البحث — المستودع الرقمي العراقي

نتائج البحث: 25 من أصل 57

انتاج تنقيه وتوصيف المستحلب الحيوي من بكتريا Geobacillus thermoleovorans ودراسة فعاليته المضادة للاحياء المجهرية والاورام Production, purification and characterization of biosurfactant from Geobacillus thermoleovorans and studying its antimicrobial and antitumor activity

اسم المؤلف: هبة منصور ناصر

اسم المشرف: ماجد حسين الجيلاوي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

تقييم عامل نخر الورم الفا والانترفيرون الفا مع بعض المعايير الكيمياحيوية في مجاميع مختلفة لمرضى ابيضاض الدم النقوي المزمن في بغداد Evaluation of tumor necrosis factor - alpha and interferon - alpha with some biochemical parameters in different groups of chronic myeloid leukemia patients in Baghdad

اسم المؤلف: محمد مازن ناجي

اسم المشرف: صالح احمد رهيب صبحي جواد حمزة

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

الكشف الجزيئي لبعض الطفرات لانزيم G6PD في عينة من المرضى العراقيين Molecular detection of some mutations of G6PD in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: هديل محمد خلف

اسم المشرف: رحاب صبحي رمضان

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

تاثير بعض المضادات الحياتية والمستخلص الكحولي لحب الدبج Loranthus europaeus على نمو بكتريا الملوية البوابية Helicobacter pylori باستخدام الكايتوسان النانوي Effect of some antibiotics and alcoholic extracts of Loranthus europaeus on growth of Helicobacter pylori by using nanochitosan

اسم المؤلف: زينب سامي علي

اسم المشرف: علي شهاب احمد نضال سهيل زبار

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

زراعة الخلايا الجذعية المزنشيمية في الفئران المصابة بتلف الكبد التجريبي Transplantation of Mesenchymal Stem Cells into Experimental Injured Mice Liver

اسم المؤلف: زهراء كامل زيدان

اسم المشرف: شهلاء مهدي صالح شلال مراد حسين

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

بعض المظاهر الكيمياوية الحياتية والمناعية لمرضى داء السكر النوع الثاني المصابين بالاعتلال الكلوي Some biochemical and immunological aspects in patients with type 2 diabetic nephropathy

اسم المؤلف: هدى منذر مهدي

اسم المشرف: وليد حميد يوسف خالد جمعه خليل

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

التحري الجزيئي عن الفايروس المضخم للخلايا CMV المعزول من النساء ذوات الاسقاط المتكرر وعلاقته بالمستقبلات ILT2 and TLR2 Molecular Detection of Cytomegalovirus (CMV) Isolated from Repeated Miscarriage Women and its Relation to TLR2 and ILT2 Receptors

اسم المؤلف: سارة احمد جهاد

اسم المشرف: رحاب صبحي رمضان

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

دراسة تاثير مستخلص نبات حب الدبج في عملية التئام الجروح Study the Effect of Loranthus europaeus Extract on Wound Healing Process

اسم المؤلف: اصلاح شاكر رجب

اسم المشرف: خلود وهيب السامرائي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

انتاج وتوصيف وتقييد انزيم اللاكيز من بكتريا Bacillus cereus المعزولة محليا Production, Characterization and Immobilization of Laccase Enzyme from Bacillus cereus Local Isolate

اسم المؤلف: مينا ماجد اللوس

اسم المشرف: اسماء علي حسين

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

تكوين الخلايا بانية العظم من الخلايا الجذعية المنزنشيمية الماخوذة من نخاع عظم الفار في الزجاج Osteoblast formation from Mesenchymal Stem Cells Deri ed from mouse Bone Marrow in vitro

اسم المؤلف: سالي طارق يونس

اسم المشرف: شهلاء صالح مهدي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

التاثير المحفز للمناعة والمضاد الاكسده والتطفير لنبات يوحنا Hypericum triquitrifolium في الزجاج والحي Immuno - enhancement, Antioxidant and Anti - mutagenic Effects of Hypericum triquitrifolium in vitro and in vivo

اسم المؤلف: رقية محمد ابراهيم العزي

اسم المشرف: خلود وهيب عبود علي حسين ادحية

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

الفعالية ضد المايكروبية والسمية للمواد الفعالة لمستخلصات نبات سم الفراخ Antimicrobial activity and cytotoxicity of active compounds of Withania somnifera extracts

