مجموعة التباين الوراثي احادي القاعدة للتلومريز, XPC وXRCC7 المتغيرة جينيا في المرضى المدخنين العراقيين المصابين بورم المثانة == Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Panel for Telomerase, XPC, and XRCC7 Genes Variants in Iraqi Smoker Patients with Bladder Tumor
Author name:
صالح علي محمود
Supervisor name:
هدف ظافر الياسين | اسامة سليمان الناصري
General topic:
Medicine
Specific topic:
Clinical Biochemistry
Degree:
Doctorate
University:
University of Baghdad - Faculty Of Medicine
Language:
English
University location:
Baghdad
First pages:
19T1633 - p.pdf
Abstract:
سرطان المثانة هو واحد من اكثر الاورام الخبيثة شيوعا في المسالك البولية. يعتبر استهلاك التبغ لفترات طويلة احد العوامل الرئيسية المسببة لتطور سرطان المثانة ، والتي تسبب تلف الحمض النووي. ولذلك ، فان مسار اصلاح الحمض النووي هو من اهم النظم التي تحافظ على سلامة الجينات ومنع التسرطن. وكان الهدف من هذه الدراسة هو معرفة تاثير التباين الوراثي احادي القاعدة لثلاثة جينات مسؤولة عن اصلاح الحمض النووي TEP1 / rs2228041 , XPC / rs2228000) و( XRCC7 7003908 على الخطر بالاصابة بهذا المرض.الاهداف : ان الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو محاولة ايجاد علاقة بين التباين الوراثي احادي القاعدة الموجودة في ثلاثة جينات مختلفة مسؤولة عن اصلاح الحمض النووي والتحقق من تاثير تدخين التبغ على التباين الوراثي الموجود في جنات اصلاح الحمض النووي البشري TEP1 / rs2228041 ) ، XPC / rs2228000 و(XRCC7 7003908 في المرضى الذين يعانون من سرطان المثانة في وتاثيرها على تطور ومرحلة المرض.المرضى وطرق العمل : اشتملت هذه الدراسة على مجموع من 62 مريض مشخص بسرطان المثانة و38 شخص من الاصحاء مطابقين لهم بالعمر والجنس. تم جمع هذه العينات في الفترة من فبراير الى سبتمبر لسنة 2017 في دراسة مقارنة لمجموعه المرضى والاصحاء التي اجريت في قسم الكيمياء الحيوية في كلية الطب بجامعة بغداد.تم الكشف عن النمط الجيني لل TEP1 / rs2228041 (C> T) وXPC rs2228000 (C> T) باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل وطريقة سانجر في ايجاد تسلسل الحمض النووي.بينما كشف عن النمط الجيني للتباين الوراثي XRCC7 (T> G) باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والمتحدد بطول القطعة المتباينة الشكل, (PCR - RFLP) وتاكيده تسلسل الحمض النووي باستخدام طريقة سانجر. تم حساب نسبة الارجحية (OR) ومجال الثقة 95 ٪ (CI) كمقياس للتاثير المشترك للتدخين السجائر ، والجينات اصلاح الحمض النووي المتباينة الشكل على خطر الاصابة بسرطان المثانة وتطوره ومراحلهه.النتائج : في هذه الدراسة ، اظهر الاليل T المتباين الشكل للجين TEP1 rs222804 علاقة معنوية في زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR = 4.7, *p=0.04). ايضا ، اظهر الاليل T وجود علاقة معنوية في زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة بين الافراد المدخنين (OR =7.02, *p=0.01)علاوة على ذلك ، اظهر الاليل T علاقة معنوية لمرحلة T2 لسرطان المثانة ((OR=13.2, **p=0.001 اظهر النمط الوراثي المغاير الزيجة من XPC rs2228000 (C> T) زيادة كبيرة في خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR=2.75, *p value<0.05). كذلك ، قد وجدت الدراسة ان المرضى الذين يعانون من الاليل متعدد الاشكال للنمط الجيني T قد زاد بشكل كبير من خطر الاصابة بسرطان المثانة (OR= 2.7; *p = 0.02).احصائيا, وجدت زيادة معنوية كبيرة في خطر الاصابة بسرطان المثانة عند الاشخاص المدخنين الحاملين للاليل T (OR= 4.3; **p = 0.004).علاوة على ذلك ، لوحظ ايضا ان الطرز الوراثية للاليل T ترتبط بزيادة ملحوظة في خطر T1 (OR= 3.9 **p = 0.005).في الدراسة الحالية ,ان خطر الاصابة بسرطان المثانة قد ازداد بشكل كبير لدى الاشخاص الحاملين للجين متعدد الاشكال متماثل الزيجة الوراثية (للنمط الجيني GG) (OR= 4.0; *p = 0.03) في حين ان النسبة بهذا الخطر قد قلت لدى الاشخاص الذين لديهم جين من النوع الطبيعي (للنمط الجيني TT). ايضا ، زيادة خطر الاصابة بسرطان المثانة زيادة كبيرة احصائيا بين الافراد الحاملين للاليل G(OR= 5.5; ***p = 0.0001). كما لوحظ ان النمط الوراثي للاليل G مرتبط بزيادة كبيرة بخطر الاصابة بالمرحلة T2 لسرطان المثانة (OR= 3.7; **p = 0.001) ، وايضا Ta (OR= 3.5; **p = 0.003).