Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 2,437

عزل وتشخيص بعض الانواع الجرثومية من مياه الانهر الداخلية في مدينة البصرة ودراسة قابليتها على المعالجة الحيوية للعناصر الثقيلة == Isolation and identification bacterial species from inner rivers in Basra governorate and study their ability to Bioremediation of heavy metals

Author name: انوار عبد الوهاب مكي
Supervisor name: علي عبود شريف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University Of Basrah - College Of Education For Pure Sciences
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The present study was conducted during November and December 2013.It included studying six inner rivers branching from Shatt al - Arab river in Basrah governorate.These rivers are Abu Al - khasseb, Al - Ribat, Al - Khandaq, Al - Ashar, Al - Khura and Al - Sarraji .The study included isolation and identification of three species of genus Bacillus which are B. licheniformis,B. megaterium and B. badius ,and two species of genus Micrococcus which are M. halobius and M. kristinae .Physical and chemical characteristics of the water samples were measured, which including pH,temperature,electric conductivity and Dissolved oxygen. The results showed that there were not correlation between physical and chemical characteristics and the concentrations of the heavy metals except for water temperature which had a negative significant correlation with the concentrations of nickel and lead.The concentrations of heavy metal dissolved in water (copper, nickel , lead and cadmium ) were measured. The concentrations of Cu+2 and Pb+2 were higher than that of Ni+2 and Cd+2 in the water .However,in general the concentrations of Cu+2, Ni+2, Pb+2 and Cd+2 were high in comparison with the local and international standards.All species of bacteria showed high resistance to the heavy metals ions starting from concentration of 1 mg/l. B. licheniformis was recorded high resistance to Pb+2, Cu+2 and Ni+2 which reached 2600 mg/l, 500mg/l and 300mg/l respectively. M. halobius was also recorded a high resistance to Pb+2 and Cd+2 with 2600mg/l and 400mg/l respectively. The highest resistance was recorded by M. kristinae to nickel with 300 mg/l . The mid resistance was by B.badius to all studied heavy metals and the lowest was by B. megaterium to all heavy metals studied in comparison with the other species of bacteria.The identified bacteria were used in the process of bioremediation of the heavy metals (Cu+2, Ni+2, Pb+2, Cd+2) with different concentrations (25, 50 and100 ) mg / l. B. licheniformis showed high ability to remove Ni+2, Cu+2 and Cd+2 than other species of bacteria, which reached (28.30%, 44.34% and 24.27%) mg/l. . respectively. B. badius showed a high capability for removing Cu+2 with 45.78% mg / l .Where as B. megaterium showed a high capability for removing Pb+2 with 23.43% mg / l.. M. halobius had the highest capability for removing Cd+2 with 25.42% mg / l. and M. kristinae had a mid capability to remove the heavy metals under studied.The study included observing the effect of the incubation period on removing the heavy metals ions.The results found that the best period was 72 hours in comparison with 24 and 48 hours.Also, the study included the effect of initial concentration in the process bioremediation.The results showed that the concentration of 25mg/l was the best for removing the heavy metals ions among the other concentrations, 50 and 100 mg/l.

عزل وتشخيص بعض انواع البكتريا المكسرة للهيدروكاربونات النفطية الاليفاتية في الترسبات النفطية لمحافظة البصرة == Isolation and Identification of some species of degradable Bacteria of N - Alkanes hydrocarbons compounds in oil sludge at Basrah Governorate

Author name: استبرق عبد الحسين سلمان جدي البوغازي
Supervisor name: ميثم ايوب عبد القادر الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the oil industries, large amounts of oil sludge are generated through the refining of crude oil. The main reason for its composition that is when exporting crude oil various kinds of oils (heavy and light ones) are mixed together for the purpose of exportation. But , the mixing process between different types cannot be fully , due to the lack of homogeneity among different quality of crude oil . So, the heavy parts of oil are precipitated to the bottom of tank and with passage of time they accumulate to be sediments that’s known as oil sludge stated at the bottom of the oil storage tank in the cleaning process , oil tanks are emptied and discharged in some spaces or reservoir (pits) located near the tanks called "oil pits". Which are places of dump excess oil of various types of oil from different oil tanks or they are close places from oil / water separating unites .From these spots, samples of two kinds of oil sludge : the bottom of oil tank (during the maintenance of the tank) and oil pits (near the unities of separating water from oil) are collected. Also, samples of soil surrounding the oil pits from five oil locations in Basrah city are collected too. Those locations are : west of Gurna, Northern Rumela, Southern Rumela, Nahar Umar, Alzubeir.At the rate of redundantly for each location and for each type of the study samples.This investigation is considered as the first which conducted in Iraq which include firstly the isolation and identification different types of bacterial species from different oil sludge, and secondly use some of them in biodegradation studies for two kinds of carbon sources of oil sludge : (oil sludge of tank bottom , oil sludge of oil pits) .Oil degrading bacterial species have been isolated on a selective mineral salt medium Bushnell and Hass Mineral Salt Medium (BHMS), supplemented with a carbon source. They are also identified depending on the Morphology and biochemical characteristics; four genus of bacteria (out of 89 bacterial isolates of oil sludge from the tank bottom)Bare identified. They include : 32 Pseudomonas spp. , 27 Rhodococcus spp. 21 Bacillus spp. , 9 Arthrobacter spp. , Also four genera of bacteria (out of 101bacterial isolates of oil sludge from the oil pits) are identified. They include : 41 Pseudomonas spp. 27 Rhodococcus spp. , 22 Bacillus spp. 11 Arthrobacter spp. , , While 8 species and 3 genus of bacteria (out of 259 bacterial isolates of the soil surrounding the oil pits) are identified. They include : 41 Aeromonas spp., 39 Corynebacterium spp., 39 Pseudomonas aeruginosa, 36 Bacillus spp., 33 Micrococcus leteuc, 23 Enterobacter intermedius, 22 Pseudomonas fluorescens, 12 Micrococcus varians 7 Staphylococcus epidermidis, 4 Staphylococcus saprophyticus,3Staphylococcus aureus .The biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and two compounds of Pristane and Phytane are measured. Also, the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and the two compounds of Pristane and Phytane are measured for each four genus which were isolated from the oil sludge pits, and it is also done for one isolated genus from the soil surrounding the oil pits. The measuring process was fulfilled as a comparative study with the control flasks. Thus, the oil sludge (tank bottom ) was used as a source of carbone in the first experiment While, the oil sludge (oil pits) was used as a source of carbone in the second experiment . The incubate time of the experiment is 27 days during which a lost of the percentage of hydrocarbon compounds each 9 days are recorded by using( Capillary Gas Chromatography ). The results showed the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard toCbacteria 73.8 % Pseudomonas spp., 70.3 % Rhodococcus spp. 65.7 % Arthobacter spp., 55.6 % Aeromonas spp.,51.5 % Bacillus spp., Whereas, the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria 80 % Pseudomonas spp., 74.9 % Aeromonas spp., 70.4 % Rhodococcus spp., 64.8 % Arthobacter spp.,55 % Bacillus spp., While , The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard to bacteria 73.7 % Pseudomonas spp.,70.3 % Rhodococcus spp. 65.6 % Arthobacter spp., 55.3 % Aeromonas spp. ,51.2 % Bacillus spp., Whereas, The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria79.2 % Pseudomonas spp., 73.8 % Aeromonas spp., 69.2 % Rhodococcus spp.,63.7 % Arthobacter spp., 53.7 % Bacillus spp. It was found that there is approximately match between the biodegradation of mole percentage by using the area and those by using the concentration for each component .

دور بعض اجناس الساينو بكتريا في التحلل الحيوي لبعض المركبات النفطية

Author name: محمود خلف صالح الجبوري
Supervisor name: علي صالح حسين الجبوري | اياد محمد علي فاضل العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: Tikrit University - Faculty Of Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: تناولت الدراسة عزل وتشخيص ثلاثة اجناس من السيانوبكتريا من بيئات التربة والمياه العذبة في محاولة لمعرفة دور هذه الاحياء في عملية التحلل الحيوي للمركبات الهيدروكاربونية وهذه الاجناس هيNostoc sp. , Anabaena sp. ,Microcyst sp. واستخدم نوعان من المركبات الهيدروكاربونية هي نفط كركوك الخام وزيت الغاز.بينت النتائج ان لجميع عزلات السيانوبكتريا المختبرة القدرة على استحلاب واسع للمركبات الهيدروكاربونية في النسب 2%,1%,0.5% في العزلات الحاوية على الحويصلة المغايرة ، بينما كانت النسب 1%,0.5% هي اكثر استحلابا في الجنس Microcyst sp. غير الحاوي على الحويصلة . في حين لم تكن العزلات ذات قدرة عالية على الاستحلاب في التركيز5% . وقد اظهرت التحاليل المجراة باستخدام جهاز طيف الاشعة تحت الحمراء تغيرا واضحا في تركيب هذه المركبات النفطية.كما تناولت الدراسة تاثير هذه المركبات في بعض الفعاليات الفسلجية للسيانوبكتريا مثل كمية الكلوروفيل(A) وبعض التغيرات المظهرية والخلوية في السيانوبكتريا مثل تكرار الحويصلات المغايرة ، وقد بينت النتائج ان المركبات النفطية ادت الى اختزال كبير في نسبة الكلوروفيل (A) حيث كان التناسب عكسيا بين نسبة الكلوروفيل وتركيز المركب الهيدروكاربوني . كما ادت المركبات الهيدروكاربونية الى زيادة كبيرة في عدد الحويصلات المغايرة ، وان النسب 1%,0.5% من هذه المركبات كانت الاكثر تاثيرا في زيادة عدد الحويصلات .كما تناولـت الدراسة اجراء اختبار البقائية للـسيانوبكتـريا في التراكيــز 80,60,40,20 ) % ) من النفط الخام وزيت الغاز وقد لوحظ ان بقائيـة الاجناس في زيت الغاز كانت اعلى منها في النفط الخام مما يدل على ان تاثير زيت الغاز كان اقل من تاثير النفط الخام .

دراسة نوعية للبكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من بيئة واخماج مستشفى عفك العام == Qualitative Study of Gram Negative Bacteria Isolated from Environment and Infections of Afak General Hospital

Author name: زينب عبد الكريم عليوي الفرحاني
Supervisor name: علي عبد الرحيم الناشي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Al-Qadisiyah - Faculty Of Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Qadisiyah
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع 400 عينة سريرية وبيئية من مستشفى عفك العام في محافظة الديوانية للفترة من 1/11/2012 ولغاية 31 /3/2013 لغرض دراسة نوعية البكتريا السالبة لصبغة كرام والملوثة لبيئة واخماج المستشفى ومدى حساسية العزلات البكتيرية ومقاومتها للمضادات الحيوية والمطهرات شائعة الاستخدام .اظهرت هذه الدراسة ان 236 عينة وبنسبة 59% قد اعطت نتيجة موجبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 31 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 56.37 % و206 عينة من مصادر بيئية وبنسبة 59.43% بينما كانت 164 عينة وبنسبة 41% سالبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 24 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 43.63% و140 عينة وبنسبة 40.57 % من مصادر بيئية من مستشفى عفك العام .كانت العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام المشخصة والبالغة 236 عزلة قد توزعت على اربعة اجناس وهي Pseudomonas شملت نوعين : P.aeruginosa 12.7% ، P. flourescens 8.5 % ، Klebsiella شملت K. pneumoniae 10.5% ، K.oxytoca 10.5% ، Serratia marcescens 3.4% ، Acenitobacterشملت A. baumanni 2.1% ، A.lwoffii 1.2% ، A.calcoceticus 0.8 %، Escherichia شملت E. coli 45.5% ، E.hermanni 4 % . كانت نسبة التلوث البكتيري في العينات السريرية الحروق والجروح قد بلغت 53.3 ، 60 % على التوالي ، بينما التلوث البكتيري في العينات البيئية المتمثلة بردهات دخول المرضى ، المطبخ ، صالات العمليات الجراحية ، ردهات الخدج وملابس العاملين في المستشفى قد شكلت النسب 66.6 ، 53.8 ، 60 ، 54.6 ، 40% على التوالي . كما اختبرت حساسية العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام اتجاه 13 مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة وحساسية مختلفة تباينت حسب نوع العزلات البكتيرية وطبيعة المضاد الحيوي .كانت اعلى مقاومة اظهرتها بكتريا K.pneumoniae تليها K.oxytoca اتجاه مضاد Tetracycline اذ بلغت النسبة 96% و92% على التوالي . كما تميزت كل من بكتريا E.hermanni ، A.baumanni بمقاومتة عالية اتجاه ال Gentamycin اذ بلغت 80.3% ، 80% على التوالي اما P.aeruginosa فقاومت ال Tobramycin بنسبة عالية بلغت 90 %، بينما تميزت جميع البكتريا المعزولة في هذه الدراسة بحساسيتها اتجاه مضاد ال Imipenem . اما اختبار حساسية العزلات البكتيرية اتجاه المطهرات فقد ابدت مقاومة متفاوتة حسب نوع العزلات البكتيرية وتركيز وطبيعة المطهر وشملت المطهرات المستخدمة في التضاد الجرثومي كلا من الفورمالين والبوفيدين - ايودين والهبتين والديتول حيث كانت اعلى مقاومة اظهرتها E.coli اتجاه مطهر الفورمالين بتركيز 12.5% اذ بلغت 93.4% . درست بعض عوامل الضراوة المنتجة من الانواع البكتيرية ومنها انتاج المحفظة فوجد ان عزلات كل من بكتريا A. baumanni، P. aeruginosa ، K. pneumoniae وE.coli منتجة للمحفظة وبنسبة 40 ، 33.33 ، 100 ، 23.36 % على التوالي ، اما انزيم الهيمولايسين فوجد ان جميع عزلات A.baumanni غير منتجة لهذا الانزيم في حين جميع عزلات P. aeruginosa كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% ، اما انزيم البروتيز فوجد اعلى نسبة لانتاجه في P.aeruginosa بنسبة 100 % وادنى نسبة في بكتريا E.coli وبنسبة 14 % ، كانت اعلى نسبة لانتاج انزيم الجلاتينيز من قبل كل من A.baumanni وP.aeruginosa وبنسبة 100 % وتميزت عزلات K.pneumoniae بعدم القدرة على انتاجه . | The study included the collection of 400 clinical specimens and environmental from Hospital Afak General in the province of Diwaniyah for the period from 1/11/2012 until 3/31/2013 for the purpose of study quality the gram negative bacteria and contaminated environment and hospital infections and the sensitivity of the bacterial isolates and their resistance to antibiotics and antiseptics commonly used . This study showed that 236 sample and 59% gave a positive result for the examination of bacterial for bacteria gram negative distributed among the 31 sample sources of clinical and increased by 56.37% and 206 samples from environmental sources and increased by 59.43% while the 164 sample and 41% negative for screening bacterial for bacteria gram negative distributed among the 24 samples from clinical sources, and by 43.63% and 140 sample and by 40.57% from environmental sources of Afak General Hospital. The bacteria gram negative isolates diagnosed, amounting to 236 isolation has distributed over four genera Pseudomonas They included two types : P.aeruginosa 12.7%, P. flourescens 8.5%, Klebsiella included K. pneumoniae 10.5%, K.oxytoca 10.5%, Serratia marcescens 3.4% , Acenitobacter included A. baumanni 2.1%, A.lwoffii 1.2%, A.calcoceticus 0.8%, Escherichia included E. coli 45.5%, E.hermanni 4%. The percentage of bacterial contamination in clinical samples of burns and wounds had reached 53.3,0.60% respectively, while bacterial contamination in environmental samples of lobbies entry of patients, the kitchen, Eat surgeries, lobbies premature and clothes of hospital personnel had formed ratios of 66.6, 53.8 0.60 , 54.6 0.40%, respectively. The sensitivity of the bacteria gram negative isolates tested for direction 13 have shown antibiotic - resistant bacterial isolates and different sensitivity varied by type of bacterial isolates and the nature of the antibiotic. The highest resistance exhibited by the bacteria K.pneumoniae followed K.oxytoca direction Anti Tetracycline as the percentage reached 96% and 92%, respectively. It also marked by both bacteria E.hermanni, A.baumanni resisting the trend of high Gentamycin reaching 80.3%, 80%, respectively, and P.aeruginosa resisting the Tobramycin high proportion reached 90%, while all characterized bacteria isolated in this study sensitivity counter direction the Imipenem . The test of the sensitivity of the bacterial isolates direction disinfectants have shown resistance varying according to the type of bacterial isolates and the concentration and nature of the cleanser included disinfectants used in contrast bacterial both Formalin and Povidin - Iodine and Hibtin and Dettol had the highest resistance exhibited by E.coli direction antiseptic Formalin concentration of 12.5% reaching 93.4% . I studied some of the virulence factors produced by bacterial species, including the production of the wallet and found that all isolates of bacteria A. baumanni, P. aeruginosa, K. pneumoniae and E.coli producing capsule and by 40, 33.33, 100, 23.36%, respectively, while the enzyme was found haemolysin that all isolates A.baumanni unproductive for this enzyme, while all P. aeruginosa isolates were producing this enzyme by 100%, while the enzyme protease and found a higher proportion of production in P.aeruginosa 100% and the lowest percentage in the bacteria E.coli and 14%, the highest percentage for the production of an enzyme gelatinase by both A.baumanni and P.aeruginosa and 100% K.pneumonae isolates were characterized by the inability to produce it

تاثير مستخلص نبات الكجرات Hibiscus sabdariffa على عوامل الضراوة لبكتيريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من التهابات المجاري البولية == Effect of Hibiscus sabdariffa Extract on the Virulence Factors of Staphylococcuss aureus Isolated from Urinary Tract Infection