اسم المؤلف: وهام سعد عطا

اسم المشرف: نبيل خلف العاني

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

انتاج وتوصيف ودراسة جينية لبكتريا Pantoeadispersa المنتجة لانزيمات السيليليزوالبكتنيز Production, Characterization and Genetic Study of Pantoeadispersa Producing Cellulase and pectinase

اسم المؤلف: محمد لفته عطا الله

اسم المشرف: حميد مجيد جاسم كاظم محمد ابراهيم

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

ازالة الكبريت واستغلال الداي بنزوثايوفين Dibenzotheiophene بفعل بعض العزلات البكتيرية المحلية

اسم المؤلف: الباب فواز ابراهيم الفراس

اسم المشرف: ماجد حسين الفتلاوي عبد الغني ابراهيم يحيى

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة النهرين - كلية العلوم - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

الكشف الجزيئي لبعض طفرات مرضى الثلاسيميا الكبرى بيتا في محافظة بابل Molecular Detection for Some Mutations of ? - thalassemia Major in Babylon Province

اسم المؤلف: سارة فاضل بنية

اسم المشرف: انوار علي الحسيني

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم - قسم علوم الحياة

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

دراسة جزيئية لبكتريا العائلة المعوية المكونة للاغشية الحيوية على العدد الطبية داخل الرحم Molecular Study of Enterobacteriaceae that Forming Biofilms on Intrauterine Devices

اسم المؤلف: زهـراء كامـل كاظم الحسني

اسم المشرف: حسن فاضل ناجي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم للبنات - قسم علوم الحياة

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

السيطرة الاحيائية واللااحيائية على نمو الفطر Aspergillus flavus والتعبير الجيني للجينين aflDو aflR وانتاج الافلاتوكسين B1 Biotic and Abiotic Control on Aspergillus flavus Growth, aflD and aflR Expression and Aflatoxin B1 Production

اسم المؤلف: لبيد عبد الله نجم السعد

اسم المشرف: عدنان عيسى البدران سامي عبد الرضا الجميلي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة البصرة

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: البصرة

الصفحات الاولى:

المستخلص: Fifteen isolates of Aspergillus flavus (AFL1 - AFL15) were isolated from multiple sources included soil, compost, seeds, fruits, feed and air. The isolates were identified morphologically then confirmed by molecular techniques. Only thirteen isolates were confirmed positively (AFL1 - AFL5 and AFL8 - AFL15) while two of them were not. A phylogenetic analysis was made which revealed that the isolates grouped according to their source of isolation. The aflR profile and phenotypic AFB1 production confirmed that all thirteen isolates posses the ability to produce AFB1 with significant differences (P ≤ 0.05) among them. Growth rate profile was performed under 30ºC which showed significant differences (P ≤ 0.05) among isolates. According to the above tests, A.flavus AFL14 was selected to be the experimental isolate for the rest of experiments in this study. Comparing to A.flavus NRRL3357 type strain, the impact of temperature, water activity aw and isolate factors was examined to determine the limits and optimum ecological conditions of growth of A.flavus AFL14. The results displayed that the best growth rate was (7.217 mm/day) at 0.98 aw where the lowest was (4.069 mm/day) at 0.9 aw with no growth at 0.85 aw while the impact of temperature demonstrated by outweigh of growth rate at 35ºC (6.201 mm/day) followed by 30ºC (5.272 mm/day) which exceeded 25ºC and 40ºC (4.604 and 4.051 mm/day), respectively.Bacillus subtilis (isolates : BSS1, BSS2, BSS3, BSS4 and BSW) and Pseudomonas fluorescens (isolates : PFMst and PFDL) were elected to be used as biocontrol agents. All the isolates were passed the biochemical identification tests moreover, BSS4 and BSW isolates of B.subtilis and PFMst and PFDL isolates of P.fluorescens were confirmed molecularly which used later in all biocontrol experiments in this study. The ability ofbiocontrol agents to inhibit fungal growth was investigated and the resultsshowed significant inhibition impact represented by significant outweighof B. subtilis BSS4 (99%) on the rest of B. subtilis isolates followed by P.fluorescense PFDL and PFMst (92.29 and 86.19) %, respectively, with nosignificant differences (P ≤ 0.05) among them. The extra - cellular abilityof biocontrol agents to degrade AFB1 showed a high degradation abilityIpreformed by B. subtilis BSS4, BSW isolates and P. fluorescence PFMst,PFDL isolates (100, 100, 97.805 and 97.396%), respectively. Thedegradation residues administrated to rats to determine their effect onbiosystems, the blood parameters showed a significant reduction ofWBC, HB, RBC, and P.C.V while there was a significant increase inUrea, Glutamic pyruvate transaminase (GPT) Glutamic oxaloacetictransaminase (GOT) and MCV in AF+DMSO treatment comparing tothe negative and positive control. Water activity and biocontrol factorswere examined to control aflD and aflR expression and phenotypic AFB1production. When the experiment held using Nutrient Agar medium, asignificant inhibition of aflD and aflR expression (P=0.000 and 0.003),respectively performed by BSW at 0.94 aw comparing to 0.98 aw whileno significant inhibition was observed in the rest of the treatments. Allbiocontrol agents revealed high significant reduction of aflD and aflRexpression (P≤0.001) in each water activity level separately whichconfirmed by HPLC results. The phenotypic results showed that 0.94 awexceeded 0.98 aw in AFB1 reduction (2011 and 4280 ng/gm),respectively which agreed with gene expression results. When MaizeMeal Agar used as a medium, aflD expression presented a highsignificant increase at 0.98 aw relating to the NM level of each individualtreatment (P= 0.000 - 0.03) except PFDL+AFL14 which showed nosignificant aflD expression between both levels. aflR expression revealeda high significant reduction (P= 0. 000) caused by 0.98 PFDL+AFL14and 0.98 BSW+AFL14, respectively, while no significant differenceswere observed in the rest of the treatments or control. The HPLC resultsdisplayed a high significant reduction of AFB1 at 0.98 aw (8447 ng/gm)compared to (219000 ng/gm) at NM aw. The biocontrol agents caused ahigh significant reduction for both aflD and aflR expression (P=0. 000 - 0.043) under each individual water activity level while, HPLC resultsshowed non significant low reduction to the AFB1 performed by BSS4and BSW (25160 and 44790 ng/gm), respectively, followed by asignificant increase in AFB1 amount caused by PFMst and PFDL(267600 and 184100 ng/gm), respectively

عزل وتشخيص احد قلويدات الايض الثانوي لبعض الطحالب ودراسة فعاليته الحيوية Isolation and identification one alkaloid of secondary metabolites from some algae and study of biological activity

اسم المؤلف: انفال نوري عباس اللفتة

اسم المشرف: احمد محسن عذبي اقبال جاسم الاسدي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة البصرة

اللغة: العربية

مكان الجامعة: البصرة

الصفحات الاولى:

المستخلص: The current study includes an isolation, Identification and purification of three species of algae, two of them belonging to cyanobacteria they are Oscillatoria brevis and Nostoc carneum . The third one was Enteromorpha intestinalis which belong to green algae which was from different location in Basrah .There are two extract were prepared from the algal species Alcohol , and alkaloid extracts , Alcoholic extract prepared to know what was compound it had and alkaloid extracts to test bioactivity of algae Cytotoxcity also was carried out on human red blood cells, the results revealed that alkaloid extract from E.intestinalis was nontoxic, whereas bioactive compounds isolated from O.brevis , N.carneum. Showed hemolytic action .The bioactivity of alkaloid extract was examined to elucidate their on ability to inhibit the growth of gram Positive and negative bacteria. .Biological activity of alkaloid extracts of three algae isolated were determined by using the Minimal Inhibitory Concentration (MIC) againsttwo bacterial isolates. And also test the effect of filtrate pure algal culture on growth of plant pathogenic fungi ,also apparently that the algal alkaloid extract and isolated compounds exhibits antioxidant.The antitumor activity of the algal alkaloid extract from E.intestinalis against Rhabdo myosarcoma cell line was examined. The results showed that crude alkaloid extract possessed an antitumor bioactivity at low concentration 0.78mg / ml .In this study also was carried out to investigate the possibility of preventing the hypercholesterolemia by using alkaloid extract of E.intestinalis .it also aimed to study the effect of use this extract in reducing the Plasma Total Cholesterol (TC) , Triglyceride (TG), Low - Density Lipoprotein (LDL) , Very Low - Density Lipoprotein (VLDL) and no effect on High - Density Lipoprotein (HDL).The identification of the compound was made depending on the active groups test and spectroscopic analyses including : Infrared (IR) and Gas Chromatography / Mass spectrum (GC - MS). The results of such analyses showed that alkaloid extract from E.intestinalisa has three compound these are Hexadecanamide , Methenamine and Benzenedicarboxylic acid, diisooctyl est and alkaloid extract from N.carneum showed that has three compound 1,2 - Benzenedicarboxylic acid diisooctyles,ا9 - Octadecenamide, (Z) - )ااااا and Didecyl phthalate .Hexadecanamide purification from alkaloid extract of E.intestinalis depended on physical and chemical properties The identification of the compound was made depending on the active groups test and spectroscopic analyses including : Infrared (IR); Gas Chromatography / Mass spectrum (GC - MS) and this component showed bioactivity on gram. Positive and negative bacteria and it has also antioxidant activity