استنتاجتوحي الدراسة الحالية ان وجود الانماط الجينية المتباينة الاشكال لجينات اصلاح الحمض النووري للمروثات يمكن ان يزيد من خطر الاصابة بسرطان المثانة ويؤثر ايضا على تطور ومراحل المرض في حين ان النمط الجيني الطبيعي يمكن ان يقلل من خطر الاصابة بسرطان المثانة وزيادة معدل البقاء على قيد الحياة لمرضى سرطان المثانة. علاوة على ذلك ، يمكن لهذه الاشكال الجينية ان تكون اداة مفيدة لمعالجة المرض للافراد الذين لديهم مقاومة لعلاج السرطان. | XPC Xeroderma pigmentosum CXPG Xeroderma pigmentosum G AbstractBackgroundBladder cancer is one of the most common malignancies of the urinary tract. Prolonged tobacco consumption constitutes the major etiological factors for bladder cancer development, which induce DNA damage. Therefore, DNA repair pathway is a crucial system in maintaining genomic integrity and preventing carcinogenesis. The present work was aimed to predict the consequence of three polymorphisms of the DNA repair genes (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000, and XRCC7 7003908) on the disease predisposition.ObjectivesThe main objective of this study is attempted to find the association between SNPs in different DNA repair pathway and investigating the influence of active tobacco smoking on human DNA repair gene polymorphisms (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000 and XRCC7 7003908) in patients with bladder cancer in and the impact of these polymorphism on the staging and development of the disease.Subjects and MethodsA total of 62 of histo - pathologically confirmed diagnosed bladder cancer patients, and 38 age - matched healthy controls were involved in the study. All were recruited from February to September 2017 in a case - control study conducted at the Department of Biochemistry - College of Medicine University of Baghdad. Genotyping of the TEP1/rs2228041 (C>T) and XPC rs2228000 (C>T) was evaluated using polymerase chain reaction and fully genotyped by Sanger sequencing method. Genotyping of the XRCC7 polymorphism (T>G) was evaluated using a polymerase chain reaction - restricted fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and confirmed by Sanger sequencing method. The odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) were calculated as a measure of the combined effect of cigarette smoking, and DNA Repair Genes Polymorphisms on bladder cancer risk, staging.ResultsIn this study, the polymorphic T allele of the TEP1 rs222804 polymorphism showed a significant association in increase bladder cancer risk OR = 4.7, p=0.04. Also, the T allele showed a significant association in increase bladder cancer risk among smoker individuals OR= 7.02, p=0.01. Furthermore, the T allele showed a significant association for the T2 stage of bladder cancer (OR=13.2, p=0.001). Heterozygous genotype of the XPC rs2228000 (C>T) showed a significant increase in bladder cancer risk OR =2.75, p value<0.05. Also, the study found that patients with the polymorphic allele (T genotype) have significantly increased the risk of bladder cancer (OR= 2.7; p = 0.02). A statistically highly significant increased in bladder cancer risk was found in the smoker individuals who carrying T Allele (OR= 4.3; p = 0.004). Moreover, T Allele genotypes were also observed to be associated with a significantly increased risk of T1 (OR= 3.9; p = 0.005). In the current study, individuals with the homo polymorphic gene (GG genotype) have significantly increased the risk of bladder cancer (OR= 4.0; p = 0.03), while subjects having the homo wild - type gene (TT genotype) could decrease the risk of bladder cancer. Also, a statistically highly significant increased bladder cancer risk in the smoker individuals who carrying G Allele (OR= 5.5; p = 0.0001). G Allele genotypes were also observed to be associated with a significantly increased risk of T2 (OR= 3.7; p = 0.001), and for Ta (OR= 3.5; p = 0.003).ConclusionThe present study suggested that having polymorphic genotypes of DNA repair gene polymorphisms (TEP1/rs2228041, XPC/rs2228000 and XRCC7 7003908) could increase the risk of bladder cancer and also affect the development and staging of the disease while having the wild type genotypes could decrease the risk of bladder cancer and increase the survival rate of bladder cancer patients. Furthermore, these gene polymorphisms could be a useful tool to tackle these emerging problems and is an attractive target for individual anticancer treatment.