Author name: صمود عبد الكاظم سلمان عبد
Supervisor name: وجدان رضا تاج الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم جمع 163 عينة ادرار من المرضى المصابين بالتهاب المجاري البولية لكلا الجنسين باعمار تتراوح من شهر واحد الى 60سنة من المراجعين في مستشفى القاسم ومستشفى الهاشمية العام خلال الفترة من اب 2016 الى كانون الاول 2016. وقد وجدت 112 (68.71%) عينة اعطت نموا بكتيريا ومن هذه النسبة وجدت36 (32.14%) عزلة موجبة لصبغة غرام و76(67.86%) سالبة لصبغة غرام . وقد تم تشخيص 23(20.5%) عزلة بكتيرية تعود للبكتريا العنقودية الذهبية Staphyllococcus aureus، تم تشخيص جميع هذه العزلات مظهريا ومجهريا وحيويا.تم اختبار حساسية المضادات الحيوية لجميع هذه العزلات. وكانت جميعها مقاومة 100% للامبسلين، يليها سيفوكسيتين 91.3 %. واظهرت هذه العزلات اعلى حساسية للمضاد الحيوي الكليندامايسين 78.2% , في حين كانت نسبة المقاومة للاميكاسين هي39.1% . وقد وجد ان نسبة المقاومة للتراسايكلين هي 47.8% . وقد اظهرت النتائج ان 20 (86.9%)عزلة مقاومة للمضاد الحيوي المثسيلين (MRSA) وقد تم الحصول على هذه النتيجة باستخدام تقنية تفاعل انزيم البلمرة التسلسلي (PCR).درست فعالية المستخلص المائي الحار والبارد لاربعة نباتات (كاس الكجرات جذور العاقول وقشور الرمان واوراق الخباز) ضد البكتريا العنقودية الذهبية ووجد من خلال التحليل الاحصائي وجود فروق معنويه 0.05 P< في حالة المستخلص المائي البارد للكجرات حيث اعطى فعالية تثبيطية تجاه هذه البكتريا لذا تم اختيار هذا المستخلص لدراسة تاثيره على عوامل الضراوة لهذه البكتريا. بعدها تم التحري عن المركبات الموجودة في هذا المستخلص وقد اظهرت النتائج ان المستخلص المائي يحتوي كلا من الفينولات , القلويدات , الفلافونات والتانينات.درست فعالية المستخلص المائي البارد الخام لكاس الكجرات المضادة للبكتريا بطريقه الانتشار بالحفر (agar well diffusion method) باستخدام التراكيز 2,5 و5و10و20و40و80 ملغم / مل. بعدها تم تحديد MIC لهذا المستخلص بطريقه الانتشار بالحفر( The modified broth macro dilution method) فكانت قيمته 25ملغم/مل.وقد اظهر المستخلص المائي البارد فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بقطر 18 ملم بتركيز 40و80 ملغم /مل .تم استخلاص المركبات الفينولية من المستخلص المائي البارد للكجرات بعدها تم استخدام تقنيه الفصل الكروموتوكرافي عالي الجودة لعزل وتشخيص المركبات الفينوليه وقد تم الحصول على عدة مركبات. بعدها تم دراسة الفعالية التثبيطية لهذه المركبات ووجد بان المركب الفينولي الكويرسيتين قد اعطى اعلى فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بتركيز 4 ملغم /مل وايضا تم تحديد MIC لهذا المركب وهي 2ملغم /مل .كما درس تاثير المستخلص الخام والكويرسيتين على عوامل الضراوة وقد اظهرت النتائج ان كلا منهم قد كان له تاثير على انتاج الهيمولايسين وعلى فعاليته وذلك بعد تنمية البكتيريا مع قيمة MIC للمستخلص الخام والكويرسيتين كلا على انفراد.كذلك تم دراسة تاثير هذه المستخلصات على تكوين البايوفيلم من قبل البكتريا وقد وجد ان 15 عزلة بكتيرية منتجة للبايوفيلم قد تحولت الى غير منتجة او الى منتجة ولكن من النوع الرقيق بعد تنميتها مع هذين المستخلصين.وقد اظهرت النتائج ايضا ان المستخلص الخام والكورسيتين للكجرات قد اثرا على فعالية كلا من الستافيلوكاينيز والبروتيز.تم التحري عن انتاج السموم المعوية من قبل البكتريا العنقودية الذهبية باستخدام تقنية الفار الرضيع وقد وجد بان جميع العزلات غير منتجة لهذه السموم.كذلك تم دراسة تاثير هذين المستخلصين على تسرب ايون البوتاسيوم من الخلايا البكتيرية خلال فترات زمنية معينة وقد وجد بان هذين المستخلصين قد عملا على زيادة تسرب هذا الايون من الخلايا البكتيرية مما يدل على ان هذين المستخلصين قد اثرا على نفاذية الغشاء الخلوي للخلية البكتيرية .كذلك وجد ان الجرعة القاتلة لنصف حيوانات التجربة قد زادت من 5,6 × 106 الى 3,9× 107 بعد معاملة البكتريا بالمستخلص المائي البارد لكاس الكجرات . ايضا تم دراسة تاثير المستخلصين الخام والكورسيتين على معايير الدم في الفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي مستخلص نباتي والفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي على الكورسيتين وقد وجد بان المستخلص الخام كان له تاثير اكبر من الكورسيتين في تحسين معايير الدم مقارنة بالبكتريا المعاملة بالعالق البكتيري بدون مستخلص نباتي ,كما تم دراسة امكانية استخدام النبات كعامل مختزل عن طريق معرفة الفعالية ضد التاكسدية وكانت قيمتها 3566,97 مايكرو مولاري بواسطة استخدام اختبار (CUPRAC). ايضا تم دراسة الفعاليه الخلويه السمية للمستخلص الخام على خلايا الكبد الطبيعية للانسان وعلى الخلايا السرطانية في الثدي وقد وجد بان هذا المستخلص ليس له فعالية سمية على خلايا الكبد الطبيعية وايضا له تاثير قاتل للخلايا السرطانية في الثدي .

دراسة مناعية ووراثية للمرضى المصابين بالتهاب المرارة في مدينة الحلة == Immunogenetic Study on Patients with Gallbladder Infection in Hilla city

Author name: رواء عداي علي السلطاني
Supervisor name: عبد النبي جويد عبد المعموري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science For Girls - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع ( 100 عينة ) اخذت بشكل اعشواني ( 87 اناث , 13 ذكور ) اجريت لهم عملية استئصال المرارة بمستشفى الحلة التعليمي للفترة من ايلول 2016 الى شهر حزيران 2017. تضمنت العينات (عينات دم وحصى) لتحقق من دور بعض المعايير المناعية والوراثية المتعلقة بمرض التهاب المرارة .بينت نتائج الدراسة الحالية ظهور الاصابة بالتهاب المرارة في كلا الجنسين(الاناث والذكور) وكانت الفئة العمرية ( 31 - 40 ) سنة الفئة الاكثر عرضة للاصابة , لكن نسبة اصابة الاناث في مجتمع الدراسة اعلى من الذكور ( 87% ) بينما الذكور ( 13%) كما ان التهاب المرارة المزمن هو الاكثر شيوعا ,اذ شكل نسبة ( 84% ) ثم التهاب المرارة الحاد اذ شكل نسبة 60%)).كما كشفت الدراسة قلة تكوين الحصى المرارية عند الاطفال بعمر اقل من عشر سنوات ويزداد تكوين الحصى مع تقدم العمر وينخفض تدريجيا بعد عمر 60 سنة . اكثر انواع الحصى المرارية الشائعة والتي عزلت الحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة.اما الدراسة المناعية فتضمنت تقدير مستويات T6F - β1 , IL - 8 في مصل مرضى التهاب المرارة باستخدام تقنية الاليزا لوحظ زيادة مستوى TBF - β1 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن) على نقيض مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية. P< 0.05 P=0.007 . كما اظهرت النتائج الحالية زيادة بمستوى T6F - β1 في كلا الجنسين) للاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة بمستوى احتمالية P=0.002 . P< 0.05 للاناث وP=0.003 . P< 0.05 للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقد لوحظ زيادة في مستوى T6F - β1 في مصل المرضى المصابين بالحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة .اظهرت النتائج الخاصة بتقدير مستوى انترلوكين 8 ,زيادة في مستوى IL - 8 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن )على نقيض مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية عالي ( P=0.005 . P<0.05 ) .كما ظهرت النتائج الحالية زيادة في مستوى انترلوكين 8 في كلا الجنسين(الاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية ( P=0.01 . P< 0.05 ) للاناث و<0.05) ( P=0.2 . P للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقط لوحظ زيادة في مستوى IL - 8في جميع المرضى المصابين بالحصى المختلطة تليها الحصى الكوليسترولية ثم الحصى الصبغية .تضمنت الدراسة الوراثية ( - 869 T C ) T6F - β1 و( - 251 T A ) L - 8 ذات الصلة مع مرضى التهاب المرارة لل85 عينة متضمنة عينات للمرضى وعينات لمجموعة السيطرة باستخدام تقنية (PCR - ARM ) .اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيري المفرد 76.6%) 46 : T6F - β1 ( - 869)T⁄C ) من متباينة الاشكال (T∕C) و9 (15%) متماثلة الاشكال (TT) و(8%) 5 متماثلة الاشكال (CC) ,واظهرت النتائج ان(Tallele) الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع( C allele) . كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى ( المزمن والحاد ) كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى المرارية الاكثر صلة بالموروثات متباينة الاشكال (T⁄C) للحصى الكوليسترولية تليها المختلطة ثم الصبغية . واظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد (41.6%)25 : IL - 8( - 251) T/A من متماثلة الاشكال متباينة الاشكال من متماثلة الاشكال (TT) واظهرت النتائج ان هو الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع لمرضى التهاب الحرارة كما اظهرت الاليات والموروثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى )المزمن والحاد ( كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى الاكثر صلة مع الموروثات متماثلة الاشكال((AA للحصى الكوليسترولية تليها الصبغية ثم المختلطة . | The study included 100 patients taken randomly (87 females and 13 males) undergoing cholecystectomy at the general teaching Hilla Hospital from September 2016 to June 2017. For each patient, two samples were taken which included the blood samples and gallstone for immunogenetic tests. The infection appears in both sexes with age group (31 - 40) years 30% but the rate of infection in female was higher than males 87%, 13% respectively.Clinically, chronic cholecystitis was the most common (84 %) and acute cholecystitis (16 %). The study displayed that the formation of gallstones is less than 10 years old. The gallstones are formed by age and gradually decrease after age 60. The most common types of gallstones were cholesterol stones and pigment stone followed by mixed stone The immunological study included estimatation the level of IL - 8, TGF - β1 in patients serum by using ELISA technique. The estimation of TGF - β1level explained a significantly increased in all patients (chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference . P=0.007, p<0.05. Estimation of TGF - β1 level showed increases in both the sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference . (p=0.002. P< 0.05) for females, (p=0.003. P< 0.05 for males). As for the stone, the results of the present study revealed increased levels of TGF - β1 in serum patients had cholesterol stone with value followed the pigment stone and mixed stone. The estimation of IL - 8 level explained a significantly increased in all patients(chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference. P=0.005 , p<0.05. Estimation of IL - 8 showed increases in both sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference (p=0.01. P< 0.05) for females, (p=0.02. P< 0.05 for males). As for the stone, the results showed that IL - 8 concentration was increased in patients serum had mixed stone followed cholesterol stone and pigment stone. The genetic study involved screening of TGF - B1 ( - 869 T/C) and IL8 - ( - 251 T/A) related to gallbladder infection patients for 85 samples, including patients and the control group by using (ARM - PCR) technique. The single nucleotide polymorphism of TGF - β1 ( - 869 T/C) showed : TC heterozygous was a higher rate with 46 (76.6%), TT homozygous with 9 (15%) and CC homozygous with 5 (8%) and the result revealed that the T allele more predominant than the C allele. The genotype and allelic association of TGF - β1 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of TGF - β1 for patients appeared the genotype of T/C higher percentage in patients with who had cholesterol stone followed by mixed stone and pigment stone. An another single nucleotide polymorphismof of IL8 - (251T/A) showed : AA homozygous was a higher rate with 25 (41.6%), TA heterozygous with 23 (38%) followed by the TT homozygous just 12 (20%) and the result revealed that the A allele more predominant than the T allele. The genotype and allelic association of IL - 8 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of IL - 8 for patients showed : The genotype of AA appeared higher percentage with patients who had cholesterol stone followed by pigment stone and mixed stone

دراسـة لبعــض المؤشــرات المناعيــة والدمــوية لمرضى عراقيــين يعانــون من فــرط الحساسيه النــوع الاول == Study of Some Immunological and Hematological Changes in Iraqi Patients Suffering from Hypersensitivity Type - 1

Author name: سرى مسلم داود الاعــــــرجي
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad - College Of Science For Girls
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: قد تم تصميم هذه الدراسة لتسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلويه ( IL - 13, IL - 18) والكلوبيولين المناعي الكلي ((T - IgE والكلوبيولين النوعي(S IgE) ل 20 مسبب للحساسيه داخلي وخارجي واعداد خلايا الحمضات. وكان مجموع مرضى الحساسية 168، [99 مريضا بالربوالتحسسي (43 ذكرا)، (56 انثى)]، [69 مريض بالتهاب الجيوب الانفيه التحسسي (29 ذكرا)، (40 انثى)]، وجمعت اربعين عينه لاشخاص اصحاء [ (15 ذكور)، (25 اناثا )]. الفئة العمرية (5 - 60) سنة تم جمعها من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافة وخلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى شباط 2017. تمت دراسه بعض التغيرات الدمويه ومنها قياس نسبه ال (Hb) والعدد الكلي لخلايا ال (WBC) واعداد خلايا الحمضه لجميع المرضى والاصحاء عن طريق استخدام محلل الالي (Beckman Coulter) والعده الخاصه بالجهاز . تم قياس الاختبار المناعي (IL - 13, IL - 18, T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء باستخدام جهاز (ELISA ) والعدد الخاصه بالاختبارات. تم قياس الكلوبيولين النوعي (Spesific IgE) الخاص بالمحسسات المستنشقه (عث الفراش، الحيوانات الاليفه ,الصرصر، الاعفان، حبوب اللقاح الاعشاب، حبوب اللقاح الاشجار ,حبوب اللقاح الحشائش) لجميع المرضى والاصحاء باستخدام تقنيه (Western Immunobloting Electrophoresis test) والعده الخاصه بالجهاز والفحص (Euro line Inhalation Profile Kits).توصلت هذه الدراسه الى النتائج التاليه : 1 - عدم وجود فروق معنويه بين المجاميع المدروسه طبقا للجنس . 2 - عدم وجود فروق معنويه بين مرضى الربوالتحسسي الذين لهم تاريخ عائلي ايجابي وسلبي. بينما كانت هناك فروق معنويه بين مرضى التهاب الجيوب الانفيه التحسسي الذين لديهم تاريخ عائلي سلبي وايجابي .3 - احصائيا، كانت الفئة العمرية و(21 - 40) الاكثر شيوعا في مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي حيث بلغت نسبتها المئويه على التوالي[63، 63.6٪)، (47،68.1٪)].4 - زيادة معنوية في النسبه المئويه لاعداد الحمضات (٪) ومستوى الكلوبيولين المناعي الكلي ( T - IgE) ظمن مجموعتي الحساسية مقارنتا بمجموعه السيطره.5 - اظهرت النتائج وجود فروق معنويه بين اعداد المرضى الذين لديهم الكلوبيولين المناعي الخاص بالمحسسات ((Spesific IgE واعداد المرضى ذوي النتيجه السالبه لدى مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي . 6 - سجل محسس الصراصر اعلى نسبة محسس لدى مرضى الربوالتحسسي وتلتها مسببات الحساسية للحيوانات الاليفة وحساسية حبوب اللقاح. بينما في مجموعة التهاب الجيوب الانفيه التحسسي اعلى نسبة محسسات كانت للحيوانات الاليفة وتلتها حبوب لقاح الحشائش .7 - زيادة معنويه كبيرة في مستوى الحركيات الخلويه (IL - 13, IL - 18) عند مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي .8 - وجود علاقة ارتباط معنوية كبيرة بين النسبه المئويه لاعداد خلايا الحمضات والكلوبيولين المناعي الكلي( T - IgE) في مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي r = 0.424)، (P = 0.00 | This study is designed to shed light on the role of IL - 13, IL - 18, T - IgE, Spesific IgE for 20 Indoor and outdoor inhalant allergens in some of type - 1 allergic disease and Eosinophil cells count . The Total allergic patients have been 168, 99 asthmatic patients (43 male ), (56 female ), 69 Rhinitic patients (29 male ), (40 female) and Apparently Healthy Control AHC 40 (15 male ) , (25 female ). Their age group (5 - 60) years . The groups have been collected from the Specialized Center Of Allergy in Baghdad / AL - Resafa and during the period from October 2016toFebruary2017. Some Hematological changes have been studied, including the measurement the Hb% , total count WBC, and eosinophil cells % for all subject by using automated analyzer (Beckman Coulter Analyzer). Beside some Immunological changes were studies including (IL - 13, IL - 18 and total IgE) which have been measured for all subjects by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) . The measurement of serum specific IgE for some inhalant allergens (HDM, Pits, Cockroach, Mites, Grasses pollen, Tree pollen and Weed pollen ) allergens for all subject by using Western Immunobloting test. The Study has reached the fallowing results.1 - There are no significant differences between the studied groups according to gender.2 - There are significant differences in family history between rhinitis group and control. 3 - Statistically, the age group (21 - 40) are most frequent within allergic asthma and rhinitis are (63, 63.6%), (47,68.1%) respectively. 4 - Highly significant increase in Eosinophil count (%) and total IgE within allergic groups when compared with control. 5 - Highly significant differences between positive specific IgE inhalant allergens (positive) and negative patients in asthma and rhinitis groups. 6 - The cockroach allergen records the highest percentage in asthmatic patients fallowed by pets allergens and grasses pollen allergens. While in rhinitic group the highest percentage is for pets allergens fallowed by grasses pollen , cockroach allergen. 7 - Highly significant increase in IL - 13 and IL - 18 level in asthmatic and rhinitic patients. 8 - Highly significant correlation between eosinophil cells count (%) and total IgE In asthmatic and rhinitic patients (r = 0.424 ), (P=0.00).

