Share
التشخيص الجزيئي للجين المسؤول عن مقاومة العلاج ودراسة بعض المتغيرات الكيميوحيوية في امصال المرضى العراقيين المصابين بالتدرن == Molecular diagnosis of gene responsible for drug resistance and study of some biochemical parameters in sera of Iraqi patients with Tuberculosis
Author name:
ضحى عبد الكريم مزعل
Supervisor name:
عبير حازم مصطفى | احمد اسمر منخي
General topic:
Chemistry
Specific topic:
Chemistry
Degree:
Master
University:
Mustansiriyah University - College Of Education For Pure Sciences - chemistry department
Language:
English
University location:
Baghdad
First pages:
25T1808 - p.pdf
Abstract:
اجريت هذه الدراسة في المختبر المرجعي التابع لمركز الامراض الصدرية والتنفسية التخصصي بغداد ومستشفى مدينة الطب من اكتوبر 2013 حتى يونيو 2014.تم جمع عينات الدم والبلغم من (70) شخص من مرضى التدرن الرئوي ، تم تقسيم هذه العينات الى مجموعتين : (40) عينة جديدة شخصت كتدرن رئوي ومتوسط عمر 30.5 ± 15.1 (22 ذكورو18 اناث)، (30) عينة تم علاجها مع متوسط العمر 38.6 ± 18.5 (19 من الذكور و11 من الاناث). في حين، تم جمع عينات الدم وسائل الجنب من (30) من مرضى التدرن خارج الرئة مع متوسط العمر 31.7 ± 15.5 (18 من الذكور، 12 من الاناث)، تم تقسيم هذه العينات الى مجموعتين : (25) عينة جديدة شخصت كتدرن خارج الرئة و(5) عينات عولجت بالادوية. من ناحية اخرى، تم جمع عينات من الدم, البلغم وسائل الجنب من (30) شخصا من الاصحاء مع متوسط العمر 29.7 ± 8.9 (19 من الذكور و11 من الاناث)،استخدموا كمجوعة سيطرةاستخدمت هذة العينات لتقدير الدوال الكيميوحيوية التالية : 1 - اختبار وظيفة الكلية والتي تشمل اليوريا التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (28.7 ± 6.0) (mg/dl) ، ( Retreatment PTB(mg/dl) (28.5 ± 8.8ومجموعة الاصحاء (27.9 ± 7.9) (mg/dl) ؛ والكرياتينين التي اظهرت زيادة معنوية (0.6 ± 0.2) (mg/dl) New PTB واعادة معالجة (mg/dl) (0.6 ± 0.2) Retreatment PTB مقارنة مع الاصحاء(0.5 ± 0.2) (mg/dl).2 - اختبار وظيفة الكبد والتي تشمل TSBالتي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (0.7 ± 0.1) (mg/dl) ، Retreatment PTB (0.1± 0.7) (mg/dl) ومجموعة الاصحاء (0.7± 0.1) (mg/dl) ؛ GPT التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين PTB New (7.8 ± 1.2) (iu/l) ، اعادة معالجة Retreatment PTB(iu/l) (1.6± 7.8)ومجموعة الاصحاء (8.1 ± 1.8) (iu/l) ؛ GOT التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (9.0 ± 1.4) (iu/l) ، Retreatment PTB 9.1) (iu/l) (2.2± ومجموعة الاصحاء (9.4 ± 2.3) (iu/l) ؛ وALP التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين PTB New(9.3 ± 1.1) (iu/l) ، Retreatment PTB(iu/l) (1.1± 9.0) ومجموعة الاصحاء(9.2 ± 1.3) (iu/l).3 - مستويات البروتين الكلي والتي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (7.0 ± 0.5) (g/dl) ، (Retreatment PTB (g/dl) (0.5 ± 7.0ومجموعة الاصحاء (7.0 ± 0.8) (g/dl) .4 - الالكتروليتات التي تشمل الصوديوم التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (142.8 ± 5.8) (mmol/l) ، Retreatment PTB ((6.2± 143.3 (mmol/l) ومجموعة الاصحاء (142.3 ± 5.3) (mmol/l) ؛ البوتاسيوم التي اظهرت فرق غير ملحوظ - بين New PTB (4.4 ± 0.6) (mmol/l) ، Retreatment PTB(mmol/l) (0.6 ± 4.4) ومجموعة الاصحاء (4.4 ± 0.6) (mmol/l) ؛ والكالسيوم والتي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (9.3 ± 0.7) (mg/dl) ، Retreatment PTB (9.2 ± 0.6) (mg/dl) ومجموعة الاصحاء (9.2 ± 0.5) (mg/dl) .5 - فعالية انزيم LDH : وجدنا