التحلل والمعالجة الاحيائية للمركبات الهيدروكاربونية النفطية بوساطة سلالات Streptomyces وNocardiopsis المعزولة من الترب الملوثة بالنفط في محافظة البصرة - العراق Biodegradation and bioremediation of petroleum hydrocarbons by Streptomyces and Nocardiopsis strains isolated from oil contaminated soil of Basrah Governorate - Iraq

اسم المؤلف: احمد عبد برغال الاسدي

اسم المشرف: كوثر هواز مهدي نادية عبد الامير المظفر

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة البصرة - كلية العلوم - قسم علوم الحياة

اللغة: العربية

مكان الجامعة: البصرة

الصفحات الاولى:

المستخلص: سبعة سلالات من البكتريا الخيطية تعود الى جنسي Streptomyces وNocardiopsis عزلت من ترب شركة مصافي الجنوب الملوثة بالنفط الخام في البصرة جنوب العراق، وقد تم اختبار قدرتها على النمو بوجود النفط الخام باستعمال وسط ملحي سائل مزود بالنفط الخام كمصدر وحيد للكربون. شملت السلالات على S. variabilis 7525 وS. variabilis SW75 وS. cellulosae XFB - T وS. parvus S86 وS. bacillaris S4BW2 وS. flavoviridis VITHM - 1 وN. synnemataformans ITD - 3 بنسبة تشابه من 99٪ الى 100٪. في هذه الدراسة تم العثور على سلالات جديدة من البكتريا الخيطية المعزولة من التربة الملوثة شخصت باستعمال تحديد تتابعات جين الحامض النووي الريبوزي 16S rRNA وقد اظهرت السلالات قدرات مختلفة على تحلل النفط الخام في الوسط الملحي السائل من 50.2٪ الى 72.4٪. كما تم تقييم تاثير الظروف الزرعية من درجة الحرارة والدالة الحامضية وتركيز النفط الخام والعناصر النزرة في نمو سلالات البكتريا الخيطية وتحلل النفط الخام، وقد لوحظ ان اعلى نمو للخلايا واعلى تحلل للنفط الخام كان 80٪ في ظروف زراعة مثالية ( درجة حرارة 30 ᵒم ودالة حامضية 7 بعد 10 ايام من الحضن وزادت هذه النسبة الى 85٪ من قبل السلالة S. cellulosae XFB - T بعد اضافة العناصر النزرة.في حين اظهرت نتائج اختبار التحلل الحيوي للنفط الخام في التربة من قبل سلالات البكتريا الخيطية منفردة بعد 60 يوما من الحضن تحت ظروف مختلفة ، اظهرت ان اعلى قيمة للتحلل كانت 87 ٪ من قبل النوع S. bacillaris عند درجة حرارة 30 ᵒم وحجم لقاح مضاف 10مل/ 25غم تربة ومستوى رطوبة 40٪.المعالجة الاحيائية هي ستراتيجية فعالة لتنظيف المواقع الملوثة بالهيدروكربونات. ونتيجة تاثر الكائنات الحية الدقيقة من تلك التربة يحدث لها اضطراب وبالتالي يتم انتقاء الاحياء المجهرية القادرة على استهلاك الهيدروكربونات لاستخدامها في هذه التقنية الفعالة في التعامل مع الملوثات الهيدروكربونية. الهيدروكربونات التي تتفاعل مع نسجة التربة والكائنات الحية الدقيقة هي التي تحدد مصير الملوثات وطبيعتها الكيميائية والقدرات الهادمة للميكروبات. الاثار المحتملة لنشارة الخشب، وخليط من روث الابقار والغنم وتعديل المكملات الغذائية لتحفيز الكائنات الدقيقة الاصلية وزيادة المعالجة البيولوجية للهيدروكربونات، هذه العملية تم اجراءها باستعمال طريقة المعالجة خارج الموقع بطريقتي الكومة والمفاعل الحيوي، بخلط التربة الملوثة مع نشارة الخشب والروث الحيواني ودعم التربة بالمغذيات والعناصر النزره مع توفير الرطوبة الملائمة والظروف المواتية لنمو الكائنات الحية الدقيقة كما قدمت التهوية الصناعية للتربة في الكومة والمفاعل بوساطة شبكة من الانابيب المثقبة لمحاكاة المعالجة الحيوية التي استمرت مدة 90 يوما.خلال تلك الفترة، رصدت الهيدروكربونات النفطية الكلية (TPHs) وازالة الالكانات الاعتيادية والتغيرات في المجتمعات البكتيرية. وقد اظهرت النتائج ان (TPHs) قد انخفضت من 52غم/كغم الى 10.6 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 79.6٪ ومعدل تحفيز كان 71.4٪ في تجربة الكومة ومن 52غم/كغم الى 13.5 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 74٪ ومعدل تحفيز كان 63.5٪ في تجربة المفاعل الحيوي. وخلال مدة 45 يوما من الاختبار بلغت اعداد الكائنات الحية الدقيقة من البكتيريا المضافة والمستوطنة التي تحلل المواد الهيدروكربونية اعلى مستوى لها 2 × 710 خلية/ غم و1.1 × 710 خلية/ غم في الكومة والمفاعل الحيوي على التوالي.