تاثير حالة التغذية على الاستجابة المناعية للمرضى البالغين المصابين بالسل == The Effect of Nutritional State on Immune Response for Adults Patients with Tuberculosis

Author name: وائــل رشيد عبيد عبد العباس
Supervisor name: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هديل فاضل فرهود
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى دراسة تاثير بعض المعايير الغذائية على الاستجابة المناعية المتضمنة مستوى الزنك ومستوى الالبومين وفيتامين C لمصول مرضى التدرن ودراسة بعض العوامل التي تؤثر على المناعة الخلوية للمرضى وتشمل نشاط الالتهام وتركيز CD56 وتركيز IFN - γ لمصول مرضى التدرن.تم تطبيق هذا العمل على 50 مريضا (31 ذكرا , 19 انثى) تتراوح اعمارهم بين (18 و75 ) عاما للمراجعين لمركز بابل للامراض الصدرية والتنفسية وللفترة من تشرين الثاني 2017 لغاية شباط 2018 و40 شخصا سويا ( 24 ذكرا, 16 انثى ) تراوحت اعمارهم (18 و75 )عاما.جمعت عينات الدم من كلا المجموعتين لتقدير نشاط الالتهام وتركيز IFN - γو فيتامين C وCD56 بطريقة الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم وقياس الزنك والالبومين باستخدام مقياس الطيف الضوئي. وقد تم تشخيص بكتريا التدرن بطريقة التصبيغ (AFB) والزراعة على وسط Lowenstein - Jensen وكذلك تقنية GeneXpert في عينة البلغم. اظهرت النتائج لمعايير المناعة الخلوية الى وجود انخفاض معنوي (p <0.05) في نشاط البلعمة للعدلات لدى مرضى التدرن (6.04٪) مقارنة بالاصحاء (11.70٪) وعدم زيادة معنوية (p> 0.05) لمستوى IFN - γ لدى المرضى (0.159) IU / ml مقارنة بالاصحاء (0.157).لم يكن هناك زيادة معنوية (p> 0.05) لمستوى CD56 لدى مرضى التدرن (78.043) IU / ml مقارنة بالاصحاء (74.473) . في حين مستوى الزنك اظهر نقصان معنوي (P <0.05) حيث كان للمرضى (51.18) dl/ g مقارنة بالاصحاء (113.44) dl/ g ومستوى الزلال في المصل اظهر زيادة كبيرة (P <0.05) لدى مرضى التدرن (38.973) dl/ g مقارنة بالاصحاء (50.2) dl/ g.وكشفت النتائج ان النسبة بين الريف والحضر كانت اعلى بنسبة 68٪ في المناطق الريفية من 32٪ في المناطق الحضرية لمرضى التدرن ، علاوة على معظم الفئات العمرية عرضه للاصابة بالمرض وخاصة الفئة (18 - 35) عاما كانت الاكثر اصابة وكانت نسبة الذكور الى الاناث اعلى في الذكور من الاناث | This study aims at evaluating the effect of nutritional factors on immune response against Mycobacterium tuberculosis including zinc, albumin level and vitamin C. Moreover the factors that affecting the cell mediated immunity including phagocytic index, CD56 and IFN - γ for TB patients were also studied.This work was applied on 50 tuberculosis patients admitted to the Babylon center of tuberculosis and chest diseases from (November 2017 to February 2018). TB patients consist of (31 males and 19 females) with age range 18 to 75 years while 40 apparently health subjects consist of 24 males and 16 females with age range from (18 to 75) years were involved as control group.Diagnosis of M.tuberculosis was carried out depending AFB, culture on Lowenstein - Jensen medium and molecular diagnosis based on GeneXpert technique in sputum sample. Blood samples were collected from patients group and control group to estimate phagocytic index, interferon gamma (IFN - γ), CD56 and Vitamin C by ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay) method . Also zinc and Albumin level were also estimated by using spectrophotometer technique.The results revealed that rural to urban TB patients percentage was (68% to 32%), moreover the affected age group was (18 - 35) years. Also male is more affected than female in TB patients. The cell mediated parameters showing that there is a significantly decreased (p< 0.05) in phagocytosis activity of neutrophils in TB patients (6.04%) compared to control group (11.70%) and there is no significantly increased (p> 0.05) of IFN - γ level in the TB patients (0.159) IU/ml compared to control group (0.157) IU/ml .No significant differences between TB patients and control group regarding concentration of CD56 . The level of zinc in serum is significantly decreased (p<0.05) in the TB patients (51.18) g/dl compared with control group (113.44) g/dl and albumin level in serum is a significantly increased (p<0.05) in theTB patients(38.973)g/l compared with control group (50.2) g/l

دراسة العلاقة بين الحالة التغذوية واستعداد كبار السن للعدوى المايكروبية == Study of the relationship between nutritional status and susceptability to microbial infections in elderly subjects

Author name: انتظار علي هادي
Supervisor name: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هديل فاضل فرهود
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى توضيح العلاقة بين الحالة الغذائية والتعرض للعدوى الميكروبية من خلال تقدير المعايير المناعية مثل (IFNγ & IL - 10)، عناصرcomplement system (C3 & C4)، فيتامين D3، وRSV وBrocella كمؤشرات من العدوى.تم تطبيق هذا العمل على 86 المسنين بزيارة الى مركز للتغذية في مستشفى مرجان في محافظة بابل ومستشفى الحسيني في محافظة كربلاء من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني عام 2017، و24 شخصا اخرين اصحاء.كبار السن يعانون من سوء التغذية 62 شخص تتكون من (23 اناث و39 ذكور) مع الفئات العمرية من 60 - 90 عاما. وتم قياس مؤشر كتلة الجسم (BMI) لجميع حالات سوء التغذية والاصحاء.تم جمع عينات الدم من مجموعة سوء التغذية ومجموعة اصحاء، والكشف عنها بتقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم للمعايير المناعيه مثل (IFN - γ وIL - 10)، complement system (C3 وC4)، فايروس الجهاز التنفسي وBrocella.اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (P≤ 0.05) في مستوى C3 وVD3 و- γ IFNفي مجموعة سوء التغذية مقارنة بالاصحاء. على النقيض من ذلك، فان مستوى زيادة معنوية في IL - 10 وC4 ، فايروس الجهاز التنفسي وBrucella - الاجسام المضادة في مجموعة سوء التغذية بالمقارنة مع الاصحاء. وفيما يتعلق بمؤشرات الالتهابات الجرثومية، بينت النتائج ان مجاميع سوء التغذيه كانت شديدة التعرض للاصابة ب فايروس الجهاز التنفسي والاجسام المضادة لل Brucella تمثلها بواسطة زيادة كبيرة في مستوى علامة العدوى المزمنة والمتكررة التي هي مضادة - الاجسام المضادة محددة لكل نوع من مسببات الامراض. | This study aimed to clarify the relation between nutritional status of elderly and susceptibility to microbial infections including respiratory syncytial virus (RSV)and Brucella indicated by anti - IgG antibodies as indicators for infections in elderly subjects by evaluating the parameters of cytokines (IFN - γ and IL - 10), complement components (C3 and C4),and vitamin D3.This work was applied on 86 elderly visited to the center of nutrition in Marjan hospital in Babylon province and Al - Husseini hospital in Karbala province from November 2016 to January 2017, and 24 non malnutrition apparently healthy as controls. Malnutrition elderly 62 consist of (23 females and 39 males) with age ranges 60 - 90 years. Body mass index(BMI ) for all subjects malnutrition and healthy was estimated.Blood sample were collected from malnutrition group and control group , and ELISA technique for cytokines (IFN - γand IL - 10), complement component (C3 and C4), and detection anti - Rspiratory syncytial virus - IgG antibodies and anti - Brucella - IgG antibodies. The results revealed a significant (p≤ 0.05) decreasing in the level of C3 , VD3 and IFN - γ in malnutrition group as compared to normal subjects.By contrast a significant increasing level in IL - 10,C4,anti - Rspiratory syncytial virus - IgG antibodies and anti - Brucella - IgG antibodies in malnutrition group as compared to normal subjects. Regarding the indicators for microbial infections ,the results expressed that malnutrition group were highly susceptible to infection with anti - Rspiratory syncytial virus - IgG antibodies and anti - Brucella - IgG antibodies represented by a significant increasing in level of the marker of chronic and recurrent infections which is anti - IgG antibodies specific for each type of pathogens.

دراسة وبائيه لالتهاب الكبد الفايروسي نوع ب وج في محافظة بابل == Epidemiological Study of Viral Hepatitis Types B and C in Babylon Province

Author name: ايمان فاضل عبد الحسين
Supervisor name: محمد عبود محسن
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسه لتوضيح وبائيه التهاب الكبد الفايروسي نوع (ب,ج) في محافظه بابل وقد شملت على عينه عشوائيه من المجتمع وكذلك على بعض المجاميع الاختصار للاصابه باالمرض وهم المتبرعين باالدم والملامسين للاشخاص المصابين ومرضى فقر دم البحر الابيض المتوسط ومرضى الكليه الصناعيه ومرضى نزف الدم الوراثي والعاملين في المجال الصحي تضمنت هذه الدراسه التي استمرت من تشرين الثاني 2011 الى حزيران 2012 عاى 2114عينه دم كانت قد فحصت لكل من المستضد السطحي للنوع ب والضدIgG للنوع ج شملت على 1408 ذكر و706 انثى وكان متوسط الاعمار 5, 38 سنه اظهرت النتائج ان نسبه الوبائيه للنوع ب في عينه عشوائيه من المجتمع كانت (97,3%) اما الاعمار الاكثر اصابه كانت تتراوح في الفئه العمريه (41 - 50) بنسبه اصابه ( 93,4 % )وكان الذكور اكثر اصابه من الاناث بنسبه (70,3 - 30,7%) كذلك كانت نسبه الاصابه في الريف اكثر من المدينه حيث انه من مجموع 37 عينه موجبه للنوع ب كان هنالك 26 منها كان في المناطق الريفيه في حين كانت البقيه (11عينه) في المدينه اي ان نسبه الاصابه في الريف الى المدينه كانت 1 : 2 على التوالياما في مجموعه متبرعي الدم فقد كانت نسبه الاصابه(76, 0% )و الاعمار الاكثر اصابه كانت ايضا في الفئه العمريه (41 - 50) بنسبه اصابه (87,0%) وايضا كان الذكور اكثر اصابه من الاناث بنسبه (52. 0 - 87,0)% وكذلك كانت نسبه الاصابه في الريف اكثر من المدينه 28,57 - 71,43 %)اما في مجموعه الملامسين فقد كانت نسبه الاصابه (4,92%) وكان الذكور اكثر اصابه من الاناث بنسبه (6,25 - 44,3%) وكان كل الافراد المصابين في هذه الفئه من المناطق الريفيه.ان نسبه الانتشار الوبائي للنوع ب في مجاميع الاختطار كان اكثر شيوعا في عوائل الاشخاص المصابين سابقا مقارنه بالاشخاص الذين ليس لديهم سجل اصابه مسبقه في عوائلهم بنسبه61,7 - 38,3%)ان عيار anti - HBc IgM كان اكثر توافقا مع الحمل الفايروسي للنوع ب بواسطه فحص RT - PCR من عيارفحص HBsAg المقاس بواسطه الاليزااظهرت النتائج ان نسبه الوبائيه للنوع ج في عينه عشوائيه من المجتمع كانت (1.07 %) وهي اقل بكثير مقارنه مع المجاميع المخطره للاصابه حيث كانت نسبه الاصابه في مرضى فقر دم البحر الابيض المتوسط كانت 25% وفي مرضى نزف الدم الوراثي كانت 6.98%,وفي مجموعه متبرعي الدم (0,43% ) بينما لم تسجل اي اصابه بين فئه العاملين في المجال الصحي وكان الذكور هم الاكثر اصابه مقارنه مع الاناث على الرغم من انه لاتوجد فروق معنويه اي انه لايوجد ترابط بين الجنس وبين الاصابه باالمرض.وقد كانت نسبه اصابه الذكور الى الاناث في العينه العشوائيه(1,12 : 1,02) و( 5,26 : 5) ,(8,69 : 6,67),(7,9 : 4,5),(0,53 : 0),(27,27 : 26,00) في كل من مجموعه الملامسين والكليه الصناعيه ومرضى نزف الدم الوراثي ومتبرعي الدم ومرضى فقر دم البحر الابيض المتوسط على التعاقب. ان نسبه الانتشار الوبائي للنوع ج في مجاميع الاختطار كان اكثر شيوعا في عوائل الاشخاص المصابين سابقا مقارنه بالاشخاص الذين ليس لديهم سجل اصابه مسبقه في عوائلهم بنسبه(67,5 : 32,5).هذه النتائج تشير الى احتماليه انتقال العدوى ضمن افراد العائله كما واظهرت الدراسه ان هذا المرض اكثر انتشارا عند الاشخاص ذوي الحاله المعيشيه والمستوى التعليمي المتدنين وان الاصابه بالمدن اكثر انتشارا من االمناطق الريفيه واخيرا ان عيار anti - HCV IgG المقاس بواسطه الاليزا لم يكن باالضروره متوافقا مع الحمل الفايروسي للنوع ج بواسطه فحص RT - PCR | Summary The prevalence of viral hepatitis B and hepatitis C infections in general population and some of high risk groups such as blood donor, house hold contact, thalassemics, haemodialysis, haemophilia, and health worker in Babylon Governorate were covered. From first of November (2011) to end of June (2012); A total of (2114) blood samples from (1408males) and (706 females) with a mean age of (36.5±7.8 years) were tested for anti - HBsAg and anti - HCV IgG antibody The results showed that prevalence of HBV in general population was (3.97%) and patients with age group (41 - 50) had the higher rate of infection (4.93%). According to the sex; male was more infected than female (26 : 11) respectively with prevalence rate (70.3 : 30.7) respectively. A total of (37) positive anti - HBsAg (26) of them were in rural regions while the rest (11) were in urban with rate of infection (2 : 1) respectively. The ratio of infection in blood donors group was (0.76%) and patients with age group (41 - 50) had the higher ratio of infection (57.1%). According to the sex; male was more infected than female with the prevalence rate (0.82 : 0.52).Higher anti - HBsAg prevalence was found among blood donor living in the urban area 71.43 % than those living in rural areas 28.57% . The prevalence of anti - HBsAg in house hold contact group was (4.92%) and the age group (31 - 40) had the higher prevalence of infection (66.7%). Male to female ratio were (6.25 : 3.44) respectively and all tested members were from rural areas. The prevalence of HBV in risk group was more common in subjects with a positive family history for HBV (61.7%) than subjects with negative family history (38.3%).The diagnostic marker anti - HBc IgM were more compatible with viral load /Ml of HBV by RT - PCR than anti - HBsAg which obtained by ELISA test. The prevalence of anti - HCV in general population was (1.07 %) which was much lower than in risk groups of this study since it was in thalassemics (25%), haemodialysis (6.98%) haemophilics (6.67%) and in blood donors (0.43%). No infection recorded HCV cases between health worker in this study. According to sex; male to female rate in the general population was (1.12 : 1.02).The rate were (5.26 : 5), (8.69 : 6.67), (7.9 : 4.5), (0.53 : 0),(25.25 : 26.08) in house hold contact, haemodialysis, haemophilics, blood donors, and thalassemics respectively. The prevalence of HCV in risk group was more common in subjects with a positive family history for HCV (47.5%) than subjects with negative family history (52.5%).This results may support the possibility of sexual and intrafamilial transmission of HCV in all studied groups. The study shows that there is a higher rate of HCV infections in urban residence than in rural areas with prevalence (67.5 : 32.5) . The results of RT - PCR and ELISA technique were not necessary compatible for anti - HCV. The HBV and HCV had more prevalence in people with low economic status, low educational level.