ارتفاع كبير New PTB(290.0 ± 73.4) (U/l) وRetreatment PTB(U/l) (60.7± 278.6)مقارنة مع الاصحاء (142.7 ± 33.2) (U/l) ؛ ايضا ارتفاع كبير في مرضى التدرن خارج الرئة ((U/l) (9.1± 289.6 مقارنة مع الاصحاء (184.1 ± 53.1) (U/l).6 - فعالية انزيم ADA التي اظهرت ارتفاع كبير (,New PTB(U/l) (10.5± 33.9 Retreatment PTB (U/l) (10.6± 28.9) مقارنة مع الاصحاء (7.3 ± 2.3) (U/l) ؛ فعالية ADA في عينات القشع التي اظهرت ارتفاع كبير New PTB(U/l) (8.8± 41.6)و Retreatment PTB(U/l) (10.7± 35.9)مقارنة مع الاصحاء (11.3 ± 1.5) (U/l) ؛فعالية ADA في عينات سائل الجنب اظهرت ارتفاع كبير في مرضى التدرن خارج الرئة (47.5 ± 3.7) (U/l) مقارنة مع الاصحاء (25.6 ± 6.1) (U/l).7 - امراض الدم : وتشمل ESR التي اظهرت ارتفاع كبير بين New PTB (43.0 ± 31.3) (mm/h)، (Retreatment PTB(mm/h) (37.9 ± 31.7 والاصحاء (8.3 ± 6.5) (mm/h)؛ WBC التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB(4.7 ± 1.1) (*10^6/l) ، Retreatment PTB(*10^6/l) (1.0 ± 4.9) والاصحاء (4.9 ± 0.9) (*10^6/l) ؛ PCV التي اظهرت فرق غير ملحوظ بين New PTB (40.0 ± 3.3) (%)،Retreatment PTB (%) (3.6± 40.6) والاصحاء (39.9 ± 2.2) (%)والهيموغلوبين والتي اظهرت فرق غير ملحوظ New PTB(g/dl). (13.0 ± 1.1)، Retreatment PTB (13.2 ± 1.2) (g/dl).والاصحاء (13.0 ± 1.8) (g/dl)..8 - ارتفاع معدل انتشار مقاومة الادوية RMP وINH بين عزلات التدرن الرئوي .9 - طرق التشخيص الجزيئية اظهرت طفرة في الجين rpoB هي المسؤولة عن غالبية مقاومة الرفامبسين في MTB وطفرة في 315 codon من KatG مسؤولة عن مقاومة INH. | This study was conducted in the Institute of Chest and Respiratory diseases / National Reference Laboratory (NRL) of Tuberculosis in Baghdad and Medical City Hospital from October 2013 till June 2014.Blood and sputum specimens were collected from (70) Pulmonary tuberculosis patients, these patients were divided into two groups : (40) samples of new diagnosed PTB with mean age 30.5 ± 15.1 years (22 male, 18 female), (30) samples of old diagnosed Pulmonary tuberculosis with mean age 38.6 ± 18.5 years (19 male, 11 female). While, blood and pleural fluid specimens were collected from (30) Extra pulmonary tuberculosis patients with mean age 31.7 ± 15.5 years (18 male, 12female), these samples were divided into two groups : (25) samples of new diagnosed Extra pulmonary tuberculosis and (5) samples of old diagnosed Extra pulmonary tuberculosis. On the other hand, blood, sputum and pleural fluid specimens were collected from (30) healthy controls with median age 29.7 ± 8.9 (19 male, 11 female). The samples collected from study groups were used to estimate the following parameters and revealed the underlined data : 1 - Renal function test which in serum include urea was measured in serum that showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (28.7 ± 6.0) (mg/dl), retreatment Pulmonary tuberculosis (28.5 ± 8.8) (mg/dl) and control (27.9 ± 7.9) (mg/dl); and creatinine that showed a non - significant difference in new diagnosed PTB (0.6 ± 0.2) (mg/dl) and retreatment PTB (0.6 ± 0.2) (mg/dl) compared with control (0.5 ± 0.2) (mg/dl).2 - Liver function test in serum, serum TSB that showed a non - significant difference among new diagnosed pulmonary tuberculosis (0.7 ± 0.1) (mg/dl), retreatment PTB (0.7 ± 0.1) (mg/dl) and control (0.7 ± 0.1) (mg/dl); GPT that showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (7.8 ± 1.2) (iu/l), retreatment PTB (7.8 ± 1.6) (iu/l) and control (8.1 ± 1.8) (iu/l); GOT that showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (9.0 ± 1.4) (iu/l), retreatment pulmonary tuberculosis (9.1 ± 2.2) (iu/l) and control (9.4 ± 2.3) (iu/l); and ALP that showed a non - significant difference among new diagnosed pulmonary tuberculosis (9.3 ± 1.1) (iu/l), retreatment PTB (9.0 ± 1.1) (iu/l) and control (9.2 ± 1.3) (iu/l).3 - Serum total protein level which revealed a non - significance differences among new diagnosed pulmonary tuberculosis (7.0 ± 0.5) (g/dl), retreatment PTB (7.0 ± 0.5) (g/dl) and control (7.0 ± 0.8) (g/dl).4 - Serum electrolytes : that include sodium which showed a non - significant difference among new diagnosed pulmonary tuberculosis (142.8 ± 5.8) (mmol/l), retreatment PTB (143.3 ± 6.2) (mmol/l) and control (142.3 ± 5.3) (mmol/l); potassium which showed a non - significant difference among new diagnosed pulmonary tuberculosis (4.4 ± 0.6) (mmol/l), retreatment PTB (4.4 ± 0.6) (mmol/l)and control (4.4 ± 0.6) (mmol/l); and Calcium which showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (9.3 ± 0.7) (mg/dl), retreatment pulmonary tuberculosis (9.2 ± 0.6) (mg/dl)and control (9.2 ± 0.5) (mg/dl).5 - Serum LDH levels : high significant elevation was found in new diagnosed PTB (290.0 ± 73.4) (U/l) and retreatment pulmonary tuberculosis (278.6 ± 60.7) (U/l) compared with control (142.7 ± 33.2) (U/l); pleural fluid LDH levels also revealed high significant elevation in Extra pulmonary tuberculosis patents (289.6 ± 9.1) (U/l) compared with control (184.1 ± 53.1) (U/l).6 - Serum ADA activity that showed a significant elevation in new diagnosed PTB (33.9 ± 10.5) (U/l) and retreatment pulmonary tuberculosis (28.9 ± 10.6) (U/l) compared with control (7.3 ± 2.3) (U/l); sputum ADA activity that showed a significant elevation in new diagnosed PTB (41.6 ± 8.8) (U/l) and retreatment pulmonary tuberculosis (35.9 ± 10.7) (U/l) compared with control (11.3 ± 1.5) (U/l); pleural fluid ADA activity that showed a significant elevation in EPTB patients (47.5 ± 3.7) (U/l) compared with control (25.6 ± 6.1) (U/l).7 - Hematology : include ESR that showed a significant elevation among new diagnosed PTB (43.0 ± 31.3) (mm/h), retreatment PTB (37.9 ± 31.7) (mm/h)and control (8.3 ± 6.5) (mm/h); WBC which showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (4.7 ± 1.1) (*10^6/l), retreatment PTB (4.9 ± 1.0) (*10^6/l) and control (4.9 ± 0.9) (*10^6/l); PCV which showed a non - significant difference among new diagnosed pulmonary tuberculosis (40.0 ± 3.3) (%), retreatment PTB (40.6 ± 3.6) (%) and control (39.9 ± 2.2) (%) and Hb which showed a non - significant difference among new diagnosed PTB (13.0 ± 1.1) (g/dl), retreatment PTB (13.2 ± 1.2) (g/dl)and control (13.0 ± 1.8) (g/dl).8 - A high prevalence of drug resistance for RMP and INH among PTB isolates..9 - Molecular diagnosis methods had showed a mutation in the rpoB gene that responsible for majority of RMP resistance in MTB and mutation at the codon 315 of KatG responsible for INH - resistance.