بناء على هذه المعطيات، نستنتج ان المعالجة الحيوية خارج الموقع افضل ستراتيجيه غير مكلفة وفعالة وصديقة للبيئة وبالتالي قد توفر خيارا قابلا للتطبيق لمعالجة التربة من الملوثات الهيدروكربونات النفطية. | Seven actinomycetes strains from genera Streptomyces and Nocardiopsis isolated from hydrocarbon contaminated soil in Basra Governorate, Iraq were selected for their capacity to grow in the presence of crude oil. Their growth rates and biodegradation ability were investigated in mineral salt media supplemented with light Remella crude oil. These strains consist of Streptomyces variabilis 7525, Streptomyces variabilis 5W75, Streptomyces cellulosae XFB - T, Streptomyces parvus S86, Streptomyces bacillaris S4BW2, Streptomyces flavoviridis VITHM - 1 and Nocardiopsis synnemataformans ITD - 3, that the sequence identity range from 99% to 100%. Our study find a new actinomycetes strains isolated from contaminated soil. these strains appears different capacity on the degradation of crude oil in mineral salt media , the highest was found to vary from 50.2% to 72.4%.The effect of the cultivation factors (temperature, pH, and concentration of crude oil and trace elements ) on growth of the actinomycetes strains and crude oil degradation was evaluated. The highest cell growth and the amount of crude oil degraded 80% were observed in optimized cultivation conditions (30oC and initial pH 7) after 10 days, this ratio reached to 85% by addition of trace elements solution at same condition by S. cellulosae XFB - T.The biodegradation test lasted 60 days in soil by actinomycetes strains at different factors shown the highest of the crude oil was removed in experiment that inoculums with 10ml of each bacterial strain, value 87% by Streptomyces bacillaris S4BW2 at 30oC. Bioremediation is an efficient strategy for cleaning up sites contaminated by hydrocarbons. Microorganism of soil is affected by hydrocarbon disturbance thus selective enrichment of hydrocarbon utilizers occurs. The technology is very effective in dealing with petroleum hydrocarbon contamination. Hydrocarbons react with the soil matrix and microorganisms determining the fate of the contaminants relative to their chemical nature and microbial degradative capabilities. The potential effects of sawdust, and mixture of cow and sheep dung as amendment nutrient supplements to biostimulate autochthonous microflora and augmentation for hydrocarbon bioremediation were investigated in test biopile and bioreactor. The soil was ground and fluffed by admixture of 1.5% sawdust, then supplemented with the necessary minerals and watered to provide conditions favoring microorganism growth industrial aeration was provided in pile by system of a abundant perforated drainage - pip network to simulate bioremediation treatments through a 90 - day period. During this period, we monitored total petroleum hydrocarbons (TPHs) and n - alkanes degradation and changes in bacterial communities. The (TPHs) had been reduced from 52 to 10.6 g/kg (79.6 %), the rate of Biostimulants Efficiency (BE) was (71.4%) in biopile and from 52 to 13.5 g/kg (63.5 %) in bioreactor . In soil, the dominant microorganism population comprised Gram - positive bacteria from actinomycete group and autochthonous microorganisms which decompose hydrocarbons reached highest level 2 x 107 and to 1.1 x 107 CFU/g at 45 days in biopile and bioreactor respectively . Based on these data, the study conclude that is ex situ ( Biopile and bioreactor ) experiment the best strategy, inexpensive, efficient, and environmentally friendly and may thus offer a viable choice for petroleum hydrocarbons - contaminated soil remediation.