دراســة المجاميع النسليـــــه وعوامـــل الالتـــصاق لبكتريا الاشريشيا القولونيه المعزولـه من مهبل النـساء في محافظة بابل == A Study of Phylogeny Groups and some Adhesins of Esherichia coli Isolated from Women Vagina in Babylon province

Author name: شهد سعد محمد
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | ملال محمد عبد الرضا الجبوري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: جمع ( 135) مسحات مهبلية من النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل المراجعات لمستشفى الامومة والاطفال في محافظة بابل للفترة تتراوح من تشرين الثاني 2016 الى نيسان 2017 , تتراوح اعمارهم من 18 الى 40 سنة . فقط 20(14.8%) من المسحات المهبلية اظهرت نتائج موجبة لبكتريا E.coli . شخصت عزلات البكتريا بواسطه الاوساط الزراعية واختبارات الكيموحيويه. الكشف الجزيئي لمجاميع النشوء بواسطه استعمال ثلاثة جينات TspE4.C2 & yjaA, chuA والنتائج اظهرت 14 (70%)عزلة من E.coli تعود لمجموعة B2 و5 (25%) عزلات تعود لمجموعة A وعزلة واحدة (5%) تعود لمجموعة B1 . ولم تظهر هذه الدراسة اي عزلة تعود لمجموعة D. صنفت اغلب عزلات E.coli التي تعود لمجموعة B2 ضمن سلالات خارج الامعاء وبقية العزلات تكون متعايشة . شملت الدراسة ايضا اختبار وجود جينات ال (pap) ل E.coli المهبلية المعزولة حيث تم تحديد بواسطه تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل (PCR) وجود جينات عوامل الالتصاق وهي papGI وpapGII وpapGIII وpapC , حيث وجدت الدراسة ان جين papGI غير موجود في جميع عزلات بكتريا E.coli و9 ( 45%) عزلات بكتيرية تحتوي على جين papGII و6 (30%)عزلات تحتوي على جين papGIII و13 (65%) عزلة بكتيرية تحتوي على جين papC . الى جانب ذلك E.coliالمهبلية فحصت لغرض وجود جينات الالتصاق معقد (sfa/foc) حيث لاحظت ان 12(60%) عزلة تحتوي على هذا الجين (sfa/foc) , وتم ايضا تشخيص وجود جين الضراوة (iucC) بواسطه علامات متخصصه حيث وجد 17 (85%) عزلة تحتوي على هذا الجين. وفقا لمجموعة النشوء، ويتم دراسة حساسية المضادات الحيوية وفقا لذلك. وقد لوحظ ان معظم العزلات تنتمي الى المجموعة 2B، كانت مقاومة لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسه، ولكنها حساسة ل Meropenemو Nitrofurantoin والى حد اقل الى Chloramphencol . وعلاوة على ذلك، وجد ان جميع العزلات المنتمية الى المجموعة A لديها مقاومة لمعظم المضادات الحيوية لكنها حساسة ل Meropenem , Chloramphencol وNitrofurantoin. وتم في هذه الدراسة ايضا اجراء اختبار انتاج الاندول من قبل العزلات البكتيرية وتاثيره على تجمع بكتريا E.coli حيث اظهرت جميع العزلات نتيجة موجبة لهذا الاختبار | A total of (135) vaginal swabs were obtained from women suffering from vaginitis who submitted to Hospital of Maternity and Children in Babylon city in a period rang from (October 2016 to April 2017), at the age ranging from 18 to 40 years. . Only 20 (14.8%) high vaginal swabs showed positive results of E.coli. The bacterial isolates were diagnosed by cultural and biochemical tests. Molecular detection of phylogeny groups by using three genetic marker chuA, yjaA & TspE4.C2,and the results showed that 14 isolates (70%) of E.coli belongs to group B2, 5 isolates (25%) belong to group A and 1 isolate (5%)belongs to group B1 whereas no isolate belongs to group D. Most E.coli belong to group B2 are classified within extra intestinal strains and the other isolates are commensal. . On the other hand, the isolated vaginal E.coli were examind for the presence of pyelonephritis associated pili (pap) type G where three subclasses (I, II, III) and type C are detected by PCR .It was found that papGI gene was not present in all isolates, papGII gene was present in 9 isolates (45%), papGIII gene was present in 6 isolates (30%) and papC gene was present in 13 isolates (65%). Besides, vaginal E.coli were examind for the presence of the adhesion genes (sfa/foc) complex. It was noticed that this gene was present in 12 isolates (60%). . Iron uptake chelate C (iucC) gene, is also investigated by using specific marker; it was found that iucC gene was present in most E.coli 17 isolates (85%). According the phylogeny group, Antibiogram profile is done accordingly. It was observed that most isolates belong to the group B2, were resistant to most antibiotics understudy, but they are sensitive to Nitrofurantion and Meropenem and to a less extent to Chloramphencol. Moreover, All isolates belonging to group A were found to have a resistant to most antibiotics but they are sensitive to Meropenem, Chloramphencol and Nitrofurantion. . Finally, the in vitro the effect of indole production on the aggregation of bacteria is also investigated. The results showed that all isolates gave positive results for this experiment

الكشف عن جينات السموم الفائقة في المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من حالات التسمم الغذائي المحلية == Detection of Superantigenic Toxin Genes in Staphylococcus aureus Isolated from Local Cases of Food Poisoning

Author name: بارق عبد اللطيف صبر العجيلي
Supervisor name: ميساء صالح مهدي الشكري | حسن سالم الجميلي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: جمعت في هذه الدراسة 100عينة من عينات الخروج لمرضى راجعوا مستشفى الحلة التعليمي ومدينه مرجان الطبية خلال الفترة من تموز 2016 الى ايلول 2016م. ثم زرعت العينات التي تم الحصول عليها على اوساط انتقائية واجريت عليها اختبارات بايوكيميائية وبكتريولوجية من اجل التشخيص. من مجموع (100) عينة تم الحصول على20 (20%) عزلة مكورات عنقودية الذهبيه , وشخص تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الانبوب (TM) وطريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الانبوب كانت جميع عزلات المكورات العنقودية الذهبية منتجة للاغشية الحيوية بينما في طريقة الطبق الزرعي النسيجي وجد ان (15%)من العزلات منتجة للاغشية الحيوية من النوع القوي و(50%) من نوع الغشيه الحيوية المتوسط وكذلك (35%)اظهر تضعيفه او غير مكونه للاغشيه الحيوية حسب قيم الامتصاصية عند كثافته نوعيه OD at 570nm .تم دراسة بعض عوامل الضراوه لجميع عزلات المكورات العنقودية الذهبية مثل قابلية التحلل على وسط الدم والنتائج بينت كل عزلات المكورات (20) (100%) لها قابلية لانتاج تحلل كامل (بيتا) وكذلك تم اختبار انتاج انزيم الفوسفولايبيز سي النتيجه بينت (70%)من عزلات المكورات العنقودية الذهبيه كانت منتجه للانزيم و(30%)من العزلات كانت غير منتجة لانزيم الفوسفولايبيز سي. تم التحري عن حساسية العزلات للمضادات الحياتية باستخدام طريقة انشار القرص. وقد وجد ان هذه العزلات كانت مقاومة لاكثر من نوع من المضادات الحيوية.فقد بينت النتائج ان (85%) من عزلات المكورات العنقودية الذهبية مقاومه للسفترياكسون وبينت نسبه مقاومه (75%)للاميبينيم بينما العزلات كانت مقاومه للتيترا سايكلين والاريثرومايسيين كانت (65%) كذلك مقاومه لكل من اوكساسيليين والاميكاسيين عند (25%)و(35%)على التوالي بينما بينت مقاومه لكل من جينتا ماسيين والكلورومفنيكول عند (15%) لكل منها تفاعل البلمرة المتسلسل قد استخدم للكشف عن جينات الضراوه التي تشفر للسموم المعوية وسموم الاصابات االجلديه وسموم متلازمه الصدمه وكذلك انزيم المخثر لعزلات المكورات العنقوديه الذهبيه التي بينت نتائج موجيه لكل من جينات sea,seb, agr, seg,sei,she,tst,eta,etb,coa,بنسبه وعدد كانت 8 (40%) ,7(35%) و19(95%),13(65%),20 (100%) ,1(5%) و(100%),9(45%),14(70%), 20(100%) على الترتيب.تفاعل البلمره المتسلسل لجين coa من كل العزلات انتج انواع مختلفةاعتمادا على الاحجام بمدى من 500 - 900 زوج قاعدي التي ميزت كما يلي النوع الاول coa500 زوج قاعدي والنوع الثاني 600 زوج قاعده ,النوع الثالث 700 زوج قاعده,النوع الرابع 800 زوج قاعده والنوع الخامس 900 زوج قاعده وكان النوع الثالث النوع الاكثر شيوعا في العزلات .تنويع جين coa على اساس تفاعل البلمره المتسلسل ل للتنوع الشكلي لطول القطع المتقطعة coa RFLP بواسطة استخدام الانزيم القاطعAuI I لتقطيع ناتج التضخيم لجين coa وانتجت مختلف اشكال التقطيع بواسطة انزيم التقطيع متباينة من80 - 700 زوج قاعدة مع 7 انواع من coa RFLP النوع الاول بين بنسبه (10%),النوع الثاني (5%),النوع الثالث(15%),النوع الرابع (20%),النوع الخامس(20%),النوع السادس (25%) والنوع السابع (5%).النوع السادس كان الاكثر شيوعا وكان بنسبه (25%)من كل العزلات.والنتائج قد بينت بعض العزلات بنسبه (20%)لم تقطع بواسطة الانزيم القاطع Alu I.النتائج بينت تاثير سموم المكورات العنقودية المنقى جزئيا على خلايا سرطان الجلد B6 كنموذج لخلايا سرطان جلد الانسان بالاضافه لذلك فقد بينت ان سموم المكورات العنقودية لها فعل مثبط لهذه الخلايا . | A total of 100 stool specimens were collected from patients who admitted to Al Hilla Teaching Hospital ,and Merjan medical city during a period extending from July 2016 to September 2016. The .Then the specimens cultured in selective media and identified by using biochemical and bacteriological tests.Only (20)isolate of Staphylococcus aureus isolates were recovered. Biofilm formation was detected by tube method and tissue culture plate technique, in tube method(TM)the results showed that all S. aureus isolates (100%)were biofilm producers as contrast to tissue culture plate (TCP) the results showed that (15%) Staphylococcus aureus isolates were produces strong biofilm and (50%) moderate biofilm also (35%) were weak or non biofilm forming according to the absorbance at OD 570nm. Some virulence factors of all Staphylococcus aureus isolates were studied as hemolytic activity on blood agar , and the results showed that all Staphylococcal aureus isolates have the ability for producing beta hemolysis ,and Staphylococcal Phospholipase C production were tested and the result showed that (70%) Staphylococcus aureus of isolates were able to produce Phospholipase enzyme extracellularly. Antibiotic susceptibility to a variety of antibiotics has been investigated by using disk diffusion method. It has been found that these isolates showed resistant to more than one antibiotic. It has been found that S.aureus isolates were resistant to Ceftiaxone(85%) and showed resistance (75%) to imipenem. whereas the isolates resistance to tetracycline and erythromycin was (65%),also the resistance for each, oxacillin and amikacin, at (25%), (35%), respectively. While most isolate were sensitive togentamycin and chloramphenicol was (15%) for each. Polymerase chain reaction (PCR) used for detection of virulence genes that coding to enterotoxin ,exofoliative toxin ,toxic shock syndrome toxin and coagulase enzyme of S. aureus isolates, it was found that were positive results were showed for, sea, seb , agr, seg sei ,seh ,tst, eta, etb ,coa with number and percentage,8(40%),7(35%),19(95%), 13(65%) 20(100%), 1(5%), 20(100%), 9(45%), 14(70%) and 20(100%), respectively.PCR amplification of coa gene from 20 isolates product different types based on size range from (500 - 900 ) bp were recognized as follows coa types I (500bP) ,coa type II(600 bp),coa type III(700 bP),coa types IV (800 bp),and coa type V (900bp). and were found at(500bp 5%,600bp 30%700bp50%,800bp5% , 900bp10%) The majority of the isolate exhibit coa type(III) . PCR - RFLPTyping of coagulase (coa) gene and polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism by using AulI restriction enzyme digestion of the PCR coa product generated different Aul I restriction pattern with the number of fragments varying from one to three and with size of the fragment varied from 80 - 700bp with 7 pattern of coa RFLP, pattern type I showed (10%),type II(5%),type III (15%),type IV(20%),type IX(20%),type X(25%),type XI(5%) typeX was the most common and it revered ( 25 %)of all isolate. The result in this study also rater that some strain ( 20% )were not digested by Aul I enzyme. The results show effect of partially purified of S.aureus toxin on B16 melanoma as a model for human skin cancers. It has been revealed that S.aureus entero toxin have an inhibiter effect on these cells.

دراسة بكتيرية ومناعية للمرضى المصابين بالتهاب الكبد الفيروسي في محافظة بابل == Bacteriological and Immunological Study among Patients with Viral Hepatitis in Babylon Province

Author name: زينب مهدي كاظم السندي
Supervisor name: محمد عبد الكاظم السعدي | الهام عباس بنيان الساعدي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: A cross - sectional study included seventy patients who clinically diagnosed positive viral hepatitis with age ranged between 14 - 61 years old from both sexes, 37 males and 33 females, within a period from November 2015 to March 2016. Blood and urine samples were collected from each subject who was attendant in Merjan Teaching Hospital in Babylon province. Twenty apparently healthy negative for viral hepatitis subjects were involved in this work as control.All specimens (blood and urine) were subjected to identify the aerobic bacterial types associated with viral hepatitis by biochemical and serological tests. The results showed that 28.57% of blood specimens and 62.8% of urine specimens were positive for bacterial growth of both Gram - positive and Gram - negative, whereas 71.43% of blood specimens and 37.2% of urine specimens were negative growth. The predominant bacteria were Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli. The results revealed that the immunecompromised patients are more susceptible to bacterial infection.Identification of two isolates of rare bacteria (Kocuria kristinae and Rothia dentecariosa) from viral hepatitis patients by vitek technique.Detection of immunoglobulin’s IgM and IgG specific to Helicobacter pylori by using Enzyme - linked immunosorbent assay technique revealed a high prevalence of Helicobacter pylori infection in patients with liver diseases.The results of immune measurement of cytokine profile interferon - γ by using Enzyme - linked immunosorbent assay technique and complement components C3 and C4 by using Single Radial Immuno - diffusion test were no significant differences in comparison to healthy control

دراسة بكتريولوجية وجزيئية لبكتريا المكورات العنقودية المعزولة من عينات سريرية == Bacteriological and Molecular Study of Staphylococcus spp. Isolated from Clinical Specimen

Author name: هبة خلف ياسين المطوري
Supervisor name: ميساء صالح مهدي الشكري | هدى هادي الحسناوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة جمع 100 عينة سريرية مختلفة لمرضى راجعوا مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2015 الى شباط 2016 م. العينات شملت (43%) عينة من الادرار, (26%) من الحروق, (20%) من الجروح و(11%)من الاذن، ثم زرعت العينات التي تم الحصول عليها على اوساط انتقائية واجريت عليها اختبارات بايوكيميائية وبكتريولوجية من اجل التشخيص. من مجموع 100 عينة تم الحصول على24 (24%) عزلة مكورات عنقودية ذهبية و8 (8%) عزله مكورات عنقودية بشرويه. تم التحري عن حساسية العزلات للمضادات الحياتية باستخدام طريقة انشار القرص. وقد وجد ان هذه العزلات كانت مقاومة لاكثر من نوع من المضادات الحيوية. فقد بينت النتائج ان كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية (100%) مقاومة ﻠ ampicillin وvancomycin ، و93.1% منهم اعطت مقاومة ﻠ amoxyclave و(87.5%) منهم اعطت مقاومة ﻠ cefoxitin, cefepim، في حين كانت العزلات المقاومة ﻟ (oxacillinو ceftriaxone وmeropenem وamikacin وtetracycline وchloramphenicol) (41.6%)، (95.8%)، (70.8%)، (33.3%)، (62.5%) و(12.5%) على التوالي، وكانت نسبة المقاومة ﻠimipenem وrifampicin (75%) لكل منهما، ونسبة (20.5%) لكل من gentamycin) وnorfloxacin). بينما كانت كل عزلات المكورات العنقودية البشرويه (100%) مقاومة ﻠ cefoxitin وvancomycin، و(50%) منهم اعطت مقاومة ﻠ oxacillin وnorfloxacin وchloramphenicol، وكانت نسبة المقاومة ﻠ ceftriaxoneو imipenem وtetracycline وrifampicin (87.5%) لكل منهم , واخيرا كانت المقاومة ﻠ amoxyclaveوampicillin cefepime وmeropenemو gentamycin وamikacin (93.1%), (75%), (70%), (62.5%), (12.5%), (37.5%) على التوالي. اظهرت النتائج ايضا ان من مجموع 24 عزلة 21(87.5%)منها كانت مقاومة للاوكساسيلين واعتبرت المكورات العنقودية مقاومة للميثيسلين كونها مقاومة للاوكساسيلين وسيفوكسيتين. وقد اظهرت النتائج ان 37.5% من عزلات المكورات العنقودية المقاومة للميثيسلين كانت في عينات الادرار, و50% في عينات الحروق والجروح. تم دراسة بعض عوامل الضراوة واظهرت النتائج ان جميع عزلات المكورات العنقودية 32(100%) لها قابلية الالتصاق على الخلايا الظهارية , وشخص تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الانبوب (TM) وطريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الانبوب كانت جميع عزلات المكورات العنقودية الذهبية منتجة للاغشية الحيوية و4(50%) من عزلات المكورات العنقودية البشروية منتجة للاغشية الحيوية و4 (50%) غير منتجة للاغشية الحيوية, بينما في طريقة الطبق الزرعي النسيجي وجد ان جميع العزلات منتجة للاغشية الحيوية من النوع القوي حسب قيم OD at 570nm . تم دراسة تاثير بعض استخلاصات النباتات على تكوين الاغشية الحيوية (الشاي الاخضر والاسود) واظهرت النتائج ان قابلية تكوين الاغشية الحيوية في جميع عزلات المكورات العنقودية ثبطت بعد اضافة الشاي ما عادة (7) عزلات ازداد بها تكوين الاغشية الحيوية. تم الكشف عن الجينات المسؤولة عن بعض عوامل الضراوة باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) فكانت النتيجة لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لجين, sar, icaD, icaC, icaB, icaA atl, agr mecA, بنسبة وعدد 23 (95.8%) , 22 (91.6%), 11(45.8%), 23 (95.8%), 15 (62.5%), 17 (70.8%), 22 (91.6%) و12 (50%),على التوالي. وكانت نسبة عزلات المكورات العنقودية البشروية للجينات, icaD, icaC, icaB, icaA atl 7 (87.5%), 7(87.5%), 4(50%), 8(100%), 7(87.5%) على التوالي, بينما اعطت نتيجة سالبة لجين mecA . | A total of 100 different clinical specimen were collected from patients who admitted to Hilla Teaching Hospital, during a period extending from November 2015 to February 2016. The specimens included (43) urine specimen, (26) burns, (20) wounds and (11) ear swabs. Then the specimens cultured in selective media and identified by using biochemical tests. Out of 100 specimens, a total of 24 (24%) Staphylococcus aureus and 8 (8%) of S. epidermidis isolates were recovered. Antibiotic susceptibility to a variety of antibiotics has been investigated by using disk diffusion method. It has been found that these isolates have been resistant to more than one antibiotic. It has been found that S. aureus isolates were resistant(100%) to ampicillin and vancomycin, amoxiclave(93.1%) and showed (87.5%) resistance to cefoxitin and cefepime, whereas the isolates were resistance to oxacillin, ceftriaxone, meropenem, amikacin, tetracycline and chloramphenicol at (41.6%), (95.8%), (70.8%), (33.3%), (62.5%)and (12.5%) respectively. While showed resistance (75%) to imipenem and rifampicin for each, gentamycin and norfloxacin at (20.5%) for each. Staphylococcus epidermidis isolates appeared resistance to cefoxitin and vancomycin (100%) for each, and (50%) for oxacillin, norfloxacin and chloramphenicol, while have resistance to ceftriaxone, imipenem, tetracycline and rifampicin at (87.5%) for each. Whereas the isolates were resistant to amoxyclave, ampicillin, cefepime, meropenem, gentamycin and amikacin at (93.1%), (70%), (75%), (62.5%), (12.5%), and (37.5%) respectively. Results also revealed that out of 24 of S. aureus isolates 21(87.5%) were assigned as methicillin - resistant Staphylococcus aureus (MRSA) phenotypically by using oxacillin and cefoxitin discs as these isolates showed resistance to both oxacillin and cefoxitin, and these MRSA isolates were distributed as 37.5% from urine and 50% from burns and wounds specimen. Some virulence factors of all Staphylococcal spp. isolates were studied, and the results showed that all Staphylococcal spp. isolates 32(100%) have the ability for adherence to epithelial cell. Biofilm formation was detected by tube method and tissue culture plate technique, in tube method(TM) the results showed that all S. aureus isolates (100%) were biofilm producers while 4(50%) of S. epidermidis isolates were biofilm producer and 4(50%) were not biofilm producer, in contrast to tissue culture plate (TCP) the result showed that all Staphylococcal spp. isolates were produce strong biofilm according to the absorbance at OD 570nm. The effect of some plants extracts on biofilm formation was studied, in the present study green and black tea were used to show the effect of these plant on biofilm formation, the results revealed that biofilm ability for all isolates has been inhibited except (7) isolates of S. aureus increased in biofilm formation. Polymerase chain reaction (PCR) were used for detection of virulence genes of Staphylococcus spp. isolates, it was found that S. aureus gave positive results for icaA, icaB, icaC, icaD, agr, sar, atl and mecA with number and percentage 23(95.8%), 22(91.6%), 11(45.8%), 23(95.8%), 17(70.8%), 15(62.5%), 22(91.6%) and 12(50%), respectively. While S. epidermidis gave positive result for icaA, icaB, icaC, icaD and atl genes at 7(87.5%), 7(87.5%), 4(50%),8(100%) and 7(87.5%), respectively, and all S. epidermidis isolates gave negative results to mecA gene.

