group which is taught grammar by the conventional way in their performance on the written test.6 - There is no statistically significant difference between the mean scores of the first and second experimental groups in their performance on the written test. To verify the above mentioned hypotheses, a sample of 120 students from the first - year students / Department of English /College of Education/ University of Wassit / morning studies during the academic year 2013 - 2014 has been chosen. This sample has been distributed into three groups : the first experimental of (41 students) using the PACE model , the second experimental of (39 students ) using the CRTs model , and the control group of (40 students) following the conventional way. The three assigned groups have been equalized by certain variables including : Parents' academic level ,The age of the subjects in months , Intelligence , Subjects' Baccalurate scores ,Subjects' pre - test - performance in writing , and Subjects' pre - test - performance in speaking.The pre - test has been administered before the beginning of the experiment for the sake of equalizing the three groups. After conducting the experiment, a post - test has been administered for the three groups in order to find out the impact of PACE and CRTs models on the students' oral and written performance. Subjects' responses to the post tests have been statistically manipulated. The study arrived at the following findings : 1 - The students in the first experimental group who are taught grammar by using PACE model perform better in the speaking and written post - tests in comparison with the students in the control group.2 - The students in the second experimental group who are taught grammar by using CRTs model perform better in the speaking and written post - tests in comparison with the students in the control group.3 - Concerning the first and second experimental groups ,the present study has found out that : A - the students in the first experimental group who are taught grammar by using PACE model perform better, on the speaking post - test, than the students in the second experimental group who are taught grammar by using CRTs model. B - the students in the first experimental group who are taught grammar by using PACE model and the students in the second experimental group who are taught grammar by using CRTs model being on the same level in their performance on the written post - test. On the basis of the findings above, some pedagogical recommendations and suggestions for further research are put forward.
Summary:
References:

اثر استراتيجيتي Fishbone وFQIP في تحصيل طلبة الجامعة العراقيين دارسي اللغة الانكليزية لغة اجنبية في الرواية == The Impact Of Fishbone And Fqip Strategies On Iraqi EFL University Students' Achievement In Novel

Author name: اضواء محمد سلمان السامرائي
Supervisor name: شيماء عبد الباقي البكري
General topic: Educational Sciences
Specific topic: Methods of Teaching English Language
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Rushd College Of Education For Human Sciences
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى ايجاد اثر استراتيجيتي Fishbone and FQIP في تحصيل طلبة الجامعة العراقيين دارسي اللغة الانكليزية لغة اجنبية في الرواية خلال : 1 - تحديد اثر استراتيجية Fishbone في تحصيل طلبة الجامعة العراقيين دارسي اللغة الانكليزية لغة اجنبية في الرواية. | This study is an attempt to find out the impact of fishbone and FQIP strategies on Iraqi EFL university students' achievement in novel through achieving the following aims : 1. Identifying the impact of Fishbone strategy on Iraqi EFL university students' achievement in novel,2. Identifying the impact of FQIP strategy on Iraqi EFL university students' achievement in novel, and 3. Finding out the difference between the first experimental group and the second experimental group achievement in novel. Nine null - hypotheses have been formulated in this study. In order to verify these hypotheses and achieve the stated aims, the following procedures have been adopted. 1. The behavioral objectives for the whole syllabus of the novel Pride and Prejudice are prepared after making a content analysis of 61 chapters (Volume 1, 2, 3) which have been studied by third year EFL university students and according to Revised Bloom's Taxonomy and in accordance with three levels (Analysis, Evaluation and Creativity) 2. A pre - test is designed for equalizing the three groups in their previous knowledge in fiction. 3. Daily lesson plans with general objectives, behavioral objectives and instructional procedures for teaching the novel Pride and Prejudice are prepared for each group of the study.4. An achievement test has been constructed which involved a written part and an oral part. 5. Two rating scales have been constructed, one for scoring the written test and the other for the oral test. The tests and plans have been exposed to a number of jurors who agreed on their content validity and face validity. The adopted post - test has been administrated to the selected sample of 98 third year EFL students in the College of Education at the University of Samarra. Results obtained by statistical treatment of data have shown that : 1. There is statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group taught according to Fishbone strategy and that of the control group which is taught according to the conventional method in their achievement in novel on the oral test in favor of the first experimental group.2. There is statistically significant difference between the mean scores of the second experimental group which taught according to FQIP strategy and that of the control group which is taught according to the conventional method in their achievement in novel on the oral test in favor of the second experimental group. 3. There is no statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group and the second experimental group in their achievement in novel on the oral test.4. There is statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group taught according to Fishbone strategy and that of the control group which is taught according to the conventional method in their achievement in novel on the written test in favor of the first experimental group.5. There is statistically significant difference between the mean score of the second experimental group which taught according to FQIP strategy and that of the control group which is taught by the conventional method in their achievements in novel on the written test in favor of the second experimental group.6. There is no statistically significant difference between the mean score of the first experimental group and second experimental group in their achievement in novel on the written test.7. There is statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group which is taught according to Fishbone strategy and that of the control group which is taught according to the conventional method in their overall achievement on novel in favor of the first experimental group.8. There is a statistically significant difference between the mean scores of the second experimental group which is taught according to FQIP strategy and that of the control group which is taught according to the conventional method in their overall achievement in novel in favor of the second experimental group.9. There is a statistically significant difference between the mean scores of the first experimental group and that of the second experimental group in their overall achievement in novel in favor of the second experimental group which taught according to FQIP strategy.The study ends up with a number of recommendations and suggestions which are based on the obtained results.
Summary:
References:

اثر الملاحظة القرين والملاحظة الذاتية والتغذية الراجعة من الطلبة بوصفها اساليب للتدريس التاملي في تحصيل طلبة الجامعة العراقيين دارسي اللغة الانكليزية/لغة اجنبية في مادة المناهج وطرائق التدريس == The Effect of Peer - Observation, Self - Observation, And Students’ Feedback As Reflective Teaching Techniques on Iraqi University Efl Students’ Achievement In Elt Curriculum And Methods

Author name: ايلاف رياض خليل ابرهيم التميمي
Supervisor name: مؤيد محمد سعيد احمد
General topic: Educational Sciences
Specific topic: Methods of Teaching English Language
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Educational And Psychological Sciences
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لقد اصبحت اساليب التعليم التاملي مسيطرة على ثقافة مدرس اللغه الاجنبية خلال السنوات الاخيرة. وهنالك قليل من المواضيع في التعليم التربوي جذبت انتباه المخططين والممارسين كالعلاقة بين التدريس التاملي وتحصيل الطلبة. من خلال ملاحظة القرين، يستطيع التدريسي الاف | Reflective teaching techniques have become dominant in second and foreign language teacher education in recent years. Few topics in education have captured as much attention from policymakers and practitioners as the connection between reflective teacher
Summary:
References:
1 ... 180 181 182 183 184 ... 280