التحري عن التشوهات الكروموسومية وطفرات المورث FLT3/ITD في مرضى ابيضاض الدم النخاعي الحاد Screening For Chromosomal Aberrations And Gene Mutations FLT3/ITD In Patients With Acute Myeloid Leukemia

اسم المؤلف: سمارة كاظم محمد

اسم المشرف: عبد الحسين مويت الفيصل

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بغداد - معهد الهندسة الوراثية والتقنيات الاحيائية - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: صممت الدراسة الحالية من اجل تسليط الضوء على تاثيرات مرض ابيضاض الدم ((AMLفي بعض معايير الوراثة الخلوية والجزيئية الحاصلة في كريات الدم البيضاء في ثلاثة حالات للمرضى اشتملت على مرحلة ما قبل العلاج, في اثناء العلاج وبعد العلاج الكيميائي. كما شملت الدراسة ا | The present study was designed to shed light on the cytogenetic and molecular effects caused by acute myeloid leukemia (AML) pathogenesis in three stages before, during and after treatment with chemotherapy (in vitro) in lymphocytes. It was also aimed to investigate chromosomal aberrations, micronucleus formation and FLT3/ITD point mutations in CN - AML region 100 - 300 bp compared with healthy control. The study was comprised of forty - seven AML Iraqi patients their ages ranged between 2.5 - 81 years. It included twenty females and twenty seven males compared with twenty - six healthy control. The following results were obtained : AML is most common leukemia in adults and uncommon in children. It was found that 46.8% patients suffer from AML, who were under 15 years old, while 19.15% patients their age ranged between 16 - 30 years; 19.15% of patients their age were more than 45 years and 14.9% of patients their age ranged between 31 - 45 years of the total AML patients. AML is more common in males than females. The percentages of females and males were 42.5% and 57.5% respectively representing 1.35 : 1.00 male : female ratio. Two AML patients 5.3% have diploid cells when examined under light microscope. The highest mitotic index was 7.498±1.7 occurred in patients before taking treatment while recorded 6.784±4.5 during treatment and 7.000±2.5 after treatment. Nuclear anomalies such as nucleoplasmic bridges and nuclear buds were observed in AML patients, Micronucleus mean values recorded 0.033±0.018, 0.020±0.00015 and 0.036±0.01for AML patients before, during and after treatment respectively when compared with the control which recorded 0.002±0.00002. Nuclear division index (NDI) means before, during and after treatment of AML patients were 1.658±0.2, 1.000±0.022 and 1.424±0.19 respectively. Significant differences occurred among the three groups when compared with the control group (1.282±0.09). Extracted DNA from 30 AML patients was amplified by PCR to obtain FLT3/ITD gene from exon 11 to intron 12 and ten of them sent for sequencing. Two patients showed larger bands (470 and 460) bp when compared with wild type (330) bp. Among six patients, three displayed point mutations of deletion and substitution while others were normal since no mutations were detected. The percentages of mutation types were substitution 57.78% and deletion 22.2%. The effect of mutations was missense mutation (55.54%), deletion (22.22%) and nonsense (22.22%). It has been concluded from the current work that AML is more common in adult males, patients suffer from AML exhibited high MI, NDI, MN and point mutations are present in such patients including deletion and substitution causing missense, nonsense and deletion.