دراسة مايكروبايلوجية للبكتريا اللاهوائية التي تصيب الحوامل بالتهاب المهبل في مدينة الحلة == Microbiological Study of Anaerobic Bacteria Affecting pregnant women with Vaginitis in Hilla City

Author name: ايمان جباررحيم عباس العرداوي
Supervisor name: حبيب صاحب نهر | نادية مضر الحلي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة خلال مدة 5 اشهر من شهر تشرين الثاني 2015 ولغاية شهر اذار 2016 من اجل دراسة ومقارنة طبيعة الفلورا المهبلية في النساء الحوامل المصابات بالتهاب المهبل البكتيري والنساء غير المصابات. حيث قسمت مئة حامل وفقا لفترة الحمل الى ثلاث مجاميع (الحوامل خلال الثلث الاول من الحمل 1 - 13 اسبوع , الحوامل خلال الثلث الثاني من الحمل 14 - 28 اسبوع والحوامل خلال الثلث الثالث من الحمل 28 - نهاية الحمل ). تم جمع العينات المهبلية من النساء الحوامل اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية في مستشفى النسائية والاطفال التعليمي بالاضافة الى عدد من العيادات الخاصة في مدينة الحلة .لغرض تقييم الفلورا المهبلية تم اتباع الصفات السريرية (Amsel’s criteria ) المتمثله طبيعة الافراز المهبلي والاس الهيدروجيني للافراز المهبلي ووجود الخلايا الطلائية المغطاة بالعصيات السالبة لصبغة غرام وانبعاث رائحة الامينات من الافراز المهبلي; نظام العد Nugent score system ) حيث بين وجود فلورا طبيعية وفلورا وسطية وفلورا غير طبيعية او وجود التهاب مهبلي بكتيري.بعض الاختبارات المتمثلة بالتصبيغ (لدراسة الصفات المجهرية ), الزرع (لدراسة الصفات الزرعية) وفحوصات كيميو حياتية ايضا اجريت لتشخيص الانواع البكتيرية.اظهرت نتائج الدراسة ان 40 (40 %) من النساء مصابات بالتهاب المهبل البكتيري وفقا للصفات السريرية Amsel’s criteria وكانت اكثر الخواص السريرية حساسية هوالاس الهيدروجيني للافراز المهبلي بينما كان وجود الخلايا الطلائية المغطاة بالعصيات السالبة لصبغة غرام هو الصفة الاكثر خصوصية ( 92 % و76% على التوالي). وفقا لنظام العد Nugent’s scores كانت 24 (24%) امراة مصابات بالالتهاب البكتيري مقابل (76 امراة بدون اصابة ) بضمنها النساء اللواتي لديهن فلورا مهبلية وسطية. كما اظهرت نتائج زرع المسحات المهبلية E.coli 15(36.55%) المكورات العنقودية الموجبة لانزيم التخثرaureus staphylococci 12(22.22%) , المكورات العنقودية السالبة لانزيم التخثر Staph epidermides, Staph. Saprophyticus 3(5.55%) و9(16.6%) على التوالي وStrep. spp. 4(7.4%) , 5(12.2%) Klebsiella spp. كانت هي السائدة في النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري تتبع ب Strep.spp. 4 (7.4%) .اما في النساء غير المصابات بالالتهاب فكانت الفلورا السائدة هي عصيلت الحليب Lactobacillus 8(14.81%) وS.aureus 7(19.96%) معايير ال Amsels اكثر دقة مقارنة مع نظام التسجيل في الكشف عن التهاب المهبل البكتيري عند النساء الحوامل وكانت النساء الحوامل في الثلث الثاني من الحمل اكثر عرضة لالتهاب المهبل البكتيري وارتفاع نسبة الاصابة بالتهاب المهبل البكتيري في المناطق الريفية اكثر من المناطق الحضرية, وجود اثنين من معايير ال Amsels وبصرف النظر عن لون الافراز المهبلي يمكن ان تستخدم لتشخيص التهاب المهبل البكتيري والنساء الحوامل في سن 26 - 35 سنه هي اكثر عرضة للاصابة بالتاب المهبل البكتيري بالمقارنة مع الفئات العمرية الاخرى | Bacterial vaginosis is a common, complex clinical syndrome characterized by alterations in the normal vaginal flora. The exact etiological agents for bacterial vaginosis are unclear; however, it is thought that it is a polymicrobial syndrome. This study has been conducted through a period of 5 month from Novembre 2015 to March 2016 in order to investigate and compare the composition of vaginal flora in pregnant women with bacterial vaginosis and those without the syndrome. A hundred pregnant women were classified to in three groups according to trimesters (first trimester 1 - 13 week, second trimester 14 - 28week and third trimester 28week to end of pregnancy). Vaginal samples were collected from the pregnant women who attending the outpatient department in the Teaching Hospital of Maternity and Pediatrics in addition to some private clinics in Al - Hilla city. For assessment of vaginal microbiota, Amsel׳s criteria represented by vaginal discharge, vaginal pH, clue cells, and amine odour; Nugent׳s scoring system including normal flora, intermediate flora, and abnormal flora or bacterial vaginosis. The results indicated that 40 patients (40%) had bacterial vaginosis according to the clinical criteria. Accordingly, Amsel׳s criteria. The vaginal pH was the most sensitive criterion, while the most specific one was the clue cells (92% and 76% respectively). According to Nugent׳s scores, 24 (24%) women in this group had bacterial vaginosis. versus 76 women without this syndrome (containing women has intermediate flora). Culturing of vaginal swabs revealed that and E.coli 15 (36.5%), S. aureus 12 (22.22%) and coagulase - negative staphylococci (Staph. epidermides, Staph. saprophyticus 9 (16.6%), 3 (5.55 %) respectively) and Klebsiella spp. 5(12.2%) were the dominant microorganisms in women with bacterial vaginosis followed by Strep.spp. 4 (7.4%), while in without bacterial vaginosis patients, the dominant microflora were Lactobacillus 8 (14.81%) and S.aureus 7 (19.96%). Amsels criteria are more accurate compared with scoring system in detection of vaginosis in pregnant women. Pregnant women in the second trimester are more vulnerable for BV. Higher percentage of BV in rural areas than urban areas. Presence of three of the Amsels criteria, apart from the color of vaginal secretion, may be used for the diagnosis of BV. Pregnant women with age 26 - 35 are more vulnerable to BV Compared with other age groups

التوصيف الجزيئي لعـوامل الضراوة لبكتيريا Moraxella lacunata والتحري عن الاجسام المضاده لطفيلي Toxoplasma gondii في المرضى المصابين بالتهابات العيون

Author name: زهراء عبد العزيز يوسف حسين اليساري
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | هادي فاضل اليساري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: في هذه الدراسة تم الحصول على 100 مسحة من المرضى الذين يعانون من اصابات في العيون المراجعين لمستشفى الحلة التعليمي للفترة من تشرين الثاني / 2015 ولغاية كانون الثاني / 2016 والذين تراوحت اعمارهم من سنتين الى 60 سنة , حيث كان بعض المرضى يعانون من امراض مزمنة كمرض السكري وضغط الدم والحساسية . حيث تم عزل وتشخيص 12% عزلة فقط من بكتيريا ال Moraxella lacunata و76% من انواع البكتيريا الاخرى وكان عدد المسحات التي لم تظهر اي نمو على اي وسط زرعي للبكتيريا 12% مسحة. العزلات التي لم تظهر اي نمو على الاوساط الزرعية للبكتيريا (12 عزلة) خضعت لتشخيص الاصابة بداء المقوسات من خلال تحديد كل من IgM وIgG بواسطة جهاز ال Minividus حيث اظهرت النتائج عدم ظهور اي اصابة بهذا الطفيلي في جميع المرضى الذين لايعانون من اصابات بكتيريا (12). حيث ان كل من IgM وIgG كان في مستوى منخفض في المرضى . جميع عزلات ال Moraxella lacunata خضعت لاختبار الحساسية للمضادات الحيوية . وقد وجد ان جميع العزلات كانت حساسة تماما 100% لل Neomycin , Gentamycin , Ceftriaxone , Piperacillin وبدرجة اقل لل Clarithromycin , Ceftazidime . الى جانب ذلك اظهرت النتائج ان جميع العزلات البكتيريا كانت غير قادرة على انتاج عامل الالتصاق الاول في حالة وجود ال D - mannose بينما جميعها كانت موجبة لعامل الالتصاق الثالث . هذا يعني ان هذا النوع من البكتيريا حساس للمانوز. تم التحري ايضا عن انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم حيث اظهرت 10 عزلات بكتيريا فقط قابليتها على انتاج هذا الانزيم بينما كانت عزلتين غير منتجة . من ناحية اخرى تم الكشف عن قابلية البكتيريا على انتاج ال Sidrophores ايضا , حيث اظهرت النتائج ان جميع هذه العزلات غير قادرة على انتاج هذا العامل . في هذه الدراسة تم التحقق من قابلية البكتيريا في انتاج انزيم ال Protease حيث اظهرت النتائج ان 4 عزلات بكتيريا فقط قادرة على انتاج انزيمات ال Protease الخارجية بينما 8 عزلات غير قادرة على ذلك. تم التحري ايضا عن امتلاك بكتيريا ال Moraxella lacunata لكبسولة متعددة السكريات حيث اظهرت النتائج بان جميع العزلات تمتلك هذه المحفظة. تم اختبار قابلية البكتيريا على النمو في وجود اللايسوزايم حيث اظهرت النتائج ان جميع العزلات تستطيع مقاومة اللايسوزايم والنمو في الوسط الزرعي الحاوي على تركيز 1% منه. تم التحري عن بعض جينات الضراوة التي تم الحصول عليها من ال Moraxella bovis لاظهار التشابه الجيني بين هذه البكتيريا وبكتيريا ال Moraxella lacunata . كما تم التحري عن الجين Ferric uptake regulation gene ( fur ) المسؤول عن اخذ الحديد حيث وجد ان هذا الجين يوجد في 6 عزلات بكتيريا فقط, بينما جين Phospholipase B ( plb) يوجد في 3 عزلات فقط. من جهة اخرى تم التحري عن وجود جين Outer membrane protein (omp79) حيث وجد ان عزلة بكتيريا واحدة موجبة لهذا الجين , بينما 3 عزلات موجبة لجين Toll like receptor C ( tolC). | In this study , a total of 100 eye swabs were obtained from patients complaining from ocular infections who attended to Al - Hilla Teaching Hospital in a period ranging from November 2015 to January 2016. The patient’s ages range from 2 years to 60 years and some of the patients suffer from chronic disease such as diabetes mellitus, hypertension, and allergy. It was found that only 12% isolates are identified as M. lacunata ,76% other bacteria and 12% the swabs were negative for bacterial infection . However ,the cases that are negative for the bacterial infections (12 cases) are undergone for detection of the T. gondii Parasite. Plasma obtained from patients were tested for detection of Toxoplasma IgG and IgM antibody level by using a minividus kit . The results showed the absence of the T. gondii among all the patients that are negative for bacterial infection .Whereas the results for both the IgM and IgG antibody level are being at the low level in only 12 cases under study. The results of this study showed that all the isolates of M. lacunata are sensitive entirely to Neomycin ,Gentamycin , Ceftriaxone and Piperacillin and less sensitive to Ceftazidime and Clarithromycin. Besides, the results of this study indicated that all the bacterial isolates failed to produce colonization factor type one in the presence of D - mannose, whereas all the isolates are positive for colonization factors type three. This means that this type of the bacteria cannot form colonization factors type one in the presence of D - mannose and it is sensitive to it . The Hemolysis on blood agar was also observed in (10) isolates of the M. lacunata, while (2) isolates fail to reveal this hemolysis. On the other hand the siderophores production is also detected whereas the result showed that all the bacterial isolates fail to produce this factor. In this study we investigate the bacterial ability to produce extracellular protease enzyme, the result showed only 4 isolate have ability to produce this enzyme, while 8 cannot produce this enzyme. The capsule test is done for all the isolates of the M. lacunata and all the isolates are found to possess capsular polysaccharides. All M. lacunata isolates showed a resistance to lysozyme ,which can grow continuously in culture media containing 1% lysozyme . Molecular investigation of some virulence genes obtained from M. bovis to show homology sequence between this bacteria and M. lacunata is also used . Ferric uptake regulator gene (fur gene) was detected in 6 DNA samples of M. lacunata isolates , whereas phospholipase b gene( plb) are found only in 3 isolates . On the other hand , outer membrane protein genes (OMP79) was detected in only one isolate of M. lacunata , whereas the Toll like receptor C gene ( tolC ) present in 3 isolates.