دراسة جزيئية عن جين المقاومة mecA في بكتريا العنقودية الذهبية المقاومة للمشيسلين والمعزولة من بعض مستشفيات بغداد Molecular Study For Detection of Meca Gene In Methicillin - Resistant Staphylococcus Aureus Isolated From Some Hospital In Baghdad City

اسم المؤلف: لمى ياسين موسى

اسم المشرف: محمد ابراهيم نادر

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بغداد - معهد الهندسة الوراثية والتقنيات الاحيائية - قسم التقانة الاحيائية

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: Two hundred and thirty clinical specimens were collected from two different hospitals in Baghdad during the period (December 2012 to April 2013). These specimens were collected from visitors, hospitalized patients and the health care workers in these hospitals. The specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, urine and blood culture diagnostic results show that 150 out of the (230) specimens gave positive bacterial cultures and (100) isolates are characterized as Staphylococcus aureus depending on the cultural and biochemical examinations.the coagulase test was performed and the results showed that from total 150 isolates of Staphylococci, 100 isolates (61%) were coagulase - positive (COPS), while only 50 isolates (39%) were coagulase negative (CONS). In addition, the distribution of methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated.The use of the antibiotic susceptibility profile for these isolates was examined against methicillin resistance. Using disk diffusion method revealed that (13) isolates were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA), While (87) isolates of S. aureus showed sensitivity to methicillin (MSSA) and there was no intermediate resistance among these isolates.The ability of MRSA isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, urease, dnase and gelatinase, and also produce a beta types of haemolysins.The ability to produce slime layer by MRSA isolates was also investigated and the results showed that all isolates of MRSA were produced slime layer when theytested by Congo red agar method and the results showed that all of MRSA isolates produced strong slime layer.One of the aims of this study was to adopted a accurate diagnostic method to detect S.aureus by its genetic material contents through extracting of DNA and gel electrophoresis of the PCR product for the specific gene.Detection of methicilline - resistance gene represented by A confirmatory test was carried out for the selected isolates using Polymerase chain reaction (PCR) technique for further characterization up to the species level by the amplification of (mecA) gene.This is Staphylococcus aureus specific gene that encodes the extra Penicillin Binding Protein, which is unique to methicillin - resistant staphylococci. All the (13) positive isolates by disk diffusion test are found to be positive for the presence of (mecA) gene as their agarose gel revealed the presence of DNA band of mecA gene with a molecular size about (200 bp.).Results of the detecting (femB) gene showed that it was positive in all of MRSA isolates as they appear to have a band with a molecular size of about (651 bp). The genetic determinants of methicillin resistance mecA and femB genes were amplified using multiplex PCR technique in order to identify methicillin resistant (mecA+) and susceptible (lacking mecA) staphylococci and to differentiate S. aureus (femB+) from coagulase negative staphylococci (lacking femB). All of the S. aureus isolates (100%) were found to harbor femA gene, it is species specific marker for S. aureus.

عزل وتشخيص الجين lipA المنتج من بكتريا الزائفة الزنجارية من مياه الصرف الصناعي Isolation And Identification of lipA Gene Producing Pseudomonas Aeruginosa From Industrial Wastewater

اسم المؤلف: انتصار طه لفتة

اسم المشرف: واثق عباس الدراغي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بغداد