دراسة بكتريولوجية لبعض المستحضرات الصيدلانية غير المعقمة في محافظة بابل - العراق == Bacteriological study of some non - sterile pharmaceuticals in Babylon province, Iraq

Author name: اشواق حسين كاظم الخفاجي
Supervisor name: علاء هاني الجراخ
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت ﻫﺫﻩ ﺍﻟﺩﺭﺍﺴة ﻟلتحري عن ﻤﺩى ﺘﻠﻭﺙ ﺍﻟﻤﻨﺘﺠﺎﺕ ﺍﻟﺼﻴﺩﻻﻨﻴﺔ ﺒﺎﻟﻜﺎﺌﻨﺎﺕ ﺍﻟﻤﺠﻬﺭﻴﺔ ﻭﺍﻟﻜﺸﻑ ﻋﻥ ﺍﻨﻭﺍﻉ ﻤﺤﺩﺩﺓ ﻤﻥ ﺍلاحياء المجهرية الملوثة ﻓﻲ ﻋﻴﻨﺎﺕ تم ﺍﺨﺘﻴﺎﺭﻫﺎ ﻋﺸﻭﺍﺌﻴﺎ ﻤﻥ ﺍﻟﻤﻨﺘﺠﺎﺕ الصيدلانية ﺍﻟﻤﺼﻨﻌﻪ ﻤﺤﻠﻴﺎ وايضا من الشركات المصنعة عالميا وتمت هذه الدراسة من شهرتشرين الاول لعام۲۰۱٥ الى شهر اذار لعام ۲۰۱٦ وخلال هذه الفترة جمع ۱٨۲عينة من منتجات الادوية غير المعقمة بعد تثبيت تاريخ الانتاج والانتهاء لها وتم الجمع من اماكن مختلفة ضمن مدينة الحلة في محافظة بابل. ان وجود التلوث المايكروبي في منتجات الادوية غير المعقمة لا يسبب التلوث لتلك المنتجات فحسب لكن يعد ايضا احد اهم المشكلات التي تهدد صحة المستخدمين لهذه المنتجات . تم في هذه الدراسة اختبار۱٨۲عينة من المنتوجات الصيدلانية المختلفة مثل الاقراص والشرابات والكبسول فضلا الي الادوية التي تستخدم خارجيا مثل المراهم والكريمات وايضا بعض مواد التجميل المختلفة . ووجد من خلال هذه الدراسة ان المنتجات الدوائية التي تؤخذ عن طريق الفم تحتوي على نسبة عالية من التلوث المايكروبي حيث كان بنسبة ٤,۳۲% مقارنة بالمنتجات التي تستخدم خارجيا والتي لم يتم ايجاد اي نمو مايكروبي فيها . اما فيما يخص الانواع البكترية المعزولة من خلال هذه الدراسة اعلى نسبة ظهور كان للعصيات الموجبة لصبغة غرام ملوثة بهذه البكتريا من المجموع الاجمالي للعزلات بالاضافة الى انواع اخرى تم تشخيصها حيث وجد ان ٦ عزلات تابعة لجنس Staphylococcus والتي تم عزلها من الاقراص والشرابات و٦ عزلات لجنس Pseudomonas تم عزلها من الكبسول , كل العينات المفحوصة بعد شرائها ووجدت انها ملوثة تم اجراء العد الحي لها وحسب المعايير القياسية في حين لم يتم عزل اي من الانواع البكترية Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ,and Salmonella species حيث تعتبر هذه الانواع كمعايير للدلالة على درجة التلوث المايكروبي للمنتجات الصيدلية . كذلك تضمنت هذه الدراسة التحري عن قابلية هذه الانواع المعزولة من مقاومة المضادات الحياتية حيث تبين من هذه الدراسة ان معظم الانواع البكتيرية المعزولة التابعة لجنس Bacillus كانت مقاومة للعديد من المضادات الحياتية وبنسبة (٧۰ - ۱۰۰%). كذلك اظهرت الانواع البكتيرية المعزولة الاخرى مقاومة للمضادات الحيوية المستخدمة خلال هذه الدراسة حيث وجد ان الانواع البكتيرية التابعة لجنس Staphylococcus تملك مقاومة لكثير من المضادات الحياتية ولكن وجد ان انواع تابعة لنفس الجنس كانت حساسة للمضادات وبنسبة اقل للانواع المقاومة وبالمقارنة مع العزلات التابعة لجنسPseudomonas حيث وجد انها تملك مقاومة عالية للمضادات المستخدمة وبنسبة ۱۰۰% بالنسبة للانواع التي تم عزلها خلال هذه الدراسة. | This study was carried out in October 2015 - March 2016. A total of 182 samples of non - sterile medications labeled with manufacturing and expiration dates were collected from different retailer drug stores placed within the city of Hilla (Babylon province). The contamination of non - sterile pharmaceuticals (NSPs) was not only found to cause spoilage of numerous products but was also proved to be a potential health hazard to the consumer. A total of 182 non - sterile pharmaceutical preparations of two types (Oral and topical) were subjected in the present study to microbial limit testing using standard conventional techniques. The oral NSPs samples included tablets, capsules, and syrups, while, the topical samples included ointments and creams. Microbial contaminants were recovered from 32.4 % of the tested products with oral preparations showing a higher incidence of contamination in comparison to the topical preparation that not present any bacterial growth, regarding the isolates, a total of 59 bacterial isolates were recovered with gram positive bacilli, accounting for the majority of isolates, while staphylococci and Pseudomonas each of them included only 6 isolates. Staphylococcus aureus isolates were recovered from tablet and a syrup samples; 6 Pseudomonas isolates were recovered from a capsule samples. All the examined samples immediately after purchase were found to have viable count of less or more than 102cfu/mg or ml. The indicator organisms e.g., Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Salmonella species were not found. The study also has demonstrated the ability of bacterial isolated to resistant a number of antibacterial agents. Bacillus showed high percentage of antibiotic resistance in a wide number from the isolates and the resistant percentage ranged from 70 - 100%.Regarding to the other bacterial species recovered in the present study, Staphylococcus spp. showed less Susceptible while Pseudomonas spp. showed high resistance to the antibacterial products

التحري عن بعض عوامل الضراوة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من مصادر مختلفة == Detection of Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa Isolated from Different Sources

Author name: حوراء احمد علي الشمري
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | زينب حمود السعدي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100مسحة من المرضى الذين يعانون من التهابات مختلفة مثل التهاب المسالك البولية والحروق والجروح كذلك اخذت عينات من القشع من المرضى الذين يعانون من امراض الجهاز التنفسي والذين تتراوح اعمارهم بين 15 الى 60 سنة من المراجعين والراقدين في مستشفى الحلة الجراحي ومستشفى مرجان للفترة بين من اكتوبر 2015 الى يناير 2016. وقد وجد من خلال الدراسة ان 12 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa كانت موزعة على النحو التالي ستة عزلات (%50 ) تم الحصول عليها من مرضى الحروق وثلاثة عزلات (%25) من مرضى الذين لديهم التهابات في المسالك البولية وعزلتان فقط (%6.16 )من مرضى الحروق بنسبة وعزلة واحدة فقط (%3.8) من القشع .خضعت جميع هذه العزلات لاختبار الحساسية للمضادات الحيوية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط حيث اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة كلية للامايكيسين,سيفاكسيم والتتراسايكلين.وكذلك اظهرت النتائج ان جميع العزلات اعطت حساسية بنسبة (8.34%) للببراسيلين والسيفتاراكسون ومقاومة بنسبة (91.66) لنفس المضادات المذكورة انفا .في حين ان جميع عزلات هذه البكتريا كانت حساسة كلية للمضاد الحيوي الليفوفلوكسين. واقل حساسية للمضاد الحيوي ازثرومايسين بنسبة (83.33%) .تم زراعة البكتريا على وسط سائل يحوي 5% من الدم لاختبار قابلية البكتريا على انتاج الهيمولايسين حيث وجد ان عشرة عينات لها القابلية على انتاج الهيمولايسين. وكذاك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير التراكيز المختلفة من التتراسايكلين على حركة البكتريا وتحفيز ظاهرة السوارمنك قد لوحظ ظهور السوارمنك بشكل واضح على وسط الزرع عندما يكون تركيز التتراسايكلين اقل من 0.5 ميكروغرام / مل وفي نفس الوقت لوحظ تضاؤل ظهور الصبغة مع تناقص تركيز التتراسايكلين وكذلك ظهور السوارمنك اوضح عندما تصبح الصبغة غائبة عند تركيز 0.5 ميكروغرام / مل او اقل.تم التحري عن وجود الجين toxA باستخدام بادئات حيث اظهرت النتائج ان عزلتان فقط كانت موجبة والاخرى سالبةوكذلك في هذه الدراسة تم استخدام بادئات نوعية خاصة اخرى للكشف عن toxA والتي تدعى بETA اظهر التحري عنها عن امتلاك ثمانية عزلات فقط لهذا الجين . كذلك في هذه الدراسة تم استخدام بادئات نوعية(primers) في تقنية PCR لتحري عن الجينات الخاصة ب exoenzyme S حيث تم استخدام ثلاث مواقع جينية .exos1 ,exos2,exos3اذ لوحظ جميع العزلات تحتوي على جين ,exos1 واحدى عشر عينة تحتوي على جين exos2 وبالاخير وجد تسعة عينات تحتوي على جين exos3 .اما التحري عن البروتين السطحي P.aeruginosa ( (OprIباستخدام بادئ متخصص , اذ لوحظ ان كافة العزلات كانت موجبة لهذا الجين. اضافة الى ذلك فان التحري عن امتلاك بكتريا الزائفة الزنجارية لجينOprLيظهر امتلاك ثلاث عزلات فقط لهذا الجين. تم الحصول على مستخلص P.aeruginosa بعد فصل نمو البكتري باستخدام Millipore filter حجم (0.45 مايكرو غرام) بعدها يتم تخفيفه بنسبة (1 : 1) باستخدام منزوع الايونات للماء المقطر وقد اظهرت الدراسة ان هنالك تاثير كبير على خلايا السرطان التي تدعى SW 480 من خلال زيادة في معدل التثبيط وتاثيره على الحد الادنى للتخفيف. | A total of 100 clinical samples were collected during this study which were obtained from patients suffering from different infections such as UTI , skins , burns , wounds and from sputum in patient with respiratory diseases. All the patient ages raged from ( 15 - 60 ) years old who admitted to two main hospitals in Hilla city : Al - Hilla General Teaching Hospital , and Mergan Teaching hospital during a period of three months lasting from (October 2015 to January 2016). It was found that (12)isolates of P.aeruginosa were recovered where six isolates (50%) were taken from burns patient, three isolates (25%) from catheters patient who have UTI and only two isolates (16.6%) from wounds and one isolate (8.3%) from sputum. The bacterial isolates showed entire resistant to Colistin, Amikacin, Cefixime and Tetracycline, while ,this resulte explain all the bacterial isolates show sensitivity for Piperacillin and Ceftriaxone(8.34%)and resistant (91.66%) for the same antibiotics. whereas, this results explain all the isolates entire sensitivity for Levofloxacin(100%) and lesses sensivity to Azithromycin (83.33%). P.aeruginosa was grown on liquid media containg 5% blood in order to show its ability to produce extracellular Hemolysin, and the results showed that hemolysis on blood agar was seen in (10) isolates. To detect the effect various concentrations of tetracycline on bacterial motility and swarming induction, it was seen that swarming was observed clearly in the culture media at concentration below 0.5 µg/ml, at the same time pigment appearance diminished with the decreasing of tetracycline concentration and swarming appearance where the pigment became absent at 0.5µg/ml or below. Exotoxin A was encoded by (toxA) gene was detected in Pseudomonas aeruginosa isolates by using specific primers , it was found that 2 (16.67 %) isolates of P.aeruginosa gave the positive amplicon for this gene. Also in this study, another primer was used to detect (toxA) production of molecular detection of Pseudomonas aeruginosa (ETA) was done by utilize specific PCR primer.It was found that (ETA) was observed in 8 (66.6 %) isolates positive results with molecular size (396 bp). In this study use three specific primers for exoenzyme S to detect Pseudomonas aeruginosa.It was found that exos1 at a locus 500bp was observed positive in all isolates result ,exos2 at a locus 240bp was observed in 11(92%) positive results and exos3 at a locus 270bp was observed only 9(75%) positive results Molecular detection of Pseudomonas aeruginosa (OprI) was done by utilize specific PCR primer. It was found that (OprI )marker was observed in all bacterial isolates (100%) with molecule size (250bp). On the other hand , Molecular detection of peptidoglycan - associated lipoprotein (OprL) ,was also done by using specific primer for this gene. Since (OprL) was present in 3 (25% ) positive isolates under study, with the molecular size (500 bp). Pseudomonas aeruginosa extract was obtained after filteration the growth of bacterial isolate by using Millipore filter of size (0.45µm).The extract was then diluted (1 : 1) by using deionized distilled water.The results showed that there was a huge effect on cancer cell line SW480 through increasing the inhibition rate (I.R) and the effect was reduced in the minimum dilution

دراسة تشخيصية لبكتيريا المسبحات القيحية والتوصيف الجزيئي لبعض عوامل الضراوة في مرضى التهاب الوزتين == Diagnostic Study for Streptococcus Poyogenes and Molecular Characterization for Some Virulence Factors in Tonsillitis Patients

Author name: مصطفى عبد الكريم حميد المسعودي
Supervisor name: لميس عيد الرزاق عبد اللطيف | محمد عبد كاظم السعدي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة الحصول على (100)عينة (مسحات الحلق وعينات الدم) من (100) مريض مصابين بالتهاب اللوزتين من كلا الجنسين من المراجعين الى مستشفى الحلة الجراحي (وحدة ENT) (من تشرين الثاني 2015 الى اذار 2016) تراوحت اعمار المرضى الذين شملتهم الدراسة من5 - 60 سنة. تعرض كل مسحات للزراعة الهوائية على اوساط زرعية انتقائية، وكان من مجموعة (100عينة). ظهر65 عينة بكتريا موجبة، في حين ظهرت 35 عينات زرع سالبة .ومن بين 65عينة يشتبه فقط 24 عينة من بكتريا المسبحيات القيحية . تم استخدام بادئات نوعية (primers) في تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) للتحري عن الجين الخاصة Spy1258))حيث يعتبر هذ الجين كمعيارلهذا البكتريا. وباستخدام الطريقة الجزيئيه التي تعتمد على دور هذا الجين, اظهرت النتائج وجود 13عينه من اصلا 24عينه تكون موجبه لهذا الجين ,بينما وجود عينتين اثنين فقط (2%) من اصلا 100 عينة دم تكون موجبه لهذا الجين. التوصيف الجزيئي لهذا البكترياThe pyrogenic exotoxin(SpeA, SpeB, SpeC) يتم باستخدام بادئات خاصه حيث اظهرت النتائج وجود عينتين(15.38%) من جين SpeA))من اصلا 13عينه بينما اوجد الدراسة عينتين(100%) لهذا الجين بالدم . وكذلك اظهرت النتائج وجود 7عينات (53.7%)من جين(SpeB)من اصلا13,وكذلك وجد عينتين بالدم.وايضا اظهرت النتائج وجود6عينات (46.15%)من جين (SpeC) من اصلا 13 عينه بينما وجد عينه واحدة فقط بالدم (50%).The streptokinase(Ska) حيث اظهرت النتائج وجود 9عينات(69.2%) من اصل 13عينه لهذا الجين ,بينما وجد عينتين لهذا الجين بالدم(100%).The multiple gene activator (Mga) حيث اظهرت النتائج وجود 6عينات(46.15%) من اصلا 13 عينه لهذا الجين,بينما اظهرت الدراسه عدم وجود هذا الجين بالدم. باستخدام لوحة زراعة الانسجة كان تكوين biofilm قوي بنسبة (79.9%).وبنسبة( 23%) كان تكون biofilmمتوسط بينما اظهرت النتائج عدم وجود تكون ضعيف لbiofilm. تم في هذا الدراسة دراسة تاثير كل من خل التمر وخل التفاح وخل العنب ,حيث اظهرت النتائج ان خل التمر له القدرة على منع تكوين biofilm بنسبة(100 %).اما بالنسبة لخل التفاح فكانت نسبة (92.3%) واظهرت النتائج ان نسبة خل العنب (84.6%). خضعت جميع العزلات لاختبار الحساسية للمضادات الحيوية .وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا كانت حساسة بشكل تام (100%) لكل من Imipeneme وMeropenem.ولكنها حساسة بدرجة متوسط لكل من Ceftriaxon وAzithromycinو Amoxicillinو Tetracyclineو Clarythromycin . كما واظهرت العزلات مقاومة ل Erythromycin . تم جمع عينات الدم من كلا المجموعتين لقياس المعيار المناعي (IFN - γ)بطريقة الامتزاز المناعي المرتبط بانزيم.حيث اظهرت النتائج انه لايوجد فرق معنوي بين مجموعة المصابين ومجموعة الاصحاء((p<0.05. | In this study, one hundred throat swabs and blood samples obtained from patients suffering from tonsillitis from both sex who were attending to an ENT unit in Al - Hilla General Teaching Hospital during a period of three months from (October 2015 to January 2016). The patient’s age ranged from (5 - 60) years. All swabs were subjected to aerobic culturing on selective media and it was out of the total of (100 samples). 65 samples showed positive bacterial culture, while 35 samples showed negative culture. Among 65 only 24 isolates of S.pyogenes were suspected. In this study the specific primer Spy1258 (encoding a putative transcriptional regulator) that consider the golden stander for strep pyogenes and the results of this study found only 13 isolates out of 24 isolates from throat swab of S.pyogenes were positive to this primer, while only 2 samples out from 100 blood samples give positive result were detected by molecular method focusing on the role of Spy1258 gene. Molecular detection of S. pyogenes (SpeA, SpeB, SpeC) were done by using specific primer. It was found that SpeA was observed in two (15.38%) isolates from throat swab, while it was found that two (100%) samples from patients' blood of S. pyogenes give positive results for this gene. Also the (SpeB)was found that two (100%)samples from patients' blood of S. Pyogenes contain this gene, while it was observed in 7 isolates out of 13 at percentage(53.8%) isolates from throat swab. On the other hand, it was found that SpeC was seen in six (46.15%) isolates from throat swab, while it was found that one (50%) samples from the patient's blood of S. pyogenes give positive results with this gene. Moerever, streptokinase (Ska) was also detected in S.pyogenes, It was found that Ska was observed in 9 isolates (69.2%) from throat swab, while it was found that two (100%) samples from the patients blood of S. pyogenes contain this gene. Multiple gene activator (Mga) was detected by using specific primer. It was found that Mga was observed in 6 isolates (%46.15) from throat swab, while it was no found this gene in blood samples Biofilm formation was also investigated by using Tissue culture plate. It was shown that biofilm formation was (76.9%) strong biofilm formation, (23%) moderately biofilm formation and no isolates that express non biofilm formation. The effect of dates vinegar, apple vinegar and grape vinegar on bacterial isolates were studied and the results showed that date vinegar prevented biofilm formation in 13(100%) biofilm producer isolates of S. pyogenes. While Apple vinegar prevented biofilm formation in 12 (92.3%) biofilm producer isolates of S. pyogenes. Also, in the third type; Grape vinegar there were two isolates not eradicated, while 11 (84.6%) isolates were eradicated depending on biofilm criteria. All the identified S. pypgenes isolates were subjected to in vitro antibiotics susceptibility test by modified Kirby - Bauer disc diffusion method. It has been found that S. pyogenes isolates were completely sensitive (100%) to Imipenem, Meropenem and moderate to ceftriaxone, Azithromycin and clarithromycin at ratio 80%, 78%, 76.9% respectively. But lesser to each of Amoxicillin and Tetracycline was 54%, 55%, respectively, and the results showed that resistance to erythromycin about 84.6%. Blood samples were collected from patients and control groups to estimate ELISA test for cytokines (IFN - γ)and the results shown and no significant differences (p>0.05) between patients (593 pg/ml) and controls (567.77 pg/ml).