اللغة: العربية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: توضح هذه الدراسة عزل lipA gene من الزوائف الزنجارية من مياه الصرف الصناعية للزيوت النباتية وتشخيصها اعتمادا على تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). استغرقت هذه الدراسة تسعة اشهر, من شهر شرين الاول 2014 لغاية حزيران 2015. تم جمع خمسين عينة من مياه الصرف الصناع | This study clarify the isolation and identification of lipA gene in Pseudomonas aeruginosa from industerial wastewater of vegetable oils factories depending on the polymerase chain reaction (PCR) technique. The present study had taken nine monthes starting from October 2014, till the mid of June 2015. Fifty samples of industrial wastewater were collected from the factories of the general company of vegetable oils, fourty from AL Rasheed factory and ten from AL ameen factory, the samples collected from the physical, chemical and biological treatment units, and other different wastewater tanks departments. While the four sewage samples were collected from sewer service Baghdad /Alrustumaiya. For Identification of Pseudomonas aeruginosa, two types of tests were used in this study. The first type was the routine tests, which include selective cultures, bacteriological and biochemical tests. Thirty four of fifty samples (68%) gave a positive growth and results for tests that were used to confirm the presence of P. aeruginosa. In addition to diagnosis P. aeruginosa in sewage sample which prepare the biological treatment units in vegetable oils factories as active sludge, other bacterial types have been diagnosed by using traditional methods and API 20 E system. For detection of bacterial lipolytic activity, two methods were used for this purpose, the first was the screening of bacterial lipolytic activity which was based on values of clear zones diameter around bacterial colony. The best values were between (1.9 _ 2.7) cm. The second test was carried by the Gas - Chromatography - Flame ionization detector, fatty acids solutions that were produced from hydrolysis by lipase enzyme were extracted by Petrolium ether solvent then analyzed by gas chromatograph apparatus. The second type of test was the Molecular diagnosis by using the Polymerase Chain Reaction (PCR) to detect lipA gene in Pseudomonas aeruginosa by two primers. Through two primers used, lipA 948 was the best and more specialized primer to isolation lipA gene of P. aeruginosa. It gave (100%) a positive result. While the second primer lipA 558, gave (66.66%) a positive result and that may be due to the design of this oligonucleotides was not specific for lipA of P.aeruginosa. This is so as was based on highly preserved region of 12 bacterial lipA - homologous genes for many genus and many species belong to Pseudomonas. DNA sequencing done for amplicon generated using lipA 948, this sequence aligned by using BLASTn software against NCBI database to validate the results and investigate the similarity degree with other corresponding strains.

انتاج انزيم الفوسفاتيز القاعدي من العزلة المحلية لبكتريا Bacillus sp. وتنقيته جزئيا

اسم المؤلف: جعفر انور قدوري الخاجي

اسم المشرف: رباب عمران راضي الجيلاوي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2015

الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم - قسم علوم الحياة

اللغة: العربية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

المستخلص: Fifteen local isolates of Bacillus bacteria and previously isolated were screening a from laboratory of advanced biotechnology and Genetic Engineering in Babylon University, College of Science to know their ability on production of extracellular alkaline phosphatase after its growth in liquid production in PH8 medium for 4 days and temperature 37°C. and destinguished 11 isolates by their different abilities on produc of enzyme and Bacillus sp.I bacteria was their best and perfected it selection to complete the study and described by depending on microscopic and cultured and biochemical characteristics studying of effect some of environmental condition for production of alkaline phosphatase enzyme by submerged cultural method were appeared that the optimum PH for production was 8, and optimum temperature 40°C, after incubation time 4days and explain that the production by static incubator was better from shaker incubator.Alkaline phosphatase of the isolate Bacillus sp.I was purified partial by fractionating with ammonium sulphate and the best ratio for saturation 95%. And on purification of enzyme by ion exchange chromatography with batch wise by using DEAE - cellulose and enzymatic recovery was 37.1%, and fold 3.64 once, and enzyme passed after concentrated on gel filtration column (Sepharcyl S - 200) one peak was appeared for enzyme and enzymatic recovery was 23 % and fold 36.80 once.Results of electrophoresis by presense of denaturation condition appeared that the molecular weight of alkaline phosphatase produced from gel filteration by using Sepharcyl S - 200 gain approximately 29.5 KDa and 28.8 KDa and this enzyme composed of homodimer.The characterization results for the enzyme indicated that the optimal pH for activity of enzyme was (9), while the optimal pH for the enzyme stability was (8 - 9), and found that the optimal temperature for activity of anzyme was 30 ? C, and on studying optimal temperature for stability of enzyme indicated that better stability for this enzyme was on temperature 0 ?C while the activity lost completely on temperature 60°C. and on studying effect some chemical compounds in activity of enzyme found that the enzyme needs to cofactor and it is zinc andmagnessium ion to increase catalytic activity and needs to calessium ion to increase stability of enzyme. At that time potassium and sodium ions appeared a negatively effect on activity, and heavy metals ions Fe and Hg appeared an inhibited effect to activity and so that the enzyme was inhibited by presence EDTA and and potassium ferro cyanide indicating that the enzyme from metal enzymes.Determination of constant kinitics of the enzyme was completed of Michaelis - Menten constant (Km) of para - nitrophenyl phosphate and this gained 500 micromolar and maximum velocity of this enzyme (Vmax), and this gained 2500 unit/ml.