الدراسة المظهريه والجزيئية لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Acinetobacter baumannii المعزولة من مرضى الجروح والحروق في مدينة الحلة == Phenotypic and Molecular Study for some Virulence Factors of Acinetobacter baumannii Isolated from Patients with Wounds and Burns in Hilla City

Author name: زهراء عبد المهدي مجباس العجيلي
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | ميساء صالح الشكري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: This study is devoted to the isolation and identification of Acinetobacter baumannii; indeed seven isolates of A.baumannii had been isolated and identified from 100wound swabs collected from 100 patients with wound infection. The isolates obtained had been cultured in selective media and biochemicaly identified. Furthermore, the sensitivity of isolates to a variety of antibiotics had been investigated. It was found that these isolates were been sensitive to more than one antibiotic. It was found that these isolates had been resistant 100% to Ampicillin and Cloxacillin, whereas the isolates were resistant to Cefepime clavulanic acid, kanamycin and gentamycin at (71.4%). And (57.1%) of isolates showed resistance to Amikacin, and finally only (14.2%) were resistant to Azathromycin. Some virulence factors of this bacteria were studied and the results showed that all bacterial isolates 7(100%) produced (the adherence, biofilm formation, gelatinase production and siderophore),while the ability of the bacteria to produce capsule and bacteriocin were in 57.1% . Also, All isolates are unable to produce haemolysin. Extracellular protease was also investigated .It was found that 5 (71.4%) of isolates were able to produce extracellular protease. Furthermore, some virulence factors had been detected by molecular techniques as polymerase chain reaction PCR and it had been found that only 2(28%) of isolates gave positive result for cnf1 at 498bp, 4(57.1%) of them gave positive result for kps at 272bp, 2(28.5%) of them gave positive result for PAI at 930bp, 5(71.4%) of them gave positive result for ibeA at 170bp, 1(14.2%) of them gave positive result for sfa at 240bp,while, 4(57.1%) of them gave positive result for iutA at 300bp, papG gene was not found in all isolates of A. baumannii in this study

الخصائص الجزيئية لبعض عوامل الضراوة لعزلات Candida albicans المعزولة من ثنيات مرضى السكري في الفرات الاوسط == Molecular characteristic of some virulence factors of Candida albicans isolates from intertrigo in diabetic patients in middle Euphrates

Author name: ايه سامي كريم الصدام
Supervisor name: لميس عبد الرزاق الخفاجي | كريمة امين الخفاجي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسه باخذ مسحات من 180 شخص منهم مرضى للسكري واشخاص اصحاء من المراجعين لمستشفى مرجان التعليمي من شهر تشرين الثاني 2014 الى شهر نيسان 2015 .مئه وثلاثين شخص تم فحصهم من مرضى للسكري وخمسين اخرين اصحاء . مئه شخص (76.92 % ) وجدو مصابين بالمبيضات ( 96 % ) منهم بشكل عزلات منفرده و( 4 % ) اخرين بشكل عزلات مشتركه . اما في الاشخاص الاصحاء كانت نسبه الاصابه بالمبيضات ( 32 % ) وجميعهم على شكل عزلات منفرده فقط .و كانت نسبه الاناث المصابه ( 70 % ) اما الذكور ( 30 % ) وكانت كذلك الاصابه اعلى في مجموعه الاشخاص الذين تتراوح اعمارهم بين ( 22 - 41) سنه . وكما وجدت منطقه تحت الاثداء هي الاكثر نسبه في الاصابه في النساء وتليها منطقه ما بين الافخاذ في كلا الجنسين , حيث كانت المبيضات البيض هي الاعلى نسبه في منطقه تحت الاثداء .و تم التعرف عليها بالفحص المباشر ,الزرعات المختبريه ,الاختبارات الكيموحياتيه وبالاضافه الى العده التشخيصيه الخاصه بالمبيضات , وتم ايضا بواسطه استخدام تقنيه ال (PCR).حيث تم عزل عده انواع لجنس ال Candida, كانت ال C. albicans هي الاكثر انتشارا ( 51 % ) , C. tropicalis(% 33 ) , C .parapsilosis ( 5 % ) , (C. Glabrata (5 % وC. dubliniensis ( 2 % ). الكشف الجزيئي عن ال C. albicans تم بواسطه استخدام الجين الخاص لها (calb 1 ) عن طريق تقنيه ال PCR .بالاضافه لذلك وجدت في هذه الدراسه قابليه المبيضات البيض على انتاج الفوسفولايبيز بنسبه (22.72 % ) وكذلك الانزيم المحلل للبروتين (31.81 % ) .تم الكشف عن ال (plb1 ) في عزلتين فقط وهذه العزلات لها القابليه على انتاج الفوسفولايبيز ظاهريا والتي تسبب غزو للنسيج . بالاضافه لذلك ( hwp 1 ) وجد بنسبه 90.09 % من عزلا ت ال C . albicans الذي يمكنها من النمو الخويطي والالتصاق وتكوين ال biofilm .( als 1) الموجود في كل عزلا ت ال C. albicans وهذه النتيجه وجدت ايضا في ال int 1 α, الاول مسؤل عن التصاق الفطر بالخلايا الطلائيه , اما الاخر مسؤل في الالتصاق على الاسطح وتكوين ال germ tube .Sap 1 جين اساسي في انتاج البروتنيز المحلل , هذا الجين وجد بنسبه 59.09 % في العزلات. تكوين ال biofilm لوحظ ايظا بواسطه استخدام لوحه زراعه الانسجه التي اظهرت ان 40.9 % من العزلات تعطي نتيجه قويه و59.1 % تعطي نتيجه ضعيفه ولا توجد عزلات لم تنتج ال biofilm . وقد اظهرت الدراسه ان مستخلص الثوم يقلل وبشكل فعال تكوين ال biofilm في 100 % ولا وجود للbiofilm القوي . كما وجد ايضا ان مستخلص الثوم ه القابليهعلى تثبيط النمو بواسطه تكوين حلقه بقطر 3 سم | In this study , a total 0f 180 skin swabs obtained from diabetic and non diabetic patients who were attended to Marjan medical City for detection of candidal intertrigo infection , during the period ranging from November (2014) to April (2015) , for study the infection rate in both groups and study the virulence factors of Candida albicans and also study other virulence gene .One hundred and thirty diabetic patients and fifty nondiabetic patients were tested with intertrigo infection . One hundred diabetic patients ( 76.92 % ) carried candida in their skin folded areas , which present as a single isolates ( 96 % ) and as a combination ( 4 %) . while in the healthy individuals 16 ( 32 % ) as a single isolates only . The infection rate in females was ( 70 %) and males (30 % ), the infection was more common in the age groups ( 22 - 41 ) years old . The underbreast area of the femals having the highest infection rate followed by inner thighs in both males and females , and C. albicans found more prominent in the underbreast area . Cultural characteristic and biochemical criteria revealed that ( 51 %) of isolates were C. albicans , which is more prominent followd by C . tropicalis (33 %) , C. parapsilosis and C . glabrata ( 5 % ) and C. dubliniensis ( 2 % ).This study also revealed that C. albicans is able to produce phospholipase enzyme in ( 22.72 % ) of the isolates , and also produce proteinase enzyme in ( 31.81 % ) of the isolates .Molecular detection of C. albicans was done by using specific PCR primer , and the molecular detection of phospholipase gene was done by using specific PCR primer. It was found that plb 1 was observed in only three C. albicans isolates out of twenty two ( 13.63 % ), and these positive isolates have the ability to produce phospholipase phenotypicaly and cause the invasion of the C. albicans. In addition hyphal wall protein 1 were produced from ( 90.9 % ) of C. albicans isolates which have the ability for filamentous growth , adherence and biofilm formation .Agglutinin like sequence 1 which present in all isolates and also this result as the same as that of alpha integrine like sequence 1 , the first one cause this fungi to adhere to the epithelial cells, and the other one involve in surface attachment and germ tube formation . Finally secreted aspartyl proteinase1 is essential to produce proteolytic proteinase . This gene was detected by specific PCR primer; it was observed that( 59.09 % ) of isolates gave positive result of this gene.Biofilm formation was also investigated by using tissue culture plate . It was shown that (40.9 % ) of isolates gave positive biofilm formation ,and ( 59.1 % ) negative biofilm formation.Fresh garlic extract able to inhibit candida albicans growth by forming zone of inhibition in 3 cm . Regard effect of (50 %) on biofilm formation, the result of this study demonstrated that fresh garlic extract effectively reduced the biofilm forming C. albicans in (100%) and no strong formation.

الكشف عنcag جين وجينات الضراوة الاخرى من بكتريا القولون المسببة لالتهاب المجاري البولية في مدينة بابل == Screening for cag Genes and Other Virulence Genes Among Escherichia coli Isolated From Patients With Urinary Tract Infection In Babylon City

Author name: ياسمين رياض سعيد العزاوي
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | محمد رضا جودي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: في هذه الدراسة، تم جمع (100) عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و(25) عينة خروج من افراد اصحاء كعينة ضابطة، من كلا الجنسين في مستشفى الحلة الجراحي خلال الفترة من شباط 2015 الى ايار 2015.ثمانون عينة فقط اظهرت نمو على الاوساط الاختبارية. و40 عينة كانت حاملة ل E.coli بنسبة 10(25%) عزلة من الذكور و30(75%) عزلة من الاناث. اضافة الى ذلك تم تشخيص (7) عزلات E.coli من عينات الخروج لاشخاص اصحاء .اظهرت الدراسة ان 20(50%) من عزلاتUPEC تمتلك القابلية على انتاج الهيمولاسين خارخ الخلية على وسط اكار دم الانسان بنسبة 15(37,5%) الفا هيمولايسين و5 (12,5%) بيتا هيمولايسين . اما باقي العزلات 20 (50%) كانت غير قادرة ع انتاج الهيمولايسين.تضمنت الدراسة ايضا الكشف الجزيئي عن cag A جين لمشاهدة Sequence homology لهذا الجين في بكتريا H.pylori وE.coli بواسطة تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) حيث لوحظ ان كافة عزلات البكتريا اظهرت نتيجة سالبة لهذا الجين . وقد لوحظ ايضا نفس النتيجة ل cag E جين.اما التحري عن vir BII جين باستخدامprimer , فقد لوحظ ان 5(71,4%) عزلة بكتيرية من عينات الخروج و25(62,5 %) عزلة بكتيرية من عينات الادرار كانت ايجابية لهذا الجين , الذي لم يسبق دراسته في بكتريا E.coli . هذه النتيجة مؤشر لوجود sequence homology لهذا الجين مع جين بكتريا H.pylori .كما تم فحص عزلات UPEC )) للكشف عن وجود جينات الالتصاقpap, sfa, afaI) ) بواسطة (PCR). حيث وجد ان 26(65%) عزلة ادرار كانت تحملpap جين. و25(62%) عزلة تحمل sfaجين. بينما afaI جين يوجد في 17(42%).كذلك الكشف الجزئي عن جينات (cnf I and cnf II). ووجد ان cnf I كان ايجابيا في 21(52%) عزلة ، بينما cnf II لم يتم تحديده في اي عزلة.اظهرت الدراسة ايضا ان aer جين متواجد في 25(62,5%) من العزلات. اما hly جين فانه موجود في 18(25%) من العزلات.بالاضافة الى ذلك تم دراسة تاثير بعض المضادات الحياتية على عزلات بكتريا القولون المعوية. وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا حساسة بنسبة 100% الى Imipenem واقل حساسية 60% الى Nitrofurantoin و55% الى Amikacin . لكن بقية العزلات اظهرت نسب مختلفة من المقاومة لمضاد واحد او اكثر من المضادات الحيوية مثل Ceftazidim 80% وCeftriaxone 87,5 % , وبدرجة اقل من المقاومة لكل من Levofloxacin 62,5% وTrimethoprim - Sulfametoxazole 77,5% . | In this study, a total of (100) urine specimens obtained from patients suffering from Urinary Tract Infection and also, 25 stool samples were taken from healthy individual as control group were included, from both sexes who admitted to Al - Hilla Teaching Hospital Babylon during a period from February (2015) to May (2015). The urine and stool samples were then cultured on selective media to isolate Escherichia coli. Only 80 samples showed positive culture growth. It was found that only 40 isolate of E. coli were isolated where 10 (25%) of the isolates from male patient and 30 (75%) from female patients. Moroever, 7 isolates E.coli were isolated from stool samples of human individual.The ability of uropathogenic E.coi (UPEC) to produce extracellular hemolysin was studied, and it was found that 20 (50%) out of 40 isolates of E. coli were able to produce hemolysin on human blood agar, whereas15 (37.5%) were found α - hemolytic and 5 (12.5%) β - hemolytic. Other isolates of E. coli 20 (50%) had no ability to produce hemolysin.On the other hand, molecular detection of cytotoxic associated gene A (cagA) to show the sequence homology of this gene in Helicobacter pylori and E.coli. by PCR technique showed that all isolates of E.coli from urine and stool gave negative result for this marker, which confirm that there is no sequence homology of this gene with that present in H. pylori.The same results were seen with cytotoxic associated gene E (cagE) by using specific marker, where all isolates from urine and stool samples gave negative result to this gene. Moreover, the isolates of E. coli were subjected to show their possession of virB II gene, by using specific marker. It was observed that 25 (62.5%) of bacterial isolates from urine and 5 (71.4%) of bacterial isolates from stool gave the positive result for this gene, which is not previously detected in E. coli. This result indicate to found sequence homology of this gene with that present in H. pylori.Besides, the isolated UPEC were examind for the presence of the adhesion genes (pap, sfa, afaI) by PCR assays. It was found that pap gene was present in 26 (65%) isolates and sfa gene present in 25 (62.5%). While afaI gene present in 17 (42%) of isolates. Molecular detection of cytotoxic necrotizing factor I and II (cnf I and cnf II), was also studied by using specific markers. It was seen that cnf I gene was positive in 21 (52.5%) isolates of E. coli. While cnf II gene was not observed in any isolates of E.coli. Aerobactin (aer) and hemolysin (hly) genes, is also investigated by using specific markers; it was found that aer gene was present in 25 (62.5 %) of isolates and hly gene present only in 18(45%). Finally, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics has been investigated. It has been found that E. coli isolates were sensitive to imipenim at a rate (100%), and lesser to nitrofurantoin 60% and amikacin 55%. But most of them showed different mode of resistance to antibiotics used in this study as Trimethoprim - Sulfamethoxazole 77.5%, Ceftazidim 80%, levofloxacin 62.5%, Ceftriaxone 87.5%.

التوصيف المظهري والجزيئي لبكتريا Staphylococcus saprophyticus الممرضة البولية المعزوله من النساء المصابات بالتهاب المثانة == Molecular and Phenotypic Characterization of Uropathogenic Staphylococus Saprophyticus Isolated From Women With Cystitis

Author name: فرح علاء عبد الحسين الوائلي
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | زينب حمود السعدي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة جمع وزراعة (140)عينة من منتصف مجرى عينة الادرار التي جمعت من (140) مريضة مصابات بالتهاب المثانه وممن احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي العام ومن العيادة الخاصة للفئه العمريه من 16 - 55 سنة (من اكتوبر 2014 الى يناير2015) وقد تم عزل وتشخيص 14 عزلة فقط من بكتريا Staphylococcus saprophyticus. وقد تمت دراسة بعض عوامل الضراوه المسؤوله عن امراضية هذه البكتريا فقد اظهر اختبار وجود المحفظه للعزلات البكترية بان عزلة واحده فقط من بكتريا S.saprophyticus تحتوي على المحفظه في حين تخلو العزلات ال13 الاخرى منها . ايضا تضمنت هذه الدراسة التحري عن وجود عوامل الاستيطان الاول CFAI)) والثانيCFAII) ) والثالث(CFAIII). وقد اظهرت النتائج بان 13 عزلات اي 92% تمتلك عامل الاستيطان الاول (CFAI) في حين تمتلك عزلة واحده من هذه البكتريا اي 7% عامل الاستيطان الثاني CFAII)), اما بالنسبه لعامل الاستيطان الثالث (CFAIII) فقد اظهرت النتائج بان مايقارب 21% اي 3 عزلات من هذه البكتريا لديها القدره على انتاج هذا العامل . كما اظهرت النتائج ان جميع عزلات S. saprophyticus غير محلله للدم اي غير منتجة للهيمولايسين عندما تنمو على وسط اكار الدم، في حين ان جميع العزلات كانت قادرة على انتاج انزيم اليورييز. وقد تم الكشف عن وجود انزيم البروتييز الخارجي فقد وجد ان 2 (14٪) من هذه البكتيريا كانت قادرة على انتاج هذا الانزيم ، في حين 12(86٪) لم تكن تملك القدرة على انتاج هذا الانزيم .اما بالنسبه للانزيم المحلل للدهون (اللايبيز) فقد اظهرت النتائج بان 8 (57٪) من بكتريا S.saprophyticus كانت قادرة على انتاج انزيم اللايبيز. ايضا شملت الدراسه قابلية البكتريا تكوين الغشاء الحيوي في جميع العزلات البكتيرية وقد وجد ان عزلتين فقط لها القابليه على تكوين الغشاء الحيوي اما العزلات البقيه فقد اظهرت عدم قابليتها على تكوينه . ايضا اظهرت الدراسة بان الغالبية العظمى من العزلات(12) عزلة لها القابلية على انتاج عامل الالتصاق بالخلايا البولية الطلائية Addherence factor)) . كما تم الكشف عن انتاج البكتريوسين من قبل S.saprophyticus وقد اظهرت العزلات نتائج مختلفة لهذا الاختبار ضد انواع مختلفة من البكتيريا التي تشمل E.coli) P.auroginosa)،and S.epidermides, S. penumoniea، وKlebsiella) لكن لم تنتج اي من هذه العزلات مبيد جرثومي ضد E.coliاو P.auroginosa، في حين ان (28٪) منها انتجت مبيد جرثومي ضد Klebsiella و(35٪) منها ضد S.epidermides و2 (14٪) مقابل S.pneumonie اما من ناحية اختبار الحساسية للمضادات الحيوية فان جميع هذه العزلات قد خضعت لهذا الاختبار وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا حساسة بشكل تام 100% لكل من Levofloxacin , Cefoxitin, Imipenem , vancomycin .ولكنها حساسة بدرجة اقل لكل من Ciprofloxacin و. Trimethoprime - Sulfamethoxazoleكما واظهرت العزلات مقاومه100% لكل من Nalidixic acid وOxacillin .ولكن بدرجة مقاومه اقل للمضادات Methicillin وGetamycin اما من ناحية الكشف والتشخيص الجزيئي فقد تم استخدام بادئات نوعيه Primer) ) في تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR للتحري عن الجينات الخاصة بانتاج (uafA) بروتين وقد اظهرت النتائج بان جميع العزلات البكترية تمتلك هذا الجين الخاص بالبروتين المسؤول عن الالتصاق بالخلايا الطلائية للقناة البولية. ايضا بواسطة نفس التقنية تم التحري عن الجين المسؤول عن انتاج المحفظة في هذه البكتريا capD وقد اظهرت النتائج بان عزلة واحدة فقط من بكتريا S.saprophyticus تمتلك هذا الجين . وعلاوة على ذلك، تم الكشف عن الجين المسؤول عن انتاج البروتين الالتصاقي المحلل Aas من قبل هذه البكتريا وقد بينت النتائج بان جميع العزلات اظهرت نتائج ايجابيه لهذا الجين وبنسبة 100% . كما تم التحري عن الجين المنتج للبروتين المسؤول عن الارتباط بالكولاجين في هذه البكتيريا واظهرت هذه الدراسة ان عزلة واحدة فقط تمتلك هذا الجين.بالاضافة الى ذلك، في جميع العزلات البكتيرية تم الكشف عن الجين المسؤول عن تشفير وانتاج انزيم اللايبيز Ssp في بكتريا S.saprophyticus باستخدام بادئات نوعية خاصة . وقد اظهرت نتائج البحث في هذه الدراسة بان 14(100٪) من العزلات تمتلك هذا الجين. في هذه الدراسة اتضح ان جينات الضراوه (UafA, Aas , and Ssp) هي الاكثر شيوعا بين العزلات وكذلك اظهرت الدراسه قدرة هذه البكتربا على انتاج الباكتريوسين ضد البكتريا السالبه لصبغة غرام | In this study, a total of 140 mid stream urine specimen were collected from women suffering from cystitis who attended to Hilla General Teaching Hospital from November 2014 to February 2015 to detect the occurrence of Staphylococcus saprophyticus among the collected specimens. The patients age ranged from 16 to 55 years. Only 14 isolates were identified as Staphylococcus saprophyticus . Some virulence factors were studied by phenotypic method in S.saprophyticus isolates. The capsule was present in only one isolate out of 14 whereas the other 13 isolates in this study did not possess the capsule. Colonization factor antigens were also detected in all isolates. It was found that 13(92%) of isolates had CFAI , while 1(7%) of them had CFAII and 3(21%) had the ability to produce CFAIII. The results also showed that all isolates of S. saprophyticus did not produce hemolysin, while all isolates were able to produce urease enzyme. Extracellular protease were also investigated. It was found that 2(14%) of this bacterium were able to produce extracellular protease, whereas the other 12(86%) didn’t have the ability to produce this enzyme. The ability of S.saprophyticus to produce lipases was identified and the results showed that 8(57%) of S.saprophyticus were able to produce lipase enzyme. Biofilm formation was investigated in all bacterial species, and the results showed that only 2(14%) of the isolates that form biofilm ,while the result of adherence test showed that 12(85%) of this bacterium had the adherence activity to attach to the uroepithelial cells. Also the investigation of bacteriocin production in S.saprophyticus revealed that the isolates had shown different results for this test against different types of bacteria that include (E.coli or P.auroginosa, S.epidermidis , S. penumoniae , and Klebsiella) but no one of them had bacteriocin against each of E.coli and P.auroginosa , while 4( 28%) of them had produced bacteriocin against Klebsilla and 5(35%) of the isolates had bacteriocin against S.epidermidis while 2(14%) against S .pneumoniae. All the isolated S.saprophyticus bacterium from urine specimen were submitted to in vitro antibiotics sensitivity test by Kirby - Bauer disc diffusion method . It had been found that S.saprophticus isolates were sensitive (100%) to Cefoxitin , Imipenem , Levofloxacin and Vancomycin but lesser to each of Ciprofloxacin and Trimethoprime - Sulfamethoxazole . However , the isolates showed resistance to Nalidixic acid and Oxacillin , but in a lesser degree to Methicillin . Molecular detection of Ubiquitous uro - adherence factor A was made by using specific PCR primer . This marker was shown to be present in all isolates of this bacterium ,while the molecular detection of the capsular polysaccharides gene capD had shown that only one isolate 1(7%) had this gene and gave positive result for this primer. Moreover, Autolysin - adhesin surface protein Aas was also detected in S.saprophyticus . It was shown that all isolates 14(100%) gave positive result for this gene. The collagen binding protein gene sdrI was also investigated in this bacteria and this study had shown that only one isolate possess this gene.In addition to that , the surface associated protein gene of S.saprophyticus Ssp was detected in this study by using specific primer in 14(100%) of isolates, this gene is responsible for lipase encoding . In this thesis it was found that the virulence factor genes (UafA, Aas , and Ssp) are more common among isolates of S.saprophyticus and this bacteria were able to produce bacteriocin against Gram negative bacteria.

التوصيف الجزيئي لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Streptococcus pneumoniae المعزولة من الاطفال المصابين بالتهاب الاذن الوسطى الحاد == Molecular characterization of some virulence factors of Streptococcus pneumoniae isolated from children with acute otitis media

Author name: شيماء عبد العباس محمدعلي الطائي
Supervisor name: لميس عبد الرزاق عبد اللطيف | صفاء حسين الطريحي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: في هذه الدراسة تم الحصول على 120 مسحة من الاطفال المصابين بالتهاب الاذن الوسطى المراجعين لمستشفى الحلة التعليمي (شعبة الانف والاذن والحنجرة) للفترة من تشرين الثاني 2014 الى كانون الثاني 2015 والذين تراوحت اعمارهم من شهر واحد الى 12 سنة . وقد تم عزل وتشخيص 8 عزلات فقط من بكتريا Streptococcus pneumoniae . خضعت جميع العزلات لاختبار الحساسية للمضادات الحيوية .وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا كانت حساسة بشكل تام (100%) لكل من Tetracycline Clarithromycin وMeropenem.ولكنها حساسة بدرجة اقل لكل من Vancomycin, Imipeneme وCloxacillin . كما واظهرت العزلات مقاومة Cefotaxime في حين كانت مقاومة وبدرجة اقل لكل Amoxy - clavulanic acid, وOxacillin . تم استخدام بادئات نوعية (primers) في تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) للتحري عن الجينات الخاصة بانتاج (ply) جين وقد اظهرت النتائج امتلاك اربع من العزلات لهذا الجين, وقد وجد ايضا ان هذه العزلات الموجبة لها القابلية على انتاج hemolysin خارجي . اضافة الى ذلك وجدت نتائج مماثلة لجين (LytA) حيث وجد ان نفس العزلات الاربعة اعطت نتائج موجبة لهذا الجين . اضافة الى ذلك فان التحري عن امتلاك Streptococcus pneumoniae لجين (LuxS) يظهر امتلاك خمس عزلات فقط لهذا الجين . كما وجد ان جينات (nan A) عنصر اساسي في الاستعمار الناجح في القنوات التنفسية وان هذه الجينات حددت بواسطة بادئات ( Primers) خاصة بواسطة تقنية PCR وقد اظهرت النتائج اعطاء جميع العزلات نتائج موجبة لهذا الجين. اضافة الى ذلك فان التحري عن جين (PsaA) قد تم باستخدام تقنية PCR قد درست ايضا وقد اظهرت النتائج بان اثنين من العزلات فقط اظهرت نتائج موجبة لهذا الجين . كما تم التحري عن جين (CpsA) بواسطة استخدام تقنية PCR ,وقد اظهرت النتائج امتلاك العزلات كافة لهذا الجين وان هذه النتيجة تدعم النتائج التي تم الحصول عليها phenotypically حيث وجد ان جميع العزلات اعطت نتائج موجبة للكبسول وهذا الجين يعتبر housekeeping جين . كما تم التحري عن الجين (α - Eno) باستخدام تقنية PCR, وقد اظهرت النتائج امتلاك خمس من العزلات لهذا الجين. وقد تم التحري عن تكوين الغشاء الحيوي biofilm بواسطة لوحة زراعة النسيجية حيث اظهرت النتائج تكوين biofilm بصورة قوية بنسبة 87.5% وتكوين biofilm بصورة متوسطة بنسبة 12.5 % وعدم وجود بكتريا غير قادرة على تكوين biofilm . بالاضافة الى ذلك تم دراسة تاثير سكر Xylitol على نمو بكتريا Streptococcus pneumoniae وقد وجد ان وجود سكر Xylitol بتركيز 3% يسرع بدخول البكتريا الى طور الثباات stationary phase .كما تم التحري عن تاثير سكر Xylitol بتركيز 5% على تكوين biofilm ,واظهرت النتائج قابلية سكر Xylitol على تفليل تكوين biofilm بنسبة 100%. | In this study , a total 0f 120 ears swabs obtained from children suffering from otitis media who were attended to Al - Hilla Teaching general Hospital (ENT unit) during the period ranging from November (2014 ) to March (2015). The patient age ranged from (1months - 12 years). Only eight isolates of S. pneumoniae were isolates. All the identified S. pneumoniae isolates from ear swabs were subjected to in vitro antibiotics susceptibility test by modified Kirby - Bauer disc diffusion method . It has been found that S. pneumoniae isolates were sensitive (100%) to Tetracycline , Clarithromycin and Meropenem. But lesser to each of Vancomycin, Imipeneme and Cloxacillin. However, the isolates showed resistance to Cefotaxime , but in a less degree to Amoxy - clavulanic acid, and Oxacillin. Molecular detection of Pneumolysin (Ply) gene was done by using specific PCR primer. It was found that Ply was observed in only four bacterial isolates, and these positive isolates have the ability to produce extracellular hemolysin. In addition, the same result was seen in autolysin (LytA) where the same four isolates give positive result for this gene. Moreover, luminescence (Lux S) was also detected in Streptococcus pneumonia isolates .It was shown that only five isolates gave positive result with this gene . It was found that neuraminidase (NanA) is essential for successful colonization of respiratory track, these genes was detected by specific PCR primer; it was observed that all isolates gave positive result of this gene. Besides, two isolates gave positive result for pneumococcal surface antigen A (psaA) gene when it was be detected through using PCR primer. Capsular polysaccharide synthesis (cpsA) was detected by using specific PCR primer. It was found that all isolates gave positive result for this gen and this result was confer phenotypically were all isolates gave positive results for capsule this gene was designated as housekeeping gene. In addition to that, specific PCR primer was used for detection of α - enolase gene. It was found that α - Eno was observed in five isolates of S. pneumoniae. Biofilm formation was also investigated by using Tissue culture plate. It was shown that biofilm formation was (87.5%) strong biofilm formation, ( 12.5 % ) moderately biofilm formation and no isolates that express non biofilm formation . Regard the effect of xylitol on bacterial growth was likewise studied which indicated that xylitol at (3%) concentration could cause accelerate the entrance of bacteria in the stationary phase when it is toxic to this bacteria. In addition, the effect of xylitol (5%) on biofilm formation was also studied, it was found that the result of this study demonstrated that xylitol effectively reduced the biofilm forming bacteria from weak to (100%) and no strong formation.

الكشف عن اصابات بكتريا التدرن Mycobacterium tuberculosis باستخدام تقنيات تشخيصية مختلفة في محافظة بابل == Detection of Mycobacterium tuberculosis Infections using Different diagnostic Techniques in Babylon Province

Author name: عبد الستار اسود كوكز
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | هادي محمد علي الموسوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف الدراسة الى المقارنة بين بعض التقنيات المستخدمة في التشخيص السريع لمرض التدرن في محافظة بابل باستخدام كل من Gene X - pert وAFB وReal Time PCR. وكذلك التحري عن معايير المناعية التي تتضمن التركيز المصلي لكل من IL - 2 وIgG وIgM لمصول مرضى التدرن. جمعت العينات المطلوبة لانجاز العمل من (60) شخص يشتبه اصابتهم بمرض التدرن والذين راجعو المركز التخصصي للامراض الصدرية والتنفسية بمدينه الحلة خلال الفترة من شباط الى حزيران 2015. بينت النتائج ان نسبه مرضى التدرن من الذكور هي 64% والاناث 36%, ضمن مدى الاعمار (15 - 74سنه) .اظهرت نتائج هذه الدراسة بان تشخيص مرض التدرن باستخدام كل من Gene X - pert وReal Time PCR نسبة حساسيه لكليهما بالنسبة لAFB موجب 100%. لكن Gene X - pert قد سجل 66% وReal Time PCR قد سجل 58% بالنسبة لAFB سالب. ونسبة الحساسية ل AFB 16,6%.حددت تسعة وثلاثون عينه موجبه لبكتريا التدرن من مجموع 60 مريض مشتبه اصابتهم ببكتريا التدرن قد حددت باستخدام Gene X - pert وكان منها (10 عينات عالية المقاومة و13 عينة متوسطة المقاومة و11 عينة واطئة المقاومة و9 عينات حساسة ) ل Rifampicin.اظهرت المعايير المناعية وجود زياده معنوية في معدل تركيز IL - 2 في مرضى التدرن غير المعالجين على حساب المعالجين ومجموعة السيطرة وكذلك زيادة في المعالجين على حساب مجموعة السيطرة. بين المتوسط الحسابي IL - 2 لغير المعالجين اعلى قيمة (196,429±69,139 بيكوغرام/ملي لتر) ويليه للاشخاص المعالجين (96,997±27,113 بيكوغرام/مليلتر) والاصحاء (78,997±0,909 بيكو غرام/مليلتر). عندما كانت قيمة P. value بين المرضى غير المعالجين والمعالجين (0,003) وجود زياده واضحه. وغير المعالجين ومجموعة السيطرة (0,005) وجود زياده واضحه. والمعالجين ومجموعة السيطرة (0,521) لا يوجد زياده واضحه. اظهرت المعايير المناعية وجود زياده معنوية في معدل تركيز الجسم المضاد IgG في مصول مرضى التدرن غير المعالجين على حساب المرضى المعالجين كالتالي : (22,09±1,299 غرام/لتر و17,376±2,494 غرام /لتر) على التوالي والقيمة الطبيعية في الاشخاص الاصحاء هي (6,3 - 16 غرام/لتر) عندما كانت P. value تساوي (0,01> P ) . لا توجد زياده معنويه في معدل تركيز الجسم المضاد IgM في مصول مرضى التدرن غير المعالجين والمعالجين (1,584±0,559غرام/لتر 1,143±0,492 غرام/لتر) على التوالي والقيمة الطبيعية هي (0,3 - 2,5غرام/على لتر) عندما كانت 0,05P. value > | The study aims at comprise between some techniques using for rapidly detecting tuberculosis cases among Babylon population and to limit the prevalence rate. This objective is achieved by the following : Collection of sputum and blood from study group who are suspected to have TB infection, molecular detection of Mycobacterium tuberculosis in patients samples using Real - Time PCR, Gene X - pert, and demonstration of immune response (IL - 2, IgG, and IgM) in TB patients. The samples of sputum and blood were collected from sixty patients suspected of having TB, in the Specialized Chest and Respiratory Center, Babylon, City during the period from February to June 2015. TB patients consisted of 28 (64%) males and 15 females (36%), with an age range from 15 to 74 years old. Gene X - pert MTB/RIF and Real - Time PCR techniques given sensitivity for AFB positive (100%) and AFB negative (66%, and 58%) respectively. AFB sensitivity is (16.6%), and the specificity is (100%) for all in the present study. Gene X - pert showed that forty three were TB positive from sixty suspected TB patients, and there are 10 with high resistance, 13 with medium resistance, 11 with low resistance, and 9 were sensitive to rifampicin. Serum level of Interleukin - 2 (IL - 2) in untreated TB patients, treated TB patients and control group showed significant differences. IL - 2 in untreated TB patients show high mean (169.429±69.139 pg/ml), followed by treated patients (96.997±27.113 pg/ml), and control group (78.997±0.909 pg/ml). The untreated v.s treated P. value (P<0.003) significant, untreated v.s control P. value is (0.005) significant, and treated V.s control P. value is (0.521) non - significant. Serum level means of immunoglobulin G (IgG) in untreated TB patients and treated TB patients show significant difference. The mean of IgG in untreated patients was higher than in the treated patients, there are (22.094± 1.299g/L, and 17. 376± 2.494 g/L, respectively), significantly P. value is (P<0.01) and the normal value of IgG is (6.3 - 16 g/L). Serum level means of immunoglobulin M (IgM) in untreated TB patients and treated TB patients showed non - significant difference. The IgM mean value in whole groups of the study had located in the normal value, the mean of IgM in the untreated patients is (1.584± 0.559 g/L), treated patients is (1.143± 0.492 g/L), (P. value >0.05), and normal value is (0.3 - 2.5 g/l).
1 ... 57 58 59 60 61 ... 98